CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 67005 2342575 2.78 2409580 2 18107 567 96.96 18674 3 994 160579 0.62 161573 4 1437 306549 0.47 307986 5 2015 260252 0.77 262267 6 2592 301602 0.85 304194 7 1751 296034 0.59 297785 8 4269 306746 1.37 311015 9 8130 327756 2.42 335886 10 2182 343097 0.63 345279 11 5445 322810 1.66 328255 12 2594 346934 0.74 349528 13 1817 359045 0.50 360862 14 3526 312180 1.12 315706 15 2171 348265 0.62 350436 16 3745 365968 1.01 369713 17 2990 311717 0.95 314707 18 1816 338636 0.53 340452 19 2445 350413 0.69 352858 20 2393 324772 0.73 327165 21 3497 353245 0.98 356742 22 2127 362795 0.58 364922 23 1650 313438 0.52 315088 24 1914 331068 0.57 332982 25 1774 341486 0.52 343260 26 1606 316635 0.50 318241 27 2020 346088 0.58 348108 28 1633 337046 0.48 338679 29 1521 311882 0.49 313403 30 1947 347990 0.56 349937 31 1734 342636 0.50 344370 32 1585 302851 0.52 304436 33 1918 331587 0.58 333505 34 1551 329237 0.47 330788 35 1681 304067 0.55 305748 36 1703 338615 0.50 340318 37 1821 333182 0.54 335003 38 1631 300042 0.54 301673 39 1813 319355 0.56 321168 40 1667 320361 0.52 322028 41 1553 294593 0.52 296146 42 1892 318609 0.59 320501 43 1672 309845 0.54 311517 44 1604 284498 0.56 286102 45 1738 308317 0.56 310055 46 1507 306776 0.49 308283 47 1595 276393 0.57 277988 48 1915 304730 0.62 306645 49 1552 297448 0.52 299000 50 1500 268918 0.55 270418 51 1719 284489 0.60 286208 52 1475 280917 0.52 282392 53 1367 254981 0.53 256348 54 1726 282767 0.61 284493 55 1560 279803 0.55 281363 56 1398 255904 0.54 257302 57 1814 283961 0.63 285775 58 1575 271630 0.58 273205 59 1409 243112 0.58 244521 60 1561 265793 0.58 267354 61 1537 270622 0.56 272159 62 1387 243068 0.57 244455 63 1813 269724 0.67 271537 64 1446 255318 0.56 256764 65 1256 225345 0.55 226601 66 1619 253410 0.63 255029 67 1371 249340 0.55 250711 68 1333 229798 0.58 231131 69 1568 251191 0.62 252759 70 1174 243429 0.48 244603 71 1378 222814 0.61 224192 72 1456 239205 0.61 240661 73 1446 231566 0.62 233012 74 1324 209237 0.63 210561 75 1388 222273 0.62 223661 76 1262 223452 0.56 224714 77 1220 201970 0.60 203190 78 1372 223908 0.61 225280 79 1332 224192 0.59 225524 80 1204 202081 0.59 203285 81 1640 221058 0.74 222698 82 1342 210422 0.63 211764 83 1129 191383 0.59 192512 84 1298 208085 0.62 209383 85 1252 197517 0.63 198769 86 1010 184175 0.55 185185 87 1346 199209 0.67 200555 88 1082 201089 0.54 202171 89 1068 182845 0.58 183913 90 1324 199403 0.66 200727 91 1185 193040 0.61 194225 92 1109 182532 0.60 183641 93 1294 199336 0.64 200630 94 1165 190421 0.61 191586 95 1003 168556 0.59 169559 96 1263 184089 0.68 185352 97 1115 179607 0.62 180722 98 1016 166260 0.61 167276 99 1145 178373 0.64 179518 100 947 164958 0.57 165905 101 982 156901 0.62 157883 102 1219 171219 0.71 172438 103 1002 165193 0.60 166195 104 869 152564 0.57 153433 105 1165 167265 0.69 168430 106 1003 161843 0.62 162846 107 1017 148025 0.68 149042 108 1162 158781 0.73 159943 109 968 148376 0.65 149344 110 929 139788 0.66 140717 111 1008 152668 0.66 153676 112 877 144660 0.60 145537 113 823 137143 0.60 137966 114 1056 151797 0.69 152853 115 983 147644 0.66 148627 116 839 132564 0.63 133403 117 1041 141508 0.73 142549 118 893 137274 0.65 138167 119 796 119850 0.66 120646 120 910 131056 0.69 131966 121 870 127422 0.68 128292 122 836 124871 0.67 125707 123 1037 138689 0.74 139726 124 858 132696 0.64 133554 125 821 117261 0.70 118082 126 910 125933 0.72 126843 127 827 122723 0.67 123550 128 729 113154 0.64 113883 129 876 119808 0.73 120684 130 771 114480 0.67 115251 131 759 105830 0.71 106589 132 874 115682 0.75 116556 133 760 111521 0.68 112281 134 735 102659 0.71 103394 135 889 112694 0.78 113583 136 721 104882 0.68 105603 137 657 98622 0.66 99279 138 783 107381 0.72 108164 139 689 104900 0.65 105589 140 828 94296 0.87 95124 141 987 103501 0.94 104488 142 1024 101707 1.00 102731 143 701 92219 0.75 92920 144 862 101584 0.84 102446 145 906 96081 0.93 96987 146 722 88288 0.81 89010 147 860 93142 0.91 94002 148 620 36166 1.69 36786 149 6393 43378 12.84 49771 150 7491 39239 16.03 46730 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 172 1869180 0.01 1869352 2 4402 1419 75.62 5821 3 16009 4091 79.65 20100 4 946 228571 0.41 229517 5 925 211976 0.43 212901 6 1219 226361 0.54 227580 7 1084 212233 0.51 213317 8 1721 283080 0.60 284801 9 1481 254164 0.58 255645 10 1330 251196 0.53 252526 11 1342 288956 0.46 290298 12 1489 283607 0.52 285096 13 1602 293066 0.54 294668 14 1343 278567 0.48 279910 15 1417 279128 0.51 280545 16 1282 284301 0.45 285583 17 1316 280039 0.47 281355 18 1806 276340 0.65 278146 19 2566 274398 0.93 276964 20 2225 278847 0.79 281072 21 1748 288561 0.60 290309 22 1475 271332 0.54 272807 23 1266 271691 0.46 272957 24 1320 276253 0.48 277573 25 1184 283054 0.42 284238 26 1173 270832 0.43 272005 27 1168 265575 0.44 266743 28 1227 276990 0.44 278217 29 1155 272526 0.42 273681 30 1241 281446 0.44 282687 31 1180 273019 0.43 274199 32 1191 261656 0.45 262847 33 1328 279539 0.47 280867 34 1156 268649 0.43 269805 35 1181 261615 0.45 262796 36 1254 268568 0.46 269822 37 1207 267621 0.45 268828 38 1293 278892 0.46 280185 39 1302 271945 0.48 273247 40 1046 242881 0.43 243927 41 1197 250191 0.48 251388 42 1255 258579 0.48 259834 43 1140 245081 0.46 246221 44 1093 245071 0.44 246164 45 1178 256967 0.46 258145 46 1112 244094 0.45 245206 47 1086 237535 0.46 238621 48 1160 263065 0.44 264225 49 1057 230196 0.46 231253 50 1149 240838 0.47 241987 51 1184 248314 0.47 249498 52 959 222891 0.43 223850 53 1121 232631 0.48 233752 54 1079 235204 0.46 236283 55 1040 225375 0.46 226415 56 1035 227128 0.45 228163 57 1181 240092 0.49 241273 58 941 216325 0.43 217266 59 1048 217601 0.48 218649 60 1105 218153 0.50 219258 61 1021 215217 0.47 216238 62 951 207608 0.46 208559 63 1090 224608 0.48 225698 64 939 204816 0.46 205755 65 942 207814 0.45 208756 66 959 204916 0.47 205875 67 1006 210722 0.48 211728 68 993 203752 0.48 204745 69 1085 205459 0.53 206544 70 937 196855 0.47 197792 71 975 208341 0.47 209316 72 1086 204447 0.53 205533 73 904 180551 0.50 181455 74 952 192894 0.49 193846 75 935 186702 0.50 187637 76 956 187054 0.51 188010 77 943 187805 0.50 188748 78 921 183434 0.50 184355 79 910 176896 0.51 177806 80 860 177144 0.48 178004 81 969 180983 0.53 181952 82 789 169675 0.46 170464 83 837 173020 0.48 173857 84 894 174187 0.51 175081 85 830 166050 0.50 166880 86 826 163240 0.50 164066 87 842 166985 0.50 167827 88 796 159544 0.50 160340 89 788 165161 0.47 165949 90 849 171881 0.49 172730 91 721 153779 0.47 154500 92 831 164713 0.50 165544 93 768 156777 0.49 157545 94 761 148382 0.51 149143 95 763 148778 0.51 149541 96 875 155926 0.56 156801 97 735 142673 0.51 143408 98 762 144215 0.53 144977 99 745 149849 0.49 150594 100 742 135497 0.54 136239 101 643 138892 0.46 139535 102 733 139285 0.52 140018 103 612 130912 0.47 131524 104 667 134145 0.49 134812 105 720 138736 0.52 139456 106 677 129373 0.52 130050 107 733 133435 0.55 134168 108 747 138078 0.54 138825 109 628 123231 0.51 123859 110 706 132458 0.53 133164 111 725 132185 0.55 132910 112 602 117586 0.51 118188 113 597 120776 0.49 121373 114 677 124029 0.54 124706 115 585 119817 0.49 120402 116 641 111187 0.57 111828 117 610 112990 0.54 113600 118 528 103655 0.51 104183 119 557 108508 0.51 109065 120 616 113056 0.54 113672 121 505 100380 0.50 100885 122 577 112540 0.51 113117 123 610 111237 0.55 111847 124 544 102492 0.53 103036 125 531 102073 0.52 102604 126 560 105310 0.53 105870 127 482 102140 0.47 102622 128 541 97669 0.55 98210 129 551 94273 0.58 94824 130 515 93793 0.55 94308 131 510 92789 0.55 93299 132 548 96561 0.56 97109 133 474 88729 0.53 89203 134 531 96203 0.55 96734 135 517 92711 0.55 93228 136 416 87681 0.47 88097 137 502 86880 0.57 87382 138 574 91017 0.63 91591 139 471 81312 0.58 81783 140 464 85255 0.54 85719 141 474 86989 0.54 87463 142 483 84628 0.57 85111 143 431 74413 0.58 74844 144 533 90235 0.59 90768 145 411 79651 0.51 80062 146 487 73390 0.66 73877 147 504 79604 0.63 80108 148 326 26438 1.22 26764 149 259 31792 0.81 32051 150 328 46251 0.70 46579 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 180 5686 3.07 5866 2 18878 339367 5.27 358245 3 15259 273651 5.28 288910 4 12913 568033 2.22 580946 5 8423 439870 1.88 448293 6 13418 470771 2.77 484189 7 7085 480156 1.45 487241 8 12393 457846 2.64 470239 9 12283 495433 2.42 507716 10 11497 513799 2.19 525296 11 10028 475213 2.07 485241 12 8097 502980 1.58 511077 13 11122 527064 2.07 538186 14 13106 452792 2.81 465898 15 16339 510603 3.10 526942 16 8013 527089 1.50 535102 17 14239 457884 3.02 472123 18 15216 517593 2.86 532809 19 9934 526151 1.85 536085 20 9378 443821 2.07 453199 21 6164 499942 1.22 506106 22 4054 503535 0.80 507589 23 3583 434701 0.82 438284 24 2947 494293 0.59 497240 25 8811 505523 1.71 514334 26 1938 428035 0.45 429973 27 2342 492480 0.47 494822 28 2189 502262 0.43 504451 29 2018 425611 0.47 427629 30 1899 469474 0.40 471373 31 1956 480739 0.41 482695 32 1739 416412 0.42 418151 33 1936 462438 0.42 464374 34 1931 475870 0.40 477801 35 1733 409613 0.42 411346 36 1756 445487 0.39 447243 37 1942 453916 0.43 455858 38 1689 403671 0.42 405360 39 1822 444208 0.41 446030 40 1835 444103 0.41 445938 41 1668 400277 0.41 401945 42 1752 437890 0.40 439642 43 1760 436266 0.40 438026 44 1689 389752 0.43 391441 45 1685 422299 0.40 423984 46 1773 420004 0.42 421777 47 1630 383631 0.42 385261 48 1757 412381 0.42 414138 49 1687 415834 0.40 417521 50 1604 369952 0.43 371556 51 1557 400716 0.39 402273 52 1639 405362 0.40 407001 53 1521 361933 0.42 363454 54 1633 392163 0.41 393796 55 1720 389148 0.44 390868 56 1488 350729 0.42 352217 57 1622 381866 0.42 383488 58 1677 379977 0.44 381654 59 1492 343842 0.43 345334 60 1590 371901 0.43 373491 61 1507 365378 0.41 366885 62 1506 324880 0.46 326386 63 1547 356197 0.43 357744 64 1486 362693 0.41 364179 65 1362 321202 0.42 322564 66 1448 352978 0.41 354426 67 1525 349133 0.43 350658 68 1378 307044 0.45 308422 69 1472 342788 0.43 344260 70 1572 348070 0.45 349642 71 1329 301150 0.44 302479 72 1483 332678 0.44 334161 73 1283 323183 0.40 324466 74 1354 292016 0.46 293370 75 1445 328098 0.44 329543 76 1420 318699 0.44 320119 77 1285 276160 0.46 277445 78 1365 307547 0.44 308912 79 1364 308105 0.44 309469 80 1191 275398 0.43 276589 81 1220 292686 0.42 293906 82 1415 303153 0.46 304568 83 1254 271016 0.46 272270 84 1260 290514 0.43 291774 85 1255 292121 0.43 293376 86 1168 260250 0.45 261418 87 1285 274630 0.47 275915 88 1219 279133 0.43 280352 89 1159 250019 0.46 251178 90 1125 267058 0.42 268183 91 1251 272435 0.46 273686 92 1056 234043 0.45 235099 93 1072 257707 0.41 258779 94 1138 261056 0.43 262194 95 1172 232043 0.50 233215 96 1162 262516 0.44 263678 97 1142 254776 0.45 255918 98 1039 225725 0.46 226764 99 1098 247610 0.44 248708 100 1040 247553 0.42 248593 101 1058 219748 0.48 220806 102 1046 237777 0.44 238823 103 1077 232138 0.46 233215 104 933 205251 0.45 206184 105 1040 225904 0.46 226944 106 983 221461 0.44 222444 107 902 201137 0.45 202039 108 958 217279 0.44 218237 109 1029 215498 0.48 216527 110 973 195324 0.50 196297 111 993 212185 0.47 213178 112 883 205461 0.43 206344 113 753 187804 0.40 188557 114 903 198375 0.45 199278 115 854 196876 0.43 197730 116 760 173374 0.44 174134 117 847 190490 0.44 191337 118 973 198611 0.49 199584 119 822 173342 0.47 174164 120 935 185857 0.50 186792 121 842 181190 0.46 182032 122 843 161471 0.52 162314 123 807 176791 0.45 177598 124 753 172840 0.43 173593 125 726 162637 0.44 163363 126 732 174767 0.42 175499 127 814 169115 0.48 169929 128 662 153292 0.43 153954 129 816 169607 0.48 170423 130 744 161131 0.46 161875 131 672 149498 0.45 150170 132 779 160824 0.48 161603 133 691 159574 0.43 160265 134 632 144658 0.43 145290 135 746 155269 0.48 156015 136 819 154938 0.53 155757 137 674 135199 0.50 135873 138 669 152314 0.44 152983 139 757 152739 0.49 153496 140 703 133134 0.53 133837 141 776 145655 0.53 146431 142 709 140345 0.50 141054 143 747 125020 0.59 125767 144 730 140905 0.52 141635 145 674 134636 0.50 135310 146 698 123498 0.56 124196 147 646 125880 0.51 126526 148 455 47405 0.95 47860 149 238 38411 0.62 38649 150 358 64903 0.55 65261 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 16268 546360 2.89 562628 2 26679 462 98.30 27141 3 237 46861 0.50 47098 4 281 69780 0.40 70061 5 401 64182 0.62 64583 6 360 71147 0.50 71507 7 365 70089 0.52 70454 8 474 73118 0.64 73592 9 549 76757 0.71 77306 10 583 74920 0.77 75503 11 414 72142 0.57 72556 12 398 75527 0.52 75925 13 370 74981 0.49 75351 14 402 67174 0.59 67576 15 489 73505 0.66 73994 16 1940 72505 2.61 74445 17 352 66208 0.53 66560 18 345 71689 0.48 72034 19 306 70219 0.43 70525 20 335 63069 0.53 63404 21 409 66746 0.61 67155 22 336 67954 0.49 68290 23 324 60217 0.54 60541 24 321 64329 0.50 64650 25 312 62197 0.50 62509 26 283 58178 0.48 58461 27 349 64811 0.54 65160 28 299 61890 0.48 62189 29 303 56502 0.53 56805 30 299 59193 0.50 59492 31 306 57780 0.53 58086 32 285 54529 0.52 54814 33 293 59241 0.49 59534 34 289 58077 0.50 58366 35 315 53979 0.58 54294 36 238 55908 0.42 56146 37 251 54923 0.45 55174 38 272 50620 0.53 50892 39 282 51328 0.55 51610 40 254 51459 0.49 51713 41 246 48388 0.51 48634 42 245 51984 0.47 52229 43 266 51073 0.52 51339 44 258 47452 0.54 47710 45 233 48931 0.47 49164 46 222 50568 0.44 50790 47 240 46423 0.51 46663 48 257 47369 0.54 47626 49 234 44646 0.52 44880 50 223 41769 0.53 41992 51 212 45147 0.47 45359 52 213 43641 0.49 43854 53 203 40288 0.50 40491 54 240 42346 0.56 42586 55 200 41882 0.48 42082 56 223 40152 0.55 40375 57 203 43086 0.47 43289 58 187 41701 0.45 41888 59 212 38070 0.55 38282 60 210 40437 0.52 40647 61 145 40898 0.35 41043 62 167 35645 0.47 35812 63 133 38880 0.34 39013 64 175 37062 0.47 37237 65 198 33997 0.58 34195 66 142 35646 0.40 35788 67 187 34556 0.54 34743 68 172 33031 0.52 33203 69 153 34888 0.44 35041 70 141 34218 0.41 34359 71 165 32829 0.50 32994 72 172 34502 0.50 34674 73 177 33770 0.52 33947 74 173 30369 0.57 30542 75 167 31281 0.53 31448 76 106 29310 0.36 29416 77 134 27410 0.49 27544 78 114 29757 0.38 29871 79 168 29584 0.56 29752 80 93 26498 0.35 26591 81 128 28338 0.45 28466 82 108 27667 0.39 27775 83 164 25518 0.64 25682 84 153 26299 0.58 26452 85 108 24378 0.44 24486 86 106 23388 0.45 23494 87 99 24905 0.40 25004 88 131 24836 0.52 24967 89 110 24438 0.45 24548 90 98 25104 0.39 25202 91 123 24516 0.50 24639 92 104 22494 0.46 22598 93 132 23321 0.56 23453 94 108 23651 0.45 23759 95 110 20955 0.52 21065 96 113 22962 0.49 23075 97 119 23628 0.50 23747 98 84 22326 0.37 22410 99 100 22110 0.45 22210 100 105 21811 0.48 21916 101 94 19372 0.48 19466 102 102 19618 0.52 19720 103 97 20361 0.47 20458 104 84 19446 0.43 19530 105 89 19392 0.46 19481 106 94 18516 0.51 18610 107 104 17382 0.59 17486 108 82 18339 0.45 18421 109 92 18397 0.50 18489 110 71 17068 0.41 17139 111 89 17432 0.51 17521 112 84 16909 0.49 16993 113 53 15926 0.33 15979 114 54 16428 0.33 16482 115 71 16444 0.43 16515 116 85 15239 0.55 15324 117 63 15196 0.41 15259 118 65 14554 0.44 14619 119 92 14178 0.64 14270 120 67 14813 0.45 14880 121 59 14824 0.40 14883 122 47 13872 0.34 13919 123 65 14712 0.44 14777 124 61 15045 0.40 15106 125 62 13405 0.46 13467 126 58 13646 0.42 13704 127 76 12733 0.59 12809 128 63 12745 0.49 12808 129 43 12301 0.35 12344 130 50 12393 0.40 12443 131 49 12558 0.39 12607 132 55 12493 0.44 12548 133 53 12190 0.43 12243 134 45 11405 0.39 11450 135 52 11616 0.45 11668 136 41 11186 0.37 11227 137 48 10654 0.45 10702 138 43 11398 0.38 11441 139 38 10977 0.34 11015 140 68 9972 0.68 10040 141 39 10692 0.36 10731 142 34 9645 0.35 9679 143 50 9288 0.54 9338 144 46 10103 0.45 10149 145 40 9224 0.43 9264 146 45 8415 0.53 8460 147 33 9231 0.36 9264 148 44 4895 0.89 4939 149 22 4293 0.51 4315 150 25 4037 0.62 4062 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 301 567476 0.05 567777 2 179 339 34.56 518 3 6234 1184 84.04 7418 4 197 56449 0.35 56646 5 261 54231 0.48 54492 6 295 55599 0.53 55894 7 311 50133 0.62 50444 8 465 65611 0.70 66076 9 307 58005 0.53 58312 10 321 53679 0.59 54000 11 332 65397 0.51 65729 12 316 62115 0.51 62431 13 354 61822 0.57 62176 14 288 60095 0.48 60383 15 325 58648 0.55 58973 16 332 59293 0.56 59625 17 269 56866 0.47 57135 18 329 56978 0.57 57307 19 262 55025 0.47 55287 20 262 55390 0.47 55652 21 333 55774 0.59 56107 22 296 52831 0.56 53127 23 298 52724 0.56 53022 24 283 48388 0.58 48671 25 240 53867 0.44 54107 26 243 51308 0.47 51551 27 264 47220 0.56 47484 28 250 49282 0.50 49532 29 242 50379 0.48 50621 30 244 45651 0.53 45895 31 234 45861 0.51 46095 32 238 45324 0.52 45562 33 202 46799 0.43 47001 34 242 47210 0.51 47452 35 243 43581 0.55 43824 36 208 43602 0.47 43810 37 256 44606 0.57 44862 38 224 46960 0.47 47184 39 212 44989 0.47 45201 40 216 40997 0.52 41213 41 242 44825 0.54 45067 42 191 39610 0.48 39801 43 212 42068 0.50 42280 44 156 38220 0.41 38376 45 229 41515 0.55 41744 46 221 39943 0.55 40164 47 177 39176 0.45 39353 48 177 35413 0.50 35590 49 161 35533 0.45 35694 50 228 38523 0.59 38751 51 206 37585 0.55 37791 52 208 35356 0.58 35564 53 181 35310 0.51 35491 54 163 33522 0.48 33685 55 135 34547 0.39 34682 56 173 34745 0.50 34918 57 165 35235 0.47 35400 58 144 31021 0.46 31165 59 144 31722 0.45 31866 60 126 31264 0.40 31390 61 158 29370 0.54 29528 62 171 31802 0.53 31973 63 188 31530 0.59 31718 64 137 29809 0.46 29946 65 133 28508 0.46 28641 66 117 28277 0.41 28394 67 143 29781 0.48 29924 68 154 28153 0.54 28307 69 130 26694 0.48 26824 70 152 27413 0.55 27565 71 153 28271 0.54 28424 72 130 25198 0.51 25328 73 121 27271 0.44 27392 74 118 26952 0.44 27070 75 157 24335 0.64 24492 76 115 24349 0.47 24464 77 115 24939 0.46 25054 78 101 23808 0.42 23909 79 108 22601 0.48 22709 80 109 23474 0.46 23583 81 142 22641 0.62 22783 82 81 20080 0.40 20161 83 104 21820 0.47 21924 84 108 22239 0.48 22347 85 109 21954 0.49 22063 86 97 20798 0.46 20895 87 87 21229 0.41 21316 88 85 19029 0.44 19114 89 86 20515 0.42 20601 90 95 20181 0.47 20276 91 103 20365 0.50 20468 92 109 18392 0.59 18501 93 83 18914 0.44 18997 94 89 19220 0.46 19309 95 92 18249 0.50 18341 96 114 17965 0.63 18079 97 82 18045 0.45 18127 98 87 18070 0.48 18157 99 80 17267 0.46 17347 100 76 15779 0.48 15855 101 78 17028 0.46 17106 102 77 15874 0.48 15951 103 62 15296 0.40 15358 104 55 16528 0.33 16583 105 63 14068 0.45 14131 106 87 15300 0.57 15387 107 52 15830 0.33 15882 108 79 14640 0.54 14719 109 56 14033 0.40 14089 110 76 15810 0.48 15886 111 74 12978 0.57 13052 112 78 13321 0.58 13399 113 62 13458 0.46 13520 114 66 13520 0.49 13586 115 60 13442 0.44 13502 116 52 13106 0.40 13158 117 64 12404 0.51 12468 118 41 12713 0.32 12754 119 39 12407 0.31 12446 120 56 12222 0.46 12278 121 62 11099 0.56 11161 122 34 11820 0.29 11854 123 57 11463 0.49 11520 124 52 11092 0.47 11144 125 47 11691 0.40 11738 126 50 11032 0.45 11082 127 67 11475 0.58 11542 128 32 10472 0.30 10504 129 47 9432 0.50 9479 130 53 10455 0.50 10508 131 27 10929 0.25 10956 132 62 10794 0.57 10856 133 40 9088 0.44 9128 134 39 10096 0.38 10135 135 42 10098 0.41 10140 136 25 9784 0.25 9809 137 43 9037 0.47 9080 138 48 9528 0.50 9576 139 35 8536 0.41 8571 140 38 8628 0.44 8666 141 37 9176 0.40 9213 142 39 9415 0.41 9454 143 38 8156 0.46 8194 144 27 7210 0.37 7237 145 26 7425 0.35 7451 146 29 7645 0.38 7674 147 22 7434 0.30 7456 148 48 3554 1.33 3602 149 17 3890 0.44 3907 150 15 3436 0.43 3451 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 117 442 20.93 559 2 760 100526 0.75 101286 3 639 82803 0.77 83442 4 847 132199 0.64 133046 5 739 108180 0.68 108919 6 612 115558 0.53 116170 7 599 111659 0.53 112258 8 588 103233 0.57 103821 9 676 115546 0.58 116222 10 577 113765 0.50 114342 11 560 107569 0.52 108129 12 567 112012 0.50 112579 13 728 113771 0.64 114499 14 505 96786 0.52 97291 15 514 107429 0.48 107943 16 503 105338 0.48 105841 17 545 94519 0.57 95064 18 489 103980 0.47 104469 19 508 103973 0.49 104481 20 510 91231 0.56 91741 21 495 99348 0.50 99843 22 490 97625 0.50 98115 23 421 84417 0.50 84838 24 530 96559 0.55 97089 25 404 93526 0.43 93930 26 446 82737 0.54 83183 27 484 91119 0.53 91603 28 455 89928 0.50 90383 29 415 79781 0.52 80196 30 443 87517 0.50 87960 31 438 89749 0.49 90187 32 406 77706 0.52 78112 33 400 82568 0.48 82968 34 436 85600 0.51 86036 35 384 73783 0.52 74167 36 407 80734 0.50 81141 37 389 81631 0.47 82020 38 356 72757 0.49 73113 39 295 77590 0.38 77885 40 361 76744 0.47 77105 41 306 70623 0.43 70929 42 394 75351 0.52 75745 43 332 71416 0.46 71748 44 365 67984 0.53 68349 45 309 72356 0.43 72665 46 368 72978 0.50 73346 47 320 61079 0.52 61399 48 302 69284 0.43 69586 49 268 66313 0.40 66581 50 266 63868 0.41 64134 51 285 63679 0.45 63964 52 280 63099 0.44 63379 53 287 58943 0.48 59230 54 297 64410 0.46 64707 55 332 61093 0.54 61425 56 280 57133 0.49 57413 57 260 59621 0.43 59881 58 285 58859 0.48 59144 59 250 54684 0.46 54934 60 262 56917 0.46 57179 61 259 55311 0.47 55570 62 253 51067 0.49 51320 63 270 55175 0.49 55445 64 255 53821 0.47 54076 65 223 50211 0.44 50434 66 252 52046 0.48 52298 67 250 52646 0.47 52896 68 241 46403 0.52 46644 69 237 53596 0.44 53833 70 242 50051 0.48 50293 71 265 44016 0.60 44281 72 192 47760 0.40 47952 73 231 45496 0.51 45727 74 186 40186 0.46 40372 75 204 45760 0.44 45964 76 200 46266 0.43 46466 77 218 39523 0.55 39741 78 176 44046 0.40 44222 79 178 41114 0.43 41292 80 198 39599 0.50 39797 81 205 40944 0.50 41149 82 185 40871 0.45 41056 83 170 37721 0.45 37891 84 175 41428 0.42 41603 85 199 40699 0.49 40898 86 157 36567 0.43 36724 87 170 37463 0.45 37633 88 138 36948 0.37 37086 89 152 32490 0.47 32642 90 154 36209 0.42 36363 91 142 35732 0.40 35874 92 157 31964 0.49 32121 93 130 35405 0.37 35535 94 154 33915 0.45 34069 95 139 31573 0.44 31712 96 160 34807 0.46 34967 97 136 32749 0.41 32885 98 136 28407 0.48 28543 99 150 32243 0.46 32393 100 146 30578 0.48 30724 101 139 28568 0.48 28707 102 152 31050 0.49 31202 103 134 30222 0.44 30356 104 102 25915 0.39 26017 105 106 28758 0.37 28864 106 136 28129 0.48 28265 107 109 26548 0.41 26657 108 108 25969 0.41 26077 109 129 26314 0.49 26443 110 95 25077 0.38 25172 111 91 25943 0.35 26034 112 132 25856 0.51 25988 113 107 22607 0.47 22714 114 93 24855 0.37 24948 115 117 24764 0.47 24881 116 71 22352 0.32 22423 117 95 24383 0.39 24478 118 74 23041 0.32 23115 119 92 21525 0.43 21617 120 84 22555 0.37 22639 121 94 20878 0.45 20972 122 79 21225 0.37 21304 123 74 21796 0.34 21870 124 90 20915 0.43 21005 125 100 18428 0.54 18528 126 81 20327 0.40 20408 127 100 20478 0.49 20578 128 64 18647 0.34 18711 129 65 19682 0.33 19747 130 95 18221 0.52 18316 131 75 16654 0.45 16729 132 71 18585 0.38 18656 133 71 17705 0.40 17776 134 56 15642 0.36 15698 135 76 17238 0.44 17314 136 61 17317 0.35 17378 137 77 15512 0.49 15589 138 56 16071 0.35 16127 139 87 17186 0.50 17273 140 60 14398 0.41 14458 141 74 16710 0.44 16784 142 64 15994 0.40 16058 143 72 14716 0.49 14788 144 51 15572 0.33 15623 145 55 14125 0.39 14180 146 39 13648 0.28 13687 147 47 13943 0.34 13990 148 32 7743 0.41 7775 149 31 6773 0.46 6804 150 33 6523 0.50 6556