CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 85227 2959078 2.80 3044305 2 36077 1151 96.91 37228 3 1739 269104 0.64 270843 4 1977 425773 0.46 427750 5 2863 385991 0.74 388854 6 4504 432494 1.03 436998 7 2592 427503 0.60 430095 8 4889 441251 1.10 446140 9 8525 479494 1.75 488019 10 3405 488356 0.69 491761 11 2872 462727 0.62 465599 12 2933 507335 0.57 510268 13 2761 508728 0.54 511489 14 5352 449576 1.18 454928 15 3309 512680 0.64 515989 16 5923 514152 1.14 520075 17 4148 449573 0.91 453721 18 2727 494997 0.55 497724 19 3750 498057 0.75 501807 20 3567 469326 0.75 472893 21 3605 516626 0.69 520231 22 3272 516967 0.63 520239 23 2704 451298 0.60 454002 24 3047 487718 0.62 490765 25 2829 486294 0.58 489123 26 2510 460540 0.54 463050 27 3389 507391 0.66 510780 28 2675 482539 0.55 485214 29 2685 451462 0.59 454147 30 3101 513673 0.60 516774 31 2959 492293 0.60 495252 32 2471 439676 0.56 442147 33 2928 490924 0.59 493852 34 2473 472085 0.52 474558 35 2582 441158 0.58 443740 36 3012 497772 0.60 500784 37 2799 482679 0.58 485478 38 2583 435367 0.59 437950 39 3107 473716 0.65 476823 40 2669 459306 0.58 461975 41 2518 427896 0.59 430414 42 3087 469619 0.65 472706 43 2536 450321 0.56 452857 44 2478 417199 0.59 419677 45 2741 454295 0.60 457036 46 2615 443149 0.59 445764 47 2390 405411 0.59 407801 48 3003 451704 0.66 454707 49 2465 428551 0.57 431016 50 2426 390917 0.62 393343 51 2772 419863 0.66 422635 52 2389 403894 0.59 406283 53 2309 373740 0.61 376049 54 2629 421274 0.62 423903 55 2446 406207 0.60 408653 56 2439 375244 0.65 377683 57 2740 422576 0.64 425316 58 2363 396337 0.59 398700 59 2372 355311 0.66 357683 60 2535 397509 0.63 400044 61 2328 393565 0.59 395893 62 2211 356113 0.62 358324 63 2734 402457 0.67 405191 64 2191 370261 0.59 372452 65 2018 333840 0.60 335858 66 2492 376347 0.66 378839 67 2101 363333 0.57 365434 68 2104 339120 0.62 341224 69 2431 376064 0.64 378495 70 2114 354255 0.59 356369 71 2170 329779 0.65 331949 72 2293 359386 0.63 361679 73 2085 339489 0.61 341574 74 2039 309252 0.66 311291 75 2137 333793 0.64 335930 76 2056 329280 0.62 331336 77 1915 302253 0.63 304168 78 2091 335896 0.62 337987 79 2014 330607 0.61 332621 80 1870 301694 0.62 303564 81 2338 331999 0.70 334337 82 2010 308897 0.65 310907 83 1970 288194 0.68 290164 84 2167 313103 0.69 315270 85 1936 290904 0.66 292840 86 1620 273967 0.59 275587 87 2053 301250 0.68 303303 88 1908 297531 0.64 299439 89 1616 274693 0.58 276309 90 2166 301437 0.71 303603 91 1794 287960 0.62 289754 92 1810 274998 0.65 276808 93 2081 303469 0.68 305550 94 1664 284851 0.58 286515 95 1578 254195 0.62 255773 96 1950 281688 0.69 283638 97 1809 271737 0.66 273546 98 1719 251983 0.68 253702 99 1943 272238 0.71 274181 100 1565 248611 0.63 250176 101 1622 238763 0.67 240385 102 1810 262767 0.68 264577 103 1671 249472 0.67 251143 104 1515 231611 0.65 233126 105 1781 257730 0.69 259511 106 1544 244334 0.63 245878 107 1504 226752 0.66 228256 108 1792 245133 0.73 246925 109 1580 226533 0.69 228113 110 1389 216337 0.64 217726 111 1681 237565 0.70 239246 112 1527 221240 0.69 222767 113 1380 213280 0.64 214660 114 1647 237444 0.69 239091 115 1578 225816 0.69 227394 116 1218 206673 0.59 207891 117 1545 222783 0.69 224328 118 1434 211017 0.67 212451 119 1299 187140 0.69 188439 120 1521 206995 0.73 208516 121 1280 196357 0.65 197637 122 1253 195382 0.64 196635 123 1660 217480 0.76 219140 124 1361 207143 0.65 208504 125 1401 185785 0.75 187186 126 1553 199466 0.77 201019 127 1270 192309 0.66 193579 128 1163 178003 0.65 179166 129 1272 189732 0.67 191004 130 1234 179998 0.68 181232 131 1126 169737 0.66 170863 132 1347 186426 0.72 187773 133 1000 174921 0.57 175921 134 1048 164962 0.63 166010 135 1320 180774 0.72 182094 136 1197 167636 0.71 168833 137 1010 156798 0.64 157808 138 1310 172163 0.76 173473 139 1171 167397 0.69 168568 140 1303 152066 0.85 153369 141 1442 165749 0.86 167191 142 1446 162402 0.88 163848 143 1186 146710 0.80 147896 144 1450 166386 0.86 167836 145 1294 155774 0.82 157068 146 1145 143421 0.79 144566 147 1315 151810 0.86 153125 148 979 54135 1.78 55114 149 8368 63973 11.57 72341 150 9314 59686 13.50 69000 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 229 3134539 0.01 3134768 2 4291 2218 65.92 6509 3 30692 8521 78.27 39213 4 1389 337917 0.41 339306 5 1493 306491 0.48 307984 6 1829 327865 0.55 329694 7 1798 308918 0.58 310716 8 2619 405523 0.64 408142 9 2222 362022 0.61 364244 10 2204 362603 0.60 364807 11 2277 413530 0.55 415807 12 2429 402381 0.60 404810 13 2703 423456 0.63 426159 14 2022 399568 0.50 401590 15 2173 399062 0.54 401235 16 2242 414151 0.54 416393 17 2150 402730 0.53 404880 18 2803 393419 0.71 396222 19 4106 398791 1.02 402897 20 3664 401101 0.91 404765 21 2760 411021 0.67 413781 22 2326 394878 0.59 397204 23 2058 390168 0.52 392226 24 2206 388114 0.57 390320 25 1950 406601 0.48 408551 26 1891 390165 0.48 392056 27 1983 375337 0.53 377320 28 2143 400410 0.53 402553 29 2056 392416 0.52 394472 30 2016 399429 0.50 401445 31 1925 393591 0.49 395516 32 1868 375797 0.49 377665 33 2157 395930 0.54 398087 34 1939 389767 0.50 391706 35 1810 374469 0.48 376279 36 1873 381991 0.49 383864 37 1982 384235 0.51 386217 38 1886 399314 0.47 401200 39 1992 382571 0.52 384563 40 1748 353396 0.49 355144 41 1838 361425 0.51 363263 42 1972 366482 0.54 368454 43 1863 354766 0.52 356629 44 1742 351488 0.49 353230 45 1932 367605 0.52 369537 46 1820 353747 0.51 355567 47 1628 340407 0.48 342035 48 1935 369779 0.52 371714 49 1748 331875 0.52 333623 50 1814 349239 0.52 351053 51 1883 351313 0.53 353196 52 1609 322227 0.50 323836 53 1738 336030 0.51 337768 54 1803 332193 0.54 333996 55 1675 326035 0.51 327710 56 1621 330013 0.49 331634 57 1749 342017 0.51 343766 58 1577 314321 0.50 315898 59 1546 312851 0.49 314397 60 1736 313738 0.55 315474 61 1579 311186 0.50 312765 62 1544 304611 0.50 306155 63 1822 320805 0.56 322627 64 1597 298659 0.53 300256 65 1673 300609 0.55 302282 66 1581 292218 0.54 293799 67 1576 306545 0.51 308121 68 1458 295753 0.49 297211 69 1598 292404 0.54 294002 70 1578 290104 0.54 291682 71 1626 302773 0.53 304399 72 1822 290292 0.62 292114 73 1411 268292 0.52 269703 74 1581 278905 0.56 280486 75 1350 268548 0.50 269898 76 1443 275430 0.52 276873 77 1526 272390 0.56 273916 78 1531 264121 0.58 265652 79 1353 260849 0.52 262202 80 1460 259667 0.56 261127 81 1510 261494 0.57 263004 82 1372 248617 0.55 249989 83 1343 254306 0.53 255649 84 1469 252458 0.58 253927 85 1262 247950 0.51 249212 86 1282 241211 0.53 242493 87 1498 242181 0.61 243679 88 1217 235245 0.51 236462 89 1450 243463 0.59 244913 90 1485 249744 0.59 251229 91 1227 229182 0.53 230409 92 1272 241491 0.52 242763 93 1256 230566 0.54 231822 94 1179 221286 0.53 222465 95 1340 220938 0.60 222278 96 1282 230581 0.55 231863 97 1153 214451 0.53 215604 98 1254 214237 0.58 215491 99 1368 220956 0.62 222324 100 1095 202122 0.54 203217 101 1080 206558 0.52 207638 102 1162 204628 0.56 205790 103 1004 196245 0.51 197249 104 1159 202846 0.57 204005 105 1199 203570 0.59 204769 106 1122 196589 0.57 197711 107 979 200081 0.49 201060 108 1225 204188 0.60 205413 109 1033 188305 0.55 189338 110 1147 199877 0.57 201024 111 1091 196316 0.55 197407 112 1012 181033 0.56 182045 113 1079 182684 0.59 183763 114 1043 184836 0.56 185879 115 1025 182600 0.56 183625 116 932 170520 0.54 171452 117 1005 168353 0.59 169358 118 941 161347 0.58 162288 119 972 168423 0.57 169395 120 1006 170942 0.59 171948 121 856 155431 0.55 156287 122 920 172615 0.53 173535 123 939 171806 0.54 172745 124 886 159907 0.55 160793 125 1011 157944 0.64 158955 126 935 161276 0.58 162211 127 934 158456 0.59 159390 128 876 152188 0.57 153064 129 870 145386 0.59 146256 130 861 145940 0.59 146801 131 843 145961 0.57 146804 132 828 148927 0.55 149755 133 710 141142 0.50 141852 134 824 152898 0.54 153722 135 924 143674 0.64 144598 136 768 139790 0.55 140558 137 840 138452 0.60 139292 138 842 141642 0.59 142484 139 733 129914 0.56 130647 140 779 135031 0.57 135810 141 819 136996 0.59 137815 142 760 134207 0.56 134967 143 679 120017 0.56 120696 144 835 138262 0.60 139097 145 728 127124 0.57 127852 146 807 119428 0.67 120235 147 817 125820 0.65 126637 148 505 38703 1.29 39208 149 357 45944 0.77 46301 150 553 67741 0.81 68294 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 348 9041 3.71 9389 2 19083 566718 3.26 585801 3 16099 458206 3.39 474305 4 14714 815398 1.77 830112 5 9821 652431 1.48 662252 6 15326 703753 2.13 719079 7 8937 703529 1.25 712466 8 17738 663743 2.60 681481 9 15300 723174 2.07 738474 10 14667 741763 1.94 756430 11 12292 682424 1.77 694716 12 9998 734729 1.34 744727 13 15359 760265 1.98 775624 14 18128 654086 2.70 672214 15 18187 741738 2.39 759925 16 10455 755038 1.37 765493 17 15706 661460 2.32 677166 18 17505 755978 2.26 773483 19 13780 756384 1.79 770164 20 13166 645892 2.00 659058 21 9301 734155 1.25 743456 22 6061 725191 0.83 731252 23 5088 633504 0.80 638592 24 4557 723543 0.63 728100 25 9865 734478 1.33 744343 26 3274 619617 0.53 622891 27 3730 714698 0.52 718428 28 3569 725427 0.49 728996 29 3150 615986 0.51 619136 30 3267 689765 0.47 693032 31 3299 698771 0.47 702070 32 2993 607169 0.49 610162 33 3130 678176 0.46 681306 34 3098 692048 0.45 695146 35 2974 602726 0.49 605700 36 3035 654016 0.46 657051 37 3242 658171 0.49 661413 38 2937 591715 0.49 594652 39 2947 650113 0.45 653060 40 3081 649148 0.47 652229 41 2901 586368 0.49 589269 42 3039 644758 0.47 647797 43 2964 634541 0.46 637505 44 2692 571038 0.47 573730 45 2897 627362 0.46 630259 46 3020 615109 0.49 618129 47 2685 561192 0.48 563877 48 2893 606538 0.47 609431 49 2878 608168 0.47 611046 50 2646 545142 0.48 547788 51 2852 595505 0.48 598357 52 2840 593399 0.48 596239 53 2686 532826 0.50 535512 54 2826 582333 0.48 585159 55 2770 569389 0.48 572159 56 2455 516524 0.47 518979 57 2713 568230 0.48 570943 58 2670 560450 0.47 563120 59 2487 507837 0.49 510324 60 2759 549912 0.50 552671 61 2650 536500 0.49 539150 62 2306 481144 0.48 483450 63 2659 528111 0.50 530770 64 2493 534620 0.46 537113 65 2204 477819 0.46 480023 66 2395 522772 0.46 525167 67 2422 515667 0.47 518089 68 2272 458676 0.49 460948 69 2506 514459 0.48 516965 70 2490 512524 0.48 515014 71 2231 447554 0.50 449785 72 2533 500224 0.50 502757 73 2261 481956 0.47 484217 74 2192 437345 0.50 439537 75 2435 490007 0.49 492442 76 2218 472800 0.47 475018 77 1995 416529 0.48 418524 78 2282 462773 0.49 465055 79 2276 462277 0.49 464553 80 2130 411163 0.52 413293 81 2204 440956 0.50 443160 82 2149 454400 0.47 456549 83 1970 408615 0.48 410585 84 2179 446240 0.49 448419 85 2301 440501 0.52 442802 86 1860 395597 0.47 397457 87 1906 422150 0.45 424056 88 2071 419991 0.49 422062 89 1834 376709 0.48 378543 90 2087 408576 0.51 410663 91 2087 410929 0.51 413016 92 1770 357546 0.49 359316 93 1871 396721 0.47 398592 94 2058 397161 0.52 399219 95 1824 354814 0.51 356638 96 1975 403313 0.49 405288 97 1878 389718 0.48 391596 98 1791 344122 0.52 345913 99 1926 382878 0.50 384804 100 1911 380367 0.50 382278 101 1672 338478 0.49 340150 102 1967 371102 0.53 373069 103 1876 357110 0.52 358986 104 1723 317970 0.54 319693 105 1724 352628 0.49 354352 106 1722 343405 0.50 345127 107 1635 312075 0.52 313710 108 1621 337758 0.48 339379 109 1748 332640 0.52 334388 110 1461 303953 0.48 305414 111 1500 331779 0.45 333279 112 1633 322085 0.50 323718 113 1499 291730 0.51 293229 114 1617 312581 0.51 314198 115 1586 310376 0.51 311962 116 1430 273525 0.52 274955 117 1527 302619 0.50 304146 118 1577 311396 0.50 312973 119 1424 275565 0.51 276989 120 1511 298825 0.50 300336 121 1406 286104 0.49 287510 122 1393 261149 0.53 262542 123 1411 283277 0.50 284688 124 1383 275911 0.50 277294 125 1287 261336 0.49 262623 126 1399 281497 0.49 282896 127 1440 272086 0.53 273526 128 1376 249403 0.55 250779 129 1372 274139 0.50 275511 130 1416 259891 0.54 261307 131 1286 239907 0.53 241193 132 1355 262784 0.51 264139 133 1326 259195 0.51 260521 134 1238 234579 0.52 235817 135 1299 252630 0.51 253929 136 1407 251361 0.56 252768 137 1123 221740 0.50 222863 138 1256 250058 0.50 251314 139 1259 248080 0.50 249339 140 1116 219095 0.51 220211 141 1481 243215 0.61 244696 142 1267 233000 0.54 234267 143 1188 209156 0.56 210344 144 1242 234061 0.53 235303 145 1184 222611 0.53 223795 146 1143 206522 0.55 207665 147 1080 211710 0.51 212790 148 759 72807 1.03 73566 149 394 58600 0.67 58994 150 743 99177 0.74 99920 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 28100 981224 2.78 1009324 2 40081 815 98.01 40896 3 451 70621 0.63 71072 4 517 117687 0.44 118204 5 761 103846 0.73 104607 6 666 117673 0.56 118339 7 634 115330 0.55 115964 8 736 120295 0.61 121031 9 1057 125461 0.84 126518 10 1221 127055 0.95 128276 11 633 119907 0.53 120540 12 698 124911 0.56 125609 13 691 127787 0.54 128478 14 665 114128 0.58 114793 15 764 123966 0.61 124730 16 2667 123466 2.11 126133 17 597 111634 0.53 112231 18 676 119875 0.56 120551 19 619 120010 0.51 120629 20 669 107391 0.62 108060 21 658 113787 0.57 114445 22 620 115884 0.53 116504 23 573 103579 0.55 104152 24 606 109218 0.55 109824 25 642 106534 0.60 107176 26 550 97733 0.56 98283 27 609 109669 0.55 110278 28 546 106765 0.51 107311 29 639 96828 0.66 97467 30 628 102315 0.61 102943 31 518 101264 0.51 101782 32 550 94492 0.58 95042 33 582 102701 0.56 103283 34 576 101144 0.57 101720 35 600 92816 0.64 93416 36 477 98413 0.48 98890 37 516 97228 0.53 97744 38 522 90147 0.58 90669 39 508 90263 0.56 90771 40 519 90858 0.57 91377 41 479 85880 0.55 86359 42 476 91190 0.52 91666 43 493 91802 0.53 92295 44 449 84518 0.53 84967 45 458 86193 0.53 86651 46 488 90627 0.54 91115 47 408 83120 0.49 83528 48 549 84284 0.65 84833 49 431 81250 0.53 81681 50 407 74095 0.55 74502 51 398 81044 0.49 81442 52 395 78618 0.50 79013 53 429 73009 0.58 73438 54 418 76796 0.54 77214 55 460 76821 0.60 77281 56 421 72833 0.57 73254 57 376 78830 0.47 79206 58 401 77949 0.51 78350 59 385 68523 0.56 68908 60 422 72390 0.58 72812 61 395 75164 0.52 75559 62 373 66711 0.56 67084 63 410 70740 0.58 71150 64 343 68842 0.50 69185 65 339 63597 0.53 63936 66 367 66436 0.55 66803 67 428 64706 0.66 65134 68 316 60781 0.52 61097 69 319 64516 0.49 64835 70 349 64310 0.54 64659 71 321 61161 0.52 61482 72 331 65496 0.50 65827 73 341 63007 0.54 63348 74 318 57923 0.55 58241 75 325 59695 0.54 60020 76 350 57142 0.61 57492 77 233 51688 0.45 51921 78 242 56868 0.42 57110 79 308 57450 0.53 57758 80 308 51888 0.59 52196 81 291 53701 0.54 53992 82 270 54218 0.50 54488 83 302 50407 0.60 50709 84 309 50865 0.60 51174 85 226 48943 0.46 49169 86 247 45939 0.53 46186 87 253 47986 0.52 48239 88 227 49336 0.46 49563 89 265 48519 0.54 48784 90 235 50001 0.47 50236 91 244 49330 0.49 49574 92 239 45047 0.53 45286 93 238 46783 0.51 47021 94 253 47547 0.53 47800 95 245 41969 0.58 42214 96 219 45457 0.48 45676 97 281 47332 0.59 47613 98 229 43799 0.52 44028 99 240 44894 0.53 45134 100 202 44194 0.45 44396 101 215 39151 0.55 39366 102 187 41293 0.45 41480 103 221 41137 0.53 41358 104 224 39330 0.57 39554 105 217 40060 0.54 40277 106 160 38497 0.41 38657 107 202 35805 0.56 36007 108 183 38532 0.47 38715 109 204 39494 0.51 39698 110 186 35459 0.52 35645 111 184 36229 0.51 36413 112 164 36032 0.45 36196 113 161 33381 0.48 33542 114 178 35267 0.50 35445 115 164 34922 0.47 35086 116 161 32499 0.49 32660 117 161 32039 0.50 32200 118 160 31469 0.51 31629 119 159 30042 0.53 30201 120 164 31530 0.52 31694 121 193 32392 0.59 32585 122 139 30272 0.46 30411 123 115 31891 0.36 32006 124 160 32837 0.48 32997 125 140 29356 0.47 29496 126 144 29536 0.49 29680 127 135 29371 0.46 29506 128 187 27506 0.68 27693 129 149 27623 0.54 27772 130 133 28495 0.46 28628 131 118 28161 0.42 28279 132 142 28036 0.50 28178 133 120 28201 0.42 28321 134 125 25574 0.49 25699 135 152 26810 0.56 26962 136 110 25614 0.43 25724 137 93 24897 0.37 24990 138 115 25996 0.44 26111 139 120 26175 0.46 26295 140 126 24051 0.52 24177 141 104 24351 0.43 24455 142 111 23233 0.48 23344 143 112 21361 0.52 21473 144 79 24002 0.33 24081 145 108 23195 0.46 23303 146 120 20356 0.59 20476 147 111 22189 0.50 22300 148 75 12726 0.59 12801 149 57 10416 0.54 10473 150 58 10090 0.57 10148 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 373 865793 0.04 866166 2 264 496 34.74 760 3 10754 2614 80.45 13368 4 384 94009 0.41 94393 5 424 89654 0.47 90078 6 576 92820 0.62 93396 7 476 82875 0.57 83351 8 943 107968 0.87 108911 9 554 96191 0.57 96745 10 660 88504 0.74 89164 11 516 109843 0.47 110359 12 553 101243 0.54 101796 13 596 105089 0.56 105685 14 576 101862 0.56 102438 15 590 99109 0.59 99699 16 571 99451 0.57 100022 17 581 96709 0.60 97290 18 558 95015 0.58 95573 19 529 93486 0.56 94015 20 473 95123 0.49 95596 21 518 94983 0.54 95501 22 550 91765 0.60 92315 23 467 91075 0.51 91542 24 488 82551 0.59 83039 25 483 92637 0.52 93120 26 507 88703 0.57 89210 27 469 82613 0.56 83082 28 494 84634 0.58 85128 29 493 85890 0.57 86383 30 501 80384 0.62 80885 31 491 79966 0.61 80457 32 423 79529 0.53 79952 33 400 82239 0.48 82639 34 473 82226 0.57 82699 35 453 76409 0.59 76862 36 459 76067 0.60 76526 37 459 77536 0.59 77995 38 408 82978 0.49 83386 39 377 79511 0.47 79888 40 407 73360 0.55 73767 41 464 79715 0.58 80179 42 453 69358 0.65 69811 43 369 75668 0.49 76037 44 371 69438 0.53 69809 45 433 74729 0.58 75162 46 426 70846 0.60 71272 47 349 70204 0.49 70553 48 332 65097 0.51 65429 49 282 64194 0.44 64476 50 439 70823 0.62 71262 51 337 68827 0.49 69164 52 328 63996 0.51 64324 53 353 65111 0.54 65464 54 376 62091 0.60 62467 55 325 62577 0.52 62902 56 328 63840 0.51 64168 57 356 65429 0.54 65785 58 292 56959 0.51 57251 59 272 58988 0.46 59260 60 311 59786 0.52 60097 61 268 54624 0.49 54892 62 332 59669 0.55 60001 63 347 58363 0.59 58710 64 281 55576 0.50 55857 65 312 54394 0.57 54706 66 315 53497 0.59 53812 67 333 57037 0.58 57370 68 286 54106 0.53 54392 69 286 49204 0.58 49490 70 258 50833 0.50 51091 71 337 54412 0.62 54749 72 253 48680 0.52 48933 73 288 52135 0.55 52423 74 236 50560 0.46 50796 75 279 47010 0.59 47289 76 240 46810 0.51 47050 77 241 47820 0.50 48061 78 218 45968 0.47 46186 79 231 44418 0.52 44649 80 237 45778 0.52 46015 81 211 44748 0.47 44959 82 220 39874 0.55 40094 83 219 43478 0.50 43697 84 192 44065 0.43 44257 85 222 43994 0.50 44216 86 217 41174 0.52 41391 87 184 42368 0.43 42552 88 198 39027 0.50 39225 89 218 41119 0.53 41337 90 146 38978 0.37 39124 91 223 41575 0.53 41798 92 181 37950 0.47 38131 93 166 37953 0.44 38119 94 180 38246 0.47 38426 95 204 38082 0.53 38286 96 170 37214 0.45 37384 97 183 36836 0.49 37019 98 199 37180 0.53 37379 99 199 35516 0.56 35715 100 171 32983 0.52 33154 101 167 34718 0.48 34885 102 133 33294 0.40 33427 103 147 32164 0.45 32311 104 147 34469 0.42 34616 105 107 29801 0.36 29908 106 164 31754 0.51 31918 107 172 33600 0.51 33772 108 157 30194 0.52 30351 109 117 29473 0.40 29590 110 153 33349 0.46 33502 111 122 28014 0.43 28136 112 134 28524 0.47 28658 113 149 28645 0.52 28794 114 146 28959 0.50 29105 115 121 29003 0.42 29124 116 131 28675 0.45 28806 117 128 26457 0.48 26585 118 142 27927 0.51 28069 119 139 26998 0.51 27137 120 109 26381 0.41 26490 121 105 24470 0.43 24575 122 114 26632 0.43 26746 123 86 25224 0.34 25310 124 128 24401 0.52 24529 125 137 25751 0.53 25888 126 93 24908 0.37 25001 127 149 25967 0.57 26116 128 156 24478 0.63 24634 129 120 21951 0.54 22071 130 112 23813 0.47 23925 131 106 24416 0.43 24522 132 98 24259 0.40 24357 133 107 21084 0.50 21191 134 146 23748 0.61 23894 135 109 22788 0.48 22897 136 116 22484 0.51 22600 137 114 21720 0.52 21834 138 94 22274 0.42 22368 139 93 20220 0.46 20313 140 98 19847 0.49 19945 141 97 21050 0.46 21147 142 103 21966 0.47 22069 143 87 19419 0.45 19506 144 91 17202 0.53 17293 145 82 17382 0.47 17464 146 86 19048 0.45 19134 147 72 18179 0.39 18251 148 55 9730 0.56 9785 149 59 9842 0.60 9901 150 42 8999 0.46 9041 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 220 908 19.50 1128 2 1272 154135 0.82 155407 3 1047 126394 0.82 127441 4 1389 224849 0.61 226238 5 1472 182188 0.80 183660 6 1070 193176 0.55 194246 7 1139 187008 0.61 188147 8 1091 174549 0.62 175640 9 1164 194127 0.60 195291 10 1046 194664 0.53 195710 11 1067 182937 0.58 184004 12 1016 191930 0.53 192946 13 1381 197302 0.70 198683 14 888 167137 0.53 168025 15 939 186322 0.50 187261 16 985 183762 0.53 184747 17 989 161721 0.61 162710 18 984 180778 0.54 181762 19 902 182722 0.49 183624 20 815 158183 0.51 158998 21 971 173413 0.56 174384 22 837 170299 0.49 171136 23 893 147822 0.60 148715 24 820 172305 0.47 173125 25 857 167818 0.51 168675 26 770 146925 0.52 147695 27 850 162674 0.52 163524 28 804 161178 0.50 161982 29 764 141008 0.54 141772 30 794 156672 0.50 157466 31 762 159800 0.47 160562 32 750 138483 0.54 139233 33 740 149441 0.49 150181 34 726 155952 0.46 156678 35 734 134322 0.54 135056 36 721 146968 0.49 147689 37 708 148662 0.47 149370 38 703 131168 0.53 131871 39 738 141231 0.52 141969 40 686 141034 0.48 141720 41 692 130145 0.53 130837 42 633 137410 0.46 138043 43 615 130396 0.47 131011 44 679 124428 0.54 125107 45 668 135225 0.49 135893 46 678 134585 0.50 135263 47 604 113930 0.53 114534 48 681 128968 0.53 129649 49 630 125391 0.50 126021 50 676 118309 0.57 118985 51 613 121469 0.50 122082 52 600 119696 0.50 120296 53 569 109974 0.51 110543 54 543 122636 0.44 123179 55 607 115556 0.52 116163 56 536 108766 0.49 109302 57 570 113239 0.50 113809 58 632 112813 0.56 113445 59 518 103773 0.50 104291 60 542 109966 0.49 110508 61 537 107616 0.50 108153 62 516 98629 0.52 99145 63 539 106544 0.50 107083 64 518 105985 0.49 106503 65 519 96973 0.53 97492 66 485 102177 0.47 102662 67 518 103902 0.50 104420 68 535 90645 0.59 91180 69 515 105368 0.49 105883 70 497 100432 0.49 100929 71 421 87016 0.48 87437 72 471 97004 0.48 97475 73 404 91565 0.44 91969 74 432 80731 0.53 81163 75 408 92503 0.44 92911 76 452 93255 0.48 93707 77 445 79130 0.56 79575 78 392 88719 0.44 89111 79 370 84634 0.44 85004 80 400 79571 0.50 79971 81 380 83958 0.45 84338 82 364 84022 0.43 84386 83 439 77030 0.57 77469 84 403 87026 0.46 87429 85 419 83838 0.50 84257 86 384 74310 0.51 74694 87 314 79036 0.40 79350 88 357 77653 0.46 78010 89 331 67760 0.49 68091 90 432 75555 0.57 75987 91 388 74800 0.52 75188 92 292 67091 0.43 67383 93 358 74640 0.48 74998 94 339 71121 0.47 71460 95 361 65606 0.55 65967 96 341 72783 0.47 73124 97 277 70299 0.39 70576 98 305 60416 0.50 60721 99 296 69214 0.43 69510 100 333 66927 0.50 67260 101 308 61585 0.50 61893 102 310 67661 0.46 67971 103 304 66240 0.46 66544 104 296 55624 0.53 55920 105 306 63199 0.48 63505 106 307 63219 0.48 63526 107 247 57301 0.43 57548 108 299 57828 0.51 58127 109 307 58111 0.53 58418 110 280 54601 0.51 54881 111 235 58137 0.40 58372 112 286 58864 0.48 59150 113 273 50893 0.53 51166 114 276 57072 0.48 57348 115 284 58012 0.49 58296 116 258 50348 0.51 50606 117 259 55760 0.46 56019 118 245 53055 0.46 53300 119 264 49920 0.53 50184 120 245 51820 0.47 52065 121 239 49677 0.48 49916 122 213 49194 0.43 49407 123 229 49881 0.46 50110 124 190 49010 0.39 49200 125 186 43512 0.43 43698 126 211 47730 0.44 47941 127 225 48556 0.46 48781 128 199 43670 0.45 43869 129 233 46889 0.49 47122 130 232 43682 0.53 43914 131 201 40037 0.50 40238 132 242 46069 0.52 46311 133 203 42647 0.47 42850 134 177 38155 0.46 38332 135 207 42841 0.48 43048 136 202 43070 0.47 43272 137 171 37844 0.45 38015 138 177 40206 0.44 40383 139 196 42420 0.46 42616 140 153 35780 0.43 35933 141 216 42026 0.51 42242 142 173 40816 0.42 40989 143 210 36875 0.57 37085 144 240 40557 0.59 40797 145 162 36197 0.45 36359 146 151 34045 0.44 34196 147 156 36039 0.43 36195 148 124 20315 0.61 20439 149 99 17888 0.55 17987 150 87 17009 0.51 17096