CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3219775 70657897 4.36 73877672 2 866743 116175 88.18 982918 3 53080 4007953 1.31 4061033 4 67428 7482986 0.89 7550414 5 110433 7542562 1.44 7652995 6 97847 6675545 1.44 6773392 7 101609 6840839 1.46 6942448 8 111704 6794577 1.62 6906281 9 129234 6995419 1.81 7124653 10 159459 7256058 2.15 7415517 11 90542 7017158 1.27 7107700 12 104121 7553768 1.36 7657889 13 82751 6661614 1.23 6744365 14 92326 7145695 1.28 7238021 15 114530 7226878 1.56 7341408 16 369292 8410920 4.21 8780212 17 102234 7439418 1.36 7541652 18 68296 6276661 1.08 6344957 19 59812 6094362 0.97 6154174 20 67452 6087285 1.10 6154737 21 88109 6945457 1.25 7033566 22 85393 7807705 1.08 7893098 23 98999 8167793 1.20 8266792 24 82525 6150371 1.32 6232896 25 86147 6553656 1.30 6639803 26 67970 5953630 1.13 6021600 27 69422 6702366 1.03 6771788 28 69115 6920510 0.99 6989625 29 104366 7428059 1.39 7532425 30 105436 7492782 1.39 7598218 31 121744 7617128 1.57 7738872 32 111925 8059298 1.37 8171223 33 123343 8297788 1.46 8421131 34 146474 9541742 1.51 9688216 35 80385 7095605 1.12 7175990 36 118141 7293978 1.59 7412119 37 81132 6746721 1.19 6827853 38 75862 6958113 1.08 7033975 39 92398 7075261 1.29 7167659 40 142700 7797857 1.80 7940557 41 98069 7718492 1.25 7816561 42 87673 6437564 1.34 6525237 43 84397 6328067 1.32 6412464 44 92782 6351380 1.44 6444162 45 83322 6318730 1.30 6402052 46 69619 5694695 1.21 5764314 47 88838 6352713 1.38 6441551 48 77071 5988092 1.27 6065163 49 81616 5747867 1.40 5829483 50 72695 5724943 1.25 5797638 51 110581 7088359 1.54 7198940 52 100046 7884392 1.25 7984438 53 80825 7147735 1.12 7228560 54 90877 6052993 1.48 6143870 55 63475 5274615 1.19 5338090 56 94018 5494544 1.68 5588562 57 64321 5305740 1.20 5370061 58 87390 7339313 1.18 7426703 59 82421 7972691 1.02 8055112 60 63503 5176448 1.21 5239951 61 68546 5506469 1.23 5575015 62 61980 6119578 1.00 6181558 63 74000 6897863 1.06 6971863 64 66853 5126404 1.29 5193257 65 66622 5355903 1.23 5422525 66 72792 5796816 1.24 5869608 67 60441 5556758 1.08 5617199 68 52572 5186145 1.00 5238717 69 55444 5815844 0.94 5871288 70 47360 4813833 0.97 4861193 71 50629 4579352 1.09 4629981 72 75931 4790547 1.56 4866478 73 57672 4735823 1.20 4793495 74 57135 5048600 1.12 5105735 75 52430 4866902 1.07 4919332 76 57611 4804251 1.18 4861862 77 55091 4373942 1.24 4429033 78 40910 4221146 0.96 4262056 79 40962 4408758 0.92 4449720 80 48591 4312284 1.11 4360875 81 53710 4489633 1.18 4543343 82 74818 6057209 1.22 6132027 83 69829 6660836 1.04 6730665 84 67073 4841054 1.37 4908127 85 52999 4230662 1.24 4283661 86 59315 6279952 0.94 6339267 87 102551 7543911 1.34 7646462 88 63630 4737500 1.33 4801130 89 48725 4195816 1.15 4244541 90 57351 4249060 1.33 4306411 91 44550 4039277 1.09 4083827 92 43346 4344159 0.99 4387505 93 66387 6798815 0.97 6865202 94 87369 6817064 1.27 6904433 95 69222 4340475 1.57 4409697 96 65797 4415367 1.47 4481164 97 59871 3839932 1.54 3899803 98 50503 4109274 1.21 4159777 99 69037 4319016 1.57 4388053 100 40310 4013395 0.99 4053705 101 40513 3721908 1.08 3762421 102 45006 3824087 1.16 3869093 103 47326 3751111 1.25 3798437 104 98381 5107497 1.89 5205878 105 66536 5059521 1.30 5126057 106 50925 4011447 1.25 4062372 107 46282 3932441 1.16 3978723 108 41849 3634754 1.14 3676603 109 44522 3815559 1.15 3860081 110 55575 4122440 1.33 4178015 111 70137 4566556 1.51 4636693 112 83322 4697037 1.74 4780359 113 73891 4797135 1.52 4871026 114 94307 4892827 1.89 4987134 115 68191 4934427 1.36 5002618 116 73981 4708161 1.55 4782142 117 41842 3222049 1.28 3263891 118 38498 3337043 1.14 3375541 119 37260 3208817 1.15 3246077 120 76208 4408577 1.70 4484785 121 53191 3892778 1.35 3945969 122 57281 4454962 1.27 4512243 123 76930 4414521 1.71 4491451 124 38453 3260085 1.17 3298538 125 35755 3127094 1.13 3162849 126 44974 3220579 1.38 3265553 127 45638 3312041 1.36 3357679 128 59728 3839941 1.53 3899669 129 67306 4344979 1.53 4412285 130 40582 2972120 1.35 3012702 131 32631 2790372 1.16 2823003 132 48623 3068622 1.56 3117245 133 37155 2756994 1.33 2794149 134 31951 2729651 1.16 2761602 135 35793 2939128 1.20 2974921 136 30932 2663789 1.15 2694721 137 35744 2632107 1.34 2667851 138 32664 2630994 1.23 2663658 139 35125 2742643 1.26 2777768 140 68990 3496944 1.93 3565934 141 37647 2585241 1.44 2622888 142 38869 2589097 1.48 2627966 143 38510 2753329 1.38 2791839 144 136440 4452678 2.97 4589118 145 57831 2623951 2.16 2681782 146 36136 2717203 1.31 2753339 147 30431 2303686 1.30 2334117 148 27400 848169 3.13 875569 149 239185 993952 19.40 1233137 150 431681 978450 30.61 1410131 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 215173 83002336 0.26 83217509 2 124430 406028 23.46 530458 3 738840 292920 71.61 1031760 4 32233 7435354 0.43 7467587 5 29951 5556877 0.54 5586828 6 31719 5176248 0.61 5207967 7 33328 5814025 0.57 5847353 8 56306 5933569 0.94 5989875 9 46240 9085375 0.51 9131615 10 39777 6082390 0.65 6122167 11 29929 5323110 0.56 5353039 12 31244 6336751 0.49 6367995 13 30976 6207479 0.50 6238455 14 29136 5964613 0.49 5993749 15 30951 6366488 0.48 6397439 16 38332 8761431 0.44 8799763 17 42916 7484565 0.57 7527481 18 35150 6246677 0.56 6281827 19 38373 6912668 0.55 6951041 20 35242 5709304 0.61 5744546 21 44288 7122195 0.62 7166483 22 46095 8140510 0.56 8186605 23 41803 5930123 0.70 5971926 24 38517 5940366 0.64 5978883 25 41298 6515516 0.63 6556814 26 39247 5845050 0.67 5884297 27 37286 6686198 0.55 6723484 28 40780 7526907 0.54 7567687 29 39952 6860220 0.58 6900172 30 33748 5772068 0.58 5805816 31 61089 9563307 0.63 9624396 32 28015 5437938 0.51 5465953 33 33871 5533624 0.61 5567495 34 55977 10399050 0.54 10455027 35 28378 5594500 0.50 5622878 36 36355 6223546 0.58 6259901 37 30784 6349325 0.48 6380109 38 37274 7602974 0.49 7640248 39 31289 6318568 0.49 6349857 40 31599 5963694 0.53 5995293 41 30237 6089715 0.49 6119952 42 30469 6104069 0.50 6134538 43 30228 6109873 0.49 6140101 44 29098 5665665 0.51 5694763 45 33620 6601355 0.51 6634975 46 29098 5868157 0.49 5897255 47 30299 5869373 0.51 5899672 48 29415 5668300 0.52 5697715 49 28887 5389579 0.53 5418466 50 30709 5924723 0.52 5955432 51 36817 7111209 0.52 7148026 52 27105 5139050 0.52 5166155 53 27966 5266849 0.53 5294815 54 31325 5989840 0.52 6021165 55 28908 5476557 0.53 5505465 56 26665 4872222 0.54 4898887 57 27633 5211056 0.53 5238689 58 29746 5956125 0.50 5985871 59 26918 5476142 0.49 5503060 60 25661 4876758 0.52 4902419 61 28161 5387537 0.52 5415698 62 25727 5186653 0.49 5212380 63 27759 5586124 0.49 5613883 64 26312 4972475 0.53 4998787 65 25908 4790853 0.54 4816761 66 26082 4691631 0.55 4717713 67 24194 4531313 0.53 4555507 68 25536 4998461 0.51 5023997 69 24931 4698894 0.53 4723825 70 24451 4664151 0.52 4688602 71 23297 4547560 0.51 4570857 72 25846 4867628 0.53 4893474 73 22568 4394235 0.51 4416803 74 23994 4759482 0.50 4783476 75 25362 5118159 0.49 5143521 76 22497 4234369 0.53 4256866 77 21801 4182002 0.52 4203803 78 24819 4753426 0.52 4778245 79 24257 4909598 0.49 4933855 80 20494 3931951 0.52 3952445 81 23736 4378180 0.54 4401916 82 22436 4305037 0.52 4327473 83 21942 4349124 0.50 4371066 84 23378 4361699 0.53 4385077 85 22681 4364743 0.52 4387424 86 25218 4840814 0.52 4866032 87 25633 4468504 0.57 4494137 88 24241 4698852 0.51 4723093 89 22026 4159689 0.53 4181715 90 22744 4208175 0.54 4230919 91 19890 3850383 0.51 3870273 92 19882 3750997 0.53 3770879 93 24425 4305129 0.56 4329554 94 26178 5743999 0.45 5770177 95 21652 4232535 0.51 4254187 96 24375 4245895 0.57 4270270 97 22611 4536997 0.50 4559608 98 19506 3869382 0.50 3888888 99 21916 4190780 0.52 4212696 100 21708 4106749 0.53 4128457 101 18158 3478558 0.52 3496716 102 19884 3772997 0.52 3792881 103 22461 4187743 0.53 4210204 104 21468 3800989 0.56 3822457 105 23285 4379684 0.53 4402969 106 20556 4008944 0.51 4029500 107 30590 6164520 0.49 6195110 108 19700 3767441 0.52 3787141 109 22123 3849983 0.57 3872106 110 21073 3801525 0.55 3822598 111 32856 7057105 0.46 7089961 112 16860 3389780 0.49 3406640 113 17191 3271601 0.52 3288792 114 25681 4881096 0.52 4906777 115 17091 3113995 0.55 3131086 116 19453 4649705 0.42 4669158 117 17746 3140796 0.56 3158542 118 17766 3331438 0.53 3349204 119 17591 3249278 0.54 3266869 120 28864 3936231 0.73 3965095 121 17105 3176739 0.54 3193844 122 17115 3370131 0.51 3387246 123 25435 4751374 0.53 4776809 124 17115 3176513 0.54 3193628 125 15940 3018204 0.53 3034144 126 17903 2987927 0.60 3005830 127 31536 3249353 0.96 3280889 128 28833 4371211 0.66 4400044 129 23086 4373838 0.53 4396924 130 15289 2627466 0.58 2642755 131 14852 2626792 0.56 2641644 132 16738 2893664 0.58 2910402 133 14915 2641940 0.56 2656855 134 13245 2395384 0.55 2408629 135 14796 2726046 0.54 2740842 136 25044 5142427 0.48 5167471 137 15855 2855782 0.55 2871637 138 16353 2663628 0.61 2679981 139 14347 2558673 0.56 2573020 140 12769 2293568 0.55 2306337 141 13909 2472016 0.56 2485925 142 13367 2349637 0.57 2363004 143 14494 2464670 0.58 2479164 144 47979 5230476 0.91 5278455 145 14302 2386987 0.60 2401289 146 15765 2550810 0.61 2566575 147 13307 2179137 0.61 2192444 148 9594 804648 1.18 814242 149 14332 975189 1.45 989521 150 15974 1250740 1.26 1266714 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 63190 4816136 1.30 4879326 2 512800 16233841 3.06 16746641 3 527385 14688112 3.47 15215497 4 268176 22418431 1.18 22686607 5 355437 20942473 1.67 21297910 6 276403 23521145 1.16 23797548 7 283749 21373316 1.31 21657065 8 338508 21636994 1.54 21975502 9 268049 20389809 1.30 20657858 10 290712 21241233 1.35 21531945 11 273438 21403979 1.26 21677417 12 300761 23619789 1.26 23920550 13 368941 23131135 1.57 23500076 14 313020 20540090 1.50 20853110 15 298181 24333328 1.21 24631509 16 316681 21190502 1.47 21507183 17 293845 22887157 1.27 23181002 18 319637 23364124 1.35 23683761 19 329075 21832921 1.48 22161996 20 322621 21780591 1.46 22103212 21 278325 22990566 1.20 23268891 22 315052 23279684 1.34 23594736 23 312177 21824267 1.41 22136444 24 245116 23014192 1.05 23259308 25 244145 21082135 1.14 21326280 26 214197 21288256 1.00 21502453 27 238149 23531802 1.00 23769951 28 188843 21379697 0.88 21568540 29 212057 20414713 1.03 20626770 30 166191 21865938 0.75 22032129 31 168066 20736048 0.80 20904114 32 119526 19916869 0.60 20036395 33 115516 20184420 0.57 20299936 34 112795 19777582 0.57 19890377 35 109010 20419208 0.53 20528218 36 107896 20114241 0.53 20222137 37 113848 22223493 0.51 22337341 38 105095 20829710 0.50 20934805 39 101201 19261886 0.52 19363087 40 99531 19792210 0.50 19891741 41 93599 19010548 0.49 19104147 42 95341 19099783 0.50 19195124 43 98466 20379266 0.48 20477732 44 98044 20280956 0.48 20379000 45 95228 20002352 0.47 20097580 46 92093 19092031 0.48 19184124 47 90685 18500078 0.49 18590763 48 94326 20107322 0.47 20201648 49 90989 19913485 0.45 20004474 50 92977 19000393 0.49 19093370 51 94792 19600503 0.48 19695295 52 81009 16992102 0.47 17073111 53 85290 17952051 0.47 18037341 54 92369 19212928 0.48 19305297 55 85341 18214627 0.47 18299968 56 83681 17488699 0.48 17572380 57 84017 17605016 0.47 17689033 58 85168 18140157 0.47 18225325 59 78826 16277127 0.48 16355953 60 82801 17393832 0.47 17476633 61 76073 16038044 0.47 16114117 62 80538 17024070 0.47 17104608 63 81596 18179881 0.45 18261477 64 78426 16176854 0.48 16255280 65 76993 16877407 0.45 16954400 66 77185 16199033 0.47 16276218 67 77361 16895417 0.46 16972778 68 77605 16892288 0.46 16969893 69 75515 16226613 0.46 16302128 70 83601 18393938 0.45 18477539 71 73387 14963747 0.49 15037134 72 81902 17078562 0.48 17160464 73 79581 17007421 0.47 17087002 74 71160 15049813 0.47 15120973 75 79868 17607122 0.45 17686990 76 75620 16195739 0.46 16271359 77 77361 16768790 0.46 16846151 78 76102 16671824 0.45 16747926 79 72045 15022814 0.48 15094859 80 72420 16279445 0.44 16351865 81 66874 14391009 0.46 14457883 82 72761 16050578 0.45 16123339 83 70998 15207752 0.46 15278750 84 66846 14130431 0.47 14197277 85 65732 14283913 0.46 14349645 86 66545 13838639 0.48 13905184 87 63067 13295652 0.47 13358719 88 62758 13525845 0.46 13588603 89 64818 13634755 0.47 13699573 90 64995 14081784 0.46 14146779 91 66549 14548703 0.46 14615252 92 62154 13097089 0.47 13159243 93 63098 13284650 0.47 13347748 94 60289 13161081 0.46 13221370 95 59928 12965573 0.46 13025501 96 65455 14235361 0.46 14300816 97 63038 13877788 0.45 13940826 98 58039 12269227 0.47 12327266 99 62755 13625708 0.46 13688463 100 57474 12267507 0.47 12324981 101 60249 13454921 0.45 13515170 102 61522 12889265 0.48 12950787 103 55905 11643025 0.48 11698930 104 58741 11713078 0.50 11771819 105 70957 14123972 0.50 14194929 106 54439 11788767 0.46 11843206 107 62709 13371585 0.47 13434294 108 67711 14614253 0.46 14681964 109 55526 11781170 0.47 11836696 110 59495 12253797 0.48 12313292 111 55053 11685367 0.47 11740420 112 52890 11573663 0.45 11626553 113 52801 11090118 0.47 11142919 114 51387 10965580 0.47 11016967 115 59352 12877334 0.46 12936686 116 73938 12267263 0.60 12341201 117 56189 12172845 0.46 12229034 118 57673 12799423 0.45 12857096 119 51283 10419577 0.49 10470860 120 51023 10205711 0.50 10256734 121 54692 11078848 0.49 11133540 122 50758 10682902 0.47 10733660 123 50050 11061963 0.45 11112013 124 48349 10715868 0.45 10764217 125 44836 9104649 0.49 9149485 126 44644 9307688 0.48 9352332 127 52854 10930899 0.48 10983753 128 49754 10368763 0.48 10418517 129 45216 9452106 0.48 9497322 130 51189 11402477 0.45 11453666 131 45053 9291036 0.48 9336089 132 48392 9845072 0.49 9893464 133 48588 10170297 0.48 10218885 134 42493 8621489 0.49 8663982 135 43493 8435883 0.51 8479376 136 39691 8221393 0.48 8261084 137 48302 9773349 0.49 9821651 138 41761 8556623 0.49 8598384 139 46116 9920493 0.46 9966609 140 40349 8184941 0.49 8225290 141 43635 8247045 0.53 8290680 142 43857 8145065 0.54 8188922 143 44404 9004750 0.49 9049154 144 41908 8027526 0.52 8069434 145 42253 7912687 0.53 7954940 146 47227 7552185 0.62 7599412 147 40010 7630303 0.52 7670313 148 24145 2456728 0.97 2480873 149 18012 2382862 0.75 2400874 150 28065 3575868 0.78 3603933 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1318461 29262384 4.31 30580845 2 884104 63206 93.33 947310 3 16277 1302014 1.23 1318291 4 18280 2413260 0.75 2431540 5 20477 1863400 1.09 1883877 6 17895 1824456 0.97 1842351 7 17663 1984053 0.88 2001716 8 23697 1999420 1.17 2023117 9 44535 2022608 2.15 2067143 10 46452 2038297 2.23 2084749 11 16138 2089409 0.77 2105547 12 17950 2151763 0.83 2169713 13 16698 2074246 0.80 2090944 14 18848 2061465 0.91 2080313 15 50086 2187497 2.24 2237583 16 199220 2353193 7.81 2552413 17 25567 1970029 1.28 1995596 18 14842 1900620 0.77 1915462 19 16595 1935889 0.85 1952484 20 18474 1945870 0.94 1964344 21 16737 1925669 0.86 1942406 22 15910 1845326 0.85 1861236 23 16418 1771103 0.92 1787521 24 11926 1640529 0.72 1652455 25 13595 1832553 0.74 1846148 26 13996 1771264 0.78 1785260 27 12924 1714178 0.75 1727102 28 11511 1670003 0.68 1681514 29 13685 1860305 0.73 1873990 30 13602 1773467 0.76 1787069 31 17923 2033534 0.87 2051457 32 12356 1583356 0.77 1595712 33 16423 1928257 0.84 1944680 34 12166 1726025 0.70 1738191 35 11059 1511388 0.73 1522447 36 11368 1488626 0.76 1499994 37 12529 1648501 0.75 1661030 38 11138 1631555 0.68 1642693 39 11178 1536531 0.72 1547709 40 15266 1775293 0.85 1790559 41 12102 1476245 0.81 1488347 42 11951 1511837 0.78 1523788 43 13377 1536454 0.86 1549831 44 12417 1440311 0.85 1452728 45 10208 1297747 0.78 1307955 46 9836 1333318 0.73 1343154 47 10320 1422141 0.72 1432461 48 10824 1453982 0.74 1464806 49 9956 1348842 0.73 1358798 50 9499 1292298 0.73 1301797 51 11516 1587803 0.72 1599319 52 8919 1305878 0.68 1314797 53 10037 1269026 0.78 1279063 54 8502 1233715 0.68 1242217 55 8868 1244438 0.71 1253306 56 9579 1254703 0.76 1264282 57 10221 1240730 0.82 1250951 58 13138 1420870 0.92 1434008 59 8760 1182890 0.74 1191650 60 8282 1165315 0.71 1173597 61 8581 1194067 0.71 1202648 62 7926 1137302 0.69 1145228 63 8093 1149316 0.70 1157409 64 7594 1166486 0.65 1174080 65 7740 1107264 0.69 1115004 66 7631 1088012 0.70 1095643 67 8520 1187314 0.71 1195834 68 7802 1096201 0.71 1104003 69 7752 1032583 0.75 1040335 70 8253 1089730 0.75 1097983 71 8714 1090268 0.79 1098982 72 9208 1078296 0.85 1087504 73 8850 1067540 0.82 1076390 74 9378 1021872 0.91 1031250 75 7587 1006769 0.75 1014356 76 7059 954915 0.73 961974 77 6704 904371 0.74 911075 78 6071 881902 0.68 887973 79 6061 863420 0.70 869481 80 6050 879539 0.68 885589 81 6547 930507 0.70 937054 82 8414 1239618 0.67 1248032 83 6181 965772 0.64 971953 84 6026 948076 0.63 954102 85 7875 937568 0.83 945443 86 8349 1128041 0.73 1136390 87 6655 932750 0.71 939405 88 12040 906551 1.31 918591 89 5822 855379 0.68 861201 90 6044 848664 0.71 854708 91 5980 777906 0.76 783886 92 6519 1001577 0.65 1008096 93 5716 862679 0.66 868395 94 7628 957610 0.79 965238 95 5774 809394 0.71 815168 96 5021 756729 0.66 761750 97 4683 719593 0.65 724276 98 4940 707363 0.69 712303 99 5703 836570 0.68 842273 100 5322 773049 0.68 778371 101 4848 700884 0.69 705732 102 4499 707750 0.63 712249 103 4924 722325 0.68 727249 104 6314 688502 0.91 694816 105 4617 716620 0.64 721237 106 4259 701607 0.60 705866 107 4620 655296 0.70 659916 108 5118 698474 0.73 703592 109 5207 757706 0.68 762913 110 4764 670856 0.71 675620 111 4472 669760 0.66 674232 112 6796 683921 0.98 690717 113 4392 629444 0.69 633836 114 6276 702728 0.89 709004 115 4013 647709 0.62 651722 116 5842 608430 0.95 614272 117 3799 579244 0.65 583043 118 3640 573739 0.63 577379 119 3686 581911 0.63 585597 120 5297 624347 0.84 629644 121 18480 609988 2.94 628468 122 4522 565167 0.79 569689 123 3950 589258 0.67 593208 124 4062 624399 0.65 628461 125 4302 544872 0.78 549174 126 3700 533371 0.69 537071 127 4669 567374 0.82 572043 128 15566 523550 2.89 539116 129 5140 580784 0.88 585924 130 4040 517836 0.77 521876 131 3631 486910 0.74 490541 132 3104 479711 0.64 482815 133 3543 493072 0.71 496615 134 3759 503146 0.74 506905 135 3809 507226 0.75 511035 136 3845 534280 0.71 538125 137 3932 530336 0.74 534268 138 3713 510775 0.72 514488 139 8641 719893 1.19 728534 140 3152 480899 0.65 484051 141 2927 503556 0.58 506483 142 2865 493033 0.58 495898 143 3301 506535 0.65 509836 144 14907 696885 2.09 711792 145 25448 442505 5.44 467953 146 2682 424425 0.63 427107 147 3364 396185 0.84 399549 148 2641 237593 1.10 240234 149 1478 219462 0.67 220940 150 1212 218506 0.55 219718 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 90440 26836424 0.34 26926864 2 56906 170168 25.06 227074 3 267490 111543 70.57 379033 4 11492 2529522 0.45 2541014 5 11327 1810121 0.62 1821448 6 12356 2254028 0.55 2266384 7 13249 1884139 0.70 1897388 8 31943 1769117 1.77 1801060 9 13084 2331714 0.56 2344798 10 13563 2014120 0.67 2027683 11 9505 1797466 0.53 1806971 12 9008 1839337 0.49 1848345 13 10049 2059079 0.49 2069128 14 9462 2147333 0.44 2156795 15 8979 1806584 0.49 1815563 16 10005 2021343 0.49 2031348 17 9565 2050767 0.46 2060332 18 9200 1955256 0.47 1964456 19 9217 2028791 0.45 2038008 20 8600 1776399 0.48 1784999 21 9114 1839996 0.49 1849110 22 8878 1882948 0.47 1891826 23 8092 1620926 0.50 1629018 24 7637 1604928 0.47 1612565 25 7575 1611745 0.47 1619320 26 8150 1804659 0.45 1812809 27 7974 1713820 0.46 1721794 28 7422 1568489 0.47 1575911 29 7404 1601774 0.46 1609178 30 7769 1654943 0.47 1662712 31 7216 1567926 0.46 1575142 32 6878 1411046 0.49 1417924 33 7031 1495893 0.47 1502924 34 8554 1892187 0.45 1900741 35 7234 1515228 0.48 1522462 36 7358 1501516 0.49 1508874 37 7360 1590978 0.46 1598338 38 7567 1723023 0.44 1730590 39 6909 1450411 0.47 1457320 40 7053 1493453 0.47 1500506 41 6665 1428527 0.46 1435192 42 6196 1303199 0.47 1309395 43 6733 1405546 0.48 1412279 44 6707 1498696 0.45 1505403 45 6705 1458212 0.46 1464917 46 6853 1463856 0.47 1470709 47 6421 1339647 0.48 1346068 48 6017 1313959 0.46 1319976 49 5938 1251356 0.47 1257294 50 6016 1356207 0.44 1362223 51 5818 1284293 0.45 1290111 52 5802 1301341 0.44 1307143 53 6011 1287454 0.46 1293465 54 5875 1260621 0.46 1266496 55 5851 1277465 0.46 1283316 56 5657 1226732 0.46 1232389 57 5642 1259102 0.45 1264744 58 6150 1353272 0.45 1359422 59 4951 1062239 0.46 1067190 60 4987 1092449 0.45 1097436 61 4767 1057536 0.45 1062303 62 4869 1101441 0.44 1106310 63 5374 1169525 0.46 1174899 64 5325 1204594 0.44 1209919 65 5373 1140132 0.47 1145505 66 4627 1007296 0.46 1011923 67 5017 1110546 0.45 1115563 68 4674 1045852 0.44 1050526 69 4585 1011975 0.45 1016560 70 4478 965285 0.46 969763 71 4619 995041 0.46 999660 72 4548 1028645 0.44 1033193 73 4334 908844 0.47 913178 74 4433 959061 0.46 963494 75 4415 949929 0.46 954344 76 4499 980521 0.46 985020 77 3980 948880 0.42 952860 78 4143 910879 0.45 915022 79 4235 948427 0.44 952662 80 3956 868537 0.45 872493 81 4452 1012557 0.44 1017009 82 4086 925234 0.44 929320 83 4025 909545 0.44 913570 84 4159 873791 0.47 877950 85 3866 876375 0.44 880241 86 3265 767102 0.42 770367 87 3892 874028 0.44 877920 88 3591 836124 0.43 839715 89 3563 800137 0.44 803700 90 3472 775415 0.45 778887 91 3643 871222 0.42 874865 92 3219 725559 0.44 728778 93 3682 814396 0.45 818078 94 3585 827532 0.43 831117 95 3241 739502 0.44 742743 96 3565 811335 0.44 814900 97 3848 900968 0.43 904816 98 3161 719509 0.44 722670 99 3480 754268 0.46 757748 100 3150 721477 0.43 724627 101 3185 690930 0.46 694115 102 3153 717223 0.44 720376 103 3362 769279 0.44 772641 104 3243 760704 0.42 763947 105 3082 689883 0.44 692965 106 3331 741674 0.45 745005 107 3026 655805 0.46 658831 108 2669 591242 0.45 593911 109 2951 703119 0.42 706070 110 2668 635590 0.42 638258 111 4260 1004507 0.42 1008767 112 2803 630884 0.44 633687 113 2516 559942 0.45 562458 114 3612 863944 0.42 867556 115 2678 612323 0.44 615001 116 2461 571184 0.43 573645 117 2388 569081 0.42 571469 118 2429 575716 0.42 578145 119 2447 604768 0.40 607215 120 3247 629793 0.51 633040 121 3089 613380 0.50 616469 122 2327 532414 0.44 534741 123 2793 602351 0.46 605144 124 2316 565861 0.41 568177 125 2083 460531 0.45 462614 126 2348 510001 0.46 512349 127 2523 524609 0.48 527132 128 11949 511512 2.28 523461 129 2103 490537 0.43 492640 130 2158 491120 0.44 493278 131 2433 573662 0.42 576095 132 2198 468632 0.47 470830 133 2202 482048 0.45 484250 134 2074 469453 0.44 471527 135 2454 558094 0.44 560548 136 2212 483430 0.46 485642 137 1984 443274 0.45 445258 138 2057 481487 0.43 483544 139 1830 415991 0.44 417821 140 2911 683461 0.42 686372 141 1951 433108 0.45 435059 142 1788 425663 0.42 427451 143 2287 509778 0.45 512065 144 2828 475995 0.59 478823 145 2085 406262 0.51 408347 146 1837 423802 0.43 425639 147 1529 381875 0.40 383404 148 1388 213009 0.65 214397 149 948 211437 0.45 212385 150 828 193517 0.43 194345 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 48855 1770136 2.69 1818991 2 99725 4758815 2.05 4858540 3 79812 4599709 1.71 4679521 4 49980 8003658 0.62 8053638 5 73641 7058493 1.03 7132134 6 39932 7336136 0.54 7376068 7 37723 7351388 0.51 7389111 8 44364 7277526 0.61 7321890 9 43827 7012728 0.62 7056555 10 38748 7021545 0.55 7060293 11 35151 7224321 0.48 7259472 12 47344 7045397 0.67 7092741 13 72686 7331268 0.98 7403954 14 35254 6498469 0.54 6533723 15 33826 6800727 0.49 6834553 16 32411 6741923 0.48 6774334 17 33117 6717374 0.49 6750491 18 32862 6991986 0.47 7024848 19 32483 6626217 0.49 6658700 20 30389 6237353 0.48 6267742 21 30714 6321461 0.48 6352175 22 30583 6528833 0.47 6559416 23 28412 5945755 0.48 5974167 24 29667 6229525 0.47 6259192 25 30345 6464955 0.47 6495300 26 27610 5882494 0.47 5910104 27 27277 5896961 0.46 5924238 28 28026 5944803 0.47 5972829 29 27265 5814311 0.47 5841576 30 28044 5906633 0.47 5934677 31 26342 5605498 0.47 5631840 32 26296 5401643 0.48 5427939 33 26341 5719590 0.46 5745931 34 27342 5810491 0.47 5837833 35 26028 5519237 0.47 5545265 36 26505 5524679 0.48 5551184 37 25197 5306674 0.47 5331871 38 24224 5216641 0.46 5240865 39 23945 5229740 0.46 5253685 40 23764 5064995 0.47 5088759 41 24104 5169108 0.46 5193212 42 23474 5022620 0.47 5046094 43 24081 5169323 0.46 5193404 44 22749 4819719 0.47 4842468 45 23815 5162332 0.46 5186147 46 22332 4814998 0.46 4837330 47 22693 4792124 0.47 4814817 48 22212 4839714 0.46 4861926 49 23039 4987809 0.46 5010848 50 21420 4715780 0.45 4737200 51 21149 4604411 0.46 4625560 52 21482 4553196 0.47 4574678 53 21077 4469774 0.47 4490851 54 20303 4424200 0.46 4444503 55 20609 4471001 0.46 4491610 56 19676 4292393 0.46 4312069 57 19979 4285641 0.46 4305620 58 19808 4310377 0.46 4330185 59 18679 4026422 0.46 4045101 60 19358 4231915 0.46 4251273 61 19443 4219771 0.46 4239214 62 19649 4339921 0.45 4359570 63 19874 4380390 0.45 4400264 64 18325 3904195 0.47 3922520 65 17861 3872397 0.46 3890258 66 17812 4007684 0.44 4025496 67 18677 4165550 0.45 4184227 68 17043 3768509 0.45 3785552 69 17149 3757562 0.45 3774711 70 18138 4133662 0.44 4151800 71 16884 3753189 0.45 3770073 72 18034 4077619 0.44 4095653 73 16698 3692696 0.45 3709394 74 16204 3542534 0.46 3558738 75 16414 3614904 0.45 3631318 76 16792 3699598 0.45 3716390 77 16154 3591429 0.45 3607583 78 15778 3459826 0.45 3475604 79 15180 3341377 0.45 3356557 80 15161 3592582 0.42 3607743 81 14509 3238201 0.45 3252710 82 14561 3249287 0.45 3263848 83 14697 3178888 0.46 3193585 84 13707 3129452 0.44 3143159 85 13861 3173244 0.43 3187105 86 13632 3087757 0.44 3101389 87 14142 3124887 0.45 3139029 88 14464 3120202 0.46 3134666 89 13443 3039694 0.44 3053137 90 13504 2985980 0.45 2999484 91 13048 2947291 0.44 2960339 92 13402 2945170 0.45 2958572 93 12905 2947586 0.44 2960491 94 12755 2883353 0.44 2896108 95 12688 2858816 0.44 2871504 96 12741 2850128 0.45 2862869 97 12465 2715071 0.46 2727536 98 11771 2686990 0.44 2698761 99 12046 2806844 0.43 2818890 100 12151 2757535 0.44 2769686 101 11879 2623911 0.45 2635790 102 11567 2603520 0.44 2615087 103 11257 2586559 0.43 2597816 104 11145 2569086 0.43 2580231 105 12001 2633830 0.45 2645831 106 11148 2497183 0.44 2508331 107 11647 2560089 0.45 2571736 108 11019 2456114 0.45 2467133 109 10660 2396684 0.44 2407344 110 10196 2289254 0.44 2299450 111 10442 2352479 0.44 2362921 112 9989 2376468 0.42 2386457 113 10050 2248881 0.44 2258931 114 10133 2278578 0.44 2288711 115 11013 2604063 0.42 2615076 116 9996 2213902 0.45 2223898 117 9715 2186562 0.44 2196277 118 10524 2448713 0.43 2459237 119 9203 2078593 0.44 2087796 120 9315 2039523 0.45 2048838 121 9324 2113137 0.44 2122461 122 12125 2270614 0.53 2282739 123 9352 2205752 0.42 2215104 124 9055 2281640 0.40 2290695 125 8382 1910722 0.44 1919104 126 8633 1979675 0.43 1988308 127 10316 2004294 0.51 2014610 128 8368 1890452 0.44 1898820 129 8658 1946268 0.44 1954926 130 9475 2209330 0.43 2218805 131 8241 1786290 0.46 1794531 132 8989 2108792 0.42 2117781 133 7825 1857870 0.42 1865695 134 8016 2003553 0.40 2011569 135 7580 1764616 0.43 1772196 136 7442 1665150 0.44 1672592 137 7618 1800931 0.42 1808549 138 7594 1716871 0.44 1724465 139 7686 1634887 0.47 1642573 140 7003 1610880 0.43 1617883 141 6763 1595089 0.42 1601852 142 6987 1564116 0.44 1571103 143 7180 1631854 0.44 1639034 144 6778 1576356 0.43 1583134 145 6872 1610042 0.43 1616914 146 6994 1600366 0.44 1607360 147 6139 1531320 0.40 1537459 148 5157 823728 0.62 828885 149 4059 775399 0.52 779458 150 3448 741731 0.46 745179