CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 176672 2590873 6.38 2767545 2 22983 1828 92.63 24811 3 1760 80991 2.13 82751 4 3646 166407 2.14 170053 5 4935 163618 2.93 168553 6 7813 190646 3.94 198459 7 7764 203949 3.67 211713 8 8293 214536 3.72 222829 9 9112 223491 3.92 232603 10 8900 216305 3.95 225205 11 7804 198591 3.78 206395 12 6394 183607 3.37 190001 13 7570 213624 3.42 221194 14 8049 244255 3.19 252304 15 8570 239530 3.45 248100 16 11534 237918 4.62 249452 17 7198 201638 3.45 208836 18 7111 202648 3.39 209759 19 7346 211558 3.36 218904 20 8213 211272 3.74 219485 21 7440 187804 3.81 195244 22 7571 206137 3.54 213708 23 7804 215081 3.50 222885 24 7167 208724 3.32 215891 25 7651 212894 3.47 220545 26 7800 207601 3.62 215401 27 6600 191418 3.33 198018 28 6370 192444 3.20 198814 29 6994 198709 3.40 205703 30 7000 203140 3.33 210140 31 7241 202375 3.45 209616 32 7707 201652 3.68 209359 33 7134 210958 3.27 218092 34 7439 205304 3.50 212743 35 7074 191073 3.57 198147 36 7315 194058 3.63 201373 37 6974 187899 3.58 194873 38 6753 195065 3.35 201818 39 7653 197252 3.73 204905 40 6966 184414 3.64 191380 41 6756 184678 3.53 191434 42 6532 182920 3.45 189452 43 6537 177998 3.54 184535 44 6618 184392 3.46 191010 45 7250 203099 3.45 210349 46 6964 213708 3.16 220672 47 6656 199658 3.23 206314 48 6923 184267 3.62 191190 49 7250 192686 3.63 199936 50 6392 177773 3.47 184165 51 6575 185744 3.42 192319 52 6898 187356 3.55 194254 53 6586 176917 3.59 183503 54 6615 177080 3.60 183695 55 6179 170626 3.49 176805 56 6749 173269 3.75 180018 57 6710 177916 3.63 184626 58 6717 186045 3.48 192762 59 7086 183369 3.72 190455 60 6781 177593 3.68 184374 61 7212 182431 3.80 189643 62 7239 185141 3.76 192380 63 6782 178589 3.66 185371 64 6320 174492 3.50 180812 65 6514 168910 3.71 175424 66 6727 177808 3.65 184535 67 5898 171327 3.33 177225 68 6075 162864 3.60 168939 69 5813 165070 3.40 170883 70 5819 165425 3.40 171244 71 6530 173987 3.62 180517 72 6495 174562 3.59 181057 73 5781 163948 3.41 169729 74 5840 166079 3.40 171919 75 6734 169764 3.82 176498 76 6662 170500 3.76 177162 77 6642 163109 3.91 169751 78 6282 162161 3.73 168443 79 5965 156819 3.66 162784 80 5663 150631 3.62 156294 81 5720 144917 3.80 150637 82 5327 142622 3.60 147949 83 5569 142449 3.76 148018 84 5442 151029 3.48 156471 85 6026 153199 3.78 159225 86 5826 147535 3.80 153361 87 5991 146727 3.92 152718 88 5569 141776 3.78 147345 89 5157 137810 3.61 142967 90 5890 149760 3.78 155650 91 5784 141698 3.92 147482 92 5324 136768 3.75 142092 93 5289 141514 3.60 146803 94 6173 144740 4.09 150913 95 5445 131909 3.96 137354 96 5134 131467 3.76 136601 97 5347 134750 3.82 140097 98 4859 127952 3.66 132811 99 4939 134211 3.55 139150 100 5106 129616 3.79 134722 101 4826 129987 3.58 134813 102 4887 125972 3.73 130859 103 4596 124739 3.55 129335 104 4352 120927 3.47 125279 105 4301 117936 3.52 122237 106 4336 116643 3.58 120979 107 4534 118235 3.69 122769 108 4763 120008 3.82 124771 109 4315 111466 3.73 115781 110 4144 109974 3.63 114118 111 4467 117774 3.65 122241 112 4307 116266 3.57 120573 113 4525 107621 4.03 112146 114 4246 111102 3.68 115348 115 3987 118281 3.26 122268 116 3807 114861 3.21 118668 117 4060 109841 3.56 113901 118 4192 107045 3.77 111237 119 4063 104810 3.73 108873 120 4473 113468 3.79 117941 121 4331 115476 3.61 119807 122 4121 114765 3.47 118886 123 3969 104965 3.64 108934 124 4011 103787 3.72 107798 125 3726 105108 3.42 108834 126 4460 123290 3.49 127750 127 4503 120594 3.60 125097 128 4144 103637 3.84 107781 129 3881 103965 3.60 107846 130 3826 98070 3.75 101896 131 4007 94824 4.05 98831 132 3970 98260 3.88 102230 133 3685 100445 3.54 104130 134 4440 108448 3.93 112888 135 4208 104829 3.86 109037 136 3688 96409 3.68 100097 137 3970 101864 3.75 105834 138 3572 93497 3.68 97069 139 3537 93574 3.64 97111 140 4012 98591 3.91 102603 141 4023 97814 3.95 101837 142 3939 91042 4.15 94981 143 4019 90298 4.26 94317 144 3870 89123 4.16 92993 145 4310 96396 4.28 100706 146 3658 84071 4.17 87729 147 3040 81764 3.58 84804 148 2504 26138 8.74 28642 149 11895 36712 24.47 48607 150 11037 34367 24.31 45404 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3416 2276773 0.15 2280189 2 1380 7371 15.77 8751 3 20205 6715 75.06 26920 4 578 146848 0.39 147426 5 783 157301 0.50 158084 6 733 141242 0.52 141975 7 978 190524 0.51 191502 8 1052 169551 0.62 170603 9 967 192287 0.50 193254 10 968 181150 0.53 182118 11 898 189949 0.47 190847 12 1010 184597 0.54 185607 13 897 192164 0.46 193061 14 906 182940 0.49 183846 15 1072 211257 0.50 212329 16 1010 203426 0.49 204436 17 1037 208803 0.49 209840 18 1059 199680 0.53 200739 19 989 182378 0.54 183367 20 1064 180235 0.59 181299 21 1160 211007 0.55 212167 22 979 175085 0.56 176064 23 1046 194067 0.54 195113 24 860 180849 0.47 181709 25 989 173551 0.57 174540 26 879 161726 0.54 162605 27 1043 192990 0.54 194033 28 1002 201100 0.50 202102 29 967 189276 0.51 190243 30 1007 204003 0.49 205010 31 1033 202330 0.51 203363 32 998 195937 0.51 196935 33 939 178952 0.52 179891 34 1011 190301 0.53 191312 35 839 188447 0.44 189286 36 892 184771 0.48 185663 37 964 193739 0.50 194703 38 823 164906 0.50 165729 39 908 178648 0.51 179556 40 932 180059 0.51 180991 41 997 187755 0.53 188752 42 912 185658 0.49 186570 43 1012 191697 0.53 192709 44 954 167628 0.57 168582 45 916 191642 0.48 192558 46 905 181599 0.50 182504 47 998 197993 0.50 198991 48 866 171066 0.50 171932 49 1003 186546 0.53 187549 50 985 188015 0.52 189000 51 912 166703 0.54 167615 52 905 158971 0.57 159876 53 945 174381 0.54 175326 54 915 175877 0.52 176792 55 993 184984 0.53 185977 56 929 170835 0.54 171764 57 1130 184309 0.61 185439 58 1064 202155 0.52 203219 59 1026 176652 0.58 177678 60 888 158969 0.56 159857 61 972 180301 0.54 181273 62 924 163080 0.56 164004 63 1001 164459 0.60 165460 64 930 162202 0.57 163132 65 859 172907 0.49 173766 66 862 162015 0.53 162877 67 903 156266 0.57 157169 68 908 168200 0.54 169108 69 823 146965 0.56 147788 70 857 154070 0.55 154927 71 903 150806 0.60 151709 72 906 149827 0.60 150733 73 866 146300 0.59 147166 74 832 150786 0.55 151618 75 965 150404 0.64 151369 76 1043 167825 0.62 168868 77 972 158295 0.61 159267 78 842 154503 0.54 155345 79 926 152654 0.60 153580 80 902 160805 0.56 161707 81 885 149437 0.59 150322 82 799 136944 0.58 137743 83 800 135159 0.59 135959 84 841 137544 0.61 138385 85 826 138897 0.59 139723 86 749 129665 0.57 130414 87 891 149423 0.59 150314 88 926 153034 0.60 153960 89 764 126484 0.60 127248 90 827 141662 0.58 142489 91 878 134833 0.65 135711 92 710 128388 0.55 129098 93 819 141853 0.57 142672 94 879 136498 0.64 137377 95 794 136359 0.58 137153 96 841 136115 0.61 136956 97 822 145195 0.56 146017 98 737 121365 0.60 122102 99 872 131846 0.66 132718 100 662 120434 0.55 121096 101 715 111697 0.64 112412 102 733 112926 0.64 113659 103 838 132506 0.63 133344 104 679 113526 0.59 114205 105 807 122826 0.65 123633 106 632 112460 0.56 113092 107 734 113524 0.64 114258 108 759 121396 0.62 122155 109 735 114087 0.64 114822 110 728 119596 0.61 120324 111 788 114773 0.68 115561 112 704 109244 0.64 109948 113 644 104535 0.61 105179 114 715 112543 0.63 113258 115 686 109801 0.62 110487 116 741 120265 0.61 121006 117 635 105351 0.60 105986 118 656 101054 0.64 101710 119 647 102413 0.63 103060 120 734 105231 0.69 105965 121 547 100799 0.54 101346 122 545 93988 0.58 94533 123 697 104300 0.66 104997 124 620 102483 0.60 103103 125 656 101641 0.64 102297 126 710 114026 0.62 114736 127 674 103577 0.65 104251 128 607 96578 0.62 97185 129 677 97694 0.69 98371 130 620 95393 0.65 96013 131 605 88855 0.68 89460 132 648 88795 0.72 89443 133 603 93074 0.64 93677 134 616 91619 0.67 92235 135 511 88243 0.58 88754 136 564 87674 0.64 88238 137 684 92912 0.73 93596 138 597 85844 0.69 86441 139 589 83962 0.70 84551 140 632 87901 0.71 88533 141 582 87165 0.66 87747 142 559 90617 0.61 91176 143 552 81740 0.67 82292 144 556 80830 0.68 81386 145 700 88447 0.79 89147 146 610 80035 0.76 80645 147 564 79323 0.71 79887 148 382 33805 1.12 34187 149 485 32272 1.48 32757 150 603 44907 1.32 45510 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 664 53074 1.24 53738 2 7311 470042 1.53 477353 3 6568 384894 1.68 391462 4 5336 657791 0.80 663127 5 5576 596938 0.93 602514 6 4992 628574 0.79 633566 7 4968 679424 0.73 684392 8 5477 665643 0.82 671120 9 5113 634058 0.80 639171 10 5119 678696 0.75 683815 11 5417 661545 0.81 666962 12 5234 701185 0.74 706419 13 5781 686997 0.83 692778 14 5312 674244 0.78 679556 15 5093 693604 0.73 698697 16 5297 718140 0.73 723437 17 5250 706013 0.74 711263 18 5229 687280 0.76 692509 19 5285 661252 0.79 666537 20 5395 662481 0.81 667876 21 5018 678022 0.73 683040 22 5259 674446 0.77 679705 23 5174 679032 0.76 684206 24 4581 662777 0.69 667358 25 4545 692063 0.65 696608 26 4710 673780 0.69 678490 27 4248 660404 0.64 664652 28 4230 671606 0.63 675836 29 3992 671284 0.59 675276 30 4017 678338 0.59 682355 31 3523 649049 0.54 652572 32 3588 656781 0.54 660369 33 3537 650107 0.54 653644 34 3489 650098 0.53 653587 35 3304 646753 0.51 650057 36 3203 652432 0.49 655635 37 3194 657813 0.48 661007 38 3226 641953 0.50 645179 39 3186 609909 0.52 613095 40 3166 644781 0.49 647947 41 3100 655220 0.47 658320 42 3238 649323 0.50 652561 43 3104 649383 0.48 652487 44 2960 613135 0.48 616095 45 3127 619641 0.50 622768 46 3080 618074 0.50 621154 47 2865 596773 0.48 599638 48 3087 608342 0.50 611429 49 3083 628437 0.49 631520 50 3154 620629 0.51 623783 51 3216 634728 0.50 637944 52 3147 624403 0.50 627550 53 3243 619218 0.52 622461 54 2945 609772 0.48 612717 55 3143 599842 0.52 602985 56 3062 582490 0.52 585552 57 2893 590526 0.49 593419 58 3136 594802 0.52 597938 59 2953 572656 0.51 575609 60 2935 591997 0.49 594932 61 2907 563136 0.51 566043 62 2987 565407 0.53 568394 63 2887 574582 0.50 577469 64 2774 547783 0.50 550557 65 2806 556979 0.50 559785 66 2912 544112 0.53 547024 67 2675 549426 0.48 552101 68 2771 541419 0.51 544190 69 2762 535382 0.51 538144 70 2889 552485 0.52 555374 71 2852 534020 0.53 536872 72 2854 528186 0.54 531040 73 2663 519950 0.51 522613 74 2803 518779 0.54 521582 75 2646 528701 0.50 531347 76 2745 528139 0.52 530884 77 2718 507720 0.53 510438 78 2736 507168 0.54 509904 79 2619 497858 0.52 500477 80 2600 489837 0.53 492437 81 2574 484798 0.53 487372 82 2670 478781 0.55 481451 83 2559 470991 0.54 473550 84 2734 491154 0.55 493888 85 2642 496201 0.53 498843 86 2458 465115 0.53 467573 87 2573 468038 0.55 470611 88 2550 461480 0.55 464030 89 2513 453395 0.55 455908 90 2392 427738 0.56 430130 91 2403 447735 0.53 450138 92 2327 443686 0.52 446013 93 2521 461313 0.54 463834 94 2397 435485 0.55 437882 95 2387 426422 0.56 428809 96 2411 432432 0.55 434843 97 2397 440843 0.54 443240 98 2173 414633 0.52 416806 99 2324 417774 0.55 420098 100 2231 403461 0.55 405692 101 2213 397214 0.55 399427 102 2213 405815 0.54 408028 103 2320 396618 0.58 398938 104 2250 397738 0.56 399988 105 2342 407885 0.57 410227 106 2238 390728 0.57 392966 107 2091 376167 0.55 378258 108 2205 392293 0.56 394498 109 2011 377272 0.53 379283 110 2082 370320 0.56 372402 111 2220 389379 0.57 391599 112 2089 368475 0.56 370564 113 1968 364582 0.54 366550 114 2097 367376 0.57 369473 115 2135 363639 0.58 365774 116 2086 374447 0.55 376533 117 1995 348448 0.57 350443 118 2109 356242 0.59 358351 119 2001 349610 0.57 351611 120 2074 344043 0.60 346117 121 1852 337642 0.55 339494 122 1824 330129 0.55 331953 123 1887 322084 0.58 323971 124 1853 329078 0.56 330931 125 1821 316766 0.57 318587 126 1977 335163 0.59 337140 127 2003 317087 0.63 319090 128 1785 313726 0.57 315511 129 1852 320871 0.57 322723 130 1878 319199 0.58 321077 131 1849 313412 0.59 315261 132 1890 312799 0.60 314689 133 1858 310735 0.59 312593 134 1952 313668 0.62 315620 135 1793 301273 0.59 303066 136 1847 303360 0.61 305207 137 1757 295914 0.59 297671 138 1741 296981 0.58 298722 139 1737 285576 0.60 287313 140 1728 279413 0.61 281141 141 1782 282609 0.63 284391 142 1834 269743 0.68 271577 143 1795 269778 0.66 271573 144 1808 278029 0.65 279837 145 1776 271582 0.65 273358 146 1872 259130 0.72 261002 147 1787 266259 0.67 268046 148 1162 99840 1.15 101002 149 824 98006 0.83 98830 150 1212 135335 0.89 136547 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 58771 961415 5.76 1020186 2 34404 1429 96.01 35833 3 709 34980 1.99 35689 4 1330 63898 2.04 65228 5 2273 63340 3.46 65613 6 2961 71496 3.98 74457 7 2840 71945 3.80 74785 8 3999 81406 4.68 85405 9 3656 81873 4.27 85529 10 3251 71908 4.33 75159 11 2605 68110 3.68 70715 12 2451 61059 3.86 63510 13 2765 76559 3.49 79324 14 2752 84432 3.16 87184 15 3937 88160 4.27 92097 16 5728 88682 6.07 94410 17 2534 65080 3.75 67614 18 2477 64386 3.70 66863 19 2269 62841 3.48 65110 20 2470 61819 3.84 64289 21 2433 58489 3.99 60922 22 2818 66171 4.08 68989 23 2436 69038 3.41 71474 24 2284 65649 3.36 67933 25 2419 62348 3.73 64767 26 2237 58517 3.68 60754 27 1816 55998 3.14 57814 28 1936 56933 3.29 58869 29 2379 56670 4.03 59049 30 2158 55524 3.74 57682 31 1955 54545 3.46 56500 32 2099 53630 3.77 55729 33 1992 53364 3.60 55356 34 2193 51624 4.07 53817 35 2115 52395 3.88 54510 36 2079 52649 3.80 54728 37 1812 49560 3.53 51372 38 2282 52778 4.14 55060 39 2316 53822 4.13 56138 40 2008 50253 3.84 52261 41 1795 49965 3.47 51760 42 1569 47018 3.23 48587 43 1650 43110 3.69 44760 44 1513 42606 3.43 44119 45 1663 44929 3.57 46592 46 1536 45581 3.26 47117 47 1589 43604 3.52 45193 48 1873 44424 4.05 46297 49 1837 45998 3.84 47835 50 1489 44066 3.27 45555 51 1620 47530 3.30 49150 52 1704 46071 3.57 47775 53 1569 39345 3.83 40914 54 1564 37448 4.01 39012 55 1460 36312 3.87 37772 56 1337 36846 3.50 38183 57 1413 39508 3.45 40921 58 1484 42379 3.38 43863 59 1382 39975 3.34 41357 60 1583 40291 3.78 41874 61 1882 42352 4.25 44234 62 1546 40312 3.69 41858 63 1436 40506 3.42 41942 64 1296 37276 3.36 38572 65 1207 35906 3.25 37113 66 1262 39716 3.08 40978 67 1228 39137 3.04 40365 68 1291 33554 3.70 34845 69 1266 33674 3.62 34940 70 1141 32552 3.39 33693 71 1177 33881 3.36 35058 72 1074 33034 3.15 34108 73 1063 32120 3.20 33183 74 1123 31928 3.40 33051 75 1686 38414 4.20 40100 76 1827 40961 4.27 42788 77 1367 33387 3.93 34754 78 1264 32636 3.73 33900 79 1114 30095 3.57 31209 80 973 28942 3.25 29915 81 938 27706 3.27 28644 82 856 26527 3.13 27383 83 909 25617 3.43 26526 84 977 27000 3.49 27977 85 990 26352 3.62 27342 86 1015 25652 3.81 26667 87 939 25107 3.61 26046 88 945 24776 3.67 25721 89 784 25770 2.95 26554 90 1200 27030 4.25 28230 91 949 24457 3.74 25406 92 798 22146 3.48 22944 93 767 23875 3.11 24642 94 912 24036 3.66 24948 95 718 21661 3.21 22379 96 711 21328 3.23 22039 97 735 21217 3.35 21952 98 732 20385 3.47 21117 99 703 20542 3.31 21245 100 641 20130 3.09 20771 101 670 19583 3.31 20253 102 630 19315 3.16 19945 103 783 19383 3.88 20166 104 692 19106 3.50 19798 105 668 18615 3.46 19283 106 631 18839 3.24 19470 107 606 18490 3.17 19096 108 650 18524 3.39 19174 109 620 17646 3.39 18266 110 693 17031 3.91 17724 111 592 17098 3.35 17690 112 698 17162 3.91 17860 113 650 16618 3.76 17268 114 615 16549 3.58 17164 115 591 17301 3.30 17892 116 556 16569 3.25 17125 117 546 15498 3.40 16044 118 585 15421 3.65 16006 119 606 15966 3.66 16572 120 586 15653 3.61 16239 121 627 15573 3.87 16200 122 511 15155 3.26 15666 123 613 14819 3.97 15432 124 555 14625 3.66 15180 125 586 14331 3.93 14917 126 523 14302 3.53 14825 127 513 13530 3.65 14043 128 554 13422 3.96 13976 129 548 13741 3.84 14289 130 509 12928 3.79 13437 131 522 13223 3.80 13745 132 498 13399 3.58 13897 133 500 12947 3.72 13447 134 464 12930 3.46 13394 135 428 12670 3.27 13098 136 453 12146 3.60 12599 137 438 11819 3.57 12257 138 455 11455 3.82 11910 139 439 11195 3.77 11634 140 427 11482 3.59 11909 141 421 11714 3.47 12135 142 381 11516 3.20 11897 143 381 11470 3.21 11851 144 349 10797 3.13 11146 145 402 10434 3.71 10836 146 375 10538 3.44 10913 147 361 10007 3.48 10368 148 312 4978 5.90 5290 149 141 5065 2.71 5206 150 147 4650 3.06 4797 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1289 1040596 0.12 1041885 2 693 3395 16.95 4088 3 13227 3340 79.84 16567 4 238 60836 0.39 61074 5 260 58786 0.44 59046 6 380 57168 0.66 57548 7 451 68147 0.66 68598 8 481 60624 0.79 61105 9 434 63700 0.68 64134 10 449 65672 0.68 66121 11 371 59556 0.62 59927 12 408 60945 0.67 61353 13 382 67682 0.56 68064 14 371 58614 0.63 58985 15 498 74705 0.66 75203 16 480 89413 0.53 89893 17 414 71530 0.58 71944 18 455 60192 0.75 60647 19 382 55259 0.69 55641 20 339 52333 0.64 52672 21 360 62567 0.57 62927 22 308 52449 0.58 52757 23 321 50868 0.63 51189 24 296 56276 0.52 56572 25 317 53804 0.59 54121 26 312 46984 0.66 47296 27 281 48289 0.58 48570 28 352 54860 0.64 55212 29 247 54549 0.45 54796 30 395 63299 0.62 63694 31 334 57158 0.58 57492 32 323 59557 0.54 59880 33 272 47870 0.56 48142 34 331 49154 0.67 49485 35 289 45308 0.63 45597 36 320 49183 0.65 49503 37 334 52353 0.63 52687 38 289 45168 0.64 45457 39 298 45289 0.65 45587 40 288 49877 0.57 50165 41 269 39902 0.67 40171 42 321 46122 0.69 46443 43 253 47075 0.53 47328 44 226 39639 0.57 39865 45 254 40706 0.62 40960 46 279 43814 0.63 44093 47 232 44000 0.52 44232 48 258 39215 0.65 39473 49 255 44154 0.57 44409 50 258 47418 0.54 47676 51 248 38237 0.64 38485 52 267 38042 0.70 38309 53 204 39600 0.51 39804 54 217 38251 0.56 38468 55 252 35564 0.70 35816 56 205 36374 0.56 36579 57 220 38072 0.57 38292 58 228 43172 0.53 43400 59 225 33905 0.66 34130 60 169 33856 0.50 34025 61 176 39360 0.45 39536 62 208 32270 0.64 32478 63 199 33425 0.59 33624 64 200 33561 0.59 33761 65 188 33174 0.56 33362 66 188 31669 0.59 31857 67 206 32444 0.63 32650 68 167 29658 0.56 29825 69 166 30454 0.54 30620 70 208 33823 0.61 34031 71 184 30388 0.60 30572 72 168 29309 0.57 29477 73 171 28421 0.60 28592 74 176 29062 0.60 29238 75 174 28068 0.62 28242 76 189 32362 0.58 32551 77 199 34417 0.57 34616 78 143 27782 0.51 27925 79 166 26917 0.61 27083 80 156 27265 0.57 27421 81 162 28100 0.57 28262 82 165 24214 0.68 24379 83 159 24995 0.63 25154 84 158 24425 0.64 24583 85 142 25233 0.56 25375 86 117 22355 0.52 22472 87 114 24645 0.46 24759 88 154 28006 0.55 28160 89 147 23033 0.63 23180 90 160 23923 0.66 24083 91 139 21909 0.63 22048 92 100 20572 0.48 20672 93 126 21552 0.58 21678 94 131 21662 0.60 21793 95 109 20318 0.53 20427 96 97 19685 0.49 19782 97 103 19804 0.52 19907 98 92 18638 0.49 18730 99 93 19334 0.48 19427 100 125 19877 0.62 20002 101 115 18139 0.63 18254 102 94 18324 0.51 18418 103 91 19288 0.47 19379 104 100 18351 0.54 18451 105 112 19246 0.58 19358 106 94 17160 0.54 17254 107 102 17412 0.58 17514 108 88 18534 0.47 18622 109 155 18270 0.84 18425 110 89 16501 0.54 16590 111 107 17157 0.62 17264 112 95 16379 0.58 16474 113 80 15734 0.51 15814 114 103 15994 0.64 16097 115 79 15106 0.52 15185 116 87 16163 0.54 16250 117 102 15019 0.67 15121 118 89 14603 0.61 14692 119 77 13960 0.55 14037 120 104 14547 0.71 14651 121 103 14783 0.69 14886 122 69 13325 0.52 13394 123 62 13613 0.45 13675 124 61 13629 0.45 13690 125 97 13513 0.71 13610 126 81 13777 0.58 13858 127 65 12924 0.50 12989 128 82 12068 0.67 12150 129 64 13428 0.47 13492 130 89 12309 0.72 12398 131 51 11776 0.43 11827 132 61 11989 0.51 12050 133 51 11500 0.44 11551 134 50 12420 0.40 12470 135 61 11651 0.52 11712 136 63 10923 0.57 10986 137 41 10856 0.38 10897 138 36 10693 0.34 10729 139 46 11232 0.41 11278 140 63 10278 0.61 10341 141 58 10299 0.56 10357 142 61 10190 0.60 10251 143 37 9832 0.37 9869 144 68 10162 0.66 10230 145 63 9693 0.65 9756 146 53 9001 0.59 9054 147 48 9930 0.48 9978 148 43 4762 0.89 4805 149 30 4493 0.66 4523 150 22 4335 0.50 4357 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 542 25645 2.07 26187 2 1565 197645 0.79 199210 3 1280 163517 0.78 164797 4 2075 259035 0.79 261110 5 1999 228854 0.87 230853 6 1573 244296 0.64 245869 7 1679 277107 0.60 278786 8 1631 235758 0.69 237389 9 1806 235680 0.76 237486 10 1577 249369 0.63 250946 11 1480 239904 0.61 241384 12 1607 240212 0.66 241819 13 1743 240716 0.72 242459 14 1488 234946 0.63 236434 15 1656 257214 0.64 258870 16 1586 249174 0.63 250760 17 1540 242452 0.63 243992 18 1500 227946 0.65 229446 19 1486 207636 0.71 209122 20 1480 216699 0.68 218179 21 1316 218863 0.60 220179 22 1374 213642 0.64 215016 23 1465 214650 0.68 216115 24 1329 201950 0.65 203279 25 1365 220666 0.61 222031 26 1258 195207 0.64 196465 27 1277 191431 0.66 192708 28 1197 197727 0.60 198924 29 1225 206995 0.59 208220 30 1223 218299 0.56 219522 31 1224 197054 0.62 198278 32 1224 178553 0.68 179777 33 1145 170292 0.67 171437 34 1151 186107 0.61 187258 35 1111 190935 0.58 192046 36 1186 194585 0.61 195771 37 1091 181866 0.60 182957 38 1194 175111 0.68 176305 39 1034 159621 0.64 160655 40 1065 161409 0.66 162474 41 961 171577 0.56 172538 42 1107 164292 0.67 165399 43 1044 162355 0.64 163399 44 956 165507 0.57 166463 45 975 160115 0.61 161090 46 1010 156819 0.64 157829 47 932 151846 0.61 152778 48 991 163057 0.60 164048 49 897 157952 0.56 158849 50 961 158478 0.60 159439 51 965 167355 0.57 168320 52 1010 162733 0.62 163743 53 926 140010 0.66 140936 54 1010 150449 0.67 151459 55 878 148064 0.59 148942 56 824 142568 0.57 143392 57 826 136850 0.60 137676 58 857 138123 0.62 138980 59 824 139122 0.59 139946 60 829 136463 0.60 137292 61 801 127872 0.62 128673 62 816 128671 0.63 129487 63 883 137003 0.64 137886 64 775 133114 0.58 133889 65 762 129299 0.59 130061 66 710 123484 0.57 124194 67 748 130174 0.57 130922 68 703 124082 0.56 124785 69 759 117963 0.64 118722 70 754 130363 0.58 131117 71 756 118388 0.63 119144 72 692 119580 0.58 120272 73 667 116830 0.57 117497 74 708 118444 0.59 119152 75 677 112057 0.60 112734 76 756 110497 0.68 111253 77 604 98475 0.61 99079 78 681 107863 0.63 108544 79 626 103526 0.60 104152 80 620 99645 0.62 100265 81 561 100321 0.56 100882 82 590 95388 0.61 95978 83 625 91722 0.68 92347 84 537 95930 0.56 96467 85 571 99315 0.57 99886 86 538 88729 0.60 89267 87 672 98888 0.67 99560 88 512 85152 0.60 85664 89 540 81389 0.66 81929 90 498 80269 0.62 80767 91 534 91010 0.58 91544 92 497 81659 0.60 82156 93 563 87546 0.64 88109 94 518 78933 0.65 79451 95 461 76022 0.60 76483 96 475 82551 0.57 83026 97 460 73699 0.62 74159 98 418 71215 0.58 71633 99 429 72692 0.59 73121 100 451 71813 0.62 72264 101 366 67733 0.54 68099 102 423 69167 0.61 69590 103 409 68856 0.59 69265 104 408 66297 0.61 66705 105 420 66895 0.62 67315 106 443 64878 0.68 65321 107 409 61512 0.66 61921 108 413 63857 0.64 64270 109 345 61373 0.56 61718 110 339 60040 0.56 60379 111 342 59490 0.57 59832 112 364 59124 0.61 59488 113 329 57603 0.57 57932 114 359 55981 0.64 56340 115 336 56812 0.59 57148 116 312 55083 0.56 55395 117 317 54457 0.58 54774 118 316 53718 0.58 54034 119 308 52721 0.58 53029 120 318 51342 0.62 51660 121 316 50399 0.62 50715 122 333 50259 0.66 50592 123 273 47759 0.57 48032 124 300 48596 0.61 48896 125 290 47664 0.60 47954 126 273 48421 0.56 48694 127 299 46520 0.64 46819 128 253 44651 0.56 44904 129 283 44858 0.63 45141 130 279 45036 0.62 45315 131 302 44586 0.67 44888 132 301 42669 0.70 42970 133 267 42616 0.62 42883 134 272 40431 0.67 40703 135 244 40420 0.60 40664 136 268 39603 0.67 39871 137 255 38810 0.65 39065 138 269 40152 0.67 40421 139 268 38964 0.68 39232 140 238 38313 0.62 38551 141 265 37520 0.70 37785 142 245 35884 0.68 36129 143 241 34910 0.69 35151 144 206 35838 0.57 36044 145 181 35423 0.51 35604 146 192 34785 0.55 34977 147 238 33539 0.70 33777 148 170 18094 0.93 18264 149 164 16912 0.96 17076 150 144 15228 0.94 15372