CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 171278 2393167 6.68 2564445 2 32584 2701 92.35 35285 3 2349 94352 2.43 96701 4 3956 169008 2.29 172964 5 5948 168260 3.41 174208 6 8188 193275 4.06 201463 7 8273 207419 3.84 215692 8 9208 219196 4.03 228404 9 9782 227276 4.13 237058 10 9728 215601 4.32 225329 11 7944 197964 3.86 205908 12 7139 183647 3.74 190786 13 8564 218450 3.77 227014 14 8865 240307 3.56 249172 15 9852 248075 3.82 257927 16 12566 240643 4.96 253209 17 8041 205377 3.77 213418 18 7767 201751 3.71 209518 19 8219 209748 3.77 217967 20 8994 206499 4.17 215493 21 8132 193002 4.04 201134 22 8570 211016 3.90 219586 23 8671 217446 3.83 226117 24 8098 217186 3.59 225284 25 8474 215091 3.79 223565 26 8197 205697 3.83 213894 27 7354 192318 3.68 199672 28 7100 194532 3.52 201632 29 7831 201188 3.75 209019 30 7745 205593 3.63 213338 31 8191 204205 3.86 212396 32 8049 205422 3.77 213471 33 7633 214018 3.44 221651 34 7937 205617 3.72 213554 35 8052 194333 3.98 202385 36 7988 197763 3.88 205751 37 7459 189435 3.79 196894 38 7928 200469 3.80 208397 39 8323 203168 3.94 211491 40 7539 192459 3.77 199998 41 7534 190459 3.81 197993 42 7518 188283 3.84 195801 43 7108 182413 3.75 189521 44 7020 189946 3.56 196966 45 7695 207099 3.58 214794 46 7951 218114 3.52 226065 47 7141 205244 3.36 212385 48 7551 195440 3.72 202991 49 7878 199816 3.79 207694 50 6823 184557 3.57 191380 51 7318 193625 3.64 200943 52 7921 195381 3.90 203302 53 7356 180946 3.91 188302 54 7275 180671 3.87 187946 55 6916 177459 3.75 184375 56 7122 177639 3.85 184761 57 7270 185900 3.76 193170 58 7307 189899 3.71 197206 59 7423 188791 3.78 196214 60 7458 181984 3.94 189442 61 8068 192434 4.02 200502 62 7822 189606 3.96 197428 63 7624 187520 3.91 195144 64 7157 179441 3.84 186598 65 7244 174207 3.99 181451 66 7253 187533 3.72 194786 67 6471 179238 3.48 185709 68 6524 169145 3.71 175669 69 6570 173468 3.65 180038 70 6381 174147 3.53 180528 71 7488 180732 3.98 188220 72 7040 180237 3.76 187277 73 6300 173488 3.50 179788 74 6580 174450 3.63 181030 75 7664 180360 4.08 188024 76 7712 179258 4.12 186970 77 7247 170140 4.09 177387 78 6922 171195 3.89 178117 79 6655 164727 3.88 171382 80 6349 158463 3.85 164812 81 6283 154014 3.92 160297 82 6094 153373 3.82 159467 83 6209 153563 3.89 159772 84 6439 162858 3.80 169297 85 6874 164249 4.02 171123 86 6623 154691 4.11 161314 87 6446 152231 4.06 158677 88 6352 149960 4.06 156312 89 5886 149658 3.78 155544 90 6604 161067 3.94 167671 91 6345 153507 3.97 159852 92 5802 147070 3.80 152872 93 5832 151907 3.70 157739 94 6869 155085 4.24 161954 95 6180 144508 4.10 150688 96 6218 147105 4.06 153323 97 6465 146569 4.22 153034 98 5672 139988 3.89 145660 99 5688 144556 3.79 150244 100 5852 141380 3.97 147232 101 5887 145118 3.90 151005 102 5995 140275 4.10 146270 103 5195 136723 3.66 141918 104 5135 133865 3.69 139000 105 5000 131040 3.68 136040 106 5249 130988 3.85 136237 107 5594 131107 4.09 136701 108 5383 134004 3.86 139387 109 5141 123465 4.00 128606 110 5031 123365 3.92 128396 111 5601 132868 4.04 138469 112 5369 131820 3.91 137189 113 5002 122411 3.93 127413 114 5208 128207 3.90 133415 115 4974 137622 3.49 142596 116 4709 129477 3.51 134186 117 4726 124329 3.66 129055 118 5020 121350 3.97 126370 119 4693 119645 3.77 124338 120 5014 129085 3.74 134099 121 5111 132488 3.71 137599 122 4929 132718 3.58 137647 123 4861 121186 3.86 126047 124 4582 120252 3.67 124834 125 4517 121573 3.58 126090 126 5084 141113 3.48 146197 127 5148 134615 3.68 139763 128 4865 120623 3.88 125488 129 4662 121013 3.71 125675 130 4365 113585 3.70 117950 131 4905 113133 4.16 118038 132 4541 115867 3.77 120408 133 4857 119739 3.90 124596 134 5663 130034 4.17 135697 135 5097 122126 4.01 127223 136 4498 112187 3.85 116685 137 4829 119221 3.89 124050 138 4562 111025 3.95 115587 139 4232 109434 3.72 113666 140 4779 114229 4.02 119008 141 4948 115087 4.12 120035 142 5046 109002 4.42 114048 143 4975 107273 4.43 112248 144 4635 106481 4.17 111116 145 5178 116274 4.26 121452 146 4580 101868 4.30 106448 147 3936 97583 3.88 101519 148 3188 31186 9.27 34374 149 10467 42516 19.76 52983 150 9545 40760 18.97 50305 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3312 2650929 0.12 2654241 2 1266 8342 13.18 9608 3 27846 9126 75.32 36972 4 664 153090 0.43 153754 5 782 163004 0.48 163786 6 863 143988 0.60 144851 7 1146 191787 0.59 192933 8 1170 178746 0.65 179916 9 1049 192819 0.54 193868 10 1134 188501 0.60 189635 11 1055 193050 0.54 194105 12 971 188659 0.51 189630 13 1040 198273 0.52 199313 14 1030 187105 0.55 188135 15 1114 215255 0.51 216369 16 1135 212295 0.53 213430 17 1157 214817 0.54 215974 18 1057 198901 0.53 199958 19 1205 184672 0.65 185877 20 1226 186816 0.65 188042 21 1258 213990 0.58 215248 22 1084 177879 0.61 178963 23 1208 196769 0.61 197977 24 1026 181248 0.56 182274 25 1059 176760 0.60 177819 26 970 163191 0.59 164161 27 1158 190490 0.60 191648 28 1122 204752 0.54 205874 29 1148 194054 0.59 195202 30 1120 206670 0.54 207790 31 1195 205850 0.58 207045 32 1124 198547 0.56 199671 33 1003 181821 0.55 182824 34 1020 191307 0.53 192327 35 953 187357 0.51 188310 36 1039 184143 0.56 185182 37 1107 195564 0.56 196671 38 963 169514 0.56 170477 39 1047 178467 0.58 179514 40 1049 183849 0.57 184898 41 987 185838 0.53 186825 42 1208 185357 0.65 186565 43 1100 192359 0.57 193459 44 990 169333 0.58 170323 45 1036 190975 0.54 192011 46 1065 182298 0.58 183363 47 1103 201427 0.54 202530 48 993 173372 0.57 174365 49 1013 188695 0.53 189708 50 1039 190914 0.54 191953 51 1013 168413 0.60 169426 52 922 161461 0.57 162383 53 1039 179846 0.57 180885 54 1051 177116 0.59 178167 55 1096 184517 0.59 185613 56 986 173916 0.56 174902 57 1110 188063 0.59 189173 58 1246 203294 0.61 204540 59 1082 176591 0.61 177673 60 945 163881 0.57 164826 61 1022 183346 0.55 184368 62 1015 164588 0.61 165603 63 1010 167881 0.60 168891 64 1005 164454 0.61 165459 65 1003 174769 0.57 175772 66 945 165974 0.57 166919 67 956 162798 0.58 163754 68 1046 168626 0.62 169672 69 873 152954 0.57 153827 70 895 159655 0.56 160550 71 993 156849 0.63 157842 72 959 155724 0.61 156683 73 880 153872 0.57 154752 74 941 153709 0.61 154650 75 926 155419 0.59 156345 76 1090 178899 0.61 179989 77 1000 164772 0.60 165772 78 1061 156858 0.67 157919 79 1006 157697 0.63 158703 80 985 164552 0.60 165537 81 977 158001 0.61 158978 82 890 143845 0.61 144735 83 876 143235 0.61 144111 84 877 146194 0.60 147071 85 815 145249 0.56 146064 86 871 135119 0.64 135990 87 965 159466 0.60 160431 88 1005 162717 0.61 163722 89 853 135132 0.63 135985 90 969 150600 0.64 151569 91 883 145041 0.61 145924 92 855 136567 0.62 137422 93 913 144195 0.63 145108 94 909 144736 0.62 145645 95 953 145652 0.65 146605 96 948 147366 0.64 148314 97 996 155793 0.64 156789 98 799 130605 0.61 131404 99 946 138649 0.68 139595 100 769 130372 0.59 131141 101 806 121748 0.66 122554 102 752 125346 0.60 126098 103 846 144973 0.58 145819 104 763 125068 0.61 125831 105 788 137233 0.57 138021 106 747 120583 0.62 121330 107 825 124185 0.66 125010 108 804 132395 0.60 133199 109 785 130151 0.60 130936 110 897 133266 0.67 134163 111 806 125838 0.64 126644 112 790 119563 0.66 120353 113 700 115915 0.60 116615 114 786 128291 0.61 129077 115 756 125201 0.60 125957 116 843 137015 0.61 137858 117 810 121298 0.66 122108 118 642 115467 0.55 116109 119 782 115507 0.67 116289 120 717 116706 0.61 117423 121 746 115321 0.64 116067 122 677 107681 0.62 108358 123 763 118154 0.64 118917 124 694 119117 0.58 119811 125 722 115886 0.62 116608 126 749 129862 0.57 130611 127 816 117671 0.69 118487 128 705 110870 0.63 111575 129 743 115833 0.64 116576 130 690 112167 0.61 112857 131 685 104913 0.65 105598 132 718 107054 0.67 107772 133 709 107916 0.65 108625 134 669 107506 0.62 108175 135 646 105296 0.61 105942 136 666 102330 0.65 102996 137 831 107080 0.77 107911 138 678 101474 0.66 102152 139 724 100682 0.71 101406 140 739 102699 0.71 103438 141 730 104994 0.69 105724 142 631 106095 0.59 106726 143 638 96916 0.65 97554 144 680 96781 0.70 97461 145 812 104530 0.77 105342 146 706 95667 0.73 96373 147 688 91402 0.75 92090 148 442 36416 1.20 36858 149 437 34340 1.26 34777 150 544 47270 1.14 47814 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 819 59455 1.36 60274 2 7183 538853 1.32 546036 3 6332 445226 1.40 451558 4 5976 693828 0.85 699804 5 5997 629891 0.94 635888 6 5394 658911 0.81 664305 7 5267 702956 0.74 708223 8 5839 696802 0.83 702641 9 5492 669991 0.81 675483 10 5780 715051 0.80 720831 11 5454 694210 0.78 699664 12 5816 719188 0.80 725004 13 6048 715626 0.84 721674 14 5862 705003 0.82 710865 15 5483 723129 0.75 728612 16 5555 744073 0.74 749628 17 5728 742226 0.77 747954 18 5670 721766 0.78 727436 19 5660 689294 0.81 694954 20 5864 699576 0.83 705440 21 5554 703677 0.78 709231 22 5614 701365 0.79 706979 23 5912 713063 0.82 718975 24 5030 705555 0.71 710585 25 4994 731741 0.68 736735 26 5131 700221 0.73 705352 27 4720 693070 0.68 697790 28 4812 712904 0.67 717716 29 4736 706755 0.67 711491 30 4386 722667 0.60 727053 31 4107 688005 0.59 692112 32 4182 695191 0.60 699373 33 3926 679180 0.57 683106 34 3972 687072 0.57 691044 35 3692 683972 0.54 687664 36 3710 697639 0.53 701349 37 3727 695429 0.53 699156 38 3719 679288 0.54 683007 39 3594 644531 0.55 648125 40 3805 676466 0.56 680271 41 3541 689757 0.51 693298 42 3788 686709 0.55 690497 43 3751 684784 0.54 688535 44 3466 653635 0.53 657101 45 3663 656757 0.55 660420 46 3619 650880 0.55 654499 47 3447 632034 0.54 635481 48 3575 653528 0.54 657103 49 3454 663918 0.52 667372 50 3608 658603 0.54 662211 51 3716 679980 0.54 683696 52 3656 661135 0.55 664791 53 3702 652648 0.56 656350 54 3584 649250 0.55 652834 55 3555 646602 0.55 650157 56 3527 626896 0.56 630423 57 3408 631212 0.54 634620 58 3475 639326 0.54 642801 59 3503 622236 0.56 625739 60 3257 635542 0.51 638799 61 3294 609592 0.54 612886 62 3364 611684 0.55 615048 63 3375 619076 0.54 622451 64 3255 599773 0.54 603028 65 3149 604734 0.52 607883 66 3232 592943 0.54 596175 67 3358 602353 0.55 605711 68 3189 592759 0.54 595948 69 3280 590004 0.55 593284 70 3328 606144 0.55 609472 71 3402 590057 0.57 593459 72 3288 588995 0.56 592283 73 3051 569750 0.53 572801 74 3284 569479 0.57 572763 75 3139 583502 0.54 586641 76 3263 581942 0.56 585205 77 3258 553804 0.58 557062 78 3059 560095 0.54 563154 79 2959 552335 0.53 555294 80 3175 544043 0.58 547218 81 3068 542209 0.56 545277 82 2967 543511 0.54 546478 83 2986 526259 0.56 529245 84 2955 550433 0.53 553388 85 3011 554379 0.54 557390 86 2758 523951 0.52 526709 87 3064 535174 0.57 538238 88 2898 516204 0.56 519102 89 2754 507668 0.54 510422 90 2639 488266 0.54 490905 91 2940 510363 0.57 513303 92 2816 510676 0.55 513492 93 3076 537195 0.57 540271 94 2758 505770 0.54 508528 95 2681 493066 0.54 495747 96 2842 500350 0.56 503192 97 2944 507867 0.58 510811 98 2736 478162 0.57 480898 99 2749 488741 0.56 491490 100 2499 468786 0.53 471285 101 2624 466511 0.56 469135 102 2719 472370 0.57 475089 103 2689 472446 0.57 475135 104 2496 467057 0.53 469553 105 2656 478406 0.55 481062 106 2581 462138 0.56 464719 107 2574 445111 0.57 447685 108 2654 472507 0.56 475161 109 2524 445137 0.56 447661 110 2526 438964 0.57 441490 111 2501 467039 0.53 469540 112 2584 439151 0.58 441735 113 2400 436472 0.55 438872 114 2420 443084 0.54 445504 115 2452 439324 0.56 441776 116 2466 446742 0.55 449208 117 2285 421053 0.54 423338 118 2541 435103 0.58 437644 119 2529 426366 0.59 428895 120 2174 417140 0.52 419314 121 2213 411272 0.54 413485 122 2366 407074 0.58 409440 123 2252 393011 0.57 395263 124 2323 406871 0.57 409194 125 2134 392884 0.54 395018 126 2275 411190 0.55 413465 127 2238 392687 0.57 394925 128 2316 390189 0.59 392505 129 2274 400406 0.56 402680 130 2246 397132 0.56 399378 131 2281 391363 0.58 393644 132 2394 388255 0.61 390649 133 2185 387996 0.56 390181 134 2261 388180 0.58 390441 135 2099 377904 0.55 380003 136 2181 385852 0.56 388033 137 2085 377986 0.55 380071 138 2228 377194 0.59 379422 139 2153 369080 0.58 371233 140 2210 361222 0.61 363432 141 2133 359290 0.59 361423 142 2162 347467 0.62 349629 143 2210 344966 0.64 347176 144 2225 359430 0.62 361655 145 2136 352416 0.60 354552 146 2096 336067 0.62 338163 147 1943 348559 0.55 350502 148 1272 120164 1.05 121436 149 937 115193 0.81 116130 150 1241 164831 0.75 166072 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 87713 1305225 6.30 1392938 2 36782 1651 95.70 38433 3 1029 42028 2.39 43057 4 1637 82671 1.94 84308 5 3000 81056 3.57 84056 6 3968 88176 4.31 92144 7 4024 93111 4.14 97135 8 5102 104772 4.64 109874 9 5216 104282 4.76 109498 10 4223 92772 4.35 96995 11 3385 86148 3.78 89533 12 3424 79037 4.15 82461 13 3777 94930 3.83 98707 14 3992 106046 3.63 110038 15 5290 113617 4.45 118907 16 7099 113788 5.87 120887 17 3631 86678 4.02 90309 18 3239 84626 3.69 87865 19 3108 80940 3.70 84048 20 3452 81896 4.04 85348 21 3420 78876 4.16 82296 22 3683 86906 4.07 90589 23 3709 93238 3.83 96947 24 3250 91739 3.42 94989 25 3444 86369 3.83 89813 26 3064 78207 3.77 81271 27 2722 75902 3.46 78624 28 2919 76602 3.67 79521 29 3387 78178 4.15 81565 30 3233 77114 4.02 80347 31 3064 73687 3.99 76751 32 2819 72918 3.72 75737 33 2857 73722 3.73 76579 34 3014 71521 4.04 74535 35 3233 71284 4.34 74517 36 2923 72851 3.86 75774 37 2615 69191 3.64 71806 38 3426 72510 4.51 75936 39 3350 75752 4.24 79102 40 2860 70437 3.90 73297 41 2723 69514 3.77 72237 42 2315 65713 3.40 68028 43 2446 62323 3.78 64769 44 2234 61117 3.53 63351 45 2402 64226 3.61 66628 46 2467 66492 3.58 68959 47 2398 65268 3.54 67666 48 2632 64821 3.90 67453 49 2532 66860 3.65 69392 50 2523 63190 3.84 65713 51 2460 67855 3.50 70315 52 2666 68990 3.72 71656 53 2381 59395 3.85 61776 54 2292 56490 3.90 58782 55 2114 54707 3.72 56821 56 2138 56078 3.67 58216 57 2257 58665 3.70 60922 58 2333 62152 3.62 64485 59 2406 61267 3.78 63673 60 2548 60717 4.03 63265 61 2978 65975 4.32 68953 62 2297 61508 3.60 63805 63 2053 60197 3.30 62250 64 2002 57336 3.37 59338 65 2086 54652 3.68 56738 66 2020 63122 3.10 65142 67 1932 60494 3.09 62426 68 2069 53333 3.73 55402 69 2021 52658 3.70 54679 70 1925 51695 3.59 53620 71 1958 53469 3.53 55427 72 1859 52856 3.40 54715 73 1866 51312 3.51 53178 74 1945 50439 3.71 52384 75 2705 58753 4.40 61458 76 3037 62417 4.64 65454 77 2131 52447 3.90 54578 78 2074 52249 3.82 54323 79 1829 49430 3.57 51259 80 1656 45636 3.50 47292 81 1662 44858 3.57 46520 82 1568 44843 3.38 46411 83 1494 43324 3.33 44818 84 1711 44955 3.67 46666 85 1706 44545 3.69 46251 86 1678 42994 3.76 44672 87 1775 42457 4.01 44232 88 1494 41865 3.45 43359 89 1558 42496 3.54 44054 90 1863 44839 3.99 46702 91 1622 42120 3.71 43742 92 1386 38962 3.44 40348 93 1397 40671 3.32 42068 94 1501 40289 3.59 41790 95 1368 38261 3.45 39629 96 1372 37472 3.53 38844 97 1473 37437 3.79 38910 98 1312 36781 3.44 38093 99 1255 36645 3.31 37900 100 1267 36336 3.37 37603 101 1263 36250 3.37 37513 102 1324 35502 3.60 36826 103 1234 35351 3.37 36585 104 1260 34818 3.49 36078 105 1228 34584 3.43 35812 106 1332 34478 3.72 35810 107 1213 34485 3.40 35698 108 1172 34127 3.32 35299 109 1215 33090 3.54 34305 110 1286 32682 3.79 33968 111 1298 32934 3.79 34232 112 1236 33123 3.60 34359 113 1270 31534 3.87 32804 114 1252 31456 3.83 32708 115 1183 32926 3.47 34109 116 1095 31750 3.33 32845 117 987 29817 3.20 30804 118 1117 29556 3.64 30673 119 1234 30631 3.87 31865 120 1055 30382 3.36 31437 121 1121 28925 3.73 30046 122 1046 30173 3.35 31219 123 1083 29427 3.55 30510 124 1151 28647 3.86 29798 125 1099 28661 3.69 29760 126 989 28451 3.36 29440 127 1026 27008 3.66 28034 128 926 27227 3.29 28153 129 977 27462 3.44 28439 130 1002 26805 3.60 27807 131 1014 27380 3.57 28394 132 980 27483 3.44 28463 133 1073 26333 3.92 27406 134 971 26482 3.54 27453 135 964 25776 3.61 26740 136 915 25163 3.51 26078 137 853 24367 3.38 25220 138 856 24485 3.38 25341 139 916 23734 3.72 24650 140 886 24122 3.54 25008 141 863 24840 3.36 25703 142 936 24471 3.68 25407 143 865 23723 3.52 24588 144 808 23339 3.35 24147 145 839 22615 3.58 23454 146 938 23272 3.87 24210 147 798 22326 3.45 23124 148 736 11737 5.90 12473 149 361 11227 3.12 11588 150 394 11191 3.40 11585 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1815 1251691 0.14 1253506 2 784 3975 16.47 4759 3 16377 4826 77.24 21203 4 266 79672 0.33 79938 5 378 75677 0.50 76055 6 458 69034 0.66 69492 7 547 88122 0.62 88669 8 691 80515 0.85 81206 9 484 82746 0.58 83230 10 627 86472 0.72 87099 11 448 77620 0.57 78068 12 504 80792 0.62 81296 13 554 88149 0.62 88703 14 494 78151 0.63 78645 15 518 97889 0.53 98407 16 626 115812 0.54 116438 17 538 97809 0.55 98347 18 540 81391 0.66 81931 19 471 75004 0.62 75475 20 458 73241 0.62 73699 21 497 86649 0.57 87146 22 406 72412 0.56 72818 23 446 69440 0.64 69886 24 444 74555 0.59 74999 25 387 72218 0.53 72605 26 415 64829 0.64 65244 27 419 66358 0.63 66777 28 444 75205 0.59 75649 29 434 76332 0.57 76766 30 479 86701 0.55 87180 31 460 78427 0.58 78887 32 483 80174 0.60 80657 33 423 66182 0.64 66605 34 358 68759 0.52 69117 35 387 64700 0.59 65087 36 411 69740 0.59 70151 37 415 73901 0.56 74316 38 344 65021 0.53 65365 39 402 66199 0.60 66601 40 377 70493 0.53 70870 41 314 58499 0.53 58813 42 414 66717 0.62 67131 43 411 66169 0.62 66580 44 345 57308 0.60 57653 45 370 60866 0.60 61236 46 404 62037 0.65 62441 47 353 64982 0.54 65335 48 375 57659 0.65 58034 49 370 63490 0.58 63860 50 399 70434 0.56 70833 51 372 57251 0.65 57623 52 330 57075 0.57 57405 53 340 62088 0.54 62428 54 314 56950 0.55 57264 55 332 55757 0.59 56089 56 348 54221 0.64 54569 57 310 59102 0.52 59412 58 312 66936 0.46 67248 59 302 52616 0.57 52918 60 316 51760 0.61 52076 61 351 59144 0.59 59495 62 288 50146 0.57 50434 63 334 53450 0.62 53784 64 312 51604 0.60 51916 65 279 51620 0.54 51899 66 276 50824 0.54 51100 67 299 51959 0.57 52258 68 278 46428 0.60 46706 69 290 49414 0.58 49704 70 280 53741 0.52 54021 71 268 48680 0.55 48948 72 286 47001 0.60 47287 73 268 46799 0.57 47067 74 275 45040 0.61 45315 75 284 46741 0.60 47025 76 302 52896 0.57 53198 77 263 53466 0.49 53729 78 246 44751 0.55 44997 79 228 43750 0.52 43978 80 222 45544 0.49 45766 81 308 48411 0.63 48719 82 234 41319 0.56 41553 83 211 42617 0.49 42828 84 239 42567 0.56 42806 85 184 41217 0.44 41401 86 220 37814 0.58 38034 87 235 43162 0.54 43397 88 235 47581 0.49 47816 89 212 39667 0.53 39879 90 285 41932 0.68 42217 91 217 39332 0.55 39549 92 195 36834 0.53 37029 93 201 37238 0.54 37439 94 228 38752 0.58 38980 95 212 36635 0.58 36847 96 211 36302 0.58 36513 97 227 37209 0.61 37436 98 157 33688 0.46 33845 99 186 35386 0.52 35572 100 189 36105 0.52 36294 101 222 32931 0.67 33153 102 194 34354 0.56 34548 103 178 34543 0.51 34721 104 191 34903 0.54 35094 105 204 35539 0.57 35743 106 185 32159 0.57 32344 107 147 32185 0.45 32332 108 215 35342 0.60 35557 109 194 34225 0.56 34419 110 146 30996 0.47 31142 111 185 33571 0.55 33756 112 203 31703 0.64 31906 113 168 30462 0.55 30630 114 147 32019 0.46 32166 115 168 29410 0.57 29578 116 143 31745 0.45 31888 117 160 30141 0.53 30301 118 148 29849 0.49 29997 119 131 27862 0.47 27993 120 175 30269 0.57 30444 121 143 28600 0.50 28743 122 175 27597 0.63 27772 123 145 28065 0.51 28210 124 159 28170 0.56 28329 125 140 27427 0.51 27567 126 154 27696 0.55 27850 127 133 27599 0.48 27732 128 154 25711 0.60 25865 129 130 27587 0.47 27717 130 137 25965 0.52 26102 131 130 24645 0.52 24775 132 140 26425 0.53 26565 133 120 24549 0.49 24669 134 137 25606 0.53 25743 135 119 25477 0.46 25596 136 102 24050 0.42 24152 137 119 23440 0.51 23559 138 113 23829 0.47 23942 139 114 23736 0.48 23850 140 128 23061 0.55 23189 141 123 23846 0.51 23969 142 135 23215 0.58 23350 143 91 22016 0.41 22107 144 114 22744 0.50 22858 145 99 21876 0.45 21975 146 95 20678 0.46 20773 147 112 22410 0.50 22522 148 83 11413 0.72 11496 149 69 11225 0.61 11294 150 67 10450 0.64 10517 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 660 29792 2.17 30452 2 2115 235860 0.89 237975 3 1720 202350 0.84 204070 4 2574 338024 0.76 340598 5 2523 305736 0.82 308259 6 2039 315450 0.64 317489 7 2165 353964 0.61 356129 8 2101 316121 0.66 318222 9 2240 317510 0.70 319750 10 2042 328950 0.62 330992 11 1984 324144 0.61 326128 12 2000 320115 0.62 322115 13 2482 332607 0.74 335089 14 1894 317564 0.59 319458 15 2021 341912 0.59 343933 16 2007 335737 0.59 337744 17 2004 327772 0.61 329776 18 1881 310748 0.60 312629 19 1927 289676 0.66 291603 20 1867 300640 0.62 302507 21 1737 301071 0.57 302808 22 1943 299877 0.64 301820 23 1798 300733 0.59 302531 24 1858 286736 0.64 288594 25 1801 313036 0.57 314837 26 1728 276835 0.62 278563 27 1752 275771 0.63 277523 28 1697 286723 0.59 288420 29 1726 296304 0.58 298030 30 1791 309703 0.57 311494 31 1751 284934 0.61 286685 32 1635 261072 0.62 262707 33 1517 254386 0.59 255903 34 1763 275771 0.64 277534 35 1554 276682 0.56 278236 36 1581 282333 0.56 283914 37 1499 266501 0.56 268000 38 1646 259561 0.63 261207 39 1433 242986 0.59 244419 40 1425 243930 0.58 245355 41 1457 256042 0.57 257499 42 1536 249960 0.61 251496 43 1420 248624 0.57 250044 44 1362 248334 0.55 249696 45 1389 244252 0.57 245641 46 1397 239161 0.58 240558 47 1296 234132 0.55 235428 48 1338 248734 0.54 250072 49 1325 236250 0.56 237575 50 1434 239949 0.59 241383 51 1500 254335 0.59 255835 52 1424 244849 0.58 246273 53 1341 218138 0.61 219479 54 1412 234664 0.60 236076 55 1291 234500 0.55 235791 56 1259 226353 0.55 227612 57 1293 216216 0.59 217509 58 1296 223573 0.58 224869 59 1253 224563 0.55 225816 60 1164 213375 0.54 214539 61 1193 208982 0.57 210175 62 1204 208276 0.57 209480 63 1234 218222 0.56 219456 64 1125 218058 0.51 219183 65 1101 206788 0.53 207889 66 1134 202368 0.56 203502 67 1108 210698 0.52 211806 68 1139 200311 0.57 201450 69 1090 194665 0.56 195755 70 1129 210979 0.53 212108 71 1106 201827 0.55 202933 72 1079 196626 0.55 197705 73 1085 195430 0.55 196515 74 1129 194699 0.58 195828 75 1079 188465 0.57 189544 76 967 187583 0.51 188550 77 993 172455 0.57 173448 78 1097 184438 0.59 185535 79 1020 181589 0.56 182609 80 988 176845 0.56 177833 81 1040 174716 0.59 175756 82 896 168959 0.53 169855 83 981 164677 0.59 165658 84 947 171075 0.55 172022 85 997 174459 0.57 175456 86 888 159859 0.55 160747 87 997 172027 0.58 173024 88 843 154175 0.54 155018 89 838 150154 0.55 150992 90 813 150599 0.54 151412 91 888 161644 0.55 162532 92 878 152163 0.57 153041 93 936 156797 0.59 157733 94 789 147760 0.53 148549 95 829 143036 0.58 143865 96 848 153065 0.55 153913 97 781 141533 0.55 142314 98 685 139069 0.49 139754 99 722 139530 0.51 140252 100 782 138037 0.56 138819 101 799 132641 0.60 133440 102 824 134881 0.61 135705 103 694 133883 0.52 134577 104 653 130188 0.50 130841 105 662 133138 0.49 133800 106 670 131042 0.51 131712 107 608 125609 0.48 126217 108 692 130484 0.53 131176 109 765 123558 0.62 124323 110 666 122765 0.54 123431 111 691 121697 0.56 122388 112 694 120149 0.57 120843 113 614 119223 0.51 119837 114 665 118004 0.56 118669 115 612 117660 0.52 118272 116 607 115383 0.52 115990 117 585 113687 0.51 114272 118 623 112296 0.55 112919 119 614 113105 0.54 113719 120 583 109686 0.53 110269 121 567 108811 0.52 109378 122 548 108148 0.50 108696 123 515 103440 0.50 103955 124 550 106030 0.52 106580 125 535 105699 0.50 106234 126 600 104663 0.57 105263 127 555 101948 0.54 102503 128 504 99849 0.50 100353 129 573 99471 0.57 100044 130 577 99884 0.57 100461 131 521 97943 0.53 98464 132 534 96503 0.55 97037 133 507 96413 0.52 96920 134 484 92817 0.52 93301 135 545 93931 0.58 94476 136 492 92488 0.53 92980 137 473 89933 0.52 90406 138 501 93245 0.53 93746 139 500 90134 0.55 90634 140 503 90178 0.55 90681 141 504 88952 0.56 89456 142 449 85815 0.52 86264 143 428 83797 0.51 84225 144 488 85993 0.56 86481 145 513 85858 0.59 86371 146 452 83591 0.54 84043 147 391 83472 0.47 83863 148 402 44476 0.90 44878 149 259 43091 0.60 43350 150 205 39333 0.52 39538