CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 23 126 15.44 149 2 22 140 13.58 162 3 12 113 9.60 125 4 19 121 13.57 140 5 11 117 8.59 128 6 10 119 7.75 129 7 15 102 12.82 117 8 7 123 5.38 130 9 9 99 8.33 108 10 16 126 11.27 142 11 15 119 11.19 134 12 11 116 8.66 127 13 13 125 9.42 138 14 6 132 4.35 138 15 13 122 9.63 135 16 15 111 11.90 126 17 9 124 6.77 133 18 9 119 7.03 128 19 9 123 6.82 132 20 4 105 3.67 109 21 17 122 12.23 139 22 13 118 9.92 131 23 9 123 6.82 132 24 12 138 8.00 150 25 10 126 7.35 136 26 16 118 11.94 134 27 12 114 9.52 126 28 14 119 10.53 133 29 16 116 12.12 132 30 13 118 9.92 131 31 12 128 8.57 140 32 14 122 10.29 136 33 14 104 11.86 118 34 20 120 14.29 140 35 7 117 5.65 124 36 8 99 7.48 107 37 3 109 2.68 112 38 11 129 7.86 140 39 15 112 11.81 127 40 12 102 10.53 114 41 11 105 9.48 116 42 11 111 9.02 122 43 12 118 9.23 130 44 5 106 4.50 111 45 12 93 11.43 105 46 11 96 10.28 107 47 9 105 7.89 114 48 5 95 5.00 100 49 4 103 3.74 107 50 8 101 7.34 109 51 12 111 9.76 123 52 9 84 9.68 93 53 7 90 7.22 97 54 11 98 10.09 109 55 9 112 7.44 121 56 11 104 9.57 115 57 6 82 6.82 88 58 4 100 3.85 104 59 12 80 13.04 92 60 9 95 8.65 104 61 12 76 13.64 88 62 9 76 10.59 85 63 7 87 7.45 94 64 7 97 6.73 104 65 7 70 9.09 77 66 3 97 3.00 100 67 7 77 8.33 84 68 4 85 4.49 89 69 8 76 9.52 84 70 7 57 10.94 64 71 7 72 8.86 79 72 3 67 4.29 70 73 5 73 6.41 78 74 6 61 8.96 67 75 9 67 11.84 76 76 9 67 11.84 76 77 9 57 13.64 66 78 4 55 6.78 59 79 6 49 10.91 55 80 5 60 7.69 65 81 7 43 14.00 50 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 56 145 27.86 201 2 12 180 6.25 192 3 6 177 3.28 183 4 7 155 4.32 162 5 12 170 6.59 182 6 10 136 6.85 146 7 4 161 2.42 165 8 9 158 5.39 167 9 10 166 5.68 176 10 9 167 5.11 176 11 3 151 1.95 154 12 5 159 3.05 164 13 6 177 3.28 183 14 5 168 2.89 173 15 3 168 1.75 171 16 6 191 3.05 197 17 1 136 0.73 137 18 7 153 4.38 160 19 5 171 2.84 176 20 0 180 0.00 180 21 5 162 2.99 167 22 3 172 1.71 175 23 2 164 1.20 166 24 6 169 3.43 175 25 2 181 1.09 183 26 13 163 7.39 176 27 3 176 1.68 179 28 7 188 3.59 195 29 1 172 0.58 173 30 4 174 2.25 178 31 5 157 3.09 162 32 7 171 3.93 178 33 3 172 1.71 175 34 3 179 1.65 182 35 5 169 2.87 174 36 2 173 1.14 175 37 7 174 3.87 181 38 4 160 2.44 164 39 3 158 1.86 161 40 6 158 3.66 164 41 3 163 1.81 166 42 5 145 3.33 150 43 4 146 2.67 150 44 3 166 1.78 169 45 3 181 1.63 184 46 4 145 2.68 149 47 2 138 1.43 140 48 3 123 2.38 126 49 4 118 3.28 122 50 5 127 3.79 132 51 5 141 3.42 146 52 3 135 2.17 138 53 6 164 3.53 170 54 0 137 0.00 137 55 3 134 2.19 137 56 5 140 3.45 145 57 4 129 3.01 133 58 6 129 4.44 135 59 1 125 0.79 126 60 6 107 5.31 113 61 2 103 1.90 105 62 5 122 3.94 127 63 2 133 1.48 135 64 3 112 2.61 115 65 2 120 1.64 122 66 1 109 0.91 110 67 2 115 1.71 117 68 3 105 2.78 108 69 3 106 2.75 109 70 7 117 5.65 124 71 5 120 4.00 125 72 2 123 1.60 125 73 3 87 3.33 90 74 4 89 4.30 93 75 1 95 1.04 96 76 4 102 3.77 106 77 6 86 6.52 92 78 5 96 4.95 101 79 4 80 4.76 84 80 4 84 4.55 88 81 4 72 5.26 76 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 219 531 29.20 750 2 163 587 21.73 750 3 186 547 25.38 733 4 201 534 27.35 735 5 206 573 26.44 779 6 178 554 24.32 732 7 221 552 28.59 773 8 162 580 21.83 742 9 190 588 24.42 778 10 213 544 28.14 757 11 225 549 29.07 774 12 225 598 27.34 823 13 213 597 26.30 810 14 206 560 26.89 766 15 186 594 23.85 780 16 200 584 25.51 784 17 215 553 27.99 768 18 217 667 24.55 884 19 234 622 27.34 856 20 194 661 22.69 855 21 204 669 23.37 873 22 206 601 25.53 807 23 208 574 26.60 782 24 213 615 25.72 828 25 196 577 25.36 773 26 203 600 25.28 803 27 196 595 24.78 791 28 211 601 25.99 812 29 198 600 24.81 798 30 207 577 26.40 784 31 203 573 26.16 776 32 201 590 25.41 791 33 196 586 25.06 782 34 203 563 26.50 766 35 182 590 23.58 772 36 185 606 23.39 791 37 185 555 25.00 740 38 189 542 25.85 731 39 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15.15 66 2 10 39 20.41 49 3 24 47 33.80 71 4 5 65 7.14 70 5 4 68 5.56 72 6 5 45 10.00 50 7 6 55 9.84 61 8 4 51 7.27 55 9 5 61 7.58 66 10 4 57 6.56 61 11 7 43 14.00 50 12 5 58 7.94 63 13 4 52 7.14 56 14 6 45 11.76 51 15 3 52 5.45 55 16 2 69 2.82 71 17 10 39 20.41 49 18 7 46 13.21 53 19 4 46 8.00 50 20 5 43 10.42 48 21 3 38 7.32 41 22 3 29 9.38 32 23 3 45 6.25 48 24 2 44 4.35 46 25 5 29 14.71 34 26 1 29 3.33 30 27 3 36 7.69 39 28 3 41 6.82 44 29 0 31 0.00 31 30 3 35 7.89 38 31 2 25 7.41 27 32 1 29 3.33 30 33 6 39 13.33 45 34 5 31 13.89 36 35 3 29 9.38 32 36 5 34 12.82 39 37 3 32 8.57 35 38 2 21 8.70 23 39 3 30 9.09 33 40 0 35 0.00 35 41 4 23 14.81 27 42 4 31 11.43 35 43 2 28 6.67 30 44 0 27 0.00 27 45 3 30 9.09 33 46 1 19 5.00 20 47 2 30 6.25 32 48 1 26 3.70 27 49 1 28 3.45 29 50 0 28 0.00 28 51 3 26 10.34 29 52 3 18 14.29 21 53 3 18 14.29 21 54 1 23 4.17 24 55 6 23 20.69 29 56 0 23 0.00 23 57 0 19 0.00 19 58 3 20 13.04 23 59 2 14 12.50 16 60 3 18 14.29 21 61 2 15 11.76 17 62 0 18 0.00 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