CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 179623 2456270 6.81 2635893 2 2662985 59277 97.82 2722262 3 250 9891 2.47 10141 4 2309 95823 2.35 98132 5 4373 174168 2.45 178541 6 6081 173259 3.39 179340 7 8178 198251 3.96 206429 8 8669 211706 3.93 220375 9 9821 226150 4.16 235971 10 10251 234155 4.19 244406 11 9395 222512 4.05 231907 12 8291 200739 3.97 209030 13 7440 192586 3.72 200026 14 8719 224258 3.74 232977 15 9438 247638 3.67 257076 16 13030 256494 4.83 269524 17 9523 241811 3.79 251334 18 8508 217196 3.77 225704 19 7959 205982 3.72 213941 20 8668 214446 3.89 223114 21 9392 212659 4.23 222051 22 9445 196469 4.59 205914 23 10361 217214 4.55 227575 24 10513 221893 4.52 232406 25 10402 220087 4.51 230489 26 11582 222303 4.95 233885 27 11916 208874 5.40 220790 28 10758 199503 5.12 210261 29 11111 197639 5.32 208750 30 12314 208500 5.58 220814 31 13040 208753 5.88 221793 32 14795 207420 6.66 222215 33 14195 213875 6.22 228070 34 14991 219643 6.39 234634 35 15408 208614 6.88 224022 36 15018 200500 6.97 215518 37 15447 203511 7.05 218958 38 14630 192473 7.06 207103 39 15512 204676 7.04 220188 40 17119 209502 7.55 226621 41 16835 196927 7.88 213762 42 16906 195107 7.97 212013 43 17657 188555 8.56 206212 44 16140 192878 7.72 209018 45 15476 196030 7.32 211506 46 16069 210031 7.11 226100 47 15898 226473 6.56 242371 48 15602 209618 6.93 225220 49 17265 200495 7.93 217760 50 17718 203260 8.02 220978 51 17498 188195 8.51 205693 52 18342 202587 8.30 220929 53 16770 197219 7.84 213989 54 17576 186734 8.60 204310 55 18220 182105 9.10 200325 56 18006 181607 9.02 199613 57 16242 185356 8.06 201598 58 19296 186040 9.40 205336 59 17913 198630 8.27 216543 60 18979 190136 9.08 209115 61 18095 188601 8.75 206696 62 18300 194412 8.60 212712 63 18570 195257 8.68 213827 64 19167 190836 9.13 210003 65 17049 185443 8.42 202492 66 17975 178929 9.13 196904 67 17889 191190 8.56 209079 68 17354 184162 8.61 201516 69 18670 173347 9.72 192017 70 17506 177770 8.96 195276 71 18158 177485 9.28 195643 72 21802 183016 10.64 204818 73 19566 187414 9.45 206980 74 18756 179044 9.48 197800 75 21397 173800 10.96 195197 76 23858 186422 11.35 210280 77 20661 186177 9.99 206838 78 22517 172469 11.55 194986 79 23422 173692 11.88 197114 80 19142 174117 9.90 193259 81 20626 160208 11.41 180834 82 17875 159896 10.06 177771 83 16966 158594 9.66 175560 84 16836 157704 9.65 174540 85 17478 165247 9.57 182725 86 17564 168689 9.43 186253 87 17847 160125 10.03 177972 88 19623 153921 11.31 173544 89 20596 151489 11.97 172085 90 17862 155194 10.32 173056 91 22155 163019 11.96 185174 92 19621 161162 10.85 180783 93 17735 150091 10.57 167826 94 18325 154464 10.61 172789 95 24906 154926 13.85 179832 96 20506 153465 11.79 173971 97 18214 147997 10.96 166211 98 20059 151465 11.69 171524 99 18357 146150 11.16 164507 100 22426 142940 13.56 165366 101 17142 152179 10.12 169321 102 15959 148259 9.72 164218 103 16923 142329 10.63 159252 104 17933 139689 11.38 157622 105 15386 137436 10.07 152822 106 16421 134370 10.89 150791 107 16236 133966 10.81 150202 108 18787 132772 12.40 151559 109 20964 133567 13.57 154531 110 15740 132431 10.62 148171 111 16984 124646 11.99 141630 112 16996 136511 11.07 153507 113 14944 135553 9.93 150497 114 14791 125889 10.51 140680 115 14431 133539 9.75 147970 116 14476 134291 9.73 148767 117 15477 133131 10.41 148608 118 14850 127586 10.43 142436 119 14393 123915 10.41 138308 120 15036 122206 10.96 137242 121 19367 125476 13.37 144843 122 13994 140481 9.06 154475 123 13616 135628 9.12 149244 124 14164 126490 10.07 140654 125 14859 120435 10.98 135294 126 13731 126635 9.78 140366 127 14019 142483 8.96 156502 128 14574 137485 9.58 152059 129 14074 121697 10.37 135771 130 14046 123658 10.20 137704 131 14364 117800 10.87 132164 132 13349 115420 10.37 128769 133 13151 117902 10.03 131053 134 13468 127073 9.58 140541 135 14688 130686 10.10 145374 136 14044 121742 10.34 135786 137 14455 112967 11.34 127422 138 21998 113104 16.28 135102 139 14653 122425 10.69 137078 140 13908 112386 11.01 126294 141 13466 115557 10.44 129023 142 14499 117024 11.02 131523 143 13078 114557 10.25 127635 144 12708 108805 10.46 121513 145 13202 108406 10.86 121608 146 23666 109415 17.78 133081 147 14443 115371 11.13 129814 148 13631 104128 11.58 117759 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3488 32093 9.80 35581 2 32753 1327 96.11 34080 3 28317 2708905 1.03 2737222 4 382 81145 0.47 81527 5 454 84352 0.54 84806 6 865 152002 0.57 152867 7 1078 186856 0.57 187934 8 1121 164021 0.68 165142 9 1146 196696 0.58 197842 10 1142 190340 0.60 191482 11 1028 194641 0.53 195669 12 1054 198386 0.53 199440 13 1095 204713 0.53 205808 14 1017 189884 0.53 190901 15 1106 213740 0.51 214846 16 1121 203474 0.55 204595 17 1221 214959 0.56 216180 18 1077 213847 0.50 214924 19 1204 207210 0.58 208414 20 1158 196219 0.59 197377 21 1144 206398 0.55 207542 22 1134 191950 0.59 193084 23 1247 212721 0.58 213968 24 1086 183752 0.59 184838 25 1143 189366 0.60 190509 26 1138 179938 0.63 181076 27 1221 194133 0.63 195354 28 1095 189947 0.57 191042 29 1274 201300 0.63 202574 30 1159 215526 0.53 216685 31 1319 203418 0.64 204737 32 1226 203339 0.60 204565 33 1130 193945 0.58 195075 34 1134 201226 0.56 202360 35 1113 194575 0.57 195688 36 1238 195054 0.63 196292 37 1135 194800 0.58 195935 38 1072 182353 0.58 183425 39 1233 195438 0.63 196671 40 1204 181965 0.66 183169 41 1206 189310 0.63 190516 42 1262 192171 0.65 193433 43 1163 190979 0.61 192142 44 1280 179866 0.71 181146 45 1133 198216 0.57 199349 46 1150 180204 0.63 181354 47 1209 196212 0.61 197421 48 1147 184204 0.62 185351 49 1277 206823 0.61 208100 50 1198 188186 0.63 189384 51 1193 184292 0.64 185485 52 1164 179988 0.64 181152 53 1155 178178 0.64 179333 54 1098 175159 0.62 176257 55 1251 188031 0.66 189282 56 1227 177693 0.69 178920 57 1196 192743 0.62 193939 58 1405 200039 0.70 201444 59 1333 189459 0.70 190792 60 1240 184631 0.67 185871 61 1227 180017 0.68 181244 62 1135 168000 0.67 169135 63 1181 181336 0.65 182517 64 1125 169364 0.66 170489 65 1172 175669 0.66 176841 66 1154 170823 0.67 171977 67 1196 170924 0.69 172120 68 1192 171806 0.69 172998 69 1139 162094 0.70 163233 70 1086 167536 0.64 168622 71 1136 161920 0.70 163056 72 1270 163142 0.77 164412 73 1023 156412 0.65 157435 74 1170 158235 0.73 159405 75 1127 161554 0.69 162681 76 1314 172680 0.76 173994 77 1260 163071 0.77 164331 78 1409 172943 0.81 174352 79 1352 164774 0.81 166126 80 1193 161202 0.73 162395 81 1151 162128 0.70 163279 82 1193 159017 0.74 160210 83 1192 154470 0.77 155662 84 1090 148199 0.73 149289 85 1004 147427 0.68 148431 86 1008 143051 0.70 144059 87 1150 154616 0.74 155766 88 1223 154824 0.78 156047 89 1196 152612 0.78 153808 90 1295 160666 0.80 161961 91 1100 143460 0.76 144560 92 1152 147346 0.78 148498 93 1153 149894 0.76 151047 94 1091 145967 0.74 147058 95 1317 145909 0.89 147226 96 1137 149082 0.76 150219 97 1188 156104 0.76 157292 98 1045 140819 0.74 141864 99 1182 152136 0.77 153318 100 1002 132071 0.75 133073 101 1038 130723 0.79 131761 102 991 130833 0.75 131824 103 1017 139507 0.72 140524 104 989 128257 0.77 129246 105 903 142286 0.63 143189 106 968 124927 0.77 125895 107 1005 133235 0.75 134240 108 1096 132354 0.82 133450 109 1002 127491 0.78 128493 110 1004 134341 0.74 135345 111 969 134616 0.71 135585 112 989 127455 0.77 128444 113 840 120570 0.69 121410 114 934 131440 0.71 132374 115 848 121670 0.69 122518 116 964 127603 0.75 128567 117 953 127834 0.74 128787 118 896 132125 0.67 133021 119 960 119510 0.80 120470 120 926 121593 0.76 122519 121 969 119323 0.81 120292 122 781 111330 0.70 112111 123 888 117088 0.75 117976 124 838 116350 0.72 117188 125 860 121195 0.70 122055 126 845 130532 0.64 131377 127 967 116830 0.82 117797 128 847 118659 0.71 119506 129 982 119239 0.82 120221 130 842 113242 0.74 114084 131 900 111119 0.80 112019 132 834 110443 0.75 111277 133 849 108132 0.78 108981 134 762 110794 0.68 111556 135 708 109435 0.64 110143 136 828 108142 0.76 108970 137 988 112897 0.87 113885 138 908 104080 0.86 104988 139 868 102068 0.84 102936 140 822 106110 0.77 106932 141 871 104609 0.83 105480 142 797 101893 0.78 102690 143 753 101378 0.74 102131 144 830 104767 0.79 105597 145 965 109081 0.88 110046 146 862 98861 0.86 99723 147 847 98222 0.85 99069 148 797 101108 0.78 101905 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1356 9539 12.45 10895 2 11216 1045 91.48 12261 3 3036 41376 6.84 44412 4 6678 882886 0.75 889564 5 6618 770127 0.85 776745 6 5598 704247 0.79 709845 7 5335 680391 0.78 685726 8 5425 693173 0.78 698598 9 5486 711427 0.77 716913 10 5783 712005 0.81 717788 11 5621 701012 0.80 706633 12 5852 779632 0.75 785484 13 6021 752560 0.79 758581 14 5638 724864 0.77 730502 15 5415 730615 0.74 736030 16 5723 745071 0.76 750794 17 5519 726414 0.75 731933 18 5630 742572 0.75 748202 19 5898 748448 0.78 754346 20 5618 732870 0.76 738488 21 5386 720417 0.74 725803 22 5529 730246 0.75 735775 23 5436 714283 0.76 719719 24 4999 696743 0.71 701742 25 5467 752493 0.72 757960 26 5317 762628 0.69 767945 27 5006 734068 0.68 739074 28 4649 700674 0.66 705323 29 4680 713204 0.65 717884 30 4706 731344 0.64 736050 31 4183 705037 0.59 709220 32 4130 723293 0.57 727423 33 4131 712925 0.58 717056 34 4254 747156 0.57 751410 35 3971 717982 0.55 721953 36 3768 688381 0.54 692149 37 3738 698021 0.53 701759 38 3765 683781 0.55 687546 39 3828 699056 0.54 702884 40 3978 726423 0.54 730401 41 3520 677456 0.52 680976 42 4025 710766 0.56 714791 43 3897 713663 0.54 717560 44 3618 674214 0.53 677832 45 3896 685529 0.57 689425 46 3705 680596 0.54 684301 47 3517 653032 0.54 656549 48 3647 649496 0.56 653143 49 3438 636264 0.54 639702 50 3755 670993 0.56 674748 51 3898 705009 0.55 708907 52 3784 693149 0.54 696933 53 3780 699384 0.54 703164 54 3607 668354 0.54 671961 55 3737 664179 0.56 667916 56 3763 652883 0.57 656646 57 3691 663300 0.55 666991 58 3617 657322 0.55 660939 59 3539 638257 0.55 641796 60 3358 623699 0.54 627057 61 3484 603390 0.57 606874 62 3519 649480 0.54 652999 63 3470 654450 0.53 657920 64 3489 630160 0.55 633649 65 3315 604619 0.55 607934 66 3278 600190 0.54 603468 67 3404 616574 0.55 619978 68 3260 605750 0.54 609010 69 3432 626145 0.55 629577 70 3374 616413 0.54 619787 71 3397 605211 0.56 608608 72 3380 602064 0.56 605444 73 3458 597348 0.58 600806 74 3484 606511 0.57 609995 75 3111 574770 0.54 577881 76 3404 585356 0.58 588760 77 3320 590041 0.56 593361 78 3331 594394 0.56 597725 79 3172 572831 0.55 576003 80 3142 557247 0.56 560389 81 3100 534112 0.58 537212 82 3140 550900 0.57 554040 83 3211 553857 0.58 557068 84 3066 569665 0.54 572731 85 3096 556605 0.55 559701 86 2974 547658 0.54 550632 87 3128 563953 0.55 567081 88 2988 536158 0.55 539146 89 2998 529037 0.56 532035 90 2771 504237 0.55 507008 91 2894 514488 0.56 517382 92 2850 508876 0.56 511726 93 3132 520252 0.60 523384 94 2930 515250 0.57 518180 95 2931 530666 0.55 533597 96 2904 519883 0.56 522787 97 3083 514795 0.60 517878 98 2914 496107 0.58 499021 99 2860 507071 0.56 509931 100 2647 471768 0.56 474415 101 2725 487437 0.56 490162 102 2767 486263 0.57 489030 103 2878 481646 0.59 484524 104 2704 487894 0.55 490598 105 2827 500038 0.56 502865 106 2652 477861 0.55 480513 107 2683 472376 0.56 475059 108 2671 474670 0.56 477341 109 2624 450591 0.58 453215 110 2575 450493 0.57 453068 111 2509 445250 0.56 447759 112 2685 451213 0.59 453898 113 2426 458119 0.53 460545 114 2584 454050 0.57 456634 115 2521 457788 0.55 460309 116 2503 442123 0.56 444626 117 2433 435574 0.56 438007 118 2629 464523 0.56 467152 119 2580 443837 0.58 446417 120 2324 425696 0.54 428020 121 2335 415044 0.56 417379 122 2368 417948 0.56 420316 123 2320 414236 0.56 416556 124 2366 419190 0.56 421556 125 2221 396925 0.56 399146 126 2303 403044 0.57 405347 127 2283 403592 0.56 405875 128 2408 423774 0.57 426182 129 2291 408285 0.56 410576 130 2259 393123 0.57 395382 131 2341 395633 0.59 397974 132 2383 404059 0.59 406442 133 2266 398027 0.57 400293 134 2361 397570 0.59 399931 135 2165 387095 0.56 389260 136 2225 391545 0.57 393770 137 2041 375709 0.54 377750 138 2185 378735 0.57 380920 139 2109 383044 0.55 385153 140 2218 371298 0.59 373516 141 2179 376495 0.58 378674 142 2202 366415 0.60 368617 143 2128 359206 0.59 361334 144 2138 368635 0.58 370773 145 2074 362537 0.57 364611 146 2020 353687 0.57 355707 147 2024 366620 0.55 368644 148 1995 348230 0.57 350225 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 199 8037 2.42 8236 2 869 48977 1.74 49846 3 2024 85402 2.32 87426 4 3016 84167 3.46 87183 5 3924 89897 4.18 93821 6 4166 96280 4.15 100446 7 5399 108286 4.75 113685 8 5306 106259 4.76 111565 9 3996 94590 4.05 98586 10 3596 87397 3.95 90993 11 3340 81757 3.92 85097 12 3977 100559 3.80 104536 13 4166 107627 3.73 111793 14 6207 119000 4.96 125207 15 5174 111313 4.44 116487 16 3873 92270 4.03 96143 17 3230 84814 3.67 88044 18 3291 84034 3.77 87325 19 3567 83550 4.09 87117 20 3460 80823 4.11 84283 21 3814 90087 4.06 93901 22 3887 96869 3.86 100756 23 3372 91372 3.56 94744 24 3344 86979 3.70 90323 25 3257 81333 3.85 84590 26 2935 78400 3.61 81335 27 3034 78441 3.72 81475 28 3210 79881 3.86 83091 29 3457 79698 4.16 83155 30 3053 75464 3.89 78517 31 2966 75492 3.78 78458 32 3043 77242 3.79 80285 33 3256 72052 4.32 75308 34 3141 73785 4.08 76926 35 3054 74597 3.93 77651 36 2776 70423 3.79 73199 37 3464 76645 4.32 80109 38 3423 75553 4.33 78976 39 2893 74077 3.76 76970 40 2837 69682 3.91 72519 41 2465 66255 3.59 68720 42 2383 65029 3.53 67412 43 2446 63115 3.73 65561 44 2438 66287 3.55 68725 45 2422 68816 3.40 71238 46 2355 65365 3.48 67720 47 2729 67056 3.91 69785 48 2988 68760 4.16 71748 49 2355 65104 3.49 67459 50 2854 71995 3.81 74849 51 2607 67173 3.74 69780 52 2369 60624 3.76 62993 53 2377 58449 3.91 60826 54 2178 55939 3.75 58117 55 2236 57438 3.75 59674 56 2261 59733 3.65 61994 57 2626 66411 3.80 69037 58 2196 59672 3.55 61868 59 2711 63895 4.07 66606 60 2849 65809 4.15 68658 61 2346 62713 3.61 65059 62 2233 62244 3.46 64477 63 2180 59118 3.56 61298 64 1961 56023 3.38 57984 65 2113 63542 3.22 65655 66 2072 63298 3.17 65370 67 2063 54256 3.66 56319 68 2076 53168 3.76 55244 69 2061 54156 3.67 56217 70 1956 55004 3.43 56960 71 2054 55166 3.59 57220 72 1933 51691 3.60 53624 73 1823 51601 3.41 53424 74 3057 63518 4.59 66575 75 3074 62066 4.72 65140 76 2192 53223 3.96 55415 77 1948 53003 3.54 54951 78 1995 52106 3.69 54101 79 1754 46621 3.63 48375 80 1607 46556 3.34 48163 81 1599 45062 3.43 46661 82 1699 45317 3.61 47016 83 1698 46337 3.53 48035 84 1823 45712 3.84 47535 85 1839 43637 4.04 45476 86 1643 43597 3.63 45240 87 1683 43755 3.70 45438 88 1647 42953 3.69 44600 89 1709 45242 3.64 46951 90 1853 44351 4.01 46204 91 1457 40268 3.49 41725 92 1468 41510 3.42 42978 93 1572 41967 3.61 43539 94 1453 39509 3.55 40962 95 1409 38144 3.56 39553 96 1412 38519 3.54 39931 97 1380 38429 3.47 39809 98 1311 36951 3.43 38262 99 1323 37995 3.36 39318 100 1380 36852 3.61 38232 101 1295 36237 3.45 37532 102 1298 36463 3.44 37761 103 1303 36233 3.47 37536 104 1337 35928 3.59 37265 105 1252 35353 3.42 36605 106 1304 35013 3.59 36317 107 1242 34912 3.44 36154 108 1276 34199 3.60 35475 109 1318 33274 3.81 34592 110 1281 34531 3.58 35812 111 1316 33520 3.78 34836 112 1323 32606 3.90 33929 113 1272 32870 3.73 34142 114 1132 32858 3.33 33990 115 1166 32876 3.43 34042 116 1090 31483 3.35 32573 117 1073 30122 3.44 31195 118 1137 30902 3.55 32039 119 1234 31117 3.81 32351 120 1106 30503 3.50 31609 121 1076 30887 3.37 31963 122 1130 30807 3.54 31937 123 1216 29305 3.98 30521 124 1090 29591 3.55 30681 125 979 28956 3.27 29935 126 1025 28118 3.52 29143 127 1056 27703 3.67 28759 128 986 28414 3.35 29400 129 1065 28097 3.65 29162 130 1040 27840 3.60 28880 131 1021 27654 3.56 28675 132 1049 28138 3.59 29187 133 1045 26814 3.75 27859 134 931 26092 3.45 27023 135 977 26003 3.62 26980 136 934 25543 3.53 26477 137 902 24552 3.54 25454 138 941 24612 3.68 25553 139 930 24709 3.63 25639 140 906 25525 3.43 26431 141 953 25285 3.63 26238 142 839 24218 3.35 25057 143 821 24104 3.29 24925 144 991 24046 3.96 25037 145 880 23412 3.62 24292 146 879 23335 3.63 24214 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 16815 1274667 1.30 1291482 2 157 47327 0.33 47484 3 203 42037 0.48 42240 4 506 75653 0.66 76159 5 552 87004 0.63 87556 6 552 75818 0.72 76370 7 527 87179 0.60 87706 8 540 86614 0.62 87154 9 472 82099 0.57 82571 10 571 88510 0.64 89081 11 527 85104 0.62 85631 12 535 79020 0.67 79555 13 556 100791 0.55 101347 14 584 98753 0.59 99337 15 560 91997 0.61 92557 16 618 99378 0.62 99996 17 494 90444 0.54 90938 18 465 79731 0.58 80196 19 457 84500 0.54 84957 20 428 74127 0.57 74555 21 538 78214 0.68 78752 22 399 75459 0.53 75858 23 379 72296 0.52 72675 24 470 70835 0.66 71305 25 421 71701 0.58 72122 26 416 73152 0.57 73568 27 451 75006 0.60 75457 28 511 84556 0.60 85067 29 454 77687 0.58 78141 30 490 83530 0.58 84020 31 416 74187 0.56 74603 32 396 76987 0.51 77383 33 431 67000 0.64 67431 34 366 70547 0.52 70913 35 409 71143 0.57 71552 36 414 68722 0.60 69136 37 419 71642 0.58 72061 38 351 69938 0.50 70289 39 386 63889 0.60 64275 40 437 71063 0.61 71500 41 384 63466 0.60 63850 42 359 62808 0.57 63167 43 382 65175 0.58 65557 44 395 61309 0.64 61704 45 374 64170 0.58 64544 46 415 61808 0.67 62223 47 349 66732 0.52 67081 48 393 65362 0.60 65755 49 400 62025 0.64 62425 50 372 65114 0.57 65486 51 339 60366 0.56 60705 52 316 59042 0.53 59358 53 381 61150 0.62 61531 54 355 56204 0.63 56559 55 317 58957 0.53 59274 56 344 66905 0.51 67249 57 334 56998 0.58 57332 58 304 56836 0.53 57140 59 313 55271 0.56 55584 60 297 52629 0.56 52926 61 343 58433 0.58 58776 62 327 52633 0.62 52960 63 318 54332 0.58 54650 64 298 52647 0.56 52945 65 310 52077 0.59 52387 66 293 48841 0.60 49134 67 292 52156 0.56 52448 68 273 51593 0.53 51866 69 284 50122 0.56 50406 70 295 52354 0.56 52649 71 265 48893 0.54 49158 72 281 47012 0.59 47293 73 293 48262 0.60 48555 74 312 51473 0.60 51785 75 261 51037 0.51 51298 76 268 48718 0.55 48986 77 264 50254 0.52 50518 78 248 46092 0.54 46340 79 276 47905 0.57 48181 80 219 44593 0.49 44812 81 250 46568 0.53 46818 82 240 43599 0.55 43839 83 190 42555 0.44 42745 84 256 40644 0.63 40900 85 239 43435 0.55 43674 86 216 43783 0.49 43999 87 209 41929 0.50 42138 88 273 45289 0.60 45562 89 232 41079 0.56 41311 90 252 41064 0.61 41316 91 216 39179 0.55 39395 92 210 38707 0.54 38917 93 221 37626 0.58 37847 94 233 38733 0.60 38966 95 210 38459 0.54 38669 96 176 35784 0.49 35960 97 220 37287 0.59 37507 98 193 35648 0.54 35841 99 202 34672 0.58 34874 100 199 36180 0.55 36379 101 207 34973 0.59 35180 102 192 35389 0.54 35581 103 184 36268 0.50 36452 104 211 34411 0.61 34622 105 195 34195 0.57 34390 106 199 35051 0.56 35250 107 202 34255 0.59 34457 108 177 33998 0.52 34175 109 175 35486 0.49 35661 110 178 32136 0.55 32314 111 167 31907 0.52 32074 112 198 33322 0.59 33520 113 174 30961 0.56 31135 114 134 31883 0.42 32017 115 174 30887 0.56 31061 116 136 32114 0.42 32250 117 140 29216 0.48 29356 118 175 30585 0.57 30760 119 138 29340 0.47 29478 120 202 30109 0.67 30311 121 134 28797 0.46 28931 122 157 28087 0.56 28244 123 158 28751 0.55 28909 124 150 28706 0.52 28856 125 148 28051 0.52 28199 126 153 27256 0.56 27409 127 124 28426 0.43 28550 128 163 26946 0.60 27109 129 134 26519 0.50 26653 130 149 26584 0.56 26733 131 131 25168 0.52 25299 132 141 26869 0.52 27010 133 132 25967 0.51 26099 134 131 25287 0.52 25418 135 104 24773 0.42 24877 136 123 24617 0.50 24740 137 142 24466 0.58 24608 138 109 24098 0.45 24207 139 103 24501 0.42 24604 140 132 23375 0.56 23507 141 108 23214 0.46 23322 142 125 23972 0.52 24097 143 98 22904 0.43 23002 144 107 22155 0.48 22262 145 131 22607 0.58 22738 146 123 21753 0.56 21876 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 674 26911 2.44 27585 2 3107 419255 0.74 422362 3 2709 367383 0.73 370092 4 2059 328609 0.62 330668 5 1959 317965 0.61 319924 6 1971 326407 0.60 328378 7 2354 370122 0.63 372476 8 2047 320846 0.63 322893 9 1974 323423 0.61 325397 10 2107 347580 0.60 349687 11 2283 345942 0.66 348225 12 1906 338369 0.56 340275 13 1973 347843 0.56 349816 14 1913 322945 0.59 324858 15 2010 327749 0.61 329759 16 1936 327286 0.59 329222 17 1984 327258 0.60 329242 18 1817 310491 0.58 312308 19 1690 292166 0.58 293856 20 1995 310317 0.64 312312 21 1882 321463 0.58 323345 22 1851 299552 0.61 301403 23 1852 312894 0.59 314746 24 1930 312243 0.61 314173 25 1794 306567 0.58 308361 26 1694 288715 0.58 290409 27 1673 290978 0.57 292651 28 1672 296916 0.56 298588 29 1792 294777 0.60 296569 30 1759 283558 0.62 285317 31 1675 282237 0.59 283912 32 1824 289749 0.63 291573 33 1528 276022 0.55 277550 34 1606 270218 0.59 271824 35 1492 271805 0.55 273297 36 1650 274335 0.60 275985 37 1484 264047 0.56 265531 38 1558 271121 0.57 272679 39 1500 251478 0.59 252978 40 1554 262475 0.59 264029 41 1459 261082 0.56 262541 42 1392 241283 0.57 242675 43 1456 260277 0.56 261733 44 1465 261014 0.56 262479 45 1320 237456 0.55 238776 46 1290 234951 0.55 236241 47 1266 228242 0.55 229508 48 1424 253375 0.56 254799 49 1455 261536 0.55 262991 50 1517 254716 0.59 256233 51 1531 243131 0.63 244662 52 1430 249274 0.57 250704 53 1250 228432 0.54 229682 54 1326 221866 0.59 223192 55 1359 238816 0.57 240175 56 1326 245661 0.54 246987 57 1336 233140 0.57 234476 58 1197 212220 0.56 213417 59 1130 204818 0.55 205948 60 1243 226021 0.55 227264 61 1283 226786 0.56 228069 62 1138 212165 0.53 213303 63 1157 212807 0.54 213964 64 1191 215239 0.55 216430 65 1145 214517 0.53 215662 66 1110 205175 0.54 206285 67 1083 210648 0.51 211731 68 1175 215614 0.54 216789 69 1165 206210 0.56 207375 70 1128 202941 0.55 204069 71 1081 209160 0.51 210241 72 1197 211510 0.56 212707 73 1109 188520 0.58 189629 74 950 186098 0.51 187048 75 1007 183909 0.54 184916 76 1110 201249 0.55 202359 77 1067 189698 0.56 190765 78 988 181354 0.54 182342 79 936 169553 0.55 170489 80 971 180864 0.53 181835 81 1090 185514 0.58 186604 82 972 181332 0.53 182304 83 993 178829 0.55 179822 84 842 164761 0.51 165603 85 979 172932 0.56 173911 86 914 161039 0.56 161953 87 908 165970 0.54 166878 88 849 156666 0.54 157515 89 823 156512 0.52 157335 90 844 154021 0.54 154865 91 919 162347 0.56 163266 92 843 156375 0.54 157218 93 949 158629 0.59 159578 94 873 159409 0.54 160282 95 802 147959 0.54 148761 96 737 148960 0.49 149697 97 736 145523 0.50 146259 98 700 135910 0.51 136610 99 775 137639 0.56 138414 100 827 143710 0.57 144537 101 745 140846 0.53 141591 102 708 137843 0.51 138551 103 659 135663 0.48 136322 104 681 135649 0.50 136330 105 654 134388 0.48 135042 106 714 133806 0.53 134520 107 737 125551 0.58 126288 108 684 126913 0.54 127597 109 671 124084 0.54 124755 110 637 125256 0.51 125893 111 645 124460 0.52 125105 112 685 122637 0.56 123322 113 635 122393 0.52 123028 114 663 121271 0.54 121934 115 612 119190 0.51 119802 116 643 118032 0.54 118675 117 592 117734 0.50 118326 118 574 113025 0.51 113599 119 571 113852 0.50 114423 120 560 111601 0.50 112161 121 530 107546 0.49 108076 122 566 111086 0.51 111652 123 534 108577 0.49 109111 124 583 107926 0.54 108509 125 527 106738 0.49 107265 126 546 105609 0.51 106155 127 593 104355 0.57 104948 128 566 101738 0.55 102304 129 502 100679 0.50 101181 130 572 101317 0.56 101889 131 527 98703 0.53 99230 132 458 95933 0.48 96391 133 517 98511 0.52 99028 134 535 95136 0.56 95671 135 487 93926 0.52 94413 136 467 95335 0.49 95802 137 504 92177 0.54 92681 138 553 94391 0.58 94944 139 492 93269 0.52 93761 140 460 90206 0.51 90666 141 430 87626 0.49 88056 142 468 89231 0.52 89699 143 498 88983 0.56 89481 144 499 86859 0.57 87358 145 444 87386 0.51 87830 146 481 84804 0.56 85285