CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 185707 2671414 6.50 2857121 2 2272965 48067 97.93 2321032 3 160 8475 1.85 8635 4 2445 104550 2.29 106995 5 3811 167796 2.22 171607 6 5962 172329 3.34 178291 7 7817 197768 3.80 205585 8 7973 209965 3.66 217938 9 9191 222595 3.97 231786 10 9466 232940 3.91 242406 11 8956 222695 3.87 231651 12 7383 199902 3.56 207285 13 6802 191442 3.43 198244 14 8125 230236 3.41 238361 15 8383 245562 3.30 253945 16 11916 254606 4.47 266522 17 8286 230959 3.46 239245 18 7661 217259 3.41 224920 19 7328 204887 3.45 212215 20 8215 220865 3.59 229080 21 8854 210376 4.04 219230 22 9051 195103 4.43 204154 23 10656 216134 4.70 226790 24 10538 213617 4.70 224155 25 10743 215103 4.76 225846 26 12571 220355 5.40 232926 27 12479 209140 5.63 221619 28 11796 199465 5.58 211261 29 12321 194884 5.95 207205 30 13936 206292 6.33 220228 31 14515 207610 6.53 222125 32 17149 204299 7.74 221448 33 16251 211959 7.12 228210 34 17856 218725 7.55 236581 35 17645 205043 7.92 222688 36 17693 197451 8.22 215144 37 17903 201896 8.15 219799 38 16910 187753 8.26 204663 39 17235 198606 7.99 215841 40 20084 203670 8.98 223754 41 19556 191671 9.26 211227 42 19577 186305 9.51 205882 43 21701 184285 10.54 205986 44 18989 188325 9.16 207314 45 18559 193187 8.76 211746 46 18950 206605 8.40 225555 47 18260 220412 7.65 238672 48 17566 200593 8.05 218159 49 20507 193683 9.57 214190 50 21600 192196 10.10 213796 51 20501 182363 10.11 202864 52 21616 194714 9.99 216330 53 19831 189028 9.49 208859 54 20587 181849 10.17 202436 55 21597 176388 10.91 197985 56 22205 178110 11.09 200315 57 19411 177872 9.84 197283 58 22992 183756 11.12 206748 59 21845 190197 10.30 212042 60 23356 186111 11.15 209467 61 21192 179633 10.55 200825 62 21685 189189 10.28 210874 63 21811 186798 10.46 208609 64 22511 183281 10.94 205792 65 20855 178383 10.47 199238 66 21684 174863 11.03 196547 67 20984 181980 10.34 202964 68 21253 174291 10.87 195544 69 22878 165504 12.14 188382 70 21245 169842 11.12 191087 71 21772 170857 11.30 192629 72 27113 175365 13.39 202478 73 23417 179257 11.55 202674 74 21594 169837 11.28 191431 75 25589 165031 13.42 190620 76 29173 178651 14.04 207824 77 24748 175847 12.34 200595 78 27704 162613 14.56 190317 79 29028 166426 14.85 195454 80 23146 165832 12.25 188978 81 24508 150357 14.02 174865 82 21382 150004 12.48 171386 83 19889 147546 11.88 167435 84 20340 146342 12.20 166682 85 20905 154266 11.93 175171 86 20552 158613 11.47 179165 87 21545 152029 12.41 173574 88 23388 147246 13.71 170634 89 25422 142325 15.15 167747 90 20468 143747 12.46 164215 91 26899 150558 15.16 177457 92 22661 148791 13.22 171452 93 21335 139271 13.28 160606 94 22532 145438 13.41 167970 95 30460 142648 17.60 173108 96 24176 140172 14.71 164348 97 21439 134832 13.72 156271 98 22330 135299 14.17 157629 99 21767 136258 13.77 158025 100 27338 132444 17.11 159782 101 19130 138066 12.17 157196 102 17341 132773 11.55 150114 103 19613 128394 13.25 148007 104 19283 126724 13.21 146007 105 17707 123618 12.53 141325 106 19083 120891 13.63 139974 107 17887 120615 12.91 138502 108 22149 116379 15.99 138528 109 24716 121572 16.90 146288 110 18005 120439 13.01 138444 111 17542 111199 13.63 128741 112 19704 120058 14.10 139762 113 17173 119714 12.55 136887 114 16283 110681 12.82 126964 115 15892 116408 12.01 132300 116 15600 113728 12.06 129328 117 17177 115718 12.93 132895 118 16542 114358 12.64 130900 119 16159 108268 12.99 124427 120 16391 105892 13.40 122283 121 23328 108274 17.73 131602 122 16708 123320 11.93 140028 123 14094 117823 10.68 131917 124 15869 109776 12.63 125645 125 16539 106467 13.45 123006 126 14938 110220 11.94 125158 127 15585 125034 11.08 140619 128 15927 119665 11.75 135592 129 15210 106717 12.47 121927 130 15996 106389 13.07 122385 131 15708 99766 13.60 115474 132 14836 98724 13.06 113560 133 13786 99903 12.13 113689 134 14169 106184 11.77 120353 135 15440 110074 12.30 125514 136 14959 102897 12.69 117856 137 15694 96600 13.98 112294 138 23372 96651 19.47 120023 139 15974 104368 13.27 120342 140 14645 95080 13.35 109725 141 14391 99212 12.67 113603 142 15414 100829 13.26 116243 143 13586 96048 12.39 109634 144 13625 89876 13.16 103501 145 14499 90651 13.79 105150 146 24544 89858 21.45 114402 147 15151 96516 13.57 111667 148 14308 86155 14.24 100463 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3627 34996 9.39 38623 2 29380 930 96.93 30310 3 20501 2316072 0.88 2336573 4 344 86538 0.40 86882 5 491 90935 0.54 91426 6 746 146589 0.51 147335 7 983 185063 0.53 186046 8 1001 160102 0.62 161103 9 1007 196982 0.51 197989 10 1008 182831 0.55 183839 11 928 190630 0.48 191558 12 998 193116 0.51 194114 13 942 203672 0.46 204614 14 945 187333 0.50 188278 15 1060 208537 0.51 209597 16 1000 197098 0.50 198098 17 1081 209616 0.51 210697 18 1043 210851 0.49 211894 19 1007 204308 0.49 205315 20 1018 192097 0.53 193115 21 1085 204867 0.53 205952 22 1048 188695 0.55 189743 23 1105 211728 0.52 212833 24 956 182500 0.52 183456 25 1046 184176 0.56 185222 26 941 178393 0.52 179334 27 1115 196285 0.56 197400 28 996 191379 0.52 192375 29 1077 198571 0.54 199648 30 1163 212414 0.54 213577 31 1380 201432 0.68 202812 32 1136 199639 0.57 200775 33 1089 190758 0.57 191847 34 1186 199554 0.59 200740 35 1122 194936 0.57 196058 36 1104 196317 0.56 197421 37 1120 195007 0.57 196127 38 974 178774 0.54 179748 39 1059 193520 0.54 194579 40 1076 179049 0.60 180125 41 1219 192756 0.63 193975 42 1133 191827 0.59 192960 43 1178 190854 0.61 192032 44 1139 177508 0.64 178647 45 1099 198293 0.55 199392 46 1045 179705 0.58 180750 47 1166 194890 0.59 196056 48 963 181424 0.53 182387 49 1249 203908 0.61 205157 50 1139 187530 0.60 188669 51 1163 181484 0.64 182647 52 1144 175070 0.65 176214 53 1094 176334 0.62 177428 54 1138 173947 0.65 175085 55 1166 186604 0.62 187770 56 1119 175296 0.63 176415 57 1255 190818 0.65 192073 58 1300 199227 0.65 200527 59 1424 188702 0.75 190126 60 1315 178901 0.73 180216 61 1295 179118 0.72 180413 62 1126 166864 0.67 167990 63 1274 177559 0.71 178833 64 1194 166765 0.71 167959 65 1165 171382 0.68 172547 66 1119 169138 0.66 170257 67 1174 166475 0.70 167649 68 1091 169358 0.64 170449 69 1094 157010 0.69 158104 70 1019 164227 0.62 165246 71 1173 154952 0.75 156125 72 1240 157260 0.78 158500 73 1010 148771 0.67 149781 74 1118 152687 0.73 153805 75 1243 155957 0.79 157200 76 1397 167140 0.83 168537 77 1281 156799 0.81 158080 78 1406 166865 0.84 168271 79 1383 159948 0.86 161331 80 1126 156977 0.71 158103 81 1252 154734 0.80 155986 82 1072 152485 0.70 153557 83 1112 144022 0.77 145134 84 1112 141246 0.78 142358 85 1057 140780 0.75 141837 86 957 133707 0.71 134664 87 1127 146061 0.77 147188 88 1201 149747 0.80 150948 89 1261 142840 0.88 144101 90 1184 150497 0.78 151681 91 1143 134130 0.84 135273 92 1107 137811 0.80 138918 93 1146 144595 0.79 145741 94 1145 138659 0.82 139804 95 1172 138966 0.84 140138 96 1097 137846 0.79 138943 97 1183 145113 0.81 146296 98 1041 129469 0.80 130510 99 1232 144693 0.84 145925 100 1033 122247 0.84 123280 101 910 119256 0.76 120166 102 921 120696 0.76 121617 103 1116 129063 0.86 130179 104 1021 115372 0.88 116393 105 932 127566 0.73 128498 106 893 115319 0.77 116212 107 963 120781 0.79 121744 108 1069 122611 0.86 123680 109 1017 114195 0.88 115212 110 885 119290 0.74 120175 111 995 120036 0.82 121031 112 1007 116794 0.85 117801 113 846 108874 0.77 109720 114 876 115651 0.75 116527 115 830 107147 0.77 107977 116 917 114245 0.80 115162 117 948 112674 0.83 113622 118 873 114215 0.76 115088 119 1031 104587 0.98 105618 120 968 109249 0.88 110217 121 890 104762 0.84 105652 122 834 96581 0.86 97415 123 749 103306 0.72 104055 124 738 101705 0.72 102443 125 948 105299 0.89 106247 126 856 115185 0.74 116041 127 866 104709 0.82 105575 128 791 101820 0.77 102611 129 833 102821 0.80 103654 130 807 97629 0.82 98436 131 810 91976 0.87 92786 132 836 91887 0.90 92723 133 772 93259 0.82 94031 134 769 94428 0.81 95197 135 670 91759 0.72 92429 136 753 91106 0.82 91859 137 829 97167 0.85 97996 138 952 89049 1.06 90001 139 734 86182 0.84 86916 140 706 90764 0.77 91470 141 785 87418 0.89 88203 142 780 85830 0.90 86610 143 657 84553 0.77 85210 144 745 87944 0.84 88689 145 925 91584 1.00 92509 146 838 82851 1.00 83689 147 727 84313 0.85 85040 148 695 83816 0.82 84511 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1113 8443 11.65 9556 2 10626 913 92.09 11539 3 3705 36501 9.22 40206 4 5896 832178 0.70 838074 5 5822 726628 0.79 732450 6 5105 672602 0.75 677707 7 5145 667063 0.77 672208 8 5206 661457 0.78 666663 9 5234 673612 0.77 678846 10 5158 684721 0.75 689879 11 5534 667932 0.82 673466 12 5343 753551 0.70 758894 13 5765 723946 0.79 729711 14 4873 697697 0.69 702570 15 5221 697304 0.74 702525 16 5215 718238 0.72 723453 17 5091 698806 0.72 703897 18 5258 711621 0.73 716879 19 5213 714206 0.72 719419 20 5168 695716 0.74 700884 21 4947 699646 0.70 704593 22 5278 700627 0.75 705905 23 4641 679593 0.68 684234 24 4423 659883 0.67 664306 25 4773 717595 0.66 722368 26 4728 727551 0.65 732279 27 4444 691560 0.64 696004 28 4129 662122 0.62 666251 29 4067 684900 0.59 688967 30 4124 696539 0.59 700663 31 3766 662326 0.57 666092 32 3732 679109 0.55 682841 33 3675 680533 0.54 684208 34 3919 708058 0.55 711977 35 3539 678634 0.52 682173 36 3228 647016 0.50 650244 37 3296 661556 0.50 664852 38 3259 646179 0.50 649438 39 3364 661183 0.51 664547 40 3425 688606 0.49 692031 41 3172 649403 0.49 652575 42 3440 671891 0.51 675331 43 3220 675353 0.47 678573 44 3134 636083 0.49 639217 45 3215 644529 0.50 647744 46 3231 639556 0.50 642787 47 3051 619038 0.49 622089 48 3116 614693 0.50 617809 49 2955 603035 0.49 605990 50 3228 626383 0.51 629611 51 3347 665241 0.50 668588 52 3286 652511 0.50 655797 53 3528 659886 0.53 663414 54 3177 627657 0.50 630834 55 3372 624493 0.54 627865 56 3198 611407 0.52 614605 57 3042 612971 0.49 616013 58 3221 613693 0.52 616914 59 3010 587770 0.51 590780 60 3030 581402 0.52 584432 61 3007 563120 0.53 566127 62 3139 600562 0.52 603701 63 3115 604791 0.51 607906 64 2977 580560 0.51 583537 65 2902 556858 0.52 559760 66 2963 545549 0.54 548512 67 2833 567492 0.50 570325 68 2876 556952 0.51 559828 69 2897 569361 0.51 572258 70 2927 559448 0.52 562375 71 2951 548593 0.54 551544 72 3079 544125 0.56 547204 73 2826 541620 0.52 544446 74 3077 546891 0.56 549968 75 2761 522577 0.53 525338 76 2749 533910 0.51 536659 77 2951 539705 0.54 542656 78 3049 536996 0.56 540045 79 2657 515890 0.51 518547 80 2722 500978 0.54 503700 81 2673 482237 0.55 484910 82 2738 489261 0.56 491999 83 2820 493821 0.57 496641 84 2868 504926 0.56 507794 85 2631 495849 0.53 498480 86 2708 485987 0.55 488695 87 2740 497949 0.55 500689 88 2659 477022 0.55 479681 89 2642 469416 0.56 472058 90 2495 444553 0.56 447048 91 2531 451652 0.56 454183 92 2468 445844 0.55 448312 93 2521 452070 0.55 454591 94 2477 442026 0.56 444503 95 2512 452869 0.55 455381 96 2553 446671 0.57 449224 97 2572 446344 0.57 448916 98 2276 424453 0.53 426729 99 2460 434503 0.56 436963 100 2263 409978 0.55 412241 101 2376 414744 0.57 417120 102 2388 415964 0.57 418352 103 2401 410137 0.58 412538 104 2361 417320 0.56 419681 105 2494 418495 0.59 420989 106 2315 402324 0.57 404639 107 2262 401143 0.56 403405 108 2309 399103 0.58 401412 109 2150 382006 0.56 384156 110 2159 376554 0.57 378713 111 2184 375782 0.58 377966 112 2214 377312 0.58 379526 113 2065 376741 0.55 378806 114 2137 378157 0.56 380294 115 2131 383545 0.55 385676 116 2115 366583 0.57 368698 117 2193 357573 0.61 359766 118 2177 386298 0.56 388475 119 2088 365598 0.57 367686 120 2158 350557 0.61 352715 121 1943 339903 0.57 341846 122 1916 339390 0.56 341306 123 1927 340054 0.56 341981 124 1931 338942 0.57 340873 125 1961 323759 0.60 325720 126 2021 325286 0.62 327307 127 1936 320849 0.60 322785 128 1979 341442 0.58 343421 129 2013 330579 0.61 332592 130 1875 317244 0.59 319119 131 1862 316147 0.59 318009 132 1915 325779 0.58 327694 133 1877 319483 0.58 321360 134 1963 318814 0.61 320777 135 1841 310334 0.59 312175 136 1808 308060 0.58 309868 137 1703 292810 0.58 294513 138 1762 297409 0.59 299171 139 1707 296975 0.57 298682 140 1729 289174 0.59 290903 141 1708 293077 0.58 294785 142 1709 281950 0.60 283659 143 1719 281245 0.61 282964 144 1750 284589 0.61 286339 145 1737 279147 0.62 280884 146 1637 271903 0.60 273540 147 1698 279788 0.60 281486 148 1735 267988 0.64 269723 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1455 66787 2.13 68242 2 2206 66788 3.20 68994 3 2786 70225 3.82 73011 4 3102 75920 3.93 79022 5 3793 84741 4.28 88534 6 4213 82924 4.83 87137 7 3023 75858 3.83 78881 8 2662 68202 3.76 70864 9 2389 64529 3.57 66918 10 2860 79980 3.45 82840 11 2940 85497 3.32 88437 12 4328 92567 4.47 96895 13 3928 85451 4.39 89379 14 2969 71447 3.99 74416 15 2421 65319 3.57 67740 16 2377 64202 3.57 66579 17 2631 63470 3.98 66101 18 2501 60941 3.94 63442 19 2550 67239 3.65 69789 20 2929 71505 3.94 74434 21 2255 65168 3.34 67423 22 2421 64652 3.61 67073 23 2357 61225 3.71 63582 24 1918 57836 3.21 59754 25 1910 58419 3.17 60329 26 2272 57449 3.80 59721 27 2371 57878 3.94 60249 28 2137 56050 3.67 58187 29 2031 56061 3.50 58092 30 2213 56372 3.78 58585 31 2232 52525 4.08 54757 32 2169 53507 3.90 55676 33 2112 54346 3.74 56458 34 1983 50989 3.74 52972 35 2307 54819 4.04 57126 36 2465 54411 4.33 56876 37 2060 53173 3.73 55233 38 1872 50422 3.58 52294 39 1559 46888 3.22 48447 40 1638 45585 3.47 47223 41 1713 43660 3.78 45373 42 1496 46899 3.09 48395 43 1688 47048 3.46 48736 44 1670 44604 3.61 46274 45 1787 46846 3.67 48633 46 1917 47429 3.88 49346 47 1703 44191 3.71 45894 48 1676 49369 3.28 51045 49 1733 45494 3.67 47227 50 1634 40265 3.90 41899 51 1562 38839 3.87 40401 52 1480 37882 3.76 39362 53 1393 38213 3.52 39606 54 1450 39470 3.54 40920 55 1550 43767 3.42 45317 56 1502 40067 3.61 41569 57 1493 40962 3.52 42455 58 1807 41972 4.13 43779 59 1794 41810 4.11 43604 60 1329 40226 3.20 41555 61 1415 40282 3.39 41697 62 1394 37199 3.61 38593 63 1274 39646 3.11 40920 64 1258 39227 3.11 40485 65 1393 35307 3.80 36700 66 1262 34173 3.56 35435 67 1196 34521 3.35 35717 68 1096 34369 3.09 35465 69 1122 34590 3.14 35712 70 1114 32620 3.30 33734 71 1125 32294 3.37 33419 72 1862 42672 4.18 44534 73 1942 41665 4.45 43607 74 1231 32554 3.64 33785 75 1231 32988 3.60 34219 76 1295 33462 3.73 34757 77 1053 28599 3.55 29652 78 898 28544 3.05 29442 79 1006 27763 3.50 28769 80 942 26946 3.38 27888 81 917 27603 3.22 28520 82 1085 27795 3.76 28880 83 1088 25724 4.06 26812 84 1039 25823 3.87 26862 85 897 25939 3.34 26836 86 929 25636 3.50 26565 87 903 27641 3.16 28544 88 1208 26388 4.38 27596 89 822 23075 3.44 23897 90 917 24902 3.55 25819 91 834 24691 3.27 25525 92 863 22614 3.68 23477 93 764 21919 3.37 22683 94 760 21788 3.37 22548 95 732 21743 3.26 22475 96 681 20658 3.19 21339 97 729 20408 3.45 21137 98 687 20488 3.24 21175 99 725 20498 3.42 21223 100 710 20199 3.40 20909 101 716 19337 3.57 20053 102 673 19434 3.35 20107 103 692 19313 3.46 20005 104 630 19117 3.19 19747 105 656 18770 3.38 19426 106 735 18610 3.80 19345 107 566 17608 3.11 18174 108 684 17776 3.71 18460 109 689 17455 3.80 18144 110 699 17123 3.92 17822 111 626 17603 3.43 18229 112 582 17411 3.23 17993 113 570 16875 3.27 17445 114 573 16438 3.37 17011 115 609 15633 3.75 16242 116 622 16134 3.71 16756 117 651 16630 3.77 17281 118 541 15392 3.40 15933 119 601 16029 3.61 16630 120 622 15840 3.78 16462 121 650 14971 4.16 15621 122 554 14887 3.59 15441 123 557 14527 3.69 15084 124 529 14229 3.58 14758 125 544 13931 3.76 14475 126 555 14011 3.81 14566 127 573 13909 3.96 14482 128 562 13776 3.92 14338 129 541 13517 3.85 14058 130 467 13680 3.30 14147 131 466 13586 3.32 14052 132 515 12640 3.91 13155 133 444 12680 3.38 13124 134 426 12211 3.37 12637 135 402 11851 3.28 12253 136 482 11722 3.95 12204 137 502 12084 3.99 12586 138 421 11963 3.40 12384 139 425 11638 3.52 12063 140 365 11494 3.08 11859 141 373 11353 3.18 11726 142 375 10980 3.30 11355 143 407 10743 3.65 11150 144 393 10656 3.56 11049 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 141 31176 0.45 31317 2 383 60097 0.63 60480 3 456 65944 0.69 66400 4 457 60208 0.75 60665 5 453 67953 0.66 68406 6 410 65241 0.62 65651 7 408 63503 0.64 63911 8 464 67652 0.68 68116 9 364 65280 0.55 65644 10 343 60228 0.57 60571 11 486 78318 0.62 78804 12 441 73857 0.59 74298 13 446 67065 0.66 67511 14 500 75905 0.65 76405 15 412 68106 0.60 68518 16 352 57836 0.60 58188 17 351 61786 0.56 62137 18 318 53651 0.59 53969 19 359 57342 0.62 57701 20 311 56247 0.55 56558 21 322 53500 0.60 53822 22 331 53463 0.62 53794 23 329 53154 0.62 53483 24 322 52598 0.61 52920 25 241 53883 0.45 54124 26 419 62568 0.67 62987 27 331 56240 0.59 56571 28 363 60089 0.60 60452 29 282 54309 0.52 54591 30 333 57937 0.57 58270 31 299 48484 0.61 48783 32 302 49716 0.60 50018 33 326 50937 0.64 51263 34 313 48390 0.64 48703 35 325 48824 0.66 49149 36 333 49017 0.67 49350 37 269 43924 0.61 44193 38 316 50375 0.62 50691 39 265 44396 0.59 44661 40 252 43167 0.58 43419 41 267 45144 0.59 45411 42 263 42536 0.61 42799 43 235 43550 0.54 43785 44 245 43093 0.57 43338 45 266 45441 0.58 45707 46 282 44325 0.63 44607 47 252 42500 0.59 42752 48 278 43532 0.63 43810 49 240 40068 0.60 40308 50 217 39578 0.55 39795 51 252 38981 0.64 39233 52 221 38311 0.57 38532 53 232 37904 0.61 38136 54 239 43289 0.55 43528 55 224 37082 0.60 37306 56 184 37444 0.49 37628 57 186 36274 0.51 36460 58 210 34547 0.60 34757 59 200 36973 0.54 37173 60 187 34079 0.55 34266 61 201 34754 0.58 34955 62 210 34301 0.61 34511 63 192 32627 0.59 32819 64 168 30703 0.54 30871 65 188 32375 0.58 32563 66 204 32709 0.62 32913 67 187 31498 0.59 31685 68 196 33087 0.59 33283 69 169 30435 0.55 30604 70 162 29843 0.54 30005 71 164 29001 0.56 29165 72 210 32305 0.65 32515 73 171 31366 0.54 31537 74 150 30144 0.50 30294 75 204 32484 0.62 32688 76 154 28118 0.54 28272 77 177 28749 0.61 28926 78 157 26263 0.59 26420 79 161 26924 0.59 27085 80 153 25510 0.60 25663 81 154 25196 0.61 25350 82 159 23484 0.67 23643 83 124 26006 0.47 26130 84 123 25682 0.48 25805 85 162 24340 0.66 24502 86 185 26987 0.68 27172 87 139 23387 0.59 23526 88 116 23131 0.50 23247 89 136 22755 0.59 22891 90 129 21471 0.60 21600 91 124 21272 0.58 21396 92 98 21568 0.45 21666 93 112 20830 0.53 20942 94 117 19612 0.59 19729 95 92 20451 0.45 20543 96 107 19881 0.54 19988 97 111 19138 0.58 19249 98 103 19700 0.52 19803 99 102 19387 0.52 19489 100 116 19086 0.60 19202 101 107 20041 0.53 20148 102 88 18146 0.48 18234 103 102 18707 0.54 18809 104 90 18371 0.49 18461 105 130 18331 0.70 18461 106 100 18527 0.54 18627 107 139 18097 0.76 18236 108 87 16780 0.52 16867 109 83 16815 0.49 16898 110 98 16956 0.57 17054 111 71 15768 0.45 15839 112 105 15979 0.65 16084 113 110 15975 0.68 16085 114 87 16017 0.54 16104 115 87 14495 0.60 14582 116 124 14921 0.82 15045 117 108 14765 0.73 14873 118 69 14305 0.48 14374 119 66 14478 0.45 14544 120 71 13835 0.51 13906 121 90 13824 0.65 13914 122 70 14148 0.49 14218 123 68 13971 0.48 14039 124 83 13288 0.62 13371 125 77 13709 0.56 13786 126 85 12748 0.66 12833 127 61 12652 0.48 12713 128 81 12522 0.64 12603 129 57 12260 0.46 12317 130 51 12640 0.40 12691 131 44 11637 0.38 11681 132 63 11842 0.53 11905 133 53 11517 0.46 11570 134 41 11368 0.36 11409 135 43 11731 0.37 11774 136 50 10783 0.46 10833 137 72 10849 0.66 10921 138 67 10461 0.64 10528 139 35 10442 0.33 10477 140 69 10417 0.66 10486 141 51 10178 0.50 10229 142 59 9991 0.59 10050 143 64 10348 0.61 10412 144 54 9421 0.57 9475 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2081 279952 0.74 282033 2 1564 252408 0.62 253972 3 1517 240461 0.63 241978 4 1524 250506 0.60 252030 5 1887 288648 0.65 290535 6 1531 241043 0.63 242574 7 1455 236849 0.61 238304 8 1628 260754 0.62 262382 9 1660 253818 0.65 255478 10 1497 256613 0.58 258110 11 1426 253981 0.56 255407 12 1485 233565 0.63 235050 13 1563 248087 0.63 249650 14 1545 243768 0.63 245313 15 1522 241201 0.63 242723 16 1427 227145 0.62 228572 17 1218 209246 0.58 210464 18 1287 222041 0.58 223328 19 1444 233824 0.61 235268 20 1390 214152 0.64 215542 21 1443 221971 0.65 223414 22 1377 224978 0.61 226355 23 1264 213513 0.59 214777 24 1183 200662 0.59 201845 25 1126 205767 0.54 206893 26 1155 207257 0.55 208412 27 1303 204986 0.63 206289 28 1267 197680 0.64 198947 29 1184 193442 0.61 194626 30 1166 197754 0.59 198920 31 1084 187573 0.57 188657 32 1121 183061 0.61 184182 33 1108 185566 0.59 186674 34 1210 187309 0.64 188519 35 1070 176266 0.60 177336 36 1107 182803 0.60 183910 37 965 166639 0.58 167604 38 1106 172758 0.64 173864 39 1095 175005 0.62 176100 40 964 158359 0.61 159323 41 950 170328 0.55 171278 42 974 173304 0.56 174278 43 951 153948 0.61 154899 44 935 151039 0.62 151974 45 880 147309 0.59 148189 46 984 164716 0.59 165700 47 997 176995 0.56 177992 48 1042 169822 0.61 170864 49 944 158930 0.59 159874 50 1001 164751 0.60 165752 51 850 144468 0.58 145318 52 854 139954 0.61 140808 53 911 150851 0.60 151762 54 865 155578 0.55 156443 55 803 146052 0.55 146855 56 775 131600 0.59 132375 57 785 126684 0.62 127469 58 903 145998 0.61 146901 59 859 141097 0.61 141956 60 735 128784 0.57 129519 61 762 133413 0.57 134175 62 715 129839 0.55 130554 63 742 132841 0.56 133583 64 706 126261 0.56 126967 65 786 130844 0.60 131630 66 719 132112 0.54 132831 67 738 123129 0.60 123867 68 721 123235 0.58 123956 69 683 126303 0.54 126986 70 736 132658 0.55 133394 71 677 110226 0.61 110903 72 692 109997 0.63 110689 73 666 108088 0.61 108754 74 725 120306 0.60 121031 75 582 107367 0.54 107949 76 558 102365 0.54 102923 77 523 95566 0.54 96089 78 632 102894 0.61 103526 79 612 107626 0.57 108238 80 546 102583 0.53 103129 81 584 101650 0.57 102234 82 528 92348 0.57 92876 83 596 97298 0.61 97894 84 491 89961 0.54 90452 85 572 94503 0.60 95075 86 503 85572 0.58 86075 87 470 85653 0.55 86123 88 442 82786 0.53 83228 89 551 90823 0.60 91374 90 514 84299 0.61 84813 91 500 89305 0.56 89805 92 517 87566 0.59 88083 93 498 78910 0.63 79408 94 396 77790 0.51 78186 95 368 75327 0.49 75695 96 418 70031 0.59 70449 97 379 71645 0.53 72024 98 398 74790 0.53 75188 99 407 72061 0.56 72468 100 420 69728 0.60 70148 101 404 68473 0.59 68877 102 410 69270 0.59 69680 103 394 67989 0.58 68383 104 420 66063 0.63 66483 105 316 62411 0.50 62727 106 305 62541 0.49 62846 107 342 61590 0.55 61932 108 355 61548 0.57 61903 109 320 60241 0.53 60561 110 315 59747 0.52 60062 111 329 59851 0.55 60180 112 316 57477 0.55 57793 113 301 57022 0.53 57323 114 278 56301 0.49 56579 115 312 56570 0.55 56882 116 297 54538 0.54 54835 117 275 53309 0.51 53584 118 300 51564 0.58 51864 119 289 49693 0.58 49982 120 273 51742 0.52 52015 121 275 49962 0.55 50237 122 257 49999 0.51 50256 123 295 48639 0.60 48934 124 236 47835 0.49 48071 125 266 47561 0.56 47827 126 261 46209 0.56 46470 127 267 45720 0.58 45987 128 280 45776 0.61 46056 129 263 44544 0.59 44807 130 262 41696 0.62 41958 131 220 43212 0.51 43432 132 254 41447 0.61 41701 133 243 41007 0.59 41250 134 239 41159 0.58 41398 135 275 39728 0.69 40003 136 225 40466 0.55 40691 137 250 40341 0.62 40591 138 218 38466 0.56 38684 139 239 36889 0.64 37128 140 200 37828 0.53 38028 141 180 37373 0.48 37553 142 180 36322 0.49 36502 143 213 35644 0.59 35857 144 178 35877 0.49 36055