CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 179623 2456270 6.81 2635893 2 2662985 59277 97.82 2722262 3 250 9891 2.47 10141 4 2309 95823 2.35 98132 5 4373 174168 2.45 178541 6 6081 173259 3.39 179340 7 8178 198251 3.96 206429 8 8669 211706 3.93 220375 9 9821 226150 4.16 235971 10 10251 234155 4.19 244406 11 9395 222512 4.05 231907 12 8291 200739 3.97 209030 13 7440 192586 3.72 200026 14 8719 224258 3.74 232977 15 9438 247638 3.67 257076 16 13030 256494 4.83 269524 17 9523 241811 3.79 251334 18 8508 217196 3.77 225704 19 7959 205982 3.72 213941 20 8668 214446 3.89 223114 21 9392 212659 4.23 222051 22 9445 196469 4.59 205914 23 10361 217214 4.55 227575 24 10513 221893 4.52 232406 25 10402 220087 4.51 230489 26 11582 222303 4.95 233885 27 11916 208874 5.40 220790 28 10758 199503 5.12 210261 29 11111 197639 5.32 208750 30 12314 208500 5.58 220814 31 13040 208753 5.88 221793 32 14795 207420 6.66 222215 33 14195 213875 6.22 228070 34 14991 219643 6.39 234634 35 15408 208614 6.88 224022 36 15018 200500 6.97 215518 37 15447 203511 7.05 218958 38 14630 192473 7.06 207103 39 15512 204676 7.04 220188 40 17119 209502 7.55 226621 41 16835 196927 7.88 213762 42 16906 195107 7.97 212013 43 17657 188555 8.56 206212 44 16140 192878 7.72 209018 45 15476 196030 7.32 211506 46 16069 210031 7.11 226100 47 15898 226473 6.56 242371 48 15602 209618 6.93 225220 49 17265 200495 7.93 217760 50 17718 203260 8.02 220978 51 17498 188195 8.51 205693 52 18342 202587 8.30 220929 53 16770 197219 7.84 213989 54 17576 186734 8.60 204310 55 18220 182105 9.10 200325 56 18006 181607 9.02 199613 57 16242 185356 8.06 201598 58 19296 186040 9.40 205336 59 17913 198630 8.27 216543 60 18979 190136 9.08 209115 61 18095 188601 8.75 206696 62 18300 194412 8.60 212712 63 18570 195257 8.68 213827 64 19167 190836 9.13 210003 65 17049 185443 8.42 202492 66 17975 178929 9.13 196904 67 17889 191190 8.56 209079 68 17354 184162 8.61 201516 69 18670 173347 9.72 192017 70 17506 177770 8.96 195276 71 18158 177485 9.28 195643 72 21802 183016 10.64 204818 73 19566 187414 9.45 206980 74 18756 179044 9.48 197800 75 21397 173800 10.96 195197 76 23858 186422 11.35 210280 77 20661 186177 9.99 206838 78 22517 172469 11.55 194986 79 23422 173692 11.88 197114 80 19142 174117 9.90 193259 81 20626 160208 11.41 180834 82 17875 159896 10.06 177771 83 16966 158594 9.66 175560 84 16836 157704 9.65 174540 85 17478 165247 9.57 182725 86 17564 168689 9.43 186253 87 17847 160125 10.03 177972 88 19623 153921 11.31 173544 89 20596 151489 11.97 172085 90 17862 155194 10.32 173056 91 22155 163019 11.96 185174 92 19621 161162 10.85 180783 93 17735 150091 10.57 167826 94 18325 154464 10.61 172789 95 24906 154926 13.85 179832 96 20506 153465 11.79 173971 97 18214 147997 10.96 166211 98 20059 151465 11.69 171524 99 18357 146150 11.16 164507 100 22426 142940 13.56 165366 101 17142 152179 10.12 169321 102 15959 148259 9.72 164218 103 16923 142329 10.63 159252 104 17933 139689 11.38 157622 105 15386 137436 10.07 152822 106 16421 134370 10.89 150791 107 16236 133966 10.81 150202 108 18787 132772 12.40 151559 109 20964 133567 13.57 154531 110 15740 132431 10.62 148171 111 16984 124646 11.99 141630 112 16996 136511 11.07 153507 113 14944 135553 9.93 150497 114 14791 125889 10.51 140680 115 14431 133539 9.75 147970 116 14476 134291 9.73 148767 117 15477 133131 10.41 148608 118 14850 127586 10.43 142436 119 14393 123915 10.41 138308 120 15036 122206 10.96 137242 121 19367 125476 13.37 144843 122 13994 140481 9.06 154475 123 13616 135628 9.12 149244 124 14164 126490 10.07 140654 125 14859 120435 10.98 135294 126 13731 126635 9.78 140366 127 14019 142483 8.96 156502 128 14574 137485 9.58 152059 129 14074 121697 10.37 135771 130 14046 123658 10.20 137704 131 14364 117800 10.87 132164 132 13349 115420 10.37 128769 133 13151 117902 10.03 131053 134 13468 127073 9.58 140541 135 14688 130686 10.10 145374 136 14044 121742 10.34 135786 137 14455 112967 11.34 127422 138 21998 113104 16.28 135102 139 14653 122425 10.69 137078 140 13908 112386 11.01 126294 141 13466 115557 10.44 129023 142 14499 117024 11.02 131523 143 13078 114557 10.25 127635 144 12708 108805 10.46 121513 145 13202 108406 10.86 121608 146 23666 109415 17.78 133081 147 14443 115371 11.13 129814 148 13631 104128 11.58 117759 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 3488 32093 9.80 35581 2 32753 1327 96.11 34080 3 28317 2708905 1.03 2737222 4 382 81145 0.47 81527 5 454 84352 0.54 84806 6 865 152002 0.57 152867 7 1078 186856 0.57 187934 8 1121 164021 0.68 165142 9 1146 196696 0.58 197842 10 1142 190340 0.60 191482 11 1028 194641 0.53 195669 12 1054 198386 0.53 199440 13 1095 204713 0.53 205808 14 1017 189884 0.53 190901 15 1106 213740 0.51 214846 16 1121 203474 0.55 204595 17 1221 214959 0.56 216180 18 1077 213847 0.50 214924 19 1204 207210 0.58 208414 20 1158 196219 0.59 197377 21 1144 206398 0.55 207542 22 1134 191950 0.59 193084 23 1247 212721 0.58 213968 24 1086 183752 0.59 184838 25 1143 189366 0.60 190509 26 1138 179938 0.63 181076 27 1221 194133 0.63 195354 28 1095 189947 0.57 191042 29 1274 201300 0.63 202574 30 1159 215526 0.53 216685 31 1319 203418 0.64 204737 32 1226 203339 0.60 204565 33 1130 193945 0.58 195075 34 1134 201226 0.56 202360 35 1113 194575 0.57 195688 36 1238 195054 0.63 196292 37 1135 194800 0.58 195935 38 1072 182353 0.58 183425 39 1233 195438 0.63 196671 40 1204 181965 0.66 183169 41 1206 189310 0.63 190516 42 1262 192171 0.65 193433 43 1163 190979 0.61 192142 44 1280 179866 0.71 181146 45 1133 198216 0.57 199349 46 1150 180204 0.63 181354 47 1209 196212 0.61 197421 48 1147 184204 0.62 185351 49 1277 206823 0.61 208100 50 1198 188186 0.63 189384 51 1193 184292 0.64 185485 52 1164 179988 0.64 181152 53 1155 178178 0.64 179333 54 1098 175159 0.62 176257 55 1251 188031 0.66 189282 56 1227 177693 0.69 178920 57 1196 192743 0.62 193939 58 1405 200039 0.70 201444 59 1333 189459 0.70 190792 60 1240 184631 0.67 185871 61 1227 180017 0.68 181244 62 1135 168000 0.67 169135 63 1181 181336 0.65 182517 64 1125 169364 0.66 170489 65 1172 175669 0.66 176841 66 1154 170823 0.67 171977 67 1196 170924 0.69 172120 68 1192 171806 0.69 172998 69 1139 162094 0.70 163233 70 1086 167536 0.64 168622 71 1136 161920 0.70 163056 72 1270 163142 0.77 164412 73 1023 156412 0.65 157435 74 1170 158235 0.73 159405 75 1127 161554 0.69 162681 76 1314 172680 0.76 173994 77 1260 163071 0.77 164331 78 1409 172943 0.81 174352 79 1352 164774 0.81 166126 80 1193 161202 0.73 162395 81 1151 162128 0.70 163279 82 1193 159017 0.74 160210 83 1192 154470 0.77 155662 84 1090 148199 0.73 149289 85 1004 147427 0.68 148431 86 1008 143051 0.70 144059 87 1150 154616 0.74 155766 88 1223 154824 0.78 156047 89 1196 152612 0.78 153808 90 1295 160666 0.80 161961 91 1100 143460 0.76 144560 92 1152 147346 0.78 148498 93 1153 149894 0.76 151047 94 1091 145967 0.74 147058 95 1317 145909 0.89 147226 96 1137 149082 0.76 150219 97 1188 156104 0.76 157292 98 1045 140819 0.74 141864 99 1182 152136 0.77 153318 100 1002 132071 0.75 133073 101 1038 130723 0.79 131761 102 991 130833 0.75 131824 103 1017 139507 0.72 140524 104 989 128257 0.77 129246 105 903 142286 0.63 143189 106 968 124927 0.77 125895 107 1005 133235 0.75 134240 108 1096 132354 0.82 133450 109 1002 127491 0.78 128493 110 1004 134341 0.74 135345 111 969 134616 0.71 135585 112 989 127455 0.77 128444 113 840 120570 0.69 121410 114 934 131440 0.71 132374 115 848 121670 0.69 122518 116 964 127603 0.75 128567 117 953 127834 0.74 128787 118 896 132125 0.67 133021 119 960 119510 0.80 120470 120 926 121593 0.76 122519 121 969 119323 0.81 120292 122 781 111330 0.70 112111 123 888 117088 0.75 117976 124 838 116350 0.72 117188 125 860 121195 0.70 122055 126 845 130532 0.64 131377 127 967 116830 0.82 117797 128 847 118659 0.71 119506 129 982 119239 0.82 120221 130 842 113242 0.74 114084 131 900 111119 0.80 112019 132 834 110443 0.75 111277 133 849 108132 0.78 108981 134 762 110794 0.68 111556 135 708 109435 0.64 110143 136 828 108142 0.76 108970 137 988 112897 0.87 113885 138 908 104080 0.86 104988 139 868 102068 0.84 102936 140 822 106110 0.77 106932 141 871 104609 0.83 105480 142 797 101893 0.78 102690 143 753 101378 0.74 102131 144 830 104767 0.79 105597 145 965 109081 0.88 110046 146 862 98861 0.86 99723 147 847 98222 0.85 99069 148 797 101108 0.78 101905 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1356 9539 12.45 10895 2 11216 1045 91.48 12261 3 3036 41376 6.84 44412 4 6678 882886 0.75 889564 5 6618 770127 0.85 776745 6 5598 704247 0.79 709845 7 5335 680391 0.78 685726 8 5425 693173 0.78 698598 9 5486 711427 0.77 716913 10 5783 712005 0.81 717788 11 5621 701012 0.80 706633 12 5852 779632 0.75 785484 13 6021 752560 0.79 758581 14 5638 724864 0.77 730502 15 5415 730615 0.74 736030 16 5723 745071 0.76 750794 17 5519 726414 0.75 731933 18 5630 742572 0.75 748202 19 5898 748448 0.78 754346 20 5618 732870 0.76 738488 21 5386 720417 0.74 725803 22 5529 730246 0.75 735775 23 5436 714283 0.76 719719 24 4999 696743 0.71 701742 25 5467 752493 0.72 757960 26 5317 762628 0.69 767945 27 5006 734068 0.68 739074 28 4649 700674 0.66 705323 29 4680 713204 0.65 717884 30 4706 731344 0.64 736050 31 4183 705037 0.59 709220 32 4130 723293 0.57 727423 33 4131 712925 0.58 717056 34 4254 747156 0.57 751410 35 3971 717982 0.55 721953 36 3768 688381 0.54 692149 37 3738 698021 0.53 701759 38 3765 683781 0.55 687546 39 3828 699056 0.54 702884 40 3978 726423 0.54 730401 41 3520 677456 0.52 680976 42 4025 710766 0.56 714791 43 3897 713663 0.54 717560 44 3618 674214 0.53 677832 45 3896 685529 0.57 689425 46 3705 680596 0.54 684301 47 3517 653032 0.54 656549 48 3647 649496 0.56 653143 49 3438 636264 0.54 639702 50 3755 670993 0.56 674748 51 3898 705009 0.55 708907 52 3784 693149 0.54 696933 53 3780 699384 0.54 703164 54 3607 668354 0.54 671961 55 3737 664179 0.56 667916 56 3763 652883 0.57 656646 57 3691 663300 0.55 666991 58 3617 657322 0.55 660939 59 3539 638257 0.55 641796 60 3358 623699 0.54 627057 61 3484 603390 0.57 606874 62 3519 649480 0.54 652999 63 3470 654450 0.53 657920 64 3489 630160 0.55 633649 65 3315 604619 0.55 607934 66 3278 600190 0.54 603468 67 3404 616574 0.55 619978 68 3260 605750 0.54 609010 69 3432 626145 0.55 629577 70 3374 616413 0.54 619787 71 3397 605211 0.56 608608 72 3380 602064 0.56 605444 73 3458 597348 0.58 600806 74 3484 606511 0.57 609995 75 3111 574770 0.54 577881 76 3404 585356 0.58 588760 77 3320 590041 0.56 593361 78 3331 594394 0.56 597725 79 3172 572831 0.55 576003 80 3142 557247 0.56 560389 81 3100 534112 0.58 537212 82 3140 550900 0.57 554040 83 3211 553857 0.58 557068 84 3066 569665 0.54 572731 85 3096 556605 0.55 559701 86 2974 547658 0.54 550632 87 3128 563953 0.55 567081 88 2988 536158 0.55 539146 89 2998 529037 0.56 532035 90 2771 504237 0.55 507008 91 2894 514488 0.56 517382 92 2850 508876 0.56 511726 93 3132 520252 0.60 523384 94 2930 515250 0.57 518180 95 2931 530666 0.55 533597 96 2904 519883 0.56 522787 97 3083 514795 0.60 517878 98 2914 496107 0.58 499021 99 2860 507071 0.56 509931 100 2647 471768 0.56 474415 101 2725 487437 0.56 490162 102 2767 486263 0.57 489030 103 2878 481646 0.59 484524 104 2704 487894 0.55 490598 105 2827 500038 0.56 502865 106 2652 477861 0.55 480513 107 2683 472376 0.56 475059 108 2671 474670 0.56 477341 109 2624 450591 0.58 453215 110 2575 450493 0.57 453068 111 2509 445250 0.56 447759 112 2685 451213 0.59 453898 113 2426 458119 0.53 460545 114 2584 454050 0.57 456634 115 2521 457788 0.55 460309 116 2503 442123 0.56 444626 117 2433 435574 0.56 438007 118 2629 464523 0.56 467152 119 2580 443837 0.58 446417 120 2324 425696 0.54 428020 121 2335 415044 0.56 417379 122 2368 417948 0.56 420316 123 2320 414236 0.56 416556 124 2366 419190 0.56 421556 125 2221 396925 0.56 399146 126 2303 403044 0.57 405347 127 2283 403592 0.56 405875 128 2408 423774 0.57 426182 129 2291 408285 0.56 410576 130 2259 393123 0.57 395382 131 2341 395633 0.59 397974 132 2383 404059 0.59 406442 133 2266 398027 0.57 400293 134 2361 397570 0.59 399931 135 2165 387095 0.56 389260 136 2225 391545 0.57 393770 137 2041 375709 0.54 377750 138 2185 378735 0.57 380920 139 2109 383044 0.55 385153 140 2218 371298 0.59 373516 141 2179 376495 0.58 378674 142 2202 366415 0.60 368617 143 2128 359206 0.59 361334 144 2138 368635 0.58 370773 145 2074 362537 0.57 364611 146 2020 353687 0.57 355707 147 2024 366620 0.55 368644 148 1995 348230 0.57 350225 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2024 85402 2.32 87426 2 3016 84167 3.46 87183 3 3924 89897 4.18 93821 4 4166 96280 4.15 100446 5 5399 108286 4.75 113685 6 5306 106259 4.76 111565 7 3996 94590 4.05 98586 8 3596 87397 3.95 90993 9 3340 81757 3.92 85097 10 3977 100559 3.80 104536 11 4166 107627 3.73 111793 12 6207 119000 4.96 125207 13 5174 111313 4.44 116487 14 3873 92270 4.03 96143 15 3230 84814 3.67 88044 16 3291 84034 3.77 87325 17 3567 83550 4.09 87117 18 3460 80823 4.11 84283 19 3814 90087 4.06 93901 20 3887 96869 3.86 100756 21 3372 91372 3.56 94744 22 3344 86979 3.70 90323 23 3257 81333 3.85 84590 24 2935 78400 3.61 81335 25 3034 78441 3.72 81475 26 3210 79881 3.86 83091 27 3457 79698 4.16 83155 28 3053 75464 3.89 78517 29 2966 75492 3.78 78458 30 3043 77242 3.79 80285 31 3256 72052 4.32 75308 32 3141 73785 4.08 76926 33 3054 74597 3.93 77651 34 2776 70423 3.79 73199 35 3464 76645 4.32 80109 36 3423 75553 4.33 78976 37 2893 74077 3.76 76970 38 2837 69682 3.91 72519 39 2465 66255 3.59 68720 40 2383 65029 3.53 67412 41 2446 63115 3.73 65561 42 2438 66287 3.55 68725 43 2422 68816 3.40 71238 44 2355 65365 3.48 67720 45 2729 67056 3.91 69785 46 2988 68760 4.16 71748 47 2355 65104 3.49 67459 48 2854 71995 3.81 74849 49 2607 67173 3.74 69780 50 2369 60624 3.76 62993 51 2377 58449 3.91 60826 52 2178 55939 3.75 58117 53 2236 57438 3.75 59674 54 2261 59733 3.65 61994 55 2626 66411 3.80 69037 56 2196 59672 3.55 61868 57 2711 63895 4.07 66606 58 2849 65809 4.15 68658 59 2346 62713 3.61 65059 60 2233 62244 3.46 64477 61 2180 59118 3.56 61298 62 1961 56023 3.38 57984 63 2113 63542 3.22 65655 64 2072 63298 3.17 65370 65 2063 54256 3.66 56319 66 2076 53168 3.76 55244 67 2061 54156 3.67 56217 68 1956 55004 3.43 56960 69 2054 55166 3.59 57220 70 1933 51691 3.60 53624 71 1823 51601 3.41 53424 72 3057 63518 4.59 66575 73 3074 62066 4.72 65140 74 2192 53223 3.96 55415 75 1948 53003 3.54 54951 76 1995 52106 3.69 54101 77 1754 46621 3.63 48375 78 1607 46556 3.34 48163 79 1599 45062 3.43 46661 80 1699 45317 3.61 47016 81 1698 46337 3.53 48035 82 1823 45712 3.84 47535 83 1839 43637 4.04 45476 84 1643 43597 3.63 45240 85 1683 43755 3.70 45438 86 1647 42953 3.69 44600 87 1709 45242 3.64 46951 88 1853 44351 4.01 46204 89 1457 40268 3.49 41725 90 1468 41510 3.42 42978 91 1572 41967 3.61 43539 92 1453 39509 3.55 40962 93 1409 38144 3.56 39553 94 1412 38519 3.54 39931 95 1380 38429 3.47 39809 96 1311 36951 3.43 38262 97 1323 37995 3.36 39318 98 1380 36852 3.61 38232 99 1295 36237 3.45 37532 100 1298 36463 3.44 37761 101 1303 36233 3.47 37536 102 1337 35928 3.59 37265 103 1252 35353 3.42 36605 104 1304 35013 3.59 36317 105 1242 34912 3.44 36154 106 1276 34199 3.60 35475 107 1318 33274 3.81 34592 108 1281 34531 3.58 35812 109 1316 33520 3.78 34836 110 1323 32606 3.90 33929 111 1272 32870 3.73 34142 112 1132 32858 3.33 33990 113 1166 32876 3.43 34042 114 1090 31483 3.35 32573 115 1073 30122 3.44 31195 116 1137 30902 3.55 32039 117 1234 31117 3.81 32351 118 1106 30503 3.50 31609 119 1076 30887 3.37 31963 120 1130 30807 3.54 31937 121 1216 29305 3.98 30521 122 1090 29591 3.55 30681 123 979 28956 3.27 29935 124 1025 28118 3.52 29143 125 1056 27703 3.67 28759 126 986 28414 3.35 29400 127 1065 28097 3.65 29162 128 1040 27840 3.60 28880 129 1021 27654 3.56 28675 130 1049 28138 3.59 29187 131 1045 26814 3.75 27859 132 931 26092 3.45 27023 133 977 26003 3.62 26980 134 934 25543 3.53 26477 135 902 24552 3.54 25454 136 941 24612 3.68 25553 137 930 24709 3.63 25639 138 906 25525 3.43 26431 139 953 25285 3.63 26238 140 839 24218 3.35 25057 141 821 24104 3.29 24925 142 991 24046 3.96 25037 143 880 23412 3.62 24292 144 879 23335 3.63 24214 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 203 42037 0.48 42240 2 506 75653 0.66 76159 3 552 87004 0.63 87556 4 552 75818 0.72 76370 5 527 87179 0.60 87706 6 540 86614 0.62 87154 7 472 82099 0.57 82571 8 571 88510 0.64 89081 9 527 85104 0.62 85631 10 535 79020 0.67 79555 11 556 100791 0.55 101347 12 584 98753 0.59 99337 13 560 91997 0.61 92557 14 618 99378 0.62 99996 15 494 90444 0.54 90938 16 465 79731 0.58 80196 17 457 84500 0.54 84957 18 428 74127 0.57 74555 19 538 78214 0.68 78752 20 399 75459 0.53 75858 21 379 72296 0.52 72675 22 470 70835 0.66 71305 23 421 71701 0.58 72122 24 416 73152 0.57 73568 25 451 75006 0.60 75457 26 511 84556 0.60 85067 27 454 77687 0.58 78141 28 490 83530 0.58 84020 29 416 74187 0.56 74603 30 396 76987 0.51 77383 31 431 67000 0.64 67431 32 366 70547 0.52 70913 33 409 71143 0.57 71552 34 414 68722 0.60 69136 35 419 71642 0.58 72061 36 351 69938 0.50 70289 37 386 63889 0.60 64275 38 437 71063 0.61 71500 39 384 63466 0.60 63850 40 359 62808 0.57 63167 41 382 65175 0.58 65557 42 395 61309 0.64 61704 43 374 64170 0.58 64544 44 415 61808 0.67 62223 45 349 66732 0.52 67081 46 393 65362 0.60 65755 47 400 62025 0.64 62425 48 372 65114 0.57 65486 49 339 60366 0.56 60705 50 316 59042 0.53 59358 51 381 61150 0.62 61531 52 355 56204 0.63 56559 53 317 58957 0.53 59274 54 344 66905 0.51 67249 55 334 56998 0.58 57332 56 304 56836 0.53 57140 57 313 55271 0.56 55584 58 297 52629 0.56 52926 59 343 58433 0.58 58776 60 327 52633 0.62 52960 61 318 54332 0.58 54650 62 298 52647 0.56 52945 63 310 52077 0.59 52387 64 293 48841 0.60 49134 65 292 52156 0.56 52448 66 273 51593 0.53 51866 67 284 50122 0.56 50406 68 295 52354 0.56 52649 69 265 48893 0.54 49158 70 281 47012 0.59 47293 71 293 48262 0.60 48555 72 312 51473 0.60 51785 73 261 51037 0.51 51298 74 268 48718 0.55 48986 75 264 50254 0.52 50518 76 248 46092 0.54 46340 77 276 47905 0.57 48181 78 219 44593 0.49 44812 79 250 46568 0.53 46818 80 240 43599 0.55 43839 81 190 42555 0.44 42745 82 256 40644 0.63 40900 83 239 43435 0.55 43674 84 216 43783 0.49 43999 85 209 41929 0.50 42138 86 273 45289 0.60 45562 87 232 41079 0.56 41311 88 252 41064 0.61 41316 89 216 39179 0.55 39395 90 210 38707 0.54 38917 91 221 37626 0.58 37847 92 233 38733 0.60 38966 93 210 38459 0.54 38669 94 176 35784 0.49 35960 95 220 37287 0.59 37507 96 193 35648 0.54 35841 97 202 34672 0.58 34874 98 199 36180 0.55 36379 99 207 34973 0.59 35180 100 192 35389 0.54 35581 101 184 36268 0.50 36452 102 211 34411 0.61 34622 103 195 34195 0.57 34390 104 199 35051 0.56 35250 105 202 34255 0.59 34457 106 177 33998 0.52 34175 107 175 35486 0.49 35661 108 178 32136 0.55 32314 109 167 31907 0.52 32074 110 198 33322 0.59 33520 111 174 30961 0.56 31135 112 134 31883 0.42 32017 113 174 30887 0.56 31061 114 136 32114 0.42 32250 115 140 29216 0.48 29356 116 175 30585 0.57 30760 117 138 29340 0.47 29478 118 202 30109 0.67 30311 119 134 28797 0.46 28931 120 157 28087 0.56 28244 121 158 28751 0.55 28909 122 150 28706 0.52 28856 123 148 28051 0.52 28199 124 153 27256 0.56 27409 125 124 28426 0.43 28550 126 163 26946 0.60 27109 127 134 26519 0.50 26653 128 149 26584 0.56 26733 129 131 25168 0.52 25299 130 141 26869 0.52 27010 131 132 25967 0.51 26099 132 131 25287 0.52 25418 133 104 24773 0.42 24877 134 123 24617 0.50 24740 135 142 24466 0.58 24608 136 109 24098 0.45 24207 137 103 24501 0.42 24604 138 132 23375 0.56 23507 139 108 23214 0.46 23322 140 125 23972 0.52 24097 141 98 22904 0.43 23002 142 107 22155 0.48 22262 143 131 22607 0.58 22738 144 123 21753 0.56 21876 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2709 367383 0.73 370092 2 2059 328609 0.62 330668 3 1959 317965 0.61 319924 4 1971 326407 0.60 328378 5 2354 370122 0.63 372476 6 2047 320846 0.63 322893 7 1974 323423 0.61 325397 8 2107 347580 0.60 349687 9 2283 345942 0.66 348225 10 1906 338369 0.56 340275 11 1973 347843 0.56 349816 12 1913 322945 0.59 324858 13 2010 327749 0.61 329759 14 1936 327286 0.59 329222 15 1984 327258 0.60 329242 16 1817 310491 0.58 312308 17 1690 292166 0.58 293856 18 1995 310317 0.64 312312 19 1882 321463 0.58 323345 20 1851 299552 0.61 301403 21 1852 312894 0.59 314746 22 1930 312243 0.61 314173 23 1794 306567 0.58 308361 24 1694 288715 0.58 290409 25 1673 290978 0.57 292651 26 1672 296916 0.56 298588 27 1792 294777 0.60 296569 28 1759 283558 0.62 285317 29 1675 282237 0.59 283912 30 1824 289749 0.63 291573 31 1528 276022 0.55 277550 32 1606 270218 0.59 271824 33 1492 271805 0.55 273297 34 1650 274335 0.60 275985 35 1484 264047 0.56 265531 36 1558 271121 0.57 272679 37 1500 251478 0.59 252978 38 1554 262475 0.59 264029 39 1459 261082 0.56 262541 40 1392 241283 0.57 242675 41 1456 260277 0.56 261733 42 1465 261014 0.56 262479 43 1320 237456 0.55 238776 44 1290 234951 0.55 236241 45 1266 228242 0.55 229508 46 1424 253375 0.56 254799 47 1455 261536 0.55 262991 48 1517 254716 0.59 256233 49 1531 243131 0.63 244662 50 1430 249274 0.57 250704 51 1250 228432 0.54 229682 52 1326 221866 0.59 223192 53 1359 238816 0.57 240175 54 1326 245661 0.54 246987 55 1336 233140 0.57 234476 56 1197 212220 0.56 213417 57 1130 204818 0.55 205948 58 1243 226021 0.55 227264 59 1283 226786 0.56 228069 60 1138 212165 0.53 213303 61 1157 212807 0.54 213964 62 1191 215239 0.55 216430 63 1145 214517 0.53 215662 64 1110 205175 0.54 206285 65 1083 210648 0.51 211731 66 1175 215614 0.54 216789 67 1165 206210 0.56 207375 68 1128 202941 0.55 204069 69 1081 209160 0.51 210241 70 1197 211510 0.56 212707 71 1109 188520 0.58 189629 72 950 186098 0.51 187048 73 1007 183909 0.54 184916 74 1110 201249 0.55 202359 75 1067 189698 0.56 190765 76 988 181354 0.54 182342 77 936 169553 0.55 170489 78 971 180864 0.53 181835 79 1090 185514 0.58 186604 80 972 181332 0.53 182304 81 993 178829 0.55 179822 82 842 164761 0.51 165603 83 979 172932 0.56 173911 84 914 161039 0.56 161953 85 908 165970 0.54 166878 86 849 156666 0.54 157515 87 823 156512 0.52 157335 88 844 154021 0.54 154865 89 919 162347 0.56 163266 90 843 156375 0.54 157218 91 949 158629 0.59 159578 92 873 159409 0.54 160282 93 802 147959 0.54 148761 94 737 148960 0.49 149697 95 736 145523 0.50 146259 96 700 135910 0.51 136610 97 775 137639 0.56 138414 98 827 143710 0.57 144537 99 745 140846 0.53 141591 100 708 137843 0.51 138551 101 659 135663 0.48 136322 102 681 135649 0.50 136330 103 654 134388 0.48 135042 104 714 133806 0.53 134520 105 737 125551 0.58 126288 106 684 126913 0.54 127597 107 671 124084 0.54 124755 108 637 125256 0.51 125893 109 645 124460 0.52 125105 110 685 122637 0.56 123322 111 635 122393 0.52 123028 112 663 121271 0.54 121934 113 612 119190 0.51 119802 114 643 118032 0.54 118675 115 592 117734 0.50 118326 116 574 113025 0.51 113599 117 571 113852 0.50 114423 118 560 111601 0.50 112161 119 530 107546 0.49 108076 120 566 111086 0.51 111652 121 534 108577 0.49 109111 122 583 107926 0.54 108509 123 527 106738 0.49 107265 124 546 105609 0.51 106155 125 593 104355 0.57 104948 126 566 101738 0.55 102304 127 502 100679 0.50 101181 128 572 101317 0.56 101889 129 527 98703 0.53 99230 130 458 95933 0.48 96391 131 517 98511 0.52 99028 132 535 95136 0.56 95671 133 487 93926 0.52 94413 134 467 95335 0.49 95802 135 504 92177 0.54 92681 136 553 94391 0.58 94944 137 492 93269 0.52 93761 138 460 90206 0.51 90666 139 430 87626 0.49 88056 140 468 89231 0.52 89699 141 498 88983 0.56 89481 142 499 86859 0.57 87358 143 444 87386 0.51 87830 144 481 84804 0.56 85285