CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 1784437 24223495 6.86 26007932 2 26213676 584004 97.82 26797680 3 2314 99161 2.28 101475 4 22607 944259 2.34 966866 5 43653 1721913 2.47 1765566 6 60532 1706362 3.43 1766894 7 83041 1950630 4.08 2033671 8 86471 2087324 3.98 2173795 9 96856 2229067 4.16 2325923 10 102943 2307702 4.27 2410645 11 94515 2189424 4.14 2283939 12 80668 1984953 3.91 2065621 13 72884 1889408 3.71 1962292 14 85253 2215622 3.71 2300875 15 94185 2436101 3.72 2530286 16 130317 2518137 4.92 2648454 17 95204 2386132 3.84 2481336 18 83869 2134475 3.78 2218344 19 79002 2040977 3.73 2119979 20 85304 2114950 3.88 2200254 21 95887 2091741 4.38 2187628 22 91625 1943145 4.50 2034770 23 101155 2137891 4.52 2239046 24 103404 2188404 4.51 2291808 25 101897 2164269 4.50 2266166 26 112931 2188700 4.91 2301631 27 114630 2065620 5.26 2180250 28 107934 1963088 5.21 2071022 29 111151 1949365 5.39 2060516 30 124173 2046501 5.72 2170674 31 132573 2070049 6.02 2202622 32 147335 2047980 6.71 2195315 33 142187 2102634 6.33 2244821 34 149844 2164325 6.48 2314169 35 152624 2055589 6.91 2208213 36 149924 1982274 7.03 2132198 37 153246 2001967 7.11 2155213 38 145696 1898826 7.13 2044522 39 153020 2012727 7.07 2165747 40 171131 2066741 7.65 2237872 41 167357 1943163 7.93 2110520 42 168590 1919621 8.07 2088211 43 176686 1857580 8.69 2034266 44 159394 1901021 7.74 2060415 45 153097 1929828 7.35 2082925 46 160780 2070571 7.21 2231351 47 159963 2223848 6.71 2383811 48 152836 2063733 6.90 2216569 49 171458 1965680 8.02 2137138 50 178230 1995062 8.20 2173292 51 171997 1852619 8.50 2024616 52 183027 1995418 8.40 2178445 53 167551 1956808 7.89 2124359 54 174384 1835620 8.68 2010004 55 180872 1799900 9.13 1980772 56 181262 1784012 9.22 1965274 57 159209 1815094 8.06 1974303 58 190011 1829858 9.41 2019869 59 178980 1952635 8.40 2131615 60 188394 1869816 9.15 2058210 61 178211 1860578 8.74 2038789 62 181298 1914726 8.65 2096024 63 182883 1918579 8.70 2101462 64 187301 1873658 9.09 2060959 65 169500 1830182 8.48 1999682 66 178742 1758202 9.23 1936944 67 177746 1882246 8.63 2059992 68 173483 1806338 8.76 1979821 69 182162 1707478 9.64 1889640 70 173715 1745535 9.05 1919250 71 180006 1748909 9.33 1928915 72 216113 1804494 10.70 2020607 73 191946 1845070 9.42 2037016 74 182597 1762031 9.39 1944628 75 210704 1708419 10.98 1919123 76 236956 1839762 11.41 2076718 77 206307 1823739 10.16 2030046 78 223609 1689601 11.69 1913210 79 232993 1710632 11.99 1943625 80 192517 1707263 10.13 1899780 81 202112 1580887 11.34 1782999 82 174190 1571839 9.98 1746029 83 168215 1555445 9.76 1723660 84 165162 1540242 9.68 1705404 85 172667 1625379 9.60 1798046 86 175348 1665441 9.53 1840789 87 172783 1565745 9.94 1738528 88 193891 1516254 11.34 1710145 89 204791 1491891 12.07 1696682 90 175832 1533203 10.29 1709035 91 219783 1599181 12.08 1818964 92 194770 1583446 10.95 1778216 93 176465 1474279 10.69 1650744 94 179215 1517551 10.56 1696766 95 246526 1526514 13.90 1773040 96 202312 1514776 11.78 1717088 97 181571 1459019 11.07 1640590 98 195741 1489399 11.62 1685140 99 178953 1440314 11.05 1619267 100 219352 1404183 13.51 1623535 101 169229 1492597 10.18 1661826 102 155390 1469185 9.56 1624575 103 169165 1401688 10.77 1570853 104 178704 1371328 11.53 1550032 105 151422 1354784 10.05 1506206 106 162068 1312627 10.99 1474695 107 158040 1326594 10.65 1484634 108 184133 1307171 12.35 1491304 109 206953 1320137 13.55 1527090 110 156277 1306950 10.68 1463227 111 165329 1231004 11.84 1396333 112 165007 1339291 10.97 1504298 113 149733 1332730 10.10 1482463 114 143640 1240704 10.38 1384344 115 142162 1314192 9.76 1456354 116 139504 1325544 9.52 1465048 117 152052 1304584 10.44 1456636 118 147002 1255942 10.48 1402944 119 142147 1218956 10.44 1361103 120 148429 1197778 11.03 1346207 121 190491 1225070 13.46 1415561 122 138882 1368673 9.21 1507555 123 131689 1330213 9.01 1461902 124 138012 1238320 10.03 1376332 125 146723 1186864 11.00 1333587 126 135206 1243046 9.81 1378252 127 139008 1401777 9.02 1540785 128 144416 1349204 9.67 1493620 129 135976 1194588 10.22 1330564 130 139640 1208091 10.36 1347731 131 140323 1150557 10.87 1290880 132 133139 1133110 10.51 1266249 133 126677 1160936 9.84 1287613 134 134080 1245926 9.72 1380006 135 145127 1278326 10.20 1423453 136 137437 1195633 10.31 1333070 137 141251 1111233 11.28 1252484 138 217934 1108474 16.43 1326408 139 144603 1203941 10.72 1348544 140 136227 1101681 11.00 1237908 141 133487 1135949 10.52 1269436 142 142577 1150793 11.02 1293370 143 129238 1126650 10.29 1255888 144 127204 1068904 10.63 1196108 145 129932 1067976 10.85 1197908 146 230399 1074126 17.66 1304525 147 143671 1132188 11.26 1275859 148 132720 1022537 11.49 1155257 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 33437 319973 9.46 353410 2 321705 12683 96.21 334388 3 275633 26675264 1.02 26950897 4 3639 802738 0.45 806377 5 4189 831794 0.50 835983 6 8672 1492876 0.58 1501548 7 10241 1848733 0.55 1858974 8 11765 1614224 0.72 1625989 9 10950 1940103 0.56 1951053 10 11190 1871660 0.59 1882850 11 10304 1917961 0.53 1928265 12 10837 1948003 0.55 1958840 13 11190 2023675 0.55 2034865 14 10059 1871995 0.53 1882054 15 11384 2119702 0.53 2131086 16 11070 2010869 0.55 2021939 17 11947 2111692 0.56 2123639 18 11427 2112332 0.54 2123759 19 11477 2039838 0.56 2051315 20 11206 1942365 0.57 1953571 21 11308 2020453 0.56 2031761 22 11366 1888651 0.60 1900017 23 12238 2103838 0.58 2116076 24 10695 1812615 0.59 1823310 25 11414 1860091 0.61 1871505 26 11254 1776531 0.63 1787785 27 11705 1905865 0.61 1917570 28 10616 1869724 0.56 1880340 29 11958 1985581 0.60 1997539 30 12490 2125673 0.58 2138163 31 12497 2004880 0.62 2017377 32 11880 2001003 0.59 2012883 33 11821 1915265 0.61 1927086 34 11823 1981461 0.59 1993284 35 11019 1917558 0.57 1928577 36 12011 1926733 0.62 1938744 37 11512 1915418 0.60 1926930 38 10822 1798310 0.60 1809132 39 11864 1928064 0.61 1939928 40 11428 1792859 0.63 1804287 41 11934 1867312 0.64 1879246 42 11972 1897790 0.63 1909762 43 11891 1889239 0.63 1901130 44 12012 1782949 0.67 1794961 45 11588 1953911 0.59 1965499 46 11204 1771207 0.63 1782411 47 11796 1936092 0.61 1947888 48 10741 1814205 0.59 1824946 49 12769 2023053 0.63 2035822 50 12301 1848174 0.66 1860475 51 11697 1825535 0.64 1837232 52 11283 1769632 0.63 1780915 53 11658 1757122 0.66 1768780 54 10521 1732258 0.60 1742779 55 11427 1851981 0.61 1863408 56 11745 1755150 0.66 1766895 57 11712 1898129 0.61 1909841 58 13068 1966846 0.66 1979914 59 12507 1864074 0.67 1876581 60 11795 1815481 0.65 1827276 61 12216 1764690 0.69 1776906 62 11110 1667386 0.66 1678496 63 11972 1788391 0.66 1800363 64 11522 1672387 0.68 1683909 65 11779 1722519 0.68 1734298 66 11406 1693353 0.67 1704759 67 11520 1685879 0.68 1697399 68 11383 1687435 0.67 1698818 69 11394 1598643 0.71 1610037 70 10977 1648474 0.66 1659451 71 11009 1592280 0.69 1603289 72 12229 1601203 0.76 1613432 73 10332 1538041 0.67 1548373 74 11027 1552586 0.71 1563613 75 11735 1591024 0.73 1602759 76 12300 1700286 0.72 1712586 77 11918 1603592 0.74 1615510 78 13646 1702314 0.80 1715960 79 13065 1623080 0.80 1636145 80 11784 1584398 0.74 1596182 81 11480 1594961 0.71 1606441 82 10963 1564937 0.70 1575900 83 10969 1515056 0.72 1526025 84 11109 1465104 0.75 1476213 85 10586 1457987 0.72 1468573 86 9898 1397639 0.70 1407537 87 11004 1522322 0.72 1533326 88 11625 1532146 0.75 1543771 89 12076 1503751 0.80 1515827 90 12334 1569718 0.78 1582052 91 10705 1406156 0.76 1416861 92 11078 1448331 0.76 1459409 93 10764 1472314 0.73 1483078 94 10758 1432574 0.75 1443332 95 12452 1436696 0.86 1449148 96 10934 1467971 0.74 1478905 97 11409 1541095 0.73 1552504 98 9985 1378300 0.72 1388285 99 11488 1492916 0.76 1504404 100 10871 1297985 0.83 1308856 101 9809 1285648 0.76 1295457 102 9628 1290832 0.74 1300460 103 10059 1369862 0.73 1379921 104 9860 1253438 0.78 1263298 105 9461 1391954 0.68 1401415 106 9510 1232949 0.77 1242459 107 9708 1304989 0.74 1314697 108 11080 1303665 0.84 1314745 109 9868 1257804 0.78 1267672 110 9742 1315436 0.74 1325178 111 9982 1314007 0.75 1323989 112 9468 1254505 0.75 1263973 113 8640 1186338 0.72 1194978 114 9193 1292632 0.71 1301825 115 8634 1197164 0.72 1205798 116 9425 1254923 0.75 1264348 117 9375 1253486 0.74 1262861 118 9366 1298235 0.72 1307601 119 9076 1173014 0.77 1182090 120 9478 1190627 0.79 1200105 121 9033 1171702 0.77 1180735 122 7861 1085009 0.72 1092870 123 8664 1149696 0.75 1158360 124 8187 1136403 0.72 1144590 125 8583 1193947 0.71 1202530 126 9202 1277808 0.71 1287010 127 8770 1154686 0.75 1163456 128 8221 1162325 0.70 1170546 129 9312 1169766 0.79 1179078 130 8314 1116083 0.74 1124397 131 8460 1087830 0.77 1096290 132 8241 1083944 0.75 1092185 133 7990 1061898 0.75 1069888 134 7686 1093917 0.70 1101603 135 7591 1073185 0.70 1080776 136 8519 1067041 0.79 1075560 137 9318 1117391 0.83 1126709 138 8931 1022813 0.87 1031744 139 8123 1001672 0.80 1009795 140 7931 1036906 0.76 1044837 141 8318 1024661 0.81 1032979 142 8254 998666 0.82 1006920 143 7556 992200 0.76 999756 144 7976 1032044 0.77 1040020 145 9098 1063718 0.85 1072816 146 8004 978543 0.81 986547 147 8003 965551 0.82 973554 148 8119 990306 0.81 998425 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 13210 94141 12.31 107351 2 110595 10828 91.08 121423 3 30386 404759 6.98 435145 4 66575 8720948 0.76 8787523 5 63787 7586907 0.83 7650694 6 54394 6928422 0.78 6982816 7 52527 6721145 0.78 6773672 8 54567 6813156 0.79 6867723 9 54999 7008193 0.78 7063192 10 57785 7025794 0.82 7083579 11 56387 6908044 0.81 6964431 12 57231 7679195 0.74 7736426 13 59683 7416469 0.80 7476152 14 54832 7147718 0.76 7202550 15 55077 7207676 0.76 7262753 16 57409 7334887 0.78 7392296 17 54988 7154649 0.76 7209637 18 55888 7308829 0.76 7364717 19 58092 7378017 0.78 7436109 20 55305 7226892 0.76 7282197 21 54006 7096520 0.76 7150526 22 55525 7223812 0.76 7279337 23 50862 7048825 0.72 7099687 24 49706 6859321 0.72 6909027 25 52758 7423411 0.71 7476169 26 50436 7512725 0.67 7563161 27 48711 7221009 0.67 7269720 28 44982 6883831 0.65 6928813 29 44736 7040404 0.63 7085140 30 45423 7215369 0.63 7260792 31 41567 6941119 0.60 6982686 32 41897 7123473 0.58 7165370 33 40269 7051169 0.57 7091438 34 42330 7364593 0.57 7406923 35 39178 7080745 0.55 7119923 36 37002 6772331 0.54 6809333 37 36491 6872160 0.53 6908651 38 37053 6737042 0.55 6774095 39 36233 6883807 0.52 6920040 40 38463 7161050 0.53 7199513 41 35338 6676187 0.53 6711525 42 38326 7000990 0.54 7039316 43 37378 7020062 0.53 7057440 44 35228 6634245 0.53 6669473 45 36871 6745202 0.54 6782073 46 36168 6681464 0.54 6717632 47 33871 6433259 0.52 6467130 48 34335 6394270 0.53 6428605 49 33688 6262698 0.54 6296386 50 36225 6590663 0.55 6626888 51 37421 6934820 0.54 6972241 52 36613 6816091 0.53 6852704 53 36675 6883332 0.53 6920007 54 34881 6568268 0.53 6603149 55 35458 6540187 0.54 6575645 56 35219 6424965 0.55 6460184 57 35538 6516847 0.54 6552385 58 35934 6468802 0.55 6504736 59 34161 6278144 0.54 6312305 60 34232 6139086 0.55 6173318 61 33042 5950315 0.55 5983357 62 34199 6399452 0.53 6433651 63 34988 6453820 0.54 6488808 64 33877 6216716 0.54 6250593 65 32919 5943973 0.55 5976892 66 31531 5899361 0.53 5930892 67 33017 6058811 0.54 6091828 68 32399 5961237 0.54 5993636 69 32984 6157491 0.53 6190475 70 33724 6065365 0.55 6099089 71 32787 5954659 0.55 5987446 72 32759 5930133 0.55 5962892 73 32558 5884717 0.55 5917275 74 33458 5969809 0.56 6003267 75 31175 5664979 0.55 5696154 76 31418 5755089 0.54 5786507 77 32594 5814803 0.56 5847397 78 32566 5847978 0.55 5880544 79 30847 5633769 0.54 5664616 80 30487 5492553 0.55 5523040 81 29129 5256402 0.55 5285531 82 30378 5414153 0.56 5444531 83 30233 5467215 0.55 5497448 84 30291 5608005 0.54 5638296 85 30552 5485740 0.55 5516292 86 29812 5374858 0.55 5404670 87 30878 5550521 0.55 5581399 88 29379 5290949 0.55 5320328 89 29100 5198913 0.56 5228013 90 27670 4974582 0.55 5002252 91 28237 5064430 0.55 5092667 92 28188 5001829 0.56 5030017 93 28972 5124817 0.56 5153789 94 28668 5068877 0.56 5097545 95 29281 5215113 0.56 5244394 96 28639 5117132 0.56 5145771 97 29114 5075728 0.57 5104842 98 27612 4876600 0.56 4904212 99 27600 4972217 0.55 4999817 100 25730 4633920 0.55 4659650 101 27124 4780709 0.56 4807833 102 26292 4781337 0.55 4807629 103 27041 4724813 0.57 4751854 104 26797 4809146 0.55 4835943 105 27776 4909698 0.56 4937474 106 26382 4712731 0.56 4739113 107 26438 4645950 0.57 4672388 108 27004 4658247 0.58 4685251 109 24893 4429036 0.56 4453929 110 25242 4420858 0.57 4446100 111 24370 4379124 0.55 4403494 112 25559 4441266 0.57 4466825 113 24745 4496950 0.55 4521695 114 24711 4460918 0.55 4485629 115 24959 4504899 0.55 4529858 116 24589 4353347 0.56 4377936 117 23709 4284760 0.55 4308469 118 25659 4555518 0.56 4581177 119 24430 4368633 0.56 4393063 120 23164 4190360 0.55 4213524 121 22909 4085777 0.56 4108686 122 22546 4103483 0.55 4126029 123 23102 4070772 0.56 4093874 124 23331 4114249 0.56 4137580 125 22003 3913467 0.56 3935470 126 22195 3969229 0.56 3991424 127 22297 3968415 0.56 3990712 128 22944 4149475 0.55 4172419 129 22545 3999934 0.56 4022479 130 21695 3863299 0.56 3884994 131 22141 3891939 0.57 3914080 132 22874 3974962 0.57 3997836 133 21867 3908050 0.56 3929917 134 22550 3903550 0.57 3926100 135 21201 3812453 0.55 3833654 136 21572 3837981 0.56 3859553 137 20375 3694052 0.55 3714427 138 20794 3733098 0.55 3753892 139 20458 3747016 0.54 3767474 140 21035 3658116 0.57 3679151 141 21681 3704452 0.58 3726133 142 20879 3594417 0.58 3615296 143 20131 3520590 0.57 3540721 144 20498 3621788 0.56 3642286 145 20188 3565880 0.56 3586068 146 19966 3485407 0.57 3505373 147 20536 3619153 0.56 3639689 148 19335 3422759 0.56 3442094 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2189 81059 2.63 83248 2 8750 485189 1.77 493939 3 20412 838771 2.38 859183 4 29928 826525 3.49 856453 5 38908 882764 4.22 921672 6 41320 947204 4.18 988524 7 52452 1068081 4.68 1120533 8 53519 1042557 4.88 1096076 9 39216 936631 4.02 975847 10 34421 863182 3.83 897603 11 32519 804875 3.88 837394 12 38170 986642 3.72 1024812 13 40112 1055822 3.66 1095934 14 61080 1160894 5.00 1221974 15 52295 1100834 4.54 1153129 16 37644 903025 4.00 940669 17 32923 832881 3.80 865804 18 32522 821616 3.81 854138 19 34921 818011 4.09 852932 20 34036 799692 4.08 833728 21 36724 886829 3.98 923553 22 39137 944619 3.98 983756 23 32332 897576 3.48 929908 24 32871 853294 3.71 886165 25 32110 798633 3.87 830743 26 28349 772325 3.54 800674 27 28936 775498 3.60 804434 28 33030 794025 3.99 827055 29 33226 784160 4.06 817386 30 30256 745284 3.90 775540 31 29888 742549 3.87 772437 32 29999 764406 3.78 794405 33 30934 712413 4.16 743347 34 31392 730775 4.12 762167 35 29949 732864 3.93 762813 36 27395 694700 3.79 722095 37 33961 752330 4.32 786291 38 34192 751318 4.35 785510 39 28601 727487 3.78 756088 40 27899 692856 3.87 720755 41 23950 653343 3.54 677293 42 25021 638079 3.77 663100 43 24087 622669 3.72 646756 44 23618 651259 3.50 674877 45 24651 678078 3.51 702729 46 24371 644280 3.64 668651 47 26735 665290 3.86 692025 48 28888 678639 4.08 707527 49 24239 639847 3.65 664086 50 27695 713865 3.73 741560 51 25584 663628 3.71 689212 52 23200 598738 3.73 621938 53 23397 576597 3.90 599994 54 21721 557575 3.75 579296 55 21797 568175 3.69 589972 56 22780 589274 3.72 612054 57 26201 653776 3.85 679977 58 22255 587128 3.65 609383 59 26736 628910 4.08 655646 60 27883 644685 4.15 672568 61 24519 614611 3.84 639130 62 22282 609405 3.53 631687 63 20938 581063 3.48 602001 64 20506 551499 3.58 572005 65 20911 629030 3.22 649941 66 20173 618286 3.16 638459 67 20184 540390 3.60 560574 68 19920 524012 3.66 543932 69 19500 530705 3.54 550205 70 18984 535560 3.42 554544 71 19212 539390 3.44 558602 72 19110 512424 3.60 531534 73 17806 507060 3.39 524866 74 29486 627530 4.49 657016 75 29868 614664 4.63 644532 76 21520 524369 3.94 545889 77 20041 523105 3.69 543146 78 19810 517679 3.69 537489 79 17812 459365 3.73 477177 80 17102 459836 3.59 476938 81 16269 449172 3.50 465441 82 16647 448380 3.58 465027 83 17017 458428 3.58 475445 84 17931 450286 3.83 468217 85 18175 430405 4.05 448580 86 17416 426596 3.92 444012 87 16461 430399 3.68 446860 88 16311 423032 3.71 439343 89 17692 450226 3.78 467918 90 18581 436402 4.08 454983 91 14309 395675 3.49 409984 92 14643 414353 3.41 428996 93 15394 415546 3.57 430940 94 14436 393731 3.54 408167 95 13887 380001 3.53 393888 96 14274 380335 3.62 394609 97 13557 376377 3.48 389934 98 13277 365379 3.51 378656 99 13372 373648 3.46 387020 100 13450 364003 3.56 377453 101 13115 359462 3.52 372577 102 12955 359654 3.48 372609 103 13134 356298 3.56 369432 104 13191 353114 3.60 366305 105 12981 347544 3.60 360525 106 12788 346109 3.56 358897 107 12644 344936 3.54 357580 108 12522 336125 3.59 348647 109 12538 327499 3.69 340037 110 13226 339773 3.75 352999 111 12815 334452 3.69 347267 112 12292 322446 3.67 334738 113 12040 327489 3.55 339529 114 11552 330230 3.38 341782 115 11215 325241 3.33 336456 116 10651 309230 3.33 319881 117 11130 300065 3.58 311195 118 11597 310281 3.60 321878 119 11968 312212 3.69 324180 120 11081 298933 3.57 310014 121 11008 306715 3.46 317723 122 11260 302877 3.58 314137 123 11430 290648 3.78 302078 124 10599 291724 3.51 302323 125 10636 286481 3.58 297117 126 10476 280281 3.60 290757 127 10582 276001 3.69 286583 128 9673 282714 3.31 292387 129 10180 274376 3.58 284556 130 10165 275329 3.56 285494 131 9983 275849 3.49 285832 132 10489 274430 3.68 284919 133 10525 267525 3.79 278050 134 9566 258048 3.57 267614 135 9406 254917 3.56 264323 136 8765 249559 3.39 258324 137 9014 244414 3.56 253428 138 9126 244784 3.59 253910 139 9130 245488 3.59 254618 140 8945 252098 3.43 261043 141 9201 251723 3.53 260924 142 8500 240008 3.42 248508 143 8242 237738 3.35 245980 144 8817 234121 3.63 242938 145 8369 233458 3.46 241827 146 8112 229996 3.41 238108 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 166516 12562299 1.31 12728815 2 2025 459253 0.44 461278 3 2050 417877 0.49 419927 4 4741 739359 0.64 744100 5 5211 856509 0.60 861720 6 5855 751499 0.77 757354 7 5378 856109 0.62 861487 8 5693 854176 0.66 859869 9 4944 812698 0.60 817642 10 5270 865772 0.61 871042 11 4971 837576 0.59 842547 12 4857 779288 0.62 784145 13 5936 994153 0.59 1000089 14 5620 974485 0.57 980105 15 5438 907909 0.60 913347 16 6200 982777 0.63 988977 17 5534 884145 0.62 889679 18 4733 781992 0.60 786725 19 4859 828978 0.58 833837 20 4250 728228 0.58 732478 21 4740 772594 0.61 777334 22 4292 741514 0.58 745806 23 4064 710012 0.57 714076 24 4258 702139 0.60 706397 25 4145 700549 0.59 704694 26 4093 718039 0.57 722132 27 4277 742550 0.57 746827 28 4946 838885 0.59 843831 29 4448 764884 0.58 769332 30 4798 820276 0.58 825074 31 4181 729566 0.57 733747 32 4399 758905 0.58 763304 33 4010 667994 0.60 672004 34 3930 691018 0.57 694948 35 4218 705466 0.59 709684 36 3957 676044 0.58 680001 37 4099 704166 0.58 708265 38 3900 687107 0.56 691007 39 3578 632159 0.56 635737 40 4079 694042 0.58 698121 41 3545 627609 0.56 631154 42 3524 614538 0.57 618062 43 3694 643816 0.57 647510 44 3567 601727 0.59 605294 45 3595 633950 0.56 637545 46 3670 613735 0.59 617405 47 3632 657616 0.55 661248 48 3663 647059 0.56 650722 49 3691 611113 0.60 614804 50 3811 632524 0.60 636335 51 3309 599259 0.55 602568 52 3352 583536 0.57 586888 53 3771 600538 0.62 604309 54 3262 564361 0.57 567623 55 3387 583206 0.58 586593 56 3619 654490 0.55 658109 57 3137 561116 0.56 564253 58 3181 561996 0.56 565177 59 3018 538703 0.56 541721 60 2852 520522 0.54 523374 61 3271 582492 0.56 585763 62 3037 519069 0.58 522106 63 3005 537124 0.56 540129 64 2956 523606 0.56 526562 65 2732 507958 0.53 510690 66 2818 485516 0.58 488334 67 2850 512089 0.55 514939 68 2811 505728 0.55 508539 69 2633 493490 0.53 496123 70 3004 515610 0.58 518614 71 2628 479099 0.55 481727 72 2694 465553 0.58 468247 73 2682 473758 0.56 476440 74 2870 511112 0.56 513982 75 2542 502906 0.50 505448 76 2743 481566 0.57 484309 77 2729 495875 0.55 498604 78 2486 453637 0.55 456123 79 2546 477476 0.53 480022 80 2378 439634 0.54 442012 81 2586 457281 0.56 459867 82 2393 429739 0.55 432132 83 2226 420541 0.53 422767 84 2238 399088 0.56 401326 85 2460 429850 0.57 432310 86 2242 432919 0.52 435161 87 2260 414368 0.54 416628 88 2582 447596 0.57 450178 89 2229 398815 0.56 401044 90 2339 403481 0.58 405820 91 2167 392409 0.55 394576 92 2024 383445 0.53 385469 93 1995 370102 0.54 372097 94 2068 382080 0.54 384148 95 2126 379478 0.56 381604 96 1865 353101 0.53 354966 97 2074 367271 0.56 369345 98 1859 350148 0.53 352007 99 1826 344959 0.53 346785 100 1980 353943 0.56 355923 101 1961 345719 0.56 347680 102 1886 350026 0.54 351912 103 1921 357132 0.54 359053 104 1861 339392 0.55 341253 105 1772 339117 0.52 340889 106 2012 348820 0.57 350832 107 1749 338923 0.51 340672 108 1821 337181 0.54 339002 109 1784 349701 0.51 351485 110 1664 317947 0.52 319611 111 1757 318493 0.55 320250 112 1667 329946 0.50 331613 113 1549 305448 0.50 306997 114 1609 313919 0.51 315528 115 1637 303049 0.54 304686 116 1610 318286 0.50 319896 117 1550 289859 0.53 291409 118 1608 302151 0.53 303759 119 1516 291450 0.52 292966 120 1609 294767 0.54 296376 121 1437 286705 0.50 288142 122 1367 275942 0.49 277309 123 1529 284596 0.53 286125 124 1512 280645 0.54 282157 125 1485 278849 0.53 280334 126 1456 270893 0.53 272349 127 1407 278277 0.50 279684 128 1427 266616 0.53 268043 129 1395 261510 0.53 262905 130 1423 263073 0.54 264496 131 1305 249455 0.52 250760 132 1354 262964 0.51 264318 133 1288 251537 0.51 252825 134 1326 251489 0.52 252815 135 1136 245956 0.46 247092 136 1320 243041 0.54 244361 137 1299 241708 0.53 243007 138 1147 239434 0.48 240581 139 1290 243559 0.53 244849 140 1188 231931 0.51 233119 141 1217 229496 0.53 230713 142 1148 233715 0.49 234863 143 1103 223875 0.49 224978 144 1117 219393 0.51 220510 145 1245 224956 0.55 226201 146 1109 213316 0.52 214425 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 6992 265624 2.56 272616 2 28949 4121853 0.70 4150802 3 26958 3622035 0.74 3648993 4 20288 3238011 0.62 3258299 5 19516 3128810 0.62 3148326 6 19852 3207629 0.62 3227481 7 22700 3643851 0.62 3666551 8 19907 3174969 0.62 3194876 9 19303 3176915 0.60 3196218 10 20872 3423070 0.61 3443942 11 21924 3399177 0.64 3421101 12 19528 3330321 0.58 3349849 13 19796 3422340 0.58 3442136 14 18474 3178534 0.58 3197008 15 18952 3240798 0.58 3259750 16 18795 3217330 0.58 3236125 17 19196 3218987 0.59 3238183 18 18145 3056293 0.59 3074438 19 16720 2881053 0.58 2897773 20 18470 3063938 0.60 3082408 21 18486 3171126 0.58 3189612 22 17804 2946439 0.60 2964243 23 17634 3081509 0.57 3099143 24 18183 3083819 0.59 3102002 25 18310 3024966 0.60 3043276 26 16240 2838112 0.57 2854352 27 16036 2869134 0.56 2885170 28 16505 2926548 0.56 2943053 29 17092 2905877 0.58 2922969 30 17253 2795743 0.61 2812996 31 16314 2775132 0.58 2791446 32 16921 2850049 0.59 2866970 33 15414 2717023 0.56 2732437 34 15290 2659928 0.57 2675218 35 15694 2674738 0.58 2690432 36 16078 2702298 0.59 2718376 37 15213 2607137 0.58 2622350 38 16063 2672555 0.60 2688618 39 13996 2467993 0.56 2481989 40 14920 2584607 0.57 2599527 41 14589 2577409 0.56 2591998 42 13538 2375269 0.57 2388807 43 14367 2554957 0.56 2569324 44 14865 2578758 0.57 2593623 45 13112 2331830 0.56 2344942 46 13065 2318037 0.56 2331102 47 12432 2252578 0.55 2265010 48 14433 2496033 0.57 2510466 49 14214 2583486 0.55 2597700 50 14095 2514385 0.56 2528480 51 14010 2399119 0.58 2413129 52 14199 2460445 0.57 2474644 53 12392 2251162 0.55 2263554 54 12487 2182878 0.57 2195365 55 13067 2347837 0.55 2360904 56 13563 2414999 0.56 2428562 57 12450 2301545 0.54 2313995 58 11592 2088658 0.55 2100250 59 11296 2028461 0.55 2039757 60 12511 2231942 0.56 2244453 61 12792 2243568 0.57 2256360 62 11366 2098099 0.54 2109465 63 12087 2101107 0.57 2113194 64 11753 2124905 0.55 2136658 65 11399 2115998 0.54 2127397 66 11295 2026522 0.55 2037817 67 11318 2081466 0.54 2092784 68 11613 2127981 0.54 2139594 69 11475 2039716 0.56 2051191 70 10906 2012641 0.54 2023547 71 10944 2060470 0.53 2071414 72 11795 2096710 0.56 2108505 73 10148 1855470 0.54 1865618 74 9974 1834354 0.54 1844328 75 10069 1824054 0.55 1834123 76 10933 1993545 0.55 2004478 77 9961 1867877 0.53 1877838 78 9829 1786007 0.55 1795836 79 9169 1670193 0.55 1679362 80 9435 1780021 0.53 1789456 81 10249 1833645 0.56 1843894 82 9709 1787945 0.54 1797654 83 9522 1765549 0.54 1775071 84 8942 1631555 0.55 1640497 85 9544 1711092 0.55 1720636 86 8595 1592566 0.54 1601161 87 8978 1644514 0.54 1653492 88 8295 1549458 0.53 1557753 89 8293 1543607 0.53 1551900 90 8098 1526820 0.53 1534918 91 8725 1610624 0.54 1619349 92 8156 1553347 0.52 1561503 93 8824 1573652 0.56 1582476 94 8296 1576867 0.52 1585163 95 7776 1460367 0.53 1468143 96 7676 1469050 0.52 1476726 97 7484 1436856 0.52 1444340 98 7112 1345962 0.53 1353074 99 7304 1361006 0.53 1368310 100 7541 1420799 0.53 1428340 101 7322 1388425 0.52 1395747 102 7237 1355522 0.53 1362759 103 7027 1340547 0.52 1347574 104 6928 1333139 0.52 1340067 105 7066 1332618 0.53 1339684 106 6864 1315351 0.52 1322215 107 6568 1241090 0.53 1247658 108 6647 1254772 0.53 1261419 109 6460 1227765 0.52 1234225 110 6429 1232432 0.52 1238861 111 6403 1230592 0.52 1236995 112 6343 1204600 0.52 1210943 113 6438 1215622 0.53 1222060 114 6403 1197217 0.53 1203620 115 6058 1173310 0.51 1179368 116 6069 1169039 0.52 1175108 117 5985 1166336 0.51 1172321 118 5611 1119592 0.50 1125203 119 5797 1121087 0.51 1126884 120 5762 1108527 0.52 1114289 121 5580 1069360 0.52 1074940 122 5653 1098065 0.51 1103718 123 5532 1078729 0.51 1084261 124 5600 1071695 0.52 1077295 125 5532 1058811 0.52 1064343 126 5414 1048335 0.51 1053749 127 5182 1036001 0.50 1041183 128 5081 1015321 0.50 1020402 129 5059 999923 0.50 1004982 130 5149 1002490 0.51 1007639 131 5022 977745 0.51 982767 132 4839 952725 0.51 957564 133 4984 981787 0.51 986771 134 4997 946244 0.53 951241 135 4649 937556 0.49 942205 136 4868 944013 0.51 948881 137 4751 919311 0.51 924062 138 4614 926594 0.50 931208 139 4905 928024 0.53 932929 140 4390 890997 0.49 895387 141 4417 868275 0.51 872692 142 4410 882812 0.50 887222 143 4481 886350 0.50 890831 144 4475 865784 0.51 870259 145 4328 866485 0.50 870813 146 4216 841096 0.50 845312