Genome: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/D-Apul/data/Apulchra-genome.fa
Alignments: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/D-Apul/output/11-Apul-sRNA-ShortStack_4.1.0-pulchra_genome/ShortStack_out/merged_alignments.bam
Location: ptg000007l:3331466-3331556 minus
PDF file name: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/D-Apul/output/11-Apul-sRNA-ShortStack_4.1.0-pulchra_genome/ShortStack_out/strucVis/Cluster_3879.ps.pdf
Locus Name: Cluster_3879
CCUUGAACACUAGUCAUCAAUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUCUGAUUACUAGUUAGAAGUAGC
.(((....((((((.((((..((((((((((.((((((((.........)))))))).))))))))))..)))).))))))...))).... (-32.10)
..................AAUAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:24 al:2
..................AcUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:25 al:1
...................AUAGUUUACAGGCUCAACUUUGgU................................................ len:24 al:1
...................gUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:24 al:1
...................AUAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:23 al:5
...................AUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:24 al:1
...................cUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:24 al:4
...................AUAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:24 al:12
...................cUAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:23 al:2
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:17
....................gAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUcACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUU................................................... len:20 al:1
....................UcGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................aAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCuACUUUGC................................................. len:22 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUcG.................................................. len:21 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCaCAACUU.................................................... len:19 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUgGCU................................................ len:23 al:13
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUaUAA............................................ len:27 al:6
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1782
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:7
....................UcGUUUACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAAuUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACg..................................................... len:18 al:4
....................UAGUUUACAGGgUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCcACUUUGC................................................. len:22 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUG.................................................. len:21 al:2
....................UAGUUUAaAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGa................................................. len:22 al:255
....................UAGUUUACAGGaUCAACUUUGC................................................. len:22 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUaA............................................. len:26 al:6
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCaU............................................... len:24 al:85
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAuGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:4
....................UAGUUUAuAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:5
....................gAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUUUACAaGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:25
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUgU.............................................. len:25 al:9
....................UgGUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:3
....................UAGUUgACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGGCgCAACUUUGCU................................................ len:23 al:5
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUgU................................................... len:20 al:1
....................UAaUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:17
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUUG.................................................. len:21 al:4
....................UAGUUUACcGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:22
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:20 al:404
....................UAGUUUACAGGCUaAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGcUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:14
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUUGCU................................................ len:23 al:172
....................UAGUaUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:12
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUGCUU............................................... len:24 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAuCUUUGCU................................................ len:23 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUU.................................................... len:19 al:54
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUUG.................................................. len:21 al:5
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUaCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAuA........................................... len:28 al:1
....................aAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:7
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCcU............................................... len:24 al:14
....................UAGUUUACuGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:46
....................UAGUUUACAGGCcCAACU..................................................... len:18 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUcGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACaUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUaAA............................................ len:27 al:2
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUa.................................................. len:21 al:25
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:34
....................UAGUUUACAGGCaCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:5
....................UAGcUUACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUcUGC................................................. len:22 al:16
....................UAGUgUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UgGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:2
....................UAGcUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:94
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGuU................................................ len:23 al:169
....................UAGUUcACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:13
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCcUU.............................................. len:25 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUc.................................................. len:21 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAA....................................................... len:16 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGaU................................................ len:23 al:10
....................UAGUUUACAGGuUCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCaCAACUUUGC................................................. len:22 al:6
....................UAGUgUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:5
....................UAGUUUACAGGCUuAACUUUGC................................................. len:22 al:6
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUGCU................................................ len:23 al:116
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUGCUUUAAAGG......................................... len:30 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAu............................................ len:27 al:7
....................UAGUUUACAGGCUCAACUc.................................................... len:19 al:4
....................UAGUUUcCAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:44
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUc............................................. len:26 al:15
....................UAGUUUACAaGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUuCU................................................ len:23 al:3
....................UAGUUUACuGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:8
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUUGC................................................. len:22 al:31
....................UAGUUUACuGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUaUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGaCUCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUcUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUaUA............................................. len:26 al:331
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUaGCU................................................ len:23 al:5
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUU................................................... len:20 al:3
....................UAGUUcACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:67
....................UAuUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UgGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:7
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:74
....................UAGUUUACAGGCUCAACUcUGCUU............................................... len:24 al:7
....................UAGUUUACAGGgUCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUUGCUUUA............................................. len:26 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACaUUGCU................................................ len:23 al:10
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUa............................................... len:24 al:453
....................UAGUUUACAGGgUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAAuUUUGCU................................................ len:23 al:21
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUaCU................................................ len:23 al:40
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUaU.............................................. len:25 al:2019
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUUGCU................................................ len:23 al:113
....................UAGUUUACAGGaUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACgUUGCU................................................ len:23 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUa.............................................. len:25 al:921
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUcU.............................................. len:25 al:13
....................UAGUUUACAGGCUCAcCUUUGCU................................................ len:23 al:11
....................UAuUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUUACAGGCUuAACUUUGCU................................................ len:23 al:32
....................UAGUgUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUUUACAGGCUaAACUUUGCU................................................ len:23 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUu............................................. len:26 al:154
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGgU................................................ len:23 al:7
....................UAGUUUACcGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:3
....................UAGUcUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:95
....................UAGUUUACAGcCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:2
....................UAGUUUACAaGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUUGCUUU.............................................. len:25 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:23 al:4822
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAAAG.......................................... len:29 al:1
....................UgGUUUACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUcCAGGCUCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACcGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUcUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:18
....................UAuUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:10
....................UAGUUUACAGGCUCAACUcUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCgACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUaC................................................. len:22 al:9
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCaUUA............................................. len:26 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAA............................................ len:27 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUU................................................... len:20 al:3
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:75
....................UAGUUUACAGGCUCAACa..................................................... len:18 al:43
....................UgGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:154
....................UAGUUUACAGGCUCAACUcUGCU................................................ len:23 al:99
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUUGCUU............................................... len:24 al:10
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAAA........................................... len:28 al:1
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:5
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUg.............................................. len:25 al:7
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUgUA............................................. len:26 al:1
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:192
....................UAGUUUACAGGuUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:47
....................UAGUcUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UuGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:13
....................UAGUUcACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGaCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:36
....................UuGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:4
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:6
....................UAGUUUAuAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:34
....................UAGUUUuCAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAAu........................................... len:28 al:3
....................UAGUUaACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCg................................................ len:23 al:648
....................UAGUUUACAGGCUCuACUUUGCU................................................ len:23 al:6
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:9005
....................UAGUUUACAGGCaCAACUUUGCU................................................ len:23 al:25
....................UAGUUUACAGGCUCAAaU..................................................... len:18 al:1
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:16
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUU.................................................... len:19 al:1
....................aAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUcA............................................. len:26 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUA............................................. len:26 al:31
....................UAGUUUACAGGCaCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:4
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUUGC................................................. len:22 al:40
....................UAGUcUACAGGCUCAACUU.................................................... len:19 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGu................................................. len:22 al:1216
....................UAGUUUACAGaCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAaUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:2
....................gAGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:2
....................cAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUgGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCa................................................ len:23 al:2743
....................UAGUUUACgGGCUCAACUU.................................................... len:19 al:1
....................UAaUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCgACUUUGC................................................. len:22 al:19
....................aAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUcUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAACUcUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACc..................................................... len:18 al:12
....................UAGUUUACAGGCUCAACaUUGC................................................. len:22 al:5
....................UAGUUcACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCaUU.............................................. len:25 al:126
....................UAGUUUACAGGuUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUa................................................... len:20 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUcGCU................................................ len:23 al:72
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGaUU............................................... len:24 al:5
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:46
....................UAGUUUACAGGCUCAcCUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUc.............................................. len:25 al:93
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUg............................................... len:24 al:17
....................gAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:8
....................UcGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUaGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUUACAuGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGaCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:9
....................UcGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:13
....................UAGUUUACAGGuUCAACUUUGC................................................. len:22 al:7
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUcC................................................. len:22 al:6
....................UAGUUUACAGGCUCAACUaUGCU................................................ len:23 al:9
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUUGCUUU.............................................. len:25 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAAaUUUGCU................................................ len:23 al:5
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:946
....................UuGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:39898
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACgGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:5
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUcGC................................................. len:22 al:15
....................UAGUUUACAaGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUc................................................... len:20 al:33
....................UAGUUUACAGuCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCA........................................................ len:15 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUu.................................................. len:21 al:1
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACcU.................................................... len:19 al:3
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAAAGG......................................... len:30 al:5
....................UAGUgUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGcUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGuUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGg................................................. len:22 al:32
....................UgGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:25
....................UAGUUUACAGGCUCcACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGuUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUUUgCAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:2
....................UAGUUUACAGGCUCAgCU..................................................... len:18 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:757
....................UAGUUUACAGGCUCcACUUUGCUU............................................... len:24 al:2
....................UAGgUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:20 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAAuUUUGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUACAGuCUCAACUUUGCU................................................ len:23 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCcACUUUGCU................................................ len:23 al:30
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUc............................................... len:24 al:150
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUcCU................................................ len:23 al:4
....................UAGUgUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAc............................................ len:27 al:1
....................UAGUUUACAGGCcCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:4
....................UAGUUUACAGGCUCAAC...................................................... len:17 al:10
....................UAGUUUACAGGCUCAACUa.................................................... len:19 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAAuU..................................................... len:18 al:4
....................UAGUUUcCAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:25 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUUGCgU............................................... len:24 al:4
....................UAGUUUcCAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:5
....................UAGUUUACAGGCUCAACcUUGCU................................................ len:23 al:178
....................UAGUUUACAGuCUCAACUUUGCUU............................................... len:24 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACUUgGC................................................. len:22 al:1
....................UAGUUUcCAGGCUCAACUUUGC................................................. len:22 al:8
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUUGC................................................. len:22 al:30
....................UAGUUUACAGGCUCAgCUUU................................................... len:20 al:4
....................UAGcUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:21 al:2
....................UAGUUUACAGGCaCAACUUUG.................................................. len:21 al:1
....................UAGUUUACAGGCUCAACU..................................................... len:18 al:118
....................UAGUUUACAGGCUCAAu...................................................... len:17 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:19 al:5
.....................AGUUUACAGGCUCAgCUUUGCU................................................ len:22 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:21 al:18
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:23 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUa............................................... len:23 al:2
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUUu............................................. len:25 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUa.............................................. len:24 al:3
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUaU.............................................. len:24 al:5
.....................AGUcUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:22 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCg................................................ len:22 al:2
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:22 al:3
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCa................................................ len:22 al:9
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGu................................................. len:21 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUcG.................................................. len:20 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGa................................................. len:21 al:1
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:24 al:3
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:20 al:2
.....................AGUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:22 al:29
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCaUU.............................................. len:23 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:22 al:3
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:21 al:9
......................GUUUAuAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:21 al:2
......................aUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:21 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACU..................................................... len:16 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUUa.............................................. len:23 al:2
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCg................................................ len:21 al:1
......................GUaUACAGGCUCAACUUU................................................... len:18 al:2
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUa............................................... len:22 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:23 al:4
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUgU.............................................. len:23 al:1
......................GUUcACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:21 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:19 al:18
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCUaU.............................................. len:23 al:3
......................GUUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:18 al:22
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:20 al:43
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:21 al:60
......................GcUUACAGGCUCAACUUU................................................... len:18 al:2
......................GUUUACAGGCUCAACUUUa.................................................. len:19 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUc................................................... len:18 al:2
......................GUUUAuAGGCUCAACUUUGC................................................. len:20 al:1
......................GUUaACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:21 al:1
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGu................................................. len:20 al:6
......................GUUUACAGGCUCAACUUUGCa................................................ len:21 al:8
.......................UUUgCAGGCUCAACUUUGC................................................. len:19 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGa................................................. len:19 al:1
.......................UcUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:19 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCaUU.............................................. len:22 al:2
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUgU.............................................. len:22 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUUUAu............................................ len:24 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUa............................................... len:21 al:9
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUUU.............................................. len:22 al:10
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUaU.............................................. len:22 al:35
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGu................................................. len:19 al:3
.......................UUUACAGGCUCAACUcUGCUUU.............................................. len:22 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCa................................................ len:20 al:3
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUUa.............................................. len:22 al:3
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUUUu............................................. len:23 al:3
.......................UUUACAGGCUCAACUUUG.................................................. len:18 al:33
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:20 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:20 al:15
.......................UUUACAGGCUCgACUUUGC................................................. len:19 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUU............................................... len:21 al:1
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:19 al:48
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUaUA............................................. len:23 al:2
.......................UUUACAGGCUCAACUUUGCUUc.............................................. len:22 al:1
........................UUACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:19 al:6
........................UUACAGGCUCAACUUUGC................................................. len:18 al:4
.........................UACAGGCUCAACUUUGCU................................................ len:18 al:3
.........................UACAGGCUCAACUUUGCc................................................ len:18 al:2
.........................UACAGGCUCAACUUUGCUUUAA............................................ len:22 al:1
.........................................CUUUAAAGGGAGUUGAUC................................ len:18 al:1
..........................................UUUAAAGGGAGUUGAUCUUG............................. len:20 al:2
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUCU.................... len:28 al:1
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUuU.................... len:28 al:2
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAA......................... len:23 al:3
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUU...................... len:26 al:1
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUCUu................... len:29 al:1
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUCa.................... len:28 al:1
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:25 al:5
...........................................UUAAAGGaAGUUGAUCUUGUAAA......................... len:23 al:1
...........................................UUAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUC..................... len:27 al:2
............................................UAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACa....................... len:24 al:2
............................................UAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACUc...................... len:25 al:1
............................................UAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACaU...................... len:25 al:1
............................................UAAAGGGAGUUGAUCUUGUA........................... len:20 al:1
............................................UAAAGGGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:24 al:1
..............................................AAGGaAGUUGAUCUUGUA........................... len:18 al:1
..............................................AAGGGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:22 al:1
...............................................AGGaAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:21 al:1
...............................................AGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUCUGAUUACU............. len:31 al:3
...............................................AGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUu..................... len:23 al:3
...............................................AGGGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:21 al:13
...............................................AGGGAGUUGAUCUUGUAAACUUuU.................... len:24 al:3
...............................................AGGGAGUUGAUCUUGUAAACUU...................... len:22 al:1
................................................GGGAGUUGAUCUUGUAAACUUC..................... len:22 al:1
................................................GGGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:20 al:3
................................................GGGAGUUGAUCUUGUAAACUU...................... len:21 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUUCU.................... len:22 al:2
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUa...................... len:20 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUU...................... len:20 al:13
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACg....................... len:19 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUUC..................... len:21 al:3
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAAuU....................... len:19 al:1
.................................................GGAGUUGAcCUUGUAAACU....................... len:19 al:2
.................................................GGAGUUGgUCUUGUAAACUU...................... len:20 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUUCUu................... len:23 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:19 al:27
.................................................GaAGUUGAUCUUGUAAACU....................... len:19 al:4
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAAC........................ len:18 al:2
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACc....................... len:19 al:6
.................................................GGAGUcGAUCUUGUAAACU....................... len:19 al:1
.................................................GGAGUUGcUCUUGUAAACUUCU.................... len:22 al:1
.................................................GGAGUUGAUCUUGUAAACUUa..................... len:21 al:2
.................................................GaAGUUGAUCUUGUAAAC........................ len:18 al:8
..................................................GAGUUGAUCUUGUAAACUU...................... len:19 al:1
...................................................AGUUGAUCUUGUAAACUUCUcA.................. len:22 al:1
...................................................AGUUGAUCUUGUAAACUUCa.................... len:20 al:4
...................................................AGUUGAUCUUGUAAACUUCU.................... len:20 al:1
...................................................AGUUGAUCUUGUAAACUUCUGAUUACU............. len:27 al:1
....................................................GUUGAUCUUGUAAACUUC..................... len:18 al:1
.....................................................UUGAUCUUGUAAACUUCUa................... len:19 al:1
.....................................................UUGAUCUUGUAAACUUCUaA.................. len:20 al:4
.....................................................UUGAUCUUGUAAACUUCU.................... len:18 al:3
.....................................................UUGAUCUUGUAAACUUCa.................... len:18 al:36
......................................................UGAUCUUGUAAACUUCUuAUU................ len:21 al:1
......................................................UGAUCUUGUAAACUUCUaAUU................ len:21 al:1
......................................................UGAUCUUGUAAACUUCUGAUUACU............. len:24 al:3
.........................................................UCUUGUAAACUUCUGAUUACU............. len:21 al:1
..........................................................CUUGUAAACUUCUGAUUACU............. len:20 al:7
............................................................UGUAAACUUCUGAUUACU............. len:18 al:3
............................................................UGUAAACUUCUGAUUACc............. len:18 al:2
............................................................UGUAAACcUCUGAUUACU............. len:18 al:1