CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 145080 379692 27.65 524772 2 140999 550841 20.38 691840 3 104119 730570 12.47 834689 4 98868 571583 14.75 670451 5 85776 682987 11.16 768763 6 65527 513647 11.31 579174 7 68633 472857 12.67 541490 8 81451 524091 13.45 605542 9 85943 522394 14.13 608337 10 84626 508340 14.27 592966 11 92842 525642 15.01 618484 12 100724 524655 16.11 625379 13 97465 526204 15.63 623669 14 96100 525601 15.46 621701 15 99205 529343 15.78 628548 16 96843 528600 15.48 625443 17 97995 529950 15.61 627945 18 96507 543805 15.07 640312 19 96628 523461 15.58 620089 20 99449 540091 15.55 639540 21 102053 546983 15.72 649036 22 103914 544124 16.04 648038 23 103663 547527 15.92 651190 24 103121 553334 15.71 656455 25 104183 548637 15.96 652820 26 102767 538788 16.02 641555 27 102182 543529 15.82 645711 28 102394 535941 16.04 638335 29 102190 538307 15.95 640497 30 101236 543051 15.71 644287 31 101526 543011 15.75 644537 32 101325 540130 15.80 641455 33 101245 542622 15.72 643867 34 101012 537451 15.82 638463 35 101434 536678 15.90 638112 36 100322 545189 15.54 645511 37 100774 530167 15.97 630941 38 100359 531935 15.87 632294 39 99129 533535 15.67 632664 40 98637 522528 15.88 621165 41 98819 522497 15.90 621316 42 98109 522113 15.82 620222 43 97457 514015 15.94 611472 44 99354 519051 16.07 618405 45 96793 511269 15.92 608062 46 95100 503648 15.88 598748 47 94471 499809 15.90 594280 48 93661 502902 15.70 596563 49 93305 495095 15.86 588400 50 91647 492642 15.69 584289 51 89946 488952 15.54 578898 52 87848 480758 15.45 568606 53 87691 472730 15.65 560421 54 86566 469125 15.58 555691 55 85171 464115 15.51 549286 56 85379 458047 15.71 543426 57 84220 456197 15.58 540417 58 82598 450065 15.51 532663 59 81719 444137 15.54 525856 60 79795 439716 15.36 519511 61 78953 428572 15.56 507525 62 77590 420748 15.57 498338 63 75928 417252 15.40 493180 64 75745 410847 15.57 486592 65 74068 403292 15.52 477360 66 73010 401848 15.38 474858 67 72262 391194 15.59 463456 68 70358 387700 15.36 458058 69 68874 380524 15.33 449398 70 67948 372016 15.44 439964 71 66232 361461 15.49 427693 72 64595 356368 15.34 420963 73 63355 348279 15.39 411634 74 61633 341341 15.29 402974 75 60808 335974 15.33 396782 76 59800 330185 15.33 389985 77 57658 321423 15.21 379081 78 56677 314954 15.25 371631 79 55811 308903 15.30 364714 80 54624 305902 15.15 360526 81 53209 299573 15.08 352782 82 52125 292140 15.14 344265 83 51862 287239 15.29 339101 84 49865 282017 15.02 331882 85 48464 273870 15.04 322334 86 47257 268994 14.94 316251 87 46410 261810 15.06 308220 88 45589 256842 15.07 302431 89 44017 251880 14.88 295897 90 42544 246962 14.70 289506 91 42418 237890 15.13 280308 92 40971 232528 14.98 273499 93 40058 227687 14.96 267745 94 38576 217972 15.04 256548 95 37181 212561 14.89 249742 96 36251 209963 14.72 246214 97 35257 202778 14.81 238035 98 33850 197926 14.60 231776 99 33267 193209 14.69 226476 100 32307 186338 14.78 218645 101 31672 182218 14.81 213890 102 30616 178907 14.61 209523 103 29633 171949 14.70 201582 104 28862 167753 14.68 196615 105 28509 163428 14.85 191937 106 27534 158659 14.79 186193 107 26425 154697 14.59 181122 108 25799 152266 14.49 178065 109 25067 147062 14.56 172129 110 24668 143500 14.67 168168 111 23529 139803 14.41 163332 112 22876 134709 14.52 157585 113 22560 132254 14.57 154814 114 21961 129524 14.50 151485 115 21309 124904 14.57 146213 116 20597 121829 14.46 142426 117 19911 118732 14.36 138643 118 19119 115123 14.24 134242 119 18528 112496 14.14 131024 120 18272 108470 14.42 126742 121 17591 105814 14.25 123405 122 17415 102701 14.50 120116 123 16562 99801 14.23 116363 124 16335 96708 14.45 113043 125 15971 94249 14.49 110220 126 15353 91446 14.38 106799 127 14735 88587 14.26 103322 128 14361 85835 14.33 100196 129 13634 83617 14.02 97251 130 13470 80985 14.26 94455 131 13122 79010 14.24 92132 132 12501 76075 14.11 88576 133 12201 73980 14.16 86181 134 11798 72236 14.04 84034 135 11523 69895 14.15 81418 136 11271 68089 14.20 79360 137 10849 65723 14.17 76572 138 10452 64610 13.92 75062 139 10373 62362 14.26 72735 140 10094 60557 14.29 70651 141 9615 58620 14.09 68235 142 9106 56852 13.81 65958 143 9014 55334 14.01 64348 144 8692 53997 13.87 62689 145 8273 52616 13.59 60889 146 8194 51664 13.69 59858 147 8022 50627 13.68 58649 148 7961 49179 13.93 57140 149 7587 46887 13.93 54474 150 7153 45835 13.50 52988 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 198371 1515896 11.57 1714267 2 116679 654168 15.14 770847 3 77486 913046 7.82 990532 4 59966 736974 7.52 796940 5 19821 1003463 1.94 1023284 6 17427 1154300 1.49 1171727 7 14926 835565 1.75 850491 8 14831 848043 1.72 862874 9 14175 862590 1.62 876765 10 14566 839951 1.70 854517 11 18153 841879 2.11 860032 12 12868 881259 1.44 894127 13 12367 889249 1.37 901616 14 11599 867415 1.32 879014 15 11825 858368 1.36 870193 16 11499 861174 1.32 872673 17 10933 880252 1.23 891185 18 10637 883478 1.19 894115 19 10205 874073 1.15 884278 20 10248 880011 1.15 890259 21 10585 888635 1.18 899220 22 10540 900850 1.16 911390 23 10268 899257 1.13 909525 24 10412 891444 1.15 901856 25 10501 903270 1.15 913771 26 10433 884914 1.17 895347 27 10455 886150 1.17 896605 28 10421 896371 1.15 906792 29 10421 896545 1.15 906966 30 10535 902422 1.15 912957 31 10487 900545 1.15 911032 32 10624 891764 1.18 902388 33 10825 907930 1.18 918755 34 10594 899563 1.16 910157 35 10539 898783 1.16 909322 36 10613 886744 1.18 897357 37 10863 906231 1.18 917094 38 10805 888443 1.20 899248 39 10872 896914 1.20 907786 40 10642 880399 1.19 891041 41 10889 882262 1.22 893151 42 11038 877226 1.24 888264 43 11090 877599 1.25 888689 44 10803 860081 1.24 870884 45 11313 863612 1.29 874925 46 11358 851142 1.32 862500 47 11216 837952 1.32 849168 48 11480 832393 1.36 843873 49 11672 832293 1.38 843965 50 11553 819637 1.39 831190 51 11514 810974 1.40 822488 52 11589 807315 1.42 818904 53 11664 803056 1.43 814720 54 11828 785106 1.48 796934 55 11840 786300 1.48 798140 56 11570 767134 1.49 778704 57 11891 766937 1.53 778828 58 11951 752057 1.56 764008 59 11904 742215 1.58 754119 60 11738 733696 1.57 745434 61 11901 732974 1.60 744875 62 11600 709292 1.61 720892 63 11788 701758 1.65 713546 64 11559 689759 1.65 701318 65 11344 682795 1.63 694139 66 11544 671029 1.69 682573 67 11240 666787 1.66 678027 68 11161 648409 1.69 659570 69 11172 640785 1.71 651957 70 11014 627885 1.72 638899 71 10937 613079 1.75 624016 72 11027 600308 1.80 611335 73 10738 593969 1.78 604707 74 10644 580816 1.80 591460 75 10670 569088 1.84 579758 76 10376 559721 1.82 570097 77 10323 545887 1.86 556210 78 10200 533238 1.88 543438 79 9984 522574 1.87 532558 80 9867 508082 1.91 517949 81 9860 502223 1.93 512083 82 9684 487978 1.95 497662 83 9414 472824 1.95 482238 84 9170 464106 1.94 473276 85 9287 457658 1.99 466945 86 8900 443497 1.97 452397 87 8815 434928 1.99 443743 88 8726 423467 2.02 432193 89 8469 415729 2.00 424198 90 8323 408031 2.00 416354 91 8351 396052 2.07 404403 92 8021 383049 2.05 391070 93 8111 375748 2.11 383859 94 7860 366737 2.10 374597 95 7611 353350 2.11 360961 96 7450 345598 2.11 353048 97 7305 337095 2.12 344400 98 7199 325936 2.16 333135 99 6957 319304 2.13 326261 100 6871 310401 2.17 317272 101 6723 303614 2.17 310337 102 6436 298586 2.11 305022 103 6350 286260 2.17 292610 104 6186 276688 2.19 282874 105 5984 270633 2.16 276617 106 5937 262522 2.21 268459 107 5667 255282 2.17 260949 108 5645 248133 2.22 253778 109 5621 242845 2.26 248466 110 5472 234978 2.28 240450 111 5193 228646 2.22 233839 112 5148 223462 2.25 228610 113 5001 216148 2.26 221149 114 4853 209991 2.26 214844 115 4791 204835 2.29 209626 116 4573 198199 2.26 202772 117 4552 193640 2.30 198192 118 4603 187395 2.40 191998 119 4247 181073 2.29 185320 120 4337 177305 2.39 181642 121 4062 172745 2.30 176807 122 3985 166540 2.34 170525 123 4063 163310 2.43 167373 124 3770 158202 2.33 161972 125 3734 153390 2.38 157124 126 3695 148306 2.43 152001 127 3477 145703 2.33 149180 128 3458 141211 2.39 144669 129 3389 137635 2.40 141024 130 3322 132005 2.45 135327 131 3190 128262 2.43 131452 132 3132 125567 2.43 128699 133 3047 121802 2.44 124849 134 2907 117409 2.42 120316 135 2900 114777 2.46 117677 136 2705 111375 2.37 114080 137 2734 109297 2.44 112031 138 2560 104305 2.40 106865 139 2584 102342 2.46 104926 140 2474 99175 2.43 101649 141 2381 95820 2.42 98201 142 2371 92991 2.49 95362 143 2222 89937 2.41 92159 144 2219 87882 2.46 90101 145 2152 85732 2.45 87884 146 2166 83053 2.54 85219 147 1989 81562 2.38 83551 148 2082 79033 2.57 81115 149 2207 77623 2.76 79830 150 2107 75424 2.72 77531 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 580522 1714229 25.30 2294751 2 433486 2137748 16.86 2571234 3 330400 2119266 13.49 2449666 4 302342 2001608 13.12 2303950 5 158199 2392958 6.20 2551157 6 129384 2609823 4.72 2739207 7 130109 2924629 4.26 3054738 8 120823 2937458 3.95 3058281 9 113510 2764502 3.94 2878012 10 105606 2705416 3.76 2811022 11 112280 2676820 4.03 2789100 12 99038 2675668 3.57 2774706 13 101326 2702539 3.61 2803865 14 96769 2662225 3.51 2758994 15 100582 2620171 3.70 2720753 16 96314 2620352 3.55 2716666 17 97154 2599538 3.60 2696692 18 89308 2615201 3.30 2704509 19 96441 2615278 3.56 2711719 20 90784 2648875 3.31 2739659 21 90761 2615254 3.35 2706015 22 87765 2637276 3.22 2725041 23 91501 2651140 3.34 2742641 24 83359 2632797 3.07 2716156 25 88376 2659611 3.22 2747987 26 84122 2680206 3.04 2764328 27 85376 2692225 3.07 2777601 28 80883 2735559 2.87 2816442 29 84012 2746646 2.97 2830658 30 77929 2736735 2.77 2814664 31 80306 2733767 2.85 2814073 32 75677 2715253 2.71 2790930 33 74706 2719702 2.67 2794408 34 70599 2716003 2.53 2786602 35 71653 2704501 2.58 2776154 36 64941 2710465 2.34 2775406 37 67745 2716129 2.43 2783874 38 63663 2699913 2.30 2763576 39 65138 2678847 2.37 2743985 40 59795 2666109 2.19 2725904 41 62195 2691821 2.26 2754016 42 57460 2658042 2.12 2715502 43 61159 2650729 2.26 2711888 44 58059 2648864 2.14 2706923 45 59047 2638854 2.19 2697901 46 57057 2623676 2.13 2680733 47 59581 2612266 2.23 2671847 48 54661 2576424 2.08 2631085 49 56700 2567677 2.16 2624377 50 55513 2555128 2.13 2610641 51 56695 2530268 2.19 2586963 52 53754 2502518 2.10 2556272 53 55085 2479074 2.17 2534159 54 52398 2445054 2.10 2497452 55 53346 2414915 2.16 2468261 56 51786 2398429 2.11 2450215 57 52288 2356637 2.17 2408925 58 51117 2337108 2.14 2388225 59 52713 2308869 2.23 2361582 60 48820 2256462 2.12 2305282 61 49273 2228566 2.16 2277839 62 48077 2208874 2.13 2256951 63 47733 2155818 2.17 2203551 64 46410 2125981 2.14 2172391 65 47540 2092197 2.22 2139737 66 44974 2063301 2.13 2108275 67 45958 2039983 2.20 2085941 68 43882 1995515 2.15 2039397 69 43624 1971839 2.16 2015463 70 43293 1941441 2.18 1984734 71 43668 1895839 2.25 1939507 72 41738 1862176 2.19 1903914 73 41644 1837364 2.22 1879008 74 40975 1810901 2.21 1851876 75 40231 1765452 2.23 1805683 76 39017 1725149 2.21 1764166 77 39375 1697001 2.27 1736376 78 38058 1670875 2.23 1708933 79 38128 1630385 2.29 1668513 80 37024 1590687 2.27 1627711 81 35999 1557899 2.26 1593898 82 35440 1526161 2.27 1561601 83 35652 1486694 2.34 1522346 84 33728 1447755 2.28 1481483 85 33701 1414256 2.33 1447957 86 32649 1389288 2.30 1421937 87 32242 1354654 2.32 1386896 88 31330 1325330 2.31 1356660 89 31794 1295501 2.40 1327295 90 30491 1261843 2.36 1292334 91 30278 1234596 2.39 1264874 92 29610 1205717 2.40 1235327 93 28599 1176434 2.37 1205033 94 28334 1151763 2.40 1180097 95 27854 1124908 2.42 1152762 96 27134 1099318 2.41 1126452 97 26746 1075219 2.43 1101965 98 26350 1041697 2.47 1068047 99 25829 1010792 2.49 1036621 100 25067 988030 2.47 1013097 101 24376 963455 2.47 987831 102 23544 943286 2.44 966830 103 23384 920487 2.48 943871 104 22770 895632 2.48 918402 105 22531 874503 2.51 897034 106 21622 847021 2.49 868643 107 21639 819918 2.57 841557 108 20677 800878 2.52 821555 109 20623 777084 2.59 797707 110 19887 758177 2.56 778064 111 19265 742669 2.53 761934 112 18897 722673 2.55 741570 113 18319 700839 2.55 719158 114 18131 684049 2.58 702180 115 17552 664847 2.57 682399 116 17167 643913 2.60 661080 117 16707 627217 2.59 643924 118 16345 609454 2.61 625799 119 16148 592797 2.65 608945 120 15740 576903 2.66 592643 121 15257 560020 2.65 575277 122 14846 544405 2.65 559251 123 14363 526826 2.65 541189 124 14144 512057 2.69 526201 125 13561 497787 2.65 511348 126 13135 485543 2.63 498678 127 12770 470854 2.64 483624 128 12608 457692 2.68 470300 129 12252 444032 2.69 456284 130 11931 432508 2.68 444439 131 11806 419994 2.73 431800 132 11202 409300 2.66 420502 133 11022 397267 2.70 408289 134 10775 386107 2.71 396882 135 10442 375609 2.70 386051 136 10360 365174 2.76 375534 137 9987 355821 2.73 365808 138 9746 345948 2.74 355694 139 9426 335243 2.73 344669 140 9074 325301 2.71 334375 141 8881 315759 2.74 324640 142 8797 306255 2.79 315052 143 8449 296890 2.77 305339 144 8119 289589 2.73 297708 145 8101 282439 2.79 290540 146 7765 276494 2.73 284259 147 7771 270586 2.79 278357 148 7892 262720 2.92 270612 149 8217 257534 3.09 265751 150 8021 249030 3.12 257051 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9867 34406 22.29 44273 2 9403 48733 16.17 58136 3 6826 62318 9.87 69144 4 6213 47127 11.65 53340 5 5220 59619 8.05 64839 6 3910 39151 9.08 43061 7 4110 35306 10.43 39416 8 4512 37214 10.81 41726 9 4709 35844 11.61 40553 10 4480 34220 11.58 38700 11 5042 34020 12.91 39062 12 5754 33384 14.70 39138 13 5012 32386 13.40 37398 14 4604 31337 12.81 35941 15 4602 30282 13.19 34884 16 4473 29987 12.98 34460 17 4678 30738 13.21 35416 18 4329 28853 13.05 33182 19 4152 27161 13.26 31313 20 3964 27617 12.55 31581 21 4019 26431 13.20 30450 22 4119 26482 13.46 30601 23 3935 24934 13.63 28869 24 3736 24828 13.08 28564 25 3812 24483 13.47 28295 26 3481 23568 12.87 27049 27 3445 22714 13.17 26159 28 3354 21922 13.27 25276 29 3287 21594 13.21 24881 30 3200 21234 13.10 24434 31 3148 20332 13.41 23480 32 3070 19721 13.47 22791 33 2874 19666 12.75 22540 34 2824 18960 12.96 21784 35 2785 18539 13.06 21324 36 2653 18758 12.39 21411 37 2598 17027 13.24 19625 38 2501 16529 13.14 19030 39 2493 16322 13.25 18815 40 2456 15423 13.74 17879 41 2435 15641 13.47 18076 42 2387 15259 13.53 17646 43 2279 14862 13.30 17141 44 2361 14173 14.28 16534 45 2061 13921 12.90 15982 46 2024 13763 12.82 15787 47 2000 13192 13.16 15192 48 1904 13012 12.76 14916 49 1891 12192 13.43 14083 50 1857 12314 13.10 14171 51 1758 11790 12.98 13548 52 1678 11561 12.67 13239 53 1669 11636 12.54 13305 54 1593 10606 13.06 12199 55 1559 10724 12.69 12283 56 1497 10597 12.38 12094 57 1565 10303 13.19 11868 58 1432 9902 12.63 11334 59 1365 9370 12.72 10735 60 1411 9347 13.12 10758 61 1240 9004 12.10 10244 62 1231 8448 12.72 9679 63 1215 8145 12.98 9360 64 1219 7949 13.30 9168 65 1166 8065 12.63 9231 66 1105 7645 12.63 8750 67 1138 7688 12.89 8826 68 1085 7567 12.54 8652 69 972 7120 12.01 8092 70 976 6926 12.35 7902 71 980 6623 12.89 7603 72 923 6335 12.72 7258 73 933 6245 13.00 7178 74 907 6187 12.79 7094 75 806 5913 12.00 6719 76 830 5772 12.57 6602 77 820 5728 12.52 6548 78 763 5373 12.43 6136 79 726 5411 11.83 6137 80 766 5588 12.06 6354 81 766 5353 12.52 6119 82 713 5118 12.23 5831 83 751 4953 13.17 5704 84 698 4947 12.36 5645 85 726 4894 12.92 5620 86 624 4836 11.43 5460 87 579 4387 11.66 4966 88 579 4337 11.78 4916 89 642 4230 13.18 4872 90 571 4138 12.13 4709 91 587 3828 13.30 4415 92 540 3565 13.15 4105 93 565 3712 13.21 4277 94 494 3248 13.20 3742 95 437 3081 12.42 3518 96 436 3187 12.03 3623 97 379 2775 12.02 3154 98 451 2897 13.47 3348 99 438 2781 13.61 3219 100 370 2655 12.23 3025 101 399 2535 13.60 2934 102 399 2507 13.73 2906 103 372 2310 13.87 2682 104 387 2235 14.76 2622 105 366 2049 15.16 2415 106 299 1996 13.03 2295 107 317 2055 13.36 2372 108 308 2015 13.26 2323 109 337 1962 14.66 2299 110 322 1791 15.24 2113 111 276 1767 13.51 2043 112 289 1662 14.81 1951 113 283 1617 14.89 1900 114 232 1593 12.71 1825 115 285 1447 16.45 1732 116 257 1500 14.63 1757 117 225 1450 13.43 1675 118 218 1404 13.44 1622 119 237 1399 14.49 1636 120 221 1222 15.32 1443 121 208 1269 14.08 1477 122 189 1134 14.29 1323 123 190 1108 14.64 1298 124 211 1110 15.97 1321 125 221 1115 16.54 1336 126 191 1101 14.78 1292 127 153 995 13.33 1148 128 158 960 14.13 1118 129 174 946 15.54 1120 130 136 890 13.26 1026 131 166 848 16.37 1014 132 137 865 13.67 1002 133 140 735 16.00 875 134 142 754 15.85 896 135 121 758 13.77 879 136 122 758 13.86 880 137 136 663 17.02 799 138 130 673 16.19 803 139 146 680 17.68 826 140 107 613 14.86 720 141 91 611 12.96 702 142 89 608 12.77 697 143 108 582 15.65 690 144 97 584 14.24 681 145 101 535 15.88 636 146 89 638 12.24 727 147 113 592 16.03 705 148 88 511 14.69 599 149 76 484 13.57 560 150 76 467 14.00 543 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 16033 156276 9.30 172309 2 8103 58046 12.25 66149 3 5913 68526 7.94 74439 4 5072 59657 7.84 64729 5 1617 79840 1.99 81457 6 1542 92889 1.63 94431 7 1259 60672 2.03 61931 8 1271 59073 2.11 60344 9 1175 59386 1.94 60561 10 1319 54849 2.35 56168 11 2008 52169 3.71 54177 12 1066 54024 1.94 55090 13 1014 52113 1.91 53127 14 870 49143 1.74 50013 15 969 47625 1.99 48594 16 993 46265 2.10 47258 17 789 47134 1.65 47923 18 760 47206 1.58 47966 19 702 44213 1.56 44915 20 712 42916 1.63 43628 21 655 41690 1.55 42345 22 633 41453 1.50 42086 23 579 40849 1.40 41428 24 583 38880 1.48 39463 25 536 38699 1.37 39235 26 493 37128 1.31 37621 27 525 36964 1.40 37489 28 429 36876 1.15 37305 29 492 35947 1.35 36439 30 409 35239 1.15 35648 31 440 32916 1.32 33356 32 398 31502 1.25 31900 33 378 32483 1.15 32861 34 387 31470 1.21 31857 35 336 30397 1.09 30733 36 362 29151 1.23 29513 37 362 29395 1.22 29757 38 342 27974 1.21 28316 39 340 27706 1.21 28046 40 303 26578 1.13 26881 41 308 25818 1.18 26126 42 302 25544 1.17 25846 43 300 24416 1.21 24716 44 287 23172 1.22 23459 45 282 23282 1.20 23564 46 295 22800 1.28 23095 47 290 21116 1.35 21406 48 285 20924 1.34 21209 49 292 20692 1.39 20984 50 263 19992 1.30 20255 51 291 19616 1.46 19907 52 256 18884 1.34 19140 53 239 18613 1.27 18852 54 239 17729 1.33 17968 55 236 17639 1.32 17875 56 233 16809 1.37 17042 57 265 16699 1.56 16964 58 238 15804 1.48 16042 59 218 15734 1.37 15952 60 229 15015 1.50 15244 61 204 15081 1.33 15285 62 217 14470 1.48 14687 63 212 14115 1.48 14327 64 186 13211 1.39 13397 65 195 13136 1.46 13331 66 168 12921 1.28 13089 67 181 12791 1.40 12972 68 170 12767 1.31 12937 69 179 12268 1.44 12447 70 177 11554 1.51 11731 71 171 11288 1.49 11459 72 165 11067 1.47 11232 73 157 10665 1.45 10822 74 170 10738 1.56 10908 75 155 9872 1.55 10027 76 171 9638 1.74 9809 77 161 9453 1.67 9614 78 153 8911 1.69 9064 79 122 8812 1.37 8934 80 117 8434 1.37 8551 81 122 8601 1.40 8723 82 131 7973 1.62 8104 83 112 7553 1.46 7665 84 105 7237 1.43 7342 85 124 7534 1.62 7658 86 103 6925 1.47 7028 87 118 6882 1.69 7000 88 111 6531 1.67 6642 89 121 6648 1.79 6769 90 111 6782 1.61 6893 91 112 6137 1.79 6249 92 115 5828 1.94 5943 93 120 5644 2.08 5764 94 102 5531 1.81 5633 95 86 5118 1.65 5204 96 88 4993 1.73 5081 97 79 4773 1.63 4852 98 77 4451 1.70 4528 99 90 4481 1.97 4571 100 85 4260 1.96 4345 101 70 4217 1.63 4287 102 73 4290 1.67 4363 103 77 3860 1.96 3937 104 80 3641 2.15 3721 105 59 3556 1.63 3615 106 70 3308 2.07 3378 107 53 3324 1.57 3377 108 77 3232 2.33 3309 109 82 3144 2.54 3226 110 75 2937 2.49 3012 111 67 2961 2.21 3028 112 45 2935 1.51 2980 113 41 2709 1.49 2750 114 36 2539 1.40 2575 115 38 2542 1.47 2580 116 52 2460 2.07 2512 117 44 2448 1.77 2492 118 40 2294 1.71 2334 119 47 2234 2.06 2281 120 42 2125 1.94 2167 121 41 2166 1.86 2207 122 29 2034 1.41 2063 123 38 1997 1.87 2035 124 31 1891 1.61 1922 125 28 1844 1.50 1872 126 20 1845 1.07 1865 127 34 1773 1.88 1807 128 27 1757 1.51 1784 129 27 1696 1.57 1723 130 26 1601 1.60 1627 131 21 1531 1.35 1552 132 23 1522 1.49 1545 133 22 1554 1.40 1576 134 23 1419 1.60 1442 135 22 1298 1.67 1320 136 20 1353 1.46 1373 137 28 1362 2.01 1390 138 26 1259 2.02 1285 139 24 1252 1.88 1276 140 17 1134 1.48 1151 141 20 1101 1.78 1121 142 21 1064 1.94 1085 143 19 1052 1.77 1071 144 15 1056 1.40 1071 145 27 1115 2.36 1142 146 13 1016 1.26 1029 147 23 1031 2.18 1054 148 19 941 1.98 960 149 25 893 2.72 918 150 16 903 1.74 919 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 40133 156147 20.45 196280 2 31334 203062 13.37 234396 3 23755 184419 11.41 208174 4 21214 161740 11.60 182954 5 10787 195997 5.22 206784 6 9286 207648 4.28 216934 7 9092 229665 3.81 238757 8 8855 223805 3.81 232660 9 7459 203111 3.54 210570 10 7017 195077 3.47 202094 11 7626 183814 3.98 191440 12 6497 178982 3.50 185479 13 6531 179483 3.51 186014 14 6054 171074 3.42 177128 15 6300 163108 3.72 169408 16 6162 156619 3.79 162781 17 5760 153557 3.62 159317 18 5104 151824 3.25 156928 19 5474 148867 3.55 154341 20 4715 145692 3.13 150407 21 4933 136443 3.49 141376 22 4434 136869 3.14 141303 23 4836 133179 3.50 138015 24 4070 129116 3.06 133186 25 4516 127682 3.42 132198 26 4043 125086 3.13 129129 27 4134 122770 3.26 126904 28 3754 122894 2.96 126648 29 4010 118925 3.26 122935 30 3526 116154 2.95 119680 31 3684 112633 3.17 116317 32 3562 108885 3.17 112447 33 3328 106791 3.02 110119 34 3280 104153 3.05 107433 35 3363 100404 3.24 103767 36 3063 98594 3.01 101657 37 3278 96485 3.29 99763 38 3102 92755 3.24 95857 39 3092 91197 3.28 94289 40 2802 87222 3.11 90024 41 2917 86044 3.28 88961 42 2578 82203 3.04 84781 43 2922 80772 3.49 83694 44 2622 79012 3.21 81634 45 2704 77741 3.36 80445 46 2611 75010 3.36 77621 47 2670 73807 3.49 76477 48 2343 70419 3.22 72762 49 2450 69254 3.42 71704 50 2380 68018 3.38 70398 51 2439 65764 3.58 68203 52 2226 63033 3.41 65259 53 2300 60766 3.65 63066 54 2116 59316 3.44 61432 55 2173 57582 3.64 59755 56 2107 56042 3.62 58149 57 1987 54341 3.53 56328 58 2051 52899 3.73 54950 59 2211 52324 4.05 54535 60 1799 49486 3.51 51285 61 1858 48377 3.70 50235 62 1816 47630 3.67 49446 63 1723 45653 3.64 47376 64 1705 43771 3.75 45476 65 1825 42593 4.11 44418 66 1540 41662 3.56 43202 67 1693 41454 3.92 43147 68 1482 39444 3.62 40926 69 1507 39019 3.72 40526 70 1512 37574 3.87 39086 71 1561 36250 4.13 37811 72 1359 35411 3.70 36770 73 1357 34673 3.77 36030 74 1370 33965 3.88 35335 75 1235 32444 3.67 33679 76 1220 31299 3.75 32519 77 1196 30493 3.77 31689 78 1127 30208 3.60 31335 79 1176 29511 3.83 30687 80 1085 28271 3.70 29356 81 1057 27198 3.74 28255 82 1089 26683 3.92 27772 83 1128 25322 4.26 26450 84 929 24351 3.67 25280 85 951 23606 3.87 24557 86 901 22963 3.78 23864 87 910 22333 3.92 23243 88 870 21804 3.84 22674 89 950 21152 4.30 22102 90 759 20279 3.61 21038 91 819 20051 3.92 20870 92 801 19295 3.99 20096 93 767 18456 3.99 19223 94 722 18083 3.84 18805 95 766 17618 4.17 18384 96 701 17582 3.83 18283 97 674 17429 3.72 18103 98 712 16056 4.25 16768 99 634 15662 3.89 16296 100 617 14884 3.98 15501 101 585 14632 3.84 15217 102 571 14345 3.83 14916 103 572 13969 3.93 14541 104 539 13402 3.87 13941 105 551 12990 4.07 13541 106 518 12397 4.01 12915 107 463 11989 3.72 12452 108 470 11664 3.87 12134 109 457 11118 3.95 11575 110 434 10915 3.82 11349 111 411 10979 3.61 11390 112 406 10489 3.73 10895 113 421 10119 3.99 10540 114 400 9727 3.95 10127 115 366 9606 3.67 9972 116 382 9246 3.97 9628 117 317 8785 3.48 9102 118 307 8382 3.53 8689 119 334 8162 3.93 8496 120 310 7844 3.80 8154 121 286 7745 3.56 8031 122 273 7316 3.60 7589 123 268 7036 3.67 7304 124 251 6703 3.61 6954 125 268 6729 3.83 6997 126 225 6386 3.40 6611 127 245 6250 3.77 6495 128 227 6000 3.65 6227 129 225 5836 3.71 6061 130 214 5633 3.66 5847 131 203 5492 3.56 5695 132 189 5278 3.46 5467 133 178 5167 3.33 5345 134 175 4962 3.41 5137 135 202 4926 3.94 5128 136 167 4731 3.41 4898 137 175 4628 3.64 4803 138 172 4582 3.62 4754 139 169 4534 3.59 4703 140 156 4341 3.47 4497 141 147 4254 3.34 4401 142 133 4012 3.21 4145 143 152 4012 3.65 4164 144 126 3836 3.18 3962 145 144 3757 3.69 3901 146 133 3726 3.45 3859 147 155 3658 4.07 3813 148 115 3522 3.16 3637 149 127 3423 3.58 3550 150 137 3264 4.03 3401