S4 generic functions used in Bioconductor
The package defines many S4 generic functions used in Bioconductor.
R (>= 4.0.0), methods, utils, graphics, stats
Biobase, S4Vectors, IRanges, GenomicRanges, DelayedArray,
Biostrings, Rsamtools, AnnotationDbi, affy, affyPLM, DESeq2,
flowClust, MSnbase, annotate, RUnit
S3-classes-as-S4-classes.R utils.R normarg-utils.R
replaceSlots.R aperm.R append.R as.data.frame.R as.list.R
as.vector.R cbind.R colSums.R do.call.R duplicated.R eval.R
Extremes.R format.R funprog.R get.R grep.R is.unsorted.R
lapply.R mapply.R match.R mean.R nrow.R order.R paste.R rank.R
rep.R row_colnames.R sets.R sort.R start.R subset.R t.R table.R
tapply.R unique.R unlist.R unsplit.R relist.R var.R which.R
which.min.R boxplot.R image.R density.R IQR.R mad.R residuals.R
weights.R xtabs.R annotation.R combine.R dbconn.R dge.R dims.R
fileName.R normalize.R Ontology.R organism_species.R path.R
plotMA.R plotPCA.R score.R strand.R toTable.R type.R
updateObject.R testPackage.R zzz.R