%%{
init: {
'theme': 'base',
'themeVariables': {
'primaryColor': '#B6ECE2',
'primaryTextColor': '#160F26',
'primaryBorderColor': '#065647',
'lineColor': '#545555',
'clusterBkg': '#BABCBD22',
'clusterBorder': '#DDDEDE',
'fontFamily': 'arial'
}
}
}%%
flowchart TB
subgraph " "
v0["Channel.of"]
v1["Channel.of"]
v5["Channel.from"]
v6[" "]
v7[" "]
v24[" "]
v25[" "]
v35[" "]
v36[" "]
v48["ch_logfc"]
v49["ch_padj"]
v83["Channel.of"]
v86["Channel.from"]
v88["Channel.from"]
v89["Channel.from"]
v90["Channel.from"]
v115["contrast_stats_assay"]
end
subgraph "NFCORE_DIFFERENTIALABUNDANCE [NFCORE_DIFFERENTIALABUNDANCE]"
subgraph "NFCORE_DIFFERENTIALABUNDANCE:DIFFERENTIALABUNDANCE [DIFFERENTIALABUNDANCE]"
v8(["GTF_TO_TABLE"])
v13(["VALIDATOR"])
v17(["CUSTOM_MATRIXFILTER"])
v26(["DESEQ2_NORM"])
v37(["DESEQ2_DIFFERENTIAL"])
v50(["FILTER_DIFFTABLE"])
v62(["PLOT_EXPLORATORY"])
v74(["PLOT_DIFFERENTIAL"])
v116(["SHINYNGS_APP"])
v121(["RMARKDOWNNOTEBOOK"])
v128(["MAKE_REPORT_BUNDLE"])
v10(( ))
v11(( ))
v12(( ))
v21(( ))
v87(( ))
v105(( ))
end
end
subgraph " "
v9[" "]
v18[" "]
v19[" "]
v20[" "]
v27[" "]
v28[" "]
v29[" "]
v30[" "]
v31[" "]
v32[" "]
v33[" "]
v34[" "]
v38[" "]
v39[" "]
v40[" "]
v41[" "]
v42[" "]
v43[" "]
v44[" "]
v51[" "]
v52[" "]
v63[" "]
v64[" "]
v65[" "]
v66[" "]
v67[" "]
v68[" "]
v69[" "]
v70[" "]
v71[" "]
v72[" "]
v73[" "]
v75[" "]
v76[" "]
v117[" "]
v119["ch_versions"]
v122[" "]
v123[" "]
v124[" "]
v125[" "]
v129[" "]
v130[" "]
end
v0 --> v12
v1 --> v12
v5 --> v13
v6 --> v8
v7 --> v8
v8 --> v9
v8 --> v10
v8 --> v11
v10 --> v13
v12 --> v13
v13 --> v17
v13 --> v11
v13 --> v21
v17 --> v20
v17 --> v19
v17 --> v18
v17 --> v21
v24 --> v26
v25 --> v26
v11 --> v26
v21 --> v26
v26 --> v34
v26 --> v33
v26 --> v32
v26 --> v31
v26 --> v30
v26 --> v29
v26 --> v28
v26 --> v27
v26 --> v11
v35 --> v37
v36 --> v37
v11 --> v37
v21 --> v37
v37 --> v50
v37 --> v44
v37 --> v43
v37 --> v42
v37 --> v41
v37 --> v40
v37 --> v39
v37 --> v38
v37 --> v74
v37 --> v11
v37 --> v105
v48 --> v50
v49 --> v50
v50 --> v52
v50 --> v51
v11 --> v62
v62 --> v73
v62 --> v72
v62 --> v71
v62 --> v70
v62 --> v69
v62 --> v68
v62 --> v67
v62 --> v66
v62 --> v65
v62 --> v64
v62 --> v63
v62 --> v11
v11 --> v74
v74 --> v76
v74 --> v75
v74 --> v11
v83 --> v11
v86 --> v87
v88 --> v11
v89 --> v11
v90 --> v11
v115 --> v116
v11 --> v116
v105 --> v116
v116 --> v117
v116 --> v11
v11 --> v119
v11 --> v121
v87 --> v121
v121 --> v125
v121 --> v124
v121 --> v123
v121 --> v122
v121 --> v11
v11 --> v128
v128 --> v130
v128 --> v129