CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 79 147 34.96 226 2 50 146 25.51 196 3 62 122 33.70 184 4 63 127 33.16 190 5 75 97 43.60 172 6 58 83 41.13 141 7 69 86 44.52 155 8 39 95 29.10 134 9 23 105 17.97 128 10 30 112 21.13 142 11 32 98 24.62 130 12 25 94 21.01 119 13 27 93 22.50 120 14 29 106 21.48 135 15 29 94 23.58 123 16 22 116 15.94 138 17 35 99 26.12 134 18 34 94 26.56 128 19 29 107 21.32 136 20 14 122 10.29 136 21 28 96 22.58 124 22 28 111 20.14 139 23 20 88 18.52 108 24 21 106 16.54 127 25 20 99 16.81 119 26 19 112 14.50 131 27 27 105 20.45 132 28 22 109 16.79 131 29 18 111 13.95 129 30 29 102 22.14 131 31 30 118 20.27 148 32 26 88 22.81 114 33 24 114 17.39 138 34 18 90 16.67 108 35 17 103 14.17 120 36 22 123 15.17 145 37 23 113 16.91 136 38 21 88 19.27 109 39 28 95 22.76 123 40 30 91 24.79 121 41 32 105 23.36 137 42 20 97 17.09 117 43 31 101 23.48 132 44 23 90 20.35 113 45 26 94 21.67 120 46 20 101 16.53 121 47 25 96 20.66 121 48 24 94 20.34 118 49 28 89 23.93 117 50 26 91 22.22 117 51 32 86 27.12 118 52 29 103 21.97 132 53 28 84 25.00 112 54 22 118 15.71 140 55 26 100 20.63 126 56 18 105 14.63 123 57 19 97 16.38 116 58 18 97 15.65 115 59 18 104 14.75 122 60 28 85 24.78 113 61 21 86 19.63 107 62 19 90 17.43 109 63 36 103 25.90 139 64 15 97 13.39 112 65 19 95 16.67 114 66 28 80 25.93 108 67 25 79 24.04 104 68 20 112 15.15 132 69 25 85 22.73 110 70 27 76 26.21 103 71 20 74 21.28 94 72 23 61 27.38 84 73 14 76 15.56 90 74 26 88 22.81 114 75 16 78 17.02 94 76 17 80 17.53 97 77 23 90 20.35 113 78 22 99 18.18 121 79 15 86 14.85 101 80 14 79 15.05 93 81 25 68 26.88 93 82 27 63 30.00 90 83 19 95 16.67 114 84 17 77 18.09 94 85 21 67 23.86 88 86 15 69 17.86 84 87 13 75 14.77 88 88 18 93 16.22 111 89 19 75 20.21 94 90 17 74 18.68 91 91 22 63 25.88 85 92 12 57 17.39 69 93 14 78 15.22 92 94 19 71 21.11 90 95 16 67 19.28 83 96 24 65 26.97 89 97 23 77 23.00 100 98 13 45 22.41 58 99 12 45 21.05 57 100 9 53 14.52 62 101 15 62 19.48 77 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 93 164 36.19 257 2 60 147 28.99 207 3 33 154 17.65 187 4 13 136 8.72 149 5 18 158 10.23 176 6 11 143 7.14 154 7 4 175 2.23 179 8 6 168 3.45 174 9 3 185 1.60 188 10 5 195 2.50 200 11 3 173 1.70 176 12 6 198 2.94 204 13 1 155 0.64 156 14 4 183 2.14 187 15 2 176 1.12 178 16 2 161 1.23 163 17 4 165 2.37 169 18 0 171 0.00 171 19 1 165 0.60 166 20 1 172 0.58 173 21 2 192 1.03 194 22 3 166 1.78 169 23 2 180 1.10 182 24 3 196 1.51 199 25 4 167 2.34 171 26 4 176 2.22 180 27 4 179 2.19 183 28 2 182 1.09 184 29 2 168 1.18 170 30 4 194 2.02 198 31 2 179 1.10 181 32 2 175 1.13 177 33 3 165 1.79 168 34 1 182 0.55 183 35 3 164 1.80 167 36 0 188 0.00 188 37 2 171 1.16 173 38 4 169 2.31 173 39 2 190 1.04 192 40 1 195 0.51 196 41 2 180 1.10 182 42 1 178 0.56 179 43 5 168 2.89 173 44 1 151 0.66 152 45 1 162 0.61 163 46 3 169 1.74 172 47 6 187 3.11 193 48 2 193 1.03 195 49 2 181 1.09 183 50 1 170 0.58 171 51 1 175 0.57 176 52 2 159 1.24 161 53 6 184 3.16 190 54 5 217 2.25 222 55 1 181 0.55 182 56 4 176 2.22 180 57 1 185 0.54 186 58 1 181 0.55 182 59 0 177 0.00 177 60 2 174 1.14 176 61 6 161 3.59 167 62 1 183 0.54 184 63 1 166 0.60 167 64 3 168 1.75 171 65 3 179 1.65 182 66 3 153 1.92 156 67 5 145 3.33 150 68 2 148 1.33 150 69 2 145 1.36 147 70 1 161 0.62 162 71 4 161 2.42 165 72 3 154 1.91 157 73 1 141 0.70 142 74 2 148 1.33 150 75 2 160 1.23 162 76 1 150 0.66 151 77 2 133 1.48 135 78 2 144 1.37 146 79 1 135 0.74 136 80 3 128 2.29 131 81 2 128 1.54 130 82 2 134 1.47 136 83 2 144 1.37 146 84 2 139 1.42 141 85 1 155 0.64 156 86 3 136 2.16 139 87 6 142 4.05 148 88 3 130 2.26 133 89 2 126 1.56 128 90 3 115 2.54 118 91 2 129 1.53 131 92 1 133 0.75 134 93 2 127 1.55 129 94 2 136 1.45 138 95 2 118 1.67 120 96 2 118 1.67 120 97 4 104 3.70 108 98 3 111 2.63 114 99 1 65 1.52 66 100 2 67 2.90 69 101 2 99 1.98 101 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 165 273 37.67 438 2 146 264 35.61 410 3 98 272 26.49 370 4 93 335 21.73 428 5 90 344 20.74 434 6 76 370 17.04 446 7 92 530 14.79 622 8 71 554 11.36 625 9 53 495 9.67 548 10 67 490 12.03 557 11 76 509 12.99 585 12 61 444 12.08 505 13 74 497 12.96 571 14 76 484 13.57 560 15 76 508 13.01 584 16 80 506 13.65 586 17 61 561 9.81 622 18 62 528 10.51 590 19 73 549 11.74 622 20 67 562 10.65 629 21 69 595 10.39 664 22 69 579 10.65 648 23 72 611 10.54 683 24 68 545 11.09 613 25 71 613 10.38 684 26 68 585 10.41 653 27 64 564 10.19 628 28 63 599 9.52 662 29 57 613 8.51 670 30 56 546 9.30 602 31 65 574 10.17 639 32 60 567 9.57 627 33 54 556 8.85 610 34 68 570 10.66 638 35 50 584 7.89 634 36 53 574 8.45 627 37 56 580 8.81 636 38 65 630 9.35 695 39 54 588 8.41 642 40 41 574 6.67 615 41 45 592 7.06 637 42 45 551 7.55 596 43 49 561 8.03 610 44 45 576 7.25 621 45 38 611 5.86 649 46 41 595 6.45 636 47 47 603 7.23 650 48 36 551 6.13 587 49 56 557 9.14 613 50 43 539 7.39 582 51 42 538 7.24 580 52 42 541 7.20 583 53 43 550 7.25 593 54 35 531 6.18 566 55 49 504 8.86 553 56 38 515 6.87 553 57 36 570 5.94 606 58 37 532 6.50 569 59 37 533 6.49 570 60 32 551 5.49 583 61 45 492 8.38 537 62 29 485 5.64 514 63 36 475 7.05 511 64 41 492 7.69 533 65 25 482 4.93 507 66 33 495 6.25 528 67 40 479 7.71 519 68 34 474 6.69 508 69 21 452 4.44 473 70 32 475 6.31 507 71 21 457 4.39 478 72 24 460 4.96 484 73 30 445 6.32 475 74 22 460 4.56 482 75 23 432 5.05 455 76 26 489 5.05 515 77 26 430 5.70 456 78 27 420 6.04 447 79 26 406 6.02 432 80 25 437 5.41 462 81 29 412 6.58 441 82 23 418 5.22 441 83 22 398 5.24 420 84 20 400 4.76 420 85 24 429 5.30 453 86 21 432 4.64 453 87 17 376 4.33 393 88 25 403 5.84 428 89 29 353 7.59 382 90 20 383 4.96 403 91 20 335 5.63 355 92 23 374 5.79 397 93 19 355 5.08 374 94 20 348 5.43 368 95 23 373 5.81 396 96 24 347 6.47 371 97 26 348 6.95 374 98 16 338 4.52 354 99 13 248 4.98 261 100 16 201 7.37 217 101 14 336 4.00 350 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 58 88 39.73 146 2 49 71 40.83 120 3 59 81 42.14 140 4 50 102 32.89 152 5 18 95 15.93 113 6 9 67 11.84 76 7 9 68 11.69 77 8 9 64 12.33 73 9 8 74 9.76 82 10 12 64 15.79 76 11 14 42 25.00 56 12 10 63 13.70 73 13 10 53 15.87 63 14 6 59 9.23 65 15 15 61 19.74 76 16 11 49 18.33 60 17 6 58 9.38 64 18 4 50 7.41 54 19 9 47 16.07 56 20 14 73 16.09 87 21 9 39 18.75 48 22 15 50 23.08 65 23 10 44 18.52 54 24 8 49 14.04 57 25 17 45 27.42 62 26 8 47 14.55 55 27 18 52 25.71 70 28 12 40 23.08 52 29 7 43 14.00 50 30 12 44 21.43 56 31 11 45 19.64 56 32 7 47 12.96 54 33 7 36 16.28 43 34 11 50 18.03 61 35 12 55 17.91 67 36 11 31 26.19 42 37 11 44 20.00 55 38 11 48 18.64 59 39 13 37 26.00 50 40 11 43 20.37 54 41 11 34 24.44 45 42 9 46 16.36 55 43 10 37 21.28 47 44 7 43 14.00 50 45 13 42 23.64 55 46 8 36 18.18 44 47 9 44 16.98 53 48 8 30 21.05 38 49 9 49 15.52 58 50 11 32 25.58 43 51 5 23 17.86 28 52 6 32 15.79 38 53 7 28 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