CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 94 168 35.88 262 2 88 161 35.34 249 3 71 137 34.13 208 4 93 119 43.87 212 5 93 104 47.21 197 6 86 104 45.26 190 7 86 72 54.43 158 8 42 109 27.81 151 9 27 87 23.68 114 10 36 110 24.66 146 11 40 115 25.81 155 12 38 104 26.76 142 13 52 94 35.62 146 14 30 111 21.28 141 15 45 113 28.48 158 16 40 116 25.64 156 17 38 91 29.46 129 18 26 112 18.84 138 19 30 97 23.62 127 20 30 114 20.83 144 21 37 113 24.67 150 22 36 111 24.49 147 23 34 101 25.19 135 24 25 112 18.25 137 25 29 111 20.71 140 26 23 126 15.44 149 27 28 111 20.14 139 28 41 121 25.31 162 29 30 94 24.19 124 30 39 112 25.83 151 31 35 94 27.13 129 32 29 105 21.64 134 33 28 119 19.05 147 34 27 107 20.15 134 35 34 114 22.97 148 36 33 123 21.15 156 37 36 119 23.23 155 38 22 105 17.32 127 39 46 86 34.85 132 40 25 88 22.12 113 41 34 95 26.36 129 42 21 111 15.91 132 43 30 105 22.22 135 44 26 95 21.49 121 45 35 99 26.12 134 46 35 103 25.36 138 47 27 105 20.45 132 48 27 112 19.42 139 49 40 118 25.32 158 50 24 99 19.51 123 51 40 102 28.17 142 52 31 119 20.67 150 53 23 101 18.55 124 54 31 97 24.22 128 55 29 101 22.31 130 56 33 91 26.61 124 57 22 89 19.82 111 58 27 114 19.15 141 59 27 101 21.09 128 60 30 113 20.98 143 61 35 89 28.23 124 62 32 127 20.13 159 63 34 87 28.10 121 64 18 83 17.82 101 65 31 102 23.31 133 66 26 89 22.61 115 67 33 99 25.00 132 68 28 101 21.71 129 69 26 82 24.07 108 70 28 106 20.90 134 71 23 84 21.50 107 72 30 88 25.42 118 73 28 96 22.58 124 74 31 87 26.27 118 75 28 110 20.29 138 76 36 96 27.27 132 77 29 97 23.02 126 78 26 79 24.76 105 79 30 88 25.42 118 80 31 82 27.43 113 81 22 91 19.47 113 82 29 71 29.00 100 83 29 82 26.13 111 84 22 106 17.19 128 85 27 75 26.47 102 86 27 92 22.69 119 87 30 80 27.27 110 88 19 79 19.39 98 89 24 72 25.00 96 90 22 74 22.92 96 91 23 87 20.91 110 92 28 107 20.74 135 93 20 75 21.05 95 94 21 76 21.65 97 95 19 81 19.00 100 96 13 73 15.12 86 97 17 78 17.89 95 98 32 70 31.37 102 99 14 66 17.50 80 100 18 76 19.15 94 101 16 71 18.39 87 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 128 196 39.51 324 2 74 171 30.20 245 3 33 190 14.80 223 4 28 172 14.00 200 5 13 148 8.07 161 6 9 165 5.17 174 7 9 200 4.31 209 8 6 207 2.82 213 9 4 209 1.88 213 10 9 210 4.11 219 11 6 190 3.06 196 12 4 189 2.07 193 13 3 170 1.73 173 14 3 197 1.50 200 15 5 191 2.55 196 16 3 189 1.56 192 17 1 222 0.45 223 18 1 177 0.56 178 19 4 214 1.83 218 20 3 215 1.38 218 21 6 203 2.87 209 22 3 214 1.38 217 23 4 187 2.09 191 24 3 192 1.54 195 25 6 223 2.62 229 26 2 201 0.99 203 27 3 242 1.22 245 28 2 211 0.94 213 29 4 236 1.67 240 30 4 187 2.09 191 31 8 211 3.65 219 32 2 198 1.00 200 33 1 210 0.47 211 34 2 217 0.91 219 35 7 194 3.48 201 36 6 194 3.00 200 37 5 196 2.49 201 38 2 206 0.96 208 39 4 207 1.90 211 40 5 204 2.39 209 41 7 226 3.00 233 42 3 199 1.49 202 43 2 191 1.04 193 44 1 190 0.52 191 45 1 205 0.49 206 46 2 192 1.03 194 47 2 203 0.98 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================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 203 313 39.34 516 2 145 370 28.16 515 3 129 328 28.23 457 4 110 355 23.66 465 5 118 390 23.23 508 6 99 463 17.62 562 7 90 551 14.04 641 8 82 635 11.44 717 9 60 550 9.84 610 10 85 560 13.18 645 11 91 589 13.38 680 12 75 579 11.47 654 13 73 548 11.76 621 14 83 593 12.28 676 15 68 644 9.55 712 16 77 631 10.88 708 17 79 646 10.90 725 18 61 620 8.96 681 19 85 647 11.61 732 20 77 648 10.62 725 21 86 704 10.89 790 22 76 692 9.90 768 23 77 642 10.71 719 24 72 661 9.82 733 25 88 673 11.56 761 26 92 662 12.20 754 27 76 670 10.19 746 28 67 675 9.03 742 29 103 650 13.68 753 30 74 670 9.95 744 31 67 665 9.15 732 32 81 680 10.64 761 33 51 634 7.45 685 34 83 660 11.17 743 35 72 637 10.16 709 36 46 676 6.37 722 37 69 717 8.78 786 38 75 692 9.78 767 39 57 712 7.41 769 40 55 670 7.59 725 41 77 630 10.89 707 42 51 708 6.72 759 43 53 697 7.07 750 44 63 701 8.25 764 45 46 680 6.34 726 46 62 693 8.21 755 47 67 686 8.90 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238 10.19 265 101 20 398 4.78 418 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 73 106 40.78 179 2 74 79 48.37 153 3 69 83 45.39 152 4 72 108 40.00 180 5 21 135 13.46 156 6 26 62 29.55 88 7 16 77 17.20 93 8 18 76 19.15 94 9 13 78 14.29 91 10 11 57 16.18 68 11 17 66 20.48 83 12 12 87 12.12 99 13 22 63 25.88 85 14 16 81 16.49 97 15 14 42 25.00 56 16 14 55 20.29 69 17 27 56 32.53 83 18 12 42 22.22 54 19 16 57 21.92 73 20 10 57 14.93 67 21 19 47 28.79 66 22 11 75 12.79 86 23 17 56 23.29 73 24 23 58 28.40 81 25 13 63 17.11 76 26 14 48 22.58 62 27 17 41 29.31 58 28 12 46 20.69 58 29 18 55 24.66 73 30 17 42 28.81 59 31 11 47 18.97 58 32 18 45 28.57 63 33 9 51 15.00 60 34 14 48 22.58 62 35 15 63 19.23 78 36 22 48 31.43 70 37 11 41 21.15 52 38 11 51 17.74 62 39 16 45 26.23 61 40 19 47 28.79 66 41 12 52 18.75 64 42 15 64 18.99 79 43 12 41 22.64 53 44 18 36 33.33 54 45 9 47 16.07 56 46 7 51 12.07 58 47 15 39 27.78 54 48 14 46 23.33 60 49 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