CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 87 178 32.83 265 2 92 170 35.11 262 3 90 145 38.30 235 4 96 132 42.11 228 5 103 118 46.61 221 6 77 91 45.83 168 7 83 87 48.82 170 8 51 115 30.72 166 9 42 95 30.66 137 10 40 111 26.49 151 11 35 108 24.48 143 12 47 111 29.75 158 13 36 124 22.50 160 14 38 124 23.46 162 15 37 109 25.34 146 16 31 92 25.20 123 17 26 110 19.12 136 18 36 114 24.00 150 19 34 122 21.79 156 20 28 126 18.18 154 21 35 115 23.33 150 22 39 99 28.26 138 23 40 117 25.48 157 24 35 110 24.14 145 25 39 113 25.66 152 26 26 111 18.98 137 27 38 124 23.46 162 28 32 123 20.65 155 29 26 115 18.44 141 30 35 122 22.29 157 31 33 127 20.62 160 32 19 105 15.32 124 33 30 133 18.40 163 34 37 107 25.69 144 35 33 116 22.15 149 36 31 125 19.87 156 37 33 98 25.19 131 38 27 118 18.62 145 39 49 117 29.52 166 40 27 117 18.75 144 41 26 98 20.97 124 42 27 106 20.30 133 43 28 101 21.71 129 44 43 115 27.22 158 45 27 124 17.88 151 46 34 121 21.94 155 47 27 94 22.31 121 48 28 115 19.58 143 49 34 127 21.12 161 50 27 118 18.62 145 51 31 123 20.13 154 52 30 131 18.63 161 53 26 114 18.57 140 54 28 115 19.58 143 55 34 91 27.20 125 56 26 95 21.49 121 57 29 119 19.59 148 58 29 101 22.31 130 59 34 111 23.45 145 60 25 107 18.94 132 61 26 115 18.44 141 62 22 114 16.18 136 63 37 90 29.13 127 64 24 124 16.22 148 65 18 110 14.06 128 66 37 89 29.37 126 67 18 110 14.06 128 68 32 94 25.40 126 69 44 109 28.76 153 70 28 103 21.37 131 71 34 104 24.64 138 72 24 104 18.75 128 73 31 108 22.30 139 74 28 96 22.58 124 75 26 95 21.49 121 76 25 111 18.38 136 77 25 105 19.23 130 78 31 107 22.46 138 79 25 120 17.24 145 80 32 100 24.24 132 81 28 81 25.69 109 82 26 105 19.85 131 83 29 108 21.17 137 84 25 102 19.69 127 85 25 83 23.15 108 86 31 103 23.13 134 87 22 102 17.74 124 88 23 90 20.35 113 89 31 95 24.60 126 90 22 77 22.22 99 91 18 100 15.25 118 92 20 79 20.20 99 93 26 88 22.81 114 94 27 75 26.47 102 95 31 87 26.27 118 96 27 91 22.88 118 97 27 99 21.43 126 98 21 89 19.09 110 99 14 57 19.72 71 100 16 79 16.84 95 101 18 87 17.14 105 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 122 207 37.08 329 2 74 177 29.48 251 3 45 163 21.63 208 4 24 182 11.65 206 5 18 172 9.47 190 6 17 161 9.55 178 7 8 187 4.10 195 8 5 227 2.16 232 9 5 202 2.42 207 10 5 202 2.42 207 11 6 212 2.75 218 12 1 187 0.53 188 13 3 198 1.49 201 14 2 185 1.07 187 15 2 203 0.98 205 16 4 196 2.00 200 17 8 214 3.60 222 18 3 205 1.44 208 19 6 217 2.69 223 20 3 233 1.27 236 21 3 214 1.38 217 22 6 215 2.71 221 23 4 208 1.89 212 24 4 212 1.85 216 25 2 201 0.99 203 26 4 201 1.95 205 27 4 204 1.92 208 28 3 238 1.24 241 29 4 231 1.70 235 30 2 234 0.85 236 31 4 224 1.75 228 32 4 233 1.69 237 33 4 208 1.89 212 34 3 208 1.42 211 35 3 200 1.48 203 36 1 223 0.45 224 37 3 219 1.35 222 38 2 209 0.95 211 39 4 195 2.01 199 40 2 210 0.94 212 41 4 234 1.68 238 42 1 229 0.43 230 43 2 217 0.91 219 44 0 214 0.00 214 45 1 194 0.51 195 46 4 203 1.93 207 47 1 212 0.47 213 48 1 217 0.46 218 49 4 181 2.16 185 50 2 221 0.90 223 51 2 217 0.91 219 52 0 214 0.00 214 53 1 228 0.44 229 54 2 256 0.78 258 55 2 198 1.00 200 56 1 213 0.47 214 57 4 202 1.94 206 58 9 240 3.61 249 59 2 245 0.81 247 60 0 229 0.00 229 61 4 217 1.81 221 62 5 223 2.19 228 63 2 200 0.99 202 64 3 201 1.47 204 65 2 200 0.99 202 66 5 198 2.46 203 67 1 175 0.57 176 68 3 240 1.23 243 69 4 188 2.08 192 70 7 200 3.38 207 71 3 188 1.57 191 72 3 199 1.49 202 73 5 183 2.66 188 74 2 202 0.98 204 75 1 180 0.55 181 76 2 190 1.04 192 77 6 182 3.19 188 78 2 224 0.88 226 79 4 197 1.99 201 80 1 169 0.59 170 81 6 203 2.87 209 82 4 187 2.09 191 83 2 191 1.04 193 84 2 182 1.09 184 85 2 182 1.09 184 86 1 180 0.55 181 87 1 181 0.55 182 88 1 189 0.53 190 89 2 140 1.41 142 90 4 178 2.20 182 91 3 162 1.82 165 92 2 193 1.03 195 93 2 171 1.16 173 94 1 161 0.62 162 95 3 149 1.97 152 96 2 151 1.31 153 97 7 152 4.40 159 98 1 129 0.77 130 99 2 77 2.53 79 100 5 80 5.88 85 101 4 133 2.92 137 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 189 265 41.63 454 2 165 272 37.76 437 3 102 355 22.32 457 4 91 348 20.73 439 5 111 417 21.02 528 6 79 410 16.16 489 7 83 542 13.28 625 8 89 616 12.62 705 9 62 592 9.48 654 10 53 559 8.66 612 11 80 577 12.18 657 12 63 577 9.84 640 13 67 591 10.18 658 14 80 551 12.68 631 15 62 617 9.13 679 16 72 667 9.74 739 17 83 637 11.53 720 18 57 652 8.04 709 19 49 649 7.02 698 20 80 643 11.07 723 21 58 664 8.03 722 22 74 646 10.28 720 23 74 679 9.83 753 24 55 696 7.32 751 25 71 640 9.99 711 26 91 682 11.77 773 27 57 656 7.99 713 28 64 684 8.56 748 29 71 689 9.34 760 30 54 657 7.59 711 31 50 629 7.36 679 32 81 660 10.93 741 33 56 663 7.79 719 34 56 629 8.18 685 35 83 619 11.82 702 36 47 677 6.49 724 37 51 698 6.81 749 38 86 729 10.55 815 39 56 693 7.48 749 40 54 672 7.44 726 41 83 672 10.99 755 42 55 694 7.34 749 43 56 630 8.16 686 44 72 591 10.86 663 45 38 692 5.21 730 46 53 700 7.04 753 47 71 702 9.18 773 48 34 668 4.84 702 49 56 694 7.47 750 50 60 683 8.08 743 51 50 646 7.18 696 52 52 700 6.91 752 53 53 641 7.64 694 54 43 599 6.70 642 55 36 614 5.54 650 56 57 618 8.44 675 57 37 686 5.12 723 58 59 705 7.72 764 59 49 682 6.70 731 60 48 661 6.77 709 61 43 630 6.39 673 62 62 633 8.92 695 63 35 612 5.41 647 64 46 658 6.53 704 65 58 589 8.96 647 66 41 619 6.21 660 67 54 650 7.67 704 68 51 580 8.08 631 69 37 580 6.00 617 70 39 583 6.27 622 71 41 637 6.05 678 72 44 596 6.88 640 73 43 613 6.55 656 74 50 584 7.89 634 75 42 523 7.43 565 76 51 617 7.63 668 77 55 532 9.37 587 78 42 552 7.07 594 79 47 600 7.26 647 80 62 605 9.30 667 81 48 519 8.47 567 82 50 571 8.05 621 83 42 520 7.47 562 84 39 548 6.64 587 85 47 519 8.30 566 86 47 551 7.86 598 87 48 521 8.44 569 88 47 498 8.62 545 89 38 535 6.63 573 90 48 537 8.21 585 91 33 526 5.90 559 92 43 499 7.93 542 93 32 514 5.86 546 94 34 501 6.36 535 95 48 489 8.94 537 96 38 447 7.84 485 97 35 465 7.00 500 98 25 461 5.14 486 99 17 316 5.11 333 100 32 256 11.11 288 101 27 439 5.79 466 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 103 93 52.55 196 2 67 96 41.10 163 3 71 98 42.01 169 4 67 144 31.75 211 5 32 138 18.82 170 6 15 64 18.99 79 7 11 95 10.38 106 8 19 88 17.76 107 9 13 94 12.15 107 10 19 72 20.88 91 11 15 88 14.56 103 12 13 95 12.04 108 13 10 70 12.50 80 14 16 75 17.58 91 15 21 70 23.08 91 16 13 77 14.44 90 17 22 67 24.72 89 18 12 61 16.44 73 19 12 74 13.95 86 20 10 67 12.99 77 21 16 64 20.00 80 22 15 59 20.27 74 23 17 61 21.79 78 24 14 73 16.09 87 25 11 50 18.03 61 26 16 64 20.00 80 27 16 51 23.88 67 28 21 58 26.58 79 29 16 58 21.62 74 30 7 66 9.59 73 31 24 53 31.17 77 32 15 64 18.99 79 33 14 42 25.00 56 34 21 54 28.00 75 35 23 55 29.49 78 36 18 62 22.50 80 37 20 54 27.03 74 38 8 42 16.00 50 39 16 46 25.81 62 40 16 62 20.51 78 41 12 35 25.53 47 42 11 67 14.10 78 43 16 44 26.67 60 44 9 57 13.64 66 45 14 60 18.92 74 46 12 36 25.00 48 47 12 50 19.35 62 48 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