CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 75 148 33.63 223 2 87 188 31.64 275 3 75 145 34.09 220 4 96 114 45.71 210 5 67 97 40.85 164 6 82 96 46.07 178 7 101 101 50.00 202 8 38 99 27.74 137 9 42 100 29.58 142 10 43 95 31.16 138 11 46 109 29.68 155 12 44 86 33.85 130 13 28 117 19.31 145 14 35 112 23.81 147 15 23 108 17.56 131 16 35 110 24.14 145 17 27 82 24.77 109 18 27 99 21.43 126 19 26 109 19.26 135 20 32 105 23.36 137 21 41 84 32.80 125 22 22 102 17.74 124 23 34 97 25.95 131 24 32 89 26.45 121 25 26 105 19.85 131 26 33 78 29.73 111 27 38 111 25.50 149 28 37 120 23.57 157 29 28 97 22.40 125 30 27 93 22.50 120 31 26 101 20.47 127 32 37 106 25.87 143 33 17 130 11.56 147 34 35 111 23.97 146 35 31 89 25.83 120 36 34 127 21.12 161 37 28 109 20.44 137 38 26 111 18.98 137 39 32 95 25.20 127 40 18 84 17.65 102 41 29 94 23.58 123 42 36 92 28.12 128 43 31 122 20.26 153 44 27 93 22.50 120 45 18 98 15.52 116 46 25 92 21.37 117 47 30 99 23.26 129 48 26 88 22.81 114 49 29 106 21.48 135 50 33 116 22.15 149 51 31 106 22.63 137 52 25 104 19.38 129 53 15 98 13.27 113 54 45 84 34.88 129 55 28 100 21.88 128 56 28 86 24.56 114 57 21 85 19.81 106 58 26 84 23.64 110 59 21 92 18.58 113 60 27 109 19.85 136 61 25 91 21.55 116 62 29 99 22.66 128 63 31 98 24.03 129 64 24 91 20.87 115 65 26 95 21.49 121 66 24 92 20.69 116 67 23 75 23.47 98 68 24 97 19.83 121 69 24 83 22.43 107 70 20 87 18.69 107 71 27 74 26.73 101 72 26 70 27.08 96 73 24 76 24.00 100 74 27 93 22.50 120 75 30 87 25.64 117 76 12 93 11.43 105 77 18 90 16.67 108 78 26 71 26.80 97 79 24 81 22.86 105 80 32 83 27.83 115 81 18 87 17.14 105 82 21 68 23.60 89 83 13 97 11.82 110 84 25 103 19.53 128 85 20 88 18.52 108 86 20 67 22.99 87 87 23 96 19.33 119 88 22 63 25.88 85 89 19 58 24.68 77 90 21 72 22.58 93 91 11 85 11.46 96 92 17 66 20.48 83 93 22 83 20.95 105 94 26 63 29.21 89 95 24 69 25.81 93 96 23 74 23.71 97 97 23 71 24.47 94 98 11 66 14.29 77 99 12 56 17.65 68 100 20 57 25.97 77 101 18 62 22.50 80 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 152 187 44.84 339 2 76 159 32.34 235 3 37 170 17.87 207 4 23 174 11.68 197 5 17 150 10.18 167 6 14 156 8.24 170 7 8 161 4.73 169 8 5 215 2.27 220 9 7 178 3.78 185 10 11 201 5.19 212 11 9 159 5.36 168 12 3 196 1.51 199 13 2 183 1.08 185 14 7 199 3.40 206 15 3 159 1.85 162 16 4 183 2.14 187 17 8 181 4.23 189 18 4 174 2.25 178 19 5 179 2.72 184 20 1 193 0.52 194 21 4 203 1.93 207 22 2 180 1.10 182 23 6 205 2.84 211 24 4 200 1.96 204 25 0 192 0.00 192 26 4 190 2.06 194 27 4 195 2.01 199 28 3 208 1.42 211 29 2 203 0.98 205 30 5 215 2.27 220 31 6 209 2.79 215 32 2 185 1.07 187 33 5 193 2.53 198 34 4 179 2.19 183 35 6 210 2.78 216 36 4 186 2.11 190 37 1 181 0.55 182 38 2 196 1.01 198 39 2 209 0.95 211 40 2 193 1.03 195 41 2 221 0.90 223 42 5 184 2.65 189 43 2 182 1.09 184 44 7 193 3.50 200 45 4 194 2.02 198 46 2 197 1.01 199 47 3 170 1.73 173 48 4 192 2.04 196 49 8 190 4.04 198 50 3 199 1.49 202 51 2 206 0.96 208 52 3 190 1.55 193 53 0 198 0.00 198 54 3 195 1.52 198 55 2 184 1.08 186 56 1 190 0.52 191 57 4 211 1.86 215 58 3 194 1.52 197 59 4 208 1.89 212 60 1 214 0.47 215 61 1 186 0.53 187 62 1 166 0.60 167 63 3 184 1.60 187 64 2 185 1.07 187 65 2 189 1.05 191 66 1 163 0.61 164 67 5 176 2.76 181 68 6 157 3.68 163 69 5 177 2.75 182 70 3 179 1.65 182 71 6 179 3.24 185 72 1 156 0.64 157 73 4 179 2.19 183 74 2 143 1.38 145 75 2 181 1.09 183 76 5 173 2.81 178 77 4 146 2.67 150 78 1 182 0.55 183 79 2 140 1.41 142 80 1 148 0.67 149 81 4 151 2.58 155 82 5 167 2.91 172 83 0 168 0.00 168 84 5 134 3.60 139 85 4 141 2.76 145 86 1 142 0.70 143 87 2 137 1.44 139 88 3 144 2.04 147 89 1 138 0.72 139 90 2 135 1.46 137 91 5 144 3.36 149 92 2 142 1.39 144 93 3 148 1.99 151 94 3 129 2.27 132 95 2 153 1.29 155 96 2 133 1.48 135 97 5 101 4.72 106 98 4 111 3.48 115 99 0 64 0.00 64 100 0 80 0.00 80 101 2 121 1.63 123 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 223 269 45.33 492 2 187 282 39.87 469 3 110 308 26.32 418 4 100 361 21.69 461 5 93 420 18.13 513 6 95 451 17.40 546 7 93 544 14.60 637 8 64 567 10.14 631 9 70 607 10.34 677 10 82 543 13.12 625 11 72 521 12.14 593 12 79 530 12.97 609 13 76 570 11.76 646 14 87 575 13.14 662 15 75 556 11.89 631 16 96 592 13.95 688 17 75 581 11.43 656 18 76 650 10.47 726 19 84 606 12.17 690 20 75 636 10.55 711 21 72 623 10.36 695 22 66 630 9.48 696 23 86 622 12.15 708 24 69 674 9.29 743 25 66 703 8.58 769 26 84 623 11.88 707 27 63 663 8.68 726 28 83 647 11.37 730 29 73 645 10.17 718 30 58 649 8.20 707 31 65 625 9.42 690 32 68 596 10.24 664 33 67 597 10.09 664 34 65 668 8.87 733 35 79 582 11.95 661 36 45 630 6.67 675 37 72 623 10.36 695 38 73 659 9.97 732 39 58 638 8.33 696 40 56 603 8.50 659 41 62 609 9.24 671 42 52 619 7.75 671 43 54 616 8.06 670 44 61 640 8.70 701 45 47 643 6.81 690 46 60 628 8.72 688 47 54 642 7.76 696 48 39 598 6.12 637 49 63 595 9.57 658 50 59 609 8.83 668 51 40 597 6.28 637 52 51 576 8.13 627 53 55 573 8.76 628 54 45 586 7.13 631 55 47 570 7.62 617 56 52 568 8.39 620 57 44 634 6.49 678 58 56 563 9.05 619 59 45 555 7.50 600 60 33 515 6.02 548 61 50 575 8.00 625 62 41 558 6.84 599 63 26 533 4.65 559 64 36 577 5.87 613 65 37 531 6.51 568 66 31 564 5.21 595 67 38 526 6.74 564 68 49 472 9.40 521 69 31 506 5.77 537 70 46 521 8.11 567 71 36 518 6.50 554 72 45 514 8.05 559 73 32 478 6.27 510 74 37 493 6.98 530 75 30 462 6.10 492 76 52 466 10.04 518 77 36 470 7.11 506 78 33 442 6.95 475 79 30 458 6.15 488 80 43 475 8.30 518 81 34 459 6.90 493 82 34 426 7.39 460 83 29 435 6.25 464 84 32 466 6.43 498 85 27 434 5.86 461 86 34 480 6.61 514 87 27 414 6.12 441 88 31 455 6.38 486 89 26 414 5.91 440 90 30 454 6.20 484 91 26 413 5.92 439 92 30 399 6.99 429 93 28 428 6.14 456 94 30 391 7.13 421 95 29 368 7.30 397 96 32 395 7.49 427 97 32 381 7.75 413 98 15 344 4.18 359 99 19 247 7.14 266 100 27 235 10.31 262 101 18 340 5.03 358 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 67 90 42.68 157 2 62 88 41.33 150 3 61 74 45.19 135 4 55 86 39.01 141 5 26 109 19.26 135 6 23 70 24.73 93 7 16 87 15.53 103 8 16 97 14.16 113 9 12 80 13.04 92 10 18 61 22.78 79 11 15 74 16.85 89 12 14 71 16.47 85 13 17 46 26.98 63 14 16 49 24.62 65 15 15 50 23.08 65 16 16 62 20.51 78 17 20 64 23.81 84 18 21 41 33.87 62 19 15 58 20.55 73 20 22 56 28.21 78 21 12 50 19.35 62 22 14 64 17.95 78 23 13 38 25.49 51 24 16 61 20.78 77 25 17 51 25.00 68 26 10 49 16.95 59 27 15 60 20.00 75 28 9 39 18.75 48 29 13 47 21.67 60 30 7 44 13.73 51 31 12 40 23.08 52 32 9 53 14.52 62 33 12 52 18.75 64 34 18 59 23.38 77 35 16 56 22.22 72 36 18 50 26.47 68 37 19 36 34.55 55 38 16 48 25.00 64 39 12 34 26.09 46 40 16 37 30.19 53 41 16 57 21.92 73 42 12 46 20.69 58 43 13 43 23.21 56 44 8 50 13.79 58 45 6 51 10.53 57 46 9 31 22.50 40 47 11 44 20.00 55 48 17 44 27.87 61 49 11 45 19.64 56 50 10 33 23.26 43 51 5 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