CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 95 183 34.17 278 2 73 180 28.85 253 3 84 163 34.01 247 4 87 146 37.34 233 5 58 129 31.02 187 6 67 110 37.85 177 7 80 124 39.22 204 8 35 125 21.88 160 9 34 118 22.37 152 10 35 100 25.93 135 11 35 119 22.73 154 12 31 113 21.53 144 13 28 113 19.86 141 14 32 127 20.13 159 15 32 114 21.92 146 16 38 97 28.15 135 17 41 107 27.70 148 18 41 115 26.28 156 19 32 112 22.22 144 20 23 115 16.67 138 21 36 121 22.93 157 22 28 104 21.21 132 23 23 120 16.08 143 24 33 96 25.58 129 25 22 112 16.42 134 26 33 130 20.25 163 27 36 91 28.35 127 28 33 130 20.25 163 29 37 130 22.16 167 30 31 133 18.90 164 31 25 109 18.66 134 32 26 126 17.11 152 33 24 104 18.75 128 34 28 115 19.58 143 35 32 124 20.51 156 36 19 129 12.84 148 37 25 111 18.38 136 38 23 108 17.56 131 39 24 110 17.91 134 40 29 133 17.90 162 41 30 105 22.22 135 42 35 125 21.88 160 43 30 131 18.63 161 44 26 123 17.45 149 45 22 116 15.94 138 46 30 124 19.48 154 47 32 121 20.92 153 48 30 109 21.58 139 49 18 125 12.59 143 50 26 117 18.18 143 51 26 103 20.16 129 52 32 121 20.92 153 53 27 119 18.49 146 54 35 125 21.88 160 55 29 116 20.00 145 56 22 99 18.18 121 57 28 137 16.97 165 58 38 109 25.85 147 59 28 103 21.37 131 60 37 85 30.33 122 61 20 112 15.15 132 62 26 102 20.31 128 63 27 114 19.15 141 64 24 114 17.39 138 65 23 124 15.65 147 66 19 101 15.83 120 67 30 92 24.59 122 68 26 106 19.70 132 69 35 106 24.82 141 70 27 93 22.50 120 71 23 93 19.83 116 72 26 114 18.57 140 73 24 119 16.78 143 74 20 114 14.93 134 75 22 126 14.86 148 76 23 118 16.31 141 77 27 99 21.43 126 78 27 101 21.09 128 79 20 87 18.69 107 80 25 87 22.32 112 81 28 104 21.21 132 82 33 99 25.00 132 83 31 83 27.19 114 84 19 96 16.52 115 85 25 84 22.94 109 86 28 89 23.93 117 87 15 86 14.85 101 88 23 96 19.33 119 89 26 83 23.85 109 90 20 77 20.62 97 91 20 78 20.41 98 92 18 85 17.48 103 93 25 91 21.55 116 94 30 83 26.55 113 95 23 75 23.47 98 96 18 94 16.07 112 97 21 85 19.81 106 98 23 79 22.55 102 99 17 53 24.29 70 100 14 64 17.95 78 101 19 76 20.00 95 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 135 187 41.93 322 2 86 186 31.62 272 3 44 154 22.22 198 4 25 186 11.85 211 5 16 165 8.84 181 6 17 150 10.18 167 7 7 216 3.14 223 8 2 222 0.89 224 9 5 204 2.39 209 10 3 190 1.55 193 11 7 166 4.05 173 12 4 231 1.70 235 13 6 206 2.83 212 14 1 196 0.51 197 15 1 194 0.51 195 16 2 197 1.01 199 17 1 205 0.49 206 18 3 188 1.57 191 19 3 192 1.54 195 20 3 205 1.44 208 21 4 198 1.98 202 22 2 195 1.02 197 23 7 223 3.04 230 24 4 217 1.81 221 25 1 214 0.47 215 26 4 209 1.88 213 27 3 208 1.42 211 28 6 239 2.45 245 29 2 236 0.84 238 30 1 193 0.52 194 31 6 216 2.70 222 32 4 200 1.96 204 33 7 216 3.14 223 34 2 210 0.94 212 35 1 200 0.50 201 36 2 216 0.92 218 37 5 209 2.34 214 38 2 197 1.01 199 39 0 203 0.00 203 40 7 199 3.40 206 41 4 203 1.93 207 42 1 202 0.49 203 43 4 203 1.93 207 44 1 200 0.50 201 45 2 199 1.00 201 46 3 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141 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 187 300 38.40 487 2 142 307 31.63 449 3 103 313 24.76 416 4 91 320 22.14 411 5 102 424 19.39 526 6 72 437 14.15 509 7 75 593 11.23 668 8 72 640 10.11 712 9 54 564 8.74 618 10 58 547 9.59 605 11 83 518 13.81 601 12 57 518 9.91 575 13 56 577 8.85 633 14 77 561 12.07 638 15 56 593 8.63 649 16 54 607 8.17 661 17 65 576 10.14 641 18 75 624 10.73 699 19 52 628 7.65 680 20 70 655 9.66 725 21 66 651 9.21 717 22 55 695 7.33 750 23 56 620 8.28 676 24 64 602 9.61 666 25 64 653 8.93 717 26 83 674 10.96 757 27 52 661 7.29 713 28 53 636 7.69 689 29 77 700 9.91 777 30 47 673 6.53 720 31 62 667 8.50 729 32 57 641 8.17 698 33 61 672 8.32 733 34 45 665 6.34 710 35 66 691 8.72 757 36 51 677 7.01 728 37 49 659 6.92 708 38 68 703 8.82 771 39 51 677 7.01 728 40 51 663 7.14 714 41 67 659 9.23 726 42 60 672 8.20 732 43 50 641 7.24 691 44 61 678 8.25 739 45 46 624 6.87 670 46 55 638 7.94 693 47 55 643 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