CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 78 175 30.83 253 2 79 160 33.05 239 3 76 156 32.76 232 4 70 129 35.18 199 5 95 128 42.60 223 6 75 90 45.45 165 7 98 92 51.58 190 8 46 120 27.71 166 9 41 108 27.52 149 10 42 117 26.42 159 11 50 125 28.57 175 12 38 118 24.36 156 13 30 94 24.19 124 14 56 134 29.47 190 15 44 121 26.67 165 16 38 107 26.21 145 17 32 102 23.88 134 18 31 132 19.02 163 19 34 112 23.29 146 20 29 126 18.71 155 21 29 119 19.59 148 22 36 112 24.32 148 23 32 114 21.92 146 24 36 132 21.43 168 25 27 107 20.15 134 26 23 124 15.65 147 27 35 123 22.15 158 28 28 121 18.79 149 29 37 131 22.02 168 30 32 109 22.70 141 31 37 117 24.03 154 32 33 118 21.85 151 33 30 115 20.69 145 34 27 111 19.57 138 35 26 119 17.93 145 36 25 124 16.78 149 37 33 109 23.24 142 38 39 109 26.35 148 39 25 108 18.80 133 40 29 115 20.14 144 41 21 103 16.94 124 42 24 117 17.02 141 43 39 136 22.29 175 44 41 110 27.15 151 45 30 118 20.27 148 46 26 125 17.22 151 47 33 124 21.02 157 48 22 121 15.38 143 49 39 113 25.66 152 50 39 131 22.94 170 51 25 122 17.01 147 52 29 119 19.59 148 53 21 106 16.54 127 54 31 130 19.25 161 55 28 96 22.58 124 56 22 127 14.77 149 57 32 117 21.48 149 58 23 124 15.65 147 59 39 91 30.00 130 60 26 122 17.57 148 61 32 113 22.07 145 62 35 108 24.48 143 63 22 106 17.19 128 64 28 107 20.74 135 65 23 102 18.40 125 66 27 124 17.88 151 67 31 94 24.80 125 68 33 100 24.81 133 69 19 100 15.97 119 70 22 110 16.67 132 71 28 104 21.21 132 72 28 111 20.14 139 73 26 98 20.97 124 74 30 95 24.00 125 75 24 96 20.00 120 76 23 88 20.72 111 77 29 101 22.31 130 78 27 85 24.11 112 79 30 121 19.87 151 80 15 99 13.16 114 81 38 97 28.15 135 82 21 83 20.19 104 83 26 82 24.07 108 84 26 94 21.67 120 85 25 81 23.58 106 86 23 96 19.33 119 87 23 98 19.01 121 88 26 111 18.98 137 89 23 95 19.49 118 90 28 84 25.00 112 91 31 84 26.96 115 92 24 92 20.69 116 93 19 87 17.92 106 94 18 85 17.48 103 95 10 90 10.00 100 96 25 86 22.52 111 97 17 88 16.19 105 98 21 81 20.59 102 99 12 47 20.34 59 100 16 59 21.33 75 101 18 76 19.15 94 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 131 205 38.99 336 2 77 192 28.62 269 3 36 175 17.06 211 4 26 174 13.00 200 5 15 171 8.06 186 6 15 160 8.57 175 7 7 198 3.41 205 8 3 213 1.39 216 9 6 193 3.02 199 10 3 212 1.40 215 11 5 199 2.45 204 12 8 194 3.96 202 13 0 191 0.00 191 14 5 198 2.46 203 15 4 232 1.69 236 16 5 209 2.34 214 17 4 164 2.38 168 18 0 172 0.00 172 19 7 220 3.08 227 20 3 188 1.57 191 21 4 215 1.83 219 22 4 228 1.72 232 23 2 214 0.93 216 24 3 186 1.59 189 25 3 212 1.40 215 26 4 215 1.83 219 27 5 214 2.28 219 28 3 215 1.38 218 29 4 229 1.72 233 30 3 214 1.38 217 31 2 229 0.87 231 32 4 217 1.81 221 33 5 228 2.15 233 34 1 203 0.49 204 35 1 207 0.48 208 36 3 193 1.53 196 37 2 213 0.93 215 38 1 190 0.52 191 39 4 213 1.84 217 40 2 216 0.92 218 41 3 219 1.35 222 42 3 245 1.21 248 43 1 213 0.47 214 44 1 197 0.51 198 45 4 180 2.17 184 46 0 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CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 179 292 38.00 471 2 118 296 28.50 414 3 108 342 24.00 450 4 94 328 22.27 422 5 95 403 19.08 498 6 88 421 17.29 509 7 64 506 11.23 570 8 63 632 9.06 695 9 54 583 8.48 637 10 64 546 10.49 610 11 68 521 11.54 589 12 59 551 9.67 610 13 60 556 9.74 616 14 63 536 10.52 599 15 64 582 9.91 646 16 62 566 9.87 628 17 58 636 8.36 694 18 63 635 9.03 698 19 58 609 8.70 667 20 54 644 7.74 698 21 59 663 8.17 722 22 64 605 9.57 669 23 56 669 7.72 725 24 53 696 7.08 749 25 63 666 8.64 729 26 74 666 10.00 740 27 55 659 7.70 714 28 55 681 7.47 736 29 54 649 7.68 703 30 55 721 7.09 776 31 65 660 8.97 725 32 58 683 7.83 741 33 65 685 8.67 750 34 62 683 8.32 745 35 50 679 6.86 729 36 55 644 7.87 699 37 59 678 8.01 737 38 41 688 5.62 729 39 40 661 5.71 701 40 56 683 7.58 739 41 46 642 6.69 688 42 51 649 7.29 700 43 61 627 8.87 688 44 40 629 5.98 669 45 44 659 6.26 703 46 54 652 7.65 706 47 37 675 5.20 712 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5.71 245 101 19 384 4.71 403 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 66 105 38.60 171 2 67 105 38.95 172 3 73 107 40.56 180 4 62 102 37.80 164 5 18 154 10.47 172 6 20 66 23.26 86 7 14 101 12.17 115 8 17 85 16.67 102 9 17 76 18.28 93 10 10 79 11.24 89 11 21 75 21.88 96 12 18 76 19.15 94 13 9 75 10.71 84 14 15 84 15.15 99 15 13 64 16.88 77 16 15 49 23.44 64 17 17 77 18.09 94 18 11 72 13.25 83 19 11 66 14.29 77 20 9 57 13.64 66 21 14 51 21.54 65 22 17 67 20.24 84 23 22 39 36.07 61 24 11 51 17.74 62 25 12 64 15.79 76 26 15 52 22.39 67 27 19 51 27.14 70 28 16 58 21.62 74 29 18 50 26.47 68 30 13 53 19.70 66 31 8 45 15.09 53 32 15 47 24.19 62 33 13 47 21.67 60 34 12 60 16.67 72 35 17 68 20.00 85 36 19 68 21.84 87 37 14 61 18.67 75 38 8 50 13.79 58 39 16 53 23.19 69 40 8 47 14.55 55 41 13 50 20.63 63 42 11 65 14.47 76 43 8 38 17.39 46 44 9 64 12.33 73 45 14 53 20.90 67 46 12 40 23.08 52 47 13 41 24.07 54 48 9 34 20.93 43 49 15 59 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