CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 95 169 35.98 264 2 87 179 32.71 266 3 64 156 29.09 220 4 62 130 32.29 192 5 69 115 37.50 184 6 67 105 38.95 172 7 89 101 46.84 190 8 37 116 24.18 153 9 38 117 24.52 155 10 30 112 21.13 142 11 34 122 21.79 156 12 31 108 22.30 139 13 36 108 25.00 144 14 22 113 16.30 135 15 34 102 25.00 136 16 29 120 19.46 149 17 31 114 21.38 145 18 28 149 15.82 177 19 36 130 21.69 166 20 37 104 26.24 141 21 34 122 21.79 156 22 29 111 20.71 140 23 26 110 19.12 136 24 18 128 12.33 146 25 26 143 15.38 169 26 27 128 17.42 155 27 36 116 23.68 152 28 26 145 15.20 171 29 25 126 16.56 151 30 33 129 20.37 162 31 23 105 17.97 128 32 35 115 23.33 150 33 35 124 22.01 159 34 24 108 18.18 132 35 34 134 20.24 168 36 35 131 21.08 166 37 30 122 19.74 152 38 27 120 18.37 147 39 23 120 16.08 143 40 29 118 19.73 147 41 25 107 18.94 132 42 24 128 15.79 152 43 27 123 18.00 150 44 26 124 17.33 150 45 28 109 20.44 137 46 27 108 20.00 135 47 27 109 19.85 136 48 33 125 20.89 158 49 26 111 18.98 137 50 21 113 15.67 134 51 31 121 20.39 152 52 30 133 18.40 163 53 27 112 19.42 139 54 28 115 19.58 143 55 29 116 20.00 145 56 23 126 15.44 149 57 28 95 22.76 123 58 36 109 24.83 145 59 32 103 23.70 135 60 26 96 21.31 122 61 36 96 27.27 132 62 20 122 14.08 142 63 22 109 16.79 131 64 24 114 17.39 138 65 21 93 18.42 114 66 16 104 13.33 120 67 26 87 23.01 113 68 22 99 18.18 121 69 23 108 17.56 131 70 20 101 16.53 121 71 26 107 19.55 133 72 28 86 24.56 114 73 24 108 18.18 132 74 21 88 19.27 109 75 21 97 17.80 118 76 22 96 18.64 118 77 22 94 18.97 116 78 23 85 21.30 108 79 23 87 20.91 110 80 17 100 14.53 117 81 18 93 16.22 111 82 17 119 12.50 136 83 15 86 14.85 101 84 18 93 16.22 111 85 19 97 16.38 116 86 15 97 13.39 112 87 21 102 17.07 123 88 22 103 17.60 125 89 21 87 19.44 108 90 25 82 23.36 107 91 19 76 20.00 95 92 11 98 10.09 109 93 21 98 17.65 119 94 19 80 19.19 99 95 12 92 11.54 104 96 18 83 17.82 101 97 17 98 14.78 115 98 24 76 24.00 100 99 14 57 19.72 71 100 11 74 12.94 85 101 19 59 24.36 78 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 126 179 41.31 305 2 74 174 29.84 248 3 37 167 18.14 204 4 28 144 16.28 172 5 11 144 7.10 155 6 14 139 9.15 153 7 11 223 4.70 234 8 6 201 2.90 207 9 4 210 1.87 214 10 5 183 2.66 188 11 1 199 0.50 200 12 3 199 1.49 202 13 6 177 3.28 183 14 10 185 5.13 195 15 3 212 1.40 215 16 1 202 0.49 203 17 4 191 2.05 195 18 4 196 2.00 200 19 1 187 0.53 188 20 6 202 2.88 208 21 3 211 1.40 214 22 5 199 2.45 204 23 1 194 0.51 195 24 1 227 0.44 228 25 5 185 2.63 190 26 8 212 3.64 220 27 1 179 0.56 180 28 3 213 1.39 216 29 4 211 1.86 215 30 3 193 1.53 196 31 1 225 0.44 226 32 0 195 0.00 195 33 5 203 2.40 208 34 4 209 1.88 213 35 2 203 0.98 205 36 6 194 3.00 200 37 5 167 2.91 172 38 2 203 0.98 205 39 1 214 0.47 215 40 9 209 4.13 218 41 2 226 0.88 228 42 0 234 0.00 234 43 6 185 3.14 191 44 4 204 1.92 208 45 1 196 0.51 197 46 1 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CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 200 290 40.82 490 2 147 302 32.74 449 3 128 278 31.53 406 4 120 349 25.59 469 5 125 421 22.89 546 6 110 425 20.56 535 7 67 548 10.89 615 8 85 607 12.28 692 9 78 539 12.64 617 10 71 541 11.60 612 11 92 549 14.35 641 12 88 526 14.33 614 13 68 566 10.73 634 14 83 584 12.44 667 15 79 568 12.21 647 16 80 618 11.46 698 17 82 572 12.54 654 18 76 668 10.22 744 19 79 684 10.35 763 20 95 650 12.75 745 21 76 639 10.63 715 22 79 628 11.17 707 23 92 605 13.20 697 24 72 675 9.64 747 25 76 572 11.73 648 26 68 654 9.42 722 27 62 648 8.73 710 28 64 685 8.54 749 29 76 640 10.61 716 30 80 658 10.84 738 31 66 626 9.54 692 32 66 613 9.72 679 33 53 617 7.91 670 34 51 624 7.56 675 35 61 631 8.82 692 36 58 662 8.06 720 37 60 661 8.32 721 38 72 692 9.42 764 39 61 638 8.73 699 40 62 614 9.17 676 41 59 585 9.16 644 42 42 611 6.43 653 43 49 628 7.24 677 44 49 633 7.18 682 45 45 624 6.73 669 46 51 639 7.39 690 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