CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 81 134 37.67 215 2 85 117 42.08 202 3 85 120 41.46 205 4 70 109 39.11 179 5 75 100 42.86 175 6 71 91 43.83 162 7 90 106 45.92 196 8 37 105 26.06 142 9 32 89 26.45 121 10 40 124 24.39 164 11 43 105 29.05 148 12 47 82 36.43 129 13 30 107 21.90 137 14 29 119 19.59 148 15 35 96 26.72 131 16 31 92 25.20 123 17 33 104 24.09 137 18 32 100 24.24 132 19 25 103 19.53 128 20 35 92 27.56 127 21 21 95 18.10 116 22 20 107 15.75 127 23 28 89 23.93 117 24 28 85 24.78 113 25 32 96 25.00 128 26 30 86 25.86 116 27 26 117 18.18 143 28 41 110 27.15 151 29 39 106 26.90 145 30 23 114 16.79 137 31 37 106 25.87 143 32 25 103 19.53 128 33 33 107 23.57 140 34 34 106 24.29 140 35 33 93 26.19 126 36 31 113 21.53 144 37 26 101 20.47 127 38 21 97 17.80 118 39 26 94 21.67 120 40 21 107 16.41 128 41 28 111 20.14 139 42 29 96 23.20 125 43 30 86 25.86 116 44 33 103 24.26 136 45 26 104 20.00 130 46 19 110 14.73 129 47 32 89 26.45 121 48 22 116 15.94 138 49 35 101 25.74 136 50 22 89 19.82 111 51 39 108 26.53 147 52 31 123 20.13 154 53 25 92 21.37 117 54 26 84 23.64 110 55 26 99 20.80 125 56 35 101 25.74 136 57 35 92 27.56 127 58 31 98 24.03 129 59 29 99 22.66 128 60 25 85 22.73 110 61 26 104 20.00 130 62 31 82 27.43 113 63 19 93 16.96 112 64 39 97 28.68 136 65 32 89 26.45 121 66 34 92 26.98 126 67 28 94 22.95 122 68 17 100 14.53 117 69 32 92 25.81 124 70 19 77 19.79 96 71 33 82 28.70 115 72 17 96 15.04 113 73 21 84 20.00 105 74 25 81 23.58 106 75 17 75 18.48 92 76 21 76 21.65 97 77 17 67 20.24 84 78 31 76 28.97 107 79 19 94 16.81 113 80 30 95 24.00 125 81 21 69 23.33 90 82 32 75 29.91 107 83 14 73 16.09 87 84 31 83 27.19 114 85 27 87 23.68 114 86 23 73 23.96 96 87 31 76 28.97 107 88 30 84 26.32 114 89 20 75 21.05 95 90 13 73 15.12 86 91 24 98 19.67 122 92 19 87 17.92 106 93 22 58 27.50 80 94 20 91 18.02 111 95 17 69 19.77 86 96 32 72 30.77 104 97 17 56 23.29 73 98 17 52 24.64 69 99 12 47 20.34 59 100 17 67 20.24 84 101 11 65 14.47 76 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 98 191 33.91 289 2 72 163 30.64 235 3 33 163 16.84 196 4 25 166 13.09 191 5 16 175 8.38 191 6 10 144 6.49 154 7 9 179 4.79 188 8 2 200 0.99 202 9 6 181 3.21 187 10 4 193 2.03 197 11 3 172 1.71 175 12 4 197 1.99 201 13 2 191 1.04 193 14 3 190 1.55 193 15 3 195 1.52 198 16 3 164 1.80 167 17 4 159 2.45 163 18 4 171 2.29 175 19 4 201 1.95 205 20 2 182 1.09 184 21 1 183 0.54 184 22 3 189 1.56 192 23 2 203 0.98 205 24 2 201 0.99 203 25 3 178 1.66 181 26 4 198 1.98 202 27 5 194 2.51 199 28 8 215 3.59 223 29 5 202 2.42 207 30 2 182 1.09 184 31 4 203 1.93 207 32 6 218 2.68 224 33 3 206 1.44 209 34 3 208 1.42 211 35 5 205 2.38 210 36 4 195 2.01 199 37 3 214 1.38 217 38 7 180 3.74 187 39 2 201 0.99 203 40 1 217 0.46 218 41 4 185 2.12 189 42 2 202 0.98 204 43 2 215 0.92 217 44 4 177 2.21 181 45 4 213 1.84 217 46 3 171 1.72 174 47 2 180 1.10 182 48 3 187 1.58 190 49 3 183 1.61 186 50 4 195 2.01 199 51 5 174 2.79 179 52 2 212 0.93 214 53 2 177 1.12 179 54 5 206 2.37 211 55 6 198 2.94 204 56 3 178 1.66 181 57 3 189 1.56 192 58 5 179 2.72 184 59 2 180 1.10 182 60 3 179 1.65 182 61 3 199 1.49 202 62 2 197 1.01 199 63 1 187 0.53 188 64 3 186 1.59 189 65 5 191 2.55 196 66 3 201 1.47 204 67 2 188 1.05 190 68 4 156 2.50 160 69 4 195 2.01 199 70 3 195 1.52 198 71 6 156 3.70 162 72 1 177 0.56 178 73 3 179 1.65 182 74 3 156 1.89 159 75 2 150 1.32 152 76 3 172 1.71 175 77 2 163 1.21 165 78 3 170 1.73 173 79 4 157 2.48 161 80 4 153 2.55 157 81 2 154 1.28 156 82 2 143 1.38 145 83 7 144 4.64 151 84 3 163 1.81 166 85 1 148 0.67 149 86 1 155 0.64 156 87 4 164 2.38 168 88 3 159 1.85 162 89 3 136 2.16 139 90 3 143 2.05 146 91 1 129 0.77 130 92 2 151 1.31 153 93 7 133 5.00 140 94 6 144 4.00 150 95 2 127 1.55 129 96 2 143 1.38 145 97 2 142 1.39 144 98 4 107 3.60 111 99 1 72 1.37 73 100 1 59 1.67 60 101 2 127 1.55 129 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 196 263 42.70 459 2 157 251 38.48 408 3 115 322 26.32 437 4 114 320 26.27 434 5 120 347 25.70 467 6 110 368 23.01 478 7 79 498 13.69 577 8 77 537 12.54 614 9 69 533 11.46 602 10 87 516 14.43 603 11 96 525 15.46 621 12 71 544 11.54 615 13 82 535 13.29 617 14 75 539 12.21 614 15 72 548 11.61 620 16 72 544 11.69 616 17 98 589 14.26 687 18 76 591 11.39 667 19 75 581 11.43 656 20 84 623 11.88 707 21 92 622 12.89 714 22 79 600 11.63 679 23 79 624 11.24 703 24 88 619 12.45 707 25 77 615 11.13 692 26 90 595 13.14 685 27 75 599 11.13 674 28 61 629 8.84 690 29 86 635 11.93 721 30 61 554 9.92 615 31 62 612 9.20 674 32 78 568 12.07 646 33 68 592 10.30 660 34 66 598 9.94 664 35 66 608 9.79 674 36 60 656 8.38 716 37 76 576 11.66 652 38 70 592 10.57 662 39 46 612 6.99 658 40 64 588 9.82 652 41 72 609 10.57 681 42 70 576 10.84 646 43 71 591 10.73 662 44 68 622 9.86 690 45 60 604 9.04 664 46 67 580 10.36 647 47 64 571 10.08 635 48 52 580 8.23 632 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4.48 357 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 87 102 46.03 189 2 67 102 39.64 169 3 51 62 45.13 113 4 52 102 33.77 154 5 31 140 18.13 171 6 24 58 29.27 82 7 14 73 16.09 87 8 9 92 8.91 101 9 9 75 10.71 84 10 11 61 15.28 72 11 16 84 16.00 100 12 6 60 9.09 66 13 12 73 14.12 85 14 20 56 26.32 76 15 10 47 17.54 57 16 15 48 23.81 63 17 18 65 21.69 83 18 13 45 22.41 58 19 16 53 23.19 69 20 19 62 23.46 81 21 23 57 28.75 80 22 16 56 22.22 72 23 14 43 24.56 57 24 12 59 16.90 71 25 13 57 18.57 70 26 20 48 29.41 68 27 14 53 20.90 67 28 6 43 12.24 49 29 9 40 18.37 49 30 19 44 30.16 63 31 16 48 25.00 64 32 6 42 12.50 48 33 12 49 19.67 61 34 13 43 23.21 56 35 14 67 17.28 81 36 4 46 8.00 50 37 14 53 20.90 67 38 15 44 25.42 59 39 19 32 37.25 51 40 13 49 20.97 62 41 11 32 25.58 43 42 17 46 26.98 63 43 13 41 24.07 54 44 8 51 13.56 59 45 9 43 17.31 52 46 15 48 23.81 63 47 5 37 11.90 42 48 15 38 28.30 53 49 12 32 27.27 44 50 10 40 20.00 50 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118 4 40 131 23.39 171 5 0 210 0.00 210 6 3 264 1.12 267 7 2 136 1.45 138 8 1 142 0.70 143 9 5 118 4.07 123 10 2 107 1.83 109 11 6 166 3.49 172 12 2 131 1.50 133 13 2 111 1.77 113 14 3 138 2.13 141 15 9 117 7.14 126 16 1 111 0.89 112 17 0 118 0.00 118 18 3 101 2.88 104 19 0 98 0.00 98 20 2 92 2.13 94 21 2 104 1.89 106 22 7 132 5.04 139 23 5 105 4.55 110 24 2 77 2.53 79 25 4 83 4.60 87 26 1 111 0.89 112 27 2 73 2.67 75 28 0 106 0.00 106 29 2 88 2.22 90 30 4 96 4.00 100 31 1 93 1.06 94 32 3 82 3.53 85 33 0 102 0.00 102 34 3 83 3.49 86 35 2 97 2.02 99 36 0 107 0.00 107 37 3 89 3.26 92 38 1 92 1.08 93 39 4 107 3.60 111 40 2 82 2.38 84 41 1 93 1.06 94 42 2 71 2.74 73 43 1 80 1.23 81 44 1 64 1.54 65 45 2 78 2.50 80 46 2 76 2.56 78 47 1 84 1.18 85 48 0 60 0.00 60 49 2 74 2.63 76 50 2 74 2.63 76 51 1 67 1.47 68 52 4 65 5.80 69 53 0 72 0.00 72 54 1 64 1.54 65 55 3 63 4.55 66 56 2 70 2.78 72 57 1 72 1.37 73 58 0 77 0.00 77 59 0 74 0.00 74 60 0 66 0.00 66 61 2 54 3.57 56 62 1 72 1.37 73 63 0 61 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58 379 13.27 437 18 56 411 11.99 467 19 46 364 11.22 410 20 69 408 14.47 477 21 51 367 12.20 418 22 50 348 12.56 398 23 46 361 11.30 407 24 42 351 10.69 393 25 50 360 12.20 410 26 48 293 14.08 341 27 49 343 12.50 392 28 53 346 13.28 399 29 51 350 12.72 401 30 42 356 10.55 398 31 46 287 13.81 333 32 32 304 9.52 336 33 50 270 15.62 320 34 31 275 10.13 306 35 38 284 11.80 322 36 36 307 10.50 343 37 35 303 10.36 338 38 31 296 9.48 327 39 34 247 12.10 281 40 34 306 10.00 340 41 32 253 11.23 285 42 20 305 6.15 325 43 35 246 12.46 281 44 18 252 6.67 270 45 24 258 8.51 282 46 20 266 6.99 286 47 15 250 5.66 265 48 24 227 9.56 251 49 21 207 9.21 228 50 10 246 3.91 256 51 17 210 7.49 227 52 15 218 6.44 233 53 23 219 9.50 242 54 19 219 7.98 238 55 14 218 6.03 232 56 9 194 4.43 203 57 17 226 7.00 243 58 16 215 6.93 231 59 10 198 4.81 208 60 22 214 9.32 236 61 15 190 7.32 205 62 11 172 6.01 183 63 14 186 7.00 200 64 18 166 9.78 184 65 8 176 4.35 184 66 10 159 5.92 169 67 14 186 7.00 200 68 6 223 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