CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 76 144 34.55 220 2 61 175 25.85 236 3 57 132 30.16 189 4 65 137 32.18 202 5 61 110 35.67 171 6 62 89 41.06 151 7 100 82 54.95 182 8 24 108 18.18 132 9 22 89 19.82 111 10 31 111 21.83 142 11 24 83 22.43 107 12 34 90 27.42 124 13 28 98 22.22 126 14 36 114 24.00 150 15 27 107 20.15 134 16 22 106 17.19 128 17 22 113 16.30 135 18 23 115 16.67 138 19 32 88 26.67 120 20 24 102 19.05 126 21 29 97 23.02 126 22 22 95 18.80 117 23 23 86 21.10 109 24 34 87 28.10 121 25 24 99 19.51 123 26 28 94 22.95 122 27 24 105 18.60 129 28 25 115 17.86 140 29 16 112 12.50 128 30 33 107 23.57 140 31 28 103 21.37 131 32 29 93 23.77 122 33 19 112 14.50 131 34 27 92 22.69 119 35 17 109 13.49 126 36 26 130 16.67 156 37 29 94 23.58 123 38 27 105 20.45 132 39 22 95 18.80 117 40 27 112 19.42 139 41 17 101 14.41 118 42 29 100 22.48 129 43 23 107 17.69 130 44 23 98 19.01 121 45 19 109 14.84 128 46 19 123 13.38 142 47 29 96 23.20 125 48 11 117 8.59 128 49 20 93 17.70 113 50 28 105 21.05 133 51 13 102 11.30 115 52 27 124 17.88 151 53 23 100 18.70 123 54 19 97 16.38 116 55 22 109 16.79 131 56 23 111 17.16 134 57 21 109 16.15 130 58 20 96 17.24 116 59 18 67 21.18 85 60 26 94 21.67 120 61 15 95 13.64 110 62 22 82 21.15 104 63 22 95 18.80 117 64 27 85 24.11 112 65 25 91 21.55 116 66 20 90 18.18 110 67 23 75 23.47 98 68 32 90 26.23 122 69 16 78 17.02 94 70 19 77 19.79 96 71 19 81 19.00 100 72 12 90 11.76 102 73 22 87 20.18 109 74 28 92 23.33 120 75 19 85 18.27 104 76 23 92 20.00 115 77 19 89 17.59 108 78 21 86 19.63 107 79 20 82 19.61 102 80 21 91 18.75 112 81 15 63 19.23 78 82 15 89 14.42 104 83 16 66 19.51 82 84 13 64 16.88 77 85 18 77 18.95 95 86 18 72 20.00 90 87 13 86 13.13 99 88 15 80 15.79 95 89 17 63 21.25 80 90 20 52 27.78 72 91 15 62 19.48 77 92 17 76 18.28 93 93 18 70 20.45 88 94 14 68 17.07 82 95 11 68 13.92 79 96 15 58 20.55 73 97 18 73 19.78 91 98 16 58 21.62 74 99 17 43 28.33 60 100 14 55 20.29 69 101 15 56 21.13 71 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 123 196 38.56 319 2 72 154 31.86 226 3 42 178 19.09 220 4 16 161 9.04 177 5 19 160 10.61 179 6 6 145 3.97 151 7 12 183 6.15 195 8 6 182 3.19 188 9 5 189 2.58 194 10 5 172 2.82 177 11 3 173 1.70 176 12 4 193 2.03 197 13 3 196 1.51 199 14 1 161 0.62 162 15 2 152 1.30 154 16 5 183 2.66 188 17 5 174 2.79 179 18 0 177 0.00 177 19 3 168 1.75 171 20 4 185 2.12 189 21 0 188 0.00 188 22 1 164 0.61 165 23 3 179 1.65 182 24 1 173 0.57 174 25 3 166 1.78 169 26 2 206 0.96 208 27 5 203 2.40 208 28 7 182 3.70 189 29 2 206 0.96 208 30 4 172 2.27 176 31 4 193 2.03 197 32 1 182 0.55 183 33 2 187 1.06 189 34 3 180 1.64 183 35 3 218 1.36 221 36 4 160 2.44 164 37 4 170 2.30 174 38 4 190 2.06 194 39 5 193 2.53 198 40 0 159 0.00 159 41 1 180 0.55 181 42 2 201 0.99 203 43 1 183 0.54 184 44 6 174 3.33 180 45 1 155 0.64 156 46 4 181 2.16 185 47 2 175 1.13 177 48 4 170 2.30 174 49 2 189 1.05 191 50 2 179 1.10 181 51 0 179 0.00 179 52 3 169 1.74 172 53 2 178 1.11 180 54 2 187 1.06 189 55 4 183 2.14 187 56 1 183 0.54 184 57 3 185 1.60 188 58 3 166 1.78 169 59 4 175 2.23 179 60 3 195 1.52 198 61 3 176 1.68 179 62 7 164 4.09 171 63 2 160 1.23 162 64 4 157 2.48 161 65 4 166 2.35 170 66 1 162 0.61 163 67 1 161 0.62 162 68 1 180 0.55 181 69 0 149 0.00 149 70 2 147 1.34 149 71 2 139 1.42 141 72 1 179 0.56 180 73 1 135 0.74 136 74 3 163 1.81 166 75 4 166 2.35 170 76 0 149 0.00 149 77 3 127 2.31 130 78 3 146 2.01 149 79 2 153 1.29 155 80 1 135 0.74 136 81 3 155 1.90 158 82 4 125 3.10 129 83 4 135 2.88 139 84 2 141 1.40 143 85 1 127 0.78 128 86 3 166 1.78 169 87 0 147 0.00 147 88 3 115 2.54 118 89 2 123 1.60 125 90 1 124 0.80 125 91 2 130 1.52 132 92 0 114 0.00 114 93 2 103 1.90 105 94 1 120 0.83 121 95 0 108 0.00 108 96 1 110 0.90 111 97 1 108 0.92 109 98 2 82 2.38 84 99 1 56 1.75 57 100 1 68 1.45 69 101 0 122 0.00 122 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 189 287 39.71 476 2 148 283 34.34 431 3 111 316 26.00 427 4 104 329 24.02 433 5 102 374 21.43 476 6 98 436 18.35 534 7 82 521 13.60 603 8 80 590 11.94 670 9 63 509 11.01 572 10 78 494 13.64 572 11 102 546 15.74 648 12 67 499 11.84 566 13 86 522 14.14 608 14 96 532 15.29 628 15 78 539 12.64 617 16 69 572 10.76 641 17 88 575 13.27 663 18 74 602 10.95 676 19 77 616 11.11 693 20 93 593 13.56 686 21 86 580 12.91 666 22 84 597 12.33 681 23 85 582 12.74 667 24 80 596 11.83 676 25 56 626 8.21 682 26 76 619 10.94 695 27 65 601 9.76 666 28 62 568 9.84 630 29 67 618 9.78 685 30 64 568 10.13 632 31 60 593 9.19 653 32 70 569 10.95 639 33 59 573 9.34 632 34 58 581 9.08 639 35 62 572 9.78 634 36 53 541 8.92 594 37 49 611 7.42 660 38 54 600 8.26 654 39 51 572 8.19 623 40 50 599 7.70 649 41 43 525 7.57 568 42 44 530 7.67 574 43 44 541 7.52 585 44 37 584 5.96 621 45 33 535 5.81 568 46 42 611 6.43 653 47 38 597 5.98 635 48 35 564 5.84 599 49 41 570 6.71 611 50 45 543 7.65 588 51 37 595 5.85 632 52 33 553 5.63 586 53 33 558 5.58 591 54 22 577 3.67 599 55 38 508 6.96 546 56 45 537 7.73 582 57 33 550 5.66 583 58 32 559 5.41 591 59 35 515 6.36 550 60 24 503 4.55 527 61 22 478 4.40 500 62 37 511 6.75 548 63 23 481 4.56 504 64 32 480 6.25 512 65 24 484 4.72 508 66 29 494 5.54 523 67 18 488 3.56 506 68 29 482 5.68 511 69 19 502 3.65 521 70 23 464 4.72 487 71 26 494 5.00 520 72 23 495 4.44 518 73 23 408 5.34 431 74 31 447 6.49 478 75 21 440 4.56 461 76 29 398 6.79 427 77 25 406 5.80 431 78 17 431 3.79 448 79 24 453 5.03 477 80 28 437 6.02 465 81 16 373 4.11 389 82 24 449 5.07 473 83 31 393 7.31 424 84 16 374 4.10 390 85 21 400 4.99 421 86 26 378 6.44 404 87 26 372 6.53 398 88 18 365 4.70 383 89 21 358 5.54 379 90 20 339 5.57 359 91 19 355 5.08 374 92 25 376 6.23 401 93 14 377 3.58 391 94 19 381 4.75 400 95 26 361 6.72 387 96 21 321 6.14 342 97 15 342 4.20 357 98 22 300 6.83 322 99 5 208 2.35 213 100 9 186 4.62 195 101 12 305 3.79 317 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 57 86 39.86 143 2 56 82 40.58 138 3 58 81 41.73 139 4 41 93 30.60 134 5 22 133 14.19 155 6 13 62 17.33 75 7 11 62 15.07 73 8 15 92 14.02 107 9 6 58 9.38 64 10 12 55 17.91 67 11 11 72 13.25 83 12 9 80 10.11 89 13 9 63 12.50 72 14 14 71 16.47 85 15 8 36 18.18 44 16 13 55 19.12 68 17 14 59 19.18 73 18 14 36 28.00 50 19 12 41 22.64 53 20 11 65 14.47 76 21 9 37 19.57 46 22 13 39 25.00 52 23 9 52 14.75 61 24 11 54 16.92 65 25 9 49 15.52 58 26 9 57 13.64 66 27 10 53 15.87 63 28 14 37 27.45 51 29 11 46 19.30 57 30 13 49 20.97 62 31 10 38 20.83 48 32 10 44 18.52 54 33 8 36 18.18 44 34 15 51 22.73 66 35 14 42 25.00 56 36 12 28 30.00 40 37 5 47 9.62 52 38 10 43 18.87 53 39 7 37 15.91 44 40 6 32 15.79 38 41 10 40 20.00 50 42 6 48 11.11 54 43 7 35 16.67 42 44 15 35 30.00 50 45 3 44 6.38 47 46 7 35 16.67 42 47 7 38 15.56 45 48 7 33 17.50 40 49 9 48 15.79 57 50 7 35 16.67 42 51 8 33 19.51 41 52 6 44 12.00 50 53 5 48 9.43 53 54 7 44 13.73 51 55 9 24 27.27 33 56 7 30 18.92 37 57 3 26 10.34 29 58 7 29 19.44 36 59 10 30 25.00 40 60 4 26 13.33 30 61 2 28 6.67 30 62 4 15 21.05 19 63 6 30 16.67 36 64 3 27 10.00 30 65 9 32 21.95 41 66 10 25 28.57 35 67 5 21 19.23 26 68 7 28 20.00 35 69 4 34 10.53 38 70 5 23 17.86 28 71 5 20 20.00 25 72 4 17 19.05 21 73 6 18 25.00 24 74 3 28 9.68 31 75 5 26 16.13 31 76 6 26 18.75 32 77 6 23 20.69 29 78 4 27 12.90 31 79 0 13 0.00 13 80 3 18 14.29 21 81 5 14 26.32 19 82 5 23 17.86 28 83 7 8 46.67 15 84 4 20 16.67 24 85 4 13 23.53 17 86 2 22 8.33 24 87 5 17 22.73 22 88 5 19 20.83 24 89 4 10 28.57 14 90 3 17 15.00 20 91 4 7 36.36 11 92 4 9 30.77 13 93 4 13 23.53 17 94 8 17 32.00 25 95 2 10 16.67 12 96 2 15 11.76 17 97 4 12 25.00 16 98 1 13 7.14 14 99 5 0 100.00 5 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 20 92 17.86 112 2 28 108 20.59 136 3 12 92 11.54 104 4 22 108 16.92 130 5 2 185 1.07 187 6 3 209 1.42 212 7 1 126 0.79 127 8 3 146 2.01 149 9 1 124 0.80 125 10 1 108 0.92 109 11 1 126 0.79 127 12 1 120 0.83 121 13 1 114 0.87 115 14 2 110 1.79 112 15 1 109 0.91 110 16 4 111 3.48 115 17 2 104 1.89 106 18 2 80 2.44 82 19 3 95 3.06 98 20 1 86 1.15 87 21 4 89 4.30 93 22 3 100 2.91 103 23 2 90 2.17 92 24 4 99 3.88 103 25 2 84 2.33 86 26 3 101 2.88 104 27 3 68 4.23 71 28 3 82 3.53 85 29 4 78 4.88 82 30 5 92 5.15 97 31 5 69 6.76 74 32 5 74 6.33 79 33 2 102 1.92 104 34 2 91 2.15 93 35 6 74 7.50 80 36 2 80 2.44 82 37 4 79 4.82 83 38 2 71 2.74 73 39 5 104 4.59 109 40 4 70 5.41 74 41 4 70 5.41 74 42 0 67 0.00 67 43 0 85 0.00 85 44 1 61 1.61 62 45 2 56 3.45 58 46 0 59 0.00 59 47 2 62 3.12 64 48 1 64 1.54 65 49 0 58 0.00 58 50 3 64 4.48 67 51 0 47 0.00 47 52 2 48 4.00 50 53 1 55 1.79 56 54 1 47 2.08 48 55 2 55 3.51 57 56 1 59 1.67 60 57 0 53 0.00 53 58 4 58 6.45 62 59 1 55 1.79 56 60 0 45 0.00 45 61 0 61 0.00 61 62 0 47 0.00 47 63 0 67 0.00 67 64 1 37 2.63 38 65 1 48 2.04 49 66 0 47 0.00 47 67 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20 62 362 14.62 424 21 77 345 18.25 422 22 46 345 11.76 391 23 49 344 12.47 393 24 68 295 18.73 363 25 62 329 15.86 391 26 55 316 14.82 371 27 51 332 13.32 383 28 35 299 10.48 334 29 46 289 13.73 335 30 47 295 13.74 342 31 28 296 8.64 324 32 55 270 16.92 325 33 47 241 16.32 288 34 40 272 12.82 312 35 32 258 11.03 290 36 51 267 16.04 318 37 29 235 10.98 264 38 30 264 10.20 294 39 37 251 12.85 288 40 28 239 10.49 267 41 23 251 8.39 274 42 28 241 10.41 269 43 27 223 10.80 250 44 13 237 5.20 250 45 28 212 11.67 240 46 19 215 8.12 234 47 15 227 6.20 242 48 22 241 8.37 263 49 10 171 5.52 181 50 11 186 5.58 197 51 17 183 8.50 200 52 10 162 5.81 172 53 13 201 6.07 214 54 18 156 10.34 174 55 14 188 6.93 202 56 9 182 4.71 191 57 19 185 9.31 204 58 10 155 6.06 165 59 5 167 2.91 172 60 15 182 7.61 197 61 10 151 6.21 161 62 5 160 3.03 165 63 15 139 9.74 154 64 7 154 4.35 161 65 6 177 3.28 183 66 12 157 7.10 169 67 11 136 7.48 147 68 4 144 2.70 148 69 12 121 9.02 133 70 4 167 2.34 171 71 1 149 0.67 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