CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 67 176 27.57 243 2 55 155 26.19 210 3 66 148 30.84 214 4 79 127 38.35 206 5 68 122 35.79 190 6 73 118 38.22 191 7 85 119 41.67 204 8 42 120 25.93 162 9 28 128 17.95 156 10 32 133 19.39 165 11 33 126 20.75 159 12 35 117 23.03 152 13 33 121 21.43 154 14 28 132 17.50 160 15 36 105 25.53 141 16 23 129 15.13 152 17 28 125 18.30 153 18 26 123 17.45 149 19 33 113 22.60 146 20 31 117 20.95 148 21 18 137 11.61 155 22 34 128 20.99 162 23 21 101 17.21 122 24 20 117 14.60 137 25 30 112 21.13 142 26 26 129 16.77 155 27 27 123 18.00 150 28 27 124 17.88 151 29 17 128 11.72 145 30 25 115 17.86 140 31 25 135 15.62 160 32 23 132 14.84 155 33 18 138 11.54 156 34 26 130 16.67 156 35 29 134 17.79 163 36 23 117 16.43 140 37 19 117 13.97 136 38 20 125 13.79 145 39 24 130 15.58 154 40 26 112 18.84 138 41 30 136 18.07 166 42 28 135 17.18 163 43 26 128 16.88 154 44 23 120 16.08 143 45 27 123 18.00 150 46 23 147 13.53 170 47 23 130 15.03 153 48 27 116 18.88 143 49 24 131 15.48 155 50 33 108 23.40 141 51 31 122 20.26 153 52 24 120 16.67 144 53 24 140 14.63 164 54 27 119 18.49 146 55 26 125 17.22 151 56 31 105 22.79 136 57 25 119 17.36 144 58 23 115 16.67 138 59 21 114 15.56 135 60 22 126 14.86 148 61 27 117 18.75 144 62 21 114 15.56 135 63 25 131 16.03 156 64 25 114 17.99 139 65 35 100 25.93 135 66 21 116 15.33 137 67 21 107 16.41 128 68 26 117 18.18 143 69 30 130 18.75 160 70 28 111 20.14 139 71 31 95 24.60 126 72 19 114 14.29 133 73 29 123 19.08 152 74 20 110 15.38 130 75 18 105 14.63 123 76 21 124 14.48 145 77 33 103 24.26 136 78 30 112 21.13 142 79 17 93 15.45 110 80 31 107 22.46 138 81 17 99 14.66 116 82 19 100 15.97 119 83 20 112 15.15 132 84 22 115 16.06 137 85 26 94 21.67 120 86 26 107 19.55 133 87 21 107 16.41 128 88 24 109 18.05 133 89 20 111 15.27 131 90 20 95 17.39 115 91 21 90 18.92 111 92 34 92 26.98 126 93 24 92 20.69 116 94 18 101 15.13 119 95 17 97 14.91 114 96 25 74 25.25 99 97 23 100 18.70 123 98 20 90 18.18 110 99 15 71 17.44 86 100 15 76 16.48 91 101 17 83 17.00 100 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 106 215 33.02 321 2 58 175 24.89 233 3 35 177 16.51 212 4 21 165 11.29 186 5 29 187 13.43 216 6 22 150 12.79 172 7 8 226 3.42 234 8 8 230 3.36 238 9 4 212 1.85 216 10 3 205 1.44 208 11 2 197 1.01 199 12 6 194 3.00 200 13 5 225 2.17 230 14 4 182 2.15 186 15 4 179 2.19 183 16 2 198 1.00 200 17 3 185 1.60 188 18 2 187 1.06 189 19 2 185 1.07 187 20 2 199 1.00 201 21 4 220 1.79 224 22 2 190 1.04 192 23 5 238 2.06 243 24 3 228 1.30 231 25 5 192 2.54 197 26 3 209 1.42 212 27 4 197 1.99 201 28 1 245 0.41 246 29 2 216 0.92 218 30 1 206 0.48 207 31 2 234 0.85 236 32 3 204 1.45 207 33 5 248 1.98 253 34 5 189 2.58 194 35 3 190 1.55 193 36 4 211 1.86 215 37 2 202 0.98 204 38 4 220 1.79 224 39 4 241 1.63 245 40 3 186 1.59 189 41 3 252 1.18 255 42 0 215 0.00 215 43 3 212 1.40 215 44 3 202 1.46 205 45 1 178 0.56 179 46 6 206 2.83 212 47 2 187 1.06 189 48 4 236 1.67 240 49 3 203 1.46 206 50 3 219 1.35 222 51 2 214 0.93 216 52 5 231 2.12 236 53 1 221 0.45 222 54 4 215 1.83 219 55 3 190 1.55 193 56 0 207 0.00 207 57 4 224 1.75 228 58 4 225 1.75 229 59 3 218 1.36 221 60 8 220 3.51 228 61 1 216 0.46 217 62 6 218 2.68 224 63 5 216 2.26 221 64 2 197 1.01 199 65 5 223 2.19 228 66 3 193 1.53 196 67 7 205 3.30 212 68 5 218 2.24 223 69 1 204 0.49 205 70 4 192 2.04 196 71 4 195 2.01 199 72 6 188 3.09 194 73 4 168 2.33 172 74 4 192 2.04 196 75 4 173 2.26 177 76 2 186 1.06 188 77 1 197 0.51 198 78 3 199 1.49 202 79 3 176 1.68 179 80 0 199 0.00 199 81 4 197 1.99 201 82 3 162 1.82 165 83 7 211 3.21 218 84 3 188 1.57 191 85 5 205 2.38 210 86 1 154 0.65 155 87 5 198 2.46 203 88 4 171 2.29 175 89 6 193 3.02 199 90 1 175 0.57 176 91 2 180 1.10 182 92 3 168 1.75 171 93 5 159 3.05 164 94 4 168 2.33 172 95 2 159 1.24 161 96 3 156 1.89 159 97 3 145 2.03 148 98 1 128 0.78 129 99 1 86 1.15 87 100 1 74 1.33 75 101 2 117 1.68 119 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 193 289 40.04 482 2 160 291 35.48 451 3 103 310 24.94 413 4 121 328 26.95 449 5 115 346 24.95 461 6 95 424 18.30 519 7 79 518 13.23 597 8 86 566 13.19 652 9 59 556 9.59 615 10 61 535 10.23 596 11 80 504 13.70 584 12 81 502 13.89 583 13 71 548 11.47 619 14 86 578 12.95 664 15 67 564 10.62 631 16 83 552 13.07 635 17 84 562 13.00 646 18 77 587 11.60 664 19 71 617 10.32 688 20 84 621 11.91 705 21 62 645 8.77 707 22 90 602 13.01 692 23 87 623 12.25 710 24 85 631 11.87 716 25 63 656 8.76 719 26 81 632 11.36 713 27 75 626 10.70 701 28 54 698 7.18 752 29 69 632 9.84 701 30 73 663 9.92 736 31 62 655 8.65 717 32 71 635 10.06 706 33 71 617 10.32 688 34 76 634 10.70 710 35 69 633 9.83 702 36 67 664 9.17 731 37 55 687 7.41 742 38 79 693 10.23 772 39 62 648 8.73 710 40 74 635 10.44 709 41 78 622 11.14 700 42 64 656 8.89 720 43 68 637 9.65 705 44 81 663 10.89 744 45 54 642 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