CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 75 148 33.63 223 2 61 139 30.50 200 3 74 129 36.45 203 4 79 126 38.54 205 5 61 106 36.53 167 6 73 99 42.44 172 7 70 103 40.46 173 8 43 115 27.22 158 9 29 101 22.31 130 10 34 105 24.46 139 11 35 110 24.14 145 12 21 99 17.50 120 13 31 111 21.83 142 14 31 124 20.00 155 15 26 108 19.40 134 16 24 103 18.90 127 17 27 107 20.15 134 18 21 129 14.00 150 19 30 109 21.58 139 20 30 95 24.00 125 21 31 111 21.83 142 22 28 104 21.21 132 23 34 125 21.38 159 24 30 112 21.13 142 25 30 121 19.87 151 26 26 122 17.57 148 27 26 114 18.57 140 28 24 142 14.46 166 29 35 122 22.29 157 30 32 111 22.38 143 31 22 122 15.28 144 32 28 92 23.33 120 33 20 121 14.18 141 34 34 122 21.79 156 35 27 115 19.01 142 36 24 118 16.90 142 37 22 107 17.05 129 38 21 106 16.54 127 39 22 101 17.89 123 40 24 104 18.75 128 41 17 108 13.60 125 42 27 118 18.62 145 43 34 115 22.82 149 44 24 114 17.39 138 45 28 113 19.86 141 46 21 108 16.28 129 47 16 105 13.22 121 48 17 95 15.18 112 49 24 99 19.51 123 50 24 108 18.18 132 51 29 115 20.14 144 52 30 109 21.58 139 53 38 109 25.85 147 54 23 105 17.97 128 55 24 113 17.52 137 56 32 112 22.22 144 57 28 121 18.79 149 58 23 127 15.33 150 59 32 112 22.22 144 60 26 119 17.93 145 61 18 119 13.14 137 62 20 82 19.61 102 63 27 118 18.62 145 64 22 97 18.49 119 65 25 113 18.12 138 66 26 108 19.40 134 67 33 96 25.58 129 68 30 95 24.00 125 69 23 94 19.66 117 70 24 109 18.05 133 71 28 83 25.23 111 72 23 91 20.18 114 73 23 77 23.00 100 74 27 83 24.55 110 75 28 90 23.73 118 76 22 95 18.80 117 77 29 87 25.00 116 78 15 88 14.56 103 79 23 91 20.18 114 80 26 103 20.16 129 81 25 105 19.23 130 82 14 91 13.33 105 83 25 97 20.49 122 84 16 65 19.75 81 85 17 82 17.17 99 86 14 97 12.61 111 87 18 104 14.75 122 88 14 105 11.76 119 89 29 54 34.94 83 90 21 95 18.10 116 91 23 77 23.00 100 92 16 105 13.22 121 93 12 85 12.37 97 94 13 86 13.13 99 95 26 76 25.49 102 96 21 69 23.33 90 97 19 79 19.39 98 98 11 72 13.25 83 99 14 52 21.21 66 100 15 65 18.75 80 101 13 83 13.54 96 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 106 206 33.97 312 2 58 204 22.14 262 3 32 188 14.55 220 4 19 228 7.69 247 5 14 169 7.65 183 6 9 163 5.23 172 7 15 221 6.36 236 8 6 217 2.69 223 9 8 213 3.62 221 10 3 222 1.33 225 11 3 193 1.53 196 12 2 216 0.92 218 13 2 207 0.96 209 14 2 190 1.04 192 15 1 213 0.47 214 16 1 182 0.55 183 17 1 196 0.51 197 18 3 207 1.43 210 19 0 197 0.00 197 20 4 213 1.84 217 21 0 220 0.00 220 22 3 221 1.34 224 23 3 171 1.72 174 24 3 191 1.55 194 25 2 198 1.00 200 26 3 238 1.24 241 27 4 213 1.84 217 28 2 227 0.87 229 29 2 205 0.97 207 30 1 224 0.44 225 31 2 233 0.85 235 32 2 218 0.91 220 33 5 211 2.31 216 34 3 220 1.35 223 35 1 203 0.49 204 36 1 191 0.52 192 37 4 211 1.86 215 38 2 196 1.01 198 39 2 201 0.99 203 40 1 207 0.48 208 41 5 192 2.54 197 42 2 213 0.93 215 43 3 216 1.37 219 44 1 221 0.45 222 45 0 171 0.00 171 46 5 203 2.40 208 47 2 216 0.92 218 48 6 194 3.00 200 49 2 212 0.93 214 50 4 203 1.93 207 51 2 212 0.93 214 52 4 197 1.99 201 53 1 243 0.41 244 54 1 220 0.45 221 55 1 205 0.49 206 56 6 184 3.16 190 57 3 199 1.49 202 58 3 211 1.40 214 59 6 219 2.67 225 60 0 190 0.00 190 61 4 182 2.15 186 62 4 217 1.81 221 63 5 208 2.35 213 64 4 209 1.88 213 65 2 223 0.89 225 66 1 184 0.54 185 67 4 193 2.03 197 68 1 171 0.58 172 69 7 199 3.40 206 70 5 202 2.42 207 71 1 206 0.48 207 72 2 173 1.14 175 73 2 189 1.05 191 74 4 200 1.96 204 75 5 193 2.53 198 76 3 164 1.80 167 77 2 186 1.06 188 78 0 177 0.00 177 79 6 162 3.57 168 80 1 164 0.61 165 81 1 193 0.52 194 82 2 152 1.30 154 83 0 167 0.00 167 84 5 152 3.18 157 85 2 175 1.13 177 86 4 169 2.31 173 87 0 174 0.00 174 88 3 159 1.85 162 89 4 165 2.37 169 90 4 185 2.12 189 91 4 176 2.22 180 92 5 155 3.12 160 93 4 157 2.48 161 94 1 148 0.67 149 95 3 148 1.99 151 96 6 132 4.35 138 97 1 114 0.87 115 98 4 111 3.48 115 99 2 79 2.47 81 100 3 69 4.17 72 101 2 119 1.65 121 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 177 301 37.03 478 2 154 321 32.42 475 3 98 287 25.45 385 4 81 339 19.29 420 5 105 401 20.75 506 6 69 437 13.64 506 7 78 563 12.17 641 8 72 625 10.33 697 9 45 558 7.46 603 10 58 524 9.97 582 11 73 506 12.61 579 12 56 586 8.72 642 13 57 541 9.53 598 14 73 577 11.23 650 15 50 619 7.47 669 16 63 549 10.29 612 17 70 586 10.67 656 18 50 606 7.62 656 19 62 621 9.08 683 20 76 616 10.98 692 21 54 649 7.68 703 22 65 624 9.43 689 23 62 628 8.99 690 24 54 620 8.01 674 25 63 670 8.59 733 26 74 635 10.44 709 27 52 649 7.42 701 28 54 654 7.63 708 29 62 661 8.58 723 30 57 649 8.07 706 31 57 651 8.05 708 32 49 685 6.68 734 33 40 686 5.51 726 34 60 666 8.26 726 35 55 660 7.69 715 36 52 680 7.10 732 37 48 697 6.44 745 38 67 679 8.98 746 39 57 663 7.92 720 40 59 655 8.26 714 41 58 629 8.44 687 42 46 647 6.64 693 43 54 644 7.74 698 44 56 652 7.91 708 45 55 636 7.96 691 46 54 691 7.25 745 47 62 720 7.93 782 48 41 660 5.85 701 49 51 631 7.48 682 50 48 625 7.13 673 51 46 633 6.77 679 52 47 630 6.94 677 53 59 641 8.43 700 54 42 624 6.31 666 55 50 646 7.18 696 56 42 638 6.18 680 57 37 645 5.43 682 58 39 663 5.56 702 59 40 618 6.08 658 60 40 559 6.68 599 61 46 620 6.91 666 62 40 612 6.13 652 63 31 570 5.16 601 64 37 569 6.11 606 65 47 579 7.51 626 66 36 543 6.22 579 67 38 574 6.21 612 68 46 576 7.40 622 69 27 596 4.33 623 70 38 558 6.38 596 71 34 549 5.83 583 72 31 571 5.15 602 73 27 560 4.60 587 74 50 525 8.70 575 75 29 537 5.12 566 76 32 555 5.45 587 77 31 542 5.41 573 78 34 552 5.80 586 79 28 525 5.06 553 80 43 513 7.73 556 81 29 467 5.85 496 82 36 499 6.73 535 83 40 516 7.19 556 84 34 509 6.26 543 85 26 476 5.18 502 86 44 484 8.33 528 87 31 474 6.14 505 88 39 454 7.91 493 89 33 431 7.11 464 90 18 468 3.70 486 91 34 443 7.13 477 92 36 460 7.26 496 93 21 454 4.42 475 94 40 461 7.98 501 95 36 435 7.64 471 96 25 425 5.56 450 97 31 418 6.90 449 98 22 400 5.21 422 99 12 286 4.03 298 100 26 258 9.15 284 101 14 377 3.58 391 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 70 79 46.98 149 2 79 90 46.75 169 3 55 93 37.16 148 4 63 96 39.62 159 5 25 128 16.34 153 6 15 63 19.23 78 7 14 69 16.87 83 8 19 91 17.27 110 9 13 80 13.98 93 10 19 60 24.05 79 11 14 83 14.43 97 12 10 69 12.66 79 13 21 57 26.92 78 14 9 57 13.64 66 15 10 58 14.71 68 16 13 60 17.81 73 17 15 61 19.74 76 18 14 41 25.45 55 19 15 75 16.67 90 20 10 68 12.82 78 21 11 54 16.92 65 22 11 61 15.28 72 23 11 47 18.97 58 24 11 59 15.71 70 25 16 52 23.53 68 26 9 54 14.29 63 27 21 65 24.42 86 28 10 46 17.86 56 29 12 45 21.05 57 30 13 59 18.06 72 31 10 49 16.95 59 32 16 55 22.54 71 33 14 57 19.72 71 34 12 50 19.35 62 35 19 46 29.23 65 36 9 48 15.79 57 37 15 49 23.44 64 38 11 46 19.30 57 39 13 50 20.63 63 40 13 39 25.00 52 41 8 56 12.50 64 42 11 57 16.18 68 43 9 32 21.95 41 44 13 63 17.11 76 45 16 72 18.18 88 46 8 37 17.78 45 47 17 36 32.08 53 48 14 40 25.93 54 49 7 64 9.86 71 50 19 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