CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 68 146 31.78 214 2 64 138 31.68 202 3 48 148 24.49 196 4 76 153 33.19 229 5 65 109 37.36 174 6 69 95 42.07 164 7 70 128 35.35 198 8 30 132 18.52 162 9 42 104 28.77 146 10 41 96 29.93 137 11 27 122 18.12 149 12 31 117 20.95 148 13 36 102 26.09 138 14 33 113 22.60 146 15 12 111 9.76 123 16 22 99 18.18 121 17 28 126 18.18 154 18 34 119 22.22 153 19 22 118 15.71 140 20 27 105 20.45 132 21 26 122 17.57 148 22 23 101 18.55 124 23 23 114 16.79 137 24 29 120 19.46 149 25 24 106 18.46 130 26 25 123 16.89 148 27 34 124 21.52 158 28 23 111 17.16 134 29 19 139 12.03 158 30 21 120 14.89 141 31 22 112 16.42 134 32 22 112 16.42 134 33 29 103 21.97 132 34 26 118 18.06 144 35 23 141 14.02 164 36 21 111 15.91 132 37 30 107 21.90 137 38 17 128 11.72 145 39 22 111 16.54 133 40 19 106 15.20 125 41 19 105 15.32 124 42 32 114 21.92 146 43 21 119 15.00 140 44 18 120 13.04 138 45 24 121 16.55 145 46 27 110 19.71 137 47 29 120 19.46 149 48 15 116 11.45 131 49 30 114 20.83 144 50 30 111 21.28 141 51 22 113 16.30 135 52 26 115 18.44 141 53 28 117 19.31 145 54 32 117 21.48 149 55 14 96 12.73 110 56 22 121 15.38 143 57 19 109 14.84 128 58 29 98 22.83 127 59 22 114 16.18 136 60 29 103 21.97 132 61 19 106 15.20 125 62 18 92 16.36 110 63 15 116 11.45 131 64 21 119 15.00 140 65 27 99 21.43 126 66 23 123 15.75 146 67 26 92 22.03 118 68 32 103 23.70 135 69 21 108 16.28 129 70 29 101 22.31 130 71 18 83 17.82 101 72 23 105 17.97 128 73 20 82 19.61 102 74 18 104 14.75 122 75 17 110 13.39 127 76 22 112 16.42 134 77 18 98 15.52 116 78 14 97 12.61 111 79 26 101 20.47 127 80 18 97 15.65 115 81 27 73 27.00 100 82 23 95 19.49 118 83 18 103 14.88 121 84 16 82 16.33 98 85 18 81 18.18 99 86 20 117 14.60 137 87 18 99 15.38 117 88 22 103 17.60 125 89 19 87 17.92 106 90 19 81 19.00 100 91 17 86 16.50 103 92 15 102 12.82 117 93 17 87 16.35 104 94 23 85 21.30 108 95 18 78 18.75 96 96 17 87 16.35 104 97 23 79 22.55 102 98 19 86 18.10 105 99 16 54 22.86 70 100 18 98 15.52 116 101 11 85 11.46 96 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 102 188 35.17 290 2 54 180 23.08 234 3 21 152 12.14 173 4 18 193 8.53 211 5 5 164 2.96 169 6 8 131 5.76 139 7 5 167 2.91 172 8 5 187 2.60 192 9 2 211 0.94 213 10 3 172 1.71 175 11 0 188 0.00 188 12 3 200 1.48 203 13 5 181 2.69 186 14 4 158 2.47 162 15 2 175 1.13 177 16 0 162 0.00 162 17 2 168 1.18 170 18 2 190 1.04 192 19 3 175 1.69 178 20 3 204 1.45 207 21 1 154 0.65 155 22 1 189 0.53 190 23 1 188 0.53 189 24 2 206 0.96 208 25 0 172 0.00 172 26 2 164 1.20 166 27 3 206 1.44 209 28 2 225 0.88 227 29 2 216 0.92 218 30 2 182 1.09 184 31 2 178 1.11 180 32 2 176 1.12 178 33 2 182 1.09 184 34 5 158 3.07 163 35 3 210 1.41 213 36 0 179 0.00 179 37 2 187 1.06 189 38 3 187 1.58 190 39 4 172 2.27 176 40 3 207 1.43 210 41 2 190 1.04 192 42 2 183 1.08 185 43 2 173 1.14 175 44 0 189 0.00 189 45 1 163 0.61 164 46 1 189 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context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 132 295 30.91 427 2 97 270 26.43 367 3 76 267 22.16 343 4 75 322 18.89 397 5 91 335 21.36 426 6 50 429 10.44 479 7 60 521 10.33 581 8 58 588 8.98 646 9 39 532 6.83 571 10 48 488 8.96 536 11 51 490 9.43 541 12 40 472 7.81 512 13 54 483 10.06 537 14 54 521 9.39 575 15 44 518 7.83 562 16 52 546 8.70 598 17 46 549 7.73 595 18 43 545 7.31 588 19 52 557 8.54 609 20 49 588 7.69 637 21 47 564 7.69 611 22 63 579 9.81 642 23 43 560 7.13 603 24 41 568 6.73 609 25 51 564 8.29 615 26 48 576 7.69 624 27 33 561 5.56 594 28 36 608 5.59 644 29 45 609 6.88 654 30 43 609 6.60 652 31 41 567 6.74 608 32 47 593 7.34 640 33 39 617 5.95 656 34 46 572 7.44 618 35 48 593 7.49 641 36 43 620 6.49 663 37 37 594 5.86 631 38 29 617 4.49 646 39 41 624 6.17 665 40 38 632 5.67 670 41 42 592 6.62 634 42 42 581 6.74 623 43 41 575 6.66 616 44 44 596 6.88 640 45 34 594 5.41 628 46 40 646 5.83 686 47 38 644 5.57 682 48 39 631 5.82 670 49 41 591 6.49 632 50 47 586 7.42 633 51 26 602 4.14 628 52 36 613 5.55 649 53 46 616 6.95 662 54 22 585 3.62 607 55 44 577 7.09 621 56 32 613 4.96 645 57 44 637 6.46 681 58 42 633 6.22 675 59 43 629 6.40 672 60 20 574 3.37 594 61 30 604 4.73 634 62 37 567 6.13 604 63 27 612 4.23 639 64 31 564 5.21 595 65 52 566 8.41 618 66 28 553 4.82 581 67 27 573 4.50 600 68 37 538 6.43 575 69 27 538 4.78 565 70 31 539 5.44 570 71 30 530 5.36 560 72 30 557 5.11 587 73 33 538 5.78 571 74 33 541 5.75 574 75 25 516 4.62 541 76 24 531 4.32 555 77 28 495 5.35 523 78 26 542 4.58 568 79 32 490 6.13 522 80 32 505 5.96 537 81 25 497 4.79 522 82 22 515 4.10 537 83 31 489 5.96 520 84 27 466 5.48 493 85 22 499 4.22 521 86 33 485 6.37 518 87 25 451 5.25 476 88 23 448 4.88 471 89 25 476 4.99 501 90 19 463 3.94 482 91 25 414 5.69 439 92 30 467 6.04 497 93 20 438 4.37 458 94 21 442 4.54 463 95 25 437 5.41 462 96 23 396 5.49 419 97 18 432 4.00 450 98 16 399 3.86 415 99 15 258 5.49 273 100 13 264 4.69 277 101 14 421 3.22 435 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 63 87 42.00 150 2 75 113 39.89 188 3 53 75 41.41 128 4 58 107 35.15 165 5 18 130 12.16 148 6 21 79 21.00 100 7 14 72 16.28 86 8 8 79 9.20 87 9 11 90 10.89 101 10 14 72 16.28 86 11 16 82 16.33 98 12 12 70 14.63 82 13 15 64 18.99 79 14 11 74 12.94 85 15 7 66 9.59 73 16 13 58 18.31 71 17 12 69 14.81 81 18 16 61 20.78 77 19 7 65 9.72 72 20 18 66 21.43 84 21 13 48 21.31 61 22 15 52 22.39 67 23 18 45 28.57 63 24 12 51 19.05 63 25 14 60 18.92 74 26 10 51 16.39 61 27 15 57 20.83 72 28 9 43 17.31 52 29 9 50 15.25 59 30 16 61 20.78 77 31 11 51 17.74 62 32 16 38 29.63 54 33 12 46 20.69 58 34 8 52 13.33 60 35 16 60 21.05 76 36 15 53 22.06 68 37 18 49 26.87 67 38 8 54 12.90 62 39 12 57 17.39 69 40 11 50 18.03 61 41 14 38 26.92 52 42 19 51 27.14 70 43 6 41 12.77 47 44 12 49 19.67 61 45 14 64 17.95 78 46 18 34 34.62 52 47 7 53 11.67 60 48 11 49 18.33 60 49 12 59 16.90 71 50 13 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