CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 61 132 31.61 193 2 54 152 26.21 206 3 50 110 31.25 160 4 58 110 34.52 168 5 52 90 36.62 142 6 55 74 42.64 129 7 70 74 48.61 144 8 30 99 23.26 129 9 33 86 27.73 119 10 21 99 17.50 120 11 31 87 26.27 118 12 34 78 30.36 112 13 34 93 26.77 127 14 32 96 25.00 128 15 34 100 25.37 134 16 40 86 31.75 126 17 30 93 24.39 123 18 27 101 21.09 128 19 28 96 22.58 124 20 24 85 22.02 109 21 31 102 23.31 133 22 18 98 15.52 116 23 24 86 21.82 110 24 25 90 21.74 115 25 22 79 21.78 101 26 19 99 16.10 118 27 35 108 24.48 143 28 22 108 16.92 130 29 19 106 15.20 125 30 24 101 19.20 125 31 19 89 17.59 108 32 17 91 15.74 108 33 28 127 18.06 155 34 23 89 20.54 112 35 12 98 10.91 110 36 25 103 19.53 128 37 29 81 26.36 110 38 21 73 22.34 94 39 24 75 24.24 99 40 15 104 12.61 119 41 18 96 15.79 114 42 19 99 16.10 118 43 27 94 22.31 121 44 28 110 20.29 138 45 25 85 22.73 110 46 27 88 23.48 115 47 27 96 21.95 123 48 23 70 24.73 93 49 28 94 22.95 122 50 19 83 18.63 102 51 24 82 22.64 106 52 25 95 20.83 120 53 18 96 15.79 114 54 30 99 23.26 129 55 22 88 20.00 110 56 16 99 13.91 115 57 25 94 21.01 119 58 19 87 17.92 106 59 27 96 21.95 123 60 18 94 16.07 112 61 23 96 19.33 119 62 24 82 22.64 106 63 16 87 15.53 103 64 19 105 15.32 124 65 22 84 20.75 106 66 23 85 21.30 108 67 28 84 25.00 112 68 25 78 24.27 103 69 22 85 20.56 107 70 21 91 18.75 112 71 18 77 18.95 95 72 25 86 22.52 111 73 16 66 19.51 82 74 21 71 22.83 92 75 18 71 20.22 89 76 29 60 32.58 89 77 20 91 18.02 111 78 15 69 17.86 84 79 18 74 19.57 92 80 16 69 18.82 85 81 18 81 18.18 99 82 16 80 16.67 96 83 20 58 25.64 78 84 13 71 15.48 84 85 19 85 18.27 104 86 18 74 19.57 92 87 13 67 16.25 80 88 17 68 20.00 85 89 9 69 11.54 78 90 18 71 20.22 89 91 16 59 21.33 75 92 14 68 17.07 82 93 21 50 29.58 71 94 14 60 18.92 74 95 17 60 22.08 77 96 11 70 13.58 81 97 15 61 19.74 76 98 16 52 23.53 68 99 10 47 17.54 57 100 15 47 24.19 62 101 16 56 22.22 72 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 93 157 37.20 250 2 49 179 21.49 228 3 33 168 16.42 201 4 21 179 10.50 200 5 16 127 11.19 143 6 11 152 6.75 163 7 6 176 3.30 182 8 3 199 1.49 202 9 7 175 3.85 182 10 6 151 3.82 157 11 5 182 2.67 187 12 2 172 1.15 174 13 5 179 2.72 184 14 0 157 0.00 157 15 2 161 1.23 163 16 4 170 2.30 174 17 4 170 2.30 174 18 4 150 2.60 154 19 4 166 2.35 170 20 7 186 3.63 193 21 2 194 1.02 196 22 4 193 2.03 197 23 2 163 1.21 165 24 2 177 1.12 179 25 2 164 1.20 166 26 2 175 1.13 177 27 2 172 1.15 174 28 2 164 1.20 166 29 5 181 2.69 186 30 3 189 1.56 192 31 2 169 1.17 171 32 4 201 1.95 205 33 9 143 5.92 152 34 5 170 2.86 175 35 3 169 1.74 172 36 3 174 1.69 177 37 1 169 0.59 170 38 2 158 1.25 160 39 4 154 2.53 158 40 2 206 0.96 208 41 1 148 0.67 149 42 2 158 1.25 160 43 7 166 4.05 173 44 1 167 0.60 168 45 1 152 0.65 153 46 3 158 1.86 161 47 0 157 0.00 157 48 4 180 2.17 184 49 2 166 1.19 168 50 4 165 2.37 169 51 4 173 2.26 177 52 2 187 1.06 189 53 4 153 2.55 157 54 2 190 1.04 192 55 1 171 0.58 172 56 5 187 2.60 192 57 4 172 2.27 176 58 5 181 2.69 186 59 1 197 0.51 198 60 5 168 2.89 173 61 6 175 3.31 181 62 2 155 1.27 157 63 2 182 1.09 184 64 5 180 2.70 185 65 4 152 2.56 156 66 3 151 1.95 154 67 3 174 1.69 177 68 6 181 3.21 187 69 4 157 2.48 161 70 1 148 0.67 149 71 3 156 1.89 159 72 2 150 1.32 152 73 6 151 3.82 157 74 2 140 1.41 142 75 2 158 1.25 160 76 3 145 2.03 148 77 2 135 1.46 137 78 3 131 2.24 134 79 0 129 0.00 129 80 3 123 2.38 126 81 3 148 1.99 151 82 1 109 0.91 110 83 2 135 1.46 137 84 5 126 3.82 131 85 1 125 0.79 126 86 5 145 3.33 150 87 3 159 1.85 162 88 2 134 1.47 136 89 4 115 3.36 119 90 3 114 2.56 117 91 3 138 2.13 141 92 1 119 0.83 120 93 1 112 0.88 113 94 7 129 5.15 136 95 2 97 2.02 99 96 4 117 3.31 121 97 3 110 2.65 113 98 0 117 0.00 117 99 1 60 1.64 61 100 0 59 0.00 59 101 4 92 4.17 96 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 177 261 40.41 438 2 149 269 35.65 418 3 113 289 28.11 402 4 107 330 24.49 437 5 118 356 24.89 474 6 97 425 18.58 522 7 82 473 14.77 555 8 86 480 15.19 566 9 83 463 15.20 546 10 80 503 13.72 583 11 88 487 15.30 575 12 77 510 13.12 587 13 97 500 16.25 597 14 94 503 15.75 597 15 83 475 14.87 558 16 73 531 12.09 604 17 98 499 16.42 597 18 75 531 12.38 606 19 78 580 11.85 658 20 85 529 13.84 614 21 82 557 12.83 639 22 71 502 12.39 573 23 74 539 12.07 613 24 76 571 11.75 647 25 72 575 11.13 647 26 73 580 11.18 653 27 63 522 10.77 585 28 53 579 8.39 632 29 84 595 12.37 679 30 82 555 12.87 637 31 60 582 9.35 642 32 86 539 13.76 625 33 63 510 10.99 573 34 73 565 11.44 638 35 78 539 12.64 617 36 53 580 8.37 633 37 58 607 8.72 665 38 70 579 10.79 649 39 59 597 8.99 656 40 58 518 10.07 576 41 71 558 11.29 629 42 67 578 10.39 645 43 51 550 8.49 601 44 60 585 9.30 645 45 63 599 9.52 662 46 54 554 8.88 608 47 64 572 10.06 636 48 58 553 9.49 611 49 42 547 7.13 589 50 50 553 8.29 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================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 63 68 48.09 131 2 48 61 44.04 109 3 68 71 48.92 139 4 44 90 32.84 134 5 23 112 17.04 135 6 6 56 9.68 62 7 15 69 17.86 84 8 8 66 10.81 74 9 12 60 16.67 72 10 14 52 21.21 66 11 13 45 22.41 58 12 12 46 20.69 58 13 16 64 20.00 80 14 12 47 20.34 59 15 12 48 20.00 60 16 9 47 16.07 56 17 10 48 17.24 58 18 16 43 27.12 59 19 8 38 17.39 46 20 8 57 12.31 65 21 9 40 18.37 49 22 15 42 26.32 57 23 14 40 25.93 54 24 9 41 18.00 50 25 9 51 15.00 60 26 17 44 27.87 61 27 12 49 19.67 61 28 16 42 27.59 58 29 14 39 26.42 53 30 11 45 19.64 56 31 8 39 17.02 47 32 5 35 12.50 40 33 9 30 23.08 39 34 7 39 15.22 46 35 17 52 24.64 69 36 16 34 32.00 50 37 14 31 31.11 45 38 8 43 15.69 51 39 12 38 24.00 50 40 8 44 15.38 52 41 13 43 23.21 56 42 8 55 12.70 63 43 5 30 14.29 35 44 15 35 30.00 50 45 11 43 20.37 54 46 8 36 18.18 44 47 5 37 11.90 42 48 9 32 21.95 41 49 3 50 5.66 53 50 10 28 26.32 38 51 5 20 20.00 25 52 7 37 15.91 44 53 5 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7 3 107 2.73 110 8 4 134 2.90 138 9 1 124 0.80 125 10 1 118 0.84 119 11 1 131 0.76 132 12 4 101 3.81 105 13 1 115 0.86 116 14 1 117 0.85 118 15 4 113 3.42 117 16 2 115 1.71 117 17 2 89 2.20 91 18 0 77 0.00 77 19 2 101 1.94 103 20 3 73 3.95 76 21 1 88 1.12 89 22 3 104 2.80 107 23 1 88 1.12 89 24 4 85 4.49 89 25 5 77 6.10 82 26 4 81 4.71 85 27 3 95 3.06 98 28 0 77 0.00 77 29 7 79 8.14 86 30 2 69 2.82 71 31 4 86 4.44 90 32 2 96 2.04 98 33 3 92 3.16 95 34 2 93 2.11 95 35 3 71 4.05 74 36 3 89 3.26 92 37 2 68 2.86 70 38 3 77 3.75 80 39 1 104 0.95 105 40 2 78 2.50 80 41 2 60 3.23 62 42 2 66 2.94 68 43 2 75 2.60 77 44 0 83 0.00 83 45 0 52 0.00 52 46 0 64 0.00 64 47 1 64 1.54 65 48 1 60 1.64 61 49 1 58 1.69 59 50 1 65 1.52 66 51 1 56 1.75 57 52 1 42 2.33 43 53 0 61 0.00 61 54 2 60 3.23 62 55 2 63 3.08 65 56 1 53 1.85 54 57 2 57 3.39 59 58 0 70 0.00 70 59 2 53 3.64 55 60 3 54 5.26 57 61 1 44 2.22 45 62 0 51 0.00 51 63 1 61 1.61 62 64 0 44 0.00 44 65 1 45 2.17 46 66 0 41 0.00 41 67 1 49 2.00 50 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399 21 53 316 14.36 369 22 38 318 10.67 356 23 52 284 15.48 336 24 64 303 17.44 367 25 49 307 13.76 356 26 45 310 12.68 355 27 55 295 15.71 350 28 43 337 11.32 380 29 52 306 14.53 358 30 42 283 12.92 325 31 39 269 12.66 308 32 39 278 12.30 317 33 46 248 15.65 294 34 35 254 12.11 289 35 38 244 13.48 282 36 30 297 9.17 327 37 29 239 10.82 268 38 46 258 15.13 304 39 37 264 12.29 301 40 38 270 12.34 308 41 28 230 10.85 258 42 30 238 11.19 268 43 23 234 8.95 257 44 29 214 11.93 243 45 32 216 12.90 248 46 18 243 6.90 261 47 15 231 6.10 246 48 26 200 11.50 226 49 11 204 5.12 215 50 14 212 6.19 226 51 23 185 11.06 208 52 14 151 8.48 165 53 16 183 8.04 199 54 16 172 8.51 188 55 10 201 4.74 211 56 17 189 8.25 206 57 17 150 10.18 167 58 9 194 4.43 203 59 12 156 7.14 168 60 22 191 10.33 213 61 4 163 2.40 167 62 11 174 5.95 185 63 12 153 7.27 165 64 11 160 6.43 171 65 8 154 4.94 162 66 12 159 7.02 171 67 5 170 2.86 175 68 3 161 1.83 164 69 13 148 8.07 161 70 9 152 5.59 161 71 5 153 3.16 158 72 8 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