CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 94 191 32.98 285 2 85 189 31.02 274 3 90 167 35.02 257 4 97 149 39.43 246 5 94 118 44.34 212 6 75 118 38.86 193 7 90 89 50.28 179 8 37 116 24.18 153 9 36 99 26.67 135 10 46 98 31.94 144 11 37 117 24.03 154 12 50 109 31.45 159 13 46 104 30.67 150 14 36 123 22.64 159 15 34 97 25.95 131 16 38 121 23.90 159 17 26 103 20.16 129 18 31 111 21.83 142 19 27 101 21.09 128 20 28 123 18.54 151 21 28 111 20.14 139 22 33 114 22.45 147 23 35 73 32.41 108 24 39 106 26.90 145 25 32 87 26.89 119 26 25 116 17.73 141 27 34 100 25.37 134 28 29 84 25.66 113 29 33 116 22.15 149 30 31 95 24.60 126 31 37 124 22.98 161 32 21 104 16.80 125 33 23 105 17.97 128 34 32 111 22.38 143 35 32 114 21.92 146 36 24 113 17.52 137 37 27 112 19.42 139 38 30 118 20.27 148 39 20 113 15.04 133 40 31 118 20.81 149 41 40 106 27.40 146 42 36 114 24.00 150 43 29 102 22.14 131 44 34 95 26.36 129 45 30 107 21.90 137 46 22 108 16.92 130 47 30 101 22.90 131 48 33 118 21.85 151 49 27 104 20.61 131 50 18 99 15.38 117 51 37 115 24.34 152 52 30 108 21.74 138 53 30 110 21.43 140 54 20 109 15.50 129 55 22 108 16.92 130 56 23 101 18.55 124 57 27 95 22.13 122 58 26 118 18.06 144 59 30 94 24.19 124 60 31 77 28.70 108 61 27 112 19.42 139 62 33 111 22.92 144 63 27 93 22.50 120 64 37 101 26.81 138 65 26 112 18.84 138 66 24 98 19.67 122 67 29 96 23.20 125 68 21 86 19.63 107 69 27 98 21.60 125 70 22 96 18.64 118 71 19 86 18.10 105 72 23 107 17.69 130 73 22 104 17.46 126 74 36 95 27.48 131 75 22 98 18.33 120 76 31 97 24.22 128 77 27 91 22.88 118 78 31 83 27.19 114 79 17 82 17.17 99 80 20 97 17.09 117 81 18 91 16.51 109 82 41 82 33.33 123 83 29 95 23.39 124 84 22 102 17.74 124 85 28 86 24.56 114 86 30 105 22.22 135 87 24 90 21.05 114 88 26 83 23.85 109 89 20 82 19.61 102 90 27 85 24.11 112 91 16 97 14.16 113 92 27 83 24.55 110 93 29 110 20.86 139 94 27 80 25.23 107 95 21 97 17.80 118 96 20 58 25.64 78 97 16 81 16.49 97 98 18 60 23.08 78 99 14 57 19.72 71 100 19 78 19.59 97 101 19 68 21.84 87 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 122 190 39.10 312 2 99 181 35.36 280 3 45 159 22.06 204 4 21 190 9.95 211 5 14 173 7.49 187 6 20 173 10.36 193 7 11 213 4.91 224 8 5 188 2.59 193 9 6 200 2.91 206 10 3 179 1.65 182 11 7 204 3.32 211 12 4 195 2.01 199 13 2 187 1.06 189 14 6 174 3.33 180 15 4 218 1.80 222 16 5 198 2.46 203 17 6 192 3.03 198 18 2 193 1.03 195 19 0 203 0.00 203 20 2 188 1.05 190 21 1 229 0.43 230 22 8 207 3.72 215 23 0 199 0.00 199 24 1 205 0.49 206 25 3 195 1.52 198 26 3 233 1.27 236 27 0 201 0.00 201 28 1 213 0.47 214 29 4 222 1.77 226 30 3 199 1.49 202 31 3 221 1.34 224 32 6 218 2.68 224 33 4 208 1.89 212 34 4 225 1.75 229 35 3 185 1.60 188 36 1 191 0.52 192 37 5 202 2.42 207 38 3 203 1.46 206 39 4 196 2.00 200 40 5 202 2.42 207 41 1 214 0.47 215 42 2 203 0.98 205 43 2 227 0.87 229 44 2 181 1.09 183 45 1 218 0.46 219 46 4 173 2.26 177 47 3 193 1.53 196 48 2 233 0.85 235 49 1 183 0.54 184 50 3 207 1.43 210 51 2 211 0.94 213 52 0 190 0.00 190 53 2 184 1.08 186 54 3 195 1.52 198 55 5 194 2.51 199 56 5 194 2.51 199 57 1 227 0.44 228 58 3 223 1.33 226 59 5 216 2.26 221 60 4 198 1.98 202 61 2 212 0.93 214 62 4 191 2.05 195 63 4 200 1.96 204 64 5 201 2.43 206 65 3 188 1.57 191 66 2 196 1.01 198 67 5 160 3.03 165 68 5 221 2.21 226 69 2 169 1.17 171 70 3 216 1.37 219 71 3 178 1.66 181 72 3 194 1.52 197 73 2 198 1.00 200 74 3 180 1.64 183 75 1 188 0.53 189 76 3 139 2.11 142 77 4 200 1.96 204 78 0 195 0.00 195 79 2 174 1.14 176 80 1 179 0.56 180 81 5 157 3.09 162 82 1 189 0.53 190 83 1 159 0.62 160 84 2 188 1.05 190 85 4 172 2.27 176 86 4 199 1.97 203 87 4 176 2.22 180 88 6 162 3.57 168 89 0 177 0.00 177 90 5 170 2.86 175 91 3 182 1.62 185 92 3 180 1.64 183 93 3 167 1.76 170 94 0 160 0.00 160 95 3 139 2.11 142 96 6 148 3.90 154 97 3 130 2.26 133 98 2 131 1.50 133 99 2 94 2.08 96 100 2 69 2.82 71 101 4 121 3.20 125 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 184 293 38.57 477 2 130 254 33.85 384 3 93 342 21.38 435 4 99 326 23.29 425 5 99 396 20.00 495 6 76 421 15.29 497 7 100 523 16.05 623 8 60 623 8.78 683 9 58 563 9.34 621 10 61 534 10.25 595 11 76 548 12.18 624 12 65 540 10.74 605 13 68 553 10.95 621 14 66 623 9.58 689 15 59 623 8.65 682 16 52 586 8.15 638 17 66 604 9.85 670 18 54 605 8.19 659 19 63 612 9.33 675 20 56 635 8.10 691 21 59 623 8.65 682 22 67 619 9.77 686 23 62 671 8.46 733 24 67 682 8.95 749 25 75 652 10.32 727 26 56 655 7.88 711 27 45 653 6.45 698 28 63 667 8.63 730 29 59 679 7.99 738 30 63 675 8.54 738 31 62 620 9.09 682 32 66 609 9.78 675 33 53 644 7.60 697 34 58 632 8.41 690 35 71 664 9.66 735 36 41 647 5.96 688 37 56 722 7.20 778 38 61 682 8.21 743 39 53 682 7.21 735 40 48 654 6.84 702 41 60 664 8.29 724 42 53 678 7.25 731 43 56 666 7.76 722 44 59 700 7.77 759 45 55 675 7.53 730 46 57 662 7.93 719 47 55 674 7.54 729 48 39 688 5.36 727 49 51 638 7.40 689 50 56 618 8.31 674 51 44 607 6.76 651 52 64 621 9.34 685 53 62 642 8.81 704 54 46 621 6.90 667 55 55 665 7.64 720 56 58 667 8.00 725 57 42 706 5.61 748 58 40 646 5.83 686 59 45 666 6.33 711 60 45 584 7.15 629 61 51 603 7.80 654 62 44 564 7.24 608 63 47 586 7.42 633 64 44 591 6.93 635 65 47 612 7.13 659 66 42 629 6.26 671 67 39 588 6.22 627 68 51 604 7.79 655 69 44 622 6.61 666 70 50 593 7.78 643 71 45 568 7.34 613 72 34 572 5.61 606 73 44 569 7.18 613 74 53 537 8.98 590 75 45 542 7.67 587 76 41 566 6.75 607 77 54 532 9.22 586 78 31 575 5.12 606 79 44 590 6.94 634 80 46 547 7.76 593 81 33 518 5.99 551 82 37 557 6.23 594 83 44 508 7.97 552 84 36 532 6.34 568 85 52 490 9.59 542 86 30 509 5.57 539 87 29 515 5.33 544 88 41 493 7.68 534 89 43 491 8.05 534 90 35 497 6.58 532 91 37 463 7.40 500 92 45 495 8.33 540 93 32 458 6.53 490 94 40 482 7.66 522 95 42 455 8.45 497 96 23 434 5.03 457 97 43 435 9.00 478 98 29 438 6.21 467 99 17 307 5.25 324 100 30 258 10.42 288 101 30 409 6.83 439 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 82 102 44.57 184 2 54 87 38.30 141 3 75 91 45.18 166 4 64 103 38.32 167 5 27 144 15.79 171 6 13 63 17.11 76 7 12 77 13.48 89 8 15 78 16.13 93 9 14 86 14.00 100 10 14 53 20.90 67 11 13 81 13.83 94 12 15 90 14.29 105 13 22 62 26.19 84 14 14 90 13.46 104 15 12 72 14.29 84 16 17 51 25.00 68 17 16 64 20.00 80 18 18 46 28.12 64 19 14 54 20.59 68 20 18 59 23.38 77 21 15 56 21.13 71 22 10 54 15.62 64 23 8 63 11.27 71 24 15 68 18.07 83 25 23 64 26.44 87 26 13 60 17.81 73 27 21 49 30.00 70 28 14 49 22.22 63 29 14 50 21.88 64 30 9 46 16.36 55 31 7 50 12.28 57 32 14 36 28.00 50 33 19 53 26.39 72 34 12 47 20.34 59 35 16 48 25.00 64 36 7 41 14.58 48 37 17 50 25.37 67 38 11 56 16.42 67 39 14 50 21.88 64 40 12 37 24.49 49 41 9 37 19.57 46 42 11 44 20.00 55 43 12 27 30.77 39 44 18 39 31.58 57 45 13 52 20.00 65 46 20 49 28.99 69 47 13 32 28.89 45 48 16 40 28.57 56 49 13 57 18.57 70 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