CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 89 136 39.56 225 2 84 141 37.33 225 3 75 147 33.78 222 4 90 105 46.15 195 5 78 98 44.32 176 6 74 98 43.02 172 7 94 87 51.93 181 8 32 101 24.06 133 9 37 99 27.21 136 10 33 107 23.57 140 11 36 138 20.69 174 12 38 105 26.57 143 13 29 119 19.59 148 14 34 123 21.66 157 15 39 120 24.53 159 16 33 85 27.97 118 17 40 103 27.97 143 18 34 99 25.56 133 19 27 104 20.61 131 20 28 120 18.92 148 21 33 132 20.00 165 22 28 131 17.61 159 23 37 103 26.43 140 24 31 106 22.63 137 25 31 106 22.63 137 26 39 120 24.53 159 27 37 89 29.37 126 28 35 138 20.23 173 29 22 125 14.97 147 30 30 120 20.00 150 31 31 105 22.79 136 32 28 119 19.05 147 33 28 105 21.05 133 34 45 96 31.91 141 35 32 120 21.05 152 36 39 99 28.26 138 37 37 126 22.70 163 38 32 111 22.38 143 39 15 106 12.40 121 40 29 99 22.66 128 41 36 129 21.82 165 42 45 127 26.16 172 43 30 95 24.00 125 44 29 105 21.64 134 45 25 113 18.12 138 46 46 111 29.30 157 47 25 110 18.52 135 48 23 87 20.91 110 49 39 115 25.32 154 50 27 114 19.15 141 51 28 124 18.42 152 52 31 115 21.23 146 53 38 122 23.75 160 54 25 111 18.38 136 55 31 120 20.53 151 56 30 117 20.41 147 57 21 112 15.79 133 58 30 113 20.98 143 59 29 103 21.97 132 60 22 101 17.89 123 61 38 87 30.40 125 62 31 100 23.66 131 63 29 91 24.17 120 64 39 114 25.49 153 65 33 103 24.26 136 66 25 100 20.00 125 67 28 107 20.74 135 68 21 95 18.10 116 69 25 90 21.74 115 70 30 99 23.26 129 71 27 90 23.08 117 72 27 91 22.88 118 73 28 105 21.05 133 74 19 112 14.50 131 75 20 96 17.24 116 76 23 111 17.16 134 77 23 102 18.40 125 78 26 97 21.14 123 79 22 96 18.64 118 80 25 92 21.37 117 81 24 81 22.86 105 82 23 86 21.10 109 83 31 106 22.63 137 84 32 97 24.81 129 85 25 94 21.01 119 86 27 92 22.69 119 87 29 106 21.48 135 88 25 91 21.55 116 89 24 97 19.83 121 90 26 110 19.12 136 91 21 87 19.44 108 92 20 68 22.73 88 93 27 71 27.55 98 94 21 92 18.58 113 95 25 74 25.25 99 96 22 97 18.49 119 97 26 87 23.01 113 98 14 85 14.14 99 99 10 71 12.35 81 100 28 75 27.18 103 101 19 85 18.27 104 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 93 187 33.21 280 2 61 166 26.87 227 3 28 182 13.33 210 4 20 191 9.48 211 5 18 144 11.11 162 6 15 132 10.20 147 7 7 208 3.26 215 8 5 222 2.20 227 9 6 231 2.53 237 10 5 177 2.75 182 11 5 230 2.13 235 12 1 200 0.50 201 13 7 173 3.89 180 14 2 171 1.16 173 15 7 202 3.35 209 16 6 224 2.61 230 17 5 192 2.54 197 18 2 199 1.00 201 19 2 194 1.02 196 20 5 214 2.28 219 21 2 212 0.93 214 22 0 214 0.00 214 23 5 201 2.43 206 24 3 210 1.41 213 25 5 232 2.11 237 26 1 208 0.48 209 27 0 226 0.00 226 28 2 236 0.84 238 29 3 203 1.46 206 30 0 217 0.00 217 31 1 212 0.47 213 32 2 203 0.98 205 33 5 204 2.39 209 34 1 211 0.47 212 35 1 200 0.50 201 36 7 213 3.18 220 37 1 207 0.48 208 38 6 212 2.75 218 39 4 221 1.78 225 40 1 225 0.44 226 41 2 202 0.98 204 42 2 198 1.00 200 43 1 190 0.52 191 44 1 208 0.48 209 45 3 223 1.33 226 46 2 202 0.98 204 47 0 205 0.00 205 48 5 211 2.31 216 49 4 201 1.95 205 50 2 201 0.99 203 51 5 206 2.37 211 52 0 226 0.00 226 53 3 154 1.91 157 54 3 213 1.39 216 55 2 216 0.92 218 56 1 191 0.52 192 57 4 218 1.80 222 58 2 205 0.97 207 59 3 202 1.46 205 60 1 229 0.43 230 61 3 187 1.58 190 62 1 193 0.52 194 63 4 219 1.79 223 64 2 185 1.07 187 65 1 200 0.50 201 66 6 199 2.93 205 67 3 198 1.49 201 68 4 192 2.04 196 69 5 179 2.72 184 70 1 196 0.51 197 71 5 204 2.39 209 72 2 188 1.05 190 73 7 206 3.29 213 74 1 213 0.47 214 75 4 177 2.21 181 76 3 183 1.61 186 77 2 173 1.14 175 78 4 179 2.19 183 79 5 184 2.65 189 80 0 182 0.00 182 81 1 170 0.58 171 82 2 165 1.20 167 83 3 171 1.72 174 84 1 177 0.56 178 85 5 192 2.54 197 86 2 171 1.16 173 87 4 172 2.27 176 88 5 190 2.56 195 89 3 171 1.72 174 90 1 165 0.60 166 91 0 161 0.00 161 92 3 164 1.80 167 93 3 157 1.88 160 94 1 155 0.64 156 95 5 129 3.73 134 96 3 160 1.84 163 97 4 131 2.96 135 98 2 126 1.56 128 99 3 91 3.19 94 100 0 80 0.00 80 101 4 136 2.86 140 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 152 304 33.33 456 2 135 282 32.37 417 3 93 319 22.57 412 4 86 350 19.72 436 5 73 395 15.60 468 6 65 447 12.70 512 7 54 538 9.12 592 8 62 582 9.63 644 9 55 528 9.43 583 10 38 480 7.34 518 11 68 488 12.23 556 12 52 494 9.52 546 13 55 510 9.73 565 14 53 492 9.72 545 15 59 558 9.56 617 16 58 585 9.02 643 17 67 581 10.34 648 18 45 595 7.03 640 19 63 602 9.47 665 20 69 620 10.01 689 21 43 640 6.30 683 22 58 612 8.66 670 23 63 633 9.05 696 24 57 616 8.47 673 25 51 625 7.54 676 26 68 639 9.62 707 27 60 642 8.55 702 28 56 625 8.22 681 29 62 693 8.21 755 30 57 632 8.27 689 31 43 668 6.05 711 32 65 640 9.22 705 33 54 614 8.08 668 34 55 620 8.15 675 35 58 637 8.35 695 36 51 663 7.14 714 37 40 616 6.10 656 38 67 628 9.64 695 39 45 636 6.61 681 40 43 658 6.13 701 41 53 650 7.54 703 42 46 660 6.52 706 43 46 639 6.72 685 44 56 685 7.56 741 45 56 643 8.01 699 46 56 667 7.75 723 47 47 632 6.92 679 48 42 603 6.51 645 49 46 584 7.30 630 50 49 621 7.31 670 51 46 599 7.13 645 52 45 602 6.96 647 53 44 592 6.92 636 54 46 684 6.30 730 55 42 600 6.54 642 56 48 599 7.42 647 57 43 698 5.80 741 58 39 591 6.19 630 59 45 603 6.94 648 60 49 618 7.35 667 61 46 615 6.96 661 62 41 599 6.41 640 63 37 595 5.85 632 64 45 578 7.22 623 65 43 593 6.76 636 66 29 594 4.65 623 67 35 596 5.55 631 68 57 583 8.91 640 69 32 600 5.06 632 70 44 612 6.71 656 71 39 558 6.53 597 72 35 616 5.38 651 73 39 585 6.25 624 74 39 585 6.25 624 75 37 559 6.21 596 76 43 532 7.48 575 77 48 573 7.73 621 78 29 506 5.42 535 79 40 536 6.94 576 80 41 526 7.23 567 81 37 516 6.69 553 82 34 523 6.10 557 83 49 522 8.58 571 84 41 505 7.51 546 85 31 495 5.89 526 86 50 480 9.43 530 87 36 493 6.81 529 88 35 490 6.67 525 89 32 475 6.31 507 90 38 480 7.34 518 91 36 504 6.67 540 92 34 475 6.68 509 93 42 500 7.75 542 94 34 480 6.61 514 95 39 474 7.60 513 96 36 431 7.71 467 97 31 455 6.38 486 98 21 443 4.53 464 99 12 290 3.97 302 100 29 274 9.57 303 101 15 408 3.55 423 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 86 95 47.51 181 2 61 112 35.26 173 3 79 103 43.41 182 4 56 94 37.33 150 5 25 168 12.95 193 6 19 75 20.21 94 7 14 81 14.74 95 8 24 78 23.53 102 9 12 80 13.04 92 10 12 92 11.54 104 11 16 81 16.49 97 12 20 77 20.62 97 13 17 82 17.17 99 14 17 73 18.89 90 15 24 65 26.97 89 16 16 66 19.51 82 17 25 60 29.41 85 18 15 62 19.48 77 19 19 59 24.36 78 20 16 64 20.00 80 21 22 57 27.85 79 22 8 56 12.50 64 23 26 61 29.89 87 24 27 67 28.72 94 25 21 63 25.00 84 26 16 54 22.86 70 27 18 60 23.08 78 28 10 47 17.54 57 29 15 49 23.44 64 30 13 48 21.31 61 31 25 53 32.05 78 32 18 49 26.87 67 33 15 55 21.43 70 34 14 46 23.33 60 35 16 58 21.62 74 36 13 40 24.53 53 37 10 52 16.13 62 38 13 48 21.31 61 39 21 56 27.27 77 40 15 50 23.08 65 41 10 45 18.18 55 42 19 49 27.94 68 43 16 55 22.54 71 44 24 51 32.00 75 45 21 48 30.43 69 46 9 33 21.43 42 47 10 35 22.22 45 48 16 48 25.00 64 49 12 58 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