CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 119 229 34.20 348 2 93 255 26.72 348 3 105 206 33.76 311 4 84 135 38.36 219 5 66 134 33.00 200 6 90 136 39.82 226 7 95 112 45.89 207 8 39 127 23.49 166 9 44 124 26.19 168 10 37 127 22.56 164 11 38 124 23.46 162 12 35 113 23.65 148 13 42 109 27.81 151 14 29 119 19.59 148 15 32 131 19.63 163 16 27 128 17.42 155 17 38 92 29.23 130 18 27 141 16.07 168 19 22 118 15.71 140 20 25 116 17.73 141 21 26 130 16.67 156 22 36 110 24.66 146 23 41 133 23.56 174 24 26 127 16.99 153 25 31 119 20.67 150 26 22 129 14.57 151 27 28 125 18.30 153 28 26 116 18.31 142 29 26 118 18.06 144 30 23 138 14.29 161 31 31 141 18.02 172 32 26 110 19.12 136 33 34 117 22.52 151 34 38 110 25.68 148 35 27 116 18.88 143 36 27 100 21.26 127 37 30 120 20.00 150 38 22 110 16.67 132 39 25 114 17.99 139 40 32 122 20.78 154 41 22 116 15.94 138 42 23 115 16.67 138 43 21 120 14.89 141 44 29 113 20.42 142 45 26 127 16.99 153 46 27 134 16.77 161 47 38 93 29.01 131 48 23 113 16.91 136 49 31 113 21.53 144 50 35 117 23.03 152 51 26 104 20.00 130 52 14 108 11.48 122 53 28 110 20.29 138 54 24 142 14.46 166 55 38 130 22.62 168 56 29 120 19.46 149 57 26 104 20.00 130 58 33 94 25.98 127 59 29 103 21.97 132 60 30 98 23.44 128 61 20 137 12.74 157 62 23 106 17.83 129 63 28 95 22.76 123 64 37 115 24.34 152 65 23 121 15.97 144 66 27 105 20.45 132 67 33 129 20.37 162 68 30 110 21.43 140 69 23 110 17.29 133 70 24 107 18.32 131 71 26 101 20.47 127 72 22 101 17.89 123 73 20 123 13.99 143 74 23 101 18.55 124 75 25 115 17.86 140 76 17 114 12.98 131 77 26 95 21.49 121 78 25 90 21.74 115 79 28 120 18.92 148 80 25 102 19.69 127 81 26 101 20.47 127 82 21 103 16.94 124 83 19 116 14.07 135 84 29 111 20.71 140 85 32 95 25.20 127 86 23 107 17.69 130 87 29 107 21.32 136 88 20 97 17.09 117 89 28 98 22.22 126 90 22 72 23.40 94 91 22 98 18.33 120 92 25 98 20.33 123 93 20 103 16.26 123 94 20 83 19.42 103 95 24 99 19.51 123 96 15 92 14.02 107 97 27 87 23.68 114 98 19 78 19.59 97 99 13 61 17.57 74 100 21 76 21.65 97 101 11 60 15.49 71 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 175 213 45.10 388 2 132 204 39.29 336 3 43 161 21.08 204 4 23 205 10.09 228 5 20 171 10.47 191 6 11 171 6.04 182 7 4 253 1.56 257 8 6 229 2.55 235 9 5 224 2.18 229 10 5 212 2.30 217 11 5 219 2.23 224 12 4 227 1.73 231 13 4 200 1.96 204 14 0 206 0.00 206 15 3 231 1.28 234 16 0 240 0.00 240 17 1 214 0.47 215 18 4 193 2.03 197 19 5 201 2.43 206 20 2 216 0.92 218 21 4 219 1.79 223 22 1 194 0.51 195 23 1 236 0.42 237 24 1 224 0.44 225 25 2 227 0.87 229 26 1 215 0.46 216 27 3 223 1.33 226 28 3 239 1.24 242 29 4 255 1.54 259 30 5 224 2.18 229 31 0 214 0.00 214 32 2 193 1.03 195 33 5 228 2.15 233 34 3 221 1.34 224 35 0 226 0.00 226 36 2 241 0.82 243 37 3 224 1.32 227 38 1 217 0.46 218 39 1 188 0.53 189 40 0 179 0.00 179 41 6 225 2.60 231 42 2 183 1.08 185 43 2 209 0.95 211 44 2 221 0.90 223 45 2 210 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4 147 2.65 151 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 199 205 49.26 404 2 103 243 29.77 346 3 76 274 21.71 350 4 66 338 16.34 404 5 74 419 15.01 493 6 55 461 10.66 516 7 46 560 7.59 606 8 33 657 4.78 690 9 33 589 5.31 622 10 39 562 6.49 601 11 48 573 7.73 621 12 36 571 5.93 607 13 40 589 6.36 629 14 54 591 8.37 645 15 45 633 6.64 678 16 39 620 5.92 659 17 58 572 9.21 630 18 36 658 5.19 694 19 47 681 6.46 728 20 47 682 6.45 729 21 42 703 5.64 745 22 46 665 6.47 711 23 43 664 6.08 707 24 40 679 5.56 719 25 34 699 4.64 733 26 32 745 4.12 777 27 35 689 4.83 724 28 41 715 5.42 756 29 35 721 4.63 756 30 35 705 4.73 740 31 40 692 5.46 732 32 43 718 5.65 761 33 35 691 4.82 726 34 31 698 4.25 729 35 29 686 4.06 715 36 40 717 5.28 757 37 24 748 3.11 772 38 33 728 4.34 761 39 34 734 4.43 768 40 34 719 4.52 753 41 43 693 5.84 736 42 29 714 3.90 743 43 35 649 5.12 684 44 38 710 5.08 748 45 34 693 4.68 727 46 28 711 3.79 739 47 26 711 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14 277 4.81 291 101 12 511 2.29 523 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 61 118 34.08 179 2 57 94 37.75 151 3 66 124 34.74 190 4 48 115 29.45 163 5 36 170 17.48 206 6 11 82 11.83 93 7 16 77 17.20 93 8 7 86 7.53 93 9 9 78 10.34 87 10 10 69 12.66 79 11 11 89 11.00 100 12 14 79 15.05 93 13 23 75 23.47 98 14 19 94 16.81 113 15 18 60 23.08 78 16 17 64 20.99 81 17 15 102 12.82 117 18 17 66 20.48 83 19 14 73 16.09 87 20 14 91 13.33 105 21 10 74 11.90 84 22 19 66 22.35 85 23 7 71 8.97 78 24 18 89 16.82 107 25 27 68 28.42 95 26 11 64 14.67 75 27 25 72 25.77 97 28 17 69 19.77 86 29 15 64 18.99 79 30 18 53 25.35 71 31 20 73 21.51 93 32 11 53 17.19 64 33 12 59 16.90 71 34 16 57 21.92 73 35 11 67 14.10 78 36 10 71 12.35 81 37 9 63 12.50 72 38 10 58 14.71 68 39 15 65 18.75 80 40 19 51 27.14 70 41 11 47 18.97 58 42 10 75 11.76 85 43 18 50 26.47 68 44 9 39 18.75 48 45 13 60 17.81 73 46 15 45 25.00 60 47 10 45 18.18 55 48 14 55 20.29 69 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