CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 121 254 32.27 375 2 104 265 28.18 369 3 103 212 32.70 315 4 96 149 39.18 245 5 106 134 44.17 240 6 99 132 42.86 231 7 101 105 49.03 206 8 45 133 25.28 178 9 41 111 26.97 152 10 58 117 33.14 175 11 37 139 21.02 176 12 43 131 24.71 174 13 37 120 23.57 157 14 38 135 21.97 173 15 34 113 23.13 147 16 37 103 26.43 140 17 38 136 21.84 174 18 26 122 17.57 148 19 36 125 22.36 161 20 37 121 23.42 158 21 33 127 20.62 160 22 39 128 23.35 167 23 30 115 20.69 145 24 39 124 23.93 163 25 23 111 17.16 134 26 36 119 23.23 155 27 27 143 15.88 170 28 38 129 22.75 167 29 22 141 13.50 163 30 25 128 16.34 153 31 26 114 18.57 140 32 36 111 24.49 147 33 28 137 16.97 165 34 25 140 15.15 165 35 28 140 16.67 168 36 25 105 19.23 130 37 31 131 19.14 162 38 21 159 11.67 180 39 23 121 15.97 144 40 37 120 23.57 157 41 22 121 15.38 143 42 41 126 24.55 167 43 30 116 20.55 146 44 22 104 17.46 126 45 27 100 21.26 127 46 39 130 23.08 169 47 33 119 21.71 152 48 26 115 18.44 141 49 33 115 22.30 148 50 26 94 21.67 120 51 45 112 28.66 157 52 27 115 19.01 142 53 29 129 18.35 158 54 25 128 16.34 153 55 29 125 18.83 154 56 34 114 22.97 148 57 27 117 18.75 144 58 24 109 18.05 133 59 22 99 18.18 121 60 35 112 23.81 147 61 28 105 21.05 133 62 27 140 16.17 167 63 30 111 21.28 141 64 32 104 23.53 136 65 26 118 18.06 144 66 29 121 19.33 150 67 32 117 21.48 149 68 23 94 19.66 117 69 27 121 18.24 148 70 23 96 19.33 119 71 24 95 20.17 119 72 28 91 23.53 119 73 25 96 20.66 121 74 30 108 21.74 138 75 20 103 16.26 123 76 27 136 16.56 163 77 32 126 20.25 158 78 25 106 19.08 131 79 30 115 20.69 145 80 26 107 19.55 133 81 27 95 22.13 122 82 26 96 21.31 122 83 22 92 19.30 114 84 21 116 15.33 137 85 25 87 22.32 112 86 25 100 20.00 125 87 17 82 17.17 99 88 22 107 17.05 129 89 24 96 20.00 120 90 17 106 13.82 123 91 13 96 11.93 109 92 13 83 13.54 96 93 22 95 18.80 117 94 19 83 18.63 102 95 23 86 21.10 109 96 35 98 26.32 133 97 19 104 15.45 123 98 12 74 13.95 86 99 18 67 21.18 85 100 28 90 23.73 118 101 11 87 11.22 98 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 215 235 47.78 450 2 116 166 41.13 282 3 39 167 18.93 206 4 17 174 8.90 191 5 10 168 5.62 178 6 8 175 4.37 183 7 4 245 1.61 249 8 1 246 0.40 247 9 2 214 0.93 216 10 1 239 0.42 240 11 4 171 2.29 175 12 5 200 2.44 205 13 1 175 0.57 176 14 5 214 2.28 219 15 2 190 1.04 192 16 3 206 1.44 209 17 5 180 2.70 185 18 2 186 1.06 188 19 3 221 1.34 224 20 2 219 0.90 221 21 1 225 0.44 226 22 0 201 0.00 201 23 1 236 0.42 237 24 3 209 1.42 212 25 2 190 1.04 192 26 4 203 1.93 207 27 0 202 0.00 202 28 1 241 0.41 242 29 4 236 1.67 240 30 1 247 0.40 248 31 3 217 1.36 220 32 1 233 0.43 234 33 1 220 0.45 221 34 4 206 1.90 210 35 1 218 0.46 219 36 3 214 1.38 217 37 3 206 1.44 209 38 2 234 0.85 236 39 3 208 1.42 211 40 0 210 0.00 210 41 5 209 2.34 214 42 1 229 0.43 230 43 1 214 0.47 215 44 1 208 0.48 209 45 0 221 0.00 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155 2.52 159 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 199 226 46.82 425 2 117 201 36.79 318 3 69 316 17.92 385 4 62 324 16.06 386 5 72 440 14.06 512 6 53 478 9.98 531 7 47 608 7.18 655 8 38 702 5.14 740 9 33 593 5.27 626 10 41 604 6.36 645 11 48 585 7.58 633 12 44 564 7.24 608 13 43 562 7.11 605 14 47 637 6.87 684 15 45 647 6.50 692 16 43 660 6.12 703 17 48 698 6.43 746 18 43 731 5.56 774 19 40 704 5.38 744 20 42 706 5.61 748 21 46 674 6.39 720 22 46 663 6.49 709 23 71 689 9.34 760 24 48 673 6.66 721 25 38 697 5.17 735 26 45 715 5.92 760 27 36 716 4.79 752 28 45 760 5.59 805 29 54 775 6.51 829 30 38 738 4.90 776 31 38 740 4.88 778 32 38 670 5.37 708 33 32 705 4.34 737 34 45 658 6.40 703 35 38 708 5.09 746 36 33 714 4.42 747 37 39 661 5.57 700 38 48 741 6.08 789 39 33 773 4.09 806 40 35 781 4.29 816 41 40 760 5.00 800 42 31 795 3.75 826 43 24 743 3.13 767 44 33 739 4.27 772 45 30 711 4.05 741 46 33 769 4.11 802 47 30 768 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16 304 5.00 320 101 14 512 2.66 526 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 72 118 37.89 190 2 62 118 34.44 180 3 78 100 43.82 178 4 53 146 26.63 199 5 31 172 15.27 203 6 14 76 15.56 90 7 19 87 17.92 106 8 12 94 11.32 106 9 14 93 13.08 107 10 20 74 21.28 94 11 12 91 11.65 103 12 19 90 17.43 109 13 19 71 21.11 90 14 16 92 14.81 108 15 11 65 14.47 76 16 14 78 15.22 92 17 19 83 18.63 102 18 16 58 21.62 74 19 15 77 16.30 92 20 24 70 25.53 94 21 13 72 15.29 85 22 14 80 14.89 94 23 21 47 30.88 68 24 10 81 10.99 91 25 22 76 22.45 98 26 11 72 13.25 83 27 19 75 20.21 94 28 17 53 24.29 70 29 16 66 19.51 82 30 20 66 23.26 86 31 16 63 20.25 79 32 18 68 20.93 86 33 22 58 27.50 80 34 18 62 22.50 80 35 21 54 28.00 75 36 21 63 25.00 84 37 18 56 24.32 74 38 15 57 20.83 72 39 11 50 18.03 61 40 22 55 28.57 77 41 11 53 17.19 64 42 18 70 20.45 88 43 17 59 22.37 76 44 15 52 22.39 67 45 17 56 23.29 73 46 19 37 33.93 56 47 12 64 15.79 76 48 12 44 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