CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 95 226 29.60 321 2 102 231 30.63 333 3 104 199 34.32 303 4 65 141 31.55 206 5 90 121 42.65 211 6 83 117 41.50 200 7 109 95 53.43 204 8 26 121 17.69 147 9 49 108 31.21 157 10 34 116 22.67 150 11 31 129 19.38 160 12 44 103 29.93 147 13 46 121 27.54 167 14 30 127 19.11 157 15 31 114 21.38 145 16 30 126 19.23 156 17 30 100 23.08 130 18 31 108 22.30 139 19 32 121 20.92 153 20 28 104 21.21 132 21 30 110 21.43 140 22 28 100 21.88 128 23 39 114 25.49 153 24 28 89 23.93 117 25 28 103 21.37 131 26 26 117 18.18 143 27 26 110 19.12 136 28 30 108 21.74 138 29 25 131 16.03 156 30 25 101 19.84 126 31 31 111 21.83 142 32 27 113 19.29 140 33 37 130 22.16 167 34 31 115 21.23 146 35 35 102 25.55 137 36 21 112 15.79 133 37 18 120 13.04 138 38 22 112 16.42 134 39 28 110 20.29 138 40 32 98 24.62 130 41 24 103 18.90 127 42 31 111 21.83 142 43 23 94 19.66 117 44 24 112 17.65 136 45 15 112 11.81 127 46 33 106 23.74 139 47 21 107 16.41 128 48 38 102 27.14 140 49 29 101 22.31 130 50 27 108 20.00 135 51 33 105 23.91 138 52 30 96 23.81 126 53 28 108 20.59 136 54 22 111 16.54 133 55 27 106 20.30 133 56 24 112 17.65 136 57 22 116 15.94 138 58 34 101 25.19 135 59 27 95 22.13 122 60 35 112 23.81 147 61 27 108 20.00 135 62 27 117 18.75 144 63 26 104 20.00 130 64 27 96 21.95 123 65 23 107 17.69 130 66 26 108 19.40 134 67 22 117 15.83 139 68 25 97 20.49 122 69 35 98 26.32 133 70 28 97 22.40 125 71 31 92 25.20 123 72 37 110 25.17 147 73 26 104 20.00 130 74 26 107 19.55 133 75 18 95 15.93 113 76 23 89 20.54 112 77 20 102 16.39 122 78 25 72 25.77 97 79 27 99 21.43 126 80 26 69 27.37 95 81 25 91 21.55 116 82 21 88 19.27 109 83 16 89 15.24 105 84 26 84 23.64 110 85 23 82 21.90 105 86 28 91 23.53 119 87 25 99 20.16 124 88 23 92 20.00 115 89 15 80 15.79 95 90 21 94 18.26 115 91 17 99 14.66 116 92 14 82 14.58 96 93 24 76 24.00 100 94 19 76 20.00 95 95 20 87 18.69 107 96 28 84 25.00 112 97 12 81 12.90 93 98 22 91 19.47 113 99 17 59 22.37 76 100 22 65 25.29 87 101 22 76 22.45 98 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 187 212 46.87 399 2 112 201 35.78 313 3 38 171 18.18 209 4 23 191 10.75 214 5 17 172 8.99 189 6 10 175 5.41 185 7 14 210 6.25 224 8 4 234 1.68 238 9 2 196 1.01 198 10 3 194 1.52 197 11 2 188 1.05 190 12 5 203 2.40 208 13 4 208 1.89 212 14 3 201 1.47 204 15 4 203 1.93 207 16 2 163 1.21 165 17 2 182 1.09 184 18 1 209 0.48 210 19 0 206 0.00 206 20 1 208 0.48 209 21 2 222 0.89 224 22 5 225 2.17 230 23 3 211 1.40 214 24 1 198 0.50 199 25 2 197 1.01 199 26 0 221 0.00 221 27 2 218 0.91 220 28 3 202 1.46 205 29 0 225 0.00 225 30 0 204 0.00 204 31 3 223 1.33 226 32 1 171 0.58 172 33 1 198 0.50 199 34 3 208 1.42 211 35 4 211 1.86 215 36 2 209 0.95 211 37 1 179 0.56 180 38 5 197 2.48 202 39 3 221 1.34 224 40 1 198 0.50 199 41 1 223 0.45 224 42 1 190 0.52 191 43 1 202 0.49 203 44 1 208 0.48 209 45 1 190 0.52 191 46 4 182 2.15 186 47 2 195 1.02 197 48 3 187 1.58 190 49 2 213 0.93 215 50 3 206 1.44 209 51 2 210 0.94 212 52 2 222 0.89 224 53 2 235 0.84 237 54 1 218 0.46 219 55 3 232 1.28 235 56 2 205 0.97 207 57 1 209 0.48 210 58 3 206 1.44 209 59 0 211 0.00 211 60 0 229 0.00 229 61 4 229 1.72 233 62 1 199 0.50 200 63 1 200 0.50 201 64 2 211 0.94 213 65 5 214 2.28 219 66 0 215 0.00 215 67 5 186 2.62 191 68 4 231 1.70 235 69 1 199 0.50 200 70 1 191 0.52 192 71 1 182 0.55 183 72 1 197 0.51 198 73 2 205 0.97 207 74 4 184 2.13 188 75 3 182 1.62 185 76 2 177 1.12 179 77 1 189 0.53 190 78 1 189 0.53 190 79 1 166 0.60 167 80 2 187 1.06 189 81 1 174 0.57 175 82 1 175 0.57 176 83 0 199 0.00 199 84 2 164 1.20 166 85 1 182 0.55 183 86 1 173 0.57 174 87 2 171 1.16 173 88 1 196 0.51 197 89 1 176 0.56 177 90 0 191 0.00 191 91 0 155 0.00 155 92 0 177 0.00 177 93 1 190 0.52 191 94 2 162 1.22 164 95 2 164 1.20 166 96 2 148 1.33 150 97 3 124 2.36 127 98 3 138 2.13 141 99 2 85 2.30 87 100 1 92 1.08 93 101 1 128 0.78 129 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 187 233 44.52 420 2 115 241 32.30 356 3 72 320 18.37 392 4 70 364 16.13 434 5 56 413 11.94 469 6 52 455 10.26 507 7 54 542 9.06 596 8 36 616 5.52 652 9 33 547 5.69 580 10 42 542 7.19 584 11 46 559 7.60 605 12 50 555 8.26 605 13 36 590 5.75 626 14 45 564 7.39 609 15 40 642 5.87 682 16 33 617 5.08 650 17 50 658 7.06 708 18 43 680 5.95 723 19 39 673 5.48 712 20 39 684 5.39 723 21 33 672 4.68 705 22 30 709 4.06 739 23 49 690 6.63 739 24 38 676 5.32 714 25 34 695 4.66 729 26 47 712 6.19 759 27 38 701 5.14 739 28 36 743 4.62 779 29 44 702 5.90 746 30 43 691 5.86 734 31 31 693 4.28 724 32 45 659 6.39 704 33 31 684 4.34 715 34 44 651 6.33 695 35 44 679 6.09 723 36 26 689 3.64 715 37 27 722 3.60 749 38 43 718 5.65 761 39 29 719 3.88 748 40 25 727 3.32 752 41 36 700 4.89 736 42 32 741 4.14 773 43 29 657 4.23 686 44 25 680 3.55 705 45 35 712 4.69 747 46 24 741 3.14 765 47 38 763 4.74 801 48 36 773 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