CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 89 234 27.55 323 2 85 248 25.53 333 3 72 170 29.75 242 4 88 131 40.18 219 5 75 136 35.55 211 6 86 120 41.75 206 7 95 117 44.81 212 8 47 137 25.54 184 9 34 139 19.65 173 10 31 125 19.87 156 11 41 131 23.84 172 12 35 117 23.03 152 13 41 125 24.70 166 14 38 113 25.17 151 15 37 140 20.90 177 16 30 118 20.27 148 17 29 131 18.12 160 18 26 115 18.44 141 19 34 134 20.24 168 20 30 112 21.13 142 21 27 127 17.53 154 22 33 132 20.00 165 23 36 109 24.83 145 24 38 136 21.84 174 25 27 117 18.75 144 26 25 153 14.04 178 27 34 146 18.89 180 28 32 125 20.38 157 29 21 129 14.00 150 30 29 121 19.33 150 31 19 125 13.19 144 32 19 119 13.77 138 33 21 125 14.38 146 34 29 119 19.59 148 35 29 110 20.86 139 36 23 120 16.08 143 37 33 125 20.89 158 38 22 143 13.33 165 39 17 125 11.97 142 40 27 111 19.57 138 41 28 123 18.54 151 42 22 96 18.64 118 43 22 135 14.01 157 44 41 121 25.31 162 45 28 112 20.00 140 46 17 123 12.14 140 47 35 118 22.88 153 48 22 127 14.77 149 49 33 134 19.76 167 50 19 115 14.18 134 51 22 120 15.49 142 52 26 125 17.22 151 53 19 118 13.87 137 54 29 122 19.21 151 55 20 103 16.26 123 56 26 121 17.69 147 57 31 93 25.00 124 58 25 102 19.69 127 59 30 137 17.96 167 60 26 118 18.06 144 61 30 121 19.87 151 62 38 115 24.84 153 63 22 105 17.32 127 64 19 127 13.01 146 65 35 121 22.44 156 66 25 127 16.45 152 67 29 101 22.31 130 68 20 103 16.26 123 69 25 93 21.19 118 70 22 126 14.86 148 71 33 116 22.15 149 72 26 110 19.12 136 73 21 109 16.15 130 74 20 115 14.81 135 75 17 108 13.60 125 76 34 96 26.15 130 77 15 112 11.81 127 78 21 112 15.79 133 79 30 107 21.90 137 80 22 98 18.33 120 81 19 107 15.08 126 82 23 95 19.49 118 83 21 110 16.03 131 84 27 110 19.71 137 85 28 90 23.73 118 86 31 102 23.31 133 87 26 99 20.80 125 88 25 94 21.01 119 89 23 81 22.12 104 90 26 96 21.31 122 91 28 85 24.78 113 92 19 99 16.10 118 93 14 99 12.39 113 94 22 97 18.49 119 95 18 99 15.38 117 96 33 88 27.27 121 97 21 119 15.00 140 98 16 79 16.84 95 99 21 76 21.65 97 100 14 88 13.73 102 101 7 103 6.36 110 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 156 227 40.73 383 2 91 164 35.69 255 3 43 163 20.87 206 4 19 201 8.64 220 5 10 190 5.00 200 6 13 173 6.99 186 7 7 227 2.99 234 8 6 250 2.34 256 9 1 232 0.43 233 10 1 233 0.43 234 11 3 198 1.49 201 12 3 226 1.31 229 13 1 220 0.45 221 14 0 223 0.00 223 15 3 215 1.38 218 16 0 210 0.00 210 17 2 185 1.07 187 18 1 175 0.57 176 19 2 218 0.91 220 20 1 229 0.43 230 21 2 236 0.84 238 22 2 223 0.89 225 23 3 249 1.19 252 24 1 212 0.47 213 25 1 219 0.45 220 26 2 217 0.91 219 27 3 213 1.39 216 28 1 245 0.41 246 29 2 230 0.86 232 30 1 224 0.44 225 31 1 272 0.37 273 32 0 219 0.00 219 33 1 211 0.47 212 34 2 221 0.90 223 35 2 226 0.88 228 36 3 220 1.35 223 37 3 230 1.29 233 38 5 212 2.30 217 39 3 203 1.46 206 40 4 204 1.92 208 41 2 231 0.86 233 42 6 209 2.79 215 43 1 210 0.47 211 44 4 207 1.90 211 45 1 227 0.44 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178 2.20 182 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 169 240 41.32 409 2 90 249 26.55 339 3 59 305 16.21 364 4 71 381 15.71 452 5 60 417 12.58 477 6 57 484 10.54 541 7 47 618 7.07 665 8 40 661 5.71 701 9 32 573 5.29 605 10 40 581 6.44 621 11 40 596 6.29 636 12 43 590 6.79 633 13 47 579 7.51 626 14 47 582 7.47 629 15 27 636 4.07 663 16 45 649 6.48 694 17 51 669 7.08 720 18 28 713 3.78 741 19 43 706 5.74 749 20 42 684 5.79 726 21 35 710 4.70 745 22 34 701 4.63 735 23 35 681 4.89 716 24 43 744 5.46 787 25 42 716 5.54 758 26 35 716 4.66 751 27 29 711 3.92 740 28 31 755 3.94 786 29 39 768 4.83 807 30 30 731 3.94 761 31 39 692 5.34 731 32 34 720 4.51 754 33 25 705 3.42 730 34 32 696 4.40 728 35 42 749 5.31 791 36 28 748 3.61 776 37 53 775 6.40 828 38 30 717 4.02 747 39 35 763 4.39 798 40 30 739 3.90 769 41 36 782 4.40 818 42 20 752 2.59 772 43 36 759 4.53 795 44 38 743 4.87 781 45 29 718 3.88 747 46 34 746 4.36 780 47 39 761 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24 324 6.90 348 101 9 509 1.74 518 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 68 114 37.36 182 2 69 101 40.59 170 3 70 121 36.65 191 4 71 125 36.22 196 5 24 188 11.32 212 6 16 83 16.16 99 7 15 86 14.85 101 8 15 94 13.76 109 9 13 93 12.26 106 10 10 83 10.75 93 11 15 110 12.00 125 12 14 88 13.73 102 13 7 84 7.69 91 14 22 102 17.74 124 15 23 72 24.21 95 16 6 76 7.32 82 17 25 67 27.17 92 18 17 46 26.98 63 19 18 83 17.82 101 20 14 77 15.38 91 21 12 66 15.38 78 22 23 91 20.18 114 23 11 68 13.92 79 24 7 75 8.54 82 25 13 59 18.06 72 26 13 65 16.67 78 27 15 74 16.85 89 28 12 55 17.91 67 29 11 71 13.41 82 30 14 68 17.07 82 31 16 55 22.54 71 32 15 67 18.29 82 33 13 63 17.11 76 34 13 64 16.88 77 35 24 68 26.09 92 36 15 74 16.85 89 37 17 52 24.64 69 38 13 60 17.81 73 39 9 61 12.86 70 40 11 67 14.10 78 41 11 65 14.47 76 42 14 81 14.74 95 43 19 61 23.75 80 44 19 49 27.94 68 45 14 78 15.22 92 46 15 43 25.86 58 47 9 73 10.98 82 48 18 49 26.87 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17.39 161 2 32 169 15.92 201 3 21 135 13.46 156 4 31 148 17.32 179 5 1 266 0.37 267 6 2 325 0.61 327 7 1 181 0.55 182 8 2 206 0.96 208 9 1 160 0.62 161 10 0 187 0.00 187 11 0 212 0.00 212 12 1 168 0.59 169 13 0 177 0.00 177 14 0 179 0.00 179 15 0 186 0.00 186 16 2 158 1.25 160 17 4 165 2.37 169 18 2 140 1.41 142 19 0 147 0.00 147 20 0 142 0.00 142 21 2 164 1.20 166 22 0 133 0.00 133 23 3 144 2.04 147 24 1 141 0.70 142 25 1 131 0.76 132 26 2 155 1.27 157 27 1 120 0.83 121 28 1 125 0.79 126 29 0 132 0.00 132 30 0 139 0.00 139 31 1 121 0.82 122 32 5 102 4.67 107 33 0 169 0.00 169 34 2 121 1.63 123 35 0 112 0.00 112 36 2 120 1.64 122 37 2 123 1.60 125 38 2 133 1.48 135 39 2 146 1.35 148 40 0 96 0.00 96 41 1 118 0.84 119 42 2 92 2.13 94 43 3 110 2.65 113 44 1 111 0.89 112 45 0 89 0.00 89 46 0 94 0.00 94 47 0 89 0.00 89 48 1 103 0.96 104 49 1 90 1.10 91 50 1 96 1.03 97 51 0 84 0.00 84 52 0 86 0.00 86 53 1 99 1.00 100 54 3 97 3.00 100 55 1 88 1.12 89 56 1 94 1.05 95 57 1 81 1.22 82 58 2 113 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