CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 113717 2481002 4.38 2594719 2 30691 4194 87.98 34885 3 1766 141437 1.23 143203 4 2417 261640 0.92 264057 5 3880 265782 1.44 269662 6 3518 233779 1.48 237297 7 3609 240946 1.48 244555 8 3937 238630 1.62 242567 9 4486 246747 1.79 251233 10 5544 254194 2.13 259738 11 3106 246901 1.24 250007 12 3672 265956 1.36 269628 13 2843 234482 1.20 237325 14 3189 252657 1.25 255846 15 4052 254585 1.57 258637 16 13028 297190 4.20 310218 17 3657 262768 1.37 266425 18 2425 221675 1.08 224100 19 2093 215377 0.96 217470 20 2225 213874 1.03 216099 21 3102 244600 1.25 247702 22 2962 275747 1.06 278709 23 3471 288004 1.19 291475 24 2851 217201 1.30 220052 25 3005 229978 1.29 232983 26 2390 208727 1.13 211117 27 2367 236636 0.99 239003 28 2353 243894 0.96 246247 29 3702 262120 1.39 265822 30 3671 264655 1.37 268326 31 4382 269219 1.60 273601 32 3979 285262 1.38 289241 33 4437 292523 1.49 296960 34 5287 337245 1.54 342532 35 2792 249413 1.11 252205 36 4119 257829 1.57 261948 37 2875 237474 1.20 240349 38 2678 246201 1.08 248879 39 3230 247753 1.29 250983 40 5089 276410 1.81 281499 41 3567 271952 1.29 275519 42 3179 228336 1.37 231515 43 2888 222945 1.28 225833 44 3276 223613 1.44 226889 45 2990 220692 1.34 223682 46 2401 200210 1.19 202611 47 3221 224089 1.42 227310 48 2696 210885 1.26 213581 49 2964 202112 1.45 205076 50 2525 201146 1.24 203671 51 3942 250936 1.55 254878 52 3432 279279 1.21 282711 53 2872 253151 1.12 256023 54 3174 212944 1.47 216118 55 2167 186407 1.15 188574 56 3364 194086 1.70 197450 57 2195 187290 1.16 189485 58 3138 260175 1.19 263313 59 3076 283287 1.07 286363 60 2356 182748 1.27 185104 61 2389 194618 1.21 197007 62 2205 217084 1.01 219289 63 2626 245466 1.06 248092 64 2415 180521 1.32 182936 65 2301 189186 1.20 191487 66 2595 204725 1.25 207320 67 2230 196620 1.12 198850 68 1958 184144 1.05 186102 69 1956 205631 0.94 207587 70 1650 170675 0.96 172325 71 1844 162281 1.12 164125 72 2759 169908 1.60 172667 73 2126 168580 1.25 170706 74 2151 178978 1.19 181129 75 1792 173151 1.02 174943 76 2084 170225 1.21 172309 77 1935 154305 1.24 156240 78 1357 149715 0.90 151072 79 1495 156205 0.95 157700 80 1722 153423 1.11 155145 81 1947 159151 1.21 161098 82 2696 215287 1.24 217983 83 2401 235275 1.01 237676 84 2406 171896 1.38 174302 85 1882 150093 1.24 151975 86 2124 223294 0.94 225418 87 3694 267859 1.36 271553 88 2179 167326 1.29 169505 89 1776 149124 1.18 150900 90 2034 150698 1.33 152732 91 1657 142754 1.15 144411 92 1619 153543 1.04 155162 93 2381 242409 0.97 244790 94 3169 241755 1.29 244924 95 2406 153870 1.54 156276 96 2357 156742 1.48 159099 97 2101 136099 1.52 138200 98 1865 145321 1.27 147186 99 2506 153424 1.61 155930 100 1472 142752 1.02 144224 101 1414 131792 1.06 133206 102 1657 135659 1.21 137316 103 1727 132681 1.28 134408 104 3466 181449 1.87 184915 105 2389 179368 1.31 181757 106 1808 142224 1.26 144032 107 1645 139463 1.17 141108 108 1509 129474 1.15 130983 109 1650 134963 1.21 136613 110 2082 146478 1.40 148560 111 2443 161475 1.49 163918 112 2972 166721 1.75 169693 113 2632 170524 1.52 173156 114 3377 174431 1.90 177808 115 2396 175184 1.35 177580 116 2645 167594 1.55 170239 117 1501 114667 1.29 116168 118 1396 118404 1.17 119800 119 1307 113654 1.14 114961 120 2688 157658 1.68 160346 121 1757 138651 1.25 140408 122 2061 159017 1.28 161078 123 2660 156773 1.67 159433 124 1392 116383 1.18 117775 125 1319 110437 1.18 111756 126 1560 114079 1.35 115639 127 1615 118024 1.35 119639 128 2213 137134 1.59 139347 129 2541 154379 1.62 156920 130 1540 105219 1.44 106759 131 1115 98554 1.12 99669 132 1837 109614 1.65 111451 133 1330 97600 1.34 98930 134 1161 96889 1.18 98050 135 1290 104406 1.22 105696 136 1030 94095 1.08 95125 137 1293 93520 1.36 94813 138 1145 93432 1.21 94577 139 1222 97895 1.23 99117 140 2451 124391 1.93 126842 141 1366 91908 1.46 93274 142 1418 91851 1.52 93269 143 1294 97620 1.31 98914 144 4829 158424 2.96 163253 145 2085 93152 2.19 95237 146 1310 96619 1.34 97929 147 1127 82035 1.36 83162 148 920 30171 2.96 31091 149 8529 35109 19.54 43638 150 15550 34079 31.33 49629 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7555 2934017 0.26 2941572 2 4183 14122 22.85 18305 3 26176 10602 71.17 36778 4 1104 261401 0.42 262505 5 1032 194980 0.53 196012 6 1150 183624 0.62 184774 7 1119 204068 0.55 205187 8 1937 209053 0.92 210990 9 1573 320581 0.49 322154 10 1373 213934 0.64 215307 11 1051 188038 0.56 189089 12 1072 222909 0.48 223981 13 1069 217925 0.49 218994 14 1019 210358 0.48 211377 15 1073 224704 0.48 225777 16 1295 309675 0.42 310970 17 1576 263601 0.59 265177 18 1211 220615 0.55 221826 19 1342 244276 0.55 245618 20 1224 201507 0.60 202731 21 1594 250543 0.63 252137 22 1587 288525 0.55 290112 23 1579 209540 0.75 211119 24 1360 209057 0.65 210417 25 1400 229412 0.61 230812 26 1372 205133 0.66 206505 27 1295 233756 0.55 235051 28 1435 264320 0.54 265755 29 1417 241240 0.58 242657 30 1189 202753 0.58 203942 31 2194 338015 0.64 340209 32 989 191949 0.51 192938 33 1133 194351 0.58 195484 34 1883 368629 0.51 370512 35 1030 197817 0.52 198847 36 1293 219537 0.59 220830 37 1113 223625 0.50 224738 38 1349 268761 0.50 270110 39 1070 222961 0.48 224031 40 1124 208555 0.54 209679 41 1043 215408 0.48 216451 42 1064 216289 0.49 217353 43 1061 216605 0.49 217666 44 1022 198820 0.51 199842 45 1235 233667 0.53 234902 46 1033 206357 0.50 207390 47 1048 206281 0.51 207329 48 1068 200059 0.53 201127 49 1057 189372 0.56 190429 50 1107 209324 0.53 210431 51 1321 251351 0.52 252672 52 984 181673 0.54 182657 53 958 185177 0.51 186135 54 1030 211821 0.48 212851 55 1003 193114 0.52 194117 56 966 171876 0.56 172842 57 1023 184531 0.55 185554 58 1062 210816 0.50 211878 59 886 193713 0.46 194599 60 923 172641 0.53 173564 61 966 189443 0.51 190409 62 893 183651 0.48 184544 63 953 197317 0.48 198270 64 919 176280 0.52 177199 65 872 169361 0.51 170233 66 826 165634 0.50 166460 67 845 160627 0.52 161472 68 917 177169 0.51 178086 69 886 165707 0.53 166593 70 926 165113 0.56 166039 71 865 161888 0.53 162753 72 850 171206 0.49 172056 73 847 155665 0.54 156512 74 785 168133 0.46 168918 75 900 180372 0.50 181272 76 793 149846 0.53 150639 77 774 147834 0.52 148608 78 922 169069 0.54 169991 79 862 174050 0.49 174912 80 714 139183 0.51 139897 81 870 154826 0.56 155696 82 833 152243 0.54 153076 83 747 153211 0.49 153958 84 807 154793 0.52 155600 85 744 155025 0.48 155769 86 867 170876 0.50 171743 87 886 157891 0.56 158777 88 876 167462 0.52 168338 89 823 146762 0.56 147585 90 852 148465 0.57 149317 91 787 135617 0.58 136404 92 693 133257 0.52 133950 93 882 152461 0.58 153343 94 968 203357 0.47 204325 95 764 150886 0.50 151650 96 859 150370 0.57 151229 97 770 159980 0.48 160750 98 733 136915 0.53 137648 99 789 147926 0.53 148715 100 776 145881 0.53 146657 101 618 123575 0.50 124193 102 790 133259 0.59 134049 103 801 148088 0.54 148889 104 835 135002 0.61 135837 105 826 155822 0.53 156648 106 714 141663 0.50 142377 107 1098 219196 0.50 220294 108 729 134304 0.54 135033 109 786 137200 0.57 137986 110 718 135071 0.53 135789 111 1135 250642 0.45 251777 112 659 120002 0.55 120661 113 610 116376 0.52 116986 114 912 173664 0.52 174576 115 588 109972 0.53 110560 116 747 164843 0.45 165590 117 624 111035 0.56 111659 118 635 117799 0.54 118434 119 680 116089 0.58 116769 120 1053 139255 0.75 140308 121 637 112581 0.56 113218 122 631 119206 0.53 119837 123 947 169364 0.56 170311 124 637 112962 0.56 113599 125 623 106936 0.58 107559 126 623 105822 0.59 106445 127 1138 115688 0.97 116826 128 1120 155114 0.72 156234 129 764 154843 0.49 155607 130 537 92867 0.57 93404 131 557 93402 0.59 93959 132 586 101830 0.57 102416 133 519 94356 0.55 94875 134 502 85036 0.59 85538 135 532 96337 0.55 96869 136 923 183196 0.50 184119 137 550 101635 0.54 102185 138 581 94300 0.61 94881 139 533 90752 0.58 91285 140 430 81610 0.52 82040 141 464 87718 0.53 88182 142 472 83333 0.56 83805 143 542 87369 0.62 87911 144 1795 186509 0.95 188304 145 502 84620 0.59 85122 146 572 90224 0.63 90796 147 512 78048 0.65 78560 148 328 28660 1.13 28988 149 536 34469 1.53 35005 150 542 43562 1.23 44104 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2258 170320 1.31 172578 2 17874 572910 3.03 590784 3 18358 520410 3.41 538768 4 9338 789888 1.17 799226 5 12109 738451 1.61 750560 6 9585 829573 1.14 839158 7 9800 753812 1.28 763612 8 11585 762450 1.50 774035 9 9326 717412 1.28 726738 10 10155 749189 1.34 759344 11 9503 755361 1.24 764864 12 10388 832900 1.23 843288 13 12723 816915 1.53 829638 14 10957 723275 1.49 734232 15 10357 857545 1.19 867902 16 10920 745957 1.44 756877 17 10209 806985 1.25 817194 18 11227 824946 1.34 836173 19 11377 767407 1.46 778784 20 11238 766674 1.44 777912 21 9544 809670 1.17 819214 22 10747 819988 1.29 830735 23 10669 769091 1.37 779760 24 8542 810140 1.04 818682 25 8583 744094 1.14 752677 26 7455 751138 0.98 758593 27 8168 830711 0.97 838879 28 6636 753413 0.87 760049 29 7502 719563 1.03 727065 30 5794 770197 0.75 775991 31 5832 730619 0.79 736451 32 4138 701184 0.59 705322 33 4000 713649 0.56 717649 34 3984 697755 0.57 701739 35 3871 720846 0.53 724717 36 3726 708047 0.52 711773 37 4103 783650 0.52 787753 38 3685 735724 0.50 739409 39 3537 679394 0.52 682931 40 3592 698046 0.51 701638 41 3390 671853 0.50 675243 42 3384 673264 0.50 676648 43 3445 720593 0.48 724038 44 3359 717362 0.47 720721 45 3196 704824 0.45 708020 46 3189 674257 0.47 677446 47 3231 653969 0.49 657200 48 3342 712268 0.47 715610 49 3245 703013 0.46 706258 50 3261 672159 0.48 675420 51 3263 691187 0.47 694450 52 2933 599086 0.49 602019 53 3090 633978 0.49 637068 54 3265 679684 0.48 682949 55 3040 642914 0.47 645954 56 2914 618495 0.47 621409 57 2975 622676 0.48 625651 58 2953 642753 0.46 645706 59 2749 576209 0.47 578958 60 3009 615501 0.49 618510 61 2654 568621 0.46 571275 62 2940 602683 0.49 605623 63 2903 643259 0.45 646162 64 2858 571235 0.50 574093 65 2665 598042 0.44 600707 66 2706 573693 0.47 576399 67 2684 598439 0.45 601123 68 2797 596705 0.47 599502 69 2689 574465 0.47 577154 70 2899 652110 0.44 655009 71 2613 530381 0.49 532994 72 2898 606775 0.48 609673 73 2807 602890 0.46 605697 74 2538 533062 0.47 535600 75 2829 624242 0.45 627071 76 2598 573563 0.45 576161 77 2697 593932 0.45 596629 78 2768 590925 0.47 593693 79 2581 530837 0.48 533418 80 2651 575888 0.46 578539 81 2347 511069 0.46 513416 82 2533 566874 0.44 569407 83 2614 539132 0.48 541746 84 2379 500008 0.47 502387 85 2350 506847 0.46 509197 86 2337 491246 0.47 493583 87 2153 471780 0.45 473933 88 2230 481541 0.46 483771 89 2279 482803 0.47 485082 90 2271 497831 0.45 500102 91 2310 516607 0.45 518917 92 2212 464740 0.47 466952 93 2249 472755 0.47 475004 94 2160 466522 0.46 468682 95 2096 460890 0.45 462986 96 2271 504811 0.45 507082 97 2336 491781 0.47 494117 98 2079 434751 0.48 436830 99 2208 483964 0.45 486172 100 2011 434739 0.46 436750 101 2214 477720 0.46 479934 102 2197 457797 0.48 459994 103 2130 412149 0.51 414279 104 2129 415494 0.51 417623 105 2519 501316 0.50 503835 106 1891 417662 0.45 419553 107 2262 472219 0.48 474481 108 2432 519537 0.47 521969 109 2054 418374 0.49 420428 110 2026 433810 0.46 435836 111 1918 414649 0.46 416567 112 1881 410335 0.46 412216 113 1945 392787 0.49 394732 114 1807 388465 0.46 390272 115 2157 456598 0.47 458755 116 2690 436415 0.61 439105 117 2033 431377 0.47 433410 118 1999 455113 0.44 457112 119 1848 369133 0.50 370981 120 1795 361297 0.49 363092 121 1964 392516 0.50 394480 122 1785 378821 0.47 380606 123 1793 392238 0.46 394031 124 1647 380686 0.43 382333 125 1689 322993 0.52 324682 126 1622 329085 0.49 330707 127 1901 388026 0.49 389927 128 1741 367083 0.47 368824 129 1664 335218 0.49 336882 130 1752 406136 0.43 407888 131 1641 330141 0.49 331782 132 1744 350038 0.50 351782 133 1727 360720 0.48 362447 134 1545 305319 0.50 306864 135 1444 297834 0.48 299278 136 1443 290104 0.49 291547 137 1775 345835 0.51 347610 138 1550 302309 0.51 303859 139 1644 352179 0.46 353823 140 1415 290311 0.49 291726 141 1569 292126 0.53 293695 142 1606 289241 0.55 290847 143 1561 318930 0.49 320491 144 1499 284324 0.52 285823 145 1531 279916 0.54 281447 146 1657 268008 0.61 269665 147 1436 272685 0.52 274121 148 859 86258 0.99 87117 149 628 83423 0.75 84051 150 1056 126848 0.83 127904 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 562 46213 1.20 46775 2 623 86065 0.72 86688 3 716 66166 1.07 66882 4 621 64646 0.95 65267 5 603 70207 0.85 70810 6 828 70515 1.16 71343 7 1520 71967 2.07 73487 8 1678 72409 2.26 74087 9 578 73739 0.78 74317 10 666 75707 0.87 76373 11 574 73601 0.77 74175 12 667 73346 0.90 74013 13 1753 76778 2.23 78531 14 6934 83093 7.70 90027 15 930 69690 1.32 70620 16 532 66883 0.79 67415 17 590 69166 0.85 69756 18 630 68489 0.91 69119 19 622 68108 0.90 68730 20 509 65322 0.77 65831 21 621 62674 0.98 63295 22 416 58006 0.71 58422 23 483 65253 0.73 65736 24 554 61858 0.89 62412 25 495 60601 0.81 61096 26 406 58978 0.68 59384 27 473 66426 0.71 66899 28 486 62545 0.77 63031 29 614 71942 0.85 72556 30 427 55821 0.76 56248 31 573 68399 0.83 68972 32 407 60581 0.67 60988 33 354 53074 0.66 53428 34 403 52675 0.76 53078 35 450 58525 0.76 58975 36 422 57619 0.73 58041 37 389 54612 0.71 55001 38 540 62491 0.86 63031 39 408 52126 0.78 52534 40 409 53186 0.76 53595 41 484 54133 0.89 54617 42 445 50966 0.87 51411 43 386 45513 0.84 45899 44 354 46749 0.75 47103 45 381 50743 0.75 51124 46 354 51417 0.68 51771 47 388 47540 0.81 47928 48 359 45232 0.79 45591 49 384 56267 0.68 56651 50 316 45544 0.69 45860 51 343 44704 0.76 45047 52 324 43542 0.74 43866 53 316 44503 0.71 44819 54 349 44276 0.78 44625 55 363 44052 0.82 44415 56 403 49917 0.80 50320 57 288 41961 0.68 42249 58 282 40812 0.69 41094 59 328 41832 0.78 42160 60 271 40083 0.67 40354 61 269 40577 0.66 40846 62 272 40620 0.67 40892 63 284 39163 0.72 39447 64 277 38186 0.72 38463 65 317 41650 0.76 41967 66 278 38795 0.71 39073 67 263 36147 0.72 36410 68 316 38155 0.82 38471 69 320 38652 0.82 38972 70 308 38400 0.80 38708 71 311 37632 0.82 37943 72 382 36339 1.04 36721 73 256 35827 0.71 36083 74 247 33386 0.73 33633 75 235 31740 0.73 31975 76 197 30850 0.63 31047 77 195 30370 0.64 30565 78 207 30751 0.67 30958 79 238 32360 0.73 32598 80 289 43705 0.66 43994 81 205 33794 0.60 33999 82 174 33461 0.52 33635 83 267 32952 0.80 33219 84 326 39895 0.81 40221 85 210 32929 0.63 33139 86 437 31680 1.36 32117 87 213 30145 0.70 30358 88 194 29822 0.65 30016 89 232 27089 0.85 27321 90 233 35141 0.66 35374 91 219 30346 0.72 30565 92 279 33424 0.83 33703 93 183 28541 0.64 28724 94 171 26532 0.64 26703 95 147 25271 0.58 25418 96 157 24500 0.64 24657 97 173 28985 0.59 29158 98 154 27000 0.57 27154 99 156 24469 0.63 24625 100 177 24894 0.71 25071 101 155 25386 0.61 25541 102 240 24108 0.99 24348 103 159 25458 0.62 25617 104 148 24648 0.60 24796 105 178 23008 0.77 23186 106 140 24566 0.57 24706 107 151 26406 0.57 26557 108 165 23419 0.70 23584 109 155 23322 0.66 23477 110 242 23977 1.00 24219 111 170 22072 0.76 22242 112 210 25089 0.83 25299 113 150 22975 0.65 23125 114 210 21370 0.97 21580 115 140 20390 0.68 20530 116 120 20246 0.59 20366 117 105 20098 0.52 20203 118 196 21908 0.89 22104 119 680 21082 3.12 21762 120 130 19814 0.65 19944 121 145 20617 0.70 20762 122 122 21682 0.56 21804 123 156 19207 0.81 19363 124 133 18821 0.70 18954 125 166 19860 0.83 20026 126 576 18252 3.06 18828 127 178 20397 0.87 20575 128 147 17924 0.81 18071 129 105 16870 0.62 16975 130 126 16767 0.75 16893 131 114 17504 0.65 17618 132 142 17534 0.80 17676 133 143 17536 0.81 17679 134 101 18604 0.54 18705 135 129 18517 0.69 18646 136 136 17670 0.76 17806 137 294 25260 1.15 25554 138 110 16760 0.65 16870 139 97 17678 0.55 17775 140 122 16938 0.72 17060 141 108 17734 0.61 17842 142 516 24685 2.05 25201 143 923 15309 5.69 16232 144 96 14900 0.64 14996 145 122 13831 0.87 13953 146 83 8202 1.00 8285 147 59 7688 0.76 7747 148 38 7717 0.49 7755 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 9682 4154 69.98 13836 2 407 89206 0.45 89613 3 413 63852 0.64 64265 4 453 80018 0.56 80471 5 459 66805 0.68 67264 6 1110 62826 1.74 63936 7 466 82483 0.56 82949 8 461 71628 0.64 72089 9 334 63701 0.52 64035 10 268 65535 0.41 65803 11 371 72814 0.51 73185 12 326 76237 0.43 76563 13 307 64297 0.48 64604 14 360 71576 0.50 71936 15 344 72397 0.47 72741 16 329 69217 0.47 69546 17 319 71348 0.45 71667 18 298 62345 0.48 62643 19 299 65024 0.46 65323 20 317 67017 0.47 67334 21 271 57302 0.47 57573 22 294 56890 0.51 57184 23 260 57014 0.45 57274 24 273 63650 0.43 63923 25 260 59958 0.43 60218 26 257 55252 0.46 55509 27 297 55971 0.53 56268 28 263 58707 0.45 58970 29 300 55740 0.54 56040 30 283 49435 0.57 49718 31 247 53136 0.46 53383 32 289 67050 0.43 67339 33 246 53495 0.46 53741 34 214 53289 0.40 53503 35 249 56216 0.44 56465 36 303 60652 0.50 60955 37 240 50949 0.47 51189 38 259 52830 0.49 53089 39 259 50004 0.52 50263 40 226 45965 0.49 46191 41 237 50002 0.47 50239 42 237 53052 0.44 53289 43 213 51209 0.41 51422 44 230 51583 0.44 51813 45 183 47178 0.39 47361 46 182 46515 0.39 46697 47 211 43976 0.48 44187 48 232 47875 0.48 48107 49 208 45631 0.45 45839 50 177 45417 0.39 45594 51 212 45316 0.47 45528 52 211 44076 0.48 44287 53 233 45633 0.51 45866 54 181 43242 0.42 43423 55 219 44317 0.49 44536 56 212 47501 0.44 47713 57 180 37139 0.48 37319 58 169 38432 0.44 38601 59 160 37245 0.43 37405 60 182 38465 0.47 38647 61 202 41378 0.49 41580 62 183 42972 0.42 43155 63 188 40030 0.47 40218 64 173 35213 0.49 35386 65 191 39291 0.48 39482 66 163 36512 0.44 36675 67 143 35616 0.40 35759 68 154 33788 0.45 33942 69 182 34566 0.52 34748 70 152 36588 0.41 36740 71 136 31994 0.42 32130 72 172 33423 0.51 33595 73 175 33497 0.52 33672 74 174 34240 0.51 34414 75 133 33226 0.40 33359 76 136 32168 0.42 32304 77 177 33288 0.53 33465 78 147 30769 0.48 30916 79 156 35431 0.44 35587 80 151 32526 0.46 32677 81 142 31897 0.44 32039 82 121 30655 0.39 30776 83 125 30903 0.40 31028 84 105 27192 0.38 27297 85 109 30620 0.35 30729 86 98 29238 0.33 29336 87 139 27851 0.50 27990 88 117 27091 0.43 27208 89 109 30831 0.35 30940 90 86 25432 0.34 25518 91 130 28378 0.46 28508 92 113 29041 0.39 29154 93 122 26101 0.47 26223 94 120 28711 0.42 28831 95 118 31401 0.37 31519 96 115 25205 0.45 25320 97 124 25983 0.47 26107 98 110 25021 0.44 25131 99 86 24025 0.36 24111 100 103 25074 0.41 25177 101 100 27334 0.36 27434 102 133 26582 0.50 26715 103 106 23898 0.44 24004 104 96 25877 0.37 25973 105 118 22925 0.51 23043 106 71 20997 0.34 21068 107 119 24726 0.48 24845 108 85 22106 0.38 22191 109 133 35422 0.37 35555 110 113 22053 0.51 22166 111 79 19631 0.40 19710 112 134 30550 0.44 30684 113 97 21346 0.45 21443 114 97 19868 0.49 19965 115 93 19985 0.46 20078 116 75 20305 0.37 20380 117 91 21292 0.43 21383 118 89 22086 0.40 22175 119 111 21627 0.51 21738 120 88 18512 0.47 18600 121 104 20990 0.49 21094 122 80 19792 0.40 19872 123 92 15991 0.57 16083 124 62 17841 0.35 17903 125 87 18396 0.47 18483 126 440 17861 2.40 18301 127 68 17094 0.40 17162 128 84 17311 0.48 17395 129 96 19863 0.48 19959 130 76 16422 0.46 16498 131 78 16985 0.46 17063 132 69 16455 0.42 16524 133 105 19387 0.54 19492 134 95 16915 0.56 17010 135 85 15615 0.54 15700 136 59 16916 0.35 16975 137 78 14492 0.54 14570 138 63 24243 0.26 24306 139 67 15063 0.44 15130 140 63 14940 0.42 15003 141 61 17952 0.34 18013 142 107 16589 0.64 16696 143 69 14323 0.48 14392 144 73 14616 0.50 14689 145 63 13348 0.47 13411 146 50 7593 0.65 7643 147 33 7521 0.44 7554 148 28 6636 0.42 6664 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 2812 161874 1.71 164686 2 1750 282302 0.62 284052 3 2655 248550 1.06 251205 4 1425 258322 0.55 259747 5 1300 258442 0.50 259742 6 1603 256995 0.62 258598 7 1525 248218 0.61 249743 8 1395 249528 0.56 250923 9 1259 256376 0.49 257635 10 1590 250436 0.63 252026 11 2561 258422 0.98 260983 12 1195 229983 0.52 231178 13 1240 240977 0.51 242217 14 1219 238706 0.51 239925 15 1189 238047 0.50 239236 16 1154 247352 0.46 248506 17 1137 233353 0.48 234490 18 1119 221362 0.50 222481 19 1099 223205 0.49 224304 20 1146 231531 0.49 232677 21 959 209936 0.45 210895 22 1005 219896 0.45 220901 23 1080 228865 0.47 229945 24 979 208077 0.47 209056 25 967 208697 0.46 209664 26 971 209582 0.46 210553 27 980 204654 0.48 205634 28 1041 208195 0.50 209236 29 927 197722 0.47 198649 30 956 190559 0.50 191515 31 981 203294 0.48 204275 32 1012 205284 0.49 206296 33 899 194698 0.46 195597 34 930 196035 0.47 196965 35 864 187802 0.46 188666 36 886 184087 0.48 184973 37 786 185138 0.42 185924 38 781 179271 0.43 180052 39 776 182367 0.42 183143 40 797 177482 0.45 178279 41 813 182282 0.44 183095 42 855 169743 0.50 170598 43 879 183040 0.48 183919 44 767 169527 0.45 170294 45 844 168775 0.50 169619 46 796 170383 0.47 171179 47 793 176566 0.45 177359 48 803 166060 0.48 166863 49 708 162640 0.43 163348 50 748 160687 0.46 161435 51 759 156991 0.48 157750 52 643 156094 0.41 156737 53 716 157531 0.45 158247 54 740 151566 0.49 152306 55 728 150518 0.48 151246 56 711 151340 0.47 152051 57 656 142171 0.46 142827 58 645 149263 0.43 149908 59 696 148959 0.47 149655 60 706 153063 0.46 153769 61 677 154081 0.44 154758 62 664 136424 0.48 137088 63 620 135646 0.45 136266 64 629 141168 0.44 141797 65 671 146718 0.46 147389 66 540 132643 0.41 133183 67 644 131290 0.49 131934 68 607 146296 0.41 146903 69 630 132658 0.47 133288 70 603 142906 0.42 143509 71 618 130148 0.47 130766 72 607 124878 0.48 125485 73 597 127010 0.47 127607 74 599 129777 0.46 130376 75 533 126638 0.42 127171 76 572 121865 0.47 122437 77 554 117656 0.47 118210 78 526 126237 0.41 126763 79 526 114358 0.46 114884 80 521 114488 0.45 115009 81 480 112382 0.43 112862 82 473 109839 0.43 110312 83 516 111738 0.46 112254 84 502 108785 0.46 109287 85 479 109582 0.44 110061 86 518 109379 0.47 109897 87 499 106822 0.46 107321 88 501 104920 0.48 105421 89 420 103382 0.40 103802 90 443 103706 0.43 104149 91 406 103036 0.39 103442 92 420 100648 0.42 101068 93 466 100500 0.46 100966 94 466 100187 0.46 100653 95 453 95556 0.47 96009 96 447 95255 0.47 95702 97 491 98999 0.49 99490 98 382 97782 0.39 98164 99 437 92131 0.47 92568 100 431 92301 0.46 92732 101 391 90261 0.43 90652 102 419 89488 0.47 89907 103 418 92632 0.45 93050 104 360 86621 0.41 86981 105 450 89760 0.50 90210 106 461 86026 0.53 86487 107 366 84345 0.43 84711 108 360 80204 0.45 80564 109 418 82543 0.50 82961 110 347 83121 0.42 83468 111 342 78897 0.43 79239 112 333 79185 0.42 79518 113 362 91781 0.39 92143 114 367 77185 0.47 77552 115 376 76255 0.49 76631 116 352 85582 0.41 85934 117 332 72493 0.46 72825 118 371 71356 0.52 71727 119 312 74385 0.42 74697 120 424 80007 0.53 80431 121 292 77266 0.38 77558 122 349 80007 0.43 80356 123 288 66496 0.43 66784 124 320 69881 0.46 70201 125 358 70143 0.51 70501 126 303 66448 0.45 66751 127 291 67796 0.43 68087 128 344 77184 0.44 77528 129 289 62452 0.46 62741 130 327 72463 0.45 72790 131 298 64827 0.46 65125 132 270 69848 0.39 70118 133 294 62540 0.47 62834 134 289 57907 0.50 58196 135 241 63068 0.38 63309 136 253 60477 0.42 60730 137 300 57596 0.52 57896 138 245 56526 0.43 56771 139 254 56063 0.45 56317 140 233 54634 0.42 54867 141 259 57648 0.45 57907 142 238 54868 0.43 55106 143 259 56440 0.46 56699 144 234 55951 0.42 56185 145 211 53850 0.39 54061 146 172 28846 0.59 29018 147 112 27127 0.41 27239 148 122 25689 0.47 25811