Genome: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/data/Porites_evermanni_v1.fa Alignments: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/output/08-Peve-sRNA-discovery-ShortStack/ShortStack_out/merged_alignments.bam Location: Porites_evermani_scaffold_730:81363-81456 minus PDF file name: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/output/08-Peve-sRNA-discovery-ShortStack/ShortStack_out/strucVis/Cluster_6918.ps.pdf Locus Name: Cluster_6918 UCAACAGUAAAACUAACAAAACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACUUGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUGUUAGCGUGGCUCAAACCCUG .....(((....((((((((((((((((((((((.(((((((((...)))))))))))))))))))))))))))))))....)))......... (-42.20) .................AAAACGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:27 al:1 ..................AAACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:27 al:1 ..................AAACGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:23 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAgCA..................................................... len:22 al:1 ...................AACGCUAACUGUAgAACUAACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAgCAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAgCUAACAAGU.................................................. len:25 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:21 al:9 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:24 al:70 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:26 al:7 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:22 al:35 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAA....................................................... len:20 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAu................................................... len:24 al:2 ...................AACaCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:22 al:2 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAgGU.................................................. len:25 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:31 al:1 ...................AACGCUgACUGUAAAACUAACA..................................................... len:22 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:25 al:14 ...................AACGCUAACUGUAAAACUcACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AgCGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAa................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAgG................................................... len:24 al:3 ...................gACGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACU......................................................... len:18 al:4 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAuU.................................................. len:25 al:1 ...................uACGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAgCUAAC...................................................... len:21 al:1 ...................AACuCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:24 al:1 ...................AACGCUAACUGUAAAACUAACAAGc.................................................. len:25 al:5 ....................ACuCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAAuA..................................................... len:21 al:1 ....................AuGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:3 ....................ACGCUAACUGUAgAACUAAC...................................................... len:20 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAgCUAACAAG................................................... len:23 al:7 ....................ACGCUAgCUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:17 ....................ACGCUAACUGUAAAACcAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGuUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:7 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUa................................................. len:25 al:3 ....................ACGaUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAAC............................................. len:29 al:13 ....................ACGCUAAuUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUc................................................. len:25 al:10 ....................ACGCUAACUGUAgAACUA........................................................ len:18 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACgAGUU................................................. len:25 al:5 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAuGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAAuUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................gCGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:9 ....................ACGCcAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:6 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAAuAAGU.................................................. len:24 al:2 ....................ACGCUAuCUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUgAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUcACAA.................................................... len:22 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAcACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACgGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:25 al:4 ....................ACGCUAACaGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGuUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:16 ....................gCGCUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:2 ....................ACGCUAgCUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAAuU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAAuUU........................................... len:31 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACUc........................................... len:31 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAgACUAACAAGU.................................................. len:24 al:4 ....................ACGuUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:7 ....................ACGCUAACUGUAAAACUgACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAgAACUAACA..................................................... len:21 al:6 ....................ACGCgAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:1 ....................ACGCUAACUGUgAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:4 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:4 ....................ACGCUAACUGUAgAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACU......................................................... len:17 al:5 ....................ACGCUAACgGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAc................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:25 al:225 ....................ACGCUAgCUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:3 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:759 ....................ACGCUAACcGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:4 ....................ACGCUAACUGUAuAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................uCGCUAACUGUAAAACUAA....................................................... len:19 al:1 ....................ACGCUAACUGUAcAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................uCGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:3 ....................ACGCUAACUGcAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACcGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:8 ....................cCGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACuAG................................................... len:23 al:2 ....................ACGCcAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAcCUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................uCGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGg.................................................. len:24 al:5 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAu.................................................... len:22 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUgACAAG................................................... len:23 al:7 ....................ACGCUAACUGUgAAACUAACAAG................................................... len:23 al:4 ....................ACGCUAACUGUAAAACgAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAuCUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACu..................................................... len:21 al:4 ....................ACGCUAACUGUAAAACcAACAAG................................................... len:23 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAuU.................................................. len:24 al:20 ....................uCGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAcCUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAAuUAACAAG................................................... len:23 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUg................................................. len:25 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAcCUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1850 ....................ACGCUAACUGUAAAACcAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUA........................................................ len:18 al:13 ....................cCGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:4 ....................ACGCUAACUGUAAAAuUAACA..................................................... len:21 al:2 ....................ACGCUAACUGUAgAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAAuAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUcACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:2 ....................ACGCUAACUGcAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAgG................................................... len:23 al:7 ....................ACGCUAACUGcAAAACUAACAAGUU................................................. len:25 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAgCAAGU.................................................. len:24 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAgCUAACAAGU.................................................. len:24 al:2 ....................ACGCUAACUGUAuAACUAACA..................................................... len:21 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAgCAAG................................................... len:23 al:5 ....................AuGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACUU........................................... len:31 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAa................................................... len:23 al:41 ....................gCGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:15 ....................ACGCUAACUGUAAAgCUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUuAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................gCGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:3 ....................ACGCUAACUGUAAAgCUAACAA.................................................... len:22 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAA....................................................... len:19 al:20 ....................ACaCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:5 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAA....................................................... len:19 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:90 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAAu...................................................... len:20 al:20 ....................ACGCUAACUGUAAAcCUAACAAG................................................... len:23 al:3 ....................AgGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGcAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:2 ....................ACGCUAACUGUAcAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAaU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAgC...................................................... len:20 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAgACUAACA..................................................... len:21 al:4 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:3 ....................ACGCUAACUGUAAAACUuACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAA.................................................... len:22 al:65 ....................ACGCUAcCUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUAgCUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:25 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACgAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:484 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGa.................................................. len:24 al:10 ....................ACGCUAcCUGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUgAC...................................................... len:20 al:2 ....................ACGCUAAuUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACa............................................ len:30 al:3 ....................ACGCUAACUaUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAu................................................... len:23 al:22 ....................ACGCcAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACg..................................................... len:21 al:15 ....................ACGCUAACcGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:4 ....................gCGCUAACUGUAAAACUAACAA.................................................... len:22 al:1 ....................ACGCUAACcGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACaGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1240 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGgU................................................. len:25 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACUU........................................... len:31 al:32 ....................ACGCUAACUGUAAAACUgACAAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACc............................................ len:30 al:5 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAgCUU........................................... len:31 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAgGUUCAACUU........................................... len:31 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACgAG................................................... len:23 al:8 ....................ACGuUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:2 ....................ACGCcAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:1 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUAACUGUAuAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAgACUAACAAG................................................... len:23 al:5 ....................ACGCUAACUGUAAAACcAACAAGUU................................................. len:25 al:2 ....................ACaCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:1 ....................ACGCcAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAAC...................................................... len:20 al:2 ....................AuGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:21 al:4 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAAGc.................................................. len:24 al:61 ....................ACGCUAACaGUAAAACUAACAAG................................................... len:23 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACcAGUU................................................. len:25 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACgAGU.................................................. len:24 al:1 ....................ACaCUAACUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:25 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAgCA..................................................... len:21 al:3 ....................ACGCUAACUGUAgAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:4 ....................ACGCUgACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:24 al:2 ....................ACGCUAACUGUAAAgCUAAC...................................................... len:20 al:1 ....................ACGCUAACUGUAAAACUAACAgGU.................................................. len:24 al:3 ....................uCGCUAACUGUAAAACUAACAAGUUCAACU............................................ len:30 al:1 .....................CGCUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:19 al:23 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACAAGUU................................................. len:24 al:2 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:20 al:11 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACAA.................................................... len:21 al:2 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:22 al:4 .....................CGCUAACUGUAAAACUAAu...................................................... len:19 al:1 .....................CGCUAACUGUAAAACUAA....................................................... len:18 al:1 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACAAuU.................................................. len:23 al:1 .....................CGCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:23 al:2 ......................GCUAACUGUAAAACUAAu...................................................... len:18 al:2 ......................GCUAACUGUAAAACUAACA..................................................... len:19 al:1 ......................GCUAACUGUAgAACUAACAAG................................................... len:21 al:1 ......................GCUAACUGUAAAACUAACAAG................................................... len:21 al:4 ......................GCUAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:18 al:19 ......................GCUAACUGUAAAACUAACAAGU.................................................. len:22 al:1 ........................UAACUGUAAAACUAAC...................................................... len:16 al:1 .........................AACUGUAAAACUAACAAGUUCAACUUGUU........................................ len:29 al:1 .................................................UUGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:24 al:1 .................................................UUGUUAGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:22 al:4 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGa.......................... len:18 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGcUAGUGU........................ len:20 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUa.................... len:24 al:4 ..................................................aGUUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:6 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUc...................... len:22 al:121 ..................................................UGUcAGUUUACAGUUAGUGU........................ len:20 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUcU...................... len:22 al:5 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUuUU.................. len:26 al:1 ..................................................UGUcAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAaUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACcGUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUc....................... len:21 al:39 ..................................................UGUUAGUUUACAGUcAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUuCAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUgCAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUg...................... len:22 al:5 ..................................................UGUUcGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:214 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGU........................ len:20 al:88 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAaUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:21 al:429 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUaUU..................... len:23 al:1 ..................................................cGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUgCAGUUAGUGU........................ len:20 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUaU...................... len:22 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACAGcUAGUGUUUU..................... len:23 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUgU...................... len:22 al:5 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUgGUGUUU...................... len:22 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGcGUUU...................... len:22 al:9 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUc.................... len:24 al:2 ..................................................UGUUgGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:3 ..................................................UGUUAGcUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGU.......................... len:18 al:176 ..................................................UGUcAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUgU..................... len:23 al:1 ..................................................cGUUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:11 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUaUU.................. len:26 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGcUU...................... len:22 al:4 ..................................................UGUUAGcUUACAGUUAGUG......................... len:19 al:1 ..................................................UGUUgGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:21 al:2 ..................................................UGUUAGcUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:11 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGaGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUaU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUG......................... len:19 al:44 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUa......................... len:19 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACgGUUAGUGUUU...................... len:22 al:8 ..................................................UGUUAGUcUACAGUUAGUGUU....................... len:21 al:2 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUgGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGc........................ len:20 al:10 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGaU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAaUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUu.................... len:24 al:28 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUgGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1756 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUUG.................... len:24 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGc.......................... len:18 al:10 ..................................................UGUUAGUUUgCAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:6 ..................................................UGUUAGUUcACAGUUAGUGU........................ len:20 al:1 ..................................................UGUUcGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGgU....................... len:21 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUcGUGUUU...................... len:22 al:2 ..................................................UGUUAGUUUAuAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUa..................... len:23 al:13 ..................................................cGUUAGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGgUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:9 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUuGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UaUUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUaUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGcUAGUGUUU...................... len:22 al:6 ..................................................UGUUAGUUUACgGUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGgUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUaACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUcUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:6 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUc..................... len:23 al:10 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUa...................... len:22 al:7 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUa....................... len:21 al:11 ..................................................UGUUAuUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:3 ..................................................UGUUAGUUUACAGUcAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUg..................... len:23 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGUGgUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGaGUUU...................... len:22 al:1 ..................................................UGUUAGUUUcCAGUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................aGUUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:1 ..................................................UGcUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:22 al:7 ..................................................UGcUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:23 al:2 ..................................................UGcUAGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:21 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUUAGg.......................... len:18 al:1 ..................................................UGUUAGUUUACAGUcAGUGUUU...................... len:22 al:4 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUGc........................ len:19 al:1 ...................................................GUUAGUUUACAGUUgGUGUU....................... len:20 al:2 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUGU........................ len:19 al:4 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUG......................... len:18 al:5 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:22 al:1 ...................................................GUcAGUUUACAGUUAGUGU........................ len:19 al:1 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUGUU....................... len:20 al:15 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGU.......................... len:17 al:1 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGcGUU....................... len:20 al:2 ...................................................GUUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:21 al:2 ....................................................UUAGUUUACAGUUAGUGUUUUGa................... len:23 al:1 ....................................................UUAGUUUACAGUUAGU.......................... len:16 al:1 ....................................................UUAGUUUACAGUUAGUGUUU...................... len:20 al:2 ....................................................UUAGUUUACAGUUAGUGUUUU..................... len:21 al:1 ........................................................................UGUUAGCGUGGCUCAAACC... len:19 al:7