Genome: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/data/Porites_evermanni_v1.fa Alignments: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/output/08-Peve-sRNA-discovery-ShortStack/ShortStack_out/merged_alignments.bam Location: Porites_evermani_scaffold_430:205865-205960 minus PDF file name: /home/shared/8TB_HDD_02/shedurkin/timeseries_molecular/E-Peve/output/08-Peve-sRNA-discovery-ShortStack/ShortStack_out/strucVis/Cluster_4968.ps.pdf Locus Name: Cluster_4968 UGAAGUGUUGUUUCUAGAGGCGGUGAAAGUCGUCUCAAUACACAGUUGAUGUAUAUUGUACGACUCUCAUCGUGUUUGUGACAAUCUCUUAUUUCA ((((((((((((..((((.(((((((.((((((..(((((.(((.....))).))))).)))))).))))))).)))).)))))).....)))))) (-33.20) ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAUACACAGUUGA............................................... len:29 al:1 ....................CGGcGAAAGUCGUCUCAAUACAC..................................................... len:23 al:1 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAUACACA.................................................... len:24 al:83 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAUgC....................................................... len:21 al:1 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAgUACACA.................................................... len:24 al:2 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAUACA...................................................... len:22 al:25 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAUACAC..................................................... len:23 al:13 ....................CGGUGAAAGUCGUCUCAAcACA...................................................... len:22 al:1 ....................CGGUGAAAGUCGcCUCAAUAC....................................................... len:21 al:1 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