CpG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 130509 607711 17.68 738220 2 139742 614061 18.54 753803 3 131448 615085 17.61 746533 4 127826 583516 17.97 711342 5 132213 593630 18.22 725843 6 133486 606648 18.04 740134 7 133803 603140 18.16 736943 8 134758 601701 18.30 736459 9 134871 608758 18.14 743629 10 136954 607605 18.39 744559 11 137926 601335 18.66 739261 12 137280 610114 18.37 747394 13 135403 599984 18.41 735387 14 136069 598542 18.52 734611 15 136464 607019 18.35 743483 16 135755 609416 18.22 745171 17 134913 602827 18.29 737740 18 134536 604471 18.20 739007 19 136388 601175 18.49 737563 20 137459 603347 18.56 740806 21 135451 624310 17.83 759761 22 134846 599645 18.36 734491 23 136304 606761 18.34 743065 24 135974 610449 18.22 746423 25 134621 591701 18.53 726322 26 137436 595936 18.74 733372 27 135231 600219 18.39 735450 28 135669 590059 18.69 725728 29 138276 599493 18.74 737769 30 134346 595639 18.40 729985 31 133840 588514 18.53 722354 32 133882 587605 18.56 721487 33 134102 593552 18.43 727654 34 133942 587847 18.56 721789 35 134234 591742 18.49 725976 36 132008 588525 18.32 720533 37 129115 581224 18.18 710339 38 129152 570317 18.46 699469 39 128484 575119 18.26 703603 40 127470 568905 18.30 696375 41 128337 569605 18.39 697942 42 128911 579012 18.21 707923 43 124863 562734 18.16 687597 44 126321 565027 18.27 691348 45 123973 566508 17.95 690481 46 122615 549618 18.24 672233 47 121773 544426 18.28 666199 48 121079 544855 18.18 665934 49 119757 542178 18.09 661935 50 120443 539537 18.25 659980 51 118545 541930 17.95 660475 52 119551 530929 18.38 650480 53 116108 529924 17.97 646032 54 114971 528725 17.86 643696 55 113859 519731 17.97 633590 56 112891 507502 18.20 620393 57 111209 508354 17.95 619563 58 108854 497014 17.97 605868 59 109410 492821 18.17 602231 60 107824 491832 17.98 599656 61 105358 482001 17.94 587359 62 105646 477617 18.11 583263 63 103954 474685 17.97 578639 64 102004 468102 17.89 570106 65 101959 465178 17.98 567137 66 101240 462467 17.96 563707 67 99842 455445 17.98 555287 68 98887 452627 17.93 551514 69 97092 455388 17.57 552480 70 94696 438831 17.75 533527 71 94630 436914 17.80 531544 72 92101 429549 17.66 521650 73 92207 429662 17.67 521869 74 90940 424861 17.63 515801 75 89174 422254 17.44 511428 76 89183 410408 17.85 499591 77 86125 405433 17.52 491558 78 87114 403188 17.77 490302 79 83295 386770 17.72 470065 80 82119 385436 17.56 467555 81 80975 384720 17.39 465695 82 79264 373874 17.49 453138 83 78074 370210 17.42 448284 84 77035 364797 17.44 441832 85 76001 359226 17.46 435227 86 76235 357387 17.58 433622 87 73554 355591 17.14 429145 88 72748 342952 17.50 415700 89 72492 339543 17.59 412035 90 71212 336369 17.47 407581 91 69338 331454 17.30 400792 92 67734 326057 17.20 393791 93 66912 328250 16.93 395162 94 66121 319681 17.14 385802 95 65406 314233 17.23 379639 96 64282 311147 17.12 375429 97 63482 305343 17.21 368825 98 62659 301008 17.23 363667 99 62409 297258 17.35 359667 100 61101 290313 17.39 351414 101 58663 289632 16.84 348295 102 58101 288050 16.78 346151 103 56291 279680 16.75 335971 104 56071 279293 16.72 335364 105 55498 271768 16.96 327266 106 54060 267025 16.84 321085 107 53692 262864 16.96 316556 108 52511 258496 16.88 311007 109 52358 253604 17.11 305962 110 52533 250702 17.32 303235 111 50327 247227 16.91 297554 112 49153 241844 16.89 290997 113 47726 237741 16.72 285467 114 46793 232993 16.72 279786 115 46082 228357 16.79 274439 116 45545 226266 16.76 271811 117 44756 223922 16.66 268678 118 44014 217431 16.83 261445 119 43032 214517 16.71 257549 120 42353 210707 16.74 253060 121 43062 208797 17.10 251859 122 42686 206075 17.16 248761 123 40505 202309 16.68 242814 124 41198 199673 17.10 240871 125 40350 195530 17.11 235880 126 38636 189713 16.92 228349 127 37736 184307 16.99 222043 128 36677 184424 16.59 221101 129 35868 181377 16.51 217245 130 35650 179272 16.59 214922 131 35312 178793 16.49 214105 132 35482 178796 16.56 214278 133 34665 174350 16.58 209015 134 33252 170640 16.31 203892 135 32315 164177 16.45 196492 CHG context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 20342 1045231 1.91 1065573 2 17782 1056576 1.66 1074358 3 16226 1082617 1.48 1098843 4 15187 1030359 1.45 1045546 5 15110 1033044 1.44 1048154 6 15051 1035860 1.43 1050911 7 14346 1044490 1.35 1058836 8 14737 1051016 1.38 1065753 9 14392 1046014 1.36 1060406 10 14281 1061639 1.33 1075920 11 14189 1047433 1.34 1061622 12 14296 1046415 1.35 1060711 13 13958 1055327 1.31 1069285 14 14174 1048840 1.33 1063014 15 13705 1047662 1.29 1061367 16 13955 1050280 1.31 1064235 17 13861 1036382 1.32 1050243 18 13915 1054817 1.30 1068732 19 13776 1057085 1.29 1070861 20 13882 1059778 1.29 1073660 21 13617 1038990 1.29 1052607 22 14031 1065202 1.30 1079233 23 13656 1042180 1.29 1055836 24 13990 1066492 1.29 1080482 25 13545 1044273 1.28 1057818 26 13716 1054497 1.28 1068213 27 13657 1048596 1.29 1062253 28 13930 1056537 1.30 1070467 29 13353 1033524 1.28 1046877 30 13572 1035439 1.29 1049011 31 13309 1028090 1.28 1041399 32 13563 1017225 1.32 1030788 33 13462 1018100 1.31 1031562 34 13721 1032566 1.31 1046287 35 13568 1017745 1.32 1031313 36 13790 1016558 1.34 1030348 37 13747 1014148 1.34 1027895 38 13576 1012069 1.32 1025645 39 13319 987775 1.33 1001094 40 13622 1007984 1.33 1021606 41 13655 989264 1.36 1002919 42 13765 989200 1.37 1002965 43 13669 980179 1.38 993848 44 13955 969152 1.42 983107 45 13571 973075 1.38 986646 46 13847 981632 1.39 995479 47 13807 961750 1.42 975557 48 13746 944712 1.43 958458 49 13632 943274 1.42 956906 50 13770 937141 1.45 950911 51 13801 928772 1.46 942573 52 14115 936561 1.48 950676 53 13484 914771 1.45 928255 54 13693 912090 1.48 925783 55 13592 910023 1.47 923615 56 13571 890775 1.50 904346 57 13604 881240 1.52 894844 58 13413 878524 1.50 891937 59 13362 861673 1.53 875035 60 13105 855688 1.51 868793 61 13268 857330 1.52 870598 62 13087 836019 1.54 849106 63 12919 824606 1.54 837525 64 13037 823383 1.56 836420 65 12691 806085 1.55 818776 66 13167 812693 1.59 825860 67 12803 791052 1.59 803855 68 12722 780845 1.60 793567 69 12434 771843 1.59 784277 70 12585 774138 1.60 786723 71 12312 751683 1.61 763995 72 12225 748877 1.61 761102 73 12150 739709 1.62 751859 74 12093 728527 1.63 740620 75 12030 730138 1.62 742168 76 12230 717733 1.68 729963 77 11665 701681 1.64 713346 78 11801 699409 1.66 711210 79 11354 704458 1.59 715812 80 11497 665288 1.70 676785 81 11311 656885 1.69 668196 82 11288 659143 1.68 670431 83 11059 636001 1.71 647060 84 10973 632157 1.71 643130 85 10954 626953 1.72 637907 86 10981 620455 1.74 631436 87 11105 631055 1.73 642160 88 10533 599743 1.73 610276 89 10372 584923 1.74 595295 90 10310 575548 1.76 585858 91 10168 568178 1.76 578346 92 9757 558718 1.72 568475 93 9870 549690 1.76 559560 94 10056 546979 1.81 557035 95 9591 532852 1.77 542443 96 9621 528818 1.79 538439 97 9502 524628 1.78 534130 98 9472 511653 1.82 521125 99 9321 507313 1.80 516634 100 9079 494265 1.80 503344 101 8944 486825 1.80 495769 102 9014 482879 1.83 491893 103 8706 473987 1.80 482693 104 8597 466553 1.81 475150 105 8564 461695 1.82 470259 106 8621 453115 1.87 461736 107 8190 444198 1.81 452388 108 8489 441458 1.89 449947 109 8223 428847 1.88 437070 110 8107 425301 1.87 433408 111 7886 417076 1.86 424962 112 7924 414539 1.88 422463 113 7813 403659 1.90 411472 114 7801 401896 1.90 409697 115 7716 390513 1.94 398229 116 7594 384253 1.94 391847 117 7459 381726 1.92 389185 118 7613 379953 1.96 387566 119 7280 369576 1.93 376856 120 7197 362816 1.95 370013 121 7092 357405 1.95 364497 122 7055 355317 1.95 362372 123 6976 347876 1.97 354852 124 7004 339889 2.02 346893 125 6823 328251 2.04 335074 126 6653 324386 2.01 331039 127 6695 315469 2.08 322164 128 6439 304729 2.07 311168 129 6453 308979 2.05 315432 130 6416 305677 2.06 312093 131 6351 302941 2.05 309292 132 6341 296506 2.09 302847 133 6544 290824 2.20 297368 134 6992 284336 2.40 291328 135 6909 278828 2.42 285737 CHH context (R1) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 103197 3246865 3.08 3350062 2 97840 3203191 2.96 3301031 3 87416 3242509 2.63 3329925 4 93078 3244244 2.79 3337322 5 85262 3263188 2.55 3348450 6 87435 3159236 2.69 3246671 7 81089 3170987 2.49 3252076 8 87485 3185769 2.67 3273254 9 79294 3165111 2.44 3244405 10 85529 3213899 2.59 3299428 11 80100 3212068 2.43 3292168 12 83255 3197322 2.54 3280577 13 79287 3246610 2.38 3325897 14 84077 3258845 2.52 3342922 15 77925 3237940 2.35 3315865 16 82658 3260026 2.47 3342684 17 77733 3238635 2.34 3316368 18 77614 3238843 2.34 3316457 19 74679 3251372 2.25 3326051 20 77649 3237969 2.34 3315618 21 71663 3234263 2.17 3305926 22 76289 3266271 2.28 3342560 23 71556 3255830 2.15 3327386 24 74362 3239094 2.24 3313456 25 69668 3233379 2.11 3303047 26 73906 3315313 2.18 3389219 27 67534 3243326 2.04 3310860 28 73024 3245076 2.20 3318100 29 68209 3254658 2.05 3322867 30 71152 3259306 2.14 3330458 31 67386 3262004 2.02 3329390 32 70434 3263615 2.11 3334049 33 66029 3223408 2.01 3289437 34 68699 3241444 2.08 3310143 35 66095 3239905 2.00 3306000 36 68400 3218003 2.08 3286403 37 65345 3189476 2.01 3254821 38 67007 3183202 2.06 3250209 39 64278 3149177 2.00 3213455 40 65628 3132219 2.05 3197847 41 64522 3133559 2.02 3198081 42 64468 3099308 2.04 3163776 43 63117 3118979 1.98 3182096 44 66098 3112533 2.08 3178631 45 61338 3042265 1.98 3103603 46 62912 3037311 2.03 3100223 47 61650 3052037 1.98 3113687 48 61278 2970904 2.02 3032182 49 60668 2948535 2.02 3009203 50 62111 2921343 2.08 2983454 51 58004 2905543 1.96 2963547 52 61616 2919444 2.07 2981060 53 58707 2866046 2.01 2924753 54 59374 2866062 2.03 2925436 55 58122 2834574 2.01 2892696 56 58607 2788387 2.06 2846994 57 56430 2762180 2.00 2818610 58 57072 2755027 2.03 2812099 59 56041 2760882 1.99 2816923 60 56112 2695129 2.04 2751241 61 55065 2661515 2.03 2716580 62 54680 2648512 2.02 2703192 63 53467 2650706 1.98 2704173 64 54592 2613869 2.05 2668461 65 53086 2565842 2.03 2618928 66 52735 2538070 2.04 2590805 67 52051 2528411 2.02 2580462 68 52506 2457678 2.09 2510184 69 49918 2426080 2.02 2475998 70 50297 2397572 2.05 2447869 71 49892 2385126 2.05 2435018 72 50189 2344078 2.10 2394267 73 48944 2337261 2.05 2386205 74 50333 2315274 2.13 2365607 75 47545 2255071 2.06 2302616 76 48199 2240255 2.11 2288454 77 46855 2212434 2.07 2259289 78 46416 2179278 2.09 2225694 79 46382 2156472 2.11 2202854 80 46451 2135325 2.13 2181776 81 44773 2129002 2.06 2173775 82 45092 2099411 2.10 2144503 83 44518 2038892 2.14 2083410 84 43602 2002752 2.13 2046354 85 43376 1977352 2.15 2020728 86 42935 1956450 2.15 1999385 87 41835 1939179 2.11 1981014 88 42412 1935190 2.14 1977602 89 41319 1895592 2.13 1936911 90 41063 1888300 2.13 1929363 91 40034 1833872 2.14 1873906 92 40375 1802626 2.19 1843001 93 38779 1793551 2.12 1832330 94 39352 1748186 2.20 1787538 95 38692 1728547 2.19 1767239 96 38875 1728189 2.20 1767064 97 37830 1686608 2.19 1724438 98 37167 1654287 2.20 1691454 99 36744 1639655 2.19 1676399 100 36736 1605491 2.24 1642227 101 36211 1577823 2.24 1614034 102 35469 1556438 2.23 1591907 103 34961 1528147 2.24 1563108 104 35277 1509485 2.28 1544762 105 34205 1481432 2.26 1515637 106 34127 1458749 2.29 1492876 107 33932 1437324 2.31 1471256 108 32912 1409583 2.28 1442495 109 32795 1386781 2.31 1419576 110 32785 1368848 2.34 1401633 111 31559 1344315 2.29 1375874 112 31440 1329947 2.31 1361387 113 30876 1301131 2.32 1332007 114 30438 1280763 2.32 1311201 115 30146 1261421 2.33 1291567 116 30620 1245293 2.40 1275913 117 29201 1220125 2.34 1249326 118 29530 1198483 2.40 1228013 119 28679 1178511 2.38 1207190 120 28150 1155981 2.38 1184131 121 27879 1140408 2.39 1168287 122 27816 1125834 2.41 1153650 123 27388 1105063 2.42 1132451 124 27394 1075583 2.48 1102977 125 26577 1043564 2.48 1070141 126 25995 1008703 2.51 1034698 127 26470 973198 2.65 999668 128 25611 953354 2.62 978965 129 25577 934965 2.66 960542 130 25015 923518 2.64 948533 131 25246 912344 2.69 937590 132 25065 899447 2.71 924512 133 25851 889589 2.82 915440 134 26570 883954 2.92 910524 135 26489 872027 2.95 898516 CpG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 26108 134200 16.29 160308 2 27420 135883 16.79 163303 3 24783 130072 16.00 154855 4 23504 121988 16.15 145492 5 23336 120306 16.25 143642 6 23728 120072 16.50 143800 7 23389 116908 16.67 140297 8 22701 113358 16.68 136059 9 22171 112978 16.40 135149 10 22979 112475 16.96 135454 11 22055 109548 16.76 131603 12 21566 109347 16.47 130913 13 21228 105550 16.74 126778 14 20606 102830 16.69 123436 15 20414 102041 16.67 122455 16 20175 100928 16.66 121103 17 19657 97620 16.76 117277 18 19067 96784 16.46 115851 19 19187 94004 16.95 113191 20 18963 94148 16.76 113111 21 18065 96092 15.82 114157 22 18031 90583 16.60 108614 23 18141 88745 16.97 106886 24 17436 88312 16.49 105748 25 17090 84412 16.84 101502 26 17104 84053 16.91 101157 27 16866 83240 16.85 100106 28 16706 80971 17.10 97677 29 16726 80444 17.21 97170 30 15990 78932 16.85 94922 31 15568 77452 16.74 93020 32 15538 75943 16.98 91481 33 15065 74900 16.75 89965 34 15225 73748 17.11 88973 35 14839 72054 17.08 86893 36 14377 71058 16.83 85435 37 13916 69670 16.65 83586 38 13713 66816 17.03 80529 39 13600 66515 16.98 80115 40 13283 65382 16.89 78665 41 13137 63616 17.12 76753 42 13131 64720 16.87 77851 43 12797 62649 16.96 75446 44 12544 61706 16.89 74250 45 12008 60622 16.53 72630 46 11855 58696 16.80 70551 47 11566 57141 16.83 68707 48 11548 56556 16.96 68104 49 11428 55593 17.05 67021 50 11347 54553 17.22 65900 51 11032 54018 16.96 65050 52 11175 52757 17.48 63932 53 10537 51972 16.86 62509 54 10255 51517 16.60 61772 55 10078 49854 16.82 59932 56 10106 48712 17.18 58818 57 9788 48068 16.92 57856 58 9806 46825 17.32 56631 59 9530 45690 17.26 55220 60 9436 45772 17.09 55208 61 9137 44245 17.12 53382 62 8998 43822 17.04 52820 63 8797 42643 17.10 51440 64 8771 41387 17.49 50158 65 8740 41350 17.45 50090 66 8574 41056 17.28 49630 67 8396 40085 17.32 48481 68 8349 39444 17.47 47793 69 7908 38972 16.87 46880 70 7863 37752 17.24 45615 71 7659 37219 17.07 44878 72 7533 36424 17.14 43957 73 7532 36130 17.25 43662 74 7192 35655 16.79 42847 75 7253 35351 17.02 42604 76 7156 33853 17.45 41009 77 6982 33226 17.36 40208 78 6953 33338 17.26 40291 79 6614 31593 17.31 38207 80 6587 31362 17.36 37949 81 6120 31227 16.39 37347 82 6081 29685 17.00 35766 83 5990 29788 16.74 35778 84 5920 29002 16.95 34922 85 5764 28425 16.86 34189 86 5874 28243 17.22 34117 87 5594 28166 16.57 33760 88 5485 27177 16.79 32662 89 5601 26365 17.52 31966 90 5348 26373 16.86 31721 91 5444 25841 17.40 31285 92 5148 25073 17.03 30221 93 5014 25427 16.47 30441 94 5016 24661 16.90 29677 95 4765 24027 16.55 28792 96 4888 23533 17.20 28421 97 4569 23017 16.56 27586 98 4569 22874 16.65 27443 99 4562 22225 17.03 26787 100 4601 21599 17.56 26200 101 4433 21625 17.01 26058 102 4301 21068 16.95 25369 103 4263 20991 16.88 25254 104 4121 20567 16.69 24688 105 4118 20079 17.02 24197 106 3976 19364 17.04 23340 107 3764 19233 16.37 22997 108 3843 18713 17.04 22556 109 3880 18489 17.35 22369 110 3941 18752 17.37 22693 111 3671 17905 17.01 21576 112 3492 17756 16.43 21248 113 3425 17165 16.63 20590 114 3346 16740 16.66 20086 115 3225 16536 16.32 19761 116 3379 16596 16.92 19975 117 3251 16147 16.76 19398 118 3152 15799 16.63 18951 119 3196 15343 17.24 18539 120 3026 15253 16.55 18279 121 3045 14695 17.16 17740 122 2960 14474 16.98 17434 123 2889 14404 16.71 17293 124 2991 14217 17.38 17208 125 2887 13885 17.21 16772 126 2683 13284 16.80 15967 127 2698 12600 17.64 15298 128 2652 13221 16.71 15873 129 2543 12768 16.61 15311 130 2492 12470 16.66 14962 131 2456 12599 16.31 15055 132 2613 12786 16.97 15399 133 2279 12108 15.84 14387 134 2355 11882 16.54 14237 135 2187 11225 16.31 13412 CHG context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 7330 222424 3.19 229754 2 5973 222893 2.61 228866 3 4920 227807 2.11 232727 4 4444 207543 2.10 211987 5 4424 207957 2.08 212381 6 4019 199199 1.98 203218 7 3709 197264 1.85 200973 8 3816 195613 1.91 199429 9 3623 189491 1.88 193114 10 3613 190141 1.86 193754 11 3488 186168 1.84 189656 12 3331 184246 1.78 187577 13 3196 183002 1.72 186198 14 3311 180760 1.80 184071 15 3216 176002 1.79 179218 16 3229 169854 1.87 173083 17 2976 164607 1.78 167583 18 2898 166559 1.71 169457 19 2805 164038 1.68 166843 20 2873 161456 1.75 164329 21 2644 156520 1.66 159164 22 2680 158286 1.66 160966 23 2437 151263 1.59 153700 24 2514 153986 1.61 156500 25 2418 146445 1.62 148863 26 2364 147750 1.57 150114 27 2209 143002 1.52 145211 28 2309 141722 1.60 144031 29 2227 135249 1.62 137476 30 2217 135198 1.61 137415 31 2123 131529 1.59 133652 32 2012 128610 1.54 130622 33 2037 127673 1.57 129710 34 2022 126611 1.57 128633 35 2014 123840 1.60 125854 36 1985 123644 1.58 125629 37 1854 118779 1.54 120633 38 1939 118428 1.61 120367 39 1900 113101 1.65 115001 40 1874 113481 1.62 115355 41 1780 110856 1.58 112636 42 1776 109453 1.60 111229 43 1717 106031 1.59 107748 44 1660 103548 1.58 105208 45 1757 103927 1.66 105684 46 1717 102106 1.65 103823 47 1680 100958 1.64 102638 48 1613 96612 1.64 98225 49 1556 95349 1.61 96905 50 1558 93887 1.63 95445 51 1654 92065 1.76 93719 52 1570 92303 1.67 93873 53 1564 88854 1.73 90418 54 1557 87240 1.75 88797 55 1428 86431 1.63 87859 56 1460 85004 1.69 86464 57 1447 84076 1.69 85523 58 1338 81571 1.61 82909 59 1307 79499 1.62 80806 60 1422 78492 1.78 79914 61 1301 77087 1.66 78388 62 1332 75196 1.74 76528 63 1297 73760 1.73 75057 64 1280 72860 1.73 74140 65 1209 70602 1.68 71811 66 1244 71098 1.72 72342 67 1261 68234 1.81 69495 68 1170 67891 1.69 69061 69 1203 66145 1.79 67348 70 1182 65818 1.76 67000 71 1139 63331 1.77 64470 72 1129 63085 1.76 64214 73 1135 61679 1.81 62814 74 1123 60947 1.81 62070 75 1093 60448 1.78 61541 76 1099 58988 1.83 60087 77 1064 58310 1.79 59374 78 985 58093 1.67 59078 79 1052 58004 1.78 59056 80 1073 53772 1.96 54845 81 962 52628 1.80 53590 82 942 52309 1.77 53251 83 927 50837 1.79 51764 84 870 50327 1.70 51197 85 958 49168 1.91 50126 86 970 48934 1.94 49904 87 875 50614 1.70 51489 88 893 46964 1.87 47857 89 856 45974 1.83 46830 90 799 44574 1.76 45373 91 875 43799 1.96 44674 92 804 42945 1.84 43749 93 844 42119 1.96 42963 94 760 41265 1.81 42025 95 793 40264 1.93 41057 96 771 39670 1.91 40441 97 787 39723 1.94 40510 98 786 38499 2.00 39285 99 748 38125 1.92 38873 100 712 36971 1.89 37683 101 681 35840 1.86 36521 102 705 36052 1.92 36757 103 712 35251 1.98 35963 104 714 34432 2.03 35146 105 669 34002 1.93 34671 106 630 33332 1.86 33962 107 666 32402 2.01 33068 108 669 32492 2.02 33161 109 615 31110 1.94 31725 110 600 31276 1.88 31876 111 577 30641 1.85 31218 112 652 30087 2.12 30739 113 640 29065 2.15 29705 114 568 28688 1.94 29256 115 547 27914 1.92 28461 116 533 27719 1.89 28252 117 544 27376 1.95 27920 118 526 27127 1.90 27653 119 541 26271 2.02 26812 120 510 25758 1.94 26268 121 514 25316 1.99 25830 122 498 25506 1.92 26004 123 497 24359 2.00 24856 124 492 23830 2.02 24322 125 551 23059 2.33 23610 126 479 22658 2.07 23137 127 511 21798 2.29 22309 128 506 21174 2.33 21680 129 473 21793 2.12 22266 130 443 21220 2.04 21663 131 428 21118 1.99 21546 132 484 20389 2.32 20873 133 421 19901 2.07 20322 134 454 19271 2.30 19725 135 461 18974 2.37 19435 CHH context (R2) ================ position count methylated count unmethylated % methylation coverage 1 38080 761200 4.76 799280 2 32660 744449 4.20 777109 3 29249 734189 3.83 763438 4 29481 725166 3.91 754647 5 26905 709894 3.65 736799 6 26413 671081 3.79 697494 7 23879 661715 3.48 685594 8 24593 654916 3.62 679509 9 22286 644233 3.34 666519 10 23163 641565 3.48 664728 11 21506 629676 3.30 651182 12 21698 616569 3.40 638267 13 20899 615348 3.28 636247 14 21495 603912 3.44 625407 15 19975 592747 3.26 612722 16 19708 588573 3.24 608281 17 18702 576031 3.14 594733 18 17027 567897 2.91 584924 19 15878 557036 2.77 572914 20 15563 545005 2.78 560568 21 14169 536186 2.57 550355 22 14379 533661 2.62 548040 23 13581 524811 2.52 538392 24 13346 516125 2.52 529471 25 12421 505638 2.40 518059 26 12703 510298 2.43 523001 27 11329 491812 2.25 503141 28 12159 486432 2.44 498591 29 11282 479948 2.30 491230 30 11475 475252 2.36 486727 31 10827 465699 2.27 476526 32 10950 459047 2.33 469997 33 10198 447870 2.23 458068 34 10653 443427 2.35 454080 35 10117 436710 2.26 446827 36 10208 428158 2.33 438366 37 9479 418040 2.22 427519 38 9775 411200 2.32 420975 39 9423 402378 2.29 411801 40 9320 393964 2.31 403284 41 9337 389611 2.34 398948 42 9097 381011 2.33 390108 43 8881 380466 2.28 389347 44 9317 375064 2.42 384381 45 8298 360991 2.25 369289 46 8607 356623 2.36 365230 47 8371 355764 2.30 364135 48 8161 339994 2.34 348155 49 8152 334431 2.38 342583 50 8295 329603 2.45 337898 51 7397 324221 2.23 331618 52 8137 325662 2.44 333799 53 7331 315118 2.27 322449 54 7432 314139 2.31 321571 55 7241 305840 2.31 313081 56 7423 299441 2.42 306864 57 6951 295765 2.30 302716 58 7139 292660 2.38 299799 59 6995 291160 2.35 298155 60 6620 280074 2.31 286694 61 6712 274073 2.39 280785 62 6422 271672 2.31 278094 63 6370 272549 2.28 278919 64 6424 267278 2.35 273702 65 6207 259116 2.34 265323 66 6092 256740 2.32 262832 67 5968 254197 2.29 260165 68 6061 244340 2.42 250401 69 5727 239020 2.34 244747 70 5659 235374 2.35 241033 71 5653 232804 2.37 238457 72 5690 228333 2.43 234023 73 5206 226476 2.25 231682 74 5553 223324 2.43 228877 75 5081 215741 2.30 220822 76 5372 213677 2.45 219049 77 5111 210396 2.37 215507 78 5091 205980 2.41 211071 79 4990 204187 2.39 209177 80 4873 200728 2.37 205601 81 4710 200172 2.30 204882 82 4727 197358 2.34 202085 83 4877 188557 2.52 193434 84 4360 185256 2.30 189616 85 4501 181455 2.42 185956 86 4419 180125 2.39 184544 87 4281 177748 2.35 182029 88 4345 176196 2.41 180541 89 4272 172608 2.42 176880 90 4159 172004 2.36 176163 91 4026 165263 2.38 169289 92 4076 161457 2.46 165533 93 3854 161102 2.34 164956 94 4000 156093 2.50 160093 95 3790 153754 2.41 157544 96 3808 154144 2.41 157952 97 3553 149908 2.32 153461 98 3665 145389 2.46 149054 99 3563 143060 2.43 146623 100 3455 141377 2.39 144832 101 3469 139064 2.43 142533 102 3335 136736 2.38 140071 103 3316 133357 2.43 136673 104 3222 130790 2.40 134012 105 3127 127363 2.40 130490 106 3110 125762 2.41 128872 107 3104 123622 2.45 126726 108 2920 120725 2.36 123645 109 2967 118468 2.44 121435 110 3034 117694 2.51 120728 111 2878 114636 2.45 117514 112 2835 112291 2.46 115126 113 2750 110489 2.43 113239 114 2721 108553 2.45 111274 115 2644 107572 2.40 110216 116 2806 105853 2.58 108659 117 2555 102885 2.42 105440 118 2548 101410 2.45 103958 119 2450 99584 2.40 102034 120 2482 97626 2.48 100108 121 2419 96729 2.44 99148 122 2465 93799 2.56 96264 123 2359 92868 2.48 95227 124 2332 89497 2.54 91829 125 2250 86208 2.54 88458 126 2171 82950 2.55 85121 127 2226 80015 2.71 82241 128 2089 77912 2.61 80001 129 2164 76491 2.75 78655 130 2067 75926 2.65 77993 131 2118 74016 2.78 76134 132 2021 72899 2.70 74920 133 2137 71930 2.89 74067 134 2096 71173 2.86 73269 135 1971 70099 2.73 72070