10.1093/bioinformatics/btw354                      # MultiQC
10.1093/bioinformatics/btp352                      # Samtools
10.1038/nmeth.1923                                 # bowtie2
10.1038/nmeth.3317                                 # bowtie2
10.1038/s41587-019-0201-4                          # bowtie2