Usage:
    MirMachine.py --node <text> --species <text> --genome <text> [--model <text>] [--cpu <integer>] [--add-all-nodes|--single-node-only] [--unlock|--remove] [--dry]
    MirMachine.py --species <text> --genome <text> --family <text> [--model <text>] [--unlock|--remove] [--dry]
    MirMachine.py --node <text> [--add-all-nodes]
    MirMachine.py --print-all-nodes
    MirMachine.py --print-all-families
    MirMachine.py --print-ascii-tree
    MirMachine.py (-h | --help)
    MirMachine.py --version