Sample	command
sRNA-POC-47-S1-TP2	/gscratch/srlab/programs/fastp.0.23.1 --in1 sRNA-POC-47-S1-TP2_R1_001.fastq.gz --in2 sRNA-POC-47-S1-TP2_R2_001.fastq.gz --detect_adapter_for_pe --trim_poly_g --thread 40 --html ../trimmed/sRNA-POC-47-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.html --json ../trimmed/sRNA-POC-47-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.json --out1 ../trimmed/sRNA-POC-47-S1-TP2_R1_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz --out2 ../trimmed/sRNA-POC-47-S1-TP2_R2_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz 
sRNA-POC-48-S1-TP2	/gscratch/srlab/programs/fastp.0.23.1 --in1 sRNA-POC-48-S1-TP2_R1_001.fastq.gz --in2 sRNA-POC-48-S1-TP2_R2_001.fastq.gz --detect_adapter_for_pe --trim_poly_g --thread 40 --html ../trimmed/sRNA-POC-48-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.html --json ../trimmed/sRNA-POC-48-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.json --out1 ../trimmed/sRNA-POC-48-S1-TP2_R1_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz --out2 ../trimmed/sRNA-POC-48-S1-TP2_R2_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz 
sRNA-POC-50-S1-TP2	/gscratch/srlab/programs/fastp.0.23.1 --in1 sRNA-POC-50-S1-TP2_R1_001.fastq.gz --in2 sRNA-POC-50-S1-TP2_R2_001.fastq.gz --detect_adapter_for_pe --trim_poly_g --thread 40 --html ../trimmed/sRNA-POC-50-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.html --json ../trimmed/sRNA-POC-50-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.json --out1 ../trimmed/sRNA-POC-50-S1-TP2_R1_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz --out2 ../trimmed/sRNA-POC-50-S1-TP2_R2_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz 
sRNA-POC-53-S1-TP2	/gscratch/srlab/programs/fastp.0.23.1 --in1 sRNA-POC-53-S1-TP2_R1_001.fastq.gz --in2 sRNA-POC-53-S1-TP2_R2_001.fastq.gz --detect_adapter_for_pe --trim_poly_g --thread 40 --html ../trimmed/sRNA-POC-53-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.html --json ../trimmed/sRNA-POC-53-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.json --out1 ../trimmed/sRNA-POC-53-S1-TP2_R1_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz --out2 ../trimmed/sRNA-POC-53-S1-TP2_R2_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz 
sRNA-POC-57-S1-TP2	/gscratch/srlab/programs/fastp.0.23.1 --in1 sRNA-POC-57-S1-TP2_R1_001.fastq.gz --in2 sRNA-POC-57-S1-TP2_R2_001.fastq.gz --detect_adapter_for_pe --trim_poly_g --thread 40 --html ../trimmed/sRNA-POC-57-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.html --json ../trimmed/sRNA-POC-57-S1-TP2.fastp-trim.20230522.report.json --out1 ../trimmed/sRNA-POC-57-S1-TP2_R1_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz --out2 ../trimmed/sRNA-POC-57-S1-TP2_R2_001.fastp-trim.20230522.fastq.gz