FastQCFastQC Report
Thu 8 Sep 2022
Geoduck-larvae-day5-RNA-EPI-99-6_S48_L006_R2_001.fastp-trim.20220908.fq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameGeoduck-larvae-day5-RNA-EPI-99-6_S48_L006_R2_001.fastp-trim.20220908.fq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences155
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length41-151
%GC73

[WARN]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[WARN]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[FAIL]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[WARN]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[OK]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC2415.483870967741936No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCC21.2903225806451613No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCC21.2903225806451613No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACC21.2903225806451613No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAC21.2903225806451613No Hit
TATGCTTTCAATATGAAGTCGACGGTGGACGATGAGAAATTGAAAGAGAA10.6451612903225806No Hit
GGTATACTCAACATATGCCAAGTCAGTTTCTCTTTTGTAATTTGTTAAAC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCACCCCCACCC10.6451612903225806No Hit
AGCATTGACATTTTAATGTAATGCTTTAATGACAGTTTTCTTTTTACCTG10.6451612903225806No Hit
TTTTTTTTGTGATATCAATGGTCTTTTATTTATATACAAAACATATGGAA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCACACCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCGCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCC10.6451612903225806No Hit
CTGACGATGTGTTCTGTTCGAATTATTTTAGGTCAAAAAGACAGTTTATA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAAC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCACCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
ATCACAAATTGAAGTTGTAGTATTTAATTTTACAGTTGATCTTTTATAAA10.6451612903225806No Hit
TGTTGCCATTCTAAGAAGAAGGGAAACTTGCGTTTTATTCAGGGTTTCTT10.6451612903225806No Hit
CCTCAGTTTAACTGCAGTAACTTGTTATAGTAATTTCACGTATTTGTTTT10.6451612903225806No Hit
TAAAAATCTCGTAGCCTAGGGGTTCCTTTTTTTTTCGAAGTATGTAATTG10.6451612903225806No Hit
CTGGCATAAGTCCTTTTGCAGGTCGCCATTACCACCATTACCCCTACCAT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
GTGACATCTGCATACATAACCTGTGTATGTCATCTGCACATGTTACCTGA10.6451612903225806No Hit
GTCTAGCCTTGGCACGTACTGGAAGACTTGGTTAGGAAATCTATTTTAGT10.6451612903225806No Hit
CCCACCCCACCCCCGCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCACCCCCCCCCCCCCACCCACCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCC10.6451612903225806No Hit
AAACAACTTCCGCCGGTCATGACGTCACACCACGTGTGAGCATGTAAACA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCACCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCGCCCCCCCTCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
TTTTTTTTTACTCCTTAGGTCAATGCTTGACGCTGCCACAATGAGGAAAG10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
TCGGGACAAAATTTTCTATCCAAACCTTAAACCCAAGTATTTAGATTCTT10.6451612903225806No Hit
CCCCACGCCCCCCAGCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCGCCCCCCCCCAA10.6451612903225806No Hit
TGTATATTGTGCTTACAGTGATTATTCTGTTCATTGATCATATTTTAGCT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCGACCCCCCCCCGCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCACC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCACCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCACCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCACTCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CTGAACAGTATTAATTGCACATATCATATAACAAGTATTGATTGAATAGA10.6451612903225806No Hit
NGTCATCATAGTTTGTGTAATTGTGTTATATTAAGGAGAGGAATTCTATT10.6451612903225806No Hit
GGAAGGCCAAAGGCTGGCTAAAGACATTGGTGCAGATACGTATCTGGAAT10.6451612903225806No Hit
ACCCCACCCCAGCCCCCACCACCCCACCACCACCCCCCCCCCAACACCCC10.6451612903225806No Hit
GGCTGGTGTTTTTTTTTACTCTCGGTTTCCTGTATAACATTACTTTTAGC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCACCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACCCCACCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCACCCCCCC10.6451612903225806No Hit
GGTCACCCAGAATCGGACCTACCGTTACAGGTACACCGAGTGGCCAAAAT10.6451612903225806No Hit
AATTGGCAAAACAAAAAAGAAGAAGTCGGTTAAAGACAAAAAGAAAAAGG10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCTCC10.6451612903225806No Hit
TCAATATATTTAAAATTTCACAAGTTTTCATATCTAGTACAATTGATTAT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCGCCCCCCTCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCACCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACAC10.6451612903225806No Hit
CAAATATTAACCCATGACCCTGGACACTTTTTTTTTTAAAATAATTTTTT10.6451612903225806No Hit
CCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCC10.6451612903225806No Hit
TCCACTTCCACGGGACGACATGACGGAAATGGACAAAAAAAAACAATACC10.6451612903225806No Hit
CCCGACGCCCCACCACCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCACCCCCCCCACACCACCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCAC10.6451612903225806No Hit
CCCACCCCCCGCCCCCGCACCCCCCCCCCCAACCCGCCCCCCCCCCCCGC10.6451612903225806No Hit
CAGACAAGCTGTCTTGCTCACTTGCTTGTCACATAACAGTGGGTGAGGGT10.6451612903225806No Hit
AACCCCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCGCCCCCACCCCGACCCACTCCCC10.6451612903225806No Hit
GCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCAACAACAACACCCC10.6451612903225806No Hit
TTGACGAGGAGGAGGGTGAGGAAGAAGCTTAAACATGCAAAAAGACAATC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
GAACGACTTGGTGTCTGAATACCAACAGTACCAGGATGCCACGGCGGAGG10.6451612903225806No Hit
CTAGCAACAGTATTGGTTCAAAGTTCAAGCACGTCGACCTCCATCATTGT10.6451612903225806No Hit
CTTCGATTCCCTGGTCAACTCAATGCAGATCTCCGTAAATTGGCAGTCAA10.6451612903225806No Hit
TGAGAATGAACCAGTACTTATATCTTATACCAAGAATGGAGAAGATCTTG10.6451612903225806No Hit
CCCAGCCAGACCTGTTCAAGAGGAATCTTCTCAGGCCTCAGTCTCGAACT10.6451612903225806No Hit
CCCCCACCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACCCAC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCACACCCACAACCAC10.6451612903225806No Hit
CCCCACCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGC10.6451612903225806No Hit
CAGAAATCAGGAGAAGTAACTAACTGTGCAGTTGTTGAACTGTGCCCCTA10.6451612903225806No Hit
AAATAACACGTTCTGTACTCAACCACTTTTTTTTTATTTCTTTTGCACAG10.6451612903225806No Hit
CCCCACCCCCCACCCACACCCCCCCCCCCACCCGCCCCCCCCCCCACCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCACC10.6451612903225806No Hit
CAGAATGCCACATGTGAAGTTTACTCATACTGGTGTGCTTGAATTTTTTT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACACCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACCCCAACC10.6451612903225806No Hit
CAGATGATTATTGGAGTAAACAAAATTGACAGCACTGAACCACCATACTC10.6451612903225806No Hit
CTTTTATTGCAATCAAGCTAAAATAAATTGGTATAGTCTAAACCAAAGTA10.6451612903225806No Hit
TCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAC10.6451612903225806No Hit
GGTCAATGTTCATATTTGTTTTGTGAACTTTCATCAAATATTAAGGCAGT10.6451612903225806No Hit
ATATGGTTGCGTGTACAGTAAACTCGCTGTGCAGGCACCATACTCTGAAC10.6451612903225806No Hit
CGCGCATCGGCTGCATCACTTGTTCGATCTGTTTTATTACTTCTGCATTG10.6451612903225806No Hit
CGCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCACCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACAAACCCCACCCC10.6451612903225806No Hit
CAATGCCACACGTATATGCCCGTTACTTGCAGATGGACGTG10.6451612903225806No Hit
CGCCAACATACATTTATAGCCAGGAATGGGAGTGTAAAACTGTATCCAAA10.6451612903225806No Hit
TTGTCGTGGGTACTACTTTACTTTAACTCTATATAAGAGAACATGATGTG10.6451612903225806No Hit
ATGCAAAGTTGTTTTTGTCTTGATATTTATGAAAGGAAATCATTTAAGAA10.6451612903225806No Hit
GTTGGTTTCAATGTGAAGAACATCTCCATTAAAGATATCAAGAGAGGAAA10.6451612903225806No Hit
CTCTCTCAGTCCACCAACTTGTTGAGAACACTGACGAGACCTACTGTATC10.6451612903225806No Hit
TGTAGCTCAAATTTTATCATGTATTTTTTAATGTGTATACAATGTACACC10.6451612903225806No Hit
CAACGAGGCTCTCTACGATATCTGCTTCAGAACACTCAAACTGACCACCC10.6451612903225806No Hit
CGAGCAGGACAGTGACACTACTGCCTCAAACGAAAAAATATGCTCTATTG10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCACTCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CAGAGGTCAGTGTTCAAATACCTGCAATAATTGAAATATGACATTGTGTC10.6451612903225806No Hit
NTTTATACAGACTTATTTACTATGTAAGCATAGAAATGGGAAATAGAAAA10.6451612903225806No Hit
CGACACCACTGTTTGGTAGAGCTAGACCTCGAGCCACACGACACAGGTCT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCAACCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCG10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
TTCAAACTGATTTTTTTTTTTTATTTCATACCAGACACATTTAATAATTA10.6451612903225806No Hit
AATTCATAGATTATCAAGCAAGACAATGATATATCGTTATTTTAGAAATG10.6451612903225806No Hit
GCATAGGAGACTATACAGAAGCTTTTTTTTTTTCGATCTGAAATTCAAGA10.6451612903225806No Hit
TTTTTTTATAATTGTAACACCAGTCTTCAGTGTCTTGATAGTTGATTATT10.6451612903225806No Hit
ACCCCCCCCCCCCCCACACCACCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
GGTGTTTATTTAATGTTTTACGCATACTGATCTTGGTCTACATCGCTTAC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCAACCCCCCCCCCCACCCACC10.6451612903225806No Hit
TAAAGGTAAAAAAATAAATTATTTAGGTTTTTCTTCTGCTGCCGTTACCA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCCCTCC10.6451612903225806No Hit
CTGCATATTCATTTGTTGATGTATTTTTTTTTTTTTCTGTATGTTAATTT10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCCCA10.6451612903225806No Hit
CAGGATTCGCCGGGGACGATGCCCCGAGGGCCGTGTTCCCCTCCATCGTC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCACCCACC10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCACCCCCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCACCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit
CGACGACGACACTGGTGTGGATGAGAAAGAGTACGAGAAAGATAATGATA10.6451612903225806No Hit
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCCCCCTCACCCCCCCCCCCCCC10.6451612903225806No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)