[1] # (a,c,g,t)= (0.317, 0.183, 0.183, 0.317) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.322 C 0.178 G 0.178 T 0.322 # l= 1 # Values AA 0.115 AC 0.0566 AG 0.0557 AT 0.095 CA 0.0722 CC 0.0328 CG 0.0169 CT 0.0557 GA 0.0513 GC 0.0369 GG 0.0328 GT 0.0566 TA 0.0838 TC 0.0513 TG 0.0722 TT 0.115 # l= 2 # Values AAA 0.0471 AAC 0.0189 AAG 0.017 AAT 0.0321 ACA 0.0258 ACC 0.00932 ACG 0.00497 ACT 0.0165 AGA 0.0172 AGC 0.012 AGG 0.01 AGT 0.0165 ATA 0.0292 ATC 0.0135 ATG 0.0202 ATT 0.0321 CAA 0.0206 CAC 0.0151 CAG 0.0163 CAT 0.0202 CCA 0.0123 CCC 0.00699 CCG 0.00346 CCT 0.01 CGA 0.0042 CGC 0.00428 CGG 0.00346 CGT 0.00497 CTA 0.0118 CTC 0.0106 CTG 0.0163 CTT 0.017 GAA 0.0177 GAC 0.00948 GAG 0.0106 GAT 0.0135 GCA 0.0139 GCC 0.00671 GCG 0.00428 GCT 0.012 GGA 0.00978 GGC 0.00671 GGG 0.00699 GGT 0.00932 GTA 0.0131 GTC 0.00948 GTG 0.0151 GTT 0.0189 TAA 0.0297 TAC 0.0131 TAG 0.0118 TAT 0.0292 TCA 0.0202 TCC 0.00979 TCG 0.0042 TCT 0.0172 TGA 0.0202 TGC 0.0139 TGG 0.0123 TGT 0.0258 TTA 0.0297 TTC 0.0177 TTG 0.0206 TTT 0.0471 # l= 3 # Values AAAA 0.0185 AAAC 0.00825 AAAG 0.00703 AAAT 0.0132 AACA 0.00852 AACC 0.00326 AACG 0.0017 AACT 0.00545 AAGA 0.0052 AAGC 0.00353 AAGG 0.00311 AAGT 0.00517 AATA 0.0109 AATC 0.00455 AATG 0.00761 AATT 0.00903 ACAA 0.00732 ACAC 0.00604 ACAG 0.00544 ACAT 0.00698 ACCA 0.0035 ACCC 0.00202 ACCG 0.00101 ACCT 0.00279 ACGA 0.0012 ACGC 0.0012 ACGG 0.000925 ACGT 0.00164 ACTA 0.00375 ACTC 0.00274 ACTG 0.00485 ACTT 0.00517 AGAA 0.0059 AGAC 0.0031 AGAG 0.00364 AGAT 0.00452 AGCA 0.00467 AGCC 0.00225 AGCG 0.00134 AGCT 0.00376 AGGA 0.003 AGGC 0.00206 AGGG 0.00217 AGGT 0.00279 AGTA 0.00401 AGTC 0.00281 AGTG 0.00423 AGTT 0.00545 ATAA 0.00983 ATAC 0.00397 ATAG 0.00361 ATAT 0.0118 ATCA 0.00536 ATCC 0.00252 ATCG 0.00112 ATCT 0.00452 ATGA 0.00603 ATGC 0.00393 ATGG 0.00328 ATGT 0.00698 ATTA 0.00897 ATTC 0.00461 ATTG 0.00526 ATTT 0.0132 CAAA 0.00849 CAAC 0.00371 CAAG 0.00317 CAAT 0.00526 CACA 0.00711 CACC 0.00246 CACG 0.00125 CACT 0.00423 CAGA 0.00489 CAGC 0.00383 CAGG 0.00269 CAGT 0.00485 CATA 0.00467 CATC 0.00358 CATG 0.00436 CATT 0.00761 CCAA 0.00364 CCAC 0.00261 CCAG 0.0028 CCAT 0.00328 CCCA 0.00246 CCCC 0.0017 CCCG 0.000667 CCCT 0.00216 CCGA 0.000843 CCGC 0.000895 CCGG 0.000798 CCGT 0.000925 CCTA 0.00201 CCTC 0.00221 CCTG 0.00269 CCTT 0.00311 CGAA 0.00121 CGAC 0.000873 CGAG 0.000994 CGAT 0.00112 CGCA 0.0014 CGCC 0.000881 CGCG 0.000655 CGCT 0.00134 CGGA 0.000956 CGGC 0.000828 CGGG 0.000667 CGGT 0.00101 CGTA 0.000982 CGTC 0.00104 CGTG 0.00125 CGTT 0.0017 CTAA 0.00423 CTAC 0.00216 CTAG 0.00183 CTAT 0.0036 CTCA 0.00371 CTCC 0.00226 CTCG 0.000994 CTCT 0.00364 CTGA 0.00455 CTGC 0.00346 CTGG 0.0028 CTGT 0.00544 CTTA 0.00363 CTTC 0.00318 CTTG 0.00317 CTTT 0.00703 GAAA 0.00703 GAAC 0.00289 GAAG 0.00318 GAAT 0.00461 GACA 0.00393 GACC 0.00171 GACG 0.00104 GACT 0.00281 GAGA 0.00339 GAGC 0.00226 GAGG 0.00221 GAGT 0.00274 GATA 0.0033 GATC 0.00208 GATG 0.00358 GATT 0.00455 GCAA 0.00387 GCAC 0.00261 GCAG 0.00346 GCAT 0.00393 GCCA 0.00253 GCCC 0.00129 GCCG 0.000828 GCCT 0.00206 GCGA 0.00105 GCGC 0.00113 GCGG 0.000895 GCGT 0.0012 GCTA 0.00241 GCTC 0.00226 GCTG 0.00383 GCTT 0.00353 GGAA 0.00328 GGAC 0.00172 GGAG 0.00226 GGAT 0.00252 GGCA 0.00223 GGCC 0.00134 GGCG 0.000881 GGCT 0.00225 GGGA 0.00198 GGGC 0.00129 GGGG 0.0017 GGGT 0.00202 GGTA 0.0019 GGTC 0.00171 GGTG 0.00246 GGTT 0.00326 GTAA 0.00479 GTAC 0.00219 GTAG 0.00216 GTAT 0.00397 GTCA 0.00378 GTCC 0.00172 GTCG 0.000873 GTCT 0.0031 GTGA 0.0038 GTGC 0.00261 GTGG 0.00261 GTGT 0.00604 GTTA 0.00408 GTTC 0.0029 GTTG 0.00371 GTTT 0.00825 TAAA 0.013 TAAC 0.00408 TAAG 0.00363 TAAT 0.00897 TACA 0.00623 TACC 0.0019 TACG 0.000982 TACT 0.00401 TAGA 0.00367 TAGC 0.00241 TAGG 0.00201 TAGT 0.00375 TATA 0.0104 TATC 0.0033 TATG 0.00467 TATT 0.0109 TCAA 0.00579 TCAC 0.0038 TCAG 0.00455 TCAT 0.00603 TCCA 0.00384 TCCC 0.00198 TCCG 0.000956 TCCT 0.003 TCGA 0.0011 TCGC 0.00105 TCGG 0.000843 TCGT 0.0012 TCTA 0.00367 TCTC 0.00339 TCTG 0.00489 TCTT 0.00521 TGAA 0.00732 TGAC 0.00378 TGAG 0.00371 TGAT 0.00536 TGCA 0.00556 TGCC 0.00223 TGCG 0.0014 TGCT 0.00467 TGGA 0.00384 TGGC 0.00253 TGGG 0.00246 TGGT 0.0035 TGTA 0.00623 TGTC 0.00393 TGTG 0.00711 TGTT 0.00852 TTAA 0.0108 TTAC 0.00479 TTAG 0.00423 TTAT 0.00983 TTCA 0.00732 TTCC 0.00328 TTCG 0.00121 TTCT 0.0059 TTGA 0.00579 TTGC 0.00387 TTGG 0.00364 TTGT 0.00732 TTTA 0.013 TTTC 0.00703 TTTG 0.00849 TTTT 0.0185 # l= 4 # Values AAAAA 0.00779 AAAAC 0.00313 AAAAG 0.00262 AAAAT 0.00501 AAACA 0.00386 AAACC 0.00136 AAACG 0.000753 AAACT 0.00228 AAAGA 0.00213 AAAGC 0.00144 AAAGG 0.00128 AAAGT 0.00218 AAATA 0.00486 AAATC 0.00189 AAATG 0.00335 AAATT 0.00314 AACAA 0.00279 AACAC 0.00165 AACAG 0.00166 AACAT 0.00242 AACCA 0.00126 AACCC 0.000732 AACCG 0.000361 AACCT 0.000904 AACGA 0.000432 AACGC 0.000392 AACGG 0.000303 AACGT 0.000573 AACTA 0.00138 AACTC 0.000941 AACTG 0.00153 AACTT 0.0016 AAGAA 0.00195 AAGAC 0.000976 AAGAG 0.00103 AAGAT 0.00125 AAGCA 0.00144 AAGCC 0.000635 AAGCG 0.000363 AAGCT 0.00109 AAGGA 0.000894 AAGGC 0.000622 AAGGG 0.000701 AAGGT 0.00089 AAGTA 0.00132 AAGTC 0.000924 AAGTG 0.00133 AAGTT 0.0016 AATAA 0.00473 AATAC 0.00147 AATAG 0.00124 AATAT 0.00344 AATCA 0.00194 AATCC 0.00079 AATCG 0.000391 AATCT 0.00143 AATGA 0.00245 AATGC 0.00138 AATGG 0.00111 AATGT 0.00266 AATTA 0.00292 AATTC 0.00136 AATTG 0.00161 AATTT 0.00314 ACAAA 0.00304 ACAAC 0.00126 ACAAG 0.00107 ACAAT 0.00195 ACACA 0.00331 ACACC 0.000788 ACACG 0.000435 ACACT 0.0015 ACAGA 0.00171 ACAGC 0.00122 ACAGG 0.000831 ACAGT 0.00169 ACATA 0.00168 ACATC 0.00112 ACATG 0.00153 ACATT 0.00266 ACCAA 0.00106 ACCAC 0.000754 ACCAG 0.000762 ACCAT 0.000921 ACCCA 0.000801 ACCCC 0.000472 ACCCG 0.000182 ACCCT 0.000566 ACCGA 0.000248 ACCGC 0.000251 ACCGG 0.000235 ACCGT 0.000276 ACCTA 0.000584 ACCTC 0.000546 ACCTG 0.000768 ACCTT 0.00089 ACGAA 0.000361 ACGAC 0.000235 ACGAG 0.000281 ACGAT 0.000325 ACGCA 0.000483 ACGCC 0.000216 ACGCG 0.000171 ACGCT 0.000334 ACGGA 0.00026 ACGGC 0.000223 ACGGG 0.000166 ACGGT 0.000276 ACGTA 0.000322 ACGTC 0.000348 ACGTG 0.000396 ACGTT 0.000573 ACTAA 0.00134 ACTAC 0.000702 ACTAG 0.000596 ACTAT 0.00112 ACTCA 0.00111 ACTCC 0.000511 ACTCG 0.00028 ACTCT 0.00084 ACTGA 0.00145 ACTGC 0.000962 ACTGG 0.000759 ACTGT 0.00169 ACTTA 0.00114 ACTTC 0.00088 ACTTG 0.000969 ACTTT 0.00218 AGAAA 0.00259 AGAAC 0.000887 AGAAG 0.00104 AGAAT 0.00138 AGACA 0.00137 AGACC 0.000509 AGACG 0.000339 AGACT 0.000886 AGAGA 0.00134 AGAGC 0.000773 AGAGG 0.000691 AGAGT 0.00084 AGATA 0.00128 AGATC 0.000674 AGATG 0.00113 AGATT 0.00143 AGCAA 0.00134 AGCAC 0.000903 AGCAG 0.00118 AGCAT 0.00124 AGCCA 0.000811 AGCCC 0.000433 AGCCG 0.000286 AGCCT 0.00072 AGCGA 0.000356 AGCGC 0.000355 AGCGG 0.0003 AGCGT 0.000334 AGCTA 0.000763 AGCTC 0.000733 AGCTG 0.00118 AGCTT 0.00109 AGGAA 0.00111 AGGAC 0.000539 AGGAG 0.000665 AGGAT 0.000685 AGGCA 0.00073 AGGCC 0.000381 AGGCG 0.00023 AGGCT 0.00072 AGGGA 0.000632 AGGGC 0.000448 AGGGG 0.000518 AGGGT 0.000566 AGGTA 0.000637 AGGTC 0.000505 AGGTG 0.000742 AGGTT 0.000904 AGTAA 0.00151 AGTAC 0.000657 AGTAG 0.000683 AGTAT 0.00116 AGTCA 0.00116 AGTCC 0.00053 AGTCG 0.00024 AGTCT 0.000886 AGTGA 0.00119 AGTGC 0.00078 AGTGG 0.000758 AGTGT 0.0015 AGTTA 0.00127 AGTTC 0.000852 AGTTG 0.00105 AGTTT 0.00228 ATAAA 0.00434 ATAAC 0.00129 ATAAG 0.00109 ATAAT 0.00311 ATACA 0.00205 ATACC 0.000494 ATACG 0.000269 ATACT 0.00116 ATAGA 0.0013 ATAGC 0.000654 ATAGG 0.000537 ATAGT 0.00112 ATATA 0.00575 ATATC 0.00104 ATATG 0.00157 ATATT 0.00344 ATCAA 0.0016 ATCAC 0.000965 ATCAG 0.0012 ATCAT 0.0016 ATCCA 0.00111 ATCCC 0.000459 ATCCG 0.00026 ATCCT 0.000685 ATCGA 0.000315 ATCGC 0.000269 ATCGG 0.000209 ATCGT 0.000325 ATCTA 0.00124 ATCTC 0.000794 ATCTG 0.00124 ATCTT 0.00125 ATGAA 0.0023 ATGAC 0.0011 ATGAG 0.00104 ATGAT 0.0016 ATGCA 0.0017 ATGCC 0.00062 ATGCG 0.000359 ATGCT 0.00124 ATGGA 0.00106 ATGGC 0.000684 ATGGG 0.000615 ATGGT 0.000921 ATGTA 0.00187 ATGTC 0.0011 ATGTG 0.00159 ATGTT 0.00242 ATTAA 0.00325 ATTAC 0.00132 ATTAG 0.00129 ATTAT 0.00311 ATTCA 0.00217 ATTCC 0.00072 ATTCG 0.000336 ATTCT 0.00138 ATTGA 0.0015 ATTGC 0.000925 ATTGG 0.000894 ATTGT 0.00195 ATTTA 0.00398 ATTTC 0.00192 ATTTG 0.00234 ATTTT 0.00501 CAAAA 0.00315 CAAAC 0.00173 CAAAG 0.00127 CAAAT 0.00234 CAACA 0.00169 CAACC 0.00069 CAACG 0.000273 CAACT 0.00105 CAAGA 0.00099 CAAGC 0.000688 CAAGG 0.000521 CAAGT 0.000969 CAATA 0.00162 CAATC 0.000868 CAATG 0.00116 CAATT 0.00161 CACAA 0.00167 CACAC 0.00246 CACAG 0.00139 CACAT 0.00159 CACCA 0.000915 CACCC 0.00054 CACCG 0.000264 CACCT 0.000742 CACGA 0.000285 CACGC 0.00034 CACGG 0.000232 CACGT 0.000396 CACTA 0.000859 CACTC 0.000733 CACTG 0.00131 CACTT 0.00133 CAGAA 0.00169 CAGAC 0.000954 CAGAG 0.00101 CAGAT 0.00124 CAGCA 0.00149 CAGCC 0.000711 CAGCG 0.000452 CAGCT 0.00118 CAGGA 0.000828 CAGGC 0.000529 CAGGG 0.000567 CAGGT 0.000768 CAGTA 0.00119 CAGTC 0.00082 CAGTG 0.00131 CAGTT 0.00153 CATAA 0.00156 CATAC 0.000926 CATAG 0.000614 CATAT 0.00157 CATCA 0.0014 CATCC 0.000781 CATCG 0.000266 CATCT 0.00113 CATGA 0.00119 CATGC 0.000969 CATGG 0.000679 CATGT 0.00153 CATTA 0.00178 CATTC 0.00132 CATTG 0.00116 CATTT 0.00335 CCAAA 0.00152 CCAAC 0.000731 CCAAG 0.000495 CCAAT 0.000894 CCACA 0.00111 CCACC 0.000534 CCACG 0.000212 CCACT 0.000758 CCAGA 0.000797 CCAGC 0.000779 CCAGG 0.000467 CCAGT 0.000759 CCATA 0.000774 CCATC 0.000716 CCATG 0.000679 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000736 CCCAC 0.000534 CCCAG 0.000573 CCCAT 0.000615 CCCCA 0.00054 CCCCC 0.00048 CCCCG 0.000158 CCCCT 0.000518 CCCGA 0.000157 CCCGC 0.000175 CCCGG 0.000169 CCCGT 0.000166 CCCTA 0.000417 CCCTC 0.00048 CCCTG 0.000567 CCCTT 0.000701 CCGAA 0.000265 CCGAC 0.000166 CCGAG 0.000203 CCGAT 0.000209 CCGCA 0.000258 CCGCC 0.000219 CCGCG 0.000119 CCGCT 0.0003 CCGGA 0.000227 CCGGC 0.000167 CCGGG 0.000169 CCGGT 0.000235 CCGTA 0.000184 CCGTC 0.000206 CCGTG 0.000232 CCGTT 0.000303 CCTAA 0.000754 CCTAC 0.000418 CCTAG 0.000296 CCTAT 0.000537 CCTCA 0.000756 CCTCC 0.000561 CCTCG 0.000205 CCTCT 0.000691 CCTGA 0.000742 CCTGC 0.000652 CCTGG 0.000467 CCTGT 0.000831 CCTTA 0.000642 CCTTC 0.000661 CCTTG 0.000521 CCTTT 0.00128 CGAAA 0.000431 CGAAC 0.000239 CGAAG 0.000208 CGAAT 0.000336 CGACA 0.000331 CGACC 0.000192 CGACG 0.00011 CGACT 0.00024 CGAGA 0.000275 CGAGC 0.000234 CGAGG 0.000205 CGAGT 0.00028 CGATA 0.000258 CGATC 0.000202 CGATG 0.000266 CGATT 0.000391 CGCAA 0.000357 CGCAC 0.000317 CGCAG 0.000368 CGCAT 0.000359 CGCCA 0.000336 CGCCC 0.000181 CGCCG 0.000134 CGCCT 0.00023 CGCGA 0.000146 CGCGC 0.000218 CGCGG 0.000119 CGCGT 0.000171 CGCTA 0.000233 CGCTC 0.000297 CGCTG 0.000452 CGCTT 0.000363 CGGAA 0.000266 CGGAC 0.000173 CGGAG 0.000257 CGGAT 0.00026 CGGCA 0.00023 CGGCC 0.000177 CGGCG 0.000134 CGGCT 0.000286 CGGGA 0.000201 CGGGC 0.000125 CGGGG 0.000158 CGGGT 0.000182 CGGTA 0.000198 CGGTC 0.000188 CGGTG 0.000264 CGGTT 0.000361 CGTAA 0.000349 CGTAC 0.000195 CGTAG 0.00017 CGTAT 0.000269 CGTCA 0.000393 CGTCC 0.000195 CGTCG 0.00011 CGTCT 0.000339 CGTGA 0.000341 CGTGC 0.000265 CGTGG 0.000212 CGTGT 0.000435 CGTTA 0.000382 CGTTC 0.000291 CGTTG 0.000273 CGTTT 0.000753 CTAAA 0.00185 CTAAC 0.000601 CTAAG 0.00049 CTAAT 0.00129 CTACA 0.000971 CTACC 0.00034 CTACG 0.00017 CTACT 0.000683 CTAGA 0.000568 CTAGC 0.000372 CTAGG 0.000296 CTAGT 0.000596 CTATA 0.00103 CTATC 0.000722 CTATG 0.000614 CTATT 0.00124 CTCAA 0.00111 CTCAC 0.000754 CTCAG 0.00081 CTCAT 0.00104 CTCCA 0.000888 CTCCC 0.000453 CTCCG 0.000257 CTCCT 0.000665 CTCGA 0.000254 CTCGC 0.000255 CTCGG 0.000203 CTCGT 0.000281 CTCTA 0.00066 CTCTC 0.000938 CTCTG 0.00101 CTCTT 0.00103 CTGAA 0.00167 CTGAC 0.000873 CTGAG 0.00081 CTGAT 0.0012 CTGCA 0.00135 CTGCC 0.000567 CTGCG 0.000368 CTGCT 0.00118 CTGGA 0.000963 CTGGC 0.000503 CTGGG 0.000573 CTGGT 0.000762 CTGTA 0.00142 CTGTC 0.000973 CTGTG 0.00139 CTGTT 0.00166 CTTAA 0.00142 CTTAC 0.000631 CTTAG 0.00049 CTTAT 0.00109 CTTCA 0.00129 CTTCC 0.000643 CTTCG 0.000208 CTTCT 0.00104 CTTGA 0.000953 CTTGC 0.00065 CTTGG 0.000495 CTTGT 0.00107 CTTTA 0.00198 CTTTC 0.00116 CTTTG 0.00127 CTTTT 0.00262 GAAAA 0.00268 GAAAC 0.00128 GAAAG 0.00116 GAAAT 0.00192 GAACA 0.00126 GAACC 0.000495 GAACG 0.000291 GAACT 0.000852 GAAGA 0.00103 GAAGC 0.000613 GAAGG 0.000661 GAAGT 0.00088 GAATA 0.00128 GAATC 0.000653 GAATG 0.00132 GAATT 0.00136 GACAA 0.00111 GACAC 0.000738 GACAG 0.000973 GACAT 0.0011 GACCA 0.000643 GACCC 0.000369 GACCG 0.000188 GACCT 0.000505 GACGA 0.00024 GACGC 0.000243 GACGG 0.000206 GACGT 0.000348 GACTA 0.0006 GACTC 0.000468 GACTG 0.00082 GACTT 0.000924 GAGAA 0.00112 GAGAC 0.000544 GAGAG 0.000938 GAGAT 0.000794 GAGCA 0.000843 GAGCC 0.00039 GAGCG 0.000297 GAGCT 0.000733 GAGGA 0.000751 GAGGC 0.000436 GAGGG 0.00048 GAGGT 0.000546 GAGTA 0.000594 GAGTC 0.000468 GAGTG 0.000733 GAGTT 0.000941 GATAA 0.00109 GATAC 0.00045 GATAG 0.000722 GATAT 0.00104 GATCA 0.000838 GATCC 0.00037 GATCG 0.000202 GATCT 0.000674 GATGA 0.00106 GATGC 0.000691 GATGG 0.000716 GATGT 0.00112 GATTA 0.00115 GATTC 0.000653 GATTG 0.000868 GATTT 0.00189 GCAAA 0.00157 GCAAC 0.000721 GCAAG 0.00065 GCAAT 0.000925 GCACA 0.00111 GCACC 0.000453 GCACG 0.000265 GCACT 0.00078 GCAGA 0.00101 GCAGC 0.000837 GCAGG 0.000652 GCAGT 0.000962 GCATA 0.000884 GCATC 0.000691 GCATG 0.000969 GCATT 0.00138 GCCAA 0.000801 GCCAC 0.000546 GCCAG 0.000503 GCCAT 0.000684 GCCCA 0.000429 GCCCC 0.000284 GCCCG 0.000125 GCCCT 0.000448 GCCGA 0.000233 GCCGC 0.000204 GCCGG 0.000167 GCCGT 0.000223 GCCTA 0.000476 GCCTC 0.000436 GCCTG 0.000529 GCCTT 0.000622 GCGAA 0.000266 GCGAC 0.000265 GCGAG 0.000255 GCGAT 0.000269 GCGCA 0.000353 GCGCC 0.000202 GCGCG 0.000218 GCGCT 0.000355 GCGGA 0.000265 GCGGC 0.000204 GCGGG 0.000175 GCGGT 0.000251 GCGTA 0.000229 GCGTC 0.000243 GCGTG 0.00034 GCGTT 0.000392 GCTAA 0.000948 GCTAC 0.000433 GCTAG 0.000372 GCTAT 0.000654 GCTCA 0.000794 GCTCC 0.000462 GCTCG 0.000234 GCTCT 0.000773 GCTGA 0.000989 GCTGC 0.000837 GCTGG 0.000779 GCTGT 0.00122 GCTTA 0.000791 GCTTC 0.000613 GCTTG 0.000688 GCTTT 0.00144 GGAAA 0.00145 GGAAC 0.000469 GGAAG 0.000643 GGAAT 0.00072 GGACA 0.00072 GGACC 0.000279 GGACG 0.000195 GGACT 0.00053 GGAGA 0.00073 GGAGC 0.000462 GGAGG 0.000561 GGAGT 0.000511 GGATA 0.000574 GGATC 0.00037 GGATG 0.000781 GGATT 0.00079 GGCAA 0.000652 GGCAC 0.000395 GGCAG 0.000567 GGCAT 0.00062 GGCCA 0.000519 GGCCC 0.000267 GGCCG 0.000177 GGCCT 0.000381 GGCGA 0.000243 GGCGC 0.000202 GGCGG 0.000219 GGCGT 0.000216 GGCTA 0.000513 GGCTC 0.00039 GGCTG 0.000711 GGCTT 0.000635 GGGAA 0.000725 GGGAC 0.000346 GGGAG 0.000453 GGGAT 0.000459 GGGCA 0.000405 GGGCC 0.000267 GGGCG 0.000181 GGGCT 0.000433 GGGGA 0.000461 GGGGC 0.000284 GGGGG 0.00048 GGGGT 0.000472 GGGTA 0.000381 GGGTC 0.000369 GGGTG 0.00054 GGGTT 0.000732 GGTAA 0.000747 GGTAC 0.000317 GGTAG 0.00034 GGTAT 0.000494 GGTCA 0.000725 GGTCC 0.000279 GGTCG 0.000192 GGTCT 0.000509 GGTGA 0.000686 GGTGC 0.000453 GGTGG 0.000534 GGTGT 0.000788 GGTTA 0.000716 GGTTC 0.000495 GGTTG 0.00069 GGTTT 0.00136 GTAAA 0.00215 GTAAC 0.000689 GTAAG 0.000631 GTAAT 0.00132 GTACA 0.00102 GTACC 0.000317 GTACG 0.000195 GTACT 0.000657 GTAGA 0.000611 GTAGC 0.000433 GTAGG 0.000418 GTAGT 0.000702 GTATA 0.00113 GTATC 0.00045 GTATG 0.000926 GTATT 0.00147 GTCAA 0.0011 GTCAC 0.000718 GTCAG 0.000873 GTCAT 0.0011 GTCCA 0.000666 GTCCC 0.000346 GTCCG 0.000173 GTCCT 0.000539 GTCGA 0.000206 GTCGC 0.000265 GTCGG 0.000166 GTCGT 0.000235 GTCTA 0.000628 GTCTC 0.000544 GTCTG 0.000954 GTCTT 0.000976 GTGAA 0.00136 GTGAC 0.000718 GTGAG 0.000754 GTGAT 0.000965 GTGCA 0.000991 GTGCC 0.000395 GTGCG 0.000317 GTGCT 0.000903 GTGGA 0.000776 GTGGC 0.000546 GTGGG 0.000534 GTGGT 0.000754 GTGTA 0.00119 GTGTC 0.000738 GTGTG 0.00246 GTGTT 0.00165 GTTAA 0.0015 GTTAC 0.000689 GTTAG 0.000601 GTTAT 0.00129 GTTCA 0.0013 GTTCC 0.000469 GTTCG 0.000239 GTTCT 0.000887 GTTGA 0.000992 GTTGC 0.000721 GTTGG 0.000731 GTTGT 0.00126 GTTTA 0.00211 GTTTC 0.00128 GTTTG 0.00173 GTTTT 0.00313 TAAAA 0.00493 TAAAC 0.00211 TAAAG 0.00198 TAAAT 0.00398 TAACA 0.00171 TAACC 0.000716 TAACG 0.000382 TAACT 0.00127 TAAGA 0.00106 TAAGC 0.000791 TAAGG 0.000642 TAAGT 0.00114 TAATA 0.00312 TAATC 0.00115 TAATG 0.00178 TAATT 0.00292 TACAA 0.00174 TACAC 0.00119 TACAG 0.00142 TACAT 0.00187 TACCA 0.000681 TACCC 0.000381 TACCG 0.000198 TACCT 0.000637 TACGA 0.000246 TACGC 0.000229 TACGG 0.000184 TACGT 0.000322 TACTA 0.000913 TACTC 0.000594 TACTG 0.00119 TACTT 0.00132 TAGAA 0.00114 TAGAC 0.000628 TAGAG 0.00066 TAGAT 0.00124 TAGCA 0.000897 TAGCC 0.000513 TAGCG 0.000233 TAGCT 0.000763 TAGGA 0.000528 TAGGC 0.000476 TAGGG 0.000417 TAGGT 0.000584 TAGTA 0.000913 TAGTC 0.0006 TAGTG 0.000859 TAGTT 0.00138 TATAA 0.00244 TATAC 0.00113 TATAG 0.00103 TATAT 0.00575 TATCA 0.00119 TATCC 0.000574 TATCG 0.000258 TATCT 0.00128 TATGA 0.00134 TATGC 0.000884 TATGG 0.000774 TATGT 0.00168 TATTA 0.00312 TATTC 0.00128 TATTG 0.00162 TATTT 0.00486 TCAAA 0.00235 TCAAC 0.000992 TCAAG 0.000953 TCAAT 0.0015 TCACA 0.00158 TCACC 0.000686 TCACG 0.000341 TCACT 0.00119 TCAGA 0.00138 TCAGC 0.000989 TCAGG 0.000742 TCAGT 0.00145 TCATA 0.00134 TCATC 0.00106 TCATG 0.00119 TCATT 0.00245 TCCAA 0.00104 TCCAC 0.000776 TCCAG 0.000963 TCCAT 0.00106 TCCCA 0.000689 TCCCC 0.000461 TCCCG 0.000201 TCCCT 0.000632 TCCGA 0.000205 TCCGC 0.000265 TCCGG 0.000227 TCCGT 0.00026 TCCTA 0.000528 TCCTC 0.000751 TCCTG 0.000828 TCCTT 0.000894 TCGAA 0.000322 TCGAC 0.000206 TCGAG 0.000254 TCGAT 0.000315 TCGCA 0.000309 TCGCC 0.000243 TCGCG 0.000146 TCGCT 0.000356 TCGGA 0.000205 TCGGC 0.000233 TCGGG 0.000157 TCGGT 0.000248 TCGTA 0.000246 TCGTC 0.00024 TCGTG 0.000285 TCGTT 0.000432 TCTAA 0.00119 TCTAC 0.000611 TCTAG 0.000568 TCTAT 0.0013 TCTCA 0.00105 TCTCC 0.00073 TCTCG 0.000275 TCTCT 0.00134 TCTGA 0.00138 TCTGC 0.00101 TCTGG 0.000797 TCTGT 0.00171 TCTTA 0.00106 TCTTC 0.00103 TCTTG 0.00099 TCTTT 0.00213 TGAAA 0.00256 TGAAC 0.0013 TGAAG 0.00129 TGAAT 0.00217 TGACA 0.00151 TGACC 0.000725 TGACG 0.000393 TGACT 0.00116 TGAGA 0.00105 TGAGC 0.000794 TGAGG 0.000756 TGAGT 0.00111 TGATA 0.00119 TGATC 0.000838 TGATG 0.0014 TGATT 0.00194 TGCAA 0.00152 TGCAC 0.000991 TGCAG 0.00135 TGCAT 0.0017 TGCCA 0.000868 TGCCC 0.000405 TGCCG 0.00023 TGCCT 0.00073 TGCGA 0.000309 TGCGC 0.000353 TGCGG 0.000258 TGCGT 0.000483 TGCTA 0.000897 TGCTC 0.000843 TGCTG 0.00149 TGCTT 0.00144 TGGAA 0.00118 TGGAC 0.000666 TGGAG 0.000888 TGGAT 0.00111 TGGCA 0.000868 TGGCC 0.000519 TGGCG 0.000336 TGGCT 0.000811 TGGGA 0.000689 TGGGC 0.000429 TGGGG 0.00054 TGGGT 0.000801 TGGTA 0.000681 TGGTC 0.000643 TGGTG 0.000915 TGGTT 0.00126 TGTAA 0.00219 TGTAC 0.00102 TGTAG 0.000971 TGTAT 0.00205 TGTCA 0.00151 TGTCC 0.00072 TGTCG 0.000331 TGTCT 0.00137 TGTGA 0.00158 TGTGC 0.00111 TGTGG 0.00111 TGTGT 0.00331 TGTTA 0.00171 TGTTC 0.00126 TGTTG 0.00169 TGTTT 0.00386 TTAAA 0.00466 TTAAC 0.0015 TTAAG 0.00142 TTAAT 0.00325 TTACA 0.00219 TTACC 0.000747 TTACG 0.000349 TTACT 0.00151 TTAGA 0.00119 TTAGC 0.000948 TTAGG 0.000754 TTAGT 0.00134 TTATA 0.00244 TTATC 0.00109 TTATG 0.00156 TTATT 0.00473 TTCAA 0.00199 TTCAC 0.00136 TTCAG 0.00167 TTCAT 0.0023 TTCCA 0.00118 TTCCC 0.000725 TTCCG 0.000266 TTCCT 0.00111 TTCGA 0.000322 TTCGC 0.000266 TTCGG 0.000265 TTCGT 0.000361 TTCTA 0.00114 TTCTC 0.00112 TTCTG 0.00169 TTCTT 0.00195 TTGAA 0.00199 TTGAC 0.0011 TTGAG 0.00111 TTGAT 0.0016 TTGCA 0.00152 TTGCC 0.000652 TTGCG 0.000357 TTGCT 0.00134 TTGGA 0.00104 TTGGC 0.000801 TTGGG 0.000736 TTGGT 0.00106 TTGTA 0.00174 TTGTC 0.00111 TTGTG 0.00167 TTGTT 0.00279 TTTAA 0.00466 TTTAC 0.00215 TTTAG 0.00185 TTTAT 0.00434 TTTCA 0.00256 TTTCC 0.00145 TTTCG 0.000431 TTTCT 0.00259 TTTGA 0.00235 TTTGC 0.00157 TTTGG 0.00152 TTTGT 0.00304 TTTTA 0.00493 TTTTC 0.00268 TTTTG 0.00315 TTTTT 0.00779 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3514 AAAAC 0.1594 AAAAG 0.1316 AAAAT 0.245 AAACA 0.4387 AAACC 0.1659 AAACG 0.09351 AAACT 0.262 AAAGA 0.3111 AAAGC 0.2056 AAAGG 0.1748 AAAGT 0.3017 AAATA 0.3494 AAATC 0.1345 AAATG 0.2296 AAATT 0.224 AACAA 0.301 AACAC 0.1987 AACAG 0.1927 AACAT 0.2536 AACCA 0.3875 AACCC 0.2344 AACCG 0.1106 AACCT 0.286 AACGA 0.2494 AACGC 0.2435 AACGG 0.1848 AACGT 0.327 AACTA 0.2391 AACTC 0.1788 AACTG 0.2712 AACTT 0.275 AAGAA 0.3626 AAGAC 0.1937 AAGAG 0.2112 AAGAT 0.2472 AAGCA 0.3832 AAGCC 0.1919 AAGCG 0.1085 AAGCT 0.3182 AAGGA 0.2841 AAGGC 0.2086 AAGGG 0.2322 AAGGT 0.2658 AAGTA 0.245 AAGTC 0.1895 AAGTG 0.2595 AAGTT 0.2938 AATAA 0.3855 AATAC 0.1305 AATAG 0.1132 AATAT 0.3043 AATCA 0.3905 AATCC 0.1725 AATCG 0.08766 AATCT 0.3022 AATGA 0.3102 AATGC 0.1731 AATGG 0.1365 AATGT 0.334 AATTA 0.2987 AATTC 0.1371 AATTG 0.1729 AATTT 0.3124 ACAAA 0.3777 ACAAC 0.1684 ACAAG 0.1463 ACAAT 0.2458 ACACA 0.5175 ACACC 0.1364 ACACG 0.07331 ACACT 0.2516 ACAGA 0.3009 ACAGC 0.2243 ACAGG 0.1469 ACAGT 0.2988 ACATA 0.2295 ACATC 0.1606 ACATG 0.208 ACATT 0.3426 ACCAA 0.3011 ACCAC 0.2276 ACCAG 0.22 ACCAT 0.2716 ACCCA 0.3982 ACCCC 0.2443 ACCCG 0.09292 ACCCT 0.2922 ACCGA 0.2593 ACCGC 0.2608 ACCGG 0.2386 ACCGT 0.2755 ACCTA 0.2143 ACCTC 0.222 ACCTG 0.2918 ACCTT 0.3207 ACGAA 0.2977 ACGAC 0.2001 ACGAG 0.2456 ACGAT 0.2704 ACGCA 0.4185 ACGCC 0.189 ACGCG 0.1453 ACGCT 0.2926 ACGGA 0.2931 ACGGC 0.2602 ACGGG 0.1891 ACGGT 0.3032 ACGTA 0.1997 ACGTC 0.2247 ACGTG 0.2511 ACGTT 0.3508 ACTAA 0.3363 ACTAC 0.1816 ACTAG 0.16 ACTAT 0.2763 ACTCA 0.4112 ACTCC 0.1938 ACTCG 0.1055 ACTCT 0.3123 ACTGA 0.2964 ACTGC 0.203 ACTGG 0.1573 ACTGT 0.3231 ACTTA 0.2166 ACTTC 0.1692 ACTTG 0.1834 ACTTT 0.3837 AGAAA 0.408 AGAAC 0.1518 AGAAG 0.1894 AGAAT 0.2209 AGACA 0.4271 AGACC 0.1771 AGACG 0.1153 AGACT 0.2878 AGAGA 0.3745 AGAGC 0.2329 AGAGG 0.2137 AGAGT 0.2476 AGATA 0.2722 AGATC 0.1674 AGATG 0.2628 AGATT 0.3102 AGCAA 0.2738 AGCAC 0.1955 AGCAG 0.2835 AGCAT 0.2691 AGCCA 0.3721 AGCCC 0.2088 AGCCG 0.1394 AGCCT 0.3273 AGCGA 0.2815 AGCGC 0.2786 AGCGG 0.2416 AGCGT 0.2566 AGCTA 0.201 AGCTC 0.2152 AGCTG 0.3505 AGCTT 0.2977 AGGAA 0.3806 AGGAC 0.1829 AGGAG 0.2643 AGGAT 0.2311 AGGCA 0.3675 AGGCC 0.2023 AGGCG 0.1175 AGGCT 0.3546 AGGGA 0.308 AGGGC 0.2202 AGGGG 0.2419 AGGGT 0.2707 AGGTA 0.2079 AGGTC 0.1827 AGGTG 0.2768 AGGTT 0.3247 AGTAA 0.3628 AGTAC 0.1618 AGTAG 0.1785 AGTAT 0.2908 AGTCA 0.4302 AGTCC 0.2052 AGTCG 0.08985 AGTCT 0.3391 AGTGA 0.2835 AGTGC 0.1924 AGTGG 0.1882 AGTGT 0.3714 AGTTA 0.2225 AGTTC 0.1571 AGTTG 0.187 AGTTT 0.422 ATAAA 0.4101 ATAAC 0.128 ATAAG 0.1138 ATAAT 0.2926 ATACA 0.4629 ATACC 0.123 ATACG 0.06802 ATACT 0.2797 ATAGA 0.3583 ATAGC 0.1795 ATAGG 0.1461 ATAGT 0.3098 ATATA 0.3996 ATATC 0.0886 ATATG 0.1219 ATATT 0.2722 ATCAA 0.2806 ATCAC 0.178 ATCAG 0.2381 ATCAT 0.3011 ATCCA 0.4545 ATCCC 0.1926 ATCCG 0.106 ATCCT 0.284 ATCGA 0.2858 ATCGC 0.2476 ATCGG 0.1886 ATCGT 0.297 ATCTA 0.2675 ATCTC 0.1836 ATCTG 0.2912 ATCTT 0.2782 ATGAA 0.3798 ATGAC 0.1852 ATGAG 0.1881 ATGAT 0.2634 ATGCA 0.4094 ATGCC 0.1617 ATGCG 0.0938 ATGCT 0.313 ATGGA 0.3114 ATGGC 0.1975 ATGGG 0.1843 ATGGT 0.2907 ATGTA 0.2525 ATGTC 0.1545 ATGTG 0.2354 ATGTT 0.3166 ATTAA 0.319 ATTAC 0.1379 ATTAG 0.1431 ATTAT 0.3015 ATTCA 0.4357 ATTCC 0.1506 ATTCG 0.0718 ATTCT 0.2856 ATTGA 0.2844 ATTGC 0.1703 ATTGG 0.1666 ATTGT 0.3504 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1313 ATTTG 0.1601 ATTTT 0.3335 CAAAA 0.3353 CAAAC 0.2006 CAAAG 0.1529 CAAAT 0.2521 CAACA 0.4328 CAACC 0.1898 CAACG 0.07362 CAACT 0.275 CAAGA 0.3096 CAAGC 0.2168 CAAGG 0.1619 CAAGT 0.3001 CAATA 0.2923 CAATC 0.1609 CAATG 0.2169 CAATT 0.2845 CACAA 0.2268 CACAC 0.342 CACAG 0.1963 CACAT 0.2295 CACCA 0.3992 CACCC 0.232 CACCG 0.1151 CACCT 0.3254 CACGA 0.2338 CACGC 0.2803 CACGG 0.1948 CACGT 0.329 CACTA 0.201 CACTC 0.1841 CACTG 0.3184 CACTT 0.3122 CAGAA 0.317 CAGAC 0.2036 CAGAG 0.2376 CAGAT 0.2517 CAGCA 0.4146 CAGCC 0.1994 CAGCG 0.1288 CAGCT 0.3192 CAGGA 0.326 CAGGC 0.2088 CAGGG 0.2218 CAGGT 0.2879 CAGTA 0.2497 CAGTC 0.1869 CAGTG 0.2887 CAGTT 0.3082 CATAA 0.3224 CATAC 0.1923 CATAG 0.1325 CATAT 0.319 CATCA 0.4206 CATCC 0.2247 CATCG 0.07658 CATCT 0.3472 CATGA 0.2829 CATGC 0.2177 CATGG 0.1579 CATGT 0.3384 CATTA 0.2206 CATTC 0.1688 CATTG 0.1528 CATTT 0.3859 CCAAA 0.4293 CCAAC 0.2029 CCAAG 0.1389 CCAAT 0.2453 CCACA 0.4457 CCACC 0.2224 CCACG 0.08786 CCACT 0.3013 CCAGA 0.3013 CCAGC 0.2924 CCAGG 0.1795 CCAGT 0.2901 CCATA 0.2332 CCATC 0.2353 CCATG 0.2123 CCATT 0.3377 CCCAA 0.3091 CCCAC 0.2288 CCCAG 0.2447 CCCAT 0.2583 CCCCA 0.3385 CCCCC 0.2972 CCCCG 0.09906 CCCCT 0.3165 CCCGA 0.2511 CCCGC 0.2767 CCCGG 0.2755 CCCGT 0.2644 CCCTA 0.1956 CCCTC 0.2412 CCCTG 0.2812 CCCTT 0.3263 CCGAA 0.3283 CCGAC 0.2093 CCGAG 0.2569 CCGAT 0.2602 CCGCA 0.3047 CCGCC 0.2673 CCGCG 0.1385 CCGCT 0.3587 CCGGA 0.2962 CCGGC 0.2232 CCGGG 0.2249 CCGGT 0.3092 CCGTA 0.1986 CCGTC 0.2425 CCGTG 0.2648 CCGTT 0.3479 CCTAA 0.3829 CCTAC 0.2075 CCTAG 0.1506 CCTAT 0.2672 CCTCA 0.362 CCTCC 0.307 CCTCG 0.09964 CCTCT 0.3553 CCTGA 0.3067 CCTGC 0.2671 CCTGG 0.1898 CCTGT 0.3225 CCTTA 0.2011 CCTTC 0.232 CCTTG 0.1721 CCTTT 0.4123 CGAAA 0.3613 CGAAC 0.2035 CGAAG 0.1749 CGAAT 0.2738 CGACA 0.4006 CGACC 0.2307 CGACG 0.1312 CGACT 0.2852 CGAGA 0.2969 CGAGC 0.2523 CGAGG 0.2217 CGAGT 0.2878 CGATA 0.2331 CGATC 0.1888 CGATG 0.2454 CGATT 0.3509 CGCAA 0.2641 CGCAC 0.2397 CGCAG 0.2827 CGCAT 0.2604 CGCCA 0.3996 CGCCC 0.217 CGCCG 0.163 CGCCT 0.2703 CGCGA 0.232 CGCGC 0.3534 CGCGG 0.1897 CGCGT 0.2656 CGCTA 0.1779 CGCTC 0.2436 CGCTG 0.3647 CGCTT 0.2824 CGGAA 0.2786 CGGAC 0.1889 CGGAG 0.2886 CGGAT 0.278 CGGCA 0.3029 CGGCC 0.2289 CGGCG 0.1747 CGGCT 0.3685 CGGGA 0.3179 CGGGC 0.203 CGGGG 0.2483 CGGGT 0.2863 CGGTA 0.1969 CGGTC 0.1972 CGGTG 0.2855 CGGTT 0.3669 CGTAA 0.3564 CGTAC 0.2061 CGTAG 0.1728 CGTAT 0.2776 CGTCA 0.4003 CGTCC 0.2088 CGTCG 0.1117 CGTCT 0.3446 CGTGA 0.2812 CGTGC 0.2153 CGTGG 0.1807 CGTGT 0.3625 CGTTA 0.2255 CGTTC 0.1806 CGTTG 0.1625 CGTTT 0.4438 CTAAA 0.4276 CTAAC 0.1412 CTAAG 0.1158 CTAAT 0.2924 CTACA 0.4418 CTACC 0.1628 CTACG 0.08095 CTACT 0.2943 CTAGA 0.3172 CTAGC 0.2015 CTAGG 0.1613 CTAGT 0.3263 CTATA 0.2744 CTATC 0.1958 CTATG 0.1668 CTATT 0.3185 CTCAA 0.2917 CTCAC 0.219 CTCAG 0.241 CTCAT 0.2969 CTCCA 0.45 CTCCC 0.2103 CTCCG 0.1246 CTCCT 0.3606 CTCGA 0.2722 CTCGC 0.2712 CTCGG 0.2192 CTCGT 0.2959 CTCTA 0.1844 CTCTC 0.2775 CTCTG 0.3178 CTCTT 0.2957 CTGAA 0.395 CTGAC 0.1948 CTGAG 0.1995 CTGAT 0.2852 CTGCA 0.392 CTGCC 0.1776 CTGCG 0.1128 CTGCT 0.3721 CTGGA 0.3759 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.2238 CTGGT 0.2832 CTGTA 0.2654 CTGTC 0.1792 CTGTG 0.2643 CTGTT 0.3089 CTTAA 0.3855 CTTAC 0.1689 CTTAG 0.135 CTTAT 0.2828 CTTCA 0.4268 CTTCC 0.2175 CTTCG 0.06896 CTTCT 0.345 CTTGA 0.3166 CTTGC 0.2027 CTTGG 0.1556 CTTGT 0.3608 CTTTA 0.2688 CTTTC 0.1687 CTTTG 0.1815 CTTTT 0.3386 GAAAA 0.3613 GAAAC 0.1875 GAAAG 0.1636 GAAAT 0.2551 GAACA 0.4304 GAACC 0.1793 GAACG 0.1034 GAACT 0.2919 GAAGA 0.3541 GAAGC 0.2073 GAAGG 0.2156 GAAGT 0.2791 GAATA 0.2717 GAATC 0.1419 GAATG 0.2728 GAATT 0.2808 GACAA 0.2751 GACAC 0.1958 GACAG 0.2512 GACAT 0.2728 GACCA 0.3845 GACCC 0.2218 GACCG 0.1142 GACCT 0.3246 GACGA 0.2419 GACGC 0.2522 GACGG 0.211 GACGT 0.3543 GACTA 0.2071 GACTC 0.1707 GACTG 0.3045 GACTT 0.3262 GAGAA 0.3568 GAGAC 0.163 GAGAG 0.2944 GAGAT 0.258 GAGCA 0.4078 GAGCC 0.1877 GAGCG 0.1417 GAGCT 0.3838 GAGGA 0.4111 GAGGC 0.2224 GAGGG 0.2341 GAGGT 0.2536 GAGTA 0.2231 GAGTC 0.1863 GAGTG 0.2819 GAGTT 0.3551 GATAA 0.3376 GATAC 0.1336 GATAG 0.2147 GATAT 0.3046 GATCA 0.4179 GATCC 0.195 GATCG 0.09956 GATCT 0.3554 GATGA 0.3272 GATGC 0.209 GATGG 0.2053 GATGT 0.3163 GATTA 0.2366 GATTC 0.1408 GATTG 0.1903 GATTT 0.3983 GCAAA 0.3976 GCAAC 0.1842 GCAAG 0.1605 GCAAT 0.2231 GCACA 0.432 GCACC 0.1857 GCACG 0.1046 GCACT 0.2972 GCAGA 0.3164 GCAGC 0.2729 GCAGG 0.2025 GCAGT 0.2922 GCATA 0.2195 GCATC 0.1859 GCATG 0.2606 GCATT 0.3337 GCCAA 0.3214 GCCAC 0.2323 GCCAG 0.2166 GCCAT 0.2768 GCCCA 0.3473 GCCCC 0.2312 GCCCG 0.1068 GCCCT 0.375 GCCGA 0.2992 GCCGC 0.2694 GCCGG 0.2138 GCCGT 0.2895 GCCTA 0.2305 GCCTC 0.2252 GCCTG 0.281 GCCTT 0.3039 GCGAA 0.2563 GCGAC 0.2633 GCGAG 0.2539 GCGAT 0.2611 GCGCA 0.3292 GCGCC 0.189 GCGCG 0.2019 GCGCT 0.3354 GCGGA 0.3096 GCGGC 0.2534 GCGGG 0.2075 GCGGT 0.2959 GCGTA 0.1957 GCGTC 0.214 GCGTG 0.2893 GCGTT 0.3287 GCTAA 0.3894 GCTAC 0.1807 GCTAG 0.1563 GCTAT 0.263 GCTCA 0.3769 GCTCC 0.2343 GCTCG 0.112 GCTCT 0.3787 GCTGA 0.2807 GCTGC 0.231 GCTGG 0.2187 GCTGT 0.3422 GCTTA 0.2159 GCTTC 0.1837 GCTTG 0.208 GCTTT 0.4172 GGAAA 0.4189 GGAAC 0.149 GGAAG 0.1996 GGAAT 0.2166 GGACA 0.4331 GGACC 0.1629 GGACG 0.1244 GGACT 0.3009 GGAGA 0.3556 GGAGC 0.2369 GGAGG 0.2823 GGAGT 0.2334 GGATA 0.2306 GGATC 0.1584 GGATG 0.3197 GGATT 0.2959 GGCAA 0.2846 GGCAC 0.1845 GGCAG 0.2858 GGCAT 0.2897 GGCCA 0.4134 GGCCC 0.2104 GGCCG 0.1421 GGCCT 0.3098 GGCGA 0.2821 GGCGC 0.2401 GGCGG 0.263 GGCGT 0.2599 GGCTA 0.2243 GGCTC 0.1926 GGCTG 0.3237 GGCTT 0.2946 GGGAA 0.3758 GGGAC 0.1785 GGGAG 0.2404 GGGAT 0.2408 GGGCA 0.3367 GGGCC 0.2188 GGGCG 0.1461 GGGCT 0.3633 GGGGA 0.278 GGGGC 0.173 GGGGG 0.2944 GGGGT 0.2854 GGGTA 0.1891 GGGTC 0.1851 GGGTG 0.2926 GGGTT 0.3681 GGTAA 0.3453 GGTAC 0.1771 GGTAG 0.1769 GGTAT 0.2548 GGTCA 0.4584 GGTCC 0.165 GGTCG 0.1165 GGTCT 0.3054 GGTGA 0.2842 GGTGC 0.198 GGTGG 0.2466 GGTGT 0.3523 GGTTA 0.2165 GGTTC 0.1567 GGTTG 0.2187 GGTTT 0.4247 GTAAA 0.4305 GTAAC 0.1413 GTAAG 0.1156 GTAAT 0.2593 GTACA 0.4612 GTACC 0.148 GTACG 0.09433 GTACT 0.2956 GTAGA 0.2867 GTAGC 0.2072 GTAGG 0.1952 GTAGT 0.3258 GTATA 0.2855 GTATC 0.1159 GTATG 0.2272 GTATT 0.3561 GTCAA 0.2942 GTCAC 0.1978 GTCAG 0.2472 GTCAT 0.2878 GTCCA 0.4056 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1062 GTCCT 0.3485 GTCGA 0.2416 GTCGC 0.3163 GTCGG 0.2015 GTCGT 0.2809 GTCTA 0.2003 GTCTC 0.1927 GTCTG 0.3289 GTCTT 0.3195 GTGAA 0.3613 GTGAC 0.1982 GTGAG 0.2006 GTGAT 0.2537 GTGCA 0.3781 GTGCC 0.1623 GTGCG 0.1289 GTGCT 0.3664 GTGGA 0.3337 GTGGC 0.2255 GTGGG 0.2136 GTGGT 0.3053 GTGTA 0.1948 GTGTC 0.1384 GTGTG 0.4233 GTGTT 0.2952 GTTAA 0.359 GTTAC 0.1673 GTTAG 0.1459 GTTAT 0.3044 GTTCA 0.453 GTTCC 0.1669 GTTCG 0.08696 GTTCT 0.3225 GTTGA 0.2722 GTTGC 0.2001 GTTGG 0.197 GTTGT 0.3327 GTTTA 0.2477 GTTTC 0.1596 GTTTG 0.215 GTTTT 0.348 TAAAA 0.3558 TAAAC 0.1541 TAAAG 0.1538 TAAAT 0.2921 TAACA 0.397 TAACC 0.1743 TAACG 0.09326 TAACT 0.3022 TAAGA 0.2864 TAAGC 0.2169 TAAGG 0.1767 TAAGT 0.2782 TAATA 0.3195 TAATC 0.1225 TAATG 0.1863 TAATT 0.2831 TACAA 0.2681 TACAC 0.1842 TACAG 0.2026 TACAT 0.2756 TACCA 0.3594 TACCC 0.2006 TACCG 0.1077 TACCT 0.3397 TACGA 0.2524 TACGC 0.2349 TACGG 0.195 TACGT 0.3416 TACTA 0.2141 TACTC 0.1458 TACTG 0.2751 TACTT 0.3112 TAGAA 0.3049 TAGAC 0.1729 TAGAG 0.1876 TAGAT 0.3311 TAGCA 0.3722 TAGCC 0.2155 TAGCG 0.09783 TAGCT 0.3173 TAGGA 0.2645 TAGGC 0.231 TAGGG 0.2089 TAGGT 0.2864 TAGTA 0.2419 TAGTC 0.1601 TAGTG 0.233 TAGTT 0.3604 TATAA 0.2305 TATAC 0.1027 TATAG 0.09697 TATAT 0.4517 TATCA 0.3527 TATCC 0.1778 TATCG 0.07828 TATCT 0.3649 TATGA 0.2838 TATGC 0.1804 TATGG 0.1579 TATGT 0.3246 TATTA 0.2512 TATTC 0.1122 TATTG 0.1402 TATTT 0.3903 TCAAA 0.3716 TCAAC 0.1657 TCAAG 0.1611 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3993 TCACC 0.1948 TCACG 0.0919 TCACT 0.3234 TCAGA 0.3003 TCAGC 0.2375 TCAGG 0.1755 TCAGT 0.3455 TCATA 0.2153 TCATC 0.1928 TCATG 0.1924 TCATT 0.3842 TCCAA 0.2764 TCCAC 0.2161 TCCAG 0.2787 TCCAT 0.2756 TCCCA 0.3664 TCCCC 0.2477 TCCCG 0.1098 TCCCT 0.3279 TCCGA 0.2229 TCCGC 0.2973 TCCGG 0.2492 TCCGT 0.2892 TCCTA 0.1757 TCCTC 0.3003 TCCTG 0.3111 TCCTT 0.3177 TCGAA 0.2972 TCGAC 0.1978 TCGAG 0.248 TCGAT 0.2897 TCGCA 0.3018 TCGCC 0.2343 TCGCG 0.1456 TCGCT 0.361 TCGGA 0.245 TCGGC 0.2895 TCGGG 0.1958 TCGGT 0.3129 TCGTA 0.2097 TCGTC 0.2124 TCGTG 0.2467 TCGTT 0.361 TCTAA 0.3174 TCTAC 0.1683 TCTAG 0.1516 TCTAT 0.3364 TCTCA 0.3267 TCTCC 0.2448 TCTCG 0.08505 TCTCT 0.4038 TCTGA 0.3025 TCTGC 0.2202 TCTGG 0.1794 TCTGT 0.361 TCTTA 0.1972 TCTTC 0.2185 TCTTG 0.1962 TCTTT 0.3895 TGAAA 0.3513 TGAAC 0.1735 TGAAG 0.1968 TGAAT 0.2876 TGACA 0.3783 TGACC 0.1996 TGACG 0.1093 TGACT 0.3094 TGAGA 0.3049 TGAGC 0.2386 TGAGG 0.2252 TGAGT 0.3074 TGATA 0.2143 TGATC 0.1607 TGATG 0.2921 TGATT 0.3448 TGCAA 0.2438 TGCAC 0.1771 TGCAG 0.2456 TGCAT 0.2964 TGCCA 0.4135 TGCCC 0.1914 TGCCG 0.1074 TGCCT 0.3331 TGCGA 0.2229 TGCGC 0.2668 TGCGG 0.2002 TGCGT 0.3513 TGCTA 0.1864 TGCTC 0.1966 TGCTG 0.3376 TGCTT 0.3082 TGGAA 0.2905 TGGAC 0.1789 TGGAG 0.2577 TGGAT 0.2854 TGGCA 0.3428 TGGCC 0.2228 TGGCG 0.1344 TGGCT 0.3217 TGGGA 0.2848 TGGGC 0.1844 TGGGG 0.2259 TGGGT 0.3263 TGGTA 0.1889 TGGTC 0.1948 TGGTG 0.2865 TGGTT 0.3678 TGTAA 0.3264 TGTAC 0.1599 TGTAG 0.1615 TGTAT 0.3193 TGTCA 0.3649 TGTCC 0.1993 TGTCG 0.08565 TGTCT 0.3517 TGTGA 0.225 TGTGC 0.1622 TGTGG 0.1632 TGTGT 0.4809 TGTTA 0.1965 TGTTC 0.1552 TGTTG 0.2015 TGTTT 0.4101 TTAAA 0.4199 TTAAC 0.1323 TTAAG 0.1266 TTAAT 0.2601 TTACA 0.3945 TTACC 0.1564 TTACG 0.07268 TTACT 0.2944 TTAGA 0.2758 TTAGC 0.2254 TTAGG 0.1748 TTAGT 0.3086 TTATA 0.2328 TTATC 0.1033 TTATG 0.1483 TTATT 0.3982 TTCAA 0.2493 TTCAC 0.1836 TTCAG 0.231 TTCAT 0.2962 TTCCA 0.3522 TTCCC 0.2338 TTCCG 0.08482 TTCCT 0.3429 TTCGA 0.2757 TTCGC 0.228 TTCGG 0.2247 TTCGT 0.3056 TTCTA 0.1812 TTCTC 0.1982 TTCTG 0.2903 TTCTT 0.328 TTGAA 0.3406 TTGAC 0.1835 TTGAG 0.2103 TTGAT 0.2728 TTGCA 0.3662 TTGCC 0.1681 TTGCG 0.09583 TTGCT 0.3454 TTGGA 0.2629 TTGGC 0.225 TTGGG 0.2006 TTGGT 0.2964 TTGTA 0.2269 TTGTC 0.145 TTGTG 0.2383 TTGTT 0.3617 TTTAA 0.332 TTTAC 0.1497 TTTAG 0.1368 TTTAT 0.2895 TTTCA 0.3246 TTTCC 0.2112 TTTCG 0.06373 TTTCT 0.3425 TTTGA 0.2728 TTTGC 0.1813 TTTGG 0.1757 TTTGT 0.328 TTTTA 0.2247 TTTTC 0.1337 TTTTG 0.159 TTTTT 0.3724 [2] # (a,c,g,t)= (0.283, 0.217, 0.217, 0.283) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.32 C 0.18 G 0.18 T 0.32 # l= 1 # Values AA 0.113 AC 0.057 AG 0.0562 AT 0.0935 CA 0.0727 CC 0.0336 CG 0.0176 CT 0.0562 GA 0.0518 GC 0.0378 GG 0.0336 GT 0.057 TA 0.0822 TC 0.0518 TG 0.0727 TT 0.113 # l= 2 # Values AAA 0.046 AAC 0.0189 AAG 0.0169 AAT 0.0314 ACA 0.0259 ACC 0.00947 ACG 0.0051 ACT 0.0165 AGA 0.0173 AGC 0.0123 AGG 0.0102 AGT 0.0165 ATA 0.0284 ATC 0.0135 ATG 0.0202 ATT 0.0314 CAA 0.0205 CAC 0.0155 CAG 0.0166 CAT 0.0202 CCA 0.0125 CCC 0.0072 CCG 0.00364 CCT 0.0102 CGA 0.00431 CGC 0.00452 CGG 0.00364 CGT 0.0051 CTA 0.0118 CTC 0.0109 CTG 0.0166 CTT 0.0169 GAA 0.0177 GAC 0.00963 GAG 0.0109 GAT 0.0135 GCA 0.014 GCC 0.00691 GCG 0.00452 GCT 0.0123 GGA 0.00999 GGC 0.00691 GGG 0.0072 GGT 0.00947 GTA 0.013 GTC 0.00963 GTG 0.0155 GTT 0.0189 TAA 0.029 TAC 0.013 TAG 0.0118 TAT 0.0284 TCA 0.0202 TCC 0.00999 TCG 0.00431 TCT 0.0173 TGA 0.0202 TGC 0.014 TGG 0.0125 TGT 0.0259 TTA 0.029 TTC 0.0177 TTG 0.0205 TTT 0.046 # l= 3 # Values AAAA 0.018 AAAC 0.00818 AAAG 0.00694 AAAT 0.0129 AACA 0.00847 AACC 0.00328 AACG 0.00172 AACT 0.0054 AAGA 0.00517 AAGC 0.00355 AAGG 0.00311 AAGT 0.0051 AATA 0.0106 AATC 0.00453 AATG 0.00751 AATT 0.00877 ACAA 0.00721 ACAC 0.0063 ACAG 0.0055 ACAT 0.00691 ACCA 0.00353 ACCC 0.00207 ACCG 0.00105 ACCT 0.00281 ACGA 0.00122 ACGC 0.00126 ACGG 0.000955 ACGT 0.00166 ACTA 0.00372 ACTC 0.00279 ACTG 0.00489 ACTT 0.0051 AGAA 0.00586 AGAC 0.00314 AGAG 0.00375 AGAT 0.0045 AGCA 0.00473 AGCC 0.00231 AGCG 0.00142 AGCT 0.00383 AGGA 0.00306 AGGC 0.0021 AGGG 0.00222 AGGT 0.00281 AGTA 0.00396 AGTC 0.00285 AGTG 0.0043 AGTT 0.0054 ATAA 0.00955 ATAC 0.00391 ATAG 0.00355 ATAT 0.0114 ATCA 0.00536 ATCC 0.00254 ATCG 0.00114 ATCT 0.0045 ATGA 0.00601 ATGC 0.00394 ATGG 0.00329 ATGT 0.00691 ATTA 0.00874 ATTC 0.00457 ATTG 0.00519 ATTT 0.0129 CAAA 0.00837 CAAC 0.00373 CAAG 0.00317 CAAT 0.00519 CACA 0.00736 CACC 0.00253 CACG 0.0013 CACT 0.0043 CAGA 0.00499 CAGC 0.00396 CAGG 0.00278 CAGT 0.00489 CATA 0.00461 CATC 0.00364 CATG 0.0044 CATT 0.00751 CCAA 0.00366 CCAC 0.00267 CCAG 0.00289 CCAT 0.00329 CCCA 0.00251 CCCC 0.00176 CCCG 0.000711 CCCT 0.00222 CCGA 0.000878 CCGC 0.000957 CCGG 0.000853 CCGT 0.000955 CCTA 0.00201 CCTC 0.0023 CCTG 0.00278 CCTT 0.00311 CGAA 0.00123 CGAC 0.000903 CGAG 0.00104 CGAT 0.00114 CGCA 0.00146 CGCC 0.000935 CGCG 0.000704 CGCT 0.00142 CGGA 0.000998 CGGC 0.000885 CGGG 0.000711 CGGT 0.00105 CGTA 0.000995 CGTC 0.00108 CGTG 0.0013 CGTT 0.00172 CTAA 0.00418 CTAC 0.00217 CTAG 0.00186 CTAT 0.00355 CTCA 0.00377 CTCC 0.00237 CTCG 0.00104 CTCT 0.00375 CTGA 0.00465 CTGC 0.00358 CTGG 0.00289 CTGT 0.0055 CTTA 0.00359 CTTC 0.00323 CTTG 0.00317 CTTT 0.00695 GAAA 0.00696 GAAC 0.00293 GAAG 0.00323 GAAT 0.00457 GACA 0.00395 GACC 0.00175 GACG 0.00108 GACT 0.00285 GAGA 0.00348 GAGC 0.00237 GAGG 0.0023 GAGT 0.00279 GATA 0.00325 GATC 0.00213 GATG 0.00363 GATT 0.00453 GCAA 0.00385 GCAC 0.00267 GCAG 0.00358 GCAT 0.00394 GCCA 0.00258 GCCC 0.00134 GCCG 0.000885 GCCT 0.0021 GCGA 0.00109 GCGC 0.00121 GCGG 0.000957 GCGT 0.00126 GCTA 0.00241 GCTC 0.00237 GCTG 0.00396 GCTT 0.00355 GGAA 0.00331 GGAC 0.00177 GGAG 0.00237 GGAT 0.00254 GGCA 0.00228 GGCC 0.00139 GGCG 0.000935 GGCT 0.00231 GGGA 0.00203 GGGC 0.00134 GGGG 0.00176 GGGT 0.00208 GGTA 0.00191 GGTC 0.00175 GGTG 0.00253 GGTT 0.00328 GTAA 0.00472 GTAC 0.0022 GTAG 0.00217 GTAT 0.00391 GTCA 0.00381 GTCC 0.00177 GTCG 0.000903 GTCT 0.00314 GTGA 0.00384 GTGC 0.00267 GTGG 0.00267 GTGT 0.0063 GTTA 0.00403 GTTC 0.00293 GTTG 0.00373 GTTT 0.00818 TAAA 0.0127 TAAC 0.00403 TAAG 0.00359 TAAT 0.00874 TACA 0.00614 TACC 0.00191 TACG 0.000996 TACT 0.00396 TAGA 0.00362 TAGC 0.00241 TAGG 0.00201 TAGT 0.00372 TATA 0.00997 TATC 0.00325 TATG 0.00461 TATT 0.0106 TCAA 0.00574 TCAC 0.00384 TCAG 0.00465 TCAT 0.00601 TCCA 0.0039 TCCC 0.00203 TCCG 0.000998 TCCT 0.00306 TCGA 0.00112 TCGC 0.00109 TCGG 0.000878 TCGT 0.00122 TCTA 0.00362 TCTC 0.00348 TCTG 0.00499 TCTT 0.00517 TGAA 0.00729 TGAC 0.00381 TGAG 0.00377 TGAT 0.00536 TGCA 0.00559 TGCC 0.00228 TGCG 0.00146 TGCT 0.00473 TGGA 0.0039 TGGC 0.00258 TGGG 0.00251 TGGT 0.00353 TGTA 0.00614 TGTC 0.00395 TGTG 0.00736 TGTT 0.00847 TTAA 0.0106 TTAC 0.00472 TTAG 0.00418 TTAT 0.00955 TTCA 0.00729 TTCC 0.00331 TTCG 0.00123 TTCT 0.00586 TTGA 0.00574 TTGC 0.00385 TTGG 0.00366 TTGT 0.00721 TTTA 0.0127 TTTC 0.00696 TTTG 0.00837 TTTT 0.018 # l= 4 # Values AAAAA 0.00751 AAAAC 0.00309 AAAAG 0.00257 AAAAT 0.00484 AAACA 0.00381 AAACC 0.00136 AAACG 0.000757 AAACT 0.00225 AAAGA 0.00209 AAAGC 0.00144 AAAGG 0.00128 AAAGT 0.00214 AAATA 0.0047 AAATC 0.00186 AAATG 0.00328 AAATT 0.00303 AACAA 0.00273 AACAC 0.00169 AACAG 0.00167 AACAT 0.00238 AACCA 0.00126 AACCC 0.000748 AACCG 0.00037 AACCT 0.000899 AACGA 0.000436 AACGC 0.000402 AACGG 0.000308 AACGT 0.000573 AACTA 0.00136 AACTC 0.000951 AACTG 0.00153 AACTT 0.00157 AAGAA 0.00191 AAGAC 0.00098 AAGAG 0.00105 AAGAT 0.00123 AAGCA 0.00144 AAGCC 0.000642 AAGCG 0.000375 AAGCT 0.00109 AAGGA 0.000894 AAGGC 0.000623 AAGGG 0.000708 AAGGT 0.000884 AAGTA 0.00129 AAGTC 0.000921 AAGTG 0.00133 AAGTT 0.00157 AATAA 0.00458 AATAC 0.00144 AATAG 0.00122 AATAT 0.00333 AATCA 0.00192 AATCC 0.000793 AATCG 0.000395 AATCT 0.00142 AATGA 0.00242 AATGC 0.00137 AATGG 0.0011 AATGT 0.00261 AATTA 0.00283 AATTC 0.00134 AATTG 0.00158 AATTT 0.00303 ACAAA 0.00297 ACAAC 0.00126 ACAAG 0.00106 ACAAT 0.00191 ACACA 0.0035 ACACC 0.000816 ACACG 0.000453 ACACT 0.00153 ACAGA 0.00172 ACAGC 0.00125 ACAGG 0.000847 ACAGT 0.00168 ACATA 0.00164 ACATC 0.00113 ACATG 0.00154 ACATT 0.00261 ACCAA 0.00107 ACCAC 0.000765 ACCAG 0.000781 ACCAT 0.00092 ACCCA 0.000817 ACCCC 0.000485 ACCCG 0.000191 ACCCT 0.000582 ACCGA 0.000256 ACCGC 0.000264 ACCGG 0.000247 ACCGT 0.000284 ACCTA 0.000581 ACCTC 0.000558 ACCTG 0.000786 ACCTT 0.000884 ACGAA 0.000364 ACGAC 0.00024 ACGAG 0.000291 ACGAT 0.000329 ACGCA 0.0005 ACGCC 0.000226 ACGCG 0.000182 ACGCT 0.000348 ACGGA 0.000265 ACGGC 0.000233 ACGGG 0.000174 ACGGT 0.000284 ACGTA 0.000323 ACGTC 0.000361 ACGTG 0.000407 ACGTT 0.000573 ACTAA 0.00132 ACTAC 0.000704 ACTAG 0.000601 ACTAT 0.0011 ACTCA 0.00112 ACTCC 0.000526 ACTCG 0.00029 ACTCT 0.000855 ACTGA 0.00146 ACTGC 0.000977 ACTGG 0.000772 ACTGT 0.00168 ACTTA 0.00112 ACTTC 0.00088 ACTTG 0.000961 ACTTT 0.00214 AGAAA 0.00255 AGAAC 0.000895 AGAAG 0.00105 AGAAT 0.00136 AGACA 0.00137 AGACC 0.000522 AGACG 0.000356 AGACT 0.000895 AGAGA 0.00137 AGAGC 0.000807 AGAGG 0.000714 AGAGT 0.000855 AGATA 0.00125 AGATC 0.000688 AGATG 0.00115 AGATT 0.00142 AGCAA 0.00133 AGCAC 0.000927 AGCAG 0.00122 AGCAT 0.00124 AGCCA 0.000823 AGCCC 0.000451 AGCCG 0.000303 AGCCT 0.000732 AGCGA 0.000372 AGCGC 0.000382 AGCGG 0.000317 AGCGT 0.000348 AGCTA 0.000763 AGCTC 0.000766 AGCTG 0.00121 AGCTT 0.00109 AGGAA 0.00112 AGGAC 0.000553 AGGAG 0.000696 AGGAT 0.000694 AGGCA 0.000738 AGGCC 0.000388 AGGCG 0.000242 AGGCT 0.000732 AGGGA 0.000645 AGGGC 0.000464 AGGGG 0.000534 AGGGT 0.000582 AGGTA 0.000634 AGGTC 0.000514 AGGTG 0.000762 AGGTT 0.000899 AGTAA 0.00148 AGTAC 0.000655 AGTAG 0.00068 AGTAT 0.00115 AGTCA 0.00116 AGTCC 0.000543 AGTCG 0.000246 AGTCT 0.000895 AGTGA 0.0012 AGTGC 0.000795 AGTGG 0.00077 AGTGT 0.00153 AGTTA 0.00124 AGTTC 0.000858 AGTTG 0.00105 AGTTT 0.00225 ATAAA 0.00421 ATAAC 0.00127 ATAAG 0.00107 ATAAT 0.003 ATACA 0.002 ATACC 0.000493 ATACG 0.000271 ATACT 0.00115 ATAGA 0.00126 ATAGC 0.000652 ATAGG 0.000531 ATAGT 0.0011 ATATA 0.00548 ATATC 0.00103 ATATG 0.00155 ATATT 0.00333 ATCAA 0.00158 ATCAC 0.000971 ATCAG 0.00122 ATCAT 0.00159 ATCCA 0.00111 ATCCC 0.000465 ATCCG 0.000269 ATCCT 0.000694 ATCGA 0.000317 ATCGC 0.000276 ATCGG 0.000214 ATCGT 0.000329 ATCTA 0.0012 ATCTC 0.000808 ATCTG 0.00126 ATCTT 0.00123 ATGAA 0.00228 ATGAC 0.0011 ATGAG 0.00105 ATGAT 0.00159 ATGCA 0.00169 ATGCC 0.000627 ATGCG 0.000371 ATGCT 0.00124 ATGGA 0.00106 ATGGC 0.000693 ATGGG 0.00062 ATGGT 0.00092 ATGTA 0.00183 ATGTC 0.0011 ATGTG 0.0016 ATGTT 0.00238 ATTAA 0.00317 ATTAC 0.00129 ATTAG 0.00127 ATTAT 0.003 ATTCA 0.00215 ATTCC 0.000721 ATTCG 0.00034 ATTCT 0.00136 ATTGA 0.00148 ATTGC 0.000912 ATTGG 0.000899 ATTGT 0.00191 ATTTA 0.00385 ATTTC 0.00189 ATTTG 0.00229 ATTTT 0.00484 CAAAA 0.00309 CAAAC 0.00173 CAAAG 0.00126 CAAAT 0.00229 CAACA 0.0017 CAACC 0.000701 CAACG 0.000277 CAACT 0.00105 CAAGA 0.000993 CAAGC 0.000695 CAAGG 0.000524 CAAGT 0.000961 CAATA 0.00159 CAATC 0.000875 CAATG 0.00115 CAATT 0.00158 CACAA 0.00167 CACAC 0.00266 CACAG 0.00142 CACAT 0.0016 CACCA 0.000934 CACCC 0.000558 CACCG 0.000279 CACCT 0.000762 CACGA 0.000293 CACGC 0.00036 CACGG 0.000243 CACGT 0.000407 CACTA 0.000866 CACTC 0.000759 CACTG 0.00134 CACTT 0.00133 CAGAA 0.0017 CAGAC 0.000977 CAGAG 0.00105 CAGAT 0.00126 CAGCA 0.00153 CAGCC 0.000741 CAGCG 0.000481 CAGCT 0.00121 CAGGA 0.000854 CAGGC 0.000548 CAGGG 0.000589 CAGGT 0.000786 CAGTA 0.00118 CAGTC 0.000838 CAGTG 0.00134 CAGTT 0.00153 CATAA 0.00153 CATAC 0.000922 CATAG 0.000611 CATAT 0.00155 CATCA 0.00142 CATCC 0.000796 CATCG 0.000273 CATCT 0.00115 CATGA 0.00119 CATGC 0.000983 CATGG 0.000689 CATGT 0.00154 CATTA 0.00175 CATTC 0.00132 CATTG 0.00115 CATTT 0.00328 CCAAA 0.00152 CCAAC 0.000743 CCAAG 0.000503 CCAAT 0.000899 CCACA 0.00113 CCACC 0.000551 CCACG 0.00022 CCACT 0.00077 CCAGA 0.000823 CCAGC 0.000816 CCAGG 0.000484 CCAGT 0.000772 CCATA 0.000772 CCATC 0.000728 CCATG 0.000689 CCATT 0.0011 CCCAA 0.000743 CCCAC 0.000549 CCCAG 0.000596 CCCAT 0.00062 CCCCA 0.000553 CCCCC 0.000499 CCCCG 0.000171 CCCCT 0.000534 CCCGA 0.000167 CCCGC 0.000191 CCCGG 0.000179 CCCGT 0.000174 CCCTA 0.000425 CCCTC 0.000503 CCCTG 0.000589 CCCTT 0.000708 CCGAA 0.000272 CCGAC 0.000176 CCGAG 0.000217 CCGAT 0.000214 CCGCA 0.000271 CCGCC 0.000238 CCGCG 0.000131 CCGCT 0.000317 CCGGA 0.000241 CCGGC 0.000187 CCGGG 0.000179 CCGGT 0.000247 CCGTA 0.000188 CCGTC 0.000217 CCGTG 0.000243 CCGTT 0.000308 CCTAA 0.000754 CCTAC 0.000423 CCTAG 0.000301 CCTAT 0.000531 CCTCA 0.000774 CCTCC 0.000594 CCTCG 0.000215 CCTCT 0.000714 CCTGA 0.000765 CCTGC 0.000682 CCTGG 0.000484 CCTGT 0.000847 CCTTA 0.000634 CCTTC 0.000675 CCTTG 0.000524 CCTTT 0.00128 CGAAA 0.000435 CGAAC 0.000245 CGAAG 0.000214 CGAAT 0.00034 CGACA 0.000344 CGACC 0.000199 CGACG 0.000115 CGACT 0.000246 CGAGA 0.000287 CGAGC 0.000249 CGAGG 0.000215 CGAGT 0.00029 CGATA 0.000258 CGATC 0.000209 CGATG 0.000273 CGATT 0.000395 CGCAA 0.000363 CGCAC 0.000335 CGCAG 0.000388 CGCAT 0.000371 CGCCA 0.00035 CGCCC 0.000195 CGCCG 0.000149 CGCCT 0.000242 CGCGA 0.000155 CGCGC 0.000237 CGCGG 0.000131 CGCGT 0.000182 CGCTA 0.00024 CGCTC 0.000322 CGCTG 0.000481 CGCTT 0.000375 CGGAA 0.000272 CGGAC 0.000183 CGGAG 0.000274 CGGAT 0.000269 CGGCA 0.000244 CGGCC 0.000189 CGGCG 0.000149 CGGCT 0.000303 CGGGA 0.000213 CGGGC 0.000136 CGGGG 0.000171 CGGGT 0.000191 CGGTA 0.000203 CGGTC 0.000199 CGGTG 0.000279 CGGTT 0.00037 CGTAA 0.000349 CGTAC 0.0002 CGTAG 0.000175 CGTAT 0.000271 CGTCA 0.000407 CGTCC 0.000204 CGTCG 0.000115 CGTCT 0.000356 CGTGA 0.000351 CGTGC 0.000279 CGTGG 0.00022 CGTGT 0.000453 CGTTA 0.000384 CGTTC 0.000301 CGTTG 0.000277 CGTTT 0.000757 CTAAA 0.00182 CTAAC 0.000602 CTAAG 0.000488 CTAAT 0.00127 CTACA 0.000975 CTACC 0.000345 CTACG 0.000175 CTACT 0.00068 CTAGA 0.000577 CTAGC 0.000378 CTAGG 0.000301 CTAGT 0.000601 CTATA 0.00102 CTATC 0.000702 CTATG 0.000611 CTATT 0.00122 CTCAA 0.00111 CTCAC 0.000776 CTCAG 0.00084 CTCAT 0.00105 CTCCA 0.000926 CTCCC 0.000473 CTCCG 0.000274 CTCCT 0.000696 CTCGA 0.000263 CTCGC 0.000271 CTCGG 0.000217 CTCGT 0.000291 CTCTA 0.000671 CTCTC 0.000982 CTCTG 0.00105 CTCTT 0.00105 CTGAA 0.00169 CTGAC 0.000894 CTGAG 0.00084 CTGAT 0.00122 CTGCA 0.00138 CTGCC 0.00059 CTGCG 0.000388 CTGCT 0.00122 CTGGA 0.000999 CTGGC 0.000518 CTGGG 0.000596 CTGGT 0.000781 CTGTA 0.00142 CTGTC 0.000986 CTGTG 0.00142 CTGTT 0.00167 CTTAA 0.00139 CTTAC 0.000629 CTTAG 0.000488 CTTAT 0.00107 CTTCA 0.00131 CTTCC 0.000656 CTTCG 0.000214 CTTCT 0.00105 CTTGA 0.000949 CTTGC 0.000656 CTTGG 0.000503 CTTGT 0.00106 CTTTA 0.00196 CTTTC 0.00116 CTTTG 0.00126 CTTTT 0.00257 GAAAA 0.00263 GAAAC 0.00129 GAAAG 0.00116 GAAAT 0.00189 GAACA 0.00127 GAACC 0.000504 GAACG 0.000301 GAACT 0.000858 GAAGA 0.00104 GAAGC 0.000628 GAAGG 0.000675 GAAGT 0.00088 GAATA 0.00126 GAATC 0.000658 GAATG 0.00132 GAATT 0.00134 GACAA 0.0011 GACAC 0.000759 GACAG 0.000986 GACAT 0.0011 GACCA 0.000654 GACCC 0.000381 GACCG 0.000199 GACCT 0.000514 GACGA 0.000247 GACGC 0.000258 GACGG 0.000217 GACGT 0.000361 GACTA 0.000602 GACTC 0.000485 GACTG 0.000838 GACTT 0.000921 GAGAA 0.00113 GAGAC 0.000561 GAGAG 0.000982 GAGAT 0.000808 GAGCA 0.00087 GAGCC 0.00041 GAGCG 0.000322 GAGCT 0.000766 GAGGA 0.000785 GAGGC 0.000452 GAGGG 0.000503 GAGGT 0.000558 GAGTA 0.000594 GAGTC 0.000485 GAGTG 0.000759 GAGTT 0.000951 GATAA 0.00107 GATAC 0.000447 GATAG 0.000702 GATAT 0.00103 GATCA 0.000853 GATCC 0.000382 GATCG 0.000209 GATCT 0.000688 GATGA 0.00108 GATGC 0.000705 GATGG 0.000728 GATGT 0.00113 GATTA 0.00113 GATTC 0.000658 GATTG 0.000875 GATTT 0.00186 GCAAA 0.00156 GCAAC 0.000728 GCAAG 0.000656 GCAAT 0.000912 GCACA 0.00113 GCACC 0.000467 GCACG 0.000279 GCACT 0.000795 GCAGA 0.00105 GCAGC 0.000872 GCAGG 0.000682 GCAGT 0.000977 GCATA 0.000877 GCATC 0.000705 GCATG 0.000983 GCATT 0.00137 GCCAA 0.000809 GCCAC 0.000564 GCCAG 0.000518 GCCAT 0.000693 GCCCA 0.000442 GCCCC 0.000297 GCCCG 0.000136 GCCCT 0.000464 GCCGA 0.000244 GCCGC 0.000222 GCCGG 0.000187 GCCGT 0.000233 GCCTA 0.000477 GCCTC 0.000452 GCCTG 0.000548 GCCTT 0.000623 GCGAA 0.000274 GCGAC 0.000275 GCGAG 0.000271 GCGAT 0.000276 GCGCA 0.000371 GCGCC 0.000217 GCGCG 0.000237 GCGCT 0.000382 GCGGA 0.00028 GCGGC 0.000222 GCGGG 0.000191 GCGGT 0.000264 GCGTA 0.000236 GCGTC 0.000258 GCGTG 0.00036 GCGTT 0.000402 GCTAA 0.000946 GCTAC 0.000436 GCTAG 0.000378 GCTAT 0.000652 GCTCA 0.00082 GCTCC 0.000491 GCTCG 0.000249 GCTCT 0.000807 GCTGA 0.00102 GCTGC 0.000872 GCTGG 0.000816 GCTGT 0.00125 GCTTA 0.000787 GCTTC 0.000628 GCTTG 0.000695 GCTTT 0.00144 GGAAA 0.00145 GGAAC 0.00048 GGAAG 0.000656 GGAAT 0.000721 GGACA 0.000736 GGACC 0.000289 GGACG 0.000204 GGACT 0.000543 GGAGA 0.000757 GGAGC 0.000491 GGAGG 0.000594 GGAGT 0.000526 GGATA 0.000571 GGATC 0.000382 GGATG 0.000796 GGATT 0.000793 GGCAA 0.000657 GGCAC 0.000403 GGCAG 0.00059 GGCAT 0.000627 GGCCA 0.000534 GGCCC 0.000276 GGCCG 0.000189 GGCCT 0.000388 GGCGA 0.000254 GGCGC 0.000217 GGCGG 0.000238 GGCGT 0.000226 GGCTA 0.000516 GGCTC 0.00041 GGCTG 0.000741 GGCTT 0.000642 GGGAA 0.000737 GGGAC 0.000355 GGGAG 0.000473 GGGAT 0.000465 GGGCA 0.000418 GGGCC 0.000276 GGGCG 0.000195 GGGCT 0.000451 GGGGA 0.000476 GGGGC 0.000297 GGGGG 0.000499 GGGGT 0.000485 GGGTA 0.000388 GGGTC 0.000381 GGGTG 0.000558 GGGTT 0.000748 GGTAA 0.000746 GGTAC 0.000323 GGTAG 0.000345 GGTAT 0.000493 GGTCA 0.000739 GGTCC 0.000289 GGTCG 0.000199 GGTCT 0.000522 GGTGA 0.000699 GGTGC 0.000467 GGTGG 0.000551 GGTGT 0.000816 GGTTA 0.000713 GGTTC 0.000504 GGTTG 0.000701 GGTTT 0.00136 GTAAA 0.00211 GTAAC 0.000687 GTAAG 0.000629 GTAAT 0.00129 GTACA 0.00102 GTACC 0.000323 GTACG 0.0002 GTACT 0.000655 GTAGA 0.000611 GTAGC 0.000436 GTAGG 0.000423 GTAGT 0.000704 GTATA 0.0011 GTATC 0.000447 GTATG 0.000922 GTATT 0.00144 GTCAA 0.00109 GTCAC 0.000727 GTCAG 0.000894 GTCAT 0.0011 GTCCA 0.000681 GTCCC 0.000355 GTCCG 0.000183 GTCCT 0.000553 GTCGA 0.000212 GTCGC 0.000275 GTCGG 0.000176 GTCGT 0.00024 GTCTA 0.000626 GTCTC 0.000561 GTCTG 0.000977 GTCTT 0.00098 GTGAA 0.00137 GTGAC 0.000727 GTGAG 0.000776 GTGAT 0.000971 GTGCA 0.00101 GTGCC 0.000403 GTGCG 0.000335 GTGCT 0.000927 GTGGA 0.000793 GTGGC 0.000564 GTGGG 0.000549 GTGGT 0.000765 GTGTA 0.0012 GTGTC 0.000759 GTGTG 0.00266 GTGTT 0.00169 GTTAA 0.00147 GTTAC 0.000687 GTTAG 0.000602 GTTAT 0.00127 GTTCA 0.00131 GTTCC 0.00048 GTTCG 0.000245 GTTCT 0.000895 GTTGA 0.000992 GTTGC 0.000728 GTTGG 0.000743 GTTGT 0.00126 GTTTA 0.00208 GTTTC 0.00129 GTTTG 0.00173 GTTTT 0.00309 TAAAA 0.00478 TAAAC 0.00208 TAAAG 0.00196 TAAAT 0.00385 TAACA 0.00169 TAACC 0.000713 TAACG 0.000384 TAACT 0.00124 TAAGA 0.00104 TAAGC 0.000787 TAAGG 0.000634 TAAGT 0.00112 TAATA 0.00302 TAATC 0.00113 TAATG 0.00175 TAATT 0.00283 TACAA 0.0017 TACAC 0.0012 TACAG 0.00142 TACAT 0.00183 TACCA 0.000681 TACCC 0.000388 TACCG 0.000203 TACCT 0.000634 TACGA 0.000248 TACGC 0.000236 TACGG 0.000188 TACGT 0.000323 TACTA 0.000899 TACTC 0.000594 TACTG 0.00118 TACTT 0.00129 TAGAA 0.00112 TAGAC 0.000626 TAGAG 0.000671 TAGAT 0.0012 TAGCA 0.000893 TAGCC 0.000516 TAGCG 0.00024 TAGCT 0.000763 TAGGA 0.000528 TAGGC 0.000477 TAGGG 0.000425 TAGGT 0.000581 TAGTA 0.000899 TAGTC 0.000602 TAGTG 0.000866 TAGTT 0.00136 TATAA 0.00237 TATAC 0.0011 TATAG 0.00102 TATAT 0.00548 TATCA 0.00117 TATCC 0.000571 TATCG 0.000258 TATCT 0.00125 TATGA 0.00132 TATGC 0.000877 TATGG 0.000772 TATGT 0.00164 TATTA 0.00302 TATTC 0.00126 TATTG 0.00159 TATTT 0.0047 TCAAA 0.00232 TCAAC 0.000992 TCAAG 0.000949 TCAAT 0.00148 TCACA 0.00159 TCACC 0.000699 TCACG 0.000351 TCACT 0.0012 TCAGA 0.0014 TCAGC 0.00102 TCAGG 0.000765 TCAGT 0.00146 TCATA 0.00132 TCATC 0.00108 TCATG 0.00119 TCATT 0.00242 TCCAA 0.00104 TCCAC 0.000793 TCCAG 0.000999 TCCAT 0.00106 TCCCA 0.000696 TCCCC 0.000476 TCCCG 0.000213 TCCCT 0.000645 TCCGA 0.000211 TCCGC 0.00028 TCCGG 0.000241 TCCGT 0.000265 TCCTA 0.000528 TCCTC 0.000785 TCCTG 0.000854 TCCTT 0.000894 TCGAA 0.000325 TCGAC 0.000212 TCGAG 0.000263 TCGAT 0.000317 TCGCA 0.000315 TCGCC 0.000254 TCGCG 0.000155 TCGCT 0.000372 TCGGA 0.000211 TCGGC 0.000244 TCGGG 0.000167 TCGGT 0.000256 TCGTA 0.000248 TCGTC 0.000247 TCGTG 0.000293 TCGTT 0.000436 TCTAA 0.00117 TCTAC 0.000611 TCTAG 0.000577 TCTAT 0.00126 TCTCA 0.00106 TCTCC 0.000757 TCTCG 0.000287 TCTCT 0.00137 TCTGA 0.0014 TCTGC 0.00105 TCTGG 0.000823 TCTGT 0.00172 TCTTA 0.00104 TCTTC 0.00104 TCTTG 0.000993 TCTTT 0.00209 TGAAA 0.00252 TGAAC 0.00131 TGAAG 0.00131 TGAAT 0.00215 TGACA 0.0015 TGACC 0.000739 TGACG 0.000407 TGACT 0.00116 TGAGA 0.00106 TGAGC 0.00082 TGAGG 0.000774 TGAGT 0.00112 TGATA 0.00117 TGATC 0.000853 TGATG 0.00142 TGATT 0.00192 TGCAA 0.0015 TGCAC 0.00101 TGCAG 0.00138 TGCAT 0.00169 TGCCA 0.000876 TGCCC 0.000418 TGCCG 0.000244 TGCCT 0.000738 TGCGA 0.000315 TGCGC 0.000371 TGCGG 0.000271 TGCGT 0.0005 TGCTA 0.000893 TGCTC 0.00087 TGCTG 0.00153 TGCTT 0.00144 TGGAA 0.00118 TGGAC 0.000681 TGGAG 0.000926 TGGAT 0.00111 TGGCA 0.000876 TGGCC 0.000534 TGGCG 0.00035 TGGCT 0.000823 TGGGA 0.000696 TGGGC 0.000442 TGGGG 0.000553 TGGGT 0.000817 TGGTA 0.000681 TGGTC 0.000654 TGGTG 0.000934 TGGTT 0.00126 TGTAA 0.00215 TGTAC 0.00102 TGTAG 0.000975 TGTAT 0.002 TGTCA 0.0015 TGTCC 0.000736 TGTCG 0.000344 TGTCT 0.00137 TGTGA 0.00159 TGTGC 0.00113 TGTGG 0.00113 TGTGT 0.0035 TGTTA 0.00169 TGTTC 0.00127 TGTTG 0.0017 TGTTT 0.00381 TTAAA 0.00452 TTAAC 0.00147 TTAAG 0.00139 TTAAT 0.00317 TTACA 0.00215 TTACC 0.000746 TTACG 0.000349 TTACT 0.00148 TTAGA 0.00117 TTAGC 0.000946 TTAGG 0.000754 TTAGT 0.00132 TTATA 0.00237 TTATC 0.00107 TTATG 0.00153 TTATT 0.00458 TTCAA 0.00195 TTCAC 0.00137 TTCAG 0.00169 TTCAT 0.00228 TTCCA 0.00118 TTCCC 0.000737 TTCCG 0.000272 TTCCT 0.00112 TTCGA 0.000325 TTCGC 0.000274 TTCGG 0.000272 TTCGT 0.000364 TTCTA 0.00112 TTCTC 0.00113 TTCTG 0.0017 TTCTT 0.00191 TTGAA 0.00195 TTGAC 0.00109 TTGAG 0.00111 TTGAT 0.00158 TTGCA 0.0015 TTGCC 0.000657 TTGCG 0.000363 TTGCT 0.00133 TTGGA 0.00104 TTGGC 0.000809 TTGGG 0.000743 TTGGT 0.00107 TTGTA 0.0017 TTGTC 0.0011 TTGTG 0.00167 TTGTT 0.00273 TTTAA 0.00452 TTTAC 0.00211 TTTAG 0.00182 TTTAT 0.00421 TTTCA 0.00252 TTTCC 0.00145 TTTCG 0.000435 TTTCT 0.00255 TTTGA 0.00232 TTTGC 0.00156 TTTGG 0.00152 TTTGT 0.00297 TTTTA 0.00478 TTTTC 0.00263 TTTTG 0.00309 TTTTT 0.00751 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3514 AAAAC 0.1594 AAAAG 0.1316 AAAAT 0.245 AAACA 0.4387 AAACC 0.1659 AAACG 0.09351 AAACT 0.262 AAAGA 0.3111 AAAGC 0.2056 AAAGG 0.1748 AAAGT 0.3017 AAATA 0.3494 AAATC 0.1345 AAATG 0.2296 AAATT 0.224 AACAA 0.301 AACAC 0.1987 AACAG 0.1927 AACAT 0.2536 AACCA 0.3875 AACCC 0.2344 AACCG 0.1106 AACCT 0.286 AACGA 0.2494 AACGC 0.2435 AACGG 0.1848 AACGT 0.327 AACTA 0.2391 AACTC 0.1788 AACTG 0.2712 AACTT 0.275 AAGAA 0.3626 AAGAC 0.1937 AAGAG 0.2112 AAGAT 0.2472 AAGCA 0.3832 AAGCC 0.1919 AAGCG 0.1085 AAGCT 0.3182 AAGGA 0.2841 AAGGC 0.2086 AAGGG 0.2322 AAGGT 0.2658 AAGTA 0.245 AAGTC 0.1895 AAGTG 0.2595 AAGTT 0.2938 AATAA 0.3855 AATAC 0.1305 AATAG 0.1132 AATAT 0.3043 AATCA 0.3905 AATCC 0.1725 AATCG 0.08766 AATCT 0.3022 AATGA 0.3102 AATGC 0.1731 AATGG 0.1365 AATGT 0.334 AATTA 0.2987 AATTC 0.1371 AATTG 0.1729 AATTT 0.3124 ACAAA 0.3777 ACAAC 0.1684 ACAAG 0.1463 ACAAT 0.2458 ACACA 0.5175 ACACC 0.1364 ACACG 0.07331 ACACT 0.2516 ACAGA 0.3009 ACAGC 0.2243 ACAGG 0.1469 ACAGT 0.2988 ACATA 0.2295 ACATC 0.1606 ACATG 0.208 ACATT 0.3426 ACCAA 0.3011 ACCAC 0.2276 ACCAG 0.22 ACCAT 0.2716 ACCCA 0.3982 ACCCC 0.2443 ACCCG 0.09292 ACCCT 0.2922 ACCGA 0.2593 ACCGC 0.2608 ACCGG 0.2386 ACCGT 0.2755 ACCTA 0.2143 ACCTC 0.222 ACCTG 0.2918 ACCTT 0.3207 ACGAA 0.2977 ACGAC 0.2001 ACGAG 0.2456 ACGAT 0.2704 ACGCA 0.4185 ACGCC 0.189 ACGCG 0.1453 ACGCT 0.2926 ACGGA 0.2931 ACGGC 0.2602 ACGGG 0.1891 ACGGT 0.3032 ACGTA 0.1997 ACGTC 0.2247 ACGTG 0.2511 ACGTT 0.3508 ACTAA 0.3363 ACTAC 0.1816 ACTAG 0.16 ACTAT 0.2763 ACTCA 0.4112 ACTCC 0.1938 ACTCG 0.1055 ACTCT 0.3123 ACTGA 0.2964 ACTGC 0.203 ACTGG 0.1573 ACTGT 0.3231 ACTTA 0.2166 ACTTC 0.1692 ACTTG 0.1834 ACTTT 0.3837 AGAAA 0.408 AGAAC 0.1518 AGAAG 0.1894 AGAAT 0.2209 AGACA 0.4271 AGACC 0.1771 AGACG 0.1153 AGACT 0.2878 AGAGA 0.3745 AGAGC 0.2329 AGAGG 0.2137 AGAGT 0.2476 AGATA 0.2722 AGATC 0.1674 AGATG 0.2628 AGATT 0.3102 AGCAA 0.2738 AGCAC 0.1955 AGCAG 0.2835 AGCAT 0.2691 AGCCA 0.3721 AGCCC 0.2088 AGCCG 0.1394 AGCCT 0.3273 AGCGA 0.2815 AGCGC 0.2786 AGCGG 0.2416 AGCGT 0.2566 AGCTA 0.201 AGCTC 0.2152 AGCTG 0.3505 AGCTT 0.2977 AGGAA 0.3806 AGGAC 0.1829 AGGAG 0.2643 AGGAT 0.2311 AGGCA 0.3675 AGGCC 0.2023 AGGCG 0.1175 AGGCT 0.3546 AGGGA 0.308 AGGGC 0.2202 AGGGG 0.2419 AGGGT 0.2707 AGGTA 0.2079 AGGTC 0.1827 AGGTG 0.2768 AGGTT 0.3247 AGTAA 0.3628 AGTAC 0.1618 AGTAG 0.1785 AGTAT 0.2908 AGTCA 0.4302 AGTCC 0.2052 AGTCG 0.08985 AGTCT 0.3391 AGTGA 0.2835 AGTGC 0.1924 AGTGG 0.1882 AGTGT 0.3714 AGTTA 0.2225 AGTTC 0.1571 AGTTG 0.187 AGTTT 0.422 ATAAA 0.4101 ATAAC 0.128 ATAAG 0.1138 ATAAT 0.2926 ATACA 0.4629 ATACC 0.123 ATACG 0.06802 ATACT 0.2797 ATAGA 0.3583 ATAGC 0.1795 ATAGG 0.1461 ATAGT 0.3098 ATATA 0.3996 ATATC 0.0886 ATATG 0.1219 ATATT 0.2722 ATCAA 0.2806 ATCAC 0.178 ATCAG 0.2381 ATCAT 0.3011 ATCCA 0.4545 ATCCC 0.1926 ATCCG 0.106 ATCCT 0.284 ATCGA 0.2858 ATCGC 0.2476 ATCGG 0.1886 ATCGT 0.297 ATCTA 0.2675 ATCTC 0.1836 ATCTG 0.2912 ATCTT 0.2782 ATGAA 0.3798 ATGAC 0.1852 ATGAG 0.1881 ATGAT 0.2634 ATGCA 0.4094 ATGCC 0.1617 ATGCG 0.0938 ATGCT 0.313 ATGGA 0.3114 ATGGC 0.1975 ATGGG 0.1843 ATGGT 0.2907 ATGTA 0.2525 ATGTC 0.1545 ATGTG 0.2354 ATGTT 0.3166 ATTAA 0.319 ATTAC 0.1379 ATTAG 0.1431 ATTAT 0.3015 ATTCA 0.4357 ATTCC 0.1506 ATTCG 0.0718 ATTCT 0.2856 ATTGA 0.2844 ATTGC 0.1703 ATTGG 0.1666 ATTGT 0.3504 ATTTA 0.2697 ATTTC 0.1313 ATTTG 0.1601 ATTTT 0.3335 CAAAA 0.3353 CAAAC 0.2006 CAAAG 0.1529 CAAAT 0.2521 CAACA 0.4328 CAACC 0.1898 CAACG 0.07362 CAACT 0.275 CAAGA 0.3096 CAAGC 0.2168 CAAGG 0.1619 CAAGT 0.3001 CAATA 0.2923 CAATC 0.1609 CAATG 0.2169 CAATT 0.2845 CACAA 0.2268 CACAC 0.342 CACAG 0.1963 CACAT 0.2295 CACCA 0.3992 CACCC 0.232 CACCG 0.1151 CACCT 0.3254 CACGA 0.2338 CACGC 0.2803 CACGG 0.1948 CACGT 0.329 CACTA 0.201 CACTC 0.1841 CACTG 0.3184 CACTT 0.3122 CAGAA 0.317 CAGAC 0.2036 CAGAG 0.2376 CAGAT 0.2517 CAGCA 0.4146 CAGCC 0.1994 CAGCG 0.1288 CAGCT 0.3192 CAGGA 0.326 CAGGC 0.2088 CAGGG 0.2218 CAGGT 0.2879 CAGTA 0.2497 CAGTC 0.1869 CAGTG 0.2887 CAGTT 0.3082 CATAA 0.3224 CATAC 0.1923 CATAG 0.1325 CATAT 0.319 CATCA 0.4206 CATCC 0.2247 CATCG 0.07658 CATCT 0.3472 CATGA 0.2829 CATGC 0.2177 CATGG 0.1579 CATGT 0.3384 CATTA 0.2206 CATTC 0.1688 CATTG 0.1528 CATTT 0.3859 CCAAA 0.4293 CCAAC 0.2029 CCAAG 0.1389 CCAAT 0.2453 CCACA 0.4457 CCACC 0.2224 CCACG 0.08786 CCACT 0.3013 CCAGA 0.3013 CCAGC 0.2924 CCAGG 0.1795 CCAGT 0.2901 CCATA 0.2332 CCATC 0.2353 CCATG 0.2123 CCATT 0.3377 CCCAA 0.3091 CCCAC 0.2288 CCCAG 0.2447 CCCAT 0.2583 CCCCA 0.3385 CCCCC 0.2972 CCCCG 0.09906 CCCCT 0.3165 CCCGA 0.2511 CCCGC 0.2767 CCCGG 0.2755 CCCGT 0.2644 CCCTA 0.1956 CCCTC 0.2412 CCCTG 0.2812 CCCTT 0.3263 CCGAA 0.3283 CCGAC 0.2093 CCGAG 0.2569 CCGAT 0.2602 CCGCA 0.3047 CCGCC 0.2673 CCGCG 0.1385 CCGCT 0.3587 CCGGA 0.2962 CCGGC 0.2232 CCGGG 0.2249 CCGGT 0.3092 CCGTA 0.1986 CCGTC 0.2425 CCGTG 0.2648 CCGTT 0.3479 CCTAA 0.3829 CCTAC 0.2075 CCTAG 0.1506 CCTAT 0.2672 CCTCA 0.362 CCTCC 0.307 CCTCG 0.09964 CCTCT 0.3553 CCTGA 0.3067 CCTGC 0.2671 CCTGG 0.1898 CCTGT 0.3225 CCTTA 0.2011 CCTTC 0.232 CCTTG 0.1721 CCTTT 0.4123 CGAAA 0.3613 CGAAC 0.2035 CGAAG 0.1749 CGAAT 0.2738 CGACA 0.4006 CGACC 0.2307 CGACG 0.1312 CGACT 0.2852 CGAGA 0.2969 CGAGC 0.2523 CGAGG 0.2217 CGAGT 0.2878 CGATA 0.2331 CGATC 0.1888 CGATG 0.2454 CGATT 0.3509 CGCAA 0.2641 CGCAC 0.2397 CGCAG 0.2827 CGCAT 0.2604 CGCCA 0.3996 CGCCC 0.217 CGCCG 0.163 CGCCT 0.2703 CGCGA 0.232 CGCGC 0.3534 CGCGG 0.1897 CGCGT 0.2656 CGCTA 0.1779 CGCTC 0.2436 CGCTG 0.3647 CGCTT 0.2824 CGGAA 0.2786 CGGAC 0.1889 CGGAG 0.2886 CGGAT 0.278 CGGCA 0.3029 CGGCC 0.2289 CGGCG 0.1747 CGGCT 0.3685 CGGGA 0.3179 CGGGC 0.203 CGGGG 0.2483 CGGGT 0.2863 CGGTA 0.1969 CGGTC 0.1972 CGGTG 0.2855 CGGTT 0.3669 CGTAA 0.3564 CGTAC 0.2061 CGTAG 0.1728 CGTAT 0.2776 CGTCA 0.4003 CGTCC 0.2088 CGTCG 0.1117 CGTCT 0.3446 CGTGA 0.2812 CGTGC 0.2153 CGTGG 0.1807 CGTGT 0.3625 CGTTA 0.2255 CGTTC 0.1806 CGTTG 0.1625 CGTTT 0.4438 CTAAA 0.4276 CTAAC 0.1412 CTAAG 0.1158 CTAAT 0.2924 CTACA 0.4418 CTACC 0.1628 CTACG 0.08095 CTACT 0.2943 CTAGA 0.3172 CTAGC 0.2015 CTAGG 0.1613 CTAGT 0.3263 CTATA 0.2744 CTATC 0.1958 CTATG 0.1668 CTATT 0.3185 CTCAA 0.2917 CTCAC 0.219 CTCAG 0.241 CTCAT 0.2969 CTCCA 0.45 CTCCC 0.2103 CTCCG 0.1246 CTCCT 0.3606 CTCGA 0.2722 CTCGC 0.2712 CTCGG 0.2192 CTCGT 0.2959 CTCTA 0.1844 CTCTC 0.2775 CTCTG 0.3178 CTCTT 0.2957 CTGAA 0.395 CTGAC 0.1948 CTGAG 0.1995 CTGAT 0.2852 CTGCA 0.392 CTGCC 0.1776 CTGCG 0.1128 CTGCT 0.3721 CTGGA 0.3759 CTGGC 0.1898 CTGGG 0.2238 CTGGT 0.2832 CTGTA 0.2654 CTGTC 0.1792 CTGTG 0.2643 CTGTT 0.3089 CTTAA 0.3855 CTTAC 0.1689 CTTAG 0.135 CTTAT 0.2828 CTTCA 0.4268 CTTCC 0.2175 CTTCG 0.06896 CTTCT 0.345 CTTGA 0.3166 CTTGC 0.2027 CTTGG 0.1556 CTTGT 0.3608 CTTTA 0.2688 CTTTC 0.1687 CTTTG 0.1815 CTTTT 0.3386 GAAAA 0.3613 GAAAC 0.1875 GAAAG 0.1636 GAAAT 0.2551 GAACA 0.4304 GAACC 0.1793 GAACG 0.1034 GAACT 0.2919 GAAGA 0.3541 GAAGC 0.2073 GAAGG 0.2156 GAAGT 0.2791 GAATA 0.2717 GAATC 0.1419 GAATG 0.2728 GAATT 0.2808 GACAA 0.2751 GACAC 0.1958 GACAG 0.2512 GACAT 0.2728 GACCA 0.3845 GACCC 0.2218 GACCG 0.1142 GACCT 0.3246 GACGA 0.2419 GACGC 0.2522 GACGG 0.211 GACGT 0.3543 GACTA 0.2071 GACTC 0.1707 GACTG 0.3045 GACTT 0.3262 GAGAA 0.3568 GAGAC 0.163 GAGAG 0.2944 GAGAT 0.258 GAGCA 0.4078 GAGCC 0.1877 GAGCG 0.1417 GAGCT 0.3838 GAGGA 0.4111 GAGGC 0.2224 GAGGG 0.2341 GAGGT 0.2536 GAGTA 0.2231 GAGTC 0.1863 GAGTG 0.2819 GAGTT 0.3551 GATAA 0.3376 GATAC 0.1336 GATAG 0.2147 GATAT 0.3046 GATCA 0.4179 GATCC 0.195 GATCG 0.09956 GATCT 0.3554 GATGA 0.3272 GATGC 0.209 GATGG 0.2053 GATGT 0.3163 GATTA 0.2366 GATTC 0.1408 GATTG 0.1903 GATTT 0.3983 GCAAA 0.3976 GCAAC 0.1842 GCAAG 0.1605 GCAAT 0.2231 GCACA 0.432 GCACC 0.1857 GCACG 0.1046 GCACT 0.2972 GCAGA 0.3164 GCAGC 0.2729 GCAGG 0.2025 GCAGT 0.2922 GCATA 0.2195 GCATC 0.1859 GCATG 0.2606 GCATT 0.3337 GCCAA 0.3214 GCCAC 0.2323 GCCAG 0.2166 GCCAT 0.2768 GCCCA 0.3473 GCCCC 0.2312 GCCCG 0.1068 GCCCT 0.375 GCCGA 0.2992 GCCGC 0.2694 GCCGG 0.2138 GCCGT 0.2895 GCCTA 0.2305 GCCTC 0.2252 GCCTG 0.281 GCCTT 0.3039 GCGAA 0.2563 GCGAC 0.2633 GCGAG 0.2539 GCGAT 0.2611 GCGCA 0.3292 GCGCC 0.189 GCGCG 0.2019 GCGCT 0.3354 GCGGA 0.3096 GCGGC 0.2534 GCGGG 0.2075 GCGGT 0.2959 GCGTA 0.1957 GCGTC 0.214 GCGTG 0.2893 GCGTT 0.3287 GCTAA 0.3894 GCTAC 0.1807 GCTAG 0.1563 GCTAT 0.263 GCTCA 0.3769 GCTCC 0.2343 GCTCG 0.112 GCTCT 0.3787 GCTGA 0.2807 GCTGC 0.231 GCTGG 0.2187 GCTGT 0.3422 GCTTA 0.2159 GCTTC 0.1837 GCTTG 0.208 GCTTT 0.4172 GGAAA 0.4189 GGAAC 0.149 GGAAG 0.1996 GGAAT 0.2166 GGACA 0.4331 GGACC 0.1629 GGACG 0.1244 GGACT 0.3009 GGAGA 0.3556 GGAGC 0.2369 GGAGG 0.2823 GGAGT 0.2334 GGATA 0.2306 GGATC 0.1584 GGATG 0.3197 GGATT 0.2959 GGCAA 0.2846 GGCAC 0.1845 GGCAG 0.2858 GGCAT 0.2897 GGCCA 0.4134 GGCCC 0.2104 GGCCG 0.1421 GGCCT 0.3098 GGCGA 0.2821 GGCGC 0.2401 GGCGG 0.263 GGCGT 0.2599 GGCTA 0.2243 GGCTC 0.1926 GGCTG 0.3237 GGCTT 0.2946 GGGAA 0.3758 GGGAC 0.1785 GGGAG 0.2404 GGGAT 0.2408 GGGCA 0.3367 GGGCC 0.2188 GGGCG 0.1461 GGGCT 0.3633 GGGGA 0.278 GGGGC 0.173 GGGGG 0.2944 GGGGT 0.2854 GGGTA 0.1891 GGGTC 0.1851 GGGTG 0.2926 GGGTT 0.3681 GGTAA 0.3453 GGTAC 0.1771 GGTAG 0.1769 GGTAT 0.2548 GGTCA 0.4584 GGTCC 0.165 GGTCG 0.1165 GGTCT 0.3054 GGTGA 0.2842 GGTGC 0.198 GGTGG 0.2466 GGTGT 0.3523 GGTTA 0.2165 GGTTC 0.1567 GGTTG 0.2187 GGTTT 0.4247 GTAAA 0.4305 GTAAC 0.1413 GTAAG 0.1156 GTAAT 0.2593 GTACA 0.4612 GTACC 0.148 GTACG 0.09433 GTACT 0.2956 GTAGA 0.2867 GTAGC 0.2072 GTAGG 0.1952 GTAGT 0.3258 GTATA 0.2855 GTATC 0.1159 GTATG 0.2272 GTATT 0.3561 GTCAA 0.2942 GTCAC 0.1978 GTCAG 0.2472 GTCAT 0.2878 GTCCA 0.4056 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1062 GTCCT 0.3485 GTCGA 0.2416 GTCGC 0.3163 GTCGG 0.2015 GTCGT 0.2809 GTCTA 0.2003 GTCTC 0.1927 GTCTG 0.3289 GTCTT 0.3195 GTGAA 0.3613 GTGAC 0.1982 GTGAG 0.2006 GTGAT 0.2537 GTGCA 0.3781 GTGCC 0.1623 GTGCG 0.1289 GTGCT 0.3664 GTGGA 0.3337 GTGGC 0.2255 GTGGG 0.2136 GTGGT 0.3053 GTGTA 0.1948 GTGTC 0.1384 GTGTG 0.4233 GTGTT 0.2952 GTTAA 0.359 GTTAC 0.1673 GTTAG 0.1459 GTTAT 0.3044 GTTCA 0.453 GTTCC 0.1669 GTTCG 0.08696 GTTCT 0.3225 GTTGA 0.2722 GTTGC 0.2001 GTTGG 0.197 GTTGT 0.3327 GTTTA 0.2477 GTTTC 0.1596 GTTTG 0.215 GTTTT 0.348 TAAAA 0.3558 TAAAC 0.1541 TAAAG 0.1538 TAAAT 0.2921 TAACA 0.397 TAACC 0.1743 TAACG 0.09326 TAACT 0.3022 TAAGA 0.2864 TAAGC 0.2169 TAAGG 0.1767 TAAGT 0.2782 TAATA 0.3195 TAATC 0.1225 TAATG 0.1863 TAATT 0.2831 TACAA 0.2681 TACAC 0.1842 TACAG 0.2026 TACAT 0.2756 TACCA 0.3594 TACCC 0.2006 TACCG 0.1077 TACCT 0.3397 TACGA 0.2524 TACGC 0.2349 TACGG 0.195 TACGT 0.3416 TACTA 0.2141 TACTC 0.1458 TACTG 0.2751 TACTT 0.3112 TAGAA 0.3049 TAGAC 0.1729 TAGAG 0.1876 TAGAT 0.3311 TAGCA 0.3722 TAGCC 0.2155 TAGCG 0.09783 TAGCT 0.3173 TAGGA 0.2645 TAGGC 0.231 TAGGG 0.2089 TAGGT 0.2864 TAGTA 0.2419 TAGTC 0.1601 TAGTG 0.233 TAGTT 0.3604 TATAA 0.2305 TATAC 0.1027 TATAG 0.09697 TATAT 0.4517 TATCA 0.3527 TATCC 0.1778 TATCG 0.07828 TATCT 0.3649 TATGA 0.2838 TATGC 0.1804 TATGG 0.1579 TATGT 0.3246 TATTA 0.2512 TATTC 0.1122 TATTG 0.1402 TATTT 0.3903 TCAAA 0.3716 TCAAC 0.1657 TCAAG 0.1611 TCAAT 0.2534 TCACA 0.3993 TCACC 0.1948 TCACG 0.0919 TCACT 0.3234 TCAGA 0.3003 TCAGC 0.2375 TCAGG 0.1755 TCAGT 0.3455 TCATA 0.2153 TCATC 0.1928 TCATG 0.1924 TCATT 0.3842 TCCAA 0.2764 TCCAC 0.2161 TCCAG 0.2787 TCCAT 0.2756 TCCCA 0.3664 TCCCC 0.2477 TCCCG 0.1098 TCCCT 0.3279 TCCGA 0.2229 TCCGC 0.2973 TCCGG 0.2492 TCCGT 0.2892 TCCTA 0.1757 TCCTC 0.3003 TCCTG 0.3111 TCCTT 0.3177 TCGAA 0.2972 TCGAC 0.1978 TCGAG 0.248 TCGAT 0.2897 TCGCA 0.3018 TCGCC 0.2343 TCGCG 0.1456 TCGCT 0.361 TCGGA 0.245 TCGGC 0.2895 TCGGG 0.1958 TCGGT 0.3129 TCGTA 0.2097 TCGTC 0.2124 TCGTG 0.2467 TCGTT 0.361 TCTAA 0.3174 TCTAC 0.1683 TCTAG 0.1516 TCTAT 0.3364 TCTCA 0.3267 TCTCC 0.2448 TCTCG 0.08505 TCTCT 0.4038 TCTGA 0.3025 TCTGC 0.2202 TCTGG 0.1794 TCTGT 0.361 TCTTA 0.1972 TCTTC 0.2185 TCTTG 0.1962 TCTTT 0.3895 TGAAA 0.3513 TGAAC 0.1735 TGAAG 0.1968 TGAAT 0.2876 TGACA 0.3783 TGACC 0.1996 TGACG 0.1093 TGACT 0.3094 TGAGA 0.3049 TGAGC 0.2386 TGAGG 0.2252 TGAGT 0.3074 TGATA 0.2143 TGATC 0.1607 TGATG 0.2921 TGATT 0.3448 TGCAA 0.2438 TGCAC 0.1771 TGCAG 0.2456 TGCAT 0.2964 TGCCA 0.4135 TGCCC 0.1914 TGCCG 0.1074 TGCCT 0.3331 TGCGA 0.2229 TGCGC 0.2668 TGCGG 0.2002 TGCGT 0.3513 TGCTA 0.1864 TGCTC 0.1966 TGCTG 0.3376 TGCTT 0.3082 TGGAA 0.2905 TGGAC 0.1789 TGGAG 0.2577 TGGAT 0.2854 TGGCA 0.3428 TGGCC 0.2228 TGGCG 0.1344 TGGCT 0.3217 TGGGA 0.2848 TGGGC 0.1844 TGGGG 0.2259 TGGGT 0.3263 TGGTA 0.1889 TGGTC 0.1948 TGGTG 0.2865 TGGTT 0.3678 TGTAA 0.3264 TGTAC 0.1599 TGTAG 0.1615 TGTAT 0.3193 TGTCA 0.3649 TGTCC 0.1993 TGTCG 0.08565 TGTCT 0.3517 TGTGA 0.225 TGTGC 0.1622 TGTGG 0.1632 TGTGT 0.4809 TGTTA 0.1965 TGTTC 0.1552 TGTTG 0.2015 TGTTT 0.4101 TTAAA 0.4199 TTAAC 0.1323 TTAAG 0.1266 TTAAT 0.2601 TTACA 0.3945 TTACC 0.1564 TTACG 0.07268 TTACT 0.2944 TTAGA 0.2758 TTAGC 0.2254 TTAGG 0.1748 TTAGT 0.3086 TTATA 0.2328 TTATC 0.1033 TTATG 0.1483 TTATT 0.3982 TTCAA 0.2493 TTCAC 0.1836 TTCAG 0.231 TTCAT 0.2962 TTCCA 0.3522 TTCCC 0.2338 TTCCG 0.08482 TTCCT 0.3429 TTCGA 0.2757 TTCGC 0.228 TTCGG 0.2247 TTCGT 0.3056 TTCTA 0.1812 TTCTC 0.1982 TTCTG 0.2903 TTCTT 0.328 TTGAA 0.3406 TTGAC 0.1835 TTGAG 0.2103 TTGAT 0.2728 TTGCA 0.3662 TTGCC 0.1681 TTGCG 0.09583 TTGCT 0.3454 TTGGA 0.2629 TTGGC 0.225 TTGGG 0.2006 TTGGT 0.2964 TTGTA 0.2269 TTGTC 0.145 TTGTG 0.2383 TTGTT 0.3617 TTTAA 0.332 TTTAC 0.1497 TTTAG 0.1368 TTTAT 0.2895 TTTCA 0.3246 TTTCC 0.2112 TTTCG 0.06373 TTTCT 0.3425 TTTGA 0.2728 TTTGC 0.1813 TTTGG 0.1757 TTTGT 0.328 TTTTA 0.2247 TTTTC 0.1337 TTTTG 0.159 TTTTT 0.3724