[1] # (a,c,g,t)= (0.306, 0.194, 0.194, 0.306) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.278 C 0.222 G 0.222 T 0.278 # l= 1 # Values AA 0.0799 AC 0.0648 AG 0.0612 AT 0.0724 CA 0.0715 CC 0.0494 CG 0.0396 CT 0.0613 GA 0.064 GC 0.0436 GG 0.0493 GT 0.0647 TA 0.0629 TC 0.0641 TG 0.0714 TT 0.0799 # l= 2 # Values AAA 0.0268 AAC 0.0168 AAG 0.0165 AAT 0.0198 ACA 0.0221 ACC 0.0141 ACG 0.0111 ACT 0.0175 AGA 0.0193 AGC 0.0128 AGG 0.0117 AGT 0.0175 ATA 0.0193 ATC 0.0158 ATG 0.0175 ATT 0.0198 CAA 0.0211 CAC 0.0166 CAG 0.0163 CAT 0.0175 CCA 0.0172 CCC 0.0116 CCG 0.00887 CCT 0.0117 CGA 0.0118 CGC 0.00778 CGG 0.00886 CGT 0.0111 CTA 0.0121 CTC 0.0164 CTG 0.0163 CTT 0.0165 GAA 0.0177 GAC 0.0142 GAG 0.0164 GAT 0.0158 GCA 0.0133 GCC 0.00976 GCG 0.00777 GCT 0.0128 GGA 0.0139 GGC 0.00975 GGG 0.0116 GGT 0.014 GTA 0.0171 GTC 0.0142 GTG 0.0166 GTT 0.0168 TAA 0.0144 TAC 0.0171 TAG 0.0121 TAT 0.0193 TCA 0.0189 TCC 0.014 TCG 0.0119 TCT 0.0194 TGA 0.0189 TGC 0.0133 TGG 0.0172 TGT 0.0221 TTA 0.0144 TTC 0.0177 TTG 0.0211 TTT 0.0268 # l= 3 # Values AAAA 0.0104 AAAC 0.00526 AAAG 0.00479 AAAT 0.00634 AACA 0.0057 AACC 0.00391 AACG 0.00283 AACT 0.0044 AAGA 0.00521 AAGC 0.00318 AAGG 0.00321 AAGT 0.00487 AATA 0.00576 AATC 0.00411 AATG 0.00492 AATT 0.005 ACAA 0.00669 ACAC 0.00484 ACAG 0.00524 ACAT 0.00532 ACCA 0.00497 ACCC 0.00327 ACCG 0.00255 ACCT 0.00326 ACGA 0.00352 ACGC 0.00203 ACGG 0.00249 ACGT 0.00305 ACTA 0.00358 ACTC 0.0043 ACTG 0.00472 ACTT 0.00487 AGAA 0.00536 AGAC 0.0044 AGAG 0.00486 AGAT 0.00472 AGCA 0.00386 AGCC 0.00298 AGCG 0.00216 AGCT 0.00377 AGGA 0.00334 AGGC 0.00218 AGGG 0.0029 AGGT 0.00326 AGTA 0.00509 AGTC 0.00373 AGTG 0.00426 AGTT 0.0044 ATAA 0.00487 ATAC 0.00472 ATAG 0.00326 ATAT 0.00644 ATCA 0.00505 ATCC 0.00308 ATCG 0.00294 ATCT 0.00472 ATGA 0.00487 ATGC 0.00311 ATGG 0.00421 ATGT 0.00531 ATTA 0.00437 ATTC 0.00406 ATTG 0.00503 ATTT 0.00634 CAAA 0.00596 CAAC 0.00505 CAAG 0.00503 CAAT 0.00503 CACA 0.00524 CACC 0.00412 CACG 0.00295 CACT 0.00426 CAGA 0.00488 CAGC 0.00368 CAGG 0.00297 CAGT 0.00472 CATA 0.00398 CATC 0.00422 CATG 0.00438 CATT 0.00493 CCAA 0.00503 CCAC 0.00424 CCAG 0.00371 CCAT 0.00421 CCCA 0.00371 CCCC 0.00319 CCCG 0.00184 CCCT 0.0029 CCGA 0.00264 CCGC 0.00194 CCGG 0.0018 CCGT 0.00249 CCTA 0.00211 CCTC 0.00339 CCTG 0.00297 CCTT 0.00321 CGAA 0.00296 CGAC 0.00287 CGAG 0.00307 CGAT 0.00294 CGCA 0.0022 CGCC 0.00207 CGCG 0.00134 CGCT 0.00216 CGGA 0.00246 CGGC 0.00202 CGGG 0.00184 CGGT 0.00255 CGTA 0.0025 CGTC 0.00281 CGTG 0.00295 CGTT 0.00283 CTAA 0.00289 CTAC 0.00385 CTAG 0.00212 CTAT 0.00326 CTCA 0.00439 CTCC 0.00406 CTCG 0.00307 CTCT 0.00486 CTGA 0.00408 CTGC 0.00324 CTGG 0.00371 CTGT 0.00524 CTTA 0.00245 CTTC 0.00419 CTTG 0.00503 CTTT 0.00479 GAAA 0.00585 GAAC 0.00356 GAAG 0.00419 GAAT 0.00406 GACA 0.00478 GACC 0.00291 GACG 0.00281 GACT 0.00373 GAGA 0.00547 GAGC 0.00324 GAGG 0.00339 GAGT 0.0043 GATA 0.0043 GATC 0.00316 GATG 0.00422 GATT 0.00411 GCAA 0.00376 GCAC 0.00316 GCAG 0.00323 GCAT 0.00311 GCCA 0.0034 GCCC 0.00216 GCCG 0.00202 GCCT 0.00218 GCGA 0.0023 GCGC 0.00151 GCGG 0.00194 GCGT 0.00203 GCTA 0.00267 GCTC 0.00324 GCTG 0.00368 GCTT 0.00318 GGAA 0.00404 GGAC 0.00277 GGAG 0.00406 GGAT 0.00308 GGCA 0.00276 GGCC 0.00194 GGCG 0.00207 GGCT 0.00298 GGGA 0.00303 GGGC 0.00216 GGGG 0.00319 GGGT 0.00326 GGTA 0.00312 GGTC 0.00291 GGTG 0.00412 GGTT 0.0039 GTAA 0.00335 GTAC 0.00516 GTAG 0.00384 GTAT 0.00472 GTCA 0.00418 GTCC 0.00278 GTCG 0.00287 GTCT 0.0044 GTGA 0.00435 GTGC 0.00316 GTGG 0.00423 GTGT 0.00483 GTTA 0.00296 GTTC 0.00356 GTTG 0.00505 GTTT 0.00526 TAAA 0.00459 TAAC 0.00296 TAAG 0.00245 TAAT 0.00437 TACA 0.00637 TACC 0.00312 TACG 0.0025 TACT 0.00509 TAGA 0.00378 TAGC 0.00267 TAGG 0.00211 TAGT 0.00358 TATA 0.00526 TATC 0.0043 TATG 0.00398 TATT 0.00576 TCAA 0.00559 TCAC 0.00436 TCAG 0.00407 TCAT 0.00488 TCCA 0.00512 TCCC 0.00304 TCCG 0.00246 TCCT 0.00334 TCGA 0.00339 TCGC 0.0023 TCGG 0.00264 TCGT 0.00352 TCTA 0.00378 TCTC 0.00548 TCTG 0.00488 TCTT 0.00521 TGAA 0.00528 TGAC 0.00418 TGAG 0.00439 TGAT 0.00505 TGCA 0.00444 TGCC 0.00276 TGCG 0.0022 TGCT 0.00386 TGGA 0.00512 TGGC 0.0034 TGGG 0.0037 TGGT 0.00497 TGTA 0.00637 TGTC 0.00479 TGTG 0.00523 TGTT 0.0057 TTAA 0.00325 TTAC 0.00336 TTAG 0.00289 TTAT 0.00487 TTCA 0.00529 TTCC 0.00405 TTCG 0.00297 TTCT 0.00537 TTGA 0.00559 TTGC 0.00376 TTGG 0.00503 TTGT 0.00669 TTTA 0.00459 TTTC 0.00586 TTTG 0.00595 TTTT 0.0104 # l= 4 # Values AAAAA 0.00456 AAAAC 0.00175 AAAAG 0.00187 AAAAT 0.00226 AAACA 0.00194 AAACC 0.00116 AAACG 0.000971 AAACT 0.00119 AAAGA 0.00164 AAAGC 0.000867 AAAGG 0.000945 AAAGT 0.00134 AAATA 0.00207 AAATC 0.00129 AAATG 0.00155 AAATT 0.00143 AACAA 0.0018 AACAC 0.00129 AACAG 0.00128 AACAT 0.00133 AACCA 0.00133 AACCC 0.000956 AACCG 0.00071 AACCT 0.000907 AACGA 0.000869 AACGC 0.000566 AACGG 0.000737 AACGT 0.00066 AACTA 0.00104 AACTC 0.00112 AACTG 0.00114 AACTT 0.00109 AAGAA 0.00153 AAGAC 0.00116 AAGAG 0.00139 AAGAT 0.00113 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000763 AAGCG 0.000583 AAGCT 0.000829 AAGGA 0.000923 AAGGC 0.000616 AAGGG 0.000831 AAGGT 0.000839 AAGTA 0.00158 AAGTC 0.000999 AAGTG 0.0012 AAGTT 0.00109 AATAA 0.00176 AATAC 0.00132 AATAG 0.000939 AATAT 0.00174 AATCA 0.00144 AATCC 0.00079 AATCG 0.000784 AATCT 0.0011 AATGA 0.00144 AATGC 0.000845 AATGG 0.00122 AATGT 0.00142 AATTA 0.0013 AATTC 0.000937 AATTG 0.00133 AATTT 0.00143 ACAAA 0.00176 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00197 ACAAT 0.00154 ACACA 0.00167 ACACC 0.00112 ACACG 0.000822 ACACT 0.00122 ACAGA 0.0014 ACAGC 0.00114 ACAGG 0.000921 ACAGT 0.00178 ACATA 0.00132 ACATC 0.00114 ACATG 0.00144 ACATT 0.00142 ACCAA 0.00145 ACCAC 0.00125 ACCAG 0.0011 ACCAT 0.00116 ACCCA 0.00101 ACCCC 0.000914 ACCCG 0.000515 ACCCT 0.000825 ACCGA 0.000734 ACCGC 0.000579 ACCGG 0.000543 ACCGT 0.000694 ACCTA 0.000587 ACCTC 0.000969 ACCTG 0.000865 ACCTT 0.000839 ACGAA 0.000771 ACGAC 0.000873 ACGAG 0.00105 ACGAT 0.000821 ACGCA 0.000575 ACGCC 0.000526 ACGCG 0.000391 ACGCT 0.000537 ACGGA 0.000665 ACGGC 0.000625 ACGGG 0.000508 ACGGT 0.000694 ACGTA 0.000586 ACGTC 0.00073 ACGTG 0.00108 ACGTT 0.00066 ACTAA 0.00098 ACTAC 0.00114 ACTAG 0.000583 ACTAT 0.000878 ACTCA 0.00115 ACTCC 0.00101 ACTCG 0.000923 ACTCT 0.00121 ACTGA 0.00104 ACTGC 0.000912 ACTGG 0.000991 ACTGT 0.00178 ACTTA 0.000647 ACTTC 0.00101 ACTTG 0.00187 ACTTT 0.00134 AGAAA 0.00174 AGAAC 0.00102 AGAAG 0.00141 AGAAT 0.0012 AGACA 0.00154 AGACC 0.000908 AGACG 0.0009 AGACT 0.00105 AGAGA 0.00167 AGAGC 0.00101 AGAGG 0.000967 AGAGT 0.00121 AGATA 0.00126 AGATC 0.000944 AGATG 0.00142 AGATT 0.0011 AGCAA 0.00112 AGCAC 0.000913 AGCAG 0.00103 AGCAT 0.000801 AGCCA 0.001 AGCCC 0.000688 AGCCG 0.000661 AGCCT 0.000626 AGCGA 0.00067 AGCGC 0.000421 AGCGG 0.000536 AGCGT 0.000537 AGCTA 0.000865 AGCTC 0.000978 AGCTG 0.0011 AGCTT 0.000829 AGGAA 0.000961 AGGAC 0.000655 AGGAG 0.00104 AGGAT 0.000684 AGGCA 0.000655 AGGCC 0.000419 AGGCG 0.00048 AGGCT 0.000626 AGGGA 0.000769 AGGGC 0.000551 AGGGG 0.000761 AGGGT 0.000825 AGGTA 0.000699 AGGTC 0.000655 AGGTG 0.001 AGGTT 0.000907 AGTAA 0.00108 AGTAC 0.00153 AGTAG 0.00114 AGTAT 0.00134 AGTCA 0.00112 AGTCC 0.000768 AGTCG 0.000789 AGTCT 0.00105 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.000852 AGTGG 0.0011 AGTGT 0.00122 AGTTA 0.000783 AGTTC 0.00091 AGTTG 0.00151 AGTTT 0.00119 ATAAA 0.00172 ATAAC 0.000921 ATAAG 0.000782 ATAAT 0.00145 ATACA 0.00169 ATACC 0.000942 ATACG 0.000749 ATACT 0.00134 ATAGA 0.00108 ATAGC 0.00074 ATAGG 0.000567 ATAGT 0.000878 ATATA 0.00213 ATATC 0.00139 ATATG 0.00118 ATATT 0.00174 ATCAA 0.00149 ATCAC 0.00121 ATCAG 0.00104 ATCAT 0.0013 ATCCA 0.00114 ATCCC 0.0007 ATCCG 0.000554 ATCCT 0.000684 ATCGA 0.000882 ATCGC 0.000599 ATCGG 0.000639 ATCGT 0.000821 ATCTA 0.000985 ATCTC 0.00137 ATCTG 0.00123 ATCTT 0.00113 ATGAA 0.00132 ATGAC 0.00111 ATGAG 0.00115 ATGAT 0.0013 ATGCA 0.00115 ATGCC 0.00064 ATGCG 0.00052 ATGCT 0.000801 ATGGA 0.00128 ATGGC 0.000895 ATGGG 0.000878 ATGGT 0.00116 ATGTA 0.00152 ATGTC 0.00119 ATGTG 0.00127 ATGTT 0.00133 ATTAA 0.00108 ATTAC 0.00102 ATTAG 0.000816 ATTAT 0.00145 ATTCA 0.00123 ATTCC 0.000925 ATTCG 0.000703 ATTCT 0.0012 ATTGA 0.00144 ATTGC 0.000898 ATTGG 0.00116 ATTGT 0.00154 ATTTA 0.0013 ATTTC 0.00139 ATTTG 0.00138 ATTTT 0.00226 CAAAA 0.00206 CAAAC 0.00139 CAAAG 0.00111 CAAAT 0.00138 CAACA 0.00163 CAACC 0.00117 CAACG 0.000739 CAACT 0.00151 CAAGA 0.00135 CAAGC 0.000922 CAAGG 0.000883 CAAGT 0.00187 CAATA 0.0014 CAATC 0.00106 CAATG 0.00124 CAATT 0.00133 CACAA 0.00149 CACAC 0.00133 CACAG 0.00114 CACAT 0.00127 CACCA 0.00154 CACCC 0.000905 CACCG 0.000668 CACCT 0.001 CACGA 0.000768 CACGC 0.000534 CACGG 0.000575 CACGT 0.00108 CACTA 0.000893 CACTC 0.00113 CACTG 0.00103 CACTT 0.0012 CAGAA 0.00141 CAGAC 0.00114 CAGAG 0.0011 CAGAT 0.00123 CAGCA 0.00116 CAGCC 0.00089 CAGCG 0.000533 CAGCT 0.0011 CAGGA 0.000836 CAGGC 0.000582 CAGGG 0.000689 CAGGT 0.000865 CAGTA 0.00158 CAGTC 0.00098 CAGTG 0.00103 CAGTT 0.00114 CATAA 0.000948 CATAC 0.00119 CATAG 0.000661 CATAT 0.00118 CATCA 0.00131 CATCC 0.000815 CATCG 0.000665 CATCT 0.00142 CATGA 0.00111 CATGC 0.000858 CATGG 0.00097 CATGT 0.00144 CATTA 0.00102 CATTC 0.00112 CATTG 0.00124 CATTT 0.00155 CCAAA 0.00155 CCAAC 0.00128 CCAAG 0.00105 CCAAT 0.00116 CCACA 0.00131 CCACC 0.00118 CCACG 0.000639 CCACT 0.0011 CCAGA 0.0012 CCAGC 0.000834 CCAGG 0.000686 CCAGT 0.000991 CCATA 0.000912 CCATC 0.0011 CCATG 0.00097 CCATT 0.00122 CCCAA 0.00111 CCCAC 0.00096 CCCAG 0.000753 CCCAT 0.000878 CCCCA 0.00106 CCCCC 0.000883 CCCCG 0.000486 CCCCT 0.000761 CCCGA 0.000537 CCCGC 0.000408 CCCGG 0.000386 CCCGT 0.000508 CCCTA 0.000561 CCCTC 0.000822 CCCTG 0.000689 CCCTT 0.000831 CCGAA 0.000736 CCGAC 0.000628 CCGAG 0.000638 CCGAT 0.000639 CCGCA 0.000543 CCGCC 0.000567 CCGCG 0.000291 CCGCT 0.000536 CCGGA 0.00049 CCGGC 0.000378 CCGGG 0.000386 CCGGT 0.000543 CCGTA 0.000545 CCGTC 0.000635 CCGTG 0.000575 CCGTT 0.000737 CCTAA 0.000515 CCTAC 0.000669 CCTAG 0.000356 CCTAT 0.000567 CCTCA 0.000846 CCTCC 0.00098 CCTCG 0.000593 CCTCT 0.000967 CCTGA 0.000748 CCTGC 0.000619 CCTGG 0.000686 CCTGT 0.000921 CCTTA 0.000497 CCTTC 0.000883 CCTTG 0.000883 CCTTT 0.000945 CGAAA 0.00103 CGAAC 0.000641 CGAAG 0.000591 CGAAT 0.000703 CGACA 0.000977 CGACC 0.000565 CGACG 0.000543 CGACT 0.000789 CGAGA 0.000953 CGAGC 0.000606 CGAGG 0.000593 CGAGT 0.000923 CGATA 0.000916 CGATC 0.000575 CGATG 0.000665 CGATT 0.000784 CGCAA 0.000625 CGCAC 0.000553 CGCAG 0.0005 CGCAT 0.00052 CGCCA 0.000724 CGCCC 0.00046 CGCCG 0.000405 CGCCT 0.00048 CGCGA 0.000368 CGCGC 0.00029 CGCGG 0.000291 CGCGT 0.000391 CGCTA 0.000468 CGCTC 0.000577 CGCTG 0.000533 CGCTT 0.000583 CGGAA 0.000744 CGGAC 0.000503 CGGAG 0.000662 CGGAT 0.000554 CGGCA 0.000556 CGGCC 0.000394 CGGCG 0.000405 CGGCT 0.000661 CGGGA 0.000483 CGGGC 0.000355 CGGGG 0.000486 CGGGT 0.000515 CGGTA 0.00064 CGGTC 0.000532 CGGTG 0.000668 CGGTT 0.00071 CGTAA 0.00049 CGTAC 0.000761 CGTAG 0.000498 CGTAT 0.000749 CGTCA 0.000827 CGTCC 0.000537 CGTCG 0.000543 CGTCT 0.0009 CGTGA 0.000915 CGTGC 0.000576 CGTGG 0.000639 CGTGT 0.000822 CGTTA 0.000509 CGTTC 0.000612 CGTTG 0.000739 CGTTT 0.000971 CTAAA 0.000894 CTAAC 0.000696 CTAAG 0.000485 CTAAT 0.000816 CTACA 0.00152 CTACC 0.000685 CTACG 0.000498 CTACT 0.00114 CTAGA 0.000721 CTAGC 0.000464 CTAGG 0.000356 CTAGT 0.000583 CTATA 0.000876 CTATC 0.000788 CTATG 0.000661 CTATT 0.000939 CTCAA 0.00131 CTCAC 0.001 CTCAG 0.000926 CTCAT 0.00115 CTCCA 0.00152 CTCCC 0.00084 CTCCG 0.000662 CTCCT 0.00104 CTCGA 0.00078 CTCGC 0.000602 CTCGG 0.000638 CTCGT 0.00105 CTCTA 0.000938 CTCTC 0.00143 CTCTG 0.0011 CTCTT 0.00139 CTGAA 0.00121 CTGAC 0.000894 CTGAG 0.000926 CTGAT 0.00104 CTGCA 0.00103 CTGCC 0.000683 CTGCG 0.0005 CTGCT 0.00103 CTGGA 0.00113 CTGGC 0.000722 CTGGG 0.000753 CTGGT 0.0011 CTGTA 0.00171 CTGTC 0.00112 CTGTG 0.00114 CTGTT 0.00128 CTTAA 0.000523 CTTAC 0.000663 CTTAG 0.000485 CTTAT 0.000782 CTTCA 0.00122 CTTCC 0.000962 CTTCG 0.000591 CTTCT 0.00141 CTTGA 0.00115 CTTGC 0.000857 CTTGG 0.00105 CTTGT 0.00197 CTTTA 0.00073 CTTTC 0.00108 CTTTG 0.00111 CTTTT 0.00187 GAAAA 0.00215 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00108 GAAAT 0.00139 GAACA 0.00118 GAACC 0.000861 GAACG 0.000612 GAACT 0.00091 GAAGA 0.00147 GAAGC 0.000829 GAAGG 0.000883 GAAGT 0.00101 GAATA 0.00108 GAATC 0.000932 GAATG 0.00112 GAATT 0.000937 GACAA 0.00136 GACAC 0.00112 GACAG 0.00112 GACAT 0.00119 GACCA 0.00101 GACCC 0.000713 GACCG 0.000532 GACCT 0.000655 GACGA 0.000908 GACGC 0.000534 GACGG 0.000635 GACGT 0.00073 GACTA 0.000771 GACTC 0.000977 GACTG 0.00098 GACTT 0.000999 GAGAA 0.00142 GAGAC 0.00125 GAGAG 0.00143 GAGAT 0.00137 GAGCA 0.000952 GAGCC 0.000732 GAGCG 0.000577 GAGCT 0.000978 GAGGA 0.000994 GAGGC 0.000603 GAGGG 0.000822 GAGGT 0.000969 GAGTA 0.00107 GAGTC 0.000977 GAGTG 0.00113 GAGTT 0.00112 GATAA 0.00104 GATAC 0.00108 GATAG 0.000788 GATAT 0.00139 GATCA 0.000981 GATCC 0.000664 GATCG 0.000575 GATCT 0.000944 GATGA 0.00124 GATGC 0.00074 GATGG 0.0011 GATGT 0.00114 GATTA 0.00083 GATTC 0.000932 GATTG 0.00106 GATTT 0.00129 GCAAA 0.00106 GCAAC 0.000946 GCAAG 0.000857 GCAAT 0.000898 GCACA 0.000991 GCACC 0.000739 GCACG 0.000576 GCACT 0.000852 GCAGA 0.000938 GCAGC 0.000767 GCAGG 0.000619 GCAGT 0.000912 GCATA 0.00067 GCATC 0.00074 GCATG 0.000858 GCATT 0.000845 GCCAA 0.000991 GCCAC 0.000793 GCCAG 0.000722 GCCAT 0.000895 GCCCA 0.00073 GCCCC 0.000521 GCCCG 0.000355 GCCCT 0.000551 GCCGA 0.000566 GCCGC 0.000448 GCCGG 0.000378 GCCGT 0.000625 GCCTA 0.000378 GCCTC 0.000603 GCCTG 0.000582 GCCTT 0.000616 GCGAA 0.000544 GCGAC 0.000558 GCGAG 0.000602 GCGAT 0.000599 GCGCA 0.000422 GCGCC 0.000373 GCGCG 0.00029 GCGCT 0.000421 GCGGA 0.000505 GCGGC 0.000448 GCGGG 0.000408 GCGGT 0.000579 GCGTA 0.000396 GCGTC 0.000534 GCGTG 0.000534 GCGTT 0.000566 GCTAA 0.000572 GCTAC 0.000892 GCTAG 0.000464 GCTAT 0.00074 GCTCA 0.000891 GCTCC 0.00073 GCTCG 0.000606 GCTCT 0.00101 GCTGA 0.000942 GCTGC 0.000767 GCTGG 0.000834 GCTGT 0.00114 GCTTA 0.000565 GCTTC 0.000829 GCTTG 0.000922 GCTTT 0.000867 GGAAA 0.00136 GGAAC 0.000798 GGAAG 0.000962 GGAAT 0.000925 GGACA 0.000882 GGACC 0.000588 GGACG 0.000537 GGACT 0.000768 GGAGA 0.00134 GGAGC 0.00073 GGAGG 0.00098 GGAGT 0.00101 GGATA 0.000811 GGATC 0.000664 GGATG 0.000815 GGATT 0.00079 GGCAA 0.0008 GGCAC 0.000642 GGCAG 0.000683 GGCAT 0.00064 GGCCA 0.000691 GGCCC 0.000441 GGCCG 0.000394 GGCCT 0.000419 GGCGA 0.000603 GGCGC 0.000373 GGCGG 0.000567 GGCGT 0.000526 GGCTA 0.000592 GGCTC 0.000732 GGCTG 0.00089 GGCTT 0.000763 GGGAA 0.000904 GGGAC 0.000593 GGGAG 0.00084 GGGAT 0.0007 GGGCA 0.000568 GGGCC 0.000441 GGGCG 0.00046 GGGCT 0.000688 GGGGA 0.00087 GGGGC 0.000521 GGGGG 0.000883 GGGGT 0.000914 GGGTA 0.000692 GGGTC 0.000713 GGGTG 0.000905 GGGTT 0.000956 GGTAA 0.000672 GGTAC 0.000822 GGTAG 0.000685 GGTAT 0.000942 GGTCA 0.000849 GGTCC 0.000588 GGTCG 0.000565 GGTCT 0.000908 GGTGA 0.00108 GGTGC 0.000739 GGTGG 0.00118 GGTGT 0.00112 GGTTA 0.000715 GGTTC 0.000861 GGTTG 0.00117 GGTTT 0.00116 GTAAA 0.000978 GTAAC 0.000694 GTAAG 0.000663 GTAAT 0.00102 GTACA 0.00205 GTACC 0.000822 GTACG 0.000761 GTACT 0.00153 GTAGA 0.00115 GTAGC 0.000892 GTAGG 0.000669 GTAGT 0.00114 GTATA 0.00113 GTATC 0.00108 GTATG 0.00119 GTATT 0.00132 GTCAA 0.00116 GTCAC 0.00102 GTCAG 0.000894 GTCAT 0.00111 GTCCA 0.00102 GTCCC 0.000593 GTCCG 0.000503 GTCCT 0.000655 GTCGA 0.000816 GTCGC 0.000558 GTCGG 0.000628 GTCGT 0.000873 GTCTA 0.000841 GTCTC 0.00125 GTCTG 0.00114 GTCTT 0.00116 GTGAA 0.00112 GTGAC 0.00102 GTGAG 0.001 GTGAT 0.00121 GTGCA 0.00105 GTGCC 0.000642 GTGCG 0.000553 GTGCT 0.000913 GTGGA 0.00123 GTGGC 0.000793 GTGGG 0.00096 GTGGT 0.00125 GTGTA 0.00109 GTGTC 0.00112 GTGTG 0.00133 GTGTT 0.00129 GTTAA 0.000649 GTTAC 0.000694 GTTAG 0.000696 GTTAT 0.000921 GTTCA 0.00111 GTTCC 0.000798 GTTCG 0.000641 GTTCT 0.00102 GTTGA 0.0014 GTTGC 0.000946 GTTGG 0.00128 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.000878 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00139 GTTTT 0.00175 TAAAA 0.00167 TAAAC 0.000878 TAAAG 0.00073 TAAAT 0.0013 TAACA 0.000952 TAACC 0.000715 TAACG 0.000509 TAACT 0.000783 TAAGA 0.000745 TAAGC 0.000565 TAAGG 0.000497 TAAGT 0.000647 TAATA 0.00122 TAATC 0.00083 TAATG 0.00102 TAATT 0.0013 TACAA 0.00204 TACAC 0.00109 TACAG 0.00171 TACAT 0.00152 TACCA 0.00109 TACCC 0.000692 TACCG 0.00064 TACCT 0.000699 TACGA 0.000971 TACGC 0.000396 TACGG 0.000545 TACGT 0.000586 TACTA 0.000872 TACTC 0.00107 TACTG 0.00158 TACTT 0.00158 TAGAA 0.00101 TAGAC 0.000841 TAGAG 0.000938 TAGAT 0.000985 TAGCA 0.000743 TAGCC 0.000592 TAGCG 0.000468 TAGCT 0.000865 TAGGA 0.000581 TAGGC 0.000378 TAGGG 0.000561 TAGGT 0.000587 TAGTA 0.000872 TAGTC 0.000771 TAGTG 0.000893 TAGTT 0.00104 TATAA 0.00113 TATAC 0.00113 TATAG 0.000876 TATAT 0.00213 TATCA 0.00131 TATCC 0.000811 TATCG 0.000916 TATCT 0.00126 TATGA 0.00108 TATGC 0.00067 TATGG 0.000912 TATGT 0.00132 TATTA 0.00122 TATTC 0.00108 TATTG 0.0014 TATTT 0.00207 TCAAA 0.00159 TCAAC 0.0014 TCAAG 0.00115 TCAAT 0.00144 TCACA 0.00128 TCACC 0.00108 TCACG 0.000915 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00134 TCAGC 0.000942 TCAGG 0.000748 TCAGT 0.00104 TCATA 0.00108 TCATC 0.00124 TCATG 0.00111 TCATT 0.00144 TCCAA 0.00148 TCCAC 0.00123 TCCAG 0.00113 TCCAT 0.00128 TCCCA 0.00091 TCCCC 0.00087 TCCCG 0.000483 TCCCT 0.000769 TCCGA 0.000803 TCCGC 0.000505 TCCGG 0.00049 TCCGT 0.000665 TCCTA 0.000581 TCCTC 0.000994 TCCTG 0.000836 TCCTT 0.000923 TCGAA 0.000914 TCGAC 0.000816 TCGAG 0.00078 TCGAT 0.000882 TCGCA 0.00066 TCGCC 0.000603 TCGCG 0.000368 TCGCT 0.00067 TCGGA 0.000803 TCGGC 0.000566 TCGGG 0.000537 TCGGT 0.000734 TCGTA 0.000971 TCGTC 0.000908 TCGTG 0.000768 TCGTT 0.000869 TCTAA 0.000827 TCTAC 0.00115 TCTAG 0.000721 TCTAT 0.00108 TCTCA 0.0015 TCTCC 0.00134 TCTCG 0.000953 TCTCT 0.00167 TCTGA 0.00134 TCTGC 0.000938 TCTGG 0.0012 TCTGT 0.0014 TCTTA 0.000745 TCTTC 0.00147 TCTTG 0.00135 TCTTT 0.00164 TGAAA 0.00172 TGAAC 0.00111 TGAAG 0.00122 TGAAT 0.00123 TGACA 0.00138 TGACC 0.000849 TGACG 0.000827 TGACT 0.00112 TGAGA 0.0015 TGAGC 0.000891 TGAGG 0.000846 TGAGT 0.00115 TGATA 0.00131 TGATC 0.000981 TGATG 0.00131 TGATT 0.00144 TGCAA 0.00121 TGCAC 0.00105 TGCAG 0.00103 TGCAT 0.00115 TGCCA 0.000985 TGCCC 0.000568 TGCCG 0.000556 TGCCT 0.000655 TGCGA 0.00066 TGCGC 0.000422 TGCGG 0.000543 TGCGT 0.000575 TGCTA 0.000743 TGCTC 0.000952 TGCTG 0.00116 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00143 TGGAC 0.00102 TGGAG 0.00152 TGGAT 0.00114 TGGCA 0.000985 TGGCC 0.000691 TGGCG 0.000724 TGGCT 0.001 TGGGA 0.00091 TGGGC 0.00073 TGGGG 0.00106 TGGGT 0.00101 TGGTA 0.00109 TGGTC 0.00101 TGGTG 0.00154 TGGTT 0.00133 TGTAA 0.00111 TGTAC 0.00205 TGTAG 0.00152 TGTAT 0.00169 TGTCA 0.00138 TGTCC 0.000882 TGTCG 0.000977 TGTCT 0.00154 TGTGA 0.00128 TGTGC 0.000991 TGTGG 0.00131 TGTGT 0.00167 TGTTA 0.000952 TGTTC 0.00118 TGTTG 0.00163 TGTTT 0.00194 TTAAA 0.000995 TTAAC 0.000649 TTAAG 0.000523 TTAAT 0.00108 TTACA 0.00111 TTACC 0.000672 TTACG 0.00049 TTACT 0.00108 TTAGA 0.000827 TTAGC 0.000572 TTAGG 0.000515 TTAGT 0.00098 TTATA 0.00113 TTATC 0.00104 TTATG 0.000948 TTATT 0.00176 TTCAA 0.00163 TTCAC 0.00112 TTCAG 0.00121 TTCAT 0.00132 TTCCA 0.00143 TTCCC 0.000904 TTCCG 0.000744 TTCCT 0.000961 TTCGA 0.000914 TTCGC 0.000544 TTCGG 0.000736 TTCGT 0.000771 TTCTA 0.00101 TTCTC 0.00142 TTCTG 0.00141 TTCTT 0.00153 TTGAA 0.00163 TTGAC 0.00116 TTGAG 0.00131 TTGAT 0.00149 TTGCA 0.00121 TTGCC 0.0008 TTGCG 0.000625 TTGCT 0.00112 TTGGA 0.00148 TTGGC 0.000991 TTGGG 0.00111 TTGGT 0.00145 TTGTA 0.00204 TTGTC 0.00136 TTGTG 0.00149 TTGTT 0.0018 TTTAA 0.000995 TTTAC 0.000978 TTTAG 0.000894 TTTAT 0.00172 TTTCA 0.00172 TTTCC 0.00136 TTTCG 0.00103 TTTCT 0.00174 TTTGA 0.00159 TTTGC 0.00106 TTTGG 0.00155 TTTGT 0.00176 TTTTA 0.00167 TTTTC 0.00215 TTTTG 0.00206 TTTTT 0.00456 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4366 AAAAC 0.1676 AAAAG 0.1793 AAAAT 0.2164 AAACA 0.3683 AAACC 0.221 AAACG 0.1845 AAACT 0.2262 AAAGA 0.3423 AAAGC 0.1808 AAAGG 0.1971 AAAGT 0.2797 AAATA 0.3262 AAATC 0.2029 AAATG 0.2446 AAATT 0.2263 AACAA 0.316 AACAC 0.226 AACAG 0.2239 AACAT 0.2342 AACCA 0.341 AACCC 0.2448 AACCG 0.1818 AACCT 0.2324 AACGA 0.3069 AACGC 0.1999 AACGG 0.2602 AACGT 0.233 AACTA 0.2371 AACTC 0.2557 AACTG 0.2587 AACTT 0.2485 AAGAA 0.2932 AAGAC 0.2231 AAGAG 0.2662 AAGAT 0.2174 AAGCA 0.3163 AAGCC 0.2398 AAGCG 0.1833 AAGCT 0.2606 AAGGA 0.2877 AAGGC 0.192 AAGGG 0.2589 AAGGT 0.2614 AAGTA 0.3242 AAGTC 0.2051 AAGTG 0.2464 AAGTT 0.2243 AATAA 0.3047 AATAC 0.2298 AATAG 0.1631 AATAT 0.3025 AATCA 0.3496 AATCC 0.1923 AATCG 0.1907 AATCT 0.2675 AATGA 0.2932 AATGC 0.1715 AATGG 0.2478 AATGT 0.2874 AATTA 0.2591 AATTC 0.1874 AATTG 0.2667 AATTT 0.2869 ACAAA 0.2629 ACAAC 0.2129 ACAAG 0.2947 ACAAT 0.2296 ACACA 0.3447 ACACC 0.2319 ACACG 0.17 ACACT 0.2533 ACAGA 0.2673 ACAGC 0.2176 ACAGG 0.1756 ACAGT 0.3395 ACATA 0.2478 ACATC 0.2142 ACATG 0.2717 ACATT 0.2663 ACCAA 0.2923 ACCAC 0.2524 ACCAG 0.2217 ACCAT 0.2336 ACCCA 0.3093 ACCCC 0.2802 ACCCG 0.1578 ACCCT 0.2527 ACCGA 0.2879 ACCGC 0.227 ACCGG 0.213 ACCGT 0.2721 ACCTA 0.18 ACCTC 0.2973 ACCTG 0.2654 ACCTT 0.2573 ACGAA 0.2192 ACGAC 0.2481 ACGAG 0.2993 ACGAT 0.2334 ACGCA 0.2834 ACGCC 0.2591 ACGCG 0.1929 ACGCT 0.2646 ACGGA 0.2668 ACGGC 0.2509 ACGGG 0.2038 ACGGT 0.2785 ACGTA 0.1921 ACGTC 0.2393 ACGTG 0.3524 ACGTT 0.2161 ACTAA 0.2738 ACTAC 0.3177 ACTAG 0.1631 ACTAT 0.2455 ACTCA 0.2686 ACTCC 0.2352 ACTCG 0.2146 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2204 ACTGC 0.1931 ACTGG 0.2098 ACTGT 0.3767 ACTTA 0.1328 ACTTC 0.2076 ACTTG 0.3843 ACTTT 0.2754 AGAAA 0.3241 AGAAC 0.1901 AGAAG 0.2626 AGAAT 0.2231 AGACA 0.3505 AGACC 0.2064 AGACG 0.2045 AGACT 0.2387 AGAGA 0.3443 AGAGC 0.2081 AGAGG 0.1987 AGAGT 0.2489 AGATA 0.266 AGATC 0.1999 AGATG 0.3012 AGATT 0.2329 AGCAA 0.2903 AGCAC 0.2365 AGCAG 0.2657 AGCAT 0.2074 AGCCA 0.3366 AGCCC 0.231 AGCCG 0.222 AGCCT 0.2104 AGCGA 0.3096 AGCGC 0.1946 AGCGG 0.2477 AGCGT 0.2481 AGCTA 0.2291 AGCTC 0.2593 AGCTG 0.2918 AGCTT 0.2198 AGGAA 0.2879 AGGAC 0.1963 AGGAG 0.3107 AGGAT 0.2051 AGGCA 0.3004 AGGCC 0.1921 AGGCG 0.2202 AGGCT 0.2873 AGGGA 0.2646 AGGGC 0.1896 AGGGG 0.262 AGGGT 0.2838 AGGTA 0.2142 AGGTC 0.2009 AGGTG 0.3068 AGGTT 0.2781 AGTAA 0.2117 AGTAC 0.3013 AGTAG 0.2231 AGTAT 0.2638 AGTCA 0.3002 AGTCC 0.2062 AGTCG 0.2117 AGTCT 0.2819 AGTGA 0.2539 AGTGC 0.2 AGTGG 0.2588 AGTGT 0.2873 AGTTA 0.1782 AGTTC 0.207 AGTTG 0.344 AGTTT 0.2708 ATAAA 0.3536 ATAAC 0.1891 ATAAG 0.1605 ATAAT 0.2968 ATACA 0.3574 ATACC 0.1994 ATACG 0.1587 ATACT 0.2845 ATAGA 0.3307 ATAGC 0.2266 ATAGG 0.1736 ATAGT 0.269 ATATA 0.3301 ATATC 0.2162 ATATG 0.1832 ATATT 0.2705 ATCAA 0.2957 ATCAC 0.2407 ATCAG 0.2063 ATCAT 0.2574 ATCCA 0.3706 ATCCC 0.2272 ATCCG 0.18 ATCCT 0.2222 ATCGA 0.3 ATCGC 0.2036 ATCGG 0.2172 ATCGT 0.2792 ATCTA 0.2087 ATCTC 0.2907 ATCTG 0.2607 ATCTT 0.2399 ATGAA 0.2707 ATGAC 0.227 ATGAG 0.2361 ATGAT 0.2663 ATGCA 0.3706 ATGCC 0.2054 ATGCG 0.1669 ATGCT 0.2571 ATGGA 0.3037 ATGGC 0.2125 ATGGG 0.2084 ATGGT 0.2755 ATGTA 0.2865 ATGTC 0.2232 ATGTG 0.2393 ATGTT 0.251 ATTAA 0.2484 ATTAC 0.2336 ATTAG 0.187 ATTAT 0.3311 ATTCA 0.3037 ATTCC 0.2279 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.295 ATTGA 0.2867 ATTGC 0.1785 ATTGG 0.2297 ATTGT 0.3051 ATTTA 0.2058 ATTTC 0.2192 ATTTG 0.2184 ATTTT 0.3567 CAAAA 0.3464 CAAAC 0.2338 CAAAG 0.1872 CAAAT 0.2325 CAACA 0.3226 CAACC 0.2312 CAACG 0.1464 CAACT 0.2998 CAAGA 0.2689 CAAGC 0.1833 CAAGG 0.1756 CAAGT 0.3722 CAATA 0.2781 CAATC 0.2115 CAATG 0.2455 CAATT 0.2649 CACAA 0.2854 CACAC 0.2546 CACAG 0.2169 CACAT 0.2431 CACCA 0.375 CACCC 0.2197 CACCG 0.1622 CACCT 0.2431 CACGA 0.2602 CACGC 0.1809 CACGG 0.1946 CACGT 0.3643 CACTA 0.2096 CACTC 0.2663 CACTG 0.2422 CACTT 0.2819 CAGAA 0.2881 CAGAC 0.2344 CAGAG 0.2253 CAGAT 0.2522 CAGCA 0.3147 CAGCC 0.2416 CAGCG 0.1448 CAGCT 0.2989 CAGGA 0.2813 CAGGC 0.1957 CAGGG 0.2319 CAGGT 0.2911 CAGTA 0.3334 CAGTC 0.2075 CAGTG 0.2183 CAGTT 0.2407 CATAA 0.2384 CATAC 0.2989 CATAG 0.1661 CATAT 0.2967 CATCA 0.3118 CATCC 0.1932 CATCG 0.1577 CATCT 0.3373 CATGA 0.2532 CATGC 0.1959 CATGG 0.2214 CATGT 0.3296 CATTA 0.2073 CATTC 0.2269 CATTG 0.2509 CATTT 0.3149 CCAAA 0.3079 CCAAC 0.2545 CCAAG 0.2078 CCAAT 0.2298 CCACA 0.3087 CCACC 0.2797 CCACG 0.151 CCACT 0.2606 CCAGA 0.323 CCAGC 0.2249 CCAGG 0.1849 CCAGT 0.2671 CCATA 0.2168 CCATC 0.2626 CCATG 0.2305 CCATT 0.2901 CCCAA 0.3004 CCCAC 0.2592 CCCAG 0.2034 CCCAT 0.237 CCCCA 0.3316 CCCCC 0.2772 CCCCG 0.1524 CCCCT 0.2388 CCCGA 0.292 CCCGC 0.2219 CCCGG 0.21 CCCGT 0.2762 CCCTA 0.1931 CCCTC 0.2832 CCCTG 0.2375 CCCTT 0.2862 CCGAA 0.2787 CCGAC 0.2378 CCGAG 0.2416 CCGAT 0.2419 CCGCA 0.2803 CCGCC 0.2929 CCGCG 0.1501 CCGCT 0.2767 CCGGA 0.2729 CCGGC 0.2103 CCGGG 0.2147 CCGGT 0.3022 CCGTA 0.2187 CCGTC 0.2549 CCGTG 0.2307 CCGTT 0.2958 CCTAA 0.2444 CCTAC 0.3177 CCTAG 0.1689 CCTAT 0.269 CCTCA 0.25 CCTCC 0.2894 CCTCG 0.1751 CCTCT 0.2855 CCTGA 0.2516 CCTGC 0.2082 CCTGG 0.2306 CCTGT 0.3096 CCTTA 0.155 CCTTC 0.2753 CCTTG 0.2752 CCTTT 0.2946 CGAAA 0.3474 CGAAC 0.2161 CGAAG 0.1994 CGAAT 0.2371 CGACA 0.3399 CGACC 0.1966 CGACG 0.189 CGACT 0.2746 CGAGA 0.31 CGAGC 0.1972 CGAGG 0.1928 CGAGT 0.3001 CGATA 0.3116 CGATC 0.1956 CGATG 0.2262 CGATT 0.2666 CGCAA 0.2844 CGCAC 0.2517 CGCAG 0.2274 CGCAT 0.2364 CGCCA 0.3499 CGCCC 0.2223 CGCCG 0.1957 CGCCT 0.2321 CGCGA 0.2747 CGCGC 0.2164 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2919 CGCTA 0.2165 CGCTC 0.267 CGCTG 0.2467 CGCTT 0.2698 CGGAA 0.302 CGGAC 0.2041 CGGAG 0.2689 CGGAT 0.225 CGGCA 0.2757 CGGCC 0.1956 CGGCG 0.2008 CGGCT 0.3279 CGGGA 0.2628 CGGGC 0.193 CGGGG 0.2641 CGGGT 0.28 CGGTA 0.2509 CGGTC 0.2088 CGGTG 0.2619 CGGTT 0.2784 CGTAA 0.1962 CGTAC 0.3046 CGTAG 0.1992 CGTAT 0.3 CGTCA 0.2947 CGTCC 0.1913 CGTCG 0.1934 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.31 CGTGC 0.1952 CGTGG 0.2164 CGTGT 0.2784 CGTTA 0.1797 CGTTC 0.2162 CGTTG 0.2609 CGTTT 0.3431 CTAAA 0.3091 CTAAC 0.2409 CTAAG 0.1676 CTAAT 0.2824 CTACA 0.3966 CTACC 0.1783 CTACG 0.1294 CTACT 0.2957 CTAGA 0.3395 CTAGC 0.2185 CTAGG 0.1674 CTAGT 0.2745 CTATA 0.2683 CTATC 0.2415 CTATG 0.2024 CTATT 0.2878 CTCAA 0.2984 CTCAC 0.2286 CTCAG 0.2108 CTCAT 0.2622 CTCCA 0.3746 CTCCC 0.2068 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.2554 CTCGA 0.2538 CTCGC 0.1961 CTCGG 0.2076 CTCGT 0.3426 CTCTA 0.1931 CTCTC 0.2953 CTCTG 0.2263 CTCTT 0.2853 CTGAA 0.2979 CTGAC 0.2194 CTGAG 0.2272 CTGAT 0.2555 CTGCA 0.3173 CTGCC 0.2111 CTGCG 0.1546 CTGCT 0.317 CTGGA 0.3052 CTGGC 0.1946 CTGGG 0.2031 CTGGT 0.2971 CTGTA 0.3268 CTGTC 0.2132 CTGTG 0.2166 CTGTT 0.2434 CTTAA 0.2131 CTTAC 0.2705 CTTAG 0.1977 CTTAT 0.3187 CTTCA 0.2925 CTTCC 0.2297 CTTCG 0.1412 CTTCT 0.3365 CTTGA 0.2296 CTTGC 0.1704 CTTGG 0.208 CTTGT 0.392 CTTTA 0.1522 CTTTC 0.2248 CTTTG 0.2324 CTTTT 0.3906 GAAAA 0.3663 GAAAC 0.2125 GAAAG 0.1841 GAAAT 0.2371 GAACA 0.3316 GAACC 0.2414 GAACG 0.1717 GAACT 0.2553 GAAGA 0.3503 GAAGC 0.1979 GAAGG 0.2107 GAAGT 0.2412 GAATA 0.2648 GAATC 0.2294 GAATG 0.2751 GAATT 0.2307 GACAA 0.2836 GACAC 0.2349 GACAG 0.2334 GACAT 0.248 GACCA 0.3466 GACCC 0.2451 GACCG 0.183 GACCT 0.2253 GACGA 0.3236 GACGC 0.1901 GACGG 0.2262 GACGT 0.2602 GACTA 0.2068 GACTC 0.2622 GACTG 0.263 GACTT 0.268 GAGAA 0.2584 GAGAC 0.229 GAGAG 0.262 GAGAT 0.2506 GAGCA 0.2937 GAGCC 0.2261 GAGCG 0.1782 GAGCT 0.302 GAGGA 0.2934 GAGGC 0.178 GAGGG 0.2426 GAGGT 0.286 GAGTA 0.2481 GAGTC 0.2271 GAGTG 0.2636 GAGTT 0.2613 GATAA 0.2417 GATAC 0.2507 GATAG 0.1834 GATAT 0.3242 GATCA 0.31 GATCC 0.21 GATCG 0.1818 GATCT 0.2983 GATGA 0.2938 GATGC 0.1752 GATGG 0.2615 GATGT 0.2695 GATTA 0.2018 GATTC 0.2266 GATTG 0.2588 GATTT 0.3128 GCAAA 0.2813 GCAAC 0.2516 GCAAG 0.228 GCAAT 0.2391 GCACA 0.3137 GCACC 0.2341 GCACG 0.1824 GCACT 0.2698 GCAGA 0.2899 GCAGC 0.237 GCAGG 0.1913 GCAGT 0.2819 GCATA 0.2152 GCATC 0.2377 GCATG 0.2757 GCATT 0.2714 GCCAA 0.2914 GCCAC 0.2331 GCCAG 0.2122 GCCAT 0.2633 GCCCA 0.3385 GCCCC 0.2416 GCCCG 0.1646 GCCCT 0.2553 GCCGA 0.2808 GCCGC 0.222 GCCGG 0.1874 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.1735 GCCTC 0.2768 GCCTG 0.267 GCCTT 0.2827 GCGAA 0.236 GCGAC 0.2425 GCGAG 0.2616 GCGAT 0.2599 GCGCA 0.2804 GCGCC 0.2479 GCGCG 0.1925 GCGCT 0.2792 GCGGA 0.2603 GCGGC 0.2309 GCGGG 0.2103 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.1952 GCGTC 0.2629 GCGTG 0.2632 GCGTT 0.2787 GCTAA 0.2144 GCTAC 0.3342 GCTAG 0.174 GCTAT 0.2773 GCTCA 0.2751 GCTCC 0.2254 GCTCG 0.1871 GCTCT 0.3123 GCTGA 0.2556 GCTGC 0.2082 GCTGG 0.2265 GCTGT 0.3097 GCTTA 0.1774 GCTTC 0.2606 GCTTG 0.2896 GCTTT 0.2724 GGAAA 0.3364 GGAAC 0.1973 GGAAG 0.2377 GGAAT 0.2286 GGACA 0.3178 GGACC 0.2119 GGACG 0.1935 GGACT 0.2768 GGAGA 0.3302 GGAGC 0.1797 GGAGG 0.2411 GGAGT 0.2489 GGATA 0.2633 GGATC 0.2157 GGATG 0.2645 GGATT 0.2565 GGCAA 0.2895 GGCAC 0.2321 GGCAG 0.247 GGCAT 0.2314 GGCCA 0.3552 GGCCC 0.2266 GGCCG 0.2028 GGCCT 0.2154 GGCGA 0.2915 GGCGC 0.1805 GGCGG 0.2741 GGCGT 0.254 GGCTA 0.1989 GGCTC 0.246 GGCTG 0.2988 GGCTT 0.2563 GGGAA 0.2978 GGGAC 0.1951 GGGAG 0.2766 GGGAT 0.2304 GGGCA 0.2635 GGGCC 0.2043 GGGCG 0.2133 GGGCT 0.3189 GGGGA 0.273 GGGGC 0.1634 GGGGG 0.277 GGGGT 0.2867 GGGTA 0.212 GGGTC 0.2183 GGGTG 0.277 GGGTT 0.2926 GGTAA 0.2153 GGTAC 0.2634 GGTAG 0.2196 GGTAT 0.3017 GGTCA 0.2917 GGTCC 0.2021 GGTCG 0.1942 GGTCT 0.312 GGTGA 0.2614 GGTGC 0.1794 GGTGG 0.2872 GGTGT 0.272 GGTTA 0.183 GGTTC 0.2204 GGTTG 0.2988 GGTTT 0.2979 GTAAA 0.2915 GTAAC 0.2069 GTAAG 0.1977 GTAAT 0.3039 GTACA 0.3964 GTACC 0.1592 GTACG 0.1473 GTACT 0.2972 GTAGA 0.2987 GTAGC 0.2318 GTAGG 0.174 GTAGT 0.2955 GTATA 0.2398 GTATC 0.2281 GTATG 0.2518 GTATT 0.2803 GTCAA 0.2779 GTCAC 0.2434 GTCAG 0.2138 GTCAT 0.2648 GTCCA 0.3692 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1812 GTCCT 0.2361 GTCGA 0.2839 GTCGC 0.1942 GTCGG 0.2183 GTCGT 0.3036 GTCTA 0.191 GTCTC 0.285 GTCTG 0.2599 GTCTT 0.2641 GTGAA 0.2575 GTGAC 0.2335 GTGAG 0.2304 GTGAT 0.2787 GTGCA 0.333 GTGCC 0.203 GTGCG 0.1751 GTGCT 0.2889 GTGGA 0.2904 GTGGC 0.187 GTGGG 0.2266 GTGGT 0.296 GTGTA 0.2262 GTGTC 0.2323 GTGTG 0.2754 GTGTT 0.2662 GTTAA 0.2191 GTTAC 0.2345 GTTAG 0.2353 GTTAT 0.3111 GTTCA 0.31 GTTCC 0.2239 GTTCG 0.1798 GTTCT 0.2862 GTTGA 0.2773 GTTGC 0.1872 GTTGG 0.2535 GTTGT 0.282 GTTTA 0.1667 GTTTC 0.2364 GTTTG 0.2644 GTTTT 0.3325 TAAAA 0.3652 TAAAC 0.1914 TAAAG 0.1591 TAAAT 0.2843 TAACA 0.3217 TAACC 0.2415 TAACG 0.1719 TAACT 0.2648 TAAGA 0.3037 TAAGC 0.2301 TAAGG 0.2026 TAAGT 0.2636 TAATA 0.2795 TAATC 0.1901 TAATG 0.2338 TAATT 0.2967 TACAA 0.32 TACAC 0.1718 TACAG 0.2689 TACAT 0.2392 TACCA 0.3487 TACCC 0.222 TACCG 0.2052 TACCT 0.2241 TACGA 0.3886 TACGC 0.1586 TACGG 0.2181 TACGT 0.2347 TACTA 0.1712 TACTC 0.2096 TACTG 0.3093 TACTT 0.31 TAGAA 0.2684 TAGAC 0.2225 TAGAG 0.2484 TAGAT 0.2608 TAGCA 0.2785 TAGCC 0.222 TAGCG 0.1755 TAGCT 0.324 TAGGA 0.2759 TAGGC 0.1794 TAGGG 0.266 TAGGT 0.2786 TAGTA 0.2437 TAGTC 0.2154 TAGTG 0.2495 TAGTT 0.2914 TATAA 0.2143 TATAC 0.2152 TATAG 0.1664 TATAT 0.4041 TATCA 0.3056 TATCC 0.1888 TATCG 0.2132 TATCT 0.2923 TATGA 0.2714 TATGC 0.1684 TATGG 0.2292 TATGT 0.331 TATTA 0.2117 TATTC 0.1866 TATTG 0.2429 TATTT 0.3588 TCAAA 0.2847 TCAAC 0.2506 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2582 TCACA 0.2935 TCACC 0.2476 TCACG 0.2103 TCACT 0.2486 TCAGA 0.33 TCAGC 0.2311 TCAGG 0.1836 TCAGT 0.2554 TCATA 0.2215 TCATC 0.2546 TCATG 0.2276 TCATT 0.2963 TCCAA 0.2885 TCCAC 0.2405 TCCAG 0.2212 TCCAT 0.2499 TCCCA 0.3002 TCCCC 0.287 TCCCG 0.1594 TCCCT 0.2534 TCCGA 0.326 TCCGC 0.205 TCCGG 0.1992 TCCGT 0.2699 TCCTA 0.1743 TCCTC 0.2981 TCCTG 0.2507 TCCTT 0.2769 TCGAA 0.2696 TCGAC 0.2406 TCGAG 0.2298 TCGAT 0.2601 TCGCA 0.2869 TCGCC 0.2621 TCGCG 0.16 TCGCT 0.291 TCGGA 0.3041 TCGGC 0.2146 TCGGG 0.2033 TCGGT 0.278 TCGTA 0.276 TCGTC 0.2584 TCGTG 0.2185 TCGTT 0.2471 TCTAA 0.2189 TCTAC 0.3042 TCTAG 0.191 TCTAT 0.2859 TCTCA 0.2746 TCTCC 0.2452 TCTCG 0.1742 TCTCT 0.306 TCTGA 0.2754 TCTGC 0.1921 TCTGG 0.2454 TCTGT 0.287 TCTTA 0.1431 TCTTC 0.282 TCTTG 0.2596 TCTTT 0.3152 TGAAA 0.3261 TGAAC 0.2091 TGAAG 0.2317 TGAAT 0.2331 TGACA 0.3312 TGACC 0.2031 TGACG 0.1979 TGACT 0.2677 TGAGA 0.3418 TGAGC 0.2028 TGAGG 0.1926 TGAGT 0.2628 TGATA 0.2602 TGATC 0.1944 TGATG 0.2606 TGATT 0.2848 TGCAA 0.2723 TGCAC 0.2369 TGCAG 0.2311 TGCAT 0.2598 TGCCA 0.3563 TGCCC 0.2056 TGCCG 0.2011 TGCCT 0.237 TGCGA 0.3 TGCGC 0.192 TGCGG 0.2467 TGCGT 0.2612 TGCTA 0.1925 TGCTC 0.2465 TGCTG 0.3003 TGCTT 0.2607 TGGAA 0.2801 TGGAC 0.2 TGGAG 0.297 TGGAT 0.2229 TGGCA 0.2895 TGGCC 0.2031 TGGCG 0.2128 TGGCT 0.2946 TGGGA 0.2456 TGGGC 0.197 TGGGG 0.2852 TGGGT 0.2723 TGGTA 0.2188 TGGTC 0.2028 TGGTG 0.3106 TGGTT 0.2678 TGTAA 0.1747 TGTAC 0.3212 TGTAG 0.2392 TGTAT 0.2649 TGTCA 0.2893 TGTCC 0.1843 TGTCG 0.2041 TGTCT 0.3223 TGTGA 0.2437 TGTGC 0.1891 TGTGG 0.2493 TGTGT 0.3179 TGTTA 0.167 TGTTC 0.2074 TGTTG 0.2856 TGTTT 0.3401 TTAAA 0.306 TTAAC 0.1996 TTAAG 0.1608 TTAAT 0.3337 TTACA 0.332 TTACC 0.2003 TTACG 0.1461 TTACT 0.3216 TTAGA 0.2857 TTAGC 0.1977 TTAGG 0.178 TTAGT 0.3386 TTATA 0.2316 TTATC 0.2133 TTATG 0.1947 TTATT 0.3604 TTCAA 0.3081 TTCAC 0.2123 TTCAG 0.2297 TTCAT 0.2499 TTCCA 0.3548 TTCCC 0.2237 TTCCG 0.1839 TTCCT 0.2376 TTCGA 0.3085 TTCGC 0.1833 TTCGG 0.2481 TTCGT 0.2601 TTCTA 0.1891 TTCTC 0.2639 TTCTG 0.2621 TTCTT 0.2848 TTGAA 0.2911 TTGAC 0.2078 TTGAG 0.2343 TTGAT 0.2668 TTGCA 0.322 TTGCC 0.2131 TTGCG 0.1665 TTGCT 0.2984 TTGGA 0.2934 TTGGC 0.1968 TTGGG 0.2211 TTGGT 0.2886 TTGTA 0.3047 TTGTC 0.2029 TTGTG 0.2233 TTGTT 0.2692 TTTAA 0.2168 TTTAC 0.2132 TTTAG 0.1948 TTTAT 0.3753 TTTCA 0.2945 TTTCC 0.2325 TTTCG 0.176 TTTCT 0.297 TTTGA 0.2672 TTTGC 0.1775 TTTGG 0.2601 TTTGT 0.2952 TTTTA 0.1604 TTTTC 0.2055 TTTTG 0.1975 TTTTT 0.4366 [2] # (a,c,g,t)= (0.272, 0.228, 0.228, 0.272) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.276 C 0.224 G 0.224 T 0.276 # l= 1 # Values AA 0.0783 AC 0.0652 AG 0.0614 AT 0.0709 CA 0.0718 CC 0.0505 CG 0.0406 CT 0.0615 GA 0.064 GC 0.0447 GG 0.0504 GT 0.0651 TA 0.0617 TC 0.0641 TG 0.0717 TT 0.0783 # l= 2 # Values AAA 0.026 AAC 0.0168 AAG 0.0164 AAT 0.0191 ACA 0.0221 ACC 0.0143 ACG 0.0113 ACT 0.0174 AGA 0.0193 AGC 0.013 AGG 0.0118 AGT 0.0174 ATA 0.0187 ATC 0.0156 ATG 0.0174 ATT 0.0191 CAA 0.021 CAC 0.017 CAG 0.0164 CAT 0.0174 CCA 0.0175 CCC 0.012 CCG 0.00919 CCT 0.0118 CGA 0.012 CGC 0.00809 CGG 0.00918 CGT 0.0113 CTA 0.0121 CTC 0.0166 CTG 0.0164 CTT 0.0164 GAA 0.0174 GAC 0.0145 GAG 0.0166 GAT 0.0156 GCA 0.0135 GCC 0.0101 GCG 0.00808 GCT 0.013 GGA 0.0141 GGC 0.0101 GGG 0.012 GGT 0.0143 GTA 0.017 GTC 0.0144 GTG 0.0169 GTT 0.0168 TAA 0.0139 TAC 0.017 TAG 0.0121 TAT 0.0187 TCA 0.0187 TCC 0.0141 TCG 0.012 TCT 0.0193 TGA 0.0187 TGC 0.0135 TGG 0.0174 TGT 0.0221 TTA 0.0139 TTC 0.0174 TTG 0.021 TTT 0.026 # l= 3 # Values AAAA 0.00999 AAAC 0.00524 AAAG 0.00475 AAAT 0.00606 AACA 0.00564 AACC 0.00394 AACG 0.00286 AACT 0.00433 AAGA 0.00513 AAGC 0.00321 AAGG 0.00322 AAGT 0.00481 AATA 0.00551 AATC 0.00402 AATG 0.00483 AATT 0.00478 ACAA 0.00665 ACAC 0.00494 ACAG 0.00526 ACAT 0.00526 ACCA 0.00501 ACCC 0.00334 ACCG 0.00264 ACCT 0.00329 ACGA 0.00355 ACGC 0.0021 ACGG 0.00257 ACGT 0.00311 ACTA 0.00353 ACTC 0.00434 ACTG 0.00471 ACTT 0.00481 AGAA 0.00524 AGAC 0.00447 AGAG 0.0049 AGAT 0.00466 AGCA 0.0039 AGCC 0.00305 AGCG 0.00224 AGCT 0.00379 AGGA 0.00334 AGGC 0.00223 AGGG 0.00296 AGGT 0.00329 AGTA 0.00501 AGTC 0.00374 AGTG 0.00432 AGTT 0.00433 ATAA 0.00466 ATAC 0.00466 ATAG 0.00322 ATAT 0.00618 ATCA 0.00493 ATCC 0.00307 ATCG 0.00294 ATCT 0.00466 ATGA 0.00478 ATGC 0.00313 ATGG 0.00423 ATGT 0.00526 ATTA 0.0042 ATTC 0.00394 ATTG 0.00494 ATTT 0.00606 CAAA 0.00592 CAAC 0.00508 CAAG 0.00506 CAAT 0.00494 CACA 0.00533 CACC 0.00425 CACG 0.00304 CACT 0.00432 CAGA 0.00489 CAGC 0.00376 CAGG 0.00301 CAGT 0.00471 CATA 0.00391 CATC 0.00422 CATG 0.00443 CATT 0.00484 CCAA 0.00508 CCAC 0.00438 CCAG 0.00376 CCAT 0.00423 CCCA 0.0038 CCCC 0.00329 CCCG 0.00191 CCCT 0.00296 CCGA 0.0027 CCGC 0.00204 CCGG 0.00188 CCGT 0.00257 CCTA 0.00211 CCTC 0.00347 CCTG 0.00301 CCTT 0.00322 CGAA 0.00296 CGAC 0.00296 CGAG 0.00314 CGAT 0.00294 CGCA 0.00227 CGCC 0.00218 CGCG 0.00139 CGCT 0.00224 CGGA 0.00252 CGGC 0.00212 CGGG 0.00191 CGGT 0.00264 CGTA 0.00253 CGTC 0.00289 CGTG 0.00304 CGTT 0.00286 CTAA 0.00286 CTAC 0.00387 CTAG 0.00212 CTAT 0.00323 CTCA 0.00441 CTCC 0.00417 CTCG 0.00314 CTCT 0.0049 CTGA 0.00404 CTGC 0.00331 CTGG 0.00376 CTGT 0.00526 CTTA 0.0024 CTTC 0.00416 CTTG 0.00506 CTTT 0.00475 GAAA 0.00576 GAAC 0.00354 GAAG 0.00415 GAAT 0.00394 GACA 0.00485 GACC 0.00297 GACG 0.00289 GACT 0.00374 GAGA 0.00551 GAGC 0.00331 GAGG 0.00346 GAGT 0.00433 GATA 0.00422 GATC 0.00314 GATG 0.00422 GATT 0.00402 GCAA 0.00381 GCAC 0.00326 GCAG 0.00331 GCAT 0.00313 GCCA 0.0035 GCCC 0.00226 GCCG 0.00211 GCCT 0.00223 GCGA 0.00237 GCGC 0.00158 GCGG 0.00204 GCGT 0.0021 GCTA 0.0027 GCTC 0.00331 GCTG 0.00376 GCTT 0.00321 GGAA 0.00402 GGAC 0.00284 GGAG 0.00416 GGAT 0.00307 GGCA 0.00283 GGCC 0.00205 GGCG 0.00218 GGCT 0.00305 GGGA 0.00309 GGGC 0.00226 GGGG 0.00328 GGGT 0.00334 GGTA 0.00312 GGTC 0.00297 GGTG 0.00424 GGTT 0.00394 GTAA 0.00328 GTAC 0.00518 GTAG 0.00386 GTAT 0.00466 GTCA 0.00419 GTCC 0.00284 GTCG 0.00296 GTCT 0.00447 GTGA 0.00437 GTGC 0.00326 GTGG 0.00437 GTGT 0.00494 GTTA 0.00292 GTTC 0.00354 GTTG 0.00508 GTTT 0.00523 TAAA 0.00438 TAAC 0.00292 TAAG 0.0024 TAAT 0.0042 TACA 0.00631 TACC 0.00313 TACG 0.00253 TACT 0.00501 TAGA 0.00373 TAGC 0.0027 TAGG 0.00211 TAGT 0.00354 TATA 0.00508 TATC 0.00422 TATG 0.00391 TATT 0.00551 TCAA 0.00547 TCAC 0.00438 TCAG 0.00404 TCAT 0.00478 TCCA 0.00514 TCCC 0.00309 TCCG 0.00252 TCCT 0.00334 TCGA 0.00338 TCGC 0.00238 TCGG 0.0027 TCGT 0.00355 TCTA 0.00373 TCTC 0.00551 TCTG 0.00488 TCTT 0.00514 TGAA 0.00516 TGAC 0.00419 TGAG 0.0044 TGAT 0.00493 TGCA 0.00451 TGCC 0.00283 TGCG 0.00227 TGCT 0.0039 TGGA 0.00514 TGGC 0.0035 TGGG 0.0038 TGGT 0.00501 TGTA 0.0063 TGTC 0.00485 TGTG 0.00533 TGTT 0.00564 TTAA 0.0031 TTAC 0.00328 TTAG 0.00286 TTAT 0.00466 TTCA 0.00516 TTCC 0.00402 TTCG 0.00296 TTCT 0.00524 TTGA 0.00547 TTGC 0.00382 TTGG 0.00507 TTGT 0.00665 TTTA 0.00437 TTTC 0.00576 TTTG 0.00591 TTTT 0.00999 # l= 4 # Values AAAAA 0.0043 AAAAC 0.00171 AAAAG 0.00185 AAAAT 0.00213 AAACA 0.00192 AAACC 0.00117 AAACG 0.000981 AAACT 0.00117 AAAGA 0.00161 AAAGC 0.00087 AAAGG 0.000943 AAAGT 0.00133 AAATA 0.00195 AAATC 0.00125 AAATG 0.00151 AAATT 0.00136 AACAA 0.00177 AACAC 0.00129 AACAG 0.00127 AACAT 0.0013 AACCA 0.00133 AACCC 0.00097 AACCG 0.000729 AACCT 0.000911 AACGA 0.000863 AACGC 0.000576 AACGG 0.000756 AACGT 0.000667 AACTA 0.00101 AACTC 0.00113 AACTG 0.00112 AACTT 0.00107 AAGAA 0.00148 AAGAC 0.00117 AAGAG 0.00138 AAGAT 0.0011 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000774 AAGCG 0.0006 AAGCT 0.000823 AAGGA 0.000917 AAGGC 0.000626 AAGGG 0.000835 AAGGT 0.000843 AAGTA 0.00154 AAGTC 0.00099 AAGTG 0.00121 AAGTT 0.00107 AATAA 0.00164 AATAC 0.00129 AATAG 0.000921 AATAT 0.00166 AATCA 0.00139 AATCC 0.000777 AATCG 0.000779 AATCT 0.00107 AATGA 0.00139 AATGC 0.000839 AATGG 0.00122 AATGT 0.00139 AATTA 0.00123 AATTC 0.000898 AATTG 0.0013 AATTT 0.00136 ACAAA 0.00173 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00199 ACAAT 0.00151 ACACA 0.0017 ACACC 0.00115 ACACG 0.000849 ACACT 0.00124 ACAGA 0.0014 ACAGC 0.00115 ACAGG 0.000936 ACAGT 0.00177 ACATA 0.00129 ACATC 0.00112 ACATG 0.00146 ACATT 0.00139 ACCAA 0.00145 ACCAC 0.00129 ACCAG 0.00111 ACCAT 0.00116 ACCCA 0.00103 ACCCC 0.00094 ACCCG 0.000532 ACCCT 0.000838 ACCGA 0.000748 ACCGC 0.000606 ACCGG 0.000567 ACCGT 0.000716 ACCTA 0.000589 ACCTC 0.000986 ACCTG 0.000871 ACCTT 0.000843 ACGAA 0.000766 ACGAC 0.000889 ACGAG 0.00107 ACGAT 0.000819 ACGCA 0.000593 ACGCC 0.000547 ACGCG 0.000405 ACGCT 0.00055 ACGGA 0.00068 ACGGC 0.000652 ACGGG 0.000527 ACGGT 0.000716 ACGTA 0.000594 ACGTC 0.000749 ACGTG 0.0011 ACGTT 0.000667 ACTAA 0.000961 ACTAC 0.00113 ACTAG 0.000583 ACTAT 0.000861 ACTCA 0.00115 ACTCC 0.00102 ACTCG 0.00094 ACTCT 0.00122 ACTGA 0.00102 ACTGC 0.000922 ACTGG 0.000999 ACTGT 0.00177 ACTTA 0.000629 ACTTC 0.000981 ACTTG 0.00187 ACTTT 0.00133 AGAAA 0.0017 AGAAC 0.001 AGAAG 0.00139 AGAAT 0.00114 AGACA 0.00157 AGACC 0.000923 AGACG 0.000927 AGACT 0.00105 AGAGA 0.00168 AGAGC 0.00102 AGAGG 0.000981 AGAGT 0.00122 AGATA 0.00123 AGATC 0.000934 AGATG 0.00142 AGATT 0.00107 AGCAA 0.00113 AGCAC 0.000925 AGCAG 0.00104 AGCAT 0.000801 AGCCA 0.00102 AGCCC 0.000708 AGCCG 0.000684 AGCCT 0.000632 AGCGA 0.00069 AGCGC 0.000435 AGCGG 0.000561 AGCGT 0.00055 AGCTA 0.000867 AGCTC 0.000993 AGCTG 0.00111 AGCTT 0.000823 AGGAA 0.000945 AGGAC 0.000662 AGGAG 0.00106 AGGAT 0.000671 AGGCA 0.000666 AGGCC 0.000435 AGGCG 0.000499 AGGCT 0.000632 AGGGA 0.000772 AGGGC 0.000574 AGGGG 0.00078 AGGGT 0.000838 AGGTA 0.000693 AGGTC 0.000659 AGGTG 0.00103 AGGTT 0.000911 AGTAA 0.00104 AGTAC 0.00152 AGTAG 0.00114 AGTAT 0.00131 AGTCA 0.00111 AGTCC 0.000772 AGTCG 0.000803 AGTCT 0.00105 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.000877 AGTGG 0.00112 AGTGT 0.00124 AGTTA 0.000771 AGTTC 0.000888 AGTTG 0.0015 AGTTT 0.00117 ATAAA 0.00161 ATAAC 0.000902 ATAAG 0.000762 ATAAT 0.00138 ATACA 0.00167 ATACC 0.000931 ATACG 0.000749 ATACT 0.00131 ATAGA 0.00106 ATAGC 0.00074 ATAGG 0.000562 ATAGT 0.000861 ATATA 0.00203 ATATC 0.00135 ATATG 0.00115 ATATT 0.00166 ATCAA 0.00144 ATCAC 0.00121 ATCAG 0.00102 ATCAT 0.00126 ATCCA 0.00114 ATCCC 0.000699 ATCCG 0.000561 ATCCT 0.000671 ATCGA 0.00087 ATCGC 0.000613 ATCGG 0.000641 ATCGT 0.000819 ATCTA 0.000965 ATCTC 0.00137 ATCTG 0.00122 ATCTT 0.0011 ATGAA 0.00128 ATGAC 0.0011 ATGAG 0.00114 ATGAT 0.00126 ATGCA 0.00115 ATGCC 0.000644 ATGCG 0.000531 ATGCT 0.000801 ATGGA 0.00128 ATGGC 0.000909 ATGGG 0.000886 ATGGT 0.00116 ATGTA 0.0015 ATGTC 0.00118 ATGTG 0.00128 ATGTT 0.0013 ATTAA 0.00103 ATTAC 0.000985 ATTAG 0.000798 ATTAT 0.00138 ATTCA 0.00119 ATTCC 0.000911 ATTCG 0.000696 ATTCT 0.00114 ATTGA 0.0014 ATTGC 0.000897 ATTGG 0.00114 ATTGT 0.00151 ATTTA 0.00124 ATTTC 0.00134 ATTTG 0.00135 ATTTT 0.00213 CAAAA 0.00202 CAAAC 0.00142 CAAAG 0.00112 CAAAT 0.00135 CAACA 0.00163 CAACC 0.0012 CAACG 0.000755 CAACT 0.0015 CAAGA 0.00135 CAAGC 0.000941 CAAGG 0.0009 CAAGT 0.00187 CAATA 0.00136 CAATC 0.00106 CAATG 0.00123 CAATT 0.0013 CACAA 0.0015 CACAC 0.00139 CACAG 0.00115 CACAT 0.00128 CACCA 0.00158 CACCC 0.000937 CACCG 0.000699 CACCT 0.00103 CACGA 0.000779 CACGC 0.000563 CACGG 0.0006 CACGT 0.0011 CACTA 0.000901 CACTC 0.00116 CACTG 0.00105 CACTT 0.00121 CAGAA 0.00138 CAGAC 0.00117 CAGAG 0.00111 CAGAT 0.00122 CAGCA 0.00118 CAGCC 0.000913 CAGCG 0.000553 CAGCT 0.00111 CAGGA 0.000834 CAGGC 0.0006 CAGGG 0.000709 CAGGT 0.000871 CAGTA 0.00155 CAGTC 0.000993 CAGTG 0.00105 CAGTT 0.00112 CATAA 0.000923 CATAC 0.00119 CATAG 0.00065 CATAT 0.00115 CATCA 0.0013 CATCC 0.000828 CATCG 0.000669 CATCT 0.00142 CATGA 0.0011 CATGC 0.000873 CATGG 0.000991 CATGT 0.00146 CATTA 0.000992 CATTC 0.00111 CATTG 0.00123 CATTT 0.00151 CCAAA 0.00157 CCAAC 0.0013 CCAAG 0.00106 CCAAT 0.00114 CCACA 0.00135 CCACC 0.00124 CCACG 0.000666 CCACT 0.00112 CCAGA 0.0012 CCAGC 0.000862 CCAGG 0.000694 CCAGT 0.000999 CCATA 0.0009 CCATC 0.00112 CCATG 0.000991 CCATT 0.00122 CCCAA 0.00114 CCCAC 0.001 CCCAG 0.000772 CCCAT 0.000886 CCCCA 0.00109 CCCCC 0.000907 CCCCG 0.000505 CCCCT 0.00078 CCCGA 0.000552 CCCGC 0.000433 CCCGG 0.000399 CCCGT 0.000527 CCCTA 0.000567 CCCTC 0.000851 CCCTG 0.000709 CCCTT 0.000835 CCGAA 0.000744 CCGAC 0.000655 CCGAG 0.000658 CCGAT 0.000641 CCGCA 0.000566 CCGCC 0.000602 CCGCG 0.000307 CCGCT 0.000561 CCGGA 0.000507 CCGGC 0.000402 CCGGG 0.000399 CCGGT 0.000567 CCGTA 0.000553 CCGTC 0.000665 CCGTG 0.0006 CCGTT 0.000756 CCTAA 0.000519 CCTAC 0.00068 CCTAG 0.000353 CCTAT 0.000562 CCTCA 0.000855 CCTCC 0.00102 CCTCG 0.000612 CCTCT 0.000981 CCTGA 0.000746 CCTGC 0.000638 CCTGG 0.000694 CCTGT 0.000936 CCTTA 0.00049 CCTTC 0.000887 CCTTG 0.0009 CCTTT 0.000943 CGAAA 0.00103 CGAAC 0.000646 CGAAG 0.000589 CGAAT 0.000696 CGACA 0.001 CGACC 0.000585 CGACG 0.000566 CGACT 0.000803 CGAGA 0.000961 CGAGC 0.000629 CGAGG 0.000612 CGAGT 0.00094 CGATA 0.000916 CGATC 0.000579 CGATG 0.000669 CGATT 0.000779 CGCAA 0.00064 CGCAC 0.000584 CGCAG 0.000518 CGCAT 0.000531 CGCCA 0.000756 CGCCC 0.00049 CGCCG 0.00043 CGCCT 0.000499 CGCGA 0.000375 CGCGC 0.000306 CGCGG 0.000307 CGCGT 0.000405 CGCTA 0.000479 CGCTC 0.000604 CGCTG 0.000553 CGCTT 0.0006 CGGAA 0.000756 CGGAC 0.000522 CGGAG 0.000685 CGGAT 0.000561 CGGCA 0.000574 CGGCC 0.000426 CGGCG 0.00043 CGGCT 0.000684 CGGGA 0.000498 CGGGC 0.000377 CGGGG 0.000505 CGGGT 0.000532 CGGTA 0.000654 CGGTC 0.000556 CGGTG 0.000699 CGGTT 0.000729 CGTAA 0.000486 CGTAC 0.000783 CGTAG 0.00051 CGTAT 0.000749 CGTCA 0.000841 CGTCC 0.000559 CGTCG 0.000566 CGTCT 0.000927 CGTGA 0.000927 CGTGC 0.0006 CGTGG 0.000666 CGTGT 0.000849 CGTTA 0.000512 CGTTC 0.000613 CGTTG 0.000755 CGTTT 0.000981 CTAAA 0.000879 CTAAC 0.0007 CTAAG 0.000485 CTAAT 0.000798 CTACA 0.00152 CTACC 0.000694 CTACG 0.00051 CTACT 0.00114 CTAGA 0.000711 CTAGC 0.00047 CTAGG 0.000353 CTAGT 0.000583 CTATA 0.000863 CTATC 0.00079 CTATG 0.00065 CTATT 0.000921 CTCAA 0.0013 CTCAC 0.00103 CTCAG 0.000929 CTCAT 0.00114 CTCCA 0.00155 CTCCC 0.000872 CTCCG 0.000685 CTCCT 0.00106 CTCGA 0.000784 CTCGC 0.000624 CTCGG 0.000658 CTCGT 0.00107 CTCTA 0.000934 CTCTC 0.00147 CTCTG 0.00111 CTCTT 0.00138 CTGAA 0.00119 CTGAC 0.000901 CTGAG 0.000929 CTGAT 0.00102 CTGCA 0.00105 CTGCC 0.000706 CTGCG 0.000518 CTGCT 0.00104 CTGGA 0.00113 CTGGC 0.000742 CTGGG 0.000772 CTGGT 0.00111 CTGTA 0.0017 CTGTC 0.00114 CTGTG 0.00115 CTGTT 0.00127 CTTAA 0.000504 CTTAC 0.000651 CTTAG 0.000485 CTTAT 0.000762 CTTCA 0.00121 CTTCC 0.000962 CTTCG 0.000589 CTTCT 0.00139 CTTGA 0.00113 CTTGC 0.00088 CTTGG 0.00106 CTTGT 0.00199 CTTTA 0.000714 CTTTC 0.00107 CTTTG 0.00112 CTTTT 0.00185 GAAAA 0.00211 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00107 GAAAT 0.00134 GAACA 0.00117 GAACC 0.000866 GAACG 0.000613 GAACT 0.000888 GAAGA 0.00146 GAAGC 0.000831 GAAGG 0.000887 GAAGT 0.000981 GAATA 0.00103 GAATC 0.000904 GAATG 0.00111 GAATT 0.000898 GACAA 0.00137 GACAC 0.00116 GACAG 0.00114 GACAT 0.00118 GACCA 0.00102 GACCC 0.000735 GACCG 0.000556 GACCT 0.000659 GACGA 0.000926 GACGC 0.000554 GACGG 0.000665 GACGT 0.000749 GACTA 0.000771 GACTC 0.000982 GACTG 0.000993 GACTT 0.00099 GAGAA 0.0014 GAGAC 0.00128 GAGAG 0.00147 GAGAT 0.00137 GAGCA 0.000966 GAGCC 0.000751 GAGCG 0.000604 GAGCT 0.000993 GAGGA 0.00101 GAGGC 0.000624 GAGGG 0.000851 GAGGT 0.000986 GAGTA 0.00107 GAGTC 0.000982 GAGTG 0.00116 GAGTT 0.00113 GATAA 0.00101 GATAC 0.00107 GATAG 0.00079 GATAT 0.00135 GATCA 0.000965 GATCC 0.000666 GATCG 0.000579 GATCT 0.000934 GATGA 0.00123 GATGC 0.000749 GATGG 0.00112 GATGT 0.00112 GATTA 0.000804 GATTC 0.000904 GATTG 0.00106 GATTT 0.00125 GCAAA 0.00107 GCAAC 0.000968 GCAAG 0.00088 GCAAT 0.000897 GCACA 0.00101 GCACC 0.000771 GCACG 0.0006 GCACT 0.000877 GCAGA 0.000957 GCAGC 0.000796 GCAGG 0.000638 GCAGT 0.000922 GCATA 0.000669 GCATC 0.000749 GCATG 0.000873 GCATT 0.000839 GCCAA 0.00102 GCCAC 0.000831 GCCAG 0.000742 GCCAT 0.000909 GCCCA 0.000756 GCCCC 0.000548 GCCCG 0.000377 GCCCT 0.000574 GCCGA 0.000587 GCCGC 0.000476 GCCGG 0.000402 GCCGT 0.000652 GCCTA 0.000382 GCCTC 0.000624 GCCTG 0.0006 GCCTT 0.000626 GCGAA 0.000553 GCGAC 0.000586 GCGAG 0.000624 GCGAT 0.000613 GCGCA 0.000438 GCGCC 0.000397 GCGCG 0.000306 GCGCT 0.000435 GCGGA 0.000523 GCGGC 0.000476 GCGGG 0.000433 GCGGT 0.000606 GCGTA 0.000403 GCGTC 0.000554 GCGTG 0.000563 GCGTT 0.000576 GCTAA 0.000581 GCTAC 0.000906 GCTAG 0.00047 GCTAT 0.00074 GCTCA 0.000902 GCTCC 0.000762 GCTCG 0.000629 GCTCT 0.00102 GCTGA 0.000947 GCTGC 0.000796 GCTGG 0.000862 GCTGT 0.00115 GCTTA 0.000563 GCTTC 0.000831 GCTTG 0.000941 GCTTT 0.00087 GGAAA 0.00135 GGAAC 0.000799 GGAAG 0.000962 GGAAT 0.000911 GGACA 0.000897 GGACC 0.00061 GGACG 0.000559 GGACT 0.000772 GGAGA 0.00137 GGAGC 0.000762 GGAGG 0.00102 GGAGT 0.00102 GGATA 0.0008 GGATC 0.000666 GGATG 0.000828 GGATT 0.000777 GGCAA 0.000821 GGCAC 0.000663 GGCAG 0.000706 GGCAT 0.000644 GGCCA 0.000722 GGCCC 0.000466 GGCCG 0.000426 GGCCT 0.000435 GGCGA 0.00063 GGCGC 0.000397 GGCGG 0.000602 GGCGT 0.000547 GGCTA 0.000607 GGCTC 0.000751 GGCTG 0.000913 GGCTT 0.000774 GGGAA 0.000911 GGGAC 0.000607 GGGAG 0.000872 GGGAT 0.000699 GGGCA 0.00059 GGGCC 0.000466 GGGCG 0.00049 GGGCT 0.000708 GGGGA 0.000891 GGGGC 0.000548 GGGGG 0.000907 GGGGT 0.00094 GGGTA 0.000698 GGGTC 0.000735 GGGTG 0.000937 GGGTT 0.00097 GGTAA 0.000669 GGTAC 0.000833 GGTAG 0.000694 GGTAT 0.000931 GGTCA 0.000854 GGTCC 0.00061 GGTCG 0.000585 GGTCT 0.000923 GGTGA 0.00109 GGTGC 0.000771 GGTGG 0.00124 GGTGT 0.00115 GGTTA 0.000713 GGTTC 0.000866 GGTTG 0.0012 GGTTT 0.00117 GTAAA 0.000953 GTAAC 0.000689 GTAAG 0.000651 GTAAT 0.000985 GTACA 0.00204 GTACC 0.000833 GTACG 0.000783 GTACT 0.00152 GTAGA 0.00115 GTAGC 0.000906 GTAGG 0.00068 GTAGT 0.00113 GTATA 0.00111 GTATC 0.00107 GTATG 0.00119 GTATT 0.00129 GTCAA 0.00116 GTCAC 0.00103 GTCAG 0.000901 GTCAT 0.0011 GTCCA 0.00105 GTCCC 0.000607 GTCCG 0.000522 GTCCT 0.000662 GTCGA 0.000828 GTCGC 0.000586 GTCGG 0.000655 GTCGT 0.000889 GTCTA 0.000852 GTCTC 0.00128 GTCTG 0.00117 GTCTT 0.00117 GTGAA 0.00111 GTGAC 0.00103 GTGAG 0.00103 GTGAT 0.00121 GTGCA 0.00109 GTGCC 0.000663 GTGCG 0.000584 GTGCT 0.000925 GTGGA 0.00126 GTGGC 0.000831 GTGGG 0.001 GTGGT 0.00129 GTGTA 0.0011 GTGTC 0.00116 GTGTG 0.00139 GTGTT 0.00129 GTTAA 0.000632 GTTAC 0.000689 GTTAG 0.0007 GTTAT 0.000902 GTTCA 0.00109 GTTCC 0.000799 GTTCG 0.000646 GTTCT 0.001 GTTGA 0.00139 GTTGC 0.000968 GTTGG 0.0013 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.000861 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00142 GTTTT 0.00171 TAAAA 0.00156 TAAAC 0.000861 TAAAG 0.000714 TAAAT 0.00124 TAACA 0.000926 TAACC 0.000713 TAACG 0.000512 TAACT 0.000771 TAAGA 0.000721 TAAGC 0.000563 TAAGG 0.00049 TAAGT 0.000629 TAATA 0.00117 TAATC 0.000804 TAATG 0.000992 TAATT 0.00123 TACAA 0.00201 TACAC 0.0011 TACAG 0.0017 TACAT 0.0015 TACCA 0.00108 TACCC 0.000698 TACCG 0.000654 TACCT 0.000693 TACGA 0.000978 TACGC 0.000403 TACGG 0.000553 TACGT 0.000594 TACTA 0.000847 TACTC 0.00107 TACTG 0.00155 TACTT 0.00154 TAGAA 0.000978 TAGAC 0.000852 TAGAG 0.000934 TAGAT 0.000965 TAGCA 0.000745 TAGCC 0.000607 TAGCG 0.000479 TAGCT 0.000867 TAGGA 0.000576 TAGGC 0.000382 TAGGG 0.000567 TAGGT 0.000589 TAGTA 0.000847 TAGTC 0.000771 TAGTG 0.000901 TAGTT 0.00101 TATAA 0.00108 TATAC 0.00111 TATAG 0.000863 TATAT 0.00203 TATCA 0.00128 TATCC 0.0008 TATCG 0.000916 TATCT 0.00123 TATGA 0.00105 TATGC 0.000669 TATGG 0.0009 TATGT 0.00129 TATTA 0.00117 TATTC 0.00103 TATTG 0.00136 TATTT 0.00195 TCAAA 0.00155 TCAAC 0.00139 TCAAG 0.00113 TCAAT 0.0014 TCACA 0.00127 TCACC 0.00109 TCACG 0.000927 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00133 TCAGC 0.000947 TCAGG 0.000746 TCAGT 0.00102 TCATA 0.00105 TCATC 0.00123 TCATG 0.0011 TCATT 0.00139 TCCAA 0.00147 TCCAC 0.00126 TCCAG 0.00113 TCCAT 0.00128 TCCCA 0.000924 TCCCC 0.000891 TCCCG 0.000498 TCCCT 0.000772 TCCGA 0.000813 TCCGC 0.000523 TCCGG 0.000507 TCCGT 0.00068 TCCTA 0.000576 TCCTC 0.00101 TCCTG 0.000834 TCCTT 0.000917 TCGAA 0.000897 TCGAC 0.000828 TCGAG 0.000784 TCGAT 0.00087 TCGCA 0.000677 TCGCC 0.00063 TCGCG 0.000375 TCGCT 0.00069 TCGGA 0.000813 TCGGC 0.000587 TCGGG 0.000552 TCGGT 0.000748 TCGTA 0.000978 TCGTC 0.000926 TCGTG 0.000779 TCGTT 0.000863 TCTAA 0.000804 TCTAC 0.00115 TCTAG 0.000711 TCTAT 0.00106 TCTCA 0.00149 TCTCC 0.00137 TCTCG 0.000961 TCTCT 0.00168 TCTGA 0.00133 TCTGC 0.000957 TCTGG 0.0012 TCTGT 0.0014 TCTTA 0.000721 TCTTC 0.00146 TCTTG 0.00135 TCTTT 0.00161 TGAAA 0.00168 TGAAC 0.00109 TGAAG 0.00121 TGAAT 0.00119 TGACA 0.00138 TGACC 0.000854 TGACG 0.000841 TGACT 0.00111 TGAGA 0.00149 TGAGC 0.000902 TGAGG 0.000855 TGAGT 0.00115 TGATA 0.00128 TGATC 0.000965 TGATG 0.0013 TGATT 0.00139 TGCAA 0.00122 TGCAC 0.00109 TGCAG 0.00105 TGCAT 0.00115 TGCCA 0.001 TGCCC 0.00059 TGCCG 0.000574 TGCCT 0.000666 TGCGA 0.000677 TGCGC 0.000438 TGCGG 0.000566 TGCGT 0.000593 TGCTA 0.000745 TGCTC 0.000966 TGCTG 0.00118 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00141 TGGAC 0.00105 TGGAG 0.00155 TGGAT 0.00114 TGGCA 0.001 TGGCC 0.000722 TGGCG 0.000756 TGGCT 0.00102 TGGGA 0.000924 TGGGC 0.000756 TGGGG 0.00109 TGGGT 0.00103 TGGTA 0.00108 TGGTC 0.00102 TGGTG 0.00158 TGGTT 0.00133 TGTAA 0.00108 TGTAC 0.00204 TGTAG 0.00152 TGTAT 0.00167 TGTCA 0.00138 TGTCC 0.000897 TGTCG 0.001 TGTCT 0.00157 TGTGA 0.00127 TGTGC 0.00101 TGTGG 0.00135 TGTGT 0.0017 TGTTA 0.000926 TGTTC 0.00117 TGTTG 0.00163 TGTTT 0.00192 TTAAA 0.000932 TTAAC 0.000632 TTAAG 0.000504 TTAAT 0.00103 TTACA 0.00108 TTACC 0.000669 TTACG 0.000486 TTACT 0.00104 TTAGA 0.000804 TTAGC 0.000581 TTAGG 0.000519 TTAGT 0.000961 TTATA 0.00108 TTATC 0.00101 TTATG 0.000923 TTATT 0.00164 TTCAA 0.00157 TTCAC 0.00111 TTCAG 0.00119 TTCAT 0.00128 TTCCA 0.00141 TTCCC 0.000911 TTCCG 0.000756 TTCCT 0.000945 TTCGA 0.000897 TTCGC 0.000553 TTCGG 0.000744 TTCGT 0.000766 TTCTA 0.000978 TTCTC 0.0014 TTCTG 0.00138 TTCTT 0.00148 TTGAA 0.00157 TTGAC 0.00116 TTGAG 0.0013 TTGAT 0.00144 TTGCA 0.00122 TTGCC 0.000821 TTGCG 0.00064 TTGCT 0.00113 TTGGA 0.00147 TTGGC 0.00102 TTGGG 0.00114 TTGGT 0.00145 TTGTA 0.00201 TTGTC 0.00137 TTGTG 0.0015 TTGTT 0.00177 TTTAA 0.000932 TTTAC 0.000953 TTTAG 0.000879 TTTAT 0.00161 TTTCA 0.00168 TTTCC 0.00135 TTTCG 0.00103 TTTCT 0.0017 TTTGA 0.00155 TTTGC 0.00107 TTTGG 0.00157 TTTGT 0.00173 TTTTA 0.00156 TTTTC 0.00211 TTTTG 0.00202 TTTTT 0.0043 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4366 AAAAC 0.1676 AAAAG 0.1793 AAAAT 0.2164 AAACA 0.3683 AAACC 0.221 AAACG 0.1845 AAACT 0.2262 AAAGA 0.3423 AAAGC 0.1808 AAAGG 0.1971 AAAGT 0.2797 AAATA 0.3262 AAATC 0.2029 AAATG 0.2446 AAATT 0.2263 AACAA 0.316 AACAC 0.226 AACAG 0.2239 AACAT 0.2342 AACCA 0.341 AACCC 0.2448 AACCG 0.1818 AACCT 0.2324 AACGA 0.3069 AACGC 0.1999 AACGG 0.2602 AACGT 0.233 AACTA 0.2371 AACTC 0.2557 AACTG 0.2587 AACTT 0.2485 AAGAA 0.2932 AAGAC 0.2231 AAGAG 0.2662 AAGAT 0.2174 AAGCA 0.3163 AAGCC 0.2398 AAGCG 0.1833 AAGCT 0.2606 AAGGA 0.2877 AAGGC 0.192 AAGGG 0.2589 AAGGT 0.2614 AAGTA 0.3242 AAGTC 0.2051 AAGTG 0.2464 AAGTT 0.2243 AATAA 0.3047 AATAC 0.2298 AATAG 0.1631 AATAT 0.3025 AATCA 0.3496 AATCC 0.1923 AATCG 0.1907 AATCT 0.2675 AATGA 0.2932 AATGC 0.1715 AATGG 0.2478 AATGT 0.2874 AATTA 0.2591 AATTC 0.1874 AATTG 0.2667 AATTT 0.2869 ACAAA 0.2629 ACAAC 0.2129 ACAAG 0.2947 ACAAT 0.2296 ACACA 0.3447 ACACC 0.2319 ACACG 0.17 ACACT 0.2533 ACAGA 0.2673 ACAGC 0.2176 ACAGG 0.1756 ACAGT 0.3395 ACATA 0.2478 ACATC 0.2142 ACATG 0.2717 ACATT 0.2663 ACCAA 0.2923 ACCAC 0.2524 ACCAG 0.2217 ACCAT 0.2336 ACCCA 0.3093 ACCCC 0.2802 ACCCG 0.1578 ACCCT 0.2527 ACCGA 0.2879 ACCGC 0.227 ACCGG 0.213 ACCGT 0.2721 ACCTA 0.18 ACCTC 0.2973 ACCTG 0.2654 ACCTT 0.2573 ACGAA 0.2192 ACGAC 0.2481 ACGAG 0.2993 ACGAT 0.2334 ACGCA 0.2834 ACGCC 0.2591 ACGCG 0.1929 ACGCT 0.2646 ACGGA 0.2668 ACGGC 0.2509 ACGGG 0.2038 ACGGT 0.2785 ACGTA 0.1921 ACGTC 0.2393 ACGTG 0.3524 ACGTT 0.2161 ACTAA 0.2738 ACTAC 0.3177 ACTAG 0.1631 ACTAT 0.2455 ACTCA 0.2686 ACTCC 0.2352 ACTCG 0.2146 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2204 ACTGC 0.1931 ACTGG 0.2098 ACTGT 0.3767 ACTTA 0.1328 ACTTC 0.2076 ACTTG 0.3843 ACTTT 0.2754 AGAAA 0.3241 AGAAC 0.1901 AGAAG 0.2626 AGAAT 0.2231 AGACA 0.3505 AGACC 0.2064 AGACG 0.2045 AGACT 0.2387 AGAGA 0.3443 AGAGC 0.2081 AGAGG 0.1987 AGAGT 0.2489 AGATA 0.266 AGATC 0.1999 AGATG 0.3012 AGATT 0.2329 AGCAA 0.2903 AGCAC 0.2365 AGCAG 0.2657 AGCAT 0.2074 AGCCA 0.3366 AGCCC 0.231 AGCCG 0.222 AGCCT 0.2104 AGCGA 0.3096 AGCGC 0.1946 AGCGG 0.2477 AGCGT 0.2481 AGCTA 0.2291 AGCTC 0.2593 AGCTG 0.2918 AGCTT 0.2198 AGGAA 0.2879 AGGAC 0.1963 AGGAG 0.3107 AGGAT 0.2051 AGGCA 0.3004 AGGCC 0.1921 AGGCG 0.2202 AGGCT 0.2873 AGGGA 0.2646 AGGGC 0.1896 AGGGG 0.262 AGGGT 0.2838 AGGTA 0.2142 AGGTC 0.2009 AGGTG 0.3068 AGGTT 0.2781 AGTAA 0.2117 AGTAC 0.3013 AGTAG 0.2231 AGTAT 0.2638 AGTCA 0.3002 AGTCC 0.2062 AGTCG 0.2117 AGTCT 0.2819 AGTGA 0.2539 AGTGC 0.2 AGTGG 0.2588 AGTGT 0.2873 AGTTA 0.1782 AGTTC 0.207 AGTTG 0.344 AGTTT 0.2708 ATAAA 0.3536 ATAAC 0.1891 ATAAG 0.1605 ATAAT 0.2968 ATACA 0.3574 ATACC 0.1994 ATACG 0.1587 ATACT 0.2845 ATAGA 0.3307 ATAGC 0.2266 ATAGG 0.1736 ATAGT 0.269 ATATA 0.3301 ATATC 0.2162 ATATG 0.1832 ATATT 0.2705 ATCAA 0.2957 ATCAC 0.2407 ATCAG 0.2063 ATCAT 0.2574 ATCCA 0.3706 ATCCC 0.2272 ATCCG 0.18 ATCCT 0.2222 ATCGA 0.3 ATCGC 0.2036 ATCGG 0.2172 ATCGT 0.2792 ATCTA 0.2087 ATCTC 0.2907 ATCTG 0.2607 ATCTT 0.2399 ATGAA 0.2707 ATGAC 0.227 ATGAG 0.2361 ATGAT 0.2663 ATGCA 0.3706 ATGCC 0.2054 ATGCG 0.1669 ATGCT 0.2571 ATGGA 0.3037 ATGGC 0.2125 ATGGG 0.2084 ATGGT 0.2755 ATGTA 0.2865 ATGTC 0.2232 ATGTG 0.2393 ATGTT 0.251 ATTAA 0.2484 ATTAC 0.2336 ATTAG 0.187 ATTAT 0.3311 ATTCA 0.3037 ATTCC 0.2279 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.295 ATTGA 0.2867 ATTGC 0.1785 ATTGG 0.2297 ATTGT 0.3051 ATTTA 0.2058 ATTTC 0.2192 ATTTG 0.2184 ATTTT 0.3567 CAAAA 0.3464 CAAAC 0.2338 CAAAG 0.1872 CAAAT 0.2325 CAACA 0.3226 CAACC 0.2312 CAACG 0.1464 CAACT 0.2998 CAAGA 0.2689 CAAGC 0.1833 CAAGG 0.1756 CAAGT 0.3722 CAATA 0.2781 CAATC 0.2115 CAATG 0.2455 CAATT 0.2649 CACAA 0.2854 CACAC 0.2546 CACAG 0.2169 CACAT 0.2431 CACCA 0.375 CACCC 0.2197 CACCG 0.1622 CACCT 0.2431 CACGA 0.2602 CACGC 0.1809 CACGG 0.1946 CACGT 0.3643 CACTA 0.2096 CACTC 0.2663 CACTG 0.2422 CACTT 0.2819 CAGAA 0.2881 CAGAC 0.2344 CAGAG 0.2253 CAGAT 0.2522 CAGCA 0.3147 CAGCC 0.2416 CAGCG 0.1448 CAGCT 0.2989 CAGGA 0.2813 CAGGC 0.1957 CAGGG 0.2319 CAGGT 0.2911 CAGTA 0.3334 CAGTC 0.2075 CAGTG 0.2183 CAGTT 0.2407 CATAA 0.2384 CATAC 0.2989 CATAG 0.1661 CATAT 0.2967 CATCA 0.3118 CATCC 0.1932 CATCG 0.1577 CATCT 0.3373 CATGA 0.2532 CATGC 0.1959 CATGG 0.2214 CATGT 0.3296 CATTA 0.2073 CATTC 0.2269 CATTG 0.2509 CATTT 0.3149 CCAAA 0.3079 CCAAC 0.2545 CCAAG 0.2078 CCAAT 0.2298 CCACA 0.3087 CCACC 0.2797 CCACG 0.151 CCACT 0.2606 CCAGA 0.323 CCAGC 0.2249 CCAGG 0.1849 CCAGT 0.2671 CCATA 0.2168 CCATC 0.2626 CCATG 0.2305 CCATT 0.2901 CCCAA 0.3004 CCCAC 0.2592 CCCAG 0.2034 CCCAT 0.237 CCCCA 0.3316 CCCCC 0.2772 CCCCG 0.1524 CCCCT 0.2388 CCCGA 0.292 CCCGC 0.2219 CCCGG 0.21 CCCGT 0.2762 CCCTA 0.1931 CCCTC 0.2832 CCCTG 0.2375 CCCTT 0.2862 CCGAA 0.2787 CCGAC 0.2378 CCGAG 0.2416 CCGAT 0.2419 CCGCA 0.2803 CCGCC 0.2929 CCGCG 0.1501 CCGCT 0.2767 CCGGA 0.2729 CCGGC 0.2103 CCGGG 0.2147 CCGGT 0.3022 CCGTA 0.2187 CCGTC 0.2549 CCGTG 0.2307 CCGTT 0.2958 CCTAA 0.2444 CCTAC 0.3177 CCTAG 0.1689 CCTAT 0.269 CCTCA 0.25 CCTCC 0.2894 CCTCG 0.1751 CCTCT 0.2855 CCTGA 0.2516 CCTGC 0.2082 CCTGG 0.2306 CCTGT 0.3096 CCTTA 0.155 CCTTC 0.2753 CCTTG 0.2752 CCTTT 0.2946 CGAAA 0.3474 CGAAC 0.2161 CGAAG 0.1994 CGAAT 0.2371 CGACA 0.3399 CGACC 0.1966 CGACG 0.189 CGACT 0.2746 CGAGA 0.31 CGAGC 0.1972 CGAGG 0.1928 CGAGT 0.3001 CGATA 0.3116 CGATC 0.1956 CGATG 0.2262 CGATT 0.2666 CGCAA 0.2844 CGCAC 0.2517 CGCAG 0.2274 CGCAT 0.2364 CGCCA 0.3499 CGCCC 0.2223 CGCCG 0.1957 CGCCT 0.2321 CGCGA 0.2747 CGCGC 0.2164 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2919 CGCTA 0.2165 CGCTC 0.267 CGCTG 0.2467 CGCTT 0.2698 CGGAA 0.302 CGGAC 0.2041 CGGAG 0.2689 CGGAT 0.225 CGGCA 0.2757 CGGCC 0.1956 CGGCG 0.2008 CGGCT 0.3279 CGGGA 0.2628 CGGGC 0.193 CGGGG 0.2641 CGGGT 0.28 CGGTA 0.2509 CGGTC 0.2088 CGGTG 0.2619 CGGTT 0.2784 CGTAA 0.1962 CGTAC 0.3046 CGTAG 0.1992 CGTAT 0.3 CGTCA 0.2947 CGTCC 0.1913 CGTCG 0.1934 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.31 CGTGC 0.1952 CGTGG 0.2164 CGTGT 0.2784 CGTTA 0.1797 CGTTC 0.2162 CGTTG 0.2609 CGTTT 0.3431 CTAAA 0.3091 CTAAC 0.2409 CTAAG 0.1676 CTAAT 0.2824 CTACA 0.3966 CTACC 0.1783 CTACG 0.1294 CTACT 0.2957 CTAGA 0.3395 CTAGC 0.2185 CTAGG 0.1674 CTAGT 0.2745 CTATA 0.2683 CTATC 0.2415 CTATG 0.2024 CTATT 0.2878 CTCAA 0.2984 CTCAC 0.2286 CTCAG 0.2108 CTCAT 0.2622 CTCCA 0.3746 CTCCC 0.2068 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.2554 CTCGA 0.2538 CTCGC 0.1961 CTCGG 0.2076 CTCGT 0.3426 CTCTA 0.1931 CTCTC 0.2953 CTCTG 0.2263 CTCTT 0.2853 CTGAA 0.2979 CTGAC 0.2194 CTGAG 0.2272 CTGAT 0.2555 CTGCA 0.3173 CTGCC 0.2111 CTGCG 0.1546 CTGCT 0.317 CTGGA 0.3052 CTGGC 0.1946 CTGGG 0.2031 CTGGT 0.2971 CTGTA 0.3268 CTGTC 0.2132 CTGTG 0.2166 CTGTT 0.2434 CTTAA 0.2131 CTTAC 0.2705 CTTAG 0.1977 CTTAT 0.3187 CTTCA 0.2925 CTTCC 0.2297 CTTCG 0.1412 CTTCT 0.3365 CTTGA 0.2296 CTTGC 0.1704 CTTGG 0.208 CTTGT 0.392 CTTTA 0.1522 CTTTC 0.2248 CTTTG 0.2324 CTTTT 0.3906 GAAAA 0.3663 GAAAC 0.2125 GAAAG 0.1841 GAAAT 0.2371 GAACA 0.3316 GAACC 0.2414 GAACG 0.1717 GAACT 0.2553 GAAGA 0.3503 GAAGC 0.1979 GAAGG 0.2107 GAAGT 0.2412 GAATA 0.2648 GAATC 0.2294 GAATG 0.2751 GAATT 0.2307 GACAA 0.2836 GACAC 0.2349 GACAG 0.2334 GACAT 0.248 GACCA 0.3466 GACCC 0.2451 GACCG 0.183 GACCT 0.2253 GACGA 0.3236 GACGC 0.1901 GACGG 0.2262 GACGT 0.2602 GACTA 0.2068 GACTC 0.2622 GACTG 0.263 GACTT 0.268 GAGAA 0.2584 GAGAC 0.229 GAGAG 0.262 GAGAT 0.2506 GAGCA 0.2937 GAGCC 0.2261 GAGCG 0.1782 GAGCT 0.302 GAGGA 0.2934 GAGGC 0.178 GAGGG 0.2426 GAGGT 0.286 GAGTA 0.2481 GAGTC 0.2271 GAGTG 0.2636 GAGTT 0.2613 GATAA 0.2417 GATAC 0.2507 GATAG 0.1834 GATAT 0.3242 GATCA 0.31 GATCC 0.21 GATCG 0.1818 GATCT 0.2983 GATGA 0.2938 GATGC 0.1752 GATGG 0.2615 GATGT 0.2695 GATTA 0.2018 GATTC 0.2266 GATTG 0.2588 GATTT 0.3128 GCAAA 0.2813 GCAAC 0.2516 GCAAG 0.228 GCAAT 0.2391 GCACA 0.3137 GCACC 0.2341 GCACG 0.1824 GCACT 0.2698 GCAGA 0.2899 GCAGC 0.237 GCAGG 0.1913 GCAGT 0.2819 GCATA 0.2152 GCATC 0.2377 GCATG 0.2757 GCATT 0.2714 GCCAA 0.2914 GCCAC 0.2331 GCCAG 0.2122 GCCAT 0.2633 GCCCA 0.3385 GCCCC 0.2416 GCCCG 0.1646 GCCCT 0.2553 GCCGA 0.2808 GCCGC 0.222 GCCGG 0.1874 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.1735 GCCTC 0.2768 GCCTG 0.267 GCCTT 0.2827 GCGAA 0.236 GCGAC 0.2425 GCGAG 0.2616 GCGAT 0.2599 GCGCA 0.2804 GCGCC 0.2479 GCGCG 0.1925 GCGCT 0.2792 GCGGA 0.2603 GCGGC 0.2309 GCGGG 0.2103 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.1952 GCGTC 0.2629 GCGTG 0.2632 GCGTT 0.2787 GCTAA 0.2144 GCTAC 0.3342 GCTAG 0.174 GCTAT 0.2773 GCTCA 0.2751 GCTCC 0.2254 GCTCG 0.1871 GCTCT 0.3123 GCTGA 0.2556 GCTGC 0.2082 GCTGG 0.2265 GCTGT 0.3097 GCTTA 0.1774 GCTTC 0.2606 GCTTG 0.2896 GCTTT 0.2724 GGAAA 0.3364 GGAAC 0.1973 GGAAG 0.2377 GGAAT 0.2286 GGACA 0.3178 GGACC 0.2119 GGACG 0.1935 GGACT 0.2768 GGAGA 0.3302 GGAGC 0.1797 GGAGG 0.2411 GGAGT 0.2489 GGATA 0.2633 GGATC 0.2157 GGATG 0.2645 GGATT 0.2565 GGCAA 0.2895 GGCAC 0.2321 GGCAG 0.247 GGCAT 0.2314 GGCCA 0.3552 GGCCC 0.2266 GGCCG 0.2028 GGCCT 0.2154 GGCGA 0.2915 GGCGC 0.1805 GGCGG 0.2741 GGCGT 0.254 GGCTA 0.1989 GGCTC 0.246 GGCTG 0.2988 GGCTT 0.2563 GGGAA 0.2978 GGGAC 0.1951 GGGAG 0.2766 GGGAT 0.2304 GGGCA 0.2635 GGGCC 0.2043 GGGCG 0.2133 GGGCT 0.3189 GGGGA 0.273 GGGGC 0.1634 GGGGG 0.277 GGGGT 0.2867 GGGTA 0.212 GGGTC 0.2183 GGGTG 0.277 GGGTT 0.2926 GGTAA 0.2153 GGTAC 0.2634 GGTAG 0.2196 GGTAT 0.3017 GGTCA 0.2917 GGTCC 0.2021 GGTCG 0.1942 GGTCT 0.312 GGTGA 0.2614 GGTGC 0.1794 GGTGG 0.2872 GGTGT 0.272 GGTTA 0.183 GGTTC 0.2204 GGTTG 0.2988 GGTTT 0.2979 GTAAA 0.2915 GTAAC 0.2069 GTAAG 0.1977 GTAAT 0.3039 GTACA 0.3964 GTACC 0.1592 GTACG 0.1473 GTACT 0.2972 GTAGA 0.2987 GTAGC 0.2318 GTAGG 0.174 GTAGT 0.2955 GTATA 0.2398 GTATC 0.2281 GTATG 0.2518 GTATT 0.2803 GTCAA 0.2779 GTCAC 0.2434 GTCAG 0.2138 GTCAT 0.2648 GTCCA 0.3692 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1812 GTCCT 0.2361 GTCGA 0.2839 GTCGC 0.1942 GTCGG 0.2183 GTCGT 0.3036 GTCTA 0.191 GTCTC 0.285 GTCTG 0.2599 GTCTT 0.2641 GTGAA 0.2575 GTGAC 0.2335 GTGAG 0.2304 GTGAT 0.2787 GTGCA 0.333 GTGCC 0.203 GTGCG 0.1751 GTGCT 0.2889 GTGGA 0.2904 GTGGC 0.187 GTGGG 0.2266 GTGGT 0.296 GTGTA 0.2262 GTGTC 0.2323 GTGTG 0.2754 GTGTT 0.2662 GTTAA 0.2191 GTTAC 0.2345 GTTAG 0.2353 GTTAT 0.3111 GTTCA 0.31 GTTCC 0.2239 GTTCG 0.1798 GTTCT 0.2862 GTTGA 0.2773 GTTGC 0.1872 GTTGG 0.2535 GTTGT 0.282 GTTTA 0.1667 GTTTC 0.2364 GTTTG 0.2644 GTTTT 0.3325 TAAAA 0.3652 TAAAC 0.1914 TAAAG 0.1591 TAAAT 0.2843 TAACA 0.3217 TAACC 0.2415 TAACG 0.1719 TAACT 0.2648 TAAGA 0.3037 TAAGC 0.2301 TAAGG 0.2026 TAAGT 0.2636 TAATA 0.2795 TAATC 0.1901 TAATG 0.2338 TAATT 0.2967 TACAA 0.32 TACAC 0.1718 TACAG 0.2689 TACAT 0.2392 TACCA 0.3487 TACCC 0.222 TACCG 0.2052 TACCT 0.2241 TACGA 0.3886 TACGC 0.1586 TACGG 0.2181 TACGT 0.2347 TACTA 0.1712 TACTC 0.2096 TACTG 0.3093 TACTT 0.31 TAGAA 0.2684 TAGAC 0.2225 TAGAG 0.2484 TAGAT 0.2608 TAGCA 0.2785 TAGCC 0.222 TAGCG 0.1755 TAGCT 0.324 TAGGA 0.2759 TAGGC 0.1794 TAGGG 0.266 TAGGT 0.2786 TAGTA 0.2437 TAGTC 0.2154 TAGTG 0.2495 TAGTT 0.2914 TATAA 0.2143 TATAC 0.2152 TATAG 0.1664 TATAT 0.4041 TATCA 0.3056 TATCC 0.1888 TATCG 0.2132 TATCT 0.2923 TATGA 0.2714 TATGC 0.1684 TATGG 0.2292 TATGT 0.331 TATTA 0.2117 TATTC 0.1866 TATTG 0.2429 TATTT 0.3588 TCAAA 0.2847 TCAAC 0.2506 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2582 TCACA 0.2935 TCACC 0.2476 TCACG 0.2103 TCACT 0.2486 TCAGA 0.33 TCAGC 0.2311 TCAGG 0.1836 TCAGT 0.2554 TCATA 0.2215 TCATC 0.2546 TCATG 0.2276 TCATT 0.2963 TCCAA 0.2885 TCCAC 0.2405 TCCAG 0.2212 TCCAT 0.2499 TCCCA 0.3002 TCCCC 0.287 TCCCG 0.1594 TCCCT 0.2534 TCCGA 0.326 TCCGC 0.205 TCCGG 0.1992 TCCGT 0.2699 TCCTA 0.1743 TCCTC 0.2981 TCCTG 0.2507 TCCTT 0.2769 TCGAA 0.2696 TCGAC 0.2406 TCGAG 0.2298 TCGAT 0.2601 TCGCA 0.2869 TCGCC 0.2621 TCGCG 0.16 TCGCT 0.291 TCGGA 0.3041 TCGGC 0.2146 TCGGG 0.2033 TCGGT 0.278 TCGTA 0.276 TCGTC 0.2584 TCGTG 0.2185 TCGTT 0.2471 TCTAA 0.2189 TCTAC 0.3042 TCTAG 0.191 TCTAT 0.2859 TCTCA 0.2746 TCTCC 0.2452 TCTCG 0.1742 TCTCT 0.306 TCTGA 0.2754 TCTGC 0.1921 TCTGG 0.2454 TCTGT 0.287 TCTTA 0.1431 TCTTC 0.282 TCTTG 0.2596 TCTTT 0.3152 TGAAA 0.3261 TGAAC 0.2091 TGAAG 0.2317 TGAAT 0.2331 TGACA 0.3312 TGACC 0.2031 TGACG 0.1979 TGACT 0.2677 TGAGA 0.3418 TGAGC 0.2028 TGAGG 0.1926 TGAGT 0.2628 TGATA 0.2602 TGATC 0.1944 TGATG 0.2606 TGATT 0.2848 TGCAA 0.2723 TGCAC 0.2369 TGCAG 0.2311 TGCAT 0.2598 TGCCA 0.3563 TGCCC 0.2056 TGCCG 0.2011 TGCCT 0.237 TGCGA 0.3 TGCGC 0.192 TGCGG 0.2467 TGCGT 0.2612 TGCTA 0.1925 TGCTC 0.2465 TGCTG 0.3003 TGCTT 0.2607 TGGAA 0.2801 TGGAC 0.2 TGGAG 0.297 TGGAT 0.2229 TGGCA 0.2895 TGGCC 0.2031 TGGCG 0.2128 TGGCT 0.2946 TGGGA 0.2456 TGGGC 0.197 TGGGG 0.2852 TGGGT 0.2723 TGGTA 0.2188 TGGTC 0.2028 TGGTG 0.3106 TGGTT 0.2678 TGTAA 0.1747 TGTAC 0.3212 TGTAG 0.2392 TGTAT 0.2649 TGTCA 0.2893 TGTCC 0.1843 TGTCG 0.2041 TGTCT 0.3223 TGTGA 0.2437 TGTGC 0.1891 TGTGG 0.2493 TGTGT 0.3179 TGTTA 0.167 TGTTC 0.2074 TGTTG 0.2856 TGTTT 0.3401 TTAAA 0.306 TTAAC 0.1996 TTAAG 0.1608 TTAAT 0.3337 TTACA 0.332 TTACC 0.2003 TTACG 0.1461 TTACT 0.3216 TTAGA 0.2857 TTAGC 0.1977 TTAGG 0.178 TTAGT 0.3386 TTATA 0.2316 TTATC 0.2133 TTATG 0.1947 TTATT 0.3604 TTCAA 0.3081 TTCAC 0.2123 TTCAG 0.2297 TTCAT 0.2499 TTCCA 0.3548 TTCCC 0.2237 TTCCG 0.1839 TTCCT 0.2376 TTCGA 0.3085 TTCGC 0.1833 TTCGG 0.2481 TTCGT 0.2601 TTCTA 0.1891 TTCTC 0.2639 TTCTG 0.2621 TTCTT 0.2848 TTGAA 0.2911 TTGAC 0.2078 TTGAG 0.2343 TTGAT 0.2668 TTGCA 0.322 TTGCC 0.2131 TTGCG 0.1665 TTGCT 0.2984 TTGGA 0.2934 TTGGC 0.1968 TTGGG 0.2211 TTGGT 0.2886 TTGTA 0.3047 TTGTC 0.2029 TTGTG 0.2233 TTGTT 0.2692 TTTAA 0.2168 TTTAC 0.2132 TTTAG 0.1948 TTTAT 0.3753 TTTCA 0.2945 TTTCC 0.2325 TTTCG 0.176 TTTCT 0.297 TTTGA 0.2672 TTTGC 0.1775 TTTGG 0.2601 TTTGT 0.2952 TTTTA 0.1604 TTTTC 0.2055 TTTTG 0.1975 TTTTT 0.4366 [3] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.273 C 0.227 G 0.227 T 0.273 # l= 1 # Values AA 0.0768 AC 0.0656 AG 0.0615 AT 0.0693 CA 0.0721 CC 0.0516 CG 0.0417 CT 0.0616 GA 0.0639 GC 0.0459 GG 0.0515 GT 0.0655 TA 0.0605 TC 0.0639 TG 0.072 TT 0.0768 # l= 2 # Values AAA 0.0254 AAC 0.0167 AAG 0.0162 AAT 0.0185 ACA 0.0222 ACC 0.0145 ACG 0.0116 ACT 0.0173 AGA 0.0191 AGC 0.0132 AGG 0.0119 AGT 0.0173 ATA 0.0182 ATC 0.0154 ATG 0.0172 ATT 0.0185 CAA 0.0209 CAC 0.0174 CAG 0.0165 CAT 0.0173 CCA 0.0177 CCC 0.0123 CCG 0.00954 CCT 0.012 CGA 0.0121 CGC 0.00843 CGG 0.00954 CGT 0.0116 CTA 0.012 CTC 0.0168 CTG 0.0165 CTT 0.0163 GAA 0.017 GAC 0.0147 GAG 0.0168 GAT 0.0154 GCA 0.0138 GCC 0.0105 GCG 0.00842 GCT 0.0132 GGA 0.0142 GGC 0.0105 GGG 0.0123 GGT 0.0145 GTA 0.0169 GTC 0.0147 GTG 0.0173 GTT 0.0167 TAA 0.0135 TAC 0.0169 TAG 0.012 TAT 0.0182 TCA 0.0184 TCC 0.0142 TCG 0.0121 TCT 0.0191 TGA 0.0184 TGC 0.0138 TGG 0.0177 TGT 0.0221 TTA 0.0135 TTC 0.0171 TTG 0.0209 TTT 0.0253 # l= 3 # Values AAAA 0.00963 AAAC 0.00521 AAAG 0.00471 AAAT 0.0058 AACA 0.00556 AACC 0.00398 AACG 0.00289 AACT 0.00425 AAGA 0.00506 AAGC 0.00322 AAGG 0.00323 AAGT 0.00474 AATA 0.00528 AATC 0.00392 AATG 0.00473 AATT 0.00457 ACAA 0.0066 ACAC 0.00507 ACAG 0.00527 ACAT 0.0052 ACCA 0.00505 ACCC 0.00341 ACCG 0.00273 ACCT 0.00332 ACGA 0.00357 ACGC 0.00217 ACGG 0.00266 ACGT 0.00317 ACTA 0.00349 ACTC 0.00436 ACTG 0.0047 ACTT 0.00474 AGAA 0.00509 AGAC 0.00453 AGAG 0.00492 AGAT 0.00458 AGCA 0.00395 AGCC 0.00312 AGCG 0.00232 AGCT 0.00381 AGGA 0.00333 AGGC 0.00229 AGGG 0.00302 AGGT 0.00331 AGTA 0.00494 AGTC 0.00373 AGTG 0.00438 AGTT 0.00425 ATAA 0.00447 ATAC 0.00459 ATAG 0.00318 ATAT 0.00595 ATCA 0.00481 ATCC 0.00306 ATCG 0.00294 ATCT 0.00458 ATGA 0.00467 ATGC 0.00314 ATGG 0.00424 ATGT 0.0052 ATTA 0.00404 ATTC 0.00381 ATTG 0.00485 ATTT 0.0058 CAAA 0.00588 CAAC 0.00511 CAAG 0.00508 CAAT 0.00486 CACA 0.00543 CACC 0.00439 CACG 0.00314 CACT 0.00438 CAGA 0.00488 CAGC 0.00384 CAGG 0.00305 CAGT 0.0047 CATA 0.00383 CATC 0.00422 CATG 0.00447 CATT 0.00473 CCAA 0.00512 CCAC 0.00453 CCAG 0.00381 CCAT 0.00425 CCCA 0.00389 CCCC 0.00341 CCCG 0.002 CCCT 0.00302 CCGA 0.00276 CCGC 0.00215 CCGG 0.00197 CCGT 0.00267 CCTA 0.00212 CCTC 0.00355 CCTG 0.00305 CCTT 0.00323 CGAA 0.00295 CGAC 0.00305 CGAG 0.0032 CGAT 0.00294 CGCA 0.00235 CGCC 0.0023 CGCG 0.00145 CGCT 0.00232 CGGA 0.00258 CGGC 0.00223 CGGG 0.002 CGGT 0.00273 CGTA 0.00256 CGTC 0.00299 CGTG 0.00314 CGTT 0.00289 CTAA 0.00283 CTAC 0.00389 CTAG 0.0021 CTAT 0.00318 CTCA 0.00441 CTCC 0.00427 CTCG 0.00321 CTCT 0.00493 CTGA 0.004 CTGC 0.0034 CTGG 0.00381 CTGT 0.00527 CTTA 0.00235 CTTC 0.00411 CTTG 0.00508 CTTT 0.00471 GAAA 0.00565 GAAC 0.00349 GAAG 0.0041 GAAT 0.00381 GACA 0.00491 GACC 0.00303 GACG 0.00299 GACT 0.00373 GAGA 0.00551 GAGC 0.00339 GAGG 0.00354 GAGT 0.00436 GATA 0.00414 GATC 0.00311 GATG 0.00421 GATT 0.00392 GCAA 0.00387 GCAC 0.00336 GCAG 0.0034 GCAT 0.00314 GCCA 0.00361 GCCC 0.00237 GCCG 0.00223 GCCT 0.00229 GCGA 0.00245 GCGC 0.00166 GCGG 0.00215 GCGT 0.00217 GCTA 0.00273 GCTC 0.00339 GCTG 0.00384 GCTT 0.00322 GGAA 0.00399 GGAC 0.0029 GGAG 0.00427 GGAT 0.00305 GGCA 0.00291 GGCC 0.00217 GGCG 0.0023 GGCT 0.00312 GGGA 0.00314 GGGC 0.00237 GGGG 0.0034 GGGT 0.00341 GGTA 0.00313 GGTC 0.00303 GGTG 0.00438 GGTT 0.00398 GTAA 0.0032 GTAC 0.00519 GTAG 0.00388 GTAT 0.00459 GTCA 0.00418 GTCC 0.0029 GTCG 0.00305 GTCT 0.00452 GTGA 0.00439 GTGC 0.00336 GTGG 0.00452 GTGT 0.00506 GTTA 0.00288 GTTC 0.00349 GTTG 0.00511 GTTT 0.00521 TAAA 0.00419 TAAC 0.00289 TAAG 0.00235 TAAT 0.00404 TACA 0.00625 TACC 0.00313 TACG 0.00256 TACT 0.00494 TAGA 0.00366 TAGC 0.00273 TAGG 0.00212 TAGT 0.00349 TATA 0.00493 TATC 0.00415 TATG 0.00383 TATT 0.00528 TCAA 0.00534 TCAC 0.0044 TCAG 0.004 TCAT 0.00467 TCCA 0.00516 TCCC 0.00314 TCCG 0.00258 TCCT 0.00333 TCGA 0.00336 TCGC 0.00245 TCGG 0.00276 TCGT 0.00358 TCTA 0.00366 TCTC 0.00552 TCTG 0.00488 TCTT 0.00506 TGAA 0.00501 TGAC 0.00418 TGAG 0.0044 TGAT 0.00481 TGCA 0.00457 TGCC 0.00291 TGCG 0.00235 TGCT 0.00395 TGGA 0.00515 TGGC 0.00361 TGGG 0.00389 TGGT 0.00505 TGTA 0.00624 TGTC 0.00491 TGTG 0.00543 TGTT 0.00556 TTAA 0.00297 TTAC 0.0032 TTAG 0.00283 TTAT 0.00447 TTCA 0.00501 TTCC 0.004 TTCG 0.00295 TTCT 0.0051 TTGA 0.00534 TTGC 0.00387 TTGG 0.00512 TTGT 0.0066 TTTA 0.00419 TTTC 0.00566 TTTG 0.00587 TTTT 0.00963 # l= 4 # Values AAAAA 0.00411 AAAAC 0.00168 AAAAG 0.00183 AAAAT 0.00201 AAACA 0.00189 AAACC 0.00117 AAACG 0.000991 AAACT 0.00115 AAAGA 0.00158 AAAGC 0.000873 AAAGG 0.00094 AAAGT 0.00132 AAATA 0.00185 AAATC 0.00121 AAATG 0.00146 AAATT 0.00128 AACAA 0.00173 AACAC 0.0013 AACAG 0.00126 AACAT 0.00127 AACCA 0.00134 AACCC 0.000984 AACCG 0.000745 AACCT 0.000916 AACGA 0.000857 AACGC 0.000587 AACGG 0.000777 AACGT 0.000673 AACTA 0.000985 AACTC 0.00112 AACTG 0.0011 AACTT 0.00104 AAGAA 0.00144 AAGAC 0.00118 AAGAG 0.00137 AAGAT 0.00107 AAGCA 0.00101 AAGCC 0.000783 AAGCG 0.000617 AAGCT 0.000813 AAGGA 0.000907 AAGGC 0.000635 AAGGG 0.000841 AAGGT 0.000848 AAGTA 0.00151 AAGTC 0.000977 AAGTG 0.00121 AAGTT 0.00104 AATAA 0.00155 AATAC 0.00126 AATAG 0.000905 AATAT 0.00158 AATCA 0.00134 AATCC 0.000762 AATCG 0.000772 AATCT 0.00105 AATGA 0.00133 AATGC 0.000834 AATGG 0.00121 AATGT 0.00136 AATTA 0.00117 AATTC 0.000858 AATTG 0.00127 AATTT 0.00128 ACAAA 0.0017 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00201 ACAAT 0.00147 ACACA 0.00174 ACACC 0.00118 ACACG 0.000878 ACACT 0.00126 ACAGA 0.0014 ACAGC 0.00117 ACAGG 0.000946 ACAGT 0.00176 ACATA 0.00126 ACATC 0.0011 ACATG 0.00148 ACATT 0.00136 ACCAA 0.00145 ACCAC 0.00132 ACCAG 0.00112 ACCAT 0.00116 ACCCA 0.00105 ACCCC 0.000965 ACCCG 0.000551 ACCCT 0.00085 ACCGA 0.000763 ACCGC 0.000638 ACCGG 0.000594 ACCGT 0.000737 ACCTA 0.000591 ACCTC 0.001 ACCTG 0.000875 ACCTT 0.000848 ACGAA 0.000757 ACGAC 0.000908 ACGAG 0.00109 ACGAT 0.000818 ACGCA 0.000611 ACGCC 0.000572 ACGCG 0.000418 ACGCT 0.000567 ACGGA 0.000697 ACGGC 0.000682 ACGGG 0.000549 ACGGT 0.000737 ACGTA 0.000601 ACGTC 0.000767 ACGTG 0.00113 ACGTT 0.000673 ACTAA 0.000942 ACTAC 0.00113 ACTAG 0.000579 ACTAT 0.000841 ACTCA 0.00115 ACTCC 0.00102 ACTCG 0.000956 ACTCT 0.00122 ACTGA 0.001 ACTGC 0.00094 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00176 ACTTA 0.000612 ACTTC 0.000947 ACTTG 0.00187 ACTTT 0.00132 AGAAA 0.00165 AGAAC 0.00098 AGAAG 0.00137 AGAAT 0.00109 AGACA 0.00159 AGACC 0.000937 AGACG 0.000954 AGACT 0.00104 AGAGA 0.00168 AGAGC 0.00103 AGAGG 0.000992 AGAGT 0.00122 AGATA 0.0012 AGATC 0.000918 AGATG 0.00142 AGATT 0.00105 AGCAA 0.00114 AGCAC 0.000937 AGCAG 0.00107 AGCAT 0.0008 AGCCA 0.00104 AGCCC 0.000731 AGCCG 0.000708 AGCCT 0.000639 AGCGA 0.000712 AGCGC 0.000451 AGCGG 0.000587 AGCGT 0.000567 AGCTA 0.000869 AGCTC 0.00101 AGCTG 0.00112 AGCTT 0.000813 AGGAA 0.000926 AGGAC 0.000665 AGGAG 0.00108 AGGAT 0.000656 AGGCA 0.000676 AGGCC 0.000452 AGGCG 0.00052 AGGCT 0.000639 AGGGA 0.000774 AGGGC 0.000599 AGGGG 0.000801 AGGGT 0.00085 AGGTA 0.000686 AGGTC 0.00066 AGGTG 0.00106 AGGTT 0.000916 AGTAA 0.00101 AGTAC 0.00151 AGTAG 0.00114 AGTAT 0.00128 AGTCA 0.0011 AGTCC 0.000774 AGTCG 0.000817 AGTCT 0.00104 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.0009 AGTGG 0.00114 AGTGT 0.00126 AGTTA 0.000756 AGTTC 0.00086 AGTTG 0.00148 AGTTT 0.00115 ATAAA 0.00152 ATAAC 0.000882 ATAAG 0.000743 ATAAT 0.00133 ATACA 0.00165 ATACC 0.000914 ATACG 0.000748 ATACT 0.00128 ATAGA 0.00104 ATAGC 0.000736 ATAGG 0.000559 ATAGT 0.000841 ATATA 0.00196 ATATC 0.0013 ATATG 0.00111 ATATT 0.00158 ATCAA 0.00139 ATCAC 0.0012 ATCAG 0.000994 ATCAT 0.00123 ATCCA 0.00113 ATCCC 0.000697 ATCCG 0.000568 ATCCT 0.000656 ATCGA 0.000853 ATCGC 0.000627 ATCGG 0.000644 ATCGT 0.000818 ATCTA 0.000942 ATCTC 0.00135 ATCTG 0.00122 ATCTT 0.00107 ATGAA 0.00123 ATGAC 0.00108 ATGAG 0.00113 ATGAT 0.00123 ATGCA 0.00115 ATGCC 0.00065 ATGCG 0.000543 ATGCT 0.0008 ATGGA 0.00127 ATGGC 0.000924 ATGGG 0.000892 ATGGT 0.00116 ATGTA 0.00148 ATGTC 0.00117 ATGTG 0.00128 ATGTT 0.00127 ATTAA 0.000979 ATTAC 0.000952 ATTAG 0.000781 ATTAT 0.00133 ATTCA 0.00114 ATTCC 0.000895 ATTCG 0.000687 ATTCT 0.00109 ATTGA 0.00135 ATTGC 0.000897 ATTGG 0.00113 ATTGT 0.00147 ATTTA 0.00117 ATTTC 0.0013 ATTTG 0.00132 ATTTT 0.00201 CAAAA 0.00199 CAAAC 0.00144 CAAAG 0.00112 CAAAT 0.00132 CAACA 0.00162 CAACC 0.00123 CAACG 0.000775 CAACT 0.00148 CAAGA 0.00134 CAAGC 0.000956 CAAGG 0.000917 CAAGT 0.00187 CAATA 0.00131 CAATC 0.00106 CAATG 0.00121 CAATT 0.00127 CACAA 0.00151 CACAC 0.00146 CACAG 0.00117 CACAT 0.00128 CACCA 0.00162 CACCC 0.000971 CACCG 0.000737 CACCT 0.00106 CACGA 0.000789 CACGC 0.000595 CACGG 0.000627 CACGT 0.00113 CACTA 0.000908 CACTC 0.00118 CACTG 0.00107 CACTT 0.00121 CAGAA 0.00134 CAGAC 0.0012 CAGAG 0.00112 CAGAT 0.00122 CAGCA 0.00121 CAGCC 0.00094 CAGCG 0.000576 CAGCT 0.00112 CAGGA 0.000829 CAGGC 0.00062 CAGGG 0.000728 CAGGT 0.000875 CAGTA 0.00153 CAGTC 0.001 CAGTG 0.00107 CAGTT 0.0011 CATAA 0.000897 CATAC 0.00118 CATAG 0.000639 CATAT 0.00111 CATCA 0.00128 CATCC 0.000841 CATCG 0.000669 CATCT 0.00142 CATGA 0.00109 CATGC 0.000888 CATGG 0.00101 CATGT 0.00148 CATTA 0.000962 CATTC 0.00109 CATTG 0.00121 CATTT 0.00146 CCAAA 0.00159 CCAAC 0.00133 CCAAG 0.00106 CCAAT 0.00113 CCACA 0.00139 CCACC 0.00129 CCACG 0.000696 CCACT 0.00114 CCAGA 0.00121 CCAGC 0.000893 CCAGG 0.000704 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000885 CCATC 0.00114 CCATG 0.00101 CCATT 0.00121 CCCAA 0.00116 CCCAC 0.00105 CCCAG 0.000793 CCCAT 0.000892 CCCCA 0.00113 CCCCC 0.000945 CCCCG 0.00053 CCCCT 0.000801 CCCGA 0.000569 CCCGC 0.000463 CCCGG 0.000416 CCCGT 0.000549 CCCTA 0.000573 CCCTC 0.000881 CCCTG 0.000728 CCCTT 0.000841 CCGAA 0.000751 CCGAC 0.000687 CCGAG 0.000677 CCGAT 0.000644 CCGCA 0.00059 CCGCC 0.000645 CCGCG 0.000326 CCGCT 0.000587 CCGGA 0.000524 CCGGC 0.000431 CCGGG 0.000416 CCGGT 0.000594 CCGTA 0.000562 CCGTC 0.000698 CCGTG 0.000627 CCGTT 0.000777 CCTAA 0.000521 CCTAC 0.000689 CCTAG 0.00035 CCTAT 0.000559 CCTCA 0.000865 CCTCC 0.00106 CCTCG 0.00063 CCTCT 0.000992 CCTGA 0.000744 CCTGC 0.000657 CCTGG 0.000704 CCTGT 0.000946 CCTTA 0.000483 CCTTC 0.000889 CCTTG 0.000917 CCTTT 0.00094 CGAAA 0.00103 CGAAC 0.000646 CGAAG 0.000586 CGAAT 0.000687 CGACA 0.00103 CGACC 0.000606 CGACG 0.000592 CGACT 0.000817 CGAGA 0.000965 CGAGC 0.000654 CGAGG 0.00063 CGAGT 0.000956 CGATA 0.000917 CGATC 0.000583 CGATG 0.000669 CGATT 0.000772 CGCAA 0.000655 CGCAC 0.000618 CGCAG 0.000536 CGCAT 0.000543 CGCCA 0.000794 CGCCC 0.000526 CGCCG 0.00046 CGCCT 0.00052 CGCGA 0.000385 CGCGC 0.000325 CGCGG 0.000326 CGCGT 0.000418 CGCTA 0.000489 CGCTC 0.000632 CGCTG 0.000576 CGCTT 0.000617 CGGAA 0.000767 CGGAC 0.000542 CGGAG 0.000708 CGGAT 0.000568 CGGCA 0.000596 CGGCC 0.000461 CGGCG 0.00046 CGGCT 0.000708 CGGGA 0.000512 CGGGC 0.000405 CGGGG 0.00053 CGGGT 0.000551 CGGTA 0.000669 CGGTC 0.000582 CGGTG 0.000737 CGGTT 0.000745 CGTAA 0.000482 CGTAC 0.000805 CGTAG 0.000521 CGTAT 0.000748 CGTCA 0.000858 CGTCC 0.000582 CGTCG 0.000592 CGTCT 0.000954 CGTGA 0.00094 CGTGC 0.000625 CGTGG 0.000696 CGTGT 0.000878 CGTTA 0.000515 CGTTC 0.000614 CGTTG 0.000775 CGTTT 0.000991 CTAAA 0.000864 CTAAC 0.000702 CTAAG 0.000484 CTAAT 0.000781 CTACA 0.00152 CTACC 0.000703 CTACG 0.000521 CTACT 0.00114 CTAGA 0.000696 CTAGC 0.000474 CTAGG 0.00035 CTAGT 0.000579 CTATA 0.000848 CTATC 0.000786 CTATG 0.000639 CTATT 0.000905 CTCAA 0.00129 CTCAC 0.00105 CTCAG 0.000927 CTCAT 0.00113 CTCCA 0.00157 CTCCC 0.000907 CTCCG 0.000708 CTCCT 0.00108 CTCGA 0.000784 CTCGC 0.000648 CTCGG 0.000677 CTCGT 0.00109 CTCTA 0.000924 CTCTC 0.0015 CTCTG 0.00112 CTCTT 0.00137 CTGAA 0.00117 CTGAC 0.000907 CTGAG 0.000927 CTGAT 0.000994 CTGCA 0.00106 CTGCC 0.000733 CTGCG 0.000536 CTGCT 0.00107 CTGGA 0.00114 CTGGC 0.000764 CTGGG 0.000793 CTGGT 0.00112 CTGTA 0.00168 CTGTC 0.00116 CTGTG 0.00117 CTGTT 0.00126 CTTAA 0.00049 CTTAC 0.000637 CTTAG 0.000484 CTTAT 0.000743 CTTCA 0.00118 CTTCC 0.000961 CTTCG 0.000586 CTTCT 0.00137 CTTGA 0.00111 CTTGC 0.000903 CTTGG 0.00106 CTTGT 0.00201 CTTTA 0.000699 CTTTC 0.00106 CTTTG 0.00112 CTTTT 0.00183 GAAAA 0.00207 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00106 GAAAT 0.0013 GAACA 0.00115 GAACC 0.000869 GAACG 0.000614 GAACT 0.00086 GAAGA 0.00144 GAAGC 0.00083 GAAGG 0.000889 GAAGT 0.000947 GAATA 0.000989 GAATC 0.000875 GAATG 0.00109 GAATT 0.000858 GACAA 0.00138 GACAC 0.0012 GACAG 0.00116 GACAT 0.00117 GACCA 0.00103 GACCC 0.000756 GACCG 0.000582 GACCT 0.00066 GACGA 0.000945 GACGC 0.000577 GACGG 0.000698 GACGT 0.000767 GACTA 0.000768 GACTC 0.000986 GACTG 0.001 GACTT 0.000977 GAGAA 0.00138 GAGAC 0.00129 GAGAG 0.0015 GAGAT 0.00135 GAGCA 0.00098 GAGCC 0.000775 GAGCG 0.000632 GAGCT 0.00101 GAGGA 0.00102 GAGGC 0.000645 GAGGG 0.000881 GAGGT 0.001 GAGTA 0.00107 GAGTC 0.000986 GAGTG 0.00118 GAGTT 0.00112 GATAA 0.000991 GATAC 0.00106 GATAG 0.000786 GATAT 0.0013 GATCA 0.000946 GATCC 0.000667 GATCG 0.000583 GATCT 0.000918 GATGA 0.00122 GATGC 0.000755 GATGG 0.00114 GATGT 0.0011 GATTA 0.000778 GATTC 0.000875 GATTG 0.00106 GATTT 0.00121 GCAAA 0.00108 GCAAC 0.000992 GCAAG 0.000903 GCAAT 0.000897 GCACA 0.00103 GCACC 0.000806 GCACG 0.000625 GCACT 0.0009 GCAGA 0.000974 GCAGC 0.000832 GCAGG 0.000657 GCAGT 0.00094 GCATA 0.000667 GCATC 0.000755 GCATG 0.000888 GCATT 0.000834 GCCAA 0.00105 GCCAC 0.000875 GCCAG 0.000764 GCCAT 0.000924 GCCCA 0.000783 GCCCC 0.000581 GCCCG 0.000405 GCCCT 0.000599 GCCGA 0.000608 GCCGC 0.000507 GCCGG 0.000431 GCCGT 0.000682 GCCTA 0.000386 GCCTC 0.000645 GCCTG 0.00062 GCCTT 0.000635 GCGAA 0.000562 GCGAC 0.000615 GCGAG 0.000648 GCGAT 0.000627 GCGCA 0.000458 GCGCC 0.000423 GCGCG 0.000325 GCGCT 0.000451 GCGGA 0.000543 GCGGC 0.000507 GCGGG 0.000463 GCGGT 0.000638 GCGTA 0.00041 GCGTC 0.000577 GCGTG 0.000595 GCGTT 0.000587 GCTAA 0.000589 GCTAC 0.000929 GCTAG 0.000474 GCTAT 0.000736 GCTCA 0.000913 GCTCC 0.000798 GCTCG 0.000654 GCTCT 0.00103 GCTGA 0.00095 GCTGC 0.000832 GCTGG 0.000893 GCTGT 0.00117 GCTTA 0.000562 GCTTC 0.00083 GCTTG 0.000956 GCTTT 0.000873 GGAAA 0.00134 GGAAC 0.000798 GGAAG 0.000961 GGAAT 0.000895 GGACA 0.00091 GGACC 0.000632 GGACG 0.000582 GGACT 0.000774 GGAGA 0.00139 GGAGC 0.000798 GGAGG 0.00106 GGAGT 0.00102 GGATA 0.000787 GGATC 0.000667 GGATG 0.000841 GGATT 0.000762 GGCAA 0.000842 GGCAC 0.000687 GGCAG 0.000733 GGCAT 0.00065 GGCCA 0.000755 GGCCC 0.000497 GGCCG 0.000461 GGCCT 0.000452 GGCGA 0.00066 GGCGC 0.000423 GGCGG 0.000645 GGCGT 0.000572 GGCTA 0.000618 GGCTC 0.000775 GGCTG 0.00094 GGCTT 0.000783 GGGAA 0.000917 GGGAC 0.000623 GGGAG 0.000907 GGGAT 0.000697 GGGCA 0.000613 GGGCC 0.000497 GGGCG 0.000526 GGGCT 0.000731 GGGGA 0.000914 GGGGC 0.000581 GGGGG 0.000945 GGGGT 0.000965 GGGTA 0.000704 GGGTC 0.000756 GGGTG 0.000971 GGGTT 0.000984 GGTAA 0.000665 GGTAC 0.000845 GGTAG 0.000703 GGTAT 0.000914 GGTCA 0.000855 GGTCC 0.000632 GGTCG 0.000606 GGTCT 0.000937 GGTGA 0.00111 GGTGC 0.000806 GGTGG 0.00129 GGTGT 0.00118 GGTTA 0.000711 GGTTC 0.000869 GGTTG 0.00123 GGTTT 0.00117 GTAAA 0.000928 GTAAC 0.000685 GTAAG 0.000637 GTAAT 0.000952 GTACA 0.00203 GTACC 0.000845 GTACG 0.000805 GTACT 0.00151 GTAGA 0.00114 GTAGC 0.000929 GTAGG 0.000689 GTAGT 0.00113 GTATA 0.00109 GTATC 0.00106 GTATG 0.00118 GTATT 0.00126 GTCAA 0.00114 GTCAC 0.00105 GTCAG 0.000907 GTCAT 0.00108 GTCCA 0.00107 GTCCC 0.000623 GTCCG 0.000542 GTCCT 0.000665 GTCGA 0.000842 GTCGC 0.000615 GTCGG 0.000687 GTCGT 0.000908 GTCTA 0.00086 GTCTC 0.00129 GTCTG 0.0012 GTCTT 0.00118 GTGAA 0.0011 GTGAC 0.00105 GTGAG 0.00105 GTGAT 0.0012 GTGCA 0.00112 GTGCC 0.000687 GTGCG 0.000618 GTGCT 0.000937 GTGGA 0.00129 GTGGC 0.000875 GTGGG 0.00105 GTGGT 0.00132 GTGTA 0.00111 GTGTC 0.0012 GTGTG 0.00146 GTGTT 0.0013 GTTAA 0.000617 GTTAC 0.000685 GTTAG 0.000702 GTTAT 0.000882 GTTCA 0.00106 GTTCC 0.000798 GTTCG 0.000646 GTTCT 0.00098 GTTGA 0.00137 GTTGC 0.000992 GTTGG 0.00133 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.000846 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00144 GTTTT 0.00168 TAAAA 0.00147 TAAAC 0.000846 TAAAG 0.000699 TAAAT 0.00117 TAACA 0.000903 TAACC 0.000711 TAACG 0.000515 TAACT 0.000756 TAAGA 0.000697 TAAGC 0.000562 TAAGG 0.000483 TAAGT 0.000612 TAATA 0.00113 TAATC 0.000778 TAATG 0.000962 TAATT 0.00117 TACAA 0.00198 TACAC 0.00111 TACAG 0.00168 TACAT 0.00148 TACCA 0.00107 TACCC 0.000704 TACCG 0.000669 TACCT 0.000686 TACGA 0.000983 TACGC 0.00041 TACGG 0.000562 TACGT 0.000601 TACTA 0.000824 TACTC 0.00107 TACTG 0.00153 TACTT 0.00151 TAGAA 0.000938 TAGAC 0.00086 TAGAG 0.000924 TAGAT 0.000942 TAGCA 0.000752 TAGCC 0.000618 TAGCG 0.000489 TAGCT 0.000869 TAGGA 0.000569 TAGGC 0.000386 TAGGG 0.000573 TAGGT 0.000591 TAGTA 0.000824 TAGTC 0.000768 TAGTG 0.000908 TAGTT 0.000985 TATAA 0.00104 TATAC 0.00109 TATAG 0.000848 TATAT 0.00196 TATCA 0.00124 TATCC 0.000787 TATCG 0.000917 TATCT 0.0012 TATGA 0.00102 TATGC 0.000667 TATGG 0.000885 TATGT 0.00126 TATTA 0.00113 TATTC 0.000989 TATTG 0.00131 TATTT 0.00185 TCAAA 0.00151 TCAAC 0.00137 TCAAG 0.00111 TCAAT 0.00135 TCACA 0.00127 TCACC 0.00111 TCACG 0.00094 TCACT 0.00108 TCAGA 0.0013 TCAGC 0.00095 TCAGG 0.000744 TCAGT 0.001 TCATA 0.00102 TCATC 0.00122 TCATG 0.00109 TCATT 0.00133 TCCAA 0.00146 TCCAC 0.00129 TCCAG 0.00114 TCCAT 0.00127 TCCCA 0.000939 TCCCC 0.000914 TCCCG 0.000512 TCCCT 0.000774 TCCGA 0.00082 TCCGC 0.000543 TCCGG 0.000524 TCCGT 0.000697 TCCTA 0.000569 TCCTC 0.00102 TCCTG 0.000829 TCCTT 0.000907 TCGAA 0.000877 TCGAC 0.000842 TCGAG 0.000784 TCGAT 0.000853 TCGCA 0.000693 TCGCC 0.00066 TCGCG 0.000385 TCGCT 0.000712 TCGGA 0.00082 TCGGC 0.000608 TCGGG 0.000569 TCGGT 0.000763 TCGTA 0.000983 TCGTC 0.000945 TCGTG 0.000789 TCGTT 0.000857 TCTAA 0.000781 TCTAC 0.00114 TCTAG 0.000696 TCTAT 0.00104 TCTCA 0.00148 TCTCC 0.00139 TCTCG 0.000965 TCTCT 0.00168 TCTGA 0.0013 TCTGC 0.000974 TCTGG 0.00121 TCTGT 0.0014 TCTTA 0.000697 TCTTC 0.00144 TCTTG 0.00134 TCTTT 0.00158 TGAAA 0.00163 TGAAC 0.00106 TGAAG 0.00118 TGAAT 0.00114 TGACA 0.00137 TGACC 0.000855 TGACG 0.000858 TGACT 0.0011 TGAGA 0.00148 TGAGC 0.000913 TGAGG 0.000865 TGAGT 0.00115 TGATA 0.00124 TGATC 0.000946 TGATG 0.00128 TGATT 0.00134 TGCAA 0.00123 TGCAC 0.00112 TGCAG 0.00106 TGCAT 0.00115 TGCCA 0.00102 TGCCC 0.000613 TGCCG 0.000596 TGCCT 0.000676 TGCGA 0.000693 TGCGC 0.000458 TGCGG 0.00059 TGCGT 0.000611 TGCTA 0.000752 TGCTC 0.00098 TGCTG 0.00121 TGCTT 0.00101 TGGAA 0.00138 TGGAC 0.00107 TGGAG 0.00157 TGGAT 0.00113 TGGCA 0.00102 TGGCC 0.000755 TGGCG 0.000794 TGGCT 0.00104 TGGGA 0.000939 TGGGC 0.000783 TGGGG 0.00113 TGGGT 0.00105 TGGTA 0.00107 TGGTC 0.00103 TGGTG 0.00162 TGGTT 0.00134 TGTAA 0.00105 TGTAC 0.00203 TGTAG 0.00152 TGTAT 0.00165 TGTCA 0.00137 TGTCC 0.00091 TGTCG 0.00103 TGTCT 0.00159 TGTGA 0.00127 TGTGC 0.00103 TGTGG 0.00139 TGTGT 0.00174 TGTTA 0.000903 TGTTC 0.00115 TGTTG 0.00162 TGTTT 0.00189 TTAAA 0.00088 TTAAC 0.000617 TTAAG 0.00049 TTAAT 0.000979 TTACA 0.00105 TTACC 0.000665 TTACG 0.000482 TTACT 0.00101 TTAGA 0.000781 TTAGC 0.000589 TTAGG 0.000521 TTAGT 0.000942 TTATA 0.00104 TTATC 0.000991 TTATG 0.000897 TTATT 0.00155 TTCAA 0.00151 TTCAC 0.0011 TTCAG 0.00117 TTCAT 0.00123 TTCCA 0.00138 TTCCC 0.000917 TTCCG 0.000767 TTCCT 0.000926 TTCGA 0.000877 TTCGC 0.000562 TTCGG 0.000751 TTCGT 0.000757 TTCTA 0.000938 TTCTC 0.00138 TTCTG 0.00134 TTCTT 0.00144 TTGAA 0.00151 TTGAC 0.00114 TTGAG 0.00129 TTGAT 0.00139 TTGCA 0.00123 TTGCC 0.000842 TTGCG 0.000655 TTGCT 0.00114 TTGGA 0.00146 TTGGC 0.00105 TTGGG 0.00116 TTGGT 0.00145 TTGTA 0.00198 TTGTC 0.00138 TTGTG 0.00151 TTGTT 0.00173 TTTAA 0.00088 TTTAC 0.000928 TTTAG 0.000864 TTTAT 0.00152 TTTCA 0.00163 TTTCC 0.00134 TTTCG 0.00103 TTTCT 0.00165 TTTGA 0.00151 TTTGC 0.00108 TTTGG 0.00159 TTTGT 0.0017 TTTTA 0.00147 TTTTC 0.00207 TTTTG 0.00199 TTTTT 0.00411 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4366 AAAAC 0.1676 AAAAG 0.1793 AAAAT 0.2164 AAACA 0.3683 AAACC 0.221 AAACG 0.1845 AAACT 0.2262 AAAGA 0.3423 AAAGC 0.1808 AAAGG 0.1971 AAAGT 0.2797 AAATA 0.3262 AAATC 0.2029 AAATG 0.2446 AAATT 0.2263 AACAA 0.316 AACAC 0.226 AACAG 0.2239 AACAT 0.2342 AACCA 0.341 AACCC 0.2448 AACCG 0.1818 AACCT 0.2324 AACGA 0.3069 AACGC 0.1999 AACGG 0.2602 AACGT 0.233 AACTA 0.2371 AACTC 0.2557 AACTG 0.2587 AACTT 0.2485 AAGAA 0.2932 AAGAC 0.2231 AAGAG 0.2662 AAGAT 0.2174 AAGCA 0.3163 AAGCC 0.2398 AAGCG 0.1833 AAGCT 0.2606 AAGGA 0.2877 AAGGC 0.192 AAGGG 0.2589 AAGGT 0.2614 AAGTA 0.3242 AAGTC 0.2051 AAGTG 0.2464 AAGTT 0.2243 AATAA 0.3047 AATAC 0.2298 AATAG 0.1631 AATAT 0.3025 AATCA 0.3496 AATCC 0.1923 AATCG 0.1907 AATCT 0.2675 AATGA 0.2932 AATGC 0.1715 AATGG 0.2478 AATGT 0.2874 AATTA 0.2591 AATTC 0.1874 AATTG 0.2667 AATTT 0.2869 ACAAA 0.2629 ACAAC 0.2129 ACAAG 0.2947 ACAAT 0.2296 ACACA 0.3447 ACACC 0.2319 ACACG 0.17 ACACT 0.2533 ACAGA 0.2673 ACAGC 0.2176 ACAGG 0.1756 ACAGT 0.3395 ACATA 0.2478 ACATC 0.2142 ACATG 0.2717 ACATT 0.2663 ACCAA 0.2923 ACCAC 0.2524 ACCAG 0.2217 ACCAT 0.2336 ACCCA 0.3093 ACCCC 0.2802 ACCCG 0.1578 ACCCT 0.2527 ACCGA 0.2879 ACCGC 0.227 ACCGG 0.213 ACCGT 0.2721 ACCTA 0.18 ACCTC 0.2973 ACCTG 0.2654 ACCTT 0.2573 ACGAA 0.2192 ACGAC 0.2481 ACGAG 0.2993 ACGAT 0.2334 ACGCA 0.2834 ACGCC 0.2591 ACGCG 0.1929 ACGCT 0.2646 ACGGA 0.2668 ACGGC 0.2509 ACGGG 0.2038 ACGGT 0.2785 ACGTA 0.1921 ACGTC 0.2393 ACGTG 0.3524 ACGTT 0.2161 ACTAA 0.2738 ACTAC 0.3177 ACTAG 0.1631 ACTAT 0.2455 ACTCA 0.2686 ACTCC 0.2352 ACTCG 0.2146 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2204 ACTGC 0.1931 ACTGG 0.2098 ACTGT 0.3767 ACTTA 0.1328 ACTTC 0.2076 ACTTG 0.3843 ACTTT 0.2754 AGAAA 0.3241 AGAAC 0.1901 AGAAG 0.2626 AGAAT 0.2231 AGACA 0.3505 AGACC 0.2064 AGACG 0.2045 AGACT 0.2387 AGAGA 0.3443 AGAGC 0.2081 AGAGG 0.1987 AGAGT 0.2489 AGATA 0.266 AGATC 0.1999 AGATG 0.3012 AGATT 0.2329 AGCAA 0.2903 AGCAC 0.2365 AGCAG 0.2657 AGCAT 0.2074 AGCCA 0.3366 AGCCC 0.231 AGCCG 0.222 AGCCT 0.2104 AGCGA 0.3096 AGCGC 0.1946 AGCGG 0.2477 AGCGT 0.2481 AGCTA 0.2291 AGCTC 0.2593 AGCTG 0.2918 AGCTT 0.2198 AGGAA 0.2879 AGGAC 0.1963 AGGAG 0.3107 AGGAT 0.2051 AGGCA 0.3004 AGGCC 0.1921 AGGCG 0.2202 AGGCT 0.2873 AGGGA 0.2646 AGGGC 0.1896 AGGGG 0.262 AGGGT 0.2838 AGGTA 0.2142 AGGTC 0.2009 AGGTG 0.3068 AGGTT 0.2781 AGTAA 0.2117 AGTAC 0.3013 AGTAG 0.2231 AGTAT 0.2638 AGTCA 0.3002 AGTCC 0.2062 AGTCG 0.2117 AGTCT 0.2819 AGTGA 0.2539 AGTGC 0.2 AGTGG 0.2588 AGTGT 0.2873 AGTTA 0.1782 AGTTC 0.207 AGTTG 0.344 AGTTT 0.2708 ATAAA 0.3536 ATAAC 0.1891 ATAAG 0.1605 ATAAT 0.2968 ATACA 0.3574 ATACC 0.1994 ATACG 0.1587 ATACT 0.2845 ATAGA 0.3307 ATAGC 0.2266 ATAGG 0.1736 ATAGT 0.269 ATATA 0.3301 ATATC 0.2162 ATATG 0.1832 ATATT 0.2705 ATCAA 0.2957 ATCAC 0.2407 ATCAG 0.2063 ATCAT 0.2574 ATCCA 0.3706 ATCCC 0.2272 ATCCG 0.18 ATCCT 0.2222 ATCGA 0.3 ATCGC 0.2036 ATCGG 0.2172 ATCGT 0.2792 ATCTA 0.2087 ATCTC 0.2907 ATCTG 0.2607 ATCTT 0.2399 ATGAA 0.2707 ATGAC 0.227 ATGAG 0.2361 ATGAT 0.2663 ATGCA 0.3706 ATGCC 0.2054 ATGCG 0.1669 ATGCT 0.2571 ATGGA 0.3037 ATGGC 0.2125 ATGGG 0.2084 ATGGT 0.2755 ATGTA 0.2865 ATGTC 0.2232 ATGTG 0.2393 ATGTT 0.251 ATTAA 0.2484 ATTAC 0.2336 ATTAG 0.187 ATTAT 0.3311 ATTCA 0.3037 ATTCC 0.2279 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.295 ATTGA 0.2867 ATTGC 0.1785 ATTGG 0.2297 ATTGT 0.3051 ATTTA 0.2058 ATTTC 0.2192 ATTTG 0.2184 ATTTT 0.3567 CAAAA 0.3464 CAAAC 0.2338 CAAAG 0.1872 CAAAT 0.2325 CAACA 0.3226 CAACC 0.2312 CAACG 0.1464 CAACT 0.2998 CAAGA 0.2689 CAAGC 0.1833 CAAGG 0.1756 CAAGT 0.3722 CAATA 0.2781 CAATC 0.2115 CAATG 0.2455 CAATT 0.2649 CACAA 0.2854 CACAC 0.2546 CACAG 0.2169 CACAT 0.2431 CACCA 0.375 CACCC 0.2197 CACCG 0.1622 CACCT 0.2431 CACGA 0.2602 CACGC 0.1809 CACGG 0.1946 CACGT 0.3643 CACTA 0.2096 CACTC 0.2663 CACTG 0.2422 CACTT 0.2819 CAGAA 0.2881 CAGAC 0.2344 CAGAG 0.2253 CAGAT 0.2522 CAGCA 0.3147 CAGCC 0.2416 CAGCG 0.1448 CAGCT 0.2989 CAGGA 0.2813 CAGGC 0.1957 CAGGG 0.2319 CAGGT 0.2911 CAGTA 0.3334 CAGTC 0.2075 CAGTG 0.2183 CAGTT 0.2407 CATAA 0.2384 CATAC 0.2989 CATAG 0.1661 CATAT 0.2967 CATCA 0.3118 CATCC 0.1932 CATCG 0.1577 CATCT 0.3373 CATGA 0.2532 CATGC 0.1959 CATGG 0.2214 CATGT 0.3296 CATTA 0.2073 CATTC 0.2269 CATTG 0.2509 CATTT 0.3149 CCAAA 0.3079 CCAAC 0.2545 CCAAG 0.2078 CCAAT 0.2298 CCACA 0.3087 CCACC 0.2797 CCACG 0.151 CCACT 0.2606 CCAGA 0.323 CCAGC 0.2249 CCAGG 0.1849 CCAGT 0.2671 CCATA 0.2168 CCATC 0.2626 CCATG 0.2305 CCATT 0.2901 CCCAA 0.3004 CCCAC 0.2592 CCCAG 0.2034 CCCAT 0.237 CCCCA 0.3316 CCCCC 0.2772 CCCCG 0.1524 CCCCT 0.2388 CCCGA 0.292 CCCGC 0.2219 CCCGG 0.21 CCCGT 0.2762 CCCTA 0.1931 CCCTC 0.2832 CCCTG 0.2375 CCCTT 0.2862 CCGAA 0.2787 CCGAC 0.2378 CCGAG 0.2416 CCGAT 0.2419 CCGCA 0.2803 CCGCC 0.2929 CCGCG 0.1501 CCGCT 0.2767 CCGGA 0.2729 CCGGC 0.2103 CCGGG 0.2147 CCGGT 0.3022 CCGTA 0.2187 CCGTC 0.2549 CCGTG 0.2307 CCGTT 0.2958 CCTAA 0.2444 CCTAC 0.3177 CCTAG 0.1689 CCTAT 0.269 CCTCA 0.25 CCTCC 0.2894 CCTCG 0.1751 CCTCT 0.2855 CCTGA 0.2516 CCTGC 0.2082 CCTGG 0.2306 CCTGT 0.3096 CCTTA 0.155 CCTTC 0.2753 CCTTG 0.2752 CCTTT 0.2946 CGAAA 0.3474 CGAAC 0.2161 CGAAG 0.1994 CGAAT 0.2371 CGACA 0.3399 CGACC 0.1966 CGACG 0.189 CGACT 0.2746 CGAGA 0.31 CGAGC 0.1972 CGAGG 0.1928 CGAGT 0.3001 CGATA 0.3116 CGATC 0.1956 CGATG 0.2262 CGATT 0.2666 CGCAA 0.2844 CGCAC 0.2517 CGCAG 0.2274 CGCAT 0.2364 CGCCA 0.3499 CGCCC 0.2223 CGCCG 0.1957 CGCCT 0.2321 CGCGA 0.2747 CGCGC 0.2164 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2919 CGCTA 0.2165 CGCTC 0.267 CGCTG 0.2467 CGCTT 0.2698 CGGAA 0.302 CGGAC 0.2041 CGGAG 0.2689 CGGAT 0.225 CGGCA 0.2757 CGGCC 0.1956 CGGCG 0.2008 CGGCT 0.3279 CGGGA 0.2628 CGGGC 0.193 CGGGG 0.2641 CGGGT 0.28 CGGTA 0.2509 CGGTC 0.2088 CGGTG 0.2619 CGGTT 0.2784 CGTAA 0.1962 CGTAC 0.3046 CGTAG 0.1992 CGTAT 0.3 CGTCA 0.2947 CGTCC 0.1913 CGTCG 0.1934 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.31 CGTGC 0.1952 CGTGG 0.2164 CGTGT 0.2784 CGTTA 0.1797 CGTTC 0.2162 CGTTG 0.2609 CGTTT 0.3431 CTAAA 0.3091 CTAAC 0.2409 CTAAG 0.1676 CTAAT 0.2824 CTACA 0.3966 CTACC 0.1783 CTACG 0.1294 CTACT 0.2957 CTAGA 0.3395 CTAGC 0.2185 CTAGG 0.1674 CTAGT 0.2745 CTATA 0.2683 CTATC 0.2415 CTATG 0.2024 CTATT 0.2878 CTCAA 0.2984 CTCAC 0.2286 CTCAG 0.2108 CTCAT 0.2622 CTCCA 0.3746 CTCCC 0.2068 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.2554 CTCGA 0.2538 CTCGC 0.1961 CTCGG 0.2076 CTCGT 0.3426 CTCTA 0.1931 CTCTC 0.2953 CTCTG 0.2263 CTCTT 0.2853 CTGAA 0.2979 CTGAC 0.2194 CTGAG 0.2272 CTGAT 0.2555 CTGCA 0.3173 CTGCC 0.2111 CTGCG 0.1546 CTGCT 0.317 CTGGA 0.3052 CTGGC 0.1946 CTGGG 0.2031 CTGGT 0.2971 CTGTA 0.3268 CTGTC 0.2132 CTGTG 0.2166 CTGTT 0.2434 CTTAA 0.2131 CTTAC 0.2705 CTTAG 0.1977 CTTAT 0.3187 CTTCA 0.2925 CTTCC 0.2297 CTTCG 0.1412 CTTCT 0.3365 CTTGA 0.2296 CTTGC 0.1704 CTTGG 0.208 CTTGT 0.392 CTTTA 0.1522 CTTTC 0.2248 CTTTG 0.2324 CTTTT 0.3906 GAAAA 0.3663 GAAAC 0.2125 GAAAG 0.1841 GAAAT 0.2371 GAACA 0.3316 GAACC 0.2414 GAACG 0.1717 GAACT 0.2553 GAAGA 0.3503 GAAGC 0.1979 GAAGG 0.2107 GAAGT 0.2412 GAATA 0.2648 GAATC 0.2294 GAATG 0.2751 GAATT 0.2307 GACAA 0.2836 GACAC 0.2349 GACAG 0.2334 GACAT 0.248 GACCA 0.3466 GACCC 0.2451 GACCG 0.183 GACCT 0.2253 GACGA 0.3236 GACGC 0.1901 GACGG 0.2262 GACGT 0.2602 GACTA 0.2068 GACTC 0.2622 GACTG 0.263 GACTT 0.268 GAGAA 0.2584 GAGAC 0.229 GAGAG 0.262 GAGAT 0.2506 GAGCA 0.2937 GAGCC 0.2261 GAGCG 0.1782 GAGCT 0.302 GAGGA 0.2934 GAGGC 0.178 GAGGG 0.2426 GAGGT 0.286 GAGTA 0.2481 GAGTC 0.2271 GAGTG 0.2636 GAGTT 0.2613 GATAA 0.2417 GATAC 0.2507 GATAG 0.1834 GATAT 0.3242 GATCA 0.31 GATCC 0.21 GATCG 0.1818 GATCT 0.2983 GATGA 0.2938 GATGC 0.1752 GATGG 0.2615 GATGT 0.2695 GATTA 0.2018 GATTC 0.2266 GATTG 0.2588 GATTT 0.3128 GCAAA 0.2813 GCAAC 0.2516 GCAAG 0.228 GCAAT 0.2391 GCACA 0.3137 GCACC 0.2341 GCACG 0.1824 GCACT 0.2698 GCAGA 0.2899 GCAGC 0.237 GCAGG 0.1913 GCAGT 0.2819 GCATA 0.2152 GCATC 0.2377 GCATG 0.2757 GCATT 0.2714 GCCAA 0.2914 GCCAC 0.2331 GCCAG 0.2122 GCCAT 0.2633 GCCCA 0.3385 GCCCC 0.2416 GCCCG 0.1646 GCCCT 0.2553 GCCGA 0.2808 GCCGC 0.222 GCCGG 0.1874 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.1735 GCCTC 0.2768 GCCTG 0.267 GCCTT 0.2827 GCGAA 0.236 GCGAC 0.2425 GCGAG 0.2616 GCGAT 0.2599 GCGCA 0.2804 GCGCC 0.2479 GCGCG 0.1925 GCGCT 0.2792 GCGGA 0.2603 GCGGC 0.2309 GCGGG 0.2103 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.1952 GCGTC 0.2629 GCGTG 0.2632 GCGTT 0.2787 GCTAA 0.2144 GCTAC 0.3342 GCTAG 0.174 GCTAT 0.2773 GCTCA 0.2751 GCTCC 0.2254 GCTCG 0.1871 GCTCT 0.3123 GCTGA 0.2556 GCTGC 0.2082 GCTGG 0.2265 GCTGT 0.3097 GCTTA 0.1774 GCTTC 0.2606 GCTTG 0.2896 GCTTT 0.2724 GGAAA 0.3364 GGAAC 0.1973 GGAAG 0.2377 GGAAT 0.2286 GGACA 0.3178 GGACC 0.2119 GGACG 0.1935 GGACT 0.2768 GGAGA 0.3302 GGAGC 0.1797 GGAGG 0.2411 GGAGT 0.2489 GGATA 0.2633 GGATC 0.2157 GGATG 0.2645 GGATT 0.2565 GGCAA 0.2895 GGCAC 0.2321 GGCAG 0.247 GGCAT 0.2314 GGCCA 0.3552 GGCCC 0.2266 GGCCG 0.2028 GGCCT 0.2154 GGCGA 0.2915 GGCGC 0.1805 GGCGG 0.2741 GGCGT 0.254 GGCTA 0.1989 GGCTC 0.246 GGCTG 0.2988 GGCTT 0.2563 GGGAA 0.2978 GGGAC 0.1951 GGGAG 0.2766 GGGAT 0.2304 GGGCA 0.2635 GGGCC 0.2043 GGGCG 0.2133 GGGCT 0.3189 GGGGA 0.273 GGGGC 0.1634 GGGGG 0.277 GGGGT 0.2867 GGGTA 0.212 GGGTC 0.2183 GGGTG 0.277 GGGTT 0.2926 GGTAA 0.2153 GGTAC 0.2634 GGTAG 0.2196 GGTAT 0.3017 GGTCA 0.2917 GGTCC 0.2021 GGTCG 0.1942 GGTCT 0.312 GGTGA 0.2614 GGTGC 0.1794 GGTGG 0.2872 GGTGT 0.272 GGTTA 0.183 GGTTC 0.2204 GGTTG 0.2988 GGTTT 0.2979 GTAAA 0.2915 GTAAC 0.2069 GTAAG 0.1977 GTAAT 0.3039 GTACA 0.3964 GTACC 0.1592 GTACG 0.1473 GTACT 0.2972 GTAGA 0.2987 GTAGC 0.2318 GTAGG 0.174 GTAGT 0.2955 GTATA 0.2398 GTATC 0.2281 GTATG 0.2518 GTATT 0.2803 GTCAA 0.2779 GTCAC 0.2434 GTCAG 0.2138 GTCAT 0.2648 GTCCA 0.3692 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1812 GTCCT 0.2361 GTCGA 0.2839 GTCGC 0.1942 GTCGG 0.2183 GTCGT 0.3036 GTCTA 0.191 GTCTC 0.285 GTCTG 0.2599 GTCTT 0.2641 GTGAA 0.2575 GTGAC 0.2335 GTGAG 0.2304 GTGAT 0.2787 GTGCA 0.333 GTGCC 0.203 GTGCG 0.1751 GTGCT 0.2889 GTGGA 0.2904 GTGGC 0.187 GTGGG 0.2266 GTGGT 0.296 GTGTA 0.2262 GTGTC 0.2323 GTGTG 0.2754 GTGTT 0.2662 GTTAA 0.2191 GTTAC 0.2345 GTTAG 0.2353 GTTAT 0.3111 GTTCA 0.31 GTTCC 0.2239 GTTCG 0.1798 GTTCT 0.2862 GTTGA 0.2773 GTTGC 0.1872 GTTGG 0.2535 GTTGT 0.282 GTTTA 0.1667 GTTTC 0.2364 GTTTG 0.2644 GTTTT 0.3325 TAAAA 0.3652 TAAAC 0.1914 TAAAG 0.1591 TAAAT 0.2843 TAACA 0.3217 TAACC 0.2415 TAACG 0.1719 TAACT 0.2648 TAAGA 0.3037 TAAGC 0.2301 TAAGG 0.2026 TAAGT 0.2636 TAATA 0.2795 TAATC 0.1901 TAATG 0.2338 TAATT 0.2967 TACAA 0.32 TACAC 0.1718 TACAG 0.2689 TACAT 0.2392 TACCA 0.3487 TACCC 0.222 TACCG 0.2052 TACCT 0.2241 TACGA 0.3886 TACGC 0.1586 TACGG 0.2181 TACGT 0.2347 TACTA 0.1712 TACTC 0.2096 TACTG 0.3093 TACTT 0.31 TAGAA 0.2684 TAGAC 0.2225 TAGAG 0.2484 TAGAT 0.2608 TAGCA 0.2785 TAGCC 0.222 TAGCG 0.1755 TAGCT 0.324 TAGGA 0.2759 TAGGC 0.1794 TAGGG 0.266 TAGGT 0.2786 TAGTA 0.2437 TAGTC 0.2154 TAGTG 0.2495 TAGTT 0.2914 TATAA 0.2143 TATAC 0.2152 TATAG 0.1664 TATAT 0.4041 TATCA 0.3056 TATCC 0.1888 TATCG 0.2132 TATCT 0.2923 TATGA 0.2714 TATGC 0.1684 TATGG 0.2292 TATGT 0.331 TATTA 0.2117 TATTC 0.1866 TATTG 0.2429 TATTT 0.3588 TCAAA 0.2847 TCAAC 0.2506 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2582 TCACA 0.2935 TCACC 0.2476 TCACG 0.2103 TCACT 0.2486 TCAGA 0.33 TCAGC 0.2311 TCAGG 0.1836 TCAGT 0.2554 TCATA 0.2215 TCATC 0.2546 TCATG 0.2276 TCATT 0.2963 TCCAA 0.2885 TCCAC 0.2405 TCCAG 0.2212 TCCAT 0.2499 TCCCA 0.3002 TCCCC 0.287 TCCCG 0.1594 TCCCT 0.2534 TCCGA 0.326 TCCGC 0.205 TCCGG 0.1992 TCCGT 0.2699 TCCTA 0.1743 TCCTC 0.2981 TCCTG 0.2507 TCCTT 0.2769 TCGAA 0.2696 TCGAC 0.2406 TCGAG 0.2298 TCGAT 0.2601 TCGCA 0.2869 TCGCC 0.2621 TCGCG 0.16 TCGCT 0.291 TCGGA 0.3041 TCGGC 0.2146 TCGGG 0.2033 TCGGT 0.278 TCGTA 0.276 TCGTC 0.2584 TCGTG 0.2185 TCGTT 0.2471 TCTAA 0.2189 TCTAC 0.3042 TCTAG 0.191 TCTAT 0.2859 TCTCA 0.2746 TCTCC 0.2452 TCTCG 0.1742 TCTCT 0.306 TCTGA 0.2754 TCTGC 0.1921 TCTGG 0.2454 TCTGT 0.287 TCTTA 0.1431 TCTTC 0.282 TCTTG 0.2596 TCTTT 0.3152 TGAAA 0.3261 TGAAC 0.2091 TGAAG 0.2317 TGAAT 0.2331 TGACA 0.3312 TGACC 0.2031 TGACG 0.1979 TGACT 0.2677 TGAGA 0.3418 TGAGC 0.2028 TGAGG 0.1926 TGAGT 0.2628 TGATA 0.2602 TGATC 0.1944 TGATG 0.2606 TGATT 0.2848 TGCAA 0.2723 TGCAC 0.2369 TGCAG 0.2311 TGCAT 0.2598 TGCCA 0.3563 TGCCC 0.2056 TGCCG 0.2011 TGCCT 0.237 TGCGA 0.3 TGCGC 0.192 TGCGG 0.2467 TGCGT 0.2612 TGCTA 0.1925 TGCTC 0.2465 TGCTG 0.3003 TGCTT 0.2607 TGGAA 0.2801 TGGAC 0.2 TGGAG 0.297 TGGAT 0.2229 TGGCA 0.2895 TGGCC 0.2031 TGGCG 0.2128 TGGCT 0.2946 TGGGA 0.2456 TGGGC 0.197 TGGGG 0.2852 TGGGT 0.2723 TGGTA 0.2188 TGGTC 0.2028 TGGTG 0.3106 TGGTT 0.2678 TGTAA 0.1747 TGTAC 0.3212 TGTAG 0.2392 TGTAT 0.2649 TGTCA 0.2893 TGTCC 0.1843 TGTCG 0.2041 TGTCT 0.3223 TGTGA 0.2437 TGTGC 0.1891 TGTGG 0.2493 TGTGT 0.3179 TGTTA 0.167 TGTTC 0.2074 TGTTG 0.2856 TGTTT 0.3401 TTAAA 0.306 TTAAC 0.1996 TTAAG 0.1608 TTAAT 0.3337 TTACA 0.332 TTACC 0.2003 TTACG 0.1461 TTACT 0.3216 TTAGA 0.2857 TTAGC 0.1977 TTAGG 0.178 TTAGT 0.3386 TTATA 0.2316 TTATC 0.2133 TTATG 0.1947 TTATT 0.3604 TTCAA 0.3081 TTCAC 0.2123 TTCAG 0.2297 TTCAT 0.2499 TTCCA 0.3548 TTCCC 0.2237 TTCCG 0.1839 TTCCT 0.2376 TTCGA 0.3085 TTCGC 0.1833 TTCGG 0.2481 TTCGT 0.2601 TTCTA 0.1891 TTCTC 0.2639 TTCTG 0.2621 TTCTT 0.2848 TTGAA 0.2911 TTGAC 0.2078 TTGAG 0.2343 TTGAT 0.2668 TTGCA 0.322 TTGCC 0.2131 TTGCG 0.1665 TTGCT 0.2984 TTGGA 0.2934 TTGGC 0.1968 TTGGG 0.2211 TTGGT 0.2886 TTGTA 0.3047 TTGTC 0.2029 TTGTG 0.2233 TTGTT 0.2692 TTTAA 0.2168 TTTAC 0.2132 TTTAG 0.1948 TTTAT 0.3753 TTTCA 0.2945 TTTCC 0.2325 TTTCG 0.176 TTTCT 0.297 TTTGA 0.2672 TTTGC 0.1775 TTTGG 0.2601 TTTGT 0.2952 TTTTA 0.1604 TTTTC 0.2055 TTTTG 0.1975 TTTTT 0.4366 [4] # (a,c,g,t)= (0.203, 0.297, 0.297, 0.203) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.271 C 0.229 G 0.229 T 0.271 # l= 1 # Values AA 0.0756 AC 0.0659 AG 0.0615 AT 0.068 CA 0.0722 CC 0.0526 CG 0.0427 CT 0.0616 GA 0.0637 GC 0.047 GG 0.0525 GT 0.0658 TA 0.0595 TC 0.0637 TG 0.0721 TT 0.0756 # l= 2 # Values AAA 0.0249 AAC 0.0166 AAG 0.0161 AAT 0.018 ACA 0.0222 ACC 0.0148 ACG 0.0118 ACT 0.0172 AGA 0.019 AGC 0.0134 AGG 0.012 AGT 0.0172 ATA 0.0177 ATC 0.0152 ATG 0.0171 ATT 0.018 CAA 0.0209 CAC 0.0177 CAG 0.0166 CAT 0.0171 CCA 0.018 CCC 0.0127 CCG 0.00989 CCT 0.0121 CGA 0.0123 CGC 0.00876 CGG 0.00988 CGT 0.0118 CTA 0.0119 CTC 0.017 CTG 0.0165 CTT 0.0161 GAA 0.0167 GAC 0.0148 GAG 0.017 GAT 0.0152 GCA 0.014 GCC 0.0109 GCG 0.00875 GCT 0.0134 GGA 0.0143 GGC 0.0109 GGG 0.0127 GGT 0.0147 GTA 0.0167 GTC 0.0148 GTG 0.0177 GTT 0.0166 TAA 0.0131 TAC 0.0167 TAG 0.0119 TAT 0.0177 TCA 0.0181 TCC 0.0143 TCG 0.0123 TCT 0.019 TGA 0.0181 TGC 0.014 TGG 0.0179 TGT 0.0221 TTA 0.0131 TTC 0.0167 TTG 0.0208 TTT 0.0249 # l= 3 # Values AAAA 0.00942 AAAC 0.0052 AAAG 0.00466 AAAT 0.0056 AACA 0.0055 AACC 0.00402 AACG 0.00292 AACT 0.00417 AAGA 0.00498 AAGC 0.00323 AAGG 0.00323 AAGT 0.00467 AATA 0.0051 AATC 0.00384 AATG 0.00463 AATT 0.0044 ACAA 0.00656 ACAC 0.00518 ACAG 0.00526 ACAT 0.00514 ACCA 0.0051 ACCC 0.00348 ACCG 0.00283 ACCT 0.00334 ACGA 0.00359 ACGC 0.00223 ACGG 0.00274 ACGT 0.00322 ACTA 0.00345 ACTC 0.00438 ACTG 0.00469 ACTT 0.00467 AGAA 0.00496 AGAC 0.00457 AGAG 0.00493 AGAT 0.00451 AGCA 0.00399 AGCC 0.00318 AGCG 0.00239 AGCT 0.00381 AGGA 0.00331 AGGC 0.00233 AGGG 0.00307 AGGT 0.00333 AGTA 0.00486 AGTC 0.00371 AGTG 0.00444 AGTT 0.00417 ATAA 0.00432 ATAC 0.00452 ATAG 0.00313 ATAT 0.00577 ATCA 0.00469 ATCC 0.00304 ATCG 0.00293 ATCT 0.00451 ATGA 0.00456 ATGC 0.00314 ATGG 0.00424 ATGT 0.00513 ATTA 0.0039 ATTC 0.00369 ATTG 0.00478 ATTT 0.0056 CAAA 0.00585 CAAC 0.00514 CAAG 0.00508 CAAT 0.00478 CACA 0.00552 CACC 0.00452 CACG 0.00322 CACT 0.00444 CAGA 0.00487 CAGC 0.00391 CAGG 0.00308 CAGT 0.00469 CATA 0.00376 CATC 0.0042 CATG 0.00449 CATT 0.00464 CCAA 0.00516 CCAC 0.00467 CCAG 0.00386 CCAT 0.00425 CCCA 0.00398 CCCC 0.00353 CCCG 0.00209 CCCT 0.00308 CCGA 0.00282 CCGC 0.00226 CCGG 0.00206 CCGT 0.00274 CCTA 0.00212 CCTC 0.00362 CCTG 0.00308 CCTT 0.00323 CGAA 0.00293 CGAC 0.00314 CGAG 0.00325 CGAT 0.00293 CGCA 0.00242 CGCC 0.00242 CGCG 0.00151 CGCT 0.00239 CGGA 0.00264 CGGC 0.00234 CGGG 0.00208 CGGT 0.00283 CGTA 0.00257 CGTC 0.00307 CGTG 0.00322 CGTT 0.00292 CTAA 0.0028 CTAC 0.0039 CTAG 0.00208 CTAT 0.00313 CTCA 0.00441 CTCC 0.00438 CTCG 0.00325 CTCT 0.00494 CTGA 0.00395 CTGC 0.00348 CTGG 0.00386 CTGT 0.00526 CTTA 0.00231 CTTC 0.00405 CTTG 0.00508 CTTT 0.00466 GAAA 0.00556 GAAC 0.00343 GAAG 0.00405 GAAT 0.00369 GACA 0.00495 GACC 0.00308 GACG 0.00307 GACT 0.00371 GAGA 0.00551 GAGC 0.00347 GAGG 0.00361 GAGT 0.00438 GATA 0.00407 GATC 0.00308 GATG 0.00419 GATT 0.00384 GCAA 0.00392 GCAC 0.00346 GCAG 0.00348 GCAT 0.00314 GCCA 0.00371 GCCC 0.00248 GCCG 0.00233 GCCT 0.00233 GCGA 0.00252 GCGC 0.00174 GCGG 0.00226 GCGT 0.00223 GCTA 0.00275 GCTC 0.00347 GCTG 0.00391 GCTT 0.00322 GGAA 0.00397 GGAC 0.00294 GGAG 0.00437 GGAT 0.00304 GGCA 0.00298 GGCC 0.00227 GGCG 0.00242 GGCT 0.00318 GGGA 0.00319 GGGC 0.00248 GGGG 0.00353 GGGT 0.00348 GGTA 0.00313 GGTC 0.00308 GGTG 0.00451 GGTT 0.00402 GTAA 0.00313 GTAC 0.00519 GTAG 0.0039 GTAT 0.00452 GTCA 0.00417 GTCC 0.00294 GTCG 0.00314 GTCT 0.00457 GTGA 0.00441 GTGC 0.00346 GTGG 0.00466 GTGT 0.00517 GTTA 0.00285 GTTC 0.00343 GTTG 0.00513 GTTT 0.0052 TAAA 0.00405 TAAC 0.00286 TAAG 0.0023 TAAT 0.00391 TACA 0.00618 TACC 0.00313 TACG 0.00257 TACT 0.00486 TAGA 0.0036 TAGC 0.00275 TAGG 0.00212 TAGT 0.00345 TATA 0.00481 TATC 0.00407 TATG 0.00376 TATT 0.0051 TCAA 0.00522 TCAC 0.00442 TCAG 0.00395 TCAT 0.00456 TCCA 0.00517 TCCC 0.00319 TCCG 0.00264 TCCT 0.00332 TCGA 0.00332 TCGC 0.00252 TCGG 0.00282 TCGT 0.00359 TCTA 0.0036 TCTC 0.00552 TCTG 0.00487 TCTT 0.00499 TGAA 0.00487 TGAC 0.00417 TGAG 0.0044 TGAT 0.00469 TGCA 0.00461 TGCC 0.00298 TGCG 0.00242 TGCT 0.00399 TGGA 0.00517 TGGC 0.00371 TGGG 0.00397 TGGT 0.00509 TGTA 0.00618 TGTC 0.00495 TGTG 0.00551 TGTT 0.0055 TTAA 0.00287 TTAC 0.00313 TTAG 0.0028 TTAT 0.00432 TTCA 0.00487 TTCC 0.00397 TTCG 0.00293 TTCT 0.00496 TTGA 0.00521 TTGC 0.00392 TTGG 0.00516 TTGT 0.00656 TTTA 0.00404 TTTC 0.00557 TTTG 0.00584 TTTT 0.00942 # l= 4 # Values AAAAA 0.00401 AAAAC 0.00166 AAAAG 0.00182 AAAAT 0.00193 AAACA 0.00187 AAACC 0.00119 AAACG 0.001 AAACT 0.00113 AAAGA 0.00155 AAAGC 0.000875 AAAGG 0.000933 AAAGT 0.0013 AAATA 0.00178 AAATC 0.00117 AAATG 0.00143 AAATT 0.00122 AACAA 0.00171 AACAC 0.0013 AACAG 0.00125 AACAT 0.00124 AACCA 0.00134 AACCC 0.000996 AACCG 0.000761 AACCT 0.000921 AACGA 0.00085 AACGC 0.000598 AACGG 0.000796 AACGT 0.000677 AACTA 0.000963 AACTC 0.00111 AACTG 0.00108 AACTT 0.00102 AAGAA 0.0014 AAGAC 0.00118 AAGAG 0.00137 AAGAT 0.00105 AAGCA 0.001 AAGCC 0.000789 AAGCG 0.000632 AAGCT 0.000801 AAGGA 0.000894 AAGGC 0.00064 AAGGG 0.000846 AAGGT 0.00085 AAGTA 0.00147 AAGTC 0.000957 AAGTG 0.00122 AAGTT 0.00102 AATAA 0.00147 AATAC 0.00123 AATAG 0.000892 AATAT 0.00151 AATCA 0.0013 AATCC 0.000748 AATCG 0.000767 AATCT 0.00102 AATGA 0.00128 AATGC 0.000829 AATGG 0.00119 AATGT 0.00133 AATTA 0.00112 AATTC 0.000821 AATTG 0.00124 AATTT 0.00122 ACAAA 0.00167 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00202 ACAAT 0.00144 ACACA 0.00178 ACACC 0.00121 ACACG 0.000899 ACACT 0.00129 ACAGA 0.0014 ACAGC 0.00118 ACAGG 0.00095 ACAGT 0.00174 ACATA 0.00123 ACATC 0.00109 ACATG 0.00149 ACATT 0.00133 ACCAA 0.00145 ACCAC 0.00136 ACCAG 0.00113 ACCAT 0.00116 ACCCA 0.00106 ACCCC 0.000987 ACCCG 0.00057 ACCCT 0.00086 ACCGA 0.000779 ACCGC 0.00067 ACCGG 0.000624 ACCGT 0.000755 ACCTA 0.000593 ACCTC 0.00101 ACCTG 0.000879 ACCTT 0.00085 ACGAA 0.000744 ACGAC 0.000924 ACGAG 0.00111 ACGAT 0.000816 ACGCA 0.000625 ACGCC 0.000594 ACGCG 0.00043 ACGCT 0.000584 ACGGA 0.00071 ACGGC 0.000707 ACGGG 0.00057 ACGGT 0.000755 ACGTA 0.000605 ACGTC 0.000782 ACGTG 0.00115 ACGTT 0.000677 ACTAA 0.000924 ACTAC 0.00112 ACTAG 0.000578 ACTAT 0.000825 ACTCA 0.00116 ACTCC 0.00103 ACTCG 0.000967 ACTCT 0.00122 ACTGA 0.000982 ACTGC 0.000962 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00174 ACTTA 0.000595 ACTTC 0.000914 ACTTG 0.00185 ACTTT 0.0013 AGAAA 0.00162 AGAAC 0.000956 AGAAG 0.00135 AGAAT 0.00104 AGACA 0.00161 AGACC 0.00095 AGACG 0.000978 AGACT 0.00104 AGAGA 0.00168 AGAGC 0.00104 AGAGG 0.000999 AGAGT 0.00122 AGATA 0.00117 AGATC 0.000899 AGATG 0.00142 AGATT 0.00102 AGCAA 0.00115 AGCAC 0.000948 AGCAG 0.0011 AGCAT 0.000795 AGCCA 0.00105 AGCCC 0.000752 AGCCG 0.000732 AGCCT 0.000642 AGCGA 0.000729 AGCGC 0.000465 AGCGG 0.00061 AGCGT 0.000584 AGCTA 0.000868 AGCTC 0.00102 AGCTG 0.00112 AGCTT 0.000801 AGGAA 0.00091 AGGAC 0.000665 AGGAG 0.0011 AGGAT 0.000642 AGGCA 0.000681 AGGCC 0.000469 AGGCG 0.000539 AGGCT 0.000642 AGGGA 0.000772 AGGGC 0.000621 AGGGG 0.000822 AGGGT 0.00086 AGGTA 0.000677 AGGTC 0.00066 AGGTG 0.00108 AGGTT 0.000921 AGTAA 0.000976 AGTAC 0.0015 AGTAG 0.00114 AGTAT 0.00125 AGTCA 0.00108 AGTCC 0.000772 AGTCG 0.000826 AGTCT 0.00104 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.00092 AGTGG 0.00116 AGTGT 0.00129 AGTTA 0.000741 AGTTC 0.00083 AGTTG 0.00147 AGTTT 0.00113 ATAAA 0.00145 ATAAC 0.000865 ATAAG 0.000724 ATAAT 0.00128 ATACA 0.00163 ATACC 0.000898 ATACG 0.000742 ATACT 0.00125 ATAGA 0.00102 ATAGC 0.00073 ATAGG 0.000555 ATAGT 0.000825 ATATA 0.00191 ATATC 0.00126 ATATG 0.00108 ATATT 0.00151 ATCAA 0.00134 ATCAC 0.00118 ATCAG 0.000973 ATCAT 0.0012 ATCCA 0.00113 ATCCC 0.000693 ATCCG 0.000575 ATCCT 0.000642 ATCGA 0.000833 ATCGC 0.000637 ATCGG 0.000648 ATCGT 0.000816 ATCTA 0.000921 ATCTC 0.00134 ATCTG 0.0012 ATCTT 0.00105 ATGAA 0.00118 ATGAC 0.00107 ATGAG 0.00112 ATGAT 0.0012 ATGCA 0.00114 ATGCC 0.000653 ATGCG 0.000551 ATGCT 0.000795 ATGGA 0.00126 ATGGC 0.000936 ATGGG 0.000894 ATGGT 0.00116 ATGTA 0.00146 ATGTC 0.00116 ATGTG 0.00128 ATGTT 0.00124 ATTAA 0.000937 ATTAC 0.000925 ATTAG 0.000765 ATTAT 0.00128 ATTCA 0.0011 ATTCC 0.00088 ATTCG 0.000677 ATTCT 0.00104 ATTGA 0.00131 ATTGC 0.000898 ATTGG 0.00113 ATTGT 0.00144 ATTTA 0.00113 ATTTC 0.00125 ATTTG 0.00128 ATTTT 0.00193 CAAAA 0.00197 CAAAC 0.00147 CAAAG 0.00112 CAAAT 0.00128 CAACA 0.00162 CAACC 0.00126 CAACG 0.000792 CAACT 0.00147 CAAGA 0.00134 CAAGC 0.000966 CAAGG 0.000927 CAAGT 0.00185 CAATA 0.00128 CAATC 0.00106 CAATG 0.0012 CAATT 0.00124 CACAA 0.00152 CACAC 0.00152 CACAG 0.00119 CACAT 0.00128 CACCA 0.00166 CACCC 0.001 CACCG 0.000775 CACCT 0.00108 CACGA 0.000795 CACGC 0.000622 CACGG 0.000646 CACGT 0.00115 CACTA 0.000914 CACTC 0.00121 CACTG 0.0011 CACTT 0.00122 CAGAA 0.00131 CAGAC 0.00122 CAGAG 0.00113 CAGAT 0.0012 CAGCA 0.00123 CAGCC 0.000961 CAGCG 0.000598 CAGCT 0.00112 CAGGA 0.000821 CAGGC 0.000637 CAGGG 0.000743 CAGGT 0.000879 CAGTA 0.00151 CAGTC 0.001 CAGTG 0.0011 CAGTT 0.00108 CATAA 0.000872 CATAC 0.00117 CATAG 0.000629 CATAT 0.00108 CATCA 0.00126 CATCC 0.000848 CATCG 0.000668 CATCT 0.00142 CATGA 0.00107 CATGC 0.000896 CATGG 0.00103 CATGT 0.00149 CATTA 0.000937 CATTC 0.00107 CATTG 0.0012 CATTT 0.00143 CCAAA 0.00161 CCAAC 0.00135 CCAAG 0.00107 CCAAT 0.00113 CCACA 0.00144 CCACC 0.00135 CCACG 0.000722 CCACT 0.00116 CCAGA 0.00122 CCAGC 0.00092 CCAGG 0.000714 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000872 CCATC 0.00115 CCATG 0.00103 CCATT 0.00119 CCCAA 0.00118 CCCAC 0.00108 CCCAG 0.000812 CCCAT 0.000894 CCCCA 0.00116 CCCCC 0.000992 CCCCG 0.000556 CCCCT 0.000822 CCCGA 0.000587 CCCGC 0.000493 CCCGG 0.000435 CCCGT 0.00057 CCCTA 0.000577 CCCTC 0.000908 CCCTG 0.000743 CCCTT 0.000846 CCGAA 0.000757 CCGAC 0.00072 CCGAG 0.000694 CCGAT 0.000648 CCGCA 0.000615 CCGCC 0.000692 CCGCG 0.000344 CCGCT 0.00061 CCGGA 0.000542 CCGGC 0.000462 CCGGG 0.000435 CCGGT 0.000624 CCGTA 0.000569 CCGTC 0.000729 CCGTG 0.000646 CCGTT 0.000796 CCTAA 0.000523 CCTAC 0.000699 CCTAG 0.000346 CCTAT 0.000555 CCTCA 0.000873 CCTCC 0.0011 CCTCG 0.000643 CCTCT 0.000999 CCTGA 0.000744 CCTGC 0.000673 CCTGG 0.000714 CCTGT 0.00095 CCTTA 0.000478 CCTTC 0.000891 CCTTG 0.000927 CCTTT 0.000933 CGAAA 0.00103 CGAAC 0.000644 CGAAG 0.000584 CGAAT 0.000677 CGACA 0.00107 CGACC 0.000627 CGACG 0.000618 CGACT 0.000826 CGAGA 0.000967 CGAGC 0.000677 CGAGG 0.000643 CGAGT 0.000967 CGATA 0.000913 CGATC 0.000586 CGATG 0.000668 CGATT 0.000767 CGCAA 0.000671 CGCAC 0.00065 CGCAG 0.000551 CGCAT 0.000551 CGCCA 0.000831 CGCCC 0.000562 CGCCG 0.000491 CGCCT 0.000539 CGCGA 0.000394 CGCGC 0.000345 CGCGG 0.000344 CGCGT 0.00043 CGCTA 0.000497 CGCTC 0.00066 CGCTG 0.000598 CGCTT 0.000632 CGGAA 0.000777 CGGAC 0.000561 CGGAG 0.000729 CGGAT 0.000575 CGGCA 0.000618 CGGCC 0.000493 CGGCG 0.000491 CGGCT 0.000732 CGGGA 0.000526 CGGGC 0.000434 CGGGG 0.000556 CGGGT 0.00057 CGGTA 0.000686 CGGTC 0.000606 CGGTG 0.000775 CGGTT 0.000761 CGTAA 0.000477 CGTAC 0.000822 CGTAG 0.000528 CGTAT 0.000742 CGTCA 0.000875 CGTCC 0.000601 CGTCG 0.000618 CGTCT 0.000978 CGTGA 0.000951 CGTGC 0.000646 CGTGG 0.000722 CGTGT 0.000899 CGTTA 0.000518 CGTTC 0.000611 CGTTG 0.000792 CGTTT 0.001 CTAAA 0.000848 CTAAC 0.000702 CTAAG 0.00048 CTAAT 0.000765 CTACA 0.00152 CTACC 0.000715 CTACG 0.000528 CTACT 0.00114 CTAGA 0.000682 CTAGC 0.000476 CTAGG 0.000346 CTAGT 0.000578 CTATA 0.000831 CTATC 0.000779 CTATG 0.000629 CTATT 0.000892 CTCAA 0.00129 CTCAC 0.00107 CTCAG 0.000923 CTCAT 0.00112 CTCCA 0.0016 CTCCC 0.000942 CTCCG 0.000729 CTCCT 0.0011 CTCGA 0.00078 CTCGC 0.00067 CTCGG 0.000694 CTCGT 0.00111 CTCTA 0.000911 CTCTC 0.00152 CTCTG 0.00113 CTCTT 0.00137 CTGAA 0.00114 CTGAC 0.000912 CTGAG 0.000923 CTGAT 0.000973 CTGCA 0.00107 CTGCC 0.00076 CTGCG 0.000551 CTGCT 0.0011 CTGGA 0.00114 CTGGC 0.000783 CTGGG 0.000812 CTGGT 0.00113 CTGTA 0.00165 CTGTC 0.00117 CTGTG 0.00119 CTGTT 0.00125 CTTAA 0.00048 CTTAC 0.000621 CTTAG 0.00048 CTTAT 0.000724 CTTCA 0.00115 CTTCC 0.000959 CTTCG 0.000584 CTTCT 0.00135 CTTGA 0.00108 CTTGC 0.00092 CTTGG 0.00107 CTTGT 0.00202 CTTTA 0.000687 CTTTC 0.00104 CTTTG 0.00112 CTTTT 0.00182 GAAAA 0.00204 GAAAC 0.00123 GAAAG 0.00104 GAAAT 0.00125 GAACA 0.00112 GAACC 0.000872 GAACG 0.000611 GAACT 0.00083 GAAGA 0.00142 GAAGC 0.000826 GAAGG 0.000891 GAAGT 0.000914 GAATA 0.000951 GAATC 0.00085 GAATG 0.00107 GAATT 0.000821 GACAA 0.00138 GACAC 0.00124 GACAG 0.00117 GACAT 0.00116 GACCA 0.00104 GACCC 0.000774 GACCG 0.000606 GACCT 0.00066 GACGA 0.000963 GACGC 0.000599 GACGG 0.000729 GACGT 0.000782 GACTA 0.000762 GACTC 0.00099 GACTG 0.001 GACTT 0.000957 GAGAA 0.00135 GAGAC 0.0013 GAGAG 0.00152 GAGAT 0.00134 GAGCA 0.000992 GAGCC 0.000802 GAGCG 0.00066 GAGCT 0.00102 GAGGA 0.00103 GAGGC 0.000664 GAGGG 0.000908 GAGGT 0.00101 GAGTA 0.00107 GAGTC 0.00099 GAGTG 0.00121 GAGTT 0.00111 GATAA 0.000973 GATAC 0.00106 GATAG 0.000779 GATAT 0.00126 GATCA 0.000927 GATCC 0.000669 GATCG 0.000586 GATCT 0.000899 GATGA 0.0012 GATGC 0.000756 GATGG 0.00115 GATGT 0.00109 GATTA 0.000754 GATTC 0.00085 GATTG 0.00106 GATTT 0.00117 GCAAA 0.00109 GCAAC 0.00101 GCAAG 0.00092 GCAAT 0.000898 GCACA 0.00105 GCACC 0.00084 GCACG 0.000646 GCACT 0.00092 GCAGA 0.000987 GCAGC 0.000859 GCAGG 0.000673 GCAGT 0.000962 GCATA 0.000664 GCATC 0.000756 GCATG 0.000896 GCATT 0.000829 GCCAA 0.00107 GCCAC 0.000916 GCCAG 0.000783 GCCAT 0.000936 GCCCA 0.000808 GCCCC 0.000615 GCCCG 0.000434 GCCCT 0.000621 GCCGA 0.000627 GCCGC 0.000539 GCCGG 0.000462 GCCGT 0.000707 GCCTA 0.000389 GCCTC 0.000664 GCCTG 0.000637 GCCTT 0.00064 GCGAA 0.00057 GCGAC 0.000643 GCGAG 0.00067 GCGAT 0.000637 GCGCA 0.00048 GCGCC 0.000451 GCGCG 0.000345 GCGCT 0.000465 GCGGA 0.000563 GCGGC 0.000539 GCGGG 0.000493 GCGGT 0.00067 GCGTA 0.000414 GCGTC 0.000599 GCGTG 0.000622 GCGTT 0.000598 GCTAA 0.000591 GCTAC 0.000953 GCTAG 0.000476 GCTAT 0.00073 GCTCA 0.000922 GCTCC 0.000837 GCTCG 0.000677 GCTCT 0.00104 GCTGA 0.00095 GCTGC 0.000859 GCTGG 0.00092 GCTGT 0.00118 GCTTA 0.000559 GCTTC 0.000826 GCTTG 0.000966 GCTTT 0.000875 GGAAA 0.00134 GGAAC 0.000793 GGAAG 0.000959 GGAAT 0.00088 GGACA 0.000919 GGACC 0.00065 GGACG 0.000601 GGACT 0.000772 GGAGA 0.00141 GGAGC 0.000837 GGAGG 0.0011 GGAGT 0.00103 GGATA 0.000775 GGATC 0.000669 GGATG 0.000848 GGATT 0.000748 GGCAA 0.00086 GGCAC 0.00071 GGCAG 0.00076 GGCAT 0.000653 GGCCA 0.000782 GGCCC 0.000527 GGCCG 0.000493 GGCCT 0.000469 GGCGA 0.000688 GGCGC 0.000451 GGCGG 0.000692 GGCGT 0.000594 GGCTA 0.000624 GGCTC 0.000802 GGCTG 0.000961 GGCTT 0.000789 GGGAA 0.000918 GGGAC 0.000638 GGGAG 0.000942 GGGAT 0.000693 GGGCA 0.000637 GGGCC 0.000527 GGGCG 0.000562 GGGCT 0.000752 GGGGA 0.000937 GGGGC 0.000615 GGGGG 0.000992 GGGGT 0.000987 GGGTA 0.000708 GGGTC 0.000774 GGGTG 0.001 GGGTT 0.000996 GGTAA 0.000662 GGTAC 0.000855 GGTAG 0.000715 GGTAT 0.000898 GGTCA 0.000854 GGTCC 0.00065 GGTCG 0.000627 GGTCT 0.00095 GGTGA 0.00112 GGTGC 0.00084 GGTGG 0.00135 GGTGT 0.00121 GGTTA 0.000708 GGTTC 0.000872 GGTTG 0.00126 GGTTT 0.00119 GTAAA 0.000906 GTAAC 0.000681 GTAAG 0.000621 GTAAT 0.000925 GTACA 0.00201 GTACC 0.000855 GTACG 0.000822 GTACT 0.0015 GTAGA 0.00113 GTAGC 0.000953 GTAGG 0.000699 GTAGT 0.00112 GTATA 0.00106 GTATC 0.00106 GTATG 0.00117 GTATT 0.00123 GTCAA 0.00113 GTCAC 0.00107 GTCAG 0.000912 GTCAT 0.00107 GTCCA 0.00108 GTCCC 0.000638 GTCCG 0.000561 GTCCT 0.000665 GTCGA 0.000853 GTCGC 0.000643 GTCGG 0.00072 GTCGT 0.000924 GTCTA 0.000867 GTCTC 0.0013 GTCTG 0.00122 GTCTT 0.00118 GTGAA 0.00109 GTGAC 0.00107 GTGAG 0.00107 GTGAT 0.00118 GTGCA 0.00115 GTGCC 0.00071 GTGCG 0.00065 GTGCT 0.000948 GTGGA 0.00131 GTGGC 0.000916 GTGGG 0.00108 GTGGT 0.00136 GTGTA 0.00111 GTGTC 0.00124 GTGTG 0.00152 GTGTT 0.0013 GTTAA 0.000607 GTTAC 0.000681 GTTAG 0.000702 GTTAT 0.000865 GTTCA 0.00104 GTTCC 0.000793 GTTCG 0.000644 GTTCT 0.000956 GTTGA 0.00135 GTTGC 0.00101 GTTGG 0.00135 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.000833 GTTTC 0.00123 GTTTG 0.00147 GTTTT 0.00166 TAAAA 0.0014 TAAAC 0.000833 TAAAG 0.000687 TAAAT 0.00113 TAACA 0.000886 TAACC 0.000708 TAACG 0.000518 TAACT 0.000741 TAAGA 0.000675 TAAGC 0.000559 TAAGG 0.000478 TAAGT 0.000595 TAATA 0.00109 TAATC 0.000754 TAATG 0.000937 TAATT 0.00112 TACAA 0.00195 TACAC 0.00111 TACAG 0.00165 TACAT 0.00146 TACCA 0.00106 TACCC 0.000708 TACCG 0.000686 TACCT 0.000677 TACGA 0.000982 TACGC 0.000414 TACGG 0.000569 TACGT 0.000605 TACTA 0.000806 TACTC 0.00107 TACTG 0.00151 TACTT 0.00147 TAGAA 0.000902 TAGAC 0.000867 TAGAG 0.000911 TAGAT 0.000921 TAGCA 0.000763 TAGCC 0.000624 TAGCG 0.000497 TAGCT 0.000868 TAGGA 0.000564 TAGGC 0.000389 TAGGG 0.000577 TAGGT 0.000593 TAGTA 0.000806 TAGTC 0.000762 TAGTG 0.000914 TAGTT 0.000963 TATAA 0.001 TATAC 0.00106 TATAG 0.000831 TATAT 0.00191 TATCA 0.00121 TATCC 0.000775 TATCG 0.000913 TATCT 0.00117 TATGA 0.000992 TATGC 0.000664 TATGG 0.000872 TATGT 0.00123 TATTA 0.00109 TATTC 0.000951 TATTG 0.00128 TATTT 0.00178 TCAAA 0.00147 TCAAC 0.00135 TCAAG 0.00108 TCAAT 0.00131 TCACA 0.00126 TCACC 0.00112 TCACG 0.000951 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00127 TCAGC 0.00095 TCAGG 0.000744 TCAGT 0.000982 TCATA 0.000992 TCATC 0.0012 TCATG 0.00107 TCATT 0.00128 TCCAA 0.00145 TCCAC 0.00131 TCCAG 0.00114 TCCAT 0.00126 TCCCA 0.000951 TCCCC 0.000937 TCCCG 0.000526 TCCCT 0.000772 TCCGA 0.000827 TCCGC 0.000563 TCCGG 0.000542 TCCGT 0.00071 TCCTA 0.000564 TCCTC 0.00103 TCCTG 0.000821 TCCTT 0.000894 TCGAA 0.000858 TCGAC 0.000853 TCGAG 0.00078 TCGAT 0.000833 TCGCA 0.000706 TCGCC 0.000688 TCGCG 0.000394 TCGCT 0.000729 TCGGA 0.000827 TCGGC 0.000627 TCGGG 0.000587 TCGGT 0.000779 TCGTA 0.000982 TCGTC 0.000963 TCGTG 0.000795 TCGTT 0.00085 TCTAA 0.000761 TCTAC 0.00113 TCTAG 0.000682 TCTAT 0.00102 TCTCA 0.00145 TCTCC 0.00141 TCTCG 0.000967 TCTCT 0.00168 TCTGA 0.00127 TCTGC 0.000987 TCTGG 0.00122 TCTGT 0.0014 TCTTA 0.000675 TCTTC 0.00142 TCTTG 0.00134 TCTTT 0.00155 TGAAA 0.00158 TGAAC 0.00104 TGAAG 0.00115 TGAAT 0.0011 TGACA 0.00136 TGACC 0.000854 TGACG 0.000875 TGACT 0.00108 TGAGA 0.00145 TGAGC 0.000922 TGAGG 0.000873 TGAGT 0.00116 TGATA 0.00121 TGATC 0.000927 TGATG 0.00126 TGATT 0.0013 TGCAA 0.00124 TGCAC 0.00115 TGCAG 0.00107 TGCAT 0.00114 TGCCA 0.00105 TGCCC 0.000637 TGCCG 0.000618 TGCCT 0.000681 TGCGA 0.000706 TGCGC 0.00048 TGCGG 0.000615 TGCGT 0.000625 TGCTA 0.000763 TGCTC 0.000992 TGCTG 0.00123 TGCTT 0.001 TGGAA 0.00136 TGGAC 0.00108 TGGAG 0.0016 TGGAT 0.00113 TGGCA 0.00105 TGGCC 0.000782 TGGCG 0.000831 TGGCT 0.00105 TGGGA 0.000951 TGGGC 0.000808 TGGGG 0.00116 TGGGT 0.00106 TGGTA 0.00106 TGGTC 0.00104 TGGTG 0.00166 TGGTT 0.00134 TGTAA 0.00102 TGTAC 0.00201 TGTAG 0.00152 TGTAT 0.00163 TGTCA 0.00136 TGTCC 0.000919 TGTCG 0.00107 TGTCT 0.00161 TGTGA 0.00126 TGTGC 0.00105 TGTGG 0.00144 TGTGT 0.00178 TGTTA 0.000886 TGTTC 0.00112 TGTTG 0.00162 TGTTT 0.00187 TTAAA 0.000842 TTAAC 0.000607 TTAAG 0.00048 TTAAT 0.000937 TTACA 0.00102 TTACC 0.000662 TTACG 0.000477 TTACT 0.000976 TTAGA 0.000761 TTAGC 0.000591 TTAGG 0.000523 TTAGT 0.000924 TTATA 0.001 TTATC 0.000973 TTATG 0.000872 TTATT 0.00147 TTCAA 0.00146 TTCAC 0.00109 TTCAG 0.00114 TTCAT 0.00118 TTCCA 0.00136 TTCCC 0.000918 TTCCG 0.000777 TTCCT 0.00091 TTCGA 0.000858 TTCGC 0.00057 TTCGG 0.000757 TTCGT 0.000744 TTCTA 0.000902 TTCTC 0.00135 TTCTG 0.00131 TTCTT 0.0014 TTGAA 0.00146 TTGAC 0.00113 TTGAG 0.00129 TTGAT 0.00134 TTGCA 0.00124 TTGCC 0.00086 TTGCG 0.000671 TTGCT 0.00115 TTGGA 0.00145 TTGGC 0.00107 TTGGG 0.00118 TTGGT 0.00145 TTGTA 0.00195 TTGTC 0.00138 TTGTG 0.00152 TTGTT 0.00171 TTTAA 0.000842 TTTAC 0.000906 TTTAG 0.000848 TTTAT 0.00145 TTTCA 0.00158 TTTCC 0.00134 TTTCG 0.00103 TTTCT 0.00162 TTTGA 0.00147 TTTGC 0.00109 TTTGG 0.00161 TTTGT 0.00167 TTTTA 0.0014 TTTTC 0.00204 TTTTG 0.00197 TTTTT 0.00401 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4366 AAAAC 0.1676 AAAAG 0.1793 AAAAT 0.2164 AAACA 0.3683 AAACC 0.221 AAACG 0.1845 AAACT 0.2262 AAAGA 0.3423 AAAGC 0.1808 AAAGG 0.1971 AAAGT 0.2797 AAATA 0.3262 AAATC 0.2029 AAATG 0.2446 AAATT 0.2263 AACAA 0.316 AACAC 0.226 AACAG 0.2239 AACAT 0.2342 AACCA 0.341 AACCC 0.2448 AACCG 0.1818 AACCT 0.2324 AACGA 0.3069 AACGC 0.1999 AACGG 0.2602 AACGT 0.233 AACTA 0.2371 AACTC 0.2557 AACTG 0.2587 AACTT 0.2485 AAGAA 0.2932 AAGAC 0.2231 AAGAG 0.2662 AAGAT 0.2174 AAGCA 0.3163 AAGCC 0.2398 AAGCG 0.1833 AAGCT 0.2606 AAGGA 0.2877 AAGGC 0.192 AAGGG 0.2589 AAGGT 0.2614 AAGTA 0.3242 AAGTC 0.2051 AAGTG 0.2464 AAGTT 0.2243 AATAA 0.3047 AATAC 0.2298 AATAG 0.1631 AATAT 0.3025 AATCA 0.3496 AATCC 0.1923 AATCG 0.1907 AATCT 0.2675 AATGA 0.2932 AATGC 0.1715 AATGG 0.2478 AATGT 0.2874 AATTA 0.2591 AATTC 0.1874 AATTG 0.2667 AATTT 0.2869 ACAAA 0.2629 ACAAC 0.2129 ACAAG 0.2947 ACAAT 0.2296 ACACA 0.3447 ACACC 0.2319 ACACG 0.17 ACACT 0.2533 ACAGA 0.2673 ACAGC 0.2176 ACAGG 0.1756 ACAGT 0.3395 ACATA 0.2478 ACATC 0.2142 ACATG 0.2717 ACATT 0.2663 ACCAA 0.2923 ACCAC 0.2524 ACCAG 0.2217 ACCAT 0.2336 ACCCA 0.3093 ACCCC 0.2802 ACCCG 0.1578 ACCCT 0.2527 ACCGA 0.2879 ACCGC 0.227 ACCGG 0.213 ACCGT 0.2721 ACCTA 0.18 ACCTC 0.2973 ACCTG 0.2654 ACCTT 0.2573 ACGAA 0.2192 ACGAC 0.2481 ACGAG 0.2993 ACGAT 0.2334 ACGCA 0.2834 ACGCC 0.2591 ACGCG 0.1929 ACGCT 0.2646 ACGGA 0.2668 ACGGC 0.2509 ACGGG 0.2038 ACGGT 0.2785 ACGTA 0.1921 ACGTC 0.2393 ACGTG 0.3524 ACGTT 0.2161 ACTAA 0.2738 ACTAC 0.3177 ACTAG 0.1631 ACTAT 0.2455 ACTCA 0.2686 ACTCC 0.2352 ACTCG 0.2146 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2204 ACTGC 0.1931 ACTGG 0.2098 ACTGT 0.3767 ACTTA 0.1328 ACTTC 0.2076 ACTTG 0.3843 ACTTT 0.2754 AGAAA 0.3241 AGAAC 0.1901 AGAAG 0.2626 AGAAT 0.2231 AGACA 0.3505 AGACC 0.2064 AGACG 0.2045 AGACT 0.2387 AGAGA 0.3443 AGAGC 0.2081 AGAGG 0.1987 AGAGT 0.2489 AGATA 0.266 AGATC 0.1999 AGATG 0.3012 AGATT 0.2329 AGCAA 0.2903 AGCAC 0.2365 AGCAG 0.2657 AGCAT 0.2074 AGCCA 0.3366 AGCCC 0.231 AGCCG 0.222 AGCCT 0.2104 AGCGA 0.3096 AGCGC 0.1946 AGCGG 0.2477 AGCGT 0.2481 AGCTA 0.2291 AGCTC 0.2593 AGCTG 0.2918 AGCTT 0.2198 AGGAA 0.2879 AGGAC 0.1963 AGGAG 0.3107 AGGAT 0.2051 AGGCA 0.3004 AGGCC 0.1921 AGGCG 0.2202 AGGCT 0.2873 AGGGA 0.2646 AGGGC 0.1896 AGGGG 0.262 AGGGT 0.2838 AGGTA 0.2142 AGGTC 0.2009 AGGTG 0.3068 AGGTT 0.2781 AGTAA 0.2117 AGTAC 0.3013 AGTAG 0.2231 AGTAT 0.2638 AGTCA 0.3002 AGTCC 0.2062 AGTCG 0.2117 AGTCT 0.2819 AGTGA 0.2539 AGTGC 0.2 AGTGG 0.2588 AGTGT 0.2873 AGTTA 0.1782 AGTTC 0.207 AGTTG 0.344 AGTTT 0.2708 ATAAA 0.3536 ATAAC 0.1891 ATAAG 0.1605 ATAAT 0.2968 ATACA 0.3574 ATACC 0.1994 ATACG 0.1587 ATACT 0.2845 ATAGA 0.3307 ATAGC 0.2266 ATAGG 0.1736 ATAGT 0.269 ATATA 0.3301 ATATC 0.2162 ATATG 0.1832 ATATT 0.2705 ATCAA 0.2957 ATCAC 0.2407 ATCAG 0.2063 ATCAT 0.2574 ATCCA 0.3706 ATCCC 0.2272 ATCCG 0.18 ATCCT 0.2222 ATCGA 0.3 ATCGC 0.2036 ATCGG 0.2172 ATCGT 0.2792 ATCTA 0.2087 ATCTC 0.2907 ATCTG 0.2607 ATCTT 0.2399 ATGAA 0.2707 ATGAC 0.227 ATGAG 0.2361 ATGAT 0.2663 ATGCA 0.3706 ATGCC 0.2054 ATGCG 0.1669 ATGCT 0.2571 ATGGA 0.3037 ATGGC 0.2125 ATGGG 0.2084 ATGGT 0.2755 ATGTA 0.2865 ATGTC 0.2232 ATGTG 0.2393 ATGTT 0.251 ATTAA 0.2484 ATTAC 0.2336 ATTAG 0.187 ATTAT 0.3311 ATTCA 0.3037 ATTCC 0.2279 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.295 ATTGA 0.2867 ATTGC 0.1785 ATTGG 0.2297 ATTGT 0.3051 ATTTA 0.2058 ATTTC 0.2192 ATTTG 0.2184 ATTTT 0.3567 CAAAA 0.3464 CAAAC 0.2338 CAAAG 0.1872 CAAAT 0.2325 CAACA 0.3226 CAACC 0.2312 CAACG 0.1464 CAACT 0.2998 CAAGA 0.2689 CAAGC 0.1833 CAAGG 0.1756 CAAGT 0.3722 CAATA 0.2781 CAATC 0.2115 CAATG 0.2455 CAATT 0.2649 CACAA 0.2854 CACAC 0.2546 CACAG 0.2169 CACAT 0.2431 CACCA 0.375 CACCC 0.2197 CACCG 0.1622 CACCT 0.2431 CACGA 0.2602 CACGC 0.1809 CACGG 0.1946 CACGT 0.3643 CACTA 0.2096 CACTC 0.2663 CACTG 0.2422 CACTT 0.2819 CAGAA 0.2881 CAGAC 0.2344 CAGAG 0.2253 CAGAT 0.2522 CAGCA 0.3147 CAGCC 0.2416 CAGCG 0.1448 CAGCT 0.2989 CAGGA 0.2813 CAGGC 0.1957 CAGGG 0.2319 CAGGT 0.2911 CAGTA 0.3334 CAGTC 0.2075 CAGTG 0.2183 CAGTT 0.2407 CATAA 0.2384 CATAC 0.2989 CATAG 0.1661 CATAT 0.2967 CATCA 0.3118 CATCC 0.1932 CATCG 0.1577 CATCT 0.3373 CATGA 0.2532 CATGC 0.1959 CATGG 0.2214 CATGT 0.3296 CATTA 0.2073 CATTC 0.2269 CATTG 0.2509 CATTT 0.3149 CCAAA 0.3079 CCAAC 0.2545 CCAAG 0.2078 CCAAT 0.2298 CCACA 0.3087 CCACC 0.2797 CCACG 0.151 CCACT 0.2606 CCAGA 0.323 CCAGC 0.2249 CCAGG 0.1849 CCAGT 0.2671 CCATA 0.2168 CCATC 0.2626 CCATG 0.2305 CCATT 0.2901 CCCAA 0.3004 CCCAC 0.2592 CCCAG 0.2034 CCCAT 0.237 CCCCA 0.3316 CCCCC 0.2772 CCCCG 0.1524 CCCCT 0.2388 CCCGA 0.292 CCCGC 0.2219 CCCGG 0.21 CCCGT 0.2762 CCCTA 0.1931 CCCTC 0.2832 CCCTG 0.2375 CCCTT 0.2862 CCGAA 0.2787 CCGAC 0.2378 CCGAG 0.2416 CCGAT 0.2419 CCGCA 0.2803 CCGCC 0.2929 CCGCG 0.1501 CCGCT 0.2767 CCGGA 0.2729 CCGGC 0.2103 CCGGG 0.2147 CCGGT 0.3022 CCGTA 0.2187 CCGTC 0.2549 CCGTG 0.2307 CCGTT 0.2958 CCTAA 0.2444 CCTAC 0.3177 CCTAG 0.1689 CCTAT 0.269 CCTCA 0.25 CCTCC 0.2894 CCTCG 0.1751 CCTCT 0.2855 CCTGA 0.2516 CCTGC 0.2082 CCTGG 0.2306 CCTGT 0.3096 CCTTA 0.155 CCTTC 0.2753 CCTTG 0.2752 CCTTT 0.2946 CGAAA 0.3474 CGAAC 0.2161 CGAAG 0.1994 CGAAT 0.2371 CGACA 0.3399 CGACC 0.1966 CGACG 0.189 CGACT 0.2746 CGAGA 0.31 CGAGC 0.1972 CGAGG 0.1928 CGAGT 0.3001 CGATA 0.3116 CGATC 0.1956 CGATG 0.2262 CGATT 0.2666 CGCAA 0.2844 CGCAC 0.2517 CGCAG 0.2274 CGCAT 0.2364 CGCCA 0.3499 CGCCC 0.2223 CGCCG 0.1957 CGCCT 0.2321 CGCGA 0.2747 CGCGC 0.2164 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2919 CGCTA 0.2165 CGCTC 0.267 CGCTG 0.2467 CGCTT 0.2698 CGGAA 0.302 CGGAC 0.2041 CGGAG 0.2689 CGGAT 0.225 CGGCA 0.2757 CGGCC 0.1956 CGGCG 0.2008 CGGCT 0.3279 CGGGA 0.2628 CGGGC 0.193 CGGGG 0.2641 CGGGT 0.28 CGGTA 0.2509 CGGTC 0.2088 CGGTG 0.2619 CGGTT 0.2784 CGTAA 0.1962 CGTAC 0.3046 CGTAG 0.1992 CGTAT 0.3 CGTCA 0.2947 CGTCC 0.1913 CGTCG 0.1934 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.31 CGTGC 0.1952 CGTGG 0.2164 CGTGT 0.2784 CGTTA 0.1797 CGTTC 0.2162 CGTTG 0.2609 CGTTT 0.3431 CTAAA 0.3091 CTAAC 0.2409 CTAAG 0.1676 CTAAT 0.2824 CTACA 0.3966 CTACC 0.1783 CTACG 0.1294 CTACT 0.2957 CTAGA 0.3395 CTAGC 0.2185 CTAGG 0.1674 CTAGT 0.2745 CTATA 0.2683 CTATC 0.2415 CTATG 0.2024 CTATT 0.2878 CTCAA 0.2984 CTCAC 0.2286 CTCAG 0.2108 CTCAT 0.2622 CTCCA 0.3746 CTCCC 0.2068 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.2554 CTCGA 0.2538 CTCGC 0.1961 CTCGG 0.2076 CTCGT 0.3426 CTCTA 0.1931 CTCTC 0.2953 CTCTG 0.2263 CTCTT 0.2853 CTGAA 0.2979 CTGAC 0.2194 CTGAG 0.2272 CTGAT 0.2555 CTGCA 0.3173 CTGCC 0.2111 CTGCG 0.1546 CTGCT 0.317 CTGGA 0.3052 CTGGC 0.1946 CTGGG 0.2031 CTGGT 0.2971 CTGTA 0.3268 CTGTC 0.2132 CTGTG 0.2166 CTGTT 0.2434 CTTAA 0.2131 CTTAC 0.2705 CTTAG 0.1977 CTTAT 0.3187 CTTCA 0.2925 CTTCC 0.2297 CTTCG 0.1412 CTTCT 0.3365 CTTGA 0.2296 CTTGC 0.1704 CTTGG 0.208 CTTGT 0.392 CTTTA 0.1522 CTTTC 0.2248 CTTTG 0.2324 CTTTT 0.3906 GAAAA 0.3663 GAAAC 0.2125 GAAAG 0.1841 GAAAT 0.2371 GAACA 0.3316 GAACC 0.2414 GAACG 0.1717 GAACT 0.2553 GAAGA 0.3503 GAAGC 0.1979 GAAGG 0.2107 GAAGT 0.2412 GAATA 0.2648 GAATC 0.2294 GAATG 0.2751 GAATT 0.2307 GACAA 0.2836 GACAC 0.2349 GACAG 0.2334 GACAT 0.248 GACCA 0.3466 GACCC 0.2451 GACCG 0.183 GACCT 0.2253 GACGA 0.3236 GACGC 0.1901 GACGG 0.2262 GACGT 0.2602 GACTA 0.2068 GACTC 0.2622 GACTG 0.263 GACTT 0.268 GAGAA 0.2584 GAGAC 0.229 GAGAG 0.262 GAGAT 0.2506 GAGCA 0.2937 GAGCC 0.2261 GAGCG 0.1782 GAGCT 0.302 GAGGA 0.2934 GAGGC 0.178 GAGGG 0.2426 GAGGT 0.286 GAGTA 0.2481 GAGTC 0.2271 GAGTG 0.2636 GAGTT 0.2613 GATAA 0.2417 GATAC 0.2507 GATAG 0.1834 GATAT 0.3242 GATCA 0.31 GATCC 0.21 GATCG 0.1818 GATCT 0.2983 GATGA 0.2938 GATGC 0.1752 GATGG 0.2615 GATGT 0.2695 GATTA 0.2018 GATTC 0.2266 GATTG 0.2588 GATTT 0.3128 GCAAA 0.2813 GCAAC 0.2516 GCAAG 0.228 GCAAT 0.2391 GCACA 0.3137 GCACC 0.2341 GCACG 0.1824 GCACT 0.2698 GCAGA 0.2899 GCAGC 0.237 GCAGG 0.1913 GCAGT 0.2819 GCATA 0.2152 GCATC 0.2377 GCATG 0.2757 GCATT 0.2714 GCCAA 0.2914 GCCAC 0.2331 GCCAG 0.2122 GCCAT 0.2633 GCCCA 0.3385 GCCCC 0.2416 GCCCG 0.1646 GCCCT 0.2553 GCCGA 0.2808 GCCGC 0.222 GCCGG 0.1874 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.1735 GCCTC 0.2768 GCCTG 0.267 GCCTT 0.2827 GCGAA 0.236 GCGAC 0.2425 GCGAG 0.2616 GCGAT 0.2599 GCGCA 0.2804 GCGCC 0.2479 GCGCG 0.1925 GCGCT 0.2792 GCGGA 0.2603 GCGGC 0.2309 GCGGG 0.2103 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.1952 GCGTC 0.2629 GCGTG 0.2632 GCGTT 0.2787 GCTAA 0.2144 GCTAC 0.3342 GCTAG 0.174 GCTAT 0.2773 GCTCA 0.2751 GCTCC 0.2254 GCTCG 0.1871 GCTCT 0.3123 GCTGA 0.2556 GCTGC 0.2082 GCTGG 0.2265 GCTGT 0.3097 GCTTA 0.1774 GCTTC 0.2606 GCTTG 0.2896 GCTTT 0.2724 GGAAA 0.3364 GGAAC 0.1973 GGAAG 0.2377 GGAAT 0.2286 GGACA 0.3178 GGACC 0.2119 GGACG 0.1935 GGACT 0.2768 GGAGA 0.3302 GGAGC 0.1797 GGAGG 0.2411 GGAGT 0.2489 GGATA 0.2633 GGATC 0.2157 GGATG 0.2645 GGATT 0.2565 GGCAA 0.2895 GGCAC 0.2321 GGCAG 0.247 GGCAT 0.2314 GGCCA 0.3552 GGCCC 0.2266 GGCCG 0.2028 GGCCT 0.2154 GGCGA 0.2915 GGCGC 0.1805 GGCGG 0.2741 GGCGT 0.254 GGCTA 0.1989 GGCTC 0.246 GGCTG 0.2988 GGCTT 0.2563 GGGAA 0.2978 GGGAC 0.1951 GGGAG 0.2766 GGGAT 0.2304 GGGCA 0.2635 GGGCC 0.2043 GGGCG 0.2133 GGGCT 0.3189 GGGGA 0.273 GGGGC 0.1634 GGGGG 0.277 GGGGT 0.2867 GGGTA 0.212 GGGTC 0.2183 GGGTG 0.277 GGGTT 0.2926 GGTAA 0.2153 GGTAC 0.2634 GGTAG 0.2196 GGTAT 0.3017 GGTCA 0.2917 GGTCC 0.2021 GGTCG 0.1942 GGTCT 0.312 GGTGA 0.2614 GGTGC 0.1794 GGTGG 0.2872 GGTGT 0.272 GGTTA 0.183 GGTTC 0.2204 GGTTG 0.2988 GGTTT 0.2979 GTAAA 0.2915 GTAAC 0.2069 GTAAG 0.1977 GTAAT 0.3039 GTACA 0.3964 GTACC 0.1592 GTACG 0.1473 GTACT 0.2972 GTAGA 0.2987 GTAGC 0.2318 GTAGG 0.174 GTAGT 0.2955 GTATA 0.2398 GTATC 0.2281 GTATG 0.2518 GTATT 0.2803 GTCAA 0.2779 GTCAC 0.2434 GTCAG 0.2138 GTCAT 0.2648 GTCCA 0.3692 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1812 GTCCT 0.2361 GTCGA 0.2839 GTCGC 0.1942 GTCGG 0.2183 GTCGT 0.3036 GTCTA 0.191 GTCTC 0.285 GTCTG 0.2599 GTCTT 0.2641 GTGAA 0.2575 GTGAC 0.2335 GTGAG 0.2304 GTGAT 0.2787 GTGCA 0.333 GTGCC 0.203 GTGCG 0.1751 GTGCT 0.2889 GTGGA 0.2904 GTGGC 0.187 GTGGG 0.2266 GTGGT 0.296 GTGTA 0.2262 GTGTC 0.2323 GTGTG 0.2754 GTGTT 0.2662 GTTAA 0.2191 GTTAC 0.2345 GTTAG 0.2353 GTTAT 0.3111 GTTCA 0.31 GTTCC 0.2239 GTTCG 0.1798 GTTCT 0.2862 GTTGA 0.2773 GTTGC 0.1872 GTTGG 0.2535 GTTGT 0.282 GTTTA 0.1667 GTTTC 0.2364 GTTTG 0.2644 GTTTT 0.3325 TAAAA 0.3652 TAAAC 0.1914 TAAAG 0.1591 TAAAT 0.2843 TAACA 0.3217 TAACC 0.2415 TAACG 0.1719 TAACT 0.2648 TAAGA 0.3037 TAAGC 0.2301 TAAGG 0.2026 TAAGT 0.2636 TAATA 0.2795 TAATC 0.1901 TAATG 0.2338 TAATT 0.2967 TACAA 0.32 TACAC 0.1718 TACAG 0.2689 TACAT 0.2392 TACCA 0.3487 TACCC 0.222 TACCG 0.2052 TACCT 0.2241 TACGA 0.3886 TACGC 0.1586 TACGG 0.2181 TACGT 0.2347 TACTA 0.1712 TACTC 0.2096 TACTG 0.3093 TACTT 0.31 TAGAA 0.2684 TAGAC 0.2225 TAGAG 0.2484 TAGAT 0.2608 TAGCA 0.2785 TAGCC 0.222 TAGCG 0.1755 TAGCT 0.324 TAGGA 0.2759 TAGGC 0.1794 TAGGG 0.266 TAGGT 0.2786 TAGTA 0.2437 TAGTC 0.2154 TAGTG 0.2495 TAGTT 0.2914 TATAA 0.2143 TATAC 0.2152 TATAG 0.1664 TATAT 0.4041 TATCA 0.3056 TATCC 0.1888 TATCG 0.2132 TATCT 0.2923 TATGA 0.2714 TATGC 0.1684 TATGG 0.2292 TATGT 0.331 TATTA 0.2117 TATTC 0.1866 TATTG 0.2429 TATTT 0.3588 TCAAA 0.2847 TCAAC 0.2506 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2582 TCACA 0.2935 TCACC 0.2476 TCACG 0.2103 TCACT 0.2486 TCAGA 0.33 TCAGC 0.2311 TCAGG 0.1836 TCAGT 0.2554 TCATA 0.2215 TCATC 0.2546 TCATG 0.2276 TCATT 0.2963 TCCAA 0.2885 TCCAC 0.2405 TCCAG 0.2212 TCCAT 0.2499 TCCCA 0.3002 TCCCC 0.287 TCCCG 0.1594 TCCCT 0.2534 TCCGA 0.326 TCCGC 0.205 TCCGG 0.1992 TCCGT 0.2699 TCCTA 0.1743 TCCTC 0.2981 TCCTG 0.2507 TCCTT 0.2769 TCGAA 0.2696 TCGAC 0.2406 TCGAG 0.2298 TCGAT 0.2601 TCGCA 0.2869 TCGCC 0.2621 TCGCG 0.16 TCGCT 0.291 TCGGA 0.3041 TCGGC 0.2146 TCGGG 0.2033 TCGGT 0.278 TCGTA 0.276 TCGTC 0.2584 TCGTG 0.2185 TCGTT 0.2471 TCTAA 0.2189 TCTAC 0.3042 TCTAG 0.191 TCTAT 0.2859 TCTCA 0.2746 TCTCC 0.2452 TCTCG 0.1742 TCTCT 0.306 TCTGA 0.2754 TCTGC 0.1921 TCTGG 0.2454 TCTGT 0.287 TCTTA 0.1431 TCTTC 0.282 TCTTG 0.2596 TCTTT 0.3152 TGAAA 0.3261 TGAAC 0.2091 TGAAG 0.2317 TGAAT 0.2331 TGACA 0.3312 TGACC 0.2031 TGACG 0.1979 TGACT 0.2677 TGAGA 0.3418 TGAGC 0.2028 TGAGG 0.1926 TGAGT 0.2628 TGATA 0.2602 TGATC 0.1944 TGATG 0.2606 TGATT 0.2848 TGCAA 0.2723 TGCAC 0.2369 TGCAG 0.2311 TGCAT 0.2598 TGCCA 0.3563 TGCCC 0.2056 TGCCG 0.2011 TGCCT 0.237 TGCGA 0.3 TGCGC 0.192 TGCGG 0.2467 TGCGT 0.2612 TGCTA 0.1925 TGCTC 0.2465 TGCTG 0.3003 TGCTT 0.2607 TGGAA 0.2801 TGGAC 0.2 TGGAG 0.297 TGGAT 0.2229 TGGCA 0.2895 TGGCC 0.2031 TGGCG 0.2128 TGGCT 0.2946 TGGGA 0.2456 TGGGC 0.197 TGGGG 0.2852 TGGGT 0.2723 TGGTA 0.2188 TGGTC 0.2028 TGGTG 0.3106 TGGTT 0.2678 TGTAA 0.1747 TGTAC 0.3212 TGTAG 0.2392 TGTAT 0.2649 TGTCA 0.2893 TGTCC 0.1843 TGTCG 0.2041 TGTCT 0.3223 TGTGA 0.2437 TGTGC 0.1891 TGTGG 0.2493 TGTGT 0.3179 TGTTA 0.167 TGTTC 0.2074 TGTTG 0.2856 TGTTT 0.3401 TTAAA 0.306 TTAAC 0.1996 TTAAG 0.1608 TTAAT 0.3337 TTACA 0.332 TTACC 0.2003 TTACG 0.1461 TTACT 0.3216 TTAGA 0.2857 TTAGC 0.1977 TTAGG 0.178 TTAGT 0.3386 TTATA 0.2316 TTATC 0.2133 TTATG 0.1947 TTATT 0.3604 TTCAA 0.3081 TTCAC 0.2123 TTCAG 0.2297 TTCAT 0.2499 TTCCA 0.3548 TTCCC 0.2237 TTCCG 0.1839 TTCCT 0.2376 TTCGA 0.3085 TTCGC 0.1833 TTCGG 0.2481 TTCGT 0.2601 TTCTA 0.1891 TTCTC 0.2639 TTCTG 0.2621 TTCTT 0.2848 TTGAA 0.2911 TTGAC 0.2078 TTGAG 0.2343 TTGAT 0.2668 TTGCA 0.322 TTGCC 0.2131 TTGCG 0.1665 TTGCT 0.2984 TTGGA 0.2934 TTGGC 0.1968 TTGGG 0.2211 TTGGT 0.2886 TTGTA 0.3047 TTGTC 0.2029 TTGTG 0.2233 TTGTT 0.2692 TTTAA 0.2168 TTTAC 0.2132 TTTAG 0.1948 TTTAT 0.3753 TTTCA 0.2945 TTTCC 0.2325 TTTCG 0.176 TTTCT 0.297 TTTGA 0.2672 TTTGC 0.1775 TTTGG 0.2601 TTTGT 0.2952 TTTTA 0.1604 TTTTC 0.2055 TTTTG 0.1975 TTTTT 0.4366 [5] # (a,c,g,t)= (0.169, 0.331, 0.331, 0.169) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.273 C 0.227 G 0.227 T 0.273 # l= 1 # Values AA 0.0766 AC 0.0656 AG 0.0614 AT 0.0691 CA 0.072 CC 0.0519 CG 0.0419 CT 0.0615 GA 0.0637 GC 0.0461 GG 0.0518 GT 0.0656 TA 0.0604 TC 0.0638 TG 0.0719 TT 0.0766 # l= 2 # Values AAA 0.0254 AAC 0.0167 AAG 0.0162 AAT 0.0184 ACA 0.0221 ACC 0.0146 ACG 0.0116 ACT 0.0173 AGA 0.019 AGC 0.0132 AGG 0.012 AGT 0.0173 ATA 0.0181 ATC 0.0153 ATG 0.0171 ATT 0.0184 CAA 0.0209 CAC 0.0175 CAG 0.0165 CAT 0.0172 CCA 0.0178 CCC 0.0125 CCG 0.00966 CCT 0.012 CGA 0.0121 CGC 0.00853 CGG 0.00965 CGT 0.0116 CTA 0.012 CTC 0.0168 CTG 0.0165 CTT 0.0162 GAA 0.0169 GAC 0.0147 GAG 0.0168 GAT 0.0153 GCA 0.0138 GCC 0.0106 GCG 0.00852 GCT 0.0132 GGA 0.0142 GGC 0.0106 GGG 0.0124 GGT 0.0146 GTA 0.0168 GTC 0.0147 GTG 0.0175 GTT 0.0167 TAA 0.0135 TAC 0.0168 TAG 0.012 TAT 0.0181 TCA 0.0183 TCC 0.0142 TCG 0.0121 TCT 0.019 TGA 0.0183 TGC 0.0138 TGG 0.0178 TGT 0.0221 TTA 0.0134 TTC 0.017 TTG 0.0209 TTT 0.0254 # l= 3 # Values AAAA 0.0097 AAAC 0.00522 AAAG 0.00468 AAAT 0.00578 AACA 0.00554 AACC 0.004 AACG 0.0029 AACT 0.00422 AAGA 0.00504 AAGC 0.0032 AAGG 0.00322 AAGT 0.0047 AATA 0.00528 AATC 0.0039 AATG 0.0047 AATT 0.00456 ACAA 0.00658 ACAC 0.00512 ACAG 0.00524 ACAT 0.00517 ACCA 0.00507 ACCC 0.00343 ACCG 0.00278 ACCT 0.00333 ACGA 0.00357 ACGC 0.00218 ACGG 0.00267 ACGT 0.00318 ACTA 0.00348 ACTC 0.00435 ACTG 0.00472 ACTT 0.0047 AGAA 0.00505 AGAC 0.00451 AGAG 0.00492 AGAT 0.00456 AGCA 0.00395 AGCC 0.00313 AGCG 0.00233 AGCT 0.00379 AGGA 0.00331 AGGC 0.00229 AGGG 0.00303 AGGT 0.00333 AGTA 0.00493 AGTC 0.0037 AGTG 0.00441 AGTT 0.00422 ATAA 0.00447 ATAC 0.00457 ATAG 0.00315 ATAT 0.00595 ATCA 0.00478 ATCC 0.00305 ATCG 0.00293 ATCT 0.00456 ATGA 0.00464 ATGC 0.00312 ATGG 0.00423 ATGT 0.00517 ATTA 0.00402 ATTC 0.00378 ATTG 0.00485 ATTT 0.00579 CAAA 0.00587 CAAC 0.0051 CAAG 0.00505 CAAT 0.00485 CACA 0.00546 CACC 0.00445 CACG 0.00315 CACT 0.00442 CAGA 0.00487 CAGC 0.00385 CAGG 0.00305 CAGT 0.00472 CATA 0.00382 CATC 0.0042 CATG 0.00443 CATT 0.0047 CCAA 0.00512 CCAC 0.00459 CCAG 0.00384 CCAT 0.00423 CCCA 0.0039 CCCC 0.00347 CCCG 0.00203 CCCT 0.00303 CCGA 0.00278 CCGC 0.00219 CCGG 0.00202 CCGT 0.00267 CCTA 0.00212 CCTC 0.00357 CCTG 0.00305 CCTT 0.00322 CGAA 0.00293 CGAC 0.00308 CGAG 0.00319 CGAT 0.00293 CGCA 0.00237 CGCC 0.00234 CGCG 0.00148 CGCT 0.00233 CGGA 0.00259 CGGC 0.00226 CGGG 0.00203 CGGT 0.00278 CGTA 0.00254 CGTC 0.00301 CGTG 0.00315 CGTT 0.0029 CTAA 0.00282 CTAC 0.0039 CTAG 0.00209 CTAT 0.00316 CTCA 0.00441 CTCC 0.0043 CTCG 0.00319 CTCT 0.00492 CTGA 0.00398 CTGC 0.00343 CTGG 0.00384 CTGT 0.00524 CTTA 0.00235 CTTC 0.00408 CTTG 0.00505 CTTT 0.00468 GAAA 0.00563 GAAC 0.00346 GAAG 0.00408 GAAT 0.00378 GACA 0.00491 GACC 0.00304 GACG 0.00301 GACT 0.0037 GAGA 0.00548 GAGC 0.00343 GAGG 0.00357 GAGT 0.00435 GATA 0.00412 GATC 0.00311 GATG 0.0042 GATT 0.0039 GCAA 0.00387 GCAC 0.00338 GCAG 0.00343 GCAT 0.00312 GCCA 0.00364 GCCC 0.0024 GCCG 0.00226 GCCT 0.00229 GCGA 0.00246 GCGC 0.00169 GCGG 0.00219 GCGT 0.00218 GCTA 0.00273 GCTC 0.00343 GCTG 0.00384 GCTT 0.0032 GGAA 0.00398 GGAC 0.0029 GGAG 0.0043 GGAT 0.00305 GGCA 0.00294 GGCC 0.00218 GGCG 0.00234 GGCT 0.00313 GGGA 0.00315 GGGC 0.0024 GGGG 0.00347 GGGT 0.00343 GGTA 0.00313 GGTC 0.00304 GGTG 0.00444 GGTT 0.004 GTAA 0.00318 GTAC 0.00516 GTAG 0.0039 GTAT 0.00457 GTCA 0.00417 GTCC 0.0029 GTCG 0.00308 GTCT 0.00451 GTGA 0.0044 GTGC 0.00338 GTGG 0.00458 GTGT 0.00511 GTTA 0.00289 GTTC 0.00346 GTTG 0.0051 GTTT 0.00522 TAAA 0.00419 TAAC 0.00289 TAAG 0.00234 TAAT 0.00403 TACA 0.00622 TACC 0.00313 TACG 0.00253 TACT 0.00493 TAGA 0.00363 TAGC 0.00273 TAGG 0.00212 TAGT 0.00348 TATA 0.00493 TATC 0.00412 TATG 0.00382 TATT 0.00528 TCAA 0.00531 TCAC 0.00441 TCAG 0.00398 TCAT 0.00464 TCCA 0.00517 TCCC 0.00315 TCCG 0.00259 TCCT 0.00331 TCGA 0.00333 TCGC 0.00246 TCGG 0.00278 TCGT 0.00357 TCTA 0.00364 TCTC 0.00549 TCTG 0.00487 TCTT 0.00504 TGAA 0.00498 TGAC 0.00418 TGAG 0.0044 TGAT 0.00478 TGCA 0.00454 TGCC 0.00294 TGCG 0.00236 TGCT 0.00395 TGGA 0.00517 TGGC 0.00364 TGGG 0.0039 TGGT 0.00507 TGTA 0.00621 TGTC 0.00491 TGTG 0.00545 TGTT 0.00554 TTAA 0.00298 TTAC 0.00319 TTAG 0.00282 TTAT 0.00447 TTCA 0.00498 TTCC 0.00398 TTCG 0.00293 TTCT 0.00505 TTGA 0.00531 TTGC 0.00387 TTGG 0.00512 TTGT 0.00657 TTTA 0.00419 TTTC 0.00563 TTTG 0.00586 TTTT 0.0097 # l= 4 # Values AAAAA 0.00417 AAAAC 0.00168 AAAAG 0.00183 AAAAT 0.00202 AAACA 0.00189 AAACC 0.00118 AAACG 0.000993 AAACT 0.00115 AAAGA 0.00158 AAAGC 0.000866 AAAGG 0.000935 AAAGT 0.00131 AAATA 0.00186 AAATC 0.00119 AAATG 0.00146 AAATT 0.00128 AACAA 0.00173 AACAC 0.0013 AACAG 0.00125 AACAT 0.00126 AACCA 0.00134 AACCC 0.000988 AACCG 0.000749 AACCT 0.00092 AACGA 0.000854 AACGC 0.000592 AACGG 0.000779 AACGT 0.000672 AACTA 0.000986 AACTC 0.00111 AACTG 0.00109 AACTT 0.00103 AAGAA 0.00143 AAGAC 0.00117 AAGAG 0.00138 AAGAT 0.00107 AAGCA 0.000994 AAGCC 0.000781 AAGCG 0.000619 AAGCT 0.000804 AAGGA 0.000897 AAGGC 0.000632 AAGGG 0.000841 AAGGT 0.000848 AAGTA 0.0015 AAGTC 0.000961 AAGTG 0.00121 AAGTT 0.00103 AATAA 0.00156 AATAC 0.00125 AATAG 0.000902 AATAT 0.00157 AATCA 0.00133 AATCC 0.000757 AATCG 0.000771 AATCT 0.00104 AATGA 0.00133 AATGC 0.000828 AATGG 0.0012 AATGT 0.00135 AATTA 0.00116 AATTC 0.000851 AATTG 0.00127 AATTT 0.00128 ACAAA 0.0017 ACAAC 0.00142 ACAAG 0.00199 ACAAT 0.00146 ACACA 0.00175 ACACC 0.0012 ACACG 0.000877 ACACT 0.00129 ACAGA 0.0014 ACAGC 0.00116 ACAGG 0.000934 ACAGT 0.00174 ACATA 0.00125 ACATC 0.0011 ACATG 0.00147 ACATT 0.00135 ACCAA 0.00145 ACCAC 0.00134 ACCAG 0.00112 ACCAT 0.00115 ACCCA 0.00105 ACCCC 0.000971 ACCCG 0.00056 ACCCT 0.000849 ACCGA 0.000775 ACCGC 0.000652 ACCGG 0.000613 ACCGT 0.000737 ACCTA 0.000595 ACCTC 0.001 ACCTG 0.00088 ACCTT 0.000848 ACGAA 0.000747 ACGAC 0.000911 ACGAG 0.00109 ACGAT 0.000821 ACGCA 0.000613 ACGCC 0.000576 ACGCG 0.00042 ACGCT 0.000574 ACGGA 0.000694 ACGGC 0.000681 ACGGG 0.000557 ACGGT 0.000737 ACGTA 0.000596 ACGTC 0.000771 ACGTG 0.00114 ACGTT 0.000672 ACTAA 0.000942 ACTAC 0.00112 ACTAG 0.00058 ACTAT 0.000837 ACTCA 0.00116 ACTCC 0.00103 ACTCG 0.000948 ACTCT 0.00122 ACTGA 0.001 ACTGC 0.000967 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00174 ACTTA 0.000607 ACTTC 0.000939 ACTTG 0.00185 ACTTT 0.00131 AGAAA 0.00164 AGAAC 0.000967 AGAAG 0.00137 AGAAT 0.00108 AGACA 0.00158 AGACC 0.000941 AGACG 0.000954 AGACT 0.00103 AGAGA 0.00168 AGAGC 0.00103 AGAGG 0.000995 AGAGT 0.00122 AGATA 0.00119 AGATC 0.00091 AGATG 0.00142 AGATT 0.00104 AGCAA 0.00113 AGCAC 0.000935 AGCAG 0.00109 AGCAT 0.000791 AGCCA 0.00104 AGCCC 0.000734 AGCCG 0.000715 AGCCT 0.00064 AGCGA 0.000714 AGCGC 0.000454 AGCGG 0.000591 AGCGT 0.000574 AGCTA 0.000868 AGCTC 0.00101 AGCTG 0.00111 AGCTT 0.000804 AGGAA 0.00092 AGGAC 0.00066 AGGAG 0.00108 AGGAT 0.00065 AGGCA 0.000673 AGGCC 0.000453 AGGCG 0.000524 AGGCT 0.00064 AGGGA 0.000771 AGGGC 0.000601 AGGGG 0.000813 AGGGT 0.000849 AGGTA 0.000682 AGGTC 0.000661 AGGTG 0.00107 AGGTT 0.00092 AGTAA 0.001 AGTAC 0.0015 AGTAG 0.00115 AGTAT 0.00127 AGTCA 0.00108 AGTCC 0.00077 AGTCG 0.000815 AGTCT 0.00103 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.000898 AGTGG 0.00116 AGTGT 0.00129 AGTTA 0.000754 AGTTC 0.000848 AGTTG 0.00147 AGTTT 0.00115 ATAAA 0.00153 ATAAC 0.00088 ATAAG 0.000738 ATAAT 0.00132 ATACA 0.00165 ATACC 0.000908 ATACG 0.000741 ATACT 0.00127 ATAGA 0.00103 ATAGC 0.000728 ATAGG 0.000557 ATAGT 0.000837 ATATA 0.00197 ATATC 0.0013 ATATG 0.00111 ATATT 0.00157 ATCAA 0.00138 ATCAC 0.00119 ATCAG 0.000989 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.00114 ATCCC 0.000693 ATCCG 0.000567 ATCCT 0.00065 ATCGA 0.000844 ATCGC 0.000626 ATCGG 0.000644 ATCGT 0.000821 ATCTA 0.000932 ATCTC 0.00134 ATCTG 0.00121 ATCTT 0.00107 ATGAA 0.00122 ATGAC 0.00108 ATGAG 0.00112 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00114 ATGCC 0.00065 ATGCG 0.000539 ATGCT 0.000791 ATGGA 0.00127 ATGGC 0.000923 ATGGG 0.000888 ATGGT 0.00115 ATGTA 0.00148 ATGTC 0.00116 ATGTG 0.00128 ATGTT 0.00126 ATTAA 0.000975 ATTAC 0.000949 ATTAG 0.000779 ATTAT 0.00132 ATTCA 0.00113 ATTCC 0.000889 ATTCG 0.000682 ATTCT 0.00108 ATTGA 0.00135 ATTGC 0.000901 ATTGG 0.00114 ATTGT 0.00146 ATTTA 0.00118 ATTTC 0.00129 ATTTG 0.0013 ATTTT 0.00202 CAAAA 0.002 CAAAC 0.00145 CAAAG 0.00111 CAAAT 0.0013 CAACA 0.00162 CAACC 0.00123 CAACG 0.000779 CAACT 0.00147 CAAGA 0.00134 CAAGC 0.000949 CAAGG 0.00091 CAAGT 0.00185 CAATA 0.00131 CAATC 0.00106 CAATG 0.00121 CAATT 0.00127 CACAA 0.00152 CACAC 0.00148 CACAG 0.00117 CACAT 0.00128 CACCA 0.00163 CACCC 0.000984 CACCG 0.000758 CACCT 0.00107 CACGA 0.000787 CACGC 0.000599 CACGG 0.000625 CACGT 0.00114 CACTA 0.000907 CACTC 0.00119 CACTG 0.00111 CACTT 0.00121 CAGAA 0.00133 CAGAC 0.0012 CAGAG 0.00113 CAGAT 0.00121 CAGCA 0.00121 CAGCC 0.000939 CAGCG 0.000583 CAGCT 0.00111 CAGGA 0.000819 CAGGC 0.000622 CAGGG 0.00073 CAGGT 0.00088 CAGTA 0.00153 CAGTC 0.00099 CAGTG 0.00111 CAGTT 0.00109 CATAA 0.00089 CATAC 0.00118 CATAG 0.000638 CATAT 0.00111 CATCA 0.00128 CATCC 0.000837 CATCG 0.000665 CATCT 0.00142 CATGA 0.00108 CATGC 0.000879 CATGG 0.001 CATGT 0.00147 CATTA 0.000959 CATTC 0.00108 CATTG 0.00121 CATTT 0.00146 CCAAA 0.00159 CCAAC 0.00133 CCAAG 0.00106 CCAAT 0.00114 CCACA 0.00141 CCACC 0.00131 CCACG 0.000704 CCACT 0.00116 CCAGA 0.00122 CCAGC 0.000897 CCAGG 0.000707 CCAGT 0.00101 CCATA 0.00088 CCATC 0.00114 CCATG 0.001 CCATT 0.0012 CCCAA 0.00116 CCCAC 0.00106 CCCAG 0.000792 CCCAT 0.000888 CCCCA 0.00113 CCCCC 0.00098 CCCCG 0.000546 CCCCT 0.000813 CCCGA 0.000576 CCCGC 0.000477 CCCGG 0.000424 CCCGT 0.000557 CCCTA 0.000571 CCCTC 0.00089 CCCTG 0.00073 CCCTT 0.000841 CCGAA 0.000748 CCGAC 0.000708 CCGAG 0.000676 CCGAT 0.000644 CCGCA 0.000596 CCGCC 0.00067 CCGCG 0.000335 CCGCT 0.000591 CCGGA 0.000532 CCGGC 0.000449 CCGGG 0.000424 CCGGT 0.000613 CCGTA 0.000557 CCGTC 0.000706 CCGTG 0.000625 CCGTT 0.000779 CCTAA 0.000522 CCTAC 0.000692 CCTAG 0.000347 CCTAT 0.000557 CCTCA 0.00087 CCTCC 0.00107 CCTCG 0.000631 CCTCT 0.000995 CCTGA 0.00075 CCTGC 0.000661 CCTGG 0.000707 CCTGT 0.000934 CCTTA 0.000484 CCTTC 0.000888 CCTTG 0.00091 CCTTT 0.000935 CGAAA 0.00102 CGAAC 0.000641 CGAAG 0.000585 CGAAT 0.000682 CGACA 0.00105 CGACC 0.000612 CGACG 0.000605 CGACT 0.000815 CGAGA 0.000959 CGAGC 0.000657 CGAGG 0.000631 CGAGT 0.000948 CGATA 0.000911 CGATC 0.000587 CGATG 0.000665 CGATT 0.000771 CGCAA 0.000663 CGCAC 0.000626 CGCAG 0.000536 CGCAT 0.000539 CGCCA 0.000807 CGCCC 0.000538 CGCCG 0.000472 CGCCT 0.000524 CGCGA 0.00039 CGCGC 0.000333 CGCGG 0.000335 CGCGT 0.00042 CGCTA 0.000488 CGCTC 0.000642 CGCTG 0.000583 CGCTT 0.000619 CGGAA 0.000768 CGGAC 0.000545 CGGAG 0.00071 CGGAT 0.000567 CGGCA 0.000603 CGGCC 0.000466 CGGCG 0.000472 CGGCT 0.000715 CGGGA 0.000514 CGGGC 0.000414 CGGGG 0.000546 CGGGT 0.00056 CGGTA 0.000681 CGGTC 0.000588 CGGTG 0.000758 CGGTT 0.000749 CGTAA 0.000476 CGTAC 0.000802 CGTAG 0.000517 CGTAT 0.000741 CGTCA 0.000866 CGTCC 0.000585 CGTCG 0.000605 CGTCT 0.000954 CGTGA 0.000943 CGTGC 0.000627 CGTGG 0.000704 CGTGT 0.000877 CGTTA 0.000515 CGTTC 0.000611 CGTTG 0.000779 CGTTT 0.000993 CTAAA 0.000857 CTAAC 0.000703 CTAAG 0.000481 CTAAT 0.000779 CTACA 0.00152 CTACC 0.000716 CTACG 0.000517 CTACT 0.00115 CTAGA 0.000694 CTAGC 0.000471 CTAGG 0.000347 CTAGT 0.00058 CTATA 0.000838 CTATC 0.000776 CTATG 0.000638 CTATT 0.000902 CTCAA 0.0013 CTCAC 0.00106 CTCAG 0.000925 CTCAT 0.00112 CTCCA 0.00158 CTCCC 0.000921 CTCCG 0.00071 CTCCT 0.00108 CTCGA 0.000776 CTCGC 0.000652 CTCGG 0.000676 CTCGT 0.00109 CTCTA 0.000916 CTCTC 0.0015 CTCTG 0.00113 CTCTT 0.00138 CTGAA 0.00115 CTGAC 0.00091 CTGAG 0.000925 CTGAT 0.000989 CTGCA 0.00106 CTGCC 0.000745 CTGCG 0.000536 CTGCT 0.00109 CTGGA 0.00115 CTGGC 0.000772 CTGGG 0.000792 CTGGT 0.00112 CTGTA 0.00166 CTGTC 0.00115 CTGTG 0.00117 CTGTT 0.00125 CTTAA 0.000495 CTTAC 0.000629 CTTAG 0.000481 CTTAT 0.000738 CTTCA 0.00117 CTTCC 0.000959 CTTCG 0.000585 CTTCT 0.00137 CTTGA 0.00109 CTTGC 0.000901 CTTGG 0.00106 CTTGT 0.00199 CTTTA 0.0007 CTTTC 0.00105 CTTTG 0.00111 CTTTT 0.00183 GAAAA 0.00206 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00105 GAAAT 0.00129 GAACA 0.00113 GAACC 0.000869 GAACG 0.000611 GAACT 0.000848 GAAGA 0.00143 GAAGC 0.000823 GAAGG 0.000888 GAAGT 0.000939 GAATA 0.000982 GAATC 0.000869 GAATG 0.00108 GAATT 0.000851 GACAA 0.00137 GACAC 0.00123 GACAG 0.00115 GACAT 0.00116 GACCA 0.00103 GACCC 0.000758 GACCG 0.000588 GACCT 0.000661 GACGA 0.00095 GACGC 0.000584 GACGG 0.000706 GACGT 0.000771 GACTA 0.000761 GACTC 0.000986 GACTG 0.00099 GACTT 0.000961 GAGAA 0.00136 GAGAC 0.00128 GAGAG 0.0015 GAGAT 0.00134 GAGCA 0.000978 GAGCC 0.000798 GAGCG 0.000642 GAGCT 0.00101 GAGGA 0.00103 GAGGC 0.000648 GAGGG 0.00089 GAGGT 0.001 GAGTA 0.00107 GAGTC 0.000986 GAGTG 0.00119 GAGTT 0.00111 GATAA 0.000988 GATAC 0.00106 GATAG 0.000776 GATAT 0.0013 GATCA 0.000936 GATCC 0.000676 GATCG 0.000587 GATCT 0.00091 GATGA 0.00121 GATGC 0.000746 GATGG 0.00114 GATGT 0.0011 GATTA 0.000774 GATTC 0.000869 GATTG 0.00106 GATTT 0.00119 GCAAA 0.00108 GCAAC 0.000996 GCAAG 0.000901 GCAAT 0.000901 GCACA 0.00103 GCACC 0.000823 GCACG 0.000627 GCACT 0.000898 GCAGA 0.000967 GCAGC 0.000838 GCAGG 0.000661 GCAGT 0.000967 GCATA 0.000666 GCATC 0.000746 GCATG 0.000879 GCATT 0.000828 GCCAA 0.00105 GCCAC 0.000896 GCCAG 0.000772 GCCAT 0.000923 GCCCA 0.000789 GCCCC 0.000595 GCCCG 0.000414 GCCCT 0.000601 GCCGA 0.00061 GCCGC 0.000518 GCCGG 0.000449 GCCGT 0.000681 GCCTA 0.000387 GCCTC 0.000648 GCCTG 0.000622 GCCTT 0.000632 GCGAA 0.000561 GCGAC 0.000625 GCGAG 0.000652 GCGAT 0.000626 GCGCA 0.000466 GCGCC 0.000432 GCGCG 0.000333 GCGCT 0.000454 GCGGA 0.000547 GCGGC 0.000518 GCGGG 0.000477 GCGGT 0.000652 GCGTA 0.000408 GCGTC 0.000584 GCGTG 0.000599 GCGTT 0.000592 GCTAA 0.000583 GCTAC 0.000953 GCTAG 0.000471 GCTAT 0.000728 GCTCA 0.000919 GCTCC 0.000816 GCTCG 0.000657 GCTCT 0.00103 GCTGA 0.000945 GCTGC 0.000838 GCTGG 0.000897 GCTGT 0.00116 GCTTA 0.000559 GCTTC 0.000823 GCTTG 0.000949 GCTTT 0.000866 GGAAA 0.00134 GGAAC 0.000792 GGAAG 0.000959 GGAAT 0.000889 GGACA 0.000906 GGACC 0.000635 GGACG 0.000585 GGACT 0.00077 GGAGA 0.00139 GGAGC 0.000816 GGAGG 0.00107 GGAGT 0.00103 GGATA 0.000781 GGATC 0.000676 GGATG 0.000837 GGATT 0.000757 GGCAA 0.000845 GGCAC 0.000697 GGCAG 0.000745 GGCAT 0.00065 GGCCA 0.000754 GGCCC 0.000507 GGCCG 0.000466 GGCCT 0.000453 GGCGA 0.000664 GGCGC 0.000432 GGCGG 0.00067 GGCGT 0.000576 GGCTA 0.000611 GGCTC 0.000798 GGCTG 0.000939 GGCTT 0.000781 GGGAA 0.000909 GGGAC 0.000629 GGGAG 0.000921 GGGAT 0.000693 GGGCA 0.00062 GGGCC 0.000507 GGGCG 0.000538 GGGCT 0.000734 GGGGA 0.000924 GGGGC 0.000595 GGGGG 0.00098 GGGGT 0.000971 GGGTA 0.000703 GGGTC 0.000758 GGGTG 0.000984 GGGTT 0.000988 GGTAA 0.000663 GGTAC 0.000843 GGTAG 0.000716 GGTAT 0.000908 GGTCA 0.000854 GGTCC 0.000635 GGTCG 0.000612 GGTCT 0.000941 GGTGA 0.00111 GGTGC 0.000823 GGTGG 0.00131 GGTGT 0.0012 GGTTA 0.000714 GGTTC 0.000869 GGTTG 0.00123 GGTTT 0.00118 GTAAA 0.000923 GTAAC 0.000684 GTAAG 0.000629 GTAAT 0.000949 GTACA 0.00201 GTACC 0.000843 GTACG 0.000802 GTACT 0.0015 GTAGA 0.00113 GTAGC 0.000953 GTAGG 0.000692 GTAGT 0.00112 GTATA 0.00108 GTATC 0.00106 GTATG 0.00118 GTATT 0.00125 GTCAA 0.00113 GTCAC 0.00106 GTCAG 0.00091 GTCAT 0.00108 GTCCA 0.00106 GTCCC 0.000629 GTCCG 0.000545 GTCCT 0.00066 GTCGA 0.00084 GTCGC 0.000625 GTCGG 0.000708 GTCGT 0.000911 GTCTA 0.000857 GTCTC 0.00128 GTCTG 0.0012 GTCTT 0.00117 GTGAA 0.0011 GTGAC 0.00106 GTGAG 0.00106 GTGAT 0.00119 GTGCA 0.00112 GTGCC 0.000697 GTGCG 0.000626 GTGCT 0.000935 GTGGA 0.00129 GTGGC 0.000896 GTGGG 0.00106 GTGGT 0.00134 GTGTA 0.00111 GTGTC 0.00123 GTGTG 0.00148 GTGTT 0.0013 GTTAA 0.000621 GTTAC 0.000684 GTTAG 0.000703 GTTAT 0.00088 GTTCA 0.00106 GTTCC 0.000792 GTTCG 0.000641 GTTCT 0.000967 GTTGA 0.00136 GTTGC 0.000996 GTTGG 0.00133 GTTGT 0.00142 GTTTA 0.000844 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00145 GTTTT 0.00168 TAAAA 0.00147 TAAAC 0.000844 TAAAG 0.0007 TAAAT 0.00118 TAACA 0.000904 TAACC 0.000714 TAACG 0.000515 TAACT 0.000754 TAAGA 0.000695 TAAGC 0.000559 TAAGG 0.000484 TAAGT 0.000607 TAATA 0.00113 TAATC 0.000774 TAATG 0.000959 TAATT 0.00116 TACAA 0.00196 TACAC 0.00111 TACAG 0.00166 TACAT 0.00148 TACCA 0.00106 TACCC 0.000703 TACCG 0.000681 TACCT 0.000682 TACGA 0.000975 TACGC 0.000408 TACGG 0.000557 TACGT 0.000596 TACTA 0.000827 TACTC 0.00107 TACTG 0.00153 TACTT 0.0015 TAGAA 0.00093 TAGAC 0.000857 TAGAG 0.000916 TAGAT 0.000932 TAGCA 0.000768 TAGCC 0.000611 TAGCG 0.000488 TAGCT 0.000868 TAGGA 0.000567 TAGGC 0.000387 TAGGG 0.000571 TAGGT 0.000595 TAGTA 0.000827 TAGTC 0.000761 TAGTG 0.000907 TAGTT 0.000986 TATAA 0.00104 TATAC 0.00108 TATAG 0.000838 TATAT 0.00197 TATCA 0.00124 TATCC 0.000781 TATCG 0.000911 TATCT 0.00119 TATGA 0.00102 TATGC 0.000666 TATGG 0.00088 TATGT 0.00125 TATTA 0.00113 TATTC 0.000982 TATTG 0.00131 TATTT 0.00186 TCAAA 0.0015 TCAAC 0.00136 TCAAG 0.00109 TCAAT 0.00135 TCACA 0.00127 TCACC 0.00111 TCACG 0.000943 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00128 TCAGC 0.000945 TCAGG 0.00075 TCAGT 0.001 TCATA 0.00102 TCATC 0.00121 TCATG 0.00108 TCATT 0.00133 TCCAA 0.00145 TCCAC 0.00129 TCCAG 0.00115 TCCAT 0.00127 TCCCA 0.000938 TCCCC 0.000924 TCCCG 0.000514 TCCCT 0.000771 TCCGA 0.000816 TCCGC 0.000547 TCCGG 0.000532 TCCGT 0.000694 TCCTA 0.000567 TCCTC 0.00103 TCCTG 0.000819 TCCTT 0.000897 TCGAA 0.000871 TCGAC 0.00084 TCGAG 0.000776 TCGAT 0.000844 TCGCA 0.000692 TCGCC 0.000664 TCGCG 0.00039 TCGCT 0.000714 TCGGA 0.000816 TCGGC 0.00061 TCGGG 0.000576 TCGGT 0.000775 TCGTA 0.000975 TCGTC 0.00095 TCGTG 0.000787 TCGTT 0.000854 TCTAA 0.000776 TCTAC 0.00113 TCTAG 0.000694 TCTAT 0.00103 TCTCA 0.00146 TCTCC 0.00139 TCTCG 0.000959 TCTCT 0.00168 TCTGA 0.00128 TCTGC 0.000967 TCTGG 0.00122 TCTGT 0.0014 TCTTA 0.000695 TCTTC 0.00143 TCTTG 0.00134 TCTTT 0.00158 TGAAA 0.00162 TGAAC 0.00106 TGAAG 0.00117 TGAAT 0.00113 TGACA 0.00137 TGACC 0.000854 TGACG 0.000866 TGACT 0.00108 TGAGA 0.00146 TGAGC 0.000919 TGAGG 0.00087 TGAGT 0.00116 TGATA 0.00124 TGATC 0.000936 TGATG 0.00128 TGATT 0.00133 TGCAA 0.00123 TGCAC 0.00112 TGCAG 0.00106 TGCAT 0.00114 TGCCA 0.00104 TGCCC 0.00062 TGCCG 0.000603 TGCCT 0.000673 TGCGA 0.000692 TGCGC 0.000466 TGCGG 0.000596 TGCGT 0.000613 TGCTA 0.000768 TGCTC 0.000978 TGCTG 0.00121 TGCTT 0.000994 TGGAA 0.00138 TGGAC 0.00106 TGGAG 0.00158 TGGAT 0.00114 TGGCA 0.00104 TGGCC 0.000754 TGGCG 0.000807 TGGCT 0.00104 TGGGA 0.000938 TGGGC 0.000789 TGGGG 0.00113 TGGGT 0.00105 TGGTA 0.00106 TGGTC 0.00103 TGGTG 0.00163 TGGTT 0.00134 TGTAA 0.00104 TGTAC 0.00201 TGTAG 0.00152 TGTAT 0.00165 TGTCA 0.00137 TGTCC 0.000906 TGTCG 0.00105 TGTCT 0.00158 TGTGA 0.00127 TGTGC 0.00103 TGTGG 0.00141 TGTGT 0.00175 TGTTA 0.000904 TGTTC 0.00113 TGTTG 0.00162 TGTTT 0.00189 TTAAA 0.000885 TTAAC 0.000621 TTAAG 0.000495 TTAAT 0.000975 TTACA 0.00104 TTACC 0.000663 TTACG 0.000476 TTACT 0.001 TTAGA 0.000776 TTAGC 0.000583 TTAGG 0.000522 TTAGT 0.000942 TTATA 0.00104 TTATC 0.000988 TTATG 0.00089 TTATT 0.00156 TTCAA 0.0015 TTCAC 0.0011 TTCAG 0.00115 TTCAT 0.00122 TTCCA 0.00138 TTCCC 0.000909 TTCCG 0.000768 TTCCT 0.00092 TTCGA 0.000871 TTCGC 0.000561 TTCGG 0.000748 TTCGT 0.000747 TTCTA 0.00093 TTCTC 0.00136 TTCTG 0.00133 TTCTT 0.00143 TTGAA 0.0015 TTGAC 0.00113 TTGAG 0.0013 TTGAT 0.00138 TTGCA 0.00123 TTGCC 0.000845 TTGCG 0.000663 TTGCT 0.00113 TTGGA 0.00145 TTGGC 0.00105 TTGGG 0.00116 TTGGT 0.00145 TTGTA 0.00196 TTGTC 0.00137 TTGTG 0.00152 TTGTT 0.00173 TTTAA 0.000885 TTTAC 0.000923 TTTAG 0.000857 TTTAT 0.00153 TTTCA 0.00162 TTTCC 0.00134 TTTCG 0.00102 TTTCT 0.00164 TTTGA 0.0015 TTTGC 0.00108 TTTGG 0.00159 TTTGT 0.0017 TTTTA 0.00147 TTTTC 0.00206 TTTTG 0.002 TTTTT 0.00417 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4366 AAAAC 0.1676 AAAAG 0.1793 AAAAT 0.2164 AAACA 0.3683 AAACC 0.221 AAACG 0.1845 AAACT 0.2262 AAAGA 0.3423 AAAGC 0.1808 AAAGG 0.1971 AAAGT 0.2797 AAATA 0.3262 AAATC 0.2029 AAATG 0.2446 AAATT 0.2263 AACAA 0.316 AACAC 0.226 AACAG 0.2239 AACAT 0.2342 AACCA 0.341 AACCC 0.2448 AACCG 0.1818 AACCT 0.2324 AACGA 0.3069 AACGC 0.1999 AACGG 0.2602 AACGT 0.233 AACTA 0.2371 AACTC 0.2557 AACTG 0.2587 AACTT 0.2485 AAGAA 0.2932 AAGAC 0.2231 AAGAG 0.2662 AAGAT 0.2174 AAGCA 0.3163 AAGCC 0.2398 AAGCG 0.1833 AAGCT 0.2606 AAGGA 0.2877 AAGGC 0.192 AAGGG 0.2589 AAGGT 0.2614 AAGTA 0.3242 AAGTC 0.2051 AAGTG 0.2464 AAGTT 0.2243 AATAA 0.3047 AATAC 0.2298 AATAG 0.1631 AATAT 0.3025 AATCA 0.3496 AATCC 0.1923 AATCG 0.1907 AATCT 0.2675 AATGA 0.2932 AATGC 0.1715 AATGG 0.2478 AATGT 0.2874 AATTA 0.2591 AATTC 0.1874 AATTG 0.2667 AATTT 0.2869 ACAAA 0.2629 ACAAC 0.2129 ACAAG 0.2947 ACAAT 0.2296 ACACA 0.3447 ACACC 0.2319 ACACG 0.17 ACACT 0.2533 ACAGA 0.2673 ACAGC 0.2176 ACAGG 0.1756 ACAGT 0.3395 ACATA 0.2478 ACATC 0.2142 ACATG 0.2717 ACATT 0.2663 ACCAA 0.2923 ACCAC 0.2524 ACCAG 0.2217 ACCAT 0.2336 ACCCA 0.3093 ACCCC 0.2802 ACCCG 0.1578 ACCCT 0.2527 ACCGA 0.2879 ACCGC 0.227 ACCGG 0.213 ACCGT 0.2721 ACCTA 0.18 ACCTC 0.2973 ACCTG 0.2654 ACCTT 0.2573 ACGAA 0.2192 ACGAC 0.2481 ACGAG 0.2993 ACGAT 0.2334 ACGCA 0.2834 ACGCC 0.2591 ACGCG 0.1929 ACGCT 0.2646 ACGGA 0.2668 ACGGC 0.2509 ACGGG 0.2038 ACGGT 0.2785 ACGTA 0.1921 ACGTC 0.2393 ACGTG 0.3524 ACGTT 0.2161 ACTAA 0.2738 ACTAC 0.3177 ACTAG 0.1631 ACTAT 0.2455 ACTCA 0.2686 ACTCC 0.2352 ACTCG 0.2146 ACTCT 0.2816 ACTGA 0.2204 ACTGC 0.1931 ACTGG 0.2098 ACTGT 0.3767 ACTTA 0.1328 ACTTC 0.2076 ACTTG 0.3843 ACTTT 0.2754 AGAAA 0.3241 AGAAC 0.1901 AGAAG 0.2626 AGAAT 0.2231 AGACA 0.3505 AGACC 0.2064 AGACG 0.2045 AGACT 0.2387 AGAGA 0.3443 AGAGC 0.2081 AGAGG 0.1987 AGAGT 0.2489 AGATA 0.266 AGATC 0.1999 AGATG 0.3012 AGATT 0.2329 AGCAA 0.2903 AGCAC 0.2365 AGCAG 0.2657 AGCAT 0.2074 AGCCA 0.3366 AGCCC 0.231 AGCCG 0.222 AGCCT 0.2104 AGCGA 0.3096 AGCGC 0.1946 AGCGG 0.2477 AGCGT 0.2481 AGCTA 0.2291 AGCTC 0.2593 AGCTG 0.2918 AGCTT 0.2198 AGGAA 0.2879 AGGAC 0.1963 AGGAG 0.3107 AGGAT 0.2051 AGGCA 0.3004 AGGCC 0.1921 AGGCG 0.2202 AGGCT 0.2873 AGGGA 0.2646 AGGGC 0.1896 AGGGG 0.262 AGGGT 0.2838 AGGTA 0.2142 AGGTC 0.2009 AGGTG 0.3068 AGGTT 0.2781 AGTAA 0.2117 AGTAC 0.3013 AGTAG 0.2231 AGTAT 0.2638 AGTCA 0.3002 AGTCC 0.2062 AGTCG 0.2117 AGTCT 0.2819 AGTGA 0.2539 AGTGC 0.2 AGTGG 0.2588 AGTGT 0.2873 AGTTA 0.1782 AGTTC 0.207 AGTTG 0.344 AGTTT 0.2708 ATAAA 0.3536 ATAAC 0.1891 ATAAG 0.1605 ATAAT 0.2968 ATACA 0.3574 ATACC 0.1994 ATACG 0.1587 ATACT 0.2845 ATAGA 0.3307 ATAGC 0.2266 ATAGG 0.1736 ATAGT 0.269 ATATA 0.3301 ATATC 0.2162 ATATG 0.1832 ATATT 0.2705 ATCAA 0.2957 ATCAC 0.2407 ATCAG 0.2063 ATCAT 0.2574 ATCCA 0.3706 ATCCC 0.2272 ATCCG 0.18 ATCCT 0.2222 ATCGA 0.3 ATCGC 0.2036 ATCGG 0.2172 ATCGT 0.2792 ATCTA 0.2087 ATCTC 0.2907 ATCTG 0.2607 ATCTT 0.2399 ATGAA 0.2707 ATGAC 0.227 ATGAG 0.2361 ATGAT 0.2663 ATGCA 0.3706 ATGCC 0.2054 ATGCG 0.1669 ATGCT 0.2571 ATGGA 0.3037 ATGGC 0.2125 ATGGG 0.2084 ATGGT 0.2755 ATGTA 0.2865 ATGTC 0.2232 ATGTG 0.2393 ATGTT 0.251 ATTAA 0.2484 ATTAC 0.2336 ATTAG 0.187 ATTAT 0.3311 ATTCA 0.3037 ATTCC 0.2279 ATTCG 0.1734 ATTCT 0.295 ATTGA 0.2867 ATTGC 0.1785 ATTGG 0.2297 ATTGT 0.3051 ATTTA 0.2058 ATTTC 0.2192 ATTTG 0.2184 ATTTT 0.3567 CAAAA 0.3464 CAAAC 0.2338 CAAAG 0.1872 CAAAT 0.2325 CAACA 0.3226 CAACC 0.2312 CAACG 0.1464 CAACT 0.2998 CAAGA 0.2689 CAAGC 0.1833 CAAGG 0.1756 CAAGT 0.3722 CAATA 0.2781 CAATC 0.2115 CAATG 0.2455 CAATT 0.2649 CACAA 0.2854 CACAC 0.2546 CACAG 0.2169 CACAT 0.2431 CACCA 0.375 CACCC 0.2197 CACCG 0.1622 CACCT 0.2431 CACGA 0.2602 CACGC 0.1809 CACGG 0.1946 CACGT 0.3643 CACTA 0.2096 CACTC 0.2663 CACTG 0.2422 CACTT 0.2819 CAGAA 0.2881 CAGAC 0.2344 CAGAG 0.2253 CAGAT 0.2522 CAGCA 0.3147 CAGCC 0.2416 CAGCG 0.1448 CAGCT 0.2989 CAGGA 0.2813 CAGGC 0.1957 CAGGG 0.2319 CAGGT 0.2911 CAGTA 0.3334 CAGTC 0.2075 CAGTG 0.2183 CAGTT 0.2407 CATAA 0.2384 CATAC 0.2989 CATAG 0.1661 CATAT 0.2967 CATCA 0.3118 CATCC 0.1932 CATCG 0.1577 CATCT 0.3373 CATGA 0.2532 CATGC 0.1959 CATGG 0.2214 CATGT 0.3296 CATTA 0.2073 CATTC 0.2269 CATTG 0.2509 CATTT 0.3149 CCAAA 0.3079 CCAAC 0.2545 CCAAG 0.2078 CCAAT 0.2298 CCACA 0.3087 CCACC 0.2797 CCACG 0.151 CCACT 0.2606 CCAGA 0.323 CCAGC 0.2249 CCAGG 0.1849 CCAGT 0.2671 CCATA 0.2168 CCATC 0.2626 CCATG 0.2305 CCATT 0.2901 CCCAA 0.3004 CCCAC 0.2592 CCCAG 0.2034 CCCAT 0.237 CCCCA 0.3316 CCCCC 0.2772 CCCCG 0.1524 CCCCT 0.2388 CCCGA 0.292 CCCGC 0.2219 CCCGG 0.21 CCCGT 0.2762 CCCTA 0.1931 CCCTC 0.2832 CCCTG 0.2375 CCCTT 0.2862 CCGAA 0.2787 CCGAC 0.2378 CCGAG 0.2416 CCGAT 0.2419 CCGCA 0.2803 CCGCC 0.2929 CCGCG 0.1501 CCGCT 0.2767 CCGGA 0.2729 CCGGC 0.2103 CCGGG 0.2147 CCGGT 0.3022 CCGTA 0.2187 CCGTC 0.2549 CCGTG 0.2307 CCGTT 0.2958 CCTAA 0.2444 CCTAC 0.3177 CCTAG 0.1689 CCTAT 0.269 CCTCA 0.25 CCTCC 0.2894 CCTCG 0.1751 CCTCT 0.2855 CCTGA 0.2516 CCTGC 0.2082 CCTGG 0.2306 CCTGT 0.3096 CCTTA 0.155 CCTTC 0.2753 CCTTG 0.2752 CCTTT 0.2946 CGAAA 0.3474 CGAAC 0.2161 CGAAG 0.1994 CGAAT 0.2371 CGACA 0.3399 CGACC 0.1966 CGACG 0.189 CGACT 0.2746 CGAGA 0.31 CGAGC 0.1972 CGAGG 0.1928 CGAGT 0.3001 CGATA 0.3116 CGATC 0.1956 CGATG 0.2262 CGATT 0.2666 CGCAA 0.2844 CGCAC 0.2517 CGCAG 0.2274 CGCAT 0.2364 CGCCA 0.3499 CGCCC 0.2223 CGCCG 0.1957 CGCCT 0.2321 CGCGA 0.2747 CGCGC 0.2164 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2919 CGCTA 0.2165 CGCTC 0.267 CGCTG 0.2467 CGCTT 0.2698 CGGAA 0.302 CGGAC 0.2041 CGGAG 0.2689 CGGAT 0.225 CGGCA 0.2757 CGGCC 0.1956 CGGCG 0.2008 CGGCT 0.3279 CGGGA 0.2628 CGGGC 0.193 CGGGG 0.2641 CGGGT 0.28 CGGTA 0.2509 CGGTC 0.2088 CGGTG 0.2619 CGGTT 0.2784 CGTAA 0.1962 CGTAC 0.3046 CGTAG 0.1992 CGTAT 0.3 CGTCA 0.2947 CGTCC 0.1913 CGTCG 0.1934 CGTCT 0.3205 CGTGA 0.31 CGTGC 0.1952 CGTGG 0.2164 CGTGT 0.2784 CGTTA 0.1797 CGTTC 0.2162 CGTTG 0.2609 CGTTT 0.3431 CTAAA 0.3091 CTAAC 0.2409 CTAAG 0.1676 CTAAT 0.2824 CTACA 0.3966 CTACC 0.1783 CTACG 0.1294 CTACT 0.2957 CTAGA 0.3395 CTAGC 0.2185 CTAGG 0.1674 CTAGT 0.2745 CTATA 0.2683 CTATC 0.2415 CTATG 0.2024 CTATT 0.2878 CTCAA 0.2984 CTCAC 0.2286 CTCAG 0.2108 CTCAT 0.2622 CTCCA 0.3746 CTCCC 0.2068 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.2554 CTCGA 0.2538 CTCGC 0.1961 CTCGG 0.2076 CTCGT 0.3426 CTCTA 0.1931 CTCTC 0.2953 CTCTG 0.2263 CTCTT 0.2853 CTGAA 0.2979 CTGAC 0.2194 CTGAG 0.2272 CTGAT 0.2555 CTGCA 0.3173 CTGCC 0.2111 CTGCG 0.1546 CTGCT 0.317 CTGGA 0.3052 CTGGC 0.1946 CTGGG 0.2031 CTGGT 0.2971 CTGTA 0.3268 CTGTC 0.2132 CTGTG 0.2166 CTGTT 0.2434 CTTAA 0.2131 CTTAC 0.2705 CTTAG 0.1977 CTTAT 0.3187 CTTCA 0.2925 CTTCC 0.2297 CTTCG 0.1412 CTTCT 0.3365 CTTGA 0.2296 CTTGC 0.1704 CTTGG 0.208 CTTGT 0.392 CTTTA 0.1522 CTTTC 0.2248 CTTTG 0.2324 CTTTT 0.3906 GAAAA 0.3663 GAAAC 0.2125 GAAAG 0.1841 GAAAT 0.2371 GAACA 0.3316 GAACC 0.2414 GAACG 0.1717 GAACT 0.2553 GAAGA 0.3503 GAAGC 0.1979 GAAGG 0.2107 GAAGT 0.2412 GAATA 0.2648 GAATC 0.2294 GAATG 0.2751 GAATT 0.2307 GACAA 0.2836 GACAC 0.2349 GACAG 0.2334 GACAT 0.248 GACCA 0.3466 GACCC 0.2451 GACCG 0.183 GACCT 0.2253 GACGA 0.3236 GACGC 0.1901 GACGG 0.2262 GACGT 0.2602 GACTA 0.2068 GACTC 0.2622 GACTG 0.263 GACTT 0.268 GAGAA 0.2584 GAGAC 0.229 GAGAG 0.262 GAGAT 0.2506 GAGCA 0.2937 GAGCC 0.2261 GAGCG 0.1782 GAGCT 0.302 GAGGA 0.2934 GAGGC 0.178 GAGGG 0.2426 GAGGT 0.286 GAGTA 0.2481 GAGTC 0.2271 GAGTG 0.2636 GAGTT 0.2613 GATAA 0.2417 GATAC 0.2507 GATAG 0.1834 GATAT 0.3242 GATCA 0.31 GATCC 0.21 GATCG 0.1818 GATCT 0.2983 GATGA 0.2938 GATGC 0.1752 GATGG 0.2615 GATGT 0.2695 GATTA 0.2018 GATTC 0.2266 GATTG 0.2588 GATTT 0.3128 GCAAA 0.2813 GCAAC 0.2516 GCAAG 0.228 GCAAT 0.2391 GCACA 0.3137 GCACC 0.2341 GCACG 0.1824 GCACT 0.2698 GCAGA 0.2899 GCAGC 0.237 GCAGG 0.1913 GCAGT 0.2819 GCATA 0.2152 GCATC 0.2377 GCATG 0.2757 GCATT 0.2714 GCCAA 0.2914 GCCAC 0.2331 GCCAG 0.2122 GCCAT 0.2633 GCCCA 0.3385 GCCCC 0.2416 GCCCG 0.1646 GCCCT 0.2553 GCCGA 0.2808 GCCGC 0.222 GCCGG 0.1874 GCCGT 0.3098 GCCTA 0.1735 GCCTC 0.2768 GCCTG 0.267 GCCTT 0.2827 GCGAA 0.236 GCGAC 0.2425 GCGAG 0.2616 GCGAT 0.2599 GCGCA 0.2804 GCGCC 0.2479 GCGCG 0.1925 GCGCT 0.2792 GCGGA 0.2603 GCGGC 0.2309 GCGGG 0.2103 GCGGT 0.2984 GCGTA 0.1952 GCGTC 0.2629 GCGTG 0.2632 GCGTT 0.2787 GCTAA 0.2144 GCTAC 0.3342 GCTAG 0.174 GCTAT 0.2773 GCTCA 0.2751 GCTCC 0.2254 GCTCG 0.1871 GCTCT 0.3123 GCTGA 0.2556 GCTGC 0.2082 GCTGG 0.2265 GCTGT 0.3097 GCTTA 0.1774 GCTTC 0.2606 GCTTG 0.2896 GCTTT 0.2724 GGAAA 0.3364 GGAAC 0.1973 GGAAG 0.2377 GGAAT 0.2286 GGACA 0.3178 GGACC 0.2119 GGACG 0.1935 GGACT 0.2768 GGAGA 0.3302 GGAGC 0.1797 GGAGG 0.2411 GGAGT 0.2489 GGATA 0.2633 GGATC 0.2157 GGATG 0.2645 GGATT 0.2565 GGCAA 0.2895 GGCAC 0.2321 GGCAG 0.247 GGCAT 0.2314 GGCCA 0.3552 GGCCC 0.2266 GGCCG 0.2028 GGCCT 0.2154 GGCGA 0.2915 GGCGC 0.1805 GGCGG 0.2741 GGCGT 0.254 GGCTA 0.1989 GGCTC 0.246 GGCTG 0.2988 GGCTT 0.2563 GGGAA 0.2978 GGGAC 0.1951 GGGAG 0.2766 GGGAT 0.2304 GGGCA 0.2635 GGGCC 0.2043 GGGCG 0.2133 GGGCT 0.3189 GGGGA 0.273 GGGGC 0.1634 GGGGG 0.277 GGGGT 0.2867 GGGTA 0.212 GGGTC 0.2183 GGGTG 0.277 GGGTT 0.2926 GGTAA 0.2153 GGTAC 0.2634 GGTAG 0.2196 GGTAT 0.3017 GGTCA 0.2917 GGTCC 0.2021 GGTCG 0.1942 GGTCT 0.312 GGTGA 0.2614 GGTGC 0.1794 GGTGG 0.2872 GGTGT 0.272 GGTTA 0.183 GGTTC 0.2204 GGTTG 0.2988 GGTTT 0.2979 GTAAA 0.2915 GTAAC 0.2069 GTAAG 0.1977 GTAAT 0.3039 GTACA 0.3964 GTACC 0.1592 GTACG 0.1473 GTACT 0.2972 GTAGA 0.2987 GTAGC 0.2318 GTAGG 0.174 GTAGT 0.2955 GTATA 0.2398 GTATC 0.2281 GTATG 0.2518 GTATT 0.2803 GTCAA 0.2779 GTCAC 0.2434 GTCAG 0.2138 GTCAT 0.2648 GTCCA 0.3692 GTCCC 0.2135 GTCCG 0.1812 GTCCT 0.2361 GTCGA 0.2839 GTCGC 0.1942 GTCGG 0.2183 GTCGT 0.3036 GTCTA 0.191 GTCTC 0.285 GTCTG 0.2599 GTCTT 0.2641 GTGAA 0.2575 GTGAC 0.2335 GTGAG 0.2304 GTGAT 0.2787 GTGCA 0.333 GTGCC 0.203 GTGCG 0.1751 GTGCT 0.2889 GTGGA 0.2904 GTGGC 0.187 GTGGG 0.2266 GTGGT 0.296 GTGTA 0.2262 GTGTC 0.2323 GTGTG 0.2754 GTGTT 0.2662 GTTAA 0.2191 GTTAC 0.2345 GTTAG 0.2353 GTTAT 0.3111 GTTCA 0.31 GTTCC 0.2239 GTTCG 0.1798 GTTCT 0.2862 GTTGA 0.2773 GTTGC 0.1872 GTTGG 0.2535 GTTGT 0.282 GTTTA 0.1667 GTTTC 0.2364 GTTTG 0.2644 GTTTT 0.3325 TAAAA 0.3652 TAAAC 0.1914 TAAAG 0.1591 TAAAT 0.2843 TAACA 0.3217 TAACC 0.2415 TAACG 0.1719 TAACT 0.2648 TAAGA 0.3037 TAAGC 0.2301 TAAGG 0.2026 TAAGT 0.2636 TAATA 0.2795 TAATC 0.1901 TAATG 0.2338 TAATT 0.2967 TACAA 0.32 TACAC 0.1718 TACAG 0.2689 TACAT 0.2392 TACCA 0.3487 TACCC 0.222 TACCG 0.2052 TACCT 0.2241 TACGA 0.3886 TACGC 0.1586 TACGG 0.2181 TACGT 0.2347 TACTA 0.1712 TACTC 0.2096 TACTG 0.3093 TACTT 0.31 TAGAA 0.2684 TAGAC 0.2225 TAGAG 0.2484 TAGAT 0.2608 TAGCA 0.2785 TAGCC 0.222 TAGCG 0.1755 TAGCT 0.324 TAGGA 0.2759 TAGGC 0.1794 TAGGG 0.266 TAGGT 0.2786 TAGTA 0.2437 TAGTC 0.2154 TAGTG 0.2495 TAGTT 0.2914 TATAA 0.2143 TATAC 0.2152 TATAG 0.1664 TATAT 0.4041 TATCA 0.3056 TATCC 0.1888 TATCG 0.2132 TATCT 0.2923 TATGA 0.2714 TATGC 0.1684 TATGG 0.2292 TATGT 0.331 TATTA 0.2117 TATTC 0.1866 TATTG 0.2429 TATTT 0.3588 TCAAA 0.2847 TCAAC 0.2506 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2582 TCACA 0.2935 TCACC 0.2476 TCACG 0.2103 TCACT 0.2486 TCAGA 0.33 TCAGC 0.2311 TCAGG 0.1836 TCAGT 0.2554 TCATA 0.2215 TCATC 0.2546 TCATG 0.2276 TCATT 0.2963 TCCAA 0.2885 TCCAC 0.2405 TCCAG 0.2212 TCCAT 0.2499 TCCCA 0.3002 TCCCC 0.287 TCCCG 0.1594 TCCCT 0.2534 TCCGA 0.326 TCCGC 0.205 TCCGG 0.1992 TCCGT 0.2699 TCCTA 0.1743 TCCTC 0.2981 TCCTG 0.2507 TCCTT 0.2769 TCGAA 0.2696 TCGAC 0.2406 TCGAG 0.2298 TCGAT 0.2601 TCGCA 0.2869 TCGCC 0.2621 TCGCG 0.16 TCGCT 0.291 TCGGA 0.3041 TCGGC 0.2146 TCGGG 0.2033 TCGGT 0.278 TCGTA 0.276 TCGTC 0.2584 TCGTG 0.2185 TCGTT 0.2471 TCTAA 0.2189 TCTAC 0.3042 TCTAG 0.191 TCTAT 0.2859 TCTCA 0.2746 TCTCC 0.2452 TCTCG 0.1742 TCTCT 0.306 TCTGA 0.2754 TCTGC 0.1921 TCTGG 0.2454 TCTGT 0.287 TCTTA 0.1431 TCTTC 0.282 TCTTG 0.2596 TCTTT 0.3152 TGAAA 0.3261 TGAAC 0.2091 TGAAG 0.2317 TGAAT 0.2331 TGACA 0.3312 TGACC 0.2031 TGACG 0.1979 TGACT 0.2677 TGAGA 0.3418 TGAGC 0.2028 TGAGG 0.1926 TGAGT 0.2628 TGATA 0.2602 TGATC 0.1944 TGATG 0.2606 TGATT 0.2848 TGCAA 0.2723 TGCAC 0.2369 TGCAG 0.2311 TGCAT 0.2598 TGCCA 0.3563 TGCCC 0.2056 TGCCG 0.2011 TGCCT 0.237 TGCGA 0.3 TGCGC 0.192 TGCGG 0.2467 TGCGT 0.2612 TGCTA 0.1925 TGCTC 0.2465 TGCTG 0.3003 TGCTT 0.2607 TGGAA 0.2801 TGGAC 0.2 TGGAG 0.297 TGGAT 0.2229 TGGCA 0.2895 TGGCC 0.2031 TGGCG 0.2128 TGGCT 0.2946 TGGGA 0.2456 TGGGC 0.197 TGGGG 0.2852 TGGGT 0.2723 TGGTA 0.2188 TGGTC 0.2028 TGGTG 0.3106 TGGTT 0.2678 TGTAA 0.1747 TGTAC 0.3212 TGTAG 0.2392 TGTAT 0.2649 TGTCA 0.2893 TGTCC 0.1843 TGTCG 0.2041 TGTCT 0.3223 TGTGA 0.2437 TGTGC 0.1891 TGTGG 0.2493 TGTGT 0.3179 TGTTA 0.167 TGTTC 0.2074 TGTTG 0.2856 TGTTT 0.3401 TTAAA 0.306 TTAAC 0.1996 TTAAG 0.1608 TTAAT 0.3337 TTACA 0.332 TTACC 0.2003 TTACG 0.1461 TTACT 0.3216 TTAGA 0.2857 TTAGC 0.1977 TTAGG 0.178 TTAGT 0.3386 TTATA 0.2316 TTATC 0.2133 TTATG 0.1947 TTATT 0.3604 TTCAA 0.3081 TTCAC 0.2123 TTCAG 0.2297 TTCAT 0.2499 TTCCA 0.3548 TTCCC 0.2237 TTCCG 0.1839 TTCCT 0.2376 TTCGA 0.3085 TTCGC 0.1833 TTCGG 0.2481 TTCGT 0.2601 TTCTA 0.1891 TTCTC 0.2639 TTCTG 0.2621 TTCTT 0.2848 TTGAA 0.2911 TTGAC 0.2078 TTGAG 0.2343 TTGAT 0.2668 TTGCA 0.322 TTGCC 0.2131 TTGCG 0.1665 TTGCT 0.2984 TTGGA 0.2934 TTGGC 0.1968 TTGGG 0.2211 TTGGT 0.2886 TTGTA 0.3047 TTGTC 0.2029 TTGTG 0.2233 TTGTT 0.2692 TTTAA 0.2168 TTTAC 0.2132 TTTAG 0.1948 TTTAT 0.3753 TTTCA 0.2945 TTTCC 0.2325 TTTCG 0.176 TTTCT 0.297 TTTGA 0.2672 TTTGC 0.1775 TTTGG 0.2601 TTTGT 0.2952 TTTTA 0.1604 TTTTC 0.2055 TTTTG 0.1975 TTTTT 0.4366