[1] # (a,c,g,t)= (0.348, 0.152, 0.152, 0.348) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.361 C 0.139 G 0.139 T 0.361 # l= 1 # Values AA 0.14 AC 0.0486 AG 0.0453 AT 0.127 CA 0.0559 CC 0.0194 CG 0.0182 CT 0.0452 GA 0.0464 GC 0.0245 GG 0.0195 GT 0.0486 TA 0.119 TC 0.0461 TG 0.056 TT 0.14 # l= 2 # Values AAA 0.0563 AAC 0.0184 AAG 0.0179 AAT 0.0474 ACA 0.0197 ACC 0.00642 ACG 0.00635 ACT 0.0162 AGA 0.0144 AGC 0.00834 AGG 0.00641 AGT 0.0162 ATA 0.0435 ATC 0.0159 ATG 0.0205 ATT 0.0473 CAA 0.0209 CAC 0.00804 CAG 0.00646 CAT 0.0205 CCA 0.00709 CCC 0.00376 CCG 0.00221 CCT 0.00638 CGA 0.00614 CGC 0.00352 CGG 0.00223 CGT 0.00635 CTA 0.0148 CTC 0.00615 CTG 0.00648 CTT 0.0179 GAA 0.0175 GAC 0.0067 GAG 0.00617 GAT 0.0159 GCA 0.0091 GCC 0.00354 GCG 0.00353 GCT 0.00834 GGA 0.00575 GGC 0.00356 GGG 0.00376 GGT 0.00641 GTA 0.0155 GTC 0.0067 GTG 0.00807 GTT 0.0184 TAA 0.0454 TAC 0.0155 TAG 0.0148 TAT 0.0435 TCA 0.02 TCC 0.00573 TCG 0.00614 TCT 0.0143 TGA 0.0201 TGC 0.00912 TGG 0.00708 TGT 0.0197 TTA 0.0454 TTC 0.0174 TTG 0.0209 TTT 0.0562 # l= 3 # Values AAAA 0.0224 AAAC 0.00675 AAAG 0.00782 AAAT 0.0193 AACA 0.00756 AACC 0.00235 AACG 0.00264 AACT 0.00585 AAGA 0.00563 AAGC 0.00333 AAGG 0.00247 AAGT 0.00648 AATA 0.0166 AATC 0.00615 AATG 0.00823 AATT 0.0164 ACAA 0.00746 ACAC 0.00284 ACAG 0.00229 ACAT 0.00711 ACCA 0.00242 ACCC 0.000936 ACCG 0.000746 ACCT 0.0023 ACGA 0.00221 ACGC 0.00121 ACGG 0.000775 ACGT 0.00216 ACTA 0.00523 ACTC 0.00196 ACTG 0.00252 ACTT 0.00648 AGAA 0.00564 AGAC 0.00208 AGAG 0.00209 AGAT 0.00454 AGCA 0.0033 AGCC 0.0011 AGCG 0.00137 AGCT 0.00256 AGGA 0.00178 AGGC 0.00112 AGGG 0.0012 AGGT 0.00231 AGTA 0.00539 AGTC 0.00212 AGTG 0.00281 AGTT 0.00586 ATAA 0.0167 ATAC 0.00587 ATAG 0.0057 ATAT 0.0152 ATCA 0.00732 ATCC 0.0019 ATCG 0.00213 ATCT 0.00452 ATGA 0.00773 ATGC 0.00326 ATGG 0.00243 ATGT 0.0071 ATTA 0.0154 ATTC 0.00544 ATTG 0.00726 ATTT 0.0193 CAAA 0.00769 CAAC 0.00345 CAAG 0.00252 CAAT 0.00725 CACA 0.00308 CACC 0.00129 CACG 0.000876 CACT 0.00279 CAGA 0.0019 CAGC 0.00125 CAGG 0.000818 CAGT 0.00251 CATA 0.00629 CATC 0.0031 CATG 0.00291 CATT 0.00823 CCAA 0.00265 CCAC 0.00121 CCAG 0.000805 CCAT 0.00243 CCCA 0.00124 CCCC 0.000925 CCCG 0.000391 CCCT 0.0012 CCGA 0.000716 CCGC 0.000472 CCGG 0.000263 CCGT 0.000774 CCTA 0.00206 CCTC 0.00107 CCTG 0.00082 CCTT 0.00246 CGAA 0.00224 CGAC 0.000979 CGAG 0.00079 CGAT 0.00213 CGCA 0.00114 CGCC 0.000643 CGCG 0.000362 CGCT 0.00137 CGGA 0.000685 CGGC 0.000397 CGGG 0.000394 CGGT 0.000748 CGTA 0.00186 CGTC 0.000972 CGTG 0.00088 CGTT 0.00265 CTAA 0.0053 CTAC 0.0021 CTAG 0.00169 CTAT 0.00569 CTCA 0.00234 CTCC 0.00096 CTCG 0.00079 CTCT 0.00208 CTGA 0.00216 CTGC 0.00121 CTGG 0.000808 CTGT 0.00229 CTTA 0.00502 CTTC 0.00253 CTTG 0.00253 CTTT 0.00784 GAAA 0.00735 GAAC 0.00209 GAAG 0.00254 GAAT 0.00544 GACA 0.00285 GACC 0.00076 GACG 0.000974 GACT 0.00213 GAGA 0.00205 GAGC 0.00109 GAGG 0.00108 GAGT 0.00196 GATA 0.00577 GATC 0.000857 GATG 0.00309 GATT 0.00615 GCAA 0.00325 GCAC 0.00139 GCAG 0.00121 GCAT 0.00326 GCCA 0.00139 GCCC 0.000656 GCCG 0.000394 GCCT 0.0011 GCGA 0.00111 GCGC 0.000731 GCGG 0.000473 GCGT 0.00121 GCTA 0.00266 GCTC 0.00109 GCTG 0.00125 GCTT 0.00333 GGAA 0.00205 GGAC 0.000834 GGAG 0.00096 GGAT 0.00191 GGCA 0.00132 GGCC 0.000469 GGCG 0.000642 GGCT 0.0011 GGGA 0.00123 GGGC 0.000661 GGGG 0.000918 GGGT 0.000942 GGTA 0.00201 GGTC 0.000757 GGTG 0.00129 GGTT 0.00234 GTAA 0.00572 GTAC 0.00178 GTAG 0.0021 GTAT 0.00587 GTCA 0.00282 GTCC 0.000829 GTCG 0.000982 GTCT 0.00208 GTGA 0.00261 GTGC 0.00139 GTGG 0.0012 GTGT 0.00284 GTTA 0.00609 GTTC 0.0021 GTTG 0.00346 GTTT 0.00676 TAAA 0.0189 TAAC 0.00609 TAAG 0.00502 TAAT 0.0154 TACA 0.00619 TACC 0.00202 TACG 0.00186 TACT 0.0054 TAGA 0.00485 TAGC 0.00266 TAGG 0.00205 TAGT 0.00522 TATA 0.0149 TATC 0.00577 TATG 0.00629 TATT 0.0165 TCAA 0.00756 TCAC 0.0026 TCAG 0.00216 TCAT 0.0077 TCCA 0.00205 TCCC 0.00124 TCCG 0.000682 TCCT 0.00178 TCGA 0.0021 TCGC 0.00111 TCGG 0.000716 TCGT 0.00221 TCTA 0.00484 TCTC 0.00203 TCTG 0.00189 TCTT 0.00559 TGAA 0.00755 TGAC 0.00281 TGAG 0.00233 TGAT 0.00733 TGCA 0.00334 TGCC 0.00132 TGCG 0.00115 TGCT 0.0033 TGGA 0.00204 TGGC 0.00138 TGGG 0.00124 TGGT 0.00242 TGTA 0.0062 TGTC 0.00285 TGTG 0.00309 TGTT 0.00756 TTAA 0.0177 TTAC 0.00572 TTAG 0.00528 TTAT 0.0167 TTCA 0.00752 TTCC 0.00204 TTCG 0.00224 TTCT 0.00563 TTGA 0.00756 TTGC 0.00326 TTGG 0.00264 TTGT 0.00746 TTTA 0.0188 TTTC 0.00732 TTTG 0.00768 TTTT 0.0224 # l= 4 # Values AAAAA 0.00833 AAAAC 0.00284 AAAAG 0.00329 AAAAT 0.0079 AAACA 0.0028 AAACC 0.0009 AAACG 0.0011 AAACT 0.00196 AAAGA 0.00254 AAAGC 0.00146 AAAGG 0.00108 AAAGT 0.00276 AAATA 0.00688 AAATC 0.00259 AAATG 0.00347 AAATT 0.00631 AACAA 0.00289 AACAC 0.0011 AACAG 0.000869 AACAT 0.0027 AACCA 0.000917 AACCC 0.00032 AACCG 0.000301 AACCT 0.000806 AACGA 0.000908 AACGC 0.00054 AACGG 0.000339 AACGT 0.000862 AACTA 0.00191 AACTC 0.000668 AACTG 0.000919 AACTT 0.00237 AAGAA 0.00214 AAGAC 0.000825 AAGAG 0.000812 AAGAT 0.00182 AAGCA 0.00134 AAGCC 0.0004 AAGCG 0.000617 AAGCT 0.000976 AAGGA 0.000671 AAGGC 0.000425 AAGGG 0.000457 AAGGT 0.000905 AAGTA 0.0022 AAGTC 0.000737 AAGTG 0.00117 AAGTT 0.00237 AATAA 0.0062 AATAC 0.00223 AATAG 0.00218 AATAT 0.00593 AATCA 0.00294 AATCC 0.000806 AATCG 0.000863 AATCT 0.00154 AATGA 0.00334 AATGC 0.00122 AATGG 0.001 AATGT 0.00267 AATTA 0.00561 AATTC 0.00193 AATTG 0.00256 AATTT 0.00631 ACAAA 0.00282 ACAAC 0.00118 ACAAG 0.000907 ACAAT 0.00255 ACACA 0.00116 ACACC 0.000471 ACACG 0.000302 ACACT 0.000907 ACAGA 0.000788 ACAGC 0.000438 ACAGG 0.000282 ACAGT 0.000785 ACATA 0.00237 ACATC 0.000981 ACATG 0.00107 ACATT 0.00267 ACCAA 0.000851 ACCAC 0.00043 ACCAG 0.000269 ACCAT 0.000866 ACCCA 0.00028 ACCCC 0.000217 ACCCG 0.000118 ACCCT 0.000326 ACCGA 0.000254 ACCGC 0.000164 ACCGG 8.98e-05 ACCGT 0.00024 ACCTA 0.000741 ACCTC 0.000357 ACCTG 0.000304 ACCTT 0.000905 ACGAA 0.000831 ACGAC 0.00037 ACGAG 0.000241 ACGAT 0.000767 ACGCA 0.000389 ACGCC 0.000194 ACGCG 0.000133 ACGCT 0.000494 ACGGA 0.000243 ACGGC 0.000152 ACGGG 0.000139 ACGGT 0.00024 ACGTA 0.000669 ACGTC 0.000316 ACGTG 0.000312 ACGTT 0.000862 ACTAA 0.00185 ACTAC 0.000801 ACTAG 0.000624 ACTAT 0.00195 ACTCA 0.000799 ACTCC 0.000314 ACTCG 0.000244 ACTCT 0.000602 ACTGA 0.000863 ACTGC 0.000549 ACTGG 0.000316 ACTGT 0.000785 ACTTA 0.00194 ACTTC 0.000871 ACTTG 0.000913 ACTTT 0.00276 AGAAA 0.0025 AGAAC 0.000685 AGAAG 0.0008 AGAAT 0.00164 AGACA 0.000963 AGACC 0.000222 AGACG 0.000318 AGACT 0.00058 AGAGA 0.000747 AGAGC 0.000376 AGAGG 0.000356 AGAGT 0.000602 AGATA 0.00178 AGATC 0.000215 AGATG 0.000978 AGATT 0.00154 AGCAA 0.00116 AGCAC 0.000505 AGCAG 0.000477 AGCAT 0.00116 AGCCA 0.000454 AGCCC 0.000192 AGCCG 0.000105 AGCCT 0.000352 AGCGA 0.000433 AGCGC 0.000275 AGCGG 0.000173 AGCGT 0.000494 AGCTA 0.000861 AGCTC 0.000331 AGCTG 0.000394 AGCTT 0.000976 AGGAA 0.000617 AGGAC 0.000217 AGGAG 0.000338 AGGAT 0.000607 AGGCA 0.000433 AGGCC 0.000114 AGGCG 0.000204 AGGCT 0.000352 AGGGA 0.000439 AGGGC 0.000154 AGGGG 0.000279 AGGGT 0.000326 AGGTA 0.000718 AGGTC 0.000286 AGGTG 0.000493 AGGTT 0.000806 AGTAA 0.00199 AGTAC 0.000623 AGTAG 0.000779 AGTAT 0.002 AGTCA 0.000985 AGTCC 0.000226 AGTCG 0.000336 AGTCT 0.00058 AGTGA 0.000998 AGTGC 0.000463 AGTGG 0.000421 AGTGT 0.000907 AGTTA 0.00206 AGTTC 0.000603 AGTTG 0.00123 AGTTT 0.00196 ATAAA 0.00717 ATAAC 0.00227 ATAAG 0.00179 ATAAT 0.00543 ATACA 0.00235 ATACC 0.000743 ATACG 0.000774 ATACT 0.002 ATAGA 0.00193 ATAGC 0.00108 ATAGG 0.000733 ATAGT 0.00195 ATATA 0.00508 ATATC 0.00198 ATATG 0.00226 ATATT 0.00593 ATCAA 0.00265 ATCAC 0.000962 ATCAG 0.00074 ATCAT 0.00297 ATCCA 0.000719 ATCCC 0.000355 ATCCG 0.000228 ATCCT 0.000607 ATCGA 0.000695 ATCGC 0.000404 ATCGG 0.00026 ATCGT 0.000767 ATCTA 0.00155 ATCTC 0.000617 ATCTG 0.000562 ATCTT 0.00182 ATGAA 0.00273 ATGAC 0.00114 ATGAG 0.000854 ATGAT 0.00297 ATGCA 0.00122 ATGCC 0.000458 ATGCG 0.000429 ATGCT 0.00116 ATGGA 0.000726 ATGGC 0.000529 ATGGG 0.000312 ATGGT 0.000866 ATGTA 0.00222 ATGTC 0.00108 ATGTG 0.00112 ATGTT 0.0027 ATTAA 0.00617 ATTAC 0.00197 ATTAG 0.00183 ATTAT 0.00543 ATTCA 0.00247 ATTCC 0.000685 ATTCG 0.000651 ATTCT 0.00164 ATTGA 0.00267 ATTGC 0.0012 ATTGG 0.000841 ATTGT 0.00255 ATTTA 0.0063 ATTTC 0.00247 ATTTG 0.00258 ATTTT 0.0079 CAAAA 0.00307 CAAAC 0.00104 CAAAG 0.000984 CAAAT 0.00258 CAACA 0.00141 CAACC 0.000413 CAACG 0.000407 CAACT 0.00123 CAAGA 0.000706 CAAGC 0.000547 CAAGG 0.000359 CAAGT 0.000913 CAATA 0.00245 CAATC 0.00101 CAATG 0.00124 CAATT 0.00256 CACAA 0.00113 CACAC 0.000444 CACAG 0.000397 CACAT 0.00112 CACCA 0.000416 CACCC 0.000246 CACCG 0.000134 CACCT 0.000493 CACGA 0.000302 CACGC 0.000178 CACGG 8.72e-05 CACGT 0.000312 CACTA 0.000882 CACTC 0.000399 CACTG 0.000367 CACTT 0.00117 CAGAA 0.000733 CAGAC 0.000316 CAGAG 0.000278 CAGAT 0.000562 CAGCA 0.00053 CAGCC 0.000169 CAGCG 0.000157 CAGCT 0.000394 CAGGA 0.000225 CAGGC 0.000168 CAGGG 0.000123 CAGGT 0.000304 CAGTA 0.000832 CAGTC 0.000404 CAGTG 0.000367 CAGTT 0.000919 CATAA 0.00238 CATAC 0.000868 CATAG 0.000789 CATAT 0.00226 CATCA 0.00143 CATCC 0.00032 CATCG 0.000368 CATCT 0.000978 CATGA 0.00104 CATGC 0.000488 CATGG 0.000312 CATGT 0.00107 CATTA 0.00254 CATTC 0.000977 CATTG 0.00124 CATTT 0.00347 CCAAA 0.000839 CCAAC 0.000629 CCAAG 0.000329 CCAAT 0.000841 CCACA 0.000464 CCACC 0.00021 CCACG 0.000109 CCACT 0.000421 CCAGA 0.000225 CCAGC 0.00018 CCAGG 8.66e-05 CCAGT 0.000316 CCATA 0.000699 CCATC 0.000424 CCATG 0.000312 CCATT 0.001 CCCAA 0.000526 CCCAC 0.000245 CCCAG 0.000161 CCCAT 0.000312 CCCCA 0.000362 CCCCC 0.000169 CCCCG 0.000109 CCCCT 0.000279 CCCGA 0.00011 CCCGC 0.0001 CCCGG 4.5e-05 CCCGT 0.000139 CCCTA 0.0004 CCCTC 0.000221 CCCTG 0.000123 CCCTT 0.000457 CCGAA 0.000212 CCGAC 0.000116 CCGAG 0.000129 CCGAT 0.00026 CCGCA 0.000129 CCGCC 0.000123 CCGCG 4.72e-05 CCGCT 0.000173 CCGGA 7.56e-05 CCGGC 5.24e-05 CCGGG 4.5e-05 CCGGT 8.98e-05 CCGTA 0.000205 CCGTC 0.000144 CCGTG 8.72e-05 CCGTT 0.000339 CCTAA 0.000753 CCTAC 0.00029 CCTAG 0.000275 CCTAT 0.000733 CCTCA 0.00039 CCTCC 0.000182 CCTCG 0.000146 CCTCT 0.000356 CCTGA 0.000276 CCTGC 0.000174 CCTGG 8.66e-05 CCTGT 0.000282 CCTTA 0.000673 CCTTC 0.000358 CCTTG 0.000359 CCTTT 0.00108 CGAAA 0.00088 CGAAC 0.000317 CGAAG 0.000389 CGAAT 0.000651 CGACA 0.000375 CGACC 0.000148 CGACG 0.000123 CGACT 0.000336 CGAGA 0.000264 CGAGC 0.000136 CGAGG 0.000146 CGAGT 0.000244 CGATA 0.00079 CGATC 0.000113 CGATG 0.000368 CGATT 0.000863 CGCAA 0.000449 CGCAC 0.000156 CGCAG 0.000114 CGCAT 0.000429 CGCCA 0.000273 CGCCC 9.05e-05 CGCCG 7.43e-05 CGCCT 0.000204 CGCGA 0.000113 CGCGC 6.95e-05 CGCGG 4.72e-05 CGCGT 0.000133 CGCTA 0.000418 CGCTC 0.000181 CGCTG 0.000157 CGCTT 0.000617 CGGAA 0.000251 CGGAC 0.000123 CGGAG 7.97e-05 CGGAT 0.000228 CGGCA 0.00017 CGGCC 4.46e-05 CGGCG 7.43e-05 CGGCT 0.000105 CGGGA 0.000101 CGGGC 6.36e-05 CGGGG 0.000109 CGGGT 0.000118 CGGTA 0.000216 CGGTC 9.42e-05 CGGTG 0.000134 CGGTT 0.000301 CGTAA 0.000636 CGTAC 0.00021 CGTAG 0.000237 CGTAT 0.000774 CGTCA 0.000398 CGTCC 0.000135 CGTCG 0.000123 CGTCT 0.000318 CGTGA 0.000289 CGTGC 0.000176 CGTGG 0.000109 CGTGT 0.000302 CGTTA 0.000791 CGTTC 0.000346 CGTTG 0.000407 CGTTT 0.0011 CTAAA 0.00217 CTAAC 0.000775 CTAAG 0.00051 CTAAT 0.00183 CTACA 0.000775 CTACC 0.000306 CTACG 0.000237 CTACT 0.000779 CTAGA 0.000487 CTAGC 0.000305 CTAGG 0.000275 CTAGT 0.000624 CTATA 0.00195 CTATC 0.000782 CTATG 0.000789 CTATT 0.00218 CTCAA 0.000881 CTCAC 0.000307 CTCAG 0.000288 CTCAT 0.000854 CTCCA 0.000284 CTCCC 0.000258 CTCCG 7.97e-05 CTCCT 0.000338 CTCGA 0.00026 CTCGC 0.00016 CTCGG 0.000129 CTCGT 0.000241 CTCTA 0.000742 CTCTC 0.000257 CTCTG 0.000278 CTCTT 0.000812 CTGAA 0.00082 CTGAC 0.000312 CTGAG 0.000288 CTGAT 0.00074 CTGCA 0.00041 CTGCC 0.000209 CTGCG 0.000114 CTGCT 0.000477 CTGGA 0.000218 CTGGC 0.000157 CTGGG 0.000161 CTGGT 0.000269 CTGTA 0.00068 CTGTC 0.000344 CTGTG 0.000397 CTGTT 0.000869 CTTAA 0.00192 CTTAC 0.000805 CTTAG 0.00051 CTTAT 0.00179 CTTCA 0.00102 CTTCC 0.000332 CTTCG 0.000389 CTTCT 0.0008 CTTGA 0.000854 CTTGC 0.000428 CTTGG 0.000329 CTTGT 0.000907 CTTTA 0.00253 CTTTC 0.00101 CTTTG 0.000984 CTTTT 0.00329 GAAAA 0.00306 GAAAC 0.000782 GAAAG 0.00101 GAAAT 0.00247 GAACA 0.00083 GAACC 0.000326 GAACG 0.000346 GAACT 0.000603 GAAGA 0.000827 GAAGC 0.000473 GAAGG 0.000358 GAAGT 0.000871 GAATA 0.00182 GAATC 0.000713 GAATG 0.000977 GAATT 0.00193 GACAA 0.00103 GACAC 0.000404 GACAG 0.000344 GACAT 0.00108 GACCA 0.000263 GACCC 0.000114 GACCG 9.42e-05 GACCT 0.000286 GACGA 0.000346 GACGC 0.000167 GACGG 0.000144 GACGT 0.000316 GACTA 0.000674 GACTC 0.000305 GACTG 0.000404 GACTT 0.000737 GAGAA 0.000834 GAGAC 0.00032 GAGAG 0.000257 GAGAT 0.000617 GAGCA 0.000393 GAGCC 0.000186 GAGCG 0.000181 GAGCT 0.000331 GAGGA 0.000284 GAGGC 0.000206 GAGGG 0.000221 GAGGT 0.000357 GAGTA 0.000592 GAGTC 0.000305 GAGTG 0.000399 GAGTT 0.000668 GATAA 0.00226 GATAC 0.00074 GATAG 0.000782 GATAT 0.00198 GATCA 0.000379 GATCC 0.00015 GATCG 0.000113 GATCT 0.000215 GATGA 0.00117 GATGC 0.000521 GATGG 0.000424 GATGT 0.000981 GATTA 0.00184 GATTC 0.000713 GATTG 0.00101 GATTT 0.00259 GCAAA 0.00111 GCAAC 0.00052 GCAAG 0.000428 GCAAT 0.0012 GCACA 0.000524 GCACC 0.000222 GCACG 0.000176 GCACT 0.000463 GCAGA 0.000314 GCAGC 0.000177 GCAGG 0.000174 GCAGT 0.000549 GCATA 0.00103 GCATC 0.000521 GCATG 0.000488 GCATT 0.00122 GCCAA 0.000449 GCCAC 0.00025 GCCAG 0.000157 GCCAT 0.000529 GCCCA 0.000156 GCCCC 0.000287 GCCCG 6.36e-05 GCCCT 0.000154 GCCGA 0.000132 GCCGC 6.11e-05 GCCGG 5.24e-05 GCCGT 0.000152 GCCTA 0.000317 GCCTC 0.000206 GCCTG 0.000168 GCCTT 0.000425 GCGAA 0.000375 GCGAC 0.00017 GCGAG 0.00016 GCGAT 0.000404 GCGCA 0.000254 GCGCC 0.000133 GCGCG 6.95e-05 GCGCT 0.000275 GCGGA 0.000147 GCGGC 6.11e-05 GCGGG 0.0001 GCGGT 0.000164 GCGTA 0.000327 GCGTC 0.000167 GCGTG 0.000178 GCGTT 0.00054 GCTAA 0.000923 GCTAC 0.000357 GCTAG 0.000305 GCTAT 0.00108 GCTCA 0.000392 GCTCC 0.00019 GCTCG 0.000136 GCTCT 0.000376 GCTGA 0.000452 GCTGC 0.000177 GCTGG 0.00018 GCTGT 0.000438 GCTTA 0.000849 GCTTC 0.000473 GCTTG 0.000547 GCTTT 0.00146 GGAAA 0.000785 GGAAC 0.000237 GGAAG 0.000332 GGAAT 0.000685 GGACA 0.000401 GGACC 6.73e-05 GGACG 0.000135 GGACT 0.000226 GGAGA 0.000274 GGAGC 0.00019 GGAGG 0.000182 GGAGT 0.000314 GGATA 0.000626 GGATC 0.00015 GGATG 0.00032 GGATT 0.000806 GGCAA 0.000416 GGCAC 0.000242 GGCAG 0.000209 GGCAT 0.000458 GGCCA 0.000113 GGCCC 0.000197 GGCCG 4.46e-05 GGCCT 0.000114 GGCGA 0.000193 GGCGC 0.000133 GGCGG 0.000123 GGCGT 0.000194 GGCTA 0.000349 GGCTC 0.000186 GGCTG 0.000169 GGCTT 0.0004 GGGAA 0.000392 GGGAC 0.000236 GGGAG 0.000258 GGGAT 0.000355 GGGCA 0.000177 GGGCC 0.000197 GGGCG 9.05e-05 GGGCT 0.000192 GGGGA 0.000252 GGGGC 0.000287 GGGGG 0.000169 GGGGT 0.000217 GGGTA 0.000256 GGGTC 0.000114 GGGTG 0.000246 GGGTT 0.00032 GGTAA 0.000697 GGTAC 0.000269 GGTAG 0.000306 GGTAT 0.000743 GGTCA 0.000323 GGTCC 6.73e-05 GGTCG 0.000148 GGTCT 0.000222 GGTGA 0.000388 GGTGC 0.000222 GGTGG 0.00021 GGTGT 0.000471 GGTTA 0.000713 GGTTC 0.000326 GGTTG 0.000413 GGTTT 0.0009 GTAAA 0.00223 GTAAC 0.000714 GTAAG 0.000805 GTAAT 0.00197 GTACA 0.000677 GTACC 0.000269 GTACG 0.00021 GTACT 0.000623 GTAGA 0.000648 GTAGC 0.000357 GTAGG 0.00029 GTAGT 0.000801 GTATA 0.00203 GTATC 0.00074 GTATG 0.000868 GTATT 0.00223 GTCAA 0.000944 GTCAC 0.000416 GTCAG 0.000312 GTCAT 0.00114 GTCCA 0.000257 GTCCC 0.000236 GTCCG 0.000123 GTCCT 0.000217 GTCGA 0.000324 GTCGC 0.00017 GTCGG 0.000116 GTCGT 0.00037 GTCTA 0.000619 GTCTC 0.00032 GTCTG 0.000316 GTCTT 0.000825 GTGAA 0.00092 GTGAC 0.000416 GTGAG 0.000307 GTGAT 0.000962 GTGCA 0.000486 GTGCC 0.000242 GTGCG 0.000156 GTGCT 0.000505 GTGGA 0.000282 GTGGC 0.00025 GTGGG 0.000245 GTGGT 0.00043 GTGTA 0.000895 GTGTC 0.000404 GTGTG 0.000444 GTGTT 0.0011 GTTAA 0.00234 GTTAC 0.000714 GTTAG 0.000775 GTTAT 0.00227 GTTCA 0.000854 GTTCC 0.000237 GTTCG 0.000317 GTTCT 0.000685 GTTGA 0.00113 GTTGC 0.00052 GTTGG 0.000629 GTTGT 0.00118 GTTTA 0.00209 GTTTC 0.000782 GTTTG 0.00104 GTTTT 0.00284 TAAAA 0.00792 TAAAC 0.00209 TAAAG 0.00253 TAAAT 0.0063 TAACA 0.00252 TAACC 0.000713 TAACG 0.000791 TAACT 0.00206 TAAGA 0.00156 TAAGC 0.000849 TAAGG 0.000673 TAAGT 0.00194 TAATA 0.00541 TAATC 0.00184 TAATG 0.00254 TAATT 0.00561 TACAA 0.00241 TACAC 0.000895 TACAG 0.00068 TACAT 0.00222 TACCA 0.000822 TACCC 0.000256 TACCG 0.000216 TACCT 0.000718 TACGA 0.000654 TACGC 0.000327 TACGG 0.000205 TACGT 0.000669 TACTA 0.00176 TACTC 0.000592 TACTG 0.000832 TACTT 0.0022 TAGAA 0.00193 TAGAC 0.000619 TAGAG 0.000742 TAGAT 0.00155 TAGCA 0.00104 TAGCC 0.000349 TAGCG 0.000418 TAGCT 0.000861 TAGGA 0.000601 TAGGC 0.000317 TAGGG 0.0004 TAGGT 0.000741 TAGTA 0.00176 TAGTC 0.000674 TAGTG 0.000882 TAGTT 0.00191 TATAA 0.00582 TATAC 0.00203 TATAG 0.00195 TATAT 0.00508 TATCA 0.00257 TATCC 0.000626 TATCG 0.00079 TATCT 0.00178 TATGA 0.00219 TATGC 0.00103 TATGG 0.000699 TATGT 0.00237 TATTA 0.00541 TATTC 0.00182 TATTG 0.00245 TATTT 0.00688 TCAAA 0.00292 TCAAC 0.00113 TCAAG 0.000854 TCAAT 0.00267 TCACA 0.000937 TCACC 0.000388 TCACG 0.000289 TCACT 0.000998 TCAGA 0.000571 TCAGC 0.000452 TCAGG 0.000276 TCAGT 0.000863 TCATA 0.00219 TCATC 0.00117 TCATG 0.00104 TCATT 0.00334 TCCAA 0.000819 TCCAC 0.000282 TCCAG 0.000218 TCCAT 0.000726 TCCCA 0.000443 TCCCC 0.000252 TCCCG 0.000101 TCCCT 0.000439 TCCGA 0.00022 TCCGC 0.000147 TCCGG 7.56e-05 TCCGT 0.000243 TCCTA 0.000601 TCCTC 0.000284 TCCTG 0.000225 TCCTT 0.000671 TCGAA 0.000824 TCGAC 0.000324 TCGAG 0.00026 TCGAT 0.000695 TCGCA 0.000371 TCGCC 0.000193 TCGCG 0.000113 TCGCT 0.000433 TCGGA 0.00022 TCGGC 0.000132 TCGGG 0.00011 TCGGT 0.000254 TCGTA 0.000654 TCGTC 0.000346 TCGTG 0.000302 TCGTT 0.000908 TCTAA 0.00178 TCTAC 0.000648 TCTAG 0.000487 TCTAT 0.00193 TCTCA 0.000762 TCTCC 0.000274 TCTCG 0.000264 TCTCT 0.000747 TCTGA 0.000571 TCTGC 0.000314 TCTGG 0.000225 TCTGT 0.000788 TCTTA 0.00156 TCTTC 0.000827 TCTTG 0.000706 TCTTT 0.00254 TGAAA 0.00318 TGAAC 0.000854 TGAAG 0.00102 TGAAT 0.00247 TGACA 0.00111 TGACC 0.000323 TGACG 0.000398 TGACT 0.000985 TGAGA 0.000762 TGAGC 0.000392 TGAGG 0.00039 TGAGT 0.000799 TGATA 0.00257 TGATC 0.000379 TGATG 0.00143 TGATT 0.00294 TGCAA 0.00123 TGCAC 0.000486 TGCAG 0.00041 TGCAT 0.00122 TGCCA 0.000545 TGCCC 0.000177 TGCCG 0.00017 TGCCT 0.000433 TGCGA 0.000371 TGCGC 0.000254 TGCGG 0.000129 TGCGT 0.000389 TGCTA 0.00104 TGCTC 0.000393 TGCTG 0.00053 TGCTT 0.00134 TGGAA 0.000788 TGGAC 0.000257 TGGAG 0.000284 TGGAT 0.000719 TGGCA 0.000545 TGGCC 0.000113 TGGCG 0.000273 TGGCT 0.000454 TGGGA 0.000443 TGGGC 0.000156 TGGGG 0.000362 TGGGT 0.00028 TGGTA 0.000822 TGGTC 0.000263 TGGTG 0.000416 TGGTT 0.000917 TGTAA 0.00239 TGTAC 0.000677 TGTAG 0.000775 TGTAT 0.00235 TGTCA 0.00111 TGTCC 0.000401 TGTCG 0.000375 TGTCT 0.000963 TGTGA 0.000937 TGTGC 0.000524 TGTGG 0.000464 TGTGT 0.00116 TGTTA 0.00252 TGTTC 0.00083 TGTTG 0.00141 TGTTT 0.0028 TTAAA 0.00731 TTAAC 0.00234 TTAAG 0.00192 TTAAT 0.00617 TTACA 0.00239 TTACC 0.000697 TTACG 0.000636 TTACT 0.00199 TTAGA 0.00178 TTAGC 0.000923 TTAGG 0.000753 TTAGT 0.00185 TTATA 0.00582 TTATC 0.00226 TTATG 0.00238 TTATT 0.0062 TTCAA 0.00308 TTCAC 0.00092 TTCAG 0.00082 TTCAT 0.00273 TTCCA 0.000788 TTCCC 0.000392 TTCCG 0.000251 TTCCT 0.000617 TTCGA 0.000824 TTCGC 0.000375 TTCGG 0.000212 TTCGT 0.000831 TTCTA 0.00193 TTCTC 0.000834 TTCTG 0.000733 TTCTT 0.00214 TTGAA 0.00308 TTGAC 0.000944 TTGAG 0.000881 TTGAT 0.00265 TTGCA 0.00123 TTGCC 0.000416 TTGCG 0.000449 TTGCT 0.00116 TTGGA 0.000819 TTGGC 0.000449 TTGGG 0.000526 TTGGT 0.000851 TTGTA 0.00241 TTGTC 0.00103 TTGTG 0.00113 TTGTT 0.00289 TTTAA 0.00731 TTTAC 0.00223 TTTAG 0.00217 TTTAT 0.00717 TTTCA 0.00318 TTTCC 0.000785 TTTCG 0.00088 TTTCT 0.0025 TTTGA 0.00292 TTTGC 0.00111 TTTGG 0.000839 TTTGT 0.00282 TTTTA 0.00792 TTTTC 0.00306 TTTTG 0.00307 TTTTT 0.00833 [2] # (a,c,g,t)= (0.332, 0.168, 0.168, 0.332) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.36 C 0.14 G 0.141 T 0.359 # l= 1 # Values AA 0.139 AC 0.0489 AG 0.0455 AT 0.126 CA 0.0563 CC 0.0199 CG 0.0186 CT 0.0454 GA 0.0466 GC 0.0251 GG 0.0199 GT 0.0489 TA 0.118 TC 0.0463 TG 0.0564 TT 0.139 # l= 2 # Values AAA 0.0557 AAC 0.0184 AAG 0.0179 AAT 0.0468 ACA 0.0198 ACC 0.00647 ACG 0.00646 ACT 0.0162 AGA 0.0144 AGC 0.00852 AGG 0.00648 AGT 0.0162 ATA 0.043 ATC 0.0158 ATG 0.0206 ATT 0.0468 CAA 0.021 CAC 0.00818 CAG 0.00661 CAT 0.0206 CCA 0.00722 CCC 0.00392 CCG 0.0023 CCT 0.00645 CGA 0.00621 CGC 0.00365 CGG 0.00231 CGT 0.00646 CTA 0.0148 CTC 0.00623 CTG 0.00663 CTT 0.0179 GAA 0.0175 GAC 0.00682 GAG 0.00625 GAT 0.0159 GCA 0.00927 GCC 0.00367 GCG 0.00364 GCT 0.00852 GGA 0.00585 GGC 0.00369 GGG 0.00392 GGT 0.00647 GTA 0.0155 GTC 0.00682 GTG 0.00822 GTT 0.0185 TAA 0.0449 TAC 0.0155 TAG 0.0148 TAT 0.043 TCA 0.02 TCC 0.00583 TCG 0.00622 TCT 0.0143 TGA 0.0201 TGC 0.00929 TGG 0.00722 TGT 0.0198 TTA 0.0448 TTC 0.0174 TTG 0.021 TTT 0.0556 # l= 3 # Values AAAA 0.0221 AAAC 0.00669 AAAG 0.0078 AAAT 0.019 AACA 0.00756 AACC 0.00237 AACG 0.00267 AACT 0.00583 AAGA 0.00559 AAGC 0.00341 AAGG 0.00246 AAGT 0.00647 AATA 0.0163 AATC 0.00612 AATG 0.00822 AATT 0.0162 ACAA 0.00747 ACAC 0.00289 ACAG 0.00234 ACAT 0.00713 ACCA 0.00243 ACCC 0.000957 ACCG 0.000769 ACCT 0.00231 ACGA 0.00224 ACGC 0.00124 ACGG 0.000797 ACGT 0.00218 ACTA 0.00519 ACTC 0.00198 ACTG 0.00256 ACTT 0.00647 AGAA 0.0056 AGAC 0.00211 AGAG 0.00212 AGAT 0.00451 AGCA 0.00334 AGCC 0.00114 AGCG 0.00142 AGCT 0.00262 AGGA 0.0018 AGGC 0.00114 AGGG 0.00122 AGGT 0.00231 AGTA 0.00537 AGTC 0.00216 AGTG 0.00283 AGTT 0.00584 ATAA 0.0165 ATAC 0.00584 ATAG 0.00567 ATAT 0.015 ATCA 0.00728 ATCC 0.00191 ATCG 0.00215 ATCT 0.00448 ATGA 0.00773 ATGC 0.0033 ATGG 0.00245 ATGT 0.00712 ATTA 0.0151 ATTC 0.00544 ATTG 0.00726 ATTT 0.019 CAAA 0.00765 CAAC 0.00354 CAAG 0.00255 CAAT 0.00725 CACA 0.00316 CACC 0.00133 CACG 0.000898 CACT 0.0028 CAGA 0.00194 CAGC 0.00128 CAGG 0.000852 CAGT 0.00255 CATA 0.0063 CATC 0.00313 CATG 0.00295 CATT 0.00823 CCAA 0.00269 CCAC 0.00125 CCAG 0.000827 CCAT 0.00245 CCCA 0.0013 CCCC 0.000984 CCCG 0.000414 CCCT 0.00122 CCGA 0.000739 CCGC 0.000497 CCGG 0.000274 CCGT 0.000797 CCTA 0.00208 CCTC 0.00108 CCTG 0.000854 CCTT 0.00245 CGAA 0.00227 CGAC 0.001 CGAG 0.000795 CGAT 0.00214 CGCA 0.00118 CGCC 0.00067 CGCG 0.000374 CGCT 0.00142 CGGA 0.000704 CGGC 0.000416 CGGG 0.000417 CGGT 0.000771 CGTA 0.00188 CGTC 0.00101 CGTG 0.000901 CGTT 0.00268 CTAA 0.00527 CTAC 0.00213 CTAG 0.00172 CTAT 0.00566 CTCA 0.00236 CTCC 0.000992 CTCG 0.000797 CTCT 0.00211 CTGA 0.00219 CTGC 0.00125 CTGG 0.00083 CTGT 0.00235 CTTA 0.00501 CTTC 0.00254 CTTG 0.00256 CTTT 0.00783 GAAA 0.00732 GAAC 0.00212 GAAG 0.00255 GAAT 0.00544 GACA 0.00288 GACC 0.000772 GACG 0.00101 GACT 0.00216 GAGA 0.00207 GAGC 0.00113 GAGG 0.00109 GAGT 0.00197 GATA 0.0057 GATC 0.000883 GATG 0.00313 GATT 0.00612 GCAA 0.0033 GCAC 0.00142 GCAG 0.00125 GCAT 0.0033 GCCA 0.00143 GCCC 0.000699 GCCG 0.000412 GCCT 0.00113 GCGA 0.00114 GCGC 0.000759 GCGG 0.000498 GCGT 0.00124 GCTA 0.0027 GCTC 0.00113 GCTG 0.00128 GCTT 0.00341 GGAA 0.00207 GGAC 0.000872 GGAG 0.000991 GGAT 0.00192 GGCA 0.00136 GGCC 0.000495 GGCG 0.000669 GGCT 0.00114 GGGA 0.00128 GGGC 0.000705 GGGG 0.000977 GGGT 0.000962 GGTA 0.002 GGTC 0.00077 GGTG 0.00132 GGTT 0.00236 GTAA 0.00569 GTAC 0.00179 GTAG 0.00213 GTAT 0.00584 GTCA 0.00284 GTCC 0.000867 GTCG 0.00101 GTCT 0.00211 GTGA 0.00263 GTGC 0.00142 GTGG 0.00125 GTGT 0.00289 GTTA 0.00607 GTTC 0.00213 GTTG 0.00355 GTTT 0.0067 TAAA 0.0186 TAAC 0.00607 TAAG 0.00501 TAAT 0.0151 TACA 0.00619 TACC 0.002 TACG 0.00188 TACT 0.00538 TAGA 0.00481 TAGC 0.00269 TAGG 0.00208 TAGT 0.00518 TATA 0.0147 TATC 0.00569 TATG 0.0063 TATT 0.0163 TCAA 0.00752 TCAC 0.00262 TCAG 0.00219 TCAT 0.0077 TCCA 0.00207 TCCC 0.00128 TCCG 0.0007 TCCT 0.0018 TCGA 0.00209 TCGC 0.00114 TCGG 0.000739 TCGT 0.00224 TCTA 0.00481 TCTC 0.00205 TCTG 0.00193 TCTT 0.00555 TGAA 0.00755 TGAC 0.00284 TGAG 0.00235 TGAT 0.00729 TGCA 0.00339 TGCC 0.00136 TGCG 0.00118 TGCT 0.00334 TGGA 0.00206 TGGC 0.00142 TGGG 0.00131 TGGT 0.00243 TGTA 0.0062 TGTC 0.00289 TGTG 0.00317 TGTT 0.00757 TTAA 0.0174 TTAC 0.0057 TTAG 0.00524 TTAT 0.0165 TTCA 0.00752 TTCC 0.00206 TTCG 0.00226 TTCT 0.00559 TTGA 0.00753 TTGC 0.00331 TTGG 0.00269 TTGT 0.00747 TTTA 0.0186 TTTC 0.00729 TTTG 0.00763 TTTT 0.0221 # l= 4 # Values AAAAA 0.0082 AAAAC 0.00281 AAAAG 0.00328 AAAAT 0.00778 AAACA 0.00276 AAACC 0.000895 AAACG 0.0011 AAACT 0.00194 AAAGA 0.00252 AAAGC 0.0015 AAAGG 0.00107 AAAGT 0.00274 AAATA 0.00678 AAATC 0.00256 AAATG 0.00345 AAATT 0.0062 AACAA 0.00288 AACAC 0.00112 AACAG 0.000879 AACAT 0.0027 AACCA 0.000924 AACCC 0.000322 AACCG 0.000311 AACCT 0.000805 AACGA 0.000913 AACGC 0.000549 AACGG 0.000344 AACGT 0.00087 AACTA 0.00188 AACTC 0.000673 AACTG 0.000937 AACTT 0.00236 AAGAA 0.0021 AAGAC 0.000831 AAGAG 0.000816 AAGAT 0.0018 AAGCA 0.00136 AAGCC 0.000412 AAGCG 0.000641 AAGCT 0.000996 AAGGA 0.000676 AAGGC 0.000425 AAGGG 0.000459 AAGGT 0.000892 AAGTA 0.00219 AAGTC 0.00075 AAGTG 0.00117 AAGTT 0.00236 AATAA 0.0061 AATAC 0.00222 AATAG 0.00216 AATAT 0.00583 AATCA 0.00293 AATCC 0.000813 AATCG 0.000869 AATCT 0.00152 AATGA 0.00333 AATGC 0.00123 AATGG 0.001 AATGT 0.00266 AATTA 0.00548 AATTC 0.00192 AATTG 0.00256 AATTT 0.0062 ACAAA 0.00281 ACAAC 0.00119 ACAAG 0.000924 ACAAT 0.00254 ACACA 0.00119 ACACC 0.000482 ACACG 0.000313 ACACT 0.000903 ACAGA 0.000811 ACAGC 0.000444 ACAGG 0.000293 ACAGT 0.000799 ACATA 0.00238 ACATC 0.000998 ACATG 0.00108 ACATT 0.00266 ACCAA 0.000853 ACCAC 0.000433 ACCAG 0.000276 ACCAT 0.000864 ACCCA 0.000279 ACCCC 0.000234 ACCCG 0.000122 ACCCT 0.000327 ACCGA 0.000263 ACCGC 0.000169 ACCGG 9.37e-05 ACCGT 0.000245 ACCTA 0.00074 ACCTC 0.00036 ACCTG 0.000316 ACCTT 0.000892 ACGAA 0.000836 ACGAC 0.00038 ACGAG 0.000247 ACGAT 0.000774 ACGCA 0.000398 ACGCC 0.000202 ACGCG 0.000135 ACGCT 0.000507 ACGGA 0.000249 ACGGC 0.000158 ACGGG 0.000146 ACGGT 0.000245 ACGTA 0.000672 ACGTC 0.000326 ACGTG 0.000315 ACGTT 0.00087 ACTAA 0.00182 ACTAC 0.000806 ACTAG 0.00062 ACTAT 0.00194 ACTCA 0.000801 ACTCC 0.00032 ACTCG 0.000245 ACTCT 0.000607 ACTGA 0.000871 ACTGC 0.000565 ACTGG 0.000317 ACTGT 0.000799 ACTTA 0.00194 ACTTC 0.000872 ACTTG 0.000925 ACTTT 0.00274 AGAAA 0.00248 AGAAC 0.000683 AGAAG 0.000795 AGAAT 0.00164 AGACA 0.000977 AGACC 0.000219 AGACG 0.000325 AGACT 0.000588 AGAGA 0.000752 AGAGC 0.000391 AGAGG 0.00036 AGAGT 0.000607 AGATA 0.00176 AGATC 0.000218 AGATG 0.000991 AGATT 0.00152 AGCAA 0.00117 AGCAC 0.000517 AGCAG 0.000482 AGCAT 0.00116 AGCCA 0.000469 AGCCC 0.000202 AGCCG 0.000109 AGCCT 0.000362 AGCGA 0.000444 AGCGC 0.000287 AGCGG 0.000179 AGCGT 0.000507 AGCTA 0.000867 AGCTC 0.000346 AGCTG 0.000412 AGCTT 0.000996 AGGAA 0.000617 AGGAC 0.000226 AGGAG 0.000349 AGGAT 0.000607 AGGCA 0.000442 AGGCC 0.000115 AGGCG 0.000211 AGGCT 0.000362 AGGGA 0.000442 AGGGC 0.000158 AGGGG 0.000291 AGGGT 0.000327 AGGTA 0.000705 AGGTC 0.000291 AGGTG 0.000504 AGGTT 0.000805 AGTAA 0.00198 AGTAC 0.00062 AGTAG 0.000786 AGTAT 0.00199 AGTCA 0.001 AGTCC 0.000231 AGTCG 0.000342 AGTCT 0.000588 AGTGA 0.000998 AGTGC 0.000466 AGTGG 0.000431 AGTGT 0.000903 AGTTA 0.00203 AGTTC 0.000604 AGTTG 0.00126 AGTTT 0.00194 ATAAA 0.00709 ATAAC 0.00227 ATAAG 0.00178 ATAAT 0.00533 ATACA 0.00234 ATACC 0.000731 ATACG 0.000777 ATACT 0.00199 ATAGA 0.00191 ATAGC 0.00107 ATAGG 0.000741 ATAGT 0.00194 ATATA 0.00501 ATATC 0.00195 ATATG 0.00225 ATATT 0.00583 ATCAA 0.00264 ATCAC 0.000959 ATCAG 0.000741 ATCAT 0.00296 ATCCA 0.000722 ATCCC 0.000355 ATCCG 0.000233 ATCCT 0.000607 ATCGA 0.000684 ATCGC 0.000418 ATCGG 0.000268 ATCGT 0.000774 ATCTA 0.00152 ATCTC 0.000612 ATCTG 0.000574 ATCTT 0.0018 ATGAA 0.00273 ATGAC 0.00115 ATGAG 0.000866 ATGAT 0.00296 ATGCA 0.00123 ATGCC 0.000467 ATGCG 0.000436 ATGCT 0.00116 ATGGA 0.00072 ATGGC 0.000544 ATGGG 0.000322 ATGGT 0.000864 ATGTA 0.0022 ATGTC 0.00109 ATGTG 0.00114 ATGTT 0.0027 ATTAA 0.00605 ATTAC 0.00195 ATTAG 0.00181 ATTAT 0.00533 ATTCA 0.00246 ATTCC 0.000691 ATTCG 0.000645 ATTCT 0.00164 ATTGA 0.00265 ATTGC 0.00121 ATTGG 0.000854 ATTGT 0.00254 ATTTA 0.00619 ATTTC 0.00247 ATTTG 0.00255 ATTTT 0.00778 CAAAA 0.00304 CAAAC 0.00104 CAAAG 0.000997 CAAAT 0.00255 CAACA 0.00144 CAACC 0.000426 CAACG 0.000422 CAACT 0.00126 CAAGA 0.000707 CAAGC 0.00057 CAAGG 0.000359 CAAGT 0.000925 CAATA 0.00244 CAATC 0.001 CAATG 0.00126 CAATT 0.00256 CACAA 0.00115 CACAC 0.000458 CACAG 0.000418 CACAT 0.00114 CACCA 0.000422 CACCC 0.000261 CACCG 0.000138 CACCT 0.000504 CACGA 0.000308 CACGC 0.000183 CACGG 9.35e-05 CACGT 0.000315 CACTA 0.000884 CACTC 0.000407 CACTG 0.000369 CACTT 0.00117 CAGAA 0.000742 CAGAC 0.000324 CAGAG 0.00029 CAGAT 0.000574 CAGCA 0.000539 CAGCC 0.000175 CAGCG 0.000158 CAGCT 0.000412 CAGGA 0.000228 CAGGC 0.000183 CAGGG 0.000127 CAGGT 0.000316 CAGTA 0.000841 CAGTC 0.000413 CAGTG 0.000369 CAGTT 0.000937 CATAA 0.00238 CATAC 0.000875 CATAG 0.000797 CATAT 0.00225 CATCA 0.00144 CATCC 0.000319 CATCG 0.00038 CATCT 0.000991 CATGA 0.00105 CATGC 0.000501 CATGG 0.000319 CATGT 0.00108 CATTA 0.00253 CATTC 0.000985 CATTG 0.00126 CATTT 0.00345 CCAAA 0.000832 CCAAC 0.000664 CCAAG 0.000335 CCAAT 0.000854 CCACA 0.000487 CCACC 0.000222 CCACG 0.000112 CCACT 0.000431 CCAGA 0.000228 CCAGC 0.000191 CCAGG 9.37e-05 CCAGT 0.000317 CCATA 0.000699 CCATC 0.000428 CCATG 0.000319 CCATT 0.001 CCCAA 0.000555 CCCAC 0.000261 CCCAG 0.000169 CCCAT 0.000322 CCCCA 0.000388 CCCCC 0.000178 CCCCG 0.000119 CCCCT 0.000291 CCCGA 0.000114 CCCGC 0.000111 CCCGG 4.72e-05 CCCGT 0.000146 CCCTA 0.000409 CCCTC 0.000225 CCCTG 0.000127 CCCTT 0.000459 CCGAA 0.000218 CCGAC 0.000123 CCGAG 0.00013 CCGAT 0.000268 CCGCA 0.000135 CCGCC 0.000133 CCGCG 5.01e-05 CCGCT 0.000179 CCGGA 7.56e-05 CCGGC 5.77e-05 CCGGG 4.72e-05 CCGGT 9.37e-05 CCGTA 0.000208 CCGTC 0.000152 CCGTG 9.35e-05 CCGTT 0.000344 CCTAA 0.000756 CCTAC 0.000297 CCTAG 0.000281 CCTAT 0.000741 CCTCA 0.000392 CCTCC 0.000189 CCTCG 0.000149 CCTCT 0.00036 CCTGA 0.000283 CCTGC 0.000182 CCTGG 9.37e-05 CCTGT 0.000293 CCTTA 0.000681 CCTTC 0.000358 CCTTG 0.000359 CCTTT 0.00107 CGAAA 0.000894 CGAAC 0.000325 CGAAG 0.000397 CGAAT 0.000645 CGACA 0.000382 CGACC 0.000151 CGACG 0.000131 CGACT 0.000342 CGAGA 0.000267 CGAGC 0.000136 CGAGG 0.000149 CGAGT 0.000245 CGATA 0.000785 CGATC 0.000118 CGATG 0.00038 CGATT 0.000869 CGCAA 0.000463 CGCAC 0.000166 CGCAG 0.000119 CGCAT 0.000436 CGCCA 0.000284 CGCCC 9.57e-05 CGCCG 7.87e-05 CGCCT 0.000211 CGCGA 0.000116 CGCGC 7.25e-05 CGCGG 5.01e-05 CGCGT 0.000135 CGCTA 0.00043 CGCTC 0.000187 CGCTG 0.000158 CGCTT 0.000641 CGGAA 0.000256 CGGAC 0.00013 CGGAG 8.25e-05 CGGAT 0.000233 CGGCA 0.000178 CGGCC 4.67e-05 CGGCG 7.87e-05 CGGCT 0.000109 CGGGA 0.000108 CGGGC 6.49e-05 CGGGG 0.000119 CGGGT 0.000122 CGGTA 0.000222 CGGTC 9.82e-05 CGGTG 0.000138 CGGTT 0.000311 CGTAA 0.000644 CGTAC 0.000213 CGTAG 0.000245 CGTAT 0.000777 CGTCA 0.000407 CGTCC 0.000146 CGTCG 0.000131 CGTCT 0.000325 CGTGA 0.000292 CGTGC 0.000182 CGTGG 0.000112 CGTGT 0.000313 CGTTA 0.000799 CGTTC 0.000348 CGTTG 0.000422 CGTTT 0.0011 CTAAA 0.00215 CTAAC 0.000771 CTAAG 0.000512 CTAAT 0.00181 CTACA 0.000787 CTACC 0.000311 CTACG 0.000245 CTACT 0.000786 CTAGA 0.000493 CTAGC 0.000321 CTAGG 0.000281 CTAGT 0.00062 CTATA 0.00193 CTATC 0.000778 CTATG 0.000797 CTATT 0.00216 CTCAA 0.000879 CTCAC 0.000309 CTCAG 0.000293 CTCAT 0.000866 CTCCA 0.000292 CTCCC 0.000267 CTCCG 8.25e-05 CTCCT 0.000349 CTCGA 0.000259 CTCGC 0.000159 CTCGG 0.00013 CTCGT 0.000247 CTCTA 0.00075 CTCTC 0.000263 CTCTG 0.00029 CTCTT 0.000816 CTGAA 0.000834 CTGAC 0.000324 CTGAG 0.000293 CTGAT 0.000741 CTGCA 0.000425 CTGCC 0.000223 CTGCG 0.000119 CTGCT 0.000482 CTGGA 0.000222 CTGGC 0.00016 CTGGG 0.000169 CTGGT 0.000276 CTGTA 0.000688 CTGTC 0.000359 CTGTG 0.000418 CTGTT 0.000879 CTTAA 0.0019 CTTAC 0.000815 CTTAG 0.000512 CTTAT 0.00178 CTTCA 0.00102 CTTCC 0.000334 CTTCG 0.000397 CTTCT 0.000795 CTTGA 0.000852 CTTGC 0.000443 CTTGG 0.000335 CTTGT 0.000924 CTTTA 0.00251 CTTTC 0.00101 CTTTG 0.000997 CTTTT 0.00328 GAAAA 0.00302 GAAAC 0.000782 GAAAG 0.00101 GAAAT 0.00247 GAACA 0.000847 GAACC 0.000334 GAACG 0.000348 GAACT 0.000604 GAAGA 0.000825 GAAGC 0.000487 GAAGG 0.000358 GAAGT 0.000872 GAATA 0.00181 GAATC 0.000723 GAATG 0.000985 GAATT 0.00192 GACAA 0.00103 GACAC 0.000408 GACAG 0.000359 GACAT 0.00109 GACCA 0.000263 GACCC 0.000118 GACCG 9.82e-05 GACCT 0.000291 GACGA 0.000356 GACGC 0.000172 GACGG 0.000152 GACGT 0.000326 GACTA 0.000679 GACTC 0.000314 GACTG 0.000413 GACTT 0.00075 GAGAA 0.000846 GAGAC 0.000325 GAGAG 0.000263 GAGAT 0.000612 GAGCA 0.000398 GAGCC 0.000197 GAGCG 0.000187 GAGCT 0.000346 GAGGA 0.000288 GAGGC 0.000211 GAGGG 0.000225 GAGGT 0.00036 GAGTA 0.000584 GAGTC 0.000314 GAGTG 0.000407 GAGTT 0.000673 GATAA 0.00223 GATAC 0.000736 GATAG 0.000778 GATAT 0.00195 GATCA 0.000386 GATCC 0.000161 GATCG 0.000118 GATCT 0.000218 GATGA 0.00117 GATGC 0.000529 GATGG 0.000428 GATGT 0.000998 GATTA 0.00184 GATTC 0.000723 GATTG 0.001 GATTT 0.00256 GCAAA 0.00112 GCAAC 0.000535 GCAAG 0.000443 GCAAT 0.00121 GCACA 0.000542 GCACC 0.00023 GCACG 0.000182 GCACT 0.000466 GCAGA 0.000325 GCAGC 0.000183 GCAGG 0.000182 GCAGT 0.000565 GCATA 0.00104 GCATC 0.000529 GCATG 0.000501 GCATT 0.00123 GCCAA 0.000458 GCCAC 0.000263 GCCAG 0.00016 GCCAT 0.000544 GCCCA 0.000167 GCCCC 0.000315 GCCCG 6.49e-05 GCCCT 0.000158 GCCGA 0.000137 GCCGC 6.31e-05 GCCGG 5.77e-05 GCCGT 0.000158 GCCTA 0.000324 GCCTC 0.000211 GCCTG 0.000183 GCCTT 0.000425 GCGAA 0.000393 GCGAC 0.000175 GCGAG 0.000159 GCGAT 0.000418 GCGCA 0.000261 GCGCC 0.000139 GCGCG 7.25e-05 GCGCT 0.000287 GCGGA 0.000154 GCGGC 6.31e-05 GCGGG 0.000111 GCGGT 0.000169 GCGTA 0.00034 GCGTC 0.000172 GCGTG 0.000183 GCGTT 0.000549 GCTAA 0.000938 GCTAC 0.000369 GCTAG 0.000321 GCTAT 0.00107 GCTCA 0.000402 GCTCC 0.000203 GCTCG 0.000136 GCTCT 0.000391 GCTGA 0.000463 GCTGC 0.000183 GCTGG 0.000191 GCTGT 0.000444 GCTTA 0.000853 GCTTC 0.000487 GCTTG 0.00057 GCTTT 0.0015 GGAAA 0.000784 GGAAC 0.00025 GGAAG 0.000334 GGAAT 0.000691 GGACA 0.000417 GGACC 7.34e-05 GGACG 0.000146 GGACT 0.000231 GGAGA 0.00028 GGAGC 0.000203 GGAGG 0.000189 GGAGT 0.00032 GGATA 0.000616 GGATC 0.000161 GGATG 0.000319 GGATT 0.000813 GGCAA 0.000425 GGCAC 0.000244 GGCAG 0.000223 GGCAT 0.000467 GGCCA 0.000112 GGCCC 0.000221 GGCCG 4.67e-05 GGCCT 0.000115 GGCGA 0.000196 GGCGC 0.000139 GGCGG 0.000133 GGCGT 0.000202 GGCTA 0.000359 GGCTC 0.000197 GGCTG 0.000175 GGCTT 0.000412 GGGAA 0.000406 GGGAC 0.000253 GGGAG 0.000267 GGGAT 0.000355 GGGCA 0.00018 GGGCC 0.000221 GGGCG 9.57e-05 GGGCT 0.000202 GGGGA 0.000257 GGGGC 0.000315 GGGGG 0.000178 GGGGT 0.000234 GGGTA 0.000256 GGGTC 0.000118 GGGTG 0.000261 GGGTT 0.000322 GGTAA 0.000687 GGTAC 0.000275 GGTAG 0.000311 GGTAT 0.000731 GGTCA 0.000328 GGTCC 7.34e-05 GGTCG 0.000151 GGTCT 0.000219 GGTGA 0.000393 GGTGC 0.00023 GGTGG 0.000222 GGTGT 0.000482 GGTTA 0.000714 GGTTC 0.000334 GGTTG 0.000426 GGTTT 0.000895 GTAAA 0.00221 GTAAC 0.000725 GTAAG 0.000815 GTAAT 0.00195 GTACA 0.000681 GTACC 0.000275 GTACG 0.000213 GTACT 0.00062 GTAGA 0.000656 GTAGC 0.000369 GTAGG 0.000297 GTAGT 0.000806 GTATA 0.00201 GTATC 0.000736 GTATG 0.000875 GTATT 0.00222 GTCAA 0.000943 GTCAC 0.000423 GTCAG 0.000324 GTCAT 0.00115 GTCCA 0.000264 GTCCC 0.000253 GTCCG 0.00013 GTCCT 0.000226 GTCGA 0.000326 GTCGC 0.000175 GTCGG 0.000123 GTCGT 0.00038 GTCTA 0.000627 GTCTC 0.000325 GTCTG 0.000324 GTCTT 0.000831 GTGAA 0.000927 GTGAC 0.000423 GTGAG 0.000309 GTGAT 0.000959 GTGCA 0.000498 GTGCC 0.000244 GTGCG 0.000166 GTGCT 0.000517 GTGGA 0.000296 GTGGC 0.000263 GTGGG 0.000261 GTGGT 0.000433 GTGTA 0.000907 GTGTC 0.000408 GTGTG 0.000458 GTGTT 0.00112 GTTAA 0.00231 GTTAC 0.000725 GTTAG 0.000771 GTTAT 0.00227 GTTCA 0.000864 GTTCC 0.00025 GTTCG 0.000325 GTTCT 0.000683 GTTGA 0.00115 GTTGC 0.000535 GTTGG 0.000664 GTTGT 0.00119 GTTTA 0.00205 GTTTC 0.000782 GTTTG 0.00104 GTTTT 0.00281 TAAAA 0.00784 TAAAC 0.00205 TAAAG 0.00251 TAAAT 0.00619 TAACA 0.00252 TAACC 0.000714 TAACG 0.000799 TAACT 0.00203 TAAGA 0.00154 TAAGC 0.000853 TAAGG 0.000681 TAAGT 0.00194 TAATA 0.0053 TAATC 0.00184 TAATG 0.00253 TAATT 0.00548 TACAA 0.00241 TACAC 0.000907 TACAG 0.000688 TACAT 0.0022 TACCA 0.000819 TACCC 0.000256 TACCG 0.000222 TACCT 0.000705 TACGA 0.00066 TACGC 0.00034 TACGG 0.000208 TACGT 0.000672 TACTA 0.00175 TACTC 0.000584 TACTG 0.000841 TACTT 0.00219 TAGAA 0.00191 TAGAC 0.000627 TAGAG 0.00075 TAGAT 0.00152 TAGCA 0.00104 TAGCC 0.000359 TAGCG 0.00043 TAGCT 0.000867 TAGGA 0.000612 TAGGC 0.000324 TAGGG 0.000409 TAGGT 0.00074 TAGTA 0.00175 TAGTC 0.000679 TAGTG 0.000884 TAGTT 0.00188 TATAA 0.00576 TATAC 0.00201 TATAG 0.00193 TATAT 0.00501 TATCA 0.00254 TATCC 0.000616 TATCG 0.000785 TATCT 0.00176 TATGA 0.00218 TATGC 0.00104 TATGG 0.000699 TATGT 0.00238 TATTA 0.0053 TATTC 0.00181 TATTG 0.00244 TATTT 0.00678 TCAAA 0.00289 TCAAC 0.00115 TCAAG 0.000852 TCAAT 0.00265 TCACA 0.000945 TCACC 0.000393 TCACG 0.000292 TCACT 0.000998 TCAGA 0.000576 TCAGC 0.000463 TCAGG 0.000283 TCAGT 0.000871 TCATA 0.00218 TCATC 0.00117 TCATG 0.00105 TCATT 0.00333 TCCAA 0.000826 TCCAC 0.000296 TCCAG 0.000222 TCCAT 0.00072 TCCCA 0.000469 TCCCC 0.000257 TCCCG 0.000108 TCCCT 0.000442 TCCGA 0.000225 TCCGC 0.000154 TCCGG 7.56e-05 TCCGT 0.000249 TCCTA 0.000612 TCCTC 0.000288 TCCTG 0.000228 TCCTT 0.000676 TCGAA 0.00082 TCGAC 0.000326 TCGAG 0.000259 TCGAT 0.000684 TCGCA 0.000385 TCGCC 0.000196 TCGCG 0.000116 TCGCT 0.000444 TCGGA 0.000225 TCGGC 0.000137 TCGGG 0.000114 TCGGT 0.000263 TCGTA 0.00066 TCGTC 0.000356 TCGTG 0.000308 TCGTT 0.000913 TCTAA 0.00175 TCTAC 0.000656 TCTAG 0.000493 TCTAT 0.00191 TCTCA 0.000766 TCTCC 0.00028 TCTCG 0.000267 TCTCT 0.000752 TCTGA 0.000576 TCTGC 0.000325 TCTGG 0.000228 TCTGT 0.000811 TCTTA 0.00154 TCTTC 0.000825 TCTTG 0.000707 TCTTT 0.00252 TGAAA 0.00316 TGAAC 0.000864 TGAAG 0.00102 TGAAT 0.00246 TGACA 0.00111 TGACC 0.000328 TGACG 0.000407 TGACT 0.001 TGAGA 0.000766 TGAGC 0.000402 TGAGG 0.000392 TGAGT 0.000801 TGATA 0.00254 TGATC 0.000386 TGATG 0.00144 TGATT 0.00293 TGCAA 0.00124 TGCAC 0.000498 TGCAG 0.000425 TGCAT 0.00123 TGCCA 0.000561 TGCCC 0.00018 TGCCG 0.000178 TGCCT 0.000442 TGCGA 0.000385 TGCGC 0.000261 TGCGG 0.000135 TGCGT 0.000398 TGCTA 0.00104 TGCTC 0.000398 TGCTG 0.000539 TGCTT 0.00136 TGGAA 0.000791 TGGAC 0.000264 TGGAG 0.000292 TGGAT 0.000722 TGGCA 0.000561 TGGCC 0.000112 TGGCG 0.000284 TGGCT 0.000469 TGGGA 0.000469 TGGGC 0.000167 TGGGG 0.000388 TGGGT 0.000279 TGGTA 0.000819 TGGTC 0.000263 TGGTG 0.000422 TGGTT 0.000924 TGTAA 0.00239 TGTAC 0.000681 TGTAG 0.000787 TGTAT 0.00234 TGTCA 0.00111 TGTCC 0.000417 TGTCG 0.000382 TGTCT 0.000977 TGTGA 0.000945 TGTGC 0.000542 TGTGG 0.000487 TGTGT 0.00119 TGTTA 0.00252 TGTTC 0.000847 TGTTG 0.00144 TGTTT 0.00276 TTAAA 0.00718 TTAAC 0.00231 TTAAG 0.0019 TTAAT 0.00605 TTACA 0.00239 TTACC 0.000687 TTACG 0.000644 TTACT 0.00198 TTAGA 0.00175 TTAGC 0.000938 TTAGG 0.000756 TTAGT 0.00182 TTATA 0.00576 TTATC 0.00223 TTATG 0.00238 TTATT 0.0061 TTCAA 0.00306 TTCAC 0.000927 TTCAG 0.000834 TTCAT 0.00273 TTCCA 0.000791 TTCCC 0.000406 TTCCG 0.000256 TTCCT 0.000617 TTCGA 0.00082 TTCGC 0.000393 TTCGG 0.000218 TTCGT 0.000836 TTCTA 0.00191 TTCTC 0.000846 TTCTG 0.000742 TTCTT 0.0021 TTGAA 0.00306 TTGAC 0.000943 TTGAG 0.000879 TTGAT 0.00264 TTGCA 0.00124 TTGCC 0.000425 TTGCG 0.000463 TTGCT 0.00117 TTGGA 0.000826 TTGGC 0.000458 TTGGG 0.000555 TTGGT 0.000853 TTGTA 0.00241 TTGTC 0.00103 TTGTG 0.00115 TTGTT 0.00288 TTTAA 0.00718 TTTAC 0.00221 TTTAG 0.00215 TTTAT 0.00709 TTTCA 0.00316 TTTCC 0.000784 TTTCG 0.000894 TTTCT 0.00248 TTTGA 0.00289 TTTGC 0.00112 TTTGG 0.000832 TTTGT 0.00281 TTTTA 0.00784 TTTTC 0.00302 TTTTG 0.00304 TTTTT 0.0082