[1] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.358 C 0.142 G 0.142 T 0.358 # l= 1 # Values AA 0.153 AC 0.0457 AG 0.0478 AT 0.112 CA 0.0551 CC 0.0227 CG 0.0163 CT 0.0478 GA 0.0486 GC 0.0249 GG 0.0227 GT 0.0457 TA 0.102 TC 0.0486 TG 0.0551 TT 0.153 # l= 2 # Values AAA 0.0694 AAC 0.018 AAG 0.0188 AAT 0.0465 ACA 0.0182 ACC 0.00678 ACG 0.00507 ACT 0.0156 AGA 0.0167 AGC 0.0081 AGG 0.0073 AGT 0.0156 ATA 0.0344 ATC 0.0137 ATG 0.0174 ATT 0.0465 CAA 0.0205 CAC 0.00812 CAG 0.00908 CAT 0.0174 CCA 0.00828 CCC 0.00443 CCG 0.0027 CCT 0.0073 CGA 0.00566 CGC 0.0029 CGG 0.00271 CGT 0.00507 CTA 0.0126 CTC 0.00733 CTG 0.00907 CTT 0.0188 GAA 0.0216 GAC 0.00603 GAG 0.00733 GAT 0.0137 GCA 0.0102 GCC 0.00377 GCG 0.0029 GCT 0.0081 GGA 0.00773 GGC 0.00377 GGG 0.00443 GGT 0.00678 GTA 0.0135 GTC 0.00603 GTG 0.00812 GTT 0.018 TAA 0.0412 TAC 0.0135 TAG 0.0126 TAT 0.0344 TCA 0.0185 TCC 0.00773 TCG 0.00567 TCT 0.0167 TGA 0.0185 TGC 0.0102 TGG 0.00828 TGT 0.0182 TTA 0.0412 TTC 0.0216 TTG 0.0206 TTT 0.0694 # l= 3 # Values AAAA 0.0317 AAAC 0.00791 AAAG 0.00806 AAAT 0.0218 AACA 0.0073 AACC 0.00246 AACG 0.00185 AACT 0.00642 AAGA 0.00664 AAGC 0.00307 AAGG 0.00281 AAGT 0.00625 AATA 0.0153 AATC 0.00529 AATG 0.00726 AATT 0.0186 ACAA 0.00695 ACAC 0.00256 ACAG 0.00293 ACAT 0.00575 ACCA 0.00261 ACCC 0.00122 ACCG 0.000832 ACCT 0.00211 ACGA 0.00178 ACGC 0.000877 ACGG 0.000821 ACGT 0.00159 ACTA 0.00432 ACTC 0.00209 ACTG 0.00299 ACTT 0.00624 AGAA 0.00767 AGAC 0.00192 AGAG 0.00264 AGAT 0.00448 AGCA 0.0034 AGCC 0.00116 AGCG 0.000895 AGCT 0.00265 AGGA 0.00258 AGGC 0.00113 AGGG 0.00147 AGGT 0.00211 AGTA 0.00462 AGTC 0.00188 AGTG 0.00272 AGTT 0.00642 ATAA 0.014 ATAC 0.00419 ATAG 0.00408 ATAT 0.0121 ATCA 0.0055 ATCC 0.00206 ATCG 0.00166 ATCT 0.00448 ATGA 0.00586 ATGC 0.00316 ATGG 0.0026 ATGT 0.00575 ATTA 0.0126 ATTC 0.00589 ATTG 0.00616 ATTT 0.0218 CAAA 0.00895 CAAC 0.00272 CAAG 0.00273 CAAT 0.00616 CACA 0.00312 CACC 0.00136 CACG 0.000922 CACT 0.00272 CAGA 0.00312 CAGC 0.00161 CAGG 0.00136 CAGT 0.00299 CATA 0.00493 CATC 0.0024 CATG 0.00279 CATT 0.00726 CCAA 0.00291 CCAC 0.00139 CCAG 0.00137 CCAT 0.0026 CCCA 0.00141 CCCC 0.00107 CCCG 0.000485 CCCT 0.00147 CCGA 0.000878 CCGC 0.000491 CCGG 0.000516 CCGT 0.000821 CCTA 0.00179 CCTC 0.00134 CCTG 0.00136 CCTT 0.00281 CGAA 0.00239 CGAC 0.00077 CGAG 0.000846 CGAT 0.00166 CGCA 0.0011 CGCC 0.000521 CGCG 0.000381 CGCT 0.000895 CGGA 0.000925 CGGC 0.000463 CGGG 0.000485 CGGT 0.000832 CGTA 0.0015 CGTC 0.0008 CGTG 0.000922 CGTT 0.00185 CTAA 0.00486 CTAC 0.00198 CTAG 0.00167 CTAT 0.00408 CTCA 0.00254 CTCC 0.00131 CTCG 0.000846 CTCT 0.00264 CTGA 0.00301 CTGC 0.00176 CTGG 0.00137 CTGT 0.00293 CTTA 0.00496 CTTC 0.00302 CTTG 0.00273 CTTT 0.00806 GAAA 0.0101 GAAC 0.00256 GAAG 0.00302 GAAT 0.00589 GACA 0.00238 GACC 0.000966 GACG 0.0008 GACT 0.00188 GAGA 0.00266 GAGC 0.00124 GAGG 0.00134 GAGT 0.00209 GATA 0.00417 GATC 0.00184 GATG 0.0024 GATT 0.00529 GCAA 0.00376 GCAC 0.00147 GCAG 0.00176 GCAT 0.00316 GCCA 0.00152 GCCC 0.000655 GCCG 0.000463 GCCT 0.00113 GCGA 0.00103 GCGC 0.000505 GCGG 0.00049 GCGT 0.000877 GCTA 0.00218 GCTC 0.00124 GCTG 0.00161 GCTT 0.00307 GGAA 0.00342 GGAC 0.000942 GGAG 0.00131 GGAT 0.00206 GGCA 0.00151 GGCC 0.000578 GGCG 0.000521 GGCT 0.00116 GGGA 0.00149 GGGC 0.000654 GGGG 0.00107 GGGT 0.00122 GGTA 0.00199 GGTC 0.000966 GGTG 0.00136 GGTT 0.00246 GTAA 0.00547 GTAC 0.00185 GTAG 0.00198 GTAT 0.00419 GTCA 0.00239 GTCC 0.000942 GTCG 0.000771 GTCT 0.00192 GTGA 0.0027 GTGC 0.00147 GTGG 0.00139 GTGT 0.00256 GTTA 0.00486 GTTC 0.00256 GTTG 0.00272 GTTT 0.00791 TAAA 0.0187 TAAC 0.00486 TAAG 0.00496 TAAT 0.0126 TACA 0.00539 TACC 0.00199 TACG 0.0015 TACT 0.00462 TAGA 0.0043 TAGC 0.00218 TAGG 0.00179 TAGT 0.00432 TATA 0.00999 TATC 0.00417 TATG 0.00493 TATT 0.0153 TCAA 0.00692 TCAC 0.0027 TCAG 0.00301 TCAT 0.00586 TCCA 0.00274 TCCC 0.00149 TCCG 0.000925 TCCT 0.00258 TCGA 0.00198 TCGC 0.00103 TCGG 0.000878 TCGT 0.00178 TCTA 0.0043 TCTC 0.00266 TCTG 0.00312 TCTT 0.00664 TGAA 0.00807 TGAC 0.00239 TGAG 0.00254 TGAT 0.0055 TGCA 0.00414 TGCC 0.00151 TGCG 0.0011 TGCT 0.0034 TGGA 0.00274 TGGC 0.00152 TGGG 0.00141 TGGT 0.00261 TGTA 0.00539 TGTC 0.00238 TGTG 0.00312 TGTT 0.0073 TTAA 0.0168 TTAC 0.00547 TTAG 0.00486 TTAT 0.014 TTCA 0.00807 TTCC 0.00342 TTCG 0.00239 TTCT 0.00767 TTGA 0.00692 TTGC 0.00376 TTGG 0.00291 TTGT 0.00695 TTTA 0.0187 TTTC 0.0101 TTTG 0.00895 TTTT 0.0317 # l= 4 # Values AAAAA 0.0146 AAAAC 0.00348 AAAAG 0.00363 AAAAT 0.00999 AAACA 0.00328 AAACC 0.00103 AAACG 0.000784 AAACT 0.00281 AAAGA 0.00285 AAAGC 0.00129 AAAGG 0.00118 AAAGT 0.00274 AAATA 0.00758 AAATC 0.00244 AAATG 0.00336 AAATT 0.0084 AACAA 0.00288 AACAC 0.000996 AACAG 0.00114 AACAT 0.00228 AACCA 0.000968 AACCC 0.000434 AACCG 0.000296 AACCT 0.000765 AACGA 0.000672 AACGC 0.000315 AACGG 0.000282 AACGT 0.000581 AACTA 0.00187 AACTC 0.000859 AACTG 0.0012 AACTT 0.00249 AAGAA 0.00318 AAGAC 0.000753 AAGAG 0.000998 AAGAT 0.00171 AAGCA 0.00136 AAGCC 0.000382 AAGCG 0.000342 AAGCT 0.000986 AAGGA 0.00102 AAGGC 0.000436 AAGGG 0.000552 AAGGT 0.000807 AAGTA 0.00196 AAGTC 0.000723 AAGTG 0.00106 AAGTT 0.00249 AATAA 0.00654 AATAC 0.00175 AATAG 0.00169 AATAT 0.00534 AATCA 0.00215 AATCC 0.000769 AATCG 0.000634 AATCT 0.00174 AATGA 0.0025 AATGC 0.00129 AATGG 0.00102 AATGT 0.00244 AATTA 0.00543 AATTC 0.00236 AATTG 0.00241 AATTT 0.0084 ACAAA 0.0031 ACAAC 0.000849 ACAAG 0.000884 ACAAT 0.00212 ACACA 0.00105 ACACC 0.000379 ACACG 0.000282 ACACT 0.000852 ACAGA 0.000999 ACAGC 0.000519 ACAGG 0.000407 ACAGT 0.00101 ACATA 0.0017 ACATC 0.000718 ACATG 0.000895 ACATT 0.00244 ACCAA 0.000916 ACCAC 0.000465 ACCAG 0.000417 ACCAT 0.000817 ACCCA 0.000414 ACCCC 0.000258 ACCCG 0.000138 ACCCT 0.000407 ACCGA 0.000277 ACCGC 0.000133 ACCGG 0.000152 ACCGT 0.00027 ACCTA 0.000549 ACCTC 0.000363 ACCTG 0.000394 ACCTT 0.000807 ACGAA 0.000761 ACGAC 0.000238 ACGAG 0.00026 ACGAT 0.00052 ACGCA 0.000354 ACGCC 0.000138 ACGCG 0.000113 ACGCT 0.000273 ACGGA 0.00029 ACGGC 0.00013 ACGGG 0.000131 ACGGT 0.00027 ACGTA 0.000481 ACGTC 0.000248 ACGTG 0.000282 ACGTT 0.000581 ACTAA 0.00167 ACTAC 0.000675 ACTAG 0.000559 ACTAT 0.00142 ACTCA 0.000759 ACTCC 0.000347 ACTCG 0.000249 ACTCT 0.000735 ACTGA 0.00103 ACTGC 0.000544 ACTGG 0.000417 ACTGT 0.00101 ACTTA 0.00171 ACTTC 0.000926 ACTTG 0.000877 ACTTT 0.00274 AGAAA 0.00371 AGAAC 0.000873 AGAAG 0.00102 AGAAT 0.00207 AGACA 0.000819 AGACC 0.000265 AGACG 0.000244 AGACT 0.000592 AGAGA 0.000968 AGAGC 0.000457 AGAGG 0.00048 AGAGT 0.000735 AGATA 0.00144 AGATC 0.00056 AGATG 0.000752 AGATT 0.00174 AGCAA 0.00129 AGCAC 0.000487 AGCAG 0.00058 AGCAT 0.00104 AGCCA 0.000449 AGCCC 0.000198 AGCCG 0.000144 AGCCT 0.000365 AGCGA 0.000322 AGCGC 0.000149 AGCGG 0.000151 AGCGT 0.000273 AGCTA 0.000741 AGCTC 0.000405 AGCTG 0.000522 AGCTT 0.000986 AGGAA 0.0012 AGGAC 0.000317 AGGAG 0.000419 AGGAT 0.000649 AGGCA 0.00047 AGGCC 0.000164 AGGCG 0.000132 AGGCT 0.000365 AGGGA 0.000497 AGGGC 0.000215 AGGGG 0.00035 AGGGT 0.000407 AGGTA 0.000664 AGGTC 0.000279 AGGTG 0.000406 AGGTT 0.000765 AGTAA 0.00189 AGTAC 0.000641 AGTAG 0.000672 AGTAT 0.00141 AGTCA 0.000771 AGTCC 0.000287 AGTCG 0.000229 AGTCT 0.000592 AGTGA 0.000902 AGTGC 0.000495 AGTGG 0.000475 AGTGT 0.000852 AGTTA 0.00178 AGTTC 0.000906 AGTTG 0.000927 AGTTT 0.00281 ATAAA 0.00636 ATAAC 0.00162 ATAAG 0.00158 ATAAT 0.00444 ATACA 0.00174 ATACC 0.000594 ATACG 0.000442 ATACT 0.00141 ATAGA 0.00138 ATAGC 0.00073 ATAGG 0.00055 ATAGT 0.00142 ATATA 0.00373 ATATC 0.00143 ATATG 0.00164 ATATT 0.00534 ATCAA 0.00205 ATCAC 0.000839 ATCAG 0.000894 ATCAT 0.00171 ATCCA 0.000762 ATCCC 0.000385 ATCCG 0.000261 ATCCT 0.000649 ATCGA 0.000587 ATCGC 0.000306 ATCGG 0.000249 ATCGT 0.00052 ATCTA 0.00122 ATCTC 0.000705 ATCTG 0.000855 ATCTT 0.00171 ATGAA 0.00261 ATGAC 0.000744 ATGAG 0.000795 ATGAT 0.00171 ATGCA 0.00135 ATGCC 0.000436 ATGCG 0.000337 ATGCT 0.00104 ATGGA 0.000885 ATGGC 0.000478 ATGGG 0.000419 ATGGT 0.000817 ATGTA 0.00178 ATGTC 0.00075 ATGTG 0.000935 ATGTT 0.00228 ATTAA 0.00504 ATTAC 0.00168 ATTAG 0.00149 ATTAT 0.00444 ATTCA 0.00227 ATTCC 0.000894 ATTCG 0.000659 ATTCT 0.00207 ATTGA 0.00204 ATTGC 0.00114 ATTGG 0.000863 ATTGT 0.00212 ATTTA 0.00594 ATTTC 0.00314 ATTTG 0.00271 ATTTT 0.00999 CAAAA 0.00403 CAAAC 0.00112 CAAAG 0.00108 CAAAT 0.00271 CAACA 0.0011 CAACC 0.000397 CAACG 0.000287 CAACT 0.000927 CAAGA 0.000944 CAAGC 0.000469 CAAGG 0.000437 CAAGT 0.000877 CAATA 0.00195 CAATC 0.000777 CAATG 0.00102 CAATT 0.00241 CACAA 0.00117 CACAC 0.000502 CACAG 0.000511 CACAT 0.000935 CACCA 0.000504 CACCC 0.000293 CACCG 0.000154 CACCT 0.000406 CACGA 0.00031 CACGC 0.000177 CACGG 0.000153 CACGT 0.000282 CACTA 0.000704 CACTC 0.000374 CACTG 0.000581 CACTT 0.00106 CAGAA 0.00138 CAGAC 0.00039 CAGAG 0.000496 CAGAT 0.000855 CAGCA 0.000654 CAGCC 0.00025 CAGCG 0.000181 CAGCT 0.000522 CAGGA 0.000448 CAGGC 0.000219 CAGGG 0.000297 CAGGT 0.000394 CAGTA 0.000827 CAGTC 0.000387 CAGTG 0.000581 CAGTT 0.0012 CATAA 0.00197 CATAC 0.000672 CATAG 0.000644 CATAT 0.00164 CATCA 0.000968 CATCC 0.000388 CATCG 0.000293 CATCT 0.000752 CATGA 0.000914 CATGC 0.000542 CATGG 0.000438 CATGT 0.000895 CATTA 0.00189 CATTC 0.000984 CATTG 0.00102 CATTT 0.00336 CCAAA 0.0012 CCAAC 0.000428 CCAAG 0.000418 CCAAT 0.000863 CCACA 0.000486 CCACC 0.000265 CCACG 0.000164 CCACT 0.000475 CCAGA 0.000481 CCAGC 0.000237 CCAGG 0.000237 CCAGT 0.000417 CCATA 0.000704 CCATC 0.000437 CCATG 0.000438 CCATT 0.00102 CCCAA 0.000477 CCCAC 0.000247 CCCAG 0.000263 CCCAT 0.000419 CCCCA 0.000283 CCCCC 0.000338 CCCCG 9.8e-05 CCCCT 0.00035 CCCGA 0.000145 CCCGC 0.00011 CCCGG 9.89e-05 CCCGT 0.000131 CCCTA 0.000336 CCCTC 0.000284 CCCTG 0.000297 CCCTT 0.000552 CCGAA 0.000371 CCGAC 0.000128 CCGAG 0.00013 CCGAT 0.000249 CCGCA 0.000187 CCGCC 8.9e-05 CCGCG 6.3e-05 CCGCT 0.000151 CCGGA 0.000179 CCGGC 8.7e-05 CCGGG 9.89e-05 CCGGT 0.000152 CCGTA 0.000243 CCGTC 0.000144 CCGTG 0.000153 CCGTT 0.000282 CCTAA 0.000686 CCTAC 0.000296 CCTAG 0.000257 CCTAT 0.00055 CCTCA 0.000436 CCTCC 0.000276 CCTCG 0.000146 CCTCT 0.00048 CCTGA 0.000447 CCTGC 0.000266 CCTGG 0.000237 CCTGT 0.000407 CCTTA 0.000712 CCTTC 0.000482 CCTTG 0.000437 CCTTT 0.00118 CGAAA 0.00106 CGAAC 0.000302 CGAAG 0.000366 CGAAT 0.000659 CGACA 0.000269 CGACC 0.000141 CGACG 0.000131 CGACT 0.000229 CGAGA 0.000298 CGAGC 0.000152 CGAGG 0.000146 CGAGT 0.000249 CGATA 0.000493 CGATC 0.000243 CGATG 0.000293 CGATT 0.000634 CGCAA 0.000394 CGCAC 0.000177 CGCAG 0.000196 CGCAT 0.000337 CGCCA 0.000237 CGCCC 8.69e-05 CGCCG 6.51e-05 CGCCT 0.000132 CGCGA 0.000139 CGCGC 6.64e-05 CGCGG 6.3e-05 CGCGT 0.000113 CGCTA 0.000234 CGCTC 0.000139 CGCTG 0.000181 CGCTT 0.000342 CGGAA 0.000397 CGGAC 0.000118 CGGAG 0.000149 CGGAT 0.000261 CGGCA 0.000168 CGGCC 8.64e-05 CGGCG 6.51e-05 CGGCT 0.000144 CGGGA 0.000161 CGGGC 8.81e-05 CGGGG 9.8e-05 CGGGT 0.000138 CGGTA 0.000252 CGGTC 0.000129 CGGTG 0.000154 CGGTT 0.000296 CGTAA 0.000637 CGTAC 0.000189 CGTAG 0.000231 CGTAT 0.000442 CGTCA 0.000308 CGTCC 0.000117 CGTCG 0.000131 CGTCT 0.000244 CGTGA 0.000312 CGTGC 0.000164 CGTGG 0.000164 CGTGT 0.000282 CGTTA 0.000514 CGTTC 0.000265 CGTTG 0.000287 CGTTT 0.000784 CTAAA 0.00211 CTAAC 0.000637 CTAAG 0.000621 CTAAT 0.00149 CTACA 0.000746 CTACC 0.000335 CTACG 0.000231 CTACT 0.000672 CTAGA 0.000575 CTAGC 0.000275 CTAGG 0.000257 CTAGT 0.000559 CTATA 0.00118 CTATC 0.000561 CTATG 0.000644 CTATT 0.00169 CTCAA 0.000938 CTCAC 0.000384 CTCAG 0.000421 CTCAT 0.000795 CTCCA 0.000456 CTCCC 0.000286 CTCCG 0.000149 CTCCT 0.000419 CTCGA 0.000291 CTCGC 0.000165 CTCGG 0.00013 CTCGT 0.00026 CTCTA 0.000664 CTCTC 0.000484 CTCTG 0.000496 CTCTT 0.000998 CTGAA 0.0013 CTGAC 0.000398 CTGAG 0.000421 CTGAT 0.000894 CTGCA 0.000692 CTGCC 0.000293 CTGCG 0.000196 CTGCT 0.00058 CTGGA 0.000466 CTGGC 0.000227 CTGGG 0.000263 CTGGT 0.000417 CTGTA 0.000866 CTGTC 0.000415 CTGTG 0.000511 CTGTT 0.00114 CTTAA 0.00207 CTTAC 0.000683 CTTAG 0.000621 CTTAT 0.00158 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.00052 CTTCG 0.000366 CTTCT 0.00102 CTTGA 0.00091 CTTGC 0.000516 CTTGG 0.000418 CTTGT 0.000884 CTTTA 0.00207 CTTTC 0.00128 CTTTG 0.00108 CTTTT 0.00363 GAAAA 0.00444 GAAAC 0.00123 GAAAG 0.00128 GAAAT 0.00314 GAACA 0.001 GAACC 0.000389 GAACG 0.000265 GAACT 0.000906 GAAGA 0.00113 GAAGC 0.000486 GAAGG 0.000482 GAAGT 0.000926 GAATA 0.00181 GAATC 0.000738 GAATG 0.000984 GAATT 0.00236 GACAA 0.000879 GACAC 0.000338 GACAG 0.000415 GACAT 0.00075 GACCA 0.000373 GACCC 0.000185 GACCG 0.000129 GACCT 0.000279 GACGA 0.000276 GACGC 0.000132 GACGG 0.000144 GACGT 0.000248 GACTA 0.000499 GACTC 0.000271 GACTG 0.000387 GACTT 0.000723 GAGAA 0.00118 GAGAC 0.000292 GAGAG 0.000484 GAGAT 0.000705 GAGCA 0.000502 GAGCC 0.000197 GAGCG 0.000139 GAGCT 0.000405 GAGGA 0.000502 GAGGC 0.000189 GAGGG 0.000284 GAGGT 0.000363 GAGTA 0.000585 GAGTC 0.000271 GAGTG 0.000374 GAGTT 0.000859 GATAA 0.00162 GATAC 0.000553 GATAG 0.000561 GATAT 0.00143 GATCA 0.00074 GATCC 0.0003 GATCG 0.000243 GATCT 0.00056 GATGA 0.000815 GATGC 0.00043 GATGG 0.000437 GATGT 0.000718 GATTA 0.00134 GATTC 0.000738 GATTG 0.000777 GATTT 0.00244 GCAAA 0.00156 GCAAC 0.000545 GCAAG 0.000516 GCAAT 0.00114 GCACA 0.00055 GCACC 0.000262 GCACG 0.000164 GCACT 0.000495 GCAGA 0.00061 GCAGC 0.000341 GCAGG 0.000266 GCAGT 0.000544 GCATA 0.000894 GCATC 0.00043 GCATG 0.000542 GCATT 0.00129 GCCAA 0.000546 GCCAC 0.000266 GCCAG 0.000227 GCCAT 0.000478 GCCCA 0.000218 GCCCC 0.000133 GCCCG 8.81e-05 GCCCT 0.000215 GCCGA 0.000159 GCCGC 8.7e-05 GCCGG 8.7e-05 GCCGT 0.00013 GCCTA 0.000288 GCCTC 0.000189 GCCTG 0.000219 GCCTT 0.000436 GCGAA 0.000403 GCGAC 0.000155 GCGAG 0.000165 GCGAT 0.000306 GCGCA 0.000196 GCGCC 9.44e-05 GCGCG 6.64e-05 GCGCT 0.000149 GCGGA 0.00016 GCGGC 8.7e-05 GCGGG 0.00011 GCGGT 0.000133 GCGTA 0.000253 GCGTC 0.000132 GCGTG 0.000177 GCGTT 0.000315 GCTAA 0.0008 GCTAC 0.000375 GCTAG 0.000275 GCTAT 0.00073 GCTCA 0.00043 GCTCC 0.000205 GCTCG 0.000152 GCTCT 0.000457 GCTGA 0.000511 GCTGC 0.000341 GCTGG 0.000237 GCTGT 0.000519 GCTTA 0.000823 GCTTC 0.000486 GCTTG 0.000469 GCTTT 0.00129 GGAAA 0.00158 GGAAC 0.000426 GGAAG 0.00052 GGAAT 0.000894 GGACA 0.000366 GGACC 0.000173 GGACG 0.000117 GGACT 0.000287 GGAGA 0.000483 GGAGC 0.000205 GGAGG 0.000276 GGAGT 0.000347 GGATA 0.0006 GGATC 0.0003 GGATG 0.000388 GGATT 0.000769 GGCAA 0.000552 GGCAC 0.000231 GGCAG 0.000293 GGCAT 0.000436 GGCCA 0.000208 GGCCC 0.000119 GGCCG 8.64e-05 GGCCT 0.000164 GGCGA 0.0002 GGCGC 9.44e-05 GGCGG 8.9e-05 GGCGT 0.000138 GGCTA 0.000327 GGCTC 0.000197 GGCTG 0.00025 GGCTT 0.000382 GGGAA 0.000626 GGGAC 0.000191 GGGAG 0.000286 GGGAT 0.000385 GGGCA 0.000251 GGGCC 0.000119 GGGCG 8.69e-05 GGGCT 0.000198 GGGGA 0.000339 GGGGC 0.000133 GGGGG 0.000338 GGGGT 0.000258 GGGTA 0.000305 GGGTC 0.000185 GGGTG 0.000293 GGGTT 0.000434 GGTAA 0.00076 GGTAC 0.000301 GGTAG 0.000335 GGTAT 0.000594 GGTCA 0.000387 GGTCC 0.000173 GGTCG 0.000141 GGTCT 0.000265 GGTGA 0.000451 GGTGC 0.000262 GGTGG 0.000265 GGTGT 0.000379 GGTTA 0.000648 GGTTC 0.000389 GGTTG 0.000397 GGTTT 0.00103 GTAAA 0.00239 GTAAC 0.000718 GTAAG 0.000683 GTAAT 0.00168 GTACA 0.000722 GTACC 0.000301 GTACG 0.000189 GTACT 0.000641 GTAGA 0.000638 GTAGC 0.000375 GTAGG 0.000296 GTAGT 0.000675 GTATA 0.00121 GTATC 0.000553 GTATG 0.000672 GTATT 0.00175 GTCAA 0.000852 GTCAC 0.0004 GTCAG 0.000398 GTCAT 0.000744 GTCCA 0.000316 GTCCC 0.000191 GTCCG 0.000118 GTCCT 0.000317 GTCGA 0.000249 GTCGC 0.000155 GTCGG 0.000128 GTCGT 0.000238 GTCTA 0.000486 GTCTC 0.000292 GTCTG 0.00039 GTCTT 0.000753 GTGAA 0.00108 GTGAC 0.0004 GTGAG 0.000384 GTGAT 0.000839 GTGCA 0.000577 GTGCC 0.000231 GTGCG 0.000177 GTGCT 0.000487 GTGGA 0.000413 GTGGC 0.000266 GTGGG 0.000247 GTGGT 0.000465 GTGTA 0.000724 GTGTC 0.000338 GTGTG 0.000502 GTGTT 0.000996 GTTAA 0.00188 GTTAC 0.000718 GTTAG 0.000637 GTTAT 0.00162 GTTCA 0.00096 GTTCC 0.000426 GTTCG 0.000302 GTTCT 0.000873 GTTGA 0.000895 GTTGC 0.000545 GTTGG 0.000428 GTTGT 0.000849 GTTTA 0.00207 GTTTC 0.00123 GTTTG 0.00112 GTTTT 0.00348 TAAAA 0.00863 TAAAC 0.00207 TAAAG 0.00207 TAAAT 0.00594 TAACA 0.00192 TAACC 0.000648 TAACG 0.000514 TAACT 0.00178 TAAGA 0.00172 TAAGC 0.000823 TAAGG 0.000712 TAAGT 0.00171 TAATA 0.00398 TAATC 0.00134 TAATG 0.00189 TAATT 0.00543 TACAA 0.00202 TACAC 0.000724 TACAG 0.000866 TACAT 0.00178 TACCA 0.000768 TACCC 0.000305 TACCG 0.000252 TACCT 0.000664 TACGA 0.000521 TACGC 0.000253 TACGG 0.000243 TACGT 0.000481 TACTA 0.00124 TACTC 0.000585 TACTG 0.000827 TACTT 0.00196 TAGAA 0.00193 TAGAC 0.000486 TAGAG 0.000664 TAGAT 0.00122 TAGCA 0.00088 TAGCC 0.000327 TAGCG 0.000234 TAGCT 0.000741 TAGGA 0.000615 TAGGC 0.000288 TAGGG 0.000336 TAGGT 0.000549 TAGTA 0.00124 TAGTC 0.000499 TAGTG 0.000704 TAGTT 0.00187 TATAA 0.00387 TATAC 0.00121 TATAG 0.00118 TATAT 0.00373 TATCA 0.00164 TATCC 0.0006 TATCG 0.000493 TATCT 0.00144 TATGA 0.00163 TATGC 0.000894 TATGG 0.000704 TATGT 0.0017 TATTA 0.00398 TATTC 0.00181 TATTG 0.00195 TATTT 0.00758 TCAAA 0.00308 TCAAC 0.000895 TCAAG 0.00091 TCAAT 0.00204 TCACA 0.00103 TCACC 0.000451 TCACG 0.000312 TCACT 0.000902 TCAGA 0.00103 TCAGC 0.000511 TCAGG 0.000447 TCAGT 0.00103 TCATA 0.00163 TCATC 0.000815 TCATG 0.000914 TCATT 0.0025 TCCAA 0.000974 TCCAC 0.000413 TCCAG 0.000466 TCCAT 0.000885 TCCCA 0.000491 TCCCC 0.000339 TCCCG 0.000161 TCCCT 0.000497 TCCGA 0.000296 TCCGC 0.00016 TCCGG 0.000179 TCCGT 0.00029 TCCTA 0.000615 TCCTC 0.000502 TCCTG 0.000448 TCCTT 0.00102 TCGAA 0.000851 TCGAC 0.000249 TCGAG 0.000291 TCGAT 0.000587 TCGCA 0.000368 TCGCC 0.0002 TCGCG 0.000139 TCGCT 0.000322 TCGGA 0.000296 TCGGC 0.000159 TCGGG 0.000145 TCGGT 0.000277 TCGTA 0.000521 TCGTC 0.000276 TCGTG 0.00031 TCGTT 0.000672 TCTAA 0.0017 TCTAC 0.000638 TCTAG 0.000575 TCTAT 0.00138 TCTCA 0.000913 TCTCC 0.000483 TCTCG 0.000298 TCTCT 0.000968 TCTGA 0.00103 TCTGC 0.00061 TCTGG 0.000481 TCTGT 0.000999 TCTTA 0.00172 TCTTC 0.00113 TCTTG 0.000944 TCTTT 0.00285 TGAAA 0.00373 TGAAC 0.00096 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00227 TGACA 0.000927 TGACC 0.000387 TGACG 0.000308 TGACT 0.000771 TGAGA 0.000913 TGAGC 0.00043 TGAGG 0.000436 TGAGT 0.000759 TGATA 0.00164 TGATC 0.00074 TGATG 0.000968 TGATT 0.00215 TGCAA 0.00152 TGCAC 0.000577 TGCAG 0.000692 TGCAT 0.00135 TGCCA 0.000623 TGCCC 0.000251 TGCCG 0.000168 TGCCT 0.00047 TGCGA 0.000368 TGCGC 0.000196 TGCGG 0.000187 TGCGT 0.000354 TGCTA 0.00088 TGCTC 0.000502 TGCTG 0.000654 TGCTT 0.00136 TGGAA 0.0012 TGGAC 0.000316 TGGAG 0.000456 TGGAT 0.000762 TGGCA 0.000623 TGGCC 0.000208 TGGCG 0.000237 TGGCT 0.000449 TGGGA 0.000491 TGGGC 0.000218 TGGGG 0.000283 TGGGT 0.000414 TGGTA 0.000768 TGGTC 0.000373 TGGTG 0.000504 TGGTT 0.000968 TGTAA 0.00218 TGTAC 0.000722 TGTAG 0.000746 TGTAT 0.00174 TGTCA 0.000927 TGTCC 0.000366 TGTCG 0.000269 TGTCT 0.000819 TGTGA 0.00103 TGTGC 0.00055 TGTGG 0.000486 TGTGT 0.00105 TGTTA 0.00192 TGTTC 0.001 TGTTG 0.0011 TGTTT 0.00328 TTAAA 0.00785 TTAAC 0.00188 TTAAG 0.00207 TTAAT 0.00504 TTACA 0.00218 TTACC 0.00076 TTACG 0.000637 TTACT 0.00189 TTAGA 0.0017 TTAGC 0.0008 TTAGG 0.000686 TTAGT 0.00167 TTATA 0.00387 TTATC 0.00162 TTATG 0.00197 TTATT 0.00654 TTCAA 0.00308 TTCAC 0.00108 TTCAG 0.0013 TTCAT 0.00261 TTCCA 0.0012 TTCCC 0.000626 TTCCG 0.000397 TTCCT 0.0012 TTCGA 0.000851 TTCGC 0.000403 TTCGG 0.000371 TTCGT 0.000761 TTCTA 0.00193 TTCTC 0.00118 TTCTG 0.00138 TTCTT 0.00318 TTGAA 0.00308 TTGAC 0.000852 TTGAG 0.000938 TTGAT 0.00205 TTGCA 0.00152 TTGCC 0.000552 TTGCG 0.000394 TTGCT 0.00129 TTGGA 0.000974 TTGGC 0.000546 TTGGG 0.000477 TTGGT 0.000916 TTGTA 0.00202 TTGTC 0.000879 TTGTG 0.00117 TTGTT 0.00288 TTTAA 0.00785 TTTAC 0.00239 TTTAG 0.00211 TTTAT 0.00636 TTTCA 0.00373 TTTCC 0.00158 TTTCG 0.00106 TTTCT 0.00371 TTTGA 0.00308 TTTGC 0.00156 TTTGG 0.0012 TTTGT 0.0031 TTTTA 0.00863 TTTTC 0.00444 TTTTG 0.00403 TTTTT 0.0146 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4599 AAAAC 0.11 AAAAG 0.1147 AAAAT 0.3154 AAACA 0.4149 AAACC 0.1302 AAACG 0.09921 AAACT 0.3557 AAAGA 0.3537 AAAGC 0.1603 AAAGG 0.1465 AAAGT 0.3396 AAATA 0.348 AAATC 0.1119 AAATG 0.1544 AAATT 0.3857 AACAA 0.395 AACAC 0.1365 AACAG 0.1559 AACAT 0.3127 AACCA 0.3929 AACCC 0.1763 AACCG 0.1203 AACCT 0.3105 AACGA 0.3634 AACGC 0.1702 AACGG 0.1522 AACGT 0.3142 AACTA 0.2914 AACTC 0.1337 AACTG 0.1865 AACTT 0.3884 AAGAA 0.4796 AAGAC 0.1134 AAGAG 0.1503 AAGAT 0.2568 AAGCA 0.4428 AAGCC 0.1244 AAGCG 0.1115 AAGCT 0.3213 AAGGA 0.3617 AAGGC 0.1552 AAGGG 0.1962 AAGGT 0.2869 AAGTA 0.3142 AAGTC 0.1158 AAGTG 0.1705 AAGTT 0.3995 AATAA 0.4266 AATAC 0.1145 AATAG 0.1105 AATAT 0.3484 AATCA 0.4067 AATCC 0.1454 AATCG 0.1198 AATCT 0.3282 AATGA 0.3451 AATGC 0.1782 AATGG 0.1407 AATGT 0.336 AATTA 0.2919 AATTC 0.1267 AATTG 0.1297 AATTT 0.4517 ACAAA 0.4462 ACAAC 0.1221 ACAAG 0.1271 ACAAT 0.3047 ACACA 0.4088 ACACC 0.1481 ACACG 0.1101 ACACT 0.333 ACAGA 0.3409 ACAGC 0.1769 ACAGG 0.1389 ACAGT 0.3432 ACATA 0.2956 ACATC 0.1249 ACATG 0.1556 ACATT 0.424 ACCAA 0.3503 ACCAC 0.1779 ACCAG 0.1594 ACCAT 0.3124 ACCCA 0.3402 ACCCC 0.2118 ACCCG 0.1132 ACCCT 0.3347 ACCGA 0.3331 ACCGC 0.16 ACCGG 0.1824 ACCGT 0.3245 ACCTA 0.26 ACCTC 0.1718 ACCTG 0.1866 ACCTT 0.3816 ACGAA 0.4276 ACGAC 0.1338 ACGAG 0.1461 ACGAT 0.2924 ACGCA 0.4037 ACGCC 0.1567 ACGCG 0.1282 ACGCT 0.3115 ACGGA 0.3532 ACGGC 0.1583 ACGGG 0.1595 ACGGT 0.3291 ACGTA 0.3021 ACGTC 0.1558 ACGTG 0.1771 ACGTT 0.365 ACTAA 0.386 ACTAC 0.1563 ACTAG 0.1294 ACTAT 0.3283 ACTCA 0.3632 ACTCC 0.166 ACTCG 0.1192 ACTCT 0.3516 ACTGA 0.3429 ACTGC 0.1818 ACTGG 0.1392 ACTGT 0.3361 ACTTA 0.273 ACTTC 0.1483 ACTTG 0.1404 ACTTT 0.4383 AGAAA 0.483 AGAAC 0.1138 AGAAG 0.133 AGAAT 0.2702 AGACA 0.4267 AGACC 0.1379 AGACG 0.1272 AGACT 0.3082 AGAGA 0.3668 AGAGC 0.1731 AGAGG 0.1818 AGAGT 0.2782 AGATA 0.3203 AGATC 0.1249 AGATG 0.1676 AGATT 0.3872 AGCAA 0.3796 AGCAC 0.1433 AGCAG 0.1708 AGCAT 0.3062 AGCCA 0.3889 AGCCC 0.1708 AGCCG 0.1241 AGCCT 0.3162 AGCGA 0.3601 AGCGC 0.1663 AGCGG 0.1684 AGCGT 0.3052 AGCTA 0.2791 AGCTC 0.1527 AGCTG 0.1966 AGCTT 0.3716 AGGAA 0.4637 AGGAC 0.1226 AGGAG 0.1624 AGGAT 0.2512 AGGCA 0.4153 AGGCC 0.1452 AGGCG 0.1164 AGGCT 0.323 AGGGA 0.3385 AGGGC 0.1464 AGGGG 0.2379 AGGGT 0.2773 AGGTA 0.3142 AGGTC 0.1319 AGGTG 0.192 AGGTT 0.3619 AGTAA 0.4097 AGTAC 0.1388 AGTAG 0.1456 AGTAT 0.3059 AGTCA 0.4103 AGTCC 0.1528 AGTCG 0.122 AGTCT 0.315 AGTGA 0.3311 AGTGC 0.1817 AGTGG 0.1743 AGTGT 0.3129 AGTTA 0.2771 AGTTC 0.1409 AGTTG 0.1442 AGTTT 0.4377 ATAAA 0.4541 ATAAC 0.116 ATAAG 0.1131 ATAAT 0.3168 ATACA 0.4161 ATACC 0.1416 ATACG 0.1054 ATACT 0.3369 ATAGA 0.338 ATAGC 0.179 ATAGG 0.135 ATAGT 0.3479 ATATA 0.3071 ATATC 0.1179 ATATG 0.1353 ATATT 0.4397 ATCAA 0.3729 ATCAC 0.1527 ATCAG 0.1626 ATCAT 0.3119 ATCCA 0.3705 ATCCC 0.1871 ATCCG 0.1271 ATCCT 0.3153 ATCGA 0.353 ATCGC 0.1841 ATCGG 0.1497 ATCGT 0.3132 ATCTA 0.2719 ATCTC 0.1571 ATCTG 0.1907 ATCTT 0.3803 ATGAA 0.4452 ATGAC 0.1268 ATGAG 0.1356 ATGAT 0.2924 ATGCA 0.4262 ATGCC 0.138 ATGCG 0.1067 ATGCT 0.3291 ATGGA 0.3406 ATGGC 0.1841 ATGGG 0.1611 ATGGT 0.3142 ATGTA 0.3098 ATGTC 0.1304 ATGTG 0.1627 ATGTT 0.3971 ATTAA 0.3985 ATTAC 0.1326 ATTAG 0.118 ATTAT 0.3509 ATTCA 0.3846 ATTCC 0.1517 ATTCG 0.1118 ATTCT 0.3519 ATTGA 0.3312 ATTGC 0.1846 ATTGG 0.1402 ATTGT 0.344 ATTTA 0.2729 ATTTC 0.144 ATTTG 0.1245 ATTTT 0.4586 CAAAA 0.4504 CAAAC 0.1253 CAAAG 0.1212 CAAAT 0.3031 CAACA 0.4068 CAACC 0.1462 CAACG 0.1057 CAACT 0.3412 CAAGA 0.3462 CAAGC 0.1719 CAAGG 0.1603 CAAGT 0.3216 CAATA 0.3163 CAATC 0.1262 CAATG 0.1659 CAATT 0.3916 CACAA 0.3748 CACAC 0.161 CACAG 0.1641 CACAT 0.3002 CACCA 0.3716 CACCC 0.2157 CACCG 0.1137 CACCT 0.299 CACGA 0.3365 CACGC 0.1918 CACGG 0.1656 CACGT 0.3062 CACTA 0.2586 CACTC 0.1373 CACTG 0.2133 CACTT 0.3908 CAGAA 0.4418 CAGAC 0.1251 CAGAG 0.1589 CAGAT 0.2742 CAGCA 0.4073 CAGCC 0.1554 CAGCG 0.1124 CAGCT 0.3249 CAGGA 0.3298 CAGGC 0.1609 CAGGG 0.2187 CAGGT 0.2905 CAGTA 0.2763 CAGTC 0.1292 CAGTG 0.1942 CAGTT 0.4003 CATAA 0.3999 CATAC 0.1363 CATAG 0.1307 CATAT 0.3332 CATCA 0.4033 CATCC 0.1617 CATCG 0.1218 CATCT 0.3132 CATGA 0.3276 CATGC 0.1945 CATGG 0.1571 CATGT 0.3208 CATTA 0.2601 CATTC 0.1356 CATTG 0.1408 CATTT 0.4635 CCAAA 0.4135 CCAAC 0.1467 CCAAG 0.1434 CCAAT 0.2964 CCACA 0.3499 CCACC 0.1907 CCACG 0.1178 CCACT 0.3416 CCAGA 0.3506 CCAGC 0.1727 CCAGG 0.1729 CCAGT 0.3038 CCATA 0.2708 CCATC 0.168 CCATG 0.1685 CCATT 0.3927 CCCAA 0.3394 CCCAC 0.1755 CCCAG 0.1871 CCCAT 0.298 CCCCA 0.2648 CCCCC 0.3162 CCCCG 0.09162 CCCCT 0.3274 CCCGA 0.2996 CCCGC 0.2267 CCCGG 0.2037 CCCGT 0.2699 CCCTA 0.2289 CCCTC 0.1934 CCCTG 0.2021 CCCTT 0.3756 CCGAA 0.4232 CCGAC 0.1455 CCGAG 0.1478 CCGAT 0.2835 CCGCA 0.3823 CCGCC 0.1815 CCGCG 0.1283 CCGCT 0.3079 CCGGA 0.346 CCGGC 0.1684 CCGGG 0.1914 CCGGT 0.2942 CCGTA 0.2963 CCGTC 0.1747 CCGTG 0.1858 CCGTT 0.3431 CCTAA 0.3836 CCTAC 0.1654 CCTAG 0.1434 CCTAT 0.3076 CCTCA 0.3255 CCTCC 0.2064 CCTCG 0.1092 CCTCT 0.3589 CCTGA 0.3293 CCTGC 0.1962 CCTGG 0.1747 CCTGT 0.2999 CCTTA 0.2531 CCTTC 0.1713 CCTTG 0.1555 CCTTT 0.42 CGAAA 0.4443 CGAAC 0.1264 CGAAG 0.1533 CGAAT 0.276 CGACA 0.3497 CGACC 0.1829 CGACG 0.1697 CGACT 0.2977 CGAGA 0.3523 CGAGC 0.1801 CGAGG 0.1729 CGAGT 0.2946 CGATA 0.2966 CGATC 0.1462 CGATG 0.1759 CGATT 0.3812 CGCAA 0.3566 CGCAC 0.1604 CGCAG 0.1777 CGCAT 0.3053 CGCCA 0.4554 CGCCC 0.1668 CGCCG 0.1248 CGCCT 0.2531 CGCGA 0.3655 CGCGC 0.1741 CGCGG 0.1651 CGCGT 0.2954 CGCTA 0.2611 CGCTC 0.1548 CGCTG 0.2017 CGCTT 0.3824 CGGAA 0.4289 CGGAC 0.1278 CGGAG 0.1607 CGGAT 0.2827 CGGCA 0.3627 CGGCC 0.1865 CGGCG 0.1405 CGGCT 0.3103 CGGGA 0.332 CGGGC 0.1816 CGGGG 0.2019 CGGGT 0.2845 CGGTA 0.3034 CGGTC 0.1546 CGGTG 0.1856 CGGTT 0.3564 CGTAA 0.4248 CGTAC 0.1262 CGTAG 0.1542 CGTAT 0.2948 CGTCA 0.3852 CGTCC 0.1459 CGTCG 0.1635 CGTCT 0.3055 CGTGA 0.3385 CGTGC 0.1779 CGTGG 0.1777 CGTGT 0.3059 CGTTA 0.2776 CGTTC 0.1433 CGTTG 0.1552 CGTTT 0.424 CTAAA 0.4343 CTAAC 0.1311 CTAAG 0.1278 CTAAT 0.3068 CTACA 0.376 CTACC 0.1688 CTACG 0.1164 CTACT 0.3388 CTAGA 0.3452 CTAGC 0.1652 CTAGG 0.1541 CTAGT 0.3356 CTATA 0.2887 CTATC 0.1376 CTATG 0.158 CTATT 0.4157 CTCAA 0.3696 CTCAC 0.1511 CTCAG 0.1658 CTCAT 0.3135 CTCCA 0.3483 CTCCC 0.2184 CTCCG 0.1133 CTCCT 0.3199 CTCGA 0.3442 CTCGC 0.1947 CTCGG 0.1535 CTCGT 0.3077 CTCTA 0.2513 CTCTC 0.1831 CTCTG 0.1876 CTCTT 0.378 CTGAA 0.4314 CTGAC 0.1322 CTGAG 0.1396 CTGAT 0.2967 CTGCA 0.3928 CTGCC 0.1662 CTGCG 0.1114 CTGCT 0.3295 CTGGA 0.3393 CTGGC 0.1654 CTGGG 0.1916 CTGGT 0.3038 CTGTA 0.2956 CTGTC 0.1415 CTGTG 0.1745 CTGTT 0.3884 CTTAA 0.4178 CTTAC 0.1377 CTTAG 0.1252 CTTAT 0.3193 CTTCA 0.3688 CTTCC 0.1722 CTTCG 0.1212 CTTCT 0.3379 CTTGA 0.3338 CTTGC 0.189 CTTGG 0.1532 CTTGT 0.324 CTTTA 0.2563 CTTTC 0.1584 CTTTG 0.1346 CTTTT 0.4507 GAAAA 0.4403 GAAAC 0.1221 GAAAG 0.1266 GAAAT 0.311 GAACA 0.3909 GAACC 0.152 GAACG 0.1035 GAACT 0.3536 GAAGA 0.3727 GAAGC 0.161 GAAGG 0.1595 GAAGT 0.3068 GAATA 0.308 GAATC 0.1253 GAATG 0.167 GAATT 0.3997 GACAA 0.3692 GACAC 0.1419 GACAG 0.1741 GACAT 0.3148 GACCA 0.3866 GACCC 0.1914 GACCG 0.1332 GACCT 0.2888 GACGA 0.3455 GACGC 0.1649 GACGG 0.1793 GACGT 0.3103 GACTA 0.2652 GACTC 0.1442 GACTG 0.2057 GACTT 0.3848 GAGAA 0.4443 GAGAC 0.1095 GAGAG 0.1816 GAGAT 0.2646 GAGCA 0.4042 GAGCC 0.1582 GAGCG 0.1114 GAGCT 0.3262 GAGGA 0.3751 GAGGC 0.141 GAGGG 0.2124 GAGGT 0.2715 GAGTA 0.2801 GAGTC 0.1297 GAGTG 0.179 GAGTT 0.4111 GATAA 0.3893 GATAC 0.1326 GATAG 0.1345 GATAT 0.3436 GATCA 0.4015 GATCC 0.1629 GATCG 0.1318 GATCT 0.3038 GATGA 0.3395 GATGC 0.1793 GATGG 0.1819 GATGT 0.2993 GATTA 0.2528 GATTC 0.1396 GATTG 0.1469 GATTT 0.4608 GCAAA 0.4158 GCAAC 0.1448 GCAAG 0.1371 GCAAT 0.3023 GCACA 0.3739 GCACC 0.1783 GCACG 0.1114 GCACT 0.3365 GCAGA 0.3463 GCAGC 0.1934 GCAGG 0.1512 GCAGT 0.3091 GCATA 0.2829 GCATC 0.1362 GCATG 0.1717 GCATT 0.4093 GCCAA 0.36 GCCAC 0.1753 GCCAG 0.1495 GCCAT 0.3152 GCCCA 0.3338 GCCCC 0.2027 GCCCG 0.1346 GCCCT 0.3289 GCCGA 0.3432 GCCGC 0.1879 GCCGG 0.1879 GCCGT 0.2809 GCCTA 0.2545 GCCTC 0.1667 GCCTG 0.1931 GCCTT 0.3857 GCGAA 0.3919 GCGAC 0.1508 GCGAG 0.1599 GCGAT 0.2974 GCGCA 0.3872 GCGCC 0.1867 GCGCG 0.1313 GCGCT 0.2948 GCGGA 0.3268 GCGGC 0.1772 GCGGG 0.2243 GCGGT 0.2717 GCGTA 0.2886 GCGTC 0.1504 GCGTG 0.2016 GCGTT 0.3594 GCTAA 0.3671 GCTAC 0.1721 GCTAG 0.1262 GCTAT 0.3346 GCTCA 0.3455 GCTCC 0.1644 GCTCG 0.1224 GCTCT 0.3676 GCTGA 0.3178 GCTGC 0.212 GCTGG 0.1475 GCTGT 0.3227 GCTTA 0.268 GCTTC 0.1583 GCTTG 0.1528 GCTTT 0.4209 GGAAA 0.4625 GGAAC 0.1245 GGAAG 0.1518 GGAAT 0.2611 GGACA 0.388 GGACC 0.1833 GGACG 0.1238 GGACT 0.3048 GGAGA 0.3687 GGAGC 0.156 GGAGG 0.2107 GGAGT 0.2646 GGATA 0.2915 GGATC 0.146 GGATG 0.1887 GGATT 0.3739 GGCAA 0.3652 GGCAC 0.1525 GGCAG 0.1937 GGCAT 0.2886 GGCCA 0.3601 GGCCC 0.2063 GGCCG 0.1492 GGCCT 0.2844 GGCGA 0.3842 GGCGC 0.1811 GGCGG 0.1707 GGCGT 0.264 GGCTA 0.283 GGCTC 0.1702 GGCTG 0.2162 GGCTT 0.3306 GGGAA 0.4206 GGGAC 0.1284 GGGAG 0.1924 GGGAT 0.2586 GGGCA 0.3831 GGGCC 0.1823 GGGCG 0.1327 GGGCT 0.3019 GGGGA 0.3178 GGGGC 0.1242 GGGGG 0.3164 GGGGT 0.2416 GGGTA 0.2506 GGGTC 0.1519 GGGTG 0.2406 GGGTT 0.3569 GGTAA 0.3818 GGTAC 0.1514 GGTAG 0.1684 GGTAT 0.2984 GGTCA 0.401 GGTCC 0.1788 GGTCG 0.1459 GGTCT 0.2742 GGTGA 0.332 GGTGC 0.1933 GGTGG 0.1954 GGTGT 0.2793 GGTTA 0.2629 GGTTC 0.158 GGTTG 0.1612 GGTTT 0.4179 GTAAA 0.4373 GTAAC 0.1313 GTAAG 0.1249 GTAAT 0.3065 GTACA 0.3897 GTACC 0.1625 GTACG 0.102 GTACT 0.3458 GTAGA 0.3216 GTAGC 0.1891 GTAGG 0.1491 GTAGT 0.3402 GTATA 0.2894 GTATC 0.1318 GTATG 0.1602 GTATT 0.4186 GTCAA 0.3559 GTCAC 0.167 GTCAG 0.1664 GTCAT 0.3108 GTCCA 0.3355 GTCCC 0.2029 GTCCG 0.1255 GTCCT 0.3362 GTCGA 0.3234 GTCGC 0.2014 GTCGG 0.1659 GTCGT 0.3093 GTCTA 0.2531 GTCTC 0.1518 GTCTG 0.203 GTCTT 0.3921 GTGAA 0.3987 GTGAC 0.1481 GTGAG 0.1421 GTGAT 0.3111 GTGCA 0.3923 GTGCC 0.1566 GTGCG 0.1204 GTGCT 0.3307 GTGGA 0.2969 GTGGC 0.1913 GTGGG 0.1774 GTGGT 0.3344 GTGTA 0.2827 GTGTC 0.132 GTGTG 0.196 GTGTT 0.3893 GTTAA 0.3866 GTTAC 0.1478 GTTAG 0.1311 GTTAT 0.3345 GTTCA 0.3749 GTTCC 0.1665 GTTCG 0.1178 GTTCT 0.3408 GTTGA 0.3297 GTTGC 0.2005 GTTGG 0.1574 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.2618 GTTTC 0.1557 GTTTG 0.1419 GTTTT 0.4406 TAAAA 0.4614 TAAAC 0.1106 TAAAG 0.1104 TAAAT 0.3176 TAACA 0.3944 TAACC 0.1333 TAACG 0.1057 TAACT 0.3666 TAAGA 0.3468 TAAGC 0.1659 TAAGG 0.1435 TAAGT 0.3439 TAATA 0.3152 TAATC 0.1058 TAATG 0.1494 TAATT 0.4296 TACAA 0.375 TACAC 0.1342 TACAG 0.1606 TACAT 0.3303 TACCA 0.3861 TACCC 0.1533 TACCG 0.1268 TACCT 0.3338 TACGA 0.3478 TACGC 0.1688 TACGG 0.1623 TACGT 0.3211 TACTA 0.2693 TACTC 0.1267 TACTG 0.1791 TACTT 0.4249 TAGAA 0.4486 TAGAC 0.1131 TAGAG 0.1545 TAGAT 0.2838 TAGCA 0.4035 TAGCC 0.1498 TAGCG 0.1071 TAGCT 0.3396 TAGGA 0.344 TAGGC 0.161 TAGGG 0.1879 TAGGT 0.3071 TAGTA 0.288 TAGTC 0.1154 TAGTG 0.1631 TAGTT 0.4335 TATAA 0.3876 TATAC 0.1214 TATAG 0.1178 TATAT 0.3733 TATCA 0.3932 TATCC 0.1439 TATCG 0.1183 TATCT 0.3446 TATGA 0.331 TATGC 0.1813 TATGG 0.1428 TATGT 0.3449 TATTA 0.26 TATTC 0.1184 TATTG 0.1271 TATTT 0.4945 TCAAA 0.4447 TCAAC 0.1293 TCAAG 0.1315 TCAAT 0.2945 TCACA 0.3832 TCACC 0.167 TCACG 0.1156 TCACT 0.3342 TCAGA 0.3412 TCAGC 0.1695 TCAGG 0.1484 TCAGT 0.3408 TCATA 0.2782 TCATC 0.1389 TCATG 0.1558 TCATT 0.4271 TCCAA 0.3558 TCCAC 0.1508 TCCAG 0.17 TCCAT 0.3234 TCCCA 0.3297 TCCCC 0.2279 TCCCG 0.1081 TCCCT 0.3343 TCCGA 0.3203 TCCGC 0.1732 TCCGG 0.1931 TCCGT 0.3134 TCCTA 0.2383 TCCTC 0.1943 TCCTG 0.1734 TCCTT 0.3939 TCGAA 0.4305 TCGAC 0.1259 TCGAG 0.147 TCGAT 0.2966 TCGCA 0.3572 TCGCC 0.1943 TCGCG 0.1352 TCGCT 0.3133 TCGGA 0.3377 TCGGC 0.1808 TCGGG 0.1656 TCGGT 0.3159 TCGTA 0.2928 TCGTC 0.1552 TCGTG 0.1742 TCGTT 0.3778 TCTAA 0.3969 TCTAC 0.1486 TCTAG 0.1338 TCTAT 0.3207 TCTCA 0.3429 TCTCC 0.1815 TCTCG 0.1118 TCTCT 0.3637 TCTGA 0.3297 TCTGC 0.1956 TCTGG 0.1543 TCTGT 0.3205 TCTTA 0.2589 TCTTC 0.1695 TCTTG 0.1422 TCTTT 0.4294 TGAAA 0.4624 TGAAC 0.1189 TGAAG 0.1379 TGAAT 0.2807 TGACA 0.3874 TGACC 0.1618 TGACG 0.1287 TGACT 0.3221 TGAGA 0.36 TGAGC 0.1693 TGAGG 0.1717 TGAGT 0.2991 TGATA 0.2981 TGATC 0.1346 TGATG 0.176 TGATT 0.3913 TGCAA 0.3683 TGCAC 0.1394 TGCAG 0.1671 TGCAT 0.3253 TGCCA 0.4125 TGCCC 0.1658 TGCCG 0.1109 TGCCT 0.3109 TGCGA 0.3329 TGCGC 0.177 TGCGG 0.1695 TGCGT 0.3206 TGCTA 0.2593 TGCTC 0.1479 TGCTG 0.1927 TGCTT 0.4002 TGGAA 0.4396 TGGAC 0.1154 TGGAG 0.1667 TGGAT 0.2783 TGGCA 0.4108 TGGCC 0.1371 TGGCG 0.1561 TGGCT 0.296 TGGGA 0.349 TGGGC 0.1553 TGGGG 0.2011 TGGGT 0.2946 TGGTA 0.2938 TGGTC 0.1428 TGGTG 0.193 TGGTT 0.3704 TGTAA 0.4044 TGTAC 0.1339 TGTAG 0.1383 TGTAT 0.3234 TGTCA 0.3894 TGTCC 0.1535 TGTCG 0.1131 TGTCT 0.3441 TGTGA 0.3318 TGTGC 0.1765 TGTGG 0.1561 TGTGT 0.3357 TGTTA 0.2623 TGTTC 0.1371 TGTTG 0.1513 TGTTT 0.4493 TTAAA 0.4664 TTAAC 0.1115 TTAAG 0.123 TTAAT 0.2991 TTACA 0.3989 TTACC 0.1389 TTACG 0.1164 TTACT 0.3459 TTAGA 0.3509 TTAGC 0.1647 TTAGG 0.1412 TTAGT 0.3431 TTATA 0.2765 TTATC 0.1159 TTATG 0.1408 TTATT 0.4669 TTCAA 0.3822 TTCAC 0.1333 TTCAG 0.161 TTCAT 0.3235 TTCCA 0.3516 TTCCC 0.1828 TTCCG 0.1158 TTCCT 0.3498 TTCGA 0.3567 TTCGC 0.1689 TTCGG 0.1556 TTCGT 0.3188 TTCTA 0.2512 TTCTC 0.1542 TTCTG 0.1795 TTCTT 0.4152 TTGAA 0.4455 TTGAC 0.123 TTGAG 0.1354 TTGAT 0.2961 TTGCA 0.4056 TTGCC 0.1468 TTGCG 0.1047 TTGCT 0.3429 TTGGA 0.3344 TTGGC 0.1876 TTGGG 0.1637 TTGGT 0.3143 TTGTA 0.2908 TTGTC 0.1264 TTGTG 0.168 TTGTT 0.4148 TTTAA 0.4197 TTTAC 0.1278 TTTAG 0.1127 TTTAT 0.3398 TTTCA 0.3702 TTTCC 0.157 TTTCG 0.1052 TTTCT 0.3675 TTTGA 0.3441 TTTGC 0.1747 TTTGG 0.1346 TTTGT 0.3466 TTTTA 0.2727 TTTTC 0.1402 TTTTG 0.1273 TTTTT 0.4599