[1] # (a,c,g,t)= (0.289, 0.211, 0.211, 0.289) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.283 C 0.217 G 0.217 T 0.283 # l= 1 # Values AA 0.0872 AC 0.0558 AG 0.0605 AT 0.0796 CA 0.0688 CC 0.0495 CG 0.038 CT 0.0606 GA 0.0595 GC 0.0521 GG 0.0495 GT 0.0558 TA 0.0675 TC 0.0595 TG 0.0689 TT 0.0872 # l= 2 # Values AAA 0.0308 AAC 0.0168 AAG 0.0171 AAT 0.0225 ACA 0.0195 ACC 0.0125 ACG 0.00923 ACT 0.0146 AGA 0.0181 AGC 0.0142 AGG 0.0136 AGT 0.0146 ATA 0.0216 ATC 0.0158 ATG 0.0196 ATT 0.0225 CAA 0.0204 CAC 0.0149 CAG 0.0139 CAT 0.0196 CCA 0.016 CCC 0.011 CCG 0.00892 CCT 0.0136 CGA 0.01 CGC 0.00977 CGG 0.00892 CGT 0.00925 CTA 0.0148 CTC 0.0148 CTG 0.0139 CTT 0.0171 GAA 0.0174 GAC 0.0115 GAG 0.0148 GAT 0.0158 GCA 0.016 GCC 0.0122 GCG 0.00977 GCT 0.0142 GGA 0.0138 GGC 0.0122 GGG 0.011 GGT 0.0125 GTA 0.0125 GTC 0.0115 GTG 0.0149 GTT 0.0168 TAA 0.0185 TAC 0.0126 TAG 0.0148 TAT 0.0216 TCA 0.0175 TCC 0.0138 TCG 0.0101 TCT 0.0181 TGA 0.0175 TGC 0.016 TGG 0.016 TGT 0.0195 TTA 0.0185 TTC 0.0174 TTG 0.0204 TTT 0.0308 # l= 3 # Values AAAA 0.0115 AAAC 0.0058 AAAG 0.0053 AAAT 0.00826 AACA 0.0064 AACC 0.00356 AACG 0.0022 AACT 0.00467 AAGA 0.00539 AAGC 0.00372 AAGG 0.00382 AAGT 0.00414 AATA 0.00668 AATC 0.00424 AATG 0.00484 AATT 0.00673 ACAA 0.00636 ACAC 0.00402 ACAG 0.00352 ACAT 0.00557 ACCA 0.00456 ACCC 0.00245 ACCG 0.00215 ACCT 0.00332 ACGA 0.00289 ACGC 0.00209 ACGG 0.00211 ACGT 0.00215 ACTA 0.00405 ACTC 0.00302 ACTG 0.00339 ACTT 0.00414 AGAA 0.00589 AGAC 0.00302 AGAG 0.00444 AGAT 0.0048 AGCA 0.00484 AGCC 0.00295 AGCG 0.0022 AGCT 0.0042 AGGA 0.00417 AGGC 0.00303 AGGG 0.00309 AGGT 0.00332 AGTA 0.00374 AGTC 0.00264 AGTG 0.00353 AGTT 0.00467 ATAA 0.00627 ATAC 0.00356 ATAG 0.00403 ATAT 0.00777 ATCA 0.00517 ATCC 0.00346 ATCG 0.00242 ATCT 0.0048 ATGA 0.0053 ATGC 0.00424 ATGG 0.00452 ATGT 0.00557 ATTA 0.00544 ATTC 0.00407 ATTG 0.00472 ATTT 0.00826 CAAA 0.00687 CAAC 0.00448 CAAG 0.00434 CAAT 0.00472 CACA 0.00483 CACC 0.00379 CACG 0.00275 CACT 0.00353 CAGA 0.0038 CAGC 0.00376 CAGG 0.00298 CAGT 0.00339 CATA 0.00467 CATC 0.00451 CATG 0.00559 CATT 0.00485 CCAA 0.00457 CCAC 0.00384 CCAG 0.00304 CCAT 0.00452 CCCA 0.00314 CCCC 0.00287 CCCG 0.0019 CCCT 0.00309 CCGA 0.00212 CCGC 0.00266 CCGG 0.00203 CCGT 0.00211 CCTA 0.00295 CCTC 0.00387 CCTG 0.00298 CCTT 0.00382 CGAA 0.00239 CGAC 0.00255 CGAG 0.00269 CGAT 0.00241 CGCA 0.00224 CGCC 0.00293 CGCG 0.0024 CGCT 0.0022 CGGA 0.00206 CGGC 0.00281 CGGG 0.0019 CGGT 0.00215 CGTA 0.0017 CGTC 0.00259 CGTG 0.00275 CGTT 0.0022 CTAA 0.00397 CTAC 0.0031 CTAG 0.00369 CTAT 0.00403 CTCA 0.00361 CTCC 0.00402 CTCG 0.00269 CTCT 0.00444 CTGA 0.00343 CTGC 0.00393 CTGG 0.00304 CTGT 0.00352 CTTA 0.00317 CTTC 0.00426 CTTG 0.00434 CTTT 0.0053 GAAA 0.0057 GAAC 0.00341 GAAG 0.00426 GAAT 0.00407 GACA 0.00368 GACC 0.00257 GACG 0.00258 GACT 0.00264 GAGA 0.00449 GAGC 0.00338 GAGG 0.00387 GAGT 0.00302 GATA 0.0036 GATC 0.00348 GATG 0.00452 GATT 0.00424 GCAA 0.00431 GCAC 0.00347 GCAG 0.00393 GCAT 0.00424 GCCA 0.00367 GCCC 0.00268 GCCG 0.00281 GCCT 0.00304 GCGA 0.00234 GCGC 0.00268 GCGG 0.00266 GCGT 0.00208 GCTA 0.00333 GCTC 0.00338 GCTG 0.00376 GCTT 0.00372 GGAA 0.00376 GGAC 0.00261 GGAG 0.00402 GGAT 0.00346 GGCA 0.00337 GGCC 0.00295 GGCG 0.00293 GGCT 0.00295 GGGA 0.00301 GGGC 0.00268 GGGG 0.00287 GGGT 0.00245 GGTA 0.00256 GGTC 0.00257 GGTG 0.00379 GGTT 0.00356 GTAA 0.00314 GTAC 0.00275 GTAG 0.0031 GTAT 0.00355 GTCA 0.0033 GTCC 0.00261 GTCG 0.00255 GTCT 0.00302 GTGA 0.00357 GTGC 0.00347 GTGG 0.00384 GTGT 0.00402 GTTA 0.00314 GTTC 0.00341 GTTG 0.00448 GTTT 0.0058 TAAA 0.00678 TAAC 0.00314 TAAG 0.00317 TAAT 0.00544 TACA 0.00455 TACC 0.00256 TACG 0.0017 TACT 0.00374 TAGA 0.00447 TAGC 0.00333 TAGG 0.00295 TAGT 0.00405 TATA 0.00667 TATC 0.00361 TATG 0.00467 TATT 0.00668 TCAA 0.00517 TCAC 0.00357 TCAG 0.00343 TCAT 0.0053 TCCA 0.0046 TCCC 0.00301 TCCG 0.00206 TCCT 0.00417 TCGA 0.00269 TCGC 0.00234 TCGG 0.00212 TCGT 0.0029 TCTA 0.00447 TCTC 0.00449 TCTG 0.0038 TCTT 0.00539 TGAA 0.00539 TGAC 0.0033 TGAG 0.00361 TGAT 0.00516 TGCA 0.00551 TGCC 0.00337 TGCG 0.00223 TGCT 0.00485 TGGA 0.0046 TGGC 0.00367 TGGG 0.00314 TGGT 0.00456 TGTA 0.00455 TGTC 0.00369 TGTG 0.00483 TGTT 0.0064 TTAA 0.00515 TTAC 0.00315 TTAG 0.00396 TTAT 0.00627 TTCA 0.00539 TTCC 0.00376 TTCG 0.00239 TTCT 0.00589 TTGA 0.00517 TTGC 0.00431 TTGG 0.00457 TTGT 0.00636 TTTA 0.00678 TTTC 0.0057 TTTG 0.00687 TTTT 0.0115 # l= 4 # Values AAAAA 0.0046 AAAAC 0.00196 AAAAG 0.00189 AAAAT 0.00302 AAACA 0.00235 AAACC 0.00114 AAACG 0.000675 AAACT 0.00163 AAAGA 0.00177 AAAGC 0.00106 AAAGG 0.00119 AAAGT 0.00129 AAATA 0.00272 AAATC 0.00146 AAATG 0.00173 AAATT 0.00236 AACAA 0.0023 AACAC 0.00121 AACAG 0.00113 AACAT 0.00176 AACCA 0.00139 AACCC 0.000702 AACCG 0.000536 AACCT 0.000929 AACGA 0.000756 AACGC 0.000444 AACGG 0.000504 AACGT 0.000498 AACTA 0.00135 AACTC 0.000914 AACTG 0.00105 AACTT 0.00136 AAGAA 0.00202 AAGAC 0.000852 AAGAG 0.00117 AAGAT 0.00135 AAGCA 0.0014 AAGCC 0.000725 AAGCG 0.000505 AAGCT 0.00109 AAGGA 0.00123 AAGGC 0.000795 AAGGG 0.000835 AAGGT 0.000961 AAGTA 0.00106 AAGTC 0.000733 AAGTG 0.000988 AAGTT 0.00136 AATAA 0.00223 AATAC 0.00105 AATAG 0.0012 AATAT 0.0022 AATCA 0.00149 AATCC 0.000903 AATCG 0.000556 AATCT 0.00129 AATGA 0.00143 AATGC 0.000955 AATGG 0.00111 AATGT 0.00135 AATTA 0.00182 AATTC 0.00119 AATTG 0.00135 AATTT 0.00236 ACAAA 0.0022 ACAAC 0.00136 ACAAG 0.00131 ACAAT 0.00148 ACACA 0.00153 ACACC 0.000876 ACACG 0.000685 ACACT 0.000934 ACAGA 0.00107 ACAGC 0.0008 ACAGG 0.000748 ACAGT 0.000898 ACATA 0.00155 ACATC 0.00108 ACATG 0.0016 ACATT 0.00135 ACCAA 0.00143 ACCAC 0.00102 ACCAG 0.000865 ACCAT 0.00125 ACCCA 0.000786 ACCCC 0.000578 ACCCG 0.000398 ACCCT 0.000691 ACCGA 0.000602 ACCGC 0.00053 ACCGG 0.000495 ACCGT 0.000523 ACCTA 0.000802 ACCTC 0.00083 ACCTG 0.000731 ACCTT 0.000961 ACGAA 0.00077 ACGAC 0.00077 ACGAG 0.000716 ACGAT 0.000642 ACGCA 0.000592 ACGCC 0.000558 ACGCG 0.000471 ACGCT 0.000463 ACGGA 0.000545 ACGGC 0.000585 ACGGG 0.000459 ACGGT 0.000523 ACGTA 0.000508 ACGTC 0.000505 ACGTG 0.00064 ACGTT 0.000498 ACTAA 0.00118 ACTAC 0.000855 ACTAG 0.000906 ACTAT 0.00111 ACTCA 0.000883 ACTCC 0.000742 ACTCG 0.000522 ACTCT 0.000871 ACTGA 0.000939 ACTGC 0.000831 ACTGG 0.00072 ACTGT 0.000898 ACTTA 0.000868 ACTTC 0.000886 ACTTG 0.0011 ACTTT 0.00129 AGAAA 0.00216 AGAAC 0.00107 AGAAG 0.00139 AGAAT 0.00128 AGACA 0.00107 AGACC 0.000639 AGACG 0.000578 AGACT 0.000733 AGAGA 0.0016 AGAGC 0.000897 AGAGG 0.00107 AGAGT 0.000871 AGATA 0.00126 AGATC 0.001 AGATG 0.00125 AGATT 0.00129 AGCAA 0.00143 AGCAC 0.000985 AGCAG 0.00127 AGCAT 0.00116 AGCCA 0.000998 AGCCC 0.000633 AGCCG 0.000562 AGCCT 0.000755 AGCGA 0.000634 AGCGC 0.000557 AGCGG 0.000547 AGCGT 0.000463 AGCTA 0.00116 AGCTC 0.000938 AGCTG 0.00101 AGCTT 0.00109 AGGAA 0.00128 AGGAC 0.000733 AGGAG 0.00119 AGGAT 0.000974 AGGCA 0.000959 AGGCC 0.000709 AGGCG 0.000613 AGGCT 0.000755 AGGGA 0.000946 AGGGC 0.000669 AGGGG 0.000787 AGGGT 0.000691 AGGTA 0.000787 AGGTC 0.000672 AGGTG 0.000937 AGGTT 0.000929 AGTAA 0.000986 AGTAC 0.000785 AGTAG 0.000971 AGTAT 0.001 AGTCA 0.000848 AGTCC 0.00059 AGTCG 0.000474 AGTCT 0.000733 AGTGA 0.000973 AGTGC 0.000758 AGTGG 0.000867 AGTGT 0.000934 AGTTA 0.00096 AGTTC 0.000925 AGTTG 0.00116 AGTTT 0.00163 ATAAA 0.0024 ATAAC 0.000963 ATAAG 0.00105 ATAAT 0.00187 ATACA 0.00144 ATACC 0.00068 ATACG 0.000425 ATACT 0.001 ATAGA 0.00135 ATAGC 0.000802 ATAGG 0.000775 ATAGT 0.00111 ATATA 0.00274 ATATC 0.00116 ATATG 0.00166 ATATT 0.0022 ATCAA 0.00162 ATCAC 0.000997 ATCAG 0.000985 ATCAT 0.00156 ATCCA 0.00129 ATCCC 0.000677 ATCCG 0.000519 ATCCT 0.000974 ATCGA 0.000777 ATCGC 0.000489 ATCGG 0.000504 ATCGT 0.000642 ATCTA 0.00132 ATCTC 0.0011 ATCTG 0.00103 ATCTT 0.00135 ATGAA 0.00167 ATGAC 0.000998 ATGAG 0.00106 ATGAT 0.00156 ATGCA 0.00171 ATGCC 0.000829 ATGCG 0.000538 ATGCT 0.00116 ATGGA 0.00141 ATGGC 0.00102 ATGGG 0.000839 ATGGT 0.00125 ATGTA 0.00142 ATGTC 0.000993 ATGTG 0.00139 ATGTT 0.00176 ATTAA 0.00159 ATTAC 0.000892 ATTAG 0.0011 ATTAT 0.00187 ATTCA 0.0014 ATTCC 0.00083 ATTCG 0.000558 ATTCT 0.00128 ATTGA 0.00129 ATTGC 0.000954 ATTGG 0.000986 ATTGT 0.00148 ATTTA 0.00196 ATTTC 0.00145 ATTTG 0.00183 ATTTT 0.00302 CAAAA 0.00226 CAAAC 0.00152 CAAAG 0.00126 CAAAT 0.00183 CAACA 0.00167 CAACC 0.000999 CAACG 0.000655 CAACT 0.00116 CAAGA 0.00124 CAAGC 0.00104 CAAGG 0.000964 CAAGT 0.0011 CAATA 0.00129 CAATC 0.000949 CAATG 0.00112 CAATT 0.00135 CACAA 0.00144 CACAC 0.00116 CACAG 0.00084 CACAT 0.00139 CACCA 0.00136 CACCC 0.000753 CACCG 0.000737 CACCT 0.000937 CACGA 0.000755 CACGC 0.000729 CACGG 0.000626 CACGT 0.00064 CACTA 0.000896 CACTC 0.000774 CACTG 0.000875 CACTT 0.000988 CAGAA 0.00114 CAGAC 0.000719 CAGAG 0.000909 CAGAT 0.00103 CAGCA 0.00124 CAGCC 0.000843 CAGCG 0.000666 CAGCT 0.00101 CAGGA 0.00083 CAGGC 0.000751 CAGGG 0.000665 CAGGT 0.000731 CAGTA 0.000799 CAGTC 0.000665 CAGTG 0.000875 CAGTT 0.00105 CATAA 0.00125 CATAC 0.000867 CATAG 0.000894 CATAT 0.00166 CATCA 0.0015 CATCC 0.00102 CATCG 0.000747 CATCT 0.00125 CATGA 0.00134 CATGC 0.00137 CATGG 0.00128 CATGT 0.0016 CATTA 0.00105 CATTC 0.000948 CATTG 0.00112 CATTT 0.00173 CCAAA 0.00161 CCAAC 0.00102 CCAAG 0.000949 CCAAT 0.000986 CCACA 0.00106 CCACC 0.00118 CCACG 0.000727 CCACT 0.000867 CCAGA 0.000781 CCAGC 0.000901 CCAGG 0.000639 CCAGT 0.00072 CCATA 0.000961 CCATC 0.00116 CCATG 0.00128 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000883 CCCAC 0.000834 CCCAG 0.000583 CCCAT 0.000839 CCCCA 0.000743 CCCCC 0.000829 CCCCG 0.000511 CCCCT 0.000787 CCCGA 0.000424 CCCGC 0.000627 CCCGG 0.000394 CCCGT 0.000459 CCCTA 0.000668 CCCTC 0.000924 CCCTG 0.000665 CCCTT 0.000835 CCGAA 0.000498 CCGAC 0.000547 CCGAG 0.00057 CCGAT 0.000504 CCGCA 0.000547 CCGCC 0.000929 CCGCG 0.000639 CCGCT 0.000547 CCGGA 0.000451 CCGGC 0.000686 CCGGG 0.000394 CCGGT 0.000495 CCGTA 0.000352 CCGTC 0.000629 CCGTG 0.000626 CCGTT 0.000504 CCTAA 0.000801 CCTAC 0.00063 CCTAG 0.000741 CCTAT 0.000775 CCTCA 0.000846 CCTCC 0.00123 CCTCG 0.000733 CCTCT 0.00107 CCTGA 0.000675 CCTGC 0.000914 CCTGG 0.000639 CCTGT 0.000748 CCTTA 0.000663 CCTTC 0.000998 CCTTG 0.000964 CCTTT 0.00119 CGAAA 0.000643 CGAAC 0.000559 CGAAG 0.000634 CGAAT 0.000558 CGACA 0.000684 CGACC 0.000616 CGACG 0.000778 CGACT 0.000474 CGAGA 0.000684 CGAGC 0.000751 CGAGG 0.000733 CGAGT 0.000522 CGATA 0.000444 CGATC 0.000669 CGATG 0.000747 CGATT 0.000556 CGCAA 0.000516 CGCAC 0.000614 CGCAG 0.000566 CGCAT 0.000538 CGCCA 0.000742 CGCCC 0.000665 CGCCG 0.000907 CGCCT 0.000613 CGCGA 0.000467 CGCGC 0.000825 CGCGG 0.000639 CGCGT 0.000471 CGCTA 0.000412 CGCTC 0.000619 CGCTG 0.000666 CGCTT 0.000505 CGGAA 0.000438 CGGAC 0.000455 CGGAG 0.000647 CGGAT 0.000519 CGGCA 0.000614 CGGCC 0.000728 CGGCG 0.000907 CGGCT 0.000562 CGGGA 0.000448 CGGGC 0.000547 CGGGG 0.000511 CGGGT 0.000398 CGGTA 0.000378 CGGTC 0.000498 CGGTG 0.000737 CGGTT 0.000536 CGTAA 0.000344 CGTAC 0.00048 CGTAG 0.000449 CGTAT 0.000425 CGTCA 0.000583 CGTCC 0.000638 CGTCG 0.000778 CGTCT 0.000578 CGTGA 0.000561 CGTGC 0.000778 CGTGG 0.000727 CGTGT 0.000685 CGTTA 0.000356 CGTTC 0.000511 CGTTG 0.000655 CGTTT 0.000675 CTAAA 0.00144 CTAAC 0.000749 CTAAG 0.000675 CTAAT 0.0011 CTACA 0.00102 CTACC 0.000667 CTACG 0.000449 CTACT 0.000971 CTAGA 0.00108 CTAGC 0.000966 CTAGG 0.000741 CTAGT 0.000906 CTATA 0.00117 CTATC 0.00077 CTATG 0.000894 CTATT 0.0012 CTCAA 0.00107 CTCAC 0.000818 CTCAG 0.000656 CTCAT 0.00106 CTCCA 0.00119 CTCCC 0.000985 CTCCG 0.000647 CTCCT 0.00119 CTCGA 0.000662 CTCGC 0.000742 CTCGG 0.00057 CTCGT 0.000716 CTCTA 0.00105 CTCTC 0.0013 CTCTG 0.000909 CTCTT 0.00117 CTGAA 0.00111 CTGAC 0.000678 CTGAG 0.000656 CTGAT 0.000985 CTGCA 0.00121 CTGCC 0.000886 CTGCG 0.000566 CTGCT 0.00127 CTGGA 0.000843 CTGGC 0.000749 CTGGG 0.000583 CTGGT 0.000865 CTGTA 0.000783 CTGTC 0.000761 CTGTG 0.00084 CTGTT 0.00113 CTTAA 0.00088 CTTAC 0.000569 CTTAG 0.000675 CTTAT 0.00105 CTTCA 0.00122 CTTCC 0.00101 CTTCG 0.000634 CTTCT 0.00139 CTTGA 0.00107 CTTGC 0.00101 CTTGG 0.000949 CTTGT 0.00131 CTTTA 0.00107 CTTTC 0.00108 CTTTG 0.00126 CTTTT 0.00189 GAAAA 0.00201 GAAAC 0.00116 GAAAG 0.00108 GAAAT 0.00145 GAACA 0.00121 GAACC 0.000763 GAACG 0.000511 GAACT 0.000925 GAAGA 0.00139 GAAGC 0.000986 GAAGG 0.000998 GAAGT 0.000886 GAATA 0.00104 GAATC 0.000892 GAATG 0.000948 GAATT 0.00119 GACAA 0.00115 GACAC 0.000785 GACAG 0.000761 GACAT 0.000993 GACCA 0.000876 GACCC 0.000525 GACCG 0.000498 GACCT 0.000672 GACGA 0.000888 GACGC 0.000566 GACGG 0.000629 GACGT 0.000505 GACTA 0.000666 GACTC 0.000578 GACTG 0.000665 GACTT 0.000733 GAGAA 0.00134 GAGAC 0.000747 GAGAG 0.0013 GAGAT 0.0011 GAGCA 0.00111 GAGCC 0.000713 GAGCG 0.000619 GAGCT 0.000938 GAGGA 0.00125 GAGGC 0.000873 GAGGG 0.000924 GAGGT 0.00083 GAGTA 0.000749 GAGTC 0.000578 GAGTG 0.000774 GAGTT 0.000914 GATAA 0.00104 GATAC 0.000631 GATAG 0.00077 GATAT 0.00116 GATCA 0.000999 GATCC 0.000811 GATCG 0.000669 GATCT 0.001 GATGA 0.00131 GATGC 0.000965 GATGG 0.00116 GATGT 0.00108 GATTA 0.000938 GATTC 0.000892 GATTG 0.000949 GATTT 0.00146 GCAAA 0.00132 GCAAC 0.00103 GCAAG 0.00101 GCAAT 0.000954 GCACA 0.00111 GCACC 0.00083 GCACG 0.000778 GCACT 0.000758 GCAGA 0.00097 GCAGC 0.00122 GCAGG 0.000914 GCAGT 0.000831 GCATA 0.000949 GCATC 0.000965 GCATG 0.00137 GCATT 0.000955 GCCAA 0.000944 GCCAC 0.000955 GCCAG 0.000749 GCCAT 0.00102 GCCCA 0.000791 GCCCC 0.000669 GCCCG 0.000547 GCCCT 0.000669 GCCGA 0.000602 GCCGC 0.000937 GCCGG 0.000686 GCCGT 0.000585 GCCTA 0.000615 GCCTC 0.000873 GCCTG 0.000751 GCCTT 0.000795 GCGAA 0.000494 GCGAC 0.000612 GCGAG 0.000742 GCGAT 0.000489 GCGCA 0.000589 GCGCC 0.000713 GCGCG 0.000825 GCGCT 0.000557 GCGGA 0.00057 GCGGC 0.000937 GCGGG 0.000627 GCGGT 0.00053 GCGTA 0.000347 GCGTC 0.000566 GCGTG 0.000729 GCGTT 0.000444 GCTAA 0.000816 GCTAC 0.000746 GCTAG 0.000966 GCTAT 0.000802 GCTCA 0.000814 GCTCC 0.000913 GCTCG 0.000751 GCTCT 0.000897 GCTGA 0.000841 GCTGC 0.00122 GCTGG 0.000901 GCTGT 0.0008 GCTTA 0.000643 GCTTC 0.000986 GCTTG 0.00104 GCTTT 0.00106 GGAAA 0.00118 GGAAC 0.000737 GGAAG 0.00101 GGAAT 0.00083 GGACA 0.000794 GGACC 0.000585 GGACG 0.000638 GGACT 0.00059 GGAGA 0.00113 GGAGC 0.000913 GGAGG 0.00123 GGAGT 0.000742 GGATA 0.000728 GGATC 0.000811 GGATG 0.00102 GGATT 0.000903 GGCAA 0.000896 GGCAC 0.000755 GGCAG 0.000886 GGCAT 0.000829 GGCCA 0.000864 GGCCC 0.000649 GGCCG 0.000728 GGCCT 0.000709 GGCGA 0.000729 GGCGC 0.000713 GGCGG 0.000929 GGCGT 0.000558 GGCTA 0.000664 GGCTC 0.000713 GGCTG 0.000843 GGCTT 0.000725 GGGAA 0.000814 GGGAC 0.000535 GGGAG 0.000985 GGGAT 0.000677 GGGCA 0.000731 GGGCC 0.000649 GGGCG 0.000665 GGGCT 0.000633 GGGGA 0.000795 GGGGC 0.000669 GGGGG 0.000829 GGGGT 0.000578 GGGTA 0.000472 GGGTC 0.000525 GGGTG 0.000753 GGGTT 0.000702 GGTAA 0.000655 GGTAC 0.00056 GGTAG 0.000667 GGTAT 0.00068 GGTCA 0.00073 GGTCC 0.000585 GGTCG 0.000616 GGTCT 0.000639 GGTGA 0.000905 GGTGC 0.00083 GGTGG 0.00118 GGTGT 0.000876 GGTTA 0.000656 GGTTC 0.000763 GGTTG 0.000999 GGTTT 0.00114 GTAAA 0.00108 GTAAC 0.000603 GTAAG 0.000569 GTAAT 0.000892 GTACA 0.000928 GTACC 0.00056 GTACG 0.00048 GTACT 0.000785 GTAGA 0.000873 GTAGC 0.000746 GTAGG 0.00063 GTAGT 0.000855 GTATA 0.001 GTATC 0.000631 GTATG 0.000867 GTATT 0.00105 GTCAA 0.000894 GTCAC 0.000732 GTCAG 0.000678 GTCAT 0.000998 GTCCA 0.000886 GTCCC 0.000535 GTCCG 0.000455 GTCCT 0.000733 GTCGA 0.000623 GTCGC 0.000612 GTCGG 0.000547 GTCGT 0.00077 GTCTA 0.000701 GTCTC 0.000747 GTCTG 0.000719 GTCTT 0.000852 GTGAA 0.00103 GTGAC 0.000732 GTGAG 0.000818 GTGAT 0.000997 GTGCA 0.00112 GTGCC 0.000755 GTGCG 0.000614 GTGCT 0.000985 GTGGA 0.00103 GTGGC 0.000955 GTGGG 0.000834 GTGGT 0.00102 GTGTA 0.000869 GTGTC 0.000785 GTGTG 0.00116 GTGTT 0.00121 GTTAA 0.000826 GTTAC 0.000603 GTTAG 0.000749 GTTAT 0.000963 GTTCA 0.00105 GTTCC 0.000737 GTTCG 0.000559 GTTCT 0.00107 GTTGA 0.00107 GTTGC 0.00103 GTTGG 0.00102 GTTGT 0.00136 GTTTA 0.00116 GTTTC 0.00116 GTTTG 0.00152 GTTTT 0.00196 TAAAA 0.00259 TAAAC 0.00116 TAAAG 0.00107 TAAAT 0.00196 TAACA 0.00117 TAACC 0.000656 TAACG 0.000356 TAACT 0.00096 TAAGA 0.001 TAAGC 0.000643 TAAGG 0.000663 TAAGT 0.000868 TAATA 0.00164 TAATC 0.000938 TAATG 0.00105 TAATT 0.00182 TACAA 0.00147 TACAC 0.000869 TACAG 0.000783 TACAT 0.00142 TACCA 0.000925 TACCC 0.000472 TACCG 0.000378 TACCT 0.000787 TACGA 0.000491 TACGC 0.000347 TACGG 0.000352 TACGT 0.000508 TACTA 0.00113 TACTC 0.000749 TACTG 0.000799 TACTT 0.00106 TAGAA 0.0014 TAGAC 0.000701 TAGAG 0.00105 TAGAT 0.00132 TAGCA 0.0011 TAGCC 0.000664 TAGCG 0.000412 TAGCT 0.00116 TAGGA 0.000864 TAGGC 0.000615 TAGGG 0.000668 TAGGT 0.000802 TAGTA 0.00113 TAGTC 0.000666 TAGTG 0.000896 TAGTT 0.00135 TATAA 0.00175 TATAC 0.001 TATAG 0.00117 TATAT 0.00274 TATCA 0.00117 TATCC 0.000728 TATCG 0.000444 TATCT 0.00126 TATGA 0.00122 TATGC 0.000949 TATGG 0.000961 TATGT 0.00155 TATTA 0.00164 TATTC 0.00104 TATTG 0.00129 TATTT 0.00272 TCAAA 0.00174 TCAAC 0.00107 TCAAG 0.00107 TCAAT 0.00129 TCACA 0.00113 TCACC 0.000905 TCACG 0.000561 TCACT 0.000973 TCAGA 0.00097 TCAGC 0.000841 TCAGG 0.000675 TCAGT 0.000939 TCATA 0.00122 TCATC 0.00131 TCATG 0.00134 TCATT 0.00143 TCCAA 0.00131 TCCAC 0.00103 TCCAG 0.000843 TCCAT 0.00141 TCCCA 0.000819 TCCCC 0.000795 TCCCG 0.000448 TCCCT 0.000946 TCCGA 0.000493 TCCGC 0.00057 TCCGG 0.000451 TCCGT 0.000545 TCCTA 0.000864 TCCTC 0.00125 TCCTG 0.00083 TCCTT 0.00123 TCGAA 0.000626 TCGAC 0.000623 TCGAG 0.000662 TCGAT 0.000777 TCGCA 0.000506 TCGCC 0.000729 TCGCG 0.000467 TCGCT 0.000634 TCGGA 0.000493 TCGGC 0.000602 TCGGG 0.000424 TCGGT 0.000602 TCGTA 0.000491 TCGTC 0.000888 TCGTG 0.000755 TCGTT 0.000756 TCTAA 0.00117 TCTAC 0.000873 TCTAG 0.00108 TCTAT 0.00135 TCTCA 0.00107 TCTCC 0.00113 TCTCG 0.000684 TCTCT 0.0016 TCTGA 0.00097 TCTGC 0.00097 TCTGG 0.000781 TCTGT 0.00107 TCTTA 0.001 TCTTC 0.00139 TCTTG 0.00124 TCTTT 0.00177 TGAAA 0.00172 TGAAC 0.00105 TGAAG 0.00122 TGAAT 0.0014 TGACA 0.00114 TGACC 0.00073 TGACG 0.000583 TGACT 0.000848 TGAGA 0.00107 TGAGC 0.000814 TGAGG 0.000846 TGAGT 0.000883 TGATA 0.00117 TGATC 0.000999 TGATG 0.0015 TGATT 0.00149 TGCAA 0.00147 TGCAC 0.00112 TGCAG 0.00121 TGCAT 0.00171 TGCCA 0.00106 TGCCC 0.000731 TGCCG 0.000614 TGCCT 0.000959 TGCGA 0.000506 TGCGC 0.000589 TGCGG 0.000547 TGCGT 0.000592 TGCTA 0.0011 TGCTC 0.00111 TGCTG 0.00124 TGCTT 0.0014 TGGAA 0.00123 TGGAC 0.000886 TGGAG 0.00119 TGGAT 0.00129 TGGCA 0.00106 TGGCC 0.000864 TGGCG 0.000742 TGGCT 0.000998 TGGGA 0.000819 TGGGC 0.000791 TGGGG 0.000743 TGGGT 0.000786 TGGTA 0.000925 TGGTC 0.000876 TGGTG 0.00136 TGGTT 0.00139 TGTAA 0.00116 TGTAC 0.000928 TGTAG 0.00102 TGTAT 0.00144 TGTCA 0.00114 TGTCC 0.000794 TGTCG 0.000684 TGTCT 0.00107 TGTGA 0.00113 TGTGC 0.00111 TGTGG 0.00106 TGTGT 0.00153 TGTTA 0.00117 TGTTC 0.00121 TGTTG 0.00167 TGTTT 0.00235 TTAAA 0.00186 TTAAC 0.000826 TTAAG 0.00088 TTAAT 0.00159 TTACA 0.00116 TTACC 0.000655 TTACG 0.000344 TTACT 0.000986 TTAGA 0.00117 TTAGC 0.000816 TTAGG 0.000801 TTAGT 0.00118 TTATA 0.00175 TTATC 0.00104 TTATG 0.00125 TTATT 0.00223 TTCAA 0.00158 TTCAC 0.00103 TTCAG 0.00111 TTCAT 0.00167 TTCCA 0.00123 TTCCC 0.000814 TTCCG 0.000438 TTCCT 0.00128 TTCGA 0.000626 TTCGC 0.000494 TTCGG 0.000498 TTCGT 0.00077 TTCTA 0.0014 TTCTC 0.00134 TTCTG 0.00114 TTCTT 0.00202 TTGAA 0.00158 TTGAC 0.000894 TTGAG 0.00107 TTGAT 0.00162 TTGCA 0.00147 TTGCC 0.000896 TTGCG 0.000516 TTGCT 0.00143 TTGGA 0.00131 TTGGC 0.000944 TTGGG 0.000883 TTGGT 0.00143 TTGTA 0.00147 TTGTC 0.00115 TTGTG 0.00144 TTGTT 0.0023 TTTAA 0.00186 TTTAC 0.00108 TTTAG 0.00144 TTTAT 0.0024 TTTCA 0.00172 TTTCC 0.00118 TTTCG 0.000643 TTTCT 0.00216 TTTGA 0.00174 TTTGC 0.00132 TTTGG 0.00161 TTTGT 0.0022 TTTTA 0.00259 TTTTC 0.00201 TTTTG 0.00226 TTTTT 0.0046 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.401 AAAAC 0.1706 AAAAG 0.1647 AAAAT 0.2636 AAACA 0.4055 AAACC 0.1971 AAACG 0.1165 AAACT 0.281 AAAGA 0.333 AAAGC 0.1992 AAAGG 0.2252 AAAGT 0.2426 AAATA 0.3287 AAATC 0.1766 AAATG 0.2088 AAATT 0.2859 AACAA 0.3591 AACAC 0.1884 AACAG 0.1772 AACAT 0.2752 AACCA 0.3916 AACCC 0.197 AACCG 0.1505 AACCT 0.2609 AACGA 0.3433 AACGC 0.2017 AACGG 0.2287 AACGT 0.2263 AACTA 0.2895 AACTC 0.1956 AACTG 0.2243 AACTT 0.2905 AAGAA 0.3741 AAGAC 0.1579 AAGAG 0.2177 AAGAT 0.2503 AAGCA 0.3763 AAGCC 0.1946 AAGCG 0.1356 AAGCT 0.2935 AAGGA 0.3216 AAGGC 0.2081 AAGGG 0.2186 AAGGT 0.2517 AAGTA 0.2562 AAGTC 0.1771 AAGTG 0.2387 AAGTT 0.328 AATAA 0.3336 AATAC 0.1577 AATAG 0.1796 AATAT 0.3292 AATCA 0.3518 AATCC 0.2131 AATCG 0.1313 AATCT 0.3039 AATGA 0.2951 AATGC 0.1971 AATGG 0.23 AATGT 0.2778 AATTA 0.2708 AATTC 0.1772 AATTG 0.2012 AATTT 0.3509 ACAAA 0.3463 ACAAC 0.2141 ACAAG 0.2064 ACAAT 0.2331 ACACA 0.3796 ACACC 0.2178 ACACG 0.1702 ACACT 0.2323 ACAGA 0.305 ACAGC 0.2273 ACAGG 0.2125 ACAGT 0.2552 ACATA 0.2775 ACATC 0.1932 ACATG 0.2876 ACATT 0.2417 ACCAA 0.3131 ACCAC 0.2234 ACCAG 0.1898 ACCAT 0.2737 ACCCA 0.3204 ACCCC 0.2356 ACCCG 0.1623 ACCCT 0.2816 ACCGA 0.2799 ACCGC 0.2464 ACCGG 0.2306 ACCGT 0.2431 ACCTA 0.2411 ACCTC 0.2498 ACCTG 0.22 ACCTT 0.2891 ACGAA 0.2656 ACGAC 0.2658 ACGAG 0.2469 ACGAT 0.2217 ACGCA 0.2843 ACGCC 0.2675 ACGCG 0.226 ACGCT 0.2223 ACGGA 0.2579 ACGGC 0.277 ACGGG 0.2176 ACGGT 0.2475 ACGTA 0.2363 ACGTC 0.2346 ACGTG 0.2976 ACGTT 0.2316 ACTAA 0.2915 ACTAC 0.2113 ACTAG 0.2239 ACTAT 0.2733 ACTCA 0.2927 ACTCC 0.2459 ACTCG 0.1728 ACTCT 0.2886 ACTGA 0.2772 ACTGC 0.2453 ACTGG 0.2124 ACTGT 0.2651 ACTTA 0.2096 ACTTC 0.214 ACTTG 0.2656 ACTTT 0.3107 AGAAA 0.367 AGAAC 0.1809 AGAAG 0.2354 AGAAT 0.2167 AGACA 0.3534 AGACC 0.2118 AGACG 0.1918 AGACT 0.243 AGAGA 0.3615 AGAGC 0.202 AGAGG 0.2403 AGAGT 0.1962 AGATA 0.2628 AGATC 0.2086 AGATG 0.2602 AGATT 0.2684 AGCAA 0.2952 AGCAC 0.2033 AGCAG 0.2619 AGCAT 0.2396 AGCCA 0.3386 AGCCC 0.2147 AGCCG 0.1906 AGCCT 0.2561 AGCGA 0.288 AGCGC 0.253 AGCGG 0.2485 AGCGT 0.2105 AGCTA 0.2754 AGCTC 0.2235 AGCTG 0.2407 AGCTT 0.2604 AGGAA 0.3057 AGGAC 0.1756 AGGAG 0.2853 AGGAT 0.2334 AGGCA 0.3159 AGGCC 0.2335 AGGCG 0.202 AGGCT 0.2486 AGGGA 0.3059 AGGGC 0.2164 AGGGG 0.2544 AGGGT 0.2233 AGGTA 0.2366 AGGTC 0.2021 AGGTG 0.2818 AGGTT 0.2795 AGTAA 0.2634 AGTAC 0.2096 AGTAG 0.2594 AGTAT 0.2676 AGTCA 0.3208 AGTCC 0.2229 AGTCG 0.1793 AGTCT 0.2771 AGTGA 0.2755 AGTGC 0.2146 AGTGG 0.2454 AGTGT 0.2645 AGTTA 0.2055 AGTTC 0.198 AGTTG 0.2479 AGTTT 0.3486 ATAAA 0.3822 ATAAC 0.1535 ATAAG 0.1669 ATAAT 0.2974 ATACA 0.4066 ATACC 0.1916 ATACG 0.1198 ATACT 0.282 ATAGA 0.3342 ATAGC 0.1989 ATAGG 0.1924 ATAGT 0.2746 ATATA 0.3533 ATATC 0.1497 ATATG 0.2139 ATATT 0.2831 ATCAA 0.3133 ATCAC 0.1931 ATCAG 0.1907 ATCAT 0.3029 ATCCA 0.3725 ATCCC 0.1959 ATCCG 0.1501 ATCCT 0.2815 ATCGA 0.3222 ATCGC 0.2026 ATCGG 0.209 ATCGT 0.2662 ATCTA 0.2744 ATCTC 0.229 ATCTG 0.2152 ATCTT 0.2814 ATGAA 0.3159 ATGAC 0.1884 ATGAG 0.2005 ATGAT 0.2952 ATGCA 0.4032 ATGCC 0.1958 ATGCG 0.127 ATGCT 0.2741 ATGGA 0.3128 ATGGC 0.2253 ATGGG 0.1856 ATGGT 0.2762 ATGTA 0.2553 ATGTC 0.1782 ATGTG 0.2501 ATGTT 0.3163 ATTAA 0.2917 ATTAC 0.1639 ATTAG 0.2015 ATTAT 0.343 ATTCA 0.3448 ATTCC 0.2041 ATTCG 0.1372 ATTCT 0.3139 ATTGA 0.2745 ATTGC 0.2022 ATTGG 0.209 ATTGT 0.3142 ATTTA 0.2368 ATTTC 0.1754 ATTTG 0.2219 ATTTT 0.366 CAAAA 0.3295 CAAAC 0.2212 CAAAG 0.1827 CAAAT 0.2667 CAACA 0.3724 CAACC 0.2229 CAACG 0.1462 CAACT 0.2586 CAAGA 0.2854 CAAGC 0.2395 CAAGG 0.2219 CAAGT 0.2532 CAATA 0.2735 CAATC 0.2012 CAATG 0.238 CAATT 0.2873 CACAA 0.2975 CACAC 0.2404 CACAG 0.1739 CACAT 0.2882 CACCA 0.3595 CACCC 0.1988 CACCG 0.1944 CACCT 0.2473 CACGA 0.2745 CACGC 0.2651 CACGG 0.2276 CACGT 0.2328 CACTA 0.2537 CACTC 0.219 CACTG 0.2477 CACTT 0.2796 CAGAA 0.299 CAGAC 0.1894 CAGAG 0.2395 CAGAT 0.272 CAGCA 0.3299 CAGCC 0.2242 CAGCG 0.1771 CAGCT 0.2688 CAGGA 0.2788 CAGGC 0.2523 CAGGG 0.2233 CAGGT 0.2456 CAGTA 0.2359 CAGTC 0.1964 CAGTG 0.2583 CAGTT 0.3094 CATAA 0.2675 CATAC 0.1855 CATAG 0.1914 CATAT 0.3557 CATCA 0.333 CATCC 0.2252 CATCG 0.1654 CATCT 0.2765 CATGA 0.2403 CATGC 0.2447 CATGG 0.2284 CATGT 0.2866 CATTA 0.2161 CATTC 0.1958 CATTG 0.2318 CATTT 0.3563 CCAAA 0.3529 CCAAC 0.2239 CCAAG 0.2076 CCAAT 0.2157 CCACA 0.2773 CCACC 0.3072 CCACG 0.1896 CCACT 0.2259 CCAGA 0.2569 CCAGC 0.2962 CCAGG 0.2103 CCAGT 0.2366 CCATA 0.2129 CCATC 0.2578 CCATG 0.2825 CCATT 0.2468 CCCAA 0.2815 CCCAC 0.2657 CCCAG 0.1857 CCCAT 0.2671 CCCCA 0.2589 CCCCC 0.289 CCCCG 0.178 CCCCT 0.2741 CCCGA 0.2227 CCCGC 0.3293 CCCGG 0.2067 CCCGT 0.2413 CCCTA 0.2162 CCCTC 0.2988 CCCTG 0.215 CCCTT 0.2701 CCGAA 0.2351 CCGAC 0.2581 CCGAG 0.2688 CCGAT 0.2379 CCGCA 0.2054 CCGCC 0.349 CCGCG 0.2402 CCGCT 0.2054 CCGGA 0.2227 CCGGC 0.3386 CCGGG 0.1942 CCGGT 0.2445 CCGTA 0.1667 CCGTC 0.2981 CCGTG 0.2965 CCGTT 0.2387 CCTAA 0.2719 CCTAC 0.2137 CCTAG 0.2514 CCTAT 0.263 CCTCA 0.2184 CCTCC 0.3171 CCTCG 0.1891 CCTCT 0.2754 CCTGA 0.2268 CCTGC 0.3072 CCTGG 0.2148 CCTGT 0.2512 CCTTA 0.1737 CCTTC 0.2614 CCTTG 0.2523 CCTTT 0.3126 CGAAA 0.2687 CGAAC 0.2334 CGAAG 0.2649 CGAAT 0.2331 CGACA 0.268 CGACC 0.2414 CGACG 0.3049 CGACT 0.1857 CGAGA 0.2543 CGAGC 0.2794 CGAGG 0.2724 CGAGT 0.1939 CGATA 0.1836 CGATC 0.2769 CGATG 0.3092 CGATT 0.2303 CGCAA 0.2311 CGCAC 0.2748 CGCAG 0.2534 CGCAT 0.2407 CGCCA 0.2536 CGCCC 0.2272 CGCCG 0.3097 CGCCT 0.2095 CGCGA 0.1944 CGCGC 0.3433 CGCGG 0.2662 CGCGT 0.196 CGCTA 0.1872 CGCTC 0.2811 CGCTG 0.3023 CGCTT 0.2294 CGGAA 0.2127 CGGAC 0.221 CGGAG 0.3143 CGGAT 0.252 CGGCA 0.2183 CGGCC 0.2591 CGGCG 0.3227 CGGCT 0.1998 CGGGA 0.2354 CGGGC 0.2874 CGGGG 0.2683 CGGGT 0.209 CGGTA 0.1758 CGGTC 0.2316 CGGTG 0.343 CGGTT 0.2495 CGTAA 0.2025 CGTAC 0.2828 CGTAG 0.2642 CGTAT 0.2506 CGTCA 0.2262 CGTCC 0.2476 CGTCG 0.3019 CGTCT 0.2243 CGTGA 0.204 CGTGC 0.2828 CGTGG 0.2643 CGTGT 0.2488 CGTTA 0.162 CGTTC 0.2326 CGTTG 0.2981 CGTTT 0.3073 CTAAA 0.364 CTAAC 0.189 CTAAG 0.1703 CTAAT 0.2767 CTACA 0.3276 CTACC 0.215 CTACG 0.1446 CTACT 0.3129 CTAGA 0.2922 CTAGC 0.2617 CTAGG 0.2007 CTAGT 0.2454 CTATA 0.2896 CTATC 0.1909 CTATG 0.2218 CTATT 0.2976 CTCAA 0.2971 CTCAC 0.2268 CTCAG 0.1818 CTCAT 0.2943 CTCCA 0.2973 CTCCC 0.2451 CTCCG 0.1612 CTCCT 0.2964 CTCGA 0.2461 CTCGC 0.2759 CTCGG 0.2119 CTCGT 0.2661 CTCTA 0.2371 CTCTC 0.2938 CTCTG 0.2048 CTCTT 0.2643 CTGAA 0.3235 CTGAC 0.1977 CTGAG 0.1914 CTGAT 0.2874 CTGCA 0.3081 CTGCC 0.2253 CTGCG 0.144 CTGCT 0.3226 CTGGA 0.2773 CTGGC 0.2465 CTGGG 0.1917 CTGGT 0.2845 CTGTA 0.2226 CTGTC 0.2163 CTGTG 0.2388 CTGTT 0.3224 CTTAA 0.2776 CTTAC 0.1793 CTTAG 0.2128 CTTAT 0.3303 CTTCA 0.2875 CTTCC 0.238 CTTCG 0.1489 CTTCT 0.3256 CTTGA 0.2459 CTTGC 0.2335 CTTGG 0.2184 CTTGT 0.3022 CTTTA 0.2025 CTTTC 0.2043 CTTTG 0.2368 CTTTT 0.3564 GAAAA 0.3526 GAAAC 0.2033 GAAAG 0.19 GAAAT 0.2542 GAACA 0.3553 GAACC 0.2237 GAACG 0.1498 GAACT 0.2712 GAAGA 0.3258 GAAGC 0.2316 GAAGG 0.2345 GAAGT 0.2081 GAATA 0.2552 GAATC 0.2191 GAATG 0.2328 GAATT 0.2929 GACAA 0.3115 GACAC 0.2129 GACAG 0.2065 GACAT 0.2692 GACCA 0.3408 GACCC 0.2043 GACCG 0.1936 GACCT 0.2613 GACGA 0.3432 GACGC 0.2186 GACGG 0.2431 GACGT 0.1951 GACTA 0.2522 GACTC 0.2186 GACTG 0.2518 GACTT 0.2774 GAGAA 0.2978 GAGAC 0.1664 GAGAG 0.2909 GAGAT 0.2449 GAGCA 0.3275 GAGCC 0.2113 GAGCG 0.1834 GAGCT 0.2779 GAGGA 0.3221 GAGGC 0.2252 GAGGG 0.2384 GAGGT 0.2143 GAGTA 0.2486 GAGTC 0.1916 GAGTG 0.2566 GAGTT 0.3032 GATAA 0.2888 GATAC 0.1751 GATAG 0.2135 GATAT 0.3226 GATCA 0.2871 GATCC 0.2329 GATCG 0.1923 GATCT 0.2877 GATGA 0.2896 GATGC 0.2139 GATGG 0.258 GATGT 0.2385 GATTA 0.2214 GATTC 0.2105 GATTG 0.2239 GATTT 0.3443 GCAAA 0.3059 GCAAC 0.238 GCAAG 0.2351 GCAAT 0.221 GCACA 0.3186 GCACC 0.239 GCACG 0.2241 GCACT 0.2183 GCAGA 0.2466 GCAGC 0.3097 GCAGG 0.2324 GCAGT 0.2113 GCATA 0.224 GCATC 0.2278 GCATG 0.3227 GCATT 0.2254 GCCAA 0.2575 GCCAC 0.2605 GCCAG 0.2044 GCCAT 0.2776 GCCCA 0.2956 GCCCC 0.2498 GCCCG 0.2045 GCCCT 0.2501 GCCGA 0.2144 GCCGC 0.3333 GCCGG 0.2442 GCCGT 0.2081 GCCTA 0.2028 GCCTC 0.2876 GCCTG 0.2476 GCCTT 0.262 GCGAA 0.2115 GCGAC 0.2619 GCGAG 0.3174 GCGAT 0.2091 GCGCA 0.2196 GCGCC 0.2657 GCGCG 0.3073 GCGCT 0.2074 GCGGA 0.2141 GCGGC 0.3517 GCGGG 0.2354 GCGGT 0.1988 GCGTA 0.1663 GCGTC 0.2712 GCGTG 0.3495 GCGTT 0.213 GCTAA 0.2451 GCTAC 0.2241 GCTAG 0.2902 GCTAT 0.2407 GCTCA 0.2412 GCTCC 0.2705 GCTCG 0.2226 GCTCT 0.2656 GCTGA 0.2236 GCTGC 0.3241 GCTGG 0.2396 GCTGT 0.2127 GCTTA 0.1725 GCTTC 0.2647 GCTTG 0.2792 GCTTT 0.2835 GGAAA 0.3133 GGAAC 0.1962 GGAAG 0.2697 GGAAT 0.2208 GGACA 0.3046 GGACC 0.2245 GGACG 0.2448 GGACT 0.2261 GGAGA 0.2822 GGAGC 0.2273 GGAGG 0.3058 GGAGT 0.1847 GGATA 0.2106 GGATC 0.2343 GGATG 0.294 GGATT 0.2611 GGCAA 0.2662 GGCAC 0.2243 GGCAG 0.2632 GGCAT 0.2463 GGCCA 0.2928 GGCCC 0.22 GGCCG 0.2469 GGCCT 0.2403 GGCGA 0.2488 GGCGC 0.2435 GGCGG 0.3173 GGCGT 0.1904 GGCTA 0.2255 GGCTC 0.2422 GGCTG 0.2861 GGCTT 0.2461 GGGAA 0.2704 GGGAC 0.1775 GGGAG 0.327 GGGAT 0.225 GGGCA 0.273 GGGCC 0.2423 GGGCG 0.2484 GGGCT 0.2363 GGGGA 0.277 GGGGC 0.2329 GGGGG 0.2889 GGGGT 0.2012 GGGTA 0.1925 GGGTC 0.2141 GGGTG 0.3072 GGGTT 0.2862 GGTAA 0.2556 GGTAC 0.2187 GGTAG 0.2603 GGTAT 0.2654 GGTCA 0.2841 GGTCC 0.2277 GGTCG 0.2397 GGTCT 0.2485 GGTGA 0.2387 GGTGC 0.219 GGTGG 0.3111 GGTGT 0.2312 GGTTA 0.1843 GGTTC 0.2143 GGTTG 0.2805 GGTTT 0.3208 GTAAA 0.3443 GTAAC 0.1915 GTAAG 0.1807 GTAAT 0.2834 GTACA 0.3369 GTACC 0.2036 GTACG 0.1745 GTACT 0.285 GTAGA 0.2811 GTAGC 0.2404 GTAGG 0.2029 GTAGT 0.2756 GTATA 0.2825 GTATC 0.1776 GTATG 0.2438 GTATT 0.2962 GTCAA 0.2708 GTCAC 0.2218 GTCAG 0.2052 GTCAT 0.3022 GTCCA 0.3396 GTCCC 0.2049 GTCCG 0.1745 GTCCT 0.2809 GTCGA 0.2441 GTCGC 0.2398 GTCGG 0.2143 GTCGT 0.3017 GTCTA 0.2321 GTCTC 0.2474 GTCTG 0.2383 GTCTT 0.2822 GTGAA 0.2873 GTGAC 0.2049 GTGAG 0.229 GTGAT 0.2789 GTGCA 0.3222 GTGCC 0.2175 GTGCG 0.1767 GTGCT 0.2836 GTGGA 0.2683 GTGGC 0.249 GTGGG 0.2174 GTGGT 0.2653 GTGTA 0.2161 GTGTC 0.1952 GTGTG 0.2889 GTGTT 0.2998 GTTAA 0.263 GTTAC 0.1918 GTTAG 0.2385 GTTAT 0.3066 GTTCA 0.3076 GTTCC 0.2162 GTTCG 0.1639 GTTCT 0.3124 GTTGA 0.2392 GTTGC 0.229 GTTGG 0.2282 GTTGT 0.3036 GTTTA 0.2003 GTTTC 0.1999 GTTTG 0.2622 GTTTT 0.3376 TAAAA 0.3822 TAAAC 0.1712 TAAAG 0.1583 TAAAT 0.2883 TAACA 0.372 TAACC 0.2089 TAACG 0.1134 TAACT 0.3057 TAAGA 0.3151 TAAGC 0.2024 TAAGG 0.209 TAAGT 0.2734 TAATA 0.3004 TAATC 0.1724 TAATG 0.1922 TAATT 0.335 TACAA 0.324 TACAC 0.1911 TACAG 0.1722 TACAT 0.3126 TACCA 0.3612 TACCC 0.1842 TACCG 0.1475 TACCT 0.3071 TACGA 0.2891 TACGC 0.2043 TACGG 0.2072 TACGT 0.2994 TACTA 0.3028 TACTC 0.2003 TACTG 0.2136 TACTT 0.2834 TAGAA 0.313 TAGAC 0.1568 TAGAG 0.2356 TAGAT 0.2947 TAGCA 0.3296 TAGCC 0.1995 TAGCG 0.1238 TAGCT 0.3471 TAGGA 0.2929 TAGGC 0.2087 TAGGG 0.2266 TAGGT 0.2718 TAGTA 0.2799 TAGTC 0.1646 TAGTG 0.2213 TAGTT 0.3342 TATAA 0.2627 TATAC 0.1506 TATAG 0.1751 TATAT 0.4116 TATCA 0.3249 TATCC 0.2021 TATCG 0.1231 TATCT 0.3499 TATGA 0.2605 TATGC 0.203 TATGG 0.2057 TATGT 0.3307 TATTA 0.2448 TATTC 0.1556 TATTG 0.1931 TATTT 0.4065 TCAAA 0.3357 TCAAC 0.2074 TCAAG 0.2065 TCAAT 0.2504 TCACA 0.3174 TCACC 0.2532 TCACG 0.1571 TCACT 0.2724 TCAGA 0.2833 TCAGC 0.2454 TCAGG 0.1971 TCAGT 0.2742 TCATA 0.2298 TCATC 0.2467 TCATG 0.2535 TCATT 0.27 TCCAA 0.2857 TCCAC 0.2238 TCCAG 0.1833 TCCAT 0.3072 TCCCA 0.2723 TCCCC 0.2643 TCCCG 0.149 TCCCT 0.3144 TCCGA 0.2395 TCCGC 0.2769 TCCGG 0.2192 TCCGT 0.2644 TCCTA 0.2072 TCCTC 0.2993 TCCTG 0.199 TCCTT 0.2945 TCGAA 0.2329 TCGAC 0.2319 TCGAG 0.2461 TCGAT 0.2891 TCGCA 0.2168 TCGCC 0.3119 TCGCG 0.1999 TCGCT 0.2713 TCGGA 0.2325 TCGGC 0.284 TCGGG 0.1999 TCGGT 0.2836 TCGTA 0.1699 TCGTC 0.3073 TCGTG 0.2613 TCGTT 0.2616 TCTAA 0.2614 TCTAC 0.1954 TCTAG 0.2416 TCTAT 0.3016 TCTCA 0.2375 TCTCC 0.2525 TCTCG 0.1524 TCTCT 0.3576 TCTGA 0.2557 TCTGC 0.2557 TCTGG 0.2059 TCTGT 0.2828 TCTTA 0.1855 TCTTC 0.2572 TCTTG 0.2298 TCTTT 0.3275 TGAAA 0.3184 TGAAC 0.1945 TGAAG 0.227 TGAAT 0.26 TGACA 0.3452 TGACC 0.2212 TGACG 0.1767 TGACT 0.2569 TGAGA 0.2953 TGAGC 0.2256 TGAGG 0.2344 TGAGT 0.2447 TGATA 0.2267 TGATC 0.1934 TGATG 0.2912 TGATT 0.2887 TGCAA 0.2668 TGCAC 0.2032 TGCAG 0.22 TGCAT 0.3101 TGCCA 0.3154 TGCCC 0.2173 TGCCG 0.1823 TGCCT 0.285 TGCGA 0.2266 TGCGC 0.2637 TGCGG 0.2446 TGCGT 0.2651 TGCTA 0.2266 TGCTC 0.2282 TGCTG 0.256 TGCTT 0.2893 TGGAA 0.2677 TGGAC 0.1926 TGGAG 0.2596 TGGAT 0.2801 TGGCA 0.2896 TGGCC 0.2357 TGGCG 0.2026 TGGCT 0.2722 TGGGA 0.2611 TGGGC 0.252 TGGGG 0.2367 TGGGT 0.2503 TGGTA 0.203 TGGTC 0.1922 TGGTG 0.2989 TGGTT 0.3059 TGTAA 0.2551 TGTAC 0.2039 TGTAG 0.2235 TGTAT 0.3175 TGTCA 0.3094 TGTCC 0.2156 TGTCG 0.1857 TGTCT 0.2893 TGTGA 0.2347 TGTGC 0.229 TGTGG 0.2202 TGTGT 0.316 TGTTA 0.1826 TGTTC 0.1894 TGTTG 0.2607 TGTTT 0.3673 TTAAA 0.361 TTAAC 0.1603 TTAAG 0.1708 TTAAT 0.308 TTACA 0.3689 TTACC 0.2083 TTACG 0.1093 TTACT 0.3135 TTAGA 0.2944 TTAGC 0.2058 TTAGG 0.2021 TTAGT 0.2976 TTATA 0.2794 TTATC 0.1661 TTATG 0.1993 TTATT 0.3553 TTCAA 0.2937 TTCAC 0.1904 TTCAG 0.2056 TTCAT 0.3103 TTCCA 0.3275 TTCCC 0.2166 TTCCG 0.1165 TTCCT 0.3393 TTCGA 0.2621 TTCGC 0.207 TTCGG 0.2086 TTCGT 0.3223 TTCTA 0.2376 TTCTC 0.2269 TTCTG 0.1928 TTCTT 0.3427 TTGAA 0.3064 TTGAC 0.1731 TTGAG 0.2075 TTGAT 0.313 TTGCA 0.3407 TTGCC 0.2078 TTGCG 0.1197 TTGCT 0.3318 TTGGA 0.2877 TTGGC 0.2066 TTGGG 0.1934 TTGGT 0.3124 TTGTA 0.2317 TTGTC 0.1806 TTGTG 0.2261 TTGTT 0.3615 TTTAA 0.2742 TTTAC 0.1597 TTTAG 0.2126 TTTAT 0.3535 TTTCA 0.3013 TTTCC 0.2065 TTTCG 0.1129 TTTCT 0.3793 TTTGA 0.2527 TTTGC 0.1921 TTTGG 0.2348 TTTGT 0.3204 TTTTA 0.2261 TTTTC 0.1753 TTTTG 0.1974 TTTTT 0.4011 [2] # (a,c,g,t)= (0.237, 0.263, 0.263, 0.237) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275 # l= 1 # Values AA 0.0827 AC 0.056 AG 0.0608 AT 0.0754 CA 0.0684 CC 0.0526 CG 0.0431 CT 0.0608 GA 0.0599 GC 0.0564 GG 0.0526 GT 0.056 TA 0.0639 TC 0.06 TG 0.0684 TT 0.0827 # l= 2 # Values AAA 0.029 AAC 0.0163 AAG 0.0165 AAT 0.0209 ACA 0.0188 ACC 0.0128 ACG 0.0103 ACT 0.0142 AGA 0.0178 AGC 0.0149 AGG 0.0139 AGT 0.0142 ATA 0.0201 ATC 0.0156 ATG 0.0189 ATT 0.0209 CAA 0.0196 CAC 0.0154 CAG 0.0145 CAT 0.0189 CCA 0.0163 CCC 0.012 CCG 0.0104 CCT 0.014 CGA 0.011 CGC 0.0115 CGG 0.0104 CGT 0.0103 CTA 0.0144 CTC 0.0154 CTG 0.0145 CTT 0.0165 GAA 0.0169 GAC 0.012 GAG 0.0154 GAT 0.0156 GCA 0.0165 GCC 0.0135 GCG 0.0115 GCT 0.0149 GGA 0.0144 GGC 0.0135 GGG 0.0119 GGT 0.0128 GTA 0.0123 GTC 0.012 GTG 0.0154 GTT 0.0163 TAA 0.0172 TAC 0.0123 TAG 0.0144 TAT 0.0201 TCA 0.0168 TCC 0.0144 TCG 0.011 TCT 0.0178 TGA 0.0168 TGC 0.0165 TGG 0.0163 TGT 0.0188 TTA 0.0172 TTC 0.0169 TTG 0.0196 TTT 0.029 # l= 3 # Values AAAA 0.0108 AAAC 0.00553 AAAG 0.00508 AAAT 0.00756 AACA 0.00603 AACC 0.00353 AACG 0.00235 AACT 0.0044 AAGA 0.00515 AAGC 0.00374 AAGG 0.00378 AAGT 0.00387 AATA 0.00609 AATC 0.00407 AATG 0.00452 AATT 0.00618 ACAA 0.00597 ACAC 0.00405 ACAG 0.00357 ACAT 0.00519 ACCA 0.00452 ACCC 0.00256 ACCG 0.00241 ACCT 0.00328 ACGA 0.00313 ACGC 0.00241 ACGG 0.00241 ACGT 0.00236 ACTA 0.00389 ACTC 0.00302 ACTG 0.00341 ACTT 0.00387 AGAA 0.00561 AGAC 0.00304 AGAG 0.00455 AGAT 0.00462 AGCA 0.00491 AGCC 0.00312 AGCG 0.00248 AGCT 0.00436 AGGA 0.00422 AGGC 0.00323 AGGG 0.00322 AGGT 0.00328 AGTA 0.00361 AGTC 0.00264 AGTG 0.00353 AGTT 0.0044 ATAA 0.00576 ATAC 0.00336 ATAG 0.0038 ATAT 0.00715 ATCA 0.00492 ATCC 0.00349 ATCG 0.00259 ATCT 0.00462 ATGA 0.00498 ATGC 0.00424 ATGG 0.00451 ATGT 0.00519 ATTA 0.00502 ATTC 0.00388 ATTG 0.0044 ATTT 0.00756 CAAA 0.00649 CAAC 0.00444 CAAG 0.00427 CAAT 0.0044 CACA 0.00478 CACC 0.004 CACG 0.00312 CACT 0.00353 CAGA 0.00379 CAGC 0.00411 CAGG 0.00317 CAGT 0.0034 CATA 0.00432 CATC 0.00452 CATG 0.00555 CATT 0.00453 CCAA 0.00451 CCAC 0.0041 CCAG 0.00322 CCAT 0.00451 CCCA 0.0033 CCCC 0.0032 CCCG 0.00223 CCCT 0.00322 CCGA 0.00237 CCGC 0.00315 CCGG 0.00246 CCGT 0.00241 CCTA 0.00289 CCTC 0.00411 CCTG 0.00317 CCTT 0.00378 CGAA 0.00251 CGAC 0.00288 CGAG 0.003 CGAT 0.00258 CGCA 0.00254 CGCC 0.00347 CGCG 0.00298 CGCT 0.00247 CGGA 0.00233 CGGC 0.00342 CGGG 0.00223 CGGT 0.00241 CGTA 0.00185 CGTC 0.00298 CGTG 0.00312 CGTT 0.00236 CTAA 0.0037 CTAC 0.00312 CTAG 0.00377 CTAT 0.0038 CTCA 0.00356 CTCC 0.00431 CTCG 0.003 CTCT 0.00454 CTGA 0.00341 CTGC 0.00428 CTGG 0.00322 CTGT 0.00357 CTTA 0.00294 CTTC 0.00424 CTTG 0.00427 CTTT 0.00508 GAAA 0.00543 GAAC 0.00339 GAAG 0.00425 GAAT 0.00387 GACA 0.00366 GACC 0.00274 GACG 0.00297 GACT 0.00264 GAGA 0.00463 GAGC 0.00364 GAGG 0.00411 GAGT 0.00303 GATA 0.0034 GATC 0.00362 GATG 0.00452 GATT 0.00407 GCAA 0.00428 GCAC 0.0037 GCAG 0.00428 GCAT 0.00424 GCCA 0.00391 GCCC 0.00299 GCCG 0.00342 GCCT 0.00323 GCGA 0.00264 GCGC 0.00327 GCGG 0.00314 GCGT 0.00241 GCTA 0.00338 GCTC 0.00364 GCTG 0.00411 GCTT 0.00374 GGAA 0.00377 GGAC 0.0028 GGAG 0.00431 GGAT 0.00349 GGCA 0.00358 GGCC 0.00338 GGCG 0.00347 GGCT 0.00312 GGGA 0.0032 GGGC 0.00299 GGGG 0.0032 GGGT 0.00256 GGTA 0.0025 GGTC 0.00274 GGTG 0.004 GGTT 0.00353 GTAA 0.00295 GTAC 0.00284 GTAG 0.00312 GTAT 0.00336 GTCA 0.00329 GTCC 0.0028 GTCG 0.00288 GTCT 0.00304 GTGA 0.00357 GTGC 0.0037 GTGG 0.0041 GTGT 0.00405 GTTA 0.00295 GTTC 0.00339 GTTG 0.00444 GTTT 0.00553 TAAA 0.00625 TAAC 0.00295 TAAG 0.00294 TAAT 0.00502 TACA 0.0043 TACC 0.0025 TACG 0.00185 TACT 0.00361 TAGA 0.00424 TAGC 0.00338 TAGG 0.00289 TAGT 0.00388 TATA 0.00626 TATC 0.0034 TATG 0.00432 TATT 0.00609 TCAA 0.00484 TCAC 0.00357 TCAG 0.00342 TCAT 0.00498 TCCA 0.00461 TCCC 0.00321 TCCG 0.00233 TCCT 0.00422 TCGA 0.00282 TCGC 0.00264 TCGG 0.00237 TCGT 0.00313 TCTA 0.00424 TCTC 0.00463 TCTG 0.00379 TCTT 0.00515 TGAA 0.00504 TGAC 0.00329 TGAG 0.00356 TGAT 0.00492 TGCA 0.00547 TGCC 0.00358 TGCG 0.00254 TGCT 0.00492 TGGA 0.00461 TGGC 0.00391 TGGG 0.00329 TGGT 0.00452 TGTA 0.0043 TGTC 0.00366 TGTG 0.00478 TGTT 0.00603 TTAA 0.00475 TTAC 0.00295 TTAG 0.0037 TTAT 0.00576 TTCA 0.00504 TTCC 0.00377 TTCG 0.00251 TTCT 0.00561 TTGA 0.00484 TTGC 0.00428 TTGG 0.00451 TTGT 0.00597 TTTA 0.00625 TTTC 0.00543 TTTG 0.00649 TTTT 0.0108 # l= 4 # Values AAAAA 0.00444 AAAAC 0.00186 AAAAG 0.0018 AAAAT 0.00275 AAACA 0.00219 AAACC 0.00112 AAACG 0.000708 AAACT 0.00151 AAAGA 0.00167 AAAGC 0.00105 AAAGG 0.00117 AAAGT 0.00119 AAATA 0.00246 AAATC 0.00138 AAATG 0.00158 AAATT 0.00214 AACAA 0.00215 AACAC 0.00116 AACAG 0.00112 AACAT 0.0016 AACCA 0.00135 AACCC 0.000713 AACCG 0.000578 AACCT 0.000887 AACGA 0.000793 AACGC 0.000497 AACGG 0.00055 AACGT 0.000518 AACTA 0.00126 AACTC 0.000886 AACTG 0.00101 AACTT 0.00124 AAGAA 0.00191 AAGAC 0.000832 AAGAG 0.00115 AAGAT 0.00126 AAGCA 0.00136 AAGCC 0.000747 AAGCG 0.000545 AAGCT 0.00108 AAGGA 0.0012 AAGGC 0.000818 AAGGG 0.000842 AAGGT 0.000915 AAGTA 0.000975 AAGTC 0.000709 AAGTG 0.000941 AAGTT 0.00124 AATAA 0.00205 AATAC 0.000969 AATAG 0.0011 AATAT 0.00196 AATCA 0.00139 AATCC 0.000894 AATCG 0.000566 AATCT 0.00122 AATGA 0.00131 AATGC 0.000919 AATGG 0.00108 AATGT 0.00122 AATTA 0.00167 AATTC 0.00112 AATTG 0.00124 AATTT 0.00214 ACAAA 0.00205 ACAAC 0.0013 ACAAG 0.00126 ACAAT 0.00135 ACACA 0.00149 ACACC 0.000895 ACACG 0.000758 ACACT 0.000908 ACAGA 0.00105 ACAGC 0.000855 ACAGG 0.000781 ACAGT 0.000884 ACATA 0.00142 ACATC 0.00103 ACATG 0.00152 ACATT 0.00122 ACCAA 0.00138 ACCAC 0.00107 ACCAG 0.000889 ACCAT 0.00119 ACCCA 0.000794 ACCCC 0.000629 ACCCG 0.000445 ACCCT 0.00069 ACCGA 0.000656 ACCGC 0.000616 ACCGG 0.00057 ACCGT 0.000568 ACCTA 0.000768 ACCTC 0.00085 ACCTG 0.00075 ACCTT 0.000915 ACGAA 0.000808 ACGAC 0.000867 ACGAG 0.000788 ACGAT 0.000671 ACGCA 0.000671 ACGCC 0.000652 ACGCG 0.000573 ACGCT 0.000508 ACGGA 0.000608 ACGGC 0.000707 ACGGG 0.00053 ACGGT 0.000568 ACGTA 0.00057 ACGTC 0.000562 ACGTG 0.000711 ACGTT 0.000518 ACTAA 0.00109 ACTAC 0.000858 ACTAG 0.000915 ACTAT 0.00102 ACTCA 0.000848 ACTCC 0.000772 ACTCG 0.000561 ACTCT 0.000845 ACTGA 0.000908 ACTGC 0.000878 ACTGG 0.000735 ACTGT 0.000884 ACTTA 0.000787 ACTTC 0.000836 ACTTG 0.00105 ACTTT 0.00119 AGAAA 0.00204 AGAAC 0.00102 AGAAG 0.00137 AGAAT 0.00119 AGACA 0.00103 AGACC 0.000652 AGACG 0.000637 AGACT 0.000715 AGAGA 0.00166 AGAGC 0.000934 AGAGG 0.0011 AGAGT 0.000845 AGATA 0.00118 AGATC 0.00101 AGATG 0.00122 AGATT 0.00122 AGCAA 0.00141 AGCAC 0.00102 AGCAG 0.00136 AGCAT 0.00112 AGCCA 0.00103 AGCCC 0.000678 AGCCG 0.000649 AGCCT 0.00077 AGCGA 0.000697 AGCGC 0.000651 AGCGG 0.000618 AGCGT 0.000508 AGCTA 0.0012 AGCTC 0.000993 AGCTG 0.00108 AGCTT 0.00108 AGGAA 0.00125 AGGAC 0.000756 AGGAG 0.00126 AGGAT 0.000953 AGGCA 0.000985 AGGCC 0.000776 AGGCG 0.000699 AGGCT 0.00077 AGGGA 0.00098 AGGGC 0.000712 AGGGG 0.000838 AGGGT 0.00069 AGGTA 0.000746 AGGTC 0.000698 AGGTG 0.000952 AGGTT 0.000887 AGTAA 0.000915 AGTAC 0.000785 AGTAG 0.000979 AGTAT 0.000935 AGTCA 0.000812 AGTCC 0.000608 AGTCG 0.000509 AGTCT 0.000715 AGTGA 0.000943 AGTGC 0.000782 AGTGG 0.000896 AGTGT 0.000908 AGTTA 0.000885 AGTTC 0.000883 AGTTG 0.00111 AGTTT 0.00151 ATAAA 0.0022 ATAAC 0.000886 ATAAG 0.000963 ATAAT 0.00171 ATACA 0.00134 ATACC 0.00064 ATACG 0.000444 ATACT 0.000935 ATAGA 0.00126 ATAGC 0.000774 ATAGG 0.000743 ATAGT 0.00102 ATATA 0.00257 ATATC 0.00108 ATATG 0.00154 ATATT 0.00196 ATCAA 0.0015 ATCAC 0.000976 ATCAG 0.000971 ATCAT 0.00146 ATCCA 0.00127 ATCCC 0.000694 ATCCG 0.000571 ATCCT 0.000953 ATCGA 0.000818 ATCGC 0.000541 ATCGG 0.000553 ATCGT 0.000671 ATCTA 0.00124 ATCTC 0.0011 ATCTG 0.00101 ATCTT 0.00126 ATGAA 0.00153 ATGAC 0.000957 ATGAG 0.00103 ATGAT 0.00146 ATGCA 0.00168 ATGCC 0.000839 ATGCG 0.000599 ATGCT 0.00112 ATGGA 0.0014 ATGGC 0.00106 ATGGG 0.000855 ATGGT 0.00119 ATGTA 0.00132 ATGTC 0.000943 ATGTG 0.00132 ATGTT 0.0016 ATTAA 0.00146 ATTAC 0.000828 ATTAG 0.00103 ATTAT 0.00171 ATTCA 0.00129 ATTCC 0.000813 ATTCG 0.000575 ATTCT 0.00119 ATTGA 0.00119 ATTGC 0.000917 ATTGG 0.000941 ATTGT 0.00135 ATTTA 0.00178 ATTTC 0.00134 ATTTG 0.00169 ATTTT 0.00275 CAAAA 0.00212 CAAAC 0.00146 CAAAG 0.00122 CAAAT 0.00169 CAACA 0.0016 CAACC 0.00101 CAACG 0.000711 CAACT 0.00111 CAAGA 0.00118 CAAGC 0.00107 CAAGG 0.000969 CAAGT 0.00105 CAATA 0.00117 CAATC 0.000919 CAATG 0.00107 CAATT 0.00124 CACAA 0.00136 CACAC 0.00123 CACAG 0.000872 CACAT 0.00132 CACCA 0.0014 CACCC 0.000801 CACCG 0.000847 CACCT 0.000952 CACGA 0.000814 CACGC 0.000859 CACGG 0.000735 CACGT 0.000711 CACTA 0.00087 CACTC 0.000805 CACTG 0.000912 CACTT 0.000941 CAGAA 0.00109 CAGAC 0.00074 CAGAG 0.000952 CAGAT 0.00101 CAGCA 0.00132 CAGCC 0.000928 CAGCG 0.000776 CAGCT 0.00108 CAGGA 0.000866 CAGGC 0.000835 CAGGG 0.000718 CAGGT 0.00075 CAGTA 0.000791 CAGTC 0.00069 CAGTG 0.000912 CAGTT 0.00101 CATAA 0.00113 CATAC 0.000827 CATAG 0.000836 CATAT 0.00154 CATCA 0.00146 CATCC 0.00104 CATCG 0.000809 CATCT 0.00122 CATGA 0.00128 CATGC 0.00144 CATGG 0.0013 CATGT 0.00152 CATTA 0.000965 CATTC 0.000914 CATTG 0.00107 CATTT 0.00158 CCAAA 0.00156 CCAAC 0.00105 CCAAG 0.000959 CCAAT 0.000941 CCACA 0.00109 CCACC 0.00128 CCACG 0.000838 CCACT 0.000896 CCAGA 0.000794 CCAGC 0.001 CCAGG 0.000688 CCAGT 0.000735 CCATA 0.000913 CCATC 0.00121 CCATG 0.0013 CCATT 0.00108 CCCAA 0.000897 CCCAC 0.000911 CCCAG 0.000632 CCCAT 0.000855 CCCCA 0.000799 CCCCC 0.000946 CCCCG 0.000615 CCCCT 0.000838 CCCGA 0.000476 CCCGC 0.000739 CCCGG 0.000487 CCCGT 0.00053 CCCTA 0.000669 CCCTC 0.00099 CCCTG 0.000718 CCCTT 0.000842 CCGAA 0.000534 CCGAC 0.000634 CCGAG 0.000649 CCGAT 0.000553 CCGCA 0.000626 CCGCC 0.00111 CCGCG 0.000795 CCGCT 0.000618 CCGGA 0.000529 CCGGC 0.000872 CCGGG 0.000487 CCGGT 0.00057 CCGTA 0.000385 CCGTC 0.000743 CCGTG 0.000735 CCGTT 0.00055 CCTAA 0.000758 CCTAC 0.000638 CCTAG 0.000746 CCTAT 0.000743 CCTCA 0.000847 CCTCC 0.00134 CCTCG 0.000825 CCTCT 0.0011 CCTGA 0.000691 CCTGC 0.00101 CCTGG 0.000688 CCTGT 0.000781 CCTTA 0.000626 CCTTC 0.00101 CCTTG 0.000969 CCTTT 0.00117 CGAAA 0.000667 CGAAC 0.000606 CGAAG 0.000666 CGAAT 0.000575 CGACA 0.000729 CGACC 0.000699 CGACG 0.000943 CGACT 0.000509 CGAGA 0.000747 CGAGC 0.000864 CGAGG 0.000825 CGAGT 0.000561 CGATA 0.000446 CGATC 0.000764 CGATG 0.000809 CGATT 0.000566 CGCAA 0.00056 CGCAC 0.000713 CGCAG 0.000666 CGCAT 0.000599 CGCCA 0.000861 CGCCC 0.000784 CGCCG 0.00112 CGCCT 0.000699 CGCGA 0.000555 CGCGC 0.00106 CGCGG 0.000795 CGCGT 0.000573 CGCTA 0.000445 CGCTC 0.000711 CGCTG 0.000776 CGCTT 0.000545 CGGAA 0.000483 CGGAC 0.000539 CGGAG 0.000738 CGGAT 0.000571 CGGCA 0.000729 CGGCC 0.000916 CGGCG 0.00112 CGGCT 0.000649 CGGGA 0.000517 CGGGC 0.000656 CGGGG 0.000615 CGGGT 0.000445 CGGTA 0.00041 CGGTC 0.000574 CGGTG 0.000847 CGGTT 0.000578 CGTAA 0.000353 CGTAC 0.000566 CGTAG 0.000486 CGTAT 0.000444 CGTCA 0.000645 CGTCC 0.000746 CGTCG 0.000943 CGTCT 0.000637 CGTGA 0.000615 CGTGC 0.000909 CGTGG 0.000838 CGTGT 0.000758 CGTTA 0.000363 CGTTC 0.000572 CGTTG 0.000711 CGTTT 0.000708 CTAAA 0.00133 CTAAC 0.000714 CTAAG 0.00063 CTAAT 0.00103 CTACA 0.000977 CTACC 0.000679 CTACG 0.000486 CTACT 0.000979 CTAGA 0.00105 CTAGC 0.00105 CTAGG 0.000746 CTAGT 0.000915 CTATA 0.00111 CTATC 0.00075 CTATG 0.000836 CTATT 0.0011 CTCAA 0.00102 CTCAC 0.000845 CTCAG 0.00067 CTCAT 0.00103 CTCCA 0.00124 CTCCC 0.00107 CTCCG 0.000738 CTCCT 0.00126 CTCGA 0.000706 CTCGC 0.000853 CTCGG 0.000649 CTCGT 0.000788 CTCTA 0.00103 CTCTC 0.00142 CTCTG 0.000952 CTCTT 0.00115 CTGAA 0.00107 CTGAC 0.000705 CTGAG 0.00067 CTGAT 0.000971 CTGCA 0.00125 CTGCC 0.000998 CTGCG 0.000666 CTGCT 0.00136 CTGGA 0.000868 CTGGC 0.000831 CTGGG 0.000632 CTGGT 0.000889 CTGTA 0.000777 CTGTC 0.000802 CTGTG 0.000872 CTGTT 0.00112 CTTAA 0.000807 CTTAC 0.000536 CTTAG 0.00063 CTTAT 0.000963 CTTCA 0.00117 CTTCC 0.00105 CTTCG 0.000666 CTTCT 0.00137 CTTGA 0.00101 CTTGC 0.00104 CTTGG 0.000959 CTTGT 0.00126 CTTTA 0.000999 CTTTC 0.00106 CTTTG 0.00122 CTTTT 0.0018 GAAAA 0.00191 GAAAC 0.00112 GAAAG 0.00106 GAAAT 0.00134 GAACA 0.00117 GAACC 0.00077 GAACG 0.000572 GAACT 0.000883 GAAGA 0.00139 GAAGC 0.00101 GAAGG 0.00101 GAAGT 0.000836 GAATA 0.00096 GAATC 0.000883 GAATG 0.000914 GAATT 0.00112 GACAA 0.0011 GACAC 0.000814 GACAG 0.000802 GACAT 0.000943 GACCA 0.000899 GACCC 0.00057 GACCG 0.000574 GACCT 0.000698 GACGA 0.00101 GACGC 0.000664 GACGG 0.000743 GACGT 0.000562 GACTA 0.000647 GACTC 0.000597 GACTG 0.00069 GACTT 0.000709 GAGAA 0.00132 GAGAC 0.000789 GAGAG 0.00142 GAGAT 0.0011 GAGCA 0.00116 GAGCC 0.000773 GAGCG 0.000711 GAGCT 0.000993 GAGGA 0.00132 GAGGC 0.000955 GAGGG 0.00099 GAGGT 0.00085 GAGTA 0.000737 GAGTC 0.000597 GAGTG 0.000805 GAGTT 0.000886 GATAA 0.000961 GATAC 0.000609 GATAG 0.00075 GATAT 0.00108 GATCA 0.000998 GATCC 0.000849 GATCG 0.000764 GATCT 0.00101 GATGA 0.00128 GATGC 0.000994 GATGG 0.00121 GATGT 0.00103 GATTA 0.000891 GATTC 0.000883 GATTG 0.000919 GATTT 0.00138 GCAAA 0.00127 GCAAC 0.00105 GCAAG 0.00104 GCAAT 0.000917 GCACA 0.00112 GCACC 0.000891 GCACG 0.000909 GCACT 0.000782 GCAGA 0.00101 GCAGC 0.00138 GCAGG 0.00101 GCAGT 0.000878 GCATA 0.00089 GCATC 0.000994 GCATG 0.00144 GCATT 0.000919 GCCAA 0.000964 GCCAC 0.00105 GCCAG 0.000831 GCCAT 0.00106 GCCCA 0.000863 GCCCC 0.000756 GCCCG 0.000656 GCCCT 0.000712 GCCGA 0.000699 GCCGC 0.00114 GCCGG 0.000872 GCCGT 0.000707 GCCTA 0.000619 GCCTC 0.000955 GCCTG 0.000835 GCCTT 0.000818 GCGAA 0.000536 GCGAC 0.000709 GCGAG 0.000853 GCGAT 0.000541 GCGCA 0.000695 GCGCC 0.000869 GCGCG 0.00106 GCGCT 0.000651 GCGGA 0.000653 GCGGC 0.00114 GCGGG 0.000739 GCGGT 0.000616 GCGTA 0.000387 GCGTC 0.000664 GCGTG 0.000859 GCGTT 0.000497 GCTAA 0.000784 GCTAC 0.000771 GCTAG 0.00105 GCTAT 0.000774 GCTCA 0.000837 GCTCC 0.001 GCTCG 0.000864 GCTCT 0.000934 GCTGA 0.000873 GCTGC 0.00138 GCTGG 0.001 GCTGT 0.000855 GCTTA 0.000614 GCTTC 0.00101 GCTTG 0.00107 GCTTT 0.00105 GGAAA 0.00115 GGAAC 0.000758 GGAAG 0.00105 GGAAT 0.000813 GGACA 0.000811 GGACC 0.000638 GGACG 0.000746 GGACT 0.000608 GGAGA 0.00119 GGAGC 0.001 GGAGG 0.00134 GGAGT 0.000772 GGATA 0.000706 GGATC 0.000849 GGATG 0.00104 GGATT 0.000894 GGCAA 0.000915 GGCAC 0.000825 GGCAG 0.000998 GGCAT 0.000839 GGCCA 0.000942 GGCCC 0.000742 GGCCG 0.000916 GGCCT 0.000776 GGCGA 0.000839 GGCGC 0.000869 GGCGG 0.00111 GGCGT 0.000652 GGCTA 0.000674 GGCTC 0.000773 GGCTG 0.000928 GGCTT 0.000747 GGGAA 0.000845 GGGAC 0.000594 GGGAG 0.00107 GGGAT 0.000694 GGGCA 0.000785 GGGCC 0.000742 GGGCG 0.000784 GGGCT 0.000678 GGGGA 0.000869 GGGGC 0.000756 GGGGG 0.000946 GGGGT 0.000629 GGGTA 0.000474 GGGTC 0.00057 GGGTG 0.000801 GGGTT 0.000713 GGTAA 0.000616 GGTAC 0.000569 GGTAG 0.000679 GGTAT 0.00064 GGTCA 0.00075 GGTCC 0.000638 GGTCG 0.000699 GGTCT 0.000652 GGTGA 0.00093 GGTGC 0.000891 GGTGG 0.00128 GGTGT 0.000895 GGTTA 0.00063 GGTTC 0.00077 GGTTG 0.00101 GGTTT 0.00112 GTAAA 0.00101 GTAAC 0.000582 GTAAG 0.000536 GTAAT 0.000828 GTACA 0.000915 GTACC 0.000569 GTACG 0.000566 GTACT 0.000785 GTAGA 0.000856 GTAGC 0.000771 GTAGG 0.000638 GTAGT 0.000858 GTATA 0.00096 GTATC 0.000609 GTATG 0.000827 GTATT 0.000969 GTCAA 0.000869 GTCAC 0.000758 GTCAG 0.000705 GTCAT 0.000957 GTCCA 0.000914 GTCCC 0.000594 GTCCG 0.000539 GTCCT 0.000756 GTCGA 0.000671 GTCGC 0.000709 GTCGG 0.000634 GTCGT 0.000867 GTCTA 0.000679 GTCTC 0.000789 GTCTG 0.00074 GTCTT 0.000832 GTGAA 0.000994 GTGAC 0.000758 GTGAG 0.000845 GTGAT 0.000976 GTGCA 0.00115 GTGCC 0.000825 GTGCG 0.000713 GTGCT 0.00102 GTGGA 0.00107 GTGGC 0.00105 GTGGG 0.000911 GTGGT 0.00107 GTGTA 0.000849 GTGTC 0.000814 GTGTG 0.00123 GTGTT 0.00116 GTTAA 0.000768 GTTAC 0.000582 GTTAG 0.000714 GTTAT 0.000886 GTTCA 0.00101 GTTCC 0.000758 GTTCG 0.000606 GTTCT 0.00102 GTTGA 0.00103 GTTGC 0.00105 GTTGG 0.00105 GTTGT 0.0013 GTTTA 0.00109 GTTTC 0.00112 GTTTG 0.00146 GTTTT 0.00186 TAAAA 0.00237 TAAAC 0.00109 TAAAG 0.000999 TAAAT 0.00178 TAACA 0.00107 TAACC 0.00063 TAACG 0.000363 TAACT 0.000885 TAAGA 0.000913 TAAGC 0.000614 TAAGG 0.000626 TAAGT 0.000787 TAATA 0.00149 TAATC 0.000891 TAATG 0.000965 TAATT 0.00167 TACAA 0.00135 TACAC 0.000849 TACAG 0.000777 TACAT 0.00132 TACCA 0.000874 TACCC 0.000474 TACCG 0.00041 TACCT 0.000746 TACGA 0.000507 TACGC 0.000387 TACGG 0.000385 TACGT 0.00057 TACTA 0.00111 TACTC 0.000737 TACTG 0.000791 TACTT 0.000975 TAGAA 0.00129 TAGAC 0.000679 TAGAG 0.00103 TAGAT 0.00124 TAGCA 0.00107 TAGCC 0.000674 TAGCG 0.000445 TAGCT 0.0012 TAGGA 0.000831 TAGGC 0.000619 TAGGG 0.000669 TAGGT 0.000768 TAGTA 0.00111 TAGTC 0.000647 TAGTG 0.00087 TAGTT 0.00126 TATAA 0.00162 TATAC 0.00096 TATAG 0.00111 TATAT 0.00257 TATCA 0.00107 TATCC 0.000706 TATCG 0.000446 TATCT 0.00118 TATGA 0.00111 TATGC 0.00089 TATGG 0.000913 TATGT 0.00142 TATTA 0.00149 TATTC 0.00096 TATTG 0.00117 TATTT 0.00246 TCAAA 0.00161 TCAAC 0.00103 TCAAG 0.00101 TCAAT 0.00119 TCACA 0.00109 TCACC 0.00093 TCACG 0.000615 TCACT 0.000943 TCAGA 0.00094 TCAGC 0.000873 TCAGG 0.000691 TCAGT 0.000908 TCATA 0.00111 TCATC 0.00128 TCATG 0.00128 TCATT 0.00131 TCCAA 0.00127 TCCAC 0.00107 TCCAG 0.000868 TCCAT 0.0014 TCCCA 0.000839 TCCCC 0.000869 TCCCG 0.000517 TCCCT 0.00098 TCCGA 0.00054 TCCGC 0.000653 TCCGG 0.000529 TCCGT 0.000608 TCCTA 0.000831 TCCTC 0.00132 TCCTG 0.000866 TCCTT 0.0012 TCGAA 0.000628 TCGAC 0.000671 TCGAG 0.000706 TCGAT 0.000818 TCGCA 0.000545 TCGCC 0.000839 TCGCG 0.000555 TCGCT 0.000697 TCGGA 0.00054 TCGGC 0.000699 TCGGG 0.000476 TCGGT 0.000656 TCGTA 0.000507 TCGTC 0.00101 TCGTG 0.000814 TCGTT 0.000793 TCTAA 0.00107 TCTAC 0.000856 TCTAG 0.00105 TCTAT 0.00126 TCTCA 0.00103 TCTCC 0.00119 TCTCG 0.000747 TCTCT 0.00166 TCTGA 0.00094 TCTGC 0.00101 TCTGG 0.000794 TCTGT 0.00105 TCTTA 0.000913 TCTTC 0.00139 TCTTG 0.00118 TCTTT 0.00167 TGAAA 0.00157 TGAAC 0.00101 TGAAG 0.00117 TGAAT 0.00129 TGACA 0.00108 TGACC 0.00075 TGACG 0.000645 TGACT 0.000812 TGAGA 0.00103 TGAGC 0.000837 TGAGG 0.000847 TGAGT 0.000848 TGATA 0.00107 TGATC 0.000998 TGATG 0.00146 TGATT 0.00139 TGCAA 0.00139 TGCAC 0.00115 TGCAG 0.00125 TGCAT 0.00168 TGCCA 0.00108 TGCCC 0.000785 TGCCG 0.000729 TGCCT 0.000985 TGCGA 0.000545 TGCGC 0.000695 TGCGG 0.000626 TGCGT 0.000671 TGCTA 0.00107 TGCTC 0.00116 TGCTG 0.00132 TGCTT 0.00136 TGGAA 0.00119 TGGAC 0.000914 TGGAG 0.00124 TGGAT 0.00127 TGGCA 0.00108 TGGCC 0.000942 TGGCG 0.000861 TGGCT 0.00103 TGGGA 0.000839 TGGGC 0.000863 TGGGG 0.000799 TGGGT 0.000794 TGGTA 0.000874 TGGTC 0.000899 TGGTG 0.0014 TGGTT 0.00135 TGTAA 0.00107 TGTAC 0.000915 TGTAG 0.000977 TGTAT 0.00134 TGTCA 0.00108 TGTCC 0.000811 TGTCG 0.000729 TGTCT 0.00103 TGTGA 0.00109 TGTGC 0.00112 TGTGG 0.00109 TGTGT 0.00149 TGTTA 0.00107 TGTTC 0.00117 TGTTG 0.0016 TGTTT 0.00219 TTAAA 0.00171 TTAAC 0.000768 TTAAG 0.000807 TTAAT 0.00146 TTACA 0.00107 TTACC 0.000616 TTACG 0.000353 TTACT 0.000915 TTAGA 0.00107 TTAGC 0.000784 TTAGG 0.000758 TTAGT 0.00109 TTATA 0.00162 TTATC 0.000961 TTATG 0.00113 TTATT 0.00205 TTCAA 0.00145 TTCAC 0.000994 TTCAG 0.00107 TTCAT 0.00153 TTCCA 0.00119 TTCCC 0.000845 TTCCG 0.000483 TTCCT 0.00125 TTCGA 0.000628 TTCGC 0.000536 TTCGG 0.000534 TTCGT 0.000808 TTCTA 0.00129 TTCTC 0.00132 TTCTG 0.00109 TTCTT 0.00191 TTGAA 0.00145 TTGAC 0.000869 TTGAG 0.00102 TTGAT 0.0015 TTGCA 0.00139 TTGCC 0.000915 TTGCG 0.00056 TTGCT 0.00141 TTGGA 0.00127 TTGGC 0.000964 TTGGG 0.000897 TTGGT 0.00138 TTGTA 0.00135 TTGTC 0.0011 TTGTG 0.00136 TTGTT 0.00215 TTTAA 0.00171 TTTAC 0.00101 TTTAG 0.00133 TTTAT 0.0022 TTTCA 0.00157 TTTCC 0.00115 TTTCG 0.000667 TTTCT 0.00204 TTTGA 0.00161 TTTGC 0.00127 TTTGG 0.00156 TTTGT 0.00205 TTTTA 0.00237 TTTTC 0.00191 TTTTG 0.00212 TTTTT 0.00444 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4097 AAAAC 0.1713 AAAAG 0.1658 AAAAT 0.2533 AAACA 0.3959 AAACC 0.2023 AAACG 0.128 AAACT 0.2739 AAAGA 0.3292 AAAGC 0.2062 AAAGG 0.2304 AAAGT 0.2342 AAATA 0.3256 AAATC 0.1821 AAATG 0.2085 AAATT 0.2837 AACAA 0.3572 AACAC 0.1924 AACAG 0.1851 AACAT 0.2653 AACCA 0.3832 AACCC 0.2018 AACCG 0.1637 AACCT 0.2512 AACGA 0.3362 AACGC 0.2109 AACGG 0.2332 AACGT 0.2197 AACTA 0.2859 AACTC 0.2014 AACTG 0.2304 AACTT 0.2823 AAGAA 0.3707 AAGAC 0.1615 AAGAG 0.2229 AAGAT 0.2449 AAGCA 0.3648 AAGCC 0.1998 AAGCG 0.1456 AAGCT 0.2899 AAGGA 0.3183 AAGGC 0.2166 AAGGG 0.2229 AAGGT 0.2422 AAGTA 0.2522 AAGTC 0.1833 AAGTG 0.2433 AAGTT 0.3211 AATAA 0.3374 AATAC 0.1591 AATAG 0.1813 AATAT 0.3222 AATCA 0.3423 AATCC 0.2197 AATCG 0.1392 AATCT 0.2988 AATGA 0.289 AATGC 0.2031 AATGG 0.238 AATGT 0.2699 AATTA 0.2709 AATTC 0.1809 AATTG 0.2011 AATTT 0.3471 ACAAA 0.3431 ACAAC 0.2186 ACAAG 0.2116 ACAAT 0.2267 ACACA 0.3675 ACACC 0.221 ACACG 0.1872 ACACT 0.2243 ACAGA 0.2933 ACAGC 0.2397 ACAGG 0.219 ACAGT 0.248 ACATA 0.2728 ACATC 0.1982 ACATG 0.2935 ACATT 0.2355 ACCAA 0.3043 ACCAC 0.2357 ACCAG 0.1966 ACCAT 0.2634 ACCCA 0.3103 ACCCC 0.2459 ACCCG 0.1741 ACCCT 0.2697 ACCGA 0.2722 ACCGC 0.2556 ACCGG 0.2364 ACCGT 0.2358 ACCTA 0.234 ACCTC 0.2589 ACCTG 0.2285 ACCTT 0.2786 ACGAA 0.2577 ACGAC 0.2766 ACGAG 0.2516 ACGAT 0.2141 ACGCA 0.2791 ACGCC 0.2713 ACGCG 0.2384 ACGCT 0.2113 ACGGA 0.252 ACGGC 0.2928 ACGGG 0.2197 ACGGT 0.2355 ACGTA 0.2414 ACGTC 0.2379 ACGTG 0.3012 ACGTT 0.2195 ACTAA 0.28 ACTAC 0.2209 ACTAG 0.2356 ACTAT 0.2636 ACTCA 0.2801 ACTCC 0.2552 ACTCG 0.1854 ACTCT 0.2793 ACTGA 0.2667 ACTGC 0.2578 ACTGG 0.2158 ACTGT 0.2597 ACTTA 0.2037 ACTTC 0.2164 ACTTG 0.2722 ACTTT 0.3077 AGAAA 0.3624 AGAAC 0.1823 AGAAG 0.2437 AGAAT 0.2116 AGACA 0.3405 AGACC 0.2145 AGACG 0.2095 AGACT 0.2354 AGAGA 0.3658 AGAGC 0.2055 AGAGG 0.2425 AGAGT 0.1861 AGATA 0.2551 AGATC 0.2178 AGATG 0.264 AGATT 0.2631 AGCAA 0.2875 AGCAC 0.2073 AGCAG 0.2775 AGCAT 0.2277 AGCCA 0.3288 AGCCC 0.2169 AGCCG 0.2079 AGCCT 0.2464 AGCGA 0.2817 AGCGC 0.2631 AGCGG 0.2498 AGCGT 0.2053 AGCTA 0.2747 AGCTC 0.2278 AGCTG 0.2487 AGCTT 0.2488 AGGAA 0.2968 AGGAC 0.1791 AGGAG 0.2983 AGGAT 0.2257 AGGCA 0.3049 AGGCC 0.2402 AGGCG 0.2165 AGGCT 0.2383 AGGGA 0.3043 AGGGC 0.2212 AGGGG 0.2603 AGGGT 0.2143 AGGTA 0.2272 AGGTC 0.2125 AGGTG 0.2901 AGGTT 0.2702 AGTAA 0.2532 AGTAC 0.2171 AGTAG 0.271 AGTAT 0.2587 AGTCA 0.3071 AGTCC 0.2298 AGTCG 0.1927 AGTCT 0.2705 AGTGA 0.2671 AGTGC 0.2215 AGTGG 0.254 AGTGT 0.2574 AGTTA 0.2013 AGTTC 0.2009 AGTTG 0.2534 AGTTT 0.3444 ATAAA 0.382 ATAAC 0.1539 ATAAG 0.1672 ATAAT 0.2969 ATACA 0.3991 ATACC 0.1905 ATACG 0.1321 ATACT 0.2783 ATAGA 0.3312 ATAGC 0.2038 ATAGG 0.1955 ATAGT 0.2695 ATATA 0.3597 ATATC 0.1515 ATATG 0.2146 ATATT 0.2742 ATCAA 0.3059 ATCAC 0.1985 ATCAG 0.1976 ATCAT 0.298 ATCCA 0.3646 ATCCC 0.1988 ATCCG 0.1636 ATCCT 0.273 ATCGA 0.3168 ATCGC 0.2093 ATCGG 0.214 ATCGT 0.2598 ATCTA 0.2691 ATCTC 0.2392 ATCTG 0.2184 ATCTT 0.2733 ATGAA 0.3072 ATGAC 0.1921 ATGAG 0.2066 ATGAT 0.2941 ATGCA 0.3971 ATGCC 0.1978 ATGCG 0.1412 ATGCT 0.2639 ATGGA 0.3106 ATGGC 0.2357 ATGGG 0.1896 ATGGT 0.2641 ATGTA 0.2547 ATGTC 0.1817 ATGTG 0.2552 ATGTT 0.3084 ATTAA 0.2905 ATTAC 0.1649 ATTAG 0.2042 ATTAT 0.3404 ATTCA 0.3344 ATTCC 0.2101 ATTCG 0.1486 ATTCT 0.3069 ATTGA 0.2702 ATTGC 0.2083 ATTGG 0.2139 ATTGT 0.3076 ATTTA 0.236 ATTTC 0.177 ATTTG 0.2235 ATTTT 0.3635 CAAAA 0.327 CAAAC 0.2248 CAAAG 0.1879 CAAAT 0.2604 CAACA 0.3608 CAACC 0.2279 CAACG 0.1603 CAACT 0.251 CAAGA 0.2768 CAAGC 0.2503 CAAGG 0.2267 CAAGT 0.2462 CAATA 0.266 CAATC 0.2088 CAATG 0.2427 CAATT 0.2824 CACAA 0.2842 CACAC 0.2567 CACAG 0.1822 CACAT 0.2768 CACCA 0.3492 CACCC 0.2005 CACCG 0.212 CACCT 0.2383 CACGA 0.261 CACGC 0.2755 CACGG 0.2355 CACGT 0.228 CACTA 0.2466 CACTC 0.2281 CACTG 0.2587 CACTT 0.2667 CAGAA 0.2879 CAGAC 0.1951 CAGAG 0.2509 CAGAT 0.2661 CAGCA 0.3218 CAGCC 0.2258 CAGCG 0.1887 CAGCT 0.2637 CAGGA 0.2733 CAGGC 0.2635 CAGGG 0.2266 CAGGT 0.2366 CAGTA 0.2321 CAGTC 0.2025 CAGTG 0.2679 CAGTT 0.2975 CATAA 0.2604 CATAC 0.1912 CATAG 0.1934 CATAT 0.355 CATCA 0.322 CATCC 0.2297 CATCG 0.1787 CATCT 0.2695 CATGA 0.2311 CATGC 0.2593 CATGG 0.2351 CATGT 0.2746 CATTA 0.2133 CATTC 0.202 CATTG 0.2361 CATTT 0.3485 CCAAA 0.3451 CCAAC 0.2336 CCAAG 0.2127 CCAAT 0.2087 CCACA 0.265 CCACC 0.312 CCACG 0.2044 CCACT 0.2186 CCAGA 0.2466 CCAGC 0.3116 CCAGG 0.2137 CCAGT 0.2281 CCATA 0.2025 CCATC 0.2692 CCATG 0.2893 CCATT 0.239 CCCAA 0.2723 CCCAC 0.2765 CCCAG 0.1917 CCCAT 0.2595 CCCCA 0.2499 CCCCC 0.2957 CCCCG 0.1923 CCCCT 0.262 CCCGA 0.2131 CCCGC 0.3311 CCCGG 0.2183 CCCGT 0.2375 CCCTA 0.2078 CCCTC 0.3075 CCCTG 0.2232 CCCTT 0.2615 CCGAA 0.2255 CCGAC 0.2674 CCGAG 0.2738 CCGAT 0.2332 CCGCA 0.199 CCGCC 0.3516 CCGCG 0.2528 CCGCT 0.1966 CCGGA 0.2151 CCGGC 0.3549 CCGGG 0.1983 CCGGT 0.2317 CCGTA 0.1597 CCGTC 0.3078 CCGTG 0.3045 CCGTT 0.228 CCTAA 0.2628 CCTAC 0.2212 CCTAG 0.2585 CCTAT 0.2574 CCTCA 0.2058 CCTCC 0.3258 CCTCG 0.2006 CCTCT 0.2678 CCTGA 0.218 CCTGC 0.3186 CCTGG 0.2171 CCTGT 0.2463 CCTTA 0.1656 CCTTC 0.268 CCTTG 0.2565 CCTTT 0.3099 CGAAA 0.2652 CGAAC 0.241 CGAAG 0.265 CGAAT 0.2288 CGACA 0.2531 CGACC 0.2427 CGACG 0.3273 CGACT 0.1769 CGAGA 0.2491 CGAGC 0.2883 CGAGG 0.2753 CGAGT 0.1873 CGATA 0.1726 CGATC 0.2955 CGATG 0.3128 CGATT 0.2191 CGCAA 0.2206 CGCAC 0.2811 CGCAG 0.2624 CGCAT 0.2359 CGCCA 0.2485 CGCCC 0.2261 CGCCG 0.3236 CGCCT 0.2017 CGCGA 0.1864 CGCGC 0.3545 CGCGG 0.2667 CGCGT 0.1924 CGCTA 0.1796 CGCTC 0.2872 CGCTG 0.3133 CGCTT 0.2199 CGGAA 0.2074 CGGAC 0.2311 CGGAG 0.3166 CGGAT 0.2448 CGGCA 0.2134 CGGCC 0.2681 CGGCG 0.3283 CGGCT 0.1901 CGGGA 0.2315 CGGGC 0.2936 CGGGG 0.2754 CGGGT 0.1994 CGGTA 0.1701 CGGTC 0.2382 CGGTG 0.3516 CGGTT 0.24 CGTAA 0.191 CGTAC 0.3059 CGTAG 0.263 CGTAT 0.2401 CGTCA 0.2171 CGTCC 0.2511 CGTCG 0.3174 CGTCT 0.2144 CGTGA 0.197 CGTGC 0.2914 CGTGG 0.2686 CGTGT 0.2431 CGTTA 0.1543 CGTTC 0.243 CGTTG 0.3022 CGTTT 0.3005 CTAAA 0.3592 CTAAC 0.193 CTAAG 0.1704 CTAAT 0.2774 CTACA 0.313 CTACC 0.2176 CTACG 0.1557 CTACT 0.3137 CTAGA 0.2797 CTAGC 0.2797 CTAGG 0.1979 CTAGT 0.2427 CTATA 0.2923 CTATC 0.1973 CTATG 0.22 CTATT 0.2904 CTCAA 0.286 CTCAC 0.2373 CTCAG 0.188 CTCAT 0.2887 CTCCA 0.2869 CTCCC 0.2494 CTCCG 0.1713 CTCCT 0.2923 CTCGA 0.2356 CTCGC 0.2847 CTCGG 0.2166 CTCGT 0.2631 CTCTA 0.2262 CTCTC 0.3117 CTCTG 0.2094 CTCTT 0.2527 CTGAA 0.313 CTGAC 0.2065 CTGAG 0.1961 CTGAT 0.2844 CTGCA 0.2924 CTGCC 0.2332 CTGCG 0.1556 CTGCT 0.3188 CTGGA 0.2696 CTGGC 0.2581 CTGGG 0.1961 CTGGT 0.2761 CTGTA 0.2178 CTGTC 0.2248 CTGTG 0.2444 CTGTT 0.313 CTTAA 0.2749 CTTAC 0.1825 CTTAG 0.2146 CTTAT 0.3279 CTTCA 0.2747 CTTCC 0.2462 CTTCG 0.1569 CTTCT 0.3222 CTTGA 0.2363 CTTGC 0.2438 CTTGG 0.2244 CTTGT 0.2955 CTTTA 0.1967 CTTTC 0.2093 CTTTG 0.2399 CTTTT 0.3541 GAAAA 0.3512 GAAAC 0.2068 GAAAG 0.1957 GAAAT 0.2463 GAACA 0.3443 GAACC 0.2269 GAACG 0.1685 GAACT 0.2603 GAAGA 0.3263 GAAGC 0.238 GAAGG 0.2385 GAAGT 0.1971 GAATA 0.2478 GAATC 0.2279 GAATG 0.2358 GAATT 0.2885 GACAA 0.301 GACAC 0.2224 GACAG 0.219 GACAT 0.2576 GACCA 0.328 GACCC 0.208 GACCG 0.2094 GACCT 0.2546 GACGA 0.3393 GACGC 0.2228 GACGG 0.2493 GACGT 0.1886 GACTA 0.2448 GACTC 0.226 GACTG 0.261 GACTT 0.2682 GAGAA 0.2848 GAGAC 0.1705 GAGAG 0.306 GAGAT 0.2386 GAGCA 0.3187 GAGCC 0.2126 GAGCG 0.1956 GAGCT 0.273 GAGGA 0.3207 GAGGC 0.2321 GAGGG 0.2406 GAGGT 0.2066 GAGTA 0.2436 GAGTC 0.1974 GAGTG 0.2661 GAGTT 0.2929 GATAA 0.2823 GATAC 0.179 GATAG 0.2203 GATAT 0.3184 GATCA 0.2759 GATCC 0.2348 GATCG 0.2112 GATCT 0.2782 GATGA 0.2841 GATGC 0.2198 GATGG 0.2685 GATGT 0.2276 GATTA 0.2188 GATTC 0.2171 GATTG 0.2258 GATTT 0.3383 GCAAA 0.2966 GCAAC 0.2457 GCAAG 0.2435 GCAAT 0.2142 GCACA 0.3028 GCACC 0.2407 GCACG 0.2455 GCACT 0.2111 GCAGA 0.2361 GCAGC 0.3227 GCAGG 0.2361 GCAGT 0.2051 GCATA 0.2099 GCATC 0.2342 GCATG 0.3392 GCATT 0.2167 GCCAA 0.2465 GCCAC 0.269 GCCAG 0.2126 GCCAT 0.2719 GCCCA 0.289 GCCCC 0.2531 GCCCG 0.2195 GCCCT 0.2384 GCCGA 0.2047 GCCGC 0.3329 GCCGG 0.2554 GCCGT 0.207 GCCTA 0.1918 GCCTC 0.2959 GCCTG 0.2589 GCCTT 0.2534 GCGAA 0.2031 GCGAC 0.2686 GCGAG 0.3234 GCGAT 0.2049 GCGCA 0.2125 GCGCC 0.2656 GCGCG 0.3228 GCGCT 0.199 GCGGA 0.2076 GCGGC 0.3615 GCGGG 0.235 GCGGT 0.1959 GCGTA 0.1606 GCGTC 0.2757 GCGTG 0.357 GCGTT 0.2067 GCTAA 0.2318 GCTAC 0.2279 GCTAG 0.3116 GCTAT 0.2287 GCTCA 0.2302 GCTCC 0.2754 GCTCG 0.2376 GCTCT 0.2567 GCTGA 0.2123 GCTGC 0.3358 GCTGG 0.2441 GCTGT 0.2079 GCTTA 0.164 GCTTC 0.2701 GCTTG 0.2859 GCTTT 0.2799 GGAAA 0.3061 GGAAC 0.2009 GGAAG 0.2772 GGAAT 0.2157 GGACA 0.2893 GGACC 0.2278 GGACG 0.2661 GGACT 0.2168 GGAGA 0.277 GGAGC 0.2325 GGAGG 0.3111 GGAGT 0.1793 GGATA 0.2024 GGATC 0.2434 GGATG 0.298 GGATT 0.2563 GGCAA 0.2559 GGCAC 0.2307 GGCAG 0.2789 GGCAT 0.2345 GGCCA 0.2792 GGCCC 0.2197 GGCCG 0.2713 GGCCT 0.2298 GGCGA 0.2421 GGCGC 0.2507 GGCGG 0.319 GGCGT 0.1882 GGCTA 0.2157 GGCTC 0.2477 GGCTG 0.2973 GGCTT 0.2393 GGGAA 0.2635 GGGAC 0.1852 GGGAG 0.335 GGGAT 0.2163 GGGCA 0.2628 GGGCC 0.2482 GGGCG 0.2622 GGGCT 0.2268 GGGGA 0.2715 GGGGC 0.2362 GGGGG 0.2956 GGGGT 0.1967 GGGTA 0.1853 GGGTC 0.2228 GGGTG 0.3132 GGGTT 0.2786 GGTAA 0.2459 GGTAC 0.2273 GGTAG 0.2712 GGTAT 0.2556 GGTCA 0.2739 GGTCC 0.233 GGTCG 0.2551 GGTCT 0.238 GGTGA 0.2327 GGTGC 0.223 GGTGG 0.3202 GGTGT 0.2241 GGTTA 0.1784 GGTTC 0.2181 GGTTG 0.2866 GGTTT 0.3169 GTAAA 0.3407 GTAAC 0.1972 GTAAG 0.1816 GTAAT 0.2805 GTACA 0.3228 GTACC 0.2008 GTACG 0.1996 GTACT 0.2768 GTAGA 0.2741 GTAGC 0.2469 GTAGG 0.2044 GTAGT 0.2746 GTATA 0.2853 GTATC 0.1811 GTATG 0.2458 GTATT 0.2879 GTCAA 0.2642 GTCAC 0.2306 GTCAG 0.2144 GTCAT 0.2909 GTCCA 0.3262 GTCCC 0.2119 GTCCG 0.1922 GTCCT 0.2698 GTCGA 0.2329 GTCGC 0.246 GTCGG 0.2201 GTCGT 0.301 GTCTA 0.2234 GTCTC 0.2596 GTCTG 0.2434 GTCTT 0.2737 GTGAA 0.2782 GTGAC 0.2123 GTGAG 0.2366 GTGAT 0.273 GTGCA 0.3094 GTGCC 0.2228 GTGCG 0.1926 GTGCT 0.2752 GTGGA 0.2616 GTGGC 0.2564 GTGGG 0.2221 GTGGT 0.2599 GTGTA 0.2096 GTGTC 0.2009 GTGTG 0.3031 GTGTT 0.2864 GTTAA 0.2603 GTTAC 0.1974 GTTAG 0.2419 GTTAT 0.3004 GTTCA 0.2965 GTTCC 0.2233 GTTCG 0.1785 GTTCT 0.3017 GTTGA 0.2325 GTTGC 0.2367 GTTGG 0.2371 GTTGT 0.2937 GTTTA 0.1974 GTTTC 0.2031 GTTTG 0.2637 GTTTT 0.3359 TAAAA 0.3798 TAAAC 0.1747 TAAAG 0.1599 TAAAT 0.2855 TAACA 0.3633 TAACC 0.2135 TAACG 0.1232 TAACT 0.3 TAAGA 0.3107 TAAGC 0.2087 TAAGG 0.2128 TAAGT 0.2678 TAATA 0.2974 TAATC 0.1773 TAATG 0.1921 TAATT 0.3333 TACAA 0.3146 TACAC 0.1975 TACAG 0.1806 TACAT 0.3073 TACCA 0.349 TACCC 0.1893 TACCG 0.1637 TACCT 0.298 TACGA 0.2744 TACGC 0.2091 TACGG 0.2084 TACGT 0.3082 TACTA 0.3078 TACTC 0.2038 TACTG 0.2187 TACTT 0.2697 TAGAA 0.3042 TAGAC 0.1602 TAGAG 0.2424 TAGAT 0.2931 TAGCA 0.3156 TAGCC 0.1991 TAGCG 0.1314 TAGCT 0.3538 TAGGA 0.2877 TAGGC 0.2144 TAGGG 0.2317 TAGGT 0.2661 TAGTA 0.2863 TAGTC 0.1664 TAGTG 0.2238 TAGTT 0.3235 TATAA 0.2582 TATAC 0.1534 TATAG 0.1775 TATAT 0.411 TATCA 0.3144 TATCC 0.2076 TATCG 0.1312 TATCT 0.3467 TATGA 0.2556 TATGC 0.2059 TATGG 0.2111 TATGT 0.3274 TATTA 0.2455 TATTC 0.1578 TATTG 0.1923 TATTT 0.4044 TCAAA 0.3329 TCAAC 0.2132 TCAAG 0.2085 TCAAT 0.2454 TCACA 0.3039 TCACC 0.2603 TCACG 0.172 TCACT 0.2638 TCAGA 0.2756 TCAGC 0.2558 TCAGG 0.2026 TCAGT 0.2661 TCATA 0.2219 TCATC 0.2579 TCATG 0.2574 TCATT 0.2627 TCCAA 0.2757 TCCAC 0.2326 TCCAG 0.1882 TCCAT 0.3035 TCCCA 0.2619 TCCCC 0.2711 TCCCG 0.1613 TCCCT 0.3057 TCCGA 0.2318 TCCGC 0.2802 TCCGG 0.2269 TCCGT 0.261 TCCTA 0.1969 TCCTC 0.3127 TCCTG 0.2054 TCCTT 0.285 TCGAA 0.2226 TCGAC 0.2376 TCGAG 0.25 TCGAT 0.2898 TCGCA 0.2068 TCGCC 0.3182 TCGCG 0.2106 TCGCT 0.2644 TCGGA 0.2278 TCGGC 0.2948 TCGGG 0.2007 TCGGT 0.2767 TCGTA 0.1624 TCGTC 0.3234 TCGTG 0.2605 TCGTT 0.2538 TCTAA 0.2523 TCTAC 0.202 TCTAG 0.2488 TCTAT 0.2968 TCTCA 0.2226 TCTCC 0.2575 TCTCG 0.1612 TCTCT 0.3587 TCTGA 0.2481 TCTGC 0.2665 TCTGG 0.2095 TCTGT 0.2759 TCTTA 0.1772 TCTTC 0.2688 TCTTG 0.2295 TCTTT 0.3245 TGAAA 0.3123 TGAAC 0.1996 TGAAG 0.2314 TGAAT 0.2568 TGACA 0.329 TGACC 0.2281 TGACG 0.196 TGACT 0.2469 TGAGA 0.2894 TGAGC 0.235 TGAGG 0.2376 TGAGT 0.238 TGATA 0.2174 TGATC 0.203 TGATG 0.2963 TGATT 0.2832 TGCAA 0.2538 TGCAC 0.2094 TGCAG 0.2288 TGCAT 0.3079 TGCCA 0.3013 TGCCC 0.2196 TGCCG 0.2038 TGCCT 0.2753 TGCGA 0.2149 TGCGC 0.274 TGCGG 0.2466 TGCGT 0.2645 TGCTA 0.2173 TGCTC 0.2359 TGCTG 0.2692 TGCTT 0.2776 TGGAA 0.2582 TGGAC 0.1982 TGGAG 0.2679 TGGAT 0.2758 TGGCA 0.2757 TGGCC 0.2412 TGGCG 0.2204 TGGCT 0.2628 TGGGA 0.2547 TGGGC 0.2619 TGGGG 0.2425 TGGGT 0.2409 TGGTA 0.1932 TGGTC 0.1988 TGGTG 0.3087 TGGTT 0.2993 TGTAA 0.2479 TGTAC 0.2129 TGTAG 0.2273 TGTAT 0.3119 TGTCA 0.2959 TGTCC 0.2218 TGTCG 0.1994 TGTCT 0.283 TGTGA 0.227 TGTGC 0.2344 TGTGG 0.2272 TGTGT 0.3113 TGTTA 0.1777 TGTTC 0.1938 TGTTG 0.2655 TGTTT 0.363 TTAAA 0.3608 TTAAC 0.1617 TTAAG 0.1701 TTAAT 0.3074 TTACA 0.3614 TTACC 0.2088 TTACG 0.1197 TTACT 0.3101 TTAGA 0.2891 TTAGC 0.212 TTAGG 0.205 TTAGT 0.2939 TTATA 0.2807 TTATC 0.1669 TTATG 0.1956 TTATT 0.3568 TTCAA 0.2874 TTCAC 0.1971 TTCAG 0.212 TTCAT 0.3034 TTCCA 0.3157 TTCCC 0.224 TTCCG 0.1282 TTCCT 0.3321 TTCGA 0.2507 TTCGC 0.2138 TTCGG 0.2132 TTCGT 0.3223 TTCTA 0.2299 TTCTC 0.235 TTCTG 0.1946 TTCTT 0.3405 TTGAA 0.2994 TTGAC 0.1795 TTGAG 0.2105 TTGAT 0.3106 TTGCA 0.3246 TTGCC 0.2141 TTGCG 0.1309 TTGCT 0.3305 TTGGA 0.2822 TTGGC 0.2138 TTGGG 0.199 TTGGT 0.3051 TTGTA 0.2266 TTGTC 0.1846 TTGTG 0.2278 TTGTT 0.361 TTTAA 0.2742 TTTAC 0.161 TTTAG 0.2126 TTTAT 0.3521 TTTCA 0.2899 TTTCC 0.2126 TTTCG 0.1228 TTTCT 0.3748 TTTGA 0.2486 TTTGC 0.1957 TTTGG 0.2399 TTTGT 0.3158 TTTTA 0.2188 TTTTC 0.1759 TTTTG 0.1956 TTTTT 0.4097 [3] # (a,c,g,t)= (0.186, 0.314, 0.314, 0.186) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.271 C 0.229 G 0.229 T 0.271 # l= 1 # Values AA 0.0808 AC 0.0561 AG 0.0608 AT 0.0736 CA 0.0682 CC 0.054 CG 0.0456 CT 0.0608 GA 0.06 GC 0.0585 GG 0.054 GT 0.0561 TA 0.0623 TC 0.06 TG 0.0682 TT 0.0809 # l= 2 # Values AAA 0.0283 AAC 0.0161 AAG 0.0163 AAT 0.0202 ACA 0.0185 ACC 0.0128 ACG 0.0108 ACT 0.014 AGA 0.0176 AGC 0.0151 AGG 0.014 AGT 0.014 ATA 0.0194 ATC 0.0155 ATG 0.0186 ATT 0.0202 CAA 0.0192 CAC 0.0156 CAG 0.0147 CAT 0.0186 CCA 0.0165 CCC 0.0124 CCG 0.0111 CCT 0.0141 CGA 0.0113 CGC 0.0123 CGG 0.0111 CGT 0.0108 CTA 0.0141 CTC 0.0156 CTG 0.0147 CTT 0.0163 GAA 0.0167 GAC 0.0122 GAG 0.0156 GAT 0.0154 GCA 0.0167 GCC 0.0143 GCG 0.0123 GCT 0.0151 GGA 0.0145 GGC 0.0142 GGG 0.0124 GGT 0.0128 GTA 0.0122 GTC 0.0122 GTG 0.0156 GTT 0.0161 TAA 0.0166 TAC 0.0122 TAG 0.0141 TAT 0.0194 TCA 0.0165 TCC 0.0145 TCG 0.0113 TCT 0.0176 TGA 0.0165 TGC 0.0167 TGG 0.0165 TGT 0.0185 TTA 0.0166 TTC 0.0167 TTG 0.0192 TTT 0.0283 # l= 3 # Values AAAA 0.0106 AAAC 0.00543 AAAG 0.005 AAAT 0.00728 AACA 0.00588 AACC 0.0035 AACG 0.00241 AACT 0.00427 AAGA 0.00506 AAGC 0.00373 AAGG 0.00375 AAGT 0.00376 AATA 0.00586 AATC 0.004 AATG 0.00439 AATT 0.00594 ACAA 0.0058 ACAC 0.00406 ACAG 0.00358 ACAT 0.00504 ACCA 0.00448 ACCC 0.00259 ACCG 0.00251 ACCT 0.00326 ACGA 0.00322 ACGC 0.00257 ACGG 0.00256 ACGT 0.00245 ACTA 0.00378 ACTC 0.00303 ACTG 0.00342 ACTT 0.00375 AGAA 0.0055 AGAC 0.00304 AGAG 0.00455 AGAT 0.00452 AGCA 0.00492 AGCC 0.0032 AGCG 0.00261 AGCT 0.00441 AGGA 0.00421 AGGC 0.00331 AGGG 0.00327 AGGT 0.00326 AGTA 0.00356 AGTC 0.00263 AGTG 0.00353 AGTT 0.00427 ATAA 0.00556 ATAC 0.00328 ATAG 0.00369 ATAT 0.0069 ATCA 0.00482 ATCC 0.00348 ATCG 0.00263 ATCT 0.00452 ATGA 0.00486 ATGC 0.00421 ATGG 0.00449 ATGT 0.00504 ATTA 0.00485 ATTC 0.0038 ATTG 0.00426 ATTT 0.00728 CAAA 0.00633 CAAC 0.0044 CAAG 0.00423 CAAT 0.00426 CACA 0.00476 CACC 0.00406 CACG 0.0033 CACT 0.00353 CAGA 0.00377 CAGC 0.00428 CAGG 0.00327 CAGT 0.00342 CATA 0.00416 CATC 0.0045 CATG 0.00554 CATT 0.0044 CCAA 0.00445 CCAC 0.0042 CCAG 0.00331 CCAT 0.00449 CCCA 0.00335 CCCC 0.00338 CCCG 0.00241 CCCT 0.00327 CCGA 0.00248 CCGC 0.00339 CCGG 0.00268 CCGT 0.00256 CCTA 0.00284 CCTC 0.0042 CCTG 0.00327 CCTT 0.00375 CGAA 0.00255 CGAC 0.00302 CGAG 0.00314 CGAT 0.00262 CGCA 0.00266 CGCC 0.00376 CGCG 0.00331 CGCT 0.00261 CGGA 0.00244 CGGC 0.00376 CGGG 0.00241 CGGT 0.00251 CGTA 0.0019 CGTC 0.00318 CGTG 0.0033 CGTT 0.00241 CTAA 0.00357 CTAC 0.00311 CTAG 0.00376 CTAT 0.00369 CTCA 0.00353 CTCC 0.00441 CTCG 0.00314 CTCT 0.00455 CTGA 0.0034 CTGC 0.00444 CTGG 0.00331 CTGT 0.00358 CTTA 0.00284 CTTC 0.00423 CTTG 0.00423 CTTT 0.005 GAAA 0.00531 GAAC 0.00336 GAAG 0.00423 GAAT 0.0038 GACA 0.00364 GACC 0.00279 GACG 0.00318 GACT 0.00263 GAGA 0.00465 GAGC 0.00374 GAGG 0.0042 GAGT 0.00303 GATA 0.0033 GATC 0.00365 GATG 0.00451 GATT 0.004 GCAA 0.00425 GCAC 0.00383 GCAG 0.00444 GCAT 0.00421 GCCA 0.00402 GCCC 0.00316 GCCG 0.00376 GCCT 0.00331 GCGA 0.00278 GCGC 0.0036 GCGG 0.00339 GCGT 0.00256 GCTA 0.00339 GCTC 0.00374 GCTG 0.00428 GCTT 0.00373 GGAA 0.00375 GGAC 0.0029 GGAG 0.00441 GGAT 0.00348 GGCA 0.00368 GGCC 0.00362 GGCG 0.00376 GGCT 0.0032 GGGA 0.00328 GGGC 0.00316 GGGG 0.00338 GGGT 0.00259 GGTA 0.00248 GGTC 0.00279 GGTG 0.00406 GGTT 0.0035 GTAA 0.00289 GTAC 0.00288 GTAG 0.00311 GTAT 0.00327 GTCA 0.00328 GTCC 0.0029 GTCG 0.00302 GTCT 0.00303 GTGA 0.00356 GTGC 0.00383 GTGG 0.0042 GTGT 0.00406 GTTA 0.00287 GTTC 0.00336 GTTG 0.00439 GTTT 0.00543 TAAA 0.00606 TAAC 0.00287 TAAG 0.00284 TAAT 0.00485 TACA 0.0042 TACC 0.00248 TACG 0.0019 TACT 0.00356 TAGA 0.00413 TAGC 0.00339 TAGG 0.00284 TAGT 0.00378 TATA 0.0061 TATC 0.0033 TATG 0.00416 TATT 0.00586 TCAA 0.0047 TCAC 0.00356 TCAG 0.0034 TCAT 0.00485 TCCA 0.00461 TCCC 0.00328 TCCG 0.00244 TCCT 0.00421 TCGA 0.00284 TCGC 0.00278 TCGG 0.00248 TCGT 0.00323 TCTA 0.00413 TCTC 0.00465 TCTG 0.00378 TCTT 0.00506 TGAA 0.00489 TGAC 0.00328 TGAG 0.00353 TGAT 0.00482 TGCA 0.00547 TGCC 0.00368 TGCG 0.00266 TGCT 0.00492 TGGA 0.00461 TGGC 0.00402 TGGG 0.00335 TGGT 0.00448 TGTA 0.0042 TGTC 0.00364 TGTG 0.00476 TGTT 0.00588 TTAA 0.0046 TTAC 0.00289 TTAG 0.00357 TTAT 0.00556 TTCA 0.00489 TTCC 0.00375 TTCG 0.00256 TTCT 0.00551 TTGA 0.0047 TTGC 0.00425 TTGG 0.00445 TTGT 0.00581 TTTA 0.00606 TTTC 0.00531 TTTG 0.00633 TTTT 0.0106 # l= 4 # Values AAAAA 0.00437 AAAAC 0.00183 AAAAG 0.00177 AAAAT 0.00266 AAACA 0.00214 AAACC 0.0011 AAACG 0.000718 AAACT 0.00147 AAAGA 0.00164 AAAGC 0.00104 AAAGG 0.00116 AAAGT 0.00115 AAATA 0.00237 AAATC 0.00134 AAATG 0.00152 AAATT 0.00205 AACAA 0.00209 AACAC 0.00113 AACAG 0.00111 AACAT 0.00155 AACCA 0.00133 AACCC 0.000715 AACCG 0.00059 AACCT 0.000866 AACGA 0.0008 AACGC 0.000518 AACGG 0.000571 AACGT 0.00052 AACTA 0.00119 AACTC 0.000881 AACTG 0.000996 AACTT 0.0012 AAGAA 0.00188 AAGAC 0.000818 AAGAG 0.00113 AAGAT 0.00122 AAGCA 0.00133 AAGCC 0.00076 AAGCG 0.00056 AAGCT 0.00108 AAGGA 0.00119 AAGGC 0.000821 AAGGG 0.000844 AAGGT 0.000894 AAGTA 0.000935 AAGTC 0.000699 AAGTG 0.00092 AAGTT 0.0012 AATAA 0.00198 AATAC 0.000936 AATAG 0.00106 AATAT 0.00188 AATCA 0.00136 AATCC 0.000885 AATCG 0.000568 AATCT 0.00118 AATGA 0.00126 AATGC 0.000903 AATGG 0.00106 AATGT 0.00117 AATTA 0.00161 AATTC 0.00109 AATTG 0.00119 AATTT 0.00205 ACAAA 0.00199 ACAAC 0.00127 ACAAG 0.00124 ACAAT 0.00131 ACACA 0.00147 ACACC 0.000895 ACACG 0.000795 ACACT 0.000896 ACAGA 0.00103 ACAGC 0.000875 ACAGG 0.000791 ACAGT 0.000884 ACATA 0.00136 ACATC 0.00101 ACATG 0.0015 ACATT 0.00117 ACCAA 0.00134 ACCAC 0.00108 ACCAG 0.000895 ACCAT 0.00116 ACCCA 0.000789 ACCCC 0.000648 ACCCG 0.000468 ACCCT 0.000685 ACCGA 0.000677 ACCGC 0.000659 ACCGG 0.000595 ACCGT 0.000576 ACCTA 0.000753 ACCTC 0.000847 ACCTG 0.000765 ACCTT 0.000894 ACGAA 0.000824 ACGAC 0.000903 ACGAG 0.000826 ACGAT 0.000679 ACGCA 0.000704 ACGCC 0.000702 ACGCG 0.00063 ACGCT 0.000529 ACGGA 0.000636 ACGGC 0.000777 ACGGG 0.00057 ACGGT 0.000576 ACGTA 0.000605 ACGTC 0.000584 ACGTG 0.000744 ACGTT 0.00052 ACTAA 0.00104 ACTAC 0.000853 ACTAG 0.000906 ACTAT 0.000985 ACTCA 0.000836 ACTCC 0.000785 ACTCG 0.000578 ACTCT 0.000836 ACTGA 0.000891 ACTGC 0.000897 ACTGG 0.000742 ACTGT 0.000884 ACTTA 0.000756 ACTTC 0.000819 ACTTG 0.00103 ACTTT 0.00115 AGAAA 0.00199 AGAAC 0.00101 AGAAG 0.00136 AGAAT 0.00116 AGACA 0.00102 AGACC 0.000654 AGACG 0.000663 AGACT 0.000696 AGAGA 0.00167 AGAGC 0.000943 AGAGG 0.0011 AGAGT 0.000836 AGATA 0.00114 AGATC 0.000995 AGATG 0.0012 AGATT 0.00118 AGCAA 0.0014 AGCAC 0.00104 AGCAG 0.00139 AGCAT 0.00109 AGCCA 0.00103 AGCCC 0.000697 AGCCG 0.0007 AGCCT 0.000771 AGCGA 0.000727 AGCGC 0.000699 AGCGG 0.000652 AGCGT 0.000529 AGCTA 0.0012 AGCTC 0.001 AGCTG 0.00112 AGCTT 0.00108 AGGAA 0.00123 AGGAC 0.00077 AGGAG 0.00128 AGGAT 0.000928 AGGCA 0.000997 AGGCC 0.0008 AGGCG 0.000744 AGGCT 0.000771 AGGGA 0.000981 AGGGC 0.000737 AGGGG 0.000867 AGGGT 0.000685 AGGTA 0.000733 AGGTC 0.000704 AGGTG 0.000956 AGGTT 0.000866 AGTAA 0.00089 AGTAC 0.00079 AGTAG 0.000973 AGTAT 0.00091 AGTCA 0.000797 AGTCC 0.000616 AGTCG 0.000521 AGTCT 0.000696 AGTGA 0.000928 AGTGC 0.000794 AGTGG 0.000909 AGTGT 0.000896 AGTTA 0.00086 AGTTC 0.000854 AGTTG 0.00109 AGTTT 0.00147 ATAAA 0.00212 ATAAC 0.000861 ATAAG 0.000929 ATAAT 0.00165 ATACA 0.00129 ATACC 0.000626 ATACG 0.000448 ATACT 0.00091 ATAGA 0.00122 ATAGC 0.000758 ATAGG 0.000724 ATAGT 0.000985 ATATA 0.0025 ATATC 0.00105 ATATG 0.00147 ATATT 0.00188 ATCAA 0.00146 ATCAC 0.000965 ATCAG 0.000964 ATCAT 0.00143 ATCCA 0.00126 ATCCC 0.000696 ATCCG 0.000594 ATCCT 0.000928 ATCGA 0.000821 ATCGC 0.000558 ATCGG 0.000565 ATCGT 0.000679 ATCTA 0.00121 ATCTC 0.00109 ATCTG 0.000995 ATCTT 0.00122 ATGAA 0.00147 ATGAC 0.000937 ATGAG 0.00101 ATGAT 0.00143 ATGCA 0.00167 ATGCC 0.000836 ATGCG 0.000618 ATGCT 0.00109 ATGGA 0.00139 ATGGC 0.00108 ATGGG 0.000859 ATGGT 0.00116 ATGTA 0.00128 ATGTC 0.000917 ATGTG 0.0013 ATGTT 0.00155 ATTAA 0.00141 ATTAC 0.000801 ATTAG 0.000989 ATTAT 0.00165 ATTCA 0.00126 ATTCC 0.000799 ATTCG 0.000589 ATTCT 0.00116 ATTGA 0.00114 ATTGC 0.000893 ATTGG 0.000916 ATTGT 0.00131 ATTTA 0.00172 ATTTC 0.00129 ATTTG 0.00162 ATTTT 0.00266 CAAAA 0.00208 CAAAC 0.00143 CAAAG 0.0012 CAAAT 0.00162 CAACA 0.00156 CAACC 0.00102 CAACG 0.000733 CAACT 0.00109 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.00107 CAAGG 0.000964 CAAGT 0.00103 CAATA 0.00111 CAATC 0.000909 CAATG 0.00105 CAATT 0.00119 CACAA 0.00132 CACAC 0.00125 CACAG 0.000885 CACAT 0.0013 CACCA 0.00139 CACCC 0.000817 CACCG 0.000895 CACCT 0.000956 CACGA 0.000844 CACGC 0.000926 CACGG 0.00079 CACGT 0.000744 CACTA 0.000855 CACTC 0.000817 CACTG 0.000933 CACTT 0.00092 CAGAA 0.00108 CAGAC 0.000745 CAGAG 0.000959 CAGAT 0.000995 CAGCA 0.00136 CAGCC 0.000966 CAGCG 0.000834 CAGCT 0.00112 CAGGA 0.00088 CAGGC 0.000878 CAGGG 0.000744 CAGGT 0.000765 CAGTA 0.000789 CAGTC 0.000699 CAGTG 0.000933 CAGTT 0.000996 CATAA 0.00108 CATAC 0.000801 CATAG 0.000807 CATAT 0.00147 CATCA 0.00144 CATCC 0.00104 CATCG 0.000823 CATCT 0.0012 CATGA 0.00126 CATGC 0.00146 CATGG 0.00132 CATGT 0.0015 CATTA 0.000928 CATTC 0.000899 CATTG 0.00105 CATTT 0.00152 CCAAA 0.00153 CCAAC 0.00106 CCAAG 0.000956 CCAAT 0.000916 CCACA 0.00109 CCACC 0.00131 CCACG 0.00089 CCACT 0.000909 CCAGA 0.000788 CCAGC 0.00106 CCAGG 0.000719 CCAGT 0.000742 CCATA 0.000878 CCATC 0.00124 CCATG 0.00132 CCATT 0.00106 CCCAA 0.000898 CCCAC 0.000928 CCCAG 0.000661 CCCAT 0.000859 CCCCA 0.000822 CCCCC 0.00102 CCCCG 0.00067 CCCCT 0.000867 CCCGA 0.000496 CCCGC 0.000801 CCCGG 0.00054 CCCGT 0.00057 CCCTA 0.000655 CCCTC 0.00102 CCCTG 0.000744 CCCTT 0.000844 CCGAA 0.00055 CCGAC 0.000674 CCGAG 0.000693 CCGAT 0.000565 CCGCA 0.000644 CCGCC 0.00121 CCGCG 0.000884 CCGCT 0.000652 CCGGA 0.000561 CCGGC 0.000983 CCGGG 0.00054 CCGGT 0.000595 CCGTA 0.000393 CCGTC 0.000805 CCGTG 0.00079 CCGTT 0.000571 CCTAA 0.000737 CCTAC 0.000637 CCTAG 0.000739 CCTAT 0.000724 CCTCA 0.000839 CCTCC 0.00138 CCTCG 0.000871 CCTCT 0.0011 CCTGA 0.000699 CCTGC 0.00106 CCTGG 0.000719 CCTGT 0.000791 CCTTA 0.000608 CCTTC 0.00101 CCTTG 0.000964 CCTTT 0.00116 CGAAA 0.000672 CGAAC 0.000621 CGAAG 0.000674 CGAAT 0.000589 CGACA 0.000744 CGACC 0.00073 CGACG 0.00103 CGACT 0.000521 CGAGA 0.000776 CGAGC 0.000918 CGAGG 0.000871 CGAGT 0.000578 CGATA 0.00044 CGATC 0.000795 CGATG 0.000823 CGATT 0.000568 CGCAA 0.000572 CGCAC 0.000759 CGCAG 0.000712 CGCAT 0.000618 CGCCA 0.000917 CGCCC 0.000849 CGCCG 0.00125 CGCCT 0.000744 CGCGA 0.000606 CGCGC 0.00119 CGCGG 0.000884 CGCGT 0.00063 CGCTA 0.000458 CGCTC 0.000756 CGCTG 0.000834 CGCTT 0.00056 CGGAA 0.0005 CGGAC 0.000572 CGGAG 0.00077 CGGAT 0.000594 CGGCA 0.000784 CGGCC 0.00103 CGGCG 0.00125 CGGCT 0.0007 CGGGA 0.000552 CGGGC 0.000716 CGGGG 0.00067 CGGGT 0.000468 CGGTA 0.000419 CGGTC 0.000602 CGGTG 0.000895 CGGTT 0.00059 CGTAA 0.000357 CGTAC 0.000603 CGTAG 0.000496 CGTAT 0.000448 CGTCA 0.000679 CGTCC 0.000806 CGTCG 0.00103 CGTCT 0.000663 CGTGA 0.000643 CGTGC 0.000977 CGTGG 0.00089 CGTGT 0.000795 CGTTA 0.00036 CGTTC 0.000594 CGTTG 0.000733 CGTTT 0.000718 CTAAA 0.00129 CTAAC 0.000686 CTAAG 0.000608 CTAAT 0.000989 CTACA 0.000961 CTACC 0.000683 CTACG 0.000496 CTACT 0.000973 CTAGA 0.00103 CTAGC 0.00108 CTAGG 0.000739 CTAGT 0.000906 CTATA 0.00108 CTATC 0.000736 CTATG 0.000807 CTATT 0.00106 CTCAA 0.000995 CTCAC 0.000845 CTCAG 0.000674 CTCAT 0.00101 CTCCA 0.00125 CTCCC 0.00111 CTCCG 0.00077 CTCCT 0.00128 CTCGA 0.000711 CTCGC 0.000912 CTCGG 0.000693 CTCGT 0.000826 CTCTA 0.00101 CTCTC 0.00145 CTCTG 0.000959 CTCTT 0.00113 CTGAA 0.00104 CTGAC 0.000724 CTGAG 0.000674 CTGAT 0.000964 CTGCA 0.00127 CTGCC 0.00107 CTGCG 0.000712 CTGCT 0.00139 CTGGA 0.000884 CTGGC 0.000872 CTGGG 0.000661 CTGGT 0.000895 CTGTA 0.000774 CTGTC 0.000813 CTGTG 0.000885 CTGTT 0.00111 CTTAA 0.000776 CTTAC 0.000524 CTTAG 0.000608 CTTAT 0.000929 CTTCA 0.00114 CTTCC 0.00105 CTTCG 0.000674 CTTCT 0.00136 CTTGA 0.000981 CTTGC 0.00105 CTTGG 0.000956 CTTGT 0.00124 CTTTA 0.000976 CTTTC 0.00105 CTTTG 0.0012 CTTTT 0.00177 GAAAA 0.00187 GAAAC 0.0011 GAAAG 0.00105 GAAAT 0.00129 GAACA 0.00115 GAACC 0.000768 GAACG 0.000594 GAACT 0.000854 GAAGA 0.00138 GAAGC 0.00101 GAAGG 0.00101 GAAGT 0.000819 GAATA 0.000933 GAATC 0.000881 GAATG 0.000899 GAATT 0.00109 GACAA 0.00108 GACAC 0.000829 GACAG 0.000813 GACAT 0.000917 GACCA 0.000905 GACCC 0.00058 GACCG 0.000602 GACCT 0.000704 GACGA 0.00107 GACGC 0.000723 GACGG 0.000805 GACGT 0.000584 GACTA 0.000628 GACTC 0.0006 GACTG 0.000699 GACTT 0.000699 GAGAA 0.0013 GAGAC 0.000808 GAGAG 0.00145 GAGAT 0.00109 GAGCA 0.00119 GAGCC 0.000796 GAGCG 0.000756 GAGCT 0.001 GAGGA 0.00133 GAGGC 0.000995 GAGGG 0.00102 GAGGT 0.000847 GAGTA 0.000732 GAGTC 0.0006 GAGTG 0.000817 GAGTT 0.000881 GATAA 0.000923 GATAC 0.000593 GATAG 0.000736 GATAT 0.00105 GATCA 0.001 GATCC 0.000858 GATCG 0.000795 GATCT 0.000995 GATGA 0.00127 GATGC 0.000991 GATGG 0.00124 GATGT 0.00101 GATTA 0.000871 GATTC 0.000881 GATTG 0.000909 GATTT 0.00134 GCAAA 0.00125 GCAAC 0.00105 GCAAG 0.00105 GCAAT 0.000893 GCACA 0.00114 GCACC 0.000924 GCACG 0.000977 GCACT 0.000794 GCAGA 0.00103 GCAGC 0.00146 GCAGG 0.00106 GCAGT 0.000897 GCATA 0.000857 GCATC 0.000991 GCATG 0.00146 GCATT 0.000903 GCCAA 0.000963 GCCAC 0.00111 GCCAG 0.000872 GCCAT 0.00108 GCCCA 0.00089 GCCCC 0.000812 GCCCG 0.000716 GCCCT 0.000737 GCCGA 0.000751 GCCGC 0.00125 GCCGG 0.000983 GCCGT 0.000777 GCCTA 0.000616 GCCTC 0.000995 GCCTG 0.000878 GCCTT 0.000821 GCGAA 0.000552 GCGAC 0.000761 GCGAG 0.000912 GCGAT 0.000558 GCGCA 0.000751 GCGCC 0.000965 GCGCG 0.00119 GCGCT 0.000699 GCGGA 0.000678 GCGGC 0.00125 GCGGG 0.000801 GCGGT 0.000659 GCGTA 0.0004 GCGTC 0.000723 GCGTG 0.000926 GCGTT 0.000518 GCTAA 0.000768 GCTAC 0.000779 GCTAG 0.00108 GCTAT 0.000758 GCTCA 0.000844 GCTCC 0.00103 GCTCG 0.000918 GCTCT 0.000943 GCTGA 0.000885 GCTGC 0.00146 GCTGG 0.00106 GCTGT 0.000875 GCTTA 0.000598 GCTTC 0.00101 GCTTG 0.00107 GCTTT 0.00104 GGAAA 0.00114 GGAAC 0.00076 GGAAG 0.00105 GGAAT 0.000799 GGACA 0.000823 GGACC 0.000656 GGACG 0.000806 GGACT 0.000616 GGAGA 0.0012 GGAGC 0.00103 GGAGG 0.00138 GGAGT 0.000785 GGATA 0.000695 GGATC 0.000858 GGATG 0.00104 GGATT 0.000885 GGCAA 0.000919 GGCAC 0.000861 GGCAG 0.00107 GGCAT 0.000836 GGCCA 0.000988 GGCCC 0.000794 GGCCG 0.00103 GGCCT 0.0008 GGCGA 0.000885 GGCGC 0.000965 GGCGG 0.00121 GGCGT 0.000702 GGCTA 0.000678 GGCTC 0.000796 GGCTG 0.000966 GGCTT 0.00076 GGGAA 0.000852 GGGAC 0.000624 GGGAG 0.00111 GGGAT 0.000696 GGGCA 0.000818 GGGCC 0.000794 GGGCG 0.000849 GGGCT 0.000697 GGGGA 0.000901 GGGGC 0.000812 GGGGG 0.00102 GGGGT 0.000648 GGGTA 0.000476 GGGTC 0.00058 GGGTG 0.000817 GGGTT 0.000715 GGTAA 0.000603 GGTAC 0.000572 GGTAG 0.000683 GGTAT 0.000626 GGTCA 0.000752 GGTCC 0.000656 GGTCG 0.00073 GGTCT 0.000654 GGTGA 0.00093 GGTGC 0.000924 GGTGG 0.00131 GGTGT 0.000895 GGTTA 0.00062 GGTTC 0.000768 GGTTG 0.00102 GGTTT 0.0011 GTAAA 0.000983 GTAAC 0.000583 GTAAG 0.000524 GTAAT 0.000801 GTACA 0.000915 GTACC 0.000572 GTACG 0.000603 GTACT 0.00079 GTAGA 0.000846 GTAGC 0.000779 GTAGG 0.000637 GTAGT 0.000853 GTATA 0.000947 GTATC 0.000593 GTATG 0.000801 GTATT 0.000936 GTCAA 0.000849 GTCAC 0.000773 GTCAG 0.000724 GTCAT 0.000937 GTCCA 0.000932 GTCCC 0.000624 GTCCG 0.000572 GTCCT 0.00077 GTCGA 0.000684 GTCGC 0.000761 GTCGG 0.000674 GTCGT 0.000903 GTCTA 0.000664 GTCTC 0.000808 GTCTG 0.000745 GTCTT 0.000818 GTGAA 0.000979 GTGAC 0.000773 GTGAG 0.000845 GTGAT 0.000965 GTGCA 0.00117 GTGCC 0.000861 GTGCG 0.000759 GTGCT 0.00104 GTGGA 0.00108 GTGGC 0.00111 GTGGG 0.000928 GTGGT 0.00108 GTGTA 0.00084 GTGTC 0.000829 GTGTG 0.00125 GTGTT 0.00113 GTTAA 0.000743 GTTAC 0.000583 GTTAG 0.000686 GTTAT 0.000861 GTTCA 0.000977 GTTCC 0.00076 GTTCG 0.000621 GTTCT 0.00101 GTTGA 0.00102 GTTGC 0.00105 GTTGG 0.00106 GTTGT 0.00127 GTTTA 0.00107 GTTTC 0.0011 GTTTG 0.00143 GTTTT 0.00183 TAAAA 0.0023 TAAAC 0.00107 TAAAG 0.000976 TAAAT 0.00172 TAACA 0.00103 TAACC 0.00062 TAACG 0.00036 TAACT 0.00086 TAAGA 0.000876 TAAGC 0.000598 TAAGG 0.000608 TAAGT 0.000756 TAATA 0.00144 TAATC 0.000871 TAATG 0.000928 TAATT 0.00161 TACAA 0.00131 TACAC 0.00084 TACAG 0.000774 TACAT 0.00128 TACCA 0.000855 TACCC 0.000476 TACCG 0.000419 TACCT 0.000733 TACGA 0.000507 TACGC 0.0004 TACGG 0.000393 TACGT 0.000605 TACTA 0.00111 TACTC 0.000732 TACTG 0.000789 TACTT 0.000935 TAGAA 0.00125 TAGAC 0.000664 TAGAG 0.00101 TAGAT 0.00121 TAGCA 0.00105 TAGCC 0.000678 TAGCG 0.000458 TAGCT 0.0012 TAGGA 0.000815 TAGGC 0.000616 TAGGG 0.000655 TAGGT 0.000753 TAGTA 0.00111 TAGTC 0.000628 TAGTG 0.000855 TAGTT 0.00119 TATAA 0.00157 TATAC 0.000947 TATAG 0.00108 TATAT 0.0025 TATCA 0.00102 TATCC 0.000695 TATCG 0.00044 TATCT 0.00114 TATGA 0.00106 TATGC 0.000857 TATGG 0.000878 TATGT 0.00136 TATTA 0.00144 TATTC 0.000933 TATTG 0.00111 TATTT 0.00237 TCAAA 0.00156 TCAAC 0.00102 TCAAG 0.000981 TCAAT 0.00114 TCACA 0.00106 TCACC 0.00093 TCACG 0.000643 TCACT 0.000928 TCAGA 0.000924 TCAGC 0.000885 TCAGG 0.000699 TCAGT 0.000891 TCATA 0.00106 TCATC 0.00127 TCATG 0.00126 TCATT 0.00126 TCCAA 0.00125 TCCAC 0.00108 TCCAG 0.000884 TCCAT 0.00139 TCCCA 0.000848 TCCCC 0.000901 TCCCG 0.000552 TCCCT 0.000981 TCCGA 0.00056 TCCGC 0.000678 TCCGG 0.000561 TCCGT 0.000636 TCCTA 0.000815 TCCTC 0.00133 TCCTG 0.00088 TCCTT 0.00119 TCGAA 0.000623 TCGAC 0.000684 TCGAG 0.000711 TCGAT 0.000821 TCGCA 0.000563 TCGCC 0.000885 TCGCG 0.000606 TCGCT 0.000727 TCGGA 0.00056 TCGGC 0.000751 TCGGG 0.000496 TCGGT 0.000677 TCGTA 0.000507 TCGTC 0.00107 TCGTG 0.000844 TCGTT 0.0008 TCTAA 0.00103 TCTAC 0.000846 TCTAG 0.00103 TCTAT 0.00122 TCTCA 0.00101 TCTCC 0.0012 TCTCG 0.000776 TCTCT 0.00167 TCTGA 0.000924 TCTGC 0.00103 TCTGG 0.000788 TCTGT 0.00103 TCTTA 0.000876 TCTTC 0.00138 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.00164 TGAAA 0.00151 TGAAC 0.000977 TGAAG 0.00114 TGAAT 0.00126 TGACA 0.00105 TGACC 0.000752 TGACG 0.000679 TGACT 0.000797 TGAGA 0.00101 TGAGC 0.000844 TGAGG 0.000839 TGAGT 0.000836 TGATA 0.00102 TGATC 0.001 TGATG 0.00144 TGATT 0.00136 TGCAA 0.00136 TGCAC 0.00117 TGCAG 0.00127 TGCAT 0.00167 TGCCA 0.00108 TGCCC 0.000818 TGCCG 0.000784 TGCCT 0.000997 TGCGA 0.000563 TGCGC 0.000751 TGCGG 0.000644 TGCGT 0.000704 TGCTA 0.00105 TGCTC 0.00119 TGCTG 0.00136 TGCTT 0.00133 TGGAA 0.00117 TGGAC 0.000932 TGGAG 0.00125 TGGAT 0.00126 TGGCA 0.00108 TGGCC 0.000988 TGGCG 0.000917 TGGCT 0.00103 TGGGA 0.000848 TGGGC 0.00089 TGGGG 0.000822 TGGGT 0.000789 TGGTA 0.000855 TGGTC 0.000905 TGGTG 0.00139 TGGTT 0.00133 TGTAA 0.00104 TGTAC 0.000915 TGTAG 0.000961 TGTAT 0.00129 TGTCA 0.00105 TGTCC 0.000823 TGTCG 0.000744 TGTCT 0.00102 TGTGA 0.00106 TGTGC 0.00114 TGTGG 0.00109 TGTGT 0.00147 TGTTA 0.00103 TGTTC 0.00115 TGTTG 0.00156 TGTTT 0.00214 TTAAA 0.00167 TTAAC 0.000743 TTAAG 0.000776 TTAAT 0.00141 TTACA 0.00104 TTACC 0.000603 TTACG 0.000357 TTACT 0.00089 TTAGA 0.00103 TTAGC 0.000768 TTAGG 0.000737 TTAGT 0.00104 TTATA 0.00157 TTATC 0.000923 TTATG 0.00108 TTATT 0.00198 TTCAA 0.0014 TTCAC 0.000979 TTCAG 0.00104 TTCAT 0.00147 TTCCA 0.00117 TTCCC 0.000852 TTCCG 0.0005 TTCCT 0.00123 TTCGA 0.000623 TTCGC 0.000552 TTCGG 0.00055 TTCGT 0.000824 TTCTA 0.00125 TTCTC 0.0013 TTCTG 0.00108 TTCTT 0.00188 TTGAA 0.0014 TTGAC 0.000849 TTGAG 0.000995 TTGAT 0.00146 TTGCA 0.00136 TTGCC 0.000919 TTGCG 0.000572 TTGCT 0.0014 TTGGA 0.00125 TTGGC 0.000963 TTGGG 0.000898 TTGGT 0.00134 TTGTA 0.00131 TTGTC 0.00108 TTGTG 0.00132 TTGTT 0.00209 TTTAA 0.00167 TTTAC 0.000983 TTTAG 0.00129 TTTAT 0.00212 TTTCA 0.00151 TTTCC 0.00114 TTTCG 0.000672 TTTCT 0.00199 TTTGA 0.00156 TTTGC 0.00125 TTTGG 0.00153 TTTGT 0.00199 TTTTA 0.0023 TTTTC 0.00187 TTTTG 0.00208 TTTTT 0.00437 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4115 AAAAC 0.1721 AAAAG 0.1664 AAAAT 0.25 AAACA 0.3949 AAACC 0.2021 AAACG 0.1323 AAACT 0.2708 AAAGA 0.3279 AAAGC 0.2085 AAAGG 0.2325 AAAGT 0.2311 AAATA 0.3254 AAATC 0.1837 AAATG 0.2089 AAATT 0.282 AACAA 0.3554 AACAC 0.1927 AACAG 0.1888 AACAT 0.263 AACCA 0.3802 AACCC 0.2041 AACCG 0.1685 AACCT 0.2472 AACGA 0.3322 AACGC 0.2149 AACGG 0.2372 AACGT 0.2158 AACTA 0.2794 AACTC 0.2062 AACTG 0.2332 AACTT 0.2811 AAGAA 0.3725 AAGAC 0.1617 AAGAG 0.2239 AAGAT 0.2419 AAGCA 0.3556 AAGCC 0.2038 AAGCG 0.1501 AAGCT 0.2905 AAGGA 0.3166 AAGGC 0.2193 AAGGG 0.2255 AAGGT 0.2387 AAGTA 0.2489 AAGTC 0.1862 AAGTG 0.2451 AAGTT 0.3198 AATAA 0.3385 AATAC 0.1598 AATAG 0.181 AATAT 0.3206 AATCA 0.3407 AATCC 0.2213 AATCG 0.1421 AATCT 0.2959 AATGA 0.2874 AATGC 0.2053 AATGG 0.2404 AATGT 0.2669 AATTA 0.2705 AATTC 0.1836 AATTG 0.2003 AATTT 0.3456 ACAAA 0.3432 ACAAC 0.2187 ACAAG 0.2132 ACAAT 0.2249 ACACA 0.3623 ACACC 0.2207 ACACG 0.1961 ACACT 0.2209 ACAGA 0.288 ACAGC 0.2443 ACAGG 0.2208 ACAGT 0.2469 ACATA 0.2705 ACATC 0.1994 ACATG 0.2973 ACATT 0.2328 ACCAA 0.3 ACCAC 0.2411 ACCAG 0.1997 ACCAT 0.2592 ACCCA 0.3049 ACCCC 0.2501 ACCCG 0.1806 ACCCT 0.2644 ACCGA 0.27 ACCGC 0.2629 ACCGG 0.2374 ACCGT 0.2297 ACCTA 0.2311 ACCTC 0.26 ACCTG 0.2347 ACCTT 0.2743 ACGAA 0.2549 ACGAC 0.2795 ACGAG 0.2554 ACGAT 0.2102 ACGCA 0.2745 ACGCC 0.2735 ACGCG 0.2456 ACGCT 0.2064 ACGGA 0.2486 ACGGC 0.3037 ACGGG 0.2226 ACGGT 0.225 ACGTA 0.2466 ACGTC 0.2382 ACGTG 0.3033 ACGTT 0.2119 ACTAA 0.2743 ACTAC 0.2256 ACTAG 0.2395 ACTAT 0.2606 ACTCA 0.2755 ACTCC 0.2586 ACTCG 0.1904 ACTCT 0.2755 ACTGA 0.261 ACTGC 0.2627 ACTGG 0.2173 ACTGT 0.259 ACTTA 0.2014 ACTTC 0.218 ACTTG 0.2732 ACTTT 0.3074 AGAAA 0.3608 AGAAC 0.1827 AGAAG 0.2467 AGAAT 0.2098 AGACA 0.3363 AGACC 0.2157 AGACG 0.2186 AGACT 0.2294 AGAGA 0.3662 AGAGC 0.2074 AGAGG 0.2425 AGAGT 0.1838 AGATA 0.2525 AGATC 0.2199 AGATG 0.2662 AGATT 0.2615 AGCAA 0.2843 AGCAC 0.2111 AGCAG 0.2831 AGCAT 0.2215 AGCCA 0.3225 AGCCC 0.2179 AGCCG 0.2187 AGCCT 0.241 AGCGA 0.279 AGCGC 0.2679 AGCGG 0.2501 AGCGT 0.203 AGCTA 0.2727 AGCTC 0.2276 AGCTG 0.2542 AGCTT 0.2456 AGGAA 0.2931 AGGAC 0.1829 AGGAG 0.3037 AGGAT 0.2204 AGGCA 0.3009 AGGCC 0.2416 AGGCG 0.2247 AGGCT 0.2328 AGGGA 0.3 AGGGC 0.2253 AGGGG 0.2653 AGGGT 0.2094 AGGTA 0.2248 AGGTC 0.216 AGGTG 0.2934 AGGTT 0.2657 AGTAA 0.2497 AGTAC 0.2218 AGTAG 0.273 AGTAT 0.2555 AGTCA 0.303 AGTCC 0.2342 AGTCG 0.1982 AGTCT 0.2646 AGTGA 0.2632 AGTGC 0.225 AGTGG 0.2578 AGTGT 0.254 AGTTA 0.2014 AGTTC 0.2 AGTTG 0.2544 AGTTT 0.3442 ATAAA 0.3818 ATAAC 0.1548 ATAAG 0.1671 ATAAT 0.2963 ATACA 0.3938 ATACC 0.1912 ATACG 0.1369 ATACT 0.2781 ATAGA 0.3306 ATAGC 0.2057 ATAGG 0.1964 ATAGT 0.2673 ATATA 0.3622 ATATC 0.1523 ATATG 0.2132 ATATT 0.2723 ATCAA 0.3027 ATCAC 0.2001 ATCAG 0.2 ATCAT 0.2973 ATCCA 0.3625 ATCCC 0.1999 ATCCG 0.1708 ATCCT 0.2668 ATCGA 0.3129 ATCGC 0.2126 ATCGG 0.2155 ATCGT 0.259 ATCTA 0.2676 ATCTC 0.2418 ATCTG 0.22 ATCTT 0.2706 ATGAA 0.3031 ATGAC 0.193 ATGAG 0.2088 ATGAT 0.2952 ATGCA 0.3957 ATGCC 0.1987 ATGCG 0.1468 ATGCT 0.2588 ATGGA 0.3099 ATGGC 0.2401 ATGGG 0.1913 ATGGT 0.2587 ATGTA 0.2529 ATGTC 0.1819 ATGTG 0.2586 ATGTT 0.3066 ATTAA 0.2909 ATTAC 0.1653 ATTAG 0.2039 ATTAT 0.3398 ATTCA 0.3306 ATTCC 0.2103 ATTCG 0.155 ATTCT 0.3041 ATTGA 0.2687 ATTGC 0.2096 ATTGG 0.2151 ATTGT 0.3067 ATTTA 0.2356 ATTTC 0.1773 ATTTG 0.2224 ATTTT 0.3647 CAAAA 0.3279 CAAAC 0.2264 CAAAG 0.1901 CAAAT 0.2556 CAACA 0.3545 CAACC 0.2313 CAACG 0.1668 CAACT 0.2474 CAAGA 0.275 CAAGC 0.2542 CAAGG 0.2281 CAAGT 0.2428 CAATA 0.2611 CAATC 0.2136 CAATG 0.2459 CAATT 0.2794 CACAA 0.2767 CACAC 0.2634 CACAG 0.1859 CACAT 0.274 CACCA 0.3425 CACCC 0.2014 CACCG 0.2204 CACCT 0.2357 CACGA 0.2555 CACGC 0.2803 CACGG 0.239 CACGT 0.2253 CACTA 0.2426 CACTC 0.2317 CACTG 0.2647 CACTT 0.261 CAGAA 0.2849 CAGAC 0.1974 CAGAG 0.2541 CAGAT 0.2636 CAGCA 0.3173 CAGCC 0.2258 CAGCG 0.1949 CAGCT 0.262 CAGGA 0.2694 CAGGC 0.2688 CAGGG 0.2278 CAGGT 0.234 CAGTA 0.2309 CAGTC 0.2046 CAGTG 0.273 CAGTT 0.2915 CATAA 0.2604 CATAC 0.1924 CATAG 0.194 CATAT 0.3532 CATCA 0.319 CATCC 0.2313 CATCG 0.1826 CATCT 0.2672 CATGA 0.2276 CATGC 0.2635 CATGG 0.238 CATGT 0.2708 CATTA 0.2111 CATTC 0.2046 CATTG 0.2382 CATTT 0.346 CCAAA 0.3424 CCAAC 0.2375 CCAAG 0.2145 CCAAT 0.2056 CCACA 0.2597 CCACC 0.3118 CCACG 0.2119 CCACT 0.2166 CCAGA 0.2379 CCAGC 0.321 CCAGG 0.2171 CCAGT 0.2239 CCATA 0.1956 CCATC 0.2755 CCATG 0.2934 CCATT 0.2355 CCCAA 0.2684 CCCAC 0.2773 CCCAG 0.1976 CCCAT 0.2567 CCCCA 0.243 CCCCC 0.3024 CCCCG 0.1981 CCCCT 0.2565 CCCGA 0.2062 CCCGC 0.3327 CCCGG 0.2243 CCCGT 0.2368 CCCTA 0.2005 CCCTC 0.3134 CCCTG 0.2277 CCCTT 0.2583 CCGAA 0.2217 CCGAC 0.2713 CCGAG 0.2793 CCGAT 0.2277 CCGCA 0.1901 CCGCC 0.3562 CCGCG 0.2611 CCGCT 0.1925 CCGGA 0.2094 CCGGC 0.367 CCGGG 0.2014 CCGGT 0.2222 CCGTA 0.1535 CCGTC 0.3145 CCGTG 0.3086 CCGTT 0.2234 CCTAA 0.2599 CCTAC 0.2244 CCTAG 0.2605 CCTAT 0.2552 CCTCA 0.1999 CCTCC 0.3298 CCTCG 0.2075 CCTCT 0.2628 CCTGA 0.2137 CCTGC 0.3242 CCTGG 0.2201 CCTGT 0.242 CCTTA 0.1622 CCTTC 0.2706 CCTTG 0.2572 CCTTT 0.31 CGAAA 0.263 CGAAC 0.2428 CGAAG 0.2638 CGAAT 0.2304 CGACA 0.2461 CGACC 0.2414 CGACG 0.3401 CGACT 0.1725 CGAGA 0.2471 CGAGC 0.292 CGAGG 0.2771 CGAGT 0.1838 CGATA 0.1675 CGATC 0.3026 CGATG 0.3135 CGATT 0.2164 CGCAA 0.215 CGCAC 0.2852 CGCAG 0.2675 CGCAT 0.2322 CGCCA 0.2443 CGCCC 0.226 CGCCG 0.3316 CGCCT 0.1982 CGCGA 0.183 CGCGC 0.3597 CGCGG 0.2671 CGCGT 0.1903 CGCTA 0.1757 CGCTC 0.29 CGCTG 0.3197 CGCTT 0.2146 CGGAA 0.2051 CGGAC 0.2349 CGGAG 0.316 CGGAT 0.244 CGGCA 0.2083 CGGCC 0.2748 CGGCG 0.331 CGGCT 0.1859 CGGGA 0.2294 CGGGC 0.2978 CGGGG 0.2785 CGGGT 0.1944 CGGTA 0.1673 CGGTC 0.2402 CGGTG 0.357 CGGTT 0.2355 CGTAA 0.1876 CGTAC 0.3166 CGTAG 0.2605 CGTAT 0.2353 CGTCA 0.2139 CGTCC 0.2536 CGTCG 0.3236 CGTCT 0.2088 CGTGA 0.1947 CGTGC 0.2956 CGTGG 0.2692 CGTGT 0.2406 CGTTA 0.1498 CGTTC 0.247 CGTTG 0.3047 CGTTT 0.2985 CTAAA 0.3604 CTAAC 0.1923 CTAAG 0.1703 CTAAT 0.277 CTACA 0.3087 CTACC 0.2194 CTACG 0.1594 CTACT 0.3125 CTAGA 0.2744 CTAGC 0.288 CTAGG 0.1966 CTAGT 0.241 CTATA 0.2941 CTATC 0.1996 CTATG 0.2189 CTATT 0.2875 CTCAA 0.2821 CTCAC 0.2396 CTCAG 0.1911 CTCAT 0.2872 CTCCA 0.2827 CTCCC 0.2525 CTCCG 0.1746 CTCCT 0.2902 CTCGA 0.2264 CTCGC 0.2902 CTCGG 0.2206 CTCGT 0.2628 CTCTA 0.2215 CTCTC 0.3187 CTCTG 0.2108 CTCTT 0.2489 CTGAA 0.3058 CTGAC 0.2128 CTGAG 0.1981 CTGAT 0.2833 CTGCA 0.286 CTGCC 0.2401 CTGCG 0.1604 CTGCT 0.3136 CTGGA 0.2669 CTGGC 0.2632 CTGGG 0.1997 CTGGT 0.2703 CTGTA 0.2162 CTGTC 0.227 CTGTG 0.247 CTGTT 0.3099 CTTAA 0.2736 CTTAC 0.1847 CTTAG 0.2143 CTTAT 0.3274 CTTCA 0.2708 CTTCC 0.2483 CTTCG 0.1595 CTTCT 0.3214 CTTGA 0.232 CTTGC 0.2492 CTTGG 0.226 CTTGT 0.2928 CTTTA 0.1952 CTTTC 0.2101 CTTTG 0.241 CTTTT 0.3537 GAAAA 0.3521 GAAAC 0.2072 GAAAG 0.1977 GAAAT 0.243 GAACA 0.3409 GAACC 0.2285 GAACG 0.1767 GAACT 0.254 GAAGA 0.3267 GAAGC 0.2397 GAAGG 0.2399 GAAGT 0.1937 GAATA 0.2453 GAATC 0.2316 GAATG 0.2364 GAATT 0.2867 GACAA 0.2976 GACAC 0.2274 GACAG 0.2232 GACAT 0.2518 GACCA 0.3243 GACCC 0.2079 GACCG 0.2156 GACCT 0.2522 GACGA 0.3365 GACGC 0.2272 GACGG 0.2528 GACGT 0.1836 GACTA 0.2391 GACTC 0.2285 GACTG 0.2662 GACTT 0.2662 GAGAA 0.2791 GAGAC 0.1738 GAGAG 0.3119 GAGAT 0.2352 GAGCA 0.3168 GAGCC 0.2128 GAGCG 0.2022 GAGCT 0.2682 GAGGA 0.3169 GAGGC 0.2371 GAGGG 0.2441 GAGGT 0.2019 GAGTA 0.2417 GAGTC 0.198 GAGTG 0.2695 GAGTT 0.2907 GATAA 0.2796 GATAC 0.1795 GATAG 0.2229 GATAT 0.3181 GATCA 0.2743 GATCC 0.2352 GATCG 0.2178 GATCT 0.2727 GATGA 0.2817 GATGC 0.2201 GATGG 0.2748 GATGT 0.2234 GATTA 0.2179 GATTC 0.2203 GATTG 0.2274 GATTT 0.3345 GCAAA 0.2944 GCAAC 0.2476 GCAAG 0.2479 GCAAT 0.2101 GCACA 0.2968 GCACC 0.241 GCACG 0.255 GCACT 0.2071 GCAGA 0.2315 GCAGC 0.3279 GCAGG 0.2386 GCAGT 0.202 GCATA 0.2036 GCATC 0.2354 GCATG 0.3465 GCATT 0.2145 GCCAA 0.2395 GCCAC 0.2755 GCCAG 0.2169 GCCAT 0.2681 GCCCA 0.2822 GCCCC 0.2574 GCCCG 0.227 GCCCT 0.2334 GCCGA 0.1996 GCCGC 0.3325 GCCGG 0.2613 GCCGT 0.2066 GCCTA 0.1861 GCCTC 0.3006 GCCTG 0.2653 GCCTT 0.2481 GCGAA 0.1983 GCGAC 0.2735 GCGAG 0.3278 GCGAT 0.2004 GCGCA 0.2082 GCGCC 0.2676 GCGCG 0.3304 GCGCT 0.1938 GCGGA 0.2002 GCGGC 0.3691 GCGGG 0.2362 GCGGT 0.1945 GCGTA 0.1559 GCGTC 0.2817 GCGTG 0.3607 GCGTT 0.2017 GCTAA 0.2268 GCTAC 0.2299 GCTAG 0.3195 GCTAT 0.2239 GCTCA 0.2257 GCTCC 0.2767 GCTCG 0.2454 GCTCT 0.2522 GCTGA 0.2068 GCTGC 0.3402 GCTGG 0.2485 GCTGT 0.2045 GCTTA 0.1605 GCTTC 0.2718 GCTTG 0.2882 GCTTT 0.2795 GGAAA 0.3042 GGAAC 0.2027 GGAAG 0.28 GGAAT 0.2132 GGACA 0.2837 GGACC 0.2262 GGACG 0.2778 GGACT 0.2123 GGAGA 0.2731 GGAGC 0.2348 GGAGG 0.3141 GGAGT 0.178 GGATA 0.1998 GGATC 0.2465 GGATG 0.2995 GGATT 0.2542 GGCAA 0.2495 GGCAC 0.2338 GGCAG 0.2896 GGCAT 0.2272 GGCCA 0.2731 GGCCC 0.2195 GGCCG 0.286 GGCCT 0.2213 GGCGA 0.2355 GGCGC 0.2567 GGCGG 0.3211 GGCGT 0.1867 GGCTA 0.2118 GGCTC 0.2488 GGCTG 0.3019 GGCTT 0.2374 GGGAA 0.2593 GGGAC 0.19 GGGAG 0.3388 GGGAT 0.2119 GGGCA 0.259 GGGCC 0.2514 GGGCG 0.2688 GGGCT 0.2208 GGGGA 0.2664 GGGGC 0.2401 GGGGG 0.3022 GGGGT 0.1914 GGGTA 0.1838 GGGTC 0.2242 GGGTG 0.3158 GGGTT 0.2762 GGTAA 0.2428 GGTAC 0.2302 GGTAG 0.275 GGTAT 0.252 GGTCA 0.2692 GGTCC 0.235 GGTCG 0.2613 GGTCT 0.2344 GGTGA 0.2292 GGTGC 0.2276 GGTGG 0.3226 GGTGT 0.2206 GGTTA 0.1771 GGTTC 0.2194 GGTTG 0.2902 GGTTT 0.3133 GTAAA 0.34 GTAAC 0.2016 GTAAG 0.1812 GTAAT 0.2772 GTACA 0.3178 GTACC 0.1985 GTACG 0.2094 GTACT 0.2743 GTAGA 0.2716 GTAGC 0.2501 GTAGG 0.2044 GTAGT 0.2739 GTATA 0.289 GTATC 0.1809 GTATG 0.2443 GTATT 0.2857 GTCAA 0.2586 GTCAC 0.2355 GTCAG 0.2205 GTCAT 0.2854 GTCCA 0.3216 GTCCC 0.2153 GTCCG 0.1974 GTCCT 0.2657 GTCGA 0.2264 GTCGC 0.2518 GTCGG 0.2229 GTCGT 0.2989 GTCTA 0.2188 GTCTC 0.2662 GTCTG 0.2455 GTCTT 0.2694 GTGAA 0.2749 GTGAC 0.217 GTGAG 0.2373 GTGAT 0.2708 GTGCA 0.3063 GTGCC 0.2247 GTGCG 0.1981 GTGCT 0.271 GTGGA 0.258 GTGGC 0.2637 GTGGG 0.221 GTGGT 0.2573 GTGTA 0.2072 GTGTC 0.2043 GTGTG 0.3091 GTGTT 0.2794 GTTAA 0.2586 GTTAC 0.2028 GTTAG 0.2389 GTTAT 0.2996 GTTCA 0.2904 GTTCC 0.226 GTTCG 0.1845 GTTCT 0.2991 GTTGA 0.2313 GTTGC 0.2393 GTTGG 0.2406 GTTGT 0.2888 GTTTA 0.1967 GTTTC 0.2027 GTTTG 0.2641 GTTTT 0.3365 TAAAA 0.3799 TAAAC 0.1762 TAAAG 0.161 TAAAT 0.283 TAACA 0.3591 TAACC 0.2159 TAACG 0.1254 TAACT 0.2995 TAAGA 0.3087 TAAGC 0.2108 TAAGG 0.2141 TAAGT 0.2664 TAATA 0.2975 TAATC 0.1797 TAATG 0.1914 TAATT 0.3314 TACAA 0.3125 TACAC 0.1999 TACAG 0.1842 TACAT 0.3034 TACCA 0.3444 TACCC 0.1916 TACCG 0.1688 TACCT 0.2952 TACGA 0.266 TACGC 0.2101 TACGG 0.2062 TACGT 0.3177 TACTA 0.3106 TACTC 0.2056 TACTG 0.2215 TACTT 0.2623 TAGAA 0.3017 TAGAC 0.1609 TAGAG 0.2442 TAGAT 0.2932 TAGCA 0.3097 TAGCC 0.2001 TAGCG 0.1353 TAGCT 0.3549 TAGGA 0.287 TAGGC 0.217 TAGGG 0.2308 TAGGT 0.2652 TAGTA 0.2925 TAGTC 0.166 TAGTG 0.2261 TAGTT 0.3155 TATAA 0.2571 TATAC 0.1553 TATAG 0.1779 TATAT 0.4097 TATCA 0.3098 TATCC 0.2108 TATCG 0.1333 TATCT 0.3462 TATGA 0.2553 TATGC 0.2059 TATGG 0.211 TATGT 0.3277 TATTA 0.2463 TATTC 0.1593 TATTG 0.1898 TATTT 0.4045 TCAAA 0.3321 TCAAC 0.2162 TCAAG 0.2085 TCAAT 0.2432 TCACA 0.2976 TCACC 0.2611 TCACG 0.1807 TCACT 0.2606 TCAGA 0.2719 TCAGC 0.2604 TCAGG 0.2055 TCAGT 0.2622 TCATA 0.2189 TCATC 0.2612 TCATG 0.2596 TCATT 0.2604 TCCAA 0.2708 TCCAC 0.2352 TCCAG 0.1919 TCCAT 0.302 TCCCA 0.2583 TCCCC 0.2747 TCCCG 0.1682 TCCCT 0.2989 TCCGA 0.2298 TCCGC 0.2786 TCCGG 0.2304 TCCGT 0.2613 TCCTA 0.1935 TCCTC 0.3158 TCCTG 0.2091 TCCTT 0.2816 TCGAA 0.2194 TCGAC 0.241 TCGAG 0.2506 TCGAT 0.289 TCGCA 0.2024 TCGCC 0.3182 TCGCG 0.2179 TCGCT 0.2615 TCGGA 0.2253 TCGGC 0.3024 TCGGG 0.1997 TCGGT 0.2726 TCGTA 0.1572 TCGTC 0.3325 TCGTG 0.2619 TCGTT 0.2484 TCTAA 0.2494 TCTAC 0.2051 TCTAG 0.25 TCTAT 0.2955 TCTCA 0.2168 TCTCC 0.2586 TCTCG 0.1668 TCTCT 0.3578 TCTGA 0.2449 TCTGC 0.2726 TCTGG 0.209 TCTGT 0.2735 TCTTA 0.1733 TCTTC 0.273 TCTTG 0.2298 TCTTT 0.3239 TGAAA 0.309 TGAAC 0.1998 TGAAG 0.2341 TGAAT 0.257 TGACA 0.3214 TGACC 0.229 TGACG 0.207 TGACT 0.2427 TGAGA 0.286 TGAGC 0.2393 TGAGG 0.2378 TGAGT 0.2369 TGATA 0.212 TGATC 0.2075 TGATG 0.2981 TGATT 0.2824 TGCAA 0.2482 TGCAC 0.2147 TGCAG 0.2323 TGCAT 0.3047 TGCCA 0.2943 TGCCC 0.2221 TGCCG 0.2129 TGCCT 0.2707 TGCGA 0.2115 TGCGC 0.282 TGCGG 0.242 TGCGT 0.2645 TGCTA 0.2134 TGCTC 0.241 TGCTG 0.2761 TGCTT 0.2695 TGGAA 0.2531 TGGAC 0.2024 TGGAG 0.2705 TGGAT 0.2739 TGGCA 0.2695 TGGCC 0.2456 TGGCG 0.2282 TGGCT 0.2567 TGGGA 0.2531 TGGGC 0.2659 TGGGG 0.2454 TGGGT 0.2357 TGGTA 0.1907 TGGTC 0.202 TGGTG 0.3101 TGGTT 0.2972 TGTAA 0.2468 TGTAC 0.2178 TGTAG 0.2287 TGTAT 0.3067 TGTCA 0.2897 TGTCC 0.2259 TGTCG 0.2042 TGTCT 0.2802 TGTGA 0.2228 TGTGC 0.2391 TGTGG 0.2292 TGTGT 0.3088 TGTTA 0.1755 TGTTC 0.195 TGTTG 0.2649 TGTTT 0.3646 TTAAA 0.3629 TTAAC 0.1616 TTAAG 0.1688 TTAAT 0.3068 TTACA 0.3592 TTACC 0.2089 TTACG 0.1237 TTACT 0.3082 TTAGA 0.2881 TTAGC 0.2151 TTAGG 0.2064 TTAGT 0.2904 TTATA 0.2821 TTATC 0.1661 TTATG 0.195 TTATT 0.3567 TTCAA 0.2861 TTCAC 0.2003 TTCAG 0.2128 TTCAT 0.3008 TTCCA 0.3107 TTCCC 0.227 TTCCG 0.1332 TTCCT 0.3291 TTCGA 0.2443 TTCGC 0.2165 TTCGG 0.2159 TTCGT 0.3233 TTCTA 0.2263 TTCTC 0.2359 TTCTG 0.1954 TTCTT 0.3424 TTGAA 0.2976 TTGAC 0.1805 TTGAG 0.2117 TTGAT 0.3102 TTGCA 0.3195 TTGCC 0.2164 TTGCG 0.1348 TTGCT 0.3293 TTGGA 0.2802 TTGGC 0.2162 TTGGG 0.2017 TTGGT 0.3019 TTGTA 0.2263 TTGTC 0.1868 TTGTG 0.2269 TTGTT 0.36 TTTAA 0.2753 TTTAC 0.1622 TTTAG 0.2122 TTTAT 0.3503 TTTCA 0.2845 TTTCC 0.2148 TTTCG 0.1266 TTTCT 0.3742 TTTGA 0.2468 TTTGC 0.1976 TTTGG 0.2409 TTTGT 0.3147 TTTTA 0.2168 TTTTC 0.1761 TTTTG 0.1956 TTTTT 0.4115