[1] # (a,c,g,t)= (0.299, 0.201, 0.201, 0.299) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.273 C 0.227 G 0.227 T 0.273 # l= 1 # Values AA 0.0848 AC 0.0629 AG 0.054 AT 0.0715 CA 0.0756 CC 0.0542 CG 0.0429 CT 0.054 GA 0.0547 GC 0.0549 GG 0.0542 GT 0.0629 TA 0.058 TC 0.0548 TG 0.0756 TT 0.0849 # l= 2 # Values AAA 0.0297 AAC 0.0172 AAG 0.015 AAT 0.0229 ACA 0.0228 ACC 0.0138 ACG 0.0125 ACT 0.0138 AGA 0.014 AGC 0.0136 AGG 0.0126 AGT 0.0138 ATA 0.0171 ATC 0.0131 ATG 0.0183 ATT 0.0229 CAA 0.0203 CAC 0.0209 CAG 0.0161 CAT 0.0183 CCA 0.0172 CCC 0.0151 CCG 0.00934 CCT 0.0126 CGA 0.0104 CGC 0.0107 CGG 0.00934 CGT 0.0125 CTA 0.0089 CTC 0.014 CTG 0.0161 CTT 0.015 GAA 0.0157 GAC 0.0119 GAG 0.014 GAT 0.0131 GCA 0.0179 GCC 0.0127 GCG 0.0107 GCT 0.0136 GGA 0.0126 GGC 0.0127 GGG 0.0151 GGT 0.0138 GTA 0.0129 GTC 0.0119 GTG 0.0209 GTT 0.0172 TAA 0.019 TAC 0.0129 TAG 0.0089 TAT 0.0171 TCA 0.0178 TCC 0.0126 TCG 0.0104 TCT 0.014 TGA 0.0178 TGC 0.0179 TGG 0.0172 TGT 0.0228 TTA 0.0191 TTC 0.0157 TTG 0.0203 TTT 0.0297 # l= 3 # Values AAAA 0.0105 AAAC 0.00602 AAAG 0.00503 AAAT 0.00817 AACA 0.00682 AACC 0.00361 AACG 0.00309 AACT 0.00368 AAGA 0.00394 AAGC 0.00358 AAGG 0.00339 AAGT 0.00409 AATA 0.0065 AATC 0.00389 AATG 0.00623 AATT 0.00627 ACAA 0.00667 ACAC 0.00602 ACAG 0.00437 ACAT 0.00577 ACCA 0.00472 ACCC 0.00355 ACCG 0.00243 ACCT 0.00314 ACGA 0.00311 ACGC 0.00275 ACGG 0.00254 ACGT 0.00412 ACTA 0.00234 ACTC 0.00319 ACTG 0.00413 ACTT 0.00409 AGAA 0.00421 AGAC 0.00291 AGAG 0.00357 AGAT 0.0033 AGCA 0.00476 AGCC 0.00313 AGCG 0.0025 AGCT 0.0032 AGGA 0.00319 AGGC 0.00287 AGGG 0.00344 AGGT 0.00314 AGTA 0.00294 AGTC 0.00267 AGTG 0.00447 AGTT 0.00368 ATAA 0.0058 ATAC 0.00351 ATAG 0.00249 ATAT 0.00534 ATCA 0.00439 ATCC 0.00279 ATCG 0.00265 ATCT 0.0033 ATGA 0.00467 ATGC 0.00403 ATGG 0.00382 ATGT 0.00577 ATTA 0.00543 ATTC 0.004 ATTG 0.0053 ATTT 0.00817 CAAA 0.00651 CAAC 0.00464 CAAG 0.00387 CAAT 0.0053 CACA 0.00689 CACC 0.00504 CACG 0.00452 CACT 0.00447 CAGA 0.00384 CAGC 0.00467 CAGG 0.00348 CAGT 0.00413 CATA 0.00335 CATC 0.00435 CATG 0.00435 CATT 0.00623 CCAA 0.00422 CCAC 0.00549 CCAG 0.00364 CCAT 0.00382 CCCA 0.00405 CCCC 0.00525 CCCG 0.00233 CCCT 0.00345 CCGA 0.00227 CCGC 0.00264 CCGG 0.00188 CCGT 0.00254 CCTA 0.00196 CCTC 0.00381 CCTG 0.00348 CCTT 0.00339 CGAA 0.00248 CGAC 0.00248 CGAG 0.00278 CGAT 0.00265 CGCA 0.00296 CGCC 0.00268 CGCG 0.00255 CGCT 0.0025 CGGA 0.00191 CGGC 0.00267 CGGG 0.00233 CGGT 0.00243 CGTA 0.0021 CGTC 0.00281 CGTG 0.00452 CGTT 0.00308 CTAA 0.00265 CTAC 0.00245 CTAG 0.00132 CTAT 0.00249 CTCA 0.00375 CTCC 0.00386 CTCG 0.00278 CTCT 0.00357 CTGA 0.00327 CTGC 0.00484 CTGG 0.00364 CTGT 0.00437 CTTA 0.00267 CTTC 0.00344 CTTG 0.00387 CTTT 0.00503 GAAA 0.00526 GAAC 0.00302 GAAG 0.00343 GAAT 0.004 GACA 0.00385 GACC 0.00262 GACG 0.00281 GACT 0.00267 GAGA 0.00381 GAGC 0.00314 GAGG 0.00381 GAGT 0.00319 GATA 0.0027 GATC 0.00218 GATG 0.00435 GATT 0.00389 GCAA 0.00467 GCAC 0.00431 GCAG 0.00484 GCAT 0.00403 GCCA 0.00429 GCCC 0.00291 GCCG 0.00267 GCCT 0.00287 GCGA 0.00269 GCGC 0.00262 GCGG 0.00264 GCGT 0.00275 GCTA 0.00219 GCTC 0.00314 GCTG 0.00467 GCTT 0.00359 GGAA 0.0036 GGAC 0.00234 GGAG 0.00386 GGAT 0.00279 GGCA 0.00379 GGCC 0.00313 GGCG 0.00268 GGCT 0.00313 GGGA 0.00336 GGGC 0.00291 GGGG 0.00525 GGGT 0.00355 GGTA 0.00258 GGTC 0.00261 GGTG 0.00504 GGTT 0.00361 GTAA 0.00408 GTAC 0.00285 GTAG 0.00245 GTAT 0.00351 GTCA 0.00421 GTCC 0.00234 GTCG 0.00248 GTCT 0.00291 GTGA 0.0051 GTGC 0.00431 GTGG 0.00548 GTGT 0.00602 GTTA 0.00351 GTTC 0.00303 GTTG 0.00464 GTTT 0.00602 TAAA 0.00744 TAAC 0.00351 TAAG 0.00266 TAAT 0.00543 TACA 0.00527 TACC 0.00258 TACG 0.0021 TACT 0.00294 TAGA 0.0024 TAGC 0.00219 TAGG 0.00196 TAGT 0.00234 TATA 0.00459 TATC 0.00271 TATG 0.00335 TATT 0.0065 TCAA 0.00475 TCAC 0.0051 TCAG 0.00327 TCAT 0.00467 TCCA 0.00412 TCCC 0.00336 TCCG 0.00191 TCCT 0.00319 TCGA 0.00231 TCGC 0.00269 TCGG 0.00227 TCGT 0.00311 TCTA 0.0024 TCTC 0.00381 TCTG 0.00384 TCTT 0.00394 TGAA 0.00544 TGAC 0.00421 TGAG 0.00375 TGAT 0.00439 TGCA 0.00635 TGCC 0.00379 TGCG 0.00296 TGCT 0.00476 TGGA 0.00412 TGGC 0.00429 TGGG 0.00405 TGGT 0.00471 TGTA 0.00527 TGTC 0.00385 TGTG 0.00689 TGTT 0.00682 TTAA 0.00652 TTAC 0.00408 TTAG 0.00265 TTAT 0.0058 TTCA 0.00544 TTCC 0.0036 TTCG 0.00248 TTCT 0.00421 TTGA 0.00475 TTGC 0.00467 TTGG 0.00422 TTGT 0.00667 TTTA 0.00744 TTTC 0.00527 TTTG 0.00651 TTTT 0.0105 # l= 4 # Values AAAAA 0.00411 AAAAC 0.0021 AAAAG 0.00144 AAAAT 0.00289 AAACA 0.00249 AAACC 0.00114 AAACG 0.0011 AAACT 0.00129 AAAGA 0.00129 AAAGC 0.00121 AAAGG 0.00104 AAAGT 0.00149 AAATA 0.00274 AAATC 0.00132 AAATG 0.00222 AAATT 0.00189 AACAA 0.00209 AACAC 0.00169 AACAG 0.00116 AACAT 0.00188 AACCA 0.00122 AACCC 0.00101 AACCG 0.00054 AACCT 0.00083 AACGA 0.000748 AACGC 0.000732 AACGG 0.000531 AACGT 0.00107 AACTA 0.000746 AACTC 0.000899 AACTG 0.000959 AACTT 0.00108 AAGAA 0.00132 AAGAC 0.000784 AAGAG 0.000957 AAGAT 0.000886 AAGCA 0.00124 AAGCC 0.000793 AAGCG 0.00063 AAGCT 0.000923 AAGGA 0.000837 AAGGC 0.000828 AAGGG 0.000887 AAGGT 0.000836 AAGTA 0.000904 AAGTC 0.00083 AAGTG 0.00128 AAGTT 0.00108 AATAA 0.00255 AATAC 0.00122 AATAG 0.000811 AATAT 0.00193 AATCA 0.00122 AATCC 0.000893 AATCG 0.000833 AATCT 0.000948 AATGA 0.00153 AATGC 0.00135 AATGG 0.00112 AATGT 0.00224 AATTA 0.00174 AATTC 0.00114 AATTG 0.0015 AATTT 0.00189 ACAAA 0.00225 ACAAC 0.00149 ACAAG 0.00117 ACAAT 0.00176 ACACA 0.00245 ACACC 0.00113 ACACG 0.0012 ACACT 0.00124 ACAGA 0.00113 ACAGC 0.00128 ACAGG 0.000899 ACAGT 0.00106 ACATA 0.00103 ACATC 0.00124 ACATG 0.00126 ACATT 0.00224 ACCAA 0.0012 ACCAC 0.00156 ACCAG 0.00098 ACCAT 0.000976 ACCCA 0.00112 ACCCC 0.00105 ACCCG 0.000608 ACCCT 0.000769 ACCGA 0.00068 ACCGC 0.000676 ACCGG 0.000458 ACCGT 0.000616 ACCTA 0.00057 ACCTC 0.000831 ACCTG 0.000904 ACCTT 0.000836 ACGAA 0.000809 ACGAC 0.000771 ACGAG 0.000791 ACGAT 0.00074 ACGCA 0.000916 ACGCC 0.000582 ACGCG 0.000671 ACGCT 0.000576 ACGGA 0.000574 ACGGC 0.000721 ACGGG 0.000633 ACGGT 0.000616 ACGTA 0.00076 ACGTC 0.000909 ACGTG 0.00137 ACGTT 0.00107 ACTAA 0.00072 ACTAC 0.000616 ACTAG 0.000334 ACTAT 0.000673 ACTCA 0.000959 ACTCC 0.000709 ACTCG 0.000753 ACTCT 0.000771 ACTGA 0.000908 ACTGC 0.00129 ACTGG 0.000879 ACTGT 0.00106 ACTTA 0.000784 ACTTC 0.000803 ACTTG 0.00101 ACTTT 0.00149 AGAAA 0.00138 AGAAC 0.00084 AGAAG 0.000951 AGAAT 0.00104 AGACA 0.00107 AGACC 0.000593 AGACG 0.000634 AGACT 0.000622 AGAGA 0.00107 AGAGC 0.00078 AGAGG 0.000946 AGAGT 0.000771 AGATA 0.000711 AGATC 0.000543 AGATG 0.0011 AGATT 0.000948 AGCAA 0.00122 AGCAC 0.00111 AGCAG 0.00143 AGCAT 0.000993 AGCCA 0.00115 AGCCC 0.000722 AGCCG 0.000587 AGCCT 0.000672 AGCGA 0.000681 AGCGC 0.000613 AGCGG 0.000635 AGCGT 0.000576 AGCTA 0.000542 AGCTC 0.000768 AGCTG 0.000967 AGCTT 0.000923 AGGAA 0.000997 AGGAC 0.000629 AGGAG 0.000922 AGGAT 0.000641 AGGCA 0.000884 AGGCC 0.000738 AGGCG 0.000571 AGGCT 0.000672 AGGGA 0.000842 AGGGC 0.000734 AGGGG 0.0011 AGGGT 0.000769 AGGTA 0.000611 AGGTC 0.000641 AGGTG 0.00106 AGGTT 0.00083 AGTAA 0.000901 AGTAC 0.000659 AGTAG 0.000535 AGTAT 0.000844 AGTCA 0.00101 AGTCC 0.000479 AGTCG 0.000557 AGTCT 0.000622 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.000969 AGTGG 0.00118 AGTGT 0.00124 AGTTA 0.000787 AGTTC 0.000652 AGTTG 0.000951 AGTTT 0.00129 ATAAA 0.00234 ATAAC 0.000975 ATAAG 0.000741 ATAAT 0.00174 ATACA 0.0016 ATACC 0.000558 ATACG 0.000509 ATACT 0.000844 ATAGA 0.000681 ATAGC 0.000632 ATAGG 0.000503 ATAGT 0.000673 ATATA 0.00158 ATATC 0.00085 ATATG 0.000985 ATATT 0.00193 ATCAA 0.00116 ATCAC 0.00118 ATCAG 0.000831 ATCAT 0.00122 ATCCA 0.00104 ATCCC 0.00069 ATCCG 0.000414 ATCCT 0.000641 ATCGA 0.00068 ATCGC 0.000695 ATCGG 0.000534 ATCGT 0.00074 ATCTA 0.00065 ATCTC 0.000852 ATCTG 0.000915 ATCTT 0.000886 ATGAA 0.00156 ATGAC 0.000988 ATGAG 0.000898 ATGAT 0.00122 ATGCA 0.00162 ATGCC 0.000813 ATGCG 0.000604 ATGCT 0.000993 ATGGA 0.00104 ATGGC 0.000934 ATGGG 0.000878 ATGGT 0.000976 ATGTA 0.00143 ATGTC 0.000936 ATGTG 0.00152 ATGTT 0.00188 ATTAA 0.00182 ATTAC 0.00114 ATTAG 0.000728 ATTAT 0.00174 ATTCA 0.00141 ATTCC 0.000965 ATTCG 0.000595 ATTCT 0.00104 ATTGA 0.00125 ATTGC 0.0012 ATTGG 0.00108 ATTGT 0.00176 ATTTA 0.0021 ATTTC 0.00138 ATTTG 0.0018 ATTTT 0.00289 CAAAA 0.00199 CAAAC 0.00145 CAAAG 0.00127 CAAAT 0.0018 CAACA 0.00194 CAACC 0.000952 CAACG 0.000803 CAACT 0.000951 CAAGA 0.00101 CAAGC 0.000986 CAAGG 0.000863 CAAGT 0.00101 CAATA 0.00129 CAATC 0.000938 CAATG 0.00157 CAATT 0.0015 CACAA 0.00196 CACAC 0.00207 CACAG 0.00135 CACAT 0.00152 CACCA 0.00182 CACCC 0.00124 CACCG 0.000924 CACCT 0.00106 CACGA 0.00108 CACGC 0.00108 CACGG 0.000986 CACGT 0.00137 CACTA 0.000707 CACTC 0.00102 CACTG 0.00146 CACTT 0.00128 CAGAA 0.00108 CAGAC 0.00084 CAGAG 0.001 CAGAT 0.000915 CAGCA 0.00183 CAGCC 0.00108 CAGCG 0.000799 CAGCT 0.000967 CAGGA 0.000928 CAGGC 0.000758 CAGGG 0.000891 CAGGT 0.000904 CAGTA 0.000871 CAGTC 0.000843 CAGTG 0.00146 CAGTT 0.000959 CATAA 0.000979 CATAC 0.000822 CATAG 0.000561 CATAT 0.000985 CATCA 0.00155 CATCC 0.000834 CATCG 0.000864 CATCT 0.0011 CATGA 0.00107 CATGC 0.00106 CATGG 0.000964 CATGT 0.00126 CATTA 0.0013 CATTC 0.00114 CATTG 0.00157 CATTT 0.00222 CCAAA 0.00133 CCAAC 0.000976 CCAAG 0.00084 CCAAT 0.00108 CCACA 0.00151 CCACC 0.00166 CCACG 0.00113 CCACT 0.00118 CCAGA 0.000826 CCAGC 0.00106 CCAGG 0.000881 CCAGT 0.000879 CCATA 0.000709 CCATC 0.00103 CCATG 0.000964 CCATT 0.00112 CCCAA 0.000948 CCCAC 0.00136 CCCAG 0.00086 CCCAT 0.000878 CCCCA 0.00117 CCCCC 0.00226 CCCCG 0.000713 CCCCT 0.0011 CCCGA 0.000551 CCCGC 0.000651 CCCGG 0.000495 CCCGT 0.000633 CCCTA 0.000482 CCCTC 0.00119 CCCTG 0.000891 CCCTT 0.000887 CCGAA 0.000568 CCGAC 0.000519 CCGAG 0.00065 CCGAT 0.000534 CCGCA 0.000669 CCGCC 0.000785 CCGCG 0.000552 CCGCT 0.000635 CCGGA 0.000391 CCGGC 0.000535 CCGGG 0.000495 CCGGT 0.000458 CCGTA 0.000437 CCGTC 0.00059 CCGTG 0.000986 CCGTT 0.000531 CCTAA 0.000536 CCTAC 0.000615 CCTAG 0.000308 CCTAT 0.000503 CCTCA 0.000831 CCTCC 0.00133 CCTCG 0.000708 CCTCT 0.000946 CCTGA 0.000667 CCTGC 0.00104 CCTGG 0.000881 CCTGT 0.000899 CCTTA 0.000607 CCTTC 0.000879 CCTTG 0.000863 CCTTT 0.00104 CGAAA 0.000898 CGAAC 0.000518 CGAAG 0.000471 CGAAT 0.000595 CGACA 0.000668 CGACC 0.000578 CGACG 0.000677 CGACT 0.000557 CGAGA 0.000658 CGAGC 0.000659 CGAGG 0.000708 CGAGT 0.000753 CGATA 0.00048 CGATC 0.000471 CGATG 0.000864 CGATT 0.000833 CGCAA 0.00073 CGCAC 0.000899 CGCAG 0.000725 CGCAT 0.000604 CGCCA 0.000768 CGCCC 0.000629 CGCCG 0.000716 CGCCT 0.000571 CGCGA 0.00058 CGCGC 0.000742 CGCGG 0.000552 CGCGT 0.000671 CGCTA 0.000388 CGCTC 0.000688 CGCTG 0.000799 CGCTT 0.00063 CGGAA 0.000464 CGGAC 0.000386 CGGAG 0.000645 CGGAT 0.000414 CGGCA 0.000694 CGGCC 0.000671 CGGCG 0.000716 CGGCT 0.000587 CGGGA 0.000498 CGGGC 0.000513 CGGGG 0.000713 CGGGT 0.000608 CGGTA 0.000491 CGGTC 0.000475 CGGTG 0.000924 CGGTT 0.00054 CGTAA 0.0006 CGTAC 0.000491 CGTAG 0.000505 CGTAT 0.000509 CGTCA 0.000975 CGTCC 0.000528 CGTCG 0.000677 CGTCT 0.000634 CGTGA 0.00123 CGTGC 0.000959 CGTGG 0.00113 CGTGT 0.0012 CGTTA 0.000583 CGTTC 0.0006 CGTTG 0.000803 CGTTT 0.0011 CTAAA 0.000991 CTAAC 0.000525 CTAAG 0.000404 CTAAT 0.000728 CTACA 0.000864 CTACC 0.000547 CTACG 0.000505 CTACT 0.000535 CTAGA 0.000374 CTAGC 0.000299 CTAGG 0.000308 CTAGT 0.000334 CTATA 0.000659 CTATC 0.000459 CTATG 0.000561 CTATT 0.000811 CTCAA 0.00108 CTCAC 0.0011 CTCAG 0.000666 CTCAT 0.000898 CTCCA 0.00114 CTCCC 0.00115 CTCCG 0.000645 CTCCT 0.000922 CTCGA 0.000529 CTCGC 0.000806 CTCGG 0.00065 CTCGT 0.000791 CTCTA 0.000534 CTCTC 0.00108 CTCTG 0.001 CTCTT 0.000957 CTGAA 0.00105 CTGAC 0.000726 CTGAG 0.000666 CTGAT 0.000831 CTGCA 0.00162 CTGCC 0.00106 CTGCG 0.000725 CTGCT 0.00143 CTGGA 0.000872 CTGGC 0.000929 CTGGG 0.00086 CTGGT 0.00098 CTGTA 0.00107 CTGTC 0.000796 CTGTG 0.00135 CTGTT 0.00116 CTTAA 0.000954 CTTAC 0.000565 CTTAG 0.000404 CTTAT 0.000741 CTTCA 0.0012 CTTCC 0.000813 CTTCG 0.000471 CTTCT 0.000951 CTTGA 0.000872 CTTGC 0.000991 CTTGG 0.00084 CTTGT 0.00117 CTTTA 0.00128 CTTTC 0.00105 CTTTG 0.00127 CTTTT 0.00144 GAAAA 0.00173 GAAAC 0.00111 GAAAG 0.00105 GAAAT 0.00138 GAACA 0.00104 GAACC 0.000737 GAACG 0.0006 GAACT 0.000652 GAAGA 0.000955 GAAGC 0.000799 GAAGG 0.000879 GAAGT 0.000803 GAATA 0.000972 GAATC 0.000751 GAATG 0.00114 GAATT 0.00114 GACAA 0.00114 GACAC 0.000978 GACAG 0.000796 GACAT 0.000936 GACCA 0.000831 GACCC 0.000667 GACCG 0.000475 GACCT 0.000641 GACGA 0.000755 GACGC 0.000556 GACGG 0.00059 GACGT 0.000909 GACTA 0.000368 GACTC 0.000626 GACTG 0.000843 GACTT 0.00083 GAGAA 0.00102 GAGAC 0.000859 GAGAG 0.00108 GAGAT 0.000852 GAGCA 0.000955 GAGCC 0.000732 GAGCG 0.000688 GAGCT 0.000768 GAGGA 0.000938 GAGGC 0.000861 GAGGG 0.00119 GAGGT 0.000831 GAGTA 0.000643 GAGTC 0.000626 GAGTG 0.00102 GAGTT 0.000899 GATAA 0.000889 GATAC 0.000508 GATAG 0.000459 GATAT 0.00085 GATCA 0.000689 GATCC 0.000473 GATCG 0.000471 GATCT 0.000543 GATGA 0.00121 GATGC 0.000864 GATGG 0.00103 GATGT 0.00124 GATTA 0.000886 GATTC 0.000751 GATTG 0.000938 GATTT 0.00132 GCAAA 0.00144 GCAAC 0.00103 GCAAG 0.000991 GCAAT 0.0012 GCACA 0.00146 GCACC 0.000921 GCACG 0.000959 GCACT 0.000969 GCAGA 0.00104 GCAGC 0.00147 GCAGG 0.00104 GCAGT 0.00129 GCATA 0.000754 GCATC 0.000864 GCATG 0.00106 GCATT 0.00135 GCCAA 0.0011 GCCAC 0.00132 GCCAG 0.000929 GCCAT 0.000934 GCCCA 0.000792 GCCCC 0.000871 GCCCG 0.000513 GCCCT 0.000734 GCCGA 0.000593 GCCGC 0.000816 GCCGG 0.000535 GCCGT 0.000721 GCCTA 0.00042 GCCTC 0.000861 GCCTG 0.000758 GCCTT 0.000828 GCGAA 0.000571 GCGAC 0.000616 GCGAG 0.000806 GCGAT 0.000695 GCGCA 0.000675 GCGCC 0.000588 GCGCG 0.000742 GCGCT 0.000613 GCGGA 0.000497 GCGGC 0.000816 GCGGG 0.000651 GCGGT 0.000676 GCGTA 0.000379 GCGTC 0.000556 GCGTG 0.00108 GCGTT 0.000732 GCTAA 0.000681 GCTAC 0.00058 GCTAG 0.000299 GCTAT 0.000632 GCTCA 0.000927 GCTCC 0.000776 GCTCG 0.000659 GCTCT 0.00078 GCTGA 0.000859 GCTGC 0.00147 GCTGG 0.00106 GCTGT 0.00128 GCTTA 0.000588 GCTTC 0.000799 GCTTG 0.000986 GCTTT 0.00121 GGAAA 0.0012 GGAAC 0.00062 GGAAG 0.000813 GGAAT 0.000965 GGACA 0.000839 GGACC 0.000494 GGACG 0.000528 GGACT 0.000479 GGAGA 0.00105 GGAGC 0.000776 GGAGG 0.00133 GGAGT 0.000709 GGATA 0.000586 GGATC 0.000473 GGATG 0.000834 GGATT 0.000893 GGCAA 0.00102 GGCAC 0.000896 GGCAG 0.00106 GGCAT 0.000813 GGCCA 0.00107 GGCCC 0.000659 GGCCG 0.000671 GGCCT 0.000738 GGCGA 0.000727 GGCGC 0.000588 GGCGG 0.000785 GGCGT 0.000582 GGCTA 0.000526 GGCTC 0.000732 GGCTG 0.00108 GGCTT 0.000793 GGGAA 0.000961 GGGAC 0.000555 GGGAG 0.00115 GGGAT 0.00069 GGGCA 0.000904 GGGCC 0.000659 GGGCG 0.000629 GGGCT 0.000722 GGGGA 0.00106 GGGGC 0.000871 GGGGG 0.00226 GGGGT 0.00105 GGGTA 0.000632 GGGTC 0.000667 GGGTG 0.00124 GGGTT 0.00101 GGTAA 0.000969 GGTAC 0.000505 GGTAG 0.000547 GGTAT 0.000558 GGTCA 0.000952 GGTCC 0.000494 GGTCG 0.000578 GGTCT 0.000593 GGTGA 0.00132 GGTGC 0.000921 GGTGG 0.00166 GGTGT 0.00113 GGTTA 0.000784 GGTTC 0.000737 GGTTG 0.000952 GGTTT 0.00114 GTAAA 0.00163 GTAAC 0.000753 GTAAG 0.000565 GTAAT 0.00114 GTACA 0.0012 GTACC 0.000505 GTACG 0.000491 GTACT 0.000659 GTAGA 0.000638 GTAGC 0.00058 GTAGG 0.000615 GTAGT 0.000616 GTATA 0.000961 GTATC 0.000508 GTATG 0.000822 GTATT 0.00122 GTCAA 0.00107 GTCAC 0.00143 GTCAG 0.000726 GTCAT 0.000988 GTCCA 0.000771 GTCCC 0.000555 GTCCG 0.000386 GTCCT 0.000629 GTCGA 0.000573 GTCGC 0.000616 GTCGG 0.000519 GTCGT 0.000771 GTCTA 0.00043 GTCTC 0.000859 GTCTG 0.00084 GTCTT 0.000784 GTGAA 0.00139 GTGAC 0.00143 GTGAG 0.0011 GTGAT 0.00118 GTGCA 0.00141 GTGCC 0.000896 GTGCG 0.000899 GTGCT 0.00111 GTGGA 0.00124 GTGGC 0.00132 GTGGG 0.00136 GTGGT 0.00156 GTGTA 0.00128 GTGTC 0.000978 GTGTG 0.00207 GTGTT 0.00169 GTTAA 0.00126 GTTAC 0.000753 GTTAG 0.000525 GTTAT 0.000975 GTTCA 0.00105 GTTCC 0.00062 GTTCG 0.000518 GTTCT 0.00084 GTTGA 0.00115 GTTGC 0.00103 GTTGG 0.000976 GTTGT 0.00149 GTTTA 0.00136 GTTTC 0.00111 GTTTG 0.00145 GTTTT 0.0021 TAAAA 0.0027 TAAAC 0.00136 TAAAG 0.00128 TAAAT 0.0021 TAACA 0.00136 TAACC 0.000784 TAACG 0.000583 TAACT 0.000787 TAAGA 0.000686 TAAGC 0.000588 TAAGG 0.000607 TAAGT 0.000784 TAATA 0.0015 TAATC 0.000886 TAATG 0.0013 TAATT 0.00174 TACAA 0.00149 TACAC 0.00128 TACAG 0.00107 TACAT 0.00143 TACCA 0.000845 TACCC 0.000632 TACCG 0.000491 TACCT 0.000611 TACGA 0.000528 TACGC 0.000379 TACGG 0.000437 TACGT 0.00076 TACTA 0.000522 TACTC 0.000643 TACTG 0.000871 TACTT 0.000904 TAGAA 0.000789 TAGAC 0.00043 TAGAG 0.000534 TAGAT 0.00065 TAGCA 0.000737 TAGCC 0.000526 TAGCG 0.000388 TAGCT 0.000542 TAGGA 0.000487 TAGGC 0.00042 TAGGG 0.000482 TAGGT 0.00057 TAGTA 0.000522 TAGTC 0.000368 TAGTG 0.000707 TAGTT 0.000746 TATAA 0.00139 TATAC 0.000961 TATAG 0.000659 TATAT 0.00158 TATCA 0.000927 TATCC 0.000586 TATCG 0.00048 TATCT 0.000711 TATGA 0.000852 TATGC 0.000754 TATGG 0.000709 TATGT 0.00103 TATTA 0.0015 TATTC 0.000972 TATTG 0.00129 TATTT 0.00274 TCAAA 0.00148 TCAAC 0.00115 TCAAG 0.000872 TCAAT 0.00125 TCACA 0.00146 TCACC 0.00132 TCACG 0.00123 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00084 TCAGC 0.000859 TCAGG 0.000667 TCAGT 0.000908 TCATA 0.000852 TCATC 0.00121 TCATG 0.00107 TCATT 0.00153 TCCAA 0.000979 TCCAC 0.00124 TCCAG 0.000872 TCCAT 0.00104 TCCCA 0.000961 TCCCC 0.00106 TCCCG 0.000498 TCCCT 0.000842 TCCGA 0.000446 TCCGC 0.000497 TCCGG 0.000391 TCCGT 0.000574 TCCTA 0.000487 TCCTC 0.000938 TCCTG 0.000928 TCCTT 0.000837 TCGAA 0.000533 TCGAC 0.000573 TCGAG 0.000529 TCGAT 0.00068 TCGCA 0.000699 TCGCC 0.000727 TCGCG 0.00058 TCGCT 0.000681 TCGGA 0.000446 TCGGC 0.000593 TCGGG 0.000551 TCGGT 0.00068 TCGTA 0.000528 TCGTC 0.000755 TCGTG 0.00108 TCGTT 0.000748 TCTAA 0.00071 TCTAC 0.000638 TCTAG 0.000374 TCTAT 0.000681 TCTCA 0.00103 TCTCC 0.00105 TCTCG 0.000658 TCTCT 0.00107 TCTGA 0.00084 TCTGC 0.00104 TCTGG 0.000826 TCTGT 0.00113 TCTTA 0.000686 TCTTC 0.000955 TCTTG 0.00101 TCTTT 0.00129 TGAAA 0.00179 TGAAC 0.00105 TGAAG 0.0012 TGAAT 0.00141 TGACA 0.00127 TGACC 0.000952 TGACG 0.000975 TGACT 0.00101 TGAGA 0.00103 TGAGC 0.000927 TGAGG 0.000831 TGAGT 0.000959 TGATA 0.000927 TGATC 0.000689 TGATG 0.00155 TGATT 0.00122 TGCAA 0.0017 TGCAC 0.00141 TGCAG 0.00162 TGCAT 0.00162 TGCCA 0.0013 TGCCC 0.000904 TGCCG 0.000694 TGCCT 0.000884 TGCGA 0.000699 TGCGC 0.000675 TGCGG 0.000669 TGCGT 0.000916 TGCTA 0.000737 TGCTC 0.000955 TGCTG 0.00183 TGCTT 0.00124 TGGAA 0.00117 TGGAC 0.000771 TGGAG 0.00114 TGGAT 0.00104 TGGCA 0.0013 TGGCC 0.00107 TGGCG 0.000768 TGGCT 0.00115 TGGGA 0.000961 TGGGC 0.000792 TGGGG 0.00117 TGGGT 0.00112 TGGTA 0.000845 TGGTC 0.000831 TGGTG 0.00182 TGGTT 0.00122 TGTAA 0.00161 TGTAC 0.0012 TGTAG 0.000864 TGTAT 0.0016 TGTCA 0.00127 TGTCC 0.000839 TGTCG 0.000668 TGTCT 0.00107 TGTGA 0.00146 TGTGC 0.00146 TGTGG 0.00151 TGTGT 0.00245 TGTTA 0.00136 TGTTC 0.00104 TGTTG 0.00194 TGTTT 0.00249 TTAAA 0.00248 TTAAC 0.00126 TTAAG 0.000954 TTAAT 0.00182 TTACA 0.00161 TTACC 0.000969 TTACG 0.0006 TTACT 0.000901 TTAGA 0.00071 TTAGC 0.000681 TTAGG 0.000536 TTAGT 0.00072 TTATA 0.00139 TTATC 0.000889 TTATG 0.000979 TTATT 0.00255 TTCAA 0.00145 TTCAC 0.00139 TTCAG 0.00105 TTCAT 0.00156 TTCCA 0.00117 TTCCC 0.000961 TTCCG 0.000464 TTCCT 0.000997 TTCGA 0.000533 TTCGC 0.000571 TTCGG 0.000568 TTCGT 0.000809 TTCTA 0.000789 TTCTC 0.00102 TTCTG 0.00108 TTCTT 0.00132 TTGAA 0.00145 TTGAC 0.00107 TTGAG 0.00108 TTGAT 0.00116 TTGCA 0.0017 TTGCC 0.00102 TTGCG 0.00073 TTGCT 0.00122 TTGGA 0.000979 TTGGC 0.0011 TTGGG 0.000948 TTGGT 0.0012 TTGTA 0.00149 TTGTC 0.00114 TTGTG 0.00196 TTGTT 0.00209 TTTAA 0.00248 TTTAC 0.00163 TTTAG 0.000991 TTTAT 0.00234 TTTCA 0.00179 TTTCC 0.0012 TTTCG 0.000898 TTTCT 0.00138 TTTGA 0.00148 TTTGC 0.00144 TTTGG 0.00133 TTTGT 0.00225 TTTTA 0.0027 TTTTC 0.00173 TTTTG 0.00199 TTTTT 0.00411 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3899 AAAAC 0.1992 AAAAG 0.1365 AAAAT 0.2744 AAACA 0.4132 AAACC 0.1889 AAACG 0.183 AAACT 0.2149 AAAGA 0.257 AAAGC 0.2407 AAAGG 0.2064 AAAGT 0.2959 AAATA 0.3354 AAATC 0.1615 AAATG 0.2714 AAATT 0.2317 AACAA 0.306 AACAC 0.2481 AACAG 0.1696 AACAT 0.2763 AACCA 0.3392 AACCC 0.281 AACCG 0.1497 AACCT 0.2301 AACGA 0.2427 AACGC 0.2372 AACGG 0.172 AACGT 0.3481 AACTA 0.2026 AACTC 0.2442 AACTG 0.2602 AACTT 0.293 AAGAA 0.3337 AAGAC 0.1989 AAGAG 0.2426 AAGAT 0.2248 AAGCA 0.3457 AAGCC 0.2213 AAGCG 0.1756 AAGCT 0.2574 AAGGA 0.2471 AAGGC 0.2445 AAGGG 0.2617 AAGGT 0.2467 AAGTA 0.221 AAGTC 0.2029 AAGTG 0.3124 AAGTT 0.2638 AATAA 0.3917 AATAC 0.1876 AATAG 0.1247 AATAT 0.2961 AATCA 0.3133 AATCC 0.2294 AATCG 0.2139 AATCT 0.2434 AATGA 0.246 AATGC 0.2159 AATGG 0.1792 AATGT 0.359 AATTA 0.2777 AATTC 0.181 AATTG 0.2397 AATTT 0.3016 ACAAA 0.3378 ACAAC 0.2227 ACAAG 0.175 ACAAT 0.2646 ACACA 0.4064 ACACC 0.1885 ACACG 0.1996 ACACT 0.2055 ACAGA 0.2581 ACAGC 0.2941 ACAGG 0.2059 ACAGT 0.2419 ACATA 0.1788 ACATC 0.2151 ACATG 0.218 ACATT 0.3881 ACCAA 0.2539 ACCAC 0.3313 ACCAG 0.2078 ACCAT 0.207 ACCCA 0.3162 ACCCC 0.2966 ACCCG 0.1709 ACCCT 0.2162 ACCGA 0.2799 ACCGC 0.2781 ACCGG 0.1885 ACCGT 0.2534 ACCTA 0.1816 ACCTC 0.2644 ACCTG 0.2878 ACCTT 0.2661 ACGAA 0.26 ACGAC 0.2478 ACGAG 0.2542 ACGAT 0.238 ACGCA 0.3336 ACGCC 0.2121 ACGCG 0.2445 ACGCT 0.2099 ACGGA 0.2255 ACGGC 0.2833 ACGGG 0.249 ACGGT 0.2421 ACGTA 0.1847 ACGTC 0.2208 ACGTG 0.3339 ACGTT 0.2607 ACTAA 0.3071 ACTAC 0.263 ACTAG 0.1427 ACTAT 0.2872 ACTCA 0.3004 ACTCC 0.2222 ACTCG 0.2359 ACTCT 0.2416 ACTGA 0.2197 ACTGC 0.3122 ACTGG 0.2126 ACTGT 0.2556 ACTTA 0.1916 ACTTC 0.1964 ACTTG 0.2479 ACTTT 0.3641 AGAAA 0.3273 AGAAC 0.1997 AGAAG 0.226 AGAAT 0.247 AGACA 0.3656 AGACC 0.2033 AGACG 0.2176 AGACT 0.2135 AGAGA 0.3008 AGAGC 0.2185 AGAGG 0.2648 AGAGT 0.2159 AGATA 0.2153 AGATC 0.1646 AGATG 0.3332 AGATT 0.2869 AGCAA 0.2569 AGCAC 0.2332 AGCAG 0.3013 AGCAT 0.2087 AGCCA 0.367 AGCCC 0.2307 AGCCG 0.1875 AGCCT 0.2148 AGCGA 0.2719 AGCGC 0.2448 AGCGG 0.2533 AGCGT 0.23 AGCTA 0.1694 AGCTC 0.2399 AGCTG 0.3023 AGCTT 0.2884 AGGAA 0.3126 AGGAC 0.1972 AGGAG 0.2892 AGGAT 0.2009 AGGCA 0.3086 AGGCC 0.2577 AGGCG 0.1992 AGGCT 0.2345 AGGGA 0.2444 AGGGC 0.2129 AGGGG 0.3196 AGGGT 0.2231 AGGTA 0.1945 AGGTC 0.2041 AGGTG 0.337 AGGTT 0.2643 AGTAA 0.3064 AGTAC 0.2243 AGTAG 0.182 AGTAT 0.2872 AGTCA 0.378 AGTCC 0.1797 AGTCG 0.2089 AGTCT 0.2334 AGTGA 0.2415 AGTGC 0.2169 AGTGG 0.2647 AGTGT 0.277 AGTTA 0.2137 AGTTC 0.1771 AGTTG 0.2581 AGTTT 0.3511 ATAAA 0.4034 ATAAC 0.168 ATAAG 0.1278 ATAAT 0.3008 ATACA 0.4551 ATACC 0.1591 ATACG 0.1452 ATACT 0.2406 ATAGA 0.2737 ATAGC 0.254 ATAGG 0.2019 ATAGT 0.2704 ATATA 0.2961 ATATC 0.1592 ATATG 0.1844 ATATT 0.3603 ATCAA 0.2639 ATCAC 0.2686 ATCAG 0.1894 ATCAT 0.2781 ATCCA 0.3739 ATCCC 0.2477 ATCCG 0.1485 ATCCT 0.23 ATCGA 0.2566 ATCGC 0.2623 ATCGG 0.2016 ATCGT 0.2795 ATCTA 0.1968 ATCTC 0.2579 ATCTG 0.277 ATCTT 0.2683 ATGAA 0.3342 ATGAC 0.2118 ATGAG 0.1924 ATGAT 0.2615 ATGCA 0.4018 ATGCC 0.2018 ATGCG 0.15 ATGCT 0.2464 ATGGA 0.2708 ATGGC 0.2443 ATGGG 0.2296 ATGGT 0.2553 ATGTA 0.2478 ATGTC 0.1623 ATGTG 0.2632 ATGTT 0.3267 ATTAA 0.3355 ATTAC 0.2094 ATTAG 0.1339 ATTAT 0.3211 ATTCA 0.3511 ATTCC 0.241 ATTCG 0.1485 ATTCT 0.2594 ATTGA 0.2358 ATTGC 0.2271 ATTGG 0.2041 ATTGT 0.333 ATTTA 0.2575 ATTTC 0.1687 ATTTG 0.2201 ATTTT 0.3537 CAAAA 0.3058 CAAAC 0.2234 CAAAG 0.1946 CAAAT 0.2762 CAACA 0.4171 CAACC 0.2051 CAACG 0.173 CAACT 0.2048 CAAGA 0.26 CAAGC 0.2548 CAAGG 0.2231 CAAGT 0.2621 CAATA 0.243 CAATC 0.177 CAATG 0.2962 CAATT 0.2838 CACAA 0.2841 CACAC 0.3003 CACAG 0.1954 CACAT 0.2202 CACCA 0.3604 CACCC 0.2461 CACCG 0.1835 CACCT 0.2101 CACGA 0.2393 CACGC 0.2385 CACGG 0.2182 CACGT 0.304 CACTA 0.1582 CACTC 0.2286 CACTG 0.3271 CACTT 0.2861 CAGAA 0.2813 CAGAC 0.219 CAGAG 0.2614 CAGAT 0.2384 CAGCA 0.3911 CAGCC 0.2306 CAGCG 0.1711 CAGCT 0.2072 CAGGA 0.2666 CAGGC 0.2179 CAGGG 0.2559 CAGGT 0.2597 CAGTA 0.2107 CAGTC 0.2038 CAGTG 0.3536 CAGTT 0.2319 CATAA 0.2924 CATAC 0.2456 CATAG 0.1676 CATAT 0.2943 CATCA 0.3569 CATCC 0.1917 CATCG 0.1985 CATCT 0.2529 CATGA 0.2452 CATGC 0.2445 CATGG 0.2215 CATGT 0.2888 CATTA 0.209 CATTC 0.1836 CATTG 0.2518 CATTT 0.3556 CCAAA 0.3139 CCAAC 0.2311 CCAAG 0.199 CCAAT 0.2561 CCACA 0.276 CCACC 0.3023 CCACG 0.206 CCACT 0.2156 CCAGA 0.2267 CCAGC 0.2903 CCAGG 0.2419 CCAGT 0.2411 CCATA 0.1854 CCATC 0.2703 CCATG 0.2522 CCATT 0.2921 CCCAA 0.2341 CCCAC 0.3366 CCCAG 0.2125 CCCAT 0.2168 CCCCA 0.2229 CCCCC 0.4314 CCCCG 0.1359 CCCCT 0.2098 CCCGA 0.2364 CCCGC 0.2794 CCCGG 0.2125 CCCGT 0.2717 CCCTA 0.1399 CCCTC 0.344 CCCTG 0.2586 CCCTT 0.2574 CCGAA 0.2503 CCGAC 0.2284 CCGAG 0.2863 CCGAT 0.235 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.2972 CCGCG 0.2091 CCGCT 0.2403 CCGGA 0.2081 CCGGC 0.2847 CCGGG 0.2635 CCGGT 0.2437 CCGTA 0.1718 CCGTC 0.232 CCGTG 0.3877 CCGTT 0.2085 CCTAA 0.2733 CCTAC 0.3134 CCTAG 0.1569 CCTAT 0.2564 CCTCA 0.218 CCTCC 0.3485 CCTCG 0.1855 CCTCT 0.248 CCTGA 0.1914 CCTGC 0.2975 CCTGG 0.253 CCTGT 0.2581 CCTTA 0.1792 CCTTC 0.2594 CCTTG 0.2548 CCTTT 0.3065 CGAAA 0.3618 CGAAC 0.2086 CGAAG 0.19 CGAAT 0.2396 CGACA 0.2692 CGACC 0.2333 CGACG 0.2729 CGACT 0.2246 CGAGA 0.2368 CGAGC 0.2374 CGAGG 0.2548 CGAGT 0.271 CGATA 0.1812 CGATC 0.1779 CGATG 0.3263 CGATT 0.3146 CGCAA 0.2467 CGCAC 0.3039 CGCAG 0.245 CGCAT 0.2043 CGCCA 0.2862 CGCCC 0.2343 CGCCG 0.2668 CGCCT 0.2127 CGCGA 0.228 CGCGC 0.2914 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2637 CGCTA 0.155 CGCTC 0.2746 CGCTG 0.319 CGCTT 0.2514 CGGAA 0.2433 CGGAC 0.2021 CGGAG 0.338 CGGAT 0.2167 CGGCA 0.2601 CGGCC 0.2517 CGGCG 0.2683 CGGCT 0.22 CGGGA 0.2135 CGGGC 0.2201 CGGGG 0.3059 CGGGT 0.2605 CGGTA 0.2021 CGGTC 0.1953 CGGTG 0.3803 CGGTT 0.2222 CGTAA 0.2851 CGTAC 0.2331 CGTAG 0.2397 CGTAT 0.242 CGTCA 0.3466 CGTCC 0.1875 CGTCG 0.2405 CGTCT 0.2254 CGTGA 0.2719 CGTGC 0.2122 CGTGG 0.25 CGTGT 0.2659 CGTTA 0.1888 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.2602 CGTTT 0.3566 CTAAA 0.3744 CTAAC 0.1982 CTAAG 0.1525 CTAAT 0.2749 CTACA 0.3527 CTACC 0.2232 CTACG 0.2059 CTACT 0.2183 CTAGA 0.2844 CTAGC 0.2276 CTAGG 0.2338 CTAGT 0.2543 CTATA 0.2645 CTATC 0.1845 CTATG 0.2253 CTATT 0.3256 CTCAA 0.2883 CTCAC 0.2942 CTCAG 0.1779 CTCAT 0.2397 CTCCA 0.2949 CTCCC 0.2988 CTCCG 0.1672 CTCCT 0.2391 CTCGA 0.1906 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.2341 CTCGT 0.2849 CTCTA 0.1495 CTCTC 0.3017 CTCTG 0.2809 CTCTT 0.2679 CTGAA 0.3207 CTGAC 0.2217 CTGAG 0.2037 CTGAT 0.2539 CTGCA 0.3354 CTGCC 0.2185 CTGCG 0.1498 CTGCT 0.2963 CTGGA 0.2396 CTGGC 0.2551 CTGGG 0.2363 CTGGT 0.269 CTGTA 0.2449 CTGTC 0.1822 CTGTG 0.3082 CTGTT 0.2647 CTTAA 0.3581 CTTAC 0.2122 CTTAG 0.1515 CTTAT 0.2782 CTTCA 0.3493 CTTCC 0.2367 CTTCG 0.1372 CTTCT 0.2768 CTTGA 0.2252 CTTGC 0.2561 CTTGG 0.2171 CTTGT 0.3016 CTTTA 0.2542 CTTTC 0.2082 CTTTG 0.2518 CTTTT 0.2857 GAAAA 0.3295 GAAAC 0.21 GAAAG 0.1989 GAAAT 0.2617 GAACA 0.3427 GAACC 0.2435 GAACG 0.1983 GAACT 0.2155 GAAGA 0.2779 GAAGC 0.2326 GAAGG 0.2557 GAAGT 0.2338 GAATA 0.2429 GAATC 0.1876 GAATG 0.2858 GAATT 0.2837 GACAA 0.2958 GACAC 0.2541 GACAG 0.2069 GACAT 0.2432 GACCA 0.318 GACCC 0.2553 GACCG 0.1816 GACCT 0.2452 GACGA 0.2688 GACGC 0.1979 GACGG 0.2099 GACGT 0.3234 GACTA 0.1378 GACTC 0.2347 GACTG 0.316 GACTT 0.3114 GAGAA 0.2681 GAGAC 0.2255 GAGAG 0.2829 GAGAT 0.2236 GAGCA 0.3038 GAGCC 0.2329 GAGCG 0.2189 GAGCT 0.2444 GAGGA 0.2459 GAGGC 0.2257 GAGGG 0.3107 GAGGT 0.2177 GAGTA 0.2015 GAGTC 0.1962 GAGTG 0.3202 GAGTT 0.282 GATAA 0.3284 GATAC 0.1876 GATAG 0.1697 GATAT 0.3142 GATCA 0.3166 GATCC 0.2172 GATCG 0.2164 GATCT 0.2498 GATGA 0.2789 GATGC 0.1985 GATGG 0.2376 GATGT 0.285 GATTA 0.2275 GATTC 0.1929 GATTG 0.2408 GATTT 0.3387 GCAAA 0.3092 GCAAC 0.2212 GCAAG 0.2121 GCAAT 0.2575 GCACA 0.3395 GCACC 0.2135 GCACG 0.2224 GCACT 0.2246 GCAGA 0.216 GCAGC 0.3029 GCAGG 0.2143 GCAGT 0.2668 GCATA 0.1871 GCATC 0.2144 GCATG 0.2643 GCATT 0.3342 GCCAA 0.2564 GCCAC 0.3089 GCCAG 0.2167 GCCAT 0.2179 GCCCA 0.2723 GCCCC 0.2994 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.252 GCCGA 0.2225 GCCGC 0.3062 GCCGG 0.2009 GCCGT 0.2704 GCCTA 0.1464 GCCTC 0.3002 GCCTG 0.2645 GCCTT 0.2889 GCGAA 0.2125 GCGAC 0.2293 GCGAG 0.2999 GCGAT 0.2584 GCGCA 0.2577 GCGCC 0.2246 GCGCG 0.2834 GCGCT 0.2343 GCGGA 0.1882 GCGGC 0.3092 GCGGG 0.2467 GCGGT 0.256 GCGTA 0.1382 GCGTC 0.2026 GCGTG 0.3927 GCGTT 0.2664 GCTAA 0.3107 GCTAC 0.2645 GCTAG 0.1365 GCTAT 0.2883 GCTCA 0.2949 GCTCC 0.247 GCTCG 0.2098 GCTCT 0.2483 GCTGA 0.1841 GCTGC 0.314 GCTGG 0.2267 GCTGT 0.2753 GCTTA 0.164 GCTTC 0.223 GCTTG 0.275 GCTTT 0.3379 GGAAA 0.3335 GGAAC 0.1723 GGAAG 0.2259 GGAAT 0.2682 GGACA 0.3585 GGACC 0.2111 GGACG 0.2255 GGACT 0.2048 GGAGA 0.2709 GGAGC 0.2011 GGAGG 0.3444 GGAGT 0.1837 GGATA 0.2105 GGATC 0.1696 GGATG 0.2994 GGATT 0.3205 GGCAA 0.2694 GGCAC 0.2367 GGCAG 0.2791 GGCAT 0.2147 GGCCA 0.3401 GGCCC 0.2102 GGCCG 0.2141 GGCCT 0.2356 GGCGA 0.2711 GGCGC 0.2193 GGCGG 0.2926 GGCGT 0.2171 GGCTA 0.1681 GGCTC 0.2339 GGCTG 0.3442 GGCTT 0.2537 GGGAA 0.2862 GGGAC 0.1651 GGGAG 0.3433 GGGAT 0.2054 GGGCA 0.3104 GGGCC 0.2261 GGGCG 0.2157 GGGCT 0.2478 GGGGA 0.2016 GGGGC 0.166 GGGGG 0.4315 GGGGT 0.2009 GGGTA 0.1778 GGGTC 0.1879 GGGTG 0.3489 GGGTT 0.2854 GGTAA 0.3757 GGTAC 0.1957 GGTAG 0.2122 GGTAT 0.2165 GGTCA 0.3637 GGTCC 0.1888 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2265 GGTGA 0.2628 GGTGC 0.1829 GGTGG 0.3291 GGTGT 0.2253 GGTTA 0.2171 GGTTC 0.2043 GGTTG 0.2638 GGTTT 0.3148 GTAAA 0.3982 GTAAC 0.1844 GTAAG 0.1385 GTAAT 0.2788 GTACA 0.4202 GTACC 0.1768 GTACG 0.1719 GTACT 0.231 GTAGA 0.2606 GTAGC 0.2369 GTAGG 0.2509 GTAGT 0.2517 GTATA 0.2737 GTATC 0.1447 GTATG 0.2342 GTATT 0.3474 GTCAA 0.253 GTCAC 0.3397 GTCAG 0.1724 GTCAT 0.2348 GTCCA 0.3293 GTCCC 0.237 GTCCG 0.1649 GTCCT 0.2688 GTCGA 0.231 GTCGC 0.2487 GTCGG 0.2093 GTCGT 0.311 GTCTA 0.1477 GTCTC 0.2948 GTCTG 0.2884 GTCTT 0.2691 GTGAA 0.2719 GTGAC 0.2806 GTGAG 0.2163 GTGAT 0.2313 GTGCA 0.3268 GTGCC 0.2078 GTGCG 0.2084 GTGCT 0.2571 GTGGA 0.2255 GTGGC 0.2413 GTGGG 0.2484 GTGGT 0.2847 GTGTA 0.2133 GTGTC 0.1623 GTGTG 0.3435 GTGTT 0.2809 GTTAA 0.3588 GTTAC 0.2143 GTTAG 0.1494 GTTAT 0.2775 GTTCA 0.3464 GTTCC 0.2049 GTTCG 0.1711 GTTCT 0.2776 GTTGA 0.2471 GTTGC 0.2227 GTTGG 0.2102 GTTGT 0.32 GTTTA 0.2259 GTTTC 0.1838 GTTTG 0.2417 GTTTT 0.3486 TAAAA 0.3628 TAAAC 0.1827 TAAAG 0.1719 TAAAT 0.2827 TAACA 0.3869 TAACC 0.2232 TAACG 0.1659 TAACT 0.2241 TAAGA 0.2573 TAAGC 0.2206 TAAGG 0.2279 TAAGT 0.2942 TAATA 0.2765 TAATC 0.163 TAATG 0.2398 TAATT 0.3207 TACAA 0.2824 TACAC 0.2436 TACAG 0.2029 TACAT 0.271 TACCA 0.3276 TACCC 0.245 TACCG 0.1905 TACCT 0.2369 TACGA 0.2507 TACGC 0.1803 TACGG 0.2077 TACGT 0.3613 TACTA 0.1774 TACTC 0.2187 TACTG 0.2963 TACTT 0.3077 TAGAA 0.3283 TAGAC 0.1791 TAGAG 0.2222 TAGAT 0.2705 TAGCA 0.3361 TAGCC 0.2398 TAGCG 0.177 TAGCT 0.2472 TAGGA 0.2488 TAGGC 0.2143 TAGGG 0.2459 TAGGT 0.2911 TAGTA 0.2227 TAGTC 0.1569 TAGTG 0.3018 TAGTT 0.3186 TATAA 0.3024 TATAC 0.2094 TATAG 0.1435 TATAT 0.3448 TATCA 0.3429 TATCC 0.2168 TATCG 0.1774 TATCT 0.2629 TATGA 0.2548 TATGC 0.2252 TATGG 0.2119 TATGT 0.3081 TATTA 0.2311 TATTC 0.1495 TATTG 0.1981 TATTT 0.4213 TCAAA 0.3123 TCAAC 0.2414 TCAAG 0.1834 TCAAT 0.2629 TCACA 0.2874 TCACC 0.2597 TCACG 0.2412 TCACT 0.2117 TCAGA 0.2565 TCAGC 0.2625 TCAGG 0.2037 TCAGT 0.2774 TCATA 0.1827 TCATC 0.2601 TCATG 0.2287 TCATT 0.3286 TCCAA 0.2375 TCCAC 0.3 TCCAG 0.2115 TCCAT 0.251 TCCCA 0.2862 TCCCC 0.315 TCCCG 0.1482 TCCCT 0.2507 TCCGA 0.234 TCCGC 0.2604 TCCGG 0.205 TCCGT 0.3006 TCCTA 0.1528 TCCTC 0.2939 TCCTG 0.2909 TCCTT 0.2623 TCGAA 0.2304 TCGAC 0.2474 TCGAG 0.2286 TCGAT 0.2936 TCGCA 0.2601 TCGCC 0.2706 TCGCG 0.2159 TCGCT 0.2534 TCGGA 0.1966 TCGGC 0.2612 TCGGG 0.2427 TCGGT 0.2995 TCGTA 0.1695 TCGTC 0.2427 TCGTG 0.3475 TCGTT 0.2404 TCTAA 0.2954 TCTAC 0.2655 TCTAG 0.1556 TCTAT 0.2834 TCTCA 0.2706 TCTCC 0.2746 TCTCG 0.1728 TCTCT 0.2821 TCTGA 0.2188 TCTGC 0.2722 TCTGG 0.2152 TCTGT 0.2938 TCTTA 0.174 TCTTC 0.2424 TCTTG 0.2553 TCTTT 0.3283 TGAAA 0.3288 TGAAC 0.1925 TGAAG 0.2204 TGAAT 0.2583 TGACA 0.3029 TGACC 0.2261 TGACG 0.2317 TGACT 0.2394 TGAGA 0.275 TGAGC 0.2473 TGAGG 0.2219 TGAGT 0.2558 TGATA 0.2113 TGATC 0.157 TGATG 0.3538 TGATT 0.2779 TGCAA 0.2676 TGCAC 0.222 TGCAG 0.2555 TGCAT 0.2549 TGCCA 0.3444 TGCCC 0.2389 TGCCG 0.1832 TGCCT 0.2335 TGCGA 0.2363 TGCGC 0.2281 TGCGG 0.2261 TGCGT 0.3095 TGCTA 0.1549 TGCTC 0.2007 TGCTG 0.3838 TGCTT 0.2606 TGGAA 0.2847 TGGAC 0.1868 TGGAG 0.2759 TGGAT 0.2525 TGGCA 0.3042 TGGCC 0.2488 TGGCG 0.1791 TGGCT 0.2679 TGGGA 0.2375 TGGGC 0.1958 TGGGG 0.289 TGGGT 0.2777 TGGTA 0.1791 TGGTC 0.1763 TGGTG 0.385 TGGTT 0.2596 TGTAA 0.3054 TGTAC 0.2275 TGTAG 0.164 TGTAT 0.303 TGTCA 0.3314 TGTCC 0.2181 TGTCG 0.1735 TGTCT 0.2769 TGTGA 0.2126 TGTGC 0.2126 TGTGG 0.2197 TGTGT 0.3551 TGTTA 0.1993 TGTTC 0.1522 TGTTG 0.2839 TGTTT 0.3646 TTAAA 0.3809 TTAAC 0.1933 TTAAG 0.1464 TTAAT 0.2795 TTACA 0.3946 TTACC 0.2375 TTACG 0.1471 TTACT 0.2208 TTAGA 0.2682 TTAGC 0.2574 TTAGG 0.2024 TTAGT 0.2719 TTATA 0.2391 TTATC 0.1532 TTATG 0.1687 TTATT 0.4389 TTCAA 0.266 TTCAC 0.2546 TTCAG 0.1928 TTCAT 0.2866 TTCCA 0.3265 TTCCC 0.2672 TTCCG 0.1291 TTCCT 0.2772 TTCGA 0.2148 TTCGC 0.2302 TTCGG 0.229 TTCGT 0.3259 TTCTA 0.1877 TTCTC 0.2428 TTCTG 0.2567 TTCTT 0.3129 TTGAA 0.3047 TTGAC 0.2242 TTGAG 0.2273 TTGAT 0.2437 TTGCA 0.3638 TTGCC 0.2184 TTGCG 0.1562 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2319 TTGGC 0.2602 TTGGG 0.2244 TTGGT 0.2835 TTGTA 0.2232 TTGTC 0.1706 TTGTG 0.2934 TTGTT 0.3128 TTTAA 0.3338 TTTAC 0.2185 TTTAG 0.1332 TTTAT 0.3145 TTTCA 0.34 TTTCC 0.2279 TTTCG 0.1706 TTTCT 0.2615 TTTGA 0.2281 TTTGC 0.222 TTTGG 0.2037 TTTGT 0.3462 TTTTA 0.2563 TTTTC 0.1648 TTTTG 0.189 TTTTT 0.3899 [2] # (a,c,g,t)= (0.258, 0.242, 0.242, 0.258) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.265 C 0.235 G 0.235 T 0.265 # l= 1 # Values AA 0.0795 AC 0.0637 AG 0.0545 AT 0.067 CA 0.0755 CC 0.0581 CG 0.0473 CT 0.0545 GA 0.0556 GC 0.058 GG 0.0581 GT 0.0636 TA 0.0539 TC 0.0556 TG 0.0755 TT 0.0795 # l= 2 # Values AAA 0.0274 AAC 0.0168 AAG 0.0144 AAT 0.021 ACA 0.0223 ACC 0.0146 ACG 0.0134 ACT 0.0134 AGA 0.0139 AGC 0.014 AGG 0.0131 AGT 0.0134 ATA 0.0156 ATC 0.013 ATG 0.0173 ATT 0.021 CAA 0.0195 CAC 0.0222 CAG 0.0165 CAT 0.0173 CCA 0.0177 CCC 0.0167 CCG 0.0106 CCT 0.0131 CGA 0.0112 CGC 0.0122 CGG 0.0106 CGT 0.0134 CTA 0.00862 CTC 0.015 CTG 0.0165 CTT 0.0144 GAA 0.0152 GAC 0.0125 GAG 0.015 GAT 0.013 GCA 0.018 GCC 0.0138 GCG 0.0122 GCT 0.014 GGA 0.013 GGC 0.0138 GGG 0.0167 GGT 0.0146 GTA 0.0122 GTC 0.0125 GTG 0.0222 GTT 0.0168 TAA 0.0174 TAC 0.0122 TAG 0.00863 TAT 0.0156 TCA 0.0175 TCC 0.013 TCG 0.0112 TCT 0.0139 TGA 0.0175 TGC 0.018 TGG 0.0177 TGT 0.0223 TTA 0.0174 TTC 0.0152 TTG 0.0196 TTT 0.0274 # l= 3 # Values AAAA 0.00955 AAAC 0.00571 AAAG 0.00471 AAAT 0.00739 AACA 0.00649 AACC 0.00364 AACG 0.00315 AACT 0.00349 AAGA 0.00377 AAGC 0.00347 AAGG 0.00333 AAGT 0.00385 AATA 0.00586 AATC 0.00375 AATG 0.00567 AATT 0.00569 ACAA 0.0063 ACAC 0.00634 ACAG 0.00439 ACAT 0.00533 ACCA 0.00484 ACCC 0.00386 ACCG 0.00267 ACCT 0.00318 ACGA 0.00328 ACGC 0.00306 ACGG 0.00282 ACGT 0.0042 ACTA 0.0022 ACTC 0.00335 ACTG 0.00399 ACTT 0.00385 AGAA 0.00397 AGAC 0.00302 AGAG 0.00374 AGAT 0.00322 AGCA 0.00472 AGCC 0.00328 AGCG 0.00282 AGCT 0.00321 AGGA 0.00323 AGGC 0.003 AGGG 0.00368 AGGT 0.00318 AGTA 0.00269 AGTC 0.0027 AGTG 0.00451 AGTT 0.00349 ATAA 0.00527 ATAC 0.00324 ATAG 0.00236 ATAT 0.00477 ATCA 0.00425 ATCC 0.00277 ATCG 0.00278 ATCT 0.00322 ATGA 0.00447 ATGC 0.00379 ATGG 0.00376 ATGT 0.00533 ATTA 0.00489 ATTC 0.00381 ATTG 0.00488 ATTT 0.00739 CAAA 0.00612 CAAC 0.00473 CAAG 0.00382 CAAT 0.00488 CACA 0.0071 CACC 0.00556 CACG 0.00499 CACT 0.00451 CAGA 0.00388 CAGC 0.00495 CAGG 0.00365 CAGT 0.00399 CATA 0.00309 CATC 0.00448 CATG 0.00411 CATT 0.00567 CCAA 0.00418 CCAC 0.00597 CCAG 0.00382 CCAT 0.00376 CCCA 0.00434 CCCC 0.00592 CCCG 0.00272 CCCT 0.00368 CCGA 0.00247 CCGC 0.00309 CCGG 0.00224 CCGT 0.00282 CCTA 0.00194 CCTC 0.00417 CCTG 0.00365 CCTT 0.00333 CGAA 0.00253 CGAC 0.00277 CGAG 0.00309 CGAT 0.00278 CGCA 0.00325 CGCC 0.00312 CGCG 0.00301 CGCT 0.00282 CGGA 0.0021 CGGC 0.00312 CGGG 0.00272 CGGT 0.00267 CGTA 0.00213 CGTC 0.00309 CGTG 0.00499 CGTT 0.00314 CTAA 0.00248 CTAC 0.00248 CTAG 0.00131 CTAT 0.00236 CTCA 0.00389 CTCC 0.00424 CTCG 0.00309 CTCT 0.00374 CTGA 0.00321 CTGC 0.00505 CTGG 0.00382 CTGT 0.00439 CTTA 0.00246 CTTC 0.00341 CTTG 0.00382 CTTT 0.00472 GAAA 0.00493 GAAC 0.00302 GAAG 0.00341 GAAT 0.00381 GACA 0.00389 GACC 0.00281 GACG 0.00309 GACT 0.0027 GAGA 0.00401 GAGC 0.00344 GAGG 0.00417 GAGT 0.00335 GATA 0.00257 GATC 0.00222 GATG 0.00448 GATT 0.00375 GCAA 0.00454 GCAC 0.00457 GCAG 0.00505 GCAT 0.00379 GCCA 0.00446 GCCC 0.00326 GCCG 0.00312 GCCT 0.003 GCGA 0.00298 GCGC 0.00307 GCGG 0.00309 GCGT 0.00306 GCTA 0.00218 GCTC 0.00344 GCTG 0.00495 GCTT 0.00347 GGAA 0.00356 GGAC 0.00247 GGAG 0.00424 GGAT 0.00277 GGCA 0.00394 GGCC 0.00349 GGCG 0.00312 GGCT 0.00329 GGGA 0.00362 GGGC 0.00326 GGGG 0.00592 GGGT 0.00386 GGTA 0.00255 GGTC 0.00281 GGTG 0.00556 GGTT 0.00364 GTAA 0.00375 GTAC 0.00278 GTAG 0.00248 GTAT 0.00324 GTCA 0.00424 GTCC 0.00247 GTCG 0.00277 GTCT 0.00302 GTGA 0.00529 GTGC 0.00457 GTGG 0.00597 GTGT 0.00634 GTTA 0.00331 GTTC 0.00302 GTTG 0.00473 GTTT 0.0057 TAAA 0.00675 TAAC 0.00331 TAAG 0.00246 TAAT 0.00489 TACA 0.00487 TACC 0.00255 TACG 0.00213 TACT 0.00269 TAGA 0.0023 TAGC 0.00218 TAGG 0.00195 TAGT 0.00221 TATA 0.00411 TATC 0.00258 TATG 0.00309 TATT 0.00586 TCAA 0.00452 TCAC 0.00529 TCAG 0.00321 TCAT 0.00447 TCCA 0.00409 TCCC 0.00362 TCCG 0.0021 TCCT 0.00323 TCGA 0.00244 TCGC 0.00298 TCGG 0.00247 TCGT 0.00328 TCTA 0.0023 TCTC 0.00401 TCTG 0.00387 TCTT 0.00377 TGAA 0.0051 TGAC 0.00424 TGAG 0.00389 TGAT 0.00425 TGCA 0.00605 TGCC 0.00394 TGCG 0.00325 TGCT 0.00472 TGGA 0.00409 TGGC 0.00446 TGGG 0.00434 TGGT 0.00484 TGTA 0.00487 TGTC 0.00389 TGTG 0.0071 TGTT 0.00649 TTAA 0.00591 TTAC 0.00375 TTAG 0.00248 TTAT 0.00527 TTCA 0.0051 TTCC 0.00356 TTCG 0.00253 TTCT 0.00397 TTGA 0.00452 TTGC 0.00455 TTGG 0.00418 TTGT 0.0063 TTTA 0.00675 TTTC 0.00494 TTTG 0.00613 TTTT 0.00955 # l= 4 # Values AAAAA 0.00373 AAAAC 0.00194 AAAAG 0.0013 AAAAT 0.00258 AAACA 0.0023 AAACC 0.00112 AAACG 0.00108 AAACT 0.0012 AAAGA 0.00122 AAAGC 0.00113 AAAGG 0.000988 AAAGT 0.00138 AAATA 0.00247 AAATC 0.00125 AAATG 0.00197 AAATT 0.0017 AACAA 0.00194 AACAC 0.00169 AACAG 0.00113 AACAT 0.00173 AACCA 0.0012 AACCC 0.00105 AACCG 0.00059 AACCT 0.000795 AACGA 0.000764 AACGC 0.000768 AACGG 0.000566 AACGT 0.00105 AACTA 0.000675 AACTC 0.000902 AACTG 0.000898 AACTT 0.00101 AAGAA 0.00121 AAGAC 0.000776 AAGAG 0.000937 AAGAT 0.000842 AAGCA 0.00114 AAGCC 0.000789 AAGCG 0.000666 AAGCT 0.000876 AAGGA 0.000802 AAGGC 0.000836 AAGGG 0.00089 AAGGT 0.000798 AAGTA 0.000802 AAGTC 0.000806 AAGTG 0.00123 AAGTT 0.00101 AATAA 0.00233 AATAC 0.0011 AATAG 0.000734 AATAT 0.0017 AATCA 0.00115 AATCC 0.000872 AATCG 0.000851 AATCT 0.000879 AATGA 0.00144 AATGC 0.00121 AATGG 0.00104 AATGT 0.00199 AATTA 0.00157 AATTC 0.00105 AATTG 0.00137 AATTT 0.0017 ACAAA 0.00212 ACAAC 0.00149 ACAAG 0.00111 ACAAT 0.00158 ACACA 0.00263 ACACC 0.00119 ACACG 0.00132 ACACT 0.0012 ACAGA 0.00114 ACAGC 0.00132 ACAGG 0.000928 ACAGT 0.000997 ACATA 0.000942 ACATC 0.00125 ACATG 0.00115 ACATT 0.00199 ACCAA 0.00118 ACCAC 0.00169 ACCAG 0.00102 ACCAT 0.00095 ACCCA 0.00121 ACCCC 0.00115 ACCCG 0.000705 ACCCT 0.000789 ACCGA 0.000706 ACCGC 0.000782 ACCGG 0.000523 ACCGT 0.000662 ACCTA 0.000561 ACCTC 0.000898 ACCTG 0.000927 ACCTT 0.000798 ACGAA 0.000802 ACGAC 0.000837 ACGAG 0.000873 ACGAT 0.000766 ACGCA 0.000991 ACGCC 0.000661 ACGCG 0.00079 ACGCT 0.000618 ACGGA 0.000612 ACGGC 0.000818 ACGGG 0.000724 ACGGT 0.000662 ACGTA 0.000736 ACGTC 0.000958 ACGTG 0.00146 ACGTT 0.00105 ACTAA 0.000671 ACTAC 0.000606 ACTAG 0.000323 ACTAT 0.000606 ACTCA 0.001 ACTCC 0.000757 ACTCG 0.000818 ACTCT 0.000769 ACTGA 0.000851 ACTGC 0.00126 ACTGG 0.000877 ACTGT 0.000997 ACTTA 0.000697 ACTTC 0.000782 ACTTG 0.00099 ACTTT 0.00138 AGAAA 0.00127 AGAAC 0.000809 AGAAG 0.000913 AGAAT 0.000977 AGACA 0.00108 AGACC 0.000621 AGACG 0.000688 AGACT 0.000631 AGAGA 0.00114 AGAGC 0.000834 AGAGG 0.001 AGAGT 0.000769 AGATA 0.000679 AGATC 0.000557 AGATG 0.0011 AGATT 0.000879 AGCAA 0.00117 AGCAC 0.00114 AGCAG 0.00149 AGCAT 0.000914 AGCCA 0.00117 AGCCC 0.000758 AGCCG 0.000668 AGCCT 0.000686 AGCGA 0.000755 AGCGC 0.000708 AGCGG 0.000744 AGCGT 0.000618 AGCTA 0.000526 AGCTC 0.000827 AGCTG 0.00098 AGCTT 0.000876 AGGAA 0.000956 AGGAC 0.000643 AGGAG 0.001 AGGAT 0.000627 AGGCA 0.000886 AGGCC 0.000793 AGGCG 0.000637 AGGCT 0.000686 AGGGA 0.000885 AGGGC 0.000775 AGGGG 0.00123 AGGGT 0.000789 AGGTA 0.000597 AGGTC 0.000678 AGGTG 0.00111 AGGTT 0.000795 AGTAA 0.000805 AGTAC 0.000612 AGTAG 0.000516 AGTAT 0.00076 AGTCA 0.000973 AGTCC 0.000495 AGTCG 0.000603 AGTCT 0.000631 AGTGA 0.00109 AGTGC 0.000969 AGTGG 0.00124 AGTGT 0.0012 AGTTA 0.000715 AGTTC 0.000645 AGTTG 0.000927 AGTTT 0.0012 ATAAA 0.00213 ATAAC 0.000902 ATAAG 0.000662 ATAAT 0.00157 ATACA 0.00147 ATACC 0.000526 ATACG 0.000489 ATACT 0.00076 ATAGA 0.000651 ATAGC 0.000611 ATAGG 0.00049 ATAGT 0.000606 ATATA 0.00142 ATATC 0.000791 ATATG 0.00086 ATATT 0.0017 ATCAA 0.00108 ATCAC 0.00121 ATCAG 0.000797 ATCAT 0.00116 ATCCA 0.001 ATCCC 0.000712 ATCCG 0.000429 ATCCT 0.000627 ATCGA 0.000702 ATCGC 0.000733 ATCGG 0.000577 ATCGT 0.000766 ATCTA 0.000607 ATCTC 0.000887 ATCTG 0.000884 ATCTT 0.000842 ATGAA 0.00145 ATGAC 0.000959 ATGAG 0.000898 ATGAT 0.00116 ATGCA 0.00146 ATGCC 0.000785 ATGCG 0.000631 ATGCT 0.000914 ATGGA 0.000983 ATGGC 0.000922 ATGGG 0.000907 ATGGT 0.00095 ATGTA 0.00127 ATGTC 0.000884 ATGTG 0.00144 ATGTT 0.00173 ATTAA 0.00163 ATTAC 0.00102 ATTAG 0.000658 ATTAT 0.00157 ATTCA 0.0013 ATTCC 0.00094 ATTCG 0.000594 ATTCT 0.000977 ATTGA 0.00114 ATTGC 0.00113 ATTGG 0.00103 ATTGT 0.00158 ATTTA 0.00187 ATTTC 0.00128 ATTTG 0.00166 ATTTT 0.00258 CAAAA 0.00182 CAAAC 0.00142 CAAAG 0.00123 CAAAT 0.00166 CAACA 0.00195 CAACC 0.000979 CAACG 0.000866 CAACT 0.000927 CAAGA 0.000986 CAAGC 0.000976 CAAGG 0.000868 CAAGT 0.00099 CAATA 0.00116 CAATC 0.00091 CAATG 0.00144 CAATT 0.00137 CACAA 0.0019 CACAC 0.00233 CACAG 0.00143 CACAT 0.00144 CACCA 0.002 CACCC 0.00139 CACCG 0.00106 CACCT 0.00111 CACGA 0.00116 CACGC 0.00125 CACGG 0.00112 CACGT 0.00146 CACTA 0.000695 CACTC 0.00113 CACTG 0.00145 CACTT 0.00123 CAGAA 0.00104 CAGAC 0.000886 CAGAG 0.00107 CAGAT 0.000884 CAGCA 0.00191 CAGCC 0.00116 CAGCG 0.000906 CAGCT 0.00098 CAGGA 0.000939 CAGGC 0.000819 CAGGG 0.000967 CAGGT 0.000927 CAGTA 0.000783 CAGTC 0.000855 CAGTG 0.00145 CAGTT 0.000898 CATAA 0.000898 CATAC 0.000776 CATAG 0.000556 CATAT 0.00086 CATCA 0.0016 CATCC 0.000855 CATCG 0.000925 CATCT 0.0011 CATGA 0.000988 CATGC 0.00101 CATGG 0.000961 CATGT 0.00115 CATTA 0.00115 CATTC 0.00111 CATTG 0.00144 CATTT 0.00197 CCAAA 0.00127 CCAAC 0.00103 CCAAG 0.000857 CCAAT 0.00103 CCACA 0.00155 CCACC 0.00189 CCACG 0.00128 CCACT 0.00124 CCAGA 0.000848 CCAGC 0.00114 CCAGG 0.000954 CCAGT 0.000877 CCATA 0.000675 CCATC 0.00109 CCATG 0.000961 CCATT 0.00104 CCCAA 0.000987 CCCAC 0.00151 CCCAG 0.000942 CCCAT 0.000907 CCCCA 0.00128 CCCCC 0.00257 CCCCG 0.000839 CCCCT 0.00123 CCCGA 0.000618 CCCGC 0.000776 CCCGG 0.000601 CCCGT 0.000724 CCCTA 0.000504 CCCTC 0.00131 CCCTG 0.000967 CCCTT 0.00089 CCGAA 0.00059 CCGAC 0.000583 CCGAG 0.000718 CCGAT 0.000577 CCGCA 0.000737 CCGCC 0.000924 CCGCG 0.000683 CCGCT 0.000744 CCGGA 0.000452 CCGGC 0.000665 CCGGG 0.000601 CCGGT 0.000523 CCGTA 0.000458 CCGTC 0.000674 CCGTG 0.00112 CCGTT 0.000566 CCTAA 0.000507 CCTAC 0.000624 CCTAG 0.000325 CCTAT 0.00049 CCTCA 0.000885 CCTCC 0.00147 CCTCG 0.000815 CCTCT 0.001 CCTGA 0.00067 CCTGC 0.0011 CCTGG 0.000954 CCTGT 0.000928 CCTTA 0.000584 CCTTC 0.000886 CCTTG 0.000868 CCTTT 0.000988 CGAAA 0.000888 CGAAC 0.00056 CGAAG 0.000492 CGAAT 0.000594 CGACA 0.00073 CGACC 0.000666 CGACG 0.000767 CGACT 0.000603 CGAGA 0.000692 CGAGC 0.000764 CGAGG 0.000815 CGAGT 0.000818 CGATA 0.000499 CGATC 0.000501 CGATG 0.000925 CGATT 0.000851 CGCAA 0.00077 CGCAC 0.00103 CGCAG 0.000812 CGCAT 0.000631 CGCCA 0.000864 CGCCC 0.000758 CGCCG 0.000864 CGCCT 0.000637 CGCGA 0.00065 CGCGC 0.000883 CGCGG 0.000683 CGCGT 0.00079 CGCTA 0.000426 CGCTC 0.000827 CGCTG 0.000906 CGCTT 0.000666 CGGAA 0.000498 CGGAC 0.000433 CGGAG 0.000742 CGGAT 0.000429 CGGCA 0.00079 CGGCC 0.0008 CGGCG 0.000864 CGGCT 0.000668 CGGGA 0.000564 CGGGC 0.000612 CGGGG 0.000839 CGGGT 0.000705 CGGTA 0.000499 CGGTC 0.000523 CGGTG 0.00106 CGGTT 0.00059 CGTAA 0.000576 CGTAC 0.000523 CGTAG 0.000541 CGTAT 0.000489 CGTCA 0.00104 CGTCC 0.000594 CGTCG 0.000767 CGTCT 0.000688 CGTGA 0.00131 CGTGC 0.00109 CGTGG 0.00128 CGTGT 0.00132 CGTTA 0.00057 CGTTC 0.000628 CGTTG 0.000866 CGTTT 0.00108 CTAAA 0.000909 CTAAC 0.00052 CTAAG 0.000389 CTAAT 0.000658 CTACA 0.000852 CTACC 0.000571 CTACG 0.000541 CTACT 0.000516 CTAGA 0.00036 CTAGC 0.000304 CTAGG 0.000325 CTAGT 0.000323 CTATA 0.000613 CTATC 0.000457 CTATG 0.000556 CTATT 0.000734 CTCAA 0.00107 CTCAC 0.00123 CTCAG 0.000694 CTCAT 0.000898 CTCCA 0.00119 CTCCC 0.0013 CTCCG 0.000742 CTCCT 0.001 CTCGA 0.000563 CTCGC 0.000936 CTCGG 0.000718 CTCGT 0.000873 CTCTA 0.000533 CTCTC 0.0012 CTCTG 0.00107 CTCTT 0.000937 CTGAA 0.000988 CTGAC 0.000728 CTGAG 0.000694 CTGAT 0.000797 CTGCA 0.0016 CTGCC 0.00115 CTGCG 0.000812 CTGCT 0.00149 CTGGA 0.000873 CTGGC 0.000984 CTGGG 0.000942 CTGGT 0.00102 CTGTA 0.00101 CTGTC 0.000822 CTGTG 0.00143 CTGTT 0.00113 CTTAA 0.000872 CTTAC 0.000536 CTTAG 0.000389 CTTAT 0.000662 CTTCA 0.00116 CTTCC 0.000845 CTTCG 0.000492 CTTCT 0.000913 CTTGA 0.000855 CTTGC 0.000999 CTTGG 0.000857 CTTGT 0.00111 CTTTA 0.00118 CTTTC 0.001 CTTTG 0.00123 CTTTT 0.0013 GAAAA 0.00159 GAAAC 0.00106 GAAAG 0.001 GAAAT 0.00128 GAACA 0.000976 GAACC 0.000771 GAACG 0.000628 GAACT 0.000645 GAAGA 0.000938 GAAGC 0.000804 GAAGG 0.000886 GAAGT 0.000782 GAATA 0.000885 GAATC 0.000766 GAATG 0.00111 GAATT 0.00105 GACAA 0.00112 GACAC 0.00107 GACAG 0.000822 GACAT 0.000884 GACCA 0.000841 GACCC 0.000764 GACCG 0.000523 GACCT 0.000678 GACGA 0.000824 GACGC 0.000634 GACGG 0.000674 GACGT 0.000958 GACTA 0.000352 GACTC 0.00069 GACTG 0.000855 GACTT 0.000806 GAGAA 0.000995 GAGAC 0.000926 GAGAG 0.0012 GAGAT 0.000887 GAGCA 0.000978 GAGCC 0.000805 GAGCG 0.000827 GAGCT 0.000827 GAGGA 0.00102 GAGGC 0.000933 GAGGG 0.00131 GAGGT 0.000898 GAGTA 0.000626 GAGTC 0.00069 GAGTG 0.00113 GAGTT 0.000902 GATAA 0.00083 GATAC 0.000499 GATAG 0.000457 GATAT 0.000791 GATCA 0.000659 GATCC 0.000498 GATCG 0.000501 GATCT 0.000557 GATGA 0.00126 GATGC 0.000885 GATGG 0.00109 GATGT 0.00125 GATTA 0.000822 GATTC 0.000766 GATTG 0.00091 GATTT 0.00125 GCAAA 0.00136 GCAAC 0.00106 GCAAG 0.000999 GCAAT 0.00113 GCACA 0.00148 GCACC 0.00104 GCACG 0.00109 GCACT 0.000969 GCAGA 0.00106 GCAGC 0.00162 GCAGG 0.0011 GCAGT 0.00126 GCATA 0.00069 GCATC 0.000885 GCATG 0.00101 GCATT 0.00121 GCCAA 0.0011 GCCAC 0.00146 GCCAG 0.000984 GCCAT 0.000922 GCCCA 0.000859 GCCCC 0.00101 GCCCG 0.000612 GCCCT 0.000775 GCCGA 0.000663 GCCGC 0.000975 GCCGG 0.000665 GCCGT 0.000818 GCCTA 0.000416 GCCTC 0.000933 GCCTG 0.000819 GCCTT 0.000836 GCGAA 0.000595 GCGAC 0.000717 GCGAG 0.000936 GCGAT 0.000733 GCGCA 0.000774 GCGCC 0.000709 GCGCG 0.000883 GCGCT 0.000708 GCGGA 0.000555 GCGGC 0.000975 GCGGG 0.000776 GCGGT 0.000782 GCGTA 0.000406 GCGTC 0.000634 GCGTG 0.00125 GCGTT 0.000768 GCTAA 0.000646 GCTAC 0.000616 GCTAG 0.000304 GCTAT 0.000611 GCTCA 0.000964 GCTCC 0.000874 GCTCG 0.000764 GCTCT 0.000834 GCTGA 0.000865 GCTGC 0.00162 GCTGG 0.00114 GCTGT 0.00132 GCTTA 0.000552 GCTTC 0.000804 GCTTG 0.000976 GCTTT 0.00113 GGAAA 0.00115 GGAAC 0.000633 GGAAG 0.000845 GGAAT 0.00094 GGACA 0.000847 GGACC 0.000532 GGACG 0.000594 GGACT 0.000495 GGAGA 0.00114 GGAGC 0.000874 GGAGG 0.00147 GGAGT 0.000757 GGATA 0.000546 GGATC 0.000498 GGATG 0.000855 GGATT 0.000872 GGCAA 0.00104 GGCAC 0.000975 GGCAG 0.00115 GGCAT 0.000785 GGCCA 0.00114 GGCCC 0.00076 GGCCG 0.0008 GGCCT 0.000793 GGCGA 0.000828 GGCGC 0.000709 GGCGG 0.000924 GGCGT 0.000661 GGCTA 0.000533 GGCTC 0.000805 GGCTG 0.00116 GGCTT 0.000789 GGGAA 0.000986 GGGAC 0.00062 GGGAG 0.0013 GGGAT 0.000712 GGGCA 0.000984 GGGCC 0.00076 GGGCG 0.000758 GGGCT 0.000758 GGGGA 0.00118 GGGGC 0.00101 GGGGG 0.00257 GGGGT 0.00115 GGGTA 0.000657 GGGTC 0.000764 GGGTG 0.00139 GGGTT 0.00105 GGTAA 0.000925 GGTAC 0.000533 GGTAG 0.000571 GGTAT 0.000526 GGTCA 0.000989 GGTCC 0.000532 GGTCG 0.000666 GGTCT 0.000621 GGTGA 0.00144 GGTGC 0.00104 GGTGG 0.00189 GGTGT 0.00119 GGTTA 0.000761 GGTTC 0.000771 GGTTG 0.000979 GGTTT 0.00112 GTAAA 0.00148 GTAAC 0.000709 GTAAG 0.000536 GTAAT 0.00102 GTACA 0.00111 GTACC 0.000533 GTACG 0.000523 GTACT 0.000612 GTAGA 0.000632 GTAGC 0.000616 GTAGG 0.000624 GTAGT 0.000606 GTATA 0.000865 GTATC 0.000499 GTATG 0.000776 GTATT 0.0011 GTCAA 0.00104 GTCAC 0.00151 GTCAG 0.000728 GTCAT 0.000959 GTCCA 0.000771 GTCCC 0.00062 GTCCG 0.000433 GTCCT 0.000643 GTCGA 0.000628 GTCGC 0.000717 GTCGG 0.000583 GTCGT 0.000837 GTCTA 0.00043 GTCTC 0.000926 GTCTG 0.000886 GTCTT 0.000776 GTGAA 0.00134 GTGAC 0.00151 GTGAG 0.00123 GTGAT 0.00121 GTGCA 0.00142 GTGCC 0.000975 GTGCG 0.00103 GTGCT 0.00114 GTGGA 0.00131 GTGGC 0.00146 GTGGG 0.00151 GTGGT 0.00169 GTGTA 0.00125 GTGTC 0.00107 GTGTG 0.00233 GTGTT 0.00169 GTTAA 0.00117 GTTAC 0.000709 GTTAG 0.00052 GTTAT 0.000902 GTTCA 0.00101 GTTCC 0.000633 GTTCG 0.00056 GTTCT 0.000809 GTTGA 0.00115 GTTGC 0.00106 GTTGG 0.00103 GTTGT 0.00149 GTTTA 0.00128 GTTTC 0.00106 GTTTG 0.00142 GTTTT 0.00194 TAAAA 0.00242 TAAAC 0.00128 TAAAG 0.00118 TAAAT 0.00187 TAACA 0.00126 TAACC 0.000761 TAACG 0.00057 TAACT 0.000715 TAAGA 0.000627 TAAGC 0.000552 TAAGG 0.000584 TAAGT 0.000697 TAATA 0.00135 TAATC 0.000822 TAATG 0.00115 TAATT 0.00157 TACAA 0.00134 TACAC 0.00125 TACAG 0.00101 TACAT 0.00127 TACCA 0.000802 TACCC 0.000657 TACCG 0.000499 TACCT 0.000597 TACGA 0.000529 TACGC 0.000406 TACGG 0.000458 TACGT 0.000736 TACTA 0.000482 TACTC 0.000626 TACTG 0.000783 TACTT 0.000802 TAGAA 0.000726 TAGAC 0.00043 TAGAG 0.000533 TAGAT 0.000607 TAGCA 0.000692 TAGCC 0.000533 TAGCG 0.000426 TAGCT 0.000526 TAGGA 0.000464 TAGGC 0.000416 TAGGG 0.000504 TAGGT 0.000561 TAGTA 0.000482 TAGTC 0.000352 TAGTG 0.000695 TAGTT 0.000675 TATAA 0.00122 TATAC 0.000865 TATAG 0.000613 TATAT 0.00142 TATCA 0.00085 TATCC 0.000546 TATCG 0.000499 TATCT 0.000679 TATGA 0.000782 TATGC 0.00069 TATGG 0.000675 TATGT 0.000942 TATTA 0.00135 TATTC 0.000885 TATTG 0.00116 TATTT 0.00247 TCAAA 0.00137 TCAAC 0.00115 TCAAG 0.000855 TCAAT 0.00114 TCACA 0.00145 TCACC 0.00144 TCACG 0.00131 TCACT 0.00109 TCAGA 0.000822 TCAGC 0.000865 TCAGG 0.00067 TCAGT 0.000851 TCATA 0.000782 TCATC 0.00126 TCATG 0.000988 TCATT 0.00144 TCCAA 0.000926 TCCAC 0.00131 TCCAG 0.000873 TCCAT 0.000983 TCCCA 0.000992 TCCCC 0.00118 TCCCG 0.000564 TCCCT 0.000885 TCCGA 0.000481 TCCGC 0.000555 TCCGG 0.000452 TCCGT 0.000612 TCCTA 0.000464 TCCTC 0.00102 TCCTG 0.000939 TCCTT 0.000802 TCGAA 0.000547 TCGAC 0.000628 TCGAG 0.000563 TCGAT 0.000702 TCGCA 0.000746 TCGCC 0.000828 TCGCG 0.00065 TCGCT 0.000755 TCGGA 0.000481 TCGGC 0.000663 TCGGG 0.000618 TCGGT 0.000706 TCGTA 0.000529 TCGTC 0.000824 TCGTG 0.00116 TCGTT 0.000764 TCTAA 0.000652 TCTAC 0.000632 TCTAG 0.00036 TCTAT 0.000651 TCTCA 0.00104 TCTCC 0.00114 TCTCG 0.000692 TCTCT 0.00114 TCTGA 0.000822 TCTGC 0.00106 TCTGG 0.000848 TCTGT 0.00114 TCTTA 0.000627 TCTTC 0.000938 TCTTG 0.000986 TCTTT 0.00122 TGAAA 0.00163 TGAAC 0.00101 TGAAG 0.00116 TGAAT 0.0013 TGACA 0.00123 TGACC 0.000989 TGACG 0.00104 TGACT 0.000973 TGAGA 0.00104 TGAGC 0.000964 TGAGG 0.000885 TGAGT 0.001 TGATA 0.00085 TGATC 0.000659 TGATG 0.0016 TGATT 0.00115 TGCAA 0.00157 TGCAC 0.00142 TGCAG 0.0016 TGCAT 0.00146 TGCCA 0.00128 TGCCC 0.000984 TGCCG 0.00079 TGCCT 0.000886 TGCGA 0.000746 TGCGC 0.000774 TGCGG 0.000737 TGCGT 0.000991 TGCTA 0.000692 TGCTC 0.000978 TGCTG 0.00191 TGCTT 0.00114 TGGAA 0.00113 TGGAC 0.000771 TGGAG 0.00119 TGGAT 0.001 TGGCA 0.00128 TGGCC 0.00114 TGGCG 0.000864 TGGCT 0.00117 TGGGA 0.000992 TGGGC 0.000859 TGGGG 0.00128 TGGGT 0.00121 TGGTA 0.000802 TGGTC 0.000841 TGGTG 0.002 TGGTT 0.0012 TGTAA 0.00145 TGTAC 0.00111 TGTAG 0.000852 TGTAT 0.00147 TGTCA 0.00123 TGTCC 0.000847 TGTCG 0.00073 TGTCT 0.00108 TGTGA 0.00145 TGTGC 0.00148 TGTGG 0.00155 TGTGT 0.00263 TGTTA 0.00126 TGTTC 0.000976 TGTTG 0.00195 TGTTT 0.0023 TTAAA 0.00223 TTAAC 0.00117 TTAAG 0.000872 TTAAT 0.00163 TTACA 0.00145 TTACC 0.000925 TTACG 0.000576 TTACT 0.000805 TTAGA 0.000652 TTAGC 0.000646 TTAGG 0.000507 TTAGT 0.000671 TTATA 0.00122 TTATC 0.00083 TTATG 0.000898 TTATT 0.00233 TTCAA 0.00132 TTCAC 0.00134 TTCAG 0.000988 TTCAT 0.00145 TTCCA 0.00113 TTCCC 0.000986 TTCCG 0.000498 TTCCT 0.000956 TTCGA 0.000547 TTCGC 0.000595 TTCGG 0.00059 TTCGT 0.000802 TTCTA 0.000726 TTCTC 0.000995 TTCTG 0.00104 TTCTT 0.00121 TTGAA 0.00132 TTGAC 0.00104 TTGAG 0.00107 TTGAT 0.00108 TTGCA 0.00157 TTGCC 0.00104 TTGCG 0.00077 TTGCT 0.00117 TTGGA 0.000926 TTGGC 0.0011 TTGGG 0.000987 TTGGT 0.00118 TTGTA 0.00134 TTGTC 0.00112 TTGTG 0.0019 TTGTT 0.00194 TTTAA 0.00223 TTTAC 0.00148 TTTAG 0.000909 TTTAT 0.00213 TTTCA 0.00163 TTTCC 0.00115 TTTCG 0.000888 TTTCT 0.00127 TTTGA 0.00137 TTTGC 0.00136 TTTGG 0.00127 TTTGT 0.00212 TTTTA 0.00242 TTTTC 0.00159 TTTTG 0.00182 TTTTT 0.00373 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3899 AAAAC 0.1992 AAAAG 0.1365 AAAAT 0.2744 AAACA 0.4132 AAACC 0.1889 AAACG 0.183 AAACT 0.2149 AAAGA 0.257 AAAGC 0.2407 AAAGG 0.2064 AAAGT 0.2959 AAATA 0.3354 AAATC 0.1615 AAATG 0.2714 AAATT 0.2317 AACAA 0.306 AACAC 0.2481 AACAG 0.1696 AACAT 0.2763 AACCA 0.3392 AACCC 0.281 AACCG 0.1497 AACCT 0.2301 AACGA 0.2427 AACGC 0.2372 AACGG 0.172 AACGT 0.3481 AACTA 0.2026 AACTC 0.2442 AACTG 0.2602 AACTT 0.293 AAGAA 0.3337 AAGAC 0.1989 AAGAG 0.2426 AAGAT 0.2248 AAGCA 0.3457 AAGCC 0.2213 AAGCG 0.1756 AAGCT 0.2574 AAGGA 0.2471 AAGGC 0.2445 AAGGG 0.2617 AAGGT 0.2467 AAGTA 0.221 AAGTC 0.2029 AAGTG 0.3124 AAGTT 0.2638 AATAA 0.3917 AATAC 0.1876 AATAG 0.1247 AATAT 0.2961 AATCA 0.3133 AATCC 0.2294 AATCG 0.2139 AATCT 0.2434 AATGA 0.246 AATGC 0.2159 AATGG 0.1792 AATGT 0.359 AATTA 0.2777 AATTC 0.181 AATTG 0.2397 AATTT 0.3016 ACAAA 0.3378 ACAAC 0.2227 ACAAG 0.175 ACAAT 0.2646 ACACA 0.4064 ACACC 0.1885 ACACG 0.1996 ACACT 0.2055 ACAGA 0.2581 ACAGC 0.2941 ACAGG 0.2059 ACAGT 0.2419 ACATA 0.1788 ACATC 0.2151 ACATG 0.218 ACATT 0.3881 ACCAA 0.2539 ACCAC 0.3313 ACCAG 0.2078 ACCAT 0.207 ACCCA 0.3162 ACCCC 0.2966 ACCCG 0.1709 ACCCT 0.2162 ACCGA 0.2799 ACCGC 0.2781 ACCGG 0.1885 ACCGT 0.2534 ACCTA 0.1816 ACCTC 0.2644 ACCTG 0.2878 ACCTT 0.2661 ACGAA 0.26 ACGAC 0.2478 ACGAG 0.2542 ACGAT 0.238 ACGCA 0.3336 ACGCC 0.2121 ACGCG 0.2445 ACGCT 0.2099 ACGGA 0.2255 ACGGC 0.2833 ACGGG 0.249 ACGGT 0.2421 ACGTA 0.1847 ACGTC 0.2208 ACGTG 0.3339 ACGTT 0.2607 ACTAA 0.3071 ACTAC 0.263 ACTAG 0.1427 ACTAT 0.2872 ACTCA 0.3004 ACTCC 0.2222 ACTCG 0.2359 ACTCT 0.2416 ACTGA 0.2197 ACTGC 0.3122 ACTGG 0.2126 ACTGT 0.2556 ACTTA 0.1916 ACTTC 0.1964 ACTTG 0.2479 ACTTT 0.3641 AGAAA 0.3273 AGAAC 0.1997 AGAAG 0.226 AGAAT 0.247 AGACA 0.3656 AGACC 0.2033 AGACG 0.2176 AGACT 0.2135 AGAGA 0.3008 AGAGC 0.2185 AGAGG 0.2648 AGAGT 0.2159 AGATA 0.2153 AGATC 0.1646 AGATG 0.3332 AGATT 0.2869 AGCAA 0.2569 AGCAC 0.2332 AGCAG 0.3013 AGCAT 0.2087 AGCCA 0.367 AGCCC 0.2307 AGCCG 0.1875 AGCCT 0.2148 AGCGA 0.2719 AGCGC 0.2448 AGCGG 0.2533 AGCGT 0.23 AGCTA 0.1694 AGCTC 0.2399 AGCTG 0.3023 AGCTT 0.2884 AGGAA 0.3126 AGGAC 0.1972 AGGAG 0.2892 AGGAT 0.2009 AGGCA 0.3086 AGGCC 0.2577 AGGCG 0.1992 AGGCT 0.2345 AGGGA 0.2444 AGGGC 0.2129 AGGGG 0.3196 AGGGT 0.2231 AGGTA 0.1945 AGGTC 0.2041 AGGTG 0.337 AGGTT 0.2643 AGTAA 0.3064 AGTAC 0.2243 AGTAG 0.182 AGTAT 0.2872 AGTCA 0.378 AGTCC 0.1797 AGTCG 0.2089 AGTCT 0.2334 AGTGA 0.2415 AGTGC 0.2169 AGTGG 0.2647 AGTGT 0.277 AGTTA 0.2137 AGTTC 0.1771 AGTTG 0.2581 AGTTT 0.3511 ATAAA 0.4034 ATAAC 0.168 ATAAG 0.1278 ATAAT 0.3008 ATACA 0.4551 ATACC 0.1591 ATACG 0.1452 ATACT 0.2406 ATAGA 0.2737 ATAGC 0.254 ATAGG 0.2019 ATAGT 0.2704 ATATA 0.2961 ATATC 0.1592 ATATG 0.1844 ATATT 0.3603 ATCAA 0.2639 ATCAC 0.2686 ATCAG 0.1894 ATCAT 0.2781 ATCCA 0.3739 ATCCC 0.2477 ATCCG 0.1485 ATCCT 0.23 ATCGA 0.2566 ATCGC 0.2623 ATCGG 0.2016 ATCGT 0.2795 ATCTA 0.1968 ATCTC 0.2579 ATCTG 0.277 ATCTT 0.2683 ATGAA 0.3342 ATGAC 0.2118 ATGAG 0.1924 ATGAT 0.2615 ATGCA 0.4018 ATGCC 0.2018 ATGCG 0.15 ATGCT 0.2464 ATGGA 0.2708 ATGGC 0.2443 ATGGG 0.2296 ATGGT 0.2553 ATGTA 0.2478 ATGTC 0.1623 ATGTG 0.2632 ATGTT 0.3267 ATTAA 0.3355 ATTAC 0.2094 ATTAG 0.1339 ATTAT 0.3211 ATTCA 0.3511 ATTCC 0.241 ATTCG 0.1485 ATTCT 0.2594 ATTGA 0.2358 ATTGC 0.2271 ATTGG 0.2041 ATTGT 0.333 ATTTA 0.2575 ATTTC 0.1687 ATTTG 0.2201 ATTTT 0.3537 CAAAA 0.3058 CAAAC 0.2234 CAAAG 0.1946 CAAAT 0.2762 CAACA 0.4171 CAACC 0.2051 CAACG 0.173 CAACT 0.2048 CAAGA 0.26 CAAGC 0.2548 CAAGG 0.2231 CAAGT 0.2621 CAATA 0.243 CAATC 0.177 CAATG 0.2962 CAATT 0.2838 CACAA 0.2841 CACAC 0.3003 CACAG 0.1954 CACAT 0.2202 CACCA 0.3604 CACCC 0.2461 CACCG 0.1835 CACCT 0.2101 CACGA 0.2393 CACGC 0.2385 CACGG 0.2182 CACGT 0.304 CACTA 0.1582 CACTC 0.2286 CACTG 0.3271 CACTT 0.2861 CAGAA 0.2813 CAGAC 0.219 CAGAG 0.2614 CAGAT 0.2384 CAGCA 0.3911 CAGCC 0.2306 CAGCG 0.1711 CAGCT 0.2072 CAGGA 0.2666 CAGGC 0.2179 CAGGG 0.2559 CAGGT 0.2597 CAGTA 0.2107 CAGTC 0.2038 CAGTG 0.3536 CAGTT 0.2319 CATAA 0.2924 CATAC 0.2456 CATAG 0.1676 CATAT 0.2943 CATCA 0.3569 CATCC 0.1917 CATCG 0.1985 CATCT 0.2529 CATGA 0.2452 CATGC 0.2445 CATGG 0.2215 CATGT 0.2888 CATTA 0.209 CATTC 0.1836 CATTG 0.2518 CATTT 0.3556 CCAAA 0.3139 CCAAC 0.2311 CCAAG 0.199 CCAAT 0.2561 CCACA 0.276 CCACC 0.3023 CCACG 0.206 CCACT 0.2156 CCAGA 0.2267 CCAGC 0.2903 CCAGG 0.2419 CCAGT 0.2411 CCATA 0.1854 CCATC 0.2703 CCATG 0.2522 CCATT 0.2921 CCCAA 0.2341 CCCAC 0.3366 CCCAG 0.2125 CCCAT 0.2168 CCCCA 0.2229 CCCCC 0.4314 CCCCG 0.1359 CCCCT 0.2098 CCCGA 0.2364 CCCGC 0.2794 CCCGG 0.2125 CCCGT 0.2717 CCCTA 0.1399 CCCTC 0.344 CCCTG 0.2586 CCCTT 0.2574 CCGAA 0.2503 CCGAC 0.2284 CCGAG 0.2863 CCGAT 0.235 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.2972 CCGCG 0.2091 CCGCT 0.2403 CCGGA 0.2081 CCGGC 0.2847 CCGGG 0.2635 CCGGT 0.2437 CCGTA 0.1718 CCGTC 0.232 CCGTG 0.3877 CCGTT 0.2085 CCTAA 0.2733 CCTAC 0.3134 CCTAG 0.1569 CCTAT 0.2564 CCTCA 0.218 CCTCC 0.3485 CCTCG 0.1855 CCTCT 0.248 CCTGA 0.1914 CCTGC 0.2975 CCTGG 0.253 CCTGT 0.2581 CCTTA 0.1792 CCTTC 0.2594 CCTTG 0.2548 CCTTT 0.3065 CGAAA 0.3618 CGAAC 0.2086 CGAAG 0.19 CGAAT 0.2396 CGACA 0.2692 CGACC 0.2333 CGACG 0.2729 CGACT 0.2246 CGAGA 0.2368 CGAGC 0.2374 CGAGG 0.2548 CGAGT 0.271 CGATA 0.1812 CGATC 0.1779 CGATG 0.3263 CGATT 0.3146 CGCAA 0.2467 CGCAC 0.3039 CGCAG 0.245 CGCAT 0.2043 CGCCA 0.2862 CGCCC 0.2343 CGCCG 0.2668 CGCCT 0.2127 CGCGA 0.228 CGCGC 0.2914 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2637 CGCTA 0.155 CGCTC 0.2746 CGCTG 0.319 CGCTT 0.2514 CGGAA 0.2433 CGGAC 0.2021 CGGAG 0.338 CGGAT 0.2167 CGGCA 0.2601 CGGCC 0.2517 CGGCG 0.2683 CGGCT 0.22 CGGGA 0.2135 CGGGC 0.2201 CGGGG 0.3059 CGGGT 0.2605 CGGTA 0.2021 CGGTC 0.1953 CGGTG 0.3803 CGGTT 0.2222 CGTAA 0.2851 CGTAC 0.2331 CGTAG 0.2397 CGTAT 0.242 CGTCA 0.3466 CGTCC 0.1875 CGTCG 0.2405 CGTCT 0.2254 CGTGA 0.2719 CGTGC 0.2122 CGTGG 0.25 CGTGT 0.2659 CGTTA 0.1888 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.2602 CGTTT 0.3566 CTAAA 0.3744 CTAAC 0.1982 CTAAG 0.1525 CTAAT 0.2749 CTACA 0.3527 CTACC 0.2232 CTACG 0.2059 CTACT 0.2183 CTAGA 0.2844 CTAGC 0.2276 CTAGG 0.2338 CTAGT 0.2543 CTATA 0.2645 CTATC 0.1845 CTATG 0.2253 CTATT 0.3256 CTCAA 0.2883 CTCAC 0.2942 CTCAG 0.1779 CTCAT 0.2397 CTCCA 0.2949 CTCCC 0.2988 CTCCG 0.1672 CTCCT 0.2391 CTCGA 0.1906 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.2341 CTCGT 0.2849 CTCTA 0.1495 CTCTC 0.3017 CTCTG 0.2809 CTCTT 0.2679 CTGAA 0.3207 CTGAC 0.2217 CTGAG 0.2037 CTGAT 0.2539 CTGCA 0.3354 CTGCC 0.2185 CTGCG 0.1498 CTGCT 0.2963 CTGGA 0.2396 CTGGC 0.2551 CTGGG 0.2363 CTGGT 0.269 CTGTA 0.2449 CTGTC 0.1822 CTGTG 0.3082 CTGTT 0.2647 CTTAA 0.3581 CTTAC 0.2122 CTTAG 0.1515 CTTAT 0.2782 CTTCA 0.3493 CTTCC 0.2367 CTTCG 0.1372 CTTCT 0.2768 CTTGA 0.2252 CTTGC 0.2561 CTTGG 0.2171 CTTGT 0.3016 CTTTA 0.2542 CTTTC 0.2082 CTTTG 0.2518 CTTTT 0.2857 GAAAA 0.3295 GAAAC 0.21 GAAAG 0.1989 GAAAT 0.2617 GAACA 0.3427 GAACC 0.2435 GAACG 0.1983 GAACT 0.2155 GAAGA 0.2779 GAAGC 0.2326 GAAGG 0.2557 GAAGT 0.2338 GAATA 0.2429 GAATC 0.1876 GAATG 0.2858 GAATT 0.2837 GACAA 0.2958 GACAC 0.2541 GACAG 0.2069 GACAT 0.2432 GACCA 0.318 GACCC 0.2553 GACCG 0.1816 GACCT 0.2452 GACGA 0.2688 GACGC 0.1979 GACGG 0.2099 GACGT 0.3234 GACTA 0.1378 GACTC 0.2347 GACTG 0.316 GACTT 0.3114 GAGAA 0.2681 GAGAC 0.2255 GAGAG 0.2829 GAGAT 0.2236 GAGCA 0.3038 GAGCC 0.2329 GAGCG 0.2189 GAGCT 0.2444 GAGGA 0.2459 GAGGC 0.2257 GAGGG 0.3107 GAGGT 0.2177 GAGTA 0.2015 GAGTC 0.1962 GAGTG 0.3202 GAGTT 0.282 GATAA 0.3284 GATAC 0.1876 GATAG 0.1697 GATAT 0.3142 GATCA 0.3166 GATCC 0.2172 GATCG 0.2164 GATCT 0.2498 GATGA 0.2789 GATGC 0.1985 GATGG 0.2376 GATGT 0.285 GATTA 0.2275 GATTC 0.1929 GATTG 0.2408 GATTT 0.3387 GCAAA 0.3092 GCAAC 0.2212 GCAAG 0.2121 GCAAT 0.2575 GCACA 0.3395 GCACC 0.2135 GCACG 0.2224 GCACT 0.2246 GCAGA 0.216 GCAGC 0.3029 GCAGG 0.2143 GCAGT 0.2668 GCATA 0.1871 GCATC 0.2144 GCATG 0.2643 GCATT 0.3342 GCCAA 0.2564 GCCAC 0.3089 GCCAG 0.2167 GCCAT 0.2179 GCCCA 0.2723 GCCCC 0.2994 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.252 GCCGA 0.2225 GCCGC 0.3062 GCCGG 0.2009 GCCGT 0.2704 GCCTA 0.1464 GCCTC 0.3002 GCCTG 0.2645 GCCTT 0.2889 GCGAA 0.2125 GCGAC 0.2293 GCGAG 0.2999 GCGAT 0.2584 GCGCA 0.2577 GCGCC 0.2246 GCGCG 0.2834 GCGCT 0.2343 GCGGA 0.1882 GCGGC 0.3092 GCGGG 0.2467 GCGGT 0.256 GCGTA 0.1382 GCGTC 0.2026 GCGTG 0.3927 GCGTT 0.2664 GCTAA 0.3107 GCTAC 0.2645 GCTAG 0.1365 GCTAT 0.2883 GCTCA 0.2949 GCTCC 0.247 GCTCG 0.2098 GCTCT 0.2483 GCTGA 0.1841 GCTGC 0.314 GCTGG 0.2267 GCTGT 0.2753 GCTTA 0.164 GCTTC 0.223 GCTTG 0.275 GCTTT 0.3379 GGAAA 0.3335 GGAAC 0.1723 GGAAG 0.2259 GGAAT 0.2682 GGACA 0.3585 GGACC 0.2111 GGACG 0.2255 GGACT 0.2048 GGAGA 0.2709 GGAGC 0.2011 GGAGG 0.3444 GGAGT 0.1837 GGATA 0.2105 GGATC 0.1696 GGATG 0.2994 GGATT 0.3205 GGCAA 0.2694 GGCAC 0.2367 GGCAG 0.2791 GGCAT 0.2147 GGCCA 0.3401 GGCCC 0.2102 GGCCG 0.2141 GGCCT 0.2356 GGCGA 0.2711 GGCGC 0.2193 GGCGG 0.2926 GGCGT 0.2171 GGCTA 0.1681 GGCTC 0.2339 GGCTG 0.3442 GGCTT 0.2537 GGGAA 0.2862 GGGAC 0.1651 GGGAG 0.3433 GGGAT 0.2054 GGGCA 0.3104 GGGCC 0.2261 GGGCG 0.2157 GGGCT 0.2478 GGGGA 0.2016 GGGGC 0.166 GGGGG 0.4315 GGGGT 0.2009 GGGTA 0.1778 GGGTC 0.1879 GGGTG 0.3489 GGGTT 0.2854 GGTAA 0.3757 GGTAC 0.1957 GGTAG 0.2122 GGTAT 0.2165 GGTCA 0.3637 GGTCC 0.1888 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2265 GGTGA 0.2628 GGTGC 0.1829 GGTGG 0.3291 GGTGT 0.2253 GGTTA 0.2171 GGTTC 0.2043 GGTTG 0.2638 GGTTT 0.3148 GTAAA 0.3982 GTAAC 0.1844 GTAAG 0.1385 GTAAT 0.2788 GTACA 0.4202 GTACC 0.1768 GTACG 0.1719 GTACT 0.231 GTAGA 0.2606 GTAGC 0.2369 GTAGG 0.2509 GTAGT 0.2517 GTATA 0.2737 GTATC 0.1447 GTATG 0.2342 GTATT 0.3474 GTCAA 0.253 GTCAC 0.3397 GTCAG 0.1724 GTCAT 0.2348 GTCCA 0.3293 GTCCC 0.237 GTCCG 0.1649 GTCCT 0.2688 GTCGA 0.231 GTCGC 0.2487 GTCGG 0.2093 GTCGT 0.311 GTCTA 0.1477 GTCTC 0.2948 GTCTG 0.2884 GTCTT 0.2691 GTGAA 0.2719 GTGAC 0.2806 GTGAG 0.2163 GTGAT 0.2313 GTGCA 0.3268 GTGCC 0.2078 GTGCG 0.2084 GTGCT 0.2571 GTGGA 0.2255 GTGGC 0.2413 GTGGG 0.2484 GTGGT 0.2847 GTGTA 0.2133 GTGTC 0.1623 GTGTG 0.3435 GTGTT 0.2809 GTTAA 0.3588 GTTAC 0.2143 GTTAG 0.1494 GTTAT 0.2775 GTTCA 0.3464 GTTCC 0.2049 GTTCG 0.1711 GTTCT 0.2776 GTTGA 0.2471 GTTGC 0.2227 GTTGG 0.2102 GTTGT 0.32 GTTTA 0.2259 GTTTC 0.1838 GTTTG 0.2417 GTTTT 0.3486 TAAAA 0.3628 TAAAC 0.1827 TAAAG 0.1719 TAAAT 0.2827 TAACA 0.3869 TAACC 0.2232 TAACG 0.1659 TAACT 0.2241 TAAGA 0.2573 TAAGC 0.2206 TAAGG 0.2279 TAAGT 0.2942 TAATA 0.2765 TAATC 0.163 TAATG 0.2398 TAATT 0.3207 TACAA 0.2824 TACAC 0.2436 TACAG 0.2029 TACAT 0.271 TACCA 0.3276 TACCC 0.245 TACCG 0.1905 TACCT 0.2369 TACGA 0.2507 TACGC 0.1803 TACGG 0.2077 TACGT 0.3613 TACTA 0.1774 TACTC 0.2187 TACTG 0.2963 TACTT 0.3077 TAGAA 0.3283 TAGAC 0.1791 TAGAG 0.2222 TAGAT 0.2705 TAGCA 0.3361 TAGCC 0.2398 TAGCG 0.177 TAGCT 0.2472 TAGGA 0.2488 TAGGC 0.2143 TAGGG 0.2459 TAGGT 0.2911 TAGTA 0.2227 TAGTC 0.1569 TAGTG 0.3018 TAGTT 0.3186 TATAA 0.3024 TATAC 0.2094 TATAG 0.1435 TATAT 0.3448 TATCA 0.3429 TATCC 0.2168 TATCG 0.1774 TATCT 0.2629 TATGA 0.2548 TATGC 0.2252 TATGG 0.2119 TATGT 0.3081 TATTA 0.2311 TATTC 0.1495 TATTG 0.1981 TATTT 0.4213 TCAAA 0.3123 TCAAC 0.2414 TCAAG 0.1834 TCAAT 0.2629 TCACA 0.2874 TCACC 0.2597 TCACG 0.2412 TCACT 0.2117 TCAGA 0.2565 TCAGC 0.2625 TCAGG 0.2037 TCAGT 0.2774 TCATA 0.1827 TCATC 0.2601 TCATG 0.2287 TCATT 0.3286 TCCAA 0.2375 TCCAC 0.3 TCCAG 0.2115 TCCAT 0.251 TCCCA 0.2862 TCCCC 0.315 TCCCG 0.1482 TCCCT 0.2507 TCCGA 0.234 TCCGC 0.2604 TCCGG 0.205 TCCGT 0.3006 TCCTA 0.1528 TCCTC 0.2939 TCCTG 0.2909 TCCTT 0.2623 TCGAA 0.2304 TCGAC 0.2474 TCGAG 0.2286 TCGAT 0.2936 TCGCA 0.2601 TCGCC 0.2706 TCGCG 0.2159 TCGCT 0.2534 TCGGA 0.1966 TCGGC 0.2612 TCGGG 0.2427 TCGGT 0.2995 TCGTA 0.1695 TCGTC 0.2427 TCGTG 0.3475 TCGTT 0.2404 TCTAA 0.2954 TCTAC 0.2655 TCTAG 0.1556 TCTAT 0.2834 TCTCA 0.2706 TCTCC 0.2746 TCTCG 0.1728 TCTCT 0.2821 TCTGA 0.2188 TCTGC 0.2722 TCTGG 0.2152 TCTGT 0.2938 TCTTA 0.174 TCTTC 0.2424 TCTTG 0.2553 TCTTT 0.3283 TGAAA 0.3288 TGAAC 0.1925 TGAAG 0.2204 TGAAT 0.2583 TGACA 0.3029 TGACC 0.2261 TGACG 0.2317 TGACT 0.2394 TGAGA 0.275 TGAGC 0.2473 TGAGG 0.2219 TGAGT 0.2558 TGATA 0.2113 TGATC 0.157 TGATG 0.3538 TGATT 0.2779 TGCAA 0.2676 TGCAC 0.222 TGCAG 0.2555 TGCAT 0.2549 TGCCA 0.3444 TGCCC 0.2389 TGCCG 0.1832 TGCCT 0.2335 TGCGA 0.2363 TGCGC 0.2281 TGCGG 0.2261 TGCGT 0.3095 TGCTA 0.1549 TGCTC 0.2007 TGCTG 0.3838 TGCTT 0.2606 TGGAA 0.2847 TGGAC 0.1868 TGGAG 0.2759 TGGAT 0.2525 TGGCA 0.3042 TGGCC 0.2488 TGGCG 0.1791 TGGCT 0.2679 TGGGA 0.2375 TGGGC 0.1958 TGGGG 0.289 TGGGT 0.2777 TGGTA 0.1791 TGGTC 0.1763 TGGTG 0.385 TGGTT 0.2596 TGTAA 0.3054 TGTAC 0.2275 TGTAG 0.164 TGTAT 0.303 TGTCA 0.3314 TGTCC 0.2181 TGTCG 0.1735 TGTCT 0.2769 TGTGA 0.2126 TGTGC 0.2126 TGTGG 0.2197 TGTGT 0.3551 TGTTA 0.1993 TGTTC 0.1522 TGTTG 0.2839 TGTTT 0.3646 TTAAA 0.3809 TTAAC 0.1933 TTAAG 0.1464 TTAAT 0.2795 TTACA 0.3946 TTACC 0.2375 TTACG 0.1471 TTACT 0.2208 TTAGA 0.2682 TTAGC 0.2574 TTAGG 0.2024 TTAGT 0.2719 TTATA 0.2391 TTATC 0.1532 TTATG 0.1687 TTATT 0.4389 TTCAA 0.266 TTCAC 0.2546 TTCAG 0.1928 TTCAT 0.2866 TTCCA 0.3265 TTCCC 0.2672 TTCCG 0.1291 TTCCT 0.2772 TTCGA 0.2148 TTCGC 0.2302 TTCGG 0.229 TTCGT 0.3259 TTCTA 0.1877 TTCTC 0.2428 TTCTG 0.2567 TTCTT 0.3129 TTGAA 0.3047 TTGAC 0.2242 TTGAG 0.2273 TTGAT 0.2437 TTGCA 0.3638 TTGCC 0.2184 TTGCG 0.1562 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2319 TTGGC 0.2602 TTGGG 0.2244 TTGGT 0.2835 TTGTA 0.2232 TTGTC 0.1706 TTGTG 0.2934 TTGTT 0.3128 TTTAA 0.3338 TTTAC 0.2185 TTTAG 0.1332 TTTAT 0.3145 TTTCA 0.34 TTTCC 0.2279 TTTCG 0.1706 TTTCT 0.2615 TTTGA 0.2281 TTTGC 0.222 TTTGG 0.2037 TTTGT 0.3462 TTTTA 0.2563 TTTTC 0.1648 TTTTG 0.189 TTTTT 0.3899 [3] # (a,c,g,t)= (0.217, 0.283, 0.283, 0.217) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.254 C 0.246 G 0.246 T 0.254 # l= 1 # Values AA 0.0729 AC 0.0645 AG 0.0549 AT 0.0615 CA 0.0755 CC 0.063 CG 0.0528 CT 0.0549 GA 0.0564 GC 0.0622 GG 0.063 GT 0.0645 TA 0.049 TC 0.0564 TG 0.0755 TT 0.0729 # l= 2 # Values AAA 0.0245 AAC 0.0162 AAG 0.0136 AAT 0.0186 ACA 0.0219 ACC 0.0154 ACG 0.0143 ACT 0.0129 AGA 0.0138 AGC 0.0146 AGG 0.0136 AGT 0.0129 ATA 0.0138 ATC 0.0128 ATG 0.0163 ATT 0.0186 CAA 0.0186 CAC 0.0238 CAG 0.0169 CAT 0.0163 CCA 0.0184 CCC 0.0187 CCG 0.0123 CCT 0.0136 CGA 0.012 CGC 0.0142 CGG 0.0123 CGT 0.0143 CTA 0.00825 CTC 0.0162 CTG 0.0169 CTT 0.0136 GAA 0.0144 GAC 0.0131 GAG 0.0162 GAT 0.0128 GCA 0.0182 GCC 0.0153 GCG 0.0142 GCT 0.0146 GGA 0.0136 GGC 0.0152 GGG 0.0187 GGT 0.0154 GTA 0.0115 GTC 0.0131 GTG 0.0238 GTT 0.0162 TAA 0.0155 TAC 0.0115 TAG 0.00825 TAT 0.0138 TCA 0.0171 TCC 0.0136 TCG 0.012 TCT 0.0138 TGA 0.0171 TGC 0.0182 TGG 0.0184 TGT 0.0219 TTA 0.0155 TTC 0.0144 TTG 0.0186 TTT 0.0245 # l= 3 # Values AAAA 0.00841 AAAC 0.00531 AAAG 0.00431 AAAT 0.00649 AACA 0.00611 AACC 0.00365 AACG 0.00318 AACT 0.00324 AAGA 0.00353 AAGC 0.00333 AAGG 0.0032 AAGT 0.00355 AATA 0.0051 AATC 0.00352 AATG 0.00502 AATT 0.005 ACAA 0.00585 ACAC 0.00677 ACAG 0.00442 ACAT 0.00485 ACCA 0.00499 ACCC 0.00426 ACCG 0.003 ACCT 0.00319 ACGA 0.00343 ACGC 0.00347 ACGG 0.00316 ACGT 0.00423 ACTA 0.00202 ACTC 0.00354 ACTG 0.00381 ACTT 0.00355 AGAA 0.00366 AGAC 0.00313 AGAG 0.00392 AGAT 0.0031 AGCA 0.00473 AGCC 0.00345 AGCG 0.00324 AGCT 0.00322 AGGA 0.00326 AGGC 0.00316 AGGG 0.00396 AGGT 0.00319 AGTA 0.00241 AGTC 0.00273 AGTG 0.00454 AGTT 0.00324 ATAA 0.00465 ATAC 0.00288 ATAG 0.00219 ATAT 0.00411 ATCA 0.00406 ATCC 0.00271 ATCG 0.00287 ATCT 0.0031 ATGA 0.00421 ATGC 0.00352 ATGG 0.00368 ATGT 0.00485 ATTA 0.00424 ATTC 0.00353 ATTG 0.00438 ATTT 0.00649 CAAA 0.00566 CAAC 0.00482 CAAG 0.00371 CAAT 0.00437 CACA 0.00745 CACC 0.00623 CACG 0.00555 CACT 0.00454 CAGA 0.00389 CAGC 0.00535 CAGG 0.00385 CAGT 0.00381 CATA 0.00278 CATC 0.00461 CATG 0.00385 CATT 0.00502 CCAA 0.00412 CCAC 0.00658 CCAG 0.00399 CCAT 0.00368 CCCA 0.00468 CCCC 0.00683 CCCG 0.00324 CCCT 0.00396 CCGA 0.00271 CCGC 0.00372 CCGG 0.00274 CCGT 0.00316 CCTA 0.00193 CCTC 0.00459 CCTG 0.00384 CCTT 0.0032 CGAA 0.00253 CGAC 0.0031 CGAG 0.00348 CGAT 0.00287 CGCA 0.0036 CGCC 0.00372 CGCG 0.00362 CGCT 0.00323 CGGA 0.00232 CGGC 0.00375 CGGG 0.00324 CGGT 0.003 CGTA 0.00215 CGTC 0.0034 CGTG 0.00555 CGTT 0.00318 CTAA 0.00227 CTAC 0.00251 CTAG 0.00128 CTAT 0.00219 CTCA 0.00407 CTCC 0.00472 CTCG 0.00348 CTCT 0.00392 CTGA 0.00312 CTGC 0.00536 CTGG 0.00399 CTGT 0.00442 CTTA 0.00222 CTTC 0.00336 CTTG 0.00371 CTTT 0.00431 GAAA 0.00451 GAAC 0.00298 GAAG 0.00336 GAAT 0.00353 GACA 0.00395 GACC 0.00303 GACG 0.00341 GACT 0.00273 GAGA 0.00425 GAGC 0.00381 GAGG 0.0046 GAGT 0.00354 GATA 0.0024 GATC 0.00222 GATG 0.00461 GATT 0.00352 GCAA 0.00437 GCAC 0.0049 GCAG 0.00536 GCAT 0.00352 GCCA 0.00466 GCCC 0.00367 GCCG 0.00376 GCCT 0.00316 GCGA 0.00331 GCGC 0.00368 GCGG 0.00372 GCGT 0.00347 GCTA 0.00214 GCTC 0.00381 GCTG 0.00535 GCTT 0.00333 GGAA 0.0035 GGAC 0.00264 GGAG 0.00472 GGAT 0.00271 GGCA 0.00413 GGCC 0.00395 GGCG 0.00372 GGCT 0.00345 GGGA 0.00394 GGGC 0.00367 GGGG 0.00683 GGGT 0.00426 GGTA 0.00252 GGTC 0.00303 GGTG 0.00623 GGTT 0.00365 GTAA 0.00336 GTAC 0.00272 GTAG 0.00251 GTAT 0.00287 GTCA 0.00424 GTCC 0.00264 GTCG 0.0031 GTCT 0.00313 GTGA 0.00551 GTGC 0.0049 GTGG 0.00658 GTGT 0.00677 GTTA 0.00307 GTTC 0.00299 GTTG 0.00482 GTTT 0.00531 TAAA 0.00594 TAAC 0.00307 TAAG 0.00222 TAAT 0.00424 TACA 0.00439 TACC 0.00252 TACG 0.00215 TACT 0.00241 TAGA 0.00216 TAGC 0.00214 TAGG 0.00193 TAGT 0.00202 TATA 0.00356 TATC 0.0024 TATG 0.00278 TATT 0.0051 TCAA 0.00421 TCAC 0.00551 TCAG 0.00312 TCAT 0.00421 TCCA 0.00404 TCCC 0.00394 TCCG 0.00232 TCCT 0.00326 TCGA 0.00256 TCGC 0.00331 TCGG 0.00271 TCGT 0.00342 TCTA 0.00216 TCTC 0.00425 TCTG 0.00389 TCTT 0.00353 TGAA 0.00469 TGAC 0.00424 TGAG 0.00407 TGAT 0.00406 TGCA 0.0057 TGCC 0.00413 TGCG 0.0036 TGCT 0.00473 TGGA 0.00404 TGGC 0.00466 TGGG 0.00468 TGGT 0.00499 TGTA 0.00439 TGTC 0.00395 TGTG 0.00745 TGTT 0.00611 TTAA 0.00518 TTAC 0.00336 TTAG 0.00227 TTAT 0.00465 TTCA 0.00469 TTCC 0.0035 TTCG 0.00253 TTCT 0.00366 TTGA 0.00421 TTGC 0.00438 TTGG 0.00412 TTGT 0.00585 TTTA 0.00594 TTTC 0.00451 TTTG 0.00566 TTTT 0.00841 # l= 4 # Values AAAAA 0.00329 AAAAC 0.00175 AAAAG 0.00114 AAAAT 0.00223 AAACA 0.00208 AAACC 0.0011 AAACG 0.00105 AAACT 0.00108 AAAGA 0.00112 AAAGC 0.00104 AAAGG 0.000914 AAAGT 0.00124 AAATA 0.00215 AAATC 0.00115 AAATG 0.0017 AAATT 0.00148 AACAA 0.00176 AACAC 0.00168 AACAG 0.00109 AACAT 0.00157 AACCA 0.00116 AACCC 0.00109 AACCG 0.00066 AACCT 0.000747 AACGA 0.000767 AACGC 0.000812 AACGG 0.000609 AACGT 0.000993 AACTA 0.000596 AACTC 0.000886 AACTG 0.000831 AACTT 0.000925 AAGAA 0.00109 AAGAC 0.000754 AAGAG 0.000906 AAGAT 0.000778 AAGCA 0.00103 AAGCC 0.000774 AAGCG 0.0007 AAGCT 0.000826 AAGGA 0.000745 AAGGC 0.00084 AAGGG 0.000875 AAGGT 0.000738 AAGTA 0.000684 AAGTC 0.000771 AAGTG 0.00117 AAGTT 0.000925 AATAA 0.00205 AATAC 0.000958 AATAG 0.000635 AATAT 0.00146 AATCA 0.00105 AATCC 0.000827 AATCG 0.000848 AATCT 0.000793 AATGA 0.00131 AATGC 0.00105 AATGG 0.000946 AATGT 0.00171 AATTA 0.00136 AATTC 0.000929 AATTG 0.00122 AATTT 0.00148 ACAAA 0.00196 ACAAC 0.0015 ACAAG 0.00103 ACAAT 0.00136 ACACA 0.00287 ACACC 0.00128 ACACG 0.00147 ACACT 0.00116 ACAGA 0.00117 ACAGC 0.00136 ACAGG 0.000955 ACAGT 0.000936 ACATA 0.000846 ACATC 0.00125 ACATG 0.00104 ACATT 0.00171 ACCAA 0.00114 ACCAC 0.00188 ACCAG 0.00105 ACCAT 0.000928 ACCCA 0.0013 ACCCC 0.00131 ACCCG 0.000844 ACCCT 0.000812 ACCGA 0.00074 ACCGC 0.000922 ACCGG 0.000616 ACCGT 0.00072 ACCTA 0.000547 ACCTC 0.000966 ACCTG 0.000937 ACCTT 0.000738 ACGAA 0.000783 ACGAC 0.000903 ACGAG 0.000962 ACGAT 0.000776 ACGCA 0.00109 ACGCC 0.000763 ACGCG 0.000941 ACGCT 0.000673 ACGGA 0.000657 ACGGC 0.000938 ACGGG 0.000842 ACGGT 0.00072 ACGTA 0.000702 ACGTC 0.000992 ACGTG 0.00154 ACGTT 0.000993 ACTAA 0.000614 ACTAC 0.000591 ACTAG 0.000298 ACTAT 0.000521 ACTCA 0.00105 ACTCC 0.000814 ACTCG 0.000908 ACTCT 0.00076 ACTGA 0.000788 ACTGC 0.00123 ACTGG 0.000855 ACTGT 0.000936 ACTTA 0.000608 ACTTC 0.000754 ACTTG 0.000946 ACTTT 0.00124 AGAAA 0.00114 AGAAC 0.000767 AGAAG 0.00087 AGAAT 0.000888 AGACA 0.0011 AGACC 0.000657 AGACG 0.000751 AGACT 0.000629 AGAGA 0.00122 AGAGC 0.000884 AGAGG 0.00106 AGAGT 0.00076 AGATA 0.00063 AGATC 0.000566 AGATG 0.00111 AGATT 0.000793 AGCAA 0.00109 AGCAC 0.0012 AGCAG 0.00162 AGCAT 0.000823 AGCCA 0.00118 AGCCC 0.000802 AGCCG 0.000771 AGCCT 0.000696 AGCGA 0.000835 AGCGC 0.000834 AGCGG 0.000892 AGCGT 0.000673 AGCTA 0.000494 AGCTC 0.000883 AGCTG 0.00101 AGCTT 0.000826 AGGAA 0.000906 AGGAC 0.000648 AGGAG 0.0011 AGGAT 0.000604 AGGCA 0.000887 AGGCC 0.000862 AGGCG 0.000713 AGGCT 0.000696 AGGGA 0.000925 AGGGC 0.000826 AGGGG 0.00139 AGGGT 0.000812 AGGTA 0.000559 AGGTC 0.000713 AGGTG 0.00117 AGGTT 0.000747 AGTAA 0.000701 AGTAC 0.000563 AGTAG 0.000497 AGTAT 0.00065 AGTCA 0.000932 AGTCC 0.000508 AGTCG 0.00066 AGTCT 0.000629 AGTGA 0.00112 AGTGC 0.000969 AGTGG 0.0013 AGTGT 0.00116 AGTTA 0.000629 AGTTC 0.000633 AGTTG 0.000893 AGTTT 0.00108 ATAAA 0.00189 ATAAC 0.00082 ATAAG 0.000569 ATAAT 0.00137 ATACA 0.00128 ATACC 0.000491 ATACG 0.000453 ATACT 0.00065 ATAGA 0.000606 ATAGC 0.000579 ATAGG 0.000488 ATAGT 0.000521 ATATA 0.00121 ATATC 0.000713 ATATG 0.000725 ATATT 0.00146 ATCAA 0.000987 ATCAC 0.00123 ATCAG 0.000755 ATCAT 0.00109 ATCCA 0.000942 ATCCC 0.000731 ATCCG 0.000438 ATCCT 0.000604 ATCGA 0.000714 ATCGC 0.000768 ATCGG 0.000616 ATCGT 0.000776 ATCTA 0.000554 ATCTC 0.00093 ATCTG 0.000842 ATCTT 0.000778 ATGAA 0.00132 ATGAC 0.000913 ATGAG 0.000894 ATGAT 0.00109 ATGCA 0.00129 ATGCC 0.000739 ATGCG 0.000664 ATGCT 0.000823 ATGGA 0.000925 ATGGC 0.000898 ATGGG 0.000929 ATGGT 0.000928 ATGTA 0.0011 ATGTC 0.000815 ATGTG 0.00137 ATGTT 0.00157 ATTAA 0.00141 ATTAC 0.000884 ATTAG 0.000574 ATTAT 0.00137 ATTCA 0.00116 ATTCC 0.000915 ATTCG 0.000573 ATTCT 0.000888 ATTGA 0.00102 ATTGC 0.00102 ATTGG 0.000979 ATTGT 0.00136 ATTTA 0.00162 ATTTC 0.00115 ATTTG 0.00149 ATTTT 0.00223 CAAAA 0.00161 CAAAC 0.00138 CAAAG 0.00118 CAAAT 0.00149 CAACA 0.00198 CAACC 0.00102 CAACG 0.000925 CAACT 0.000893 CAAGA 0.000942 CAAGC 0.000979 CAAGG 0.000843 CAAGT 0.000946 CAATA 0.001 CAATC 0.000871 CAATG 0.00128 CAATT 0.00122 CACAA 0.00185 CACAC 0.0027 CACAG 0.00153 CACAT 0.00137 CACCA 0.00224 CACCC 0.00157 CACCG 0.00125 CACCT 0.00117 CACGA 0.00124 CACGC 0.00148 CACGG 0.00129 CACGT 0.00154 CACTA 0.000675 CACTC 0.00127 CACTG 0.00143 CACTT 0.00117 CAGAA 0.00097 CAGAC 0.000938 CAGAG 0.00114 CAGAT 0.000842 CAGCA 0.00203 CAGCC 0.00125 CAGCG 0.00105 CAGCT 0.00101 CAGGA 0.000958 CAGGC 0.000884 CAGGG 0.00106 CAGGT 0.000937 CAGTA 0.000689 CAGTC 0.000862 CAGTG 0.00143 CAGTT 0.000831 CATAA 0.00081 CATAC 0.000701 CATAG 0.000539 CATAT 0.000725 CATCA 0.00164 CATCC 0.000869 CATCG 0.000991 CATCT 0.00111 CATGA 0.000894 CATGC 0.000961 CATGG 0.000959 CATGT 0.00104 CATTA 0.000985 CATTC 0.00104 CATTG 0.00128 CATTT 0.0017 CCAAA 0.00119 CCAAC 0.00109 CCAAG 0.00086 CCAAT 0.000979 CCACA 0.00163 CCACC 0.00221 CCACG 0.00145 CCACT 0.0013 CCAGA 0.000855 CCAGC 0.00125 CCAGG 0.00103 CCAGT 0.000855 CCATA 0.000633 CCATC 0.00114 CCATG 0.000959 CCATT 0.000946 CCCAA 0.00101 CCCAC 0.00169 CCCAG 0.00104 CCCAT 0.000929 CCCCA 0.00143 CCCCC 0.003 CCCCG 0.00101 CCCCT 0.00139 CCCGA 0.000702 CCCGC 0.000949 CCCGG 0.000748 CCCGT 0.000842 CCCTA 0.000536 CCCTC 0.00148 CCCTG 0.00106 CCCTT 0.000875 CCGAA 0.000606 CCGAC 0.00067 CCGAG 0.000815 CCGAT 0.000616 CCGCA 0.000835 CCGCC 0.00113 CCGCG 0.000865 CCGCT 0.000892 CCGGA 0.00052 CCGGC 0.000852 CCGGG 0.000748 CCGGT 0.000616 CCGTA 0.000479 CCGTC 0.000784 CCGTG 0.00129 CCGTT 0.000609 CCTAA 0.000472 CCTAC 0.000631 CCTAG 0.000335 CCTAT 0.000488 CCTCA 0.00094 CCTCC 0.00164 CCTCG 0.000955 CCTCT 0.00106 CCTGA 0.000668 CCTGC 0.00119 CCTGG 0.00103 CCTGT 0.000955 CCTTA 0.000549 CCTTC 0.00089 CCTTG 0.000843 CCTTT 0.000914 CGAAA 0.000855 CGAAC 0.000596 CGAAG 0.000508 CGAAT 0.000573 CGACA 0.0008 CGACC 0.000769 CGACG 0.000875 CGACT 0.00066 CGAGA 0.000732 CGAGC 0.000888 CGAGG 0.000955 CGAGT 0.000908 CGATA 0.000505 CGATC 0.000528 CGATG 0.000991 CGATT 0.000848 CGCAA 0.000812 CGCAC 0.0012 CGCAG 0.000917 CGCAT 0.000664 CGCCA 0.000982 CGCCC 0.000932 CGCCG 0.00109 CGCCT 0.000713 CGCGA 0.000741 CGCGC 0.00107 CGCGG 0.000865 CGCGT 0.000941 CGCTA 0.000468 CGCTC 0.00102 CGCTG 0.00105 CGCTT 0.0007 CGGAA 0.000519 CGGAC 0.000497 CGGAG 0.00087 CGGAT 0.000438 CGGCA 0.000912 CGGCC 0.00098 CGGCG 0.00109 CGGCT 0.000771 CGGGA 0.000654 CGGGC 0.000735 CGGGG 0.00101 CGGGT 0.000844 CGGTA 0.000505 CGGTC 0.000585 CGGTG 0.00125 CGGTT 0.00066 CGTAA 0.000544 CGTAC 0.00058 CGTAG 0.000573 CGTAT 0.000453 CGTCA 0.00111 CGTCC 0.000675 CGTCG 0.000875 CGTCT 0.000751 CGTGA 0.00139 CGTGC 0.00124 CGTGG 0.00145 CGTGT 0.00147 CGTTA 0.00055 CGTTC 0.000658 CGTTG 0.000925 CGTTT 0.00105 CTAAA 0.0008 CTAAC 0.000521 CTAAG 0.00037 CTAAT 0.000574 CTACA 0.000833 CTACC 0.000608 CTACG 0.000573 CTACT 0.000497 CTAGA 0.000341 CTAGC 0.000307 CTAGG 0.000335 CTAGT 0.000298 CTATA 0.000559 CTATC 0.000461 CTATG 0.000539 CTATT 0.000635 CTCAA 0.00105 CTCAC 0.0014 CTCAG 0.000726 CTCAT 0.000894 CTCCA 0.00127 CTCCC 0.00148 CTCCG 0.00087 CTCCT 0.0011 CTCGA 0.000609 CTCGC 0.0011 CTCGG 0.000815 CTCGT 0.000962 CTCTA 0.000528 CTCTC 0.00135 CTCTG 0.00114 CTCTT 0.000906 CTGAA 0.000909 CTGAC 0.000728 CTGAG 0.000726 CTGAT 0.000755 CTGCA 0.00157 CTGCC 0.00126 CTGCG 0.000917 CTGCT 0.00162 CTGGA 0.000865 CTGGC 0.00104 CTGGG 0.00104 CTGGT 0.00105 CTGTA 0.000935 CTGTC 0.00086 CTGTG 0.00153 CTGTT 0.00109 CTTAA 0.000769 CTTAC 0.000508 CTTAG 0.00037 CTTAT 0.000569 CTTCA 0.00111 CTTCC 0.00087 CTTCG 0.000508 CTTCT 0.00087 CTTGA 0.000816 CTTGC 0.001 CTTGG 0.00086 CTTGT 0.00103 CTTTA 0.00105 CTTTC 0.00094 CTTTG 0.00118 CTTTT 0.00114 GAAAA 0.00141 GAAAC 0.00101 GAAAG 0.00094 GAAAT 0.00115 GAACA 0.000903 GAACC 0.000793 GAACG 0.000658 GAACT 0.000633 GAAGA 0.000907 GAAGC 0.000805 GAAGG 0.00089 GAAGT 0.000754 GAATA 0.000791 GAATC 0.000765 GAATG 0.00104 GAATT 0.000929 GACAA 0.00107 GACAC 0.00121 GACAG 0.00086 GACAT 0.000815 GACCA 0.000853 GACCC 0.000883 GACCG 0.000585 GACCT 0.000713 GACGA 0.000898 GACGC 0.00073 GACGG 0.000784 GACGT 0.000992 GACTA 0.000327 GACTC 0.000769 GACTG 0.000862 GACTT 0.000771 GAGAA 0.000956 GAGAC 0.00101 GAGAG 0.00135 GAGAT 0.00093 GAGCA 0.00102 GAGCC 0.000888 GAGCG 0.00102 GAGCT 0.000883 GAGGA 0.00112 GAGGC 0.00103 GAGGG 0.00148 GAGGT 0.000966 GAGTA 0.000612 GAGTC 0.000769 GAGTG 0.00127 GAGTT 0.000886 GATAA 0.000748 GATAC 0.000476 GATAG 0.000461 GATAT 0.000713 GATCA 0.000614 GATCC 0.000514 GATCG 0.000528 GATCT 0.000566 GATGA 0.00131 GATGC 0.000904 GATGG 0.00114 GATGT 0.00125 GATTA 0.000735 GATTC 0.000765 GATTG 0.000871 GATTT 0.00115 GCAAA 0.00126 GCAAC 0.00109 GCAAG 0.001 GCAAT 0.00102 GCACA 0.00152 GCACC 0.00118 GCACG 0.00124 GCACT 0.000969 GCAGA 0.00108 GCAGC 0.00186 GCAGG 0.00119 GCAGT 0.00123 GCATA 0.000605 GCATC 0.000904 GCATG 0.000961 GCATT 0.00105 GCCAA 0.0011 GCCAC 0.00163 GCCAG 0.00104 GCCAT 0.000898 GCCCA 0.000932 GCCCC 0.00118 GCCCG 0.000735 GCCCT 0.000826 GCCGA 0.000751 GCCGC 0.00121 GCCGG 0.000852 GCCGT 0.000938 GCCTA 0.00041 GCCTC 0.00103 GCCTG 0.000884 GCCTT 0.00084 GCGAA 0.000606 GCGAC 0.000835 GCGAG 0.0011 GCGAT 0.000768 GCGCA 0.000887 GCGCC 0.000883 GCGCG 0.00107 GCGCT 0.000834 GCGGA 0.000634 GCGGC 0.00121 GCGGG 0.000949 GCGGT 0.000922 GCGTA 0.000446 GCGTC 0.00073 GCGTG 0.00148 GCGTT 0.000812 GCTAA 0.000597 GCTAC 0.000658 GCTAG 0.000307 GCTAT 0.000579 GCTCA 0.00103 GCTCC 0.00102 GCTCG 0.000888 GCTCT 0.000884 GCTGA 0.000878 GCTGC 0.00186 GCTGG 0.00125 GCTGT 0.00136 GCTTA 0.000505 GCTTC 0.000805 GCTTG 0.000979 GCTTT 0.00104 GGAAA 0.00107 GGAAC 0.000638 GGAAG 0.00087 GGAAT 0.000915 GGACA 0.00087 GGACC 0.000585 GGACG 0.000675 GGACT 0.000508 GGAGA 0.00125 GGAGC 0.00102 GGAGG 0.00164 GGAGT 0.000814 GGATA 0.000503 GGATC 0.000514 GGATG 0.000869 GGATT 0.000827 GGCAA 0.00106 GGCAC 0.00108 GGCAG 0.00126 GGCAT 0.000739 GGCCA 0.00123 GGCCC 0.000875 GGCCG 0.00098 GGCCT 0.000862 GGCGA 0.000947 GGCGC 0.000883 GGCGG 0.00113 GGCGT 0.000763 GGCTA 0.000536 GGCTC 0.000888 GGCTG 0.00125 GGCTT 0.000774 GGGAA 0.001 GGGAC 0.000726 GGGAG 0.00148 GGGAT 0.000731 GGGCA 0.00107 GGGCC 0.000875 GGGCG 0.000932 GGGCT 0.000802 GGGGA 0.00134 GGGGC 0.00118 GGGGG 0.003 GGGGT 0.00131 GGGTA 0.000718 GGGTC 0.000883 GGGTG 0.00157 GGGTT 0.00109 GGTAA 0.000851 GGTAC 0.000573 GGTAG 0.000608 GGTAT 0.000491 GGTCA 0.00102 GGTCC 0.000585 GGTCG 0.000769 GGTCT 0.000657 GGTGA 0.00157 GGTGC 0.00118 GGTGG 0.00221 GGTGT 0.00128 GGTTA 0.000744 GGTTC 0.000793 GGTTG 0.00102 GGTTT 0.0011 GTAAA 0.00132 GTAAC 0.000654 GTAAG 0.000508 GTAAT 0.000884 GTACA 0.00101 GTACC 0.000573 GTACG 0.00058 GTACT 0.000563 GTAGA 0.000629 GTAGC 0.000658 GTAGG 0.000631 GTAGT 0.000591 GTATA 0.000739 GTATC 0.000476 GTATG 0.000701 GTATT 0.000958 GTCAA 0.001 GTCAC 0.0016 GTCAG 0.000728 GTCAT 0.000913 GTCCA 0.000766 GTCCC 0.000726 GTCCG 0.000497 GTCCT 0.000648 GTCGA 0.000695 GTCGC 0.000835 GTCGG 0.00067 GTCGT 0.000903 GTCTA 0.000428 GTCTC 0.00101 GTCTG 0.000938 GTCTT 0.000754 GTGAA 0.00129 GTGAC 0.0016 GTGAG 0.0014 GTGAT 0.00123 GTGCA 0.00143 GTGCC 0.00108 GTGCG 0.0012 GTGCT 0.0012 GTGGA 0.00138 GTGGC 0.00163 GTGGG 0.00169 GTGGT 0.00188 GTGTA 0.00118 GTGTC 0.00121 GTGTG 0.0027 GTGTT 0.00168 GTTAA 0.00107 GTTAC 0.000654 GTTAG 0.000521 GTTAT 0.00082 GTTCA 0.000984 GTTCC 0.000638 GTTCG 0.000596 GTTCT 0.000767 GTTGA 0.00114 GTTGC 0.00109 GTTGG 0.00109 GTTGT 0.0015 GTTTA 0.00118 GTTTC 0.00101 GTTTG 0.00138 GTTTT 0.00175 TAAAA 0.0021 TAAAC 0.00118 TAAAG 0.00105 TAAAT 0.00162 TAACA 0.00114 TAACC 0.000744 TAACG 0.00055 TAACT 0.000629 TAAGA 0.000554 TAAGC 0.000505 TAAGG 0.000549 TAAGT 0.000608 TAATA 0.00116 TAATC 0.000735 TAATG 0.000985 TAATT 0.00136 TACAA 0.00118 TACAC 0.00118 TACAG 0.000935 TACAT 0.0011 TACCA 0.000739 TACCC 0.000718 TACCG 0.000505 TACCT 0.000559 TACGA 0.000522 TACGC 0.000446 TACGG 0.000479 TACGT 0.000702 TACTA 0.000425 TACTC 0.000612 TACTG 0.000689 TACTT 0.000684 TAGAA 0.000647 TAGAC 0.000428 TAGAG 0.000528 TAGAT 0.000554 TAGCA 0.000644 TAGCC 0.000536 TAGCG 0.000468 TAGCT 0.000494 TAGGA 0.000432 TAGGC 0.00041 TAGGG 0.000536 TAGGT 0.000547 TAGTA 0.000425 TAGTC 0.000327 TAGTG 0.000675 TAGTT 0.000596 TATAA 0.00104 TATAC 0.000739 TATAG 0.000559 TATAT 0.00121 TATCA 0.000758 TATCC 0.000503 TATCG 0.000505 TATCT 0.00063 TATGA 0.000691 TATGC 0.000605 TATGG 0.000633 TATGT 0.000846 TATTA 0.00116 TATTC 0.000791 TATTG 0.001 TATTT 0.00215 TCAAA 0.00124 TCAAC 0.00114 TCAAG 0.000816 TCAAT 0.00102 TCACA 0.00144 TCACC 0.00157 TCACG 0.00139 TCACT 0.00112 TCAGA 0.000784 TCAGC 0.000878 TCAGG 0.000668 TCAGT 0.000788 TCATA 0.000691 TCATC 0.00131 TCATG 0.000894 TCATT 0.00131 TCCAA 0.00087 TCCAC 0.00138 TCCAG 0.000865 TCCAT 0.000925 TCCCA 0.00102 TCCCC 0.00134 TCCCG 0.000654 TCCCT 0.000925 TCCGA 0.000513 TCCGC 0.000634 TCCGG 0.00052 TCCGT 0.000657 TCCTA 0.000432 TCCTC 0.00112 TCCTG 0.000958 TCCTT 0.000745 TCGAA 0.000537 TCGAC 0.000695 TCGAG 0.000609 TCGAT 0.000714 TCGCA 0.000784 TCGCC 0.000947 TCGCG 0.000741 TCGCT 0.000835 TCGGA 0.000513 TCGGC 0.000751 TCGGG 0.000702 TCGGT 0.00074 TCGTA 0.000522 TCGTC 0.000898 TCGTG 0.00124 TCGTT 0.000767 TCTAA 0.000582 TCTAC 0.000629 TCTAG 0.000341 TCTAT 0.000606 TCTCA 0.00105 TCTCC 0.00125 TCTCG 0.000732 TCTCT 0.00122 TCTGA 0.000784 TCTGC 0.00108 TCTGG 0.000855 TCTGT 0.00117 TCTTA 0.000554 TCTTC 0.000907 TCTTG 0.000942 TCTTT 0.00112 TGAAA 0.00144 TGAAC 0.000984 TGAAG 0.00111 TGAAT 0.00116 TGACA 0.00118 TGACC 0.00102 TGACG 0.00111 TGACT 0.000932 TGAGA 0.00105 TGAGC 0.00103 TGAGG 0.00094 TGAGT 0.00105 TGATA 0.000758 TGATC 0.000614 TGATG 0.00164 TGATT 0.00105 TGCAA 0.00141 TGCAC 0.00143 TGCAG 0.00157 TGCAT 0.00129 TGCCA 0.00127 TGCCC 0.00107 TGCCG 0.000912 TGCCT 0.000887 TGCGA 0.000784 TGCGC 0.000887 TGCGG 0.000835 TGCGT 0.00109 TGCTA 0.000644 TGCTC 0.00102 TGCTG 0.00203 TGCTT 0.00103 TGGAA 0.00107 TGGAC 0.000766 TGGAG 0.00127 TGGAT 0.000942 TGGCA 0.00127 TGGCC 0.00123 TGGCG 0.000982 TGGCT 0.00118 TGGGA 0.00102 TGGGC 0.000932 TGGGG 0.00143 TGGGT 0.0013 TGGTA 0.000739 TGGTC 0.000853 TGGTG 0.00224 TGGTT 0.00116 TGTAA 0.00127 TGTAC 0.00101 TGTAG 0.000833 TGTAT 0.00128 TGTCA 0.00118 TGTCC 0.00087 TGTCG 0.0008 TGTCT 0.0011 TGTGA 0.00144 TGTGC 0.00152 TGTGG 0.00163 TGTGT 0.00287 TGTTA 0.00114 TGTTC 0.000903 TGTTG 0.00198 TGTTT 0.00208 TTAAA 0.00193 TTAAC 0.00107 TTAAG 0.000769 TTAAT 0.00141 TTACA 0.00127 TTACC 0.000851 TTACG 0.000544 TTACT 0.000701 TTAGA 0.000582 TTAGC 0.000597 TTAGG 0.000472 TTAGT 0.000614 TTATA 0.00104 TTATC 0.000748 TTATG 0.00081 TTATT 0.00205 TTCAA 0.00117 TTCAC 0.00129 TTCAG 0.000909 TTCAT 0.00132 TTCCA 0.00107 TTCCC 0.001 TTCCG 0.000519 TTCCT 0.000906 TTCGA 0.000537 TTCGC 0.000606 TTCGG 0.000606 TTCGT 0.000783 TTCTA 0.000647 TTCTC 0.000956 TTCTG 0.00097 TTCTT 0.00109 TTGAA 0.00117 TTGAC 0.001 TTGAG 0.00105 TTGAT 0.000987 TTGCA 0.00141 TTGCC 0.00106 TTGCG 0.000812 TTGCT 0.00109 TTGGA 0.00087 TTGGC 0.0011 TTGGG 0.00101 TTGGT 0.00114 TTGTA 0.00118 TTGTC 0.00107 TTGTG 0.00185 TTGTT 0.00176 TTTAA 0.00193 TTTAC 0.00132 TTTAG 0.0008 TTTAT 0.00189 TTTCA 0.00144 TTTCC 0.00107 TTTCG 0.000855 TTTCT 0.00114 TTTGA 0.00124 TTTGC 0.00126 TTTGG 0.00119 TTTGT 0.00196 TTTTA 0.0021 TTTTC 0.00141 TTTTG 0.00161 TTTTT 0.00329 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3899 AAAAC 0.1992 AAAAG 0.1365 AAAAT 0.2744 AAACA 0.4132 AAACC 0.1889 AAACG 0.183 AAACT 0.2149 AAAGA 0.257 AAAGC 0.2407 AAAGG 0.2064 AAAGT 0.2959 AAATA 0.3354 AAATC 0.1615 AAATG 0.2714 AAATT 0.2317 AACAA 0.306 AACAC 0.2481 AACAG 0.1696 AACAT 0.2763 AACCA 0.3392 AACCC 0.281 AACCG 0.1497 AACCT 0.2301 AACGA 0.2427 AACGC 0.2372 AACGG 0.172 AACGT 0.3481 AACTA 0.2026 AACTC 0.2442 AACTG 0.2602 AACTT 0.293 AAGAA 0.3337 AAGAC 0.1989 AAGAG 0.2426 AAGAT 0.2248 AAGCA 0.3457 AAGCC 0.2213 AAGCG 0.1756 AAGCT 0.2574 AAGGA 0.2471 AAGGC 0.2445 AAGGG 0.2617 AAGGT 0.2467 AAGTA 0.221 AAGTC 0.2029 AAGTG 0.3124 AAGTT 0.2638 AATAA 0.3917 AATAC 0.1876 AATAG 0.1247 AATAT 0.2961 AATCA 0.3133 AATCC 0.2294 AATCG 0.2139 AATCT 0.2434 AATGA 0.246 AATGC 0.2159 AATGG 0.1792 AATGT 0.359 AATTA 0.2777 AATTC 0.181 AATTG 0.2397 AATTT 0.3016 ACAAA 0.3378 ACAAC 0.2227 ACAAG 0.175 ACAAT 0.2646 ACACA 0.4064 ACACC 0.1885 ACACG 0.1996 ACACT 0.2055 ACAGA 0.2581 ACAGC 0.2941 ACAGG 0.2059 ACAGT 0.2419 ACATA 0.1788 ACATC 0.2151 ACATG 0.218 ACATT 0.3881 ACCAA 0.2539 ACCAC 0.3313 ACCAG 0.2078 ACCAT 0.207 ACCCA 0.3162 ACCCC 0.2966 ACCCG 0.1709 ACCCT 0.2162 ACCGA 0.2799 ACCGC 0.2781 ACCGG 0.1885 ACCGT 0.2534 ACCTA 0.1816 ACCTC 0.2644 ACCTG 0.2878 ACCTT 0.2661 ACGAA 0.26 ACGAC 0.2478 ACGAG 0.2542 ACGAT 0.238 ACGCA 0.3336 ACGCC 0.2121 ACGCG 0.2445 ACGCT 0.2099 ACGGA 0.2255 ACGGC 0.2833 ACGGG 0.249 ACGGT 0.2421 ACGTA 0.1847 ACGTC 0.2208 ACGTG 0.3339 ACGTT 0.2607 ACTAA 0.3071 ACTAC 0.263 ACTAG 0.1427 ACTAT 0.2872 ACTCA 0.3004 ACTCC 0.2222 ACTCG 0.2359 ACTCT 0.2416 ACTGA 0.2197 ACTGC 0.3122 ACTGG 0.2126 ACTGT 0.2556 ACTTA 0.1916 ACTTC 0.1964 ACTTG 0.2479 ACTTT 0.3641 AGAAA 0.3273 AGAAC 0.1997 AGAAG 0.226 AGAAT 0.247 AGACA 0.3656 AGACC 0.2033 AGACG 0.2176 AGACT 0.2135 AGAGA 0.3008 AGAGC 0.2185 AGAGG 0.2648 AGAGT 0.2159 AGATA 0.2153 AGATC 0.1646 AGATG 0.3332 AGATT 0.2869 AGCAA 0.2569 AGCAC 0.2332 AGCAG 0.3013 AGCAT 0.2087 AGCCA 0.367 AGCCC 0.2307 AGCCG 0.1875 AGCCT 0.2148 AGCGA 0.2719 AGCGC 0.2448 AGCGG 0.2533 AGCGT 0.23 AGCTA 0.1694 AGCTC 0.2399 AGCTG 0.3023 AGCTT 0.2884 AGGAA 0.3126 AGGAC 0.1972 AGGAG 0.2892 AGGAT 0.2009 AGGCA 0.3086 AGGCC 0.2577 AGGCG 0.1992 AGGCT 0.2345 AGGGA 0.2444 AGGGC 0.2129 AGGGG 0.3196 AGGGT 0.2231 AGGTA 0.1945 AGGTC 0.2041 AGGTG 0.337 AGGTT 0.2643 AGTAA 0.3064 AGTAC 0.2243 AGTAG 0.182 AGTAT 0.2872 AGTCA 0.378 AGTCC 0.1797 AGTCG 0.2089 AGTCT 0.2334 AGTGA 0.2415 AGTGC 0.2169 AGTGG 0.2647 AGTGT 0.277 AGTTA 0.2137 AGTTC 0.1771 AGTTG 0.2581 AGTTT 0.3511 ATAAA 0.4034 ATAAC 0.168 ATAAG 0.1278 ATAAT 0.3008 ATACA 0.4551 ATACC 0.1591 ATACG 0.1452 ATACT 0.2406 ATAGA 0.2737 ATAGC 0.254 ATAGG 0.2019 ATAGT 0.2704 ATATA 0.2961 ATATC 0.1592 ATATG 0.1844 ATATT 0.3603 ATCAA 0.2639 ATCAC 0.2686 ATCAG 0.1894 ATCAT 0.2781 ATCCA 0.3739 ATCCC 0.2477 ATCCG 0.1485 ATCCT 0.23 ATCGA 0.2566 ATCGC 0.2623 ATCGG 0.2016 ATCGT 0.2795 ATCTA 0.1968 ATCTC 0.2579 ATCTG 0.277 ATCTT 0.2683 ATGAA 0.3342 ATGAC 0.2118 ATGAG 0.1924 ATGAT 0.2615 ATGCA 0.4018 ATGCC 0.2018 ATGCG 0.15 ATGCT 0.2464 ATGGA 0.2708 ATGGC 0.2443 ATGGG 0.2296 ATGGT 0.2553 ATGTA 0.2478 ATGTC 0.1623 ATGTG 0.2632 ATGTT 0.3267 ATTAA 0.3355 ATTAC 0.2094 ATTAG 0.1339 ATTAT 0.3211 ATTCA 0.3511 ATTCC 0.241 ATTCG 0.1485 ATTCT 0.2594 ATTGA 0.2358 ATTGC 0.2271 ATTGG 0.2041 ATTGT 0.333 ATTTA 0.2575 ATTTC 0.1687 ATTTG 0.2201 ATTTT 0.3537 CAAAA 0.3058 CAAAC 0.2234 CAAAG 0.1946 CAAAT 0.2762 CAACA 0.4171 CAACC 0.2051 CAACG 0.173 CAACT 0.2048 CAAGA 0.26 CAAGC 0.2548 CAAGG 0.2231 CAAGT 0.2621 CAATA 0.243 CAATC 0.177 CAATG 0.2962 CAATT 0.2838 CACAA 0.2841 CACAC 0.3003 CACAG 0.1954 CACAT 0.2202 CACCA 0.3604 CACCC 0.2461 CACCG 0.1835 CACCT 0.2101 CACGA 0.2393 CACGC 0.2385 CACGG 0.2182 CACGT 0.304 CACTA 0.1582 CACTC 0.2286 CACTG 0.3271 CACTT 0.2861 CAGAA 0.2813 CAGAC 0.219 CAGAG 0.2614 CAGAT 0.2384 CAGCA 0.3911 CAGCC 0.2306 CAGCG 0.1711 CAGCT 0.2072 CAGGA 0.2666 CAGGC 0.2179 CAGGG 0.2559 CAGGT 0.2597 CAGTA 0.2107 CAGTC 0.2038 CAGTG 0.3536 CAGTT 0.2319 CATAA 0.2924 CATAC 0.2456 CATAG 0.1676 CATAT 0.2943 CATCA 0.3569 CATCC 0.1917 CATCG 0.1985 CATCT 0.2529 CATGA 0.2452 CATGC 0.2445 CATGG 0.2215 CATGT 0.2888 CATTA 0.209 CATTC 0.1836 CATTG 0.2518 CATTT 0.3556 CCAAA 0.3139 CCAAC 0.2311 CCAAG 0.199 CCAAT 0.2561 CCACA 0.276 CCACC 0.3023 CCACG 0.206 CCACT 0.2156 CCAGA 0.2267 CCAGC 0.2903 CCAGG 0.2419 CCAGT 0.2411 CCATA 0.1854 CCATC 0.2703 CCATG 0.2522 CCATT 0.2921 CCCAA 0.2341 CCCAC 0.3366 CCCAG 0.2125 CCCAT 0.2168 CCCCA 0.2229 CCCCC 0.4314 CCCCG 0.1359 CCCCT 0.2098 CCCGA 0.2364 CCCGC 0.2794 CCCGG 0.2125 CCCGT 0.2717 CCCTA 0.1399 CCCTC 0.344 CCCTG 0.2586 CCCTT 0.2574 CCGAA 0.2503 CCGAC 0.2284 CCGAG 0.2863 CCGAT 0.235 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.2972 CCGCG 0.2091 CCGCT 0.2403 CCGGA 0.2081 CCGGC 0.2847 CCGGG 0.2635 CCGGT 0.2437 CCGTA 0.1718 CCGTC 0.232 CCGTG 0.3877 CCGTT 0.2085 CCTAA 0.2733 CCTAC 0.3134 CCTAG 0.1569 CCTAT 0.2564 CCTCA 0.218 CCTCC 0.3485 CCTCG 0.1855 CCTCT 0.248 CCTGA 0.1914 CCTGC 0.2975 CCTGG 0.253 CCTGT 0.2581 CCTTA 0.1792 CCTTC 0.2594 CCTTG 0.2548 CCTTT 0.3065 CGAAA 0.3618 CGAAC 0.2086 CGAAG 0.19 CGAAT 0.2396 CGACA 0.2692 CGACC 0.2333 CGACG 0.2729 CGACT 0.2246 CGAGA 0.2368 CGAGC 0.2374 CGAGG 0.2548 CGAGT 0.271 CGATA 0.1812 CGATC 0.1779 CGATG 0.3263 CGATT 0.3146 CGCAA 0.2467 CGCAC 0.3039 CGCAG 0.245 CGCAT 0.2043 CGCCA 0.2862 CGCCC 0.2343 CGCCG 0.2668 CGCCT 0.2127 CGCGA 0.228 CGCGC 0.2914 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2637 CGCTA 0.155 CGCTC 0.2746 CGCTG 0.319 CGCTT 0.2514 CGGAA 0.2433 CGGAC 0.2021 CGGAG 0.338 CGGAT 0.2167 CGGCA 0.2601 CGGCC 0.2517 CGGCG 0.2683 CGGCT 0.22 CGGGA 0.2135 CGGGC 0.2201 CGGGG 0.3059 CGGGT 0.2605 CGGTA 0.2021 CGGTC 0.1953 CGGTG 0.3803 CGGTT 0.2222 CGTAA 0.2851 CGTAC 0.2331 CGTAG 0.2397 CGTAT 0.242 CGTCA 0.3466 CGTCC 0.1875 CGTCG 0.2405 CGTCT 0.2254 CGTGA 0.2719 CGTGC 0.2122 CGTGG 0.25 CGTGT 0.2659 CGTTA 0.1888 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.2602 CGTTT 0.3566 CTAAA 0.3744 CTAAC 0.1982 CTAAG 0.1525 CTAAT 0.2749 CTACA 0.3527 CTACC 0.2232 CTACG 0.2059 CTACT 0.2183 CTAGA 0.2844 CTAGC 0.2276 CTAGG 0.2338 CTAGT 0.2543 CTATA 0.2645 CTATC 0.1845 CTATG 0.2253 CTATT 0.3256 CTCAA 0.2883 CTCAC 0.2942 CTCAG 0.1779 CTCAT 0.2397 CTCCA 0.2949 CTCCC 0.2988 CTCCG 0.1672 CTCCT 0.2391 CTCGA 0.1906 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.2341 CTCGT 0.2849 CTCTA 0.1495 CTCTC 0.3017 CTCTG 0.2809 CTCTT 0.2679 CTGAA 0.3207 CTGAC 0.2217 CTGAG 0.2037 CTGAT 0.2539 CTGCA 0.3354 CTGCC 0.2185 CTGCG 0.1498 CTGCT 0.2963 CTGGA 0.2396 CTGGC 0.2551 CTGGG 0.2363 CTGGT 0.269 CTGTA 0.2449 CTGTC 0.1822 CTGTG 0.3082 CTGTT 0.2647 CTTAA 0.3581 CTTAC 0.2122 CTTAG 0.1515 CTTAT 0.2782 CTTCA 0.3493 CTTCC 0.2367 CTTCG 0.1372 CTTCT 0.2768 CTTGA 0.2252 CTTGC 0.2561 CTTGG 0.2171 CTTGT 0.3016 CTTTA 0.2542 CTTTC 0.2082 CTTTG 0.2518 CTTTT 0.2857 GAAAA 0.3295 GAAAC 0.21 GAAAG 0.1989 GAAAT 0.2617 GAACA 0.3427 GAACC 0.2435 GAACG 0.1983 GAACT 0.2155 GAAGA 0.2779 GAAGC 0.2326 GAAGG 0.2557 GAAGT 0.2338 GAATA 0.2429 GAATC 0.1876 GAATG 0.2858 GAATT 0.2837 GACAA 0.2958 GACAC 0.2541 GACAG 0.2069 GACAT 0.2432 GACCA 0.318 GACCC 0.2553 GACCG 0.1816 GACCT 0.2452 GACGA 0.2688 GACGC 0.1979 GACGG 0.2099 GACGT 0.3234 GACTA 0.1378 GACTC 0.2347 GACTG 0.316 GACTT 0.3114 GAGAA 0.2681 GAGAC 0.2255 GAGAG 0.2829 GAGAT 0.2236 GAGCA 0.3038 GAGCC 0.2329 GAGCG 0.2189 GAGCT 0.2444 GAGGA 0.2459 GAGGC 0.2257 GAGGG 0.3107 GAGGT 0.2177 GAGTA 0.2015 GAGTC 0.1962 GAGTG 0.3202 GAGTT 0.282 GATAA 0.3284 GATAC 0.1876 GATAG 0.1697 GATAT 0.3142 GATCA 0.3166 GATCC 0.2172 GATCG 0.2164 GATCT 0.2498 GATGA 0.2789 GATGC 0.1985 GATGG 0.2376 GATGT 0.285 GATTA 0.2275 GATTC 0.1929 GATTG 0.2408 GATTT 0.3387 GCAAA 0.3092 GCAAC 0.2212 GCAAG 0.2121 GCAAT 0.2575 GCACA 0.3395 GCACC 0.2135 GCACG 0.2224 GCACT 0.2246 GCAGA 0.216 GCAGC 0.3029 GCAGG 0.2143 GCAGT 0.2668 GCATA 0.1871 GCATC 0.2144 GCATG 0.2643 GCATT 0.3342 GCCAA 0.2564 GCCAC 0.3089 GCCAG 0.2167 GCCAT 0.2179 GCCCA 0.2723 GCCCC 0.2994 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.252 GCCGA 0.2225 GCCGC 0.3062 GCCGG 0.2009 GCCGT 0.2704 GCCTA 0.1464 GCCTC 0.3002 GCCTG 0.2645 GCCTT 0.2889 GCGAA 0.2125 GCGAC 0.2293 GCGAG 0.2999 GCGAT 0.2584 GCGCA 0.2577 GCGCC 0.2246 GCGCG 0.2834 GCGCT 0.2343 GCGGA 0.1882 GCGGC 0.3092 GCGGG 0.2467 GCGGT 0.256 GCGTA 0.1382 GCGTC 0.2026 GCGTG 0.3927 GCGTT 0.2664 GCTAA 0.3107 GCTAC 0.2645 GCTAG 0.1365 GCTAT 0.2883 GCTCA 0.2949 GCTCC 0.247 GCTCG 0.2098 GCTCT 0.2483 GCTGA 0.1841 GCTGC 0.314 GCTGG 0.2267 GCTGT 0.2753 GCTTA 0.164 GCTTC 0.223 GCTTG 0.275 GCTTT 0.3379 GGAAA 0.3335 GGAAC 0.1723 GGAAG 0.2259 GGAAT 0.2682 GGACA 0.3585 GGACC 0.2111 GGACG 0.2255 GGACT 0.2048 GGAGA 0.2709 GGAGC 0.2011 GGAGG 0.3444 GGAGT 0.1837 GGATA 0.2105 GGATC 0.1696 GGATG 0.2994 GGATT 0.3205 GGCAA 0.2694 GGCAC 0.2367 GGCAG 0.2791 GGCAT 0.2147 GGCCA 0.3401 GGCCC 0.2102 GGCCG 0.2141 GGCCT 0.2356 GGCGA 0.2711 GGCGC 0.2193 GGCGG 0.2926 GGCGT 0.2171 GGCTA 0.1681 GGCTC 0.2339 GGCTG 0.3442 GGCTT 0.2537 GGGAA 0.2862 GGGAC 0.1651 GGGAG 0.3433 GGGAT 0.2054 GGGCA 0.3104 GGGCC 0.2261 GGGCG 0.2157 GGGCT 0.2478 GGGGA 0.2016 GGGGC 0.166 GGGGG 0.4315 GGGGT 0.2009 GGGTA 0.1778 GGGTC 0.1879 GGGTG 0.3489 GGGTT 0.2854 GGTAA 0.3757 GGTAC 0.1957 GGTAG 0.2122 GGTAT 0.2165 GGTCA 0.3637 GGTCC 0.1888 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2265 GGTGA 0.2628 GGTGC 0.1829 GGTGG 0.3291 GGTGT 0.2253 GGTTA 0.2171 GGTTC 0.2043 GGTTG 0.2638 GGTTT 0.3148 GTAAA 0.3982 GTAAC 0.1844 GTAAG 0.1385 GTAAT 0.2788 GTACA 0.4202 GTACC 0.1768 GTACG 0.1719 GTACT 0.231 GTAGA 0.2606 GTAGC 0.2369 GTAGG 0.2509 GTAGT 0.2517 GTATA 0.2737 GTATC 0.1447 GTATG 0.2342 GTATT 0.3474 GTCAA 0.253 GTCAC 0.3397 GTCAG 0.1724 GTCAT 0.2348 GTCCA 0.3293 GTCCC 0.237 GTCCG 0.1649 GTCCT 0.2688 GTCGA 0.231 GTCGC 0.2487 GTCGG 0.2093 GTCGT 0.311 GTCTA 0.1477 GTCTC 0.2948 GTCTG 0.2884 GTCTT 0.2691 GTGAA 0.2719 GTGAC 0.2806 GTGAG 0.2163 GTGAT 0.2313 GTGCA 0.3268 GTGCC 0.2078 GTGCG 0.2084 GTGCT 0.2571 GTGGA 0.2255 GTGGC 0.2413 GTGGG 0.2484 GTGGT 0.2847 GTGTA 0.2133 GTGTC 0.1623 GTGTG 0.3435 GTGTT 0.2809 GTTAA 0.3588 GTTAC 0.2143 GTTAG 0.1494 GTTAT 0.2775 GTTCA 0.3464 GTTCC 0.2049 GTTCG 0.1711 GTTCT 0.2776 GTTGA 0.2471 GTTGC 0.2227 GTTGG 0.2102 GTTGT 0.32 GTTTA 0.2259 GTTTC 0.1838 GTTTG 0.2417 GTTTT 0.3486 TAAAA 0.3628 TAAAC 0.1827 TAAAG 0.1719 TAAAT 0.2827 TAACA 0.3869 TAACC 0.2232 TAACG 0.1659 TAACT 0.2241 TAAGA 0.2573 TAAGC 0.2206 TAAGG 0.2279 TAAGT 0.2942 TAATA 0.2765 TAATC 0.163 TAATG 0.2398 TAATT 0.3207 TACAA 0.2824 TACAC 0.2436 TACAG 0.2029 TACAT 0.271 TACCA 0.3276 TACCC 0.245 TACCG 0.1905 TACCT 0.2369 TACGA 0.2507 TACGC 0.1803 TACGG 0.2077 TACGT 0.3613 TACTA 0.1774 TACTC 0.2187 TACTG 0.2963 TACTT 0.3077 TAGAA 0.3283 TAGAC 0.1791 TAGAG 0.2222 TAGAT 0.2705 TAGCA 0.3361 TAGCC 0.2398 TAGCG 0.177 TAGCT 0.2472 TAGGA 0.2488 TAGGC 0.2143 TAGGG 0.2459 TAGGT 0.2911 TAGTA 0.2227 TAGTC 0.1569 TAGTG 0.3018 TAGTT 0.3186 TATAA 0.3024 TATAC 0.2094 TATAG 0.1435 TATAT 0.3448 TATCA 0.3429 TATCC 0.2168 TATCG 0.1774 TATCT 0.2629 TATGA 0.2548 TATGC 0.2252 TATGG 0.2119 TATGT 0.3081 TATTA 0.2311 TATTC 0.1495 TATTG 0.1981 TATTT 0.4213 TCAAA 0.3123 TCAAC 0.2414 TCAAG 0.1834 TCAAT 0.2629 TCACA 0.2874 TCACC 0.2597 TCACG 0.2412 TCACT 0.2117 TCAGA 0.2565 TCAGC 0.2625 TCAGG 0.2037 TCAGT 0.2774 TCATA 0.1827 TCATC 0.2601 TCATG 0.2287 TCATT 0.3286 TCCAA 0.2375 TCCAC 0.3 TCCAG 0.2115 TCCAT 0.251 TCCCA 0.2862 TCCCC 0.315 TCCCG 0.1482 TCCCT 0.2507 TCCGA 0.234 TCCGC 0.2604 TCCGG 0.205 TCCGT 0.3006 TCCTA 0.1528 TCCTC 0.2939 TCCTG 0.2909 TCCTT 0.2623 TCGAA 0.2304 TCGAC 0.2474 TCGAG 0.2286 TCGAT 0.2936 TCGCA 0.2601 TCGCC 0.2706 TCGCG 0.2159 TCGCT 0.2534 TCGGA 0.1966 TCGGC 0.2612 TCGGG 0.2427 TCGGT 0.2995 TCGTA 0.1695 TCGTC 0.2427 TCGTG 0.3475 TCGTT 0.2404 TCTAA 0.2954 TCTAC 0.2655 TCTAG 0.1556 TCTAT 0.2834 TCTCA 0.2706 TCTCC 0.2746 TCTCG 0.1728 TCTCT 0.2821 TCTGA 0.2188 TCTGC 0.2722 TCTGG 0.2152 TCTGT 0.2938 TCTTA 0.174 TCTTC 0.2424 TCTTG 0.2553 TCTTT 0.3283 TGAAA 0.3288 TGAAC 0.1925 TGAAG 0.2204 TGAAT 0.2583 TGACA 0.3029 TGACC 0.2261 TGACG 0.2317 TGACT 0.2394 TGAGA 0.275 TGAGC 0.2473 TGAGG 0.2219 TGAGT 0.2558 TGATA 0.2113 TGATC 0.157 TGATG 0.3538 TGATT 0.2779 TGCAA 0.2676 TGCAC 0.222 TGCAG 0.2555 TGCAT 0.2549 TGCCA 0.3444 TGCCC 0.2389 TGCCG 0.1832 TGCCT 0.2335 TGCGA 0.2363 TGCGC 0.2281 TGCGG 0.2261 TGCGT 0.3095 TGCTA 0.1549 TGCTC 0.2007 TGCTG 0.3838 TGCTT 0.2606 TGGAA 0.2847 TGGAC 0.1868 TGGAG 0.2759 TGGAT 0.2525 TGGCA 0.3042 TGGCC 0.2488 TGGCG 0.1791 TGGCT 0.2679 TGGGA 0.2375 TGGGC 0.1958 TGGGG 0.289 TGGGT 0.2777 TGGTA 0.1791 TGGTC 0.1763 TGGTG 0.385 TGGTT 0.2596 TGTAA 0.3054 TGTAC 0.2275 TGTAG 0.164 TGTAT 0.303 TGTCA 0.3314 TGTCC 0.2181 TGTCG 0.1735 TGTCT 0.2769 TGTGA 0.2126 TGTGC 0.2126 TGTGG 0.2197 TGTGT 0.3551 TGTTA 0.1993 TGTTC 0.1522 TGTTG 0.2839 TGTTT 0.3646 TTAAA 0.3809 TTAAC 0.1933 TTAAG 0.1464 TTAAT 0.2795 TTACA 0.3946 TTACC 0.2375 TTACG 0.1471 TTACT 0.2208 TTAGA 0.2682 TTAGC 0.2574 TTAGG 0.2024 TTAGT 0.2719 TTATA 0.2391 TTATC 0.1532 TTATG 0.1687 TTATT 0.4389 TTCAA 0.266 TTCAC 0.2546 TTCAG 0.1928 TTCAT 0.2866 TTCCA 0.3265 TTCCC 0.2672 TTCCG 0.1291 TTCCT 0.2772 TTCGA 0.2148 TTCGC 0.2302 TTCGG 0.229 TTCGT 0.3259 TTCTA 0.1877 TTCTC 0.2428 TTCTG 0.2567 TTCTT 0.3129 TTGAA 0.3047 TTGAC 0.2242 TTGAG 0.2273 TTGAT 0.2437 TTGCA 0.3638 TTGCC 0.2184 TTGCG 0.1562 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2319 TTGGC 0.2602 TTGGG 0.2244 TTGGT 0.2835 TTGTA 0.2232 TTGTC 0.1706 TTGTG 0.2934 TTGTT 0.3128 TTTAA 0.3338 TTTAC 0.2185 TTTAG 0.1332 TTTAT 0.3145 TTTCA 0.34 TTTCC 0.2279 TTTCG 0.1706 TTTCT 0.2615 TTTGA 0.2281 TTTGC 0.222 TTTGG 0.2037 TTTGT 0.3462 TTTTA 0.2563 TTTTC 0.1648 TTTTG 0.189 TTTTT 0.3899 [4] # (a,c,g,t)= (0.176, 0.324, 0.324, 0.176) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.252 C 0.248 G 0.248 T 0.252 # l= 1 # Values AA 0.0716 AC 0.0648 AG 0.0549 AT 0.0605 CA 0.0756 CC 0.0642 CG 0.0535 CT 0.0549 GA 0.0561 GC 0.0631 GG 0.0642 GT 0.0648 TA 0.0485 TC 0.0561 TG 0.0756 TT 0.0716 # l= 2 # Values AAA 0.024 AAC 0.0161 AAG 0.0133 AAT 0.0182 ACA 0.022 ACC 0.0157 ACG 0.0143 ACT 0.0129 AGA 0.0137 AGC 0.0147 AGG 0.0136 AGT 0.0129 ATA 0.0136 ATC 0.0126 ATG 0.0161 ATT 0.0182 CAA 0.0183 CAC 0.0242 CAG 0.017 CAT 0.0161 CCA 0.0185 CCC 0.0193 CCG 0.0127 CCT 0.0136 CGA 0.0119 CGC 0.0146 CGG 0.0127 CGT 0.0142 CTA 0.00821 CTC 0.0164 CTG 0.017 CTT 0.0133 GAA 0.014 GAC 0.0131 GAG 0.0164 GAT 0.0125 GCA 0.0182 GCC 0.0155 GCG 0.0146 GCT 0.0147 GGA 0.0136 GGC 0.0155 GGG 0.0193 GGT 0.0157 GTA 0.0114 GTC 0.0131 GTG 0.0242 GTT 0.0161 TAA 0.0152 TAC 0.0114 TAG 0.00821 TAT 0.0136 TCA 0.0169 TCC 0.0136 TCG 0.0119 TCT 0.0137 TGA 0.0169 TGC 0.0182 TGG 0.0185 TGT 0.022 TTA 0.0152 TTC 0.014 TTG 0.0183 TTT 0.024 # l= 3 # Values AAAA 0.00821 AAAC 0.00524 AAAG 0.0042 AAAT 0.00635 AACA 0.00607 AACC 0.00367 AACG 0.00313 AACT 0.00319 AAGA 0.00343 AAGC 0.00328 AAGG 0.00312 AAGT 0.00347 AATA 0.00499 AATC 0.00342 AATG 0.00492 AATT 0.00486 ACAA 0.0058 ACAC 0.00691 ACAG 0.00446 ACAT 0.00483 ACCA 0.00505 ACCC 0.00443 ACCG 0.00309 ACCT 0.00315 ACGA 0.00335 ACGC 0.00355 ACGG 0.0032 ACGT 0.00415 ACTA 0.00202 ACTC 0.00357 ACTG 0.00379 ACTT 0.00347 AGAA 0.00356 AGAC 0.00314 AGAG 0.0039 AGAT 0.00306 AGCA 0.00483 AGCC 0.00344 AGCG 0.0033 AGCT 0.00317 AGGA 0.00326 AGGC 0.0032 AGGG 0.00402 AGGT 0.00315 AGTA 0.00239 AGTC 0.00271 AGTG 0.00457 AGTT 0.00319 ATAA 0.00462 ATAC 0.00281 ATAG 0.00219 ATAT 0.00401 ATCA 0.00405 ATCC 0.00264 ATCG 0.0028 ATCT 0.00306 ATGA 0.00416 ATGC 0.00348 ATGG 0.00364 ATGT 0.00483 ATTA 0.00414 ATTC 0.00342 ATTG 0.00428 ATTT 0.00635 CAAA 0.00557 CAAC 0.00483 CAAG 0.00362 CAAT 0.00428 CACA 0.00758 CACC 0.00646 CACG 0.0056 CACT 0.00457 CAGA 0.00384 CAGC 0.00548 CAGG 0.00387 CAGT 0.00379 CATA 0.00274 CATC 0.0046 CATG 0.00386 CATT 0.00492 CCAA 0.00406 CCAC 0.00678 CCAG 0.00399 CCAT 0.00364 CCCA 0.00476 CCCC 0.00716 CCCG 0.00339 CCCT 0.00402 CCGA 0.00274 CCGC 0.00391 CCGG 0.00289 CCGT 0.0032 CCTA 0.00197 CCTC 0.00468 CCTG 0.00387 CCTT 0.00312 CGAA 0.00244 CGAC 0.00313 CGAG 0.00355 CGAT 0.0028 CGCA 0.00363 CGCC 0.0039 CGCG 0.00377 CGCT 0.0033 CGGA 0.00231 CGGC 0.00395 CGGG 0.00339 CGGT 0.00309 CGTA 0.00213 CGTC 0.0034 CGTG 0.0056 CGTT 0.00313 CTAA 0.00224 CTAC 0.00253 CTAG 0.00125 CTAT 0.00219 CTCA 0.00409 CTCC 0.00486 CTCG 0.00355 CTCT 0.0039 CTGA 0.0031 CTGC 0.00544 CTGG 0.00399 CTGT 0.00446 CTTA 0.00219 CTTC 0.0033 CTTG 0.00362 CTTT 0.0042 GAAA 0.00436 GAAC 0.00295 GAAG 0.0033 GAAT 0.00342 GACA 0.00397 GACC 0.00305 GACG 0.0034 GACT 0.00271 GAGA 0.00428 GAGC 0.00387 GAGG 0.00468 GAGT 0.00357 GATA 0.00235 GATC 0.00217 GATG 0.0046 GATT 0.00342 GCAA 0.00429 GCAC 0.005 GCAG 0.00544 GCAT 0.00348 GCCA 0.00465 GCCC 0.00373 GCCG 0.00395 GCCT 0.0032 GCGA 0.00332 GCGC 0.00381 GCGG 0.00391 GCGT 0.00355 GCTA 0.00211 GCTC 0.00387 GCTG 0.00548 GCTT 0.00329 GGAA 0.00344 GGAC 0.00267 GGAG 0.00486 GGAT 0.00264 GGCA 0.00416 GGCC 0.00403 GGCG 0.0039 GGCT 0.00344 GGGA 0.00402 GGGC 0.00373 GGGG 0.00716 GGGT 0.00443 GGTA 0.00254 GGTC 0.00305 GGTG 0.00646 GGTT 0.00367 GTAA 0.0033 GTAC 0.00277 GTAG 0.00253 GTAT 0.00281 GTCA 0.0042 GTCC 0.00267 GTCG 0.00313 GTCT 0.00314 GTGA 0.00551 GTGC 0.005 GTGG 0.00678 GTGT 0.00691 GTTA 0.00304 GTTC 0.00295 GTTG 0.00483 GTTT 0.00524 TAAA 0.00586 TAAC 0.00304 TAAG 0.00219 TAAT 0.00414 TACA 0.00436 TACC 0.00254 TACG 0.00213 TACT 0.00239 TAGA 0.00211 TAGC 0.00211 TAGG 0.00197 TAGT 0.00202 TATA 0.00355 TATC 0.00235 TATG 0.00274 TATT 0.00499 TCAA 0.00415 TCAC 0.00551 TCAG 0.0031 TCAT 0.00417 TCCA 0.00402 TCCC 0.00402 TCCG 0.00231 TCCT 0.00326 TCGA 0.00251 TCGC 0.00332 TCGG 0.00274 TCGT 0.00335 TCTA 0.00211 TCTC 0.00428 TCTG 0.00384 TCTT 0.00343 TGAA 0.0046 TGAC 0.0042 TGAG 0.00409 TGAT 0.00405 TGCA 0.00559 TGCC 0.00417 TGCG 0.00362 TGCT 0.00483 TGGA 0.00402 TGGC 0.00465 TGGG 0.00476 TGGT 0.00505 TGTA 0.00436 TGTC 0.00398 TGTG 0.00758 TGTT 0.00608 TTAA 0.00507 TTAC 0.0033 TTAG 0.00224 TTAT 0.00461 TTCA 0.0046 TTCC 0.00344 TTCG 0.00244 TTCT 0.00356 TTGA 0.00416 TTGC 0.00429 TTGG 0.00406 TTGT 0.00579 TTTA 0.00586 TTTC 0.00436 TTTG 0.00557 TTTT 0.00821 # l= 4 # Values AAAAA 0.0032 AAAAC 0.00171 AAAAG 0.00112 AAAAT 0.00218 AAACA 0.00207 AAACC 0.00109 AAACG 0.00103 AAACT 0.00106 AAAGA 0.0011 AAAGC 0.001 AAAGG 0.000898 AAAGT 0.0012 AAATA 0.00211 AAATC 0.00111 AAATG 0.00169 AAATT 0.00145 AACAA 0.00174 AACAC 0.00167 AACAG 0.00109 AACAT 0.00158 AACCA 0.00113 AACCC 0.0011 AACCG 0.000699 AACCT 0.000736 AACGA 0.000743 AACGC 0.000814 AACGG 0.000611 AACGT 0.000959 AACTA 0.000596 AACTC 0.00087 AACTG 0.000825 AACTT 0.000898 AAGAA 0.00106 AAGAC 0.000734 AAGAG 0.000884 AAGAT 0.000757 AAGCA 0.00104 AAGCC 0.000757 AAGCG 0.000675 AAGCT 0.000818 AAGGA 0.000718 AAGGC 0.000832 AAGGG 0.000856 AAGGT 0.000717 AAGTA 0.000671 AAGTC 0.000757 AAGTG 0.00115 AAGTT 0.000898 AATAA 0.002 AATAC 0.000938 AATAG 0.000615 AATAT 0.00144 AATCA 0.00104 AATCC 0.000791 AATCG 0.000809 AATCT 0.000779 AATGA 0.00127 AATGC 0.00103 AATGG 0.000918 AATGT 0.0017 AATTA 0.00133 AATTC 0.000897 AATTG 0.00119 AATTT 0.00145 ACAAA 0.00194 ACAAC 0.00151 ACAAG 0.00101 ACAAT 0.00133 ACACA 0.00294 ACACC 0.00131 ACACG 0.0015 ACACT 0.00116 ACAGA 0.00118 ACAGC 0.00137 ACAGG 0.000959 ACAGT 0.000944 ACATA 0.000859 ACATC 0.00122 ACATG 0.00105 ACATT 0.0017 ACCAA 0.00111 ACCAC 0.00197 ACCAG 0.00103 ACCAT 0.000939 ACCCA 0.00131 ACCCC 0.0014 ACCCG 0.000894 ACCCT 0.00082 ACCGA 0.000746 ACCGC 0.000957 ACCGG 0.00066 ACCGT 0.000727 ACCTA 0.000548 ACCTC 0.000956 ACCTG 0.000929 ACCTT 0.000717 ACGAA 0.000757 ACGAC 0.000893 ACGAG 0.000953 ACGAT 0.000749 ACGCA 0.00111 ACGCC 0.00079 ACGCG 0.00097 ACGCT 0.000676 ACGGA 0.000648 ACGGC 0.000957 ACGGG 0.00087 ACGGT 0.000727 ACGTA 0.00069 ACGTC 0.000967 ACGTG 0.00153 ACGTT 0.000959 ACTAA 0.000608 ACTAC 0.000606 ACTAG 0.000286 ACTAT 0.000521 ACTCA 0.00106 ACTCC 0.000822 ACTCG 0.000925 ACTCT 0.000758 ACTGA 0.000789 ACTGC 0.00122 ACTGG 0.000836 ACTGT 0.000944 ACTTA 0.000615 ACTTC 0.000735 ACTTG 0.000919 ACTTT 0.0012 AGAAA 0.0011 AGAAC 0.000746 AGAAG 0.000857 AGAAT 0.000855 AGACA 0.00112 AGACC 0.00066 AGACG 0.000745 AGACT 0.000615 AGAGA 0.00123 AGAGC 0.000857 AGAGG 0.00106 AGAGT 0.000758 AGATA 0.000609 AGATC 0.000557 AGATG 0.00112 AGATT 0.000779 AGCAA 0.00106 AGCAC 0.00123 AGCAG 0.00172 AGCAT 0.000822 AGCCA 0.00114 AGCCC 0.000816 AGCCG 0.000798 AGCCT 0.00069 AGCGA 0.000828 AGCGC 0.000857 AGCGG 0.00094 AGCGT 0.000676 AGCTA 0.000465 AGCTC 0.000862 AGCTG 0.00102 AGCTT 0.000818 AGGAA 0.000902 AGGAC 0.000632 AGGAG 0.00114 AGGAT 0.000587 AGGCA 0.000917 AGGCC 0.000875 AGGCG 0.000721 AGGCT 0.00069 AGGGA 0.000931 AGGGC 0.000824 AGGGG 0.00145 AGGGT 0.00082 AGGTA 0.000539 AGGTC 0.000704 AGGTG 0.00117 AGGTT 0.000736 AGTAA 0.000697 AGTAC 0.000559 AGTAG 0.000501 AGTAT 0.000633 AGTCA 0.000927 AGTCC 0.000504 AGTCG 0.000666 AGTCT 0.000615 AGTGA 0.00114 AGTGC 0.000981 AGTGG 0.00129 AGTGT 0.00116 AGTTA 0.000615 AGTTC 0.00063 AGTTG 0.000883 AGTTT 0.00106 ATAAA 0.00187 ATAAC 0.000822 ATAAG 0.000575 ATAAT 0.00134 ATACA 0.00125 ATACC 0.000495 ATACG 0.000434 ATACT 0.000633 ATAGA 0.000581 ATAGC 0.000559 ATAGG 0.000532 ATAGT 0.000521 ATATA 0.00117 ATATC 0.000684 ATATG 0.000723 ATATT 0.00144 ATCAA 0.000976 ATCAC 0.00121 ATCAG 0.000763 ATCAT 0.0011 ATCCA 0.000907 ATCCC 0.000726 ATCCG 0.000418 ATCCT 0.000587 ATCGA 0.000692 ATCGC 0.000755 ATCGG 0.000605 ATCGT 0.000749 ATCTA 0.000541 ATCTC 0.000938 ATCTG 0.000826 ATCTT 0.000757 ATGAA 0.00129 ATGAC 0.000887 ATGAG 0.000892 ATGAT 0.0011 ATGCA 0.00127 ATGCC 0.000721 ATGCG 0.000671 ATGCT 0.000822 ATGGA 0.000912 ATGGC 0.000872 ATGGG 0.00092 ATGGT 0.000939 ATGTA 0.00108 ATGTC 0.000793 ATGTG 0.00137 ATGTT 0.00158 ATTAA 0.00137 ATTAC 0.000865 ATTAG 0.000564 ATTAT 0.00134 ATTCA 0.00111 ATTCC 0.000904 ATTCG 0.00055 ATTCT 0.000855 ATTGA 0.00101 ATTGC 0.000978 ATTGG 0.000964 ATTGT 0.00133 ATTTA 0.0016 ATTTC 0.00111 ATTTG 0.00146 ATTTT 0.00218 CAAAA 0.00158 CAAAC 0.00136 CAAAG 0.00117 CAAAT 0.00146 CAACA 0.00199 CAACC 0.00105 CAACG 0.000905 CAACT 0.000883 CAAGA 0.000907 CAAGC 0.000992 CAAGG 0.000806 CAAGT 0.000919 CAATA 0.000979 CAATC 0.000861 CAATG 0.00125 CAATT 0.00119 CACAA 0.00185 CACAC 0.0028 CACAG 0.00155 CACAT 0.00137 CACCA 0.00235 CACCC 0.00164 CACCG 0.00129 CACCT 0.00117 CACGA 0.00123 CACGC 0.00152 CACGG 0.00132 CACGT 0.00153 CACTA 0.000687 CACTC 0.0013 CACTG 0.00143 CACTT 0.00115 CAGAA 0.000934 CAGAC 0.000957 CAGAG 0.00112 CAGAT 0.000826 CAGCA 0.00211 CAGCC 0.00127 CAGCG 0.00108 CAGCT 0.00102 CAGGA 0.000966 CAGGC 0.000891 CAGGG 0.00108 CAGGT 0.000929 CAGTA 0.000687 CAGTC 0.000853 CAGTG 0.00143 CAGTT 0.000825 CATAA 0.000824 CATAC 0.000675 CATAG 0.000521 CATAT 0.000723 CATCA 0.00165 CATCC 0.000859 CATCG 0.000977 CATCT 0.00112 CATGA 0.000886 CATGC 0.00097 CATGG 0.000948 CATGT 0.00105 CATTA 0.000972 CATTC 0.00101 CATTG 0.00125 CATTT 0.00169 CCAAA 0.00117 CCAAC 0.00109 CCAAG 0.000834 CCAAT 0.000964 CCACA 0.00166 CCACC 0.00236 CCACG 0.00147 CCACT 0.00129 CCAGA 0.000828 CCAGC 0.00128 CCAGG 0.00104 CCAGT 0.000836 CCATA 0.000627 CCATC 0.00115 CCATG 0.000948 CCATT 0.000918 CCCAA 0.001 CCCAC 0.00177 CCCAG 0.00106 CCCAT 0.00092 CCCCA 0.00149 CCCCC 0.00317 CCCCG 0.00106 CCCCT 0.00145 CCCGA 0.00072 CCCGC 0.001 CCCGG 0.0008 CCCGT 0.00087 CCCTA 0.000555 CCCTC 0.00153 CCCTG 0.00108 CCCTT 0.000856 CCGAA 0.00059 CCGAC 0.000697 CCGAG 0.000844 CCGAT 0.000605 CCGCA 0.000853 CCGCC 0.00121 CCGCG 0.000915 CCGCT 0.00094 CCGGA 0.000513 CCGGC 0.00092 CCGGG 0.0008 CCGGT 0.00066 CCGTA 0.00047 CCGTC 0.000804 CCGTG 0.00132 CCGTT 0.000611 CCTAA 0.000475 CCTAC 0.000635 CCTAG 0.000326 CCTAT 0.000532 CCTCA 0.000932 CCTCC 0.0017 CCTCG 0.000988 CCTCT 0.00106 CCTGA 0.000658 CCTGC 0.00121 CCTGG 0.00104 CCTGT 0.000959 CCTTA 0.000537 CCTTC 0.000881 CCTTG 0.000806 CCTTT 0.000898 CGAAA 0.000816 CGAAC 0.000581 CGAAG 0.000493 CGAAT 0.00055 CGACA 0.000798 CGACC 0.000779 CGACG 0.000888 CGACT 0.000666 CGAGA 0.000733 CGAGC 0.000902 CGAGG 0.000988 CGAGT 0.000925 CGATA 0.000492 CGATC 0.000522 CGATG 0.000977 CGATT 0.000809 CGCAA 0.0008 CGCAC 0.00123 CGCAG 0.00092 CGCAT 0.000671 CGCCA 0.00101 CGCCC 0.00098 CGCCG 0.00119 CGCCT 0.000721 CGCGA 0.000757 CGCGC 0.00112 CGCGG 0.000915 CGCGT 0.00097 CGCTA 0.000468 CGCTC 0.00108 CGCTG 0.00108 CGCTT 0.000675 CGGAA 0.000498 CGGAC 0.000504 CGGAG 0.00089 CGGAT 0.000418 CGGCA 0.000932 CGGCC 0.00104 CGGCG 0.00119 CGGCT 0.000798 CGGGA 0.000682 CGGGC 0.000761 CGGGG 0.00106 CGGGT 0.000894 CGGTA 0.000496 CGGTC 0.0006 CGGTG 0.00129 CGGTT 0.000699 CGTAA 0.00053 CGTAC 0.000605 CGTAG 0.00056 CGTAT 0.000434 CGTCA 0.00109 CGTCC 0.000679 CGTCG 0.000888 CGTCT 0.000745 CGTGA 0.00135 CGTGC 0.00127 CGTGG 0.00147 CGTGT 0.0015 CGTTA 0.000542 CGTTC 0.000656 CGTTG 0.000905 CGTTT 0.00103 CTAAA 0.000781 CTAAC 0.000528 CTAAG 0.000363 CTAAT 0.000564 CTACA 0.00083 CTACC 0.000638 CTACG 0.00056 CTACT 0.000501 CTAGA 0.000333 CTAGC 0.000306 CTAGG 0.000326 CTAGT 0.000286 CTATA 0.000581 CTATC 0.000475 CTATG 0.000521 CTATT 0.000615 CTCAA 0.00103 CTCAC 0.00144 CTCAG 0.000721 CTCAT 0.000892 CTCCA 0.00131 CTCCC 0.00152 CTCCG 0.00089 CTCCT 0.00114 CTCGA 0.000612 CTCGC 0.00114 CTCGG 0.000844 CTCGT 0.000953 CTCTA 0.000515 CTCTC 0.00138 CTCTG 0.00112 CTCTT 0.000884 CTGAA 0.000888 CTGAC 0.000727 CTGAG 0.000721 CTGAT 0.000763 CTGCA 0.00153 CTGCC 0.00127 CTGCG 0.00092 CTGCT 0.00172 CTGGA 0.000855 CTGGC 0.00103 CTGGG 0.00106 CTGGT 0.00103 CTGTA 0.000945 CTGTC 0.000868 CTGTG 0.00155 CTGTT 0.00109 CTTAA 0.000752 CTTAC 0.000497 CTTAG 0.000363 CTTAT 0.000575 CTTCA 0.00109 CTTCC 0.000858 CTTCG 0.000493 CTTCT 0.000857 CTTGA 0.000795 CTTGC 0.00098 CTTGG 0.000834 CTTGT 0.00101 CTTTA 0.00101 CTTTC 0.000904 CTTTG 0.00117 CTTTT 0.00112 GAAAA 0.00136 GAAAC 0.000989 GAAAG 0.000904 GAAAT 0.00111 GAACA 0.000893 GAACC 0.000771 GAACG 0.000656 GAACT 0.00063 GAAGA 0.000889 GAAGC 0.000793 GAAGG 0.000881 GAAGT 0.000735 GAATA 0.000778 GAATC 0.000743 GAATG 0.00101 GAATT 0.000897 GACAA 0.00104 GACAC 0.00127 GACAG 0.000868 GACAT 0.000793 GACCA 0.000842 GACCC 0.000907 GACCG 0.0006 GACCT 0.000704 GACGA 0.000882 GACGC 0.000745 GACGG 0.000804 GACGT 0.000967 GACTA 0.000324 GACTC 0.000777 GACTG 0.000853 GACTT 0.000757 GAGAA 0.000938 GAGAC 0.00103 GAGAG 0.00138 GAGAT 0.000938 GAGCA 0.00104 GAGCC 0.000884 GAGCG 0.00108 GAGCT 0.000862 GAGGA 0.00114 GAGGC 0.00105 GAGGG 0.00153 GAGGT 0.000956 GAGTA 0.000619 GAGTC 0.000777 GAGTG 0.0013 GAGTT 0.00087 GATAA 0.00072 GATAC 0.000471 GATAG 0.000475 GATAT 0.000684 GATCA 0.000603 GATCC 0.000493 GATCG 0.000522 GATCT 0.000557 GATGA 0.00134 GATGC 0.000893 GATGG 0.00115 GATGT 0.00122 GATTA 0.000714 GATTC 0.000743 GATTG 0.000861 GATTT 0.00111 GCAAA 0.00123 GCAAC 0.0011 GCAAG 0.00098 GCAAT 0.000978 GCACA 0.00155 GCACC 0.0012 GCACG 0.00127 GCACT 0.000981 GCAGA 0.00107 GCAGC 0.00193 GCAGG 0.00121 GCAGT 0.00122 GCATA 0.000588 GCATC 0.000893 GCATG 0.00097 GCATT 0.00103 GCCAA 0.0011 GCCAC 0.00165 GCCAG 0.00103 GCCAT 0.000872 GCCCA 0.000939 GCCCC 0.0012 GCCCG 0.000761 GCCCT 0.000824 GCCGA 0.000768 GCCGC 0.00131 GCCGG 0.00092 GCCGT 0.000957 GCCTA 0.000433 GCCTC 0.00105 GCCTG 0.000891 GCCTT 0.000832 GCGAA 0.000588 GCGAC 0.000836 GCGAG 0.00114 GCGAT 0.000755 GCGCA 0.000892 GCGCC 0.000941 GCGCG 0.00112 GCGCT 0.000857 GCGGA 0.000648 GCGGC 0.00131 GCGGG 0.001 GCGGT 0.000957 GCGTA 0.000468 GCGTC 0.000745 GCGTG 0.00152 GCGTT 0.000814 GCTAA 0.000582 GCTAC 0.000659 GCTAG 0.000306 GCTAT 0.000559 GCTCA 0.00106 GCTCC 0.00105 GCTCG 0.000902 GCTCT 0.000857 GCTGA 0.000894 GCTGC 0.00193 GCTGG 0.00128 GCTGT 0.00137 GCTTA 0.000496 GCTTC 0.000793 GCTTG 0.000992 GCTTT 0.001 GGAAA 0.00104 GGAAC 0.000632 GGAAG 0.000858 GGAAT 0.000904 GGACA 0.000883 GGACC 0.000603 GGACG 0.000679 GGACT 0.000504 GGAGA 0.00129 GGAGC 0.00105 GGAGG 0.0017 GGAGT 0.000822 GGATA 0.000496 GGATC 0.000493 GGATG 0.000859 GGATT 0.000791 GGCAA 0.00107 GGCAC 0.0011 GGCAG 0.00127 GGCAT 0.000721 GGCCA 0.00124 GGCCC 0.00087 GGCCG 0.00104 GGCCT 0.000875 GGCGA 0.000964 GGCGC 0.000941 GGCGG 0.00121 GGCGT 0.00079 GGCTA 0.00053 GGCTC 0.000884 GGCTG 0.00127 GGCTT 0.000757 GGGAA 0.000996 GGGAC 0.000776 GGGAG 0.00152 GGGAT 0.000726 GGGCA 0.00106 GGGCC 0.00087 GGGCG 0.00098 GGGCT 0.000816 GGGGA 0.00139 GGGGC 0.0012 GGGGG 0.00317 GGGGT 0.0014 GGGTA 0.000774 GGGTC 0.000907 GGGTG 0.00164 GGGTT 0.0011 GGTAA 0.000818 GGTAC 0.000592 GGTAG 0.000638 GGTAT 0.000495 GGTCA 0.00101 GGTCC 0.000603 GGTCG 0.000779 GGTCT 0.00066 GGTGA 0.00159 GGTGC 0.0012 GGTGG 0.00236 GGTGT 0.00131 GGTTA 0.000763 GGTTC 0.000771 GGTTG 0.00105 GGTTT 0.00109 GTAAA 0.0013 GTAAC 0.000645 GTAAG 0.000497 GTAAT 0.000865 GTACA 0.00102 GTACC 0.000592 GTACG 0.000605 GTACT 0.000559 GTAGA 0.000628 GTAGC 0.000659 GTAGG 0.000635 GTAGT 0.000606 GTATA 0.00073 GTATC 0.000471 GTATG 0.000675 GTATT 0.000938 GTCAA 0.001 GTCAC 0.00158 GTCAG 0.000727 GTCAT 0.000887 GTCCA 0.000757 GTCCC 0.000776 GTCCG 0.000504 GTCCT 0.000632 GTCGA 0.000704 GTCGC 0.000836 GTCGG 0.000697 GTCGT 0.000893 GTCTA 0.000424 GTCTC 0.00103 GTCTG 0.000957 GTCTT 0.000734 GTGAA 0.00127 GTGAC 0.00158 GTGAG 0.00144 GTGAT 0.00121 GTGCA 0.00143 GTGCC 0.0011 GTGCG 0.00123 GTGCT 0.00123 GTGGA 0.00139 GTGGC 0.00165 GTGGG 0.00177 GTGGT 0.00197 GTGTA 0.00118 GTGTC 0.00127 GTGTG 0.0028 GTGTT 0.00167 GTTAA 0.00105 GTTAC 0.000645 GTTAG 0.000528 GTTAT 0.000822 GTTCA 0.000991 GTTCC 0.000632 GTTCG 0.000581 GTTCT 0.000746 GTTGA 0.00112 GTTGC 0.0011 GTTGG 0.00109 GTTGT 0.00151 GTTTA 0.00118 GTTTC 0.000989 GTTTG 0.00136 GTTTT 0.00171 TAAAA 0.00206 TAAAC 0.00118 TAAAG 0.00101 TAAAT 0.0016 TAACA 0.00112 TAACC 0.000763 TAACG 0.000542 TAACT 0.000615 TAAGA 0.00054 TAAGC 0.000496 TAAGG 0.000537 TAAGT 0.000615 TAATA 0.00113 TAATC 0.000714 TAATG 0.000972 TAATT 0.00133 TACAA 0.00116 TACAC 0.00118 TACAG 0.000945 TACAT 0.00108 TACCA 0.000731 TACCC 0.000774 TACCG 0.000496 TACCT 0.000539 TACGA 0.000502 TACGC 0.000468 TACGG 0.00047 TACGT 0.00069 TACTA 0.000412 TACTC 0.000619 TACTG 0.000687 TACTT 0.000671 TAGAA 0.000632 TAGAC 0.000424 TAGAG 0.000515 TAGAT 0.000541 TAGCA 0.000643 TAGCC 0.00053 TAGCG 0.000468 TAGCT 0.000465 TAGGA 0.000431 TAGGC 0.000433 TAGGG 0.000555 TAGGT 0.000548 TAGTA 0.000412 TAGTC 0.000324 TAGTG 0.000687 TAGTT 0.000596 TATAA 0.00107 TATAC 0.00073 TATAG 0.000581 TATAT 0.00117 TATCA 0.000754 TATCC 0.000496 TATCG 0.000492 TATCT 0.000609 TATGA 0.00067 TATGC 0.000588 TATGG 0.000627 TATGT 0.000859 TATTA 0.00113 TATTC 0.000778 TATTG 0.000979 TATTT 0.00211 TCAAA 0.00123 TCAAC 0.00112 TCAAG 0.000795 TCAAT 0.00101 TCACA 0.00143 TCACC 0.00159 TCACG 0.00135 TCACT 0.00114 TCAGA 0.000758 TCAGC 0.000894 TCAGG 0.000658 TCAGT 0.000789 TCATA 0.00067 TCATC 0.00134 TCATG 0.000886 TCATT 0.00127 TCCAA 0.000859 TCCAC 0.00139 TCCAG 0.000855 TCCAT 0.000912 TCCCA 0.00101 TCCCC 0.00139 TCCCG 0.000682 TCCCT 0.000931 TCCGA 0.000502 TCCGC 0.000648 TCCGG 0.000513 TCCGT 0.000648 TCCTA 0.000431 TCCTC 0.00114 TCCTG 0.000966 TCCTT 0.000718 TCGAA 0.000506 TCGAC 0.000704 TCGAG 0.000612 TCGAT 0.000692 TCGCA 0.000769 TCGCC 0.000964 TCGCG 0.000757 TCGCT 0.000828 TCGGA 0.000502 TCGGC 0.000768 TCGGG 0.00072 TCGGT 0.000746 TCGTA 0.000502 TCGTC 0.000882 TCGTG 0.00123 TCGTT 0.000743 TCTAA 0.00057 TCTAC 0.000628 TCTAG 0.000333 TCTAT 0.000581 TCTCA 0.00104 TCTCC 0.00129 TCTCG 0.000733 TCTCT 0.00123 TCTGA 0.000758 TCTGC 0.00107 TCTGG 0.000828 TCTGT 0.00118 TCTTA 0.00054 TCTTC 0.000889 TCTTG 0.000907 TCTTT 0.0011 TGAAA 0.0014 TGAAC 0.000991 TGAAG 0.00109 TGAAT 0.00111 TGACA 0.00117 TGACC 0.00101 TGACG 0.00109 TGACT 0.000927 TGAGA 0.00104 TGAGC 0.00106 TGAGG 0.000932 TGAGT 0.00106 TGATA 0.000754 TGATC 0.000603 TGATG 0.00165 TGATT 0.00104 TGCAA 0.00136 TGCAC 0.00143 TGCAG 0.00153 TGCAT 0.00127 TGCCA 0.00125 TGCCC 0.00106 TGCCG 0.000932 TGCCT 0.000917 TGCGA 0.000769 TGCGC 0.000892 TGCGG 0.000853 TGCGT 0.00111 TGCTA 0.000643 TGCTC 0.00104 TGCTG 0.00211 TGCTT 0.00104 TGGAA 0.00104 TGGAC 0.000757 TGGAG 0.00131 TGGAT 0.000907 TGGCA 0.00125 TGGCC 0.00124 TGGCG 0.00101 TGGCT 0.00114 TGGGA 0.00101 TGGGC 0.000939 TGGGG 0.00149 TGGGT 0.00131 TGGTA 0.000731 TGGTC 0.000842 TGGTG 0.00235 TGGTT 0.00113 TGTAA 0.00126 TGTAC 0.00102 TGTAG 0.00083 TGTAT 0.00125 TGTCA 0.00117 TGTCC 0.000883 TGTCG 0.000798 TGTCT 0.00112 TGTGA 0.00143 TGTGC 0.00155 TGTGG 0.00166 TGTGT 0.00294 TGTTA 0.00112 TGTTC 0.000893 TGTTG 0.00199 TGTTT 0.00207 TTAAA 0.00191 TTAAC 0.00105 TTAAG 0.000752 TTAAT 0.00137 TTACA 0.00126 TTACC 0.000818 TTACG 0.00053 TTACT 0.000697 TTAGA 0.00057 TTAGC 0.000582 TTAGG 0.000475 TTAGT 0.000608 TTATA 0.00107 TTATC 0.00072 TTATG 0.000824 TTATT 0.002 TTCAA 0.00115 TTCAC 0.00127 TTCAG 0.000888 TTCAT 0.00129 TTCCA 0.00104 TTCCC 0.000996 TTCCG 0.000498 TTCCT 0.000902 TTCGA 0.000506 TTCGC 0.000588 TTCGG 0.00059 TTCGT 0.000757 TTCTA 0.000632 TTCTC 0.000938 TTCTG 0.000934 TTCTT 0.00106 TTGAA 0.00115 TTGAC 0.001 TTGAG 0.00103 TTGAT 0.000976 TTGCA 0.00136 TTGCC 0.00107 TTGCG 0.0008 TTGCT 0.00106 TTGGA 0.000859 TTGGC 0.0011 TTGGG 0.001 TTGGT 0.00111 TTGTA 0.00116 TTGTC 0.00104 TTGTG 0.00185 TTGTT 0.00174 TTTAA 0.00191 TTTAC 0.0013 TTTAG 0.000781 TTTAT 0.00187 TTTCA 0.0014 TTTCC 0.00104 TTTCG 0.000816 TTTCT 0.0011 TTTGA 0.00123 TTTGC 0.00123 TTTGG 0.00117 TTTGT 0.00194 TTTTA 0.00206 TTTTC 0.00136 TTTTG 0.00158 TTTTT 0.0032 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.3899 AAAAC 0.1992 AAAAG 0.1365 AAAAT 0.2744 AAACA 0.4132 AAACC 0.1889 AAACG 0.183 AAACT 0.2149 AAAGA 0.257 AAAGC 0.2407 AAAGG 0.2064 AAAGT 0.2959 AAATA 0.3354 AAATC 0.1615 AAATG 0.2714 AAATT 0.2317 AACAA 0.306 AACAC 0.2481 AACAG 0.1696 AACAT 0.2763 AACCA 0.3392 AACCC 0.281 AACCG 0.1497 AACCT 0.2301 AACGA 0.2427 AACGC 0.2372 AACGG 0.172 AACGT 0.3481 AACTA 0.2026 AACTC 0.2442 AACTG 0.2602 AACTT 0.293 AAGAA 0.3337 AAGAC 0.1989 AAGAG 0.2426 AAGAT 0.2248 AAGCA 0.3457 AAGCC 0.2213 AAGCG 0.1756 AAGCT 0.2574 AAGGA 0.2471 AAGGC 0.2445 AAGGG 0.2617 AAGGT 0.2467 AAGTA 0.221 AAGTC 0.2029 AAGTG 0.3124 AAGTT 0.2638 AATAA 0.3917 AATAC 0.1876 AATAG 0.1247 AATAT 0.2961 AATCA 0.3133 AATCC 0.2294 AATCG 0.2139 AATCT 0.2434 AATGA 0.246 AATGC 0.2159 AATGG 0.1792 AATGT 0.359 AATTA 0.2777 AATTC 0.181 AATTG 0.2397 AATTT 0.3016 ACAAA 0.3378 ACAAC 0.2227 ACAAG 0.175 ACAAT 0.2646 ACACA 0.4064 ACACC 0.1885 ACACG 0.1996 ACACT 0.2055 ACAGA 0.2581 ACAGC 0.2941 ACAGG 0.2059 ACAGT 0.2419 ACATA 0.1788 ACATC 0.2151 ACATG 0.218 ACATT 0.3881 ACCAA 0.2539 ACCAC 0.3313 ACCAG 0.2078 ACCAT 0.207 ACCCA 0.3162 ACCCC 0.2966 ACCCG 0.1709 ACCCT 0.2162 ACCGA 0.2799 ACCGC 0.2781 ACCGG 0.1885 ACCGT 0.2534 ACCTA 0.1816 ACCTC 0.2644 ACCTG 0.2878 ACCTT 0.2661 ACGAA 0.26 ACGAC 0.2478 ACGAG 0.2542 ACGAT 0.238 ACGCA 0.3336 ACGCC 0.2121 ACGCG 0.2445 ACGCT 0.2099 ACGGA 0.2255 ACGGC 0.2833 ACGGG 0.249 ACGGT 0.2421 ACGTA 0.1847 ACGTC 0.2208 ACGTG 0.3339 ACGTT 0.2607 ACTAA 0.3071 ACTAC 0.263 ACTAG 0.1427 ACTAT 0.2872 ACTCA 0.3004 ACTCC 0.2222 ACTCG 0.2359 ACTCT 0.2416 ACTGA 0.2197 ACTGC 0.3122 ACTGG 0.2126 ACTGT 0.2556 ACTTA 0.1916 ACTTC 0.1964 ACTTG 0.2479 ACTTT 0.3641 AGAAA 0.3273 AGAAC 0.1997 AGAAG 0.226 AGAAT 0.247 AGACA 0.3656 AGACC 0.2033 AGACG 0.2176 AGACT 0.2135 AGAGA 0.3008 AGAGC 0.2185 AGAGG 0.2648 AGAGT 0.2159 AGATA 0.2153 AGATC 0.1646 AGATG 0.3332 AGATT 0.2869 AGCAA 0.2569 AGCAC 0.2332 AGCAG 0.3013 AGCAT 0.2087 AGCCA 0.367 AGCCC 0.2307 AGCCG 0.1875 AGCCT 0.2148 AGCGA 0.2719 AGCGC 0.2448 AGCGG 0.2533 AGCGT 0.23 AGCTA 0.1694 AGCTC 0.2399 AGCTG 0.3023 AGCTT 0.2884 AGGAA 0.3126 AGGAC 0.1972 AGGAG 0.2892 AGGAT 0.2009 AGGCA 0.3086 AGGCC 0.2577 AGGCG 0.1992 AGGCT 0.2345 AGGGA 0.2444 AGGGC 0.2129 AGGGG 0.3196 AGGGT 0.2231 AGGTA 0.1945 AGGTC 0.2041 AGGTG 0.337 AGGTT 0.2643 AGTAA 0.3064 AGTAC 0.2243 AGTAG 0.182 AGTAT 0.2872 AGTCA 0.378 AGTCC 0.1797 AGTCG 0.2089 AGTCT 0.2334 AGTGA 0.2415 AGTGC 0.2169 AGTGG 0.2647 AGTGT 0.277 AGTTA 0.2137 AGTTC 0.1771 AGTTG 0.2581 AGTTT 0.3511 ATAAA 0.4034 ATAAC 0.168 ATAAG 0.1278 ATAAT 0.3008 ATACA 0.4551 ATACC 0.1591 ATACG 0.1452 ATACT 0.2406 ATAGA 0.2737 ATAGC 0.254 ATAGG 0.2019 ATAGT 0.2704 ATATA 0.2961 ATATC 0.1592 ATATG 0.1844 ATATT 0.3603 ATCAA 0.2639 ATCAC 0.2686 ATCAG 0.1894 ATCAT 0.2781 ATCCA 0.3739 ATCCC 0.2477 ATCCG 0.1485 ATCCT 0.23 ATCGA 0.2566 ATCGC 0.2623 ATCGG 0.2016 ATCGT 0.2795 ATCTA 0.1968 ATCTC 0.2579 ATCTG 0.277 ATCTT 0.2683 ATGAA 0.3342 ATGAC 0.2118 ATGAG 0.1924 ATGAT 0.2615 ATGCA 0.4018 ATGCC 0.2018 ATGCG 0.15 ATGCT 0.2464 ATGGA 0.2708 ATGGC 0.2443 ATGGG 0.2296 ATGGT 0.2553 ATGTA 0.2478 ATGTC 0.1623 ATGTG 0.2632 ATGTT 0.3267 ATTAA 0.3355 ATTAC 0.2094 ATTAG 0.1339 ATTAT 0.3211 ATTCA 0.3511 ATTCC 0.241 ATTCG 0.1485 ATTCT 0.2594 ATTGA 0.2358 ATTGC 0.2271 ATTGG 0.2041 ATTGT 0.333 ATTTA 0.2575 ATTTC 0.1687 ATTTG 0.2201 ATTTT 0.3537 CAAAA 0.3058 CAAAC 0.2234 CAAAG 0.1946 CAAAT 0.2762 CAACA 0.4171 CAACC 0.2051 CAACG 0.173 CAACT 0.2048 CAAGA 0.26 CAAGC 0.2548 CAAGG 0.2231 CAAGT 0.2621 CAATA 0.243 CAATC 0.177 CAATG 0.2962 CAATT 0.2838 CACAA 0.2841 CACAC 0.3003 CACAG 0.1954 CACAT 0.2202 CACCA 0.3604 CACCC 0.2461 CACCG 0.1835 CACCT 0.2101 CACGA 0.2393 CACGC 0.2385 CACGG 0.2182 CACGT 0.304 CACTA 0.1582 CACTC 0.2286 CACTG 0.3271 CACTT 0.2861 CAGAA 0.2813 CAGAC 0.219 CAGAG 0.2614 CAGAT 0.2384 CAGCA 0.3911 CAGCC 0.2306 CAGCG 0.1711 CAGCT 0.2072 CAGGA 0.2666 CAGGC 0.2179 CAGGG 0.2559 CAGGT 0.2597 CAGTA 0.2107 CAGTC 0.2038 CAGTG 0.3536 CAGTT 0.2319 CATAA 0.2924 CATAC 0.2456 CATAG 0.1676 CATAT 0.2943 CATCA 0.3569 CATCC 0.1917 CATCG 0.1985 CATCT 0.2529 CATGA 0.2452 CATGC 0.2445 CATGG 0.2215 CATGT 0.2888 CATTA 0.209 CATTC 0.1836 CATTG 0.2518 CATTT 0.3556 CCAAA 0.3139 CCAAC 0.2311 CCAAG 0.199 CCAAT 0.2561 CCACA 0.276 CCACC 0.3023 CCACG 0.206 CCACT 0.2156 CCAGA 0.2267 CCAGC 0.2903 CCAGG 0.2419 CCAGT 0.2411 CCATA 0.1854 CCATC 0.2703 CCATG 0.2522 CCATT 0.2921 CCCAA 0.2341 CCCAC 0.3366 CCCAG 0.2125 CCCAT 0.2168 CCCCA 0.2229 CCCCC 0.4314 CCCCG 0.1359 CCCCT 0.2098 CCCGA 0.2364 CCCGC 0.2794 CCCGG 0.2125 CCCGT 0.2717 CCCTA 0.1399 CCCTC 0.344 CCCTG 0.2586 CCCTT 0.2574 CCGAA 0.2503 CCGAC 0.2284 CCGAG 0.2863 CCGAT 0.235 CCGCA 0.2534 CCGCC 0.2972 CCGCG 0.2091 CCGCT 0.2403 CCGGA 0.2081 CCGGC 0.2847 CCGGG 0.2635 CCGGT 0.2437 CCGTA 0.1718 CCGTC 0.232 CCGTG 0.3877 CCGTT 0.2085 CCTAA 0.2733 CCTAC 0.3134 CCTAG 0.1569 CCTAT 0.2564 CCTCA 0.218 CCTCC 0.3485 CCTCG 0.1855 CCTCT 0.248 CCTGA 0.1914 CCTGC 0.2975 CCTGG 0.253 CCTGT 0.2581 CCTTA 0.1792 CCTTC 0.2594 CCTTG 0.2548 CCTTT 0.3065 CGAAA 0.3618 CGAAC 0.2086 CGAAG 0.19 CGAAT 0.2396 CGACA 0.2692 CGACC 0.2333 CGACG 0.2729 CGACT 0.2246 CGAGA 0.2368 CGAGC 0.2374 CGAGG 0.2548 CGAGT 0.271 CGATA 0.1812 CGATC 0.1779 CGATG 0.3263 CGATT 0.3146 CGCAA 0.2467 CGCAC 0.3039 CGCAG 0.245 CGCAT 0.2043 CGCCA 0.2862 CGCCC 0.2343 CGCCG 0.2668 CGCCT 0.2127 CGCGA 0.228 CGCGC 0.2914 CGCGG 0.2169 CGCGT 0.2637 CGCTA 0.155 CGCTC 0.2746 CGCTG 0.319 CGCTT 0.2514 CGGAA 0.2433 CGGAC 0.2021 CGGAG 0.338 CGGAT 0.2167 CGGCA 0.2601 CGGCC 0.2517 CGGCG 0.2683 CGGCT 0.22 CGGGA 0.2135 CGGGC 0.2201 CGGGG 0.3059 CGGGT 0.2605 CGGTA 0.2021 CGGTC 0.1953 CGGTG 0.3803 CGGTT 0.2222 CGTAA 0.2851 CGTAC 0.2331 CGTAG 0.2397 CGTAT 0.242 CGTCA 0.3466 CGTCC 0.1875 CGTCG 0.2405 CGTCT 0.2254 CGTGA 0.2719 CGTGC 0.2122 CGTGG 0.25 CGTGT 0.2659 CGTTA 0.1888 CGTTC 0.1945 CGTTG 0.2602 CGTTT 0.3566 CTAAA 0.3744 CTAAC 0.1982 CTAAG 0.1525 CTAAT 0.2749 CTACA 0.3527 CTACC 0.2232 CTACG 0.2059 CTACT 0.2183 CTAGA 0.2844 CTAGC 0.2276 CTAGG 0.2338 CTAGT 0.2543 CTATA 0.2645 CTATC 0.1845 CTATG 0.2253 CTATT 0.3256 CTCAA 0.2883 CTCAC 0.2942 CTCAG 0.1779 CTCAT 0.2397 CTCCA 0.2949 CTCCC 0.2988 CTCCG 0.1672 CTCCT 0.2391 CTCGA 0.1906 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.2341 CTCGT 0.2849 CTCTA 0.1495 CTCTC 0.3017 CTCTG 0.2809 CTCTT 0.2679 CTGAA 0.3207 CTGAC 0.2217 CTGAG 0.2037 CTGAT 0.2539 CTGCA 0.3354 CTGCC 0.2185 CTGCG 0.1498 CTGCT 0.2963 CTGGA 0.2396 CTGGC 0.2551 CTGGG 0.2363 CTGGT 0.269 CTGTA 0.2449 CTGTC 0.1822 CTGTG 0.3082 CTGTT 0.2647 CTTAA 0.3581 CTTAC 0.2122 CTTAG 0.1515 CTTAT 0.2782 CTTCA 0.3493 CTTCC 0.2367 CTTCG 0.1372 CTTCT 0.2768 CTTGA 0.2252 CTTGC 0.2561 CTTGG 0.2171 CTTGT 0.3016 CTTTA 0.2542 CTTTC 0.2082 CTTTG 0.2518 CTTTT 0.2857 GAAAA 0.3295 GAAAC 0.21 GAAAG 0.1989 GAAAT 0.2617 GAACA 0.3427 GAACC 0.2435 GAACG 0.1983 GAACT 0.2155 GAAGA 0.2779 GAAGC 0.2326 GAAGG 0.2557 GAAGT 0.2338 GAATA 0.2429 GAATC 0.1876 GAATG 0.2858 GAATT 0.2837 GACAA 0.2958 GACAC 0.2541 GACAG 0.2069 GACAT 0.2432 GACCA 0.318 GACCC 0.2553 GACCG 0.1816 GACCT 0.2452 GACGA 0.2688 GACGC 0.1979 GACGG 0.2099 GACGT 0.3234 GACTA 0.1378 GACTC 0.2347 GACTG 0.316 GACTT 0.3114 GAGAA 0.2681 GAGAC 0.2255 GAGAG 0.2829 GAGAT 0.2236 GAGCA 0.3038 GAGCC 0.2329 GAGCG 0.2189 GAGCT 0.2444 GAGGA 0.2459 GAGGC 0.2257 GAGGG 0.3107 GAGGT 0.2177 GAGTA 0.2015 GAGTC 0.1962 GAGTG 0.3202 GAGTT 0.282 GATAA 0.3284 GATAC 0.1876 GATAG 0.1697 GATAT 0.3142 GATCA 0.3166 GATCC 0.2172 GATCG 0.2164 GATCT 0.2498 GATGA 0.2789 GATGC 0.1985 GATGG 0.2376 GATGT 0.285 GATTA 0.2275 GATTC 0.1929 GATTG 0.2408 GATTT 0.3387 GCAAA 0.3092 GCAAC 0.2212 GCAAG 0.2121 GCAAT 0.2575 GCACA 0.3395 GCACC 0.2135 GCACG 0.2224 GCACT 0.2246 GCAGA 0.216 GCAGC 0.3029 GCAGG 0.2143 GCAGT 0.2668 GCATA 0.1871 GCATC 0.2144 GCATG 0.2643 GCATT 0.3342 GCCAA 0.2564 GCCAC 0.3089 GCCAG 0.2167 GCCAT 0.2179 GCCCA 0.2723 GCCCC 0.2994 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.252 GCCGA 0.2225 GCCGC 0.3062 GCCGG 0.2009 GCCGT 0.2704 GCCTA 0.1464 GCCTC 0.3002 GCCTG 0.2645 GCCTT 0.2889 GCGAA 0.2125 GCGAC 0.2293 GCGAG 0.2999 GCGAT 0.2584 GCGCA 0.2577 GCGCC 0.2246 GCGCG 0.2834 GCGCT 0.2343 GCGGA 0.1882 GCGGC 0.3092 GCGGG 0.2467 GCGGT 0.256 GCGTA 0.1382 GCGTC 0.2026 GCGTG 0.3927 GCGTT 0.2664 GCTAA 0.3107 GCTAC 0.2645 GCTAG 0.1365 GCTAT 0.2883 GCTCA 0.2949 GCTCC 0.247 GCTCG 0.2098 GCTCT 0.2483 GCTGA 0.1841 GCTGC 0.314 GCTGG 0.2267 GCTGT 0.2753 GCTTA 0.164 GCTTC 0.223 GCTTG 0.275 GCTTT 0.3379 GGAAA 0.3335 GGAAC 0.1723 GGAAG 0.2259 GGAAT 0.2682 GGACA 0.3585 GGACC 0.2111 GGACG 0.2255 GGACT 0.2048 GGAGA 0.2709 GGAGC 0.2011 GGAGG 0.3444 GGAGT 0.1837 GGATA 0.2105 GGATC 0.1696 GGATG 0.2994 GGATT 0.3205 GGCAA 0.2694 GGCAC 0.2367 GGCAG 0.2791 GGCAT 0.2147 GGCCA 0.3401 GGCCC 0.2102 GGCCG 0.2141 GGCCT 0.2356 GGCGA 0.2711 GGCGC 0.2193 GGCGG 0.2926 GGCGT 0.2171 GGCTA 0.1681 GGCTC 0.2339 GGCTG 0.3442 GGCTT 0.2537 GGGAA 0.2862 GGGAC 0.1651 GGGAG 0.3433 GGGAT 0.2054 GGGCA 0.3104 GGGCC 0.2261 GGGCG 0.2157 GGGCT 0.2478 GGGGA 0.2016 GGGGC 0.166 GGGGG 0.4315 GGGGT 0.2009 GGGTA 0.1778 GGGTC 0.1879 GGGTG 0.3489 GGGTT 0.2854 GGTAA 0.3757 GGTAC 0.1957 GGTAG 0.2122 GGTAT 0.2165 GGTCA 0.3637 GGTCC 0.1888 GGTCG 0.2211 GGTCT 0.2265 GGTGA 0.2628 GGTGC 0.1829 GGTGG 0.3291 GGTGT 0.2253 GGTTA 0.2171 GGTTC 0.2043 GGTTG 0.2638 GGTTT 0.3148 GTAAA 0.3982 GTAAC 0.1844 GTAAG 0.1385 GTAAT 0.2788 GTACA 0.4202 GTACC 0.1768 GTACG 0.1719 GTACT 0.231 GTAGA 0.2606 GTAGC 0.2369 GTAGG 0.2509 GTAGT 0.2517 GTATA 0.2737 GTATC 0.1447 GTATG 0.2342 GTATT 0.3474 GTCAA 0.253 GTCAC 0.3397 GTCAG 0.1724 GTCAT 0.2348 GTCCA 0.3293 GTCCC 0.237 GTCCG 0.1649 GTCCT 0.2688 GTCGA 0.231 GTCGC 0.2487 GTCGG 0.2093 GTCGT 0.311 GTCTA 0.1477 GTCTC 0.2948 GTCTG 0.2884 GTCTT 0.2691 GTGAA 0.2719 GTGAC 0.2806 GTGAG 0.2163 GTGAT 0.2313 GTGCA 0.3268 GTGCC 0.2078 GTGCG 0.2084 GTGCT 0.2571 GTGGA 0.2255 GTGGC 0.2413 GTGGG 0.2484 GTGGT 0.2847 GTGTA 0.2133 GTGTC 0.1623 GTGTG 0.3435 GTGTT 0.2809 GTTAA 0.3588 GTTAC 0.2143 GTTAG 0.1494 GTTAT 0.2775 GTTCA 0.3464 GTTCC 0.2049 GTTCG 0.1711 GTTCT 0.2776 GTTGA 0.2471 GTTGC 0.2227 GTTGG 0.2102 GTTGT 0.32 GTTTA 0.2259 GTTTC 0.1838 GTTTG 0.2417 GTTTT 0.3486 TAAAA 0.3628 TAAAC 0.1827 TAAAG 0.1719 TAAAT 0.2827 TAACA 0.3869 TAACC 0.2232 TAACG 0.1659 TAACT 0.2241 TAAGA 0.2573 TAAGC 0.2206 TAAGG 0.2279 TAAGT 0.2942 TAATA 0.2765 TAATC 0.163 TAATG 0.2398 TAATT 0.3207 TACAA 0.2824 TACAC 0.2436 TACAG 0.2029 TACAT 0.271 TACCA 0.3276 TACCC 0.245 TACCG 0.1905 TACCT 0.2369 TACGA 0.2507 TACGC 0.1803 TACGG 0.2077 TACGT 0.3613 TACTA 0.1774 TACTC 0.2187 TACTG 0.2963 TACTT 0.3077 TAGAA 0.3283 TAGAC 0.1791 TAGAG 0.2222 TAGAT 0.2705 TAGCA 0.3361 TAGCC 0.2398 TAGCG 0.177 TAGCT 0.2472 TAGGA 0.2488 TAGGC 0.2143 TAGGG 0.2459 TAGGT 0.2911 TAGTA 0.2227 TAGTC 0.1569 TAGTG 0.3018 TAGTT 0.3186 TATAA 0.3024 TATAC 0.2094 TATAG 0.1435 TATAT 0.3448 TATCA 0.3429 TATCC 0.2168 TATCG 0.1774 TATCT 0.2629 TATGA 0.2548 TATGC 0.2252 TATGG 0.2119 TATGT 0.3081 TATTA 0.2311 TATTC 0.1495 TATTG 0.1981 TATTT 0.4213 TCAAA 0.3123 TCAAC 0.2414 TCAAG 0.1834 TCAAT 0.2629 TCACA 0.2874 TCACC 0.2597 TCACG 0.2412 TCACT 0.2117 TCAGA 0.2565 TCAGC 0.2625 TCAGG 0.2037 TCAGT 0.2774 TCATA 0.1827 TCATC 0.2601 TCATG 0.2287 TCATT 0.3286 TCCAA 0.2375 TCCAC 0.3 TCCAG 0.2115 TCCAT 0.251 TCCCA 0.2862 TCCCC 0.315 TCCCG 0.1482 TCCCT 0.2507 TCCGA 0.234 TCCGC 0.2604 TCCGG 0.205 TCCGT 0.3006 TCCTA 0.1528 TCCTC 0.2939 TCCTG 0.2909 TCCTT 0.2623 TCGAA 0.2304 TCGAC 0.2474 TCGAG 0.2286 TCGAT 0.2936 TCGCA 0.2601 TCGCC 0.2706 TCGCG 0.2159 TCGCT 0.2534 TCGGA 0.1966 TCGGC 0.2612 TCGGG 0.2427 TCGGT 0.2995 TCGTA 0.1695 TCGTC 0.2427 TCGTG 0.3475 TCGTT 0.2404 TCTAA 0.2954 TCTAC 0.2655 TCTAG 0.1556 TCTAT 0.2834 TCTCA 0.2706 TCTCC 0.2746 TCTCG 0.1728 TCTCT 0.2821 TCTGA 0.2188 TCTGC 0.2722 TCTGG 0.2152 TCTGT 0.2938 TCTTA 0.174 TCTTC 0.2424 TCTTG 0.2553 TCTTT 0.3283 TGAAA 0.3288 TGAAC 0.1925 TGAAG 0.2204 TGAAT 0.2583 TGACA 0.3029 TGACC 0.2261 TGACG 0.2317 TGACT 0.2394 TGAGA 0.275 TGAGC 0.2473 TGAGG 0.2219 TGAGT 0.2558 TGATA 0.2113 TGATC 0.157 TGATG 0.3538 TGATT 0.2779 TGCAA 0.2676 TGCAC 0.222 TGCAG 0.2555 TGCAT 0.2549 TGCCA 0.3444 TGCCC 0.2389 TGCCG 0.1832 TGCCT 0.2335 TGCGA 0.2363 TGCGC 0.2281 TGCGG 0.2261 TGCGT 0.3095 TGCTA 0.1549 TGCTC 0.2007 TGCTG 0.3838 TGCTT 0.2606 TGGAA 0.2847 TGGAC 0.1868 TGGAG 0.2759 TGGAT 0.2525 TGGCA 0.3042 TGGCC 0.2488 TGGCG 0.1791 TGGCT 0.2679 TGGGA 0.2375 TGGGC 0.1958 TGGGG 0.289 TGGGT 0.2777 TGGTA 0.1791 TGGTC 0.1763 TGGTG 0.385 TGGTT 0.2596 TGTAA 0.3054 TGTAC 0.2275 TGTAG 0.164 TGTAT 0.303 TGTCA 0.3314 TGTCC 0.2181 TGTCG 0.1735 TGTCT 0.2769 TGTGA 0.2126 TGTGC 0.2126 TGTGG 0.2197 TGTGT 0.3551 TGTTA 0.1993 TGTTC 0.1522 TGTTG 0.2839 TGTTT 0.3646 TTAAA 0.3809 TTAAC 0.1933 TTAAG 0.1464 TTAAT 0.2795 TTACA 0.3946 TTACC 0.2375 TTACG 0.1471 TTACT 0.2208 TTAGA 0.2682 TTAGC 0.2574 TTAGG 0.2024 TTAGT 0.2719 TTATA 0.2391 TTATC 0.1532 TTATG 0.1687 TTATT 0.4389 TTCAA 0.266 TTCAC 0.2546 TTCAG 0.1928 TTCAT 0.2866 TTCCA 0.3265 TTCCC 0.2672 TTCCG 0.1291 TTCCT 0.2772 TTCGA 0.2148 TTCGC 0.2302 TTCGG 0.229 TTCGT 0.3259 TTCTA 0.1877 TTCTC 0.2428 TTCTG 0.2567 TTCTT 0.3129 TTGAA 0.3047 TTGAC 0.2242 TTGAG 0.2273 TTGAT 0.2437 TTGCA 0.3638 TTGCC 0.2184 TTGCG 0.1562 TTGCT 0.2616 TTGGA 0.2319 TTGGC 0.2602 TTGGG 0.2244 TTGGT 0.2835 TTGTA 0.2232 TTGTC 0.1706 TTGTG 0.2934 TTGTT 0.3128 TTTAA 0.3338 TTTAC 0.2185 TTTAG 0.1332 TTTAT 0.3145 TTTCA 0.34 TTTCC 0.2279 TTTCG 0.1706 TTTCT 0.2615 TTTGA 0.2281 TTTGC 0.222 TTTGG 0.2037 TTTGT 0.3462 TTTTA 0.2563 TTTTC 0.1648 TTTTG 0.189 TTTTT 0.3899