[1] # (a,c,g,t)= (0.29, 0.21, 0.21, 0.29) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.283 C 0.217 G 0.217 T 0.283 # l= 1 # Values AA 0.0916 AC 0.0506 AG 0.0717 AT 0.0693 CA 0.0728 CC 0.0586 CG 0.0137 CT 0.0717 GA 0.0596 GC 0.048 GG 0.0586 GT 0.0506 TA 0.0592 TC 0.0596 TG 0.0728 TT 0.0916 # l= 2 # Values AAA 0.0361 AAC 0.0141 AAG 0.0193 AAT 0.0221 ACA 0.0193 ACC 0.0124 ACG 0.003 ACT 0.0159 AGA 0.0214 AGC 0.015 AGG 0.0194 AGT 0.0159 ATA 0.0175 ATC 0.0127 ATG 0.0169 ATT 0.0221 CAA 0.0183 CAC 0.0159 CAG 0.0217 CAT 0.0169 CCA 0.0196 CCC 0.0154 CCG 0.00412 CCT 0.0194 CGA 0.00281 CGC 0.00378 CGG 0.00412 CGT 0.003 CTA 0.0123 CTC 0.0184 CTG 0.0217 CTT 0.0193 GAA 0.0186 GAC 0.00985 GAG 0.0184 GAT 0.0127 GCA 0.015 GCC 0.0142 GCG 0.00378 GCT 0.015 GGA 0.0165 GGC 0.0142 GGG 0.0154 GGT 0.0124 GTA 0.0108 GTC 0.00985 GTG 0.0159 GTT 0.0141 TAA 0.0186 TAC 0.0108 TAG 0.0123 TAT 0.0175 TCA 0.0189 TCC 0.0165 TCG 0.00281 TCT 0.0214 TGA 0.0189 TGC 0.015 TGG 0.0196 TGT 0.0193 TTA 0.0186 TTC 0.0186 TTG 0.0183 TTT 0.0361 # l= 3 # Values AAAA 0.0151 AAAC 0.00531 AAAG 0.00682 AAAT 0.00887 AACA 0.00568 AACC 0.00335 AACG 0.000659 AACT 0.0044 AAGA 0.00625 AAGC 0.00368 AAGG 0.00465 AAGT 0.00474 AATA 0.00636 AATC 0.00389 AATG 0.00524 AATT 0.00662 ACAA 0.00519 ACAC 0.00391 ACAG 0.00538 ACAT 0.00479 ACCA 0.00433 ACCC 0.00325 ACCG 0.000657 ACCT 0.00418 ACGA 0.00062 ACGC 0.000773 ACGG 0.000798 ACGT 0.000811 ACTA 0.00306 ACTC 0.00363 ACTG 0.0045 ACTT 0.00474 AGAA 0.00714 AGAC 0.0039 AGAG 0.00571 AGAT 0.00461 AGCA 0.00476 AGCC 0.0047 AGCG 0.000856 AGCT 0.00471 AGGA 0.00577 AGGC 0.0052 AGGG 0.00427 AGGT 0.00418 AGTA 0.00357 AGTC 0.00305 AGTG 0.00491 AGTT 0.0044 ATAA 0.00567 ATAC 0.00305 ATAG 0.00318 ATAT 0.00562 ATCA 0.00418 ATCC 0.00337 ATCG 0.000587 ATCT 0.00461 ATGA 0.00461 ATGC 0.00323 ATGG 0.00427 ATGT 0.00479 ATTA 0.00522 ATTC 0.00422 ATTG 0.0038 ATTT 0.00887 CAAA 0.00685 CAAC 0.00317 CAAG 0.00447 CAAT 0.0038 CACA 0.00543 CACC 0.00433 CACG 0.0012 CACT 0.00491 CAGA 0.00558 CAGC 0.00528 CAGG 0.00639 CAGT 0.0045 CATA 0.00353 CATC 0.00348 CATG 0.00465 CATT 0.00524 CCAA 0.00454 CCAC 0.00449 CCAG 0.00635 CCAT 0.00427 CCCA 0.0059 CCCC 0.00373 CCCG 0.00149 CCCT 0.00427 CCGA 0.000824 CCGC 0.00122 CCGG 0.00127 CCGT 0.000798 CCTA 0.00281 CCTC 0.00555 CCTG 0.00639 CCTT 0.00465 CGAA 0.00064 CGAC 0.000456 CGAG 0.00112 CGAT 0.000587 CGCA 0.000764 CGCC 0.00157 CGCG 0.000588 CGCT 0.000856 CGGA 0.000832 CGGC 0.00114 CGGG 0.00149 CGGT 0.000657 CGTA 0.000452 CGTC 0.000692 CGTG 0.0012 CGTT 0.000659 CTAA 0.00369 CTAC 0.00272 CTAG 0.00268 CTAT 0.00318 CTCA 0.00579 CTCC 0.00576 CTCG 0.00112 CTCT 0.00571 CTGA 0.00516 CTGC 0.00486 CTGG 0.00635 CTGT 0.00538 CTTA 0.00343 CTTC 0.00459 CTTG 0.00447 CTTT 0.00683 GAAA 0.00687 GAAC 0.00292 GAAG 0.00459 GAAT 0.00422 GACA 0.00364 GACC 0.00247 GACG 0.000692 GACT 0.00305 GAGA 0.00579 GAGC 0.0034 GAGG 0.00555 GAGT 0.00363 GATA 0.00272 GATC 0.00266 GATG 0.00348 GATT 0.00389 GCAA 0.00379 GCAC 0.00309 GCAG 0.00486 GCAT 0.00323 GCCA 0.00449 GCCC 0.00342 GCCG 0.00114 GCCT 0.0052 GCGA 0.000739 GCGC 0.00105 GCGG 0.00122 GCGT 0.000773 GCTA 0.00267 GCTC 0.0034 GCTG 0.00528 GCTT 0.00368 GGAA 0.00499 GGAC 0.00239 GGAG 0.00576 GGAT 0.00337 GGCA 0.0044 GGCC 0.00358 GGCG 0.00157 GGCT 0.0047 GGGA 0.00498 GGGC 0.00342 GGGG 0.00373 GGGT 0.00325 GGTA 0.00226 GGTC 0.00247 GGTG 0.00433 GGTT 0.00335 GTAA 0.00337 GTAC 0.00168 GTAG 0.00272 GTAT 0.00305 GTCA 0.00311 GTCC 0.00239 GTCG 0.000456 GTCT 0.0039 GTGA 0.00437 GTGC 0.00309 GTGG 0.00449 GTGT 0.00391 GTTA 0.00268 GTTC 0.00292 GTTG 0.00317 GTTT 0.00531 TAAA 0.0073 TAAC 0.00268 TAAG 0.00343 TAAT 0.00522 TACA 0.00453 TACC 0.00226 TACG 0.000452 TACT 0.00357 TAGA 0.00374 TAGC 0.00267 TAGG 0.00281 TAGT 0.00306 TATA 0.0049 TATC 0.00272 TATG 0.00353 TATT 0.00636 TCAA 0.00477 TCAC 0.00437 TCAG 0.00516 TCAT 0.00461 TCCA 0.00492 TCCC 0.00498 TCCG 0.000833 TCCT 0.00577 TCGA 0.000623 TCGC 0.000739 TCGG 0.000824 TCGT 0.00062 TCTA 0.00374 TCTC 0.00579 TCTG 0.00558 TCTT 0.00625 TGAA 0.00583 TGAC 0.00311 TGAG 0.00579 TGAT 0.00418 TGCA 0.00504 TGCC 0.0044 TGCG 0.000764 TGCT 0.00476 TGGA 0.00492 TGGC 0.00449 TGGG 0.0059 TGGT 0.00433 TGTA 0.00453 TGTC 0.00364 TGTG 0.00543 TGTT 0.00568 TTAA 0.0059 TTAC 0.00337 TTAG 0.00369 TTAT 0.00567 TTCA 0.00583 TTCC 0.00499 TTCG 0.00064 TTCT 0.00714 TTGA 0.00477 TTGC 0.00379 TTGG 0.00454 TTGT 0.00519 TTTA 0.0073 TTTC 0.00687 TTTG 0.00685 TTTT 0.0151 # l= 4 # Values AAAAA 0.00707 AAAAC 0.00197 AAAAG 0.00238 AAAAT 0.00366 AAACA 0.00219 AAACC 0.00124 AAACG 0.000248 AAACT 0.00163 AAAGA 0.00234 AAAGC 0.00123 AAAGG 0.00152 AAAGT 0.00173 AAATA 0.00294 AAATC 0.00132 AAATG 0.00215 AAATT 0.00247 AACAA 0.0018 AACAC 0.00103 AACAG 0.00133 AACAT 0.00152 AACCA 0.0011 AACCC 0.000987 AACCG 0.000138 AACCT 0.00113 AACGA 0.000165 AACGC 0.000136 AACGG 0.000148 AACGT 0.00021 AACTA 0.000918 AACTC 0.00108 AACTG 0.00114 AACTT 0.00126 AAGAA 0.00234 AAGAC 0.00111 AAGAG 0.00149 AAGAT 0.00131 AAGCA 0.00142 AAGCC 0.000947 AAGCG 0.000233 AAGCT 0.00108 AAGGA 0.00158 AAGGC 0.000997 AAGGG 0.0011 AAGGT 0.000967 AAGTA 0.00114 AAGTC 0.000875 AAGTG 0.00146 AAGTT 0.00126 AATAA 0.00233 AATAC 0.00114 AATAG 0.00107 AATAT 0.00183 AATCA 0.00129 AATCC 0.00116 AATCG 0.00018 AATCT 0.00126 AATGA 0.00156 AATGC 0.000969 AATGG 0.00123 AATGT 0.00148 AATTA 0.00179 AATTC 0.00125 AATTG 0.00111 AATTT 0.00247 ACAAA 0.00223 ACAAC 0.000795 ACAAG 0.00103 ACAAT 0.00114 ACACA 0.00177 ACACC 0.000883 ACACG 0.000248 ACACT 0.00101 ACAGA 0.00171 ACAGC 0.000994 ACAGG 0.00154 ACAGT 0.00114 ACATA 0.00121 ACATC 0.000813 ACATG 0.00128 ACATT 0.00148 ACCAA 0.00102 ACCAC 0.00108 ACCAG 0.00109 ACCAT 0.00114 ACCCA 0.00118 ACCCC 0.000875 ACCCG 0.00027 ACCCT 0.00093 ACCGA 0.00013 ACCGC 0.000205 ACCGG 0.000138 ACCGT 0.000184 ACCTA 0.000676 ACCTC 0.00126 ACCTG 0.00127 ACCTT 0.000967 ACGAA 0.000169 ACGAC 9.74e-05 ACGAG 0.000199 ACGAT 0.000154 ACGCA 0.000178 ACGCC 0.000354 ACGCG 7.15e-05 ACGCT 0.000169 ACGGA 0.00021 ACGGC 0.000153 ACGGG 0.000251 ACGGT 0.000184 ACGTA 0.000163 ACGTC 0.000148 ACGTG 0.00029 ACGTT 0.00021 ACTAA 0.00099 ACTAC 0.000647 ACTAG 0.000584 ACTAT 0.000836 ACTCA 0.00108 ACTCC 0.00123 ACTCG 0.000203 ACTCT 0.00112 ACTGA 0.00113 ACTGC 0.00122 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00114 ACTTA 0.000916 ACTTC 0.00101 ACTTG 0.00108 ACTTT 0.00173 AGAAA 0.00284 AGAAC 0.00102 AGAAG 0.00161 AGAAT 0.00167 AGACA 0.00148 AGACC 0.000966 AGACG 0.000315 AGACT 0.00114 AGAGA 0.00207 AGAGC 0.00105 AGAGG 0.00147 AGAGT 0.00112 AGATA 0.00108 AGATC 0.000894 AGATG 0.00137 AGATT 0.00126 AGCAA 0.00138 AGCAC 0.000997 AGCAG 0.00135 AGCAT 0.00103 AGCCA 0.00159 AGCCC 0.000987 AGCCG 0.000354 AGCCT 0.00177 AGCGA 0.000278 AGCGC 0.000192 AGCGG 0.000217 AGCGT 0.000169 AGCTA 0.00104 AGCTC 0.00101 AGCTG 0.00159 AGCTT 0.00108 AGGAA 0.00191 AGGAC 0.000814 AGGAG 0.00193 AGGAT 0.00112 AGGCA 0.00176 AGGCC 0.00111 AGGCG 0.000552 AGGCT 0.00177 AGGGA 0.00141 AGGGC 0.000891 AGGGG 0.00104 AGGGT 0.00093 AGGTA 0.000808 AGGTC 0.000824 AGGTG 0.00141 AGGTT 0.00113 AGTAA 0.00107 AGTAC 0.000543 AGTAG 0.00108 AGTAT 0.000884 AGTCA 0.000998 AGTCC 0.000795 AGTCG 0.000122 AGTCT 0.00114 AGTGA 0.00156 AGTGC 0.00108 AGTGG 0.00127 AGTGT 0.00101 AGTTA 0.00091 AGTTC 0.000999 AGTTG 0.000861 AGTTT 0.00163 ATAAA 0.00242 ATAAC 0.000748 ATAAG 0.000924 ATAAT 0.00158 ATACA 0.00142 ATACC 0.000601 ATACG 0.000138 ATACT 0.000884 ATAGA 0.00102 ATAGC 0.000637 ATAGG 0.000691 ATAGT 0.000836 ATATA 0.00189 ATATC 0.000784 ATATG 0.00112 ATATT 0.00183 ATCAA 0.00103 ATCAC 0.00107 ATCAG 0.000959 ATCAT 0.00112 ATCCA 0.00105 ATCCC 0.00104 ATCCG 0.00016 ATCCT 0.00112 ATCGA 0.000124 ATCGC 0.000212 ATCGG 9.71e-05 ATCGT 0.000154 ATCTA 0.000843 ATCTC 0.0013 ATCTG 0.00115 ATCTT 0.00131 ATGAA 0.00157 ATGAC 0.000752 ATGAG 0.00117 ATGAT 0.00112 ATGCA 0.00109 ATGCC 0.000968 ATGCG 0.00014 ATGCT 0.00103 ATGGA 0.00121 ATGGC 0.000901 ATGGG 0.00102 ATGGT 0.00114 ATGTA 0.00116 ATGTC 0.000831 ATGTG 0.00127 ATGTT 0.00152 ATTAA 0.00154 ATTAC 0.00108 ATTAG 0.00104 ATTAT 0.00158 ATTCA 0.00139 ATTCC 0.00104 ATTCG 0.000129 ATTCT 0.00167 ATTGA 0.000974 ATTGC 0.000894 ATTGG 0.000788 ATTGT 0.00114 ATTTA 0.00199 ATTTC 0.00166 ATTTG 0.00156 ATTTT 0.00366 CAAAA 0.00256 CAAAC 0.00112 CAAAG 0.00161 CAAAT 0.00156 CAACA 0.00136 CAACC 0.000808 CAACG 0.000145 CAACT 0.000861 CAAGA 0.00138 CAAGC 0.000905 CAAGG 0.00111 CAAGT 0.00108 CAATA 0.001 CAATC 0.000727 CAATG 0.000959 CAATT 0.00111 CACAA 0.00119 CACAC 0.00148 CACAG 0.00149 CACAT 0.00127 CACCA 0.00152 CACCC 0.0011 CACCG 0.000296 CACCT 0.00141 CACGA 0.000226 CACGC 0.000409 CACGG 0.000273 CACGT 0.00029 CACTA 0.000709 CACTC 0.00108 CACTG 0.00165 CACTT 0.00146 CAGAA 0.00174 CAGAC 0.000898 CAGAG 0.00178 CAGAT 0.00115 CAGCA 0.00154 CAGCC 0.00189 CAGCG 0.000271 CAGCT 0.00159 CAGGA 0.00192 CAGGC 0.00185 CAGGG 0.00136 CAGGT 0.00127 CAGTA 0.000864 CAGTC 0.000838 CAGTG 0.00165 CAGTT 0.00114 CATAA 0.00103 CATAC 0.000631 CATAG 0.000754 CATAT 0.00112 CATCA 0.00106 CATCC 0.000904 CATCG 0.000137 CATCT 0.00137 CATGA 0.00114 CATGC 0.00102 CATGG 0.0012 CATGT 0.00128 CATTA 0.00101 CATTC 0.00113 CATTG 0.000959 CATTT 0.00215 CCAAA 0.00163 CCAAC 0.000866 CCAAG 0.00125 CCAAT 0.000788 CCACA 0.0013 CCACC 0.00157 CCACG 0.000351 CCACT 0.00127 CCAGA 0.00131 CCAGC 0.00197 CCAGG 0.00207 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000735 CCATC 0.0011 CCATG 0.0012 CCATT 0.00123 CCCAA 0.00134 CCCAC 0.00119 CCCAG 0.00235 CCCAT 0.00102 CCCCA 0.0014 CCCCC 0.000865 CCCCG 0.000427 CCCCT 0.00104 CCCGA 0.00026 CCCGC 0.000436 CCCGG 0.000545 CCCGT 0.000251 CCCTA 0.000644 CCCTC 0.00116 CCCTG 0.00136 CCCTT 0.0011 CCGAA 0.000152 CCGAC 0.00013 CCGAG 0.000445 CCGAT 9.71e-05 CCGCA 0.000224 CCGCC 0.000582 CCGCG 0.000199 CCGCT 0.000217 CCGGA 0.000203 CCGGC 0.000387 CCGGG 0.000545 CCGGT 0.000138 CCGTA 0.000105 CCGTC 0.000273 CCGTG 0.000273 CCGTT 0.000148 CCTAA 0.000812 CCTAC 0.000567 CCTAG 0.000739 CCTAT 0.000691 CCTCA 0.00161 CCTCC 0.00211 CCTCG 0.000362 CCTCT 0.00147 CCTGA 0.00143 CCTGC 0.00136 CCTGG 0.00207 CCTGT 0.00154 CCTTA 0.000779 CCTTC 0.00124 CCTTG 0.00111 CCTTT 0.00152 CGAAA 0.00019 CGAAC 0.000151 CGAAG 0.000171 CGAAT 0.000129 CGACA 0.000161 CGACC 0.000126 CGACG 4.65e-05 CGACT 0.000122 CGAGA 0.000387 CGAGC 0.000171 CGAGG 0.000362 CGAGT 0.000203 CGATA 8.68e-05 CGATC 0.000183 CGATG 0.000137 CGATT 0.00018 CGCAA 0.00014 CGCAC 0.000206 CGCAG 0.000278 CGCAT 0.00014 CGCCA 0.000346 CGCCC 0.000501 CGCCG 0.000176 CGCCT 0.000552 CGCGA 8.66e-05 CGCGC 0.000232 CGCGG 0.000199 CGCGT 7.15e-05 CGCTA 9.88e-05 CGCTC 0.000254 CGCTG 0.000271 CGCTT 0.000233 CGGAA 0.000182 CGGAC 0.000125 CGGAG 0.000365 CGGAT 0.00016 CGGCA 0.000193 CGGCC 0.000413 CGGCG 0.000176 CGGCT 0.000354 CGGGA 0.000387 CGGGC 0.000407 CGGGG 0.000427 CGGGT 0.00027 CGGTA 9.34e-05 CGGTC 0.000129 CGGTG 0.000296 CGGTT 0.000138 CGTAA 0.000126 CGTAC 7.79e-05 CGTAG 0.000111 CGTAT 0.000138 CGTCA 0.000154 CGTCC 0.000177 CGTCG 4.65e-05 CGTCT 0.000315 CGTGA 0.000348 CGTGC 0.000251 CGTGG 0.000351 CGTGT 0.000248 CGTTA 0.000118 CGTTC 0.000148 CGTTG 0.000145 CGTTT 0.000248 CTAAA 0.00133 CTAAC 0.000573 CTAAG 0.000755 CTAAT 0.00104 CTACA 0.000937 CTACC 0.000592 CTACG 0.000111 CTACT 0.00108 CTAGA 0.000818 CTAGC 0.000534 CTAGG 0.000739 CTAGT 0.000584 CTATA 0.000796 CTATC 0.000565 CTATG 0.000754 CTATT 0.00107 CTCAA 0.00143 CTCAC 0.00136 CTCAG 0.00183 CTCAT 0.00117 CTCCA 0.00163 CTCCC 0.00183 CTCCG 0.000365 CTCCT 0.00193 CTCGA 0.000235 CTCGC 0.000243 CTCGG 0.000445 CTCGT 0.000199 CTCTA 0.00106 CTCTC 0.00138 CTCTG 0.00178 CTCTT 0.00149 CTGAA 0.00142 CTGAC 0.000942 CTGAG 0.00183 CTGAT 0.000959 CTGCA 0.00165 CTGCC 0.00157 CTGCG 0.000278 CTGCT 0.00135 CTGGA 0.00156 CTGGC 0.00135 CTGGG 0.00235 CTGGT 0.00109 CTGTA 0.00137 CTGTC 0.00121 CTGTG 0.00149 CTGTT 0.00133 CTTAA 0.00109 CTTAC 0.000658 CTTAG 0.000755 CTTAT 0.000924 CTTCA 0.00132 CTTCC 0.00149 CTTCG 0.000171 CTTCT 0.00161 CTTGA 0.0013 CTTGC 0.000895 CTTGG 0.00125 CTTGT 0.00103 CTTTA 0.0013 CTTTC 0.00153 CTTTG 0.00161 CTTTT 0.00238 GAAAA 0.00243 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00153 GAAAT 0.00166 GAACA 0.00104 GAACC 0.000734 GAACG 0.000148 GAACT 0.000999 GAAGA 0.00142 GAAGC 0.00091 GAAGG 0.00124 GAAGT 0.00101 GAATA 0.00104 GAATC 0.000799 GAATG 0.00113 GAATT 0.00125 GACAA 0.000895 GACAC 0.000708 GACAG 0.00121 GACAT 0.000831 GACCA 0.000891 GACCC 0.000624 GACCG 0.000129 GACCT 0.000824 GACGA 0.000128 GACGC 0.000143 GACGG 0.000273 GACGT 0.000148 GACTA 0.000593 GACTC 0.000744 GACTG 0.000838 GACTT 0.000875 GAGAA 0.00175 GAGAC 0.00136 GAGAG 0.00138 GAGAT 0.0013 GAGCA 0.000979 GAGCC 0.00116 GAGCG 0.000254 GAGCT 0.00101 GAGGA 0.00136 GAGGC 0.00177 GAGGG 0.00116 GAGGT 0.00126 GAGTA 0.000728 GAGTC 0.000744 GAGTG 0.00108 GAGTT 0.00108 GATAA 0.000879 GATAC 0.000491 GATAG 0.000565 GATAT 0.000784 GATCA 0.000929 GATCC 0.000656 GATCG 0.000183 GATCT 0.000894 GATGA 0.000951 GATGC 0.000612 GATGG 0.0011 GATGT 0.000813 GATTA 0.00104 GATTC 0.000799 GATTG 0.000727 GATTT 0.00132 GCAAA 0.00122 GCAAC 0.000776 GCAAG 0.000895 GCAAT 0.000894 GCACA 0.00101 GCACC 0.000749 GCACG 0.000251 GCACT 0.00108 GCAGA 0.00127 GCAGC 0.00101 GCAGG 0.00136 GCAGT 0.00122 GCATA 0.000625 GCATC 0.000612 GCATG 0.00102 GCATT 0.000969 GCCAA 0.00104 GCCAC 0.00121 GCCAG 0.00135 GCCAT 0.000901 GCCCA 0.00125 GCCCC 0.000872 GCCCG 0.000407 GCCCT 0.000891 GCCGA 0.000297 GCCGC 0.000299 GCCGG 0.000387 GCCGT 0.000153 GCCTA 0.000585 GCCTC 0.00177 GCCTG 0.00185 GCCTT 0.000997 GCGAA 0.000137 GCGAC 0.000146 GCGAG 0.000243 GCGAT 0.000212 GCGCA 0.000217 GCGCC 0.000409 GCGCG 0.000232 GCGCT 0.000192 GCGGA 0.000283 GCGGC 0.000299 GCGGG 0.000436 GCGGT 0.000205 GCGTA 8.42e-05 GCGTC 0.000143 GCGTG 0.000409 GCGTT 0.000136 GCTAA 0.000852 GCTAC 0.000648 GCTAG 0.000534 GCTAT 0.000637 GCTCA 0.00132 GCTCC 0.000856 GCTCG 0.000171 GCTCT 0.00105 GCTGA 0.00131 GCTGC 0.00101 GCTGG 0.00197 GCTGT 0.000994 GCTTA 0.000633 GCTTC 0.00091 GCTTG 0.000905 GCTTT 0.00123 GGAAA 0.00176 GGAAC 0.000708 GGAAG 0.00149 GGAAT 0.00104 GGACA 0.000887 GGACC 0.000531 GGACG 0.000177 GGACT 0.000795 GGAGA 0.00155 GGAGC 0.000856 GGAGG 0.00211 GGAGT 0.00123 GGATA 0.000649 GGATC 0.000656 GGATG 0.000904 GGATT 0.00116 GGCAA 0.000998 GGCAC 0.000855 GGCAG 0.00157 GGCAT 0.000968 GGCCA 0.00127 GGCCC 0.00078 GGCCG 0.000413 GGCCT 0.00111 GGCGA 0.000229 GGCGC 0.000409 GGCGG 0.000582 GGCGT 0.000354 GGCTA 0.000705 GGCTC 0.00116 GGCTG 0.00189 GGCTT 0.000947 GGGAA 0.00134 GGGAC 0.000766 GGGAG 0.00183 GGGAT 0.00104 GGGCA 0.00116 GGGCC 0.00078 GGGCG 0.000501 GGGCT 0.000987 GGGGA 0.00111 GGGGC 0.000872 GGGGG 0.000865 GGGGT 0.000875 GGGTA 0.000543 GGGTC 0.000624 GGGTG 0.0011 GGGTT 0.000987 GGTAA 0.000677 GGTAC 0.000389 GGTAG 0.000592 GGTAT 0.000601 GGTCA 0.000845 GGTCC 0.000531 GGTCG 0.000126 GGTCT 0.000966 GGTGA 0.00113 GGTGC 0.000749 GGTGG 0.00157 GGTGT 0.000883 GGTTA 0.000567 GGTTC 0.000734 GGTTG 0.000808 GGTTT 0.00124 GTAAA 0.00111 GTAAC 0.000525 GTAAG 0.000658 GTAAT 0.00108 GTACA 0.000671 GTACC 0.000389 GTACG 7.79e-05 GTACT 0.000543 GTAGA 0.000858 GTAGC 0.000648 GTAGG 0.000567 GTAGT 0.000647 GTATA 0.000787 GTATC 0.000491 GTATG 0.000631 GTATT 0.00114 GTCAA 0.000683 GTCAC 0.000733 GTCAG 0.000942 GTCAT 0.000752 GTCCA 0.000685 GTCCC 0.000766 GTCCG 0.000125 GTCCT 0.000814 GTCGA 8.21e-05 GTCGC 0.000146 GTCGG 0.00013 GTCGT 9.74e-05 GTCTA 0.000533 GTCTC 0.00136 GTCTG 0.000898 GTCTT 0.00111 GTGAA 0.00121 GTGAC 0.000733 GTGAG 0.00136 GTGAT 0.00107 GTGCA 0.00103 GTGCC 0.000855 GTGCG 0.000206 GTGCT 0.000997 GTGGA 0.00101 GTGGC 0.00121 GTGGG 0.00119 GTGGT 0.00108 GTGTA 0.000696 GTGTC 0.000708 GTGTG 0.00148 GTGTT 0.00103 GTTAA 0.000831 GTTAC 0.000525 GTTAG 0.000573 GTTAT 0.000748 GTTCA 0.00105 GTTCC 0.000708 GTTCG 0.000151 GTTCT 0.00102 GTTGA 0.000734 GTTGC 0.000776 GTTGG 0.000866 GTTGT 0.000795 GTTTA 0.00098 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00112 GTTTT 0.00197 TAAAA 0.00303 TAAAC 0.00098 TAAAG 0.0013 TAAAT 0.00199 TAACA 0.00108 TAACC 0.000567 TAACG 0.000118 TAACT 0.00091 TAAGA 0.0011 TAAGC 0.000633 TAAGG 0.000779 TAAGT 0.000916 TAATA 0.00138 TAATC 0.00104 TAATG 0.00101 TAATT 0.00179 TACAA 0.0013 TACAC 0.000696 TACAG 0.00137 TACAT 0.00116 TACCA 0.000814 TACCC 0.000543 TACCG 9.34e-05 TACCT 0.000808 TACGA 0.0001 TACGC 8.42e-05 TACGG 0.000105 TACGT 0.000163 TACTA 0.000837 TACTC 0.000728 TACTG 0.000864 TACTT 0.00114 TAGAA 0.00131 TAGAC 0.000533 TAGAG 0.00106 TAGAT 0.000843 TAGCA 0.000825 TAGCC 0.000705 TAGCG 9.88e-05 TAGCT 0.00104 TAGGA 0.000904 TAGGC 0.000585 TAGGG 0.000644 TAGGT 0.000676 TAGTA 0.000837 TAGTC 0.000593 TAGTG 0.000709 TAGTT 0.000918 TATAA 0.00143 TATAC 0.000787 TATAG 0.000796 TATAT 0.00189 TATCA 0.000899 TATCC 0.000649 TATCG 8.68e-05 TATCT 0.00108 TATGA 0.000954 TATGC 0.000625 TATGG 0.000735 TATGT 0.00121 TATTA 0.00138 TATTC 0.00104 TATTG 0.001 TATTT 0.00294 TCAAA 0.00176 TCAAC 0.000734 TCAAG 0.0013 TCAAT 0.000974 TCACA 0.00134 TCACC 0.00113 TCACG 0.000348 TCACT 0.00156 TCAGA 0.00129 TCAGC 0.00131 TCAGG 0.00143 TCAGT 0.00113 TCATA 0.000954 TCATC 0.000951 TCATG 0.00114 TCATT 0.00156 TCCAA 0.00114 TCCAC 0.00101 TCCAG 0.00156 TCCAT 0.00121 TCCCA 0.00208 TCCCC 0.00111 TCCCG 0.000387 TCCCT 0.00141 TCCGA 0.000137 TCCGC 0.000283 TCCGG 0.000203 TCCGT 0.00021 TCCTA 0.000904 TCCTC 0.00136 TCCTG 0.00192 TCCTT 0.00158 TCGAA 0.000182 TCGAC 8.21e-05 TCGAG 0.000235 TCGAT 0.000124 TCGCA 0.000145 TCGCC 0.000229 TCGCG 8.66e-05 TCGCT 0.000278 TCGGA 0.000137 TCGGC 0.000297 TCGGG 0.00026 TCGGT 0.00013 TCGTA 0.0001 TCGTC 0.000128 TCGTG 0.000226 TCGTT 0.000165 TCTAA 0.00104 TCTAC 0.000858 TCTAG 0.000818 TCTAT 0.00102 TCTCA 0.00178 TCTCC 0.00155 TCTCG 0.000387 TCTCT 0.00207 TCTGA 0.00129 TCTGC 0.00127 TCTGG 0.00131 TCTGT 0.00171 TCTTA 0.0011 TCTTC 0.00142 TCTTG 0.00138 TCTTT 0.00234 TGAAA 0.00208 TGAAC 0.00105 TGAAG 0.00132 TGAAT 0.00139 TGACA 0.00111 TGACC 0.000845 TGACG 0.000154 TGACT 0.000998 TGAGA 0.00178 TGAGC 0.00132 TGAGG 0.00161 TGAGT 0.00108 TGATA 0.000899 TGATC 0.000929 TGATG 0.00106 TGATT 0.00129 TGCAA 0.00127 TGCAC 0.00103 TGCAG 0.00165 TGCAT 0.00109 TGCCA 0.00128 TGCCC 0.00116 TGCCG 0.000193 TGCCT 0.00176 TGCGA 0.000145 TGCGC 0.000217 TGCGG 0.000224 TGCGT 0.000178 TGCTA 0.000825 TGCTC 0.000979 TGCTG 0.00154 TGCTT 0.00142 TGGAA 0.00156 TGGAC 0.000685 TGGAG 0.00163 TGGAT 0.00105 TGGCA 0.00128 TGGCC 0.00127 TGGCG 0.000346 TGGCT 0.00159 TGGGA 0.00208 TGGGC 0.00125 TGGGG 0.0014 TGGGT 0.00118 TGGTA 0.000814 TGGTC 0.000891 TGGTG 0.00152 TGGTT 0.0011 TGTAA 0.0015 TGTAC 0.000671 TGTAG 0.000937 TGTAT 0.00142 TGTCA 0.00111 TGTCC 0.000887 TGTCG 0.000161 TGTCT 0.00148 TGTGA 0.00134 TGTGC 0.00101 TGTGG 0.0013 TGTGT 0.00177 TGTTA 0.00108 TGTTC 0.00104 TGTTG 0.00136 TGTTT 0.00219 TTAAA 0.00244 TTAAC 0.000831 TTAAG 0.00109 TTAAT 0.00154 TTACA 0.0015 TTACC 0.000677 TTACG 0.000126 TTACT 0.00107 TTAGA 0.00104 TTAGC 0.000852 TTAGG 0.000812 TTAGT 0.00099 TTATA 0.00143 TTATC 0.000879 TTATG 0.00103 TTATT 0.00233 TTCAA 0.00163 TTCAC 0.00121 TTCAG 0.00142 TTCAT 0.00157 TTCCA 0.00156 TTCCC 0.00134 TTCCG 0.000182 TTCCT 0.00191 TTCGA 0.000182 TTCGC 0.000137 TTCGG 0.000152 TTCGT 0.000169 TTCTA 0.00131 TTCTC 0.00175 TTCTG 0.00174 TTCTT 0.00234 TTGAA 0.00163 TTGAC 0.000683 TTGAG 0.00143 TTGAT 0.00103 TTGCA 0.00127 TTGCC 0.000998 TTGCG 0.00014 TTGCT 0.00138 TTGGA 0.00114 TTGGC 0.00104 TTGGG 0.00134 TTGGT 0.00102 TTGTA 0.0013 TTGTC 0.000895 TTGTG 0.00119 TTGTT 0.0018 TTTAA 0.00244 TTTAC 0.00111 TTTAG 0.00133 TTTAT 0.00242 TTTCA 0.00208 TTTCC 0.00176 TTTCG 0.00019 TTTCT 0.00284 TTTGA 0.00176 TTTGC 0.00122 TTTGG 0.00163 TTTGT 0.00223 TTTTA 0.00303 TTTTC 0.00243 TTTTG 0.00256 TTTTT 0.00707 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4686 AAAAC 0.1306 AAAAG 0.158 AAAAT 0.2428 AAACA 0.4124 AAACC 0.2341 AAACG 0.04672 AAACT 0.3067 AAAGA 0.3435 AAAGC 0.1804 AAAGG 0.2225 AAAGT 0.2536 AAATA 0.3315 AAATC 0.1485 AAATG 0.2421 AAATT 0.2779 AACAA 0.3175 AACAC 0.1812 AACAG 0.2334 AACAT 0.2678 AACCA 0.3272 AACCC 0.2943 AACCG 0.04126 AACCT 0.3372 AACGA 0.2504 AACGC 0.2067 AACGG 0.2246 AACGT 0.3183 AACTA 0.2086 AACTC 0.2455 AACTG 0.2596 AACTT 0.2864 AAGAA 0.3753 AAGAC 0.1773 AAGAG 0.2378 AAGAT 0.2096 AAGCA 0.3859 AAGCC 0.2574 AAGCG 0.06329 AAGCT 0.2934 AAGGA 0.3402 AAGGC 0.2145 AAGGG 0.2373 AAGGT 0.208 AAGTA 0.2411 AAGTC 0.1846 AAGTG 0.3085 AAGTT 0.2658 AATAA 0.3664 AATAC 0.1786 AATAG 0.1681 AATAT 0.2869 AATCA 0.3319 AATCC 0.2989 AATCG 0.0463 AATCT 0.3229 AATGA 0.2979 AATGC 0.1848 AATGG 0.2344 AATGT 0.2829 AATTA 0.2705 AATTC 0.1892 AATTG 0.1677 AATTT 0.3726 ACAAA 0.4298 ACAAC 0.1532 ACAAG 0.1974 ACAAT 0.2195 ACACA 0.453 ACACC 0.226 ACACG 0.06345 ACACT 0.2575 ACAGA 0.3173 ACAGC 0.1847 ACAGG 0.2859 ACAGT 0.2121 ACATA 0.2533 ACATC 0.1698 ACATG 0.267 ACATT 0.3099 ACCAA 0.2354 ACCAC 0.2506 ACCAG 0.2516 ACCAT 0.2624 ACCCA 0.3618 ACCCC 0.2691 ACCCG 0.08316 ACCCT 0.2859 ACCGA 0.1985 ACCGC 0.3115 ACCGG 0.2097 ACCGT 0.2803 ACCTA 0.1617 ACCTC 0.3023 ACCTG 0.3044 ACCTT 0.2316 ACGAA 0.2723 ACGAC 0.1572 ACGAG 0.3218 ACGAT 0.2487 ACGCA 0.2308 ACGCC 0.4575 ACGCG 0.09252 ACGCT 0.2192 ACGGA 0.2629 ACGGC 0.1917 ACGGG 0.3148 ACGGT 0.2306 ACGTA 0.2011 ACGTC 0.1825 ACGTG 0.3575 ACGTT 0.2589 ACTAA 0.3238 ACTAC 0.2116 ACTAG 0.191 ACTAT 0.2736 ACTCA 0.2971 ACTCC 0.3393 ACTCG 0.05588 ACTCT 0.3077 ACTGA 0.2509 ACTGC 0.2705 ACTGG 0.2245 ACTGT 0.254 ACTTA 0.1933 ACTTC 0.214 ACTTG 0.2276 ACTTT 0.3651 AGAAA 0.3982 AGAAC 0.1424 AGAAG 0.2255 AGAAT 0.2338 AGACA 0.3797 AGACC 0.248 AGACG 0.08081 AGACT 0.2915 AGAGA 0.3625 AGAGC 0.1839 AGAGG 0.2577 AGAGT 0.1959 AGATA 0.2354 AGATC 0.1939 AGATG 0.2982 AGATT 0.2724 AGCAA 0.2894 AGCAC 0.2092 AGCAG 0.2842 AGCAT 0.2171 AGCCA 0.3388 AGCCC 0.2098 AGCCG 0.07523 AGCCT 0.3761 AGCGA 0.3252 AGCGC 0.2239 AGCGG 0.253 AGCGT 0.1979 AGCTA 0.2211 AGCTC 0.2134 AGCTG 0.3364 AGCTT 0.2291 AGGAA 0.3309 AGGAC 0.1411 AGGAG 0.3344 AGGAT 0.1935 AGGCA 0.3394 AGGCC 0.2141 AGGCG 0.1062 AGGCT 0.3403 AGGGA 0.3297 AGGGC 0.2089 AGGGG 0.2436 AGGGT 0.2179 AGGTA 0.1935 AGGTC 0.1973 AGGTG 0.3385 AGGTT 0.2707 AGTAA 0.2982 AGTAC 0.1519 AGTAG 0.3023 AGTAT 0.2476 AGTCA 0.3271 AGTCC 0.2606 AGTCG 0.04001 AGTCT 0.3723 AGTGA 0.3174 AGTGC 0.2193 AGTGG 0.2581 AGTGT 0.2052 AGTTA 0.2068 AGTTC 0.2271 AGTTG 0.1956 AGTTT 0.3705 ATAAA 0.4269 ATAAC 0.1319 ATAAG 0.1631 ATAAT 0.2781 ATACA 0.4671 ATACC 0.1973 ATACG 0.04517 ATACT 0.2904 ATAGA 0.3205 ATAGC 0.2 ATAGG 0.2169 ATAGT 0.2626 ATATA 0.3365 ATATC 0.1396 ATATG 0.1988 ATATT 0.3251 ATCAA 0.2466 ATCAC 0.2558 ATCAG 0.2295 ATCAT 0.268 ATCCA 0.3117 ATCCC 0.3096 ATCCG 0.04761 ATCCT 0.331 ATCGA 0.2112 ATCGC 0.3611 ATCGG 0.1654 ATCGT 0.2623 ATCTA 0.1829 ATCTC 0.2824 ATCTG 0.2506 ATCTT 0.2842 ATGAA 0.34 ATGAC 0.163 ATGAG 0.2541 ATGAT 0.2428 ATGCA 0.337 ATGCC 0.2996 ATGCG 0.04332 ATGCT 0.3201 ATGGA 0.2841 ATGGC 0.211 ATGGG 0.2389 ATGGT 0.2659 ATGTA 0.2428 ATGTC 0.1735 ATGTG 0.2662 ATGTT 0.3175 ATTAA 0.294 ATTAC 0.2061 ATTAG 0.1981 ATTAT 0.3017 ATTCA 0.3285 ATTCC 0.2456 ATTCG 0.03049 ATTCT 0.3955 ATTGA 0.2566 ATTGC 0.2356 ATTGG 0.2076 ATTGT 0.3003 ATTTA 0.224 ATTTC 0.1871 ATTTG 0.176 ATTTT 0.4129 CAAAA 0.3737 CAAAC 0.1638 CAAAG 0.2345 CAAAT 0.228 CAACA 0.4281 CAACC 0.2548 CAACG 0.04582 CAACT 0.2713 CAAGA 0.3086 CAAGC 0.2024 CAAGG 0.2477 CAAGT 0.2413 CAATA 0.2635 CAATC 0.1916 CAATG 0.2526 CAATT 0.2923 CACAA 0.2197 CACAC 0.2718 CACAG 0.2737 CACAT 0.2348 CACCA 0.3517 CACCC 0.2534 CACCG 0.06836 CACCT 0.3265 CACGA 0.1887 CACGC 0.3416 CACGG 0.2277 CACGT 0.2419 CACTA 0.1445 CACTC 0.2206 CACTG 0.3366 CACTT 0.2982 CAGAA 0.3121 CAGAC 0.1611 CAGAG 0.3198 CAGAT 0.207 CAGCA 0.2916 CAGCC 0.357 CAGCG 0.05123 CAGCT 0.3001 CAGGA 0.2999 CAGGC 0.2891 CAGGG 0.2121 CAGGT 0.1989 CAGTA 0.1923 CAGTC 0.1864 CAGTG 0.3673 CAGTT 0.254 CATAA 0.2906 CATAC 0.179 CATAG 0.2138 CATAT 0.3165 CATCA 0.3053 CATCC 0.26 CATCG 0.03944 CATCT 0.3953 CATGA 0.2461 CATGC 0.2202 CATGG 0.259 CATGT 0.2748 CATTA 0.1925 CATTC 0.215 CATTG 0.1828 CATTT 0.4096 CCAAA 0.3593 CCAAC 0.1909 CCAAG 0.2761 CCAAT 0.1737 CCACA 0.2897 CCACC 0.3502 CCACG 0.07815 CCACT 0.282 CCAGA 0.2059 CCAGC 0.3099 CCAGG 0.3253 CCAGT 0.159 CCATA 0.1722 CCATC 0.2576 CCATG 0.2822 CCATT 0.2879 CCCAA 0.2271 CCCAC 0.2012 CCCAG 0.3989 CCCAT 0.1729 CCCCA 0.3745 CCCCC 0.232 CCCCG 0.1147 CCCCT 0.2788 CCCGA 0.1741 CCCGC 0.2919 CCCGG 0.3655 CCCGT 0.1684 CCCTA 0.151 CCCTC 0.2725 CCCTG 0.3179 CCCTT 0.2587 CCGAA 0.1842 CCGAC 0.1581 CCGAG 0.5398 CCGAT 0.1179 CCGCA 0.1834 CCGCC 0.4768 CCGCG 0.1625 CCGCT 0.1773 CCGGA 0.1592 CCGGC 0.304 CCGGG 0.4286 CCGGT 0.1082 CCGTA 0.131 CCGTC 0.3418 CCGTG 0.3418 CCGTT 0.1855 CCTAA 0.2891 CCTAC 0.2018 CCTAG 0.2632 CCTAT 0.2459 CCTCA 0.2891 CCTCC 0.3807 CCTCG 0.06515 CCTCT 0.265 CCTGA 0.2235 CCTGC 0.2129 CCTGG 0.323 CCTGT 0.2407 CCTTA 0.1675 CCTTC 0.2677 CCTTG 0.2382 CCTTT 0.3266 CGAAA 0.297 CGAAC 0.2355 CGAAG 0.2665 CGAAT 0.2011 CGACA 0.3539 CGACC 0.2765 CGACG 0.1019 CGACT 0.2677 CGAGA 0.3444 CGAGC 0.1523 CGAGG 0.3223 CGAGT 0.181 CGATA 0.1478 CGATC 0.3124 CGATG 0.2335 CGATT 0.3064 CGCAA 0.1832 CGCAC 0.27 CGCAG 0.3635 CGCAT 0.1834 CGCCA 0.2197 CGCCC 0.318 CGCCG 0.1117 CGCCT 0.3506 CGCGA 0.1472 CGCGC 0.3938 CGCGG 0.3375 CGCGT 0.1215 CGCTA 0.1154 CGCTC 0.2964 CGCTG 0.3161 CGCTT 0.272 CGGAA 0.2189 CGGAC 0.15 CGGAG 0.4383 CGGAT 0.1928 CGGCA 0.1697 CGGCC 0.3638 CGGCG 0.1549 CGGCT 0.3116 CGGGA 0.2597 CGGGC 0.2726 CGGGG 0.2865 CGGGT 0.1813 CGGTA 0.1423 CGGTC 0.1963 CGGTG 0.4508 CGGTT 0.2106 CGTAA 0.2786 CGTAC 0.1723 CGTAG 0.2448 CGTAT 0.3044 CGTCA 0.2221 CGTCC 0.2557 CGTCG 0.06718 CGTCT 0.455 CGTGA 0.2901 CGTGC 0.2099 CGTGG 0.2929 CGTGT 0.207 CGTTA 0.1789 CGTTC 0.2242 CGTTG 0.2204 CGTTT 0.3765 CTAAA 0.3603 CTAAC 0.1552 CTAAG 0.2043 CTAAT 0.2801 CTACA 0.3445 CTACC 0.2176 CTACG 0.04069 CTACT 0.3971 CTAGA 0.3058 CTAGC 0.1996 CTAGG 0.2763 CTAGT 0.2182 CTATA 0.2498 CTATC 0.1774 CTATG 0.2369 CTATT 0.3359 CTCAA 0.2463 CTCAC 0.2346 CTCAG 0.3167 CTCAT 0.2024 CTCCA 0.2828 CTCCC 0.3188 CTCCG 0.0634 CTCCT 0.3351 CTCGA 0.2094 CTCGC 0.2167 CTCGG 0.3963 CTCGT 0.1776 CTCTA 0.1851 CTCTC 0.2425 CTCTG 0.3122 CTCTT 0.2601 CTGAA 0.2759 CTGAC 0.1826 CTGAG 0.3556 CTGAT 0.186 CTGCA 0.34 CTGCC 0.3241 CTGCG 0.05714 CTGCT 0.2787 CTGGA 0.2459 CTGGC 0.2119 CTGGG 0.3708 CTGGT 0.1714 CTGTA 0.2537 CTGTC 0.2241 CTGTG 0.276 CTGTT 0.2462 CTTAA 0.3186 CTTAC 0.1918 CTTAG 0.2201 CTTAT 0.2695 CTTCA 0.2877 CTTCC 0.3244 CTTCG 0.03715 CTTCT 0.3507 CTTGA 0.2904 CTTGC 0.2002 CTTGG 0.2801 CTTGT 0.2292 CTTTA 0.1909 CTTTC 0.2246 CTTTG 0.2353 CTTTT 0.3493 GAAAA 0.3542 GAAAC 0.1809 GAAAG 0.2231 GAAAT 0.2417 GAACA 0.3569 GAACC 0.2508 GAACG 0.05055 GAACT 0.3417 GAAGA 0.3094 GAAGC 0.1984 GAAGG 0.2712 GAAGT 0.221 GAATA 0.2467 GAATC 0.1894 GAATG 0.2672 GAATT 0.2966 GACAA 0.2458 GACAC 0.1946 GACAG 0.3314 GACAT 0.2282 GACCA 0.3611 GACCC 0.2528 GACCG 0.05223 GACCT 0.3339 GACGA 0.1851 GACGC 0.2068 GACGG 0.3943 GACGT 0.2138 GACTA 0.1944 GACTC 0.244 GACTG 0.2746 GACTT 0.287 GAGAA 0.3019 GAGAC 0.2342 GAGAG 0.2392 GAGAT 0.2247 GAGCA 0.2876 GAGCC 0.3421 GAGCG 0.07458 GAGCT 0.2957 GAGGA 0.2452 GAGGC 0.3181 GAGGG 0.2093 GAGGT 0.2274 GAGTA 0.2003 GAGTC 0.2047 GAGTG 0.2977 GAGTT 0.2972 GATAA 0.3234 GATAC 0.1805 GATAG 0.2077 GATAT 0.2884 GATCA 0.349 GATCC 0.2464 GATCG 0.06891 GATCT 0.3356 GATGA 0.2736 GATGC 0.1761 GATGG 0.3164 GATGT 0.2339 GATTA 0.2682 GATTC 0.2057 GATTG 0.1871 GATTT 0.339 GCAAA 0.3229 GCAAC 0.2049 GCAAG 0.2363 GCAAT 0.236 GCACA 0.3278 GCACC 0.2425 GCACG 0.08139 GCACT 0.3483 GCAGA 0.2613 GCAGC 0.2081 GCAGG 0.2802 GCAGT 0.2503 GCATA 0.1935 GCATC 0.1894 GCATG 0.317 GCATT 0.3 GCCAA 0.2318 GCCAC 0.2683 GCCAG 0.2994 GCCAT 0.2005 GCCCA 0.3661 GCCCC 0.2548 GCCCG 0.1188 GCCCT 0.2603 GCCGA 0.2612 GCCGC 0.2631 GCCGG 0.3408 GCCGT 0.1348 GCCTA 0.1125 GCCTC 0.3399 GCCTG 0.3557 GCCTT 0.1919 GCGAA 0.1857 GCGAC 0.1978 GCGAG 0.3293 GCGAT 0.2871 GCGCA 0.2066 GCGCC 0.3899 GCGCG 0.2209 GCGCT 0.1827 GCGGA 0.2314 GCGGC 0.2445 GCGGG 0.3566 GCGGT 0.1675 GCGTA 0.1089 GCGTC 0.1851 GCGTG 0.5296 GCGTT 0.1764 GCTAA 0.319 GCTAC 0.2425 GCTAG 0.2 GCTAT 0.2385 GCTCA 0.3894 GCTCC 0.2517 GCTCG 0.05026 GCTCT 0.3086 GCTGA 0.2479 GCTGC 0.1914 GCTGG 0.3724 GCTGT 0.1883 GCTTA 0.1721 GCTTC 0.2474 GCTTG 0.2459 GCTTT 0.3346 GGAAA 0.3522 GGAAC 0.1418 GGAAG 0.2983 GGAAT 0.2076 GGACA 0.3711 GGACC 0.2222 GGACG 0.07403 GGACT 0.3327 GGAGA 0.2697 GGAGC 0.1488 GGAGG 0.3673 GGAGT 0.2143 GGATA 0.1925 GGATC 0.1947 GGATG 0.2682 GGATT 0.3447 GGCAA 0.2271 GGCAC 0.1945 GGCAG 0.3582 GGCAT 0.2203 GGCCA 0.3554 GGCCC 0.2181 GGCCG 0.1154 GGCCT 0.3111 GGCGA 0.1455 GGCGC 0.2598 GGCGG 0.37 GGCGT 0.2246 GGCTA 0.1499 GGCTC 0.2475 GGCTG 0.4011 GGCTT 0.2015 GGGAA 0.2689 GGGAC 0.1537 GGGAG 0.368 GGGAT 0.2094 GGGCA 0.3377 GGGCC 0.2279 GGGCG 0.1462 GGGCT 0.2882 GGGGA 0.299 GGGGC 0.2341 GGGGG 0.232 GGGGT 0.2349 GGGTA 0.1671 GGGTC 0.1919 GGGTG 0.3375 GGGTT 0.3035 GGTAA 0.2998 GGTAC 0.1724 GGTAG 0.2619 GGTAT 0.2659 GGTCA 0.3424 GGTCC 0.2151 GGTCG 0.05107 GGTCT 0.3914 GGTGA 0.2599 GGTGC 0.173 GGTGG 0.3631 GGTGT 0.204 GGTTA 0.1692 GGTTC 0.2188 GGTTG 0.241 GGTTT 0.3711 GTAAA 0.3286 GTAAC 0.1559 GTAAG 0.1955 GTAAT 0.32 GTACA 0.3991 GTACC 0.2317 GTACG 0.04633 GTACT 0.3228 GTAGA 0.3156 GTAGC 0.2382 GTAGG 0.2084 GTAGT 0.2378 GTATA 0.2583 GTATC 0.1611 GTATG 0.2074 GTATT 0.3732 GTCAA 0.2197 GTCAC 0.2357 GTCAG 0.3028 GTCAT 0.2418 GTCCA 0.2865 GTCCC 0.3206 GTCCG 0.05227 GTCCT 0.3406 GTCGA 0.18 GTCGC 0.3205 GTCGG 0.2858 GTCGT 0.2137 GTCTA 0.137 GTCTC 0.3481 GTCTG 0.2306 GTCTT 0.2843 GTGAA 0.2773 GTGAC 0.1676 GTGAG 0.3106 GTGAT 0.2445 GTGCA 0.3339 GTGCC 0.2767 GTGCG 0.06674 GTGCT 0.3226 GTGGA 0.2256 GTGGC 0.2685 GTGGG 0.2644 GTGGT 0.2415 GTGTA 0.1781 GTGTC 0.1813 GTGTG 0.3775 GTGTT 0.2631 GTTAA 0.3105 GTTAC 0.196 GTTAG 0.2142 GTTAT 0.2793 GTTCA 0.3588 GTTCC 0.2421 GTTCG 0.05152 GTTCT 0.3476 GTTGA 0.2315 GTTGC 0.2447 GTTGG 0.273 GTTGT 0.2507 GTTTA 0.1844 GTTTC 0.2338 GTTTG 0.211 GTTTT 0.3708 TAAAA 0.4147 TAAAC 0.1343 TAAAG 0.1786 TAAAT 0.2724 TAACA 0.4043 TAACC 0.2119 TAACG 0.04408 TAACT 0.3398 TAAGA 0.3211 TAAGC 0.1846 TAAGG 0.2271 TAAGT 0.2672 TAATA 0.2645 TAATC 0.1995 TAATG 0.1933 TAATT 0.3427 TACAA 0.2877 TACAC 0.1538 TACAG 0.3017 TACAT 0.2568 TACCA 0.3604 TACCC 0.2405 TACCG 0.04136 TACCT 0.3577 TACGA 0.222 TACGC 0.1862 TACGG 0.2313 TACGT 0.3605 TACTA 0.2342 TACTC 0.2039 TACTG 0.2419 TACTT 0.32 TAGAA 0.3492 TAGAC 0.1427 TAGAG 0.2828 TAGAT 0.2254 TAGCA 0.3089 TAGCC 0.264 TAGCG 0.03701 TAGCT 0.3901 TAGGA 0.322 TAGGC 0.2082 TAGGG 0.2293 TAGGT 0.2405 TAGTA 0.2738 TAGTC 0.194 TAGTG 0.232 TAGTT 0.3002 TATAA 0.2919 TATAC 0.1604 TATAG 0.1622 TATAT 0.3855 TATCA 0.3306 TATCC 0.2386 TATCG 0.03191 TATCT 0.3989 TATGA 0.2705 TATGC 0.1773 TATGG 0.2084 TATGT 0.3438 TATTA 0.2171 TATTC 0.1636 TATTG 0.1571 TATTT 0.4621 TCAAA 0.3694 TCAAC 0.154 TCAAG 0.2724 TCAAT 0.2042 TCACA 0.3072 TCACC 0.2573 TCACG 0.07945 TCACT 0.356 TCAGA 0.2504 TCAGC 0.2539 TCAGG 0.277 TCAGT 0.2187 TCATA 0.2069 TCATC 0.2062 TCATG 0.2482 TCATT 0.3387 TCCAA 0.2309 TCCAC 0.2057 TCCAG 0.3171 TCCAT 0.2464 TCCCA 0.4165 TCCCC 0.2236 TCCCG 0.07774 TCCCT 0.2822 TCCGA 0.1648 TCCGC 0.3395 TCCGG 0.2435 TCCGT 0.2522 TCCTA 0.1569 TCCTC 0.2362 TCCTG 0.3326 TCCTT 0.2744 TCGAA 0.2923 TCGAC 0.1316 TCGAG 0.3771 TCGAT 0.199 TCGCA 0.1956 TCGCC 0.3102 TCGCG 0.1173 TCGCT 0.3769 TCGGA 0.1665 TCGGC 0.3599 TCGGG 0.3154 TCGGT 0.1582 TCGTA 0.1619 TCGTC 0.2067 TCGTG 0.3649 TCGTT 0.2665 TCTAA 0.2785 TCTAC 0.2296 TCTAG 0.2189 TCTAT 0.273 TCTCA 0.3076 TCTCC 0.2681 TCTCG 0.06677 TCTCT 0.3576 TCTGA 0.2316 TCTGC 0.2276 TCTGG 0.2344 TCTGT 0.3063 TCTTA 0.1763 TCTTC 0.2274 TCTTG 0.221 TCTTT 0.3753 TGAAA 0.3561 TGAAC 0.1799 TGAAG 0.2264 TGAAT 0.2377 TGACA 0.358 TGACC 0.2718 TGACG 0.04942 TGACT 0.3208 TGAGA 0.3075 TGAGC 0.2288 TGAGG 0.2772 TGAGT 0.1865 TGATA 0.2151 TGATC 0.2224 TGATG 0.2539 TGATT 0.3086 TGCAA 0.2522 TGCAC 0.2044 TGCAG 0.3274 TGCAT 0.2159 TGCCA 0.2918 TGCCC 0.263 TGCCG 0.04384 TGCCT 0.4013 TGCGA 0.1892 TGCGC 0.2838 TGCGG 0.2934 TGCGT 0.2336 TGCTA 0.1731 TGCTC 0.2054 TGCTG 0.3233 TGCTT 0.2981 TGGAA 0.3171 TGGAC 0.139 TGGAG 0.3305 TGGAT 0.2134 TGGCA 0.2854 TGGCC 0.283 TGGCG 0.07698 TGGCT 0.3546 TGGGA 0.3518 TGGGC 0.2124 TGGGG 0.2364 TGGGT 0.1994 TGGTA 0.1882 TGGTC 0.206 TGGTG 0.3521 TGGTT 0.2536 TGTAA 0.3307 TGTAC 0.1482 TGTAG 0.2069 TGTAT 0.3142 TGTCA 0.3058 TGTCC 0.2436 TGTCG 0.04432 TGTCT 0.4062 TGTGA 0.2476 TGTGC 0.1866 TGTGG 0.2396 TGTGT 0.3263 TGTTA 0.1907 TGTTC 0.1839 TGTTG 0.2392 TGTTT 0.3862 TTAAA 0.4134 TTAAC 0.1409 TTAAG 0.1853 TTAAT 0.2604 TTACA 0.4448 TTACC 0.2013 TTACG 0.03741 TTACT 0.3165 TTAGA 0.2818 TTAGC 0.2306 TTAGG 0.2198 TTAGT 0.2678 TTATA 0.2526 TTATC 0.1551 TTATG 0.1809 TTATT 0.4114 TTCAA 0.2792 TTCAC 0.208 TTCAG 0.244 TTCAT 0.2689 TTCCA 0.3128 TTCCC 0.2685 TTCCG 0.0365 TTCCT 0.3822 TTCGA 0.2847 TTCGC 0.2144 TTCGG 0.2373 TTCGT 0.2637 TTCTA 0.1829 TTCTC 0.2449 TTCTG 0.2438 TTCTT 0.3284 TTGAA 0.3415 TTGAC 0.1432 TTGAG 0.2991 TTGAT 0.2161 TTGCA 0.3358 TTGCC 0.2634 TTGCG 0.03691 TTGCT 0.3639 TTGGA 0.2506 TTGGC 0.2295 TTGGG 0.2954 TTGGT 0.2245 TTGTA 0.2509 TTGTC 0.1723 TTGTG 0.2296 TTGTT 0.3471 TTTAA 0.3342 TTTAC 0.1516 TTTAG 0.1825 TTTAT 0.3317 TTTCA 0.3024 TTTCC 0.256 TTTCG 0.02767 TTTCT 0.4139 TTTGA 0.2573 TTTGC 0.1787 TTTGG 0.2381 TTTGT 0.3259 TTTTA 0.2006 TTTTC 0.1613 TTTTG 0.1696 TTTTT 0.4686 [2] # (a,c,g,t)= (0.265, 0.235, 0.235, 0.265) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.273 C 0.227 G 0.227 T 0.273 # l= 1 # Values AA 0.0857 AC 0.0506 AG 0.0733 AT 0.0638 CA 0.0737 CC 0.0641 CG 0.0157 CT 0.0733 GA 0.0601 GC 0.0519 GG 0.0641 GT 0.0506 TA 0.0538 TC 0.0601 TG 0.0737 TT 0.0857 # l= 2 # Values AAA 0.0335 AAC 0.0135 AAG 0.0187 AAT 0.02 ACA 0.0187 ACC 0.013 ACG 0.00328 ACT 0.0155 AGA 0.021 AGC 0.0159 AGG 0.0208 AGT 0.0155 ATA 0.0154 ATC 0.0124 ATG 0.0161 ATT 0.02 CAA 0.0176 CAC 0.0167 CAG 0.0232 CAT 0.0161 CCA 0.0208 CCC 0.0175 CCG 0.00487 CCT 0.0208 CGA 0.00311 CGC 0.00442 CGG 0.00487 CGT 0.00328 CTA 0.0116 CTC 0.0197 CTG 0.0232 CTT 0.0187 GAA 0.0178 GAC 0.0103 GAG 0.0197 GAT 0.0124 GCA 0.0156 GCC 0.016 GCG 0.00442 GCT 0.0159 GGA 0.0174 GGC 0.016 GGG 0.0175 GGT 0.013 GTA 0.0101 GTC 0.0103 GTG 0.0167 GTT 0.0135 TAA 0.0167 TAC 0.0101 TAG 0.0116 TAT 0.0154 TCA 0.0185 TCC 0.0174 TCG 0.00311 TCT 0.021 TGA 0.0185 TGC 0.0156 TGG 0.0208 TGT 0.0187 TTA 0.0167 TTC 0.0178 TTG 0.0176 TTT 0.0335 # l= 3 # Values AAAA 0.0142 AAAC 0.00499 AAAG 0.00642 AAAT 0.0079 AACA 0.00532 AACC 0.00339 AACG 0.000678 AACT 0.0041 AAGA 0.00589 AAGC 0.00368 AAGG 0.0047 AAGT 0.00445 AATA 0.00558 AATC 0.00368 AATG 0.00481 AATT 0.00588 ACAA 0.00486 ACAC 0.00395 ACAG 0.00553 ACAT 0.0044 ACCA 0.00438 ACCC 0.00359 ACCG 0.000744 ACCT 0.00432 ACGA 0.00065 ACGC 0.000884 ACGG 0.000911 ACGT 0.000835 ACTA 0.0028 ACTC 0.00374 ACTG 0.00451 ACTT 0.00445 AGAA 0.00673 AGAC 0.00401 AGAG 0.00593 AGAT 0.00439 AGCA 0.00479 AGCC 0.00521 AGCG 0.000987 AGCT 0.0049 AGGA 0.00596 AGGC 0.00576 AGGG 0.00477 AGGT 0.00432 AGTA 0.00329 AGTC 0.00307 AGTG 0.00504 AGTT 0.0041 ATAA 0.00496 ATAC 0.00274 ATAG 0.00288 ATAT 0.00479 ATCA 0.00392 ATCC 0.00343 ATCG 0.000627 ATCT 0.00439 ATGA 0.00428 ATGC 0.00317 ATGG 0.00428 ATGT 0.0044 ATTA 0.00465 ATTC 0.00391 ATTG 0.00348 ATTT 0.0079 CAAA 0.00646 CAAC 0.00315 CAAG 0.00456 CAAT 0.00348 CACA 0.00552 CACC 0.00478 CACG 0.00136 CACT 0.00504 CAGA 0.00571 CAGC 0.00584 CAGG 0.00717 CAGT 0.00451 CATA 0.00316 CATC 0.0035 CATG 0.00466 CATT 0.00481 CCAA 0.00456 CCAC 0.00491 CCAG 0.00709 CCAT 0.00428 CCCA 0.00657 CCCC 0.0044 CCCG 0.0018 CCCT 0.00477 CCGA 0.00095 CCGC 0.00146 CCGG 0.00155 CCGT 0.000911 CCTA 0.00276 CCTC 0.00619 CCTG 0.00717 CCTT 0.0047 CGAA 0.000675 CGAC 0.000519 CGAG 0.00129 CGAT 0.000627 CGCA 0.000875 CGCC 0.00186 CGCG 0.000698 CGCT 0.000987 CGGA 0.000959 CGGC 0.00136 CGGG 0.0018 CGGT 0.000744 CGTA 0.000447 CGTC 0.00079 CGTG 0.00136 CGTT 0.000678 CTAA 0.00346 CTAC 0.00268 CTAG 0.00262 CTAT 0.00288 CTCA 0.00604 CTCC 0.00641 CTCG 0.00129 CTCT 0.00593 CTGA 0.00528 CTGC 0.00533 CTGG 0.00709 CTGT 0.00553 CTTA 0.00313 CTTC 0.00462 CTTG 0.00456 CTTT 0.00642 GAAA 0.0064 GAAC 0.00291 GAAG 0.00462 GAAT 0.00391 GACA 0.00369 GACC 0.00271 GACG 0.00079 GACT 0.00307 GAGA 0.00598 GAGC 0.00375 GAGG 0.00619 GAGT 0.00374 GATA 0.00244 GATC 0.00274 GATG 0.0035 GATT 0.00368 GCAA 0.00374 GCAC 0.00335 GCAG 0.00533 GCAT 0.00317 GCCA 0.00487 GCCC 0.00405 GCCG 0.00136 GCCT 0.00576 GCGA 0.00084 GCGC 0.00124 GCGG 0.00146 GCGT 0.000884 GCTA 0.00264 GCTC 0.00375 GCTG 0.00584 GCTT 0.00368 GGAA 0.00499 GGAC 0.00261 GGAG 0.00641 GGAT 0.00343 GGCA 0.00477 GGCC 0.0042 GGCG 0.00186 GGCT 0.00521 GGGA 0.0055 GGGC 0.00405 GGGG 0.0044 GGGT 0.00359 GGTA 0.00216 GGTC 0.00271 GGTG 0.00478 GGTT 0.00339 GTAA 0.0031 GTAC 0.00159 GTAG 0.00268 GTAT 0.00274 GTCA 0.00312 GTCC 0.00262 GTCG 0.000519 GTCT 0.00401 GTGA 0.00449 GTGC 0.00335 GTGG 0.00491 GTGT 0.00395 GTTA 0.00243 GTTC 0.00291 GTTG 0.00315 GTTT 0.00499 TAAA 0.00645 TAAC 0.00243 TAAG 0.00313 TAAT 0.00465 TACA 0.00422 TACC 0.00216 TACG 0.000446 TACT 0.00329 TAGA 0.00346 TAGC 0.00263 TAGG 0.00276 TAGT 0.0028 TATA 0.00419 TATC 0.00244 TATG 0.00316 TATT 0.00558 TCAA 0.00449 TCAC 0.00449 TCAG 0.00528 TCAT 0.00428 TCCA 0.00502 TCCC 0.0055 TCCG 0.000959 TCCT 0.00596 TCGA 0.000669 TCGC 0.00084 TCGG 0.00095 TCGT 0.00065 TCTA 0.00346 TCTC 0.00598 TCTG 0.00571 TCTT 0.00589 TGAA 0.00546 TGAC 0.00312 TGAG 0.00604 TGAT 0.00392 TGCA 0.00514 TGCC 0.00477 TGCG 0.000875 TGCT 0.00479 TGGA 0.00502 TGGC 0.00487 TGGG 0.00657 TGGT 0.00438 TGTA 0.00422 TGTC 0.00369 TGTG 0.00552 TGTT 0.00532 TTAA 0.00515 TTAC 0.0031 TTAG 0.00346 TTAT 0.00496 TTCA 0.00546 TTCC 0.00499 TTCG 0.000675 TTCT 0.00673 TTGA 0.00449 TTGC 0.00374 TTGG 0.00456 TTGT 0.00486 TTTA 0.00645 TTTC 0.0064 TTTG 0.00646 TTTT 0.0142 # l= 4 # Values AAAAA 0.0069 AAAAC 0.00181 AAAAG 0.00219 AAAAT 0.00329 AAACA 0.00202 AAACC 0.00123 AAACG 0.00025 AAACT 0.00149 AAAGA 0.00217 AAAGC 0.00117 AAAGG 0.00147 AAAGT 0.0016 AAATA 0.00261 AAATC 0.00119 AAATG 0.00193 AAATT 0.00217 AACAA 0.00166 AACAC 0.000989 AACAG 0.00128 AACAT 0.00139 AACCA 0.00105 AACCC 0.00106 AACCG 0.00015 AACCT 0.00113 AACGA 0.000164 AACGC 0.000147 AACGG 0.000161 AACGT 0.000205 AACTA 0.0008 AACTC 0.00108 AACTG 0.00109 AACTT 0.00113 AAGAA 0.00216 AAGAC 0.00108 AAGAG 0.00146 AAGAT 0.0012 AAGCA 0.00137 AAGCC 0.000986 AAGCG 0.000261 AAGCT 0.00106 AAGGA 0.00155 AAGGC 0.00104 AAGGG 0.00116 AAGGT 0.00095 AAGTA 0.00102 AAGTC 0.000841 AAGTG 0.00146 AAGTT 0.00113 AATAA 0.00206 AATAC 0.00104 AATAG 0.000947 AATAT 0.00154 AATCA 0.00117 AATCC 0.00117 AATCG 0.000189 AATCT 0.00115 AATGA 0.00141 AATGC 0.000907 AATGG 0.00117 AATGT 0.00131 AATTA 0.00159 AATTC 0.00113 AATTG 0.000992 AATTT 0.00217 ACAAA 0.00209 ACAAC 0.000752 ACAAG 0.001 ACAAT 0.00102 ACACA 0.00176 ACACC 0.000941 ACACG 0.000274 ACACT 0.000977 ACAGA 0.00171 ACAGC 0.00105 ACAGG 0.00167 ACAGT 0.0011 ACATA 0.00107 ACATC 0.000782 ACATG 0.00123 ACATT 0.00131 ACCAA 0.000972 ACCAC 0.00114 ACCAG 0.00115 ACCAT 0.00112 ACCCA 0.00126 ACCCC 0.00101 ACCCG 0.000319 ACCCT 0.001 ACCGA 0.000143 ACCGC 0.000237 ACCGG 0.000162 ACCGT 0.000203 ACCTA 0.000633 ACCTC 0.00137 ACCTG 0.00137 ACCTT 0.00095 ACGAA 0.000169 ACGAC 0.000105 ACGAG 0.000219 ACGAT 0.000157 ACGCA 0.000198 ACGCC 0.000411 ACGCG 8.58e-05 ACGCT 0.000188 ACGGA 0.000232 ACGGC 0.000181 ACGGG 0.000295 ACGGT 0.000203 ACGTA 0.000154 ACGTC 0.00016 ACGTG 0.000316 ACGTT 0.000205 ACTAA 0.00091 ACTAC 0.000612 ACTAG 0.000542 ACTAT 0.000732 ACTCA 0.00107 ACTCC 0.00133 ACTCG 0.000225 ACTCT 0.00111 ACTGA 0.00108 ACTGC 0.00128 ACTGG 0.00104 ACTGT 0.0011 ACTTA 0.00081 ACTTC 0.000979 ACTTG 0.00106 ACTTT 0.0016 AGAAA 0.00263 AGAAC 0.000977 AGAAG 0.00158 AGAAT 0.00154 AGACA 0.00148 AGACC 0.00104 AGACG 0.000354 AGACT 0.00113 AGAGA 0.0021 AGAGC 0.00112 AGAGG 0.00159 AGAGT 0.00111 AGATA 0.000965 AGATC 0.000899 AGATG 0.00137 AGATT 0.00115 AGCAA 0.00133 AGCAC 0.00105 AGCAG 0.00143 AGCAT 0.000981 AGCCA 0.0017 AGCCC 0.00115 AGCCG 0.000416 AGCCT 0.00195 AGCGA 0.000313 AGCGC 0.000226 AGCGG 0.000259 AGCGT 0.000188 AGCTA 0.00104 AGCTC 0.00109 AGCTG 0.00172 AGCTT 0.00106 AGGAA 0.00188 AGGAC 0.000868 AGGAG 0.00211 AGGAT 0.00111 AGGCA 0.00189 AGGCC 0.00128 AGGCG 0.000642 AGGCT 0.00195 AGGGA 0.00152 AGGGC 0.00104 AGGGG 0.00121 AGGGT 0.001 AGGTA 0.000762 AGGTC 0.000888 AGGTG 0.00154 AGGTT 0.00113 AGTAA 0.000946 AGTAC 0.000503 AGTAG 0.00107 AGTAT 0.000767 AGTCA 0.000966 AGTCC 0.000845 AGTCG 0.000134 AGTCT 0.00113 AGTGA 0.00158 AGTGC 0.00115 AGTGG 0.00134 AGTGT 0.000977 AGTTA 0.000811 AGTTC 0.000978 AGTTG 0.000819 AGTTT 0.00149 ATAAA 0.00213 ATAAC 0.000655 ATAAG 0.000817 ATAAT 0.00135 ATACA 0.00129 ATACC 0.000553 ATACG 0.00013 ATACT 0.000767 ATAGA 0.000908 ATAGC 0.00059 ATAGG 0.000654 ATAGT 0.000732 ATATA 0.00161 ATATC 0.000679 ATATG 0.000971 ATATT 0.00154 ATCAA 0.000913 ATCAC 0.00107 ATCAG 0.000919 ATCAT 0.00102 ATCCA 0.00103 ATCCC 0.00111 ATCCG 0.000181 ATCCT 0.00111 ATCGA 0.000127 ATCGC 0.000237 ATCGG 0.000107 ATCGT 0.000157 ATCTA 0.000747 ATCTC 0.00131 ATCTG 0.00113 ATCTT 0.0012 ATGAA 0.00141 ATGAC 0.000712 ATGAG 0.00114 ATGAT 0.00102 ATGCA 0.00103 ATGCC 0.001 ATGCG 0.000152 ATGCT 0.000981 ATGGA 0.00118 ATGGC 0.000919 ATGGG 0.00107 ATGGT 0.00112 ATGTA 0.00101 ATGTC 0.000787 ATGTG 0.00122 ATGTT 0.00139 ATTAA 0.00132 ATTAC 0.00102 ATTAG 0.000963 ATTAT 0.00135 ATTCA 0.00125 ATTCC 0.000996 ATTCG 0.000128 ATTCT 0.00154 ATTGA 0.000862 ATTGC 0.00086 ATTGG 0.00074 ATTGT 0.00102 ATTTA 0.00173 ATTTC 0.00149 ATTTG 0.0014 ATTTT 0.00329 CAAAA 0.00241 CAAAC 0.00108 CAAAG 0.00157 CAAAT 0.0014 CAACA 0.00133 CAACC 0.000844 CAACG 0.000154 CAACT 0.000819 CAAGA 0.00137 CAAGC 0.000958 CAAGG 0.00117 CAAGT 0.00106 CAATA 0.00088 CAATC 0.000707 CAATG 0.000905 CAATT 0.000992 CACAA 0.00114 CACAC 0.00157 CACAG 0.00159 CACAT 0.00122 CACCA 0.00163 CACCC 0.00127 CACCG 0.000345 CACCT 0.00154 CACGA 0.000248 CACGC 0.000477 CACGG 0.000323 CACGT 0.000316 CACTA 0.00067 CACTC 0.00116 CACTG 0.00175 CACTT 0.00146 CAGAA 0.00168 CAGAC 0.000954 CAGAG 0.00194 CAGAT 0.00113 CAGCA 0.00162 CAGCC 0.00217 CAGCG 0.000322 CAGCT 0.00172 CAGGA 0.00209 CAGGC 0.00212 CAGGG 0.00159 CAGGT 0.00137 CAGTA 0.000799 CAGTC 0.000868 CAGTG 0.00175 CAGTT 0.00109 CATAA 0.000902 CATAC 0.000581 CATAG 0.000709 CATAT 0.000971 CATCA 0.00102 CATCC 0.000956 CATCG 0.00015 CATCT 0.00137 CATGA 0.0011 CATGC 0.00106 CATGG 0.00126 CATGT 0.00123 CATTA 0.000886 CATTC 0.00108 CATTG 0.000905 CATTT 0.00193 CCAAA 0.00159 CCAAC 0.000899 CCAAG 0.00133 CCAAT 0.00074 CCACA 0.00137 CCACC 0.00179 CCACG 0.000411 CCACT 0.00134 CCAGA 0.00139 CCAGC 0.00226 CCAGG 0.0024 CCAGT 0.00104 CCATA 0.000685 CCATC 0.00117 CCATG 0.00126 CCATT 0.00117 CCCAA 0.00142 CCCAC 0.00135 CCCAG 0.00273 CCCAT 0.00107 CCCCA 0.00162 CCCCC 0.00104 CCCCG 0.000534 CCCCT 0.00121 CCCGA 0.000308 CCCGC 0.000535 CCCGG 0.000667 CCCGT 0.000295 CCCTA 0.000665 CCCTC 0.00135 CCCTG 0.00159 CCCTT 0.00116 CCGAA 0.000165 CCGAC 0.000156 CCGAG 0.000523 CCGAT 0.000107 CCGCA 0.000266 CCGCC 0.000693 CCGCG 0.00024 CCGCT 0.000259 CCGGA 0.000244 CCGGC 0.000475 CCGGG 0.000667 CCGGT 0.000162 CCGTA 0.000108 CCGTC 0.000318 CCGTG 0.000323 CCGTT 0.000161 CCTAA 0.000773 CCTAC 0.000568 CCTAG 0.000761 CCTAT 0.000654 CCTCA 0.00174 CCTCC 0.00243 CCTCG 0.000427 CCTCT 0.00159 CCTGA 0.00153 CCTGC 0.00157 CCTGG 0.0024 CCTGT 0.00167 CCTTA 0.000739 CCTTC 0.00132 CCTTG 0.00117 CCTTT 0.00147 CGAAA 0.000195 CGAAC 0.000165 CGAAG 0.000186 CGAAT 0.000128 CGACA 0.00018 CGACC 0.000149 CGACG 5.63e-05 CGACT 0.000134 CGAGA 0.000434 CGAGC 0.0002 CGAGG 0.000427 CGAGT 0.000225 CGATA 8.42e-05 CGATC 0.000204 CGATG 0.00015 CGATT 0.000189 CGCAA 0.000151 CGCAC 0.000241 CGCAG 0.000331 CGCAT 0.000152 CGCCA 0.000399 CGCCC 0.00061 CGCCG 0.000209 CGCCT 0.000642 CGCGA 0.0001 CGCGC 0.000273 CGCGG 0.00024 CGCGT 8.58e-05 CGCTA 0.000106 CGCTC 0.000297 CGCTG 0.000322 CGCTT 0.000261 CGGAA 0.000202 CGGAC 0.000147 CGGAG 0.000429 CGGAT 0.000181 CGGCA 0.000227 CGGCC 0.000505 CGGCG 0.000209 CGGCT 0.000416 CGGGA 0.000459 CGGGC 0.000493 CGGGG 0.000534 CGGGT 0.000319 CGGTA 9.79e-05 CGGTC 0.000151 CGGTG 0.000345 CGGTT 0.00015 CGTAA 0.000121 CGTAC 8e-05 CGTAG 0.000115 CGTAT 0.00013 CGTCA 0.000168 CGTCC 0.000212 CGTCG 5.63e-05 CGTCT 0.000354 CGTGA 0.000387 CGTGC 0.000292 CGTGG 0.000411 CGTGT 0.000274 CGTTA 0.000114 CGTTC 0.000161 CGTTG 0.000154 CGTTT 0.00025 CTAAA 0.00123 CTAAC 0.000544 CTAAG 0.000723 CTAAT 0.000963 CTACA 0.0009 CTACC 0.000595 CTACG 0.000115 CTACT 0.00107 CTAGA 0.000781 CTAGC 0.000539 CTAGG 0.000761 CTAGT 0.000542 CTATA 0.000701 CTATC 0.000526 CTATG 0.000709 CTATT 0.000947 CTCAA 0.00143 CTCAC 0.00147 CTCAG 0.002 CTCAT 0.00114 CTCCA 0.00176 CTCCC 0.00211 CTCCG 0.000429 CTCCT 0.00211 CTCGA 0.000262 CTCGC 0.000283 CTCGG 0.000523 CTCGT 0.000219 CTCTA 0.00105 CTCTC 0.00148 CTCTG 0.00194 CTCTT 0.00146 CTGAA 0.00137 CTGAC 0.000996 CTGAG 0.002 CTGAT 0.000919 CTGCA 0.00177 CTGCC 0.00179 CTGCG 0.000331 CTGCT 0.00143 CTGGA 0.00168 CTGGC 0.00153 CTGGG 0.00273 CTGGT 0.00115 CTGTA 0.00136 CTGTC 0.00131 CTGTG 0.00159 CTGTT 0.00128 CTTAA 0.000978 CTTAC 0.000613 CTTAG 0.000723 CTTAT 0.000817 CTTCA 0.00127 CTTCC 0.00158 CTTCG 0.000186 CTTCT 0.00158 CTTGA 0.00131 CTTGC 0.000924 CTTGG 0.00133 CTTGT 0.001 CTTTA 0.00116 CTTTC 0.00149 CTTTG 0.00157 CTTTT 0.00219 GAAAA 0.0022 GAAAC 0.00122 GAAAG 0.00149 GAAAT 0.00149 GAACA 0.000995 GAACC 0.00078 GAACG 0.000161 GAACT 0.000978 GAAGA 0.00137 GAAGC 0.000947 GAAGG 0.00132 GAAGT 0.000979 GAATA 0.000912 GAATC 0.000784 GAATG 0.00108 GAATT 0.00113 GACAA 0.000858 GACAC 0.000741 GACAG 0.00131 GACAT 0.000787 GACCA 0.000948 GACCC 0.000724 GACCG 0.000151 GACCT 0.000888 GACGA 0.00014 GACGC 0.000172 GACGG 0.000318 GACGT 0.00016 GACTA 0.000565 GACTC 0.000798 GACTG 0.000868 GACTT 0.000841 GAGAA 0.00172 GAGAC 0.00147 GAGAG 0.00148 GAGAT 0.00131 GAGCA 0.00103 GAGCC 0.00133 GAGCG 0.000297 GAGCT 0.00109 GAGGA 0.00146 GAGGC 0.00201 GAGGG 0.00135 GAGGT 0.00137 GAGTA 0.000707 GAGTC 0.000798 GAGTG 0.00116 GAGTT 0.00108 GATAA 0.000779 GATAC 0.000451 GATAG 0.000526 GATAT 0.000679 GATCA 0.000938 GATCC 0.000699 GATCG 0.000204 GATCT 0.000899 GATGA 0.00092 GATGC 0.00063 GATGG 0.00117 GATGT 0.000782 GATTA 0.001 GATTC 0.000784 GATTG 0.000707 GATTT 0.00119 GCAAA 0.00115 GCAAC 0.000805 GCAAG 0.000924 GCAAT 0.00086 GCACA 0.00106 GCACC 0.000843 GCACG 0.000292 GCACT 0.00115 GCAGA 0.00134 GCAGC 0.00113 GCAGG 0.00157 GCAGT 0.00128 GCATA 0.000569 GCATC 0.00063 GCATG 0.00106 GCATT 0.000907 GCCAA 0.00108 GCCAC 0.00135 GCCAG 0.00153 GCCAT 0.000919 GCCCA 0.00143 GCCCC 0.00108 GCCCG 0.000493 GCCCT 0.00104 GCCGA 0.000345 GCCGC 0.000357 GCCGG 0.000475 GCCGT 0.000181 GCCTA 0.00059 GCCTC 0.00201 GCCTG 0.00212 GCCTT 0.00104 GCGAA 0.00015 GCGAC 0.000171 GCGAG 0.000283 GCGAT 0.000237 GCGCA 0.000252 GCGCC 0.000487 GCGCG 0.000273 GCGCT 0.000226 GCGGA 0.000328 GCGGC 0.000357 GCGGG 0.000535 GCGGT 0.000237 GCGTA 8.69e-05 GCGTC 0.000172 GCGTG 0.000477 GCGTT 0.000147 GCTAA 0.00084 GCTAC 0.000667 GCTAG 0.000539 GCTAT 0.00059 GCTCA 0.00144 GCTCC 0.000984 GCTCG 0.0002 GCTCT 0.00112 GCTGA 0.0014 GCTGC 0.00113 GCTGG 0.00226 GCTGT 0.00105 GCTTA 0.000596 GCTTC 0.000947 GCTTG 0.000958 GCTTT 0.00117 GGAAA 0.00169 GGAAC 0.000729 GGAAG 0.00158 GGAAT 0.000996 GGACA 0.000946 GGACC 0.000612 GGACG 0.000212 GGACT 0.000845 GGAGA 0.00166 GGAGC 0.000984 GGAGG 0.00243 GGAGT 0.00133 GGATA 0.0006 GGATC 0.000699 GGATG 0.000956 GGATT 0.00117 GGCAA 0.00102 GGCAC 0.000958 GGCAG 0.00179 GGCAT 0.001 GGCCA 0.00144 GGCCC 0.000966 GGCCG 0.000505 GGCCT 0.00128 GGCGA 0.000268 GGCGC 0.000487 GGCGG 0.000693 GGCGT 0.000411 GGCTA 0.000723 GGCTC 0.00133 GGCTG 0.00217 GGCTT 0.000986 GGGAA 0.0014 GGGAC 0.000879 GGGAG 0.00211 GGGAT 0.00111 GGGCA 0.00132 GGGCC 0.000966 GGGCG 0.00061 GGGCT 0.00115 GGGGA 0.00127 GGGGC 0.00108 GGGGG 0.00104 GGGGT 0.00101 GGGTA 0.000547 GGGTC 0.000724 GGGTG 0.00127 GGGTT 0.00106 GGTAA 0.000633 GGTAC 0.000381 GGTAG 0.000595 GGTAT 0.000553 GGTCA 0.000908 GGTCC 0.000612 GGTCG 0.000149 GGTCT 0.00104 GGTGA 0.00121 GGTGC 0.000843 GGTGG 0.00179 GGTGT 0.000941 GGTTA 0.000537 GGTTC 0.00078 GGTTG 0.000844 GGTTT 0.00123 GTAAA 0.000985 GTAAC 0.000489 GTAAG 0.000613 GTAAT 0.00102 GTACA 0.000628 GTACC 0.000381 GTACG 8e-05 GTACT 0.000503 GTAGA 0.000836 GTAGC 0.000667 GTAGG 0.000568 GTAGT 0.000612 GTATA 0.000673 GTATC 0.000451 GTATG 0.000581 GTATT 0.00104 GTCAA 0.000642 GTCAC 0.000774 GTCAG 0.000996 GTCAT 0.000712 GTCCA 0.00072 GTCCC 0.000879 GTCCG 0.000147 GTCCT 0.000868 GTCGA 8.77e-05 GTCGC 0.000171 GTCGG 0.000156 GTCGT 0.000105 GTCTA 0.000502 GTCTC 0.00147 GTCTG 0.000954 GTCTT 0.00108 GTGAA 0.00118 GTGAC 0.000774 GTGAG 0.00147 GTGAT 0.00107 GTGCA 0.0011 GTGCC 0.000958 GTGCG 0.000241 GTGCT 0.00105 GTGGA 0.00107 GTGGC 0.00135 GTGGG 0.00135 GTGGT 0.00114 GTGTA 0.000653 GTGTC 0.000741 GTGTG 0.00157 GTGTT 0.000989 GTTAA 0.000739 GTTAC 0.000489 GTTAG 0.000544 GTTAT 0.000655 GTTCA 0.00104 GTTCC 0.000729 GTTCG 0.000165 GTTCT 0.000977 GTTGA 0.000691 GTTGC 0.000805 GTTGG 0.000899 GTTGT 0.000752 GTTTA 0.000875 GTTTC 0.00122 GTTTG 0.00108 GTTTT 0.00181 TAAAA 0.00269 TAAAC 0.000875 TAAAG 0.00116 TAAAT 0.00173 TAACA 0.000966 TAACC 0.000537 TAACG 0.000114 TAACT 0.000811 TAAGA 0.000986 TAAGC 0.000596 TAAGG 0.000739 TAAGT 0.00081 TAATA 0.00118 TAATC 0.001 TAATG 0.000886 TAATT 0.00159 TACAA 0.0012 TACAC 0.000653 TACAG 0.00136 TACAT 0.00101 TACCA 0.000756 TACCC 0.000547 TACCG 9.79e-05 TACCT 0.000762 TACGA 9.7e-05 TACGC 8.69e-05 TACGG 0.000108 TACGT 0.000154 TACTA 0.000761 TACTC 0.000707 TACTG 0.000799 TACTT 0.00102 TAGAA 0.00116 TAGAC 0.000502 TAGAG 0.00105 TAGAT 0.000747 TAGCA 0.000768 TAGCC 0.000723 TAGCG 0.000106 TAGCT 0.00104 TAGGA 0.000867 TAGGC 0.00059 TAGGG 0.000665 TAGGT 0.000633 TAGTA 0.000761 TAGTC 0.000565 TAGTG 0.00067 TAGTT 0.0008 TATAA 0.00121 TATAC 0.000673 TATAG 0.000701 TATAT 0.00161 TATCA 0.000787 TATCC 0.0006 TATCG 8.42e-05 TATCT 0.000965 TATGA 0.000838 TATGC 0.000569 TATGG 0.000685 TATGT 0.00107 TATTA 0.00118 TATTC 0.000912 TATTG 0.00088 TATTT 0.00261 TCAAA 0.00163 TCAAC 0.000691 TCAAG 0.00131 TCAAT 0.000862 TCACA 0.00132 TCACC 0.00121 TCACG 0.000387 TCACT 0.00158 TCAGA 0.00126 TCAGC 0.0014 TCAGG 0.00153 TCAGT 0.00108 TCATA 0.000838 TCATC 0.00092 TCATG 0.0011 TCATT 0.00141 TCCAA 0.00109 TCCAC 0.00107 TCCAG 0.00168 TCCAT 0.00118 TCCCA 0.00226 TCCCC 0.00127 TCCCG 0.000459 TCCCT 0.00152 TCCGA 0.000155 TCCGC 0.000328 TCCGG 0.000244 TCCGT 0.000232 TCCTA 0.000867 TCCTC 0.00146 TCCTG 0.00209 TCCTT 0.00155 TCGAA 0.000191 TCGAC 8.77e-05 TCGAG 0.000262 TCGAT 0.000127 TCGCA 0.000159 TCGCC 0.000268 TCGCG 0.0001 TCGCT 0.000313 TCGGA 0.000155 TCGGC 0.000345 TCGGG 0.000308 TCGGT 0.000143 TCGTA 9.7e-05 TCGTC 0.00014 TCGTG 0.000248 TCGTT 0.000164 TCTAA 0.000933 TCTAC 0.000836 TCTAG 0.000781 TCTAT 0.000908 TCTCA 0.00179 TCTCC 0.00166 TCTCG 0.000434 TCTCT 0.0021 TCTGA 0.00126 TCTGC 0.00134 TCTGG 0.00139 TCTGT 0.00171 TCTTA 0.000986 TCTTC 0.00137 TCTTG 0.00137 TCTTT 0.00217 TGAAA 0.00189 TGAAC 0.00104 TGAAG 0.00127 TGAAT 0.00125 TGACA 0.00108 TGACC 0.000908 TGACG 0.000168 TGACT 0.000966 TGAGA 0.00179 TGAGC 0.00144 TGAGG 0.00174 TGAGT 0.00107 TGATA 0.000787 TGATC 0.000938 TGATG 0.00102 TGATT 0.00117 TGCAA 0.00124 TGCAC 0.0011 TGCAG 0.00177 TGCAT 0.00103 TGCCA 0.00133 TGCCC 0.00132 TGCCG 0.000227 TGCCT 0.00189 TGCGA 0.000159 TGCGC 0.000252 TGCGG 0.000266 TGCGT 0.000198 TGCTA 0.000768 TGCTC 0.00103 TGCTG 0.00162 TGCTT 0.00137 TGGAA 0.00151 TGGAC 0.00072 TGGAG 0.00176 TGGAT 0.00103 TGGCA 0.00133 TGGCC 0.00144 TGGCG 0.000399 TGGCT 0.0017 TGGGA 0.00226 TGGGC 0.00143 TGGGG 0.00162 TGGGT 0.00126 TGGTA 0.000756 TGGTC 0.000948 TGGTG 0.00163 TGGTT 0.00105 TGTAA 0.0014 TGTAC 0.000628 TGTAG 0.0009 TGTAT 0.00129 TGTCA 0.00108 TGTCC 0.000946 TGTCG 0.00018 TGTCT 0.00148 TGTGA 0.00132 TGTGC 0.00106 TGTGG 0.00137 TGTGT 0.00176 TGTTA 0.000966 TGTTC 0.000995 TGTTG 0.00133 TGTTT 0.00202 TTAAA 0.00211 TTAAC 0.000739 TTAAG 0.000978 TTAAT 0.00132 TTACA 0.0014 TTACC 0.000633 TTACG 0.000121 TTACT 0.000946 TTAGA 0.000933 TTAGC 0.00084 TTAGG 0.000773 TTAGT 0.00091 TTATA 0.00121 TTATC 0.000779 TTATG 0.000902 TTATT 0.00206 TTCAA 0.0015 TTCAC 0.00118 TTCAG 0.00137 TTCAT 0.00141 TTCCA 0.00151 TTCCC 0.0014 TTCCG 0.000202 TTCCT 0.00188 TTCGA 0.000191 TTCGC 0.00015 TTCGG 0.000165 TTCGT 0.000169 TTCTA 0.00116 TTCTC 0.00172 TTCTG 0.00168 TTCTT 0.00216 TTGAA 0.0015 TTGAC 0.000642 TTGAG 0.00143 TTGAT 0.000913 TTGCA 0.00124 TTGCC 0.00102 TTGCG 0.000151 TTGCT 0.00133 TTGGA 0.00109 TTGGC 0.00108 TTGGG 0.00142 TTGGT 0.000972 TTGTA 0.0012 TTGTC 0.000858 TTGTG 0.00114 TTGTT 0.00166 TTTAA 0.00211 TTTAC 0.000985 TTTAG 0.00123 TTTAT 0.00213 TTTCA 0.00189 TTTCC 0.00169 TTTCG 0.000195 TTTCT 0.00263 TTTGA 0.00163 TTTGC 0.00115 TTTGG 0.00159 TTTGT 0.00209 TTTTA 0.00269 TTTTC 0.0022 TTTTG 0.00241 TTTTT 0.0069 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4861 AAAAC 0.1276 AAAAG 0.1545 AAAAT 0.2318 AAACA 0.4055 AAACC 0.246 AAACG 0.05002 AAACT 0.2984 AAAGA 0.3383 AAAGC 0.1829 AAAGG 0.2288 AAAGT 0.25 AAATA 0.3301 AAATC 0.1504 AAATG 0.2449 AAATT 0.2745 AACAA 0.3119 AACAC 0.186 AACAG 0.2412 AACAT 0.2609 AACCA 0.3108 AACCC 0.3116 AACCG 0.0442 AACCT 0.3334 AACGA 0.2424 AACGC 0.2171 AACGG 0.2378 AACGT 0.3027 AACTA 0.1953 AACTC 0.2627 AACTG 0.2654 AACTT 0.2766 AAGAA 0.3662 AAGAC 0.1831 AAGAG 0.2477 AAGAT 0.2031 AAGCA 0.373 AAGCC 0.2684 AAGCG 0.07114 AAGCT 0.2875 AAGGA 0.3287 AAGGC 0.2218 AAGGG 0.2474 AAGGT 0.202 AAGTA 0.2292 AAGTC 0.1889 AAGTG 0.3274 AAGTT 0.2545 AATAA 0.3694 AATAC 0.1855 AATAG 0.1697 AATAT 0.2754 AATCA 0.3177 AATCC 0.3186 AATCG 0.05133 AATCT 0.3124 AATGA 0.2942 AATGC 0.1885 AATGG 0.2439 AATGT 0.2733 AATTA 0.2696 AATTC 0.1929 AATTG 0.1686 AATTT 0.3688 ACAAA 0.4293 ACAAC 0.1547 ACAAG 0.2057 ACAAT 0.2103 ACACA 0.4452 ACACC 0.2382 ACACG 0.06927 ACACT 0.2474 ACAGA 0.3099 ACAGC 0.1896 ACAGG 0.3011 ACAGT 0.1994 ACATA 0.2433 ACATC 0.1776 ACATG 0.2804 ACATT 0.2987 ACCAA 0.2218 ACCAC 0.2605 ACCAG 0.2632 ACCAT 0.2546 ACCCA 0.3512 ACCCC 0.281 ACCCG 0.08876 ACCCT 0.279 ACCGA 0.1919 ACCGC 0.3186 ACCGG 0.2174 ACCGT 0.2722 ACCTA 0.1464 ACCTC 0.3167 ACCTG 0.3173 ACCTT 0.2196 ACGAA 0.2597 ACGAC 0.1619 ACGAG 0.3373 ACGAT 0.2411 ACGCA 0.2243 ACGCC 0.4654 ACGCG 0.0971 ACGCT 0.2131 ACGGA 0.255 ACGGC 0.1991 ACGGG 0.3235 ACGGT 0.2224 ACGTA 0.1847 ACGTC 0.1915 ACGTG 0.3781 ACGTT 0.2457 ACTAA 0.3255 ACTAC 0.219 ACTAG 0.1938 ACTAT 0.2617 ACTCA 0.2861 ACTCC 0.3566 ACTCG 0.06024 ACTCT 0.2971 ACTGA 0.24 ACTGC 0.2844 ACTGG 0.2307 ACTGT 0.2449 ACTTA 0.1819 ACTTC 0.2199 ACTTG 0.238 ACTTT 0.3602 AGAAA 0.3904 AGAAC 0.1453 AGAAG 0.2352 AGAAT 0.229 AGACA 0.3702 AGACC 0.26 AGACG 0.08838 AGACT 0.2814 AGAGA 0.3546 AGAGC 0.1894 AGAGG 0.2685 AGAGT 0.1875 AGATA 0.2199 AGATC 0.2048 AGATG 0.3131 AGATT 0.2622 AGCAA 0.2775 AGCAC 0.2194 AGCAG 0.2986 AGCAT 0.2045 AGCCA 0.3262 AGCCC 0.2205 AGCCG 0.07983 AGCCT 0.3735 AGCGA 0.3175 AGCGC 0.2295 AGCGG 0.2623 AGCGT 0.1908 AGCTA 0.2117 AGCTC 0.2214 AGCTG 0.3514 AGCTT 0.2154 AGGAA 0.3145 AGGAC 0.1457 AGGAG 0.3539 AGGAT 0.186 AGGCA 0.3279 AGGCC 0.2228 AGGCG 0.1114 AGGCT 0.338 AGGGA 0.3183 AGGGC 0.2172 AGGGG 0.2541 AGGGT 0.2103 AGGTA 0.1763 AGGTC 0.2054 AGGTG 0.357 AGGTT 0.2613 AGTAA 0.2876 AGTAC 0.1531 AGTAG 0.3259 AGTAT 0.2334 AGTCA 0.3145 AGTCC 0.2749 AGTCG 0.04375 AGTCT 0.3669 AGTGA 0.3127 AGTGC 0.2282 AGTGG 0.2652 AGTGT 0.194 AGTTA 0.1979 AGTTC 0.2386 AGTTG 0.1998 AGTTT 0.3637 ATAAA 0.4296 ATAAC 0.1322 ATAAG 0.1649 ATAAT 0.2733 ATACA 0.4705 ATACC 0.202 ATACG 0.04746 ATACT 0.28 ATAGA 0.315 ATAGC 0.2045 ATAGG 0.2267 ATAGT 0.2538 ATATA 0.3352 ATATC 0.1416 ATATG 0.2025 ATATT 0.3207 ATCAA 0.233 ATCAC 0.273 ATCAG 0.2347 ATCAT 0.2593 ATCCA 0.2991 ATCCC 0.3248 ATCCG 0.05266 ATCCT 0.3234 ATCGA 0.2029 ATCGC 0.3773 ATCGG 0.1701 ATCGT 0.2497 ATCTA 0.1702 ATCTC 0.299 ATCTG 0.2579 ATCTT 0.2728 ATGAA 0.3289 ATGAC 0.1664 ATGAG 0.2673 ATGAT 0.2374 ATGCA 0.326 ATGCC 0.3166 ATGCG 0.04788 ATGCT 0.3095 ATGGA 0.2754 ATGGC 0.2146 ATGGG 0.2494 ATGGT 0.2606 ATGTA 0.2291 ATGTC 0.1788 ATGTG 0.2769 ATGTT 0.3152 ATTAA 0.2835 ATTAC 0.2185 ATTAG 0.2069 ATTAT 0.2911 ATTCA 0.3192 ATTCC 0.2545 ATTCG 0.03274 ATTCT 0.3935 ATTGA 0.2474 ATTGC 0.2467 ATTGG 0.2125 ATTGT 0.2933 ATTTA 0.2185 ATTTC 0.1882 ATTTG 0.1768 ATTTT 0.4165 CAAAA 0.3725 CAAAC 0.1677 CAAAG 0.2436 CAAAT 0.2163 CAACA 0.4228 CAACC 0.2682 CAACG 0.04889 CAACT 0.2602 CAAGA 0.3004 CAAGC 0.2102 CAAGG 0.2569 CAAGT 0.2325 CAATA 0.2527 CAATC 0.2028 CAATG 0.2598 CAATT 0.2847 CACAA 0.2069 CACAC 0.2841 CACAG 0.288 CACAT 0.221 CACCA 0.3403 CACCC 0.2648 CACCG 0.07218 CACCT 0.3228 CACGA 0.182 CACGC 0.3498 CACGG 0.2368 CACGT 0.2314 CACTA 0.1329 CACTC 0.2302 CACTG 0.3475 CACTT 0.2893 CAGAA 0.295 CAGAC 0.167 CAGAG 0.3399 CAGAT 0.1981 CAGCA 0.2778 CAGCC 0.3719 CAGCG 0.05518 CAGCT 0.2952 CAGGA 0.2919 CAGGC 0.2953 CAGGG 0.2214 CAGGT 0.1914 CAGTA 0.1773 CAGTC 0.1927 CAGTG 0.3886 CAGTT 0.2413 CATAA 0.2853 CATAC 0.1836 CATAG 0.2242 CATAT 0.3068 CATCA 0.2919 CATCC 0.273 CATCG 0.04272 CATCT 0.3923 CATGA 0.2372 CATGC 0.2281 CATGG 0.2696 CATGT 0.2651 CATTA 0.1843 CATTC 0.2252 CATTG 0.1882 CATTT 0.4024 CCAAA 0.3488 CCAAC 0.1972 CCAAG 0.2916 CCAAT 0.1624 CCACA 0.279 CCACC 0.3653 CCACG 0.08375 CCACT 0.2719 CCAGA 0.1963 CCAGC 0.3183 CCAGG 0.3387 CCAGT 0.1467 CCATA 0.1599 CCATC 0.2732 CCATG 0.2931 CCATT 0.2739 CCCAA 0.216 CCCAC 0.2061 CCCAG 0.4153 CCCAT 0.1626 CCCCA 0.3676 CCCCC 0.2355 CCCCG 0.1214 CCCCT 0.2755 CCCGA 0.1705 CCCGC 0.2965 CCCGG 0.3698 CCCGT 0.1632 CCCTA 0.1395 CCCTC 0.2835 CCCTG 0.3331 CCCTT 0.244 CCGAA 0.1733 CCGAC 0.1639 CCGAG 0.5504 CCGAT 0.1124 CCGCA 0.1823 CCGCC 0.4754 CCGCG 0.1647 CCGCT 0.1776 CCGGA 0.1576 CCGGC 0.3067 CCGGG 0.4312 CCGGT 0.1045 CCGTA 0.119 CCGTC 0.3492 CCGTG 0.3547 CCGTT 0.177 CCTAA 0.2805 CCTAC 0.206 CCTAG 0.2763 CCTAT 0.2372 CCTCA 0.2807 CCTCC 0.393 CCTCG 0.06906 CCTCT 0.2572 CCTGA 0.2138 CCTGC 0.2191 CCTGG 0.3348 CCTGT 0.2324 CCTTA 0.1573 CCTTC 0.2814 CCTTG 0.2491 CCTTT 0.3123 CGAAA 0.2892 CGAAC 0.2446 CGAAG 0.2762 CGAAT 0.19 CGACA 0.3461 CGACC 0.2867 CGACG 0.1083 CGACT 0.2589 CGAGA 0.3371 CGAGC 0.1556 CGAGG 0.3321 CGAGT 0.1752 CGATA 0.1343 CGATC 0.3259 CGATG 0.2385 CGATT 0.3013 CGCAA 0.1722 CGCAC 0.2756 CGCAG 0.3788 CGCAT 0.1734 CGCCA 0.2148 CGCCC 0.3279 CGCCG 0.1122 CGCCT 0.3451 CGCGA 0.1432 CGCGC 0.3903 CGCGG 0.3437 CGCGT 0.1228 CGCTA 0.1076 CGCTC 0.3009 CGCTG 0.3264 CGCTT 0.265 CGGAA 0.2105 CGGAC 0.1538 CGGAG 0.4475 CGGAT 0.1882 CGGCA 0.1675 CGGCC 0.3723 CGGCG 0.1537 CGGCT 0.3066 CGGGA 0.2542 CGGGC 0.2733 CGGGG 0.2958 CGGGT 0.1767 CGGTA 0.1315 CGGTC 0.2034 CGGTG 0.4638 CGGTT 0.2013 CGTAA 0.2715 CGTAC 0.1791 CGTAG 0.2582 CGTAT 0.2913 CGTCA 0.2122 CGTCC 0.2687 CGTCG 0.07116 CGTCT 0.448 CGTGA 0.2839 CGTGC 0.2139 CGTGG 0.3016 CGTGT 0.2006 CGTTA 0.1676 CGTTC 0.2371 CGTTG 0.2269 CGTTT 0.3684 CTAAA 0.3548 CTAAC 0.1574 CTAAG 0.2093 CTAAT 0.2785 CTACA 0.3357 CTACC 0.2219 CTACG 0.04297 CTACT 0.3995 CTAGA 0.2978 CTAGC 0.2054 CTAGG 0.2902 CTAGT 0.2066 CTATA 0.243 CTATC 0.1826 CTATG 0.246 CTATT 0.3284 CTCAA 0.237 CTCAC 0.2429 CTCAG 0.3307 CTCAT 0.1894 CTCCA 0.2748 CTCCC 0.3289 CTCCG 0.06699 CTCCT 0.3293 CTCGA 0.2038 CTCGC 0.2197 CTCGG 0.4062 CTCGT 0.1703 CTCTA 0.1764 CTCTC 0.2497 CTCTG 0.3275 CTCTT 0.2463 CTGAA 0.2588 CTGAC 0.1887 CTGAG 0.3783 CTGAT 0.1741 CTGCA 0.3324 CTGCC 0.3366 CTGCG 0.0622 CTGCT 0.2689 CTGGA 0.2367 CTGGC 0.2157 CTGGG 0.3848 CTGGT 0.1628 CTGTA 0.2453 CTGTC 0.2358 CTGTG 0.2871 CTGTT 0.2317 CTTAA 0.3124 CTTAC 0.1958 CTTAG 0.231 CTTAT 0.2609 CTTCA 0.2752 CTTCC 0.3418 CTTCG 0.04035 CTTCT 0.3427 CTTGA 0.2863 CTTGC 0.2026 CTTGG 0.2917 CTTGT 0.2194 CTTTA 0.1812 CTTTC 0.2318 CTTTG 0.2452 CTTTT 0.3418 GAAAA 0.3441 GAAAC 0.1913 GAAAG 0.2323 GAAAT 0.2323 GAACA 0.3414 GAACC 0.2678 GAACG 0.0552 GAACT 0.3356 GAAGA 0.2963 GAAGC 0.2051 GAAGG 0.2865 GAAGT 0.2121 GAATA 0.2331 GAATC 0.2004 GAATG 0.2766 GAATT 0.2899 GACAA 0.2324 GACAC 0.2009 GACAG 0.3535 GACAT 0.2132 GACCA 0.3496 GACCC 0.2669 GACCG 0.05586 GACCT 0.3276 GACGA 0.1772 GACGC 0.218 GACGG 0.4024 GACGT 0.2024 GACTA 0.1839 GACTC 0.2598 GACTG 0.2826 GACTT 0.2737 GAGAA 0.2873 GAGAC 0.2459 GAGAG 0.2474 GAGAT 0.2193 GAGCA 0.2757 GAGCC 0.3555 GAGCG 0.0792 GAGCT 0.2896 GAGGA 0.2355 GAGGC 0.3248 GAGGG 0.2184 GAGGT 0.2213 GAGTA 0.1889 GAGTC 0.2134 GAGTG 0.31 GAGTT 0.2876 GATAA 0.3199 GATAC 0.1852 GATAG 0.2161 GATAT 0.2787 GATCA 0.3424 GATCC 0.2551 GATCG 0.0746 GATCT 0.3279 GATGA 0.2628 GATGC 0.1798 GATGG 0.3341 GATGT 0.2232 GATTA 0.2721 GATTC 0.2131 GATTG 0.1919 GATTT 0.3229 GCAAA 0.3083 GCAAC 0.2151 GCAAG 0.2469 GCAAT 0.2298 GCACA 0.3174 GCACC 0.2519 GCACG 0.08721 GCACT 0.3435 GCAGA 0.2522 GCAGC 0.2122 GCAGG 0.295 GCAGT 0.2406 GCATA 0.1797 GCATC 0.1988 GCATG 0.3354 GCATT 0.2862 GCCAA 0.2211 GCCAC 0.2765 GCCAG 0.3137 GCCAT 0.1886 GCCCA 0.3543 GCCCC 0.2678 GCCCG 0.1219 GCCCT 0.2559 GCCGA 0.2538 GCCGC 0.2629 GCCGG 0.3497 GCCGT 0.1336 GCCTA 0.1024 GCCTC 0.349 GCCTG 0.3676 GCCTT 0.181 GCGAA 0.1783 GCGAC 0.2032 GCGAG 0.3366 GCGAT 0.2819 GCGCA 0.2034 GCGCC 0.3936 GCGCG 0.2202 GCGCT 0.1829 GCGGA 0.2253 GCGGC 0.2449 GCGGG 0.3671 GCGGT 0.1627 GCGTA 0.09835 GCGTC 0.195 GCGTG 0.54 GCGTT 0.1666 GCTAA 0.3187 GCTAC 0.2532 GCTAG 0.2044 GCTAT 0.2238 GCTCA 0.3849 GCTCC 0.2624 GCTCG 0.05339 GCTCT 0.2993 GCTGA 0.2403 GCTGC 0.1935 GCTGG 0.3864 GCTGT 0.1797 GCTTA 0.1623 GCTTC 0.2577 GCTTG 0.2607 GCTTT 0.3193 GGAAA 0.338 GGAAC 0.146 GGAAG 0.3163 GGAAT 0.1997 GGACA 0.3618 GGACC 0.234 GGACG 0.08121 GGACT 0.323 GGAGA 0.2586 GGAGC 0.1536 GGAGG 0.3796 GGAGT 0.2082 GGATA 0.1751 GGATC 0.2039 GGATG 0.2789 GGATT 0.3421 GGCAA 0.213 GGCAC 0.2009 GGCAG 0.3758 GGCAT 0.2103 GGCCA 0.3435 GGCCC 0.2302 GGCCG 0.1204 GGCCT 0.3059 GGCGA 0.1439 GGCGC 0.2621 GGCGG 0.3727 GGCGT 0.2212 GGCTA 0.1386 GGCTC 0.2557 GGCTG 0.4165 GGCTT 0.1892 GGGAA 0.2546 GGGAC 0.1598 GGGAG 0.3831 GGGAT 0.2025 GGGCA 0.3265 GGGCC 0.2387 GGGCG 0.1507 GGGCT 0.2841 GGGGA 0.2885 GGGGC 0.2465 GGGGG 0.2354 GGGGT 0.2296 GGGTA 0.1521 GGGTC 0.2014 GGGTG 0.3525 GGGTT 0.294 GGTAA 0.2926 GGTAC 0.1762 GGTAG 0.2753 GGTAT 0.2559 GGTCA 0.3349 GGTCC 0.2258 GGTCG 0.05492 GGTCT 0.3844 GGTGA 0.252 GGTGC 0.1762 GGTGG 0.3751 GGTGT 0.1967 GGTTA 0.1584 GGTTC 0.2302 GGTTG 0.2489 GGTTT 0.3625 GTAAA 0.3174 GTAAC 0.1575 GTAAG 0.1975 GTAAT 0.3276 GTACA 0.3946 GTACC 0.2393 GTACG 0.05021 GTACT 0.3159 GTAGA 0.3115 GTAGC 0.2487 GTAGG 0.2116 GTAGT 0.2282 GTATA 0.2455 GTATC 0.1647 GTATG 0.212 GTATT 0.3778 GTCAA 0.2055 GTCAC 0.2478 GTCAG 0.3188 GTCAT 0.2279 GTCCA 0.2754 GTCCC 0.3361 GTCCG 0.05641 GTCCT 0.3321 GTCGA 0.169 GTCGC 0.3286 GTCGG 0.2998 GTCGT 0.2026 GTCTA 0.1254 GTCTC 0.3672 GTCTG 0.238 GTCTT 0.2694 GTGAA 0.2631 GTGAC 0.1723 GTGAG 0.3266 GTGAT 0.238 GTGCA 0.3273 GTGCC 0.2864 GTGCG 0.07202 GTGCT 0.3144 GTGGA 0.2176 GTGGC 0.2743 GTGGG 0.2756 GTGGT 0.2325 GTGTA 0.1654 GTGTC 0.1877 GTGTG 0.3967 GTGTT 0.2502 GTTAA 0.3046 GTTAC 0.2014 GTTAG 0.2241 GTTAT 0.2699 GTTCA 0.3578 GTTCC 0.2501 GTTCG 0.05664 GTTCT 0.3355 GTTGA 0.2195 GTTGC 0.2557 GTTGG 0.2858 GTTGT 0.2389 GTTTA 0.1752 GTTTC 0.2452 GTTTG 0.2169 GTTTT 0.3628 TAAAA 0.4165 TAAAC 0.1356 TAAAG 0.1802 TAAAT 0.2677 TAACA 0.398 TAACC 0.2212 TAACG 0.0468 TAACT 0.334 TAAGA 0.3149 TAAGC 0.1904 TAAGG 0.2361 TAAGT 0.2586 TAATA 0.2533 TAATC 0.2153 TAATG 0.1905 TAATT 0.3409 TACAA 0.2849 TACAC 0.1547 TACAG 0.3216 TACAT 0.2388 TACCA 0.3496 TACCC 0.2527 TACCG 0.04525 TACCT 0.3524 TACGA 0.2172 TACGC 0.1946 TACGG 0.2428 TACGT 0.3454 TACTA 0.2315 TACTC 0.215 TACTG 0.2431 TACTT 0.3104 TAGAA 0.3365 TAGAC 0.1452 TAGAG 0.3024 TAGAT 0.2159 TAGCA 0.2915 TAGCC 0.2742 TAGCG 0.04031 TAGCT 0.394 TAGGA 0.3148 TAGGC 0.2142 TAGGG 0.2413 TAGGT 0.2298 TAGTA 0.2722 TAGTC 0.2021 TAGTG 0.2395 TAGTT 0.2862 TATAA 0.2892 TATAC 0.1605 TATAG 0.1671 TATAT 0.3832 TATCA 0.3229 TATCC 0.2464 TATCG 0.03457 TATCT 0.3961 TATGA 0.265 TATGC 0.1799 TATGG 0.2165 TATGT 0.3386 TATTA 0.2112 TATTC 0.1635 TATTG 0.1578 TATTT 0.4675 TCAAA 0.363 TCAAC 0.154 TCAAG 0.2909 TCAAT 0.1921 TCACA 0.2949 TCACC 0.2683 TCACG 0.08621 TCACT 0.3507 TCAGA 0.239 TCAGC 0.2658 TCAGG 0.2904 TCAGT 0.2048 TCATA 0.1959 TCATC 0.2151 TCATG 0.2582 TCATT 0.3307 TCCAA 0.2175 TCCAC 0.213 TCCAG 0.3344 TCCAT 0.2351 TCCCA 0.4101 TCCCC 0.2306 TCCCG 0.08341 TCCCT 0.2759 TCCGA 0.1612 TCCGC 0.3423 TCCGG 0.2543 TCCGT 0.2422 TCCTA 0.1454 TCCTC 0.2444 TCCTG 0.351 TCCTT 0.2592 TCGAA 0.2863 TCGAC 0.1312 TCGAG 0.3921 TCGAT 0.1903 TCGCA 0.1892 TCGCC 0.3186 TCGCG 0.1191 TCGCT 0.373 TCGGA 0.1628 TCGGC 0.3628 TCGGG 0.324 TCGGT 0.1504 TCGTA 0.1492 TCGTC 0.2156 TCGTG 0.3822 TCGTT 0.2529 TCTAA 0.2699 TCTAC 0.2417 TCTAG 0.2258 TCTAT 0.2626 TCTCA 0.2992 TCTCC 0.2769 TCTCG 0.07251 TCTCT 0.3514 TCTGA 0.2209 TCTGC 0.2352 TCTGG 0.2437 TCTGT 0.3003 TCTTA 0.1673 TCTTC 0.2321 TCTTG 0.2323 TCTTT 0.3683 TGAAA 0.3471 TGAAC 0.191 TGAAG 0.2329 TGAAT 0.229 TGACA 0.3464 TGACC 0.2906 TGACG 0.05368 TGACT 0.3093 TGAGA 0.2963 TGAGC 0.2389 TGAGG 0.2876 TGAGT 0.1772 TGATA 0.2008 TGATC 0.2395 TGATG 0.261 TGATT 0.2986 TGCAA 0.242 TGCAC 0.213 TGCAG 0.3442 TGCAT 0.2008 TGCCA 0.2793 TGCCC 0.277 TGCCG 0.04768 TGCCT 0.396 TGCGA 0.1817 TGCGC 0.2879 TGCGG 0.3038 TGCGT 0.2266 TGCTA 0.1602 TGCTC 0.2156 TGCTG 0.3382 TGCTT 0.2859 TGGAA 0.3013 TGGAC 0.1435 TGGAG 0.3509 TGGAT 0.2044 TGGCA 0.2733 TGGCC 0.2958 TGGCG 0.08194 TGGCT 0.3489 TGGGA 0.3434 TGGGC 0.2183 TGGGG 0.2461 TGGGT 0.1922 TGGTA 0.1724 TGGTC 0.2161 TGGTG 0.3712 TGGTT 0.2402 TGTAA 0.3325 TGTAC 0.1488 TGTAG 0.2133 TGTAT 0.3054 TGTCA 0.2932 TGTCC 0.2563 TGTCG 0.04869 TGTCT 0.4018 TGTGA 0.2402 TGTGC 0.1925 TGTGG 0.2485 TGTGT 0.3188 TGTTA 0.1817 TGTTC 0.1871 TGTTG 0.2503 TGTTT 0.3809 TTAAA 0.4101 TTAAC 0.1436 TTAAG 0.19 TTAAT 0.2563 TTACA 0.4523 TTACC 0.2039 TTACG 0.03906 TTACT 0.3047 TTAGA 0.2701 TTAGC 0.243 TTAGG 0.2236 TTAGT 0.2634 TTATA 0.2447 TTATC 0.1573 TTATG 0.1821 TTATT 0.416 TTCAA 0.275 TTCAC 0.2167 TTCAG 0.2504 TTCAT 0.2579 TTCCA 0.303 TTCCC 0.2807 TTCCG 0.04047 TTCCT 0.3758 TTCGA 0.2838 TTCGC 0.222 TTCGG 0.244 TTCGT 0.2502 TTCTA 0.173 TTCTC 0.2556 TTCTG 0.2505 TTCTT 0.3209 TTGAA 0.3344 TTGAC 0.1431 TTGAG 0.3191 TTGAT 0.2034 TTGCA 0.3326 TTGCC 0.2715 TTGCG 0.04026 TTGCT 0.3556 TTGGA 0.2394 TTGGC 0.2363 TTGGG 0.311 TTGGT 0.2133 TTGTA 0.2474 TTGTC 0.1765 TTGTG 0.2349 TTGTT 0.3412 TTTAA 0.3272 TTTAC 0.1527 TTTAG 0.1901 TTTAT 0.33 TTTCA 0.2958 TTTCC 0.2635 TTTCG 0.03048 TTTCT 0.4102 TTTGA 0.2522 TTTGC 0.1786 TTTGG 0.2462 TTTGT 0.323 TTTTA 0.1893 TTTTC 0.1552 TTTTG 0.1695 TTTTT 0.4861