[1] # (a,c,g,t)= (0.4, 0.1, 0.1, 0.4) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.378 C 0.122 G 0.122 T 0.378 # l= 1 # Values AA 0.154 AC 0.0395 AG 0.0362 AT 0.148 CA 0.0455 CC 0.015 CG 0.0258 CT 0.0362 GA 0.0491 GC 0.0188 GG 0.015 GT 0.0395 TA 0.129 TC 0.0491 TG 0.0455 TT 0.154 # l= 2 # Values AAA 0.068 AAC 0.0141 AAG 0.0149 AAT 0.0566 ACA 0.0168 ACC 0.00398 ACG 0.00813 ACT 0.0105 AGA 0.0164 AGC 0.00461 AGG 0.00462 AGT 0.0105 ATA 0.0587 ATC 0.0163 ATG 0.0166 ATT 0.0566 CAA 0.0173 CAC 0.00667 CAG 0.00491 CAT 0.0166 CCA 0.0051 CCC 0.00231 CCG 0.00295 CCT 0.00462 CGA 0.0101 CGC 0.00453 CGG 0.00295 CGT 0.00814 CTA 0.00966 CTC 0.00669 CTG 0.00491 CTT 0.0149 GAA 0.0212 GAC 0.00492 GAG 0.00669 GAT 0.0163 GCA 0.00716 GCC 0.0025 GCG 0.00452 GCT 0.00462 GGA 0.00618 GGC 0.0025 GGG 0.00231 GGT 0.00398 GTA 0.0137 GTC 0.00492 GTG 0.00667 GTT 0.0142 TAA 0.0471 TAC 0.0137 TAG 0.00966 TAT 0.0588 TCA 0.0164 TCC 0.00618 TCG 0.0102 TCT 0.0164 TGA 0.0164 TGC 0.00716 TGG 0.0051 TGT 0.0169 TTA 0.0471 TTC 0.0212 TTG 0.0173 TTT 0.068 # l= 3 # Values AAAA 0.0311 AAAC 0.00575 AAAG 0.0066 AAAT 0.0246 AACA 0.00605 AACC 0.00134 AACG 0.00291 AACT 0.00385 AAGA 0.00696 AAGC 0.00171 AAGG 0.00178 AAGT 0.00444 AATA 0.0227 AATC 0.00575 AATG 0.00655 AATT 0.0216 ACAA 0.00656 ACAC 0.00233 ACAG 0.00184 ACAT 0.00613 ACCA 0.00143 ACCC 0.000464 ACCG 0.000929 ACCT 0.00116 ACGA 0.00333 ACGC 0.00136 ACGG 0.0009 ACGT 0.00255 ACTA 0.00304 ACTC 0.00144 ACTG 0.0016 ACTT 0.00444 AGAA 0.00755 AGAC 0.00133 AGAG 0.00257 AGAT 0.00495 AGCA 0.00187 AGCC 0.000566 AGCG 0.000998 AGCT 0.00118 AGGA 0.00208 AGGC 0.00062 AGGG 0.000761 AGGT 0.00116 AGTA 0.00374 AGTC 0.00123 AGTG 0.00171 AGTT 0.00385 ATAA 0.0214 ATAC 0.00549 ATAG 0.00421 ATAT 0.0276 ATCA 0.00596 ATCC 0.00175 ATCG 0.00365 ATCT 0.00495 ATGA 0.00631 ATGC 0.00237 ATGG 0.00177 ATGT 0.00613 ATTA 0.0189 ATTC 0.00675 ATTG 0.00643 ATTT 0.0246 CAAA 0.00692 CAAC 0.00202 CAAG 0.00197 CAAT 0.00643 CACA 0.00245 CACC 0.000807 CACG 0.0017 CACT 0.00171 CAGA 0.00186 CAGC 0.000786 CAGG 0.000667 CAGT 0.0016 CATA 0.00568 CATC 0.00231 CATG 0.00205 CATT 0.00655 CCAA 0.00177 CCAC 0.000937 CCAG 0.000621 CCAT 0.00177 CCCA 0.00054 CCCC 0.000549 CCCG 0.000461 CCCT 0.000761 CCGA 0.000969 CCGC 0.000625 CCGG 0.000454 CCGT 0.0009 CCTA 0.00104 CCTC 0.00113 CCTG 0.000667 CCTT 0.00178 CGAA 0.00361 CGAC 0.00121 CGAG 0.00168 CGAT 0.00364 CGCA 0.0013 CGCC 0.000665 CGCG 0.00156 CGCT 0.000997 CGGA 0.000969 CGGC 0.000589 CGGG 0.000461 CGGT 0.000929 CGTA 0.00231 CGTC 0.00121 CGTG 0.00171 CGTT 0.00291 CTAA 0.00319 CTAC 0.00133 CTAG 0.000931 CTAT 0.00421 CTCA 0.00146 CTCC 0.000989 CTCG 0.00168 CTCT 0.00257 CTGA 0.00157 CTGC 0.000885 CTGG 0.000621 CTGT 0.00183 CTTA 0.00373 CTTC 0.0026 CTTG 0.00196 CTTT 0.0066 GAAA 0.00972 GAAC 0.00214 GAAG 0.0026 GAAT 0.00675 GACA 0.00192 GACC 0.000559 GACG 0.00121 GACT 0.00123 GAGA 0.00326 GAGC 0.000858 GAGG 0.00114 GAGT 0.00144 GATA 0.00594 GATC 0.0023 GATG 0.00231 GATT 0.00575 GCAA 0.00275 GCAC 0.00115 GCAG 0.000885 GCAT 0.00237 GCCA 0.000966 GCCC 0.000327 GCCG 0.000589 GCCT 0.00062 GCGA 0.00157 GCGC 0.000971 GCGG 0.000624 GCGT 0.00136 GCTA 0.00126 GCTC 0.000859 GCTG 0.000786 GCTT 0.00172 GGAA 0.0028 GGAC 0.000642 GGAG 0.000989 GGAT 0.00175 GGCA 0.000857 GGCC 0.000414 GGCG 0.000665 GGCT 0.000566 GGGA 0.000971 GGGC 0.000327 GGGG 0.000549 GGGT 0.000464 GGTA 0.00128 GGTC 0.000559 GGTG 0.000808 GGTT 0.00134 GTAA 0.00503 GTAC 0.0019 GTAG 0.00133 GTAT 0.00549 GTCA 0.00174 GTCC 0.000642 GTCG 0.00121 GTCT 0.00133 GTGA 0.00226 GTGC 0.00115 GTGG 0.000937 GTGT 0.00232 GTTA 0.00424 GTTC 0.00214 GTTG 0.00202 GTTT 0.00575 TAAA 0.0203 TAAC 0.00424 TAAG 0.00372 TAAT 0.0189 TACA 0.00642 TACC 0.00128 TACG 0.00231 TACT 0.00374 TAGA 0.00431 TAGC 0.00126 TAGG 0.00105 TAGT 0.00304 TATA 0.0244 TATC 0.00594 TATG 0.00568 TATT 0.0227 TCAA 0.00625 TCAC 0.00226 TCAG 0.00157 TCAT 0.00631 TCCA 0.00216 TCCC 0.000972 TCCG 0.00097 TCCT 0.00208 TCGA 0.00428 TCGC 0.00157 TCGG 0.000969 TCGT 0.00333 TCTA 0.00431 TCTC 0.00326 TCTG 0.00186 TCTT 0.00696 TGAA 0.00724 TGAC 0.00174 TGAG 0.00146 TGAT 0.00596 TGCA 0.00313 TGCC 0.000857 TGCG 0.0013 TGCT 0.00187 TGGA 0.00216 TGGC 0.000966 TGGG 0.00054 TGGT 0.00143 TGTA 0.00642 TGTC 0.00193 TGTG 0.00245 TGTT 0.00605 TTAA 0.0175 TTAC 0.00503 TTAG 0.00319 TTAT 0.0214 TTCA 0.00724 TTCC 0.0028 TTCG 0.00361 TTCT 0.00755 TTGA 0.00625 TTGC 0.00275 TTGG 0.00177 TTGT 0.00656 TTTA 0.0203 TTTC 0.00972 TTTG 0.00691 TTTT 0.0311 # l= 4 # Values AAAAA 0.015 AAAAC 0.00227 AAAAG 0.00292 AAAAT 0.0109 AAACA 0.0025 AAACC 0.000436 AAACG 0.00115 AAACT 0.00167 AAAGA 0.00324 AAAGC 0.000673 AAAGG 0.000766 AAAGT 0.00192 AAATA 0.0102 AAATC 0.00231 AAATG 0.00279 AAATT 0.00924 AACAA 0.00258 AACAC 0.000701 AACAG 0.00066 AACAT 0.00211 AACCA 0.000474 AACCC 0.000138 AACCG 0.000307 AACCT 0.000416 AACGA 0.00129 AACGC 0.000438 AACGG 0.00033 AACGT 0.000856 AACTA 0.00116 AACTC 0.000485 AACTG 0.000566 AACTT 0.00164 AAGAA 0.00348 AAGAC 0.000495 AAGAG 0.000917 AAGAT 0.00207 AAGCA 0.000735 AAGCC 0.00017 AAGCG 0.00036 AAGCT 0.00045 AAGGA 0.000876 AAGGC 0.00021 AAGGG 0.000282 AAGGT 0.000408 AAGTA 0.00168 AAGTC 0.000436 AAGTG 0.000692 AAGTT 0.00164 AATAA 0.0092 AATAC 0.0019 AATAG 0.00168 AATAT 0.00995 AATCA 0.00222 AATCC 0.000558 AATCG 0.00121 AATCT 0.00175 AATGA 0.00265 AATGC 0.000868 AATGG 0.000704 AATGT 0.00232 AATTA 0.00747 AATTC 0.00243 AATTG 0.00247 AATTT 0.00924 ACAAA 0.00277 ACAAC 0.000644 ACAAG 0.000722 ACAAT 0.00243 ACACA 0.000992 ACACC 0.000213 ACACG 0.000591 ACACT 0.000529 ACAGA 0.000736 ACAGC 0.000256 ACAGG 0.000252 ACAGT 0.00059 ACATA 0.0024 ACATC 0.000657 ACATG 0.000751 ACATT 0.00232 ACCAA 0.000524 ACCAC 0.000252 ACCAG 0.00019 ACCAT 0.000466 ACCCA 0.000126 ACCCC 8.93e-05 ACCCG 9.85e-05 ACCCT 0.00015 ACCGA 0.000339 ACCGC 0.000171 ACCGG 0.000155 ACCGT 0.000263 ACCTA 0.000326 ACCTC 0.000226 ACCTG 0.000198 ACCTT 0.000408 ACGAA 0.00127 ACGAC 0.00036 ACGAG 0.000551 ACGAT 0.00115 ACGCA 0.00043 ACGCC 0.000158 ACGCG 0.000485 ACGCT 0.000283 ACGGA 0.000346 ACGGC 0.000152 ACGGG 0.00014 ACGGT 0.000263 ACGTA 0.000838 ACGTC 0.000302 ACGTG 0.000555 ACGTT 0.000856 ACTAA 0.00101 ACTAC 0.000411 ACTAG 0.0003 ACTAT 0.00132 ACTCA 0.000387 ACTCC 0.000163 ACTCG 0.000434 ACTCT 0.000455 ACTGA 0.000545 ACTGC 0.000272 ACTGG 0.000191 ACTGT 0.00059 ACTTA 0.00126 ACTTC 0.000613 ACTTG 0.000651 ACTTT 0.00192 AGAAA 0.00371 AGAAC 0.000599 AGAAG 0.000945 AGAAT 0.0023 AGACA 0.000558 AGACC 0.000118 AGACG 0.000294 AGACT 0.000361 AGAGA 0.00148 AGAGC 0.000246 AGAGG 0.000388 AGAGT 0.000455 AGATA 0.00196 AGATC 0.000558 AGATG 0.000675 AGATT 0.00175 AGCAA 0.00076 AGCAC 0.000263 AGCAG 0.000243 AGCAT 0.000605 AGCCA 0.000226 AGCCC 6.41e-05 AGCCG 0.000127 AGCCT 0.000149 AGCGA 0.000379 AGCGC 0.000184 AGCGG 0.000152 AGCGT 0.000283 AGCTA 0.000333 AGCTC 0.000181 AGCTG 0.000217 AGCTT 0.00045 AGGAA 0.000991 AGGAC 0.000172 AGGAG 0.000342 AGGAT 0.000576 AGGCA 0.000233 AGGCC 8.8e-05 AGGCG 0.000151 AGGCT 0.000149 AGGGA 0.00034 AGGGC 8.76e-05 AGGGG 0.000183 AGGGT 0.00015 AGGTA 0.0004 AGGTC 0.000134 AGGTG 0.00021 AGGTT 0.000416 AGTAA 0.00145 AGTAC 0.000447 AGTAG 0.000423 AGTAT 0.00142 AGTCA 0.000456 AGTCC 0.000126 AGTCG 0.000283 AGTCT 0.000361 AGTGA 0.000665 AGTGC 0.00026 AGTGG 0.000253 AGTGT 0.000529 AGTTA 0.00116 AGTTC 0.00049 AGTTG 0.000536 AGTTT 0.00167 ATAAA 0.00936 ATAAC 0.00172 ATAAG 0.0016 ATAAT 0.00876 ATACA 0.00274 ATACC 0.000446 ATACG 0.000889 ATACT 0.00142 ATAGA 0.00196 ATAGC 0.000496 ATAGG 0.000432 ATAGT 0.00132 ATATA 0.0128 ATATC 0.00238 ATATG 0.00252 ATATT 0.00995 ATCAA 0.00228 ATCAC 0.000765 ATCAG 0.000564 ATCAT 0.00235 ATCCA 0.000637 ATCCC 0.000234 ATCCG 0.0003 ATCCT 0.000576 ATCGA 0.00164 ATCGC 0.000488 ATCGG 0.000367 ATCGT 0.00115 ATCTA 0.0015 ATCTC 0.000795 ATCTG 0.000582 ATCTT 0.00207 ATGAA 0.00285 ATGAC 0.000587 ATGAG 0.000525 ATGAT 0.00235 ATGCA 0.00112 ATGCC 0.000215 ATGCG 0.000432 ATGCT 0.000605 ATGGA 0.000793 ATGGC 0.000333 ATGGG 0.000182 ATGGT 0.000466 ATGTA 0.00265 ATGTC 0.00057 ATGTG 0.000807 ATGTT 0.00211 ATTAA 0.00706 ATTAC 0.00185 ATTAG 0.00122 ATTAT 0.00876 ATTCA 0.00247 ATTCC 0.000784 ATTCG 0.00119 ATTCT 0.0023 ATTGA 0.00241 ATTGC 0.000956 ATTGG 0.000635 ATTGT 0.00243 ATTTA 0.00791 ATTTC 0.0032 ATTTG 0.00251 ATTTT 0.0109 CAAAA 0.00281 CAAAC 0.000761 CAAAG 0.000825 CAAAT 0.00251 CAACA 0.000799 CAACC 0.000223 CAACG 0.000463 CAACT 0.000536 CAAGA 0.000788 CAAGC 0.000274 CAAGG 0.000252 CAAGT 0.000651 CAATA 0.00227 CAATC 0.000792 CAATG 0.000888 CAATT 0.00247 CACAA 0.000836 CACAC 0.000507 CACAG 0.000298 CACAT 0.000807 CACCA 0.000273 CACCC 0.000121 CACCG 0.000204 CACCT 0.00021 CACGA 0.000606 CACGC 0.000339 CACGG 0.000205 CACGT 0.000555 CACTA 0.000419 CACTC 0.000294 CACTG 0.000305 CACTT 0.000692 CAGAA 0.000777 CAGAC 0.000209 CAGAG 0.000294 CAGAT 0.000582 CAGCA 0.000271 CAGCC 0.000132 CAGCG 0.000165 CAGCT 0.000217 CAGGA 0.000255 CAGGC 0.000108 CAGGG 0.000105 CAGGT 0.000198 CAGTA 0.000486 CAGTC 0.000243 CAGTG 0.000305 CAGTT 0.000566 CATAA 0.00198 CATAC 0.000691 CATAG 0.00049 CATAT 0.00252 CATCA 0.000784 CATCC 0.000291 CATCG 0.000556 CATCT 0.000675 CATGA 0.000707 CATGC 0.000354 CATGG 0.00024 CATGT 0.000751 CATTA 0.00192 CATTC 0.000956 CATTG 0.000888 CATTT 0.00279 CCAAA 0.00061 CCAAC 0.000276 CCAAG 0.000246 CCAAT 0.000635 CCACA 0.000229 CCACC 0.000189 CCACG 0.000266 CCACT 0.000253 CCAGA 0.000214 CCAGC 0.000119 CCAGG 9.63e-05 CCAGT 0.000191 CCATA 0.000461 CCATC 0.000369 CCATG 0.00024 CCATT 0.000704 CCCAA 0.000163 CCCAC 0.000128 CCCAG 6.7e-05 CCCAT 0.000182 CCCCA 9.72e-05 CCCCC 0.000167 CCCCG 0.000102 CCCCT 0.000183 CCCGA 0.000134 CCCGC 0.000112 CCCGG 7.59e-05 CCCGT 0.00014 CCCTA 0.000123 CCCTC 0.000252 CCCTG 0.000105 CCCTT 0.000282 CCGAA 0.000276 CCGAC 0.000154 CCGAG 0.000172 CCGAT 0.000367 CCGCA 0.000139 CCGCC 0.000129 CCGCG 0.000204 CCGCT 0.000152 CCGGA 0.000122 CCGGC 0.000102 CCGGG 7.59e-05 CCGGT 0.000155 CCGTA 0.000198 CCGTC 0.000167 CCGTG 0.000205 CCGTT 0.00033 CCTAA 0.000335 CCTAC 0.000163 CCTAG 0.000116 CCTAT 0.000432 CCTCA 0.000174 CCTCC 0.000273 CCTCG 0.0003 CCTCT 0.000388 CCTGA 0.000194 CCTGC 0.000125 CCTGG 9.63e-05 CCTGT 0.000252 CCTTA 0.000349 CCTTC 0.000409 CCTTG 0.000252 CCTTT 0.000766 CGAAA 0.00142 CGAAC 0.000489 CGAAG 0.000505 CGAAT 0.00119 CGACA 0.000397 CGACC 0.00017 CGACG 0.000363 CGACT 0.000283 CGAGA 0.000655 CGAGC 0.000291 CGAGG 0.0003 CGAGT 0.000434 CGATA 0.00117 CGATC 0.00071 CGATG 0.000556 CGATT 0.00121 CGCAA 0.000447 CGCAC 0.000252 CGCAG 0.00017 CGCAT 0.000432 CGCCA 0.000256 CGCCC 9.5e-05 CGCCG 0.000164 CGCCT 0.000151 CGCGA 0.000522 CGCGC 0.00035 CGCGG 0.000204 CGCGT 0.000485 CGCTA 0.000234 CGCTC 0.000238 CGCTG 0.000165 CGCTT 0.00036 CGGAA 0.000385 CGGAC 0.000124 CGGAG 0.000161 CGGAT 0.0003 CGGCA 0.000177 CGGCC 0.000122 CGGCG 0.000164 CGGCT 0.000127 CGGGA 0.000175 CGGGC 8.63e-05 CGGGG 0.000102 CGGGT 9.85e-05 CGGTA 0.000265 CGGTC 0.000154 CGGTG 0.000204 CGGTT 0.000307 CGTAA 0.000792 CGTAC 0.000359 CGTAG 0.000266 CGTAT 0.000889 CGTCA 0.000353 CGTCC 0.000201 CGTCG 0.000363 CGTCT 0.000294 CGTGA 0.000528 CGTGC 0.000319 CGTGG 0.000266 CGTGT 0.000591 CGTTA 0.000728 CGTTC 0.000574 CGTTG 0.000463 CGTTT 0.00115 CTAAA 0.0013 CTAAC 0.00039 CTAAG 0.000285 CTAAT 0.00122 CTACA 0.00047 CTACC 0.000167 CTACG 0.000266 CTACT 0.000423 CTAGA 0.000375 CTAGC 0.000139 CTAGG 0.000116 CTAGT 0.0003 CTATA 0.00144 CTATC 0.000599 CTATG 0.00049 CTATT 0.00168 CTCAA 0.000531 CTCAC 0.000246 CTCAG 0.000155 CTCAT 0.000525 CTCCA 0.000266 CTCCC 0.00022 CTCCG 0.000161 CTCCT 0.000342 CTCGA 0.000651 CTCGC 0.000307 CTCGG 0.000172 CTCGT 0.000551 CTCTA 0.000475 CTCTC 0.000881 CTCTG 0.000294 CTCTT 0.000917 CTGAA 0.000637 CTGAC 0.000216 CTGAG 0.000155 CTGAT 0.000564 CTGCA 0.000319 CTGCC 0.000153 CTGCG 0.00017 CTGCT 0.000243 CTGGA 0.000234 CTGGC 0.000129 CTGGG 6.7e-05 CTGGT 0.00019 CTGTA 0.000596 CTGTC 0.00028 CTGTG 0.000298 CTGTT 0.00066 CTTAA 0.00132 CTTAC 0.000514 CTTAG 0.000285 CTTAT 0.0016 CTTCA 0.000701 CTTCC 0.000453 CTTCG 0.000505 CTTCT 0.000945 CTTGA 0.000661 CTTGC 0.000337 CTTGG 0.000246 CTTGT 0.000722 CTTTA 0.0016 CTTTC 0.00125 CTTTG 0.000825 CTTTT 0.00292 GAAAA 0.00414 GAAAC 0.00112 GAAAG 0.00125 GAAAT 0.0032 GAACA 0.000856 GAACC 0.000217 GAACG 0.000574 GAACT 0.00049 GAAGA 0.00124 GAAGC 0.000344 GAAGG 0.000409 GAAGT 0.000613 GAATA 0.00247 GAATC 0.000883 GAATG 0.000956 GAATT 0.00243 GACAA 0.000762 GACAC 0.000313 GACAG 0.00028 GACAT 0.00057 GACCA 0.000196 GACCC 7.63e-05 GACCG 0.000154 GACCT 0.000134 GACGA 0.000526 GACGC 0.000215 GACGG 0.000167 GACGT 0.000302 GACTA 0.000335 GACTC 0.000212 GACTG 0.000243 GACTT 0.000436 GAGAA 0.00129 GAGAC 0.000298 GAGAG 0.000881 GAGAT 0.000795 GAGCA 0.000326 GAGCC 0.000114 GAGCG 0.000238 GAGCT 0.000181 GAGGA 0.000493 GAGGC 0.000164 GAGGG 0.000252 GAGGT 0.000226 GAGTA 0.000447 GAGTC 0.000212 GAGTG 0.000294 GAGTT 0.000485 GATAA 0.00225 GATAC 0.000715 GATAG 0.000599 GATAT 0.00238 GATCA 0.000753 GATCC 0.000283 GATCG 0.00071 GATCT 0.000558 GATGA 0.000922 GATGC 0.000357 GATGG 0.000369 GATGT 0.000657 GATTA 0.00176 GATTC 0.000883 GATTG 0.000792 GATTT 0.00231 GCAAA 0.00106 GCAAC 0.000396 GCAAG 0.000337 GCAAT 0.000956 GCACA 0.000423 GCACC 0.000144 GCACG 0.000319 GCACT 0.00026 GCAGA 0.00031 GCAGC 0.000179 GCAGG 0.000125 GCAGT 0.000272 GCATA 0.000794 GCATC 0.000357 GCATG 0.000354 GCATT 0.000868 GCCAA 0.000311 GCCAC 0.000193 GCCAG 0.000129 GCCAT 0.000333 GCCCA 8.07e-05 GCCCC 7.26e-05 GCCCG 8.63e-05 GCCCT 8.76e-05 GCCGA 0.000188 GCCGC 0.000148 GCCGG 0.000102 GCCGT 0.000152 GCCTA 0.000139 GCCTC 0.000164 GCCTG 0.000108 GCCTT 0.00021 GCGAA 0.000549 GCGAC 0.000229 GCGAG 0.000307 GCGAT 0.000488 GCGCA 0.000278 GCGCC 0.000159 GCGCG 0.00035 GCGCT 0.000184 GCGGA 0.000194 GCGGC 0.000148 GCGGG 0.000112 GCGGT 0.000171 GCGTA 0.000365 GCGTC 0.000215 GCGTG 0.000339 GCGTT 0.000438 GCTAA 0.000404 GCTAC 0.000215 GCTAG 0.000139 GCTAT 0.000496 GCTCA 0.000194 GCTCC 0.000127 GCTCG 0.000291 GCTCT 0.000246 GCTGA 0.000231 GCTGC 0.000179 GCTGG 0.000119 GCTGT 0.000256 GCTTA 0.000423 GCTTC 0.000344 GCTTG 0.000274 GCTTT 0.000673 GGAAA 0.00122 GGAAC 0.000346 GGAAG 0.000453 GGAAT 0.000784 GGACA 0.000236 GGACC 7.88e-05 GGACG 0.000201 GGACT 0.000126 GGAGA 0.000426 GGAGC 0.000127 GGAGG 0.000273 GGAGT 0.000163 GGATA 0.000614 GGATC 0.000283 GGATG 0.000291 GGATT 0.000558 GGCAA 0.000322 GGCAC 0.000167 GGCAG 0.000153 GGCAT 0.000215 GGCCA 0.000143 GGCCC 6.16e-05 GGCCG 0.000122 GGCCT 8.8e-05 GGCGA 0.000219 GGCGC 0.000159 GGCGG 0.000129 GGCGT 0.000158 GGCTA 0.000149 GGCTC 0.000114 GGCTG 0.000132 GGCTT 0.00017 GGGAA 0.000409 GGGAC 0.000109 GGGAG 0.00022 GGGAT 0.000234 GGGCA 0.000106 GGGCC 6.16e-05 GGGCG 9.5e-05 GGGCT 6.41e-05 GGGGA 0.000221 GGGGC 7.26e-05 GGGGG 0.000167 GGGGT 8.93e-05 GGGTA 0.000128 GGGTC 7.63e-05 GGGTG 0.000121 GGGTT 0.000138 GGTAA 0.000475 GGTAC 0.000193 GGTAG 0.000167 GGTAT 0.000446 GGTCA 0.000192 GGTCC 7.88e-05 GGTCG 0.00017 GGTCT 0.000118 GGTGA 0.00026 GGTGC 0.000144 GGTGG 0.000189 GGTGT 0.000213 GGTTA 0.00046 GGTTC 0.000217 GGTTG 0.000223 GGTTT 0.000436 GTAAA 0.00204 GTAAC 0.000624 GTAAG 0.000514 GTAAT 0.00185 GTACA 0.000905 GTACC 0.000193 GTACG 0.000359 GTACT 0.000447 GTAGA 0.000536 GTAGC 0.000215 GTAGG 0.000163 GTAGT 0.000411 GTATA 0.00219 GTATC 0.000715 GTATG 0.000691 GTATT 0.0019 GTCAA 0.000611 GTCAC 0.000323 GTCAG 0.000216 GTCAT 0.000587 GTCCA 0.000238 GTCCC 0.000109 GTCCG 0.000124 GTCCT 0.000172 GTCGA 0.000469 GTCGC 0.000229 GTCGG 0.000154 GTCGT 0.00036 GTCTA 0.000329 GTCTC 0.000298 GTCTG 0.000209 GTCTT 0.000495 GTGAA 0.000923 GTGAC 0.000323 GTGAG 0.000246 GTGAT 0.000765 GTGCA 0.000466 GTGCC 0.000167 GTGCG 0.000252 GTGCT 0.000263 GTGGA 0.000364 GTGGC 0.000193 GTGGG 0.000128 GTGGT 0.000252 GTGTA 0.000804 GTGTC 0.000313 GTGTG 0.000507 GTGTT 0.000701 GTTAA 0.00151 GTTAC 0.000624 GTTAG 0.00039 GTTAT 0.00172 GTTCA 0.000703 GTTCC 0.000346 GTTCG 0.000489 GTTCT 0.000599 GTTGA 0.000703 GTTGC 0.000396 GTTGG 0.000276 GTTGT 0.000644 GTTTA 0.0016 GTTTC 0.00112 GTTTG 0.000761 GTTTT 0.00227 TAAAA 0.00918 TAAAC 0.0016 TAAAG 0.0016 TAAAT 0.00791 TAACA 0.0019 TAACC 0.00046 TAACG 0.000728 TAACT 0.00116 TAAGA 0.00169 TAAGC 0.000423 TAAGG 0.000349 TAAGT 0.00126 TAATA 0.00774 TAATC 0.00176 TAATG 0.00192 TAATT 0.00747 TACAA 0.00237 TACAC 0.000804 TACAG 0.000596 TACAT 0.00265 TACCA 0.000488 TACCC 0.000128 TACCG 0.000265 TACCT 0.0004 TACGA 0.000907 TACGC 0.000365 TACGG 0.000198 TACGT 0.000838 TACTA 0.00113 TACTC 0.000447 TACTG 0.000486 TACTT 0.00168 TAGAA 0.00201 TAGAC 0.000329 TAGAG 0.000475 TAGAT 0.0015 TAGCA 0.000538 TAGCC 0.000149 TAGCG 0.000234 TAGCT 0.000333 TAGGA 0.000457 TAGGC 0.000139 TAGGG 0.000123 TAGGT 0.000326 TAGTA 0.00113 TAGTC 0.000335 TAGTG 0.000419 TAGTT 0.00116 TATAA 0.00801 TATAC 0.00219 TATAG 0.00144 TATAT 0.0128 TATCA 0.0022 TATCC 0.000614 TATCG 0.00117 TATCT 0.00196 TATGA 0.00202 TATGC 0.000794 TATGG 0.000461 TATGT 0.0024 TATTA 0.00774 TATTC 0.00247 TATTG 0.00227 TATTT 0.0102 TCAAA 0.00248 TCAAC 0.000703 TCAAG 0.000661 TCAAT 0.00241 TCACA 0.000804 TCACC 0.00026 TCACG 0.000528 TCACT 0.000665 TCAGA 0.000602 TCAGC 0.000231 TCAGG 0.000194 TCAGT 0.000545 TCATA 0.00202 TCATC 0.000922 TCATG 0.000707 TCATT 0.00265 TCCAA 0.000768 TCCAC 0.000364 TCCAG 0.000234 TCCAT 0.000793 TCCCA 0.000236 TCCCC 0.000221 TCCCG 0.000175 TCCCT 0.00034 TCCGA 0.000307 TCCGC 0.000194 TCCGG 0.000122 TCCGT 0.000346 TCCTA 0.000457 TCCTC 0.000493 TCCTG 0.000255 TCCTT 0.000876 TCGAA 0.00152 TCGAC 0.000469 TCGAG 0.000651 TCGAT 0.00164 TCGCA 0.000454 TCGCC 0.000219 TCGCG 0.000522 TCGCT 0.000379 TCGGA 0.000307 TCGGC 0.000188 TCGGG 0.000134 TCGGT 0.000339 TCGTA 0.000907 TCGTC 0.000526 TCGTG 0.000606 TCGTT 0.00129 TCTAA 0.00144 TCTAC 0.000536 TCTAG 0.000375 TCTAT 0.00196 TCTCA 0.000702 TCTCC 0.000426 TCTCG 0.000655 TCTCT 0.00148 TCTGA 0.000602 TCTGC 0.00031 TCTGG 0.000214 TCTGT 0.000736 TCTTA 0.00169 TCTTC 0.00124 TCTTG 0.000788 TCTTT 0.00324 TGAAA 0.00337 TGAAC 0.000703 TGAAG 0.000701 TGAAT 0.00247 TGACA 0.000735 TGACC 0.000192 TGACG 0.000353 TGACT 0.000456 TGAGA 0.000702 TGAGC 0.000194 TGAGG 0.000174 TGAGT 0.000387 TGATA 0.0022 TGATC 0.000753 TGATG 0.000784 TGATT 0.00222 TGCAA 0.00122 TGCAC 0.000466 TGCAG 0.000319 TGCAT 0.00112 TGCCA 0.000341 TGCCC 0.000106 TGCCG 0.000177 TGCCT 0.000233 TGCGA 0.000454 TGCGC 0.000278 TGCGG 0.000139 TGCGT 0.00043 TGCTA 0.000538 TGCTC 0.000326 TGCTG 0.000271 TGCTT 0.000735 TGGAA 0.00102 TGGAC 0.000238 TGGAG 0.000266 TGGAT 0.000637 TGGCA 0.000341 TGGCC 0.000143 TGGCG 0.000256 TGGCT 0.000226 TGGGA 0.000236 TGGGC 8.07e-05 TGGGG 9.72e-05 TGGGT 0.000126 TGGTA 0.000488 TGGTC 0.000196 TGGTG 0.000273 TGGTT 0.000474 TGTAA 0.00231 TGTAC 0.000905 TGTAG 0.00047 TGTAT 0.00274 TGTCA 0.000735 TGTCC 0.000236 TGTCG 0.000397 TGTCT 0.000558 TGTGA 0.000804 TGTGC 0.000423 TGTGG 0.000229 TGTGT 0.000992 TGTTA 0.0019 TGTTC 0.000856 TGTTG 0.000799 TGTTT 0.0025 TTAAA 0.00759 TTAAC 0.00151 TTAAG 0.00132 TTAAT 0.00706 TTACA 0.00231 TTACC 0.000475 TTACG 0.000792 TTACT 0.00145 TTAGA 0.00144 TTAGC 0.000404 TTAGG 0.000335 TTAGT 0.00101 TTATA 0.00801 TTATC 0.00225 TTATG 0.00198 TTATT 0.0092 TTCAA 0.00283 TTCAC 0.000923 TTCAG 0.000637 TTCAT 0.00285 TTCCA 0.00102 TTCCC 0.000409 TTCCG 0.000385 TTCCT 0.000991 TTCGA 0.00152 TTCGC 0.000549 TTCGG 0.000276 TTCGT 0.00127 TTCTA 0.00201 TTCTC 0.00129 TTCTG 0.000777 TTCTT 0.00348 TTGAA 0.00283 TTGAC 0.000611 TTGAG 0.000531 TTGAT 0.00228 TTGCA 0.00122 TTGCC 0.000322 TTGCG 0.000447 TTGCT 0.00076 TTGGA 0.000768 TTGGC 0.000311 TTGGG 0.000163 TTGGT 0.000524 TTGTA 0.00237 TTGTC 0.000762 TTGTG 0.000836 TTGTT 0.00258 TTTAA 0.00759 TTTAC 0.00204 TTTAG 0.0013 TTTAT 0.00936 TTTCA 0.00337 TTTCC 0.00122 TTTCG 0.00142 TTTCT 0.00371 TTTGA 0.00248 TTTGC 0.00106 TTTGG 0.00061 TTTGT 0.00277 TTTTA 0.00918 TTTTC 0.00414 TTTTG 0.00281 TTTTT 0.015 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4814 AAAAC 0.07298 AAAAG 0.09399 AAAAT 0.3517 AAACA 0.4347 AAACC 0.07586 AAACG 0.1995 AAACT 0.29 AAAGA 0.4914 AAAGC 0.102 AAAGG 0.1161 AAAGT 0.2906 AAATA 0.4162 AAATC 0.09401 AAATG 0.1135 AAATT 0.3763 AACAA 0.427 AACAC 0.1158 AACAG 0.109 AACAT 0.3482 AACCA 0.3552 AACCC 0.1035 AACCG 0.2296 AACCT 0.3117 AACGA 0.4423 AACGC 0.1503 AACGG 0.1134 AACGT 0.294 AACTA 0.3014 AACTC 0.126 AACTG 0.1469 AACTT 0.4257 AAGAA 0.5 AAGAC 0.07106 AAGAG 0.1317 AAGAT 0.2972 AAGCA 0.4284 AAGCC 0.0992 AAGCG 0.2101 AAGCT 0.2622 AAGGA 0.4935 AAGGC 0.1183 AAGGG 0.1586 AAGGT 0.2297 AAGTA 0.3771 AAGTC 0.09804 AAGTG 0.1559 AAGTT 0.369 AATAA 0.4047 AATAC 0.08344 AATAG 0.07383 AATAT 0.438 AATCA 0.3868 AATCC 0.09711 AATCG 0.211 AATCT 0.305 AATGA 0.4054 AATGC 0.1325 AATGG 0.1076 AATGT 0.3545 AATTA 0.3455 AATTC 0.1126 AATTG 0.1143 AATTT 0.4276 ACAAA 0.4218 ACAAC 0.09815 ACAAG 0.1101 ACAAT 0.37 ACACA 0.4266 ACACC 0.09158 ACACG 0.2542 ACACT 0.2276 ACAGA 0.4011 ACAGC 0.1397 ACAGG 0.1376 ACAGT 0.3217 ACATA 0.3918 ACATC 0.1072 ACATG 0.1224 ACATT 0.3785 ACCAA 0.3659 ACCAC 0.1757 ACCAG 0.1329 ACCAT 0.3255 ACCCA 0.2714 ACCCC 0.1925 ACCCG 0.2124 ACCCT 0.3237 ACCGA 0.3653 ACCGC 0.1846 ACCGG 0.1671 ACCGT 0.2829 ACCTA 0.2819 ACCTC 0.1951 ACCTG 0.171 ACCTT 0.3521 ACGAA 0.3802 ACGAC 0.1082 ACGAG 0.1654 ACGAT 0.3462 ACGCA 0.3172 ACGCC 0.1163 ACGCG 0.3579 ACGCT 0.2086 ACGGA 0.3844 ACGGC 0.1683 ACGGG 0.1556 ACGGT 0.2918 ACGTA 0.3284 ACGTC 0.1183 ACGTG 0.2177 ACGTT 0.3356 ACTAA 0.3312 ACTAC 0.135 ACTAG 0.09862 ACTAT 0.4351 ACTCA 0.2691 ACTCC 0.1131 ACTCG 0.3017 ACTCT 0.3161 ACTGA 0.3411 ACTGC 0.1701 ACTGG 0.1195 ACTGT 0.3692 ACTTA 0.2837 ACTTC 0.138 ACTTG 0.1465 ACTTT 0.4318 AGAAA 0.4911 AGAAC 0.07926 AGAAG 0.1251 AGAAT 0.3046 AGACA 0.4194 AGACC 0.08881 AGACG 0.2207 AGACT 0.2711 AGAGA 0.576 AGAGC 0.09581 AGAGG 0.1511 AGAGT 0.1771 AGATA 0.3965 AGATC 0.1129 AGATG 0.1364 AGATT 0.3543 AGCAA 0.4061 AGCAC 0.1405 AGCAG 0.1298 AGCAT 0.3235 AGCCA 0.399 AGCCC 0.1133 AGCCG 0.224 AGCCT 0.2637 AGCGA 0.3797 AGCGC 0.1843 AGCGG 0.1526 AGCGT 0.2835 AGCTA 0.2823 AGCTC 0.1529 AGCTG 0.1838 AGCTT 0.3809 AGGAA 0.4763 AGGAC 0.08254 AGGAG 0.1643 AGGAT 0.2768 AGGCA 0.3748 AGGCC 0.1418 AGGCG 0.2428 AGGCT 0.2405 AGGGA 0.4466 AGGGC 0.1151 AGGGG 0.241 AGGGT 0.1973 AGGTA 0.3449 AGGTC 0.1152 AGGTG 0.1808 AGGTT 0.3591 AGTAA 0.3881 AGTAC 0.1197 AGTAG 0.1133 AGTAT 0.379 AGTCA 0.3715 AGTCC 0.1032 AGTCG 0.2312 AGTCT 0.2941 AGTGA 0.3896 AGTGC 0.1522 AGTGG 0.1483 AGTGT 0.3099 AGTTA 0.3005 AGTTC 0.1273 AGTTG 0.1391 AGTTT 0.4331 ATAAA 0.4366 ATAAC 0.08014 ATAAG 0.07474 ATAAT 0.4086 ATACA 0.499 ATACC 0.08119 ATACG 0.162 ATACT 0.2578 ATAGA 0.4648 ATAGC 0.1179 ATAGG 0.1026 ATAGT 0.3147 ATATA 0.4622 ATATC 0.08605 ATATG 0.09127 ATATT 0.3605 ATCAA 0.383 ATCAC 0.1285 ATCAG 0.09463 ATCAT 0.3939 ATCCA 0.3647 ATCCC 0.134 ATCCG 0.1716 ATCCT 0.3296 ATCGA 0.449 ATCGC 0.134 ATCGG 0.1008 ATCGT 0.3162 ATCTA 0.3037 ATCTC 0.1606 ATCTG 0.1176 ATCTT 0.4181 ATGAA 0.4517 ATGAC 0.09298 ATGAG 0.08321 ATGAT 0.3721 ATGCA 0.4724 ATGCC 0.09043 ATGCG 0.182 ATGCT 0.2552 ATGGA 0.4472 ATGGC 0.1875 ATGGG 0.1026 ATGGT 0.2628 ATGTA 0.4318 ATGTC 0.09291 ATGTG 0.1317 ATGTT 0.3437 ATTAA 0.3736 ATTAC 0.09803 ATTAG 0.06454 ATTAT 0.4638 ATTCA 0.3657 ATTCC 0.1162 ATTCG 0.1771 ATTCT 0.3411 ATTGA 0.3747 ATTGC 0.1488 ATTGG 0.09884 ATTGT 0.3777 ATTTA 0.3219 ATTTC 0.1304 ATTTG 0.1023 ATTTT 0.4453 CAAAA 0.4071 CAAAC 0.1101 CAAAG 0.1193 CAAAT 0.3635 CAACA 0.3952 CAACC 0.1104 CAACG 0.2292 CAACT 0.2652 CAAGA 0.4011 CAAGC 0.1394 CAAGG 0.1283 CAAGT 0.3313 CAATA 0.354 CAATC 0.1233 CAATG 0.1382 CAATT 0.3845 CACAA 0.3415 CACAC 0.2071 CACAG 0.1217 CACAT 0.3296 CACCA 0.3385 CACCC 0.1503 CACCG 0.2519 CACCT 0.2594 CACGA 0.3554 CACGC 0.1986 CACGG 0.1203 CACGT 0.3257 CACTA 0.245 CACTC 0.1718 CACTG 0.1783 CACTT 0.4049 CAGAA 0.4175 CAGAC 0.1123 CAGAG 0.1577 CAGAT 0.3125 CAGCA 0.3451 CAGCC 0.1684 CAGCG 0.2103 CAGCT 0.2762 CAGGA 0.3831 CAGGC 0.162 CAGGG 0.1578 CAGGT 0.2971 CAGTA 0.3038 CAGTC 0.1518 CAGTG 0.1907 CAGTT 0.3537 CATAA 0.349 CATAC 0.1215 CATAG 0.08622 CATAT 0.4433 CATCA 0.34 CATCC 0.1263 CATCG 0.241 CATCT 0.2927 CATGA 0.3445 CATGC 0.1723 CATGG 0.1172 CATGT 0.366 CATTA 0.2926 CATTC 0.146 CATTG 0.1356 CATTT 0.4259 CCAAA 0.3452 CCAAC 0.1562 CCAAG 0.139 CCAAT 0.3595 CCACA 0.2445 CCACC 0.2018 CCACG 0.2836 CCACT 0.2701 CCAGA 0.3451 CCAGC 0.1919 CCAGG 0.1551 CCAGT 0.3078 CCATA 0.26 CCATC 0.2077 CCATG 0.1355 CCATT 0.3968 CCCAA 0.3014 CCCAC 0.2376 CCCAG 0.1241 CCCAT 0.3369 CCCCA 0.1769 CCCCC 0.3037 CCCCG 0.1855 CCCCT 0.334 CCCGA 0.2902 CCCGC 0.2417 CCCGG 0.1644 CCCGT 0.3036 CCCTA 0.161 CCCTC 0.331 CCCTG 0.1382 CCCTT 0.3699 CCGAA 0.285 CCGAC 0.1592 CCGAG 0.177 CCGAT 0.3788 CCGCA 0.2226 CCGCC 0.2073 CCGCG 0.3265 CCGCT 0.2436 CCGGA 0.2675 CCGGC 0.2239 CCGGG 0.167 CCGGT 0.3416 CCGTA 0.2196 CCGTC 0.1857 CCGTG 0.2279 CCGTT 0.3669 CCTAA 0.3205 CCTAC 0.1556 CCTAG 0.1111 CCTAT 0.4128 CCTCA 0.1529 CCTCC 0.2409 CCTCG 0.2645 CCTCT 0.3417 CCTGA 0.2905 CCTGC 0.1869 CCTGG 0.1443 CCTGT 0.3783 CCTTA 0.1966 CCTTC 0.2302 CCTTG 0.1419 CCTTT 0.4314 CGAAA 0.3943 CGAAC 0.1354 CGAAG 0.1398 CGAAT 0.3306 CGACA 0.3271 CGACC 0.1399 CGACG 0.2992 CGACT 0.2338 CGAGA 0.3897 CGAGC 0.1733 CGAGG 0.1788 CGAGT 0.2583 CGATA 0.3205 CGATC 0.1948 CGATG 0.1524 CGATT 0.3324 CGCAA 0.3439 CGCAC 0.1935 CGCAG 0.1306 CGCAT 0.332 CGCCA 0.385 CGCCC 0.1428 CGCCG 0.2458 CGCCT 0.2264 CGCGA 0.3343 CGCGC 0.2244 CGCGG 0.1306 CGCGT 0.3107 CGCTA 0.2346 CGCTC 0.2385 CGCTG 0.1656 CGCTT 0.3613 CGGAA 0.3968 CGGAC 0.1275 CGGAG 0.1664 CGGAT 0.3093 CGGCA 0.301 CGGCC 0.2064 CGGCG 0.2776 CGGCT 0.2151 CGGGA 0.3786 CGGGC 0.187 CGGGG 0.2209 CGGGT 0.2136 CGGTA 0.2854 CGGTC 0.1653 CGGTG 0.2191 CGGTT 0.3301 CGTAA 0.3433 CGTAC 0.1558 CGTAG 0.1152 CGTAT 0.3856 CGTCA 0.2915 CGTCC 0.1662 CGTCG 0.2997 CGTCT 0.2426 CGTGA 0.3099 CGTGC 0.1874 CGTGG 0.156 CGTGT 0.3467 CGTTA 0.2499 CGTTC 0.1971 CGTTG 0.159 CGTTT 0.394 CTAAA 0.4064 CTAAC 0.1223 CTAAG 0.08935 CTAAT 0.382 CTACA 0.3542 CTACC 0.1262 CTACG 0.2005 CTACT 0.3191 CTAGA 0.4028 CTAGC 0.1498 CTAGG 0.1249 CTAGT 0.3226 CTATA 0.3426 CTATC 0.1423 CTATG 0.1165 CTATT 0.3986 CTCAA 0.3643 CTCAC 0.1687 CTCAG 0.1066 CTCAT 0.3605 CTCCA 0.2693 CTCCC 0.222 CTCCG 0.1631 CTCCT 0.3456 CTCGA 0.3872 CTCGC 0.1829 CTCGG 0.1021 CTCGT 0.3277 CTCTA 0.1852 CTCTC 0.3432 CTCTG 0.1144 CTCTT 0.3572 CTGAA 0.4053 CTGAC 0.1374 CTGAG 0.09872 CTGAT 0.3586 CTGCA 0.3603 CTGCC 0.1733 CTGCG 0.1919 CTGCT 0.2746 CTGGA 0.3771 CTGGC 0.2084 CTGGG 0.108 CTGGT 0.3065 CTGTA 0.3251 CTGTC 0.1528 CTGTG 0.1625 CTGTT 0.3596 CTTAA 0.3549 CTTAC 0.1381 CTTAG 0.07658 CTTAT 0.4304 CTTCA 0.2692 CTTCC 0.1741 CTTCG 0.1939 CTTCT 0.3628 CTTGA 0.3362 CTTGC 0.1716 CTTGG 0.125 CTTGT 0.3673 CTTTA 0.2423 CTTTC 0.19 CTTTG 0.125 CTTTT 0.4427 GAAAA 0.426 GAAAC 0.1153 GAAAG 0.1291 GAAAT 0.3296 GAACA 0.4006 GAACC 0.1014 GAACG 0.2686 GAACT 0.2295 GAAGA 0.4752 GAAGC 0.1322 GAAGG 0.1571 GAAGT 0.2354 GAATA 0.3667 GAATC 0.1308 GAATG 0.1416 GAATT 0.3608 GACAA 0.3958 GACAC 0.1627 GACAG 0.1456 GACAT 0.2958 GACCA 0.3502 GACCC 0.1364 GACCG 0.2746 GACCT 0.2388 GACGA 0.4349 GACGC 0.1775 GACGG 0.1382 GACGT 0.2494 GACTA 0.2736 GACTC 0.1731 GACTG 0.198 GACTT 0.3553 GAGAA 0.395 GAGAC 0.0913 GAGAG 0.2701 GAGAT 0.2436 GAGCA 0.3798 GAGCC 0.1329 GAGCG 0.277 GAGCT 0.2103 GAGGA 0.4344 GAGGC 0.1444 GAGGG 0.2221 GAGGT 0.1991 GAGTA 0.3108 GAGTC 0.1475 GAGTG 0.2043 GAGTT 0.3375 GATAA 0.3793 GATAC 0.1203 GATAG 0.1007 GATAT 0.3997 GATCA 0.3266 GATCC 0.123 GATCG 0.3082 GATCT 0.2423 GATGA 0.3998 GATGC 0.155 GATGG 0.1599 GATGT 0.2852 GATTA 0.3067 GATTC 0.1536 GATTG 0.1379 GATTT 0.4019 GCAAA 0.3861 GCAAC 0.144 GCAAG 0.1225 GCAAT 0.3474 GCACA 0.3691 GCACC 0.1258 GCACG 0.2784 GCACT 0.2266 GCAGA 0.3497 GCAGC 0.2021 GCAGG 0.1409 GCAGT 0.3073 GCATA 0.3345 GCATC 0.1507 GCATG 0.1491 GCATT 0.3657 GCCAA 0.3219 GCCAC 0.1997 GCCAG 0.134 GCCAT 0.3444 GCCCA 0.2466 GCCCC 0.2218 GCCCG 0.2637 GCCCT 0.2678 GCCGA 0.3194 GCCGC 0.2505 GCCGG 0.1727 GCCGT 0.2573 GCCTA 0.2232 GCCTC 0.2641 GCCTG 0.1741 GCCTT 0.3385 GCGAA 0.349 GCGAC 0.1453 GCGAG 0.1954 GCGAT 0.3103 GCGCA 0.2863 GCGCC 0.1639 GCGCG 0.3607 GCGCT 0.1891 GCGGA 0.3107 GCGGC 0.2362 GCGGG 0.1786 GCGGT 0.2745 GCGTA 0.269 GCGTC 0.1585 GCGTG 0.2498 GCGTT 0.3228 GCTAA 0.3222 GCTAC 0.1714 GCTAG 0.111 GCTAT 0.3954 GCTCA 0.2262 GCTCC 0.1479 GCTCG 0.3392 GCTCT 0.2867 GCTGA 0.2944 GCTGC 0.2277 GCTGG 0.1517 GCTGT 0.3262 GCTTA 0.2468 GCTTC 0.2007 GCTTG 0.1598 GCTTT 0.3927 GGAAA 0.4354 GGAAC 0.1233 GGAAG 0.1617 GGAAT 0.2796 GGACA 0.3671 GGACC 0.1228 GGACG 0.3132 GGACT 0.197 GGAGA 0.4307 GGAGC 0.1283 GGAGG 0.2765 GGAGT 0.1645 GGATA 0.3514 GGATC 0.1623 GGATG 0.1668 GGATT 0.3195 GGCAA 0.3755 GGCAC 0.1953 GGCAG 0.1789 GGCAT 0.2503 GGCCA 0.3454 GGCCC 0.1487 GGCCG 0.2934 GGCCT 0.2124 GGCGA 0.3292 GGCGC 0.2393 GGCGG 0.1946 GGCGT 0.2369 GGCTA 0.2641 GGCTC 0.2015 GGCTG 0.2337 GGCTT 0.3007 GGGAA 0.421 GGGAC 0.1121 GGGAG 0.2259 GGGAT 0.241 GGGCA 0.3252 GGGCC 0.1884 GGGCG 0.2905 GGGCT 0.196 GGGGA 0.4018 GGGGC 0.1321 GGGGG 0.3036 GGGGT 0.1626 GGGTA 0.2761 GGGTC 0.1644 GGGTG 0.2618 GGGTT 0.2977 GGTAA 0.3708 GGTAC 0.1506 GGTAG 0.1306 GGTAT 0.3479 GGTCA 0.344 GGTCC 0.1411 GGTCG 0.3036 GGTCT 0.2114 GGTGA 0.3226 GGTGC 0.179 GGTGG 0.2345 GGTGT 0.2639 GGTTA 0.3441 GGTTC 0.1622 GGTTG 0.1671 GGTTT 0.3267 GTAAA 0.4051 GTAAC 0.1242 GTAAG 0.1023 GTAAT 0.3684 GTACA 0.4752 GTACC 0.1013 GTACG 0.1887 GTACT 0.2347 GTAGA 0.4048 GTAGC 0.1623 GTAGG 0.1227 GTAGT 0.3101 GTATA 0.3987 GTATC 0.1302 GTATG 0.1258 GTATT 0.3453 GTCAA 0.3518 GTCAC 0.186 GTCAG 0.1244 GTCAT 0.3378 GTCCA 0.3706 GTCCC 0.1695 GTCCG 0.1925 GTCCT 0.2673 GTCGA 0.3871 GTCGC 0.1885 GTCGG 0.1273 GTCGT 0.2971 GTCTA 0.2474 GTCTC 0.2238 GTCTG 0.1571 GTCTT 0.3717 GTGAA 0.4089 GTGAC 0.1431 GTGAG 0.1088 GTGAT 0.3391 GTGCA 0.4058 GTGCC 0.1458 GTGCG 0.2192 GTGCT 0.2291 GTGGA 0.3885 GTGGC 0.206 GTGGG 0.137 GTGGT 0.2686 GTGTA 0.3457 GTGTC 0.1347 GTGTG 0.2182 GTGTT 0.3014 GTTAA 0.3559 GTTAC 0.1471 GTTAG 0.09199 GTTAT 0.405 GTTCA 0.329 GTTCC 0.1618 GTTCG 0.2289 GTTCT 0.2802 GTTGA 0.3483 GTTGC 0.1963 GTTGG 0.1367 GTTGT 0.3188 GTTTA 0.278 GTTTC 0.1949 GTTTG 0.1323 GTTTT 0.3948 TAAAA 0.4524 TAAAC 0.07881 TAAAG 0.07889 TAAAT 0.3899 TAACA 0.4472 TAACC 0.1083 TAACG 0.1715 TAACT 0.2729 TAAGA 0.4544 TAAGC 0.1136 TAAGG 0.09375 TAAGT 0.3382 TAATA 0.4099 TAATC 0.09328 TAATG 0.1014 TAATT 0.3954 TACAA 0.3697 TACAC 0.1252 TACAG 0.09288 TACAT 0.4122 TACCA 0.381 TACCC 0.1 TACCG 0.2069 TACCT 0.312 TACGA 0.3932 TACGC 0.158 TACGG 0.08567 TACGT 0.3631 TACTA 0.3018 TACTC 0.1197 TACTG 0.1301 TACTT 0.4484 TAGAA 0.4651 TAGAC 0.07634 TAGAG 0.1102 TAGAT 0.3484 TAGCA 0.4289 TAGCC 0.1191 TAGCG 0.1864 TAGCT 0.2656 TAGGA 0.4373 TAGGC 0.1326 TAGGG 0.1174 TAGGT 0.3127 TAGTA 0.3706 TAGTC 0.1102 TAGTG 0.1377 TAGTT 0.3815 TATAA 0.3284 TATAC 0.0897 TATAG 0.05907 TATAT 0.5229 TATCA 0.37 TATCC 0.1033 TATCG 0.1967 TATCT 0.33 TATGA 0.3563 TATGC 0.1396 TATGG 0.0812 TATGT 0.4229 TATTA 0.3409 TATTC 0.1089 TATTG 0.1001 TATTT 0.45 TCAAA 0.3963 TCAAC 0.1126 TCAAG 0.1058 TCAAT 0.3853 TCACA 0.356 TCACC 0.1153 TCACG 0.234 TCACT 0.2947 TCAGA 0.383 TCAGC 0.147 TCAGG 0.1233 TCAGT 0.3467 TCATA 0.321 TCATC 0.1461 TCATG 0.1121 TCATT 0.4208 TCCAA 0.3557 TCCAC 0.1685 TCCAG 0.1084 TCCAT 0.3674 TCCCA 0.2429 TCCCC 0.2273 TCCCG 0.1799 TCCCT 0.35 TCCGA 0.3172 TCCGC 0.2003 TCCGG 0.1254 TCCGT 0.3571 TCCTA 0.2194 TCCTC 0.2368 TCCTG 0.1227 TCCTT 0.421 TCGAA 0.3557 TCGAC 0.1097 TCGAG 0.1521 TCGAT 0.3824 TCGCA 0.2883 TCGCC 0.1393 TCGCG 0.3317 TCGCT 0.2407 TCGGA 0.3174 TCGGC 0.1942 TCGGG 0.1383 TCGGT 0.3502 TCGTA 0.2727 TCGTC 0.1581 TCGTG 0.1821 TCGTT 0.3871 TCTAA 0.3349 TCTAC 0.1244 TCTAG 0.08694 TCTAT 0.4537 TCTCA 0.2152 TCTCC 0.1306 TCTCG 0.2007 TCTCT 0.4535 TCTGA 0.3235 TCTGC 0.1662 TCTGG 0.115 TCTGT 0.3952 TCTTA 0.2432 TCTTC 0.1777 TCTTG 0.1132 TCTTT 0.4659 TGAAA 0.4653 TGAAC 0.0971 TGAAG 0.09687 TGAAT 0.3408 TGACA 0.4234 TGACC 0.1108 TGACG 0.2033 TGACT 0.2625 TGAGA 0.4819 TGAGC 0.1333 TGAGG 0.1191 TGAGT 0.2657 TGATA 0.3691 TGATC 0.1263 TGATG 0.1316 TGATT 0.373 TGCAA 0.391 TGCAC 0.1489 TGCAG 0.1019 TGCAT 0.3582 TGCCA 0.3978 TGCCC 0.1241 TGCCG 0.2068 TGCCT 0.2713 TGCGA 0.3487 TGCGC 0.2138 TGCGG 0.1069 TGCGT 0.3305 TGCTA 0.2878 TGCTC 0.1744 TGCTG 0.145 TGCTT 0.3929 TGGAA 0.4713 TGGAC 0.1102 TGGAG 0.1233 TGGAT 0.2951 TGGCA 0.3529 TGGCC 0.1481 TGGCG 0.2652 TGGCT 0.2337 TGGGA 0.4371 TGGGC 0.1495 TGGGG 0.1801 TGGGT 0.2333 TGGTA 0.3409 TGGTC 0.1368 TGGTG 0.191 TGGTT 0.3313 TGTAA 0.3595 TGTAC 0.1409 TGTAG 0.0731 TGTAT 0.4265 TGTCA 0.3817 TGTCC 0.1225 TGTCG 0.206 TGTCT 0.2898 TGTGA 0.3283 TGTGC 0.173 TGTGG 0.09362 TGTGT 0.4051 TGTTA 0.3135 TGTTC 0.1414 TGTTG 0.1319 TGTTT 0.4131 TTAAA 0.4341 TTAAC 0.08643 TTAAG 0.07563 TTAAT 0.4039 TTACA 0.4595 TTACC 0.09453 TTACG 0.1576 TTACT 0.2884 TTAGA 0.4524 TTAGC 0.1267 TTAGG 0.105 TTAGT 0.316 TTATA 0.3736 TTATC 0.1051 TTATG 0.09248 TTATT 0.4288 TTCAA 0.3906 TTCAC 0.1275 TTCAG 0.08806 TTCAT 0.3938 TTCCA 0.3632 TTCCC 0.146 TTCCG 0.1373 TTCCT 0.3536 TTCGA 0.4212 TTCGC 0.152 TTCGG 0.07648 TTCGT 0.3503 TTCTA 0.2656 TTCTC 0.1706 TTCTG 0.1029 TTCTT 0.4608 TTGAA 0.4523 TTGAC 0.09774 TTGAG 0.08488 TTGAT 0.3651 TTGCA 0.4445 TTGCC 0.1169 TTGCG 0.1625 TTGCT 0.2761 TTGGA 0.435 TTGGC 0.1761 TTGGG 0.09219 TTGGT 0.2968 TTGTA 0.3621 TTGTC 0.1162 TTGTG 0.1276 TTGTT 0.3941 TTTAA 0.374 TTTAC 0.1004 TTTAG 0.06395 TTTAT 0.4616 TTTCA 0.3464 TTTCC 0.1255 TTTCG 0.1465 TTTCT 0.3815 TTTGA 0.3581 TTTGC 0.1537 TTTGG 0.08819 TTTGT 0.4001 TTTTA 0.295 TTTTC 0.1331 TTTTG 0.0905 TTTTT 0.4814 [2] # (a,c,g,t)= (0.375, 0.125, 0.125, 0.375) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.368 C 0.132 G 0.132 T 0.368 # l= 1 # Values AA 0.149 AC 0.0412 AG 0.0381 AT 0.14 CA 0.0463 CC 0.0172 CG 0.0303 CT 0.0381 GA 0.0526 GC 0.0208 GG 0.0172 GT 0.0412 TA 0.12 TC 0.0526 TG 0.0463 TT 0.149 # l= 2 # Values AAA 0.0655 AAC 0.0147 AAG 0.0155 AAT 0.0531 ACA 0.0167 ACC 0.00443 ACG 0.00947 ACT 0.0106 AGA 0.0172 AGC 0.00502 AGG 0.00526 AGT 0.0106 ATA 0.0537 ATC 0.0171 ATG 0.0162 ATT 0.0531 CAA 0.0174 CAC 0.00734 CAG 0.00526 CAT 0.0162 CCA 0.00563 CCC 0.00279 CCG 0.00354 CCT 0.00525 CGA 0.012 CGC 0.00534 CGG 0.00354 CGT 0.00947 CTA 0.00954 CTC 0.00777 CTG 0.00526 CTT 0.0155 GAA 0.0223 GAC 0.00546 GAG 0.00777 GAT 0.0171 GCA 0.00756 GCC 0.0029 GCG 0.00534 GCT 0.00502 GGA 0.00709 GGC 0.0029 GGG 0.00279 GGT 0.00443 GTA 0.0138 GTC 0.00546 GTG 0.00735 GTT 0.0147 TAA 0.0435 TAC 0.0138 TAG 0.00954 TAT 0.0537 TCA 0.0163 TCC 0.00709 TCG 0.012 TCT 0.0172 TGA 0.0163 TGC 0.00756 TGG 0.00563 TGT 0.0167 TTA 0.0435 TTC 0.0223 TTG 0.0174 TTT 0.0655 # l= 3 # Values AAAA 0.03 AAAC 0.00587 AAAG 0.00686 AAAT 0.0227 AACA 0.00595 AACC 0.00147 AACG 0.00339 AACT 0.00384 AAGA 0.00723 AAGC 0.00184 AAGG 0.00202 AAGT 0.00442 AATA 0.0206 AATC 0.00591 AATG 0.00636 AATT 0.0202 ACAA 0.00645 ACAC 0.00254 ACAG 0.00194 ACAT 0.00582 ACCA 0.00153 ACCC 0.000546 ACCG 0.00111 ACCT 0.00125 ACGA 0.00388 ACGC 0.00159 ACGG 0.00109 ACGT 0.00291 ACTA 0.0029 ACTC 0.00161 ACTG 0.00165 ACTT 0.00442 AGAA 0.00782 AGAC 0.00144 AGAG 0.00296 AGAT 0.00499 AGCA 0.00193 AGCC 0.000649 AGCG 0.00118 AGCT 0.00126 AGGA 0.00237 AGGC 0.000716 AGGG 0.00092 AGGT 0.00125 AGTA 0.00361 AGTC 0.00131 AGTG 0.00182 AGTT 0.00384 ATAA 0.0194 ATAC 0.0054 ATAG 0.00408 ATAT 0.0248 ATCA 0.00585 ATCC 0.00198 ATCG 0.00425 ATCT 0.00499 ATGA 0.0061 ATGC 0.00242 ATGG 0.0019 ATGT 0.00582 ATTA 0.0172 ATTC 0.00688 ATTG 0.00632 ATTT 0.0227 CAAA 0.00681 CAAC 0.0022 CAAG 0.00212 CAAT 0.00632 CACA 0.00255 CACC 0.000939 CACG 0.00203 CACT 0.00182 CAGA 0.00197 CAGC 0.000876 CAGG 0.000761 CAGT 0.00165 CATA 0.00531 CATC 0.00251 CATG 0.00206 CATT 0.00636 CCAA 0.00192 CCAC 0.00109 CCAG 0.000717 CCAT 0.0019 CCCA 0.000625 CCCC 0.000684 CCCG 0.000565 CCCT 0.00092 CCGA 0.00115 CCGC 0.00075 CCGG 0.000546 CCGT 0.00109 CCTA 0.00111 CCTC 0.00137 CCTG 0.000761 CCTT 0.00201 CGAA 0.00419 CGAC 0.00146 CGAG 0.00207 CGAT 0.00425 CGCA 0.00149 CGCC 0.000792 CGCG 0.00189 CGCT 0.00118 CGGA 0.00116 CGGC 0.00071 CGGG 0.000566 CGGT 0.00111 CGTA 0.0026 CGTC 0.00145 CGTG 0.00203 CGTT 0.00339 CTAA 0.0031 CTAC 0.00141 CTAG 0.000959 CTAT 0.00408 CTCA 0.00154 CTCC 0.00119 CTCG 0.00207 CTCT 0.00296 CTGA 0.00163 CTGC 0.00097 CTGG 0.000717 CTGT 0.00194 CTTA 0.00362 CTTC 0.00291 CTTG 0.00211 CTTT 0.00686 GAAA 0.0102 GAAC 0.00236 GAAG 0.00291 GAAT 0.00687 GACA 0.00206 GACC 0.000645 GACG 0.00145 GACT 0.00131 GAGA 0.00378 GAGC 0.001 GAGG 0.00138 GAGT 0.00161 GATA 0.00601 GATC 0.00264 GATG 0.00251 GATT 0.00591 GCAA 0.00289 GCAC 0.00128 GCAG 0.00097 GCAT 0.00242 GCCA 0.00108 GCCC 0.000395 GCCG 0.00071 GCCT 0.000716 GCGA 0.00187 GCGC 0.00113 GCGG 0.00075 GCGT 0.00159 GCTA 0.0013 GCTC 0.001 GCTG 0.000876 GCTT 0.00184 GGAA 0.00317 GGAC 0.000744 GGAG 0.00119 GGAT 0.00198 GGCA 0.000959 GGCC 0.0005 GGCG 0.000792 GGCT 0.000649 GGGA 0.00117 GGGC 0.000396 GGGG 0.000684 GGGT 0.000546 GGTA 0.00138 GGTC 0.000646 GGTG 0.00094 GGTT 0.00147 GTAA 0.00497 GTAC 0.002 GTAG 0.00141 GTAT 0.0054 GTCA 0.00181 GTCC 0.000743 GTCG 0.00146 GTCT 0.00144 GTGA 0.00243 GTGC 0.00128 GTGG 0.00109 GTGT 0.00254 GTTA 0.00422 GTTC 0.00236 GTTG 0.0022 GTTT 0.00588 TAAA 0.0185 TAAC 0.00422 TAAG 0.00362 TAAT 0.0172 TACA 0.00619 TACC 0.00138 TACG 0.00259 TACT 0.00361 TAGA 0.00423 TAGC 0.0013 TAGG 0.00111 TAGT 0.0029 TATA 0.0218 TATC 0.00601 TATG 0.00531 TATT 0.0206 TCAA 0.00618 TCAC 0.00243 TCAG 0.00163 TCAT 0.0061 TCCA 0.00239 TCCC 0.00117 TCCG 0.00116 TCCT 0.00237 TCGA 0.00505 TCGC 0.00187 TCGG 0.00115 TCGT 0.00388 TCTA 0.00423 TCTC 0.00379 TCTG 0.00197 TCTT 0.00723 TGAA 0.00714 TGAC 0.00182 TGAG 0.00154 TGAT 0.00585 TGCA 0.00318 TGCC 0.000958 TGCG 0.00149 TGCT 0.00193 TGGA 0.00239 TGGC 0.00108 TGGG 0.000625 TGGT 0.00153 TGTA 0.00619 TGTC 0.00206 TGTG 0.00255 TGTT 0.00595 TTAA 0.016 TTAC 0.00497 TTAG 0.0031 TTAT 0.0194 TTCA 0.00714 TTCC 0.00317 TTCG 0.00419 TTCT 0.00782 TTGA 0.00618 TTGC 0.00289 TTGG 0.00192 TTGT 0.00645 TTTA 0.0185 TTTC 0.0102 TTTG 0.0068 TTTT 0.03 # l= 4 # Values AAAAA 0.0147 AAAAC 0.00225 AAAAG 0.00303 AAAAT 0.01 AAACA 0.00242 AAACC 0.000476 AAACG 0.00133 AAACT 0.00165 AAAGA 0.00337 AAAGC 0.000711 AAAGG 0.000872 AAAGT 0.00191 AAATA 0.00915 AAATC 0.00232 AAATG 0.00268 AAATT 0.00856 AACAA 0.00253 AACAC 0.000753 AACAG 0.000692 AACAT 0.00197 AACCA 0.000503 AACCC 0.000163 AACCG 0.000366 AACCT 0.000439 AACGA 0.00151 AACGC 0.000511 AACGG 0.000397 AACGT 0.000975 AACTA 0.0011 AACTC 0.00054 AACTG 0.00059 AACTT 0.00161 AAGAA 0.00361 AAGAC 0.000523 AAGAG 0.00103 AAGAT 0.00207 AAGCA 0.000748 AAGCC 0.000192 AAGCG 0.000424 AAGCT 0.000479 AAGGA 0.001 AAGGC 0.000237 AAGGG 0.00034 AAGGT 0.000436 AAGTA 0.00161 AAGTC 0.00046 AAGTG 0.000735 AAGTT 0.00161 AATAA 0.00833 AATAC 0.00182 AATAG 0.00161 AATAT 0.00882 AATCA 0.00215 AATCC 0.000615 AATCG 0.00139 AATCT 0.00175 AATGA 0.00255 AATGC 0.000867 AATGG 0.000752 AATGT 0.00219 AATTA 0.0068 AATTC 0.00246 AATTG 0.00243 AATTT 0.00856 ACAAA 0.00266 ACAAC 0.000688 ACAAG 0.000756 ACAAT 0.00234 ACACA 0.00103 ACACC 0.000245 ACACG 0.000705 ACACT 0.000559 ACAGA 0.000768 ACAGC 0.00028 ACAGG 0.000284 ACAGT 0.000608 ACATA 0.0022 ACATC 0.000689 ACATG 0.000731 ACATT 0.00219 ACCAA 0.000545 ACCAC 0.000286 ACCAG 0.000215 ACCAT 0.000486 ACCCA 0.000144 ACCCC 0.000108 ACCCG 0.00012 ACCCT 0.000174 ACCGA 0.000404 ACCGC 0.000202 ACCGG 0.000183 ACCGT 0.000319 ACCTA 0.000335 ACCTC 0.000256 ACCTG 0.000219 ACCTT 0.000436 ACGAA 0.00145 ACGAC 0.000425 ACGAG 0.000675 ACGAT 0.00133 ACGCA 0.000487 ACGCC 0.000186 ACGCG 0.000586 ACGCT 0.000331 ACGGA 0.000412 ACGGC 0.000183 ACGGG 0.000176 ACGGT 0.000319 ACGTA 0.000933 ACGTC 0.000352 ACGTG 0.000645 ACGTT 0.000975 ACTAA 0.000939 ACTAC 0.000422 ACTAG 0.000298 ACTAT 0.00124 ACTCA 0.000395 ACTCC 0.000185 ACTCG 0.000531 ACTCT 0.000499 ACTGA 0.000546 ACTGC 0.000282 ACTGG 0.000218 ACTGT 0.000608 ACTTA 0.00119 ACTTC 0.000643 ACTTG 0.000681 ACTTT 0.00191 AGAAA 0.00384 AGAAC 0.00064 AGAAG 0.00105 AGAAT 0.00229 AGACA 0.000586 AGACC 0.000134 AGACG 0.000349 AGACT 0.000373 AGAGA 0.00172 AGAGC 0.000278 AGAGG 0.000463 AGAGT 0.000499 AGATA 0.00192 AGATC 0.000611 AGATG 0.000713 AGATT 0.00175 AGCAA 0.000783 AGCAC 0.000283 AGCAG 0.000264 AGCAT 0.000602 AGCCA 0.000249 AGCCC 7.61e-05 AGCCG 0.000152 AGCCT 0.000172 AGCGA 0.00045 AGCGC 0.000211 AGCGG 0.000184 AGCGT 0.000331 AGCTA 0.000341 AGCTC 0.000205 AGCTG 0.000238 AGCTT 0.000479 AGGAA 0.00112 AGGAC 0.000196 AGGAG 0.000414 AGGAT 0.000642 AGGCA 0.00026 AGGCC 0.000102 AGGCG 0.000182 AGGCT 0.000172 AGGGA 0.000415 AGGGC 0.000103 AGGGG 0.000228 AGGGT 0.000174 AGGTA 0.000419 AGGTC 0.00015 AGGTG 0.000239 AGGTT 0.000439 AGTAA 0.00139 AGTAC 0.000441 AGTAG 0.000441 AGTAT 0.00134 AGTCA 0.000463 AGTCC 0.000139 AGTCG 0.000333 AGTCT 0.000373 AGTGA 0.000695 AGTGC 0.000277 AGTGG 0.000287 AGTGT 0.000559 AGTTA 0.00111 AGTTC 0.00051 AGTTG 0.000565 AGTTT 0.00165 ATAAA 0.00837 ATAAC 0.00166 ATAAG 0.00153 ATAAT 0.00786 ATACA 0.0026 ATACC 0.000467 ATACG 0.000989 ATACT 0.00134 ATAGA 0.00188 ATAGC 0.000501 ATAGG 0.00045 ATAGT 0.00124 ATATA 0.0113 ATATC 0.00232 ATATG 0.0023 ATATT 0.00882 ATCAA 0.00222 ATCAC 0.000801 ATCAG 0.00058 ATCAT 0.00225 ATCCA 0.000699 ATCCC 0.000279 ATCCG 0.000359 ATCCT 0.000642 ATCGA 0.00191 ATCGC 0.000573 ATCGG 0.000434 ATCGT 0.00133 ATCTA 0.00145 ATCTC 0.000879 ATCTG 0.000601 ATCTT 0.00207 ATGAA 0.00272 ATGAC 0.00059 ATGAG 0.000541 ATGAT 0.00225 ATGCA 0.00111 ATGCC 0.00023 ATGCG 0.00048 ATGCT 0.000602 ATGGA 0.000854 ATGGC 0.000354 ATGGG 0.000208 ATGGT 0.000486 ATGTA 0.00247 ATGTC 0.000576 ATGTG 0.0008 ATGTT 0.00197 ATTAA 0.00637 ATTAC 0.0018 ATTAG 0.00117 ATTAT 0.00786 ATTCA 0.00237 ATTCC 0.000855 ATTCG 0.00136 ATTCT 0.00229 ATTGA 0.00232 ATTGC 0.000976 ATTGG 0.000676 ATTGT 0.00234 ATTTA 0.00705 ATTTC 0.00321 ATTTG 0.00241 ATTTT 0.01 CAAAA 0.00272 CAAAC 0.000802 CAAAG 0.000869 CAAAT 0.00241 CAACA 0.000832 CAACC 0.000262 CAACG 0.000546 CAACT 0.000565 CAAGA 0.000838 CAAGC 0.000307 CAAGG 0.000289 CAAGT 0.000681 CAATA 0.00214 CAATC 0.000846 CAATG 0.000897 CAATT 0.00243 CACAA 0.000857 CACAC 0.00057 CACAG 0.000326 CACAT 0.0008 CACCA 0.000306 CACCC 0.000147 CACCG 0.000248 CACCT 0.000239 CACGA 0.000724 CACGC 0.000405 CACGG 0.000258 CACGT 0.000645 CACTA 0.000418 CACTC 0.000337 CACTG 0.00033 CACTT 0.000735 CAGAA 0.000801 CAGAC 0.000228 CAGAG 0.000338 CAGAT 0.000601 CAGCA 0.000288 CAGCC 0.000155 CAGCG 0.000196 CAGCT 0.000238 CAGGA 0.000288 CAGGC 0.000127 CAGGG 0.000126 CAGGT 0.000219 CAGTA 0.000474 CAGTC 0.000262 CAGTG 0.00033 CAGTT 0.00059 CATAA 0.00182 CATAC 0.0007 CATAG 0.000486 CATAT 0.0023 CATCA 0.00079 CATCC 0.000343 CATCG 0.000663 CATCT 0.000713 CATGA 0.000693 CATGC 0.000373 CATGG 0.000263 CATGT 0.000731 CATTA 0.00178 CATTC 0.000999 CATTG 0.000897 CATTT 0.00268 CCAAA 0.000645 CCAAC 0.000317 CCAAG 0.000281 CCAAT 0.000676 CCACA 0.00025 CCACC 0.000227 CCACG 0.000325 CCACT 0.000287 CCAGA 0.000241 CCAGC 0.000141 CCAGG 0.000116 CCAGT 0.000218 CCATA 0.000469 CCATC 0.00042 CCATG 0.000263 CCATT 0.000752 CCCAA 0.000185 CCCAC 0.000151 CCCAG 8.04e-05 CCCAT 0.000208 CCCCA 0.000117 CCCCC 0.000212 CCCCG 0.000127 CCCCT 0.000228 CCCGA 0.000164 CCCGC 0.000133 CCCGG 9.23e-05 CCCGT 0.000176 CCCTA 0.000138 CCCTC 0.000315 CCCTG 0.000126 CCCTT 0.00034 CCGAA 0.000321 CCGAC 0.000187 CCGAG 0.000212 CCGAT 0.000434 CCGCA 0.000163 CCGCC 0.000156 CCGCG 0.000248 CCGCT 0.000184 CCGGA 0.000148 CCGGC 0.000122 CCGGG 9.23e-05 CCGGT 0.000183 CCGTA 0.000232 CCGTC 0.000201 CCGTG 0.000258 CCGTT 0.000397 CCTAA 0.000349 CCTAC 0.000181 CCTAG 0.000126 CCTAT 0.00045 CCTCA 0.000191 CCTCC 0.000342 CCTCG 0.000379 CCTCT 0.000463 CCTGA 0.000215 CCTGC 0.000146 CCTGG 0.000116 CCTGT 0.000284 CCTTA 0.00037 CCTTC 0.000483 CCTTG 0.000289 CCTTT 0.000872 CGAAA 0.00164 CGAAC 0.000582 CGAAG 0.000607 CGAAT 0.00136 CGACA 0.000463 CGACC 0.000207 CGACG 0.000454 CGACT 0.000333 CGAGA 0.000802 CGAGC 0.000361 CGAGG 0.000379 CGAGT 0.000531 CGATA 0.00132 CGATC 0.000876 CGATG 0.000663 CGATT 0.00139 CGCAA 0.000513 CGCAC 0.000297 CGCAG 0.000197 CGCAT 0.00048 CGCCA 0.000293 CGCCC 0.000116 CGCCG 0.0002 CGCCT 0.000182 CGCGA 0.000635 CGCGC 0.000418 CGCGG 0.000248 CGCGT 0.000586 CGCTA 0.000265 CGCTC 0.000292 CGCTG 0.000196 CGCTT 0.000424 CGGAA 0.000448 CGGAC 0.00015 CGGAG 0.000198 CGGAT 0.000359 CGGCA 0.000206 CGGCC 0.000152 CGGCG 0.0002 CGGCT 0.000152 CGGGA 0.000212 CGGGC 0.000106 CGGGG 0.000127 CGGGT 0.00012 CGGTA 0.000307 CGGTC 0.000188 CGGTG 0.000248 CGGTT 0.000366 CGTAA 0.000877 CGTAC 0.000424 CGTAG 0.000305 CGTAT 0.000989 CGTCA 0.000401 CGTCC 0.000244 CGTCG 0.000454 CGTCT 0.000349 CGTGA 0.000618 CGTGC 0.000384 CGTGG 0.000325 CGTGT 0.000705 CGTTA 0.000821 CGTTC 0.000697 CGTTG 0.000546 CGTTT 0.00133 CTAAA 0.00123 CTAAC 0.000405 CTAAG 0.000288 CTAAT 0.00117 CTACA 0.000473 CTACC 0.00019 CTACG 0.000305 CTACT 0.000441 CTAGA 0.000384 CTAGC 0.00015 CTAGG 0.000126 CTAGT 0.000298 CTATA 0.00134 CTATC 0.000637 CTATG 0.000486 CTATT 0.00161 CTCAA 0.000554 CTCAC 0.00028 CTCAG 0.000168 CTCAT 0.000541 CTCCA 0.000311 CTCCC 0.00027 CTCCG 0.000198 CTCCT 0.000414 CTCGA 0.000806 CTCGC 0.00038 CTCGG 0.000212 CTCGT 0.000675 CTCTA 0.000502 CTCTC 0.00108 CTCTG 0.000338 CTCTT 0.00103 CTGAA 0.000652 CTGAC 0.000234 CTGAG 0.000168 CTGAT 0.00058 CTGCA 0.000336 CTGCC 0.000174 CTGCG 0.000197 CTGCT 0.000264 CTGGA 0.000269 CTGGC 0.000152 CTGGG 8.04e-05 CTGGT 0.000215 CTGTA 0.000604 CTGTC 0.000317 CTGTG 0.000326 CTGTT 0.000692 CTTAA 0.00127 CTTAC 0.00053 CTTAG 0.000288 CTTAT 0.00153 CTTCA 0.000719 CTTCC 0.000534 CTTCG 0.000607 CTTCT 0.00105 CTTGA 0.000702 CTTGC 0.000376 CTTGG 0.000281 CTTGT 0.000756 CTTTA 0.00155 CTTTC 0.00141 CTTTG 0.000869 CTTTT 0.00303 GAAAA 0.00431 GAAAC 0.00125 GAAAG 0.00141 GAAAT 0.00321 GAACA 0.000901 GAACC 0.00025 GAACG 0.000697 GAACT 0.00051 GAAGA 0.00139 GAAGC 0.000392 GAAGG 0.000483 GAAGT 0.000643 GAATA 0.00244 GAATC 0.000979 GAATG 0.000999 GAATT 0.00246 GACAA 0.000806 GACAC 0.000358 GACAG 0.000317 GACAT 0.000576 GACCA 0.000218 GACCC 9.02e-05 GACCG 0.000188 GACCT 0.00015 GACGA 0.000637 GACGC 0.000256 GACGG 0.000201 GACGT 0.000352 GACTA 0.000341 GACTC 0.000245 GACTG 0.000262 GACTT 0.00046 GAGAA 0.00147 GAGAC 0.00035 GAGAG 0.00108 GAGAT 0.000879 GAGCA 0.000367 GAGCC 0.000137 GAGCG 0.000292 GAGCT 0.000205 GAGGA 0.000604 GAGGC 0.000199 GAGGG 0.000315 GAGGT 0.000256 GAGTA 0.000487 GAGTC 0.000245 GAGTG 0.000337 GAGTT 0.00054 GATAA 0.00228 GATAC 0.000775 GATAG 0.000637 GATAT 0.00232 GATCA 0.000816 GATCC 0.000341 GATCG 0.000876 GATCT 0.000611 GATGA 0.000998 GATGC 0.000401 GATGG 0.00042 GATGT 0.000689 GATTA 0.00176 GATTC 0.000979 GATTG 0.000846 GATTT 0.00232 GCAAA 0.00109 GCAAC 0.000442 GCAAG 0.000376 GCAAT 0.000976 GCACA 0.000454 GCACC 0.000165 GCACG 0.000384 GCACT 0.000277 GCAGA 0.000336 GCAGC 0.000205 GCAGG 0.000146 GCAGT 0.000282 GCATA 0.000781 GCATC 0.000401 GCATG 0.000373 GCATT 0.000867 GCCAA 0.000344 GCCAC 0.000227 GCCAG 0.000152 GCCAT 0.000354 GCCCA 9.62e-05 GCCCC 8.99e-05 GCCCG 0.000106 GCCCT 0.000103 GCCGA 0.000226 GCCGC 0.000179 GCCGG 0.000122 GCCGT 0.000183 GCCTA 0.000153 GCCTC 0.000199 GCCTG 0.000127 GCCTT 0.000237 GCGAA 0.000642 GCGAC 0.000275 GCGAG 0.00038 GCGAT 0.000573 GCGCA 0.00032 GCGCC 0.000183 GCGCG 0.000418 GCGCT 0.000211 GCGGA 0.000235 GCGGC 0.000179 GCGGG 0.000133 GCGGT 0.000202 GCGTA 0.000417 GCGTC 0.000256 GCGTG 0.000405 GCGTT 0.000511 GCTAA 0.000412 GCTAC 0.000237 GCTAG 0.00015 GCTAT 0.000501 GCTCA 0.000213 GCTCC 0.000149 GCTCG 0.000361 GCTCT 0.000278 GCTGA 0.00025 GCTGC 0.000205 GCTGG 0.000141 GCTGT 0.00028 GCTTA 0.000432 GCTTC 0.000392 GCTTG 0.000307 GCTTT 0.000711 GGAAA 0.00139 GGAAC 0.0004 GGAAG 0.000534 GGAAT 0.000855 GGACA 0.000268 GGACC 9.27e-05 GGACG 0.000244 GGACT 0.000139 GGAGA 0.000517 GGAGC 0.000149 GGAGG 0.000342 GGAGT 0.000185 GGATA 0.000679 GGATC 0.000341 GGATG 0.000343 GGATT 0.000615 GGCAA 0.000359 GGCAC 0.000195 GGCAG 0.000174 GGCAT 0.00023 GGCCA 0.00017 GGCCC 7.56e-05 GGCCG 0.000152 GGCCT 0.000102 GGCGA 0.000267 GGCGC 0.000183 GGCGG 0.000156 GGCGT 0.000186 GGCTA 0.000166 GGCTC 0.000137 GGCTG 0.000155 GGCTT 0.000192 GGGAA 0.000488 GGGAC 0.000131 GGGAG 0.00027 GGGAT 0.000279 GGGCA 0.000128 GGGCC 7.56e-05 GGGCG 0.000116 GGGCT 7.61e-05 GGGGA 0.000274 GGGGC 8.99e-05 GGGGG 0.000212 GGGGT 0.000108 GGGTA 0.000146 GGGTC 9.02e-05 GGGTG 0.000147 GGGTT 0.000163 GGTAA 0.000508 GGTAC 0.000211 GGTAG 0.00019 GGTAT 0.000467 GGTCA 0.000211 GGTCC 9.27e-05 GGTCG 0.000207 GGTCT 0.000134 GGTGA 0.000301 GGTGC 0.000165 GGTGG 0.000227 GGTGT 0.000245 GGTTA 0.000484 GGTTC 0.00025 GGTTG 0.000262 GGTTT 0.000476 GTAAA 0.00199 GTAAC 0.000655 GTAAG 0.00053 GTAAT 0.0018 GTACA 0.00092 GTACC 0.000211 GTACG 0.000424 GTACT 0.000441 GTAGA 0.000569 GTAGC 0.000237 GTAGG 0.000181 GTAGT 0.000422 GTATA 0.0021 GTATC 0.000775 GTATG 0.0007 GTATT 0.00182 GTCAA 0.000632 GTCAC 0.000359 GTCAG 0.000234 GTCAT 0.00059 GTCCA 0.000266 GTCCC 0.000131 GTCCG 0.00015 GTCCT 0.000196 GTCGA 0.000571 GTCGC 0.000275 GTCGG 0.000187 GTCGT 0.000425 GTCTA 0.000341 GTCTC 0.00035 GTCTG 0.000228 GTCTT 0.000523 GTGAA 0.000991 GTGAC 0.000359 GTGAG 0.00028 GTGAT 0.000801 GTGCA 0.000505 GTGCC 0.000195 GTGCG 0.000297 GTGCT 0.000283 GTGGA 0.000426 GTGGC 0.000227 GTGGG 0.000151 GTGGT 0.000286 GTGTA 0.000857 GTGTC 0.000358 GTGTG 0.00057 GTGTT 0.000753 GTTAA 0.0015 GTTAC 0.000655 GTTAG 0.000405 GTTAT 0.00166 GTTCA 0.000736 GTTCC 0.0004 GTTCG 0.000582 GTTCT 0.00064 GTTGA 0.000756 GTTGC 0.000442 GTTGG 0.000317 GTTGT 0.000688 GTTTA 0.00157 GTTTC 0.00125 GTTTG 0.000802 GTTTT 0.00225 TAAAA 0.00829 TAAAC 0.00157 TAAAG 0.00155 TAAAT 0.00705 TAACA 0.0018 TAACC 0.000484 TAACG 0.000821 TAACT 0.00111 TAAGA 0.00163 TAAGC 0.000432 TAAGG 0.00037 TAAGT 0.00119 TAATA 0.00685 TAATC 0.00176 TAATG 0.00178 TAATT 0.0068 TACAA 0.00226 TACAC 0.000857 TACAG 0.000604 TACAT 0.00247 TACCA 0.000504 TACCC 0.000146 TACCG 0.000307 TACCT 0.000419 TACGA 0.00101 TACGC 0.000417 TACGG 0.000232 TACGT 0.000933 TACTA 0.00104 TACTC 0.000487 TACTG 0.000474 TACTT 0.00161 TAGAA 0.00194 TAGAC 0.000341 TAGAG 0.000502 TAGAT 0.00145 TAGCA 0.000528 TAGCC 0.000166 TAGCG 0.000265 TAGCT 0.000341 TAGGA 0.000479 TAGGC 0.000153 TAGGG 0.000138 TAGGT 0.000335 TAGTA 0.00104 TAGTC 0.000341 TAGTG 0.000418 TAGTT 0.0011 TATAA 0.00698 TATAC 0.0021 TATAG 0.00134 TATAT 0.0113 TATCA 0.00209 TATCC 0.000679 TATCG 0.00132 TATCT 0.00192 TATGA 0.00186 TATGC 0.000781 TATGG 0.000469 TATGT 0.0022 TATTA 0.00685 TATTC 0.00244 TATTG 0.00214 TATTT 0.00915 TCAAA 0.0024 TCAAC 0.000756 TCAAG 0.000702 TCAAT 0.00232 TCACA 0.000818 TCACC 0.000301 TCACG 0.000618 TCACT 0.000695 TCAGA 0.000623 TCAGC 0.00025 TCAGG 0.000215 TCAGT 0.000546 TCATA 0.00186 TCATC 0.000998 TCATG 0.000693 TCATT 0.00255 TCCAA 0.000844 TCCAC 0.000426 TCCAG 0.000269 TCCAT 0.000854 TCCCA 0.000267 TCCCC 0.000274 TCCCG 0.000212 TCCCT 0.000415 TCCGA 0.00036 TCCGC 0.000235 TCCGG 0.000148 TCCGT 0.000412 TCCTA 0.000479 TCCTC 0.000604 TCCTG 0.000288 TCCTT 0.001 TCGAA 0.00177 TCGAC 0.000571 TCGAG 0.000806 TCGAT 0.00191 TCGCA 0.000518 TCGCC 0.000267 TCGCG 0.000635 TCGCT 0.00045 TCGGA 0.00036 TCGGC 0.000226 TCGGG 0.000164 TCGGT 0.000404 TCGTA 0.00101 TCGTC 0.000637 TCGTG 0.000724 TCGTT 0.00151 TCTAA 0.0014 TCTAC 0.000569 TCTAG 0.000384 TCTAT 0.00188 TCTCA 0.000745 TCTCC 0.000517 TCTCG 0.000802 TCTCT 0.00172 TCTGA 0.000623 TCTGC 0.000336 TCTGG 0.000241 TCTGT 0.000768 TCTTA 0.00163 TCTTC 0.00139 TCTTG 0.000838 TCTTT 0.00337 TGAAA 0.00332 TGAAC 0.000736 TGAAG 0.000719 TGAAT 0.00237 TGACA 0.000739 TGACC 0.000211 TGACG 0.000401 TGACT 0.000463 TGAGA 0.000745 TGAGC 0.000213 TGAGG 0.000191 TGAGT 0.000395 TGATA 0.00209 TGATC 0.000816 TGATG 0.00079 TGATT 0.00215 TGCAA 0.00123 TGCAC 0.000505 TGCAG 0.000336 TGCAT 0.00111 TGCCA 0.000365 TGCCC 0.000128 TGCCG 0.000206 TGCCT 0.00026 TGCGA 0.000518 TGCGC 0.00032 TGCGG 0.000163 TGCGT 0.000487 TGCTA 0.000528 TGCTC 0.000367 TGCTG 0.000288 TGCTT 0.000748 TGGAA 0.00112 TGGAC 0.000266 TGGAG 0.000311 TGGAT 0.000699 TGGCA 0.000365 TGGCC 0.00017 TGGCG 0.000293 TGGCT 0.000249 TGGGA 0.000267 TGGGC 9.62e-05 TGGGG 0.000117 TGGGT 0.000144 TGGTA 0.000504 TGGTC 0.000218 TGGTG 0.000306 TGGTT 0.000503 TGTAA 0.00219 TGTAC 0.00092 TGTAG 0.000473 TGTAT 0.0026 TGTCA 0.000739 TGTCC 0.000268 TGTCG 0.000463 TGTCT 0.000586 TGTGA 0.000818 TGTGC 0.000454 TGTGG 0.00025 TGTGT 0.00103 TGTTA 0.0018 TGTTC 0.000901 TGTTG 0.000832 TGTTT 0.00242 TTAAA 0.00688 TTAAC 0.0015 TTAAG 0.00127 TTAAT 0.00637 TTACA 0.00219 TTACC 0.000508 TTACG 0.000877 TTACT 0.00139 TTAGA 0.0014 TTAGC 0.000412 TTAGG 0.000349 TTAGT 0.000939 TTATA 0.00698 TTATC 0.00228 TTATG 0.00182 TTATT 0.00833 TTCAA 0.00278 TTCAC 0.000991 TTCAG 0.000652 TTCAT 0.00272 TTCCA 0.00112 TTCCC 0.000488 TTCCG 0.000448 TTCCT 0.00112 TTCGA 0.00177 TTCGC 0.000642 TTCGG 0.000321 TTCGT 0.00145 TTCTA 0.00194 TTCTC 0.00147 TTCTG 0.000801 TTCTT 0.00361 TTGAA 0.00278 TTGAC 0.000632 TTGAG 0.000554 TTGAT 0.00222 TTGCA 0.00123 TTGCC 0.000359 TTGCG 0.000513 TTGCT 0.000783 TTGGA 0.000844 TTGGC 0.000344 TTGGG 0.000185 TTGGT 0.000545 TTGTA 0.00226 TTGTC 0.000806 TTGTG 0.000857 TTGTT 0.00253 TTTAA 0.00688 TTTAC 0.00199 TTTAG 0.00123 TTTAT 0.00837 TTTCA 0.00332 TTTCC 0.00139 TTTCG 0.00164 TTTCT 0.00384 TTTGA 0.0024 TTTGC 0.00109 TTTGG 0.000645 TTTGT 0.00266 TTTTA 0.00829 TTTTC 0.00431 TTTTG 0.00272 TTTTT 0.0147 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4898 AAAAC 0.07499 AAAAG 0.101 AAAAT 0.3343 AAACA 0.4113 AAACC 0.08096 AAACG 0.2261 AAACT 0.2816 AAAGA 0.4916 AAAGC 0.1036 AAAGG 0.1271 AAAGT 0.2777 AAATA 0.4028 AAATC 0.1022 AAATG 0.1181 AAATT 0.3768 AACAA 0.4253 AACAC 0.1267 AACAG 0.1164 AACAT 0.3317 AACCA 0.342 AACCC 0.1108 AACCG 0.249 AACCT 0.2982 AACGA 0.4447 AACGC 0.1507 AACGG 0.1171 AACGT 0.2874 AACTA 0.286 AACTC 0.1405 AACTG 0.1535 AACTT 0.42 AAGAA 0.4988 AAGAC 0.07226 AAGAG 0.143 AAGAT 0.286 AAGCA 0.4061 AAGCC 0.104 AAGCG 0.2299 AAGCT 0.26 AAGGA 0.4973 AAGGC 0.1178 AAGGG 0.1686 AAGGT 0.2163 AAGTA 0.3642 AAGTC 0.1041 AAGTG 0.1664 AAGTT 0.3652 AATAA 0.4048 AATAC 0.08856 AATAG 0.07826 AATAT 0.4283 AATCA 0.3639 AATCC 0.1041 AATCG 0.2355 AATCT 0.2965 AATGA 0.4008 AATGC 0.1363 AATGG 0.1181 AATGT 0.3448 AATTA 0.3357 AATTC 0.1213 AATTG 0.1202 AATTT 0.4227 ACAAA 0.4129 ACAAC 0.1066 ACAAG 0.1172 ACAAT 0.3633 ACACA 0.4054 ACACC 0.09661 ACACG 0.2778 ACACT 0.2203 ACAGA 0.396 ACAGC 0.1443 ACAGG 0.1464 ACAGT 0.3134 ACATA 0.3784 ACATC 0.1185 ACATG 0.1258 ACATT 0.3773 ACCAA 0.3559 ACCAC 0.1863 ACCAG 0.1405 ACCAT 0.3173 ACCCA 0.2636 ACCCC 0.1984 ACCCG 0.2202 ACCCT 0.3177 ACCGA 0.3645 ACCGC 0.1826 ACCGG 0.165 ACCGT 0.2879 ACCTA 0.2691 ACCTC 0.2054 ACCTG 0.1758 ACCTT 0.3498 ACGAA 0.3735 ACGAC 0.1094 ACGAG 0.1738 ACGAT 0.3434 ACGCA 0.3062 ACGCC 0.1167 ACGCG 0.3687 ACGCT 0.2083 ACGGA 0.3781 ACGGC 0.1677 ACGGG 0.1613 ACGGT 0.293 ACGTA 0.3212 ACGTC 0.1211 ACGTG 0.222 ACGTT 0.3357 ACTAA 0.3235 ACTAC 0.1453 ACTAG 0.1028 ACTAT 0.4284 ACTCA 0.2453 ACTCC 0.1147 ACTCG 0.3301 ACTCT 0.3099 ACTGA 0.3302 ACTGC 0.1707 ACTGG 0.1317 ACTGT 0.3674 ACTTA 0.269 ACTTC 0.1456 ACTTG 0.1541 ACTTT 0.4314 AGAAA 0.4908 AGAAC 0.08183 AGAAG 0.1347 AGAAT 0.2927 AGACA 0.4063 AGACC 0.0931 AGACG 0.2419 AGACT 0.2587 AGAGA 0.5812 AGAGC 0.09391 AGAGG 0.1564 AGAGT 0.1685 AGATA 0.3839 AGATC 0.1224 AGATG 0.1427 AGATT 0.351 AGCAA 0.4055 AGCAC 0.1466 AGCAG 0.1364 AGCAT 0.3116 AGCCA 0.3842 AGCCC 0.1173 AGCCG 0.2342 AGCCT 0.2643 AGCGA 0.3824 AGCGC 0.1796 AGCGG 0.1564 AGCGT 0.2816 AGCTA 0.2698 AGCTC 0.1626 AGCTG 0.1882 AGCTT 0.3794 AGGAA 0.4721 AGGAC 0.0828 AGGAG 0.1744 AGGAT 0.2707 AGGCA 0.363 AGGCC 0.1428 AGGCG 0.2547 AGGCT 0.2394 AGGGA 0.4509 AGGGC 0.112 AGGGG 0.2482 AGGGT 0.1888 AGGTA 0.3361 AGGTC 0.1201 AGGTG 0.1918 AGGTT 0.352 AGTAA 0.3852 AGTAC 0.122 AGTAG 0.122 AGTAT 0.3708 AGTCA 0.3539 AGTCC 0.1063 AGTCG 0.2547 AGTCT 0.285 AGTGA 0.3821 AGTGC 0.1523 AGTGG 0.1581 AGTGT 0.3075 AGTTA 0.2897 AGTTC 0.1328 AGTTG 0.147 AGTTT 0.4305 ATAAA 0.4313 ATAAC 0.08536 ATAAG 0.07857 ATAAT 0.4048 ATACA 0.4819 ATACC 0.08646 ATACG 0.1833 ATACT 0.2483 ATAGA 0.4617 ATAGC 0.1229 ATAGG 0.1103 ATAGT 0.3051 ATATA 0.4579 ATATC 0.09353 ATATG 0.09281 ATATT 0.3558 ATCAA 0.3793 ATCAC 0.1369 ATCAG 0.09908 ATCAT 0.3846 ATCCA 0.3533 ATCCC 0.141 ATCCG 0.1813 ATCCT 0.3244 ATCGA 0.4488 ATCGC 0.1348 ATCGG 0.1023 ATCGT 0.3141 ATCTA 0.2896 ATCTC 0.176 ATCTG 0.1204 ATCTT 0.4141 ATGAA 0.4459 ATGAC 0.09664 ATGAG 0.08863 ATGAT 0.3688 ATGCA 0.4584 ATGCC 0.09505 ATGCG 0.1981 ATGCT 0.2485 ATGGA 0.4491 ATGGC 0.1862 ATGGG 0.1091 ATGGT 0.2556 ATGTA 0.424 ATGTC 0.09907 ATGTG 0.1376 ATGTT 0.3393 ATTAA 0.3704 ATTAC 0.1046 ATTAG 0.06803 ATTAT 0.4569 ATTCA 0.3447 ATTCC 0.1244 ATTCG 0.1979 ATTCT 0.3331 ATTGA 0.3672 ATTGC 0.1546 ATTGG 0.107 ATTGT 0.3712 ATTTA 0.3106 ATTTC 0.1411 ATTTG 0.1063 ATTTT 0.442 CAAAA 0.3996 CAAAC 0.1178 CAAAG 0.1277 CAAAT 0.3549 CAACA 0.3774 CAACC 0.1188 CAACG 0.2476 CAACT 0.2562 CAAGA 0.396 CAAGC 0.1453 CAAGG 0.1369 CAAGT 0.3218 CAATA 0.3383 CAATC 0.134 CAATG 0.1421 CAATT 0.3855 CACAA 0.3357 CACAC 0.2232 CACAG 0.1278 CACAT 0.3134 CACCA 0.326 CACCC 0.1562 CACCG 0.2634 CACCT 0.2543 CACGA 0.3562 CACGC 0.1993 CACGG 0.1271 CACGT 0.3174 CACTA 0.2297 CACTC 0.1853 CACTG 0.1811 CACTT 0.4039 CAGAA 0.4067 CAGAC 0.116 CAGAG 0.1719 CAGAT 0.3054 CAGCA 0.3288 CAGCC 0.1765 CAGCG 0.2236 CAGCT 0.2712 CAGGA 0.3792 CAGGC 0.1669 CAGGG 0.166 CAGGT 0.2878 CAGTA 0.2864 CAGTC 0.1582 CAGTG 0.1992 CAGTT 0.3562 CATAA 0.3435 CATAC 0.1318 CATAG 0.09157 CATAT 0.4331 CATCA 0.315 CATCC 0.1368 CATCG 0.2642 CATCT 0.284 CATGA 0.3365 CATGC 0.1809 CATGG 0.1275 CATGT 0.3551 CATTA 0.2804 CATTC 0.157 CATTG 0.141 CATTT 0.4216 CCAAA 0.3362 CCAAC 0.165 CCAAG 0.1466 CCAAT 0.3522 CCACA 0.2294 CCACC 0.2087 CCACG 0.2984 CCACT 0.2635 CCAGA 0.3368 CCAGC 0.1972 CCAGG 0.1619 CCAGT 0.3041 CCATA 0.2463 CCATC 0.2208 CCATG 0.138 CCATT 0.3949 CCCAA 0.2967 CCCAC 0.2423 CCCAG 0.1287 CCCAT 0.3323 CCCCA 0.1709 CCCCC 0.3095 CCCCG 0.1858 CCCCT 0.3339 CCCGA 0.2906 CCCGC 0.2357 CCCGG 0.1632 CCCGT 0.3106 CCCTA 0.1505 CCCTC 0.343 CCCTG 0.1373 CCCTT 0.3692 CCGAA 0.2784 CCGAC 0.1616 CCGAG 0.1837 CCGAT 0.3762 CCGCA 0.2168 CCGCC 0.208 CCGCG 0.3301 CCGCT 0.2451 CCGGA 0.2719 CCGGC 0.2242 CCGGG 0.1691 CCGGT 0.3348 CCGTA 0.2134 CCGTC 0.1845 CCGTG 0.2373 CCGTT 0.3648 CCTAA 0.3158 CCTAC 0.1637 CCTAG 0.1141 CCTAT 0.4064 CCTCA 0.1386 CCTCC 0.2488 CCTCG 0.2759 CCTCT 0.3367 CCTGA 0.2824 CCTGC 0.192 CCTGG 0.1525 CCTGT 0.3731 CCTTA 0.1838 CCTTC 0.2399 CCTTG 0.1437 CCTTT 0.4326 CGAAA 0.3908 CGAAC 0.1391 CGAAG 0.145 CGAAT 0.325 CGACA 0.318 CGACC 0.1421 CGACG 0.3113 CGACT 0.2286 CGAGA 0.3869 CGAGC 0.1739 CGAGG 0.183 CGAGT 0.2562 CGATA 0.3103 CGATC 0.2061 CGATG 0.156 CGATT 0.3276 CGCAA 0.3451 CGCAC 0.1998 CGCAG 0.1325 CGCAT 0.3227 CGCCA 0.3703 CGCCC 0.1464 CGCCG 0.2529 CGCCT 0.2305 CGCGA 0.3365 CGCGC 0.2217 CGCGG 0.1312 CGCGT 0.3105 CGCTA 0.2251 CGCTC 0.2481 CGCTG 0.1666 CGCTT 0.3602 CGGAA 0.3879 CGGAC 0.1301 CGGAG 0.1716 CGGAT 0.3104 CGGCA 0.29 CGGCC 0.2143 CGGCG 0.2818 CGGCT 0.2139 CGGGA 0.3743 CGGGC 0.1883 CGGGG 0.2246 CGGGT 0.2128 CGGTA 0.2767 CGGTC 0.1692 CGGTG 0.2235 CGGTT 0.3306 CGTAA 0.338 CGTAC 0.1633 CGTAG 0.1175 CGTAT 0.3811 CGTCA 0.277 CGTCC 0.1684 CGTCG 0.3136 CGTCT 0.241 CGTGA 0.3041 CGTGC 0.189 CGTGG 0.1601 CGTGT 0.3468 CGTTA 0.2421 CGTTC 0.2055 CGTTG 0.1609 CGTTT 0.3916 CTAAA 0.3981 CTAAC 0.1309 CTAAG 0.09317 CTAAT 0.3778 CTACA 0.3355 CTACC 0.135 CTACG 0.2165 CTACT 0.313 CTAGA 0.4009 CTAGC 0.1563 CTAGG 0.1317 CTAGT 0.3112 CTATA 0.3293 CTATC 0.1563 CTATG 0.1193 CTATT 0.3951 CTCAA 0.3593 CTCAC 0.1813 CTCAG 0.1089 CTCAT 0.3504 CTCCA 0.2604 CTCCC 0.2267 CTCCG 0.1662 CTCCT 0.3467 CTCGA 0.3888 CTCGC 0.1834 CTCGG 0.1023 CTCGT 0.3255 CTCTA 0.1696 CTCTC 0.3666 CTCTG 0.1144 CTCTT 0.3493 CTGAA 0.3993 CTGAC 0.1431 CTGAG 0.1029 CTGAT 0.3547 CTGCA 0.3463 CTGCC 0.1789 CTGCG 0.2031 CTGCT 0.2717 CTGGA 0.3751 CTGGC 0.2126 CTGGG 0.1121 CTGGT 0.3002 CTGTA 0.3115 CTGTC 0.1636 CTGTG 0.1681 CTGTT 0.3568 CTTAA 0.3521 CTTAC 0.1465 CTTAG 0.07975 CTTAT 0.4216 CTTCA 0.2468 CTTCC 0.1831 CTTCG 0.2083 CTTCT 0.3617 CTTGA 0.3317 CTTGC 0.1778 CTTGG 0.133 CTTGT 0.3575 CTTTA 0.2259 CTTTC 0.2058 CTTTG 0.1266 CTTTT 0.4417 GAAAA 0.4234 GAAAC 0.1227 GAAAG 0.1388 GAAAT 0.3151 GAACA 0.3821 GAACC 0.106 GAACG 0.2955 GAACT 0.2163 GAAGA 0.4789 GAAGC 0.1345 GAAGG 0.166 GAAGT 0.2207 GAATA 0.3551 GAATC 0.1424 GAATG 0.1452 GAATT 0.3573 GACAA 0.3918 GACAC 0.1739 GACAG 0.1543 GACAT 0.28 GACCA 0.338 GACCC 0.1397 GACCG 0.2905 GACCT 0.2318 GACGA 0.4405 GACGC 0.1773 GACGG 0.1389 GACGT 0.2433 GACTA 0.261 GACTC 0.1871 GACTG 0.2001 GACTT 0.3518 GAGAA 0.3887 GAGAC 0.09251 GAGAG 0.2866 GAGAT 0.2322 GAGCA 0.3664 GAGCC 0.1368 GAGCG 0.2916 GAGCT 0.2052 GAGGA 0.4394 GAGGC 0.145 GAGGG 0.2295 GAGGT 0.1861 GAGTA 0.3028 GAGTC 0.1521 GAGTG 0.2097 GAGTT 0.3355 GATAA 0.3791 GATAC 0.129 GATAG 0.1061 GATAT 0.3858 GATCA 0.3086 GATCC 0.1291 GATCG 0.3312 GATCT 0.2312 GATGA 0.3977 GATGC 0.16 GATGG 0.1675 GATGT 0.2748 GATTA 0.2984 GATTC 0.1656 GATTG 0.1432 GATTT 0.3928 GCAAA 0.3784 GCAAC 0.1531 GCAAG 0.1303 GCAAT 0.3382 GCACA 0.3549 GCACC 0.129 GCACG 0.2999 GCACT 0.2162 GCAGA 0.3467 GCAGC 0.2115 GCAGG 0.1507 GCAGT 0.2912 GCATA 0.3223 GCATC 0.1657 GCATG 0.1538 GCATT 0.3581 GCCAA 0.319 GCCAC 0.2105 GCCAG 0.1415 GCCAT 0.3289 GCCCA 0.2431 GCCCC 0.2273 GCCCG 0.2691 GCCCT 0.2605 GCCGA 0.3178 GCCGC 0.2527 GCCGG 0.1724 GCCGT 0.2572 GCCTA 0.2133 GCCTC 0.2782 GCCTG 0.1772 GCCTT 0.3313 GCGAA 0.3433 GCGAC 0.1472 GCGAG 0.2034 GCGAT 0.3061 GCGCA 0.2823 GCGCC 0.1616 GCGCG 0.3696 GCGCT 0.1866 GCGGA 0.3136 GCGGC 0.2391 GCGGG 0.1776 GCGGT 0.2697 GCGTA 0.2623 GCGTC 0.1613 GCGTG 0.2548 GCGTT 0.3216 GCTAA 0.3167 GCTAC 0.1824 GCTAG 0.1153 GCTAT 0.3856 GCTCA 0.2131 GCTCC 0.1489 GCTCG 0.3603 GCTCT 0.2778 GCTGA 0.2849 GCTGC 0.2341 GCTGG 0.1614 GCTGT 0.3195 GCTTA 0.2346 GCTTC 0.2127 GCTTG 0.1668 GCTTT 0.3858 GGAAA 0.4366 GGAAC 0.1259 GGAAG 0.1681 GGAAT 0.2694 GGACA 0.3606 GGACC 0.1247 GGACG 0.3276 GGACT 0.1871 GGAGA 0.4334 GGAGC 0.1249 GGAGG 0.2869 GGAGT 0.1548 GGATA 0.3431 GGATC 0.1725 GGATG 0.1735 GGATT 0.3109 GGCAA 0.3749 GGCAC 0.2039 GGCAG 0.181 GGCAT 0.2402 GGCCA 0.3397 GGCCC 0.1513 GGCCG 0.3044 GGCCT 0.2046 GGCGA 0.3373 GGCGC 0.2311 GGCGG 0.1972 GGCGT 0.2344 GGCTA 0.2558 GGCTC 0.211 GGCTG 0.2382 GGCTT 0.2951 GGGAA 0.4177 GGGAC 0.1118 GGGAG 0.2316 GGGAT 0.239 GGGCA 0.3232 GGGCC 0.1913 GGGCG 0.293 GGGCT 0.1925 GGGGA 0.4003 GGGGC 0.1315 GGGGG 0.3095 GGGGT 0.1586 GGGTA 0.2676 GGGTC 0.1651 GGGTG 0.2687 GGGTT 0.2985 GGTAA 0.3694 GGTAC 0.1533 GGTAG 0.1382 GGTAT 0.3391 GGTCA 0.3276 GGTCC 0.1436 GGTCG 0.3208 GGTCT 0.208 GGTGA 0.3205 GGTGC 0.176 GGTGG 0.2423 GGTGT 0.2611 GGTTA 0.329 GGTTC 0.1699 GGTTG 0.1779 GGTTT 0.3232 GTAAA 0.3996 GTAAC 0.1318 GTAAG 0.1066 GTAAT 0.362 GTACA 0.4609 GTACC 0.1057 GTACG 0.2124 GTACT 0.221 GTAGA 0.4036 GTAGC 0.1683 GTAGG 0.1285 GTAGT 0.2995 GTATA 0.3889 GTATC 0.1436 GTATG 0.1297 GTATT 0.3378 GTCAA 0.3484 GTCAC 0.1979 GTCAG 0.1288 GTCAT 0.3248 GTCCA 0.3581 GTCCC 0.1756 GTCCG 0.2023 GTCCT 0.2641 GTCGA 0.3915 GTCGC 0.1889 GTCGG 0.1281 GTCGT 0.2916 GTCTA 0.2366 GTCTC 0.2428 GTCTG 0.1584 GTCTT 0.3623 GTGAA 0.4077 GTGAC 0.1478 GTGAG 0.1151 GTGAT 0.3295 GTGCA 0.3945 GTGCC 0.1525 GTGCG 0.2319 GTGCT 0.221 GTGGA 0.391 GTGGC 0.2081 GTGGG 0.1389 GTGGT 0.262 GTGTA 0.3377 GTGTC 0.141 GTGTG 0.2245 GTGTT 0.2969 GTTAA 0.3558 GTTAC 0.1553 GTTAG 0.09605 GTTAT 0.3928 GTTCA 0.3121 GTTCC 0.1695 GTTCG 0.2469 GTTCT 0.2715 GTTGA 0.3434 GTTGC 0.2006 GTTGG 0.1438 GTTGT 0.3122 GTTTA 0.2676 GTTTC 0.2126 GTTTG 0.1365 GTTTT 0.3834 TAAAA 0.449 TAAAC 0.0851 TAAAG 0.08393 TAAAT 0.3819 TAACA 0.4265 TAACC 0.1148 TAACG 0.1948 TAACT 0.2639 TAAGA 0.4497 TAAGC 0.1195 TAAGG 0.1024 TAAGT 0.3284 TAATA 0.3984 TAATC 0.1026 TAATG 0.1037 TAATT 0.3953 TACAA 0.3652 TACAC 0.1385 TACAG 0.09767 TACAT 0.3986 TACCA 0.3663 TACCC 0.1063 TACCG 0.2229 TACCT 0.3045 TACGA 0.3903 TACGC 0.1607 TACGG 0.08953 TACGT 0.3595 TACTA 0.2888 TACTC 0.1348 TACTG 0.1311 TACTT 0.4452 TAGAA 0.4592 TAGAC 0.08062 TAGAG 0.1186 TAGAT 0.3416 TAGCA 0.4062 TAGCC 0.1278 TAGCG 0.2038 TAGCT 0.2622 TAGGA 0.433 TAGGC 0.1382 TAGGG 0.1253 TAGGT 0.3034 TAGTA 0.3597 TAGTC 0.1176 TAGTG 0.1441 TAGTT 0.3786 TATAA 0.3207 TATAC 0.09641 TATAG 0.06166 TATAT 0.5213 TATCA 0.3483 TATCC 0.113 TATCG 0.2195 TATCT 0.3191 TATGA 0.3501 TATGC 0.1471 TATGG 0.08832 TATGT 0.4146 TATTA 0.3329 TATTC 0.1187 TATTG 0.1038 TATTT 0.4446 TCAAA 0.3889 TCAAC 0.1224 TCAAG 0.1135 TCAAT 0.3752 TCACA 0.3365 TCACC 0.1237 TCACG 0.2541 TCACT 0.2856 TCAGA 0.3814 TCAGC 0.1528 TCAGG 0.1315 TCAGT 0.3343 TCATA 0.3046 TCATC 0.1635 TCATG 0.1136 TCATT 0.4182 TCCAA 0.3527 TCCAC 0.178 TCCAG 0.1124 TCCAT 0.3569 TCCCA 0.2291 TCCCC 0.2344 TCCCG 0.1813 TCCCT 0.3552 TCCGA 0.3115 TCCGC 0.2037 TCCGG 0.1285 TCCGT 0.3564 TCCTA 0.2017 TCCTC 0.2545 TCCTG 0.1216 TCCTT 0.4222 TCGAA 0.3505 TCGAC 0.1129 TCGAG 0.1595 TCGAT 0.3771 TCGCA 0.2769 TCGCC 0.1428 TCGCG 0.3397 TCGCT 0.2405 TCGGA 0.3119 TCGGC 0.1956 TCGGG 0.1424 TCGGT 0.3501 TCGTA 0.2609 TCGTC 0.1641 TCGTG 0.1865 TCGTT 0.3886 TCTAA 0.3299 TCTAC 0.1344 TCTAG 0.09085 TCTAT 0.4449 TCTCA 0.1969 TCTCC 0.1366 TCTCG 0.212 TCTCT 0.4546 TCTGA 0.3166 TCTGC 0.1708 TCTGG 0.1226 TCTGT 0.39 TCTTA 0.225 TCTTC 0.1929 TCTTG 0.1158 TCTTT 0.4663 TGAAA 0.4643 TGAAC 0.1031 TGAAG 0.1007 TGAAT 0.3318 TGACA 0.4074 TGACC 0.1165 TGACG 0.2209 TGACT 0.2552 TGAGA 0.4827 TGAGC 0.1382 TGAGG 0.1234 TGAGT 0.2557 TGATA 0.3577 TGATC 0.1395 TGATG 0.1351 TGATT 0.3677 TGCAA 0.3867 TGCAC 0.1588 TGCAG 0.1056 TGCAT 0.3489 TGCCA 0.3805 TGCCC 0.1333 TGCCG 0.2149 TGCCT 0.2713 TGCGA 0.3482 TGCGC 0.215 TGCGG 0.1094 TGCGT 0.3274 TGCTA 0.2733 TGCTC 0.1899 TGCTG 0.1492 TGCTT 0.3876 TGGAA 0.4669 TGGAC 0.1112 TGGAG 0.1298 TGGAT 0.2921 TGGCA 0.3386 TGGCC 0.1577 TGGCG 0.2722 TGGCT 0.2315 TGGGA 0.4283 TGGGC 0.154 TGGGG 0.1871 TGGGT 0.2307 TGGTA 0.329 TGGTC 0.1425 TGGTG 0.2001 TGGTT 0.3285 TGTAA 0.3547 TGTAC 0.1487 TGTAG 0.07639 TGTAT 0.4203 TGTCA 0.3595 TGTCC 0.1304 TGTCG 0.2254 TGTCT 0.2848 TGTGA 0.3207 TGTGC 0.1781 TGTGG 0.09804 TGTGT 0.4031 TGTTA 0.3024 TGTTC 0.1515 TGTTG 0.1398 TGTTT 0.4062 TTAAA 0.4293 TTAAC 0.09367 TTAAG 0.07948 TTAAT 0.3975 TTACA 0.4414 TTACC 0.1022 TTACG 0.1764 TTACT 0.28 TTAGA 0.4509 TTAGC 0.1329 TTAGG 0.1128 TTAGT 0.3034 TTATA 0.3595 TTATC 0.1173 TTATG 0.09395 TTATT 0.4292 TTCAA 0.3888 TTCAC 0.1388 TTCAG 0.09136 TTCAT 0.381 TTCCA 0.3522 TTCCC 0.1537 TTCCG 0.1413 TTCCT 0.3528 TTCGA 0.4232 TTCGC 0.1534 TTCGG 0.07681 TTCGT 0.3466 TTCTA 0.2484 TTCTC 0.1881 TTCTG 0.1023 TTCTT 0.4611 TTGAA 0.4491 TTGAC 0.1023 TTGAG 0.08968 TTGAT 0.3589 TTGCA 0.4263 TTGCC 0.1245 TTGCG 0.1778 TTGCT 0.2714 TTGGA 0.4401 TTGGC 0.1791 TTGGG 0.09661 TTGGT 0.2842 TTGTA 0.3501 TTGTC 0.1249 TTGTG 0.1328 TTGTT 0.3921 TTTAA 0.3724 TTTAC 0.1076 TTTAG 0.06675 TTTAT 0.4533 TTTCA 0.3258 TTTCC 0.1362 TTTCG 0.1607 TTTCT 0.3773 TTTGA 0.3532 TTTGC 0.1605 TTTGG 0.09481 TTTGT 0.3915 TTTTA 0.2762 TTTTC 0.1435 TTTTG 0.09056 TTTTT 0.4898 [3] # (a,c,g,t)= (0.35, 0.15, 0.15, 0.35) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.355 C 0.145 G 0.145 T 0.355 # l= 1 # Values AA 0.142 AC 0.0432 AG 0.0406 AT 0.129 CA 0.0466 CC 0.0209 CG 0.0373 CT 0.0406 GA 0.0575 GC 0.0238 GG 0.0209 GT 0.0432 TA 0.109 TC 0.0575 TG 0.0466 TT 0.142 # l= 2 # Values AAA 0.0618 AAC 0.0152 AAG 0.0162 AAT 0.0484 ACA 0.0163 ACC 0.0051 ACG 0.0114 ACT 0.0105 AGA 0.0183 AGC 0.00557 AGG 0.00625 AGT 0.0105 ATA 0.0472 ATC 0.018 ATG 0.0155 ATT 0.0484 CAA 0.0173 CAC 0.00819 CAG 0.00563 CAT 0.0155 CCA 0.00638 CCC 0.00368 CCG 0.00457 CCT 0.00625 CGA 0.0147 CGC 0.0067 CGG 0.00457 CGT 0.0114 CTA 0.00923 CTC 0.00949 CTG 0.00563 CTT 0.0162 GAA 0.0238 GAC 0.0062 GAG 0.00949 GAT 0.018 GCA 0.008 GCC 0.00356 GCG 0.0067 GCT 0.00557 GGA 0.00855 GGC 0.00356 GGG 0.00368 GGT 0.0051 GTA 0.0136 GTC 0.0062 GTG 0.00819 GTT 0.0152 TAA 0.0388 TAC 0.0136 TAG 0.00923 TAT 0.0472 TCA 0.016 TCC 0.00855 TCG 0.0147 TCT 0.0183 TGA 0.016 TGC 0.008 TGG 0.00638 TGT 0.0163 TTA 0.0388 TTC 0.0238 TTG 0.0173 TTT 0.0618 # l= 3 # Values AAAA 0.0284 AAAC 0.006 AAAG 0.00715 AAAT 0.0203 AACA 0.00572 AACC 0.00167 AACG 0.00407 AACT 0.00378 AAGA 0.00753 AAGC 0.002 AAGG 0.00237 AAGT 0.00431 AATA 0.0179 AATC 0.00608 AATG 0.00601 AATT 0.0185 ACAA 0.00619 ACAC 0.00278 ACAG 0.00203 ACAT 0.00528 ACCA 0.00165 ACCC 0.000682 ACCG 0.0014 ACCT 0.00136 ACGA 0.00465 ACGC 0.00195 ACGG 0.0014 ACGT 0.00336 ACTA 0.00266 ACTC 0.00183 ACTG 0.00168 ACTT 0.00431 AGAA 0.00813 AGAC 0.00158 AGAG 0.00357 AGAT 0.00499 AGCA 0.00198 AGCC 0.000775 AGCG 0.00145 AGCT 0.00136 AGGA 0.00282 AGGC 0.000862 AGGG 0.0012 AGGT 0.00136 AGTA 0.00339 AGTC 0.00139 AGTG 0.00192 AGTT 0.00378 ATAA 0.0169 ATAC 0.00518 ATAG 0.00383 ATAT 0.0213 ATCA 0.00558 ATCC 0.00233 ATCG 0.00511 ATCT 0.00499 ATGA 0.0057 ATGC 0.00244 ATGG 0.00206 ATGT 0.00528 ATTA 0.0151 ATTC 0.007 ATTG 0.00607 ATTT 0.0203 CAAA 0.00655 CAAC 0.00244 CAAG 0.00228 CAAT 0.00607 CACA 0.00261 CACC 0.00115 CACG 0.00251 CACT 0.00192 CAGA 0.00207 CAGC 0.000992 CAGG 0.000894 CAGT 0.00168 CATA 0.00473 CATC 0.00275 CATG 0.00199 CATT 0.00601 CCAA 0.00213 CCAC 0.00134 CCAG 0.000855 CCAT 0.00206 CCCA 0.000755 CCCC 0.000954 CCCG 0.00077 CCCT 0.0012 CCGA 0.00147 CCGC 0.000986 CCGG 0.000719 CCGT 0.0014 CCTA 0.00117 CCTC 0.00182 CCTG 0.000894 CCTT 0.00237 CGAA 0.00501 CGAC 0.00184 CGAG 0.00274 CGAT 0.0051 CGCA 0.00174 CGCC 0.00102 CGCG 0.00248 CGCT 0.00145 CGGA 0.00146 CGGC 0.000939 CGGG 0.00077 CGGT 0.0014 CGTA 0.00295 CGTC 0.00183 CGTG 0.00251 CGTT 0.00407 CTAA 0.00293 CTAC 0.00149 CTAG 0.000981 CTAT 0.00383 CTCA 0.00162 CTCC 0.00157 CTCG 0.00274 CTCT 0.00357 CTGA 0.00167 CTGC 0.00108 CTGG 0.000854 CTGT 0.00203 CTTA 0.00341 CTTC 0.00338 CTTG 0.00228 CTTT 0.00715 GAAA 0.0107 GAAC 0.00266 GAAG 0.00338 GAAT 0.007 GACA 0.0022 GACC 0.000781 GACG 0.00183 GACT 0.00139 GAGA 0.00461 GAGC 0.00124 GAGG 0.00182 GAGT 0.00183 GATA 0.00602 GATC 0.00314 GATG 0.00276 GATT 0.00608 GCAA 0.00303 GCAC 0.00145 GCAG 0.00108 GCAT 0.00244 GCCA 0.00124 GCCC 0.000518 GCCG 0.000939 GCCT 0.000862 GCGA 0.00235 GCGC 0.00141 GCGG 0.000986 GCGT 0.00195 GCTA 0.00134 GCTC 0.00124 GCTG 0.000993 GCTT 0.002 GGAA 0.00374 GGAC 0.000909 GGAG 0.00157 GGAT 0.00233 GGCA 0.0011 GGCC 0.000662 GGCG 0.00102 GGCT 0.000775 GGGA 0.00153 GGGC 0.000518 GGGG 0.000954 GGGT 0.000683 GGTA 0.00149 GGTC 0.000781 GGTG 0.00115 GGTT 0.00167 GTAA 0.00484 GTAC 0.00207 GTAG 0.00149 GTAT 0.00518 GTCA 0.00188 GTCC 0.000908 GTCG 0.00184 GTCT 0.00158 GTGA 0.00262 GTGC 0.00145 GTGG 0.00134 GTGT 0.00278 GTTA 0.00413 GTTC 0.00266 GTTG 0.00244 GTTT 0.006 TAAA 0.0162 TAAC 0.00414 TAAG 0.00341 TAAT 0.0151 TACA 0.00575 TACC 0.00149 TACG 0.00295 TACT 0.00339 TAGA 0.00407 TAGC 0.00134 TAGG 0.00117 TAGT 0.00266 TATA 0.0186 TATC 0.00602 TATG 0.00473 TATT 0.0179 TCAA 0.00598 TCAC 0.00262 TCAG 0.00167 TCAT 0.0057 TCCA 0.00273 TCCC 0.00153 TCCG 0.00146 TCCT 0.00282 TCGA 0.00622 TCGC 0.00235 TCGG 0.00147 TCGT 0.00465 TCTA 0.00407 TCTC 0.00461 TCTG 0.00207 TCTT 0.00753 TGAA 0.0069 TGAC 0.00188 TGAG 0.00162 TGAT 0.00558 TGCA 0.00319 TGCC 0.0011 TGCG 0.00174 TGCT 0.00198 TGGA 0.00273 TGGC 0.00124 TGGG 0.000754 TGGT 0.00165 TGTA 0.00575 TGTC 0.0022 TGTG 0.00261 TGTT 0.00572 TTAA 0.0141 TTAC 0.00484 TTAG 0.00293 TTAT 0.0169 TTCA 0.0069 TTCC 0.00374 TTCG 0.00501 TTCT 0.00813 TTGA 0.00598 TTGC 0.00303 TTGG 0.00213 TTGT 0.00619 TTTA 0.0162 TTTC 0.0107 TTTG 0.00655 TTTT 0.0284 # l= 4 # Values AAAAA 0.0142 AAAAC 0.0022 AAAAG 0.00314 AAAAT 0.00886 AAACA 0.00228 AAACC 0.000532 AAACG 0.00157 AAACT 0.00162 AAAGA 0.0035 AAAGC 0.000751 AAAGG 0.00102 AAAGT 0.00187 AAATA 0.00782 AAATC 0.00231 AAATG 0.00249 AAATT 0.00767 AACAA 0.00243 AACAC 0.000805 AACAG 0.000723 AACAT 0.00176 AACCA 0.000535 AACCC 0.000203 AACCG 0.000465 AACCT 0.000468 AACGA 0.00181 AACGC 0.000621 AACGG 0.000508 AACGT 0.00113 AACTA 0.001 AACTC 0.000613 AACTG 0.000605 AACTT 0.00156 AAGAA 0.00376 AAGAC 0.000545 AAGAG 0.00119 AAGAT 0.00203 AAGCA 0.000749 AAGCC 0.000223 AAGCG 0.000519 AAGCT 0.000511 AAGGA 0.00118 AAGGC 0.000274 AAGGG 0.00044 AAGGT 0.000473 AAGTA 0.0015 AAGTC 0.000482 AAGTG 0.00077 AAGTT 0.00156 AATAA 0.00726 AATAC 0.00171 AATAG 0.0015 AATAT 0.00743 AATCA 0.00201 AATCC 0.000698 AATCG 0.00164 AATCT 0.00173 AATGA 0.00236 AATGC 0.000851 AATGG 0.00081 AATGT 0.00199 AATTA 0.00596 AATTC 0.00247 AATTG 0.00235 AATTT 0.00767 ACAAA 0.00248 ACAAC 0.000737 ACAAG 0.000784 ACAAT 0.00219 ACACA 0.00105 ACACC 0.000296 ACACG 0.000857 ACACT 0.00058 ACAGA 0.00079 ACAGC 0.000305 ACAGG 0.000326 ACAGT 0.00061 ACATA 0.00191 ACATC 0.000714 ACATG 0.000676 ACATT 0.00199 ACCAA 0.000568 ACCAC 0.000335 ACCAG 0.000247 ACCAT 0.000503 ACCCA 0.00017 ACCCC 0.000143 ACCCG 0.000158 ACCCT 0.000212 ACCGA 0.000507 ACCGC 0.000258 ACCGG 0.000233 ACCGT 0.000403 ACCTA 0.00034 ACCTC 0.000304 ACCTG 0.000246 ACCTT 0.000473 ACGAA 0.00169 ACGAC 0.000521 ACGAG 0.00087 ACGAT 0.00157 ACGCA 0.000557 ACGCC 0.000232 ACGCG 0.000761 ACGCT 0.000399 ACGGA 0.000517 ACGGC 0.000238 ACGGG 0.000242 ACGGT 0.000403 ACGTA 0.00104 ACGTC 0.000424 ACGTG 0.000763 ACGTT 0.00113 ACTAA 0.000836 ACTAC 0.000421 ACTAG 0.000291 ACTAT 0.00111 ACTCA 0.000391 ACTCC 0.000218 ACTCG 0.000679 ACTCT 0.000547 ACTGA 0.000527 ACTGC 0.000289 ACTGG 0.000251 ACTGT 0.00061 ACTTA 0.00107 ACTTC 0.000671 ACTTG 0.000703 ACTTT 0.00187 AGAAA 0.00398 AGAAC 0.000689 AGAAG 0.00122 AGAAT 0.00224 AGACA 0.00061 AGACC 0.000157 AGACG 0.00043 AGACT 0.000379 AGAGA 0.00211 AGAGC 0.000325 AGAGG 0.00059 AGAGT 0.000547 AGATA 0.00183 AGATC 0.000681 AGATG 0.000741 AGATT 0.00173 AGCAA 0.000802 AGCAC 0.000304 AGCAG 0.00029 AGCAT 0.000583 AGCCA 0.000282 AGCCC 9.61e-05 AGCCG 0.000197 AGCCT 0.000199 AGCGA 0.00056 AGCGC 0.000253 AGCGG 0.000239 AGCGT 0.000399 AGCTA 0.000345 AGCTC 0.000244 AGCTG 0.000262 AGCTT 0.000511 AGGAA 0.00131 AGGAC 0.000231 AGGAG 0.000545 AGGAT 0.000736 AGGCA 0.000295 AGGCC 0.000128 AGGCG 0.00024 AGGCT 0.000199 AGGGA 0.000547 AGGGC 0.000129 AGGGG 0.000315 AGGGT 0.000212 AGGTA 0.000439 AGGTC 0.000173 AGGTG 0.000283 AGGTT 0.000468 AGTAA 0.00129 AGTAC 0.000423 AGTAG 0.000454 AGTAT 0.00122 AGTCA 0.000458 AGTCC 0.000156 AGTCG 0.000401 AGTCT 0.000379 AGTGA 0.000713 AGTGC 0.000289 AGTGG 0.000336 AGTGT 0.00058 AGTTA 0.00104 AGTTC 0.000529 AGTTG 0.000599 AGTTT 0.00162 ATAAA 0.00716 ATAAC 0.00156 ATAAG 0.0014 ATAAT 0.00674 ATACA 0.00237 ATACC 0.000491 ATACG 0.0011 ATACT 0.00122 ATAGA 0.00176 ATAGC 0.000495 ATAGG 0.000464 ATAGT 0.00111 ATATA 0.00969 ATATC 0.00222 ATATG 0.00198 ATATT 0.00743 ATCAA 0.0021 ATCAC 0.00083 ATCAG 0.00058 ATCAT 0.00207 ATCCA 0.000782 ATCCC 0.000357 ATCCG 0.000455 ATCCT 0.000736 ATCGA 0.00229 ATCGC 0.000702 ATCGG 0.000545 ATCGT 0.00157 ATCTA 0.00135 ATCTC 0.000994 ATCTG 0.000613 ATCTT 0.00203 ATGAA 0.00251 ATGAC 0.000576 ATGAG 0.000545 ATGAT 0.00207 ATGCA 0.00107 ATGCC 0.000249 ATGCG 0.000538 ATGCT 0.000583 ATGGA 0.000937 ATGGC 0.000375 ATGGG 0.000243 ATGGT 0.000503 ATGTA 0.00219 ATGTC 0.000567 ATGTG 0.000765 ATGTT 0.00176 ATTAA 0.00551 ATTAC 0.00171 ATTAG 0.00109 ATTAT 0.00674 ATTCA 0.00221 ATTCC 0.000958 ATTCG 0.00159 ATTCT 0.00224 ATTGA 0.00217 ATTGC 0.000983 ATTGG 0.000726 ATTGT 0.00219 ATTTA 0.00601 ATTTC 0.00319 ATTTG 0.00224 ATTTT 0.00886 CAAAA 0.00254 CAAAC 0.000848 CAAAG 0.000913 CAAAT 0.00224 CAACA 0.000857 CAACC 0.000322 CAACG 0.000667 CAACT 0.000599 CAAGA 0.000883 CAAGC 0.000349 CAAGG 0.000342 CAAGT 0.000703 CAATA 0.00192 CAATC 0.000902 CAATG 0.000885 CAATT 0.00235 CACAA 0.000851 CACAC 0.000644 CACAG 0.000352 CACAT 0.000765 CACCA 0.000352 CACCC 0.000192 CACCG 0.000326 CACCT 0.000283 CACGA 0.000884 CACGC 0.000514 CACGG 0.000346 CACGT 0.000763 CACTA 0.0004 CACTC 0.000399 CACTG 0.000351 CACTT 0.00077 CAGAA 0.000811 CAGAC 0.000251 CAGAG 0.000393 CAGAT 0.000613 CAGCA 0.000303 CAGCC 0.000189 CAGCG 0.000239 CAGCT 0.000262 CAGGA 0.000334 CAGGC 0.000154 CAGGG 0.00016 CAGGT 0.000246 CAGTA 0.000442 CAGTC 0.00028 CAGTG 0.000351 CAGTT 0.000605 CATAA 0.0016 CATAC 0.000686 CATAG 0.000463 CATAT 0.00198 CATCA 0.000777 CATCC 0.000424 CATCG 0.000814 CATCT 0.000741 CATGA 0.000647 CATGC 0.000381 CATGG 0.000283 CATGT 0.000676 CATTA 0.00159 CATTC 0.00104 CATTG 0.000885 CATTT 0.00249 CCAAA 0.000687 CCAAC 0.000383 CCAAG 0.000332 CCAAT 0.000726 CCACA 0.000275 CCACC 0.0003 CCACG 0.00043 CCACT 0.000336 CCAGA 0.000279 CCAGC 0.000176 CCAGG 0.000148 CCAGT 0.000251 CCATA 0.000467 CCATC 0.000498 CCATG 0.000283 CCATT 0.00081 CCCAA 0.00022 CCCAC 0.000191 CCCAG 0.000101 CCCAT 0.000243 CCCCA 0.00015 CCCCC 0.000306 CCCCG 0.000183 CCCCT 0.000315 CCCGA 0.000226 CCCGC 0.000177 CCCGG 0.000126 CCCGT 0.000242 CCCTA 0.000162 CCCTC 0.000443 CCCTG 0.00016 CCCTT 0.00044 CCGAA 0.000391 CCGAC 0.000243 CCGAG 0.000288 CCGAT 0.000545 CCGCA 0.000199 CCGCC 0.000209 CCGCG 0.000338 CCGCT 0.000239 CCGGA 0.000195 CCGGC 0.000165 CCGGG 0.000126 CCGGT 0.000233 CCGTA 0.000281 CCGTC 0.000265 CCGTG 0.000346 CCGTT 0.000508 CCTAA 0.00036 CCTAC 0.000206 CCTAG 0.000139 CCTAT 0.000464 CCTCA 0.000214 CCTCC 0.000485 CCTCG 0.000531 CCTCT 0.00059 CCTGA 0.00024 CCTGC 0.00018 CCTGG 0.000148 CCTGT 0.000326 CCTTA 0.000393 CCTTC 0.000613 CCTTG 0.000342 CCTTT 0.00102 CGAAA 0.00194 CGAAC 0.000724 CGAAG 0.000764 CGAAT 0.00159 CGACA 0.000551 CGACC 0.000273 CGACG 0.000613 CGACT 0.000401 CGAGA 0.00104 CGAGC 0.000486 CGAGG 0.000531 CGAGT 0.000679 CGATA 0.00151 CGATC 0.00114 CGATG 0.000814 CGATT 0.00164 CGCAA 0.0006 CGCAC 0.000363 CGCAG 0.000238 CGCAT 0.000538 CGCCA 0.000349 CGCCC 0.000159 CGCCG 0.000275 CGCCT 0.00024 CGCGA 0.000836 CGCGC 0.000547 CGCGG 0.000338 CGCGT 0.000761 CGCTA 0.000303 CGCTC 0.000391 CGCTG 0.000239 CGCTT 0.000519 CGGAA 0.000546 CGGAC 0.000196 CGGAG 0.000266 CGGAT 0.000455 CGGCA 0.00025 CGGCC 0.000217 CGGCG 0.000275 CGGCT 0.000197 CGGGA 0.000282 CGGGC 0.000147 CGGGG 0.000183 CGGGT 0.000158 CGGTA 0.000365 CGGTC 0.000243 CGGTG 0.000326 CGGTT 0.000465 CGTAA 0.000988 CGTAC 0.000508 CGTAG 0.000357 CGTAT 0.0011 CGTCA 0.000461 CGTCC 0.000323 CGTCG 0.000613 CGTCT 0.00043 CGTGA 0.000738 CGTGC 0.000481 CGTGG 0.00043 CGTGT 0.000857 CGTTA 0.000942 CGTTC 0.00089 CGTTG 0.000667 CGTTT 0.00157 CTAAA 0.00113 CTAAC 0.000418 CTAAG 0.000285 CTAAT 0.00109 CTACA 0.00046 CTACC 0.000221 CTACG 0.000357 CTACT 0.000454 CTAGA 0.00039 CTAGC 0.000162 CTAGG 0.000139 CTAGT 0.000291 CTATA 0.0012 CTATC 0.000677 CTATG 0.000463 CTATT 0.0015 CTCAA 0.000571 CTCAC 0.000322 CTCAG 0.00018 CTCAT 0.000545 CTCCA 0.000382 CTCCC 0.000376 CTCCG 0.000266 CTCCT 0.000545 CTCGA 0.00106 CTCGC 0.000514 CTCGG 0.000288 CTCGT 0.00087 CTCTA 0.000529 CTCTC 0.00146 CTCTG 0.000393 CTCTT 0.00119 CTGAA 0.000656 CTGAC 0.000253 CTGAG 0.00018 CTGAT 0.00058 CTGCA 0.000349 CTGCC 0.000203 CTGCG 0.000238 CTGCT 0.00029 CTGGA 0.000318 CTGGC 0.000189 CTGGG 0.000101 CTGGT 0.000247 CTGTA 0.000596 CTGTC 0.00036 CTGTG 0.000352 CTGTT 0.000723 CTTAA 0.00119 CTTAC 0.000542 CTTAG 0.000285 CTTAT 0.0014 CTTCA 0.000726 CTTCC 0.000672 CTTCG 0.000764 CTTCT 0.00122 CTTGA 0.000734 CTTGC 0.000426 CTTGG 0.000332 CTTGT 0.000784 CTTTA 0.00146 CTTTC 0.00164 CTTTG 0.000913 CTTTT 0.00314 GAAAA 0.0045 GAAAC 0.00142 GAAAG 0.00164 GAAAT 0.00319 GAACA 0.000944 GAACC 0.0003 GAACG 0.00089 GAACT 0.000529 GAAGA 0.00163 GAAGC 0.000464 GAAGG 0.000613 GAAGT 0.000671 GAATA 0.00238 GAATC 0.00112 GAATG 0.00104 GAATT 0.00247 GACAA 0.00085 GACAC 0.00042 GACAG 0.00036 GACAT 0.000567 GACCA 0.000251 GACCC 0.000113 GACCG 0.000243 GACCT 0.000173 GACGA 0.00081 GACGC 0.000328 GACGG 0.000265 GACGT 0.000424 GACTA 0.00034 GACTC 0.000292 GACTG 0.00028 GACTT 0.000482 GAGAA 0.00173 GAGAC 0.000428 GAGAG 0.00146 GAGAT 0.000994 GAGCA 0.000425 GAGCC 0.000177 GAGCG 0.000391 GAGCT 0.000244 GAGGA 0.000808 GAGGC 0.000264 GAGGG 0.000443 GAGGT 0.000304 GAGTA 0.000531 GAGTC 0.000292 GAGTG 0.000399 GAGTT 0.000613 GATAA 0.00228 GATAC 0.000839 GATAG 0.000677 GATAT 0.00222 GATCA 0.00088 GATCC 0.000443 GATCG 0.00114 GATCT 0.000681 GATGA 0.00108 GATGC 0.000462 GATGG 0.000498 GATGT 0.000714 GATTA 0.00175 GATTC 0.00112 GATTG 0.000902 GATTT 0.00231 GCAAA 0.00112 GCAAC 0.000507 GCAAG 0.000426 GCAAT 0.000983 GCACA 0.000482 GCACC 0.000196 GCACG 0.000481 GCACT 0.000289 GCAGA 0.000369 GCAGC 0.000241 GCAGG 0.00018 GCAGT 0.000289 GCATA 0.000744 GCATC 0.000462 GCATG 0.000381 GCATT 0.000851 GCCAA 0.000392 GCCAC 0.000283 GCCAG 0.000189 GCCAT 0.000375 GCCCA 0.000119 GCCCC 0.000123 GCCCG 0.000147 GCCCT 0.000129 GCCGA 0.000294 GCCGC 0.000241 GCCGG 0.000165 GCCGT 0.000238 GCCTA 0.000169 GCCTC 0.000264 GCCTG 0.000154 GCCTT 0.000274 GCGAA 0.000787 GCGAC 0.000351 GCGAG 0.000514 GCGAT 0.000702 GCGCA 0.000382 GCGCC 0.000226 GCGCG 0.000547 GCGCT 0.000253 GCGGA 0.000311 GCGGC 0.000241 GCGGG 0.000177 GCGGT 0.000258 GCGTA 0.000487 GCGTC 0.000328 GCGTG 0.000514 GCGTT 0.000621 GCTAA 0.000415 GCTAC 0.000265 GCTAG 0.000162 GCTAT 0.000495 GCTCA 0.000235 GCTCC 0.000191 GCTCG 0.000486 GCTCT 0.000325 GCTGA 0.00027 GCTGC 0.000241 GCTGG 0.000176 GCTGT 0.000305 GCTTA 0.000437 GCTTC 0.000464 GCTTG 0.000349 GCTTT 0.000751 GGAAA 0.00163 GGAAC 0.000483 GGAAG 0.000672 GGAAT 0.000958 GGACA 0.000313 GGACC 0.000117 GGACG 0.000323 GGACT 0.000156 GGAGA 0.000674 GGAGC 0.000191 GGAGG 0.000485 GGAGT 0.000218 GGATA 0.000765 GGATC 0.000443 GGATG 0.000424 GGATT 0.000698 GGCAA 0.000414 GGCAC 0.000232 GGCAG 0.000203 GGCAT 0.000249 GGCCA 0.000217 GGCCC 0.000101 GGCCG 0.000217 GGCCT 0.000128 GGCGA 0.000356 GGCGC 0.000226 GGCGG 0.000209 GGCGT 0.000232 GGCTA 0.000187 GGCTC 0.000177 GGCTG 0.000189 GGCTT 0.000223 GGGAA 0.000622 GGGAC 0.000173 GGGAG 0.000376 GGGAT 0.000357 GGGCA 0.000162 GGGCC 0.000101 GGGCG 0.000159 GGGCT 9.61e-05 GGGGA 0.000382 GGGGC 0.000123 GGGGG 0.000306 GGGGT 0.000143 GGGTA 0.000174 GGGTC 0.000113 GGGTG 0.000192 GGGTT 0.000203 GGTAA 0.00055 GGTAC 0.00023 GGTAG 0.000221 GGTAT 0.000491 GGTCA 0.000235 GGTCC 0.000117 GGTCG 0.000273 GGTCT 0.000157 GGTGA 0.000361 GGTGC 0.000196 GGTGG 0.0003 GGTGT 0.000296 GGTTA 0.000518 GGTTC 0.0003 GGTTG 0.000322 GGTTT 0.000532 GTAAA 0.0019 GTAAC 0.000688 GTAAG 0.000542 GTAAT 0.00171 GTACA 0.000913 GTACC 0.00023 GTACG 0.000508 GTACT 0.000423 GTAGA 0.0006 GTAGC 0.000265 GTAGG 0.000206 GTAGT 0.000421 GTATA 0.00195 GTATC 0.000839 GTATG 0.000686 GTATT 0.00171 GTCAA 0.000646 GTCAC 0.000401 GTCAG 0.000253 GTCAT 0.000576 GTCCA 0.000309 GTCCC 0.000173 GTCCG 0.000196 GTCCT 0.000231 GTCGA 0.000723 GTCGC 0.000351 GTCGG 0.000243 GTCGT 0.000521 GTCTA 0.000352 GTCTC 0.000428 GTCTG 0.000251 GTCTT 0.000545 GTGAA 0.00107 GTGAC 0.000401 GTGAG 0.000322 GTGAT 0.00083 GTGCA 0.00055 GTGCC 0.000232 GTGCG 0.000363 GTGCT 0.000304 GTGGA 0.000531 GTGGC 0.000283 GTGGG 0.000191 GTGGT 0.000335 GTGTA 0.000912 GTGTC 0.00042 GTGTG 0.000644 GTGTT 0.000805 GTTAA 0.00147 GTTAC 0.000688 GTTAG 0.000418 GTTAT 0.00156 GTTCA 0.000766 GTTCC 0.000483 GTTCG 0.000724 GTTCT 0.000689 GTTGA 0.000816 GTTGC 0.000507 GTTGG 0.000383 GTTGT 0.000737 GTTTA 0.00152 GTTTC 0.00142 GTTTG 0.000848 GTTTT 0.0022 TAAAA 0.00716 TAAAC 0.00152 TAAAG 0.00146 TAAAT 0.00601 TAACA 0.00164 TAACC 0.000518 TAACG 0.000942 TAACT 0.00104 TAAGA 0.00151 TAAGC 0.000437 TAAGG 0.000393 TAAGT 0.00107 TAATA 0.00576 TAATC 0.00175 TAATG 0.00159 TAATT 0.00596 TACAA 0.00206 TACAC 0.000912 TACAG 0.000596 TACAT 0.00219 TACCA 0.000513 TACCC 0.000174 TACCG 0.000365 TACCT 0.000439 TACGA 0.00114 TACGC 0.000487 TACGG 0.000281 TACGT 0.00104 TACTA 0.000917 TACTC 0.000531 TACTG 0.000442 TACTT 0.0015 TAGAA 0.00184 TAGAC 0.000352 TAGAG 0.000529 TAGAT 0.00135 TAGCA 0.000501 TAGCC 0.000187 TAGCG 0.000303 TAGCT 0.000345 TAGGA 0.000497 TAGGC 0.000169 TAGGG 0.000162 TAGGT 0.00034 TAGTA 0.000917 TAGTC 0.00034 TAGTG 0.0004 TAGTT 0.001 TATAA 0.00572 TATAC 0.00195 TATAG 0.0012 TATAT 0.00969 TATCA 0.00191 TATCC 0.000765 TATCG 0.00151 TATCT 0.00183 TATGA 0.00161 TATGC 0.000744 TATGG 0.000467 TATGT 0.00191 TATTA 0.00576 TATTC 0.00238 TATTG 0.00192 TATTT 0.00782 TCAAA 0.00227 TCAAC 0.000816 TCAAG 0.000734 TCAAT 0.00217 TCACA 0.000806 TCACC 0.000361 TCACG 0.000738 TCACT 0.000713 TCAGA 0.000631 TCAGC 0.00027 TCAGG 0.00024 TCAGT 0.000527 TCATA 0.00161 TCATC 0.00108 TCATG 0.000647 TCATT 0.00236 TCCAA 0.000949 TCCAC 0.000531 TCCAG 0.000318 TCCAT 0.000937 TCCCA 0.000316 TCCCC 0.000382 TCCCG 0.000282 TCCCT 0.000547 TCCGA 0.00044 TCCGC 0.000311 TCCGG 0.000195 TCCGT 0.000517 TCCTA 0.000497 TCCTC 0.000808 TCCTG 0.000334 TCCTT 0.00118 TCGAA 0.00214 TCGAC 0.000723 TCGAG 0.00106 TCGAT 0.00229 TCGCA 0.000601 TCGCC 0.000356 TCGCG 0.000836 TCGCT 0.00056 TCGGA 0.00044 TCGGC 0.000294 TCGGG 0.000226 TCGGT 0.000507 TCGTA 0.00114 TCGTC 0.00081 TCGTG 0.000884 TCGTT 0.00181 TCTAA 0.00132 TCTAC 0.0006 TCTAG 0.00039 TCTAT 0.00176 TCTCA 0.000779 TCTCC 0.000674 TCTCG 0.00104 TCTCT 0.00211 TCTGA 0.000631 TCTGC 0.000369 TCTGG 0.000279 TCTGT 0.00079 TCTTA 0.00151 TCTTC 0.00163 TCTTG 0.000883 TCTTT 0.0035 TGAAA 0.0032 TGAAC 0.000766 TGAAG 0.000726 TGAAT 0.00221 TGACA 0.000722 TGACC 0.000235 TGACG 0.000461 TGACT 0.000458 TGAGA 0.000779 TGAGC 0.000235 TGAGG 0.000214 TGAGT 0.000391 TGATA 0.00191 TGATC 0.00088 TGATG 0.000777 TGATT 0.00201 TGCAA 0.00122 TGCAC 0.00055 TGCAG 0.000349 TGCAT 0.00107 TGCCA 0.000392 TGCCC 0.000162 TGCCG 0.00025 TGCCT 0.000295 TGCGA 0.000601 TGCGC 0.000382 TGCGG 0.000199 TGCGT 0.000557 TGCTA 0.000501 TGCTC 0.000425 TGCTG 0.000303 TGCTT 0.000749 TGGAA 0.00126 TGGAC 0.000309 TGGAG 0.000382 TGGAT 0.000782 TGGCA 0.000392 TGGCC 0.000217 TGGCG 0.000349 TGGCT 0.000282 TGGGA 0.000316 TGGGC 0.000119 TGGGG 0.00015 TGGGT 0.00017 TGGTA 0.000513 TGGTC 0.000251 TGGTG 0.000352 TGGTT 0.000535 TGTAA 0.00202 TGTAC 0.000913 TGTAG 0.00046 TGTAT 0.00237 TGTCA 0.000722 TGTCC 0.000313 TGTCG 0.000551 TGTCT 0.00061 TGTGA 0.000806 TGTGC 0.000482 TGTGG 0.000275 TGTGT 0.00105 TGTTA 0.00164 TGTTC 0.000944 TGTTG 0.000857 TGTTT 0.00228 TTAAA 0.00596 TTAAC 0.00147 TTAAG 0.00119 TTAAT 0.00551 TTACA 0.00202 TTACC 0.00055 TTACG 0.000988 TTACT 0.00129 TTAGA 0.00132 TTAGC 0.000415 TTAGG 0.00036 TTAGT 0.000836 TTATA 0.00572 TTATC 0.00228 TTATG 0.0016 TTATT 0.00726 TTCAA 0.00267 TTCAC 0.00107 TTCAG 0.000656 TTCAT 0.00251 TTCCA 0.00126 TTCCC 0.000622 TTCCG 0.000546 TTCCT 0.00131 TTCGA 0.00214 TTCGC 0.000787 TTCGG 0.000391 TTCGT 0.00169 TTCTA 0.00184 TTCTC 0.00173 TTCTG 0.000811 TTCTT 0.00376 TTGAA 0.00267 TTGAC 0.000646 TTGAG 0.000571 TTGAT 0.0021 TTGCA 0.00122 TTGCC 0.000414 TTGCG 0.0006 TTGCT 0.000802 TTGGA 0.000949 TTGGC 0.000392 TTGGG 0.00022 TTGGT 0.000568 TTGTA 0.00206 TTGTC 0.00085 TTGTG 0.000851 TTGTT 0.00243 TTTAA 0.00596 TTTAC 0.0019 TTTAG 0.00113 TTTAT 0.00716 TTTCA 0.0032 TTTCC 0.00163 TTTCG 0.00194 TTTCT 0.00398 TTTGA 0.00227 TTTGC 0.00112 TTTGG 0.000687 TTTGT 0.00248 TTTTA 0.00716 TTTTC 0.0045 TTTTG 0.00254 TTTTT 0.0142 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4996 AAAAC 0.07759 AAAAG 0.1105 AAAAT 0.3124 AAACA 0.3801 AAACC 0.0887 AAACG 0.2619 AAACT 0.2693 AAAGA 0.4905 AAAGC 0.1051 AAAGG 0.1431 AAAGT 0.2613 AAATA 0.3853 AAATC 0.114 AAATG 0.1229 AAATT 0.3779 AACAA 0.4243 AACAC 0.1408 AACAG 0.1265 AACAT 0.3084 AACCA 0.3201 AACCC 0.1216 AACCG 0.2782 AACCT 0.2801 AACGA 0.4459 AACGC 0.1527 AACGG 0.1248 AACGT 0.2767 AACTA 0.2646 AACTC 0.162 AACTG 0.1599 AACTT 0.4134 AAGAA 0.4994 AAGAC 0.07244 AAGAG 0.1585 AAGAT 0.2697 AAGCA 0.3742 AAGCC 0.1113 AAGCG 0.2591 AAGCT 0.2554 AAGGA 0.4992 AAGGC 0.1157 AAGGG 0.1855 AAGGT 0.1996 AAGTA 0.3469 AAGTC 0.1119 AAGTG 0.1787 AAGTT 0.3626 AATAA 0.4057 AATAC 0.0954 AATAG 0.08364 AATAT 0.4153 AATCA 0.3307 AATCC 0.1148 AATCG 0.2697 AATCT 0.2848 AATGA 0.3933 AATGC 0.1417 AATGG 0.1348 AATGT 0.3303 AATTA 0.323 AATTC 0.1337 AATTG 0.1276 AATTT 0.4158 ACAAA 0.4001 ACAAC 0.1191 ACAAG 0.1268 ACAAT 0.3539 ACACA 0.3768 ACACC 0.1063 ACACG 0.3083 ACACT 0.2086 ACAGA 0.3891 ACAGC 0.1501 ACAGG 0.1607 ACAGT 0.3002 ACATA 0.3609 ACATC 0.1353 ACATG 0.1279 ACATT 0.3759 ACCAA 0.3438 ACCAC 0.2028 ACCAG 0.1492 ACCAT 0.3042 ACCCA 0.2484 ACCCC 0.2089 ACCCG 0.2319 ACCCT 0.3109 ACCGA 0.3618 ACCGC 0.184 ACCGG 0.1662 ACCGT 0.288 ACCTA 0.2494 ACCTC 0.2229 ACCTG 0.1807 ACCTT 0.347 ACGAA 0.3638 ACGAC 0.112 ACGAG 0.187 ACGAT 0.3373 ACGCA 0.2857 ACGCC 0.1191 ACGCG 0.3904 ACGCT 0.2049 ACGGA 0.3691 ACGGC 0.17 ACGGG 0.1729 ACGGT 0.288 ACGTA 0.3107 ACGTC 0.1265 ACGTG 0.2275 ACGTT 0.3354 ACTAA 0.3146 ACTAC 0.1586 ACTAG 0.1093 ACTAT 0.4176 ACTCA 0.2128 ACTCC 0.1189 ACTCG 0.3701 ACTCT 0.2982 ACTGA 0.3142 ACTGC 0.1724 ACTGG 0.1499 ACTGT 0.3634 ACTTA 0.2484 ACTTC 0.1557 ACTTG 0.1629 ACTTT 0.4329 AGAAA 0.4898 AGAAC 0.08472 AGAAG 0.1495 AGAAT 0.2759 AGACA 0.3871 AGACC 0.09937 AGACG 0.2729 AGACT 0.2407 AGAGA 0.5909 AGAGC 0.09084 AGAGG 0.1651 AGAGT 0.1531 AGATA 0.3676 AGATC 0.1364 AGATG 0.1485 AGATT 0.3474 AGCAA 0.4055 AGCAC 0.1536 AGCAG 0.1465 AGCAT 0.2944 AGCCA 0.3639 AGCCC 0.124 AGCCG 0.2548 AGCCT 0.2573 AGCGA 0.3861 AGCGC 0.1741 AGCGG 0.1646 AGCGT 0.2752 AGCTA 0.253 AGCTC 0.1791 AGCTG 0.1922 AGCTT 0.3757 AGGAA 0.4643 AGGAC 0.08179 AGGAG 0.193 AGGAT 0.2609 AGGCA 0.3419 AGGCC 0.1483 AGGCG 0.2784 AGGCT 0.2314 AGGGA 0.4548 AGGGC 0.1072 AGGGG 0.2618 AGGGT 0.1763 AGGTA 0.3219 AGGTC 0.1271 AGGTG 0.2077 AGGTT 0.3433 AGTAA 0.3804 AGTAC 0.1248 AGTAG 0.1341 AGTAT 0.3607 AGTCA 0.3285 AGTCC 0.1116 AGTCG 0.2878 AGTCT 0.2721 AGTGA 0.3717 AGTGC 0.1508 AGTGG 0.1751 AGTGT 0.3024 AGTTA 0.2747 AGTTC 0.1399 AGTTG 0.1584 AGTTT 0.427 ATAAA 0.4247 ATAAC 0.09245 ATAAG 0.08283 ATAAT 0.4001 ATACA 0.4567 ATACC 0.09477 ATACG 0.2127 ATACT 0.2358 ATAGA 0.4601 ATAGC 0.1291 ATAGG 0.1212 ATAGT 0.2896 ATATA 0.4544 ATATC 0.1043 ATATG 0.09296 ATATT 0.3484 ATCAA 0.3757 ATCAC 0.1487 ATCAG 0.104 ATCAT 0.3716 ATCCA 0.3356 ATCCC 0.1532 ATCCG 0.1953 ATCCT 0.3159 ATCGA 0.4482 ATCGC 0.1375 ATCGG 0.1068 ATCGT 0.3075 ATCTA 0.2708 ATCTC 0.1992 ATCTG 0.123 ATCTT 0.407 ATGAA 0.4399 ATGAC 0.101 ATGAG 0.09559 ATGAT 0.3634 ATGCA 0.4382 ATGCC 0.1021 ATGCG 0.2208 ATGCT 0.2389 ATGGA 0.4555 ATGGC 0.1824 ATGGG 0.1179 ATGGT 0.2442 ATGTA 0.414 ATGTC 0.1074 ATGTG 0.1448 ATGTT 0.3339 ATTAA 0.3661 ATTAC 0.1135 ATTAG 0.07256 ATTAT 0.4478 ATTCA 0.3157 ATTCC 0.1369 ATTCG 0.2268 ATTCT 0.3206 ATTGA 0.3572 ATTGC 0.1621 ATTGG 0.1197 ATTGT 0.361 ATTTA 0.2959 ATTTC 0.1571 ATTTG 0.1104 ATTTT 0.4367 CAAAA 0.3887 CAAAC 0.1295 CAAAG 0.1395 CAAAT 0.3423 CAACA 0.3505 CAACC 0.1316 CAACG 0.2727 CAACT 0.2452 CAAGA 0.3877 CAAGC 0.1534 CAAGG 0.1503 CAAGT 0.3086 CAATA 0.3172 CAATC 0.1488 CAATG 0.1459 CAATT 0.3881 CACAA 0.3259 CACAC 0.2465 CACAG 0.1349 CACAT 0.2927 CACCA 0.3052 CACCC 0.1664 CACCG 0.2829 CACCT 0.2455 CACGA 0.3526 CACGC 0.2048 CACGG 0.1381 CACGT 0.3045 CACTA 0.2081 CACTC 0.2078 CACTG 0.1828 CACTT 0.4013 CAGAA 0.392 CAGAC 0.1215 CAGAG 0.1901 CAGAT 0.2964 CAGCA 0.3053 CAGCC 0.1901 CAGCG 0.2411 CAGCT 0.2635 CAGGA 0.3732 CAGGC 0.1723 CAGGG 0.179 CAGGT 0.2756 CAGTA 0.2634 CAGTC 0.1669 CAGTG 0.2091 CAGTT 0.3606 CATAA 0.3379 CATAC 0.1451 CATAG 0.09787 CATAT 0.4192 CATCA 0.282 CATCC 0.1538 CATCG 0.2953 CATCT 0.2688 CATGA 0.3256 CATGC 0.1917 CATGG 0.1426 CATGT 0.3401 CATTA 0.2651 CATTC 0.1726 CATTG 0.1472 CATTT 0.415 CCAAA 0.3229 CCAAC 0.1798 CCAAG 0.1561 CCAAT 0.3412 CCACA 0.205 CCACC 0.224 CCACG 0.3206 CCACT 0.2503 CCAGA 0.3266 CCAGC 0.2061 CCAGG 0.173 CCAGT 0.2944 CCATA 0.2271 CCATC 0.2417 CCATG 0.1376 CCATT 0.3935 CCCAA 0.2911 CCCAC 0.2536 CCCAG 0.1338 CCCAT 0.3215 CCCCA 0.1574 CCCCC 0.3207 CCCCG 0.1916 CCCCT 0.3303 CCCGA 0.2928 CCCGC 0.2293 CCCGG 0.1637 CCCGT 0.3142 CCCTA 0.1344 CCCTC 0.3675 CCCTG 0.1328 CCCTT 0.3653 CCGAA 0.2664 CCGAC 0.1659 CCGAG 0.1963 CCGAT 0.3714 CCGCA 0.2023 CCGCC 0.2123 CCGCG 0.3431 CCGCT 0.2423 CCGGA 0.2712 CCGGC 0.23 CCGGG 0.1754 CCGGT 0.3234 CCGTA 0.2007 CCGTC 0.1893 CCGTG 0.2474 CCGTT 0.3626 CCTAA 0.308 CCTAC 0.1759 CCTAG 0.1189 CCTAT 0.3972 CCTCA 0.1176 CCTCC 0.2663 CCTCG 0.2918 CCTCT 0.3243 CCTGA 0.2681 CCTGC 0.2017 CCTGG 0.1652 CCTGT 0.365 CCTTA 0.1658 CCTTC 0.2586 CCTTG 0.1443 CCTTT 0.4313 CGAAA 0.3866 CGAAC 0.1444 CGAAG 0.1523 CGAAT 0.3167 CGACA 0.2997 CGACC 0.1486 CGACG 0.3335 CGACT 0.2181 CGAGA 0.3802 CGAGC 0.1775 CGAGG 0.1941 CGAGT 0.2482 CGATA 0.2961 CGATC 0.2231 CGATG 0.1594 CGATT 0.3214 CGCAA 0.3449 CGCAC 0.2085 CGCAG 0.137 CGCAT 0.3095 CGCCA 0.341 CGCCC 0.1558 CGCCG 0.2688 CGCCT 0.2344 CGCGA 0.3366 CGCGC 0.2205 CGCGG 0.1362 CGCGT 0.3066 CGCTA 0.2087 CGCTC 0.269 CGCTG 0.1649 CGCTT 0.3574 CGGAA 0.373 CGGAC 0.1342 CGGAG 0.1816 CGGAT 0.3111 CGGCA 0.2658 CGGCC 0.2308 CGGCG 0.293 CGGCT 0.2103 CGGGA 0.3661 CGGGC 0.1911 CGGGG 0.2373 CGGGT 0.2055 CGGTA 0.2609 CGGTC 0.1737 CGGTG 0.2332 CGGTT 0.3322 CGTAA 0.3345 CGTAC 0.1718 CGTAG 0.1207 CGTAT 0.3729 CGTCA 0.2522 CGTCC 0.1769 CGTCG 0.3356 CGTCT 0.2353 CGTGA 0.2945 CGTGC 0.192 CGTGG 0.1715 CGTGT 0.3419 CGTTA 0.2314 CGTTC 0.2187 CGTTG 0.1638 CGTTT 0.3861 CTAAA 0.3865 CTAAC 0.1428 CTAAG 0.09729 CTAAT 0.3733 CTACA 0.3085 CTACC 0.1481 CTACG 0.239 CTACT 0.3044 CTAGA 0.3974 CTAGC 0.1649 CTAGG 0.1417 CTAGT 0.2961 CTATA 0.3123 CTATC 0.1766 CTATG 0.1208 CTATT 0.3903 CTCAA 0.353 CTCAC 0.1988 CTCAG 0.1112 CTCAT 0.337 CTCCA 0.2437 CTCCC 0.2397 CTCCG 0.1694 CTCCT 0.3472 CTCGA 0.3888 CTCGC 0.1879 CTCGG 0.1053 CTCGT 0.318 CTCTA 0.148 CTCTC 0.4079 CTCTG 0.1101 CTCTT 0.334 CTGAA 0.3932 CTGAC 0.1514 CTGAG 0.1078 CTGAT 0.3475 CTGCA 0.3228 CTGCC 0.188 CTGCG 0.2206 CTGCT 0.2685 CTGGA 0.3721 CTGGC 0.2214 CTGGG 0.1181 CTGGT 0.2884 CTGTA 0.2932 CTGTC 0.1774 CTGTG 0.1734 CTGTT 0.3559 CTTAA 0.3488 CTTAC 0.1587 CTTAG 0.08342 CTTAT 0.409 CTTCA 0.2149 CTTCC 0.1989 CTTCG 0.2261 CTTCT 0.3601 CTTGA 0.3225 CTTGC 0.187 CTTGG 0.146 CTTGT 0.3445 CTTTA 0.2045 CTTTC 0.2289 CTTTG 0.1278 CTTTT 0.4387 GAAAA 0.4184 GAAAC 0.1326 GAAAG 0.1523 GAAAT 0.2967 GAACA 0.3545 GAACC 0.1127 GAACG 0.3341 GAACT 0.1987 GAAGA 0.482 GAAGC 0.1375 GAAGG 0.1816 GAAGT 0.1988 GAATA 0.3397 GAATC 0.1599 GAATG 0.1482 GAATT 0.3522 GACAA 0.3868 GACAC 0.1911 GACAG 0.1641 GACAT 0.2581 GACCA 0.3217 GACCC 0.1453 GACCG 0.3111 GACCT 0.2219 GACGA 0.4433 GACGC 0.1794 GACGG 0.145 GACGT 0.2323 GACTA 0.2437 GACTC 0.2092 GACTG 0.2009 GACTT 0.3462 GAGAA 0.3748 GAGAC 0.09294 GAGAG 0.3164 GAGAT 0.2158 GAGCA 0.3435 GAGCC 0.1433 GAGCG 0.3159 GAGCT 0.1973 GAGGA 0.4442 GAGGC 0.1454 GAGGG 0.2433 GAGGT 0.1671 GAGTA 0.2897 GAGTC 0.1589 GAGTG 0.2174 GAGTT 0.334 GATAA 0.3789 GATAC 0.1394 GATAG 0.1124 GATAT 0.3693 GATCA 0.2799 GATCC 0.141 GATCG 0.3625 GATCT 0.2166 GATGA 0.3926 GATGC 0.1676 GATGG 0.1806 GATGT 0.2593 GATTA 0.2875 GATTC 0.1839 GATTG 0.1483 GATTT 0.3802 GCAAA 0.3685 GCAAC 0.1672 GCAAG 0.1403 GCAAT 0.324 GCACA 0.3328 GCACC 0.1352 GCACG 0.3324 GCACT 0.1996 GCAGA 0.3419 GCAGC 0.2232 GCAGG 0.167 GCAGT 0.2679 GCATA 0.3053 GCATC 0.1893 GCATG 0.1562 GCATT 0.3492 GCCAA 0.3165 GCCAC 0.2281 GCCAG 0.1526 GCCAT 0.3028 GCCCA 0.2297 GCCCC 0.2373 GCCCG 0.2841 GCCCT 0.2489 GCCGA 0.3136 GCCGC 0.2566 GCCGG 0.1762 GCCGT 0.2535 GCCTA 0.196 GCCTC 0.3069 GCCTG 0.1787 GCCTT 0.3184 GCGAA 0.3343 GCGAC 0.1491 GCGAG 0.2184 GCGAT 0.2982 GCGCA 0.2711 GCGCC 0.1604 GCGCG 0.389 GCGCT 0.1795 GCGGA 0.3152 GCGGC 0.2443 GCGGG 0.1792 GCGGT 0.2612 GCGTA 0.2499 GCGTC 0.1681 GCGTG 0.2634 GCGTT 0.3186 GCTAA 0.3105 GCTAC 0.1981 GCTAG 0.1211 GCTAT 0.3703 GCTCA 0.19 GCTCC 0.1545 GCTCG 0.3929 GCTCT 0.2626 GCTGA 0.2726 GCTGC 0.2429 GCTGG 0.1774 GCTGT 0.3072 GCTTA 0.2183 GCTTC 0.232 GCTTG 0.1745 GCTTT 0.3752 GGAAA 0.4348 GGAAC 0.1292 GGAAG 0.1797 GGAAT 0.2563 GGACA 0.3444 GGACC 0.1284 GGACG 0.3558 GGACT 0.1713 GGAGA 0.4298 GGAGC 0.1219 GGAGG 0.3092 GGAGT 0.1392 GGATA 0.3284 GGATC 0.1901 GGATG 0.1819 GGATT 0.2996 GGCAA 0.3769 GGCAC 0.2112 GGCAG 0.185 GGCAT 0.227 GGCCA 0.3279 GGCCC 0.1521 GGCCG 0.3272 GGCCT 0.1929 GGCGA 0.3481 GGCGC 0.2206 GGCGG 0.2045 GGCGT 0.2268 GGCTA 0.2408 GGCTC 0.2285 GGCTG 0.2434 GGCTT 0.2874 GGGAA 0.4073 GGGAC 0.113 GGGAG 0.246 GGGAT 0.2336 GGGCA 0.3122 GGGCC 0.1944 GGGCG 0.3078 GGGCT 0.1855 GGGGA 0.4008 GGGGC 0.1289 GGGGG 0.3208 GGGGT 0.1495 GGGTA 0.2543 GGGTC 0.1663 GGGTG 0.2814 GGGTT 0.2979 GGTAA 0.3686 GGTAC 0.154 GGTAG 0.1482 GGTAT 0.3292 GGTCA 0.3003 GGTCC 0.1494 GGTCG 0.3499 GGTCT 0.2004 GGTGA 0.3131 GGTGC 0.1699 GGTGG 0.2606 GGTGT 0.2564 GGTTA 0.3098 GGTTC 0.1796 GGTTG 0.1924 GGTTT 0.3182 GTAAA 0.3929 GTAAC 0.142 GTAAG 0.1119 GTAAT 0.3532 GTACA 0.4404 GTACC 0.1108 GTACG 0.245 GTACT 0.2039 GTAGA 0.4021 GTAGC 0.1774 GTAGG 0.1378 GTAGT 0.2826 GTATA 0.376 GTATC 0.162 GTATG 0.1325 GTATT 0.3295 GTCAA 0.3443 GTCAC 0.2138 GTCAG 0.1347 GTCAT 0.3072 GTCCA 0.3399 GTCCC 0.1901 GTCCG 0.2161 GTCCT 0.254 GTCGA 0.3934 GTCGC 0.1908 GTCGG 0.1324 GTCGT 0.2833 GTCTA 0.2233 GTCTC 0.2714 GTCTG 0.1595 GTCTT 0.3458 GTGAA 0.407 GTGAC 0.1532 GTGAG 0.1229 GTGAT 0.317 GTGCA 0.3799 GTGCC 0.1599 GTGCG 0.2504 GTGCT 0.2098 GTGGA 0.3962 GTGGC 0.211 GTGGG 0.1427 GTGGT 0.25 GTGTA 0.3281 GTGTC 0.151 GTGTG 0.2315 GTGTT 0.2895 GTTAA 0.3558 GTTAC 0.1662 GTTAG 0.1011 GTTAT 0.3768 GTTCA 0.2877 GTTCC 0.1815 GTTCG 0.2719 GTTCT 0.2589 GTTGA 0.3339 GTTGC 0.2077 GTTGG 0.1567 GTTGT 0.3017 GTTTA 0.2539 GTTTC 0.2376 GTTTG 0.1414 GTTTT 0.3672 TAAAA 0.4434 TAAAC 0.09426 TAAAG 0.09049 TAAAT 0.3719 TAACA 0.3957 TAACC 0.1253 TAACG 0.2277 TAACT 0.2513 TAAGA 0.443 TAAGC 0.128 TAAGG 0.1152 TAAGT 0.3138 TAATA 0.3823 TAATC 0.1162 TAATG 0.1058 TAATT 0.3957 TACAA 0.3579 TACAC 0.1585 TACAG 0.1035 TACAT 0.38 TACCA 0.3441 TACCC 0.1164 TACCG 0.245 TACCT 0.2945 TACGA 0.3872 TACGC 0.1649 TACGG 0.09509 TACGT 0.3529 TACTA 0.2708 TACTC 0.157 TACTG 0.1305 TACTT 0.4418 TAGAA 0.4516 TAGAC 0.08653 TAGAG 0.1299 TAGAT 0.332 TAGCA 0.3754 TAGCC 0.1398 TAGCG 0.2269 TAGCT 0.258 TAGGA 0.4257 TAGGC 0.1446 TAGGG 0.1385 TAGGT 0.2911 TAGTA 0.3451 TAGTC 0.1278 TAGTG 0.1504 TAGTT 0.3767 TATAA 0.3085 TATAC 0.1049 TATAG 0.06449 TATAT 0.5221 TATCA 0.3171 TATCC 0.1271 TATCG 0.2511 TATCT 0.3046 TATGA 0.3406 TATGC 0.1575 TATGG 0.09888 TATGT 0.4031 TATTA 0.322 TATTC 0.133 TATTG 0.1076 TATTT 0.4374 TCAAA 0.3787 TCAAC 0.1363 TCAAG 0.1227 TCAAT 0.3622 TCACA 0.3078 TCACC 0.1378 TCACG 0.2821 TCACT 0.2723 TCAGA 0.3783 TCAGC 0.1621 TCAGG 0.1437 TCAGT 0.316 TCATA 0.2824 TCATC 0.1896 TCATG 0.1135 TCATT 0.4145 TCCAA 0.3468 TCCAC 0.1942 TCCAG 0.1163 TCCAT 0.3427 TCCCA 0.2068 TCCCC 0.2502 TCCCG 0.1846 TCCCT 0.3584 TCCGA 0.3009 TCCGC 0.2125 TCCGG 0.1333 TCCGT 0.3533 TCCTA 0.1762 TCCTC 0.2863 TCCTG 0.1182 TCCTT 0.4194 TCGAA 0.3446 TCGAC 0.1164 TCGAG 0.1711 TCGAT 0.3679 TCGCA 0.2555 TCGCC 0.1514 TCGCG 0.355 TCGCT 0.2381 TCGGA 0.3001 TCGGC 0.2008 TCGGG 0.1538 TCGGT 0.3454 TCGTA 0.2459 TCGTC 0.1741 TCGTG 0.1901 TCGTT 0.39 TCTAA 0.3234 TCTAC 0.1474 TCTAG 0.09581 TCTAT 0.4334 TCTCA 0.1693 TCTCC 0.1463 TCTCG 0.2259 TCTCT 0.4586 TCTGA 0.305 TCTGC 0.1784 TCTGG 0.1348 TCTGT 0.3819 TCTTA 0.2009 TCTTC 0.2162 TCTTG 0.1173 TCTTT 0.4656 TGAAA 0.4635 TGAAC 0.111 TGAAG 0.1052 TGAAT 0.3202 TGACA 0.385 TGACC 0.1251 TGACG 0.2458 TGACT 0.2441 TGAGA 0.4815 TGAGC 0.1451 TGAGG 0.1321 TGAGT 0.2413 TGATA 0.3422 TGATC 0.1577 TGATG 0.1393 TGATT 0.3608 TGCAA 0.3823 TGCAC 0.1728 TGCAG 0.1094 TGCAT 0.3355 TGCCA 0.3567 TGCCC 0.1474 TGCCG 0.2274 TGCCT 0.2685 TGCGA 0.3458 TGCGC 0.2194 TGCGG 0.1147 TGCGT 0.3202 TGCTA 0.2534 TGCTC 0.2146 TGCTG 0.1532 TGCTT 0.3787 TGGAA 0.4613 TGGAC 0.1129 TGGAG 0.1397 TGGAT 0.286 TGGCA 0.3158 TGGCC 0.1752 TGGCG 0.2816 TGGCT 0.2275 TGGGA 0.4186 TGGGC 0.1578 TGGGG 0.199 TGGGT 0.2247 TGGTA 0.3106 TGGTC 0.1522 TGGTG 0.2132 TGGTT 0.3239 TGTAA 0.3504 TGTAC 0.1586 TGTAG 0.07997 TGTAT 0.411 TGTCA 0.3288 TGTCC 0.1425 TGTCG 0.251 TGTCT 0.2778 TGTGA 0.3086 TGTGC 0.1847 TGTGG 0.1053 TGTGT 0.4014 TGTTA 0.2862 TGTTC 0.1651 TGTTG 0.1498 TGTTT 0.3988 TTAAA 0.4218 TTAAC 0.1041 TTAAG 0.0842 TTAAT 0.3899 TTACA 0.4164 TTACC 0.1135 TTACG 0.2041 TTACT 0.266 TTAGA 0.4495 TTAGC 0.1417 TTAGG 0.123 TTAGT 0.2858 TTATA 0.3396 TTATC 0.1353 TTATG 0.09475 TTATT 0.4304 TTCAA 0.3869 TTCAC 0.1544 TTCAG 0.0951 TTCAT 0.3636 TTCCA 0.3373 TTCCC 0.1664 TTCCG 0.1459 TTCCT 0.3503 TTCGA 0.4273 TTCGC 0.157 TTCGG 0.07797 TTCGT 0.3377 TTCTA 0.2259 TTCTC 0.2122 TTCTG 0.09973 TTCTT 0.4621 TTGAA 0.4463 TTGAC 0.1079 TTGAG 0.09547 TTGAT 0.3503 TTGCA 0.4014 TTGCC 0.1363 TTGCG 0.1978 TTGCT 0.2645 TTGGA 0.4456 TTGGC 0.1843 TTGGG 0.1032 TTGGT 0.2669 TTGTA 0.3329 TTGTC 0.1374 TTGTG 0.1376 TTGTT 0.3921 TTTAA 0.3692 TTTAC 0.1177 TTTAG 0.07002 TTTAT 0.4431 TTTCA 0.2976 TTTCC 0.1513 TTTCG 0.1803 TTTCT 0.3707 TTTGA 0.3461 TTTGC 0.1708 TTTGG 0.105 TTTGT 0.3781 TTTTA 0.2524 TTTTC 0.1584 TTTTG 0.08965 TTTTT 0.4996 [4] # (a,c,g,t)= (0.325, 0.175, 0.175, 0.325) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.34 C 0.16 G 0.16 T 0.34 # l= 1 # Values AA 0.134 AC 0.045 AG 0.0431 AT 0.118 CA 0.0464 CC 0.0252 CG 0.0451 CT 0.0431 GA 0.0624 GC 0.0272 GG 0.0252 GT 0.045 TA 0.0972 TC 0.0624 TG 0.0464 TT 0.134 # l= 2 # Values AAA 0.0579 AAC 0.0157 AAG 0.0168 AAT 0.0437 ACA 0.0156 ACC 0.00581 ACG 0.0133 ACT 0.0102 AGA 0.0193 AGC 0.00614 AGG 0.00739 AGT 0.0103 ATA 0.041 ATC 0.0188 ATG 0.0145 ATT 0.0437 CAA 0.017 CAC 0.00899 CAG 0.00593 CAT 0.0145 CCA 0.00715 CCC 0.00481 CCG 0.00584 CCT 0.00739 CGA 0.0176 CGC 0.00835 CGG 0.00584 CGT 0.0133 CTA 0.00882 CTC 0.0115 CTG 0.00593 CTT 0.0168 GAA 0.0251 GAC 0.00698 GAG 0.0115 GAT 0.0188 GCA 0.00839 GCC 0.00436 GCG 0.00835 GCT 0.00614 GGA 0.0102 GGC 0.00436 GGG 0.00481 GGT 0.00581 GTA 0.0133 GTC 0.00698 GTG 0.00899 GTT 0.0157 TAA 0.0342 TAC 0.0133 TAG 0.00882 TAT 0.041 TCA 0.0153 TCC 0.0102 TCG 0.0176 TCT 0.0193 TGA 0.0153 TGC 0.00839 TGG 0.00715 TGT 0.0156 TTA 0.0342 TTC 0.0251 TTG 0.017 TTT 0.0579 # l= 3 # Values AAAA 0.0265 AAAC 0.00609 AAAG 0.00737 AAAT 0.0179 AACA 0.00541 AACC 0.00188 AACG 0.00477 AACT 0.00368 AAGA 0.00777 AAGC 0.00215 AAGG 0.00276 AAGT 0.00414 AATA 0.0153 AATC 0.0062 AATG 0.00557 AATT 0.0166 ACAA 0.00582 ACAC 0.00299 ACAG 0.00208 ACAT 0.00468 ACCA 0.00175 ACCC 0.000843 ACCG 0.00173 ACCT 0.00148 ACGA 0.00542 ACGC 0.00237 ACGG 0.00177 ACGT 0.00377 ACTA 0.00239 ACTC 0.00206 ACTG 0.00166 ACTT 0.00414 AGAA 0.00839 AGAC 0.0017 AGAG 0.00427 AGAT 0.00492 AGCA 0.002 AGCC 0.000921 AGCG 0.00177 AGCT 0.00145 AGGA 0.00332 AGGC 0.00103 AGGG 0.00156 AGGT 0.00148 AGTA 0.00313 AGTC 0.00146 AGTG 0.00198 AGTT 0.00368 ATAA 0.0145 ATAC 0.0049 ATAG 0.00354 ATAT 0.0181 ATCA 0.00519 ATCC 0.00271 ATCG 0.00598 ATCT 0.00492 ATGA 0.00521 ATGC 0.00243 ATGG 0.0022 ATGT 0.00468 ATTA 0.013 ATTC 0.00705 ATTG 0.00571 ATTT 0.0179 CAAA 0.00618 CAAC 0.00267 CAAG 0.0024 CAAT 0.00571 CACA 0.00261 CACC 0.00139 CACG 0.00301 CACT 0.00197 CAGA 0.00213 CAGC 0.00111 CAGG 0.00103 CAGT 0.00166 CATA 0.00411 CATC 0.00298 CATG 0.00186 CATT 0.00557 CCAA 0.00233 CCAC 0.00163 CCAG 0.000996 CCAT 0.0022 CCCA 0.000898 CCCC 0.00131 CCCG 0.00104 CCCT 0.00156 CCGA 0.00184 CCGC 0.0013 CCGG 0.000945 CCGT 0.00177 CCTA 0.00122 CCTC 0.00238 CCTG 0.00103 CCTT 0.00276 CGAA 0.00585 CGAC 0.00227 CGAG 0.00351 CGAT 0.00598 CGCA 0.00201 CGCC 0.00132 CGCG 0.00326 CGCT 0.00177 CGGA 0.00183 CGGC 0.00124 CGGG 0.00104 CGGT 0.00173 CGTA 0.00329 CGTC 0.00227 CGTG 0.00301 CGTT 0.00477 CTAA 0.00273 CTAC 0.00156 CTAG 0.000988 CTAT 0.00354 CTCA 0.00165 CTCC 0.00205 CTCG 0.00351 CTCT 0.00427 CTGA 0.00166 CTGC 0.00119 CTGG 0.000996 CTGT 0.00208 CTTA 0.00318 CTTC 0.00388 CTTG 0.0024 CTTT 0.00736 GAAA 0.0112 GAAC 0.00297 GAAG 0.00388 GAAT 0.00705 GACA 0.00231 GACC 0.000936 GACG 0.00227 GACT 0.00146 GAGA 0.00553 GAGC 0.00152 GAGG 0.00239 GAGT 0.00206 GATA 0.00596 GATC 0.00366 GATG 0.00298 GATT 0.0062 GCAA 0.00315 GCAC 0.00161 GCAG 0.00119 GCAT 0.00243 GCCA 0.00142 GCCC 0.00067 GCCG 0.00124 GCCT 0.00103 GCGA 0.00293 GCGC 0.00176 GCGG 0.0013 GCGT 0.00237 GCTA 0.00136 GCTC 0.00152 GCTG 0.00111 GCTT 0.00216 GGAA 0.00435 GGAC 0.0011 GGAG 0.00205 GGAT 0.00271 GGCA 0.00124 GGCC 0.000871 GGCG 0.00132 GGCT 0.000921 GGGA 0.00198 GGGC 0.00067 GGGG 0.00131 GGGT 0.000843 GGTA 0.0016 GGTC 0.000936 GGTG 0.0014 GGTT 0.00188 GTAA 0.00467 GTAC 0.00212 GTAG 0.00156 GTAT 0.0049 GTCA 0.00191 GTCC 0.0011 GTCG 0.00227 GTCT 0.0017 GTGA 0.00275 GTGC 0.00161 GTGG 0.00163 GTGT 0.00299 GTTA 0.00401 GTTC 0.00297 GTTG 0.00267 GTTT 0.00609 TAAA 0.0139 TAAC 0.00401 TAAG 0.00318 TAAT 0.013 TACA 0.00525 TACC 0.0016 TACG 0.00329 TACT 0.00313 TAGA 0.00386 TAGC 0.00136 TAGG 0.00122 TAGT 0.00239 TATA 0.0156 TATC 0.00596 TATG 0.00411 TATT 0.0153 TCAA 0.00567 TCAC 0.00275 TCAG 0.00166 TCAT 0.00521 TCCA 0.00308 TCCC 0.00198 TCCG 0.00183 TCCT 0.00332 TCGA 0.00742 TCGC 0.00293 TCGG 0.00184 TCGT 0.00543 TCTA 0.00386 TCTC 0.00553 TCTG 0.00213 TCTT 0.00777 TGAA 0.00654 TGAC 0.00191 TGAG 0.00165 TGAT 0.00519 TGCA 0.00314 TGCC 0.00124 TGCG 0.00201 TGCT 0.002 TGGA 0.00308 TGGC 0.00142 TGGG 0.000897 TGGT 0.00175 TGTA 0.00524 TGTC 0.00231 TGTG 0.00261 TGTT 0.00541 TTAA 0.0123 TTAC 0.00466 TTAG 0.00273 TTAT 0.0145 TTCA 0.00654 TTCC 0.00435 TTCG 0.00585 TTCT 0.00839 TTGA 0.00567 TTGC 0.00315 TTGG 0.00233 TTGT 0.00582 TTTA 0.0139 TTTC 0.0112 TTTG 0.00618 TTTT 0.0265 # l= 4 # Values AAAAA 0.0135 AAAAC 0.00214 AAAAG 0.0032 AAAAT 0.00771 AAACA 0.00213 AAACC 0.000588 AAACG 0.00181 AAACT 0.00156 AAAGA 0.0036 AAAGC 0.000785 AAAGG 0.00118 AAAGT 0.0018 AAATA 0.00657 AAATC 0.00228 AAATG 0.00227 AAATT 0.00678 AACAA 0.00229 AACAC 0.000842 AACAG 0.00074 AACAT 0.00154 AACCA 0.000558 AACCC 0.000249 AACCG 0.000579 AACCT 0.000495 AACGA 0.00212 AACGC 0.000744 AACGG 0.000639 AACGT 0.00126 AACTA 0.000898 AACTC 0.000683 AACTG 0.000608 AACTT 0.00149 AAGAA 0.00389 AAGAC 0.000559 AAGAG 0.00136 AAGAT 0.00196 AAGCA 0.000737 AAGCC 0.000257 AAGCG 0.000624 AAGCT 0.000537 AAGGA 0.00137 AAGGC 0.000314 AAGGG 0.000562 AAGGT 0.00051 AAGTA 0.00137 AAGTC 0.000495 AAGTG 0.000785 AAGTT 0.00149 AATAA 0.00624 AATAC 0.00158 AATAG 0.00136 AATAT 0.00613 AATCA 0.00184 AATCC 0.000782 AATCG 0.00189 AATCT 0.00169 AATGA 0.00213 AATGC 0.000826 AATGG 0.00086 AATGT 0.00175 AATTA 0.00516 AATTC 0.00245 AATTG 0.00224 AATTT 0.00678 ACAAA 0.00225 ACAAC 0.000779 ACAAG 0.000796 ACAAT 0.002 ACACA 0.00105 ACACC 0.00035 ACACG 0.00101 ACACT 0.000586 ACAGA 0.000794 ACAGC 0.000325 ACAGG 0.000367 ACAGT 0.000595 ACATA 0.00161 ACATC 0.000723 ACATG 0.000601 ACATT 0.00175 ACCAA 0.000581 ACCAC 0.00039 ACCAG 0.000274 ACCAT 0.000508 ACCCA 0.000196 ACCCC 0.000185 ACCCG 0.000206 ACCCT 0.000256 ACCGA 0.000618 ACCGC 0.000327 ACCGG 0.000296 ACCGT 0.000494 ACCTA 0.000339 ACCTC 0.000358 ACCTG 0.000272 ACCTT 0.00051 ACGAA 0.00192 ACGAC 0.000627 ACGAG 0.00109 ACGAT 0.00179 ACGCA 0.000625 ACGCC 0.000287 ACGCG 0.000981 ACGCT 0.000472 ACGGA 0.000639 ACGGC 0.000307 ACGGG 0.000326 ACGGT 0.000494 ACGTA 0.00113 ACGTC 0.000502 ACGTG 0.000875 ACGTT 0.00126 ACTAA 0.00073 ACTAC 0.000419 ACTAG 0.000277 ACTAT 0.000965 ACTCA 0.000374 ACTCC 0.000256 ACTCG 0.00084 ACTCT 0.000588 ACTGA 0.000493 ACTGC 0.000293 ACTGG 0.000282 ACTGT 0.000595 ACTTA 0.000944 ACTTC 0.000686 ACTTG 0.000708 ACTTT 0.0018 AGAAA 0.00409 AGAAC 0.000735 AGAAG 0.00139 AGAAT 0.00217 AGACA 0.000623 AGACC 0.00018 AGACG 0.00052 AGACT 0.000379 AGAGA 0.00256 AGAGC 0.000377 AGAGG 0.000744 AGAGT 0.000588 AGATA 0.00173 AGATC 0.000747 AGATG 0.000754 AGATT 0.00169 AGCAA 0.000808 AGCAC 0.000321 AGCAG 0.000315 AGCAT 0.000555 AGCCA 0.000315 AGCCC 0.00012 AGCCG 0.000257 AGCCT 0.000228 AGCGA 0.000685 AGCGC 0.000302 AGCGG 0.000308 AGCGT 0.000472 AGCTA 0.000342 AGCTC 0.000287 AGCTG 0.000282 AGCTT 0.000537 AGGAA 0.00151 AGGAC 0.000268 AGGAG 0.000715 AGGAT 0.00083 AGGCA 0.000331 AGGCC 0.000158 AGGCG 0.000312 AGGCT 0.000228 AGGGA 0.000712 AGGGC 0.000161 AGGGG 0.00043 AGGGT 0.000256 AGGTA 0.000454 AGGTC 0.0002 AGGTG 0.000331 AGGTT 0.000495 AGTAA 0.00117 AGTAC 0.0004 AGTAG 0.000465 AGTAT 0.00109 AGTCA 0.000442 AGTCC 0.000171 AGTCG 0.000471 AGTCT 0.000379 AGTGA 0.000709 AGTGC 0.000294 AGTGG 0.000385 AGTGT 0.000586 AGTTA 0.000955 AGTTC 0.000541 AGTTG 0.000628 AGTTT 0.00156 ATAAA 0.00604 ATAAC 0.00145 ATAAG 0.00126 ATAAT 0.00571 ATACA 0.00211 ATACC 0.000513 ATACG 0.00119 ATACT 0.00109 ATAGA 0.00163 ATAGC 0.000481 ATAGG 0.000471 ATAGT 0.000965 ATATA 0.0082 ATATC 0.00211 ATATG 0.00166 ATATT 0.00613 ATCAA 0.00193 ATCAC 0.000835 ATCAG 0.000565 ATCAT 0.00186 ATCCA 0.00086 ATCCC 0.000449 ATCCG 0.000568 ATCCT 0.00083 ATCGA 0.00267 ATCGC 0.000847 ATCGG 0.000673 ATCGT 0.00179 ATCTA 0.00124 ATCTC 0.00111 ATCTG 0.000612 ATCTT 0.00196 ATGAA 0.00226 ATGAC 0.000554 ATGAG 0.000536 ATGAT 0.00186 ATGCA 0.00101 ATGCC 0.00027 ATGCG 0.000598 ATGCT 0.000555 ATGGA 0.00102 ATGGC 0.000394 ATGGG 0.000278 ATGGT 0.000508 ATGTA 0.00189 ATGTC 0.000543 ATGTG 0.000711 ATGTT 0.00154 ATTAA 0.00471 ATTAC 0.00161 ATTAG 0.00101 ATTAT 0.00571 ATTCA 0.00202 ATTCC 0.00106 ATTCG 0.0018 ATTCT 0.00217 ATTGA 0.00198 ATTGC 0.000971 ATTGG 0.000767 ATTGT 0.002 ATTTA 0.00503 ATTTC 0.00314 ATTTG 0.00203 ATTTT 0.00771 CAAAA 0.00233 CAAAC 0.000882 CAAAG 0.000941 CAAAT 0.00203 CAACA 0.000865 CAACC 0.000388 CAACG 0.000794 CAACT 0.000628 CAAGA 0.000907 CAAGC 0.000387 CAAGG 0.000396 CAAGT 0.000708 CAATA 0.00169 CAATC 0.000938 CAATG 0.000849 CAATT 0.00224 CACAA 0.00082 CACAC 0.000713 CACAG 0.00037 CACAT 0.000711 CACCA 0.000396 CACCC 0.000247 CACCG 0.000422 CACCT 0.000331 CACGA 0.00104 CACGC 0.000641 CACGG 0.000449 CACGT 0.000875 CACTA 0.000367 CACTC 0.000463 CACTG 0.000361 CACTT 0.000785 CAGAA 0.000802 CAGAC 0.000271 CAGAG 0.000444 CAGAT 0.000612 CAGCA 0.000312 CAGCC 0.000229 CAGCG 0.000286 CAGCT 0.000282 CAGGA 0.000377 CAGGC 0.000183 CAGGG 0.000198 CAGGT 0.000272 CAGTA 0.0004 CAGTC 0.000293 CAGTG 0.000361 CAGTT 0.000608 CATAA 0.00137 CATAC 0.000655 CATAG 0.000428 CATAT 0.00166 CATCA 0.000745 CATCC 0.000515 CATCG 0.000968 CATCT 0.000754 CATGA 0.000584 CATGC 0.000381 CATGG 0.000296 CATGT 0.000601 CATTA 0.00139 CATTC 0.00106 CATTG 0.000849 CATTT 0.00227 CCAAA 0.000717 CCAAC 0.000459 CCAAG 0.000383 CCAAT 0.000767 CCACA 0.000295 CCACC 0.000394 CCACG 0.000556 CCACT 0.000385 CCAGA 0.000315 CCAGC 0.000216 CCAGG 0.000182 CCAGT 0.000282 CCATA 0.000455 CCATC 0.000584 CCATG 0.000296 CCATT 0.00086 CCCAA 0.000257 CCCAC 0.000238 CCCAG 0.000124 CCCAT 0.000278 CCCCA 0.00019 CCCCC 0.000432 CCCCG 0.00026 CCCCT 0.00043 CCCGA 0.000305 CCCGC 0.000237 CCCGG 0.000172 CCCGT 0.000326 CCCTA 0.000185 CCCTC 0.000614 CCCTG 0.000198 CCCTT 0.000562 CCGAA 0.000467 CCGAC 0.000311 CCGAG 0.000385 CCGAT 0.000673 CCGCA 0.000243 CCGCC 0.000281 CCGCG 0.000464 CCGCT 0.000308 CCGGA 0.000251 CCGGC 0.000226 CCGGG 0.000172 CCGGT 0.000296 CCGTA 0.000332 CCGTC 0.000346 CCGTG 0.000449 CCGTT 0.000639 CCTAA 0.000365 CCTAC 0.000232 CCTAG 0.000151 CCTAT 0.000471 CCTCA 0.000237 CCTCC 0.000685 CCTCG 0.00072 CCTCT 0.000744 CCTGA 0.000261 CCTGC 0.00022 CCTGG 0.000182 CCTGT 0.000367 CCTTA 0.000412 CCTTC 0.000773 CCTTG 0.000396 CCTTT 0.00118 CGAAA 0.00224 CGAAC 0.00088 CGAAG 0.000932 CGAAT 0.0018 CGACA 0.000634 CGACC 0.000354 CGACG 0.000807 CGACT 0.000471 CGAGA 0.00131 CGAGC 0.000642 CGAGG 0.00072 CGAGT 0.00084 CGATA 0.00169 CGATC 0.00143 CGATG 0.000968 CGATT 0.00189 CGCAA 0.000687 CGCAC 0.000436 CGCAG 0.000286 CGCAT 0.000598 CGCCA 0.000413 CGCCC 0.000218 CGCCG 0.000378 CGCCT 0.000312 CGCGA 0.00109 CGCGC 0.000721 CGCGG 0.000464 CGCGT 0.000981 CGCTA 0.000341 CGCTC 0.000517 CGCTG 0.000286 CGCTT 0.000624 CGGAA 0.000658 CGGAC 0.000251 CGGAG 0.000353 CGGAT 0.000568 CGGCA 0.0003 CGGCC 0.000304 CGGCG 0.000378 CGGCT 0.000257 CGGGA 0.000374 CGGGC 0.0002 CGGGG 0.00026 CGGGT 0.000206 CGGTA 0.000426 CGGTC 0.000308 CGGTG 0.000422 CGGTT 0.000579 CGTAA 0.00109 CGTAC 0.000593 CGTAG 0.000409 CGTAT 0.00119 CGTCA 0.00052 CGTCC 0.000424 CGTCG 0.000807 CGTCT 0.00052 CGTGA 0.000854 CGTGC 0.000586 CGTGG 0.000556 CGTGT 0.00101 CGTTA 0.00105 CGTTC 0.00111 CGTTG 0.000794 CGTTT 0.00181 CTAAA 0.00102 CTAAC 0.000426 CTAAG 0.000276 CTAAT 0.00101 CTACA 0.000438 CTACC 0.000252 CTACG 0.000409 CTACT 0.000465 CTAGA 0.000388 CTAGC 0.000173 CTAGG 0.000151 CTAGT 0.000277 CTATA 0.00104 CTATC 0.000708 CTATG 0.000428 CTATT 0.00136 CTCAA 0.000574 CTCAC 0.000358 CTCAG 0.000186 CTCAT 0.000536 CTCCA 0.000463 CTCCC 0.000522 CTCCG 0.000353 CTCCT 0.000715 CTCGA 0.00136 CTCGC 0.000685 CTCGG 0.000385 CTCGT 0.00109 CTCTA 0.000549 CTCTC 0.00192 CTCTG 0.000444 CTCTT 0.00136 CTGAA 0.000645 CTGAC 0.000268 CTGAG 0.000186 CTGAT 0.000565 CTGCA 0.000353 CTGCC 0.000237 CTGCG 0.000286 CTGCT 0.000315 CTGGA 0.000368 CTGGC 0.00023 CTGGG 0.000124 CTGGT 0.000274 CTGTA 0.000574 CTGTC 0.000398 CTGTG 0.00037 CTGTT 0.00074 CTTAA 0.0011 CTTAC 0.000546 CTTAG 0.000276 CTTAT 0.00126 CTTCA 0.000715 CTTCC 0.000839 CTTCG 0.000932 CTTCT 0.00139 CTTGA 0.000743 CTTGC 0.000474 CTTGG 0.000383 CTTGT 0.000796 CTTTA 0.00136 CTTTC 0.00186 CTTTG 0.000941 CTTTT 0.0032 GAAAA 0.00464 GAAAC 0.0016 GAAAG 0.00186 GAAAT 0.00314 GAACA 0.000968 GAACC 0.000353 GAACG 0.00111 GAACT 0.000541 GAAGA 0.00187 GAAGC 0.000546 GAAGG 0.000773 GAAGT 0.000686 GAATA 0.00229 GAATC 0.00126 GAATG 0.00106 GAATT 0.00245 GACAA 0.00088 GACAC 0.000487 GACAG 0.000398 GACAT 0.000543 GACCA 0.000286 GACCC 0.000142 GACCG 0.000308 GACCT 0.0002 GACGA 0.00101 GACGC 0.000417 GACGG 0.000346 GACGT 0.000502 GACTA 0.000332 GACTC 0.000342 GACTG 0.000293 GACTT 0.000495 GAGAA 0.00199 GAGAC 0.000513 GAGAG 0.00192 GAGAT 0.00111 GAGCA 0.000483 GAGCC 0.000228 GAGCG 0.000517 GAGCT 0.000287 GAGGA 0.00106 GAGGC 0.000348 GAGGG 0.000614 GAGGT 0.000358 GAGTA 0.000569 GAGTC 0.000342 GAGTG 0.000463 GAGTT 0.000683 GATAA 0.00225 GATAC 0.000892 GATAG 0.000708 GATAT 0.00211 GATCA 0.000915 GATCC 0.000561 GATCG 0.00143 GATCT 0.000747 GATGA 0.00115 GATGC 0.000526 GATGG 0.000584 GATGT 0.000723 GATTA 0.00172 GATTC 0.00126 GATTG 0.000938 GATTT 0.00228 GCAAA 0.00113 GCAAC 0.000576 GCAAG 0.000474 GCAAT 0.000971 GCACA 0.000503 GCACC 0.00023 GCACG 0.000586 GCACT 0.000294 GCAGA 0.000398 GCAGC 0.00028 GCAGG 0.00022 GCAGT 0.000293 GCATA 0.0007 GCATC 0.000526 GCATG 0.000381 GCATT 0.000826 GCCAA 0.000446 GCCAC 0.000348 GCCAG 0.00023 GCCAT 0.000394 GCCCA 0.000143 GCCCC 0.000166 GCCCG 0.0002 GCCCT 0.000161 GCCGA 0.000382 GCCGC 0.000324 GCCGG 0.000226 GCCGT 0.000307 GCCTA 0.000185 GCCTC 0.000348 GCCTG 0.000183 GCCTT 0.000314 GCGAA 0.000956 GCGAC 0.000443 GCGAG 0.000685 GCGAT 0.000847 GCGCA 0.000454 GCGCC 0.000283 GCGCG 0.000721 GCGCT 0.000302 GCGGA 0.000408 GCGGC 0.000324 GCGGG 0.000237 GCGGT 0.000327 GCGTA 0.000565 GCGTC 0.000417 GCGTG 0.000641 GCGTT 0.000744 GCTAA 0.000412 GCTAC 0.000291 GCTAG 0.000173 GCTAT 0.000481 GCTCA 0.000252 GCTCC 0.000245 GCTCG 0.000642 GCTCT 0.000377 GCTGA 0.000288 GCTGC 0.00028 GCTGG 0.000216 GCTGT 0.000325 GCTTA 0.000437 GCTTC 0.000546 GCTTG 0.000387 GCTTT 0.000785 GGAAA 0.00188 GGAAC 0.000576 GGAAG 0.000839 GGAAT 0.00106 GGACA 0.000361 GGACC 0.000143 GGACG 0.000424 GGACT 0.000171 GGAGA 0.000864 GGAGC 0.000245 GGAGG 0.000685 GGAGT 0.000256 GGATA 0.000849 GGATC 0.000561 GGATG 0.000515 GGATT 0.000782 GGCAA 0.00047 GGCAC 0.000267 GGCAG 0.000237 GGCAT 0.00027 GGCCA 0.000275 GGCCC 0.000133 GGCCG 0.000304 GGCCT 0.000158 GGCGA 0.00047 GGCGC 0.000283 GGCGG 0.000281 GGCGT 0.000287 GGCTA 0.000207 GGCTC 0.000228 GGCTG 0.000229 GGCTT 0.000257 GGGAA 0.000784 GGGAC 0.000227 GGGAG 0.000522 GGGAT 0.000449 GGGCA 0.0002 GGGCC 0.000133 GGGCG 0.000218 GGGCT 0.00012 GGGGA 0.000527 GGGGC 0.000166 GGGGG 0.000432 GGGGT 0.000185 GGGTA 0.000205 GGGTC 0.000142 GGGTG 0.000247 GGGTT 0.000249 GGTAA 0.000587 GGTAC 0.000244 GGTAG 0.000252 GGTAT 0.000513 GGTCA 0.000258 GGTCC 0.000143 GGTCG 0.000354 GGTCT 0.00018 GGTGA 0.00042 GGTGC 0.00023 GGTGG 0.000394 GGTGT 0.00035 GGTTA 0.000551 GGTTC 0.000353 GGTTG 0.000388 GGTTT 0.000588 GTAAA 0.0018 GTAAC 0.000712 GTAAG 0.000546 GTAAT 0.00161 GTACA 0.000886 GTACC 0.000244 GTACG 0.000593 GTACT 0.0004 GTAGA 0.000622 GTAGC 0.000291 GTAGG 0.000232 GTAGT 0.000419 GTATA 0.00178 GTATC 0.000892 GTATG 0.000655 GTATT 0.00158 GTCAA 0.000647 GTCAC 0.000439 GTCAG 0.000268 GTCAT 0.000554 GTCCA 0.000355 GTCCC 0.000227 GTCCG 0.000251 GTCCT 0.000268 GTCGA 0.000886 GTCGC 0.000443 GTCGG 0.000311 GTCGT 0.000627 GTCTA 0.000359 GTCTC 0.000513 GTCTG 0.000271 GTCTT 0.000559 GTGAA 0.00112 GTGAC 0.000439 GTGAG 0.000358 GTGAT 0.000835 GTGCA 0.00059 GTGCC 0.000267 GTGCG 0.000436 GTGCT 0.000321 GTGGA 0.000653 GTGGC 0.000348 GTGGG 0.000238 GTGGT 0.00039 GTGTA 0.000951 GTGTC 0.000487 GTGTG 0.000713 GTGTT 0.000842 GTTAA 0.00143 GTTAC 0.000712 GTTAG 0.000426 GTTAT 0.00145 GTTCA 0.000778 GTTCC 0.000576 GTTCG 0.00088 GTTCT 0.000735 GTTGA 0.00086 GTTGC 0.000576 GTTGG 0.000459 GTTGT 0.000779 GTTTA 0.00147 GTTTC 0.0016 GTTTG 0.000882 GTTTT 0.00214 TAAAA 0.00608 TAAAC 0.00147 TAAAG 0.00136 TAAAT 0.00503 TAACA 0.00145 TAACC 0.000551 TAACG 0.00105 TAACT 0.000955 TAAGA 0.00139 TAAGC 0.000437 TAAGG 0.000412 TAAGT 0.000944 TAATA 0.00476 TAATC 0.00172 TAATG 0.00139 TAATT 0.00516 TACAA 0.00183 TACAC 0.000951 TACAG 0.000574 TACAT 0.00189 TACCA 0.000511 TACCC 0.000205 TACCG 0.000426 TACCT 0.000454 TACGA 0.00126 TACGC 0.000565 TACGG 0.000332 TACGT 0.00113 TACTA 0.000794 TACTC 0.000569 TACTG 0.0004 TACTT 0.00137 TAGAA 0.00171 TAGAC 0.000359 TAGAG 0.000549 TAGAT 0.00124 TAGCA 0.000466 TAGCC 0.000207 TAGCG 0.000341 TAGCT 0.000342 TAGGA 0.000509 TAGGC 0.000185 TAGGG 0.000185 TAGGT 0.000339 TAGTA 0.000794 TAGTC 0.000332 TAGTG 0.000367 TAGTT 0.000898 TATAA 0.0046 TATAC 0.00178 TATAG 0.00104 TATAT 0.0082 TATCA 0.00169 TATCC 0.000849 TATCG 0.00169 TATCT 0.00173 TATGA 0.00135 TATGC 0.0007 TATGG 0.000455 TATGT 0.00161 TATTA 0.00476 TATTC 0.00229 TATTG 0.00169 TATTT 0.00657 TCAAA 0.00209 TCAAC 0.00086 TCAAG 0.000743 TCAAT 0.00198 TCACA 0.000768 TCACC 0.00042 TCACG 0.000854 TCACT 0.000709 TCAGA 0.000622 TCAGC 0.000288 TCAGG 0.000261 TCAGT 0.000493 TCATA 0.00135 TCATC 0.00115 TCATG 0.000584 TCATT 0.00213 TCCAA 0.00104 TCCAC 0.000653 TCCAG 0.000368 TCCAT 0.00102 TCCCA 0.000368 TCCCC 0.000527 TCCCG 0.000374 TCCCT 0.000712 TCCGA 0.00053 TCCGC 0.000408 TCCGG 0.000251 TCCGT 0.000639 TCCTA 0.000509 TCCTC 0.00106 TCCTG 0.000377 TCCTT 0.00137 TCGAA 0.00251 TCGAC 0.000886 TCGAG 0.00136 TCGAT 0.00267 TCGCA 0.000684 TCGCC 0.00047 TCGCG 0.00109 TCGCT 0.000685 TCGGA 0.00053 TCGGC 0.000382 TCGGG 0.000305 TCGGT 0.000618 TCGTA 0.00126 TCGTC 0.00101 TCGTG 0.00104 TCGTT 0.00212 TCTAA 0.00122 TCTAC 0.000622 TCTAG 0.000388 TCTAT 0.00163 TCTCA 0.000792 TCTCC 0.000864 TCTCG 0.00131 TCTCT 0.00256 TCTGA 0.000622 TCTGC 0.000398 TCTGG 0.000315 TCTGT 0.000794 TCTTA 0.00139 TCTTC 0.00187 TCTTG 0.000907 TCTTT 0.0036 TGAAA 0.00303 TGAAC 0.000778 TGAAG 0.000715 TGAAT 0.00202 TGACA 0.000688 TGACC 0.000258 TGACG 0.00052 TGACT 0.000442 TGAGA 0.000792 TGAGC 0.000252 TGAGG 0.000237 TGAGT 0.000374 TGATA 0.00169 TGATC 0.000915 TGATG 0.000745 TGATT 0.00184 TGCAA 0.00119 TGCAC 0.00059 TGCAG 0.000353 TGCAT 0.00101 TGCCA 0.000414 TGCCC 0.0002 TGCCG 0.0003 TGCCT 0.000331 TGCGA 0.000684 TGCGC 0.000454 TGCGG 0.000243 TGCGT 0.000625 TGCTA 0.000466 TGCTC 0.000483 TGCTG 0.000312 TGCTT 0.000737 TGGAA 0.0014 TGGAC 0.000355 TGGAG 0.000463 TGGAT 0.00086 TGGCA 0.000414 TGGCC 0.000275 TGGCG 0.000413 TGGCT 0.000315 TGGGA 0.000368 TGGGC 0.000143 TGGGG 0.00019 TGGGT 0.000196 TGGTA 0.000511 TGGTC 0.000286 TGGTG 0.000396 TGGTT 0.000558 TGTAA 0.00182 TGTAC 0.000886 TGTAG 0.000438 TGTAT 0.00211 TGTCA 0.000688 TGTCC 0.000361 TGTCG 0.000634 TGTCT 0.000623 TGTGA 0.000768 TGTGC 0.000503 TGTGG 0.000295 TGTGT 0.00105 TGTTA 0.00145 TGTTC 0.000968 TGTTG 0.000865 TGTTT 0.00213 TTAAA 0.00508 TTAAC 0.00143 TTAAG 0.0011 TTAAT 0.00471 TTACA 0.00182 TTACC 0.000587 TTACG 0.00109 TTACT 0.00117 TTAGA 0.00122 TTAGC 0.000412 TTAGG 0.000365 TTAGT 0.00073 TTATA 0.0046 TTATC 0.00225 TTATG 0.00137 TTATT 0.00624 TTCAA 0.00252 TTCAC 0.00112 TTCAG 0.000645 TTCAT 0.00226 TTCCA 0.0014 TTCCC 0.000784 TTCCG 0.000658 TTCCT 0.00151 TTCGA 0.00251 TTCGC 0.000956 TTCGG 0.000467 TTCGT 0.00192 TTCTA 0.00171 TTCTC 0.00199 TTCTG 0.000802 TTCTT 0.00389 TTGAA 0.00252 TTGAC 0.000647 TTGAG 0.000574 TTGAT 0.00193 TTGCA 0.00119 TTGCC 0.00047 TTGCG 0.000687 TTGCT 0.000808 TTGGA 0.00104 TTGGC 0.000446 TTGGG 0.000257 TTGGT 0.000581 TTGTA 0.00183 TTGTC 0.00088 TTGTG 0.00082 TTGTT 0.00229 TTTAA 0.00508 TTTAC 0.0018 TTTAG 0.00102 TTTAT 0.00604 TTTCA 0.00303 TTTCC 0.00188 TTTCG 0.00224 TTTCT 0.00409 TTTGA 0.00209 TTTGC 0.00113 TTTGG 0.000717 TTTGT 0.00225 TTTTA 0.00608 TTTTC 0.00464 TTTTG 0.00233 TTTTT 0.0135 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.5083 AAAAC 0.0806 AAAAG 0.1207 AAAAT 0.2904 AAACA 0.3493 AAACC 0.09667 AAACG 0.298 AAACT 0.256 AAAGA 0.4891 AAAGC 0.1066 AAAGG 0.1599 AAAGT 0.2445 AAATA 0.3671 AAATC 0.1274 AAATG 0.1266 AAATT 0.3789 AACAA 0.4233 AACAC 0.1555 AACAG 0.1368 AACAT 0.2845 AACCA 0.2969 AACCC 0.1325 AACCG 0.3077 AACCT 0.263 AACGA 0.4447 AACGC 0.1561 AACGG 0.1341 AACGT 0.2652 AACTA 0.2438 AACTC 0.1856 AACTG 0.1651 AACTT 0.4055 AAGAA 0.5008 AAGAC 0.07196 AAGAG 0.1752 AAGAT 0.2521 AAGCA 0.3418 AAGCC 0.1192 AAGCG 0.2897 AAGCT 0.2493 AAGGA 0.4976 AAGGC 0.1138 AAGGG 0.2038 AAGGT 0.1848 AAGTA 0.3301 AAGTC 0.1196 AAGTG 0.1896 AAGTT 0.3607 AATAA 0.4076 AATAC 0.103 AATAG 0.08905 AATAT 0.4004 AATCA 0.2965 AATCC 0.1262 AATCG 0.3046 AATCT 0.2727 AATGA 0.3826 AATGC 0.1484 AATGG 0.1546 AATGT 0.3145 AATTA 0.3102 AATTC 0.1472 AATTG 0.1345 AATTT 0.4081 ACAAA 0.3863 ACAAC 0.1337 ACAAG 0.1368 ACAAT 0.3432 ACACA 0.3499 ACACC 0.1169 ACACG 0.3374 ACACT 0.1959 ACAGA 0.3814 ACAGC 0.1561 ACAGG 0.1764 ACAGT 0.2861 ACATA 0.3432 ACATC 0.1545 ACATG 0.1284 ACATT 0.3739 ACCAA 0.3317 ACCAC 0.2223 ACCAG 0.1562 ACCAT 0.2898 ACCCA 0.2327 ACCCC 0.2194 ACCCG 0.2443 ACCCT 0.3036 ACCGA 0.3562 ACCGC 0.1884 ACCGG 0.1704 ACCGT 0.2849 ACCTA 0.2293 ACCTC 0.2421 ACCTG 0.184 ACCTT 0.3447 ACGAA 0.3539 ACGAC 0.1156 ACGAG 0.2006 ACGAT 0.33 ACGCA 0.2642 ACGCC 0.1214 ACGCG 0.4147 ACGCT 0.1996 ACGGA 0.3618 ACGGC 0.1739 ACGGG 0.1846 ACGGT 0.2797 ACGTA 0.2999 ACGTC 0.1331 ACGTG 0.232 ACGTT 0.335 ACTAA 0.3052 ACTAC 0.1752 ACTAG 0.116 ACTAT 0.4036 ACTCA 0.1816 ACTCC 0.1246 ACTCG 0.4082 ACTCT 0.2856 ACTGA 0.2961 ACTGC 0.1764 ACTGG 0.1695 ACTGT 0.358 ACTTA 0.2282 ACTTC 0.1658 ACTTG 0.1711 ACTTT 0.435 AGAAA 0.4877 AGAAC 0.08753 AGAAG 0.1661 AGAAT 0.2587 AGACA 0.3661 AGACC 0.1056 AGACG 0.3056 AGACT 0.2227 AGAGA 0.6001 AGAGC 0.08817 AGAGG 0.1741 AGAGT 0.1376 AGATA 0.3515 AGATC 0.1518 AGATG 0.1532 AGATT 0.3435 AGCAA 0.404 AGCAC 0.1608 AGCAG 0.1577 AGCAT 0.2774 AGCCA 0.3424 AGCCC 0.1301 AGCCG 0.2797 AGCCT 0.2478 AGCGA 0.3876 AGCGC 0.171 AGCGG 0.1742 AGCGT 0.2673 AGCTA 0.2362 AGCTC 0.1982 AGCTG 0.1948 AGCTT 0.3707 AGGAA 0.4545 AGGAC 0.08061 AGGAG 0.2151 AGGAT 0.2498 AGGCA 0.3212 AGGCC 0.1538 AGGCG 0.3033 AGGCT 0.2217 AGGGA 0.457 AGGGC 0.1031 AGGGG 0.2758 AGGGT 0.1642 AGGTA 0.3071 AGGTC 0.135 AGGTG 0.2235 AGGTT 0.3344 AGTAA 0.3748 AGTAC 0.1278 AGTAG 0.1485 AGTAT 0.3489 AGTCA 0.3019 AGTCC 0.1168 AGTCG 0.3223 AGTCT 0.259 AGTGA 0.3588 AGTGC 0.1491 AGTGG 0.1952 AGTGT 0.2969 AGTTA 0.2595 AGTTC 0.1468 AGTTG 0.1706 AGTTT 0.4231 ATAAA 0.418 ATAAC 0.1002 ATAAG 0.08706 ATAAT 0.3947 ATACA 0.4295 ATACC 0.1046 ATACG 0.2433 ATACT 0.2226 ATAGA 0.4589 ATAGC 0.1358 ATAGG 0.1329 ATAGT 0.2724 ATATA 0.4532 ATATC 0.1163 ATATG 0.0919 ATATT 0.3386 ATCAA 0.3719 ATCAC 0.1609 ATCAG 0.1089 ATCAT 0.3582 ATCCA 0.3178 ATCCC 0.1658 ATCCG 0.2097 ATCCT 0.3067 ATCGA 0.446 ATCGC 0.1417 ATCGG 0.1127 ATCGT 0.2996 ATCTA 0.252 ATCTC 0.2258 ATCTG 0.1243 ATCTT 0.398 ATGAA 0.4342 ATGAC 0.1062 ATGAG 0.1028 ATGAT 0.3567 ATGCA 0.4155 ATGCC 0.1109 ATGCG 0.2456 ATGCT 0.228 ATGGA 0.4626 ATGGC 0.1793 ATGGG 0.1266 ATGGT 0.2314 ATGTA 0.4034 ATGTC 0.1159 ATGTG 0.1518 ATGTT 0.3289 ATTAA 0.3615 ATTAC 0.1232 ATTAG 0.07725 ATTAT 0.438 ATTCA 0.2863 ATTCC 0.1505 ATTCG 0.2552 ATTCT 0.308 ATTGA 0.3459 ATTGC 0.1699 ATTGG 0.1343 ATTGT 0.3498 ATTTA 0.281 ATTTC 0.1753 ATTTG 0.1134 ATTTT 0.4303 CAAAA 0.3769 CAAAC 0.1427 CAAAG 0.1521 CAAAT 0.3283 CAACA 0.3232 CAACC 0.145 CAACG 0.2969 CAACT 0.2349 CAAGA 0.3784 CAAGC 0.1616 CAAGG 0.1649 CAAGT 0.2952 CAATA 0.2957 CAATC 0.1642 CAATG 0.1486 CAATT 0.3914 CACAA 0.3137 CACAC 0.2729 CACAG 0.1415 CACAT 0.272 CACCA 0.2839 CACCC 0.177 CACCG 0.3022 CACCT 0.2369 CACGA 0.3464 CACGC 0.2132 CACGG 0.1492 CACGT 0.2912 CACTA 0.1857 CACTC 0.2343 CACTG 0.1829 CACTT 0.3971 CAGAA 0.3769 CAGAC 0.1274 CAGAG 0.2083 CAGAT 0.2874 CAGCA 0.2817 CAGCC 0.2062 CAGCG 0.2575 CAGCT 0.2546 CAGGA 0.3661 CAGGC 0.1776 CAGGG 0.1923 CAGGT 0.2641 CAGTA 0.2405 CAGTC 0.1765 CAGTG 0.2174 CAGTT 0.3656 CATAA 0.3321 CATAC 0.1594 CATAG 0.104 CATAT 0.4045 CATCA 0.2498 CATCC 0.1727 CATCG 0.3246 CATCT 0.2528 CATGA 0.3136 CATGC 0.2047 CATGG 0.1591 CATGT 0.3226 CATTA 0.2504 CATTC 0.1897 CATTG 0.1526 CATTT 0.4073 CCAAA 0.3083 CCAAC 0.1971 CCAAG 0.1648 CCAAT 0.3298 CCACA 0.1809 CCACC 0.2418 CCACG 0.3409 CCACT 0.2364 CCAGA 0.3169 CCAGC 0.2166 CCAGG 0.1833 CCAGT 0.2832 CCATA 0.207 CCATC 0.2662 CCATG 0.135 CCATT 0.3918 CCCAA 0.2864 CCCAC 0.2654 CCCAG 0.1385 CCCAT 0.3098 CCCCA 0.1447 CCCCC 0.3294 CCCCG 0.1981 CCCCT 0.3278 CCCGA 0.2934 CCCGC 0.2276 CCCGG 0.1653 CCCGT 0.3137 CCCTA 0.1187 CCCTC 0.394 CCCTG 0.127 CCCTT 0.3603 CCGAA 0.2542 CCGAC 0.1693 CCGAG 0.2097 CCGAT 0.3669 CCGCA 0.1876 CCGCC 0.2169 CCGCG 0.358 CCGCT 0.2376 CCGGA 0.2661 CCGGC 0.2394 CCGGG 0.1818 CCGGT 0.3128 CCGTA 0.1881 CCGTC 0.1961 CCGTG 0.2539 CCGTT 0.3618 CCTAA 0.2996 CCTAC 0.1904 CCTAG 0.1237 CCTAT 0.3864 CCTCA 0.09918 CCTCC 0.2872 CCTCG 0.3019 CCTCT 0.3117 CCTGA 0.2533 CCTGC 0.2132 CCTGG 0.1771 CCTGT 0.3564 CCTTA 0.1493 CCTTC 0.2802 CCTTG 0.1434 CCTTT 0.4271 CGAAA 0.3828 CGAAC 0.1504 CGAAG 0.1593 CGAAT 0.3075 CGACA 0.2796 CGACC 0.1563 CGACG 0.3561 CGACT 0.2079 CGAGA 0.3735 CGAGC 0.1826 CGAGG 0.2049 CGAGT 0.239 CGATA 0.2822 CGATC 0.24 CGATG 0.1619 CGATT 0.3159 CGCAA 0.3425 CGCAC 0.2172 CGCAG 0.1423 CGCAT 0.2979 CGCCA 0.3127 CGCCC 0.1648 CGCCG 0.2861 CGCCT 0.2364 CGCGA 0.335 CGCGC 0.2214 CGCGG 0.1424 CGCGT 0.3012 CGCTA 0.193 CGCTC 0.2923 CGCTG 0.1615 CGCTT 0.3532 CGGAA 0.3599 CGGAC 0.1371 CGGAG 0.1927 CGGAT 0.3102 CGGCA 0.2419 CGGCC 0.2455 CGGCG 0.3049 CGGCT 0.2077 CGGGA 0.3596 CGGGC 0.1922 CGGGG 0.25 CGGGT 0.1983 CGGTA 0.2454 CGGTC 0.1777 CGGTG 0.2432 CGGTT 0.3337 CGTAA 0.3321 CGTAC 0.1803 CGTAG 0.1244 CGTAT 0.3632 CGTCA 0.2288 CGTCC 0.1868 CGTCG 0.3554 CGTCT 0.229 CGTGA 0.2841 CGTGC 0.1951 CGTGG 0.1849 CGTGT 0.3359 CGTTA 0.2203 CGTTC 0.2324 CGTTG 0.1666 CGTTT 0.3806 CTAAA 0.3737 CTAAC 0.1562 CTAAG 0.101 CTAAT 0.3691 CTACA 0.2802 CTACC 0.1613 CTACG 0.2614 CTACT 0.2972 CTAGA 0.3922 CTAGC 0.1746 CTAGG 0.1525 CTAGT 0.2807 CTATA 0.2949 CTATC 0.1997 CTATG 0.1207 CTATT 0.3847 CTCAA 0.3469 CTCAC 0.2165 CTCAG 0.1125 CTCAT 0.3242 CTCCA 0.2254 CTCCC 0.2545 CTCCG 0.1718 CTCCT 0.3483 CTCGA 0.3859 CTCGC 0.195 CTCGG 0.1095 CTCGT 0.3096 CTCTA 0.1285 CTCTC 0.4489 CTCTG 0.1039 CTCTT 0.3187 CTGAA 0.3874 CTGAC 0.1611 CTGAG 0.1118 CTGAT 0.3397 CTGCA 0.2962 CTGCC 0.1991 CTGCG 0.2398 CTGCT 0.2649 CTGGA 0.3689 CTGGC 0.2314 CTGGG 0.1248 CTGGT 0.2749 CTGTA 0.2755 CTGTC 0.1911 CTGTG 0.1777 CTGTT 0.3557 CTTAA 0.3454 CTTAC 0.1719 CTTAG 0.08669 CTTAT 0.396 CTTCA 0.1843 CTTCC 0.2161 CTTCG 0.2403 CTTCT 0.3593 CTTGA 0.3101 CTTGC 0.1978 CTTGG 0.1599 CTTGT 0.3322 CTTTA 0.1843 CTTTC 0.2532 CTTTG 0.1277 CTTTT 0.4348 GAAAA 0.4125 GAAAC 0.1423 GAAAG 0.1659 GAAAT 0.2793 GAACA 0.326 GAACC 0.119 GAACG 0.373 GAACT 0.182 GAAGA 0.4831 GAAGC 0.1407 GAAGG 0.1993 GAAGT 0.1769 GAATA 0.3243 GAATC 0.1791 GAATG 0.1497 GAATT 0.3469 GACAA 0.3813 GACAC 0.211 GACAG 0.1724 GACAT 0.2353 GACCA 0.306 GACCC 0.1515 GACCG 0.3292 GACCT 0.2133 GACGA 0.4426 GACGC 0.1837 GACGG 0.1525 GACGT 0.2212 GACTA 0.2269 GACTC 0.2338 GACTG 0.2006 GACTT 0.3386 GAGAA 0.3599 GAGAC 0.09281 GAGAG 0.3465 GAGAT 0.2008 GAGCA 0.3189 GAGCC 0.1506 GAGCG 0.341 GAGCT 0.1895 GAGGA 0.4466 GAGGC 0.1457 GAGGG 0.2577 GAGGT 0.1501 GAGTA 0.2765 GAGTC 0.1663 GAGTG 0.225 GAGTT 0.3322 GATAA 0.3782 GATAC 0.1497 GATAG 0.1187 GATAT 0.3533 GATCA 0.2501 GATCC 0.1534 GATCG 0.3923 GATCT 0.2043 GATGA 0.3848 GATGC 0.1764 GATGG 0.1961 GATGT 0.2427 GATTA 0.277 GATTC 0.2037 GATTG 0.1513 GATTT 0.3679 GCAAA 0.3585 GCAAC 0.1829 GCAAG 0.1506 GCAAT 0.3081 GCACA 0.3116 GCACC 0.1427 GCACG 0.3633 GCACT 0.1825 GCAGA 0.334 GCAGC 0.235 GCAGG 0.1845 GCAGT 0.2465 GCATA 0.2876 GCATC 0.216 GCATG 0.1568 GCATT 0.3395 GCCAA 0.3142 GCCAC 0.2457 GCCAG 0.1625 GCCAT 0.2776 GCCCA 0.2139 GCCCC 0.2484 GCCCG 0.298 GCCCT 0.2398 GCCGA 0.3082 GCCGC 0.2615 GCCGG 0.1825 GCCGT 0.2479 GCCTA 0.1796 GCCTC 0.3377 GCCTG 0.1777 GCCTT 0.3049 GCGAA 0.3261 GCGAC 0.1511 GCGAG 0.2338 GCGAT 0.2889 GCGCA 0.2578 GCGCC 0.1607 GCGCG 0.4098 GCGCT 0.1717 GCGGA 0.3152 GCGGC 0.2501 GCGGG 0.1826 GCGGT 0.2521 GCGTA 0.2386 GCGTC 0.1762 GCGTG 0.2708 GCGTT 0.3144 GCTAA 0.3038 GCTAC 0.2144 GCTAG 0.1272 GCTAT 0.3546 GCTCA 0.1663 GCTCC 0.1619 GCTCG 0.4233 GCTCT 0.2484 GCTGA 0.26 GCTGC 0.2524 GCTGG 0.1945 GCTGT 0.293 GCTTA 0.2026 GCTTC 0.2533 GCTTG 0.1798 GCTTT 0.3642 GGAAA 0.4314 GGAAC 0.1323 GGAAG 0.1926 GGAAT 0.2437 GGACA 0.3285 GGACC 0.1304 GGACG 0.3857 GGACT 0.1554 GGAGA 0.4213 GGAGC 0.1197 GGAGG 0.334 GGAGT 0.125 GGATA 0.3136 GGATC 0.2072 GGATG 0.1902 GGATT 0.2889 GGCAA 0.3781 GGCAC 0.2144 GGCAG 0.1906 GGCAT 0.2169 GGCCA 0.3161 GGCCC 0.1527 GGCCG 0.3495 GGCCT 0.1818 GGCGA 0.3556 GGCGC 0.2142 GGCGG 0.2127 GGCGT 0.2175 GGCTA 0.225 GGCTC 0.2478 GGCTG 0.2483 GGCTT 0.2789 GGGAA 0.3956 GGGAC 0.1145 GGGAG 0.2634 GGGAT 0.2264 GGGCA 0.2979 GGGCC 0.1984 GGGCG 0.325 GGGCT 0.1788 GGGGA 0.4024 GGGGC 0.127 GGGGG 0.3295 GGGGT 0.1412 GGGTA 0.2434 GGGTC 0.1682 GGGTG 0.293 GGGTT 0.2955 GGTAA 0.3677 GGTAC 0.1531 GGTAG 0.158 GGTAT 0.3213 GGTCA 0.2762 GGTCC 0.1533 GGTCG 0.3786 GGTCT 0.1919 GGTGA 0.3015 GGTGC 0.1651 GGTGG 0.2826 GGTGT 0.2507 GGTTA 0.293 GGTTC 0.1879 GGTTG 0.2063 GGTTT 0.3128 GTAAA 0.386 GTAAC 0.1526 GTAAG 0.1171 GTAAT 0.3442 GTACA 0.4173 GTACC 0.1151 GTACG 0.2792 GTACT 0.1884 GTAGA 0.3976 GTAGC 0.1861 GTAGG 0.1484 GTAGT 0.2679 GTATA 0.3628 GTATC 0.182 GTATG 0.1337 GTATT 0.3216 GTCAA 0.3392 GTCAC 0.2301 GTCAG 0.1405 GTCAT 0.2901 GTCCA 0.3222 GTCCC 0.2064 GTCCG 0.228 GTCCT 0.2434 GTCGA 0.391 GTCGC 0.1953 GTCGG 0.1371 GTCGT 0.2766 GTCTA 0.2108 GTCTC 0.3016 GTCTG 0.1593 GTCTT 0.3284 GTGAA 0.4065 GTGAC 0.1597 GTGAG 0.1302 GTGAT 0.3037 GTGCA 0.3656 GTGCC 0.1653 GTGCG 0.2699 GTGCT 0.1992 GTGGA 0.4009 GTGGC 0.2139 GTGGG 0.1461 GTGGT 0.2391 GTGTA 0.3177 GTGTC 0.1627 GTGTG 0.2383 GTGTT 0.2813 GTTAA 0.3555 GTTAC 0.1774 GTTAG 0.1062 GTTAT 0.3609 GTTCA 0.2621 GTTCC 0.194 GTTCG 0.2965 GTTCT 0.2474 GTTGA 0.3218 GTTGC 0.2155 GTTGG 0.1715 GTTGT 0.2912 GTTTA 0.2408 GTTTC 0.2628 GTTTG 0.145 GTTTT 0.3514 TAAAA 0.4363 TAAAC 0.1051 TAAAG 0.09742 TAAAT 0.3611 TAACA 0.3626 TAACC 0.1374 TAACG 0.2617 TAACT 0.2382 TAAGA 0.436 TAAGC 0.1374 TAAGG 0.1295 TAAGT 0.2971 TAATA 0.3654 TAATC 0.1318 TAATG 0.107 TAATT 0.3958 TACAA 0.3493 TACAC 0.1812 TACAG 0.1093 TACAT 0.3601 TACCA 0.3203 TACCC 0.1286 TACCG 0.2666 TACCT 0.2845 TACGA 0.3828 TACGC 0.1718 TACGG 0.1011 TACGT 0.3443 TACTA 0.2538 TACTC 0.1818 TACTG 0.1278 TACTT 0.4366 TAGAA 0.443 TAGAC 0.09307 TAGAG 0.1423 TAGAT 0.3216 TAGCA 0.3436 TAGCC 0.1527 TAGCG 0.2515 TAGCT 0.2522 TAGGA 0.4179 TAGGC 0.1518 TAGGG 0.152 TAGGT 0.2783 TAGTA 0.3321 TAGTC 0.1388 TAGTG 0.1535 TAGTT 0.3755 TATAA 0.2942 TATAC 0.1139 TATAG 0.06689 TATAT 0.5251 TATCA 0.2843 TATCC 0.1425 TATCG 0.283 TATCT 0.2903 TATGA 0.3289 TATGC 0.1701 TATGG 0.1105 TATGT 0.3906 TATTA 0.311 TATTC 0.1494 TATTG 0.1103 TATTT 0.4293 TCAAA 0.3683 TCAAC 0.1518 TCAAG 0.1312 TCAAT 0.3487 TCACA 0.2791 TCACC 0.1528 TCACG 0.3105 TCACT 0.2576 TCAGA 0.3739 TCAGC 0.1732 TCAGG 0.1568 TCAGT 0.2961 TCATA 0.2595 TCATC 0.22 TCATG 0.1121 TCATT 0.4085 TCCAA 0.3387 TCCAC 0.2121 TCCAG 0.1194 TCCAT 0.3298 TCCCA 0.1859 TCCCC 0.2661 TCCCG 0.1885 TCCCT 0.3594 TCCGA 0.2899 TCCGC 0.2233 TCCGG 0.1374 TCCGT 0.3494 TCCTA 0.1532 TCCTC 0.3205 TCCTG 0.1135 TCCTT 0.4129 TCGAA 0.3384 TCGAC 0.1195 TCGAG 0.1828 TCGAT 0.3593 TCGCA 0.2334 TCGCC 0.1603 TCGCG 0.3725 TCGCT 0.2338 TCGGA 0.289 TCGGC 0.2081 TCGGG 0.1662 TCGGT 0.3367 TCGTA 0.232 TCGTC 0.1853 TCGTG 0.192 TCGTT 0.3907 TCTAA 0.3164 TCTAC 0.1612 TCTAG 0.1006 TCTAT 0.4218 TCTCA 0.1432 TCTCC 0.1562 TCTCG 0.2372 TCTCT 0.4634 TCTGA 0.2922 TCTGC 0.1868 TCTGG 0.1482 TCTGT 0.3729 TCTTA 0.1783 TCTTC 0.2412 TCTTG 0.1168 TCTTT 0.4636 TGAAA 0.4631 TGAAC 0.1189 TGAAG 0.1093 TGAAT 0.3086 TGACA 0.3607 TGACC 0.1355 TGACG 0.2724 TGACT 0.2314 TGAGA 0.4788 TGAGC 0.1524 TGAGG 0.1429 TGAGT 0.2258 TGATA 0.3263 TGATC 0.1762 TGATG 0.1434 TGATT 0.3541 TGCAA 0.3776 TGCAC 0.188 TGCAG 0.1124 TGCAT 0.322 TGCCA 0.3329 TGCCC 0.1604 TGCCG 0.241 TGCCT 0.2657 TGCGA 0.3409 TGCGC 0.2263 TGCGG 0.1211 TGCGT 0.3117 TGCTA 0.2333 TGCTC 0.2418 TGCTG 0.1563 TGCTT 0.3686 TGGAA 0.4551 TGGAC 0.1152 TGGAG 0.1503 TGGAT 0.2794 TGGCA 0.2922 TGGCC 0.1941 TGGCG 0.2914 TGGCT 0.2223 TGGGA 0.4104 TGGGC 0.1596 TGGGG 0.2114 TGGGT 0.2186 TGGTA 0.2918 TGGTC 0.1634 TGGTG 0.2261 TGGTT 0.3186 TGTAA 0.346 TGTAC 0.1689 TGTAG 0.08352 TGTAT 0.4016 TGTCA 0.2984 TGTCC 0.1567 TGTCG 0.2748 TGTCT 0.2701 TGTGA 0.2939 TGTGC 0.1925 TGTGG 0.1129 TGTGT 0.4007 TGTTA 0.2687 TGTTC 0.1788 TGTTG 0.1597 TGTTT 0.3928 TTAAA 0.4123 TTAAC 0.1159 TTAAG 0.08917 TTAAT 0.3827 TTACA 0.389 TTACC 0.1258 TTACG 0.2339 TTACT 0.2513 TTAGA 0.4472 TTAGC 0.1512 TTAGG 0.1339 TTAGT 0.2677 TTATA 0.3179 TTATC 0.1559 TTATG 0.09449 TTATT 0.4317 TTCAA 0.3845 TTCAC 0.1709 TTCAG 0.09857 TTCAT 0.3461 TTCCA 0.3218 TTCCC 0.1801 TTCCG 0.1512 TTCCT 0.3468 TTCGA 0.4289 TTCGC 0.1633 TTCGG 0.07972 TTCGT 0.3281 TTCTA 0.2035 TTCTC 0.2373 TTCTG 0.09562 TTCTT 0.4636 TTGAA 0.4438 TTGAC 0.1142 TTGAG 0.1012 TTGAT 0.3408 TTGCA 0.3762 TTGCC 0.1493 TTGCG 0.2181 TTGCT 0.2564 TTGGA 0.4482 TTGGC 0.1915 TTGGG 0.1105 TTGGT 0.2499 TTGTA 0.3146 TTGTC 0.1511 TTGTG 0.1408 TTGTT 0.3935 TTTAA 0.3641 TTTAC 0.1292 TTTAG 0.07312 TTTAT 0.4336 TTTCA 0.2695 TTTCC 0.1671 TTTCG 0.1993 TTTCT 0.3641 TTTGA 0.3375 TTTGC 0.1827 TTTGG 0.116 TTTGT 0.3638 TTTTA 0.2292 TTTTC 0.1747 TTTTG 0.08784 TTTTT 0.5083 [5] # (a,c,g,t)= (0.3, 0.2, 0.2, 0.3) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.327 C 0.173 G 0.173 T 0.327 # l= 1 # Values AA 0.127 AC 0.0462 AG 0.0451 AT 0.109 CA 0.0457 CC 0.0294 CG 0.0524 CT 0.0451 GA 0.0664 GC 0.0306 GG 0.0294 GT 0.0462 TA 0.088 TC 0.0664 TG 0.0457 TT 0.127 # l= 2 # Values AAA 0.0543 AAC 0.0161 AAG 0.0172 AAT 0.0398 ACA 0.0148 ACC 0.00645 ACG 0.015 ACT 0.00994 AGA 0.02 AGC 0.00664 AGG 0.00847 AGT 0.00994 ATA 0.0363 ATC 0.0193 ATG 0.0136 ATT 0.0398 CAA 0.0164 CAC 0.00959 CAG 0.00611 CAT 0.0136 CCA 0.00779 CCC 0.00599 CCG 0.00717 CCT 0.00847 CGA 0.0201 CGC 0.0101 CGG 0.00717 CGT 0.015 CTA 0.0084 CTC 0.0134 CTG 0.0061 CTT 0.0172 GAA 0.0261 GAC 0.00766 GAG 0.0134 GAT 0.0193 GCA 0.00867 GCC 0.00518 GCG 0.0101 GCT 0.00664 GGA 0.0118 GGC 0.00518 GGG 0.006 GGT 0.00645 GTA 0.0129 GTC 0.00766 GTG 0.00959 GTT 0.0161 TAA 0.0305 TAC 0.0129 TAG 0.0084 TAT 0.0363 TCA 0.0145 TCC 0.0118 TCG 0.0201 TCT 0.02 TGA 0.0145 TGC 0.00867 TGG 0.00779 TGT 0.0148 TTA 0.0305 TTC 0.0261 TTG 0.0164 TTT 0.0542 # l= 3 # Values AAAA 0.0247 AAAC 0.00611 AAAG 0.00746 AAAT 0.016 AACA 0.00509 AACC 0.00206 AACG 0.00534 AACT 0.00356 AAGA 0.00787 AAGC 0.00227 AAGG 0.0031 AAGT 0.00394 AATA 0.0133 AATC 0.00623 AATG 0.00513 AATT 0.0151 ACAA 0.00543 ACAC 0.00313 ACAG 0.00208 ACAT 0.00414 ACCA 0.00181 ACCC 0.001 ACCG 0.00206 ACCT 0.00157 ACGA 0.00602 ACGC 0.00277 ACGG 0.00213 ACGT 0.00407 ACTA 0.00215 ACTC 0.00223 ACTG 0.00161 ACTT 0.00394 AGAA 0.00852 AGAC 0.00179 AGAG 0.00492 AGAT 0.0048 AGCA 0.00199 AGCC 0.00106 AGCG 0.00208 AGCT 0.00151 AGGA 0.00378 AGGC 0.0012 AGGG 0.00193 AGGT 0.00157 AGTA 0.00289 AGTC 0.00151 AGTG 0.00198 AGTT 0.00356 ATAA 0.0126 ATAC 0.00463 ATAG 0.00327 ATAT 0.0158 ATCA 0.00477 ATCC 0.00304 ATCG 0.00667 ATCT 0.0048 ATGA 0.00473 ATGC 0.00241 ATGG 0.00229 ATGT 0.00414 ATTA 0.0115 ATTC 0.00702 ATTG 0.00533 ATTT 0.016 CAAA 0.0058 CAAC 0.00285 CAAG 0.00245 CAAT 0.00533 CACA 0.00255 CACC 0.00163 CACG 0.00343 CACT 0.00198 CAGA 0.00214 CAGC 0.00121 CAGG 0.00115 CAGT 0.00162 CATA 0.0036 CATC 0.00313 CATG 0.00172 CATT 0.00513 CCAA 0.00248 CCAC 0.00191 CCAG 0.00111 CCAT 0.00229 CCCA 0.00103 CCCC 0.0017 CCCG 0.00134 CCCT 0.00193 CCGA 0.00221 CCGC 0.00164 CCGG 0.00119 CCGT 0.00213 CCTA 0.00125 CCTC 0.00298 CCTG 0.00115 CCTT 0.0031 CGAA 0.00652 CGAC 0.00267 CGAG 0.00427 CGAT 0.00667 CGCA 0.00223 CGCC 0.00165 CGCG 0.0041 CGCT 0.00207 CGGA 0.0022 CGGC 0.00157 CGGG 0.00134 CGGT 0.00206 CGTA 0.00353 CGTC 0.00269 CGTG 0.00343 CGTT 0.00534 CTAA 0.00254 CTAC 0.00161 CTAG 0.000982 CTAT 0.00327 CTCA 0.00165 CTCC 0.00256 CTCG 0.00427 CTCT 0.00492 CTGA 0.00162 CTGC 0.00129 CTGG 0.00111 CTGT 0.00208 CTTA 0.00296 CTTC 0.00431 CTTG 0.00245 CTTT 0.00746 GAAA 0.0115 GAAC 0.00322 GAAG 0.00432 GAAT 0.00702 GACA 0.00237 GACC 0.00108 GACG 0.00269 GACT 0.00151 GAGA 0.00639 GAGC 0.0018 GAGG 0.00298 GAGT 0.00223 GATA 0.00583 GATC 0.00408 GATG 0.00313 GATT 0.00623 GCAA 0.00322 GCAC 0.00175 GCAG 0.00129 GCAT 0.00241 GCCA 0.00158 GCCC 0.000833 GCCG 0.00157 GCCT 0.0012 GCGA 0.0035 GCGC 0.00214 GCGG 0.00164 GCGT 0.00277 GCTA 0.00137 GCTC 0.0018 GCTG 0.00121 GCTT 0.00227 GGAA 0.00491 GGAC 0.00129 GGAG 0.00256 GGAT 0.00304 GGCA 0.00138 GGCC 0.00109 GGCG 0.00165 GGCT 0.00106 GGGA 0.00246 GGGC 0.000833 GGGG 0.0017 GGGT 0.001 GGTA 0.00167 GGTC 0.00108 GGTG 0.00163 GGTT 0.00206 GTAA 0.00448 GTAC 0.00214 GTAG 0.00161 GTAT 0.00463 GTCA 0.00191 GTCC 0.00129 GTCG 0.00267 GTCT 0.00179 GTGA 0.0028 GTGC 0.00175 GTGG 0.00191 GTGT 0.00313 GTTA 0.00387 GTTC 0.00322 GTTG 0.00285 GTTT 0.00611 TAAA 0.0122 TAAC 0.00387 TAAG 0.00296 TAAT 0.0115 TACA 0.00477 TACC 0.00167 TACG 0.00353 TACT 0.00289 TAGA 0.00363 TAGC 0.00137 TAGG 0.00125 TAGT 0.00215 TATA 0.0135 TATC 0.00583 TATG 0.0036 TATT 0.0133 TCAA 0.0053 TCAC 0.0028 TCAG 0.00162 TCAT 0.00473 TCCA 0.00336 TCCC 0.00246 TCCG 0.0022 TCCT 0.00378 TCGA 0.0084 TCGC 0.0035 TCGG 0.00221 TCGT 0.00603 TCTA 0.00363 TCTC 0.00639 TCTG 0.00214 TCTT 0.00787 TGAA 0.00614 TGAC 0.00191 TGAG 0.00164 TGAT 0.00477 TGCA 0.00306 TGCC 0.00138 TGCG 0.00223 TGCT 0.00199 TGGA 0.00336 TGGC 0.00158 TGGG 0.00103 TGGT 0.00181 TGTA 0.00477 TGTC 0.00237 TGTG 0.00255 TGTT 0.00509 TTAA 0.0109 TTAC 0.00448 TTAG 0.00254 TTAT 0.0126 TTCA 0.00614 TTCC 0.0049 TTCG 0.00653 TTCT 0.00852 TTGA 0.0053 TTGC 0.00322 TTGG 0.00248 TTGT 0.00543 TTTA 0.0122 TTTC 0.0115 TTTG 0.0058 TTTT 0.0247 # l= 4 # Values AAAAA 0.0126 AAAAC 0.00207 AAAAG 0.0032 AAAAT 0.00678 AAACA 0.00198 AAACC 0.000637 AAACG 0.00201 AAACT 0.00149 AAAGA 0.00362 AAAGC 0.000807 AAAGG 0.0013 AAAGT 0.00172 AAATA 0.00565 AAATC 0.00223 AAATG 0.00205 AAATT 0.00606 AACAA 0.00215 AACAC 0.000857 AACAG 0.000742 AACAT 0.00135 AACCA 0.000567 AACCC 0.000292 AACCG 0.000689 AACCT 0.000514 AACGA 0.00236 AACGC 0.000857 AACGG 0.000769 AACGT 0.00136 AACTA 0.000808 AACTC 0.000734 AACTG 0.000598 AACTT 0.00142 AAGAA 0.00396 AAGAC 0.000563 AAGAG 0.0015 AAGAT 0.00186 AAGCA 0.000713 AAGCC 0.000286 AAGCG 0.000723 AAGCT 0.00055 AAGGA 0.00153 AAGGC 0.000349 AAGGG 0.000684 AAGGT 0.000537 AAGTA 0.00125 AAGTC 0.000499 AAGTG 0.000777 AAGTT 0.00142 AATAA 0.00546 AATAC 0.00146 AATAG 0.00124 AATAT 0.00519 AATCA 0.00166 AATCC 0.000853 AATCG 0.00208 AATCT 0.00163 AATGA 0.0019 AATGC 0.0008 AATGG 0.000889 AATGT 0.00154 AATTA 0.00453 AATTC 0.0024 AATTG 0.0021 AATTT 0.00606 ACAAA 0.00203 ACAAC 0.000801 ACAAG 0.000788 ACAAT 0.00181 ACACA 0.00102 ACACC 0.000398 ACACG 0.00113 ACACT 0.000574 ACAGA 0.000779 ACAGC 0.000338 ACAGG 0.000398 ACAGT 0.000567 ACATA 0.00137 ACATC 0.000711 ACATG 0.000525 ACATT 0.00154 ACCAA 0.000582 ACCAC 0.000437 ACCAG 0.000291 ACCAT 0.000503 ACCCA 0.000219 ACCCC 0.000229 ACCCG 0.000256 ACCCT 0.000299 ACCGA 0.00072 ACCGC 0.000401 ACCGG 0.000362 ACCGT 0.000577 ACCTA 0.000331 ACCTC 0.000409 ACCTG 0.000293 ACCTT 0.000537 ACGAA 0.00207 ACGAC 0.000723 ACGAG 0.00129 ACGAT 0.00194 ACGCA 0.000676 ACGCC 0.000344 ACGCG 0.00121 ACGCT 0.000538 ACGGA 0.000756 ACGGC 0.000378 ACGGG 0.000415 ACGGT 0.000577 ACGTA 0.00119 ACGTC 0.000571 ACGTG 0.000955 ACGTT 0.00136 ACTAA 0.000642 ACTAC 0.000412 ACTAG 0.000262 ACTAT 0.000837 ACTCA 0.000349 ACTCC 0.000291 ACTCG 0.000981 ACTCT 0.00061 ACTGA 0.000451 ACTGC 0.000296 ACTGG 0.000301 ACTGT 0.000567 ACTTA 0.000836 ACTTC 0.000685 ACTTG 0.000695 ACTTT 0.00172 AGAAA 0.00413 AGAAC 0.000765 AGAAG 0.00155 AGAAT 0.00208 AGACA 0.000622 AGACC 0.0002 AGACG 0.000599 AGACT 0.000372 AGAGA 0.00299 AGAGC 0.000426 AGAGG 0.0009 AGAGT 0.00061 AGATA 0.00162 AGATC 0.000796 AGATG 0.000745 AGATT 0.00163 AGCAA 0.000799 AGCAC 0.000334 AGCAG 0.000336 AGCAT 0.000525 AGCCA 0.000341 AGCCC 0.000144 AGCCG 0.000323 AGCCT 0.000252 AGCGA 0.000804 AGCGC 0.000353 AGCGG 0.000379 AGCGT 0.000538 AGCTA 0.000339 AGCTC 0.000327 AGCTG 0.000299 AGCTT 0.00055 AGGAA 0.00168 AGGAC 0.0003 AGGAG 0.000895 AGGAT 0.000902 AGGCA 0.000363 AGGCC 0.00019 AGGCG 0.000391 AGGCT 0.000252 AGGGA 0.000879 AGGGC 0.000194 AGGGG 0.000555 AGGGT 0.000299 AGGTA 0.00046 AGGTC 0.000224 AGGTG 0.000374 AGGTT 0.000514 AGTAA 0.00107 AGTAC 0.000377 AGTAG 0.00047 AGTAT 0.000978 AGTCA 0.00042 AGTCC 0.000184 AGTCG 0.000533 AGTCT 0.000372 AGTGA 0.000685 AGTGC 0.000293 AGTGG 0.000429 AGTGT 0.000574 AGTTA 0.000878 AGTTC 0.000543 AGTTG 0.000642 AGTTT 0.00149 ATAAA 0.00522 ATAAC 0.00135 ATAAG 0.00114 ATAAT 0.00492 ATACA 0.00188 ATACC 0.000526 ATACG 0.00125 ATACT 0.000978 ATAGA 0.0015 ATAGC 0.000466 ATAGG 0.000468 ATAGT 0.000837 ATATA 0.00716 ATATC 0.00199 ATATG 0.00142 ATATT 0.00519 ATCAA 0.00176 ATCAC 0.000818 ATCAG 0.000537 ATCAT 0.00165 ATCCA 0.000918 ATCCC 0.000539 ATCCG 0.000678 ATCCT 0.000902 ATCGA 0.00295 ATCGC 0.00098 ATCGG 0.000801 ATCGT 0.00194 ATCTA 0.00114 ATCTC 0.0012 ATCTG 0.000599 ATCTT 0.00186 ATGAA 0.00203 ATGAC 0.000524 ATGAG 0.000519 ATGAT 0.00165 ATGCA 0.000954 ATGCC 0.000289 ATGCG 0.000645 ATGCT 0.000525 ATGGA 0.00107 ATGGC 0.000404 ATGGG 0.000308 ATGGT 0.000503 ATGTA 0.00164 ATGTC 0.00051 ATGTG 0.000647 ATGTT 0.00135 ATTAA 0.0041 ATTAC 0.00151 ATTAG 0.000931 ATTAT 0.00492 ATTCA 0.00184 ATTCC 0.00114 ATTCG 0.00195 ATTCT 0.00208 ATTGA 0.00179 ATTGC 0.000939 ATTGG 0.000788 ATTGT 0.00181 ATTTA 0.00431 ATTTC 0.00306 ATTTG 0.00183 ATTTT 0.00678 CAAAA 0.00212 CAAAC 0.0009 CAAAG 0.00095 CAAAT 0.00183 CAACA 0.000854 CAACC 0.00045 CAACG 0.000907 CAACT 0.000642 CAAGA 0.000904 CAAGC 0.000414 CAAGG 0.000436 CAAGT 0.000695 CAATA 0.00148 CAATC 0.000946 CAATG 0.000798 CAATT 0.0021 CACAA 0.00077 CACAC 0.000759 CACAG 0.000374 CACAT 0.000647 CACCA 0.00043 CACCC 0.000305 CACCG 0.000521 CACCT 0.000374 CACGA 0.00116 CACGC 0.00077 CACGG 0.000548 CACGT 0.000955 CACTA 0.00033 CACTC 0.000516 CACTG 0.000358 CACTT 0.000777 CAGAA 0.000775 CAGAC 0.000285 CAGAG 0.000478 CAGAT 0.000599 CAGCA 0.000314 CAGCC 0.000267 CAGCG 0.000326 CAGCT 0.000299 CAGGA 0.00041 CAGGC 0.00021 CAGGG 0.000235 CAGGT 0.000293 CAGTA 0.000359 CAGTC 0.0003 CAGTG 0.000358 CAGTT 0.000598 CATAA 0.00118 CATAC 0.000614 CATAG 0.00039 CATAT 0.00142 CATCA 0.000699 CATCC 0.000599 CATCG 0.00109 CATCT 0.000745 CATGA 0.000519 CATGC 0.000374 CATGG 0.000299 CATGT 0.000525 CATTA 0.00123 CATTC 0.00105 CATTG 0.000798 CATTT 0.00205 CCAAA 0.000729 CCAAC 0.000534 CCAAG 0.000426 CCAAT 0.000788 CCACA 0.000306 CCACC 0.000496 CCACG 0.00068 CCACT 0.000429 CCAGA 0.000344 CCAGC 0.000253 CCAGG 0.000216 CCAGT 0.000301 CCATA 0.000435 CCATC 0.000666 CCATG 0.000299 CCATT 0.000889 CCCAA 0.00029 CCCAC 0.000286 CCCAG 0.000146 CCCAT 0.000308 CCCCA 0.000227 CCCCC 0.000569 CCCCG 0.000349 CCCCT 0.000555 CCCGA 0.000392 CCCGC 0.000307 CCCGG 0.000224 CCCGT 0.000415 CCCTA 0.000205 CCCTC 0.000803 CCCTG 0.000235 CCCTT 0.000684 CCGAA 0.000537 CCGAC 0.000379 CCGAG 0.00049 CCGAT 0.000801 CCGCA 0.000286 CCGCC 0.000366 CCGCG 0.000609 CCGCT 0.000379 CCGGA 0.000309 CCGGC 0.000296 CCGGG 0.000224 CCGGT 0.000362 CCGTA 0.000376 CCGTC 0.000433 CCGTG 0.000548 CCGTT 0.000769 CCTAA 0.000363 CCTAC 0.000256 CCTAG 0.000161 CCTAT 0.000468 CCTCA 0.000254 CCTCC 0.000913 CCTCG 0.000917 CCTCT 0.0009 CCTGA 0.000274 CCTGC 0.000259 CCTGG 0.000216 CCTGT 0.000398 CCTTA 0.000421 CCTTC 0.000933 CCTTG 0.000436 CCTTT 0.0013 CGAAA 0.00248 CGAAC 0.00102 CGAAG 0.00108 CGAAT 0.00195 CGACA 0.000697 CGACC 0.000438 CGACG 0.001 CGACT 0.000533 CGAGA 0.00157 CGAGC 0.000805 CGAGG 0.000917 CGAGT 0.000981 CGATA 0.0018 CGATC 0.0017 CGATG 0.00109 CGATT 0.00208 CGCAA 0.000756 CGCAC 0.000502 CGCAG 0.00033 CGCAT 0.000645 CGCCA 0.000479 CGCCC 0.000284 CGCCG 0.000496 CGCCT 0.000391 CGCGA 0.00136 CGCGC 0.000918 CGCGG 0.000609 CGCGT 0.00121 CGCTA 0.000374 CGCTC 0.000652 CGCTG 0.000326 CGCTT 0.000723 CGGAA 0.000767 CGGAC 0.000304 CGGAG 0.000447 CGGAT 0.000678 CGGCA 0.00035 CGGCC 0.000403 CGGCG 0.000496 CGGCT 0.000323 CGGGA 0.000473 CGGGC 0.000259 CGGGG 0.000349 CGGGT 0.000256 CGGTA 0.000478 CGGTC 0.000372 CGGTG 0.000521 CGGTT 0.000689 CGTAA 0.00116 CGTAC 0.000662 CGTAG 0.000451 CGTAT 0.00125 CGTCA 0.000563 CGTCC 0.00053 CGTCG 0.001 CGTCT 0.000599 CGTGA 0.00094 CGTGC 0.000679 CGTGG 0.00068 CGTGT 0.00113 CGTTA 0.00113 CGTTC 0.0013 CGTTG 0.000907 CGTTT 0.00201 CTAAA 0.000918 CTAAC 0.000429 CTAAG 0.000263 CTAAT 0.000931 CTACA 0.000411 CTACC 0.000279 CTACG 0.000451 CTACT 0.00047 CTAGA 0.000378 CTAGC 0.000182 CTAGG 0.000161 CTAGT 0.000262 CTATA 0.000918 CTATC 0.000724 CTATG 0.00039 CTATT 0.00124 CTCAA 0.000559 CTCAC 0.000382 CTCAG 0.000185 CTCAT 0.000519 CTCCA 0.000537 CTCCC 0.000685 CTCCG 0.000447 CTCCT 0.000895 CTCGA 0.00162 CTCGC 0.00087 CTCGG 0.00049 CTCGT 0.00129 CTCTA 0.000556 CTCTC 0.00239 CTCTG 0.000478 CTCTT 0.0015 CTGAA 0.000621 CTGAC 0.000277 CTGAG 0.000185 CTGAT 0.000537 CTGCA 0.000351 CTGCC 0.000273 CTGCG 0.00033 CTGCT 0.000336 CTGGA 0.000406 CTGGC 0.00027 CTGGG 0.000146 CTGGT 0.000291 CTGTA 0.000544 CTGTC 0.000423 CTGTG 0.000374 CTGTT 0.000742 CTTAA 0.00101 CTTAC 0.000539 CTTAG 0.000263 CTTAT 0.00114 CTTCA 0.000688 CTTCC 0.001 CTTCG 0.00108 CTTCT 0.00155 CTTGA 0.000722 CTTGC 0.000512 CTTGG 0.000426 CTTGT 0.000788 CTTTA 0.00126 CTTTC 0.00205 CTTTG 0.00095 CTTTT 0.0032 GAAAA 0.00469 GAAAC 0.00174 GAAAG 0.00205 GAAAT 0.00306 GAACA 0.000972 GAACC 0.000398 GAACG 0.0013 GAACT 0.000543 GAAGA 0.00208 GAAGC 0.00062 GAAGG 0.000933 GAAGT 0.000685 GAATA 0.00218 GAATC 0.00138 GAATG 0.00105 GAATT 0.0024 GACAA 0.000889 GACAC 0.000546 GACAG 0.000423 GACAT 0.00051 GACCA 0.000317 GACCC 0.000171 GACCG 0.000372 GACCT 0.000224 GACGA 0.00118 GACGC 0.000509 GACGG 0.000433 GACGT 0.000571 GACTA 0.000321 GACTC 0.000389 GACTG 0.0003 GACTT 0.000499 GAGAA 0.00221 GAGAC 0.000587 GAGAG 0.00239 GAGAT 0.0012 GAGCA 0.000535 GAGCC 0.000282 GAGCG 0.000652 GAGCT 0.000327 GAGGA 0.00133 GAGGC 0.00044 GAGGG 0.000803 GAGGT 0.000409 GAGTA 0.000591 GAGTC 0.000389 GAGTG 0.000516 GAGTT 0.000734 GATAA 0.0022 GATAC 0.000922 GATAG 0.000724 GATAT 0.00199 GATCA 0.000913 GATCC 0.000673 GATCG 0.0017 GATCT 0.000796 GATGA 0.00117 GATGC 0.000581 GATGG 0.000666 GATGT 0.000711 GATTA 0.00168 GATTC 0.00138 GATTG 0.000946 GATTT 0.00223 GCAAA 0.00113 GCAAC 0.000638 GCAAG 0.000512 GCAAT 0.000939 GCACA 0.00051 GCACC 0.000265 GCACG 0.000679 GCACT 0.000293 GCAGA 0.000418 GCAGC 0.000317 GCAGG 0.000259 GCAGT 0.000296 GCATA 0.00066 GCATC 0.000581 GCATG 0.000374 GCATT 0.0008 GCCAA 0.000492 GCCAC 0.000416 GCCAG 0.00027 GCCAT 0.000404 GCCCA 0.000166 GCCCC 0.000215 GCCCG 0.000259 GCCCT 0.000194 GCCGA 0.000477 GCCGC 0.00042 GCCGG 0.000296 GCCGT 0.000378 GCCTA 0.000198 GCCTC 0.00044 GCCTG 0.00021 GCCTT 0.000349 GCGAA 0.00111 GCGAC 0.000535 GCGAG 0.00087 GCGAT 0.00098 GCGCA 0.000524 GCGCC 0.000349 GCGCG 0.000918 GCGCT 0.000353 GCGGA 0.000512 GCGGC 0.00042 GCGGG 0.000307 GCGGT 0.000401 GCGTA 0.000637 GCGTC 0.000509 GCGTG 0.00077 GCGTT 0.000857 GCTAA 0.000408 GCTAC 0.000313 GCTAG 0.000182 GCTAT 0.000466 GCTCA 0.000262 GCTCC 0.000305 GCTCG 0.000805 GCTCT 0.000426 GCTGA 0.000298 GCTGC 0.000317 GCTGG 0.000253 GCTGT 0.000338 GCTTA 0.000431 GCTTC 0.00062 GCTTG 0.000414 GCTTT 0.000807 GGAAA 0.00209 GGAAC 0.000662 GGAAG 0.001 GGAAT 0.00114 GGACA 0.000403 GGACC 0.000169 GGACG 0.00053 GGACT 0.000184 GGAGA 0.00105 GGAGC 0.000305 GGAGG 0.000913 GGAGT 0.000291 GGATA 0.000912 GGATC 0.000673 GGATG 0.000599 GGATT 0.000853 GGCAA 0.000521 GGCAC 0.000294 GGCAG 0.000273 GGCAT 0.000289 GGCCA 0.000333 GGCCC 0.000169 GGCCG 0.000403 GGCCT 0.00019 GGCGA 0.000591 GGCGC 0.000349 GGCGG 0.000366 GGCGT 0.000344 GGCTA 0.000225 GGCTC 0.000282 GGCTG 0.000267 GGCTT 0.000286 GGGAA 0.000948 GGGAC 0.000286 GGGAG 0.000685 GGGAT 0.000539 GGGCA 0.000236 GGGCC 0.000169 GGGCG 0.000284 GGGCT 0.000144 GGGGA 0.000687 GGGGC 0.000215 GGGGG 0.000569 GGGGT 0.000229 GGGTA 0.000235 GGGTC 0.000171 GGGTG 0.000305 GGGTT 0.000292 GGTAA 0.000613 GGTAC 0.000253 GGTAG 0.000279 GGTAT 0.000526 GGTCA 0.000277 GGTCC 0.000169 GGTCG 0.000438 GGTCT 0.0002 GGTGA 0.00047 GGTGC 0.000265 GGTGG 0.000496 GGTGT 0.000398 GGTTA 0.000577 GGTTC 0.000398 GGTTG 0.00045 GGTTT 0.000637 GTAAA 0.0017 GTAAC 0.000727 GTAAG 0.000539 GTAAT 0.00151 GTACA 0.00085 GTACC 0.000253 GTACG 0.000662 GTACT 0.000377 GTAGA 0.000629 GTAGC 0.000313 GTAGG 0.000256 GTAGT 0.000412 GTATA 0.00163 GTATC 0.000922 GTATG 0.000614 GTATT 0.00146 GTCAA 0.000636 GTCAC 0.000468 GTCAG 0.000277 GTCAT 0.000524 GTCCA 0.000396 GTCCC 0.000286 GTCCG 0.000304 GTCCT 0.0003 GTCGA 0.00103 GTCGC 0.000535 GTCGG 0.000379 GTCGT 0.000723 GTCTA 0.000359 GTCTC 0.000587 GTCTG 0.000285 GTCTT 0.000563 GTGAA 0.00114 GTGAC 0.000468 GTGAG 0.000382 GTGAT 0.000818 GTGCA 0.000618 GTGCC 0.000294 GTGCG 0.000502 GTGCT 0.000334 GTGGA 0.00077 GTGGC 0.000416 GTGGG 0.000286 GTGGT 0.000437 GTGTA 0.000966 GTGTC 0.000546 GTGTG 0.000759 GTGTT 0.000857 GTTAA 0.00137 GTTAC 0.000727 GTTAG 0.000429 GTTAT 0.00135 GTTCA 0.000772 GTTCC 0.000662 GTTCG 0.00102 GTTCT 0.000765 GTTGA 0.000879 GTTGC 0.000638 GTTGG 0.000534 GTTGT 0.000801 GTTTA 0.00141 GTTTC 0.00174 GTTTG 0.0009 GTTTT 0.00207 TAAAA 0.00524 TAAAC 0.00141 TAAAG 0.00126 TAAAT 0.00431 TAACA 0.00129 TAACC 0.000577 TAACG 0.00113 TAACT 0.000878 TAAGA 0.00127 TAAGC 0.000431 TAAGG 0.000421 TAAGT 0.000836 TAATA 0.00403 TAATC 0.00168 TAATG 0.00123 TAATT 0.00453 TACAA 0.00162 TACAC 0.000966 TACAG 0.000544 TACAT 0.00164 TACCA 0.000498 TACCC 0.000235 TACCG 0.000478 TACCT 0.00046 TACGA 0.00133 TACGC 0.000637 TACGG 0.000376 TACGT 0.00119 TACTA 0.000694 TACTC 0.000591 TACTG 0.000359 TACTT 0.00125 TAGAA 0.00158 TAGAC 0.000359 TAGAG 0.000556 TAGAT 0.00114 TAGCA 0.000431 TAGCC 0.000225 TAGCG 0.000374 TAGCT 0.000339 TAGGA 0.000513 TAGGC 0.000198 TAGGG 0.000205 TAGGT 0.000331 TAGTA 0.000694 TAGTC 0.000321 TAGTG 0.00033 TAGTT 0.000808 TATAA 0.00379 TATAC 0.00163 TATAG 0.000918 TATAT 0.00716 TATCA 0.00149 TATCC 0.000912 TATCG 0.0018 TATCT 0.00162 TATGA 0.00114 TATGC 0.00066 TATGG 0.000435 TATGT 0.00137 TATTA 0.00403 TATTC 0.00218 TATTG 0.00148 TATTT 0.00565 TCAAA 0.00191 TCAAC 0.000879 TCAAG 0.000722 TCAAT 0.00179 TCACA 0.00071 TCACC 0.00047 TCACG 0.00094 TCACT 0.000685 TCAGA 0.000596 TCAGC 0.000298 TCAGG 0.000274 TCAGT 0.000451 TCATA 0.00114 TCATC 0.00117 TCATG 0.000519 TCATT 0.0019 TCCAA 0.00111 TCCAC 0.00077 TCCAG 0.000406 TCCAT 0.00107 TCCCA 0.000419 TCCCC 0.000687 TCCCG 0.000473 TCCCT 0.000879 TCCGA 0.000619 TCCGC 0.000512 TCCGG 0.000309 TCCGT 0.000756 TCCTA 0.000513 TCCTC 0.00133 TCCTG 0.00041 TCCTT 0.00153 TCGAA 0.0028 TCGAC 0.00103 TCGAG 0.00162 TCGAT 0.00295 TCGCA 0.000748 TCGCC 0.000591 TCGCG 0.00136 TCGCT 0.000804 TCGGA 0.000619 TCGGC 0.000477 TCGGG 0.000392 TCGGT 0.00072 TCGTA 0.00133 TCGTC 0.00118 TCGTG 0.00116 TCGTT 0.00236 TCTAA 0.00113 TCTAC 0.000629 TCTAG 0.000378 TCTAT 0.0015 TCTCA 0.000781 TCTCC 0.00105 TCTCG 0.00157 TCTCT 0.00299 TCTGA 0.000596 TCTGC 0.000418 TCTGG 0.000344 TCTGT 0.000779 TCTTA 0.00127 TCTTC 0.00208 TCTTG 0.000904 TCTTT 0.00362 TGAAA 0.00284 TGAAC 0.000772 TGAAG 0.000688 TGAAT 0.00184 TGACA 0.000646 TGACC 0.000277 TGACG 0.000563 TGACT 0.00042 TGAGA 0.000781 TGAGC 0.000262 TGAGG 0.000254 TGAGT 0.000349 TGATA 0.00149 TGATC 0.000913 TGATG 0.000699 TGATT 0.00166 TGCAA 0.00114 TGCAC 0.000618 TGCAG 0.000351 TGCAT 0.000954 TGCCA 0.000429 TGCCC 0.000236 TGCCG 0.00035 TGCCT 0.000363 TGCGA 0.000748 TGCGC 0.000524 TGCGG 0.000286 TGCGT 0.000676 TGCTA 0.000431 TGCTC 0.000535 TGCTG 0.000314 TGCTT 0.000713 TGGAA 0.00151 TGGAC 0.000396 TGGAG 0.000537 TGGAT 0.000918 TGGCA 0.000429 TGGCC 0.000333 TGGCG 0.000479 TGGCT 0.000341 TGGGA 0.000419 TGGGC 0.000166 TGGGG 0.000227 TGGGT 0.000219 TGGTA 0.000498 TGGTC 0.000317 TGGTG 0.00043 TGGTT 0.000567 TGTAA 0.00163 TGTAC 0.00085 TGTAG 0.000411 TGTAT 0.00188 TGTCA 0.000646 TGTCC 0.000403 TGTCG 0.000697 TGTCT 0.000622 TGTGA 0.00071 TGTGC 0.00051 TGTGG 0.000306 TGTGT 0.00102 TGTTA 0.00129 TGTTC 0.000972 TGTTG 0.000854 TGTTT 0.00198 TTAAA 0.00438 TTAAC 0.00137 TTAAG 0.00101 TTAAT 0.0041 TTACA 0.00163 TTACC 0.000613 TTACG 0.00116 TTACT 0.00107 TTAGA 0.00113 TTAGC 0.000408 TTAGG 0.000363 TTAGT 0.000642 TTATA 0.00379 TTATC 0.0022 TTATG 0.00118 TTATT 0.00546 TTCAA 0.00235 TTCAC 0.00114 TTCAG 0.000621 TTCAT 0.00203 TTCCA 0.00151 TTCCC 0.000948 TTCCG 0.000767 TTCCT 0.00168 TTCGA 0.0028 TTCGC 0.00111 TTCGG 0.000537 TTCGT 0.00207 TTCTA 0.00158 TTCTC 0.00221 TTCTG 0.000775 TTCTT 0.00396 TTGAA 0.00235 TTGAC 0.000636 TTGAG 0.000559 TTGAT 0.00176 TTGCA 0.00114 TTGCC 0.000521 TTGCG 0.000756 TTGCT 0.000799 TTGGA 0.00111 TTGGC 0.000492 TTGGG 0.00029 TTGGT 0.000582 TTGTA 0.00162 TTGTC 0.000889 TTGTG 0.00077 TTGTT 0.00215 TTTAA 0.00438 TTTAC 0.0017 TTTAG 0.000918 TTTAT 0.00522 TTTCA 0.00284 TTTCC 0.00209 TTTCG 0.00248 TTTCT 0.00413 TTTGA 0.00191 TTTGC 0.00113 TTTGG 0.000729 TTTGT 0.00203 TTTTA 0.00524 TTTTC 0.00469 TTTTG 0.00212 TTTTT 0.0126 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.5119 AAAAC 0.08366 AAAAG 0.1298 AAAAT 0.2747 AAACA 0.3232 AAACC 0.1042 AAACG 0.3284 AAACT 0.2442 AAAGA 0.4857 AAAGC 0.1082 AAAGG 0.175 AAAGT 0.2311 AAATA 0.3534 AAATC 0.1393 AAATG 0.1284 AAATT 0.379 AACAA 0.4213 AACAC 0.1684 AACAG 0.1457 AACAT 0.2646 AACCA 0.2752 AACCC 0.1414 AACCG 0.3342 AACCT 0.2492 AACGA 0.4413 AACGC 0.1604 AACGG 0.1438 AACGT 0.2545 AACTA 0.2271 AACTC 0.2065 AACTG 0.1682 AACTT 0.3982 AAGAA 0.5025 AAGAC 0.07149 AAGAG 0.19 AAGAT 0.236 AAGCA 0.3139 AAGCC 0.1258 AAGCG 0.3183 AAGCT 0.2419 AAGGA 0.4927 AAGGC 0.1126 AAGGG 0.2211 AAGGT 0.1735 AAGTA 0.3168 AAGTC 0.1267 AAGTG 0.1972 AAGTT 0.3593 AATAA 0.4091 AATAC 0.1095 AATAG 0.09267 AATAT 0.3888 AATCA 0.2672 AATCC 0.1369 AATCG 0.3339 AATCT 0.2621 AATGA 0.3703 AATGC 0.156 AATGG 0.1735 AATGT 0.3003 AATTA 0.3005 AATTC 0.159 AATTG 0.139 AATTT 0.4015 ACAAA 0.3744 ACAAC 0.1476 ACAAG 0.1451 ACAAT 0.3329 ACACA 0.3275 ACACC 0.1273 ACACG 0.3618 ACACT 0.1834 ACAGA 0.3742 ACAGC 0.1623 ACAGG 0.1911 ACAGT 0.2725 ACATA 0.3298 ACATC 0.1717 ACATG 0.1268 ACATT 0.3717 ACCAA 0.3208 ACCAC 0.2411 ACCAG 0.1605 ACCAT 0.2775 ACCCA 0.2183 ACCCC 0.2286 ACCCG 0.2553 ACCCT 0.2979 ACCGA 0.3494 ACCGC 0.1948 ACCGG 0.1758 ACCGT 0.28 ACCTA 0.2109 ACCTC 0.2608 ACCTG 0.1863 ACCTT 0.3421 ACGAA 0.3443 ACGAC 0.1199 ACGAG 0.2135 ACGAT 0.3222 ACGCA 0.2438 ACGCC 0.124 ACGCG 0.438 ACGCT 0.1941 ACGGA 0.3557 ACGGC 0.1778 ACGGG 0.1951 ACGGT 0.2714 ACGTA 0.2912 ACGTC 0.1403 ACGTG 0.2345 ACGTT 0.334 ACTAA 0.2983 ACTAC 0.1912 ACTAG 0.1215 ACTAT 0.389 ACTCA 0.1563 ACTCC 0.1304 ACTCG 0.4399 ACTCT 0.2733 ACTGA 0.2793 ACTGC 0.1835 ACTGG 0.186 ACTGT 0.3512 ACTTA 0.2122 ACTTC 0.1739 ACTTG 0.1765 ACTTT 0.4374 AGAAA 0.4846 AGAAC 0.08978 AGAAG 0.1817 AGAAT 0.244 AGACA 0.3469 AGACC 0.1113 AGACG 0.3342 AGACT 0.2076 AGAGA 0.6068 AGAGC 0.0865 AGAGG 0.1828 AGAGT 0.1239 AGATA 0.3383 AGATC 0.166 AGATG 0.1553 AGATT 0.3404 AGCAA 0.4005 AGCAC 0.1674 AGCAG 0.1687 AGCAT 0.2635 AGCCA 0.3219 AGCCC 0.1357 AGCCG 0.3048 AGCCT 0.2376 AGCGA 0.3877 AGCGC 0.1701 AGCGG 0.1829 AGCGT 0.2594 AGCTA 0.2238 AGCTC 0.216 AGCTG 0.1973 AGCTT 0.3629 AGGAA 0.4448 AGGAC 0.0794 AGGAG 0.237 AGGAT 0.2388 AGGCA 0.3038 AGGCC 0.1586 AGGCG 0.3272 AGGCT 0.2104 AGGGA 0.4563 AGGGC 0.1007 AGGGG 0.2879 AGGGT 0.1552 AGGTA 0.2925 AGGTC 0.1423 AGGTG 0.2381 AGGTT 0.3271 AGTAA 0.3692 AGTAC 0.1304 AGTAG 0.1624 AGTAT 0.338 AGTCA 0.2782 AGTCC 0.1219 AGTCG 0.3533 AGTCT 0.2466 AGTGA 0.3458 AGTGC 0.148 AGTGG 0.2165 AGTGT 0.2897 AGTTA 0.247 AGTTC 0.1527 AGTTG 0.1805 AGTTT 0.4199 ATAAA 0.4136 ATAAC 0.1066 ATAAG 0.09042 ATAAT 0.3894 ATACA 0.4057 ATACC 0.1137 ATACG 0.2696 ATACT 0.2111 ATAGA 0.4582 ATAGC 0.1424 ATAGG 0.1431 ATAGT 0.2562 ATATA 0.4548 ATATC 0.1262 ATATG 0.08983 ATATT 0.3292 ATCAA 0.3692 ATCAC 0.1715 ATCAG 0.1126 ATCAT 0.3468 ATCCA 0.3021 ATCCC 0.1776 ATCCG 0.2233 ATCCT 0.297 ATCGA 0.4418 ATCGC 0.1469 ATCGG 0.1201 ATCGT 0.2912 ATCTA 0.2372 ATCTC 0.2509 ATCTG 0.1248 ATCTT 0.3872 ATGAA 0.43 ATGAC 0.1108 ATGAG 0.1096 ATGAT 0.3496 ATGCA 0.395 ATGCC 0.1199 ATGCG 0.2674 ATGCT 0.2177 ATGGA 0.469 ATGGC 0.1765 ATGGG 0.1346 ATGGT 0.2199 ATGTA 0.3954 ATGTC 0.1232 ATGTG 0.1562 ATGTT 0.3252 ATTAA 0.3581 ATTAC 0.1317 ATTAG 0.08123 ATTAT 0.429 ATTCA 0.2624 ATTCC 0.1631 ATTCG 0.2781 ATTCT 0.2963 ATTGA 0.3363 ATTGC 0.1763 ATTGG 0.148 ATTGT 0.3394 ATTTA 0.2696 ATTTC 0.1916 ATTTG 0.1145 ATTTT 0.4242 CAAAA 0.3657 CAAAC 0.1551 CAAAG 0.1637 CAAAT 0.3156 CAACA 0.2995 CAACC 0.1577 CAACG 0.3179 CAACT 0.225 CAAGA 0.3692 CAAGC 0.1689 CAAGG 0.178 CAAGT 0.2839 CAATA 0.2786 CAATC 0.1776 CAATG 0.1498 CAATT 0.394 CACAA 0.302 CACAC 0.2976 CACAG 0.1467 CACAT 0.2537 CACCA 0.2638 CACCC 0.1873 CACCG 0.3196 CACCT 0.2293 CACGA 0.3375 CACGC 0.2244 CACGG 0.1597 CACGT 0.2784 CACTA 0.1665 CACTC 0.2604 CACTG 0.1806 CACTT 0.3924 CAGAA 0.3627 CAGAC 0.1335 CAGAG 0.2236 CAGAT 0.2802 CAGCA 0.2603 CAGCC 0.2214 CAGCG 0.2705 CAGCT 0.2478 CAGGA 0.3576 CAGGC 0.1828 CAGGG 0.2046 CAGGT 0.255 CAGTA 0.2223 CAGTC 0.1858 CAGTG 0.2215 CAGTT 0.3704 CATAA 0.3284 CATAC 0.1705 CATAG 0.1084 CATAT 0.3928 CATCA 0.2235 CATCC 0.1915 CATCG 0.3471 CATCT 0.238 CATGA 0.3022 CATGC 0.2176 CATGG 0.1744 CATGT 0.3058 CATTA 0.2391 CATTC 0.205 CATTG 0.1556 CATTT 0.4002 CCAAA 0.2944 CCAAC 0.2155 CCAAG 0.1719 CCAAT 0.3183 CCACA 0.16 CCACC 0.2598 CCACG 0.3558 CCACT 0.2243 CCAGA 0.3087 CCAGC 0.2271 CCAGG 0.1943 CCAGT 0.27 CCATA 0.1898 CCATC 0.2909 CCATG 0.1308 CCATT 0.3884 CCCAA 0.2816 CCCAC 0.2776 CCCAG 0.1418 CCCAT 0.2991 CCCCA 0.1337 CCCCC 0.3348 CCCCG 0.2053 CCCCT 0.3263 CCCGA 0.2927 CCCGC 0.2295 CCCGG 0.1676 CCCGT 0.3101 CCCTA 0.1064 CCCTC 0.4168 CCCTG 0.1217 CCCTT 0.3551 CCGAA 0.2433 CCGAC 0.1719 CCGAG 0.2221 CCGAT 0.3628 CCGCA 0.1745 CCGCC 0.223 CCGCG 0.3713 CCGCT 0.2313 CCGGA 0.2595 CCGGC 0.2484 CCGGG 0.1881 CCGGT 0.3041 CCGTA 0.177 CCGTC 0.2038 CCGTG 0.2577 CCGTT 0.3615 CCTAA 0.2909 CCTAC 0.2051 CCTAG 0.1288 CCTAT 0.3752 CCTCA 0.08501 CCTCC 0.306 CCTCG 0.3073 CCTCT 0.3017 CCTGA 0.2391 CCTGC 0.2255 CCTGG 0.1886 CCTGT 0.3469 CCTTA 0.1361 CCTTC 0.3015 CCTTG 0.1409 CCTTT 0.4215 CGAAA 0.3803 CGAAC 0.1558 CGAAG 0.1649 CGAAT 0.299 CGACA 0.261 CGACC 0.1642 CGACG 0.3752 CGACT 0.1997 CGAGA 0.3672 CGAGC 0.1885 CGAGG 0.2146 CGAGT 0.2298 CGATA 0.2701 CGATC 0.255 CGATG 0.1629 CGATT 0.312 CGCAA 0.3385 CGCAC 0.2247 CGCAG 0.1479 CGCAT 0.289 CGCCA 0.2901 CGCCC 0.1722 CGCCG 0.3006 CGCCT 0.2372 CGCGA 0.331 CGCGC 0.224 CGCGG 0.1486 CGCGT 0.2963 CGCTA 0.1802 CGCTC 0.3142 CGCTG 0.1572 CGCTT 0.3484 CGGAA 0.3492 CGGAC 0.1386 CGGAG 0.2035 CGGAT 0.3088 CGGCA 0.2226 CGGCC 0.2562 CGGCG 0.3157 CGGCT 0.2055 CGGGA 0.3538 CGGGC 0.1935 CGGGG 0.2611 CGGGT 0.1916 CGGTA 0.2321 CGGTC 0.1806 CGGTG 0.2529 CGGTT 0.3344 CGTAA 0.3302 CGTAC 0.1879 CGTAG 0.1278 CGTAT 0.3541 CGTCA 0.2089 CGTCC 0.1969 CGTCG 0.3719 CGTCT 0.2224 CGTGA 0.274 CGTGC 0.1979 CGTGG 0.1982 CGTGT 0.3299 CGTTA 0.2107 CGTTC 0.2437 CGTTG 0.1697 CGTTT 0.3759 CTAAA 0.3612 CTAAC 0.169 CTAAG 0.1034 CTAAT 0.3665 CTACA 0.2553 CTACC 0.1731 CTACG 0.2799 CTACT 0.2917 CTAGA 0.3849 CTAGC 0.185 CTAGG 0.1636 CTAGT 0.2665 CTATA 0.2808 CTATC 0.2215 CTATG 0.1195 CTATT 0.3782 CTCAA 0.3399 CTCAC 0.2323 CTCAG 0.1123 CTCAT 0.3155 CTCCA 0.2094 CTCCC 0.2672 CTCCG 0.1743 CTCCT 0.3491 CTCGA 0.3802 CTCGC 0.2038 CTCGG 0.1148 CTCGT 0.3012 CTCTA 0.113 CTCTC 0.486 CTCTG 0.09708 CTCTT 0.3039 CTGAA 0.3834 CTGAC 0.1712 CTGAG 0.114 CTGAT 0.3314 CTGCA 0.2718 CTGCC 0.2117 CTGCG 0.256 CTGCT 0.2606 CTGGA 0.3649 CTGGC 0.2426 CTGGG 0.1312 CTGGT 0.2614 CTGTA 0.261 CTGTC 0.2032 CTGTG 0.1797 CTGTT 0.3561 CTTAA 0.3429 CTTAC 0.1821 CTTAG 0.0888 CTTAT 0.3862 CTTCA 0.1593 CTTCC 0.2327 CTTCG 0.2494 CTTCT 0.3587 CTTGA 0.2951 CTTGC 0.2093 CTTGG 0.1738 CTTGT 0.3218 CTTTA 0.1683 CTTTC 0.2747 CTTTG 0.1273 CTTTT 0.4296 GAAAA 0.4063 GAAAC 0.1508 GAAAG 0.1775 GAAAT 0.2654 GAACA 0.3023 GAACC 0.1239 GAACG 0.405 GAACT 0.1688 GAAGA 0.4813 GAAGC 0.1436 GAAGG 0.2163 GAAGT 0.1588 GAATA 0.3109 GAATC 0.1973 GAATG 0.1498 GAATT 0.342 GACAA 0.3755 GACAC 0.2304 GACAG 0.1787 GACAT 0.2155 GACCA 0.2928 GACCC 0.1575 GACCG 0.3435 GACCT 0.2062 GACGA 0.4383 GACGC 0.1888 GACGG 0.1608 GACGT 0.2121 GACTA 0.2126 GACTC 0.2577 GACTG 0.1987 GACTT 0.3309 GAGAA 0.3456 GAGAC 0.09189 GAGAG 0.3742 GAGAT 0.1883 GAGCA 0.2979 GAGCC 0.1572 GAGCG 0.3629 GAGCT 0.182 GAGGA 0.446 GAGGC 0.1475 GAGGG 0.2693 GAGGT 0.1372 GAGTA 0.2651 GAGTC 0.1744 GAGTG 0.2313 GAGTT 0.3292 GATAA 0.3767 GATAC 0.1581 GATAG 0.1242 GATAT 0.3409 GATCA 0.2235 GATCC 0.1649 GATCG 0.4165 GATCT 0.1951 GATGA 0.3741 GATGC 0.1856 GATGG 0.2129 GATGT 0.2274 GATTA 0.2689 GATTC 0.2221 GATTG 0.1518 GATTT 0.3572 GCAAA 0.3509 GCAAC 0.1982 GCAAG 0.1592 GCAAT 0.2918 GCACA 0.292 GCACC 0.1518 GCACG 0.3885 GCACT 0.1677 GCAGA 0.3238 GCAGC 0.2459 GCAGG 0.2005 GCAGT 0.2298 GCATA 0.2733 GCATC 0.2406 GCATG 0.1548 GCATT 0.3313 GCCAA 0.3111 GCCAC 0.2629 GCCAG 0.1708 GCCAT 0.2553 GCCCA 0.1987 GCCCC 0.2576 GCCCG 0.3107 GCCCT 0.233 GCCGA 0.3034 GCCGC 0.2675 GCCGG 0.1884 GCCGT 0.2407 GCCTA 0.1653 GCCTC 0.3679 GCCTG 0.1753 GCCTT 0.2915 GCGAA 0.3185 GCGAC 0.153 GCGAG 0.2487 GCGAT 0.2799 GCGCA 0.2443 GCGCC 0.163 GCGCG 0.4282 GCGCT 0.1646 GCGGA 0.3121 GCGGC 0.2562 GCGGG 0.1871 GCGGT 0.2447 GCGTA 0.2297 GCGTC 0.1835 GCGTG 0.2776 GCGTT 0.3092 GCTAA 0.2984 GCTAC 0.2288 GCTAG 0.1327 GCTAT 0.3401 GCTCA 0.1456 GCTCC 0.1695 GCTCG 0.448 GCTCT 0.237 GCTGA 0.2468 GCTGC 0.2632 GCTGG 0.2097 GCTGT 0.2803 GCTTA 0.1898 GCTTC 0.2727 GCTTG 0.1821 GCTTT 0.3553 GGAAA 0.427 GGAAC 0.1349 GGAAG 0.2047 GGAAT 0.2334 GGACA 0.3132 GGACC 0.1314 GGACG 0.4124 GGACT 0.143 GGAGA 0.4115 GGAGC 0.1188 GGAGG 0.3561 GGAGT 0.1135 GGATA 0.3003 GGATC 0.2216 GGATG 0.1973 GGATT 0.2808 GGCAA 0.3783 GGCAC 0.2132 GGCAG 0.1983 GGCAT 0.2101 GGCCA 0.3043 GGCCC 0.1546 GGCCG 0.3678 GGCCT 0.1733 GGCGA 0.3583 GGCGC 0.2117 GGCGG 0.2216 GGCGT 0.2083 GGCTA 0.2119 GGCTC 0.2665 GGCTG 0.2519 GGCTT 0.2697 GGGAA 0.3856 GGGAC 0.1164 GGGAG 0.2787 GGGAT 0.2193 GGGCA 0.2831 GGGCC 0.2032 GGGCG 0.3412 GGGCT 0.1726 GGGGA 0.4039 GGGGC 0.1262 GGGGG 0.3349 GGGGT 0.135 GGGTA 0.2347 GGGTC 0.1702 GGGTG 0.3044 GGGTT 0.2907 GGTAA 0.3669 GGTAC 0.1515 GGTAG 0.1668 GGTAT 0.3148 GGTCA 0.2555 GGTCC 0.1559 GGTCG 0.4044 GGTCT 0.1841 GGTGA 0.2885 GGTGC 0.1627 GGTGG 0.3046 GGTGT 0.2442 GGTTA 0.2798 GGTTC 0.1932 GGTTG 0.218 GGTTT 0.309 GTAAA 0.3801 GTAAC 0.1625 GTAAG 0.1203 GTAAT 0.3371 GTACA 0.3968 GTACC 0.1182 GTACG 0.3091 GTACT 0.1759 GTAGA 0.391 GTAGC 0.1945 GTAGG 0.1589 GTAGT 0.2556 GTATA 0.3528 GTATC 0.1991 GTATG 0.1327 GTATT 0.3155 GTCAA 0.3338 GTCAC 0.2457 GTCAG 0.1455 GTCAT 0.275 GTCCA 0.3079 GTCCC 0.2224 GTCCG 0.2366 GTCCT 0.2331 GTCGA 0.3869 GTCGC 0.2005 GTCGG 0.1421 GTCGT 0.2706 GTCTA 0.2 GTCTC 0.3274 GTCTG 0.159 GTCTT 0.3136 GTGAA 0.405 GTGAC 0.167 GTGAG 0.1362 GTGAT 0.2918 GTGCA 0.3535 GTGCC 0.1682 GTGCG 0.2873 GTGCT 0.1911 GTGGA 0.4033 GTGGC 0.2178 GTGGG 0.1498 GTGGT 0.2291 GTGTA 0.3088 GTGTC 0.1744 GTGTG 0.2427 GTGTT 0.2741 GTTAA 0.3537 GTTAC 0.1878 GTTAG 0.1109 GTTAT 0.3476 GTTCA 0.24 GTTCC 0.2059 GTTCG 0.3161 GTTCT 0.238 GTTGA 0.3082 GTTGC 0.2237 GTTGG 0.1871 GTTGT 0.281 GTTTA 0.2304 GTTTC 0.2846 GTTTG 0.1471 GTTTT 0.3379 TAAAA 0.4291 TAAAC 0.1153 TAAAG 0.1027 TAAAT 0.3528 TAACA 0.3331 TAACC 0.1491 TAACG 0.2909 TAACT 0.227 TAAGA 0.4288 TAAGC 0.1458 TAAGG 0.1425 TAAGT 0.2828 TAATA 0.3512 TAATC 0.1462 TAATG 0.107 TAATT 0.3957 TACAA 0.3404 TACAC 0.2024 TACAG 0.1139 TACAT 0.3433 TACCA 0.2981 TACCC 0.1409 TACCG 0.2861 TACCT 0.2749 TACGA 0.3764 TACGC 0.1806 TACGG 0.1067 TACGT 0.3363 TACTA 0.2398 TACTC 0.2044 TACTG 0.1241 TACTT 0.4316 TAGAA 0.4349 TAGAC 0.09877 TAGAG 0.1531 TAGAT 0.3132 TAGCA 0.315 TAGCC 0.1641 TAGCG 0.2733 TAGCT 0.2476 TAGGA 0.4112 TAGGC 0.1586 TAGGG 0.1646 TAGGT 0.2656 TAGTA 0.3223 TAGTC 0.1491 TAGTG 0.1533 TAGTT 0.3753 TATAA 0.2808 TATAC 0.1209 TATAG 0.06794 TATAT 0.5304 TATCA 0.256 TATCC 0.1565 TATCG 0.3091 TATCT 0.2784 TATGA 0.3173 TATGC 0.183 TATGG 0.1206 TATGT 0.3791 TATTA 0.3018 TATTC 0.1635 TATTG 0.1112 TATTT 0.4235 TCAAA 0.3602 TCAAC 0.1657 TCAAG 0.1362 TCAAT 0.3378 TCACA 0.2531 TCACC 0.1676 TCACG 0.3351 TCACT 0.2442 TCAGA 0.3681 TCAGC 0.1838 TCAGG 0.1694 TCAGT 0.2788 TCATA 0.2416 TCATC 0.2474 TCATG 0.1097 TCATT 0.4013 TCCAA 0.3306 TCCAC 0.2292 TCCAG 0.1209 TCCAT 0.3194 TCCCA 0.1706 TCCCC 0.2793 TCCCG 0.1924 TCCCT 0.3577 TCCGA 0.2817 TCCGC 0.2331 TCCGG 0.1408 TCCGT 0.3444 TCCTA 0.1356 TCCTC 0.3521 TCCTG 0.1085 TCCTT 0.4037 TCGAA 0.333 TCGAC 0.123 TCGAG 0.1933 TCGAT 0.3507 TCGCA 0.2138 TCGCC 0.1689 TCGCG 0.3875 TCGCT 0.2298 TCGGA 0.2803 TCGGC 0.216 TCGGG 0.1774 TCGGT 0.3263 TCGTA 0.2203 TCGTC 0.1961 TCGTG 0.1921 TCGTT 0.3915 TCTAA 0.3104 TCTAC 0.1733 TCTAG 0.104 TCTAT 0.4123 TCTCA 0.1222 TCTCC 0.165 TCTCG 0.2454 TCTCT 0.4674 TCTGA 0.2789 TCTGC 0.1955 TCTGG 0.1609 TCTGT 0.3647 TCTTA 0.1611 TCTTC 0.2638 TCTTG 0.1149 TCTTT 0.4602 TGAAA 0.4624 TGAAC 0.1257 TGAAG 0.112 TGAAT 0.2999 TGACA 0.339 TGACC 0.1453 TGACG 0.2953 TGACT 0.2203 TGAGA 0.4748 TGAGC 0.1591 TGAGG 0.1541 TGAGT 0.212 TGATA 0.3129 TGATC 0.1914 TGATG 0.1467 TGATT 0.3491 TGCAA 0.3728 TGCAC 0.2015 TGCAG 0.1145 TGCAT 0.3112 TGCCA 0.3113 TGCCC 0.1711 TGCCG 0.2539 TGCCT 0.2637 TGCGA 0.335 TGCGC 0.2344 TGCGG 0.1281 TGCGT 0.3026 TGCTA 0.2163 TGCTC 0.2685 TGCTG 0.1575 TGCTT 0.3577 TGGAA 0.4493 TGGAC 0.1179 TGGAG 0.1598 TGGAT 0.273 TGGCA 0.2712 TGGCC 0.2105 TGGCG 0.3026 TGGCT 0.2156 TGGGA 0.4066 TGGGC 0.1605 TGGGG 0.2204 TGGGT 0.2124 TGGTA 0.2749 TGGTC 0.175 TGGTG 0.2372 TGGTT 0.3129 TGTAA 0.342 TGTAC 0.1782 TGTAG 0.08614 TGTAT 0.3936 TGTCA 0.2729 TGTCC 0.1701 TGTCG 0.2943 TGTCT 0.2627 TGTGA 0.2783 TGTGC 0.2 TGTGG 0.1199 TGTGT 0.4017 TGTTA 0.2532 TGTTC 0.1909 TGTTG 0.1677 TGTTT 0.3881 TTAAA 0.4028 TTAAC 0.1261 TTAAG 0.09335 TTAAT 0.3778 TTACA 0.3645 TTACC 0.137 TTACG 0.26 TTACT 0.2385 TTAGA 0.4437 TTAGC 0.1608 TTAGG 0.1428 TTAGT 0.2527 TTATA 0.3003 TTATC 0.1739 TTATG 0.09368 TTATT 0.4321 TTCAA 0.3824 TTCAC 0.185 TTCAG 0.1012 TTCAT 0.3314 TTCCA 0.3078 TTCCC 0.1933 TTCCG 0.1563 TTCCT 0.3426 TTCGA 0.4289 TTCGC 0.1708 TTCGG 0.08231 TTCGT 0.318 TTCTA 0.1854 TTCTC 0.2593 TTCTG 0.09096 TTCTT 0.4643 TTGAA 0.4426 TTGAC 0.12 TTGAG 0.1054 TTGAT 0.332 TTGCA 0.355 TTGCC 0.162 TTGCG 0.2349 TTGCT 0.2481 TTGGA 0.4489 TTGGC 0.1988 TTGGG 0.1172 TTGGT 0.2351 TTGTA 0.2992 TTGTC 0.1638 TTGTG 0.1419 TTGTT 0.3951 TTTAA 0.3581 TTTAC 0.1393 TTTAG 0.07511 TTTAT 0.4275 TTTCA 0.2459 TTTCC 0.1814 TTTCG 0.215 TTTCT 0.3577 TTTGA 0.3293 TTTGC 0.1947 TTTGG 0.1257 TTTGT 0.3503 TTTTA 0.2123 TTTTC 0.1899 TTTTG 0.08591 TTTTT 0.5119 [6] # (a,c,g,t)= (0.275, 0.225, 0.225, 0.275) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.32 C 0.18 G 0.18 T 0.32 # l= 1 # Values AA 0.123 AC 0.0466 AG 0.0462 AT 0.104 CA 0.0449 CC 0.0323 CG 0.0568 CT 0.0462 GA 0.0683 GC 0.0329 GG 0.0323 GT 0.0467 TA 0.0837 TC 0.0683 TG 0.0449 TT 0.123 # l= 2 # Values AAA 0.0519 AAC 0.0161 AAG 0.0172 AAT 0.0376 ACA 0.0142 ACC 0.00683 ACG 0.0159 ACT 0.0097 AGA 0.0203 AGC 0.00696 AGG 0.00919 AGT 0.0097 ATA 0.0342 ATC 0.0193 ATG 0.013 ATT 0.0376 CAA 0.0159 CAC 0.00985 CAG 0.00614 CAT 0.013 CCA 0.0081 CCC 0.00688 CCG 0.00812 CCT 0.00919 CGA 0.0215 CGC 0.0113 CGG 0.00812 CGT 0.0159 CTA 0.00814 CTC 0.0146 CTG 0.00614 CTT 0.0172 GAA 0.0263 GAC 0.00807 GAG 0.0146 GAT 0.0193 GCA 0.0088 GCC 0.00578 GCG 0.0113 GCT 0.00696 GGA 0.0128 GGC 0.00578 GGG 0.00688 GGT 0.00683 GTA 0.0126 GTC 0.00807 GTG 0.00986 GTT 0.0161 TAA 0.0288 TAC 0.0126 TAG 0.00814 TAT 0.0342 TCA 0.0138 TCC 0.0128 TCG 0.0215 TCT 0.0203 TGA 0.0138 TGC 0.0088 TGG 0.0081 TGT 0.0142 TTA 0.0288 TTC 0.0263 TTG 0.0159 TTT 0.0519 # l= 3 # Values AAAA 0.0234 AAAC 0.00608 AAAG 0.00741 AAAT 0.015 AACA 0.00487 AACC 0.00215 AACG 0.00565 AACT 0.00346 AAGA 0.00783 AAGC 0.00233 AAGG 0.00329 AAGT 0.00378 AATA 0.0125 AATC 0.00616 AATG 0.00484 AATT 0.0142 ACAA 0.00515 ACAC 0.00317 ACAG 0.00205 ACAT 0.00386 ACCA 0.00182 ACCC 0.00111 ACCG 0.00227 ACCT 0.00162 ACGA 0.00628 ACGC 0.00306 ACGG 0.00237 ACGT 0.00419 ACTA 0.00204 ACTC 0.00231 ACTG 0.00156 ACTT 0.00379 AGAA 0.00849 AGAC 0.00183 AGAG 0.00532 AGAT 0.00467 AGCA 0.00198 AGCC 0.00115 AGCG 0.00228 AGCT 0.00155 AGGA 0.00406 AGGC 0.00131 AGGG 0.0022 AGGT 0.00162 AGTA 0.00276 AGTC 0.00154 AGTG 0.00194 AGTT 0.00345 ATAA 0.0118 ATAC 0.00447 ATAG 0.00311 ATAT 0.0148 ATCA 0.00446 ATCC 0.0032 ATCG 0.00697 ATCT 0.00467 ATGA 0.00442 ATGC 0.0024 ATGG 0.00231 ATGT 0.00386 ATTA 0.0107 ATTC 0.00688 ATTG 0.00503 ATTT 0.015 CAAA 0.00552 CAAC 0.00293 CAAG 0.00242 CAAT 0.00503 CACA 0.00247 CACC 0.00179 CACG 0.00366 CACT 0.00194 CAGA 0.0021 CAGC 0.00126 CAGG 0.00121 CAGT 0.00157 CATA 0.00337 CATC 0.00317 CATG 0.00162 CATT 0.00484 CCAA 0.00253 CCAC 0.00209 CCAG 0.00117 CCAT 0.00231 CCCA 0.00111 CCCC 0.002 CCCG 0.00157 CCCT 0.0022 CCGA 0.00246 CCGC 0.00192 CCGG 0.00137 CCGT 0.00237 CCTA 0.00125 CCTC 0.00343 CCTG 0.00121 CCTT 0.00329 CGAA 0.00681 CGAC 0.00293 CGAG 0.00476 CGAT 0.00697 CGCA 0.00237 CGCC 0.0019 CGCG 0.00477 CGCT 0.00228 CGGA 0.00245 CGGC 0.00183 CGGG 0.00157 CGGT 0.00227 CGTA 0.00362 CGTC 0.00297 CGTG 0.00366 CGTT 0.00565 CTAA 0.00242 CTAC 0.00163 CTAG 0.000971 CTAT 0.00311 CTCA 0.0016 CTCC 0.00295 CTCG 0.00476 CTCT 0.00532 CTGA 0.00156 CTGC 0.00135 CTGG 0.00117 CTGT 0.00205 CTTA 0.00283 CTTC 0.00456 CTTG 0.00242 CTTT 0.00741 GAAA 0.0116 GAAC 0.00334 GAAG 0.00456 GAAT 0.00688 GACA 0.00238 GACC 0.00118 GACG 0.00297 GACT 0.00154 GAGA 0.0069 GAGC 0.002 GAGG 0.00343 GAGT 0.00231 GATA 0.00569 GATC 0.00428 GATG 0.00317 GATT 0.00616 GCAA 0.00322 GCAC 0.00182 GCAG 0.00135 GCAT 0.0024 GCCA 0.00168 GCCC 0.000953 GCCG 0.00183 GCCT 0.00131 GCGA 0.0039 GCGC 0.00244 GCGG 0.00192 GCGT 0.00306 GCTA 0.00137 GCTC 0.002 GCTG 0.00126 GCTT 0.00233 GGAA 0.00523 GGAC 0.00142 GGAG 0.00296 GGAT 0.0032 GGCA 0.00146 GGCC 0.00125 GGCG 0.0019 GGCT 0.00115 GGGA 0.00281 GGGC 0.000954 GGGG 0.002 GGGT 0.00111 GGTA 0.00171 GGTC 0.00118 GGTG 0.00179 GGTT 0.00215 GTAA 0.00435 GTAC 0.00215 GTAG 0.00163 GTAT 0.00447 GTCA 0.00189 GTCC 0.00142 GTCG 0.00293 GTCT 0.00183 GTGA 0.00278 GTGC 0.00182 GTGG 0.00209 GTGT 0.00317 GTTA 0.00377 GTTC 0.00334 GTTG 0.00293 GTTT 0.00608 TAAA 0.0114 TAAC 0.00377 TAAG 0.00283 TAAT 0.0107 TACA 0.00451 TACC 0.00171 TACG 0.00362 TACT 0.00276 TAGA 0.00347 TAGC 0.00137 TAGG 0.00125 TAGT 0.00204 TATA 0.0127 TATC 0.00569 TATG 0.00337 TATT 0.0125 TCAA 0.005 TCAC 0.00277 TCAG 0.00156 TCAT 0.00442 TCCA 0.00349 TCCC 0.00281 TCCG 0.00245 TCCT 0.00406 TCGA 0.00884 TCGC 0.0039 TCGG 0.00246 TCGT 0.00628 TCTA 0.00347 TCTC 0.0069 TCTG 0.0021 TCTT 0.00783 TGAA 0.00582 TGAC 0.00189 TGAG 0.0016 TGAT 0.00446 TGCA 0.003 TGCC 0.00146 TGCG 0.00236 TGCT 0.00198 TGGA 0.00349 TGGC 0.00168 TGGG 0.00111 TGGT 0.00182 TGTA 0.00451 TGTC 0.00238 TGTG 0.00247 TGTT 0.00487 TTAA 0.0102 TTAC 0.00435 TTAG 0.00242 TTAT 0.0118 TTCA 0.00582 TTCC 0.00523 TTCG 0.00682 TTCT 0.00849 TTGA 0.005 TTGC 0.00322 TTGG 0.00253 TTGT 0.00515 TTTA 0.0114 TTTC 0.0116 TTTG 0.00552 TTTT 0.0234 # l= 4 # Values AAAAA 0.0119 AAAAC 0.00201 AAAAG 0.00316 AAAAT 0.00631 AAACA 0.00188 AAACC 0.000662 AAACG 0.0021 AAACT 0.00144 AAAGA 0.00357 AAAGC 0.000821 AAAGG 0.00137 AAAGT 0.00166 AAATA 0.00526 AAATC 0.00216 AAATG 0.00192 AAATT 0.00566 AACAA 0.00204 AACAC 0.000853 AACAG 0.000729 AACAT 0.00125 AACCA 0.000561 AACCC 0.000316 AACCG 0.000754 AACCT 0.000522 AACGA 0.00246 AACGC 0.000933 AACGG 0.000857 AACGT 0.0014 AACTA 0.000763 AACTC 0.00075 AACTG 0.000584 AACTT 0.00136 AAGAA 0.00393 AAGAC 0.000561 AAGAG 0.00157 AAGAT 0.00177 AAGCA 0.000692 AAGCC 0.000304 AAGCG 0.000785 AAGCT 0.000548 AAGGA 0.0016 AAGGC 0.00037 AAGGG 0.000771 AAGGT 0.00055 AAGTA 0.00118 AAGTC 0.000498 AAGTG 0.00075 AAGTT 0.00136 AATAA 0.00509 AATAC 0.0014 AATAG 0.00116 AATAT 0.00481 AATCA 0.00155 AATCC 0.000881 AATCG 0.00216 AATCT 0.00157 AATGA 0.00174 AATGC 0.000785 AATGG 0.000888 AATGT 0.00142 AATTA 0.00422 AATTC 0.00233 AATTG 0.00198 AATTT 0.00566 ACAAA 0.0019 ACAAC 0.000805 ACAAG 0.000767 ACAAT 0.00168 ACACA 0.001 ACACC 0.000426 ACACG 0.00119 ACACT 0.000551 ACAGA 0.000755 ACAGC 0.000343 ACAGG 0.000411 ACAGT 0.000544 ACATA 0.00127 ACATC 0.000689 ACATG 0.000482 ACATT 0.00142 ACCAA 0.000574 ACCAC 0.000465 ACCAG 0.000294 ACCAT 0.000492 ACCCA 0.000231 ACCCC 0.000263 ACCCG 0.000292 ACCCT 0.000328 ACCGA 0.00078 ACCGC 0.000458 ACCGG 0.00041 ACCGT 0.000624 ACCTA 0.000324 ACCTC 0.000443 ACCTG 0.000303 ACCTT 0.00055 ACGAA 0.00212 ACGAC 0.000782 ACGAG 0.0014 ACGAT 0.00198 ACGCA 0.000698 ACGCC 0.000383 ACGCG 0.0014 ACGCT 0.000579 ACGGA 0.000835 ACGGC 0.000428 ACGGG 0.000482 ACGGT 0.000624 ACGTA 0.00119 ACGTC 0.000613 ACGTG 0.000986 ACGTT 0.0014 ACTAA 0.0006 ACTAC 0.000409 ACTAG 0.000251 ACTAT 0.000779 ACTCA 0.000327 ACTCC 0.000312 ACTCG 0.00106 ACTCT 0.000611 ACTGA 0.000422 ACTGC 0.000298 ACTGG 0.000302 ACTGT 0.000544 ACTTA 0.000782 ACTTC 0.000673 ACTTG 0.000672 ACTTT 0.00166 AGAAA 0.00408 AGAAC 0.000776 AGAAG 0.00164 AGAAT 0.00199 AGACA 0.000612 AGACC 0.000211 AGACG 0.000645 AGACT 0.000365 AGAGA 0.00324 AGAGC 0.00046 AGAGG 0.00101 AGAGT 0.000611 AGATA 0.00155 AGATC 0.000812 AGATG 0.000728 AGATT 0.00157 AGCAA 0.00078 AGCAC 0.000341 AGCAG 0.000347 AGCAT 0.000507 AGCCA 0.000351 AGCCC 0.00016 AGCCG 0.000376 AGCCT 0.000266 AGCGA 0.000881 AGCGC 0.00039 AGCGG 0.000433 AGCGT 0.000579 AGCTA 0.000337 AGCTC 0.000352 AGCTG 0.000311 AGCTT 0.000548 AGGAA 0.00177 AGGAC 0.000321 AGGAG 0.00104 AGGAT 0.000925 AGGCA 0.000383 AGGCC 0.000212 AGGCG 0.00045 AGGCT 0.000266 AGGGA 0.000999 AGGGC 0.000218 AGGGG 0.000654 AGGGT 0.000328 AGGTA 0.000458 AGGTC 0.000239 AGGTG 0.000402 AGGTT 0.000522 AGTAA 0.00101 AGTAC 0.000366 AGTAG 0.00047 AGTAT 0.000917 AGTCA 0.000405 AGTCC 0.000194 AGTCG 0.000572 AGTCT 0.000365 AGTGA 0.000651 AGTGC 0.000287 AGTGG 0.000453 AGTGT 0.000551 AGTTA 0.000834 AGTTC 0.000538 AGTTG 0.00064 AGTTT 0.00144 ATAAA 0.00488 ATAAC 0.00129 ATAAG 0.00109 ATAAT 0.00456 ATACA 0.00177 ATACC 0.00053 ATACG 0.00126 ATACT 0.000917 ATAGA 0.00142 ATAGC 0.000456 ATAGG 0.00046 ATAGT 0.000779 ATATA 0.00679 ATATC 0.0019 ATATG 0.00131 ATATT 0.00481 ATCAA 0.00163 ATCAC 0.000789 ATCAG 0.000507 ATCAT 0.00153 ATCCA 0.000933 ATCCC 0.000595 ATCCG 0.000747 ATCCT 0.000925 ATCGA 0.00304 ATCGC 0.00106 ATCGG 0.000887 ATCGT 0.00198 ATCTA 0.00108 ATCTC 0.00124 ATCTG 0.000581 ATCTT 0.00177 ATGAA 0.0019 ATGAC 0.000502 ATGAG 0.000499 ATGAT 0.00153 ATGCA 0.000917 ATGCC 0.000302 ATGCG 0.000672 ATGCT 0.000507 ATGGA 0.00109 ATGGC 0.000407 ATGGG 0.000322 ATGGT 0.000492 ATGTA 0.00152 ATGTC 0.000486 ATGTG 0.000602 ATGTT 0.00125 ATTAA 0.00383 ATTAC 0.00145 ATTAG 0.000883 ATTAT 0.00456 ATTCA 0.00172 ATTCC 0.00118 ATTCG 0.00199 ATTCT 0.00199 ATTGA 0.00166 ATTGC 0.000905 ATTGG 0.000784 ATTGT 0.00168 ATTTA 0.004 ATTTC 0.00298 ATTTG 0.00171 ATTTT 0.00631 CAAAA 0.00198 CAAAC 0.000893 CAAAG 0.000938 CAAAT 0.00171 CAACA 0.000832 CAACC 0.000486 CAACG 0.000974 CAACT 0.00064 CAAGA 0.000878 CAAGC 0.00042 CAAGG 0.000453 CAAGT 0.000672 CAATA 0.00137 CAATC 0.000924 CAATG 0.000753 CAATT 0.00198 CACAA 0.000726 CACAC 0.000775 CACAG 0.000371 CACAT 0.000602 CACCA 0.000443 CACCC 0.00035 CACCG 0.000592 CACCT 0.000402 CACGA 0.0012 CACGC 0.00086 CACGG 0.000611 CACGT 0.000986 CACTA 0.000306 CACTC 0.000542 CACTG 0.000345 CACTT 0.00075 CAGAA 0.000743 CAGAC 0.00029 CAGAG 0.000486 CAGAT 0.000581 CAGCA 0.000307 CAGCC 0.000292 CAGCG 0.000351 CAGCT 0.000311 CAGGA 0.000422 CAGGC 0.000227 CAGGG 0.000258 CAGGT 0.000303 CAGTA 0.000336 CAGTC 0.000301 CAGTG 0.000345 CAGTT 0.000584 CATAA 0.0011 CATAC 0.000585 CATAG 0.000368 CATAT 0.00131 CATCA 0.000658 CATCC 0.000647 CATCG 0.00114 CATCT 0.000728 CATGA 0.00048 CATGC 0.000365 CATGG 0.000292 CATGT 0.000482 CATTA 0.00114 CATTC 0.00103 CATTG 0.000753 CATTT 0.00192 CCAAA 0.000716 CCAAC 0.000583 CCAAG 0.000446 CCAAT 0.000784 CCACA 0.000305 CCACC 0.000574 CCACG 0.000759 CCACT 0.000453 CCAGA 0.000352 CCAGC 0.000277 CCAGG 0.000239 CCAGT 0.000302 CCATA 0.000416 CCATC 0.000717 CCATG 0.000292 CCATT 0.000888 CCCAA 0.000308 CCCAC 0.000318 CCCAG 0.000159 CCCAT 0.000322 CCCCA 0.00025 CCCCC 0.000675 CCCCG 0.000421 CCCCT 0.000654 CCCGA 0.000457 CCCGC 0.000366 CCCGG 0.000265 CCCGT 0.000482 CCCTA 0.000216 CCCTC 0.000955 CCCTG 0.000258 CCCTT 0.000771 CCGAA 0.000578 CCGAC 0.000428 CCGAG 0.000571 CCGAT 0.000887 CCGCA 0.000318 CCGCC 0.000436 CCGCG 0.000729 CCGCT 0.000433 CCGGA 0.000347 CCGGC 0.000351 CCGGG 0.000265 CCGGT 0.00041 CCGTA 0.0004 CCGTC 0.000498 CCGTG 0.000611 CCGTT 0.000857 CCTAA 0.000355 CCTAC 0.000272 CCTAG 0.000167 CCTAT 0.00046 CCTCA 0.000259 CCTCC 0.00111 CCTCG 0.00105 CCTCT 0.00101 CCTGA 0.000277 CCTGC 0.000284 CCTGG 0.000239 CCTGT 0.000411 CCTTA 0.000423 CCTTC 0.00105 CCTTG 0.000453 CCTTT 0.00137 CGAAA 0.00258 CGAAC 0.00109 CGAAG 0.00115 CGAAT 0.00199 CGACA 0.000725 CGACC 0.000499 CGACG 0.00114 CGACT 0.000572 CGAGA 0.00172 CGAGC 0.000927 CGAGG 0.00105 CGAGT 0.00106 CGATA 0.00183 CGATC 0.00185 CGATG 0.00114 CGATT 0.00216 CGCAA 0.000788 CGCAC 0.000546 CGCAG 0.000359 CGCAT 0.000672 CGCCA 0.000525 CGCCC 0.000338 CGCCG 0.000591 CGCCT 0.00045 CGCGA 0.00156 CGCGC 0.00108 CGCGG 0.000729 CGCGT 0.0014 CGCTA 0.000392 CGCTC 0.000756 CGCTG 0.000351 CGCTT 0.000785 CGGAA 0.00084 CGGAC 0.000342 CGGAG 0.00052 CGGAT 0.000747 CGGCA 0.000387 CGGCC 0.000476 CGGCG 0.000591 CGGCT 0.000376 CGGGA 0.00055 CGGGC 0.000306 CGGGG 0.000421 CGGGT 0.000292 CGGTA 0.000509 CGGTC 0.000415 CGGTG 0.000592 CGGTT 0.000754 CGTAA 0.00119 CGTAC 0.000696 CGTAG 0.000474 CGTAT 0.00126 CGTCA 0.000578 CGTCC 0.000612 CGTCG 0.00114 CGTCT 0.000645 CGTGA 0.000973 CGTGC 0.000735 CGTGG 0.000759 CGTGT 0.00119 CGTTA 0.00115 CGTTC 0.00142 CGTTG 0.000974 CGTTT 0.0021 CTAAA 0.000861 CTAAC 0.000427 CTAAG 0.000252 CTAAT 0.000883 CTACA 0.000393 CTACC 0.000293 CTACG 0.000474 CTACT 0.00047 CTAGA 0.000366 CTAGC 0.000186 CTAGG 0.000167 CTAGT 0.000251 CTATA 0.000859 CTATC 0.000723 CTATG 0.000368 CTATT 0.00116 CTCAA 0.000533 CTCAC 0.000387 CTCAG 0.00018 CTCAT 0.000499 CTCCA 0.000581 CTCCC 0.000819 CTCCG 0.00052 CTCCT 0.00104 CTCGA 0.00178 CTCGC 0.00101 CTCGG 0.000571 CTCGT 0.0014 CTCTA 0.000552 CTCTC 0.00271 CTCTG 0.000486 CTCTT 0.00157 CTGAA 0.000594 CTGAC 0.000281 CTGAG 0.00018 CTGAT 0.000507 CTGCA 0.000347 CTGCC 0.000302 CTGCG 0.000359 CTGCT 0.000347 CTGGA 0.000424 CTGGC 0.000294 CTGGG 0.000159 CTGGT 0.000294 CTGTA 0.00052 CTGTC 0.000432 CTGTG 0.000371 CTGTT 0.000729 CTTAA 0.000967 CTTAC 0.000529 CTTAG 0.000252 CTTAT 0.00109 CTTCA 0.000655 CTTCC 0.00112 CTTCG 0.00115 CTTCT 0.00164 CTTGA 0.000681 CTTGC 0.000528 CTTGG 0.000446 CTTGT 0.000767 CTTTA 0.00119 CTTTC 0.00213 CTTTG 0.000938 CTTTT 0.00316 GAAAA 0.00465 GAAAC 0.00181 GAAAG 0.00213 GAAAT 0.00298 GAACA 0.000962 GAACC 0.000419 GAACG 0.00142 GAACT 0.000538 GAAGA 0.00218 GAAGC 0.000662 GAAGG 0.00105 GAAGT 0.000673 GAATA 0.00209 GAATC 0.00144 GAATG 0.00103 GAATT 0.00233 GACAA 0.00088 GACAC 0.00058 GACAG 0.000432 GACAT 0.000486 GACCA 0.000335 GACCC 0.000192 GACCG 0.000415 GACCT 0.000239 GACGA 0.00128 GACGC 0.000578 GACGG 0.000498 GACGT 0.000613 GACTA 0.000315 GACTC 0.000422 GACTG 0.000301 GACTT 0.000498 GAGAA 0.00232 GAGAC 0.000627 GAGAG 0.00271 GAGAT 0.00124 GAGCA 0.000566 GAGCC 0.000323 GAGCG 0.000756 GAGCT 0.000352 GAGGA 0.00152 GAGGC 0.000512 GAGGG 0.000955 GAGGT 0.000443 GAGTA 0.000593 GAGTC 0.000422 GAGTG 0.000542 GAGTT 0.00075 GATAA 0.00214 GATAC 0.000928 GATAG 0.000723 GATAT 0.0019 GATCA 0.000879 GATCC 0.000736 GATCG 0.00185 GATCT 0.000812 GATGA 0.00115 GATGC 0.00061 GATGG 0.000717 GATGT 0.000689 GATTA 0.00164 GATTC 0.00144 GATTG 0.000924 GATTT 0.00216 GCAAA 0.00112 GCAAC 0.000674 GCAAG 0.000528 GCAAT 0.000905 GCACA 0.00051 GCACC 0.000292 GCACG 0.000735 GCACT 0.000287 GCAGA 0.000426 GCAGC 0.000346 GCAGG 0.000284 GCAGT 0.000298 GCATA 0.000638 GCATC 0.00061 GCATG 0.000365 GCATT 0.000785 GCCAA 0.000518 GCCAC 0.000462 GCCAG 0.000294 GCCAT 0.000407 GCCCA 0.000178 GCCCC 0.000251 GCCCG 0.000306 GCCCT 0.000218 GCCGA 0.000548 GCCGC 0.000502 GCCGG 0.000351 GCCGT 0.000428 GCCTA 0.000204 GCCTC 0.000512 GCCTG 0.000227 GCCTT 0.00037 GCGAA 0.00122 GCGAC 0.000607 GCGAG 0.00101 GCGAT 0.00106 GCGCA 0.00057 GCGCC 0.000404 GCGCG 0.00108 GCGCT 0.00039 GCGGA 0.00059 GCGGC 0.000502 GCGGG 0.000366 GCGGT 0.000458 GCGTA 0.000689 GCGTC 0.000578 GCGTG 0.00086 GCGTT 0.000933 GCTAA 0.000404 GCTAC 0.000327 GCTAG 0.000186 GCTAT 0.000456 GCTCA 0.000262 GCTCC 0.00035 GCTCG 0.000927 GCTCT 0.00046 GCTGA 0.000296 GCTGC 0.000346 GCTGG 0.000277 GCTGT 0.000343 GCTTA 0.000426 GCTTC 0.000662 GCTTG 0.00042 GCTTT 0.000821 GGAAA 0.00221 GGAAC 0.000719 GGAAG 0.00112 GGAAT 0.00118 GGACA 0.000428 GGACC 0.000183 GGACG 0.000612 GGACT 0.000194 GGAGA 0.00119 GGAGC 0.00035 GGAGG 0.00111 GGAGT 0.000312 GGATA 0.000936 GGATC 0.000736 GGATG 0.000647 GGATT 0.000881 GGCAA 0.000552 GGCAC 0.000307 GGCAG 0.000302 GGCAT 0.000302 GGCCA 0.000369 GGCCC 0.000198 GGCCG 0.000476 GGCCT 0.000212 GGCGA 0.000681 GGCGC 0.000404 GGCGG 0.000436 GGCGT 0.000383 GGCTA 0.000235 GGCTC 0.000323 GGCTG 0.000292 GGCTT 0.000304 GGGAA 0.00106 GGGAC 0.000332 GGGAG 0.000819 GGGAT 0.000595 GGGCA 0.000258 GGGCC 0.000198 GGGCG 0.000338 GGGCT 0.00016 GGGGA 0.000811 GGGGC 0.000251 GGGGG 0.000675 GGGGT 0.000263 GGGTA 0.000255 GGGTC 0.000192 GGGTG 0.00035 GGGTT 0.000316 GGTAA 0.000625 GGTAC 0.000258 GGTAG 0.000293 GGTAT 0.00053 GGTCA 0.000288 GGTCC 0.000183 GGTCG 0.000499 GGTCT 0.000211 GGTGA 0.000493 GGTGC 0.000292 GGTGG 0.000574 GGTGT 0.000426 GGTTA 0.000588 GGTTC 0.000419 GGTTG 0.000486 GGTTT 0.000662 GTAAA 0.00163 GTAAC 0.000735 GTAAG 0.000529 GTAAT 0.00145 GTACA 0.000828 GTACC 0.000258 GTACG 0.000696 GTACT 0.000366 GTAGA 0.000623 GTAGC 0.000327 GTAGG 0.000272 GTAGT 0.000409 GTATA 0.00156 GTATC 0.000928 GTATG 0.000585 GTATT 0.0014 GTCAA 0.000621 GTCAC 0.000483 GTCAG 0.000281 GTCAT 0.000502 GTCCA 0.000422 GTCCC 0.000332 GTCCG 0.000342 GTCCT 0.000321 GTCGA 0.00112 GTCGC 0.000607 GTCGG 0.000428 GTCGT 0.000782 GTCTA 0.000355 GTCTC 0.000627 GTCTG 0.00029 GTCTT 0.000561 GTGAA 0.00112 GTGAC 0.000483 GTGAG 0.000387 GTGAT 0.000789 GTGCA 0.00063 GTGCC 0.000307 GTGCG 0.000546 GTGCT 0.000341 GTGGA 0.000844 GTGGC 0.000462 GTGGG 0.000318 GTGGT 0.000465 GTGTA 0.000959 GTGTC 0.00058 GTGTG 0.000775 GTGTT 0.000853 GTTAA 0.00132 GTTAC 0.000735 GTTAG 0.000427 GTTAT 0.00129 GTTCA 0.000752 GTTCC 0.000719 GTTCG 0.00109 GTTCT 0.000776 GTTGA 0.00087 GTTGC 0.000674 GTTGG 0.000583 GTTGT 0.000805 GTTTA 0.00137 GTTTC 0.00181 GTTTG 0.000893 GTTTT 0.00201 TAAAA 0.00485 TAAAC 0.00137 TAAAG 0.00119 TAAAT 0.004 TAACA 0.0012 TAACC 0.000588 TAACG 0.00115 TAACT 0.000834 TAAGA 0.0012 TAAGC 0.000426 TAAGG 0.000423 TAAGT 0.000782 TAATA 0.00373 TAATC 0.00164 TAATG 0.00114 TAATT 0.00422 TACAA 0.00151 TACAC 0.000959 TACAG 0.00052 TACAT 0.00152 TACCA 0.000484 TACCC 0.000255 TACCG 0.000509 TACCT 0.000458 TACGA 0.00134 TACGC 0.000689 TACGG 0.0004 TACGT 0.00119 TACTA 0.000656 TACTC 0.000593 TACTG 0.000336 TACTT 0.00118 TAGAA 0.00149 TAGAC 0.000355 TAGAG 0.000552 TAGAT 0.00108 TAGCA 0.00041 TAGCC 0.000235 TAGCG 0.000392 TAGCT 0.000337 TAGGA 0.00051 TAGGC 0.000204 TAGGG 0.000216 TAGGT 0.000324 TAGTA 0.000656 TAGTC 0.000315 TAGTG 0.000306 TAGTT 0.000763 TATAA 0.00349 TATAC 0.00156 TATAG 0.000859 TATAT 0.00679 TATCA 0.00137 TATCC 0.000936 TATCG 0.00183 TATCT 0.00155 TATGA 0.00105 TATGC 0.000638 TATGG 0.000416 TATGT 0.00127 TATTA 0.00373 TATTC 0.00209 TATTG 0.00137 TATTT 0.00526 TCAAA 0.00178 TCAAC 0.00087 TCAAG 0.000681 TCAAT 0.00166 TCACA 0.000658 TCACC 0.000493 TCACG 0.000973 TCACT 0.000651 TCAGA 0.000567 TCAGC 0.000296 TCAGG 0.000277 TCAGT 0.000422 TCATA 0.00105 TCATC 0.00115 TCATG 0.00048 TCATT 0.00174 TCCAA 0.00113 TCCAC 0.000844 TCCAG 0.000424 TCCAT 0.00109 TCCCA 0.000449 TCCCC 0.000811 TCCCG 0.00055 TCCCT 0.000999 TCCGA 0.000678 TCCGC 0.00059 TCCGG 0.000347 TCCGT 0.000835 TCCTA 0.00051 TCCTC 0.00152 TCCTG 0.000422 TCCTT 0.0016 TCGAA 0.0029 TCGAC 0.00112 TCGAG 0.00178 TCGAT 0.00304 TCGCA 0.00078 TCGCC 0.000681 TCGCG 0.00156 TCGCT 0.000881 TCGGA 0.000678 TCGGC 0.000548 TCGGG 0.000457 TCGGT 0.00078 TCGTA 0.00134 TCGTC 0.00128 TCGTG 0.0012 TCGTT 0.00246 TCTAA 0.00106 TCTAC 0.000623 TCTAG 0.000366 TCTAT 0.00142 TCTCA 0.000753 TCTCC 0.00119 TCTCG 0.00172 TCTCT 0.00324 TCTGA 0.000567 TCTGC 0.000426 TCTGG 0.000352 TCTGT 0.000755 TCTTA 0.0012 TCTTC 0.00218 TCTTG 0.000878 TCTTT 0.00357 TGAAA 0.00269 TGAAC 0.000752 TGAAG 0.000655 TGAAT 0.00172 TGACA 0.000614 TGACC 0.000288 TGACG 0.000578 TGACT 0.000405 TGAGA 0.000753 TGAGC 0.000262 TGAGG 0.000259 TGAGT 0.000327 TGATA 0.00137 TGATC 0.000879 TGATG 0.000658 TGATT 0.00155 TGCAA 0.0011 TGCAC 0.00063 TGCAG 0.000347 TGCAT 0.000917 TGCCA 0.000435 TGCCC 0.000258 TGCCG 0.000387 TGCCT 0.000383 TGCGA 0.00078 TGCGC 0.00057 TGCGG 0.000318 TGCGT 0.000698 TGCTA 0.00041 TGCTC 0.000566 TGCTG 0.000307 TGCTT 0.000692 TGGAA 0.00155 TGGAC 0.000422 TGGAG 0.000581 TGGAT 0.000933 TGGCA 0.000435 TGGCC 0.000369 TGGCG 0.000525 TGGCT 0.000351 TGGGA 0.000449 TGGGC 0.000178 TGGGG 0.00025 TGGGT 0.000231 TGGTA 0.000484 TGGTC 0.000335 TGGTG 0.000443 TGGTT 0.000561 TGTAA 0.00153 TGTAC 0.000828 TGTAG 0.000393 TGTAT 0.00177 TGTCA 0.000614 TGTCC 0.000428 TGTCG 0.000725 TGTCT 0.000612 TGTGA 0.000658 TGTGC 0.00051 TGTGG 0.000305 TGTGT 0.001 TGTTA 0.0012 TGTTC 0.000962 TGTTG 0.000832 TGTTT 0.00188 TTAAA 0.00404 TTAAC 0.00132 TTAAG 0.000967 TTAAT 0.00383 TTACA 0.00153 TTACC 0.000625 TTACG 0.00119 TTACT 0.00101 TTAGA 0.00106 TTAGC 0.000404 TTAGG 0.000355 TTAGT 0.0006 TTATA 0.00349 TTATC 0.00214 TTATG 0.0011 TTATT 0.00509 TTCAA 0.00221 TTCAC 0.00112 TTCAG 0.000594 TTCAT 0.0019 TTCCA 0.00155 TTCCC 0.00106 TTCCG 0.00084 TTCCT 0.00177 TTCGA 0.0029 TTCGC 0.00122 TTCGG 0.000578 TTCGT 0.00212 TTCTA 0.00149 TTCTC 0.00232 TTCTG 0.000743 TTCTT 0.00393 TTGAA 0.00221 TTGAC 0.000621 TTGAG 0.000533 TTGAT 0.00163 TTGCA 0.0011 TTGCC 0.000552 TTGCG 0.000788 TTGCT 0.00078 TTGGA 0.00113 TTGGC 0.000518 TTGGG 0.000308 TTGGT 0.000574 TTGTA 0.00151 TTGTC 0.00088 TTGTG 0.000726 TTGTT 0.00204 TTTAA 0.00404 TTTAC 0.00163 TTTAG 0.000861 TTTAT 0.00488 TTTCA 0.00269 TTTCC 0.00221 TTTCG 0.00258 TTTCT 0.00408 TTTGA 0.00178 TTTGC 0.00112 TTTGG 0.000716 TTTGT 0.0019 TTTTA 0.00485 TTTTC 0.00465 TTTTG 0.00198 TTTTT 0.0119 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.5097 AAAAC 0.08599 AAAAG 0.1349 AAAAT 0.2694 AAACA 0.3086 AAACC 0.1087 AAACG 0.3455 AAACT 0.2372 AAAGA 0.4813 AAAGC 0.1107 AAAGG 0.1846 AAAGT 0.2234 AAATA 0.3508 AAATC 0.144 AAATG 0.1279 AAATT 0.3773 AACAA 0.4183 AACAC 0.1753 AACAG 0.1498 AACAT 0.2566 AACCA 0.2606 AACCC 0.1469 AACCG 0.3502 AACCT 0.2424 AACGA 0.4355 AACGC 0.1651 AACGG 0.1518 AACGT 0.2475 AACTA 0.221 AACTC 0.217 AACTG 0.169 AACTT 0.3931 AAGAA 0.5023 AAGAC 0.07167 AAGAG 0.2005 AAGAT 0.2255 AAGCA 0.2971 AAGCC 0.1305 AAGCG 0.3369 AAGCT 0.2355 AAGGA 0.4864 AAGGC 0.1123 AAGGG 0.2343 AAGGT 0.167 AAGTA 0.3116 AAGTC 0.1316 AAGTG 0.198 AAGTT 0.3587 AATAA 0.4086 AATAC 0.1121 AATAG 0.09344 AATAT 0.3858 AATCA 0.251 AATCC 0.1431 AATCG 0.3502 AATCT 0.2556 AATGA 0.3602 AATGC 0.1622 AATGG 0.1834 AATGT 0.2941 AATTA 0.2976 AATTC 0.164 AATTG 0.1396 AATTT 0.3988 ACAAA 0.3694 ACAAC 0.1563 ACAAG 0.1488 ACAAT 0.3255 ACACA 0.3158 ACACC 0.1346 ACACG 0.3758 ACACT 0.1738 ACAGA 0.368 ACAGC 0.1671 ACAGG 0.2001 ACAGT 0.2648 ACATA 0.3279 ACATC 0.1785 ACATG 0.1248 ACATT 0.3688 ACCAA 0.3148 ACCAC 0.2548 ACCAG 0.1609 ACCAT 0.2695 ACCCA 0.2073 ACCCC 0.2363 ACCCG 0.262 ACCCT 0.2944 ACCGA 0.3434 ACCGC 0.2017 ACCGG 0.1805 ACCGT 0.2745 ACCTA 0.2 ACCTC 0.2737 ACCTG 0.187 ACCTT 0.3393 ACGAA 0.3368 ACGAC 0.1244 ACGAG 0.2233 ACGAT 0.3155 ACGCA 0.2282 ACGCC 0.1253 ACGCG 0.4574 ACGCT 0.1891 ACGGA 0.3524 ACGGC 0.1807 ACGGG 0.2036 ACGGT 0.2633 ACGTA 0.285 ACGTC 0.1462 ACGTG 0.2353 ACGTT 0.3335 ACTAA 0.2943 ACTAC 0.2005 ACTAG 0.1233 ACTAT 0.3819 ACTCA 0.1416 ACTCC 0.1351 ACTCG 0.4586 ACTCT 0.2647 ACTGA 0.2692 ACTGC 0.1904 ACTGG 0.1932 ACTGT 0.3472 ACTTA 0.2067 ACTTC 0.1779 ACTTG 0.1777 ACTTT 0.4377 AGAAA 0.4809 AGAAC 0.09139 AGAAG 0.1931 AGAAT 0.2346 AGACA 0.3337 AGACC 0.1153 AGACG 0.352 AGACT 0.199 AGAGA 0.6084 AGAGC 0.08636 AGAGG 0.1904 AGAGT 0.1148 AGATA 0.3325 AGATC 0.174 AGATG 0.156 AGATT 0.3375 AGCAA 0.395 AGCAC 0.1728 AGCAG 0.1756 AGCAT 0.2566 AGCCA 0.3046 AGCCC 0.1386 AGCCG 0.3258 AGCCT 0.2309 AGCGA 0.386 AGCGC 0.1708 AGCGG 0.1899 AGCGT 0.2534 AGCTA 0.2173 AGCTC 0.2275 AGCTG 0.2011 AGCTT 0.3541 AGGAA 0.4374 AGGAC 0.07919 AGGAG 0.2553 AGGAT 0.2282 AGGCA 0.292 AGGCC 0.1617 AGGCG 0.3433 AGGCT 0.203 AGGGA 0.4543 AGGGC 0.09931 AGGGG 0.2974 AGGGT 0.1491 AGGTA 0.2827 AGGTC 0.1473 AGGTG 0.2478 AGGTT 0.3222 AGTAA 0.3656 AGTAC 0.1323 AGTAG 0.1702 AGTAT 0.3318 AGTCA 0.2637 AGTCC 0.1261 AGTCG 0.3727 AGTCT 0.2375 AGTGA 0.3353 AGTGC 0.148 AGTGG 0.2332 AGTGT 0.2836 AGTTA 0.2414 AGTTC 0.1558 AGTTG 0.1851 AGTTT 0.4177 ATAAA 0.4131 ATAAC 0.1088 ATAAG 0.09197 ATAAT 0.3861 ATACA 0.3948 ATACC 0.1186 ATACG 0.2815 ATACT 0.2051 ATAGA 0.4557 ATAGC 0.1463 ATAGG 0.1478 ATAGT 0.2501 ATATA 0.4583 ATATC 0.1283 ATATG 0.08867 ATATT 0.3247 ATCAA 0.3668 ATCAC 0.177 ATCAG 0.1138 ATCAT 0.3424 ATCCA 0.2915 ATCCC 0.186 ATCCG 0.2335 ATCCT 0.2891 ATCGA 0.4365 ATCGC 0.1523 ATCGG 0.1271 ATCGT 0.2841 ATCTA 0.2308 ATCTC 0.266 ATCTG 0.1246 ATCTT 0.3786 ATGAA 0.4286 ATGAC 0.1135 ATGAG 0.1129 ATGAT 0.345 ATGCA 0.3824 ATGCC 0.1259 ATGCG 0.2802 ATGCT 0.2114 ATGGA 0.4721 ATGGC 0.1762 ATGGG 0.1392 ATGGT 0.2125 ATGTA 0.3944 ATGTC 0.1259 ATGTG 0.1561 ATGTT 0.3236 ATTAA 0.3572 ATTAC 0.1354 ATTAG 0.08225 ATTAT 0.4252 ATTCA 0.2505 ATTCC 0.1712 ATTCG 0.2891 ATTCT 0.2892 ATTGA 0.3309 ATTGC 0.1798 ATTGG 0.1558 ATTGT 0.3334 ATTTA 0.2669 ATTTC 0.1987 ATTTG 0.1139 ATTTT 0.4205 CAAAA 0.3587 CAAAC 0.1618 CAAAG 0.17 CAAAT 0.3095 CAACA 0.2837 CAACC 0.1657 CAACG 0.3324 CAACT 0.2182 CAAGA 0.3624 CAAGC 0.1732 CAAGG 0.1869 CAAGT 0.2775 CAATA 0.273 CAATC 0.1837 CAATG 0.1496 CAATT 0.3937 CACAA 0.2934 CACAC 0.3131 CACAG 0.1499 CACAT 0.2436 CACCA 0.2479 CACCC 0.1957 CACCG 0.3317 CACCT 0.2248 CACGA 0.328 CACGC 0.2352 CACGG 0.1672 CACGT 0.2696 CACTA 0.1574 CACTC 0.279 CACTG 0.1775 CACTT 0.3861 CAGAA 0.3536 CAGAC 0.1382 CAGAG 0.2313 CAGAT 0.2768 CAGCA 0.2434 CAGCC 0.2316 CAGCG 0.2781 CAGCT 0.2469 CAGGA 0.3488 CAGGC 0.1873 CAGGG 0.2134 CAGGT 0.2505 CAGTA 0.2146 CAGTC 0.1921 CAGTG 0.2202 CAGTT 0.3731 CATAA 0.3271 CATAC 0.1738 CATAG 0.1092 CATAT 0.3898 CATCA 0.2077 CATCC 0.2042 CATCG 0.3584 CATCT 0.2297 CATGA 0.2962 CATGC 0.2257 CATGG 0.1806 CATGT 0.2975 CATTA 0.2358 CATTC 0.2123 CATTG 0.1556 CATTT 0.3964 CCAAA 0.2832 CCAAC 0.2304 CCAAG 0.1764 CCAAT 0.31 CCACA 0.1458 CCACC 0.2745 CCACG 0.3631 CCACT 0.2166 CCAGA 0.3009 CCAGC 0.2365 CCAGG 0.2041 CCAGT 0.2586 CCATA 0.18 CCATC 0.31 CCATG 0.1264 CCATT 0.3837 CCCAA 0.2785 CCCAC 0.2874 CCCAG 0.1435 CCCAT 0.2907 CCCCA 0.1251 CCCCC 0.3374 CCCCG 0.2106 CCCCT 0.327 CCCGA 0.2909 CCCGC 0.2332 CCCGG 0.1687 CCCGT 0.3072 CCCTA 0.09798 CCCTC 0.434 CCCTG 0.1173 CCCTT 0.3506 CCGAA 0.2345 CCGAC 0.1737 CCGAG 0.2319 CCGAT 0.36 CCGCA 0.1658 CCGCC 0.2276 CCGCG 0.3803 CCGCT 0.2262 CCGGA 0.2526 CCGGC 0.256 CCGGG 0.1928 CCGGT 0.2986 CCGTA 0.1691 CCGTC 0.2105 CCGTG 0.2582 CCGTT 0.3622 CCTAA 0.2831 CCTAC 0.2165 CCTAG 0.1334 CCTAT 0.3669 CCTCA 0.07551 CCTCC 0.322 CCTCG 0.3072 CCTCT 0.2952 CCTGA 0.2285 CCTGC 0.2348 CCTGG 0.1973 CCTGT 0.3394 CCTTA 0.1284 CCTTC 0.3182 CCTTG 0.1376 CCTTT 0.4158 CGAAA 0.3789 CGAAC 0.16 CGAAG 0.1691 CGAAT 0.292 CGACA 0.2471 CGACC 0.1702 CGACG 0.3877 CGACT 0.1951 CGAGA 0.3618 CGAGC 0.1947 CGAGG 0.2214 CGAGT 0.2221 CGATA 0.2619 CGATC 0.266 CGATG 0.1628 CGATT 0.3093 CGCAA 0.3332 CGCAC 0.2307 CGCAG 0.1518 CGCAT 0.2842 CGCCA 0.2758 CGCCC 0.1774 CGCCG 0.3103 CGCCT 0.2365 CGCGA 0.3271 CGCGC 0.2265 CGCGG 0.1529 CGCGT 0.2935 CGCTA 0.1718 CGCTC 0.3311 CGCTG 0.1536 CGCTT 0.3436 CGGAA 0.3427 CGGAC 0.1398 CGGAG 0.2124 CGGAT 0.3051 CGGCA 0.2113 CGGCC 0.2602 CGGCG 0.323 CGGCT 0.2055 CGGGA 0.3506 CGGGC 0.1951 CGGGG 0.2684 CGGGT 0.1859 CGGTA 0.2242 CGGTC 0.1829 CGGTG 0.2608 CGGTT 0.3321 CGTAA 0.3286 CGTAC 0.1924 CGTAG 0.1311 CGTAT 0.3479 CGTCA 0.1946 CGTCC 0.2059 CGTCG 0.3825 CGTCT 0.217 CGTGA 0.2661 CGTGC 0.2009 CGTGG 0.2075 CGTGT 0.3255 CGTTA 0.204 CGTTC 0.2511 CGTTG 0.1726 CGTTT 0.3723 CTAAA 0.3553 CTAAC 0.1764 CTAAG 0.104 CTAAT 0.3644 CTACA 0.2409 CTACC 0.1796 CTACG 0.2909 CTACT 0.2886 CTAGA 0.3767 CTAGC 0.1918 CTAGG 0.1724 CTAGT 0.2591 CTATA 0.2757 CTATC 0.2323 CTATG 0.1182 CTATT 0.3739 CTCAA 0.333 CTCAC 0.2421 CTCAG 0.1127 CTCAT 0.3121 CTCCA 0.1965 CTCCC 0.2772 CTCCG 0.1761 CTCCT 0.3503 CTCGA 0.3732 CTCGC 0.2124 CTCGG 0.1199 CTCGT 0.2945 CTCTA 0.1037 CTCTC 0.5098 CTCTG 0.09135 CTCTT 0.2951 CTGAA 0.3803 CTGAC 0.1796 CTGAG 0.1155 CTGAT 0.3246 CTGCA 0.256 CTGCC 0.2227 CTGCG 0.2651 CTGCT 0.2562 CTGGA 0.3619 CTGGC 0.2514 CTGGG 0.1358 CTGGT 0.2508 CTGTA 0.2534 CTGTC 0.2107 CTGTG 0.1806 CTGTT 0.3553 CTTAA 0.341 CTTAC 0.1865 CTTAG 0.08893 CTTAT 0.3836 CTTCA 0.1435 CTTCC 0.245 CTTCG 0.2524 CTTCT 0.3591 CTTGA 0.2811 CTTGC 0.2182 CTTGG 0.1841 CTTGT 0.3166 CTTTA 0.1604 CTTTC 0.2872 CTTTG 0.1265 CTTTT 0.4258 GAAAA 0.402 GAAAC 0.1561 GAAAG 0.1842 GAAAT 0.2577 GAACA 0.2883 GAACC 0.1256 GAACG 0.4248 GAACT 0.1613 GAAGA 0.4777 GAAGC 0.1451 GAAGG 0.2296 GAAGT 0.1476 GAATA 0.3038 GAATC 0.2091 GAATG 0.1492 GAATT 0.338 GACAA 0.3699 GACAC 0.2438 GACAG 0.1819 GACAT 0.2044 GACCA 0.2835 GACCC 0.1627 GACCG 0.3517 GACCT 0.2021 GACGA 0.4321 GACGC 0.1943 GACGG 0.1676 GACGT 0.2061 GACTA 0.205 GACTC 0.2748 GACTG 0.1957 GACTT 0.3245 GAGAA 0.3363 GAGAC 0.09088 GAGAG 0.393 GAGAT 0.1798 GAGCA 0.2835 GAGCC 0.1618 GAGCG 0.3784 GAGCT 0.1763 GAGGA 0.4436 GAGGC 0.1491 GAGGG 0.2781 GAGGT 0.1292 GAGTA 0.2572 GAGTC 0.1829 GAGTG 0.2349 GAGTT 0.325 GATAA 0.3755 GATAC 0.1632 GATAG 0.1272 GATAT 0.3341 GATCA 0.2053 GATCC 0.172 GATCG 0.4332 GATCT 0.1895 GATGA 0.3636 GATGC 0.1926 GATGG 0.2264 GATGT 0.2174 GATTA 0.2658 GATTC 0.2337 GATTG 0.15 GATTT 0.3505 GCAAA 0.3464 GCAAC 0.2091 GCAAG 0.1639 GCAAT 0.2806 GCACA 0.2798 GCACC 0.16 GCACG 0.4027 GCACT 0.1575 GCAGA 0.3146 GCAGC 0.2553 GCAGG 0.2098 GCAGT 0.2202 GCATA 0.2661 GCATC 0.2543 GCATG 0.1524 GCATT 0.3272 GCCAA 0.308 GCCAC 0.2746 GCCAG 0.175 GCCAT 0.2424 GCCCA 0.187 GCCCC 0.2628 GCCCG 0.3211 GCCCT 0.2291 GCCGA 0.2995 GCCGC 0.2745 GCCGG 0.1921 GCCGT 0.2339 GCCTA 0.1556 GCCTC 0.3902 GCCTG 0.1727 GCCTT 0.2816 GCGAA 0.3129 GCGAC 0.1555 GCGAG 0.2594 GCGAT 0.2723 GCGCA 0.2332 GCGCC 0.1654 GCGCG 0.4419 GCGCT 0.1595 GCGGA 0.3078 GCGGC 0.2621 GCGGG 0.191 GCGGT 0.2391 GCGTA 0.2252 GCGTC 0.1888 GCGTG 0.2811 GCGTT 0.3048 GCTAA 0.2942 GCTAC 0.2382 GCTAG 0.1356 GCTAT 0.332 GCTCA 0.131 GCTCC 0.1751 GCTCG 0.464 GCTCT 0.23 GCTGA 0.2346 GCTGC 0.2741 GCTGG 0.2194 GCTGT 0.2719 GCTTA 0.1831 GCTTC 0.2843 GCTTG 0.1802 GCTTT 0.3524 GGAAA 0.4233 GGAAC 0.1374 GGAAG 0.2139 GGAAT 0.2254 GGACA 0.3019 GGACC 0.1293 GGACG 0.4322 GGACT 0.1367 GGAGA 0.4018 GGAGC 0.1185 GGAGG 0.3743 GGAGT 0.1055 GGATA 0.2924 GGATC 0.23 GGATG 0.2022 GGATT 0.2754 GGCAA 0.3773 GGCAC 0.21 GGCAG 0.2062 GGCAT 0.2065 GGCCA 0.294 GGCCC 0.1574 GGCCG 0.3795 GGCCT 0.1691 GGCGA 0.3575 GGCGC 0.2122 GGCGG 0.229 GGCGT 0.2014 GGCTA 0.2033 GGCTC 0.2802 GGCTG 0.2532 GGCTT 0.2633 GGGAA 0.3787 GGGAC 0.118 GGGAG 0.2915 GGGAT 0.2118 GGGCA 0.2707 GGGCC 0.2072 GGGCG 0.3543 GGGCT 0.1677 GGGGA 0.4057 GGGGC 0.1253 GGGGG 0.3374 GGGGT 0.1315 GGGTA 0.2288 GGGTC 0.1728 GGGTG 0.3141 GGGTT 0.2844 GGTAA 0.3665 GGTAC 0.1511 GGTAG 0.1716 GGTAT 0.3108 GGTCA 0.2438 GGTCC 0.1549 GGTCG 0.4225 GGTCT 0.1788 GGTGA 0.2764 GGTGC 0.1635 GGTGG 0.3213 GGTGT 0.2388 GGTTA 0.2728 GGTTC 0.1946 GGTTG 0.2255 GGTTT 0.3071 GTAAA 0.3757 GTAAC 0.1688 GTAAG 0.1215 GTAAT 0.3339 GTACA 0.3855 GTACC 0.12 GTACG 0.3242 GTACT 0.1703 GTAGA 0.3819 GTAGC 0.2005 GTAGG 0.1666 GTAGT 0.2509 GTATA 0.3491 GTATC 0.2076 GTATG 0.1309 GTATT 0.3124 GTCAA 0.3292 GTCAC 0.2559 GTCAG 0.1487 GTCAT 0.2661 GTCCA 0.2976 GTCCC 0.2341 GTCCG 0.2417 GTCCT 0.2267 GTCGA 0.381 GTCGC 0.2068 GTCGG 0.1458 GTCGT 0.2664 GTCTA 0.1935 GTCTC 0.342 GTCTG 0.1584 GTCTT 0.3061 GTGAA 0.4023 GTGAC 0.1739 GTGAG 0.1396 GTGAT 0.2842 GTGCA 0.3453 GTGCC 0.1684 GTGCG 0.2991 GTGCT 0.1871 GTGGA 0.4041 GTGGC 0.221 GTGGG 0.1524 GTGGT 0.2225 GTGTA 0.3029 GTGTC 0.1831 GTGTG 0.2446 GTGTT 0.2694 GTTAA 0.3507 GTTAC 0.1948 GTTAG 0.1133 GTTAT 0.3412 GTTCA 0.2255 GTTCC 0.2153 GTTCG 0.3268 GTTCT 0.2324 GTTGA 0.2968 GTTGC 0.2299 GTTGG 0.1987 GTTGT 0.2746 GTTTA 0.2257 GTTTC 0.2967 GTTTG 0.1468 GTTTT 0.3308 TAAAA 0.4248 TAAAC 0.1203 TAAAG 0.1042 TAAAT 0.3507 TAACA 0.3174 TAACC 0.1559 TAACG 0.3054 TAACT 0.2212 TAAGA 0.4246 TAAGC 0.1504 TAAGG 0.1491 TAAGT 0.2759 TAATA 0.3478 TAATC 0.1525 TAATG 0.1063 TAATT 0.3934 TACAA 0.3347 TACAC 0.2126 TACAG 0.1153 TACAT 0.3374 TACCA 0.2837 TACCC 0.1492 TACCG 0.2985 TACCT 0.2685 TACGA 0.369 TACGC 0.1904 TACGG 0.1106 TACGT 0.33 TACTA 0.2372 TACTC 0.2146 TACTG 0.1214 TACTT 0.4268 TAGAA 0.4288 TAGAC 0.1022 TAGAG 0.1589 TAGAT 0.3101 TAGCA 0.2983 TAGCC 0.1709 TAGCG 0.2857 TAGCT 0.2451 TAGGA 0.4069 TAGGC 0.1628 TAGGG 0.1719 TAGGT 0.2584 TAGTA 0.3215 TAGTC 0.1543 TAGTG 0.1499 TAGTT 0.3743 TATAA 0.2752 TATAC 0.1229 TATAG 0.06761 TATAT 0.5343 TATCA 0.2413 TATCC 0.1646 TATCG 0.3212 TATCT 0.2728 TATGA 0.3112 TATGC 0.1894 TATGG 0.1236 TATGT 0.3758 TATTA 0.2997 TATTC 0.1679 TATTG 0.1102 TATTT 0.4222 TCAAA 0.3567 TCAAC 0.1741 TCAAG 0.1362 TCAAT 0.333 TCACA 0.2371 TCACC 0.1778 TCACG 0.3506 TCACT 0.2346 TCAGA 0.3632 TCAGC 0.1896 TCAGG 0.1772 TCAGT 0.2701 TCATA 0.237 TCATC 0.2604 TCATG 0.1085 TCATT 0.3941 TCCAA 0.3233 TCCAC 0.2421 TCCAG 0.1215 TCCAT 0.3132 TCCCA 0.1598 TCCCC 0.2888 TCCCG 0.1958 TCCCT 0.3556 TCCGA 0.2768 TCCGC 0.2408 TCCGG 0.1416 TCCGT 0.3407 TCCTA 0.1258 TCCTC 0.3755 TCCTG 0.1041 TCCTT 0.3947 TCGAA 0.3282 TCGAC 0.1264 TCGAG 0.201 TCGAT 0.3444 TCGCA 0.1999 TCGCC 0.1745 TCGCG 0.3997 TCGCT 0.2259 TCGGA 0.2753 TCGGC 0.2225 TCGGG 0.1854 TCGGT 0.3168 TCGTA 0.2127 TCGTC 0.2046 TCGTG 0.191 TCGTT 0.3917 TCTAA 0.3065 TCTAC 0.1794 TCTAG 0.1053 TCTAT 0.4088 TCTCA 0.1091 TCTCC 0.172 TCTCG 0.2497 TCTCT 0.4691 TCTGA 0.2699 TCTGC 0.2028 TCTGG 0.1676 TCTGT 0.3597 TCTTA 0.1537 TCTTC 0.2783 TCTTG 0.1122 TCTTT 0.4558 TGAAA 0.4617 TGAAC 0.1293 TGAAG 0.1126 TGAAT 0.2964 TGACA 0.3255 TGACC 0.1528 TGACG 0.3069 TGACT 0.2148 TGAGA 0.4705 TGAGC 0.1635 TGAGG 0.1619 TGAGT 0.2041 TGATA 0.3079 TGATC 0.1973 TGATG 0.1477 TGATT 0.347 TGCAA 0.3679 TGCAC 0.2102 TGCAG 0.1157 TGCAT 0.3061 TGCCA 0.2974 TGCCC 0.1764 TGCCG 0.2643 TGCCT 0.2619 TGCGA 0.3296 TGCGC 0.2409 TGCGG 0.1343 TGCGT 0.2952 TGCTA 0.2074 TGCTC 0.2868 TGCTG 0.1555 TGCTT 0.3504 TGGAA 0.4449 TGGAC 0.1209 TGGAG 0.1666 TGGAT 0.2676 TGGCA 0.2589 TGGCC 0.2195 TGGCG 0.3125 TGGCT 0.2091 TGGGA 0.405 TGGGC 0.1609 TGGGG 0.2258 TGGGT 0.2083 TGGTA 0.2655 TGGTC 0.1837 TGGTG 0.2429 TGGTT 0.3079 TGTAA 0.3383 TGTAC 0.1835 TGTAG 0.08703 TGTAT 0.3912 TGTCA 0.2581 TGTCC 0.1798 TGTCG 0.3048 TGTCT 0.2572 TGTGA 0.2661 TGTGC 0.2064 TGTGG 0.1232 TGTGT 0.4044 TGTTA 0.2458 TGTTC 0.1976 TGTTG 0.1709 TGTTT 0.3857 TTAAA 0.3973 TTAAC 0.1302 TTAAG 0.09514 TTAAT 0.3774 TTACA 0.3509 TTACC 0.1437 TTACG 0.2732 TTACT 0.2322 TTAGA 0.439 TTAGC 0.1667 TTAGG 0.1466 TTAGT 0.2477 TTATA 0.2956 TTATC 0.1806 TTATG 0.09318 TTATT 0.4306 TTCAA 0.3802 TTCAC 0.1919 TTCAG 0.1021 TTCAT 0.3258 TTCCA 0.2967 TTCCC 0.2036 TTCCG 0.1606 TTCCT 0.3392 TTCGA 0.4257 TTCGC 0.1791 TTCGG 0.08477 TTCGT 0.3104 TTCTA 0.1755 TTCTC 0.2735 TTCTG 0.08752 TTCTT 0.4635 TTGAA 0.4424 TTGAC 0.1242 TTGAG 0.1065 TTGAT 0.3269 TTGCA 0.3421 TTGCC 0.1712 TTGCG 0.2445 TTGCT 0.2422 TTGGA 0.446 TTGGC 0.2048 TTGGG 0.122 TTGGT 0.2272 TTGTA 0.2931 TTGTC 0.1707 TTGTG 0.1409 TTGTT 0.3952 TTTAA 0.3536 TTTAC 0.1432 TTTAG 0.0754 TTTAT 0.4279 TTTCA 0.2323 TTTCC 0.1914 TTTCG 0.2233 TTTCT 0.353 TTTGA 0.3231 TTTGC 0.2023 TTTGG 0.1298 TTTGT 0.3448 TTTTA 0.2072 TTTTC 0.1986 TTTTG 0.08458 TTTTT 0.5096 [7] # (a,c,g,t)= (0.25, 0.25, 0.25, 0.25) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.321 C 0.179 G 0.179 T 0.321 # l= 1 # Values AA 0.123 AC 0.0462 AG 0.0458 AT 0.106 CA 0.0445 CC 0.0323 CG 0.0564 CT 0.0458 GA 0.0674 GC 0.033 GG 0.0323 GT 0.0463 TA 0.086 TC 0.0674 TG 0.0445 TT 0.123 # l= 2 # Values AAA 0.052 AAC 0.0159 AAG 0.017 AAT 0.0383 ACA 0.0142 ACC 0.00677 ACG 0.0156 ACT 0.00965 AGA 0.02 AGC 0.00694 AGG 0.00918 AGT 0.00965 ATA 0.0356 ATC 0.0189 ATG 0.0131 ATT 0.0383 CAA 0.0157 CAC 0.0097 CAG 0.00603 CAT 0.0131 CCA 0.00796 CCC 0.00699 CCG 0.00822 CCT 0.00918 CGA 0.021 CGC 0.0115 CGG 0.00822 CGT 0.0156 CTA 0.00815 CTC 0.0146 CTG 0.00603 CTT 0.017 GAA 0.0258 GAC 0.00802 GAG 0.0146 GAT 0.0189 GCA 0.00873 GCC 0.00585 GCG 0.0115 GCT 0.00694 GGA 0.0127 GGC 0.00585 GGG 0.00699 GGT 0.00677 GTA 0.0126 GTC 0.00802 GTG 0.0097 GTT 0.0159 TAA 0.0296 TAC 0.0126 TAG 0.00815 TAT 0.0356 TCA 0.0136 TCC 0.0127 TCG 0.021 TCT 0.02 TGA 0.0136 TGC 0.00873 TGG 0.00797 TGT 0.0142 TTA 0.0296 TTC 0.0258 TTG 0.0157 TTT 0.052 # l= 3 # Values AAAA 0.0233 AAAC 0.00602 AAAG 0.00728 AAAT 0.0154 AACA 0.00486 AACC 0.00212 AACG 0.00553 AACT 0.00343 AAGA 0.00768 AAGC 0.0023 AAGG 0.00325 AAGT 0.00376 AATA 0.013 AATC 0.00605 AATG 0.00485 AATT 0.0144 ACAA 0.00513 ACAC 0.00311 ACAG 0.00201 ACAT 0.00395 ACCA 0.00179 ACCC 0.00112 ACCG 0.00227 ACCT 0.0016 ACGA 0.00609 ACGC 0.00308 ACGG 0.00237 ACGT 0.00408 ACTA 0.00209 ACTC 0.00226 ACTG 0.00154 ACTT 0.00376 AGAA 0.00832 AGAC 0.0018 AGAG 0.00528 AGAT 0.0046 AGCA 0.00196 AGCC 0.00116 AGCG 0.00229 AGCT 0.00153 AGGA 0.00402 AGGC 0.00132 AGGG 0.00223 AGGT 0.0016 AGTA 0.0028 AGTC 0.00153 AGTG 0.00189 AGTT 0.00343 ATAA 0.0124 ATAC 0.00449 ATAG 0.00315 ATAT 0.0156 ATCA 0.00443 ATCC 0.00313 ATCG 0.00676 ATCT 0.0046 ATGA 0.00446 ATGC 0.0024 ATGG 0.00227 ATGT 0.00395 ATTA 0.0112 ATTC 0.00675 ATTG 0.00499 ATTT 0.0154 CAAA 0.00549 CAAC 0.00288 CAAG 0.00235 CAAT 0.00499 CACA 0.00243 CACC 0.00179 CACG 0.00359 CACT 0.00189 CAGA 0.00204 CAGC 0.00125 CAGG 0.00119 CAGT 0.00154 CATA 0.0035 CATC 0.00309 CATG 0.00162 CATT 0.00485 CCAA 0.00247 CCAC 0.00208 CCAG 0.00114 CCAT 0.00227 CCCA 0.0011 CCCC 0.00205 CCCG 0.00161 CCCT 0.00223 CCGA 0.00247 CCGC 0.00198 CCGG 0.0014 CCGT 0.00237 CCTA 0.00124 CCTC 0.0035 CCTG 0.00119 CCTT 0.00325 CGAA 0.0066 CGAC 0.00293 CGAG 0.00474 CGAT 0.00675 CGCA 0.00234 CGCC 0.00196 CGCG 0.0049 CGCT 0.00229 CGGA 0.00246 CGGC 0.00188 CGGG 0.00161 CGGT 0.00227 CGTA 0.00354 CGTC 0.00296 CGTG 0.00359 CGTT 0.00554 CTAA 0.00243 CTAC 0.00161 CTAG 0.00096 CTAT 0.00315 CTCA 0.00156 CTCC 0.00302 CTCG 0.00474 CTCT 0.00528 CTGA 0.00152 CTGC 0.00136 CTGG 0.00114 CTGT 0.00201 CTTA 0.00286 CTTC 0.0045 CTTG 0.00235 CTTT 0.00727 GAAA 0.0113 GAAC 0.00328 GAAG 0.0045 GAAT 0.00675 GACA 0.00234 GACC 0.00118 GACG 0.00296 GACT 0.00153 GAGA 0.00683 GAGC 0.00201 GAGG 0.0035 GAGT 0.00226 GATA 0.00561 GATC 0.00417 GATG 0.00309 GATT 0.00605 GCAA 0.00317 GCAC 0.00181 GCAG 0.00136 GCAT 0.0024 GCCA 0.00167 GCCC 0.000976 GCCG 0.00188 GCCT 0.00132 GCGA 0.00392 GCGC 0.00251 GCGG 0.00197 GCGT 0.00308 GCTA 0.00137 GCTC 0.00201 GCTG 0.00125 GCTT 0.0023 GGAA 0.00516 GGAC 0.00142 GGAG 0.00302 GGAT 0.00313 GGCA 0.00146 GGCC 0.00128 GGCG 0.00196 GGCT 0.00116 GGGA 0.00285 GGGC 0.000976 GGGG 0.00205 GGGT 0.00112 GGTA 0.00169 GGTC 0.00118 GGTG 0.00179 GGTT 0.00212 GTAA 0.00435 GTAC 0.00213 GTAG 0.00161 GTAT 0.00449 GTCA 0.00186 GTCC 0.00142 GTCG 0.00293 GTCT 0.0018 GTGA 0.0027 GTGC 0.00181 GTGG 0.00208 GTGT 0.00311 GTTA 0.00375 GTTC 0.00328 GTTG 0.00288 GTTT 0.00602 TAAA 0.0119 TAAC 0.00375 TAAG 0.00286 TAAT 0.0112 TACA 0.00458 TACC 0.00169 TACG 0.00354 TACT 0.0028 TAGA 0.00345 TAGC 0.00137 TAGG 0.00124 TAGT 0.00209 TATA 0.0135 TATC 0.00561 TATG 0.0035 TATT 0.013 TCAA 0.00493 TCAC 0.0027 TCAG 0.00152 TCAT 0.00446 TCCA 0.00341 TCCC 0.00285 TCCG 0.00246 TCCT 0.00402 TCGA 0.00854 TCGC 0.00392 TCGG 0.00247 TCGT 0.00609 TCTA 0.00345 TCTC 0.00683 TCTG 0.00204 TCTT 0.00768 TGAA 0.00575 TGAC 0.00187 TGAG 0.00155 TGAT 0.00443 TGCA 0.00297 TGCC 0.00146 TGCG 0.00234 TGCT 0.00196 TGGA 0.00341 TGGC 0.00167 TGGG 0.0011 TGGT 0.00179 TGTA 0.00458 TGTC 0.00234 TGTG 0.00243 TGTT 0.00486 TTAA 0.0105 TTAC 0.00435 TTAG 0.00243 TTAT 0.0124 TTCA 0.00575 TTCC 0.00516 TTCG 0.0066 TTCT 0.00832 TTGA 0.00493 TTGC 0.00317 TTGG 0.00247 TTGT 0.00513 TTTA 0.0119 TTTC 0.0113 TTTG 0.00549 TTTT 0.0233 # l= 4 # Values AAAAA 0.0117 AAAAC 0.002 AAAAG 0.00309 AAAAT 0.00649 AAACA 0.00188 AAACC 0.000652 AAACG 0.00206 AAACT 0.00144 AAAGA 0.00348 AAAGC 0.000819 AAAGG 0.00134 AAAGT 0.00164 AAATA 0.00554 AAATC 0.00213 AAATG 0.00193 AAATT 0.00577 AACAA 0.00202 AACAC 0.000839 AACAG 0.000711 AACAT 0.00129 AACCA 0.000548 AACCC 0.00031 AACCG 0.000743 AACCT 0.000516 AACGA 0.00238 AACGC 0.000932 AACGG 0.000863 AACGT 0.00136 AACTA 0.00078 AACTC 0.000726 AACTG 0.000573 AACTT 0.00135 AAGAA 0.00384 AAGAC 0.000559 AAGAG 0.00154 AAGAT 0.00173 AAGCA 0.000686 AAGCC 0.000301 AAGCG 0.000784 AAGCT 0.000533 AAGGA 0.00156 AAGGC 0.000368 AAGGG 0.000779 AAGGT 0.000541 AAGTA 0.00119 AAGTC 0.000494 AAGTG 0.000725 AAGTT 0.00135 AATAA 0.00529 AATAC 0.00141 AATAG 0.00118 AATAT 0.00512 AATCA 0.00155 AATCC 0.000856 AATCG 0.00209 AATCT 0.00155 AATGA 0.00175 AATGC 0.000787 AATGG 0.000862 AATGT 0.00145 AATTA 0.00437 AATTC 0.00228 AATTG 0.00195 AATTT 0.00577 ACAAA 0.00192 ACAAC 0.00079 ACAAG 0.000747 ACAAT 0.00168 ACACA 0.000994 ACACC 0.000421 ACACG 0.00117 ACACT 0.000531 ACAGA 0.000734 ACAGC 0.000337 ACAGG 0.000402 ACAGT 0.000536 ACATA 0.00134 ACATC 0.000669 ACATG 0.000493 ACATT 0.00145 ACCAA 0.000561 ACCAC 0.00046 ACCAG 0.000284 ACCAT 0.000483 ACCCA 0.000227 ACCCC 0.000269 ACCCG 0.000294 ACCCT 0.000328 ACCGA 0.000767 ACCGC 0.000467 ACCGG 0.000417 ACCGT 0.000615 ACCTA 0.000321 ACCTC 0.000442 ACCTG 0.000299 ACCTT 0.000541 ACGAA 0.00204 ACGAC 0.000778 ACGAG 0.00138 ACGAT 0.0019 ACGCA 0.000685 ACGCC 0.000386 ACGCG 0.00143 ACGCT 0.000575 ACGGA 0.000832 ACGGC 0.000433 ACGGG 0.000493 ACGGT 0.000615 ACGTA 0.00116 ACGTC 0.000605 ACGTG 0.000953 ACGTT 0.00136 ACTAA 0.000622 ACTAC 0.000408 ACTAG 0.000251 ACTAT 0.000813 ACTCA 0.000322 ACTCC 0.000307 ACTCG 0.00103 ACTCT 0.000592 ACTGA 0.000419 ACTGC 0.000298 ACTGG 0.000288 ACTGT 0.000536 ACTTA 0.000808 ACTTC 0.000658 ACTTG 0.000654 ACTTT 0.00164 AGAAA 0.00399 AGAAC 0.000761 AGAAG 0.00162 AGAAT 0.00195 AGACA 0.000597 AGACC 0.000209 AGACG 0.000634 AGACT 0.000361 AGAGA 0.0032 AGAGC 0.000459 AGAGG 0.00103 AGAGT 0.000592 AGATA 0.00155 AGATC 0.000787 AGATG 0.000715 AGATT 0.00155 AGCAA 0.000765 AGCAC 0.00034 AGCAG 0.000347 AGCAT 0.000509 AGCCA 0.000343 AGCCC 0.000161 AGCCG 0.000385 AGCCT 0.000267 AGCGA 0.000878 AGCGC 0.000396 AGCGG 0.000443 AGCGT 0.000575 AGCTA 0.000336 AGCTC 0.000349 AGCTG 0.000313 AGCTT 0.000533 AGGAA 0.00174 AGGAC 0.000321 AGGAG 0.00106 AGGAT 0.000895 AGGCA 0.000381 AGGCC 0.000216 AGGCG 0.00046 AGGCT 0.000267 AGGGA 0.00101 AGGGC 0.000222 AGGGG 0.000671 AGGGT 0.000328 AGGTA 0.00045 AGGTC 0.000236 AGGTG 0.000402 AGGTT 0.000516 AGTAA 0.00103 AGTAC 0.00037 AGTAG 0.000465 AGTAT 0.000939 AGTCA 0.000405 AGTCC 0.000195 AGTCG 0.00057 AGTCT 0.000361 AGTGA 0.000636 AGTGC 0.00028 AGTGG 0.000446 AGTGT 0.000531 AGTTA 0.000841 AGTTC 0.000529 AGTTG 0.000622 AGTTT 0.00144 ATAAA 0.00515 ATAAC 0.0013 ATAAG 0.00112 ATAAT 0.00479 ATACA 0.00181 ATACC 0.000521 ATACG 0.00123 ATACT 0.000939 ATAGA 0.00143 ATAGC 0.000455 ATAGG 0.000452 ATAGT 0.000813 ATATA 0.00717 ATATC 0.00188 ATATG 0.00139 ATATT 0.00512 ATCAA 0.00162 ATCAC 0.000772 ATCAG 0.000494 ATCAT 0.00155 ATCCA 0.000906 ATCCC 0.000588 ATCCG 0.000744 ATCCT 0.000895 ATCGA 0.00292 ATCGC 0.00105 ATCGG 0.000884 ATCGT 0.0019 ATCTA 0.00108 ATCTC 0.00121 ATCTG 0.000569 ATCTT 0.00173 ATGAA 0.00192 ATGAC 0.000499 ATGAG 0.000494 ATGAT 0.00155 ATGCA 0.000921 ATGCC 0.000303 ATGCG 0.000663 ATGCT 0.000509 ATGGA 0.00106 ATGGC 0.000405 ATGGG 0.000317 ATGGT 0.000483 ATGTA 0.00158 ATGTC 0.000484 ATGTG 0.0006 ATGTT 0.00129 ATTAA 0.00401 ATTAC 0.00147 ATTAG 0.000891 ATTAT 0.00479 ATTCA 0.00173 ATTCC 0.00115 ATTCG 0.00191 ATTCT 0.00195 ATTGA 0.00166 ATTGC 0.000884 ATTGG 0.000762 ATTGT 0.00168 ATTTA 0.00423 ATTTC 0.00294 ATTTG 0.00172 ATTTT 0.00649 CAAAA 0.00198 CAAAC 0.000869 CAAAG 0.000916 CAAAT 0.00172 CAACA 0.000815 CAACC 0.000477 CAACG 0.000966 CAACT 0.000622 CAAGA 0.000852 CAAGC 0.000407 CAAGG 0.000437 CAAGT 0.000654 CAATA 0.0014 CAATC 0.00089 CAATG 0.000742 CAATT 0.00195 CACAA 0.000711 CACAC 0.000761 CACAG 0.000362 CACAT 0.0006 CACCA 0.000432 CACCC 0.000357 CACCG 0.000598 CACCT 0.000402 CACGA 0.00116 CACGC 0.000868 CACGG 0.000608 CACGT 0.000953 CACTA 0.000309 CACTC 0.000528 CACTG 0.000331 CACTT 0.000725 CAGAA 0.000723 CAGAC 0.000284 CAGAG 0.000466 CAGAT 0.000569 CAGCA 0.0003 CAGCC 0.000293 CAGCG 0.000348 CAGCT 0.000313 CAGGA 0.000411 CAGGC 0.000226 CAGGG 0.000258 CAGGT 0.000299 CAGTA 0.000341 CAGTC 0.000296 CAGTG 0.000331 CAGTT 0.000573 CATAA 0.00115 CATAC 0.000582 CATAG 0.000371 CATAT 0.00139 CATCA 0.000649 CATCC 0.000637 CATCG 0.00109 CATCT 0.000715 CATGA 0.000487 CATGC 0.000363 CATGG 0.000282 CATGT 0.000493 CATTA 0.00118 CATTC 0.001 CATTG 0.000742 CATTT 0.00193 CCAAA 0.000692 CCAAC 0.000582 CCAAG 0.000437 CCAAT 0.000762 CCACA 0.000294 CCACC 0.000586 CCACG 0.000753 CCACT 0.000446 CCAGA 0.000339 CCAGC 0.000277 CCAGG 0.000239 CCAGT 0.000288 CCATA 0.000411 CCATC 0.000715 CCATG 0.000282 CCATT 0.000862 CCCAA 0.000306 CCCAC 0.000317 CCCAG 0.000157 CCCAT 0.000317 CCCCA 0.000248 CCCCC 0.000689 CCCCG 0.00044 CCCCT 0.000671 CCCGA 0.000465 CCCGC 0.000381 CCCGG 0.000272 CCCGT 0.000493 CCCTA 0.000211 CCCTC 0.000983 CCCTG 0.000258 CCCTT 0.000779 CCGAA 0.000571 CCGAC 0.000431 CCGAG 0.000587 CCGAT 0.000884 CCGCA 0.00032 CCGCC 0.000459 CCGCG 0.000753 CCGCT 0.000443 CCGGA 0.000346 CCGGC 0.000361 CCGGG 0.000272 CCGGT 0.000417 CCGTA 0.000395 CCGTC 0.000506 CCGTG 0.000608 CCGTT 0.000863 CCTAA 0.000345 CCTAC 0.000272 CCTAG 0.000169 CCTAT 0.000452 CCTCA 0.000251 CCTCC 0.00116 CCTCG 0.00106 CCTCT 0.00103 CCTGA 0.000268 CCTGC 0.000285 CCTGG 0.000239 CCTGT 0.000402 CCTTA 0.000415 CCTTC 0.00105 CCTTG 0.000437 CCTTT 0.00134 CGAAA 0.0025 CGAAC 0.00107 CGAAG 0.00112 CGAAT 0.00191 CGACA 0.000708 CGACC 0.000511 CGACG 0.00114 CGACT 0.00057 CGAGA 0.0017 CGAGC 0.000941 CGAGG 0.00106 CGAGT 0.00103 CGATA 0.00175 CGATC 0.00182 CGATG 0.00109 CGATT 0.00209 CGCAA 0.000769 CGCAC 0.000544 CGCAG 0.000359 CGCAT 0.000663 CGCCA 0.000533 CGCCC 0.000351 CGCCG 0.000614 CGCCT 0.00046 CGCGA 0.00159 CGCGC 0.00113 CGCGG 0.000753 CGCGT 0.00143 CGCTA 0.000389 CGCTC 0.000772 CGCTG 0.000348 CGCTT 0.000784 CGGAA 0.000841 CGGAC 0.000342 CGGAG 0.000535 CGGAT 0.000744 CGGCA 0.000394 CGGCC 0.000488 CGGCG 0.000614 CGGCT 0.000385 CGGGA 0.00056 CGGGC 0.000317 CGGGG 0.00044 CGGGT 0.000294 CGGTA 0.000505 CGGTC 0.00042 CGGTG 0.000598 CGGTT 0.000743 CGTAA 0.00116 CGTAC 0.000681 CGTAG 0.000471 CGTAT 0.00123 CGTCA 0.000559 CGTCC 0.000621 CGTCG 0.00114 CGTCT 0.000634 CGTGA 0.000938 CGTGC 0.000727 CGTGG 0.000753 CGTGT 0.00117 CGTTA 0.00112 CGTTC 0.00139 CGTTG 0.000966 CGTTT 0.00206 CTAAA 0.000873 CTAAC 0.000418 CTAAG 0.00025 CTAAT 0.000891 CTACA 0.000391 CTACC 0.000288 CTACG 0.000471 CTACT 0.000465 CTAGA 0.000355 CTAGC 0.000185 CTAGG 0.000169 CTAGT 0.000251 CTATA 0.00089 CTATC 0.000708 CTATG 0.000371 CTATT 0.00118 CTCAA 0.000512 CTCAC 0.000374 CTCAG 0.000175 CTCAT 0.000494 CTCCA 0.000573 CTCCC 0.000852 CTCCG 0.000535 CTCCT 0.00106 CTCGA 0.00174 CTCGC 0.00103 CTCGG 0.000587 CTCGT 0.00138 CTCTA 0.000541 CTCTC 0.00272 CTCTG 0.000466 CTCTT 0.00154 CTGAA 0.000576 CTGAC 0.000277 CTGAG 0.000175 CTGAT 0.000494 CTGCA 0.000343 CTGCC 0.000309 CTGCG 0.000359 CTGCT 0.000347 CTGGA 0.000411 CTGGC 0.000292 CTGGG 0.000157 CTGGT 0.000284 CTGTA 0.000513 CTGTC 0.000423 CTGTG 0.000362 CTGTT 0.000711 CTTAA 0.000975 CTTAC 0.00052 CTTAG 0.00025 CTTAT 0.00112 CTTCA 0.000636 CTTCC 0.00112 CTTCG 0.00112 CTTCT 0.00162 CTTGA 0.00065 CTTGC 0.000516 CTTGG 0.000437 CTTGT 0.000747 CTTTA 0.0012 CTTTC 0.00207 CTTTG 0.000916 CTTTT 0.00309 GAAAA 0.00453 GAAAC 0.00177 GAAAG 0.00207 GAAAT 0.00294 GAACA 0.000947 GAACC 0.000409 GAACG 0.00139 GAACT 0.000529 GAAGA 0.00213 GAAGC 0.000654 GAAGG 0.00105 GAAGT 0.000658 GAATA 0.00206 GAATC 0.00141 GAATG 0.001 GAATT 0.00228 GACAA 0.000862 GACAC 0.000574 GACAG 0.000423 GACAT 0.000484 GACCA 0.000331 GACCC 0.000196 GACCG 0.00042 GACCT 0.000236 GACGA 0.00127 GACGC 0.000584 GACGG 0.000506 GACGT 0.000605 GACTA 0.000317 GACTC 0.000424 GACTG 0.000296 GACTT 0.000494 GAGAA 0.00228 GAGAC 0.000612 GAGAG 0.00272 GAGAT 0.00121 GAGCA 0.000562 GAGCC 0.000329 GAGCG 0.000772 GAGCT 0.000349 GAGGA 0.00155 GAGGC 0.000528 GAGGG 0.000983 GAGGT 0.000442 GAGTA 0.000578 GAGTC 0.000424 GAGTG 0.000528 GAGTT 0.000726 GATAA 0.00211 GATAC 0.000911 GATAG 0.000708 GATAT 0.00188 GATCA 0.000839 GATCC 0.000723 GATCG 0.00182 GATCT 0.000787 GATGA 0.00111 GATGC 0.000599 GATGG 0.000715 GATGT 0.000669 GATTA 0.00163 GATTC 0.00141 GATTG 0.00089 GATTT 0.00213 GCAAA 0.0011 GCAAC 0.000667 GCAAG 0.000516 GCAAT 0.000884 GCACA 0.000501 GCACC 0.000298 GCACG 0.000727 GCACT 0.00028 GCAGA 0.000419 GCAGC 0.000355 GCAGG 0.000285 GCAGT 0.000298 GCATA 0.000647 GCATC 0.000599 GCATG 0.000363 GCATT 0.000787 GCCAA 0.000512 GCCAC 0.000464 GCCAG 0.000292 GCCAT 0.000405 GCCCA 0.000179 GCCCC 0.000258 GCCCG 0.000317 GCCCT 0.000222 GCCGA 0.000558 GCCGC 0.000527 GCCGG 0.000361 GCCGT 0.000433 GCCTA 0.000203 GCCTC 0.000528 GCCTG 0.000226 GCCTT 0.000368 GCGAA 0.00122 GCGAC 0.000621 GCGAG 0.00103 GCGAT 0.00105 GCGCA 0.000569 GCGCC 0.000419 GCGCG 0.00113 GCGCT 0.000396 GCGGA 0.0006 GCGGC 0.000527 GCGGG 0.000381 GCGGT 0.000467 GCGTA 0.000694 GCGTC 0.000584 GCGTG 0.000868 GCGTT 0.000932 GCTAA 0.000405 GCTAC 0.000326 GCTAG 0.000185 GCTAT 0.000455 GCTCA 0.000253 GCTCC 0.000357 GCTCG 0.000941 GCTCT 0.000459 GCTGA 0.000284 GCTGC 0.000355 GCTGG 0.000277 GCTGT 0.000337 GCTTA 0.000424 GCTTC 0.000654 GCTTG 0.000407 GCTTT 0.000819 GGAAA 0.00217 GGAAC 0.000717 GGAAG 0.00112 GGAAT 0.00115 GGACA 0.000422 GGACC 0.000178 GGACG 0.000621 GGACT 0.000195 GGAGA 0.0012 GGAGC 0.000357 GGAGG 0.00116 GGAGT 0.000307 GGATA 0.000917 GGATC 0.000723 GGATG 0.000637 GGATT 0.000856 GGCAA 0.000547 GGCAC 0.0003 GGCAG 0.000309 GGCAT 0.000303 GGCCA 0.000368 GGCCC 0.000206 GGCCG 0.000488 GGCCT 0.000216 GGCGA 0.000694 GGCGC 0.000419 GGCGG 0.000459 GGCGT 0.000386 GGCTA 0.000235 GGCTC 0.000329 GGCTG 0.000293 GGCTT 0.000301 GGGAA 0.00107 GGGAC 0.000335 GGGAG 0.000852 GGGAT 0.000588 GGGCA 0.000256 GGGCC 0.000206 GGGCG 0.000351 GGGCT 0.000161 GGGGA 0.000832 GGGGC 0.000258 GGGGG 0.000689 GGGGT 0.000269 GGGTA 0.000254 GGGTC 0.000196 GGGTG 0.000357 GGGTT 0.00031 GGTAA 0.00062 GGTAC 0.000256 GGTAG 0.000288 GGTAT 0.000521 GGTCA 0.000286 GGTCC 0.000178 GGTCG 0.000511 GGTCT 0.000209 GGTGA 0.000482 GGTGC 0.000298 GGTGG 0.000586 GGTGT 0.000421 GGTTA 0.000579 GGTTC 0.000409 GGTTG 0.000477 GGTTT 0.000652 GTAAA 0.00164 GTAAC 0.000726 GTAAG 0.00052 GTAAT 0.00147 GTACA 0.000827 GTACC 0.000256 GTACG 0.000681 GTACT 0.00037 GTAGA 0.000608 GTAGC 0.000326 GTAGG 0.000272 GTAGT 0.000408 GTATA 0.00159 GTATC 0.000911 GTATG 0.000582 GTATT 0.00141 GTCAA 0.000615 GTCAC 0.000474 GTCAG 0.000277 GTCAT 0.000499 GTCCA 0.000419 GTCCC 0.000335 GTCCG 0.000342 GTCCT 0.000321 GTCGA 0.0011 GTCGC 0.000621 GTCGG 0.000431 GTCGT 0.000778 GTCTA 0.000346 GTCTC 0.000612 GTCTG 0.000284 GTCTT 0.000559 GTGAA 0.00108 GTGAC 0.000474 GTGAG 0.000374 GTGAT 0.000772 GTGCA 0.000621 GTGCC 0.0003 GTGCG 0.000544 GTGCT 0.00034 GTGGA 0.000839 GTGGC 0.000464 GTGGG 0.000317 GTGGT 0.00046 GTGTA 0.00094 GTGTC 0.000574 GTGTG 0.000761 GTGTT 0.000839 GTTAA 0.00131 GTTAC 0.000726 GTTAG 0.000418 GTTAT 0.0013 GTTCA 0.000734 GTTCC 0.000717 GTTCG 0.00107 GTTCT 0.000761 GTTGA 0.000842 GTTGC 0.000667 GTTGG 0.000582 GTTGT 0.00079 GTTTA 0.00138 GTTTC 0.00177 GTTTG 0.000869 GTTTT 0.002 TAAAA 0.00507 TAAAC 0.00138 TAAAG 0.0012 TAAAT 0.00423 TAACA 0.00122 TAACC 0.000579 TAACG 0.00112 TAACT 0.000841 TAAGA 0.00122 TAAGC 0.000424 TAAGG 0.000415 TAAGT 0.000808 TAATA 0.00399 TAATC 0.00163 TAATG 0.00118 TAATT 0.00437 TACAA 0.00154 TACAC 0.00094 TACAG 0.000513 TACAT 0.00158 TACCA 0.000476 TACCC 0.000254 TACCG 0.000505 TACCT 0.00045 TACGA 0.00129 TACGC 0.000694 TACGG 0.000395 TACGT 0.00116 TACTA 0.000687 TACTC 0.000578 TACTG 0.000341 TACTT 0.00119 TAGAA 0.00148 TAGAC 0.000346 TAGAG 0.000541 TAGAT 0.00108 TAGCA 0.000413 TAGCC 0.000235 TAGCG 0.000389 TAGCT 0.000336 TAGGA 0.000503 TAGGC 0.000203 TAGGG 0.000211 TAGGT 0.000321 TAGTA 0.000687 TAGTC 0.000317 TAGTG 0.000309 TAGTT 0.00078 TATAA 0.00381 TATAC 0.00159 TATAG 0.00089 TATAT 0.00717 TATCA 0.00139 TATCC 0.000917 TATCG 0.00175 TATCT 0.00155 TATGA 0.00111 TATGC 0.000647 TATGG 0.000411 TATGT 0.00134 TATTA 0.00399 TATTC 0.00206 TATTG 0.0014 TATTT 0.00554 TCAAA 0.00177 TCAAC 0.000842 TCAAG 0.00065 TCAAT 0.00166 TCACA 0.000644 TCACC 0.000482 TCACG 0.000938 TCACT 0.000636 TCAGA 0.00055 TCAGC 0.000284 TCAGG 0.000268 TCAGT 0.000419 TCATA 0.00111 TCATC 0.00111 TCATG 0.000487 TCATT 0.00175 TCCAA 0.00109 TCCAC 0.000839 TCCAG 0.000411 TCCAT 0.00106 TCCCA 0.000443 TCCCC 0.000832 TCCCG 0.00056 TCCCT 0.00101 TCCGA 0.000682 TCCGC 0.0006 TCCGG 0.000346 TCCGT 0.000832 TCCTA 0.000503 TCCTC 0.00155 TCCTG 0.000411 TCCTT 0.00156 TCGAA 0.00278 TCGAC 0.0011 TCGAG 0.00174 TCGAT 0.00292 TCGCA 0.000762 TCGCC 0.000694 TCGCG 0.00159 TCGCT 0.000878 TCGGA 0.000682 TCGGC 0.000558 TCGGG 0.000465 TCGGT 0.000767 TCGTA 0.00129 TCGTC 0.00127 TCGTG 0.00116 TCGTT 0.00238 TCTAA 0.00106 TCTAC 0.000608 TCTAG 0.000355 TCTAT 0.00143 TCTCA 0.00073 TCTCC 0.0012 TCTCG 0.0017 TCTCT 0.0032 TCTGA 0.00055 TCTGC 0.000419 TCTGG 0.000339 TCTGT 0.000734 TCTTA 0.00122 TCTTC 0.00213 TCTTG 0.000852 TCTTT 0.00348 TGAAA 0.00265 TGAAC 0.000734 TGAAG 0.000636 TGAAT 0.00173 TGACA 0.000615 TGACC 0.000286 TGACG 0.000559 TGACT 0.000405 TGAGA 0.00073 TGAGC 0.000253 TGAGG 0.000251 TGAGT 0.000322 TGATA 0.00139 TGATC 0.000839 TGATG 0.000649 TGATT 0.00155 TGCAA 0.00109 TGCAC 0.000621 TGCAG 0.000343 TGCAT 0.000921 TGCCA 0.000428 TGCCC 0.000256 TGCCG 0.000394 TGCCT 0.000381 TGCGA 0.000762 TGCGC 0.000569 TGCGG 0.00032 TGCGT 0.000685 TGCTA 0.000413 TGCTC 0.000562 TGCTG 0.0003 TGCTT 0.000686 TGGAA 0.00151 TGGAC 0.000419 TGGAG 0.000573 TGGAT 0.000906 TGGCA 0.000428 TGGCC 0.000368 TGGCG 0.000533 TGGCT 0.000343 TGGGA 0.000443 TGGGC 0.000179 TGGGG 0.000248 TGGGT 0.000227 TGGTA 0.000476 TGGTC 0.000331 TGGTG 0.000432 TGGTT 0.000548 TGTAA 0.00155 TGTAC 0.000827 TGTAG 0.000391 TGTAT 0.00181 TGTCA 0.000615 TGTCC 0.000422 TGTCG 0.000708 TGTCT 0.000597 TGTGA 0.000644 TGTGC 0.000501 TGTGG 0.000294 TGTGT 0.000994 TGTTA 0.00122 TGTTC 0.000947 TGTTG 0.000815 TGTTT 0.00188 TTAAA 0.00421 TTAAC 0.00131 TTAAG 0.000975 TTAAT 0.00401 TTACA 0.00155 TTACC 0.00062 TTACG 0.00116 TTACT 0.00103 TTAGA 0.00106 TTAGC 0.000405 TTAGG 0.000345 TTAGT 0.000622 TTATA 0.00381 TTATC 0.00211 TTATG 0.00115 TTATT 0.00529 TTCAA 0.00218 TTCAC 0.00108 TTCAG 0.000576 TTCAT 0.00192 TTCCA 0.00151 TTCCC 0.00107 TTCCG 0.000841 TTCCT 0.00174 TTCGA 0.00278 TTCGC 0.00122 TTCGG 0.000571 TTCGT 0.00204 TTCTA 0.00148 TTCTC 0.00228 TTCTG 0.000723 TTCTT 0.00384 TTGAA 0.00218 TTGAC 0.000615 TTGAG 0.000512 TTGAT 0.00162 TTGCA 0.00109 TTGCC 0.000547 TTGCG 0.000769 TTGCT 0.000765 TTGGA 0.00109 TTGGC 0.000512 TTGGG 0.000306 TTGGT 0.000561 TTGTA 0.00154 TTGTC 0.000862 TTGTG 0.000711 TTGTT 0.00202 TTTAA 0.00421 TTTAC 0.00164 TTTAG 0.000873 TTTAT 0.00515 TTTCA 0.00265 TTTCC 0.00217 TTTCG 0.0025 TTTCT 0.00399 TTTGA 0.00177 TTTGC 0.0011 TTTGG 0.000692 TTTGT 0.00192 TTTTA 0.00507 TTTTC 0.00453 TTTTG 0.00198 TTTTT 0.0117 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.5034 AAAAC 0.08574 AAAAG 0.1326 AAAAT 0.2783 AAACA 0.3118 AAACC 0.1083 AAACG 0.3416 AAACT 0.2383 AAAGA 0.4783 AAAGC 0.1125 AAAGG 0.1841 AAAGT 0.225 AAATA 0.3606 AAATC 0.1383 AAATG 0.1256 AAATT 0.3756 AACAA 0.4161 AACAC 0.1727 AACAG 0.1465 AACAT 0.2647 AACCA 0.2587 AACCC 0.1466 AACCG 0.351 AACCT 0.2437 AACGA 0.4298 AACGC 0.1683 AACGG 0.156 AACGT 0.2459 AACTA 0.2278 AACTC 0.2118 AACTG 0.1673 AACTT 0.3931 AAGAA 0.5004 AAGAC 0.07283 AAGAG 0.201 AAGAT 0.2258 AAGCA 0.2976 AAGCC 0.1308 AAGCG 0.3402 AAGCT 0.2314 AAGGA 0.4797 AAGGC 0.1134 AAGGG 0.2401 AAGGT 0.1667 AAGTA 0.3174 AAGTC 0.1314 AAGTG 0.1929 AAGTT 0.3582 AATAA 0.4071 AATAC 0.1088 AATAG 0.09057 AATAT 0.3936 AATCA 0.2569 AATCC 0.1414 AATCG 0.3457 AATCT 0.256 AATGA 0.3609 AATGC 0.1622 AATGG 0.1776 AATGT 0.2993 AATTA 0.3039 AATTC 0.1588 AATTG 0.1356 AATTT 0.4017 ACAAA 0.3745 ACAAC 0.1538 ACAAG 0.1455 ACAAT 0.3262 ACACA 0.3192 ACACC 0.135 ACACG 0.3752 ACACT 0.1706 ACAGA 0.3653 ACAGC 0.1678 ACAGG 0.2 ACAGT 0.267 ACATA 0.3382 ACATC 0.1693 ACATG 0.1248 ACATT 0.3677 ACCAA 0.314 ACCAC 0.2571 ACCAG 0.1587 ACCAT 0.2702 ACCCA 0.2028 ACCCC 0.2404 ACCCG 0.2634 ACCCT 0.2934 ACCGA 0.3385 ACCGC 0.2062 ACCGG 0.184 ACCGT 0.2713 ACCTA 0.1999 ACCTC 0.276 ACCTG 0.1867 ACCTT 0.3374 ACGAA 0.3342 ACGAC 0.1277 ACGAG 0.2263 ACGAT 0.3118 ACGCA 0.2226 ACGCC 0.1255 ACGCG 0.4651 ACGCT 0.1867 ACGGA 0.3504 ACGGC 0.1827 ACGGG 0.2078 ACGGT 0.2591 ACGTA 0.2843 ACGTC 0.1482 ACGTG 0.2337 ACGTT 0.3338 ACTAA 0.2969 ACTAC 0.1949 ACTAG 0.12 ACTAT 0.3882 ACTCA 0.1427 ACTCC 0.136 ACTCG 0.4587 ACTCT 0.2627 ACTGA 0.2717 ACTGC 0.1935 ACTGG 0.187 ACTGT 0.3478 ACTTA 0.215 ACTTC 0.1751 ACTTG 0.1742 ACTTT 0.4357 AGAAA 0.4789 AGAAC 0.09141 AGAAG 0.195 AGAAT 0.2347 AGACA 0.3318 AGACC 0.1158 AGACG 0.3521 AGACT 0.2002 AGAGA 0.6062 AGAGC 0.087 AGAGG 0.1945 AGAGT 0.1123 AGATA 0.3366 AGATC 0.1711 AGATG 0.1555 AGATT 0.3368 AGCAA 0.3902 AGCAC 0.1734 AGCAG 0.1768 AGCAT 0.2596 AGCCA 0.2969 AGCCC 0.1396 AGCCG 0.3331 AGCCT 0.2304 AGCGA 0.3832 AGCGC 0.1727 AGCGG 0.1933 AGCGT 0.2508 AGCTA 0.2194 AGCTC 0.2279 AGCTG 0.2043 AGCTT 0.3484 AGGAA 0.434 AGGAC 0.07983 AGGAG 0.2634 AGGAT 0.2228 AGGCA 0.2882 AGGCC 0.1629 AGGCG 0.3475 AGGCT 0.2014 AGGGA 0.4528 AGGGC 0.09948 AGGGG 0.3008 AGGGT 0.147 AGGTA 0.2807 AGGTC 0.1474 AGGTG 0.2504 AGGTT 0.3215 AGTAA 0.3663 AGTAC 0.1321 AGTAG 0.1662 AGTAT 0.3354 AGTCA 0.2645 AGTCC 0.1276 AGTCG 0.3725 AGTCT 0.2354 AGTGA 0.336 AGTGC 0.1478 AGTGG 0.2356 AGTGT 0.2806 AGTTA 0.2454 AGTTC 0.1542 AGTTG 0.1816 AGTTT 0.4188 ATAAA 0.4165 ATAAC 0.1051 ATAAG 0.09041 ATAAT 0.388 ATACA 0.4023 ATACC 0.116 ATACG 0.2729 ATACT 0.2088 ATAGA 0.4535 ATAGC 0.1447 ATAGG 0.1436 ATAGT 0.2582 ATATA 0.4606 ATATC 0.121 ATATG 0.08964 ATATT 0.3288 ATCAA 0.3658 ATCAC 0.174 ATCAG 0.1115 ATCAT 0.3487 ATCCA 0.2891 ATCCC 0.1877 ATCCG 0.2374 ATCCT 0.2857 ATCGA 0.4318 ATCGC 0.156 ATCGG 0.1309 ATCGT 0.2814 ATCTA 0.2358 ATCTC 0.2637 ATCTG 0.1237 ATCTT 0.3769 ATGAA 0.4302 ATGAC 0.112 ATGAG 0.1108 ATGAT 0.347 ATGCA 0.3843 ATGCC 0.1264 ATGCG 0.2769 ATGCT 0.2124 ATGGA 0.4692 ATGGC 0.1786 ATGGG 0.1395 ATGGT 0.2128 ATGTA 0.4003 ATGTC 0.1224 ATGTG 0.1519 ATGTT 0.3254 ATTAA 0.359 ATTAC 0.1314 ATTAG 0.07988 ATTAT 0.4297 ATTCA 0.2564 ATTCC 0.1709 ATTCG 0.2834 ATTCT 0.2893 ATTGA 0.3339 ATTGC 0.1773 ATTGG 0.1529 ATTGT 0.336 ATTTA 0.2751 ATTTC 0.191 ATTTG 0.112 ATTTT 0.422 CAAAA 0.3609 CAAAC 0.1584 CAAAG 0.167 CAAAT 0.3137 CAACA 0.2829 CAACC 0.1655 CAACG 0.3354 CAACT 0.2161 CAAGA 0.3626 CAAGC 0.1733 CAAGG 0.1858 CAAGT 0.2784 CAATA 0.2816 CAATC 0.1784 CAATG 0.1488 CAATT 0.3911 CACAA 0.292 CACAC 0.3127 CACAG 0.1487 CACAT 0.2465 CACCA 0.2413 CACCC 0.1994 CACCG 0.3346 CACCT 0.2246 CACGA 0.3226 CACGC 0.242 CACGG 0.1696 CACGT 0.2658 CACTA 0.1632 CACTC 0.2788 CACTG 0.1749 CACTT 0.3831 CAGAA 0.3541 CAGAC 0.1389 CAGAG 0.2284 CAGAT 0.2786 CAGCA 0.2394 CAGCC 0.2336 CAGCG 0.2776 CAGCT 0.2495 CAGGA 0.344 CAGGC 0.1889 CAGGG 0.2162 CAGGT 0.2508 CAGTA 0.2213 CAGTC 0.1921 CAGTG 0.2147 CAGTT 0.3718 CATAA 0.3293 CATAC 0.1662 CATAG 0.1061 CATAT 0.3984 CATCA 0.2098 CATCC 0.2058 CATCG 0.3532 CATCT 0.2312 CATGA 0.2995 CATGC 0.2233 CATGG 0.1738 CATGT 0.3034 CATTA 0.2424 CATTC 0.2068 CATTG 0.1529 CATTT 0.3979 CCAAA 0.2799 CCAAC 0.2352 CCAAG 0.1766 CCAAT 0.3083 CCACA 0.1415 CCACC 0.282 CCACG 0.3621 CCACT 0.2145 CCAGA 0.2963 CCAGC 0.242 CCAGG 0.2094 CCAGT 0.2523 CCATA 0.1809 CCATC 0.315 CCATG 0.1244 CCATT 0.3797 CCCAA 0.2788 CCCAC 0.2889 CCCAG 0.1435 CCCAT 0.2887 CCCCA 0.121 CCCCC 0.3364 CCCCG 0.2149 CCCCT 0.3277 CCCGA 0.2885 CCCGC 0.2362 CCCGG 0.1691 CCCGT 0.3061 CCCTA 0.09449 CCCTC 0.4405 CCCTG 0.1157 CCCTT 0.3493 CCGAA 0.2308 CCGAC 0.1744 CCGAG 0.2374 CCGAT 0.3574 CCGCA 0.162 CCGCC 0.2323 CCGCG 0.3814 CCGCT 0.2243 CCGGA 0.2478 CCGGC 0.2587 CCGGG 0.195 CCGGT 0.2985 CCGTA 0.1663 CCGTC 0.2133 CCGTG 0.2565 CCGTT 0.3639 CCTAA 0.2787 CCTAC 0.22 CCTAG 0.1363 CCTAT 0.365 CCTCA 0.07177 CCTCC 0.3308 CCTCG 0.304 CCTCT 0.2934 CCTGA 0.2247 CCTGC 0.2385 CCTGG 0.2004 CCTGT 0.3364 CCTTA 0.1278 CCTTC 0.325 CCTTG 0.1345 CCTTT 0.4127 CGAAA 0.379 CGAAC 0.1614 CGAAG 0.1698 CGAAT 0.2898 CGACA 0.2414 CGACC 0.1741 CGACG 0.3901 CGACT 0.1944 CGAGA 0.3589 CGAGC 0.1985 CGAGG 0.2243 CGAGT 0.2182 CGATA 0.2596 CGATC 0.269 CGATG 0.1618 CGATT 0.3096 CGCAA 0.3292 CGCAC 0.233 CGCAG 0.1539 CGCAT 0.284 CGCCA 0.2721 CGCCC 0.1795 CGCCG 0.3135 CGCCT 0.2349 CGCGA 0.3245 CGCGC 0.2298 CGCGG 0.1537 CGCGT 0.292 CGCTA 0.1698 CGCTC 0.3366 CGCTG 0.1517 CGCTT 0.3419 CGGAA 0.3416 CGGAC 0.139 CGGAG 0.2173 CGGAT 0.3022 CGGCA 0.2092 CGGCC 0.2595 CGGCG 0.3264 CGGCT 0.2049 CGGGA 0.3477 CGGGC 0.1966 CGGGG 0.273 CGGGT 0.1827 CGGTA 0.2228 CGGTC 0.1853 CGGTG 0.264 CGGTT 0.3279 CGTAA 0.3276 CGTAC 0.1925 CGTAG 0.133 CGTAT 0.3468 CGTCA 0.189 CGTCC 0.2099 CGTCG 0.3868 CGTCT 0.2142 CGTGA 0.2616 CGTGC 0.2026 CGTGG 0.21 CGTGT 0.3258 CGTTA 0.202 CGTTC 0.2517 CGTTG 0.1745 CGTTT 0.3718 CTAAA 0.3589 CTAAC 0.1718 CTAAG 0.1029 CTAAT 0.3664 CTACA 0.2419 CTACC 0.1785 CTACG 0.2915 CTACT 0.2881 CTAGA 0.3696 CTAGC 0.1927 CTAGG 0.1758 CTAGT 0.2618 CTATA 0.283 CTATC 0.2249 CTATG 0.118 CTATT 0.3741 CTCAA 0.3296 CTCAC 0.2402 CTCAG 0.1125 CTCAT 0.3177 CTCCA 0.1899 CTCCC 0.2823 CTCCG 0.1771 CTCCT 0.3506 CTCGA 0.3672 CTCGC 0.2179 CTCGG 0.1239 CTCGT 0.291 CTCTA 0.1025 CTCTC 0.5165 CTCTG 0.08842 CTCTT 0.2925 CTGAA 0.3784 CTGAC 0.182 CTGAG 0.1149 CTGAT 0.3247 CTGCA 0.2525 CTGCC 0.2275 CTGCG 0.2647 CTGCT 0.2553 CTGGA 0.3593 CTGGC 0.2551 CTGGG 0.1376 CTGGT 0.248 CTGTA 0.2553 CTGTC 0.2107 CTGTG 0.18 CTGTT 0.3539 CTTAA 0.3407 CTTAC 0.1816 CTTAG 0.08742 CTTAT 0.3903 CTTCA 0.1413 CTTCC 0.2488 CTTCG 0.2492 CTTCT 0.3607 CTTGA 0.2768 CTTGC 0.2197 CTTGG 0.1858 CTTGT 0.3178 CTTTA 0.1643 CTTTC 0.2848 CTTTG 0.126 CTTTT 0.4249 GAAAA 0.4005 GAAAC 0.1567 GAAAG 0.1831 GAAAT 0.2596 GAACA 0.289 GAACC 0.1247 GAACG 0.425 GAACT 0.1613 GAAGA 0.4736 GAAGC 0.1454 GAAGG 0.2346 GAAGT 0.1463 GAATA 0.3053 GAATC 0.2081 GAATG 0.1485 GAATT 0.3381 GACAA 0.3678 GACAC 0.2451 GACAG 0.1807 GACAT 0.2064 GACCA 0.2796 GACCC 0.1654 GACCG 0.355 GACCT 0.1999 GACGA 0.4276 GACGC 0.1972 GACGG 0.1709 GACGT 0.2042 GACTA 0.2071 GACTC 0.2768 GACTG 0.1934 GACTT 0.3227 GAGAA 0.3335 GAGAC 0.08969 GAGAG 0.3992 GAGAT 0.1777 GAGCA 0.2794 GAGCC 0.1635 GAGCG 0.3838 GAGCT 0.1734 GAGGA 0.4419 GAGGC 0.1508 GAGGG 0.2809 GAGGT 0.1265 GAGTA 0.2562 GAGTC 0.1879 GAGTG 0.2341 GAGTT 0.3218 GATAA 0.3759 GATAC 0.1624 GATAG 0.1261 GATAT 0.3356 GATCA 0.2014 GATCC 0.1735 GATCG 0.4362 GATCT 0.189 GATGA 0.3589 GATGC 0.1937 GATGG 0.2312 GATGT 0.2162 GATTA 0.2693 GATTC 0.2323 GATTG 0.147 GATTT 0.3514 GCAAA 0.3477 GCAAC 0.2104 GCAAG 0.1629 GCAAT 0.279 GCACA 0.2774 GCACC 0.165 GCACG 0.4026 GCACT 0.155 GCAGA 0.3087 GCAGC 0.2615 GCAGG 0.2099 GCAGT 0.2199 GCATA 0.27 GCATC 0.2501 GCATG 0.1514 GCATT 0.3285 GCCAA 0.3061 GCCAC 0.2772 GCCAG 0.1744 GCCAT 0.2423 GCCCA 0.1838 GCCCC 0.2645 GCCCG 0.3244 GCCCT 0.2274 GCCGA 0.297 GCCGC 0.2803 GCCGG 0.1922 GCCGT 0.2305 GCCTA 0.1531 GCCTC 0.3984 GCCTG 0.1704 GCCTT 0.278 GCGAA 0.3101 GCGAC 0.1583 GCGAG 0.2631 GCGAT 0.2685 GCGCA 0.2266 GCGCC 0.1671 GCGCG 0.4488 GCGCT 0.1576 GCGGA 0.3039 GCGGC 0.2668 GCGGG 0.1927 GCGGT 0.2366 GCGTA 0.2255 GCGTC 0.1897 GCGTG 0.2821 GCGTT 0.3028 GCTAA 0.2956 GCTAC 0.2375 GCTAG 0.1349 GCTAT 0.332 GCTCA 0.126 GCTCC 0.1775 GCTCG 0.4682 GCTCT 0.2284 GCTGA 0.2267 GCTGC 0.2833 GCTGG 0.2209 GCTGT 0.2691 GCTTA 0.184 GCTTC 0.2839 GCTTG 0.1768 GCTTT 0.3553 GGAAA 0.421 GGAAC 0.1389 GGAAG 0.2167 GGAAT 0.2235 GGACA 0.2978 GGACC 0.1257 GGACG 0.4386 GGACT 0.1379 GGAGA 0.3964 GGAGC 0.1183 GGAGG 0.3837 GGAGT 0.1017 GGATA 0.2926 GGATC 0.2308 GGATG 0.2033 GGATT 0.2732 GGCAA 0.3751 GGCAC 0.2059 GGCAG 0.2116 GGCAT 0.2074 GGCCA 0.2877 GGCCC 0.1616 GGCCG 0.3819 GGCCT 0.1688 GGCGA 0.3543 GGCGC 0.2142 GGCGG 0.2343 GGCGT 0.1973 GGCTA 0.2027 GGCTC 0.284 GGCTG 0.2529 GGCTT 0.2603 GGGAA 0.3761 GGGAC 0.1178 GGGAG 0.2995 GGGAT 0.2066 GGGCA 0.2628 GGGCC 0.2116 GGGCG 0.3601 GGGCT 0.1655 GGGGA 0.4062 GGGGC 0.1261 GGGGG 0.3364 GGGGT 0.1313 GGGTA 0.2276 GGGTC 0.1752 GGGTG 0.3193 GGGTT 0.2778 GGTAA 0.3679 GGTAC 0.1519 GGTAG 0.1709 GGTAT 0.3093 GGTCA 0.2414 GGTCC 0.1505 GGTCG 0.4318 GGTCT 0.1763 GGTGA 0.2698 GGTGC 0.1667 GGTGG 0.3282 GGTGT 0.2353 GGTTA 0.2735 GGTTC 0.193 GGTTG 0.2252 GGTTT 0.3082 GTAAA 0.3769 GTAAC 0.1668 GTAAG 0.1194 GTAAT 0.3368 GTACA 0.3877 GTACC 0.1199 GTACG 0.3191 GTACT 0.1733 GTAGA 0.3766 GTAGC 0.2018 GTAGG 0.1688 GTAGT 0.2528 GTATA 0.3532 GTATC 0.2028 GTATG 0.1295 GTATT 0.3145 GTCAA 0.3298 GTCAC 0.2542 GTCAG 0.1486 GTCAT 0.2674 GTCCA 0.2956 GTCCC 0.2367 GTCCG 0.2414 GTCCT 0.2263 GTCGA 0.3762 GTCGC 0.2117 GTCGG 0.147 GTCGT 0.2651 GTCTA 0.1921 GTCTC 0.3399 GTCTG 0.1575 GTCTT 0.3105 GTGAA 0.4001 GTGAC 0.1757 GTGAG 0.1384 GTGAT 0.2858 GTGCA 0.3439 GTGCC 0.1664 GTGCG 0.3015 GTGCT 0.1882 GTGGA 0.4037 GTGGC 0.2229 GTGGG 0.1523 GTGGT 0.221 GTGTA 0.3019 GTGTC 0.1844 GTGTG 0.2444 GTGTT 0.2693 GTTAA 0.3491 GTTAC 0.1935 GTTAG 0.1113 GTTAT 0.3461 GTTCA 0.2239 GTTCC 0.2188 GTTCG 0.3252 GTTCT 0.2322 GTTGA 0.2924 GTTGC 0.2314 GTTGG 0.2019 GTTGT 0.2742 GTTTA 0.2292 GTTTC 0.2945 GTTTG 0.1443 GTTTT 0.332 TAAAA 0.4268 TAAAC 0.1163 TAAAG 0.1007 TAAAT 0.3562 TAACA 0.3239 TAACC 0.1543 TAACG 0.2978 TAACT 0.224 TAAGA 0.4248 TAAGC 0.148 TAAGG 0.1449 TAAGT 0.2822 TAATA 0.3571 TAATC 0.146 TAATG 0.1054 TAATT 0.3915 TACAA 0.337 TACAC 0.2054 TACAG 0.1121 TACAT 0.3455 TACCA 0.2825 TACCC 0.1508 TACCG 0.2995 TACCT 0.2672 TACGA 0.3647 TACGC 0.1961 TACGG 0.1115 TACGT 0.3277 TACTA 0.2453 TACTC 0.2064 TACTG 0.1219 TACTT 0.4263 TAGAA 0.4287 TAGAC 0.1003 TAGAG 0.1567 TAGAT 0.3143 TAGCA 0.3008 TAGCC 0.1709 TAGCG 0.2836 TAGCT 0.2447 TAGGA 0.4068 TAGGC 0.1638 TAGGG 0.1703 TAGGT 0.259 TAGTA 0.328 TAGTC 0.1515 TAGTG 0.1476 TAGTT 0.3728 TATAA 0.283 TATAC 0.118 TATAG 0.06619 TATAT 0.5328 TATCA 0.248 TATCC 0.1634 TATCG 0.3126 TATCT 0.276 TATGA 0.3164 TATGC 0.1847 TATGG 0.1173 TATGT 0.3816 TATTA 0.3067 TATTC 0.1586 TATTG 0.108 TATTT 0.4267 TCAAA 0.3594 TCAAC 0.1709 TCAAG 0.132 TCAAT 0.3377 TCACA 0.2384 TCACC 0.1786 TCACG 0.3475 TCACT 0.2356 TCAGA 0.3616 TCAGC 0.1866 TCAGG 0.1764 TCAGT 0.2754 TCATA 0.2486 TCATC 0.2491 TCATG 0.1092 TCATT 0.393 TCCAA 0.3207 TCCAC 0.2463 TCCAG 0.1205 TCCAT 0.3125 TCCCA 0.1557 TCCCC 0.2923 TCCCG 0.1969 TCCCT 0.3551 TCCGA 0.2773 TCCGC 0.2439 TCCGG 0.1407 TCCGT 0.338 TCCTA 0.1253 TCCTC 0.3849 TCCTG 0.1022 TCCTT 0.3875 TCGAA 0.3254 TCGAC 0.1293 TCGAG 0.2038 TCGAT 0.3415 TCGCA 0.1942 TCGCC 0.1768 TCGCG 0.4053 TCGCT 0.2237 TCGGA 0.2759 TCGGC 0.2258 TCGGG 0.188 TCGGT 0.3102 TCGTA 0.2118 TCGTC 0.2078 TCGTG 0.1899 TCGTT 0.3905 TCTAA 0.3074 TCTAC 0.1762 TCTAG 0.1028 TCTAT 0.4136 TCTCA 0.1069 TCTCC 0.1752 TCTCG 0.2492 TCTCT 0.4687 TCTGA 0.2695 TCTGC 0.2052 TCTGG 0.1659 TCTGT 0.3594 TCTTA 0.1584 TCTTC 0.2774 TCTTG 0.111 TCTTT 0.4532 TGAAA 0.4611 TGAAC 0.1275 TGAAG 0.1105 TGAAT 0.3009 TGACA 0.3296 TGACC 0.1531 TGACG 0.3 TGACT 0.2172 TGAGA 0.469 TGAGC 0.1628 TGAGG 0.1614 TGAGT 0.2069 TGATA 0.3138 TGATC 0.1892 TGATG 0.1464 TGATT 0.3506 TGCAA 0.3656 TGCAC 0.209 TGCAG 0.1154 TGCAT 0.31 TGCCA 0.2934 TGCCC 0.1757 TGCCG 0.2696 TGCCT 0.2613 TGCGA 0.3263 TGCGC 0.2435 TGCGG 0.1369 TGCGT 0.2933 TGCTA 0.2106 TGCTC 0.2866 TGCTG 0.1531 TGCTT 0.3498 TGGAA 0.4431 TGGAC 0.1229 TGGAG 0.1682 TGGAT 0.2657 TGGCA 0.2561 TGGCC 0.2198 TGGCG 0.3186 TGGCT 0.2054 TGGGA 0.4039 TGGGC 0.1636 TGGGG 0.2259 TGGGT 0.2066 TGGTA 0.2666 TGGTC 0.1852 TGGTG 0.2416 TGGTT 0.3066 TGTAA 0.3388 TGTAC 0.1808 TGTAG 0.08532 TGTAT 0.3951 TGTCA 0.2624 TGTCC 0.1801 TGTCG 0.3024 TGTCT 0.255 TGTGA 0.2646 TGTGC 0.2059 TGTGG 0.121 TGTGT 0.4086 TGTTA 0.2503 TGTTC 0.1951 TGTTG 0.1678 TGTTT 0.3868 TTAAA 0.401 TTAAC 0.1248 TTAAG 0.09286 TTAAT 0.3814 TTACA 0.3561 TTACC 0.1424 TTACG 0.2661 TTACT 0.2354 TTAGA 0.436 TTAGC 0.1666 TTAGG 0.1418 TTAGT 0.2555 TTATA 0.308 TTATC 0.1707 TTATG 0.09326 TTATT 0.4281 TTCAA 0.379 TTCAC 0.1877 TTCAG 0.1001 TTCAT 0.3331 TTCCA 0.2924 TTCCC 0.2072 TTCCG 0.1628 TTCCT 0.3375 TTCGA 0.4208 TTCGC 0.1843 TTCGG 0.08645 TTCGT 0.3084 TTCTA 0.1778 TTCTC 0.2735 TTCTG 0.08689 TTCTT 0.4618 TTGAA 0.4423 TTGAC 0.1248 TTGAG 0.1039 TTGAT 0.329 TTGCA 0.3429 TTGCC 0.1728 TTGCG 0.2427 TTGCT 0.2415 TTGGA 0.4422 TTGGC 0.2071 TTGGG 0.1237 TTGGT 0.227 TTGTA 0.3003 TTGTC 0.1678 TTGTG 0.1384 TTGTT 0.3935 TTTAA 0.3547 TTTAC 0.1382 TTTAG 0.07354 TTTAT 0.4335 TTTCA 0.2345 TTTCC 0.1921 TTTCG 0.2212 TTTCT 0.3522 TTTGA 0.3228 TTTGC 0.2007 TTTGG 0.1261 TTTGT 0.3504 TTTTA 0.2173 TTTTC 0.1944 TTTTG 0.08493 TTTTT 0.5034