[1] # (a,c,g,t)= (0.295, 0.205, 0.205, 0.295) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.277 C 0.222 G 0.222 T 0.278 # l= 1 # Values AA 0.0896 AC 0.053 AG 0.0719 AT 0.0629 CA 0.0754 CC 0.054 CG 0.0212 CT 0.0719 GA 0.0572 GC 0.0582 GG 0.054 GT 0.053 TA 0.0553 TC 0.0572 TG 0.0754 TT 0.0897 # l= 2 # Values AAA 0.0337 AAC 0.0158 AAG 0.0206 AAT 0.0195 ACA 0.0212 ACC 0.011 ACG 0.00482 ACT 0.016 AGA 0.0203 AGC 0.0189 AGG 0.0167 AGT 0.016 ATA 0.0151 ATC 0.0118 ATG 0.0165 ATT 0.0195 CAA 0.0181 CAC 0.0163 CAG 0.0244 CAT 0.0165 CCA 0.0163 CCC 0.0145 CCG 0.00645 CCT 0.0167 CGA 0.00329 CGC 0.00665 CGG 0.00645 CGT 0.00482 CTA 0.0106 CTC 0.0163 CTG 0.0244 CTT 0.0206 GAA 0.0199 GAC 0.00922 GAG 0.0163 GAT 0.0118 GCA 0.0196 GCC 0.0131 GCG 0.00665 GCT 0.0189 GGA 0.0154 GGC 0.0131 GGG 0.0145 GGT 0.011 GTA 0.0117 GTC 0.00922 GTG 0.0164 GTT 0.0158 TAA 0.0179 TAC 0.0117 TAG 0.0106 TAT 0.0151 TCA 0.0182 TCC 0.0154 TCG 0.00329 TCT 0.0203 TGA 0.0182 TGC 0.0196 TGG 0.0163 TGT 0.0212 TTA 0.0179 TTC 0.0199 TTG 0.0181 TTT 0.0337 # l= 3 # Values AAAA 0.0128 AAAC 0.00589 AAAG 0.00725 AAAT 0.00782 AACA 0.00662 AACC 0.00315 AACG 0.00132 AACT 0.00468 AAGA 0.00611 AAGC 0.00488 AAGG 0.00485 AAGT 0.00479 AATA 0.00553 AATC 0.00331 AATG 0.00532 AATT 0.00537 ACAA 0.00566 ACAC 0.0043 ACAG 0.00668 ACAT 0.0046 ACCA 0.00384 ACCC 0.0025 ACCG 0.00107 ACCT 0.00359 ACGA 0.000902 ACGC 0.00116 ACGG 0.00126 ACGT 0.0015 ACTA 0.00265 ACTC 0.00287 ACTG 0.00566 ACTT 0.00479 AGAA 0.00746 AGAC 0.00314 AGAG 0.00542 AGAT 0.00426 AGCA 0.00721 AGCC 0.00402 AGCG 0.00181 AGCT 0.00589 AGGA 0.00536 AGGC 0.00371 AGGG 0.00408 AGGT 0.00359 AGTA 0.00379 AGTC 0.00278 AGTG 0.00471 AGTT 0.00468 ATAA 0.00486 ATAC 0.0031 ATAG 0.0028 ATAT 0.00431 ATCA 0.00404 ATCC 0.00289 ATCG 0.000654 ATCT 0.00426 ATGA 0.00429 ATGC 0.0039 ATGG 0.0037 ATGT 0.0046 ATTA 0.00439 ATTC 0.00385 ATTG 0.00347 ATTT 0.00782 CAAA 0.00687 CAAC 0.00349 CAAG 0.00428 CAAT 0.00347 CACA 0.0062 CACC 0.0037 CACG 0.00174 CACT 0.00471 CAGA 0.00648 CAGC 0.00721 CAGG 0.00507 CAGT 0.00566 CATA 0.00334 CATC 0.00386 CATG 0.00396 CATT 0.00532 CCAA 0.00396 CCAC 0.00382 CCAG 0.00482 CCAT 0.0037 CCCA 0.00422 CCCC 0.00414 CCCG 0.00209 CCCT 0.00408 CCGA 0.000958 CCGC 0.00253 CCGG 0.0017 CCGT 0.00126 CCTA 0.00228 CCTC 0.00453 CCTG 0.00507 CCTT 0.00485 CGAA 0.000773 CGAC 0.000612 CGAG 0.00125 CGAT 0.000654 CGCA 0.00137 CGCC 0.002 CGCG 0.00148 CGCT 0.0018 CGGA 0.00111 CGGC 0.00217 CGGG 0.00209 CGGT 0.00107 CGTA 0.000838 CGTC 0.000926 CGTG 0.00174 CGTT 0.00132 CTAA 0.00326 CTAC 0.00258 CTAG 0.00195 CTAT 0.0028 CTCA 0.00476 CTCC 0.00485 CTCG 0.00125 CTCT 0.00542 CTGA 0.00585 CTGC 0.00707 CTGG 0.00482 CTGT 0.00668 CTTA 0.00361 CTTC 0.00549 CTTG 0.00428 CTTT 0.00725 GAAA 0.00727 GAAC 0.00325 GAAG 0.00548 GAAT 0.00385 GACA 0.00361 GACC 0.0019 GACG 0.000926 GACT 0.00278 GAGA 0.00457 GAGC 0.00431 GAGG 0.00453 GAGT 0.00287 GATA 0.00258 GATC 0.0021 GATG 0.00386 GATT 0.00331 GCAA 0.00443 GCAC 0.0042 GCAG 0.00707 GCAT 0.0039 GCCA 0.00358 GCCC 0.00361 GCCG 0.00217 GCCT 0.00371 GCGA 0.00091 GCGC 0.00205 GCGG 0.00253 GCGT 0.00116 GCTA 0.00253 GCTC 0.00431 GCTG 0.00721 GCTT 0.00488 GGAA 0.00532 GGAC 0.00234 GGAG 0.00485 GGAT 0.00289 GGCA 0.00423 GGCC 0.00282 GGCG 0.002 GGCT 0.00402 GGGA 0.00428 GGGC 0.00361 GGGG 0.00414 GGGT 0.0025 GGTA 0.00225 GGTC 0.0019 GGTG 0.0037 GGTT 0.00315 GTAA 0.00366 GTAC 0.00235 GTAG 0.00258 GTAT 0.0031 GTCA 0.00312 GTCC 0.00234 GTCG 0.000612 GTCT 0.00314 GTGA 0.00402 GTGC 0.0042 GTGG 0.00382 GTGT 0.0043 GTTA 0.00314 GTTC 0.00325 GTTG 0.00349 GTTT 0.00589 TAAA 0.00681 TAAC 0.00314 TAAG 0.0036 TAAT 0.00439 TACA 0.0048 TACC 0.00225 TACG 0.000838 TACT 0.00379 TAGA 0.00312 TAGC 0.00253 TAGG 0.00228 TAGT 0.00265 TATA 0.00361 TATC 0.00258 TATG 0.00334 TATT 0.00553 TCAA 0.00407 TCAC 0.00402 TCAG 0.00585 TCAT 0.00429 TCCA 0.00465 TCCC 0.00428 TCCG 0.00111 TCCT 0.00536 TCGA 0.000518 TCGC 0.00091 TCGG 0.000958 TCGT 0.000902 TCTA 0.00312 TCTC 0.00457 TCTG 0.00648 TCTT 0.00611 TGAA 0.00631 TGAC 0.00312 TGAG 0.00476 TGAT 0.00404 TGCA 0.00679 TGCC 0.00423 TGCG 0.00137 TGCT 0.00721 TGGA 0.00465 TGGC 0.00358 TGGG 0.00422 TGGT 0.00384 TGTA 0.0048 TGTC 0.00361 TGTG 0.0062 TGTT 0.00662 TTAA 0.00617 TTAC 0.00366 TTAG 0.00326 TTAT 0.00486 TTCA 0.00631 TTCC 0.00532 TTCG 0.000773 TTCT 0.00746 TTGA 0.00407 TTGC 0.00443 TTGG 0.00396 TTGT 0.00566 TTTA 0.00681 TTTC 0.00727 TTTG 0.00687 TTTT 0.0128 # l= 4 # Values AAAAA 0.00534 AAAAC 0.0022 AAAAG 0.00246 AAAAT 0.00278 AAACA 0.00261 AAACC 0.00122 AAACG 0.000432 AAACT 0.00162 AAAGA 0.00222 AAAGC 0.00189 AAAGG 0.00163 AAAGT 0.00152 AAATA 0.00252 AAATC 0.00138 AAATG 0.00215 AAATT 0.00177 AACAA 0.00199 AACAC 0.00136 AACAG 0.00188 AACAT 0.0014 AACCA 0.00119 AACCC 0.000747 AACCG 0.000227 AACCT 0.000994 AACGA 0.000275 AACGC 0.000331 AACGG 0.000286 AACGT 0.000427 AACTA 0.000877 AACTC 0.00089 AACTG 0.00155 AACTT 0.00136 AAGAA 0.00237 AAGAC 0.000966 AAGAG 0.00153 AAGAT 0.00124 AAGCA 0.00206 AAGCC 0.000984 AAGCG 0.000345 AAGCT 0.00149 AAGGA 0.00166 AAGGC 0.0011 AAGGG 0.00111 AAGGT 0.000991 AAGTA 0.00123 AAGTC 0.000878 AAGTG 0.00132 AAGTT 0.00136 AATAA 0.00197 AATAC 0.00115 AATAG 0.000957 AATAT 0.00146 AATCA 0.00123 AATCC 0.0008 AATCG 0.000159 AATCT 0.00112 AATGA 0.00148 AATGC 0.00128 AATGG 0.00111 AATGT 0.00145 AATTA 0.00145 AATTC 0.00115 AATTG 0.001 AATTT 0.00177 ACAAA 0.00229 ACAAC 0.00109 ACAAG 0.00123 ACAAT 0.00104 ACACA 0.00182 ACACC 0.000874 ACACG 0.000431 ACACT 0.00118 ACAGA 0.00197 ACAGC 0.00194 ACAGG 0.00126 ACAGT 0.00151 ACATA 0.00104 ACATC 0.00104 ACATG 0.00106 ACATT 0.00145 ACCAA 0.00103 ACCAC 0.000963 ACCAG 0.00102 ACCAT 0.000824 ACCCA 0.000876 ACCCC 0.000679 ACCCG 0.000248 ACCCT 0.0007 ACCGA 0.000228 ACCGC 0.000384 ACCGG 0.000215 ACCGT 0.000243 ACCTA 0.000561 ACCTC 0.00095 ACCTG 0.00109 ACCTT 0.000991 ACGAA 0.000255 ACGAC 0.000161 ACGAG 0.000292 ACGAT 0.000194 ACGCA 0.000355 ACGCC 0.00025 ACGCG 0.000193 ACGCT 0.000361 ACGGA 0.000293 ACGGC 0.000388 ACGGG 0.000337 ACGGT 0.000243 ACGTA 0.000307 ACGTC 0.000255 ACGTG 0.000511 ACGTT 0.000427 ACTAA 0.000846 ACTAC 0.000659 ACTAG 0.000472 ACTAT 0.000668 ACTCA 0.00098 ACTCC 0.000763 ACTCG 0.000194 ACTCT 0.000931 ACTGA 0.00157 ACTGC 0.00157 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00151 ACTTA 0.000914 ACTTC 0.00128 ACTTG 0.00107 ACTTT 0.00152 AGAAA 0.00286 AGAAC 0.00126 AGAAG 0.00192 AGAAT 0.00142 AGACA 0.00129 AGACC 0.000642 AGACG 0.00025 AGACT 0.000961 AGAGA 0.00166 AGAGC 0.00145 AGAGG 0.00138 AGAGT 0.000931 AGATA 0.000996 AGATC 0.000766 AGATG 0.00137 AGATT 0.00112 AGCAA 0.00176 AGCAC 0.00159 AGCAG 0.00247 AGCAT 0.00139 AGCCA 0.00127 AGCCC 0.00111 AGCCG 0.000448 AGCCT 0.00119 AGCGA 0.000322 AGCGC 0.000574 AGCGG 0.000549 AGCGT 0.000361 AGCTA 0.000881 AGCTC 0.00135 AGCTG 0.00216 AGCTT 0.00149 AGGAA 0.00198 AGGAC 0.000834 AGGAG 0.00159 AGGAT 0.000952 AGGCA 0.00141 AGGCC 0.000718 AGGCG 0.000388 AGGCT 0.00119 AGGGA 0.00138 AGGGC 0.000984 AGGGG 0.00101 AGGGT 0.0007 AGGTA 0.00082 AGGTC 0.000638 AGGTG 0.00114 AGGTT 0.000994 AGTAA 0.00124 AGTAC 0.000779 AGTAG 0.000815 AGTAT 0.000956 AGTCA 0.00102 AGTCC 0.000666 AGTCG 0.000142 AGTCT 0.000961 AGTGA 0.00128 AGTGC 0.00123 AGTGG 0.00102 AGTGT 0.00118 AGTTA 0.00103 AGTTC 0.00102 AGTTG 0.001 AGTTT 0.00162 ATAAA 0.00203 ATAAC 0.000816 ATAAG 0.000866 ATAAT 0.00115 ATACA 0.00136 ATACC 0.000566 ATACG 0.000217 ATACT 0.000956 ATAGA 0.000844 ATAGC 0.000702 ATAGG 0.000583 ATAGT 0.000668 ATATA 0.00128 ATATC 0.000687 ATATG 0.000886 ATATT 0.00146 ATCAA 0.000975 ATCAC 0.000932 ATCAG 0.00119 ATCAT 0.000946 ATCCA 0.001 ATCCC 0.000778 ATCCG 0.000159 ATCCT 0.000952 ATCGA 0.000127 ATCGC 0.000191 ATCGG 0.000143 ATCGT 0.000194 ATCTA 0.000728 ATCTC 0.000973 ATCTG 0.00132 ATCTT 0.00124 ATGAA 0.00157 ATGAC 0.000729 ATGAG 0.00105 ATGAT 0.000946 ATGCA 0.00153 ATGCC 0.000763 ATGCG 0.000216 ATGCT 0.00139 ATGGA 0.00113 ATGGC 0.000857 ATGGG 0.000887 ATGGT 0.000824 ATGTA 0.00117 ATGTC 0.000766 ATGTG 0.00126 ATGTT 0.0014 ATTAA 0.00156 ATTAC 0.000901 ATTAG 0.000783 ATTAT 0.00115 ATTCA 0.00135 ATTCC 0.000953 ATTCG 0.000133 ATTCT 0.00142 ATTGA 0.000798 ATTGC 0.000954 ATTGG 0.000673 ATTGT 0.00104 ATTTA 0.00177 ATTTC 0.00173 ATTTG 0.00153 ATTTT 0.00278 CAAAA 0.00228 CAAAC 0.00137 CAAAG 0.0017 CAAAT 0.00153 CAACA 0.0014 CAACC 0.000793 CAACG 0.000301 CAACT 0.001 CAAGA 0.00122 CAAGC 0.000984 CAAGG 0.00101 CAAGT 0.00107 CAATA 0.000907 CAATC 0.000608 CAATG 0.00095 CAATT 0.001 CACAA 0.00144 CACAC 0.00137 CACAG 0.00213 CACAT 0.00126 CACCA 0.00123 CACCC 0.000858 CACCG 0.000472 CACCT 0.00114 CACGA 0.0003 CACGC 0.000436 CACGG 0.000492 CACGT 0.000511 CACTA 0.000694 CACTC 0.000845 CACTG 0.00185 CACTT 0.00132 CAGAA 0.00225 CAGAC 0.00105 CAGAG 0.00186 CAGAT 0.00132 CAGCA 0.00261 CAGCC 0.0017 CAGCG 0.00073 CAGCT 0.00216 CAGGA 0.00153 CAGGC 0.00118 CAGGG 0.00127 CAGGT 0.00109 CAGTA 0.00129 CAGTC 0.000969 CAGTG 0.00185 CAGTT 0.00155 CATAA 0.001 CATAC 0.000749 CATAG 0.000706 CATAT 0.000886 CATCA 0.00123 CATCC 0.00102 CATCG 0.000235 CATCT 0.00137 CATGA 0.000957 CATGC 0.000994 CATGG 0.000948 CATGT 0.00106 CATTA 0.00111 CATTC 0.0011 CATTG 0.00095 CATTT 0.00215 CCAAA 0.00143 CCAAC 0.000866 CCAAG 0.000982 CCAAT 0.000673 CCACA 0.00136 CCACC 0.000993 CCACG 0.000453 CCACT 0.00102 CCAGA 0.00119 CCAGC 0.00147 CCAGG 0.00115 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000683 CCATC 0.000951 CCATG 0.000948 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000913 CCCAC 0.00107 CCCAG 0.00136 CCCAT 0.000887 CCCCA 0.00117 CCCCC 0.00119 CCCCG 0.00077 CCCCT 0.00101 CCCGA 0.000279 CCCGC 0.000867 CCCGG 0.000607 CCCGT 0.000337 CCCTA 0.000475 CCCTC 0.00122 CCCTG 0.00127 CCCTT 0.00111 CCGAA 0.00021 CCGAC 0.000192 CCGAG 0.000414 CCGAT 0.000143 CCGCA 0.00043 CCGCC 0.000948 CCGCG 0.000603 CCGCT 0.000549 CCGGA 0.000268 CCGGC 0.000608 CCGGG 0.000607 CCGGT 0.000215 CCGTA 0.000192 CCGTC 0.000293 CCGTG 0.000492 CCGTT 0.000286 CCTAA 0.000686 CCTAC 0.000595 CCTAG 0.000419 CCTAT 0.000583 CCTCA 0.00127 CCTCC 0.00147 CCTCG 0.000416 CCTCT 0.00138 CCTGA 0.00113 CCTGC 0.00154 CCTGG 0.00115 CCTGT 0.00126 CCTTA 0.000798 CCTTC 0.00141 CCTTG 0.00101 CCTTT 0.00163 CGAAA 0.000206 CGAAC 0.000164 CGAAG 0.00027 CGAAT 0.000133 CGACA 0.000179 CGACC 0.000166 CGACG 0.000125 CGACT 0.000142 CGAGA 0.00024 CGAGC 0.0004 CGAGG 0.000416 CGAGT 0.000194 CGATA 0.000121 CGATC 0.00014 CGATG 0.000235 CGATT 0.000159 CGCAA 0.000182 CGCAC 0.000367 CGCAG 0.000605 CGCAT 0.000216 CGCCA 0.000295 CGCCC 0.000661 CGCCG 0.000653 CGCCT 0.000388 CGCGA 0.000149 CGCGC 0.000537 CGCGG 0.000603 CGCGT 0.000193 CGCTA 0.000165 CGCTC 0.000565 CGCTG 0.00073 CGCTT 0.000345 CGGAA 0.000257 CGGAC 0.000186 CGGAG 0.000512 CGGAT 0.000159 CGGCA 0.000409 CGGCC 0.000662 CGGCG 0.000653 CGGCT 0.000448 CGGGA 0.000436 CGGGC 0.000636 CGGGG 0.00077 CGGGT 0.000248 CGGTA 0.000169 CGGTC 0.0002 CGGTG 0.000472 CGGTT 0.000227 CGTAA 0.000228 CGTAC 0.000186 CGTAG 0.000207 CGTAT 0.000217 CGTCA 0.000245 CGTCC 0.000306 CGTCG 0.000125 CGTCT 0.00025 CGTGA 0.000342 CGTGC 0.000512 CGTGG 0.000453 CGTGT 0.000431 CGTTA 0.000258 CGTTC 0.000328 CGTTG 0.000301 CGTTT 0.000432 CTAAA 0.00115 CTAAC 0.00061 CTAAG 0.000712 CTAAT 0.000783 CTACA 0.00102 CTACC 0.000534 CTACG 0.000207 CTACT 0.000815 CTAGA 0.000612 CTAGC 0.000446 CTAGG 0.000419 CTAGT 0.000472 CTATA 0.000615 CTATC 0.000519 CTATG 0.000706 CTATT 0.000957 CTCAA 0.000981 CTCAC 0.00109 CTCAG 0.00164 CTCAT 0.00105 CTCCA 0.00135 CTCCC 0.0014 CTCCG 0.000512 CTCCT 0.00159 CTCGA 0.00018 CTCGC 0.000363 CTCGG 0.000414 CTCGT 0.000292 CTCTA 0.000735 CTCTC 0.00129 CTCTG 0.00186 CTCTT 0.00153 CTGAA 0.00202 CTGAC 0.000999 CTGAG 0.00164 CTGAT 0.00119 CTGCA 0.00235 CTGCC 0.00164 CTGCG 0.000605 CTGCT 0.00247 CTGGA 0.00141 CTGGC 0.00103 CTGGG 0.00136 CTGGT 0.00102 CTGTA 0.00149 CTGTC 0.00118 CTGTG 0.00213 CTGTT 0.00188 CTTAA 0.00123 CTTAC 0.0008 CTTAG 0.000712 CTTAT 0.000866 CTTCA 0.0017 CTTCC 0.00159 CTTCG 0.00027 CTTCT 0.00192 CTTGA 0.00101 CTTGC 0.00106 CTTGG 0.000982 CTTGT 0.00123 CTTTA 0.00139 CTTTC 0.00171 CTTTG 0.0017 CTTTT 0.00246 GAAAA 0.00259 GAAAC 0.00124 GAAAG 0.00171 GAAAT 0.00173 GAACA 0.00133 GAACC 0.000572 GAACG 0.000328 GAACT 0.00102 GAAGA 0.00158 GAAGC 0.00121 GAAGG 0.00141 GAAGT 0.00128 GAATA 0.000949 GAATC 0.000652 GAATG 0.0011 GAATT 0.00115 GACAA 0.000937 GACAC 0.000734 GACAG 0.00118 GACAT 0.000766 GACCA 0.000607 GACCC 0.000453 GACCG 0.0002 GACCT 0.000638 GACGA 0.000156 GACGC 0.000221 GACGG 0.000293 GACGT 0.000255 GACTA 0.000435 GACTC 0.000502 GACTG 0.000969 GACTT 0.000878 GAGAA 0.0016 GAGAC 0.000707 GAGAG 0.00129 GAGAT 0.000973 GAGCA 0.00148 GAGCC 0.00092 GAGCG 0.000565 GAGCT 0.00135 GAGGA 0.00137 GAGGC 0.000986 GAGGG 0.00122 GAGGT 0.00095 GAGTA 0.00063 GAGTC 0.000502 GAGTG 0.000845 GAGTT 0.00089 GATAA 0.000817 GATAC 0.000557 GATAG 0.000519 GATAT 0.000687 GATCA 0.0007 GATCC 0.000498 GATCG 0.00014 GATCT 0.000766 GATGA 0.000967 GATGC 0.000895 GATGG 0.000951 GATGT 0.00104 GATTA 0.000673 GATTC 0.000652 GATTG 0.000608 GATTT 0.00138 GCAAA 0.0016 GCAAC 0.000816 GCAAG 0.00106 GCAAT 0.000954 GCACA 0.00153 GCACC 0.000928 GCACG 0.000512 GCACT 0.00123 GCAGA 0.00173 GCAGC 0.00224 GCAGG 0.00154 GCAGT 0.00157 GCATA 0.000734 GCATC 0.000895 GCATG 0.000994 GCATT 0.00128 GCCAA 0.000834 GCCAC 0.00086 GCCAG 0.00103 GCCAT 0.000857 GCCCA 0.000899 GCCCC 0.00109 GCCCG 0.000636 GCCCT 0.000984 GCCGA 0.000269 GCCGC 0.000908 GCCGG 0.000608 GCCGT 0.000388 GCCTA 0.000443 GCCTC 0.000986 GCCTG 0.00118 GCCTT 0.0011 GCGAA 0.000177 GCGAC 0.00018 GCGAG 0.000363 GCGAT 0.000191 GCGCA 0.000374 GCGCC 0.000569 GCGCG 0.000537 GCGCT 0.000574 GCGGA 0.00037 GCGGC 0.000908 GCGGG 0.000867 GCGGT 0.000384 GCGTA 0.000169 GCGTC 0.000221 GCGTG 0.000436 GCGTT 0.000331 GCTAA 0.000749 GCTAC 0.000631 GCTAG 0.000446 GCTAT 0.000702 GCTCA 0.00115 GCTCC 0.00131 GCTCG 0.0004 GCTCT 0.00145 GCTGA 0.00157 GCTGC 0.00224 GCTGG 0.00147 GCTGT 0.00194 GCTTA 0.000794 GCTTC 0.00121 GCTTG 0.000984 GCTTT 0.00189 GGAAA 0.00195 GGAAC 0.000827 GGAAG 0.00159 GGAAT 0.000953 GGACA 0.000911 GGACC 0.000459 GGACG 0.000306 GGACT 0.000666 GGAGA 0.00131 GGAGC 0.00131 GGAGG 0.00147 GGAGT 0.000763 GGATA 0.00057 GGATC 0.000498 GGATG 0.00102 GGATT 0.0008 GGCAA 0.000872 GGCAC 0.000951 GGCAG 0.00164 GGCAT 0.000763 GGCCA 0.000702 GGCCC 0.000736 GGCCG 0.000662 GGCCT 0.000718 GGCGA 0.000229 GGCGC 0.000569 GGCGG 0.000948 GGCGT 0.00025 GGCTA 0.00042 GGCTC 0.00092 GGCTG 0.0017 GGCTT 0.000984 GGGAA 0.0014 GGGAC 0.000693 GGGAG 0.0014 GGGAT 0.000778 GGGCA 0.0011 GGGCC 0.000736 GGGCG 0.000661 GGGCT 0.00111 GGGGA 0.00118 GGGGC 0.00109 GGGGG 0.00119 GGGGT 0.000679 GGGTA 0.000446 GGGTC 0.000453 GGGTG 0.000858 GGGTT 0.000747 GGTAA 0.000682 GGTAC 0.000466 GGTAG 0.000534 GGTAT 0.000566 GGTCA 0.000631 GGTCC 0.000459 GGTCG 0.000166 GGTCT 0.000642 GGTGA 0.000907 GGTGC 0.000928 GGTGG 0.000993 GGTGT 0.000874 GGTTA 0.000571 GGTTC 0.000572 GGTTG 0.000793 GGTTT 0.00122 GTAAA 0.00122 GTAAC 0.000741 GTAAG 0.0008 GTAAT 0.000901 GTACA 0.000915 GTACC 0.000466 GTACG 0.000186 GTACT 0.000779 GTAGA 0.00069 GTAGC 0.000631 GTAGG 0.000595 GTAGT 0.000659 GTATA 0.000644 GTATC 0.000557 GTATG 0.000749 GTATT 0.00115 GTCAA 0.000613 GTCAC 0.000785 GTCAG 0.000999 GTCAT 0.000729 GTCCA 0.000628 GTCCC 0.000693 GTCCG 0.000186 GTCCT 0.000834 GTCGA 7.86e-05 GTCGC 0.00018 GTCGG 0.000192 GTCGT 0.000161 GTCTA 0.000417 GTCTC 0.000707 GTCTG 0.00105 GTCTT 0.000966 GTGAA 0.00122 GTGAC 0.000785 GTGAG 0.00109 GTGAT 0.000932 GTGCA 0.00129 GTGCC 0.000951 GTGCG 0.000367 GTGCT 0.00159 GTGGA 0.000936 GTGGC 0.00086 GTGGG 0.00107 GTGGT 0.000963 GTGTA 0.000842 GTGTC 0.000734 GTGTG 0.00137 GTGTT 0.00136 GTTAA 0.000971 GTTAC 0.000741 GTTAG 0.00061 GTTAT 0.000816 GTTCA 0.000997 GTTCC 0.000827 GTTCG 0.000164 GTTCT 0.00126 GTTGA 0.000718 GTTGC 0.000816 GTTGG 0.000866 GTTGT 0.00109 GTTTA 0.00108 GTTTC 0.00124 GTTTG 0.00137 GTTTT 0.0022 TAAAA 0.00257 TAAAC 0.00108 TAAAG 0.00139 TAAAT 0.00177 TAACA 0.00128 TAACC 0.000571 TAACG 0.000258 TAACT 0.00103 TAAGA 0.0011 TAAGC 0.000794 TAAGG 0.000798 TAAGT 0.000914 TAATA 0.00116 TAATC 0.000673 TAATG 0.00111 TAATT 0.00145 TACAA 0.0013 TACAC 0.000842 TACAG 0.00149 TACAT 0.00117 TACCA 0.000814 TACCC 0.000446 TACCG 0.000169 TACCT 0.00082 TACGA 0.00017 TACGC 0.000169 TACGG 0.000192 TACGT 0.000307 TACTA 0.00064 TACTC 0.00063 TACTG 0.00129 TACTT 0.00123 TAGAA 0.00124 TAGAC 0.000417 TAGAG 0.000735 TAGAT 0.000728 TAGCA 0.00106 TAGCC 0.00042 TAGCG 0.000165 TAGCT 0.000881 TAGGA 0.000803 TAGGC 0.000443 TAGGG 0.000475 TAGGT 0.000561 TAGTA 0.00064 TAGTC 0.000435 TAGTG 0.000694 TAGTT 0.000877 TATAA 0.00107 TATAC 0.000644 TATAG 0.000615 TATAT 0.00128 TATCA 0.000892 TATCC 0.00057 TATCG 0.000121 TATCT 0.000996 TATGA 0.000888 TATGC 0.000734 TATGG 0.000683 TATGT 0.00104 TATTA 0.00116 TATTC 0.000949 TATTG 0.000907 TATTT 0.00252 TCAAA 0.00154 TCAAC 0.000718 TCAAG 0.00101 TCAAT 0.000798 TCACA 0.00149 TCACC 0.000907 TCACG 0.000342 TCACT 0.00128 TCAGA 0.00159 TCAGC 0.00157 TCAGG 0.00113 TCAGT 0.00157 TCATA 0.000888 TCATC 0.000967 TCATG 0.000957 TCATT 0.00148 TCCAA 0.00118 TCCAC 0.000936 TCCAG 0.00141 TCCAT 0.00113 TCCCA 0.00128 TCCCC 0.00118 TCCCG 0.000436 TCCCT 0.00138 TCCGA 0.000183 TCCGC 0.00037 TCCGG 0.000268 TCCGT 0.000293 TCCTA 0.000803 TCCTC 0.00137 TCCTG 0.00153 TCCTT 0.00166 TCGAA 0.000132 TCGAC 7.86e-05 TCGAG 0.00018 TCGAT 0.000127 TCGCA 0.000211 TCGCC 0.000229 TCGCG 0.000149 TCGCT 0.000322 TCGGA 0.000183 TCGGC 0.000269 TCGGG 0.000279 TCGGT 0.000228 TCGTA 0.00017 TCGTC 0.000156 TCGTG 0.0003 TCGTT 0.000275 TCTAA 0.000977 TCTAC 0.00069 TCTAG 0.000612 TCTAT 0.000844 TCTCA 0.00135 TCTCC 0.00131 TCTCG 0.00024 TCTCT 0.00166 TCTGA 0.00159 TCTGC 0.00173 TCTGG 0.00119 TCTGT 0.00197 TCTTA 0.0011 TCTTC 0.00158 TCTTG 0.00122 TCTTT 0.00222 TGAAA 0.00226 TGAAC 0.000997 TGAAG 0.0017 TGAAT 0.00135 TGACA 0.00123 TGACC 0.000631 TGACG 0.000245 TGACT 0.00102 TGAGA 0.00135 TGAGC 0.00115 TGAGG 0.00127 TGAGT 0.00098 TGATA 0.000892 TGATC 0.0007 TGATG 0.00123 TGATT 0.00123 TGCAA 0.00162 TGCAC 0.00129 TGCAG 0.00235 TGCAT 0.00153 TGCCA 0.00131 TGCCC 0.0011 TGCCG 0.000409 TGCCT 0.00141 TGCGA 0.000211 TGCGC 0.000374 TGCGG 0.00043 TGCGT 0.000355 TGCTA 0.00106 TGCTC 0.00148 TGCTG 0.00261 TGCTT 0.00206 TGGAA 0.00168 TGGAC 0.000628 TGGAG 0.00135 TGGAT 0.001 TGGCA 0.00131 TGGCC 0.000702 TGGCG 0.000295 TGGCT 0.00127 TGGGA 0.00128 TGGGC 0.000899 TGGGG 0.00117 TGGGT 0.000876 TGGTA 0.000814 TGGTC 0.000607 TGGTG 0.00123 TGGTT 0.00119 TGTAA 0.0015 TGTAC 0.000915 TGTAG 0.00102 TGTAT 0.00136 TGTCA 0.00123 TGTCC 0.000911 TGTCG 0.000179 TGTCT 0.00129 TGTGA 0.00149 TGTGC 0.00153 TGTGG 0.00136 TGTGT 0.00182 TGTTA 0.00128 TGTTC 0.00133 TGTTG 0.0014 TGTTT 0.00261 TTAAA 0.00241 TTAAC 0.000971 TTAAG 0.00123 TTAAT 0.00156 TTACA 0.0015 TTACC 0.000682 TTACG 0.000228 TTACT 0.00124 TTAGA 0.000977 TTAGC 0.000749 TTAGG 0.000686 TTAGT 0.000846 TTATA 0.00107 TTATC 0.000817 TTATG 0.001 TTATT 0.00197 TTCAA 0.0015 TTCAC 0.00122 TTCAG 0.00202 TTCAT 0.00157 TTCCA 0.00168 TTCCC 0.0014 TTCCG 0.000257 TTCCT 0.00198 TTCGA 0.000132 TTCGC 0.000177 TTCGG 0.00021 TTCGT 0.000255 TTCTA 0.00124 TTCTC 0.0016 TTCTG 0.00225 TTCTT 0.00237 TTGAA 0.0015 TTGAC 0.000613 TTGAG 0.000981 TTGAT 0.000975 TTGCA 0.00162 TTGCC 0.000872 TTGCG 0.000182 TTGCT 0.00176 TTGGA 0.00118 TTGGC 0.000834 TTGGG 0.000913 TTGGT 0.00103 TTGTA 0.0013 TTGTC 0.000937 TTGTG 0.00144 TTGTT 0.00199 TTTAA 0.00241 TTTAC 0.00122 TTTAG 0.00115 TTTAT 0.00203 TTTCA 0.00226 TTTCC 0.00195 TTTCG 0.000206 TTTCT 0.00286 TTTGA 0.00154 TTTGC 0.0016 TTTGG 0.00143 TTTGT 0.00229 TTTTA 0.00257 TTTTC 0.00259 TTTTG 0.00228 TTTTT 0.00534 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [2] # (a,c,g,t)= (0.284, 0.216, 0.216, 0.284) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.275 C 0.225 G 0.225 T 0.275 # l= 1 # Values AA 0.0879 AC 0.0529 AG 0.0722 AT 0.0616 CA 0.0756 CC 0.0556 CG 0.022 CT 0.0722 GA 0.0573 GC 0.0597 GG 0.0556 GT 0.0529 TA 0.0537 TC 0.0573 TG 0.0756 TT 0.088 # l= 2 # Values AAA 0.033 AAC 0.0156 AAG 0.0205 AAT 0.019 ACA 0.021 ACC 0.0112 ACG 0.00496 ACT 0.0157 AGA 0.0201 AGC 0.0193 AGG 0.017 AGT 0.0157 ATA 0.0146 ATC 0.0118 ATG 0.0163 ATT 0.019 CAA 0.0179 CAC 0.0166 CAG 0.0248 CAT 0.0163 CCA 0.0166 CCC 0.0152 CCG 0.00674 CCT 0.017 CGA 0.00339 CGC 0.00692 CGG 0.00674 CGT 0.00496 CTA 0.0103 CTC 0.0166 CTG 0.0248 CTT 0.0205 GAA 0.0196 GAC 0.00928 GAG 0.0166 GAT 0.0118 GCA 0.0199 GCC 0.0135 GCG 0.00692 GCT 0.0193 GGA 0.0157 GGC 0.0135 GGG 0.0152 GGT 0.0112 GTA 0.0114 GTC 0.00928 GTG 0.0166 GTT 0.0156 TAA 0.0174 TAC 0.0114 TAG 0.0103 TAT 0.0146 TCA 0.0181 TCC 0.0157 TCG 0.00339 TCT 0.0202 TGA 0.0181 TGC 0.0199 TGG 0.0166 TGT 0.021 TTA 0.0174 TTC 0.0197 TTG 0.0179 TTT 0.033 # l= 3 # Values AAAA 0.0124 AAAC 0.00579 AAAG 0.00717 AAAT 0.00756 AACA 0.0065 AACC 0.00317 AACG 0.00135 AACT 0.00456 AAGA 0.00601 AAGC 0.00489 AAGG 0.00489 AAGT 0.00467 AATA 0.00533 AATC 0.00324 AATG 0.00522 AATT 0.00516 ACAA 0.00555 ACAC 0.00432 ACAG 0.00669 ACAT 0.00449 ACCA 0.00385 ACCC 0.0026 ACCG 0.00111 ACCT 0.00361 ACGA 0.00092 ACGC 0.0012 ACGG 0.00132 ACGT 0.00152 ACTA 0.00255 ACTC 0.00286 ACTG 0.00563 ACTT 0.00467 AGAA 0.00734 AGAC 0.00313 AGAG 0.00548 AGAT 0.00419 AGCA 0.00731 AGCC 0.00416 AGCG 0.00188 AGCT 0.00595 AGGA 0.00542 AGGC 0.00379 AGGG 0.00422 AGGT 0.00361 AGTA 0.00367 AGTC 0.00276 AGTG 0.00472 AGTT 0.00456 ATAA 0.00469 ATAC 0.00301 ATAG 0.00273 ATAT 0.00413 ATCA 0.00397 ATCC 0.00292 ATCG 0.000669 ATCT 0.00419 ATGA 0.0042 ATGC 0.00389 ATGG 0.00374 ATGT 0.00449 ATTA 0.00423 ATTC 0.00377 ATTG 0.0034 ATTT 0.00756 CAAA 0.00677 CAAC 0.00348 CAAG 0.00428 CAAT 0.0034 CACA 0.00625 CACC 0.00382 CACG 0.00181 CACT 0.00472 CAGA 0.0065 CAGC 0.00745 CAGG 0.00521 CAGT 0.00563 CATA 0.00325 CATC 0.00389 CATG 0.00396 CATT 0.00522 CCAA 0.00399 CCAC 0.00393 CCAG 0.00495 CCAT 0.00374 CCCA 0.0044 CCCC 0.00438 CCCG 0.0022 CCCT 0.00422 CCGA 0.000999 CCGC 0.00264 CCGG 0.00179 CCGT 0.00132 CCTA 0.00226 CCTC 0.00467 CCTG 0.00521 CCTT 0.00489 CGAA 0.000787 CGAC 0.000633 CGAG 0.0013 CGAT 0.000669 CGCA 0.00143 CGCC 0.00207 CGCG 0.00154 CGCT 0.00188 CGGA 0.00116 CGGC 0.00227 CGGG 0.0022 CGGT 0.00111 CGTA 0.000841 CGTC 0.000961 CGTG 0.00181 CGTT 0.00135 CTAA 0.00317 CTAC 0.00253 CTAG 0.00191 CTAT 0.00273 CTCA 0.0048 CTCC 0.00502 CTCG 0.0013 CTCT 0.00549 CTGA 0.00586 CTGC 0.00729 CTGG 0.00495 CTGT 0.00669 CTTA 0.00352 CTTC 0.00549 CTTG 0.00428 CTTT 0.00717 GAAA 0.00715 GAAC 0.00324 GAAG 0.00549 GAAT 0.00377 GACA 0.00362 GACC 0.00194 GACG 0.000961 GACT 0.00276 GAGA 0.0046 GAGC 0.00447 GAGG 0.00467 GAGT 0.00286 GATA 0.00251 GATC 0.00211 GATG 0.00389 GATT 0.00324 GCAA 0.00442 GCAC 0.00432 GCAG 0.00729 GCAT 0.00389 GCCA 0.00366 GCCC 0.00379 GCCG 0.00227 GCCT 0.00379 GCGA 0.000941 GCGC 0.00214 GCGG 0.00264 GCGT 0.0012 GCTA 0.00249 GCTC 0.00447 GCTG 0.00745 GCTT 0.00489 GGAA 0.00535 GGAC 0.0024 GGAG 0.00502 GGAT 0.00292 GGCA 0.00435 GGCC 0.00293 GGCG 0.00208 GGCT 0.00416 GGGA 0.00443 GGGC 0.00379 GGGG 0.00438 GGGT 0.0026 GGTA 0.00223 GGTC 0.00194 GGTG 0.00382 GGTT 0.00318 GTAA 0.00356 GTAC 0.00231 GTAG 0.00253 GTAT 0.00301 GTCA 0.00311 GTCC 0.0024 GTCG 0.000634 GTCT 0.00313 GTGA 0.00403 GTGC 0.00432 GTGG 0.00393 GTGT 0.00432 GTTA 0.00306 GTTC 0.00324 GTTG 0.00348 GTTT 0.00579 TAAA 0.00659 TAAC 0.00306 TAAG 0.00352 TAAT 0.00424 TACA 0.00468 TACC 0.00223 TACG 0.00084 TACT 0.00367 TAGA 0.00303 TAGC 0.00249 TAGG 0.00226 TAGT 0.00255 TATA 0.00347 TATC 0.00251 TATG 0.00325 TATT 0.00533 TCAA 0.00397 TCAC 0.00403 TCAG 0.00586 TCAT 0.0042 TCCA 0.00468 TCCC 0.00443 TCCG 0.00116 TCCT 0.00542 TCGA 0.000527 TCGC 0.000941 TCGG 0.000999 TCGT 0.00092 TCTA 0.00303 TCTC 0.0046 TCTG 0.0065 TCTT 0.00601 TGAA 0.00617 TGAC 0.00311 TGAG 0.0048 TGAT 0.00397 TGCA 0.00685 TGCC 0.00435 TGCG 0.00143 TGCT 0.00731 TGGA 0.00468 TGGC 0.00366 TGGG 0.0044 TGGT 0.00385 TGTA 0.00468 TGTC 0.00362 TGTG 0.00625 TGTT 0.0065 TTAA 0.00597 TTAC 0.00356 TTAG 0.00317 TTAT 0.00469 TTCA 0.00617 TTCC 0.00535 TTCG 0.000787 TTCT 0.00734 TTGA 0.00397 TTGC 0.00442 TTGG 0.00399 TTGT 0.00555 TTTA 0.00659 TTTC 0.00715 TTTG 0.00677 TTTT 0.0124 # l= 4 # Values AAAAA 0.0052 AAAAC 0.00215 AAAAG 0.00242 AAAAT 0.00267 AAACA 0.00256 AAACC 0.00122 AAACG 0.000438 AAACT 0.00158 AAAGA 0.00218 AAAGC 0.00189 AAAGG 0.00163 AAAGT 0.00147 AAATA 0.00242 AAATC 0.00134 AAATG 0.0021 AAATT 0.00169 AACAA 0.00194 AACAC 0.00135 AACAG 0.00186 AACAT 0.00136 AACCA 0.00118 AACCC 0.000769 AACCG 0.000234 AACCT 0.000989 AACGA 0.00028 AACGC 0.000342 AACGG 0.000295 AACGT 0.00043 AACTA 0.000841 AACTC 0.000882 AACTG 0.00152 AACTT 0.00132 AAGAA 0.00232 AAGAC 0.000951 AAGAG 0.00153 AAGAT 0.00121 AAGCA 0.00206 AAGCC 0.000996 AAGCG 0.000355 AAGCT 0.00148 AAGGA 0.00166 AAGGC 0.00111 AAGGG 0.00113 AAGGT 0.000983 AAGTA 0.00118 AAGTC 0.000866 AAGTG 0.00131 AAGTT 0.00132 AATAA 0.0019 AATAC 0.00111 AATAG 0.000928 AATAT 0.00139 AATCA 0.0012 AATCC 0.000797 AATCG 0.00016 AATCT 0.00109 AATGA 0.00144 AATGC 0.00127 AATGG 0.00111 AATGT 0.0014 AATTA 0.00139 AATTC 0.00111 AATTG 0.000967 AATTT 0.00169 ACAAA 0.00224 ACAAC 0.00108 ACAAG 0.00122 ACAAT 0.00101 ACACA 0.00181 ACACC 0.000891 ACACG 0.000445 ACACT 0.00117 ACAGA 0.00196 ACAGC 0.00198 ACAGG 0.00127 ACAGT 0.00148 ACATA 0.000998 ACATC 0.00104 ACATG 0.00105 ACATT 0.0014 ACCAA 0.00103 ACCAC 0.000976 ACCAG 0.00104 ACCAT 0.000817 ACCCA 0.000902 ACCCC 0.000718 ACCCG 0.000262 ACCCT 0.000715 ACCGA 0.000235 ACCGC 0.000401 ACCGG 0.000225 ACCGT 0.000248 ACCTA 0.000549 ACCTC 0.000968 ACCTG 0.00111 ACCTT 0.000983 ACGAA 0.000257 ACGAC 0.000165 ACGAG 0.000302 ACGAT 0.000195 ACGCA 0.000366 ACGCC 0.000261 ACGCG 0.000202 ACGCT 0.000371 ACGGA 0.000304 ACGGC 0.000408 ACGGG 0.000356 ACGGT 0.000248 ACGTA 0.000305 ACGTC 0.000263 ACGTG 0.000526 ACGTT 0.00043 ACTAA 0.000816 ACTAC 0.000639 ACTAG 0.000456 ACTAT 0.000641 ACTCA 0.000973 ACTCC 0.000772 ACTCG 0.000199 ACTCT 0.00092 ACTGA 0.00155 ACTGC 0.00158 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00148 ACTTA 0.000883 ACTTC 0.00126 ACTTG 0.00105 ACTTT 0.00147 AGAAA 0.0028 AGAAC 0.00125 AGAAG 0.00191 AGAAT 0.00137 AGACA 0.00128 AGACC 0.000651 AGACG 0.000255 AGACT 0.000945 AGAGA 0.00166 AGAGC 0.0015 AGAGG 0.00141 AGAGT 0.00092 AGATA 0.000965 AGATC 0.000763 AGATG 0.00137 AGATT 0.00109 AGCAA 0.00175 AGCAC 0.00163 AGCAG 0.00254 AGCAT 0.00138 AGCCA 0.0013 AGCCC 0.00118 AGCCG 0.000469 AGCCT 0.00122 AGCGA 0.000333 AGCGC 0.0006 AGCGG 0.000573 AGCGT 0.000371 AGCTA 0.000865 AGCTC 0.00139 AGCTG 0.00221 AGCTT 0.00148 AGGAA 0.00198 AGGAC 0.00085 AGGAG 0.00164 AGGAT 0.000952 AGGCA 0.00144 AGGCC 0.000736 AGGCG 0.000401 AGGCT 0.00122 AGGGA 0.00142 AGGGC 0.00103 AGGGG 0.00106 AGGGT 0.000715 AGGTA 0.000806 AGGTC 0.000646 AGGTG 0.00116 AGGTT 0.000989 AGTAA 0.0012 AGTAC 0.000759 AGTAG 0.000794 AGTAT 0.000918 AGTCA 0.001 AGTCC 0.000673 AGTCG 0.000145 AGTCT 0.000945 AGTGA 0.00127 AGTGC 0.00125 AGTGG 0.00103 AGTGT 0.00117 AGTTA 0.000995 AGTTC 0.00101 AGTTG 0.000983 AGTTT 0.00158 ATAAA 0.00196 ATAAC 0.000791 ATAAG 0.000841 ATAAT 0.0011 ATACA 0.00132 ATACC 0.000556 ATACG 0.000216 ATACT 0.000918 ATAGA 0.000821 ATAGC 0.00069 ATAGG 0.000576 ATAGT 0.000641 ATATA 0.00123 ATATC 0.000663 ATATG 0.000851 ATATT 0.00139 ATCAA 0.000945 ATCAC 0.000927 ATCAG 0.00118 ATCAT 0.00092 ATCCA 0.001 ATCCC 0.000807 ATCCG 0.000165 ATCCT 0.000952 ATCGA 0.000129 ATCGC 0.000197 ATCGG 0.000148 ATCGT 0.000195 ATCTA 0.000703 ATCTC 0.000975 ATCTG 0.00131 ATCTT 0.00121 ATGAA 0.00152 ATGAC 0.000715 ATGAG 0.00104 ATGAT 0.00092 ATGCA 0.00152 ATGCC 0.000771 ATGCG 0.000222 ATGCT 0.00138 ATGGA 0.00113 ATGGC 0.000871 ATGGG 0.000918 ATGGT 0.000817 ATGTA 0.00113 ATGTC 0.000756 ATGTG 0.00125 ATGTT 0.00136 ATTAA 0.00151 ATTAC 0.000871 ATTAG 0.000759 ATTAT 0.0011 ATTCA 0.00131 ATTCC 0.000946 ATTCG 0.000134 ATTCT 0.00137 ATTGA 0.000774 ATTGC 0.000945 ATTGG 0.00067 ATTGT 0.00101 ATTTA 0.0017 ATTTC 0.00169 ATTTG 0.00149 ATTTT 0.00267 CAAAA 0.00222 CAAAC 0.00136 CAAAG 0.0017 CAAAT 0.00149 CAACA 0.00138 CAACC 0.000805 CAACG 0.000311 CAACT 0.000983 CAAGA 0.0012 CAAGC 0.000991 CAAGG 0.00103 CAAGT 0.00105 CAATA 0.000881 CAATC 0.000602 CAATG 0.000946 CAATT 0.000967 CACAA 0.00143 CACAC 0.0014 CACAG 0.00218 CACAT 0.00125 CACCA 0.00126 CACCC 0.000902 CACCG 0.000496 CACCT 0.00116 CACGA 0.000309 CACGC 0.000456 CACGG 0.000519 CACGT 0.000526 CACTA 0.000678 CACTC 0.000859 CACTG 0.00188 CACTT 0.00131 CAGAA 0.00223 CAGAC 0.00106 CAGAG 0.0019 CAGAT 0.00131 CAGCA 0.00269 CAGCC 0.00178 CAGCG 0.000764 CAGCT 0.00221 CAGGA 0.00156 CAGGC 0.00122 CAGGG 0.00133 CAGGT 0.00111 CAGTA 0.00126 CAGTC 0.000969 CAGTG 0.00188 CAGTT 0.00152 CATAA 0.000967 CATAC 0.000732 CATAG 0.000696 CATAT 0.000851 CATCA 0.00122 CATCC 0.00105 CATCG 0.000244 CATCT 0.00137 CATGA 0.000943 CATGC 0.001 CATGG 0.000969 CATGT 0.00105 CATTA 0.00108 CATTC 0.00109 CATTG 0.000946 CATTT 0.0021 CCAAA 0.00144 CCAAC 0.000883 CCAAG 0.001 CCAAT 0.00067 CCACA 0.00139 CCACC 0.00103 CCACG 0.000479 CCACT 0.00103 CCAGA 0.00121 CCAGC 0.00153 CCAGG 0.0012 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000677 CCATC 0.00098 CCATG 0.000969 CCATT 0.00111 CCCAA 0.000942 CCCAC 0.00112 CCCAG 0.00142 CCCAT 0.000918 CCCCA 0.00124 CCCCC 0.00127 CCCCG 0.000816 CCCCT 0.00106 CCCGA 0.000293 CCCGC 0.000907 CCCGG 0.000643 CCCGT 0.000356 CCCTA 0.00048 CCCTC 0.00128 CCCTG 0.00133 CCCTT 0.00113 CCGAA 0.000216 CCGAC 0.000202 CCGAG 0.000433 CCGAT 0.000148 CCGCA 0.000454 CCGCC 0.000984 CCGCG 0.000629 CCGCT 0.000573 CCGGA 0.000281 CCGGC 0.000636 CCGGG 0.000643 CCGGT 0.000225 CCGTA 0.000196 CCGTC 0.000307 CCGTG 0.000519 CCGTT 0.000295 CCTAA 0.000677 CCTAC 0.000596 CCTAG 0.000414 CCTAT 0.000576 CCTCA 0.00129 CCTCC 0.00153 CCTCG 0.000434 CCTCT 0.00141 CCTGA 0.00114 CCTGC 0.0016 CCTGG 0.0012 CCTGT 0.00127 CCTTA 0.00079 CCTTC 0.00144 CCTTG 0.00103 CCTTT 0.00163 CGAAA 0.000208 CGAAC 0.000168 CGAAG 0.000277 CGAAT 0.000134 CGACA 0.000183 CGACC 0.000173 CGACG 0.000132 CGACT 0.000145 CGAGA 0.000248 CGAGC 0.000418 CGAGG 0.000434 CGAGT 0.000199 CGATA 0.000121 CGATC 0.000144 CGATG 0.000244 CGATT 0.00016 CGCAA 0.000186 CGCAC 0.000384 CGCAG 0.000634 CGCAT 0.000222 CGCCA 0.000306 CGCCC 0.00069 CGCCG 0.000679 CGCCT 0.000401 CGCGA 0.000154 CGCGC 0.000558 CGCGG 0.000629 CGCGT 0.000202 CGCTA 0.000167 CGCTC 0.000592 CGCTG 0.000764 CGCTT 0.000355 CGGAA 0.000265 CGGAC 0.000194 CGGAG 0.000539 CGGAT 0.000165 CGGCA 0.000426 CGGCC 0.000693 CGGCG 0.000679 CGGCT 0.000469 CGGGA 0.000456 CGGGC 0.000665 CGGGG 0.000816 CGGGT 0.000262 CGGTA 0.00017 CGGTC 0.000208 CGGTG 0.000496 CGGTT 0.000234 CGTAA 0.000228 CGTAC 0.000188 CGTAG 0.000209 CGTAT 0.000216 CGTCA 0.000251 CGTCC 0.000322 CGTCG 0.000132 CGTCT 0.000255 CGTGA 0.00035 CGTGC 0.000536 CGTGG 0.000479 CGTGT 0.000445 CGTTA 0.00026 CGTTC 0.000337 CGTTG 0.000311 CGTTT 0.000438 CTAAA 0.00112 CTAAC 0.000598 CTAAG 0.000698 CTAAT 0.000759 CTACA 0.001 CTACC 0.000531 CTACG 0.000209 CTACT 0.000794 CTAGA 0.000595 CTAGC 0.000441 CTAGG 0.000414 CTAGT 0.000456 CTATA 0.000594 CTATC 0.000509 CTATG 0.000696 CTATT 0.000928 CTCAA 0.00097 CTCAC 0.00111 CTCAG 0.00167 CTCAT 0.00104 CTCCA 0.00138 CTCCC 0.00147 CTCCG 0.000539 CTCCT 0.00164 CTCGA 0.000185 CTCGC 0.000376 CTCGG 0.000433 CTCGT 0.000302 CTCTA 0.000724 CTCTC 0.00132 CTCTG 0.0019 CTCTT 0.00153 CTGAA 0.002 CTGAC 0.00101 CTGAG 0.00167 CTGAT 0.00118 CTGCA 0.00241 CTGCC 0.00171 CTGCG 0.000634 CTGCT 0.00254 CTGGA 0.00143 CTGGC 0.00106 CTGGG 0.00142 CTGGT 0.00104 CTGTA 0.00146 CTGTC 0.00119 CTGTG 0.00218 CTGTT 0.00186 CTTAA 0.00119 CTTAC 0.000785 CTTAG 0.000698 CTTAT 0.000841 CTTCA 0.00168 CTTCC 0.00162 CTTCG 0.000277 CTTCT 0.00191 CTTGA 0.000994 CTTGC 0.00107 CTTGG 0.001 CTTGT 0.00122 CTTTA 0.00136 CTTTC 0.0017 CTTTG 0.0017 CTTTT 0.00242 GAAAA 0.00253 GAAAC 0.00123 GAAAG 0.0017 GAAAT 0.00169 GAACA 0.00132 GAACC 0.000582 GAACG 0.000337 GAACT 0.00101 GAAGA 0.00156 GAAGC 0.00123 GAAGG 0.00144 GAAGT 0.00126 GAATA 0.000917 GAATC 0.000645 GAATG 0.00109 GAATT 0.00111 GACAA 0.000927 GACAC 0.000746 GACAG 0.00119 GACAT 0.000756 GACCA 0.000614 GACCC 0.000474 GACCG 0.000208 GACCT 0.000646 GACGA 0.00016 GACGC 0.000231 GACGG 0.000307 GACGT 0.000263 GACTA 0.000422 GACTC 0.000508 GACTG 0.000969 GACTT 0.000866 GAGAA 0.00159 GAGAC 0.000715 GAGAG 0.00132 GAGAT 0.000975 GAGCA 0.00152 GAGCC 0.000963 GAGCG 0.000592 GAGCT 0.00139 GAGGA 0.0014 GAGGC 0.00102 GAGGG 0.00128 GAGGT 0.000968 GAGTA 0.000616 GAGTC 0.000508 GAGTG 0.000859 GAGTT 0.000882 GATAA 0.000796 GATAC 0.000545 GATAG 0.000509 GATAT 0.000663 GATCA 0.000694 GATCC 0.000508 GATCG 0.000144 GATCT 0.000763 GATGA 0.000961 GATGC 0.000912 GATGG 0.00098 GATGT 0.00104 GATTA 0.000651 GATTC 0.000645 GATTG 0.000602 GATTT 0.00134 GCAAA 0.00159 GCAAC 0.000819 GCAAG 0.00107 GCAAT 0.000945 GCACA 0.00156 GCACC 0.00097 GCACG 0.000536 GCACT 0.00125 GCAGA 0.00176 GCAGC 0.00234 GCAGG 0.0016 GCAGT 0.00158 GCATA 0.000714 GCATC 0.000912 GCATG 0.001 GCATT 0.00127 GCCAA 0.000847 GCCAC 0.000887 GCCAG 0.00106 GCCAT 0.000871 GCCCA 0.000939 GCCCC 0.00116 GCCCG 0.000665 GCCCT 0.00103 GCCGA 0.000281 GCCGC 0.000944 GCCGG 0.000636 GCCGT 0.000408 GCCTA 0.000439 GCCTC 0.00102 GCCTG 0.00122 GCCTT 0.00111 GCGAA 0.000181 GCGAC 0.000187 GCGAG 0.000376 GCGAT 0.000197 GCGCA 0.000389 GCGCC 0.000592 GCGCG 0.000558 GCGCT 0.0006 GCGGA 0.000387 GCGGC 0.000944 GCGGG 0.000907 GCGGT 0.000401 GCGTA 0.00017 GCGTC 0.000231 GCGTG 0.000456 GCGTT 0.000342 GCTAA 0.000738 GCTAC 0.000625 GCTAG 0.000441 GCTAT 0.00069 GCTCA 0.00119 GCTCC 0.00137 GCTCG 0.000418 GCTCT 0.0015 GCTGA 0.0016 GCTGC 0.00234 GCTGG 0.00153 GCTGT 0.00198 GCTTA 0.00078 GCTTC 0.00123 GCTTG 0.000991 GCTTT 0.00189 GGAAA 0.00195 GGAAC 0.00084 GGAAG 0.00162 GGAAT 0.000946 GGACA 0.000932 GGACC 0.000477 GGACG 0.000322 GGACT 0.000673 GGAGA 0.00134 GGAGC 0.00137 GGAGG 0.00153 GGAGT 0.000772 GGATA 0.000564 GGATC 0.000508 GGATG 0.00105 GGATT 0.000797 GGCAA 0.000879 GGCAC 0.00099 GGCAG 0.00171 GGCAT 0.000771 GGCCA 0.000726 GGCCC 0.000772 GGCCG 0.000693 GGCCT 0.000736 GGCGA 0.000238 GGCGC 0.000592 GGCGG 0.000984 GGCGT 0.000261 GGCTA 0.000418 GGCTC 0.000963 GGCTG 0.00178 GGCTT 0.000996 GGGAA 0.00143 GGGAC 0.000727 GGGAG 0.00147 GGGAT 0.000807 GGGCA 0.00115 GGGCC 0.000772 GGGCG 0.00069 GGGCT 0.00118 GGGGA 0.00124 GGGGC 0.00116 GGGGG 0.00127 GGGGT 0.000718 GGGTA 0.000451 GGGTC 0.000474 GGGTG 0.000902 GGGTT 0.000769 GGTAA 0.000672 GGTAC 0.000468 GGTAG 0.000531 GGTAT 0.000556 GGTCA 0.00064 GGTCC 0.000477 GGTCG 0.000173 GGTCT 0.000651 GGTGA 0.000926 GGTGC 0.00097 GGTGG 0.00103 GGTGT 0.000891 GGTTA 0.000566 GGTTC 0.000582 GGTTG 0.000805 GGTTT 0.00122 GTAAA 0.00118 GTAAC 0.000728 GTAAG 0.000785 GTAAT 0.000871 GTACA 0.000896 GTACC 0.000468 GTACG 0.000188 GTACT 0.000759 GTAGA 0.000673 GTAGC 0.000625 GTAGG 0.000596 GTAGT 0.000639 GTATA 0.00062 GTATC 0.000545 GTATG 0.000732 GTATT 0.00111 GTCAA 0.000601 GTCAC 0.000793 GTCAG 0.00101 GTCAT 0.000715 GTCCA 0.000634 GTCCC 0.000727 GTCCG 0.000194 GTCCT 0.00085 GTCGA 8.02e-05 GTCGC 0.000187 GTCGG 0.000202 GTCGT 0.000165 GTCTA 0.000404 GTCTC 0.000715 GTCTG 0.00106 GTCTT 0.000951 GTGAA 0.0012 GTGAC 0.000793 GTGAG 0.00111 GTGAT 0.000927 GTGCA 0.00132 GTGCC 0.00099 GTGCG 0.000384 GTGCT 0.00163 GTGGA 0.000947 GTGGC 0.000887 GTGGG 0.00112 GTGGT 0.000976 GTGTA 0.000826 GTGTC 0.000746 GTGTG 0.0014 GTGTT 0.00135 GTTAA 0.000945 GTTAC 0.000728 GTTAG 0.000598 GTTAT 0.000791 GTTCA 0.000983 GTTCC 0.00084 GTTCG 0.000168 GTTCT 0.00125 GTTGA 0.000704 GTTGC 0.000819 GTTGG 0.000883 GTTGT 0.00108 GTTTA 0.00105 GTTTC 0.00123 GTTTG 0.00136 GTTTT 0.00215 TAAAA 0.00248 TAAAC 0.00105 TAAAG 0.00136 TAAAT 0.0017 TAACA 0.00124 TAACC 0.000566 TAACG 0.00026 TAACT 0.000995 TAAGA 0.00107 TAAGC 0.00078 TAAGG 0.00079 TAAGT 0.000883 TAATA 0.00111 TAATC 0.000651 TAATG 0.00108 TAATT 0.00139 TACAA 0.00126 TACAC 0.000826 TACAG 0.00146 TACAT 0.00113 TACCA 0.0008 TACCC 0.000451 TACCG 0.00017 TACCT 0.000806 TACGA 0.00017 TACGC 0.00017 TACGG 0.000196 TACGT 0.000305 TACTA 0.000611 TACTC 0.000616 TACTG 0.00126 TACTT 0.00118 TAGAA 0.0012 TAGAC 0.000404 TAGAG 0.000724 TAGAT 0.000703 TAGCA 0.00104 TAGCC 0.000418 TAGCG 0.000167 TAGCT 0.000865 TAGGA 0.000795 TAGGC 0.000439 TAGGG 0.00048 TAGGT 0.000549 TAGTA 0.000611 TAGTC 0.000422 TAGTG 0.000678 TAGTT 0.000841 TATAA 0.00103 TATAC 0.00062 TATAG 0.000594 TATAT 0.00123 TATCA 0.000862 TATCC 0.000564 TATCG 0.000121 TATCT 0.000965 TATGA 0.000856 TATGC 0.000714 TATGG 0.000677 TATGT 0.000998 TATTA 0.00111 TATTC 0.000917 TATTG 0.000881 TATTT 0.00242 TCAAA 0.0015 TCAAC 0.000704 TCAAG 0.000994 TCAAT 0.000774 TCACA 0.00148 TCACC 0.000926 TCACG 0.00035 TCACT 0.00127 TCAGA 0.00157 TCAGC 0.0016 TCAGG 0.00114 TCAGT 0.00155 TCATA 0.000856 TCATC 0.000961 TCATG 0.000943 TCATT 0.00144 TCCAA 0.00118 TCCAC 0.000947 TCCAG 0.00143 TCCAT 0.00113 TCCCA 0.00132 TCCCC 0.00124 TCCCG 0.000456 TCCCT 0.00142 TCCGA 0.00019 TCCGC 0.000387 TCCGG 0.000281 TCCGT 0.000304 TCCTA 0.000795 TCCTC 0.0014 TCCTG 0.00156 TCCTT 0.00166 TCGAA 0.000132 TCGAC 8.02e-05 TCGAG 0.000185 TCGAT 0.000129 TCGCA 0.000217 TCGCC 0.000238 TCGCG 0.000154 TCGCT 0.000333 TCGGA 0.00019 TCGGC 0.000281 TCGGG 0.000293 TCGGT 0.000235 TCGTA 0.00017 TCGTC 0.00016 TCGTG 0.000309 TCGTT 0.00028 TCTAA 0.000944 TCTAC 0.000673 TCTAG 0.000595 TCTAT 0.000821 TCTCA 0.00135 TCTCC 0.00134 TCTCG 0.000248 TCTCT 0.00166 TCTGA 0.00157 TCTGC 0.00176 TCTGG 0.00121 TCTGT 0.00196 TCTTA 0.00107 TCTTC 0.00156 TCTTG 0.0012 TCTTT 0.00218 TGAAA 0.0022 TGAAC 0.000983 TGAAG 0.00168 TGAAT 0.00131 TGACA 0.00122 TGACC 0.00064 TGACG 0.000251 TGACT 0.001 TGAGA 0.00135 TGAGC 0.00119 TGAGG 0.00129 TGAGT 0.000973 TGATA 0.000862 TGATC 0.000694 TGATG 0.00122 TGATT 0.0012 TGCAA 0.0016 TGCAC 0.00132 TGCAG 0.00241 TGCAT 0.00152 TGCCA 0.00134 TGCCC 0.00115 TGCCG 0.000426 TGCCT 0.00144 TGCGA 0.000217 TGCGC 0.000389 TGCGG 0.000454 TGCGT 0.000366 TGCTA 0.00104 TGCTC 0.00152 TGCTG 0.00269 TGCTT 0.00206 TGGAA 0.00167 TGGAC 0.000634 TGGAG 0.00138 TGGAT 0.001 TGGCA 0.00134 TGGCC 0.000726 TGGCG 0.000306 TGGCT 0.0013 TGGGA 0.00132 TGGGC 0.000939 TGGGG 0.00124 TGGGT 0.000902 TGGTA 0.0008 TGGTC 0.000614 TGGTG 0.00126 TGGTT 0.00118 TGTAA 0.00146 TGTAC 0.000896 TGTAG 0.001 TGTAT 0.00132 TGTCA 0.00122 TGTCC 0.000932 TGTCG 0.000183 TGTCT 0.00128 TGTGA 0.00148 TGTGC 0.00156 TGTGG 0.00139 TGTGT 0.00181 TGTTA 0.00124 TGTTC 0.00132 TGTTG 0.00138 TGTTT 0.00256 TTAAA 0.00233 TTAAC 0.000945 TTAAG 0.00119 TTAAT 0.00151 TTACA 0.00146 TTACC 0.000672 TTACG 0.000228 TTACT 0.0012 TTAGA 0.000944 TTAGC 0.000738 TTAGG 0.000677 TTAGT 0.000816 TTATA 0.00103 TTATC 0.000796 TTATG 0.000967 TTATT 0.0019 TTCAA 0.00145 TTCAC 0.0012 TTCAG 0.002 TTCAT 0.00152 TTCCA 0.00167 TTCCC 0.00143 TTCCG 0.000265 TTCCT 0.00198 TTCGA 0.000132 TTCGC 0.000181 TTCGG 0.000216 TTCGT 0.000257 TTCTA 0.0012 TTCTC 0.00159 TTCTG 0.00223 TTCTT 0.00232 TTGAA 0.00145 TTGAC 0.000601 TTGAG 0.00097 TTGAT 0.000945 TTGCA 0.0016 TTGCC 0.000879 TTGCG 0.000186 TTGCT 0.00175 TTGGA 0.00118 TTGGC 0.000847 TTGGG 0.000942 TTGGT 0.00103 TTGTA 0.00126 TTGTC 0.000927 TTGTG 0.00143 TTGTT 0.00194 TTTAA 0.00233 TTTAC 0.00118 TTTAG 0.00112 TTTAT 0.00196 TTTCA 0.0022 TTTCC 0.00195 TTTCG 0.000208 TTTCT 0.0028 TTTGA 0.0015 TTTGC 0.00159 TTTGG 0.00144 TTTGT 0.00224 TTTTA 0.00248 TTTTC 0.00253 TTTTG 0.00222 TTTTT 0.0052 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [3] # (a,c,g,t)= (0.274, 0.226, 0.226, 0.274) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.271 C 0.229 G 0.229 T 0.271 # l= 1 # Values AA 0.0859 AC 0.0527 AG 0.0725 AT 0.06 CA 0.0759 CC 0.0575 CG 0.023 CT 0.0725 GA 0.0574 GC 0.0614 GG 0.0575 GT 0.0527 TA 0.0519 TC 0.0574 TG 0.0759 TT 0.0859 # l= 2 # Values AAA 0.0321 AAC 0.0153 AAG 0.0202 AAT 0.0183 ACA 0.0208 ACC 0.0114 ACG 0.00512 ACT 0.0154 AGA 0.02 AGC 0.0197 AGG 0.0174 AGT 0.0154 ATA 0.014 ATC 0.0116 ATG 0.0161 ATT 0.0183 CAA 0.0177 CAC 0.0169 CAG 0.0252 CAT 0.0161 CCA 0.017 CCC 0.0161 CCG 0.00711 CCT 0.0174 CGA 0.00351 CGC 0.00726 CGG 0.00711 CGT 0.00512 CTA 0.01 CTC 0.017 CTG 0.0252 CTT 0.0202 GAA 0.0194 GAC 0.00935 GAG 0.017 GAT 0.0116 GCA 0.0203 GCC 0.014 GCG 0.00726 GCT 0.0197 GGA 0.0161 GGC 0.014 GGG 0.0161 GGT 0.0114 GTA 0.0111 GTC 0.00935 GTG 0.0169 GTT 0.0153 TAA 0.0168 TAC 0.0111 TAG 0.01 TAT 0.014 TCA 0.0178 TCC 0.0161 TCG 0.00351 TCT 0.02 TGA 0.0178 TGC 0.0203 TGG 0.017 TGT 0.0208 TTA 0.0168 TTC 0.0194 TTG 0.0177 TTT 0.0321 # l= 3 # Values AAAA 0.0121 AAAC 0.00568 AAAG 0.00707 AAAT 0.00726 AACA 0.00635 AACC 0.0032 AACG 0.00137 AACT 0.00442 AAGA 0.00588 AAGC 0.00489 AAGG 0.00493 AAGT 0.00453 AATA 0.0051 AATC 0.00316 AATG 0.0051 AATT 0.00493 ACAA 0.00541 ACAC 0.00433 ACAG 0.00669 ACAT 0.00436 ACCA 0.00387 ACCC 0.00272 ACCG 0.00116 ACCT 0.00361 ACGA 0.00094 ACGC 0.00125 ACGG 0.00138 ACGT 0.00154 ACTA 0.00244 ACTC 0.00286 ACTG 0.00557 ACTT 0.00453 AGAA 0.00719 AGAC 0.00311 AGAG 0.00556 AGAT 0.0041 AGCA 0.00742 AGCC 0.00432 AGCG 0.00197 AGCT 0.00603 AGGA 0.00549 AGGC 0.00388 AGGG 0.0044 AGGT 0.00361 AGTA 0.00352 AGTC 0.00273 AGTG 0.00473 AGTT 0.00442 ATAA 0.0045 ATAC 0.0029 ATAG 0.00265 ATAT 0.00394 ATCA 0.00389 ATCC 0.00297 ATCG 0.000686 ATCT 0.0041 ATGA 0.0041 ATGC 0.00388 ATGG 0.00379 ATGT 0.00436 ATTA 0.00405 ATTC 0.00366 ATTG 0.00332 ATTT 0.00726 CAAA 0.00666 CAAC 0.00347 CAAG 0.00426 CAAT 0.00332 CACA 0.0063 CACC 0.00396 CACG 0.0019 CACT 0.00473 CAGA 0.00651 CAGC 0.00773 CAGG 0.00538 CAGT 0.00557 CATA 0.00313 CATC 0.00393 CATG 0.00396 CATT 0.0051 CCAA 0.00403 CCAC 0.00405 CCAG 0.00511 CCAT 0.00379 CCCA 0.00463 CCCC 0.00471 CCCG 0.00234 CCCT 0.0044 CCGA 0.00105 CCGC 0.00278 CCGG 0.0019 CCGT 0.00138 CCTA 0.00224 CCTC 0.00483 CCTG 0.00538 CCTT 0.00493 CGAA 0.000805 CGAC 0.000661 CGAG 0.00136 CGAT 0.000686 CGCA 0.0015 CGCC 0.00217 CGCG 0.00162 CGCT 0.00197 CGGA 0.00122 CGGC 0.00239 CGGG 0.00234 CGGT 0.00116 CGTA 0.00084 CGTC 0.001 CGTG 0.0019 CGTT 0.00138 CTAA 0.00307 CTAC 0.00248 CTAG 0.00185 CTAT 0.00265 CTCA 0.00484 CTCC 0.00523 CTCG 0.00136 CTCT 0.00556 CTGA 0.00585 CTGC 0.00755 CTGG 0.00511 CTGT 0.00669 CTTA 0.00341 CTTC 0.00549 CTTG 0.00426 CTTT 0.00707 GAAA 0.00701 GAAC 0.00322 GAAG 0.00549 GAAT 0.00366 GACA 0.00362 GACC 0.002 GACG 0.001 GACT 0.00273 GAGA 0.00464 GAGC 0.00466 GAGG 0.00483 GAGT 0.00286 GATA 0.00243 GATC 0.00211 GATG 0.00393 GATT 0.00316 GCAA 0.00441 GCAC 0.00447 GCAG 0.00756 GCAT 0.00388 GCCA 0.00376 GCCC 0.00401 GCCG 0.00239 GCCT 0.00388 GCGA 0.000981 GCGC 0.00225 GCGG 0.00278 GCGT 0.00125 GCTA 0.00245 GCTC 0.00466 GCTG 0.00773 GCTT 0.00489 GGAA 0.00538 GGAC 0.00248 GGAG 0.00523 GGAT 0.00297 GGCA 0.00449 GGCC 0.00306 GGCG 0.00217 GGCT 0.00432 GGGA 0.00464 GGGC 0.00401 GGGG 0.00471 GGGT 0.00272 GGTA 0.0022 GGTC 0.002 GGTG 0.00397 GGTT 0.0032 GTAA 0.00345 GTAC 0.00226 GTAG 0.00248 GTAT 0.0029 GTCA 0.0031 GTCC 0.00248 GTCG 0.000661 GTCT 0.00311 GTGA 0.00404 GTGC 0.00447 GTGG 0.00405 GTGT 0.00433 GTTA 0.00297 GTTC 0.00322 GTTG 0.00347 GTTT 0.00568 TAAA 0.00633 TAAC 0.00297 TAAG 0.00341 TAAT 0.00406 TACA 0.00453 TACC 0.0022 TACG 0.00084 TACT 0.00352 TAGA 0.00293 TAGC 0.00245 TAGG 0.00224 TAGT 0.00244 TATA 0.00331 TATC 0.00244 TATG 0.00313 TATT 0.00511 TCAA 0.00385 TCAC 0.00404 TCAG 0.00585 TCAT 0.0041 TCCA 0.00471 TCCC 0.00464 TCCG 0.00122 TCCT 0.00549 TCGA 0.000537 TCGC 0.000981 TCGG 0.00105 TCGT 0.00094 TCTA 0.00293 TCTC 0.00464 TCTG 0.00651 TCTT 0.00588 TGAA 0.00601 TGAC 0.0031 TGAG 0.00484 TGAT 0.00389 TGCA 0.00691 TGCC 0.00449 TGCG 0.0015 TGCT 0.00742 TGGA 0.00471 TGGC 0.00376 TGGG 0.00463 TGGT 0.00387 TGTA 0.00453 TGTC 0.00362 TGTG 0.0063 TGTT 0.00635 TTAA 0.00575 TTAC 0.00345 TTAG 0.00307 TTAT 0.0045 TTCA 0.00601 TTCC 0.00538 TTCG 0.000805 TTCT 0.00719 TTGA 0.00385 TTGC 0.00441 TTGG 0.00403 TTGT 0.00542 TTTA 0.00633 TTTC 0.00701 TTTG 0.00666 TTTT 0.0121 # l= 4 # Values AAAAA 0.00505 AAAAC 0.0021 AAAAG 0.00236 AAAAT 0.00255 AAACA 0.00249 AAACC 0.00123 AAACG 0.000444 AAACT 0.00152 AAAGA 0.00213 AAAGC 0.00189 AAAGG 0.00163 AAAGT 0.00142 AAATA 0.00232 AAATC 0.00131 AAATG 0.00203 AAATT 0.0016 AACAA 0.00188 AACAC 0.00133 AACAG 0.00183 AACAT 0.0013 AACCA 0.00118 AACCC 0.000798 AACCG 0.000242 AACCT 0.000979 AACGA 0.000286 AACGC 0.000355 AACGG 0.000305 AACGT 0.00043 AACTA 0.000799 AACTC 0.000872 AACTG 0.00148 AACTT 0.00127 AAGAA 0.00225 AAGAC 0.00093 AAGAG 0.00153 AAGAT 0.00116 AAGCA 0.00205 AAGCC 0.00101 AAGCG 0.000367 AAGCT 0.00146 AAGGA 0.00166 AAGGC 0.00113 AAGGG 0.00117 AAGGT 0.000972 AAGTA 0.00113 AAGTC 0.00085 AAGTG 0.00129 AAGTT 0.00127 AATAA 0.00183 AATAC 0.00107 AATAG 0.000895 AATAT 0.00132 AATCA 0.00116 AATCC 0.000794 AATCG 0.000162 AATCT 0.00105 AATGA 0.0014 AATGC 0.00125 AATGG 0.0011 AATGT 0.00135 AATTA 0.00133 AATTC 0.00107 AATTG 0.00093 AATTT 0.0016 ACAAA 0.00219 ACAAC 0.00106 ACAAG 0.0012 ACAAT 0.000968 ACACA 0.00181 ACACC 0.00091 ACACG 0.000459 ACACT 0.00115 ACAGA 0.00194 ACAGC 0.00203 ACAGG 0.00128 ACAGT 0.00144 ACATA 0.000952 ACATC 0.00103 ACATG 0.00103 ACATT 0.00135 ACCAA 0.00102 ACCAC 0.000991 ACCAG 0.00105 ACCAT 0.00081 ACCCA 0.000934 ACCCC 0.000771 ACCCG 0.000279 ACCCT 0.000731 ACCGA 0.000244 ACCGC 0.000422 ACCGG 0.000238 ACCGT 0.000255 ACCTA 0.000533 ACCTC 0.000988 ACCTG 0.00112 ACCTT 0.000972 ACGAA 0.00026 ACGAC 0.00017 ACGAG 0.000314 ACGAT 0.000196 ACGCA 0.00038 ACGCC 0.000274 ACGCG 0.000213 ACGCT 0.000383 ACGGA 0.000317 ACGGC 0.000431 ACGGG 0.00038 ACGGT 0.000255 ACGTA 0.0003 ACGTC 0.000271 ACGTG 0.000543 ACGTT 0.00043 ACTAA 0.00078 ACTAC 0.000614 ACTAG 0.000435 ACTAT 0.00061 ACTCA 0.000964 ACTCC 0.000782 ACTCG 0.000205 ACTCT 0.000905 ACTGA 0.00152 ACTGC 0.0016 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00144 ACTTA 0.000845 ACTTC 0.00124 ACTTG 0.00103 ACTTT 0.00142 AGAAA 0.00274 AGAAC 0.00123 AGAAG 0.0019 AGAAT 0.00132 AGACA 0.00127 AGACC 0.000661 AGACG 0.000262 AGACT 0.000923 AGAGA 0.00166 AGAGC 0.00155 AGAGG 0.00144 AGAGT 0.000905 AGATA 0.000929 AGATC 0.000757 AGATG 0.00137 AGATT 0.00105 AGCAA 0.00175 AGCAC 0.00168 AGCAG 0.00262 AGCAT 0.00137 AGCCA 0.00133 AGCCC 0.00126 AGCCG 0.000495 AGCCT 0.00124 AGCGA 0.000347 AGCGC 0.000635 AGCGG 0.000605 AGCGT 0.000383 AGCTA 0.000843 AGCTC 0.00145 AGCTG 0.00227 AGCTT 0.00146 AGGAA 0.00198 AGGAC 0.000867 AGGAG 0.00169 AGGAT 0.000953 AGGCA 0.00147 AGGCC 0.000757 AGGCG 0.000417 AGGCT 0.00124 AGGGA 0.00147 AGGGC 0.00108 AGGGG 0.00112 AGGGT 0.000731 AGGTA 0.000788 AGGTC 0.000656 AGGTG 0.00119 AGGTT 0.000979 AGTAA 0.00115 AGTAC 0.000731 AGTAG 0.000766 AGTAT 0.000873 AGTCA 0.000983 AGTCC 0.00068 AGTCG 0.000149 AGTCT 0.000923 AGTGA 0.00126 AGTGC 0.00128 AGTGG 0.00104 AGTGT 0.00115 AGTTA 0.000955 AGTTC 0.000984 AGTTG 0.000962 AGTTT 0.00152 ATAAA 0.00189 ATAAC 0.000763 ATAAG 0.000811 ATAAT 0.00105 ATACA 0.00127 ATACC 0.000543 ATACG 0.000214 ATACT 0.000873 ATAGA 0.000794 ATAGC 0.000675 ATAGG 0.000568 ATAGT 0.00061 ATATA 0.00117 ATATC 0.000638 ATATG 0.000812 ATATT 0.00132 ATCAA 0.00091 ATCAC 0.000921 ATCAG 0.00116 ATCAT 0.000891 ATCCA 0.000999 ATCCC 0.000844 ATCCG 0.000173 ATCCT 0.000953 ATCGA 0.00013 ATCGC 0.000206 ATCGG 0.000154 ATCGT 0.000196 ATCTA 0.000672 ATCTC 0.000975 ATCTG 0.00129 ATCTT 0.00116 ATGAA 0.00147 ATGAC 0.000698 ATGAG 0.00104 ATGAT 0.000891 ATGCA 0.0015 ATGCC 0.000779 ATGCG 0.00023 ATGCT 0.00137 ATGGA 0.00113 ATGGC 0.000887 ATGGG 0.000959 ATGGT 0.00081 ATGTA 0.00108 ATGTC 0.000742 ATGTG 0.00123 ATGTT 0.0013 ATTAA 0.00144 ATTAC 0.000835 ATTAG 0.000731 ATTAT 0.00105 ATTCA 0.00127 ATTCC 0.000937 ATTCG 0.000135 ATTCT 0.00132 ATTGA 0.000746 ATTGC 0.000935 ATTGG 0.000667 ATTGT 0.000968 ATTTA 0.00163 ATTTC 0.00164 ATTTG 0.00144 ATTTT 0.00255 CAAAA 0.00217 CAAAC 0.00136 CAAAG 0.0017 CAAAT 0.00144 CAACA 0.00137 CAACC 0.000819 CAACG 0.000323 CAACT 0.000962 CAAGA 0.00119 CAAGC 0.000998 CAAGG 0.00105 CAAGT 0.00103 CAATA 0.00085 CAATC 0.000595 CAATG 0.000941 CAATT 0.00093 CACAA 0.00141 CACAC 0.00143 CACAG 0.00223 CACAT 0.00123 CACCA 0.00129 CACCC 0.00096 CACCG 0.000528 CACCT 0.00119 CACGA 0.00032 CACGC 0.000482 CACGG 0.000554 CACGT 0.000543 CACTA 0.000657 CACTC 0.000873 CACTG 0.00191 CACTT 0.00129 CAGAA 0.0022 CAGAC 0.00107 CAGAG 0.00196 CAGAT 0.00129 CAGCA 0.00277 CAGCC 0.00188 CAGCG 0.000808 CAGCT 0.00227 CAGGA 0.0016 CAGGC 0.00127 CAGGG 0.0014 CAGGT 0.00112 CAGTA 0.00122 CAGTC 0.000965 CAGTG 0.00191 CAGTT 0.00148 CATAA 0.000926 CATAC 0.00071 CATAG 0.000685 CATAT 0.000812 CATCA 0.00122 CATCC 0.0011 CATCG 0.000255 CATCT 0.00137 CATGA 0.000927 CATGC 0.00101 CATGG 0.000994 CATGT 0.00103 CATTA 0.00105 CATTC 0.00108 CATTG 0.000941 CATTT 0.00203 CCAAA 0.00145 CCAAC 0.000902 CCAAG 0.00102 CCAAT 0.000667 CCACA 0.00142 CCACC 0.00108 CCACG 0.000512 CCACT 0.00104 CCAGA 0.00122 CCAGC 0.00161 CCAGG 0.00126 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000671 CCATC 0.00102 CCATG 0.000994 CCATT 0.0011 CCCAA 0.000978 CCCAC 0.00119 CCCAG 0.00151 CCCAT 0.000959 CCCCA 0.00134 CCCCC 0.00138 CCCCG 0.00088 CCCCT 0.00112 CCCGA 0.000314 CCCGC 0.000958 CCCGG 0.00069 CCCGT 0.00038 CCCTA 0.000485 CCCTC 0.00134 CCCTG 0.0014 CCCTT 0.00117 CCGAA 0.000225 CCGAC 0.000214 CCGAG 0.000459 CCGAT 0.000154 CCGCA 0.000483 CCGCC 0.00103 CCGCG 0.000662 CCGCT 0.000605 CCGGA 0.000298 CCGGC 0.000671 CCGGG 0.00069 CCGGT 0.000238 CCGTA 0.0002 CCGTC 0.000325 CCGTG 0.000554 CCGTT 0.000305 CCTAA 0.000665 CCTAC 0.000594 CCTAG 0.000408 CCTAT 0.000568 CCTCA 0.00131 CCTCC 0.00162 CCTCG 0.000456 CCTCT 0.00144 CCTGA 0.00115 CCTGC 0.00169 CCTGG 0.00126 CCTGT 0.00128 CCTTA 0.000779 CCTTC 0.00147 CCTTG 0.00105 CCTTT 0.00163 CGAAA 0.00021 CGAAC 0.000173 CGAAG 0.000286 CGAAT 0.000135 CGACA 0.000189 CGACC 0.000183 CGACG 0.000141 CGACT 0.000149 CGAGA 0.000256 CGAGC 0.000441 CGAGG 0.000456 CGAGT 0.000205 CGATA 0.000121 CGATC 0.000148 CGATG 0.000255 CGATT 0.000162 CGCAA 0.00019 CGCAC 0.000406 CGCAG 0.000671 CGCAT 0.00023 CGCCA 0.000319 CGCCC 0.000728 CGCCG 0.000711 CGCCT 0.000417 CGCGA 0.00016 CGCGC 0.000585 CGCGG 0.000662 CGCGT 0.000213 CGCTA 0.000169 CGCTC 0.000627 CGCTG 0.000808 CGCTT 0.000367 CGGAA 0.000273 CGGAC 0.000203 CGGAG 0.000573 CGGAT 0.000173 CGGCA 0.000447 CGGCC 0.000732 CGGCG 0.000711 CGGCT 0.000495 CGGGA 0.000482 CGGGC 0.0007 CGGGG 0.00088 CGGGT 0.000279 CGGTA 0.000172 CGGTC 0.000217 CGGTG 0.000528 CGGTT 0.000242 CGTAA 0.000226 CGTAC 0.000189 CGTAG 0.000211 CGTAT 0.000214 CGTCA 0.000258 CGTCC 0.000344 CGTCG 0.000141 CGTCT 0.000262 CGTGA 0.000359 CGTGC 0.000567 CGTGG 0.000512 CGTGT 0.000459 CGTTA 0.000262 CGTTC 0.000346 CGTTG 0.000323 CGTTT 0.000444 CTAAA 0.00108 CTAAC 0.000582 CTAAG 0.000681 CTAAT 0.000731 CTACA 0.000975 CTACC 0.000526 CTACG 0.000211 CTACT 0.000766 CTAGA 0.000575 CTAGC 0.000433 CTAGG 0.000408 CTAGT 0.000435 CTATA 0.000571 CTATC 0.000496 CTATG 0.000685 CTATT 0.000895 CTCAA 0.000956 CTCAC 0.00114 CTCAG 0.00171 CTCAT 0.00104 CTCCA 0.00142 CTCCC 0.00155 CTCCG 0.000573 CTCCT 0.00169 CTCGA 0.000191 CTCGC 0.000393 CTCGG 0.000459 CTCGT 0.000314 CTCTA 0.000711 CTCTC 0.00136 CTCTG 0.00196 CTCTT 0.00153 CTGAA 0.00196 CTGAC 0.00101 CTGAG 0.00171 CTGAT 0.00116 CTGCA 0.00248 CTGCC 0.00179 CTGCG 0.000671 CTGCT 0.00262 CTGGA 0.00145 CTGGC 0.0011 CTGGG 0.00151 CTGGT 0.00105 CTGTA 0.00143 CTGTC 0.0012 CTGTG 0.00223 CTGTT 0.00183 CTTAA 0.00115 CTTAC 0.000765 CTTAG 0.000681 CTTAT 0.000811 CTTCA 0.00166 CTTCC 0.00165 CTTCG 0.000286 CTTCT 0.0019 CTTGA 0.000972 CTTGC 0.00107 CTTGG 0.00102 CTTGT 0.0012 CTTTA 0.00132 CTTTC 0.00169 CTTTG 0.0017 CTTTT 0.00236 GAAAA 0.00247 GAAAC 0.00121 GAAAG 0.00169 GAAAT 0.00164 GAACA 0.0013 GAACC 0.000594 GAACG 0.000346 GAACT 0.000984 GAAGA 0.00154 GAAGC 0.00124 GAAGG 0.00147 GAAGT 0.00124 GAATA 0.00088 GAATC 0.000634 GAATG 0.00108 GAATT 0.00107 GACAA 0.000914 GACAC 0.00076 GACAG 0.0012 GACAT 0.000742 GACCA 0.000621 GACCC 0.000502 GACCG 0.000217 GACCT 0.000656 GACGA 0.000165 GACGC 0.000242 GACGG 0.000325 GACGT 0.000271 GACTA 0.000405 GACTC 0.000513 GACTG 0.000965 GACTT 0.00085 GAGAA 0.00159 GAGAC 0.000723 GAGAG 0.00136 GAGAT 0.000975 GAGCA 0.00157 GAGCC 0.00102 GAGCG 0.000627 GAGCT 0.00145 GAGGA 0.00144 GAGGC 0.00106 GAGGG 0.00134 GAGGT 0.000988 GAGTA 0.000597 GAGTC 0.000513 GAGTG 0.000873 GAGTT 0.000872 GATAA 0.000772 GATAC 0.00053 GATAG 0.000496 GATAT 0.000638 GATCA 0.000685 GATCC 0.00052 GATCG 0.000148 GATCT 0.000757 GATGA 0.000952 GATGC 0.000934 GATGG 0.00102 GATGT 0.00103 GATTA 0.000625 GATTC 0.000634 GATTG 0.000595 GATTT 0.00131 GCAAA 0.00158 GCAAC 0.00082 GCAAG 0.00107 GCAAT 0.000935 GCACA 0.0016 GCACC 0.00102 GCACG 0.000567 GCACT 0.00128 GCAGA 0.0018 GCAGC 0.00246 GCAGG 0.00169 GCAGT 0.0016 GCATA 0.000691 GCATC 0.000934 GCATG 0.00101 GCATT 0.00125 GCCAA 0.000861 GCCAC 0.000919 GCCAG 0.0011 GCCAT 0.000887 GCCCA 0.000989 GCCCC 0.00124 GCCCG 0.0007 GCCCT 0.00108 GCCGA 0.000295 GCCGC 0.000989 GCCGG 0.000671 GCCGT 0.000431 GCCTA 0.000433 GCCTC 0.00106 GCCTG 0.00127 GCCTT 0.00113 GCGAA 0.000187 GCGAC 0.000195 GCGAG 0.000393 GCGAT 0.000206 GCGCA 0.000409 GCGCC 0.000622 GCGCG 0.000585 GCGCT 0.000635 GCGGA 0.000408 GCGGC 0.000989 GCGGG 0.000958 GCGGT 0.000422 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000242 GCGTG 0.000482 GCGTT 0.000355 GCTAA 0.000722 GCTAC 0.000618 GCTAG 0.000433 GCTAT 0.000675 GCTCA 0.00122 GCTCC 0.00145 GCTCG 0.000441 GCTCT 0.00155 GCTGA 0.00163 GCTGC 0.00246 GCTGG 0.00161 GCTGT 0.00203 GCTTA 0.000761 GCTTC 0.00124 GCTTG 0.000998 GCTTT 0.00189 GGAAA 0.00194 GGAAC 0.000852 GGAAG 0.00165 GGAAT 0.000937 GGACA 0.000956 GGACC 0.000502 GGACG 0.000344 GGACT 0.00068 GGAGA 0.00138 GGAGC 0.00145 GGAGG 0.00162 GGAGT 0.000782 GGATA 0.000558 GGATC 0.00052 GGATG 0.0011 GGATT 0.000794 GGCAA 0.000885 GGCAC 0.00104 GGCAG 0.00179 GGCAT 0.000779 GGCCA 0.000754 GGCCC 0.000816 GGCCG 0.000732 GGCCT 0.000757 GGCGA 0.00025 GGCGC 0.000622 GGCGG 0.00103 GGCGT 0.000274 GGCTA 0.000415 GGCTC 0.00102 GGCTG 0.00188 GGCTT 0.00101 GGGAA 0.00147 GGGAC 0.000772 GGGAG 0.00155 GGGAT 0.000844 GGGCA 0.00121 GGGCC 0.000816 GGGCG 0.000728 GGGCT 0.00126 GGGGA 0.00132 GGGGC 0.00124 GGGGG 0.00138 GGGGT 0.000771 GGGTA 0.000455 GGGTC 0.000502 GGGTG 0.00096 GGGTT 0.000798 GGTAA 0.000659 GGTAC 0.000468 GGTAG 0.000526 GGTAT 0.000543 GGTCA 0.00065 GGTCC 0.000502 GGTCG 0.000183 GGTCT 0.000661 GGTGA 0.00095 GGTGC 0.00102 GGTGG 0.00108 GGTGT 0.00091 GGTTA 0.000558 GGTTC 0.000594 GGTTG 0.000819 GGTTT 0.00123 GTAAA 0.00113 GTAAC 0.000711 GTAAG 0.000765 GTAAT 0.000835 GTACA 0.000874 GTACC 0.000468 GTACG 0.000189 GTACT 0.000731 GTAGA 0.000652 GTAGC 0.000618 GTAGG 0.000594 GTAGT 0.000614 GTATA 0.00059 GTATC 0.00053 GTATG 0.00071 GTATT 0.00107 GTCAA 0.000586 GTCAC 0.000801 GTCAG 0.00101 GTCAT 0.000698 GTCCA 0.000639 GTCCC 0.000772 GTCCG 0.000203 GTCCT 0.000867 GTCGA 8.21e-05 GTCGC 0.000195 GTCGG 0.000214 GTCGT 0.00017 GTCTA 0.000389 GTCTC 0.000723 GTCTG 0.00107 GTCTT 0.00093 GTGAA 0.00118 GTGAC 0.000801 GTGAG 0.00114 GTGAT 0.000921 GTGCA 0.00134 GTGCC 0.00104 GTGCG 0.000406 GTGCT 0.00168 GTGGA 0.000957 GTGGC 0.000919 GTGGG 0.00119 GTGGT 0.000991 GTGTA 0.000806 GTGTC 0.00076 GTGTG 0.00143 GTGTT 0.00133 GTTAA 0.000915 GTTAC 0.000711 GTTAG 0.000582 GTTAT 0.000763 GTTCA 0.000963 GTTCC 0.000852 GTTCG 0.000173 GTTCT 0.00123 GTTGA 0.000686 GTTGC 0.00082 GTTGG 0.000902 GTTGT 0.00106 GTTTA 0.00101 GTTTC 0.00121 GTTTG 0.00136 GTTTT 0.0021 TAAAA 0.00237 TAAAC 0.00101 TAAAG 0.00132 TAAAT 0.00163 TAACA 0.0012 TAACC 0.000558 TAACG 0.000262 TAACT 0.000955 TAAGA 0.00103 TAAGC 0.000761 TAAGG 0.000779 TAAGT 0.000845 TAATA 0.00105 TAATC 0.000625 TAATG 0.00105 TAATT 0.00133 TACAA 0.00121 TACAC 0.000806 TACAG 0.00143 TACAT 0.00108 TACCA 0.000781 TACCC 0.000455 TACCG 0.000172 TACCT 0.000788 TACGA 0.000169 TACGC 0.000171 TACGG 0.0002 TACGT 0.0003 TACTA 0.000577 TACTC 0.000597 TACTG 0.00122 TACTT 0.00113 TAGAA 0.00116 TAGAC 0.000389 TAGAG 0.000711 TAGAT 0.000672 TAGCA 0.00102 TAGCC 0.000415 TAGCG 0.000169 TAGCT 0.000843 TAGGA 0.000784 TAGGC 0.000433 TAGGG 0.000485 TAGGT 0.000533 TAGTA 0.000577 TAGTC 0.000405 TAGTG 0.000657 TAGTT 0.000799 TATAA 0.000978 TATAC 0.00059 TATAG 0.000571 TATAT 0.00117 TATCA 0.000828 TATCC 0.000558 TATCG 0.000121 TATCT 0.000929 TATGA 0.000819 TATGC 0.000691 TATGG 0.000671 TATGT 0.000952 TATTA 0.00105 TATTC 0.00088 TATTG 0.00085 TATTT 0.00232 TCAAA 0.00144 TCAAC 0.000686 TCAAG 0.000972 TCAAT 0.000746 TCACA 0.00147 TCACC 0.00095 TCACG 0.000359 TCACT 0.00126 TCAGA 0.00155 TCAGC 0.00163 TCAGG 0.00115 TCAGT 0.00152 TCATA 0.000819 TCATC 0.000952 TCATG 0.000927 TCATT 0.0014 TCCAA 0.00117 TCCAC 0.000957 TCCAG 0.00145 TCCAT 0.00113 TCCCA 0.00137 TCCCC 0.00132 TCCCG 0.000482 TCCCT 0.00147 TCCGA 0.000199 TCCGC 0.000408 TCCGG 0.000298 TCCGT 0.000317 TCCTA 0.000784 TCCTC 0.00144 TCCTG 0.0016 TCCTT 0.00166 TCGAA 0.000133 TCGAC 8.21e-05 TCGAG 0.000191 TCGAT 0.00013 TCGCA 0.000224 TCGCC 0.00025 TCGCG 0.00016 TCGCT 0.000347 TCGGA 0.000199 TCGGC 0.000295 TCGGG 0.000314 TCGGT 0.000244 TCGTA 0.000169 TCGTC 0.000165 TCGTG 0.00032 TCGTT 0.000286 TCTAA 0.000906 TCTAC 0.000652 TCTAG 0.000575 TCTAT 0.000794 TCTCA 0.00134 TCTCC 0.00138 TCTCG 0.000256 TCTCT 0.00166 TCTGA 0.00155 TCTGC 0.0018 TCTGG 0.00122 TCTGT 0.00194 TCTTA 0.00103 TCTTC 0.00154 TCTTG 0.00119 TCTTT 0.00213 TGAAA 0.00212 TGAAC 0.000963 TGAAG 0.00166 TGAAT 0.00127 TGACA 0.00121 TGACC 0.00065 TGACG 0.000258 TGACT 0.000983 TGAGA 0.00134 TGAGC 0.00122 TGAGG 0.00131 TGAGT 0.000964 TGATA 0.000828 TGATC 0.000685 TGATG 0.00122 TGATT 0.00116 TGCAA 0.00159 TGCAC 0.00134 TGCAG 0.00248 TGCAT 0.0015 TGCCA 0.00136 TGCCC 0.00121 TGCCG 0.000447 TGCCT 0.00147 TGCGA 0.000224 TGCGC 0.000409 TGCGG 0.000483 TGCGT 0.00038 TGCTA 0.00102 TGCTC 0.00157 TGCTG 0.00277 TGCTT 0.00205 TGGAA 0.00165 TGGAC 0.000639 TGGAG 0.00142 TGGAT 0.000999 TGGCA 0.00136 TGGCC 0.000754 TGGCG 0.000319 TGGCT 0.00133 TGGGA 0.00137 TGGGC 0.000989 TGGGG 0.00134 TGGGT 0.000934 TGGTA 0.000781 TGGTC 0.000621 TGGTG 0.00129 TGGTT 0.00118 TGTAA 0.00141 TGTAC 0.000874 TGTAG 0.000975 TGTAT 0.00127 TGTCA 0.00121 TGTCC 0.000956 TGTCG 0.000189 TGTCT 0.00127 TGTGA 0.00147 TGTGC 0.0016 TGTGG 0.00142 TGTGT 0.00181 TGTTA 0.0012 TGTTC 0.0013 TGTTG 0.00137 TGTTT 0.00249 TTAAA 0.00223 TTAAC 0.000915 TTAAG 0.00115 TTAAT 0.00144 TTACA 0.00141 TTACC 0.000659 TTACG 0.000226 TTACT 0.00115 TTAGA 0.000906 TTAGC 0.000722 TTAGG 0.000665 TTAGT 0.00078 TTATA 0.000978 TTATC 0.000772 TTATG 0.000926 TTATT 0.00183 TTCAA 0.0014 TTCAC 0.00118 TTCAG 0.00196 TTCAT 0.00147 TTCCA 0.00165 TTCCC 0.00147 TTCCG 0.000273 TTCCT 0.00198 TTCGA 0.000133 TTCGC 0.000187 TTCGG 0.000225 TTCGT 0.00026 TTCTA 0.00116 TTCTC 0.00159 TTCTG 0.0022 TTCTT 0.00225 TTGAA 0.0014 TTGAC 0.000586 TTGAG 0.000956 TTGAT 0.00091 TTGCA 0.00159 TTGCC 0.000885 TTGCG 0.00019 TTGCT 0.00175 TTGGA 0.00117 TTGGC 0.000861 TTGGG 0.000978 TTGGT 0.00102 TTGTA 0.00121 TTGTC 0.000914 TTGTG 0.00141 TTGTT 0.00188 TTTAA 0.00223 TTTAC 0.00113 TTTAG 0.00108 TTTAT 0.00189 TTTCA 0.00212 TTTCC 0.00194 TTTCG 0.00021 TTTCT 0.00274 TTTGA 0.00144 TTTGC 0.00158 TTTGG 0.00145 TTTGT 0.00219 TTTTA 0.00237 TTTTC 0.00247 TTTTG 0.00217 TTTTT 0.00505 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [4] # (a,c,g,t)= (0.263, 0.237, 0.237, 0.263) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.267 C 0.233 G 0.233 T 0.267 # l= 1 # Values AA 0.0836 AC 0.0524 AG 0.0727 AT 0.0583 CA 0.0762 CC 0.0598 CG 0.0242 CT 0.0727 GA 0.0574 GC 0.0633 GG 0.0598 GT 0.0524 TA 0.0498 TC 0.0574 TG 0.0762 TT 0.0837 # l= 2 # Values AAA 0.0311 AAC 0.0151 AAG 0.0199 AAT 0.0176 ACA 0.0205 ACC 0.0116 ACG 0.0053 ACT 0.015 AGA 0.0197 AGC 0.0202 AGG 0.0178 AGT 0.015 ATA 0.0134 ATC 0.0115 ATG 0.0159 ATT 0.0176 CAA 0.0174 CAC 0.0172 CAG 0.0256 CAT 0.0159 CCA 0.0174 CCC 0.0171 CCG 0.00755 CCT 0.0178 CGA 0.00365 CGC 0.00765 CGG 0.00756 CGT 0.0053 CTA 0.00972 CTC 0.0174 CTG 0.0256 CTT 0.0199 GAA 0.0191 GAC 0.00942 GAG 0.0174 GAT 0.0115 GCA 0.0207 GCC 0.0147 GCG 0.00766 GCT 0.0202 GGA 0.0165 GGC 0.0147 GGG 0.0171 GGT 0.0116 GTA 0.0107 GTC 0.00942 GTG 0.0172 GTT 0.0151 TAA 0.0161 TAC 0.0107 TAG 0.00972 TAT 0.0134 TCA 0.0176 TCC 0.0165 TCG 0.00365 TCT 0.0197 TGA 0.0176 TGC 0.0207 TGG 0.0174 TGT 0.0205 TTA 0.0161 TTC 0.0191 TTG 0.0174 TTT 0.0311 # l= 3 # Values AAAA 0.0116 AAAC 0.00555 AAAG 0.00695 AAAT 0.00694 AACA 0.00618 AACC 0.00322 AACG 0.00141 AACT 0.00426 AAGA 0.00573 AAGC 0.00488 AAGG 0.00497 AAGT 0.00437 AATA 0.00486 AATC 0.00307 AATG 0.00496 AATT 0.00468 ACAA 0.00526 ACAC 0.00433 ACAG 0.00669 ACAT 0.00422 ACCA 0.00388 ACCC 0.00286 ACCG 0.00122 ACCT 0.00361 ACGA 0.00096 ACGC 0.00131 ACGG 0.00146 ACGT 0.00157 ACTA 0.00231 ACTC 0.00284 ACTG 0.00551 ACTT 0.00437 AGAA 0.00702 AGAC 0.00308 AGAG 0.00563 AGAT 0.004 AGCA 0.00753 AGCC 0.0045 AGCG 0.00208 AGCT 0.0061 AGGA 0.00556 AGGC 0.00398 AGGG 0.00461 AGGT 0.00361 AGTA 0.00335 AGTC 0.0027 AGTG 0.00473 AGTT 0.00426 ATAA 0.0043 ATAC 0.00277 ATAG 0.00256 ATAT 0.00373 ATCA 0.00379 ATCC 0.00302 ATCG 0.000705 ATCT 0.004 ATGA 0.00398 ATGC 0.00386 ATGG 0.00384 ATGT 0.00422 ATTA 0.00386 ATTC 0.00355 ATTG 0.00323 ATTT 0.00694 CAAA 0.00653 CAAC 0.00345 CAAG 0.00423 CAAT 0.00322 CACA 0.00635 CACC 0.00414 CACG 0.002 CACT 0.00473 CAGA 0.00652 CAGC 0.00806 CAGG 0.00557 CAGT 0.00551 CATA 0.00301 CATC 0.00398 CATG 0.00395 CATT 0.00496 CCAA 0.00407 CCAC 0.0042 CCAG 0.00528 CCAT 0.00384 CCCA 0.0049 CCCC 0.00511 CCCG 0.00251 CCCT 0.00461 CCGA 0.00111 CCGC 0.00294 CCGG 0.00204 CCGT 0.00146 CCTA 0.00221 CCTC 0.00502 CCTG 0.00557 CCTT 0.00497 CGAA 0.000825 CGAC 0.00069 CGAG 0.00143 CGAT 0.000705 CGCA 0.00158 CGCC 0.00229 CGCG 0.00171 CGCT 0.00208 CGGA 0.00129 CGGC 0.00253 CGGG 0.00251 CGGT 0.00122 CGTA 0.00084 CGTC 0.00105 CGTG 0.002 CGTT 0.00141 CTAA 0.00296 CTAC 0.00241 CTAG 0.00179 CTAT 0.00256 CTCA 0.00488 CTCC 0.00547 CTCG 0.00143 CTCT 0.00563 CTGA 0.00583 CTGC 0.00785 CTGG 0.00528 CTGT 0.00669 CTTA 0.00329 CTTC 0.00548 CTTG 0.00423 CTTT 0.00695 GAAA 0.00685 GAAC 0.0032 GAAG 0.00548 GAAT 0.00355 GACA 0.00361 GACC 0.00205 GACG 0.00105 GACT 0.0027 GAGA 0.00467 GAGC 0.00488 GAGG 0.00502 GAGT 0.00284 GATA 0.00235 GATC 0.00211 GATG 0.00398 GATT 0.00307 GCAA 0.00439 GCAC 0.00464 GCAG 0.00785 GCAT 0.00387 GCCA 0.00388 GCCC 0.00428 GCCG 0.00253 GCCT 0.00398 GCGA 0.00103 GCGC 0.00238 GCGG 0.00294 GCGT 0.00131 GCTA 0.00239 GCTC 0.00488 GCTG 0.00806 GCTT 0.00488 GGAA 0.00541 GGAC 0.00257 GGAG 0.00547 GGAT 0.00302 GGCA 0.00465 GGCC 0.00322 GGCG 0.00229 GGCT 0.0045 GGGA 0.00487 GGGC 0.00428 GGGG 0.00511 GGGT 0.00286 GGTA 0.00216 GGTC 0.00206 GGTG 0.00414 GGTT 0.00322 GTAA 0.00331 GTAC 0.00221 GTAG 0.00242 GTAT 0.00277 GTCA 0.00307 GTCC 0.00257 GTCG 0.00069 GTCT 0.00308 GTGA 0.00404 GTGC 0.00464 GTGG 0.0042 GTGT 0.00433 GTTA 0.00287 GTTC 0.0032 GTTG 0.00345 GTTT 0.00555 TAAA 0.00606 TAAC 0.00287 TAAG 0.00329 TAAT 0.00386 TACA 0.00436 TACC 0.00216 TACG 0.000839 TACT 0.00335 TAGA 0.00281 TAGC 0.00239 TAGG 0.00221 TAGT 0.00232 TATA 0.00314 TATC 0.00235 TATG 0.00301 TATT 0.00486 TCAA 0.00371 TCAC 0.00404 TCAG 0.00583 TCAT 0.00398 TCCA 0.00473 TCCC 0.00487 TCCG 0.00129 TCCT 0.00556 TCGA 0.000548 TCGC 0.00103 TCGG 0.00111 TCGT 0.00096 TCTA 0.00281 TCTC 0.00467 TCTG 0.00652 TCTT 0.00573 TGAA 0.00582 TGAC 0.00307 TGAG 0.00488 TGAT 0.00379 TGCA 0.00698 TGCC 0.00465 TGCG 0.00158 TGCT 0.00753 TGGA 0.00473 TGGC 0.00388 TGGG 0.0049 TGGT 0.00388 TGTA 0.00436 TGTC 0.00361 TGTG 0.00635 TGTT 0.00618 TTAA 0.00549 TTAC 0.00331 TTAG 0.00296 TTAT 0.0043 TTCA 0.00582 TTCC 0.00541 TTCG 0.000825 TTCT 0.00702 TTGA 0.00371 TTGC 0.00439 TTGG 0.00407 TTGT 0.00526 TTTA 0.00606 TTTC 0.00685 TTTG 0.00653 TTTT 0.0116 # l= 4 # Values AAAAA 0.00489 AAAAC 0.00203 AAAAG 0.0023 AAAAT 0.00242 AAACA 0.00241 AAACC 0.00123 AAACG 0.000451 AAACT 0.00146 AAAGA 0.00207 AAAGC 0.00188 AAAGG 0.00164 AAAGT 0.00137 AAATA 0.00221 AAATC 0.00127 AAATG 0.00196 AAATT 0.00151 AACAA 0.00182 AACAC 0.00132 AACAG 0.0018 AACAT 0.00124 AACCA 0.00117 AACCC 0.000829 AACCG 0.000251 AACCT 0.000968 AACGA 0.000291 AACGC 0.000368 AACGG 0.000316 AACGT 0.00043 AACTA 0.000754 AACTC 0.000859 AACTG 0.00144 AACTT 0.00121 AAGAA 0.00219 AAGAC 0.000906 AAGAG 0.00152 AAGAT 0.00112 AAGCA 0.00203 AAGCC 0.00102 AAGCG 0.00038 AAGCT 0.00144 AAGGA 0.00167 AAGGC 0.00114 AAGGG 0.0012 AAGGT 0.000958 AAGTA 0.00106 AAGTC 0.00083 AAGTG 0.00127 AAGTT 0.00121 AATAA 0.00175 AATAC 0.00101 AATAG 0.000858 AATAT 0.00124 AATCA 0.00112 AATCC 0.000789 AATCG 0.000165 AATCT 0.001 AATGA 0.00135 AATGC 0.00123 AATGG 0.0011 AATGT 0.00128 AATTA 0.00126 AATTC 0.00103 AATTG 0.000888 AATTT 0.00151 ACAAA 0.00212 ACAAC 0.00104 ACAAG 0.00118 ACAAT 0.000924 ACACA 0.0018 ACACC 0.000931 ACACG 0.000476 ACACT 0.00113 ACAGA 0.00191 ACAGC 0.00208 ACAGG 0.0013 ACAGT 0.0014 ACATA 0.000903 ACATC 0.00102 ACATG 0.00101 ACATT 0.00128 ACCAA 0.00101 ACCAC 0.00101 ACCAG 0.00106 ACCAT 0.0008 ACCCA 0.00097 ACCCC 0.000837 ACCCG 0.0003 ACCCT 0.000751 ACCGA 0.000254 ACCGC 0.000449 ACCGG 0.000254 ACCGT 0.000262 ACCTA 0.000517 ACCTC 0.00101 ACCTG 0.00113 ACCTT 0.000958 ACGAA 0.000262 ACGAC 0.000175 ACGAG 0.000327 ACGAT 0.000196 ACGCA 0.000396 ACGCC 0.000289 ACGCG 0.000227 ACGCT 0.000397 ACGGA 0.000333 ACGGC 0.000459 ACGGG 0.000409 ACGGT 0.000262 ACGTA 0.000296 ACGTC 0.000281 ACGTG 0.000562 ACGTT 0.00043 ACTAA 0.00074 ACTAC 0.000587 ACTAG 0.000412 ACTAT 0.000576 ACTCA 0.000953 ACTCC 0.000791 ACTCG 0.000211 ACTCT 0.000886 ACTGA 0.00148 ACTGC 0.00162 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.0014 ACTTA 0.000802 ACTTC 0.00121 ACTTG 0.000995 ACTTT 0.00137 AGAAA 0.00266 AGAAC 0.00121 AGAAG 0.00188 AGAAT 0.00127 AGACA 0.00125 AGACC 0.00067 AGACG 0.000269 AGACT 0.000896 AGAGA 0.00166 AGAGC 0.00161 AGAGG 0.00148 AGAGT 0.000886 AGATA 0.000888 AGATC 0.000749 AGATG 0.00136 AGATT 0.001 AGCAA 0.00173 AGCAC 0.00173 AGCAG 0.0027 AGCAT 0.00136 AGCCA 0.00136 AGCCC 0.00135 AGCCG 0.000526 AGCCT 0.00127 AGCGA 0.000361 AGCGC 0.000675 AGCGG 0.000644 AGCGT 0.000397 AGCTA 0.000817 AGCTC 0.0015 AGCTG 0.00234 AGCTT 0.00144 AGGAA 0.00197 AGGAC 0.000887 AGGAG 0.00175 AGGAT 0.000953 AGGCA 0.00149 AGGCC 0.000779 AGGCG 0.000436 AGGCT 0.00127 AGGGA 0.00152 AGGGC 0.00115 AGGGG 0.00119 AGGGT 0.000751 AGGTA 0.000768 AGGTC 0.000664 AGGTG 0.00121 AGGTT 0.000968 AGTAA 0.00109 AGTAC 0.000701 AGTAG 0.000735 AGTAT 0.000823 AGTCA 0.00096 AGTCC 0.000686 AGTCG 0.000153 AGTCT 0.000896 AGTGA 0.00124 AGTGC 0.0013 AGTGG 0.00106 AGTGT 0.00113 AGTTA 0.000908 AGTTC 0.000959 AGTTG 0.000936 AGTTT 0.00146 ATAAA 0.00181 ATAAC 0.000732 ATAAG 0.000778 ATAAT 0.000987 ATACA 0.00121 ATACC 0.000528 ATACG 0.000211 ATACT 0.000823 ATAGA 0.000764 ATAGC 0.000658 ATAGG 0.00056 ATAGT 0.000576 ATATA 0.00111 ATATC 0.00061 ATATG 0.000771 ATATT 0.00124 ATCAA 0.000872 ATCAC 0.000912 ATCAG 0.00114 ATCAT 0.000857 ATCCA 0.000995 ATCCC 0.000888 ATCCG 0.000181 ATCCT 0.000953 ATCGA 0.000132 ATCGC 0.000215 ATCGG 0.000162 ATCGT 0.000196 ATCTA 0.000638 ATCTC 0.000974 ATCTG 0.00127 ATCTT 0.00112 ATGAA 0.00141 ATGAC 0.00068 ATGAG 0.00103 ATGAT 0.000857 ATGCA 0.00148 ATGCC 0.000787 ATGCG 0.000238 ATGCT 0.00136 ATGGA 0.00113 ATGGC 0.000904 ATGGG 0.00101 ATGGT 0.0008 ATGTA 0.00103 ATGTC 0.000728 ATGTG 0.00122 ATGTT 0.00124 ATTAA 0.00138 ATTAC 0.000795 ATTAG 0.000699 ATTAT 0.000987 ATTCA 0.00122 ATTCC 0.000925 ATTCG 0.000137 ATTCT 0.00127 ATTGA 0.000716 ATTGC 0.000922 ATTGG 0.000663 ATTGT 0.000924 ATTTA 0.00155 ATTTC 0.00159 ATTTG 0.00139 ATTTT 0.00242 CAAAA 0.0021 CAAAC 0.00135 CAAAG 0.0017 CAAAT 0.00139 CAACA 0.00134 CAACC 0.000833 CAACG 0.000335 CAACT 0.000936 CAAGA 0.00116 CAAGC 0.001 CAAGG 0.00107 CAAGT 0.000995 CAATA 0.000816 CAATC 0.000587 CAATG 0.000934 CAATT 0.000888 CACAA 0.00139 CACAC 0.00146 CACAG 0.00229 CACAT 0.00122 CACCA 0.00132 CACCC 0.00103 CACCG 0.000567 CACCT 0.00121 CACGA 0.000331 CACGC 0.000512 CACGG 0.000595 CACGT 0.000562 CACTA 0.000634 CACTC 0.00089 CACTG 0.00194 CACTT 0.00127 CAGAA 0.00216 CAGAC 0.00107 CAGAG 0.00202 CAGAT 0.00127 CAGCA 0.00287 CAGCC 0.00199 CAGCG 0.000859 CAGCT 0.00234 CAGGA 0.00164 CAGGC 0.00131 CAGGG 0.00149 CAGGT 0.00113 CAGTA 0.00117 CAGTC 0.00096 CAGTG 0.00194 CAGTT 0.00144 CATAA 0.000883 CATAC 0.000685 CATAG 0.000672 CATAT 0.000771 CATCA 0.00121 CATCC 0.00115 CATCG 0.000268 CATCT 0.00136 CATGA 0.000905 CATGC 0.00102 CATGG 0.00102 CATGT 0.00101 CATTA 0.001 CATTC 0.00106 CATTG 0.000934 CATTT 0.00196 CCAAA 0.00145 CCAAC 0.000921 CCAAG 0.00103 CCAAT 0.000663 CCACA 0.00145 CCACC 0.00114 CCACG 0.000552 CCACT 0.00106 CCAGA 0.00124 CCAGC 0.00171 CCAGG 0.00133 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000663 CCATC 0.00106 CCATG 0.00102 CCATT 0.0011 CCCAA 0.00102 CCCAC 0.00127 CCCAG 0.00161 CCCAT 0.00101 CCCCA 0.00145 CCCCC 0.00151 CCCCG 0.000957 CCCCT 0.00119 CCCGA 0.000337 CCCGC 0.00102 CCCGG 0.00075 CCCGT 0.000409 CCCTA 0.000492 CCCTC 0.00142 CCCTG 0.00149 CCCTT 0.0012 CCGAA 0.000235 CCGAC 0.000228 CCGAG 0.000489 CCGAT 0.000162 CCGCA 0.000519 CCGCC 0.00108 CCGCG 0.000701 CCGCT 0.000644 CCGGA 0.000318 CCGGC 0.000715 CCGGG 0.00075 CCGGT 0.000254 CCGTA 0.000205 CCGTC 0.000347 CCGTG 0.000595 CCGTT 0.000316 CCTAA 0.000652 CCTAC 0.000592 CCTAG 0.000401 CCTAT 0.00056 CCTCA 0.00134 CCTCC 0.00171 CCTCG 0.000482 CCTCT 0.00148 CCTGA 0.00117 CCTGC 0.00178 CCTGG 0.00133 CCTGT 0.0013 CCTTA 0.000766 CCTTC 0.0015 CCTTG 0.00107 CCTTT 0.00164 CGAAA 0.000213 CGAAC 0.000179 CGAAG 0.000296 CGAAT 0.000137 CGACA 0.000194 CGACC 0.000194 CGACG 0.00015 CGACT 0.000153 CGAGA 0.000266 CGAGC 0.000467 CGAGG 0.000482 CGAGT 0.000211 CGATA 0.00012 CGATC 0.000153 CGATG 0.000268 CGATT 0.000165 CGCAA 0.000195 CGCAC 0.000431 CGCAG 0.000715 CGCAT 0.000238 CGCCA 0.000334 CGCCC 0.000771 CGCCG 0.000749 CGCCT 0.000436 CGCGA 0.000168 CGCGC 0.000614 CGCGG 0.000701 CGCGT 0.000227 CGCTA 0.00017 CGCTC 0.000668 CGCTG 0.000859 CGCTT 0.00038 CGGAA 0.000282 CGGAC 0.000215 CGGAG 0.000615 CGGAT 0.000181 CGGCA 0.000472 CGGCC 0.000779 CGGCG 0.000749 CGGCT 0.000526 CGGGA 0.000514 CGGGC 0.000743 CGGGG 0.000957 CGGGT 0.0003 CGGTA 0.000175 CGGTC 0.000227 CGGTG 0.000567 CGGTT 0.000251 CGTAA 0.000224 CGTAC 0.000191 CGTAG 0.000213 CGTAT 0.000211 CGTCA 0.000266 CGTCC 0.000369 CGTCG 0.00015 CGTCT 0.000269 CGTGA 0.000369 CGTGC 0.000603 CGTGG 0.000552 CGTGT 0.000476 CGTTA 0.000263 CGTTC 0.000358 CGTTG 0.000335 CGTTT 0.000451 CTAAA 0.00104 CTAAC 0.000564 CTAAG 0.00066 CTAAT 0.000699 CTACA 0.000946 CTACC 0.000521 CTACG 0.000213 CTACT 0.000735 CTAGA 0.000552 CTAGC 0.000423 CTAGG 0.000401 CTAGT 0.000412 CTATA 0.000545 CTATC 0.000483 CTATG 0.000672 CTATT 0.000858 CTCAA 0.000938 CTCAC 0.00116 CTCAG 0.00176 CTCAT 0.00103 CTCCA 0.00146 CTCCC 0.00165 CTCCG 0.000615 CTCCT 0.00175 CTCGA 0.000198 CTCGC 0.000413 CTCGG 0.000489 CTCGT 0.000327 CTCTA 0.000695 CTCTC 0.0014 CTCTG 0.00202 CTCTT 0.00152 CTGAA 0.00192 CTGAC 0.00102 CTGAG 0.00176 CTGAT 0.00114 CTGCA 0.00255 CTGCC 0.00188 CTGCG 0.000715 CTGCT 0.0027 CTGGA 0.00147 CTGGC 0.00114 CTGGG 0.00161 CTGGT 0.00106 CTGTA 0.00139 CTGTC 0.00121 CTGTG 0.00229 CTGTT 0.0018 CTTAA 0.00111 CTTAC 0.000741 CTTAG 0.00066 CTTAT 0.000778 CTTCA 0.00162 CTTCC 0.00168 CTTCG 0.000296 CTTCT 0.00188 CTTGA 0.000944 CTTGC 0.00107 CTTGG 0.00103 CTTGT 0.00118 CTTTA 0.00128 CTTTC 0.00167 CTTTG 0.0017 CTTTT 0.0023 GAAAA 0.00239 GAAAC 0.0012 GAAAG 0.00167 GAAAT 0.00159 GAACA 0.00128 GAACC 0.000607 GAACG 0.000358 GAACT 0.000959 GAAGA 0.00152 GAAGC 0.00126 GAAGG 0.0015 GAAGT 0.00121 GAATA 0.000841 GAATC 0.000622 GAATG 0.00106 GAATT 0.00103 GACAA 0.000897 GACAC 0.000776 GACAG 0.00121 GACAT 0.000728 GACCA 0.000628 GACCC 0.000537 GACCG 0.000227 GACCT 0.000664 GACGA 0.00017 GACGC 0.000256 GACGG 0.000347 GACGT 0.000281 GACTA 0.000387 GACTC 0.000518 GACTG 0.00096 GACTT 0.00083 GAGAA 0.00157 GAGAC 0.000731 GAGAG 0.0014 GAGAT 0.000974 GAGCA 0.00163 GAGCC 0.00108 GAGCG 0.000668 GAGCT 0.0015 GAGGA 0.00149 GAGGC 0.0011 GAGGG 0.00142 GAGGT 0.00101 GAGTA 0.000576 GAGTC 0.000518 GAGTG 0.00089 GAGTT 0.000859 GATAA 0.000743 GATAC 0.000512 GATAG 0.000483 GATAT 0.00061 GATCA 0.000674 GATCC 0.000534 GATCG 0.000153 GATCT 0.000749 GATGA 0.000942 GATGC 0.000958 GATGG 0.00106 GATGT 0.00102 GATTA 0.000596 GATTC 0.000622 GATTG 0.000587 GATTT 0.00127 GCAAA 0.00157 GCAAC 0.000821 GCAAG 0.00107 GCAAT 0.000922 GCACA 0.00165 GCACC 0.00108 GCACG 0.000603 GCACT 0.0013 GCAGA 0.00185 GCAGC 0.00261 GCAGG 0.00178 GCAGT 0.00162 GCATA 0.000665 GCATC 0.000958 GCATG 0.00102 GCATT 0.00123 GCCAA 0.000875 GCCAC 0.000955 GCCAG 0.00114 GCCAT 0.000904 GCCCA 0.00105 GCCCC 0.00135 GCCCG 0.000743 GCCCT 0.00115 GCCGA 0.000312 GCCGC 0.00104 GCCGG 0.000715 GCCGT 0.000459 GCCTA 0.000426 GCCTC 0.0011 GCCTG 0.00131 GCCTT 0.00114 GCGAA 0.000194 GCGAC 0.000203 GCGAG 0.000413 GCGAT 0.000215 GCGCA 0.000432 GCGCC 0.000656 GCGCG 0.000614 GCGCT 0.000675 GCGGA 0.000433 GCGGC 0.00104 GCGGG 0.00102 GCGGT 0.000449 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000256 GCGTG 0.000512 GCGTT 0.000368 GCTAA 0.000704 GCTAC 0.000607 GCTAG 0.000423 GCTAT 0.000658 GCTCA 0.00126 GCTCC 0.00154 GCTCG 0.000467 GCTCT 0.00161 GCTGA 0.00166 GCTGC 0.00261 GCTGG 0.00171 GCTGT 0.00208 GCTTA 0.000739 GCTTC 0.00126 GCTTG 0.001 GCTTT 0.00188 GGAAA 0.00194 GGAAC 0.000866 GGAAG 0.00168 GGAAT 0.000925 GGACA 0.000986 GGACC 0.000531 GGACG 0.000369 GGACT 0.000686 GGAGA 0.00142 GGAGC 0.00154 GGAGG 0.00171 GGAGT 0.000791 GGATA 0.000549 GGATC 0.000534 GGATG 0.00115 GGATT 0.000789 GGCAA 0.00089 GGCAC 0.0011 GGCAG 0.00188 GGCAT 0.000787 GGCCA 0.000787 GGCCC 0.00087 GGCCG 0.000779 GGCCT 0.000779 GGCGA 0.000265 GGCGC 0.000656 GGCGG 0.00108 GGCGT 0.000289 GGCTA 0.000411 GGCTC 0.00108 GGCTG 0.00199 GGCTT 0.00102 GGGAA 0.00151 GGGAC 0.000827 GGGAG 0.00165 GGGAT 0.000888 GGGCA 0.00129 GGGCC 0.00087 GGGCG 0.000771 GGGCT 0.00135 GGGGA 0.00141 GGGGC 0.00135 GGGGG 0.00151 GGGGT 0.000837 GGGTA 0.00046 GGGTC 0.000537 GGGTG 0.00103 GGGTT 0.000829 GGTAA 0.000643 GGTAC 0.000469 GGTAG 0.000521 GGTAT 0.000528 GGTCA 0.000661 GGTCC 0.000531 GGTCG 0.000194 GGTCT 0.00067 GGTGA 0.000976 GGTGC 0.00108 GGTGG 0.00114 GGTGT 0.000931 GGTTA 0.000549 GGTTC 0.000607 GGTTG 0.000833 GGTTT 0.00123 GTAAA 0.00109 GTAAC 0.00069 GTAAG 0.000741 GTAAT 0.000795 GTACA 0.000849 GTACC 0.000469 GTACG 0.000191 GTACT 0.000701 GTAGA 0.000629 GTAGC 0.000607 GTAGG 0.000592 GTAGT 0.000587 GTATA 0.000558 GTATC 0.000512 GTATG 0.000685 GTATT 0.00101 GTCAA 0.000569 GTCAC 0.000809 GTCAG 0.00102 GTCAT 0.00068 GTCCA 0.000643 GTCCC 0.000827 GTCCG 0.000215 GTCCT 0.000887 GTCGA 8.43e-05 GTCGC 0.000203 GTCGG 0.000228 GTCGT 0.000175 GTCTA 0.000372 GTCTC 0.000731 GTCTG 0.00107 GTCTT 0.000906 GTGAA 0.00116 GTGAC 0.000809 GTGAG 0.00116 GTGAT 0.000912 GTGCA 0.00138 GTGCC 0.0011 GTGCG 0.000431 GTGCT 0.00173 GTGGA 0.000969 GTGGC 0.000955 GTGGG 0.00127 GTGGT 0.00101 GTGTA 0.000782 GTGTC 0.000776 GTGTG 0.00146 GTGTT 0.00132 GTTAA 0.000881 GTTAC 0.00069 GTTAG 0.000564 GTTAT 0.000732 GTTCA 0.00094 GTTCC 0.000866 GTTCG 0.000179 GTTCT 0.00121 GTTGA 0.000667 GTTGC 0.000821 GTTGG 0.000921 GTTGT 0.00104 GTTTA 0.000971 GTTTC 0.0012 GTTTG 0.00135 GTTTT 0.00203 TAAAA 0.00226 TAAAC 0.000971 TAAAG 0.00128 TAAAT 0.00155 TAACA 0.00115 TAACC 0.000549 TAACG 0.000263 TAACT 0.000908 TAAGA 0.000982 TAAGC 0.000739 TAAGG 0.000766 TAAGT 0.000802 TAATA 0.000996 TAATC 0.000596 TAATG 0.001 TAATT 0.00126 TACAA 0.00115 TACAC 0.000782 TACAG 0.00139 TACAT 0.00103 TACCA 0.000758 TACCC 0.00046 TACCG 0.000175 TACCT 0.000768 TACGA 0.000167 TACGC 0.000171 TACGG 0.000205 TACGT 0.000296 TACTA 0.000539 TACTC 0.000576 TACTG 0.00117 TACTT 0.00106 TAGAA 0.0011 TAGAC 0.000372 TAGAG 0.000695 TAGAT 0.000638 TAGCA 0.000994 TAGCC 0.000411 TAGCG 0.00017 TAGCT 0.000817 TAGGA 0.00077 TAGGC 0.000426 TAGGG 0.000492 TAGGT 0.000517 TAGTA 0.000539 TAGTC 0.000387 TAGTG 0.000634 TAGTT 0.000754 TATAA 0.000924 TATAC 0.000558 TATAG 0.000545 TATAT 0.00111 TATCA 0.00079 TATCC 0.000549 TATCG 0.00012 TATCT 0.000888 TATGA 0.00078 TATGC 0.000665 TATGG 0.000663 TATGT 0.000903 TATTA 0.000996 TATTC 0.000841 TATTG 0.000816 TATTT 0.00221 TCAAA 0.00138 TCAAC 0.000667 TCAAG 0.000944 TCAAT 0.000716 TCACA 0.00145 TCACC 0.000976 TCACG 0.000369 TCACT 0.00124 TCAGA 0.00152 TCAGC 0.00166 TCAGG 0.00117 TCAGT 0.00148 TCATA 0.00078 TCATC 0.000942 TCATG 0.000905 TCATT 0.00135 TCCAA 0.00116 TCCAC 0.000969 TCCAG 0.00147 TCCAT 0.00113 TCCCA 0.00143 TCCCC 0.00141 TCCCG 0.000514 TCCCT 0.00152 TCCGA 0.00021 TCCGC 0.000433 TCCGG 0.000318 TCCGT 0.000333 TCCTA 0.00077 TCCTC 0.00149 TCCTG 0.00164 TCCTT 0.00167 TCGAA 0.000134 TCGAC 8.43e-05 TCGAG 0.000198 TCGAT 0.000132 TCGCA 0.000233 TCGCC 0.000265 TCGCG 0.000168 TCGCT 0.000361 TCGGA 0.00021 TCGGC 0.000312 TCGGG 0.000337 TCGGT 0.000254 TCGTA 0.000167 TCGTC 0.00017 TCGTG 0.000331 TCGTT 0.000291 TCTAA 0.000863 TCTAC 0.000629 TCTAG 0.000552 TCTAT 0.000764 TCTCA 0.00133 TCTCC 0.00142 TCTCG 0.000266 TCTCT 0.00166 TCTGA 0.00152 TCTGC 0.00185 TCTGG 0.00124 TCTGT 0.00191 TCTTA 0.000982 TCTTC 0.00152 TCTTG 0.00116 TCTTT 0.00207 TGAAA 0.00203 TGAAC 0.00094 TGAAG 0.00162 TGAAT 0.00122 TGACA 0.00119 TGACC 0.000661 TGACG 0.000266 TGACT 0.00096 TGAGA 0.00133 TGAGC 0.00126 TGAGG 0.00134 TGAGT 0.000953 TGATA 0.00079 TGATC 0.000674 TGATG 0.00121 TGATT 0.00112 TGCAA 0.00157 TGCAC 0.00138 TGCAG 0.00255 TGCAT 0.00148 TGCCA 0.00139 TGCCC 0.00129 TGCCG 0.000472 TGCCT 0.00149 TGCGA 0.000233 TGCGC 0.000432 TGCGG 0.000519 TGCGT 0.000396 TGCTA 0.000994 TGCTC 0.00163 TGCTG 0.00287 TGCTT 0.00203 TGGAA 0.00164 TGGAC 0.000643 TGGAG 0.00146 TGGAT 0.000995 TGGCA 0.00139 TGGCC 0.000787 TGGCG 0.000334 TGGCT 0.00136 TGGGA 0.00143 TGGGC 0.00105 TGGGG 0.00145 TGGGT 0.00097 TGGTA 0.000758 TGGTC 0.000628 TGGTG 0.00132 TGGTT 0.00117 TGTAA 0.00135 TGTAC 0.000849 TGTAG 0.000946 TGTAT 0.00121 TGTCA 0.00119 TGTCC 0.000986 TGTCG 0.000194 TGTCT 0.00125 TGTGA 0.00145 TGTGC 0.00165 TGTGG 0.00145 TGTGT 0.0018 TGTTA 0.00115 TGTTC 0.00128 TGTTG 0.00134 TGTTT 0.00241 TTAAA 0.00213 TTAAC 0.000881 TTAAG 0.00111 TTAAT 0.00138 TTACA 0.00135 TTACC 0.000643 TTACG 0.000224 TTACT 0.00109 TTAGA 0.000863 TTAGC 0.000704 TTAGG 0.000652 TTAGT 0.00074 TTATA 0.000924 TTATC 0.000743 TTATG 0.000883 TTATT 0.00175 TTCAA 0.00133 TTCAC 0.00116 TTCAG 0.00192 TTCAT 0.00141 TTCCA 0.00164 TTCCC 0.00151 TTCCG 0.000282 TTCCT 0.00197 TTCGA 0.000134 TTCGC 0.000194 TTCGG 0.000235 TTCGT 0.000262 TTCTA 0.0011 TTCTC 0.00157 TTCTG 0.00216 TTCTT 0.00219 TTGAA 0.00133 TTGAC 0.000569 TTGAG 0.000938 TTGAT 0.000872 TTGCA 0.00157 TTGCC 0.00089 TTGCG 0.000195 TTGCT 0.00173 TTGGA 0.00116 TTGGC 0.000875 TTGGG 0.00102 TTGGT 0.00101 TTGTA 0.00115 TTGTC 0.000897 TTGTG 0.00139 TTGTT 0.00182 TTTAA 0.00213 TTTAC 0.00109 TTTAG 0.00104 TTTAT 0.00181 TTTCA 0.00203 TTTCC 0.00194 TTTCG 0.000213 TTTCT 0.00266 TTTGA 0.00138 TTTGC 0.00157 TTTGG 0.00145 TTTGT 0.00212 TTTTA 0.00226 TTTTC 0.00239 TTTTG 0.0021 TTTTT 0.00489 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [5] # (a,c,g,t)= (0.253, 0.247, 0.247, 0.253) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.262 C 0.238 G 0.238 T 0.262 # l= 1 # Values AA 0.081 AC 0.0521 AG 0.0729 AT 0.0564 CA 0.0765 CC 0.0626 CG 0.0256 CT 0.0729 GA 0.0574 GC 0.0655 GG 0.0626 GT 0.0521 TA 0.0475 TC 0.0574 TG 0.0765 TT 0.0811 # l= 2 # Values AAA 0.03 AAC 0.0147 AAG 0.0196 AAT 0.0168 ACA 0.0201 ACC 0.0118 ACG 0.00551 ACT 0.0146 AGA 0.0194 AGC 0.0207 AGG 0.0182 AGT 0.0146 ATA 0.0127 ATC 0.0114 ATG 0.0156 ATT 0.0168 CAA 0.0171 CAC 0.0176 CAG 0.0261 CAT 0.0156 CCA 0.0179 CCC 0.0184 CCG 0.0081 CCT 0.0182 CGA 0.00382 CGC 0.00813 CGG 0.00811 CGT 0.00551 CTA 0.00933 CTC 0.0179 CTG 0.0261 CTT 0.0196 GAA 0.0187 GAC 0.00949 GAG 0.0179 GAT 0.0114 GCA 0.0212 GCC 0.0154 GCG 0.00813 GCT 0.0207 GGA 0.0169 GGC 0.0154 GGG 0.0184 GGT 0.0118 GTA 0.0103 GTC 0.00949 GTG 0.0176 GTT 0.0147 TAA 0.0153 TAC 0.0103 TAG 0.00933 TAT 0.0127 TCA 0.0172 TCC 0.0169 TCG 0.00382 TCT 0.0194 TGA 0.0172 TGC 0.0212 TGG 0.0179 TGT 0.0201 TTA 0.0153 TTC 0.0187 TTG 0.0171 TTT 0.03 # l= 3 # Values AAAA 0.0112 AAAC 0.00539 AAAG 0.00681 AAAT 0.00659 AACA 0.00597 AACC 0.00324 AACG 0.00144 AACT 0.00407 AAGA 0.00555 AAGC 0.00486 AAGG 0.005 AAGT 0.00418 AATA 0.00459 AATC 0.00297 AATG 0.0048 AATT 0.00441 ACAA 0.00509 ACAC 0.00433 ACAG 0.00667 ACAT 0.00405 ACCA 0.00388 ACCC 0.00303 ACCG 0.00129 ACCT 0.00361 ACGA 0.000984 ACGC 0.00138 ACGG 0.00156 ACGT 0.00159 ACTA 0.00217 ACTC 0.00282 ACTG 0.00542 ACTT 0.00418 AGAA 0.00681 AGAC 0.00304 AGAG 0.0057 AGAT 0.00388 AGCA 0.00764 AGCC 0.00472 AGCG 0.0022 AGCT 0.00616 AGGA 0.00564 AGGC 0.00407 AGGG 0.00486 AGGT 0.00361 AGTA 0.00316 AGTC 0.00265 AGTG 0.00472 AGTT 0.00407 ATAA 0.00408 ATAC 0.00263 ATAG 0.00245 ATAT 0.0035 ATCA 0.00367 ATCC 0.00308 ATCG 0.000728 ATCT 0.00388 ATGA 0.00384 ATGC 0.00384 ATGG 0.0039 ATGT 0.00405 ATTA 0.00364 ATTC 0.00341 ATTG 0.00312 ATTT 0.00659 CAAA 0.00638 CAAC 0.00342 CAAG 0.00418 CAAT 0.00312 CACA 0.0064 CACC 0.00434 CACG 0.00212 CACT 0.00472 CAGA 0.00651 CAGC 0.00842 CAGG 0.00578 CAGT 0.00542 CATA 0.00287 CATC 0.00403 CATG 0.00394 CATT 0.0048 CCAA 0.00411 CCAC 0.00437 CCAG 0.00548 CCAT 0.0039 CCCA 0.00523 CCCC 0.00562 CCCG 0.00273 CCCT 0.00486 CCGA 0.00119 CCGC 0.00314 CCGG 0.00221 CCGT 0.00156 CCTA 0.00217 CCTC 0.00523 CCTG 0.00578 CCTT 0.005 CGAA 0.000851 CGAC 0.000729 CGAG 0.00151 CGAT 0.000728 CGCA 0.00168 CGCC 0.00243 CGCG 0.00182 CGCT 0.0022 CGGA 0.00138 CGGC 0.0027 CGGG 0.00273 CGGT 0.00129 CGTA 0.000837 CGTC 0.00112 CGTG 0.00212 CGTT 0.00144 CTAA 0.00283 CTAC 0.00234 CTAG 0.00171 CTAT 0.00246 CTCA 0.00492 CTCC 0.00575 CTCG 0.00151 CTCT 0.00571 CTGA 0.0058 CTGC 0.00818 CTGG 0.00548 CTGT 0.00667 CTTA 0.00314 CTTC 0.00545 CTTG 0.00418 CTTT 0.00681 GAAA 0.00666 GAAC 0.00317 GAAG 0.00545 GAAT 0.00341 GACA 0.00361 GACC 0.00212 GACG 0.00112 GACT 0.00265 GAGA 0.0047 GAGC 0.00513 GAGG 0.00523 GAGT 0.00282 GATA 0.00225 GATC 0.00211 GATG 0.00403 GATT 0.00297 GCAA 0.00436 GCAC 0.00484 GCAG 0.00818 GCAT 0.00384 GCCA 0.004 GCCC 0.00462 GCCG 0.0027 GCCT 0.00407 GCGA 0.00108 GCGC 0.00253 GCGG 0.00314 GCGT 0.00138 GCTA 0.00232 GCTC 0.00513 GCTG 0.00842 GCTT 0.00486 GGAA 0.00543 GGAC 0.00268 GGAG 0.00575 GGAT 0.00308 GGCA 0.00484 GGCC 0.0034 GGCG 0.00243 GGCT 0.00472 GGGA 0.00516 GGGC 0.00462 GGGG 0.00563 GGGT 0.00303 GGTA 0.00211 GGTC 0.00213 GGTG 0.00434 GGTT 0.00324 GTAA 0.00316 GTAC 0.00215 GTAG 0.00234 GTAT 0.00263 GTCA 0.00304 GTCC 0.00268 GTCG 0.000729 GTCT 0.00304 GTGA 0.00404 GTGC 0.00484 GTGG 0.00437 GTGT 0.00433 GTTA 0.00274 GTTC 0.00317 GTTG 0.00342 GTTT 0.00539 TAAA 0.00574 TAAC 0.00274 TAAG 0.00314 TAAT 0.00364 TACA 0.00416 TACC 0.00211 TACG 0.000837 TACT 0.00316 TAGA 0.00267 TAGC 0.00232 TAGG 0.00217 TAGT 0.00217 TATA 0.00295 TATC 0.00225 TATG 0.00287 TATT 0.00459 TCAA 0.00355 TCAC 0.00404 TCAG 0.0058 TCAT 0.00384 TCCA 0.00475 TCCC 0.00516 TCCG 0.00138 TCCT 0.00564 TCGA 0.000561 TCGC 0.00108 TCGG 0.00119 TCGT 0.000984 TCTA 0.00267 TCTC 0.00471 TCTG 0.00651 TCTT 0.00555 TGAA 0.00559 TGAC 0.00304 TGAG 0.00492 TGAT 0.00367 TGCA 0.00706 TGCC 0.00484 TGCG 0.00168 TGCT 0.00764 TGGA 0.00475 TGGC 0.004 TGGG 0.00523 TGGT 0.00388 TGTA 0.00416 TGTC 0.00361 TGTG 0.0064 TGTT 0.00597 TTAA 0.00521 TTAC 0.00316 TTAG 0.00283 TTAT 0.00408 TTCA 0.00559 TTCC 0.00543 TTCG 0.000851 TTCT 0.00681 TTGA 0.00355 TTGC 0.00436 TTGG 0.00411 TTGT 0.00509 TTTA 0.00574 TTTC 0.00666 TTTG 0.00639 TTTT 0.0112 # l= 4 # Values AAAAA 0.00473 AAAAC 0.00196 AAAAG 0.00223 AAAAT 0.00228 AAACA 0.00232 AAACC 0.00123 AAACG 0.000457 AAACT 0.00139 AAAGA 0.00201 AAAGC 0.00187 AAAGG 0.00164 AAAGT 0.0013 AAATA 0.00209 AAATC 0.00122 AAATG 0.00188 AAATT 0.0014 AACAA 0.00175 AACAC 0.00129 AACAG 0.00175 AACAT 0.00118 AACCA 0.00116 AACCC 0.000866 AACCG 0.000262 AACCT 0.000952 AACGA 0.000297 AACGC 0.000384 AACGG 0.00033 AACGT 0.000428 AACTA 0.000702 AACTC 0.000842 AACTG 0.00139 AACTT 0.00114 AAGAA 0.0021 AAGAC 0.000876 AAGAG 0.00151 AAGAT 0.00106 AAGCA 0.00201 AAGCC 0.00104 AAGCG 0.000396 AAGCT 0.00141 AAGGA 0.00166 AAGGC 0.00115 AAGGG 0.00125 AAGGT 0.00094 AAGTA 0.000995 AAGTC 0.000806 AAGTG 0.00124 AAGTT 0.00114 AATAA 0.00166 AATAC 0.000957 AATAG 0.000816 AATAT 0.00115 AATCA 0.00107 AATCC 0.000783 AATCG 0.000167 AATCT 0.000952 AATGA 0.00129 AATGC 0.0012 AATGG 0.00109 AATGT 0.00121 AATTA 0.00119 AATTC 0.000977 AATTG 0.000841 AATTT 0.0014 ACAAA 0.00205 ACAAC 0.00101 ACAAG 0.00114 ACAAT 0.000878 ACACA 0.00178 ACACC 0.000956 ACACG 0.000494 ACACT 0.0011 ACAGA 0.00188 ACAGC 0.00213 ACAGG 0.00131 ACAGT 0.00135 ACATA 0.000848 ACATC 0.00101 ACATG 0.000977 ACATT 0.00121 ACCAA 0.000999 ACCAC 0.00102 ACCAG 0.00107 ACCAT 0.000788 ACCCA 0.00101 ACCCC 0.00092 ACCCG 0.000326 ACCCT 0.000774 ACCGA 0.000267 ACCGC 0.00048 ACCGG 0.000274 ACCGT 0.000272 ACCTA 0.000496 ACCTC 0.00103 ACCTG 0.00114 ACCTT 0.00094 ACGAA 0.000266 ACGAC 0.000181 ACGAG 0.00034 ACGAT 0.000197 ACGCA 0.000414 ACGCC 0.000307 ACGCG 0.000243 ACGCT 0.000413 ACGGA 0.000352 ACGGC 0.000493 ACGGG 0.000444 ACGGT 0.000272 ACGTA 0.00029 ACGTC 0.000292 ACGTG 0.000582 ACGTT 0.000428 ACTAA 0.000695 ACTAC 0.000556 ACTAG 0.000386 ACTAT 0.000538 ACTCA 0.000938 ACTCC 0.0008 ACTCG 0.000219 ACTCT 0.000864 ACTGA 0.00143 ACTGC 0.00163 ACTGG 0.00101 ACTGT 0.00135 ACTTA 0.000753 ACTTC 0.00117 ACTTG 0.000958 ACTTT 0.0013 AGAAA 0.00257 AGAAC 0.00119 AGAAG 0.00185 AGAAT 0.00121 AGACA 0.00122 AGACC 0.00068 AGACG 0.000278 AGACT 0.000863 AGAGA 0.00165 AGAGC 0.00167 AGAGG 0.00152 AGAGT 0.000864 AGATA 0.000843 AGATC 0.000738 AGATG 0.00135 AGATT 0.000952 AGCAA 0.00171 AGCAC 0.0018 AGCAG 0.00279 AGCAT 0.00134 AGCCA 0.0014 AGCCC 0.00147 AGCCG 0.000564 AGCCT 0.00129 AGCGA 0.000378 AGCGC 0.000723 AGCGG 0.000691 AGCGT 0.000413 AGCTA 0.000784 AGCTC 0.00156 AGCTG 0.00241 AGCTT 0.00141 AGGAA 0.00196 AGGAC 0.000907 AGGAG 0.00181 AGGAT 0.000953 AGGCA 0.00152 AGGCC 0.000805 AGGCG 0.000456 AGGCT 0.00129 AGGGA 0.00158 AGGGC 0.00122 AGGGG 0.00128 AGGGT 0.000774 AGGTA 0.000742 AGGTC 0.000672 AGGTG 0.00124 AGGTT 0.000952 AGTAA 0.00102 AGTAC 0.000667 AGTAG 0.000698 AGTAT 0.000768 AGTCA 0.000931 AGTCC 0.000693 AGTCG 0.000158 AGTCT 0.000863 AGTGA 0.00122 AGTGC 0.00133 AGTGG 0.00107 AGTGT 0.0011 AGTTA 0.000854 AGTTC 0.000929 AGTTG 0.000905 AGTTT 0.00139 ATAAA 0.00172 ATAAC 0.000696 ATAAG 0.000741 ATAAT 0.000924 ATACA 0.00114 ATACC 0.000509 ATACG 0.000207 ATACT 0.000768 ATAGA 0.000729 ATAGC 0.000638 ATAGG 0.000551 ATAGT 0.000538 ATATA 0.00105 ATATC 0.000579 ATATG 0.000724 ATATT 0.00115 ATCAA 0.000828 ATCAC 0.000902 ATCAG 0.00112 ATCAT 0.000818 ATCCA 0.000988 ATCCC 0.000942 ATCCG 0.000193 ATCCT 0.000953 ATCGA 0.000133 ATCGC 0.000227 ATCGG 0.000171 ATCGT 0.000197 ATCTA 0.000601 ATCTC 0.000971 ATCTG 0.00125 ATCTT 0.00106 ATGAA 0.00134 ATGAC 0.000658 ATGAG 0.00102 ATGAT 0.000818 ATGCA 0.00146 ATGCC 0.000795 ATGCG 0.000248 ATGCT 0.00134 ATGGA 0.00113 ATGGC 0.000923 ATGGG 0.00107 ATGGT 0.000788 ATGTA 0.000969 ATGTC 0.000711 ATGTG 0.0012 ATGTT 0.00118 ATTAA 0.0013 ATTAC 0.00075 ATTAG 0.000663 ATTAT 0.000924 ATTCA 0.00116 ATTCC 0.000911 ATTCG 0.000139 ATTCT 0.00121 ATTGA 0.000681 ATTGC 0.000906 ATTGG 0.000658 ATTGT 0.000878 ATTTA 0.00146 ATTTC 0.00152 ATTTG 0.00133 ATTTT 0.00228 CAAAA 0.00203 CAAAC 0.00133 CAAAG 0.0017 CAAAT 0.00133 CAACA 0.00132 CAACC 0.000849 CAACG 0.000349 CAACT 0.000905 CAAGA 0.00113 CAAGC 0.00101 CAAGG 0.00108 CAAGT 0.000958 CAATA 0.000778 CAATC 0.000577 CAATG 0.000927 CAATT 0.000841 CACAA 0.00137 CACAC 0.00149 CACAG 0.00235 CACAT 0.0012 CACCA 0.00136 CACCC 0.00112 CACCG 0.000615 CACCT 0.00124 CACGA 0.000344 CACGC 0.000548 CACGG 0.000648 CACGT 0.000582 CACTA 0.000608 CACTC 0.000905 CACTG 0.00197 CACTT 0.00124 CAGAA 0.00211 CAGAC 0.00108 CAGAG 0.00208 CAGAT 0.00125 CAGCA 0.00298 CAGCC 0.00212 CAGCG 0.000921 CAGCT 0.00241 CAGGA 0.00168 CAGGC 0.00136 CAGGG 0.0016 CAGGT 0.00114 CAGTA 0.00111 CAGTC 0.00095 CAGTG 0.00197 CAGTT 0.00139 CATAA 0.000834 CATAC 0.000656 CATAG 0.000656 CATAT 0.000724 CATCA 0.0012 CATCC 0.0012 CATCG 0.000284 CATCT 0.00135 CATGA 0.000881 CATGC 0.00102 CATGG 0.00106 CATGT 0.000977 CATTA 0.000956 CATTC 0.00103 CATTG 0.000927 CATTT 0.00188 CCAAA 0.00146 CCAAC 0.000944 CCAAG 0.00105 CCAAT 0.000658 CCACA 0.00148 CCACC 0.00122 CCACG 0.0006 CCACT 0.00107 CCAGA 0.00126 CCAGC 0.00181 CCAGG 0.0014 CCAGT 0.00101 CCATA 0.000654 CCATC 0.0011 CCATG 0.00106 CCATT 0.00109 CCCAA 0.00107 CCCAC 0.00137 CCCAG 0.00172 CCCAT 0.00107 CCCCA 0.0016 CCCCC 0.00169 CCCCG 0.00106 CCCCT 0.00128 CCCGA 0.000367 CCCGC 0.00109 CCCGG 0.000825 CCCGT 0.000444 CCCTA 0.000501 CCCTC 0.00151 CCCTG 0.0016 CCCTT 0.00125 CCGAA 0.000247 CCGAC 0.000247 CCGAG 0.000526 CCGAT 0.000171 CCGCA 0.000563 CCGCC 0.00114 CCGCG 0.000749 CCGCT 0.000691 CCGGA 0.000343 CCGGC 0.00077 CCGGG 0.000825 CCGGT 0.000274 CCGTA 0.00021 CCGTC 0.000373 CCGTG 0.000648 CCGTT 0.00033 CCTAA 0.000635 CCTAC 0.000589 CCTAG 0.000392 CCTAT 0.000551 CCTCA 0.00137 CCTCC 0.00183 CCTCG 0.000514 CCTCT 0.00152 CCTGA 0.00118 CCTGC 0.00188 CCTGG 0.0014 CCTGT 0.00131 CCTTA 0.000749 CCTTC 0.00153 CCTTG 0.00108 CCTTT 0.00164 CGAAA 0.000218 CGAAC 0.000185 CGAAG 0.000308 CGAAT 0.000139 CGACA 0.000202 CGACC 0.000208 CGACG 0.000162 CGACT 0.000158 CGAGA 0.000277 CGAGC 0.000499 CGAGG 0.000514 CGAGT 0.000219 CGATA 0.00012 CGATC 0.000158 CGATG 0.000284 CGATT 0.000167 CGCAA 0.000201 CGCAC 0.000462 CGCAG 0.00077 CGCAT 0.000248 CGCCA 0.000353 CGCCC 0.000825 CGCCG 0.000794 CGCCT 0.000456 CGCGA 0.000176 CGCGC 0.000648 CGCGG 0.000749 CGCGT 0.000243 CGCTA 0.000172 CGCTC 0.000716 CGCTG 0.000921 CGCTT 0.000396 CGGAA 0.000293 CGGAC 0.000229 CGGAG 0.000667 CGGAT 0.000193 CGGCA 0.000505 CGGCC 0.000837 CGGCG 0.000794 CGGCT 0.000564 CGGGA 0.000552 CGGGC 0.000795 CGGGG 0.00106 CGGGT 0.000326 CGGTA 0.000178 CGGTC 0.000239 CGGTG 0.000615 CGGTT 0.000262 CGTAA 0.000221 CGTAC 0.000193 CGTAG 0.000215 CGTAT 0.000207 CGTCA 0.000275 CGTCC 0.000401 CGTCG 0.000162 CGTCT 0.000278 CGTGA 0.000381 CGTGC 0.000646 CGTGG 0.0006 CGTGT 0.000494 CGTTA 0.000263 CGTTC 0.00037 CGTTG 0.000349 CGTTT 0.000457 CTAAA 0.000985 CTAAC 0.000541 CTAAG 0.000635 CTAAT 0.000663 CTACA 0.000913 CTACC 0.000512 CTACG 0.000215 CTACT 0.000698 CTAGA 0.000526 CTAGC 0.000411 CTAGG 0.000392 CTAGT 0.000386 CTATA 0.000516 CTATC 0.000467 CTATG 0.000656 CTATT 0.000816 CTCAA 0.000915 CTCAC 0.00119 CTCAG 0.0018 CTCAT 0.00102 CTCCA 0.00151 CTCCC 0.00176 CTCCG 0.000667 CTCCT 0.00181 CTCGA 0.000206 CTCGC 0.000436 CTCGG 0.000526 CTCGT 0.00034 CTCTA 0.000675 CTCTC 0.00144 CTCTG 0.00208 CTCTT 0.00151 CTGAA 0.00186 CTGAC 0.00102 CTGAG 0.0018 CTGAT 0.00112 CTGCA 0.00264 CTGCC 0.00198 CTGCG 0.00077 CTGCT 0.00279 CTGGA 0.00149 CTGGC 0.00119 CTGGG 0.00172 CTGGT 0.00107 CTGTA 0.00134 CTGTC 0.00123 CTGTG 0.00235 CTGTT 0.00175 CTTAA 0.00105 CTTAC 0.000713 CTTAG 0.000635 CTTAT 0.000741 CTTCA 0.00158 CTTCC 0.00171 CTTCG 0.000308 CTTCT 0.00185 CTTGA 0.000911 CTTGC 0.00107 CTTGG 0.00105 CTTGT 0.00114 CTTTA 0.00123 CTTTC 0.00165 CTTTG 0.0017 CTTTT 0.00223 GAAAA 0.00231 GAAAC 0.00117 GAAAG 0.00165 GAAAT 0.00152 GAACA 0.00125 GAACC 0.000621 GAACG 0.00037 GAACT 0.000929 GAAGA 0.00148 GAAGC 0.00127 GAAGG 0.00153 GAAGT 0.00117 GAATA 0.000795 GAATC 0.000608 GAATG 0.00103 GAATT 0.000977 GACAA 0.000877 GACAC 0.000793 GACAG 0.00123 GACAT 0.000711 GACCA 0.000633 GACCC 0.000581 GACCG 0.000239 GACCT 0.000672 GACGA 0.000178 GACGC 0.000273 GACGG 0.000373 GACGT 0.000292 GACTA 0.000366 GACTC 0.000522 GACTG 0.00095 GACTT 0.000806 GAGAA 0.00155 GAGAC 0.000739 GAGAG 0.00144 GAGAT 0.000971 GAGCA 0.0017 GAGCC 0.00116 GAGCG 0.000716 GAGCT 0.00156 GAGGA 0.00154 GAGGC 0.00114 GAGGG 0.00151 GAGGT 0.00103 GAGTA 0.000551 GAGTC 0.000522 GAGTG 0.000905 GAGTT 0.000842 GATAA 0.000711 GATAC 0.000491 GATAG 0.000467 GATAT 0.000579 GATCA 0.000659 GATCC 0.00055 GATCG 0.000158 GATCT 0.000738 GATGA 0.000929 GATGC 0.000985 GATGG 0.0011 GATGT 0.00101 GATTA 0.000564 GATTC 0.000608 GATTG 0.000577 GATTT 0.00122 GCAAA 0.00156 GCAAC 0.000819 GCAAG 0.00107 GCAAT 0.000906 GCACA 0.00171 GCACC 0.00116 GCACG 0.000646 GCACT 0.00133 GCAGA 0.00189 GCAGC 0.00278 GCAGG 0.00188 GCAGT 0.00163 GCATA 0.000634 GCATC 0.000985 GCATG 0.00102 GCATT 0.0012 GCCAA 0.00089 GCCAC 0.000999 GCCAG 0.00119 GCCAT 0.000923 GCCCA 0.00111 GCCCC 0.00149 GCCCG 0.000795 GCCCT 0.00122 GCCGA 0.000333 GCCGC 0.0011 GCCGG 0.00077 GCCGT 0.000493 GCCTA 0.000417 GCCTC 0.00114 GCCTG 0.00136 GCCTT 0.00115 GCGAA 0.000203 GCGAC 0.000214 GCGAG 0.000436 GCGAT 0.000227 GCGCA 0.000459 GCGCC 0.000697 GCGCG 0.000648 GCGCT 0.000723 GCGGA 0.000465 GCGGC 0.0011 GCGGG 0.00109 GCGGT 0.00048 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000273 GCGTG 0.000548 GCGTT 0.000384 GCTAA 0.00068 GCTAC 0.000592 GCTAG 0.000411 GCTAT 0.000638 GCTCA 0.00131 GCTCC 0.00165 GCTCG 0.000499 GCTCT 0.00167 GCTGA 0.0017 GCTGC 0.00278 GCTGG 0.00181 GCTGT 0.00213 GCTTA 0.000711 GCTTC 0.00127 GCTTG 0.00101 GCTTT 0.00187 GGAAA 0.00193 GGAAC 0.000882 GGAAG 0.00171 GGAAT 0.000911 GGACA 0.00102 GGACC 0.000566 GGACG 0.000401 GGACT 0.000693 GGAGA 0.00147 GGAGC 0.00165 GGAGG 0.00183 GGAGT 0.0008 GGATA 0.00054 GGATC 0.00055 GGATG 0.0012 GGATT 0.000783 GGCAA 0.000895 GGCAC 0.00117 GGCAG 0.00198 GGCAT 0.000795 GGCCA 0.000826 GGCCC 0.000937 GGCCG 0.000837 GGCCT 0.000805 GGCGA 0.000282 GGCGC 0.000697 GGCGG 0.00114 GGCGT 0.000307 GGCTA 0.000404 GGCTC 0.00116 GGCTG 0.00212 GGCTT 0.00104 GGGAA 0.00156 GGGAC 0.000895 GGGAG 0.00176 GGGAT 0.000942 GGGCA 0.00139 GGGCC 0.000937 GGGCG 0.000825 GGGCT 0.00147 GGGGA 0.00153 GGGGC 0.00149 GGGGG 0.00169 GGGGT 0.00092 GGGTA 0.000465 GGGTC 0.000581 GGGTG 0.00112 GGGTT 0.000866 GGTAA 0.000624 GGTAC 0.000469 GGTAG 0.000512 GGTAT 0.000509 GGTCA 0.000671 GGTCC 0.000566 GGTCG 0.000208 GGTCT 0.00068 GGTGA 0.00101 GGTGC 0.00116 GGTGG 0.00122 GGTGT 0.000956 GGTTA 0.000537 GGTTC 0.000621 GGTTG 0.000849 GGTTT 0.00123 GTAAA 0.00103 GTAAC 0.000663 GTAAG 0.000713 GTAAT 0.00075 GTACA 0.000819 GTACC 0.000469 GTACG 0.000193 GTACT 0.000667 GTAGA 0.000602 GTAGC 0.000592 GTAGG 0.000589 GTAGT 0.000556 GTATA 0.000521 GTATC 0.000491 GTATG 0.000656 GTATT 0.000957 GTCAA 0.000548 GTCAC 0.000818 GTCAG 0.00102 GTCAT 0.000658 GTCCA 0.000647 GTCCC 0.000895 GTCCG 0.000229 GTCCT 0.000907 GTCGA 8.69e-05 GTCGC 0.000214 GTCGG 0.000247 GTCGT 0.000181 GTCTA 0.000352 GTCTC 0.000739 GTCTG 0.00108 GTCTT 0.000876 GTGAA 0.00113 GTGAC 0.000818 GTGAG 0.00119 GTGAT 0.000902 GTGCA 0.00141 GTGCC 0.00117 GTGCG 0.000462 GTGCT 0.0018 GTGGA 0.000979 GTGGC 0.000999 GTGGG 0.00137 GTGGT 0.00102 GTGTA 0.000753 GTGTC 0.000793 GTGTG 0.00149 GTGTT 0.00129 GTTAA 0.00084 GTTAC 0.000663 GTTAG 0.000541 GTTAT 0.000696 GTTCA 0.000913 GTTCC 0.000882 GTTCG 0.000185 GTTCT 0.00119 GTTGA 0.000644 GTTGC 0.000819 GTTGG 0.000944 GTTGT 0.00101 GTTTA 0.000924 GTTTC 0.00117 GTTTG 0.00133 GTTTT 0.00196 TAAAA 0.00213 TAAAC 0.000924 TAAAG 0.00123 TAAAT 0.00146 TAACA 0.00109 TAACC 0.000537 TAACG 0.000263 TAACT 0.000854 TAAGA 0.000929 TAAGC 0.000711 TAAGG 0.000749 TAAGT 0.000753 TAATA 0.000932 TAATC 0.000564 TAATG 0.000956 TAATT 0.00119 TACAA 0.0011 TACAC 0.000753 TACAG 0.00134 TACAT 0.000969 TACCA 0.00073 TACCC 0.000465 TACCG 0.000178 TACCT 0.000742 TACGA 0.000166 TACGC 0.000171 TACGG 0.00021 TACGT 0.00029 TACTA 0.000499 TACTC 0.000551 TACTG 0.00111 TACTT 0.000995 TAGAA 0.00104 TAGAC 0.000352 TAGAG 0.000675 TAGAT 0.000601 TAGCA 0.000961 TAGCC 0.000404 TAGCG 0.000172 TAGCT 0.000784 TAGGA 0.000752 TAGGC 0.000417 TAGGG 0.000501 TAGGT 0.000496 TAGTA 0.000499 TAGTC 0.000366 TAGTG 0.000608 TAGTT 0.000702 TATAA 0.000865 TATAC 0.000521 TATAG 0.000516 TATAT 0.00105 TATCA 0.000746 TATCC 0.00054 TATCG 0.00012 TATCT 0.000843 TATGA 0.000735 TATGC 0.000634 TATGG 0.000654 TATGT 0.000848 TATTA 0.000932 TATTC 0.000795 TATTG 0.000778 TATTT 0.00209 TCAAA 0.00132 TCAAC 0.000644 TCAAG 0.000911 TCAAT 0.000681 TCACA 0.00143 TCACC 0.00101 TCACG 0.000381 TCACT 0.00122 TCAGA 0.00149 TCAGC 0.0017 TCAGG 0.00118 TCAGT 0.00143 TCATA 0.000735 TCATC 0.000929 TCATG 0.000881 TCATT 0.00129 TCCAA 0.00115 TCCAC 0.000979 TCCAG 0.00149 TCCAT 0.00113 TCCCA 0.0015 TCCCC 0.00153 TCCCG 0.000552 TCCCT 0.00158 TCCGA 0.000223 TCCGC 0.000465 TCCGG 0.000343 TCCGT 0.000352 TCCTA 0.000752 TCCTC 0.00154 TCCTG 0.00168 TCCTT 0.00166 TCGAA 0.000135 TCGAC 8.69e-05 TCGAG 0.000206 TCGAT 0.000133 TCGCA 0.000244 TCGCC 0.000282 TCGCG 0.000176 TCGCT 0.000378 TCGGA 0.000223 TCGGC 0.000333 TCGGG 0.000367 TCGGT 0.000267 TCGTA 0.000166 TCGTC 0.000178 TCGTG 0.000344 TCGTT 0.000297 TCTAA 0.000815 TCTAC 0.000602 TCTAG 0.000526 TCTAT 0.000729 TCTCA 0.00131 TCTCC 0.00147 TCTCG 0.000277 TCTCT 0.00165 TCTGA 0.00149 TCTGC 0.00189 TCTGG 0.00126 TCTGT 0.00188 TCTTA 0.000929 TCTTC 0.00148 TCTTG 0.00113 TCTTT 0.00201 TGAAA 0.00193 TGAAC 0.000913 TGAAG 0.00158 TGAAT 0.00116 TGACA 0.00116 TGACC 0.000671 TGACG 0.000275 TGACT 0.000931 TGAGA 0.00131 TGAGC 0.00131 TGAGG 0.00137 TGAGT 0.000938 TGATA 0.000746 TGATC 0.000659 TGATG 0.0012 TGATT 0.00107 TGCAA 0.00155 TGCAC 0.00141 TGCAG 0.00264 TGCAT 0.00146 TGCCA 0.00143 TGCCC 0.00139 TGCCG 0.000505 TGCCT 0.00152 TGCGA 0.000244 TGCGC 0.000459 TGCGG 0.000563 TGCGT 0.000414 TGCTA 0.000961 TGCTC 0.0017 TGCTG 0.00298 TGCTT 0.00201 TGGAA 0.00161 TGGAC 0.000647 TGGAG 0.00151 TGGAT 0.000988 TGGCA 0.00143 TGGCC 0.000826 TGGCG 0.000353 TGGCT 0.0014 TGGGA 0.0015 TGGGC 0.00111 TGGGG 0.0016 TGGGT 0.00101 TGGTA 0.00073 TGGTC 0.000633 TGGTG 0.00136 TGGTT 0.00116 TGTAA 0.00129 TGTAC 0.000819 TGTAG 0.000913 TGTAT 0.00114 TGTCA 0.00116 TGTCC 0.00102 TGTCG 0.000202 TGTCT 0.00122 TGTGA 0.00143 TGTGC 0.00171 TGTGG 0.00148 TGTGT 0.00178 TGTTA 0.00109 TGTTC 0.00125 TGTTG 0.00132 TGTTT 0.00232 TTAAA 0.00201 TTAAC 0.00084 TTAAG 0.00105 TTAAT 0.0013 TTACA 0.00129 TTACC 0.000624 TTACG 0.000221 TTACT 0.00102 TTAGA 0.000815 TTAGC 0.00068 TTAGG 0.000635 TTAGT 0.000695 TTATA 0.000865 TTATC 0.000711 TTATG 0.000834 TTATT 0.00166 TTCAA 0.00126 TTCAC 0.00113 TTCAG 0.00186 TTCAT 0.00134 TTCCA 0.00161 TTCCC 0.00156 TTCCG 0.000293 TTCCT 0.00196 TTCGA 0.000135 TTCGC 0.000203 TTCGG 0.000247 TTCGT 0.000266 TTCTA 0.00104 TTCTC 0.00155 TTCTG 0.00211 TTCTT 0.0021 TTGAA 0.00126 TTGAC 0.000548 TTGAG 0.000915 TTGAT 0.000828 TTGCA 0.00155 TTGCC 0.000895 TTGCG 0.000201 TTGCT 0.00171 TTGGA 0.00115 TTGGC 0.00089 TTGGG 0.00107 TTGGT 0.000999 TTGTA 0.0011 TTGTC 0.000877 TTGTG 0.00137 TTGTT 0.00175 TTTAA 0.00201 TTTAC 0.00103 TTTAG 0.000985 TTTAT 0.00172 TTTCA 0.00193 TTTCC 0.00193 TTTCG 0.000218 TTTCT 0.00257 TTTGA 0.00132 TTTGC 0.00156 TTTGG 0.00146 TTTGT 0.00205 TTTTA 0.00213 TTTTC 0.00231 TTTTG 0.00203 TTTTT 0.00473 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [6] # (a,c,g,t)= (0.242, 0.258, 0.258, 0.242) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.257 C 0.242 G 0.242 T 0.258 # l= 1 # Values AA 0.0783 AC 0.0517 AG 0.0731 AT 0.0544 CA 0.0767 CC 0.0656 CG 0.0271 CT 0.0731 GA 0.0574 GC 0.0678 GG 0.0656 GT 0.0517 TA 0.0451 TC 0.0574 TG 0.0767 TT 0.0783 # l= 2 # Values AAA 0.0288 AAC 0.0143 AAG 0.0192 AAT 0.0159 ACA 0.0198 ACC 0.0121 ACG 0.00573 ACT 0.0141 AGA 0.0191 AGC 0.0213 AGG 0.0186 AGT 0.0141 ATA 0.012 ATC 0.0112 ATG 0.0154 ATT 0.0159 CAA 0.0167 CAC 0.018 CAG 0.0266 CAT 0.0154 CCA 0.0184 CCC 0.0199 CCG 0.00872 CCT 0.0186 CGA 0.00399 CGC 0.00863 CGG 0.00872 CGT 0.00573 CTA 0.00892 CTC 0.0184 CTG 0.0266 CTT 0.0192 GAA 0.0182 GAC 0.00956 GAG 0.0184 GAT 0.0112 GCA 0.0217 GCC 0.0162 GCG 0.00864 GCT 0.0213 GGA 0.0174 GGC 0.0162 GGG 0.0199 GGT 0.0121 GTA 0.00981 GTC 0.00957 GTG 0.018 GTT 0.0143 TAA 0.0144 TAC 0.00981 TAG 0.00892 TAT 0.012 TCA 0.0169 TCC 0.0174 TCG 0.00399 TCT 0.0191 TGA 0.0169 TGC 0.0217 TGG 0.0184 TGT 0.0198 TTA 0.0144 TTC 0.0183 TTG 0.0167 TTT 0.0288 # l= 3 # Values AAAA 0.0107 AAAC 0.00523 AAAG 0.00665 AAAT 0.00622 AACA 0.00575 AACC 0.00325 AACG 0.00147 AACT 0.00387 AAGA 0.00535 AAGC 0.00482 AAGG 0.00502 AAGT 0.00397 AATA 0.00432 AATC 0.00286 AATG 0.00463 AATT 0.00413 ACAA 0.0049 ACAC 0.00433 ACAG 0.00665 ACAT 0.00389 ACCA 0.00388 ACCC 0.00322 ACCG 0.00138 ACCT 0.00359 ACGA 0.00101 ACGC 0.00145 ACGG 0.00167 ACGT 0.00161 ACTA 0.00203 ACTC 0.00279 ACTG 0.00532 ACTT 0.00397 AGAA 0.00658 AGAC 0.003 AGAG 0.00577 AGAT 0.00375 AGCA 0.00775 AGCC 0.00495 AGCG 0.00234 AGCT 0.00623 AGGA 0.00571 AGGC 0.00417 AGGG 0.00513 AGGT 0.00359 AGTA 0.00296 AGTC 0.00259 AGTG 0.0047 AGTT 0.00387 ATAA 0.00385 ATAC 0.00248 ATAG 0.00235 ATAT 0.00328 ATCA 0.00355 ATCC 0.00314 ATCG 0.000752 ATCT 0.00375 ATGA 0.00369 ATGC 0.00382 ATGG 0.00397 ATGT 0.00389 ATTA 0.00342 ATTC 0.00327 ATTG 0.00302 ATTT 0.00622 CAAA 0.00622 CAAC 0.00338 CAAG 0.00412 CAAT 0.00302 CACA 0.00646 CACC 0.00456 CACG 0.00225 CACT 0.0047 CAGA 0.00649 CAGC 0.00881 CAGG 0.006 CAGT 0.00532 CATA 0.00273 CATC 0.00409 CATG 0.00393 CATT 0.00463 CCAA 0.00415 CCAC 0.00455 CCAG 0.00569 CCAT 0.00397 CCCA 0.00559 CCCC 0.00622 CCCG 0.00297 CCCT 0.00513 CCGA 0.00127 CCGC 0.00336 CCGG 0.00241 CCGT 0.00167 CCTA 0.00212 CCTC 0.00546 CCTG 0.006 CCTT 0.00502 CGAA 0.000877 CGAC 0.000768 CGAG 0.0016 CGAT 0.000752 CGCA 0.00179 CGCC 0.00258 CGCG 0.00193 CGCT 0.00234 CGGA 0.00148 CGGC 0.00289 CGGG 0.00297 CGGT 0.00138 CGTA 0.000833 CGTC 0.00118 CGTG 0.00225 CGTT 0.00147 CTAA 0.00268 CTAC 0.00226 CTAG 0.00163 CTAT 0.00235 CTCA 0.00496 CTCC 0.00605 CTCG 0.0016 CTCT 0.00577 CTGA 0.00575 CTGC 0.00853 CTGG 0.00569 CTGT 0.00665 CTTA 0.00298 CTTC 0.00541 CTTG 0.00412 CTTT 0.00665 GAAA 0.00645 GAAC 0.00313 GAAG 0.00541 GAAT 0.00327 GACA 0.0036 GACC 0.0022 GACG 0.00118 GACT 0.00259 GAGA 0.00472 GAGC 0.00541 GAGG 0.00546 GAGT 0.00279 GATA 0.00215 GATC 0.0021 GATG 0.00409 GATT 0.00286 GCAA 0.00432 GCAC 0.00506 GCAG 0.00853 GCAT 0.00382 GCCA 0.00414 GCCC 0.00499 GCCG 0.00289 GCCT 0.00417 GCGA 0.00114 GCGC 0.00269 GCGG 0.00336 GCGT 0.00145 GCTA 0.00224 GCTC 0.00541 GCTG 0.00881 GCTT 0.00482 GGAA 0.00544 GGAC 0.0028 GGAG 0.00605 GGAT 0.00314 GGCA 0.00504 GGCC 0.00361 GGCG 0.00258 GGCT 0.00495 GGGA 0.00548 GGGC 0.00499 GGGG 0.00622 GGGT 0.00323 GGTA 0.00206 GGTC 0.0022 GGTG 0.00456 GGTT 0.00325 GTAA 0.00299 GTAC 0.00208 GTAG 0.00226 GTAT 0.00248 GTCA 0.003 GTCC 0.0028 GTCG 0.000768 GTCT 0.003 GTGA 0.00403 GTGC 0.00506 GTGG 0.00455 GTGT 0.00433 GTTA 0.00261 GTTC 0.00313 GTTG 0.00338 GTTT 0.00523 TAAA 0.00543 TAAC 0.00261 TAAG 0.00298 TAAT 0.00342 TACA 0.00395 TACC 0.00206 TACG 0.000833 TACT 0.00296 TAGA 0.00253 TAGC 0.00224 TAGG 0.00212 TAGT 0.00203 TATA 0.00276 TATC 0.00215 TATG 0.00273 TATT 0.00432 TCAA 0.00338 TCAC 0.00403 TCAG 0.00575 TCAT 0.00369 TCCA 0.00476 TCCC 0.00548 TCCG 0.00148 TCCT 0.00571 TCGA 0.000575 TCGC 0.00114 TCGG 0.00127 TCGT 0.00101 TCTA 0.00253 TCTC 0.00472 TCTG 0.0065 TCTT 0.00535 TGAA 0.00535 TGAC 0.003 TGAG 0.00496 TGAT 0.00355 TGCA 0.00714 TGCC 0.00504 TGCG 0.00179 TGCT 0.00775 TGGA 0.00476 TGGC 0.00414 TGGG 0.00559 TGGT 0.00388 TGTA 0.00395 TGTC 0.0036 TGTG 0.00646 TGTT 0.00575 TTAA 0.00491 TTAC 0.003 TTAG 0.00268 TTAT 0.00385 TTCA 0.00535 TTCC 0.00544 TTCG 0.000877 TTCT 0.00658 TTGA 0.00338 TTGC 0.00432 TTGG 0.00415 TTGT 0.0049 TTTA 0.00543 TTTC 0.00645 TTTG 0.00623 TTTT 0.0107 # l= 4 # Values AAAAA 0.00457 AAAAC 0.00189 AAAAG 0.00216 AAAAT 0.00213 AAACA 0.00223 AAACC 0.00123 AAACG 0.000462 AAACT 0.00131 AAAGA 0.00193 AAAGC 0.00185 AAAGG 0.00163 AAAGT 0.00123 AAATA 0.00196 AAATC 0.00117 AAATG 0.00179 AAATT 0.0013 AACAA 0.00167 AACAC 0.00127 AACAG 0.0017 AACAT 0.00111 AACCA 0.00114 AACCC 0.000905 AACCG 0.000272 AACCT 0.000933 AACGA 0.000302 AACGC 0.000399 AACGG 0.000344 AACGT 0.000426 AACTA 0.00065 AACTC 0.000823 AACTG 0.00133 AACTT 0.00107 AAGAA 0.00201 AAGAC 0.000841 AAGAG 0.00149 AAGAT 0.00101 AAGCA 0.00198 AAGCC 0.00105 AAGCG 0.00041 AAGCT 0.00138 AAGGA 0.00166 AAGGC 0.00116 AAGGG 0.00129 AAGGT 0.000918 AAGTA 0.000922 AAGTC 0.000778 AAGTG 0.0012 AAGTT 0.00107 AATAA 0.00158 AATAC 0.000897 AATAG 0.000774 AATAT 0.00107 AATCA 0.00102 AATCC 0.000774 AATCG 0.000169 AATCT 0.000898 AATGA 0.00123 AATGC 0.00117 AATGG 0.00108 AATGT 0.00114 AATTA 0.00111 AATTC 0.000923 AATTG 0.000794 AATTT 0.0013 ACAAA 0.00197 ACAAC 0.000985 ACAAG 0.00111 ACAAT 0.000828 ACACA 0.00177 ACACC 0.000982 ACACG 0.000512 ACACT 0.00107 ACAGA 0.00184 ACAGC 0.00219 ACAGG 0.00132 ACAGT 0.0013 ACATA 0.000791 ACATC 0.001 ACATG 0.000949 ACATT 0.00114 ACCAA 0.000986 ACCAC 0.00104 ACCAG 0.00108 ACCAT 0.000776 ACCCA 0.00106 ACCCC 0.00102 ACCCG 0.000354 ACCCT 0.0008 ACCGA 0.00028 ACCGC 0.000516 ACCGG 0.000298 ACCGT 0.000282 ACCTA 0.000474 ACCTC 0.00106 ACCTG 0.00115 ACCTT 0.000918 ACGAA 0.000268 ACGAC 0.000186 ACGAG 0.000355 ACGAT 0.000197 ACGCA 0.000434 ACGCC 0.000325 ACGCG 0.00026 ACGCT 0.000429 ACGGA 0.000373 ACGGC 0.00053 ACGGG 0.000484 ACGGT 0.000282 ACGTA 0.000282 ACGTC 0.000303 ACGTG 0.000602 ACGTT 0.000426 ACTAA 0.000649 ACTAC 0.000523 ACTAG 0.000359 ACTAT 0.0005 ACTCA 0.000921 ACTCC 0.000808 ACTCG 0.000225 ACTCT 0.000839 ACTGA 0.00138 ACTGC 0.00164 ACTGG 0.001 ACTGT 0.0013 ACTTA 0.000702 ACTTC 0.00112 ACTTG 0.000916 ACTTT 0.00123 AGAAA 0.00248 AGAAC 0.00115 AGAAG 0.00181 AGAAT 0.00114 AGACA 0.00119 AGACC 0.000689 AGACG 0.000287 AGACT 0.000827 AGAGA 0.00164 AGAGC 0.00173 AGAGG 0.00156 AGAGT 0.000839 AGATA 0.000797 AGATC 0.000724 AGATG 0.00133 AGATT 0.000898 AGCAA 0.00169 AGCAC 0.00186 AGCAG 0.00289 AGCAT 0.00132 AGCCA 0.00143 AGCCC 0.0016 AGCCG 0.000606 AGCCT 0.00131 AGCGA 0.000394 AGCGC 0.000775 AGCGG 0.000743 AGCGT 0.000429 AGCTA 0.000748 AGCTC 0.00163 AGCTG 0.00247 AGCTT 0.00138 AGGAA 0.00195 AGGAC 0.000928 AGGAG 0.00188 AGGAT 0.000953 AGGCA 0.00155 AGGCC 0.000829 AGGCG 0.000477 AGGCT 0.00131 AGGGA 0.00165 AGGGC 0.00131 AGGGG 0.00138 AGGGT 0.0008 AGGTA 0.000713 AGGTC 0.000679 AGGTG 0.00127 AGGTT 0.000933 AGTAA 0.000957 AGTAC 0.00063 AGTAG 0.000661 AGTAT 0.000713 AGTCA 0.000899 AGTCC 0.000697 AGTCG 0.000162 AGTCT 0.000827 AGTGA 0.00119 AGTGC 0.00136 AGTGG 0.00108 AGTGT 0.00107 AGTTA 0.000798 AGTTC 0.000895 AGTTG 0.00087 AGTTT 0.00131 ATAAA 0.00163 ATAAC 0.000659 ATAAG 0.000702 ATAAT 0.000863 ATACA 0.00107 ATACC 0.00049 ATACG 0.000203 ATACT 0.000713 ATAGA 0.000692 ATAGC 0.000616 ATAGG 0.000542 ATAGT 0.0005 ATATA 0.000983 ATATC 0.000549 ATATG 0.000678 ATATT 0.00107 ATCAA 0.000783 ATCAC 0.000891 ATCAG 0.00109 ATCAT 0.000778 ATCCA 0.000978 ATCCC 0.001 ATCCG 0.000205 ATCCT 0.000953 ATCGA 0.000135 ATCGC 0.00024 ATCGG 0.00018 ATCGT 0.000197 ATCTA 0.000562 ATCTC 0.000964 ATCTG 0.00122 ATCTT 0.00101 ATGAA 0.00127 ATGAC 0.000636 ATGAG 0.00101 ATGAT 0.000778 ATGCA 0.00144 ATGCC 0.000803 ATGCG 0.00026 ATGCT 0.00132 ATGGA 0.00112 ATGGC 0.000942 ATGGG 0.00113 ATGGT 0.000776 ATGTA 0.000906 ATGTC 0.000694 ATGTG 0.00118 ATGTT 0.00111 ATTAA 0.00123 ATTAC 0.000705 ATTAG 0.000625 ATTAT 0.000863 ATTCA 0.0011 ATTCC 0.000894 ATTCG 0.00014 ATTCT 0.00114 ATTGA 0.000647 ATTGC 0.000889 ATTGG 0.000653 ATTGT 0.000828 ATTTA 0.00137 ATTTC 0.00146 ATTTG 0.00126 ATTTT 0.00213 CAAAA 0.00195 CAAAC 0.00132 CAAAG 0.00169 CAAAT 0.00126 CAACA 0.00129 CAACC 0.000864 CAACG 0.000363 CAACT 0.00087 CAAGA 0.0011 CAAGC 0.00101 CAAGG 0.0011 CAAGT 0.000916 CAATA 0.000738 CAATC 0.000567 CAATG 0.000918 CAATT 0.000794 CACAA 0.00134 CACAC 0.00153 CACAG 0.00242 CACAT 0.00118 CACCA 0.0014 CACCC 0.00122 CACCG 0.00067 CACCT 0.00127 CACGA 0.000357 CACGC 0.000586 CACGG 0.000707 CACGT 0.000602 CACTA 0.00058 CACTC 0.000919 CACTG 0.002 CACTT 0.0012 CAGAA 0.00205 CAGAC 0.00108 CAGAG 0.00215 CAGAT 0.00122 CAGCA 0.00309 CAGCC 0.00226 CAGCG 0.00099 CAGCT 0.00247 CAGGA 0.00173 CAGGC 0.00141 CAGGG 0.00171 CAGGT 0.00115 CAGTA 0.00105 CAGTC 0.000938 CAGTG 0.002 CAGTT 0.00133 CATAA 0.000785 CATAC 0.000625 CATAG 0.00064 CATAT 0.000678 CATCA 0.00119 CATCC 0.00127 CATCG 0.000301 CATCT 0.00133 CATGA 0.000854 CATGC 0.00103 CATGG 0.00109 CATGT 0.000949 CATTA 0.000906 CATTC 0.00101 CATTG 0.000918 CATTT 0.00179 CCAAA 0.00147 CCAAC 0.000965 CCAAG 0.00106 CCAAT 0.000653 CCACA 0.00152 CCACC 0.0013 CCACG 0.000656 CCACT 0.00108 CCAGA 0.00127 CCAGC 0.00193 CCAGG 0.00149 CCAGT 0.001 CCATA 0.000645 CCATC 0.00116 CCATG 0.00109 CCATT 0.00108 CCCAA 0.00112 CCCAC 0.00148 CCCAG 0.00186 CCCAT 0.00113 CCCCA 0.00177 CCCCC 0.0019 CCCCG 0.00117 CCCCT 0.00138 CCCGA 0.000401 CCCGC 0.00118 CCCGG 0.000912 CCCGT 0.000484 CCCTA 0.000511 CCCTC 0.00162 CCCTG 0.00171 CCCTT 0.00129 CCGAA 0.00026 CCGAC 0.000267 CCGAG 0.000566 CCGAT 0.00018 CCGCA 0.000612 CCGCC 0.00121 CCGCG 0.000802 CCGCT 0.000743 CCGGA 0.000371 CCGGC 0.000833 CCGGG 0.000912 CCGGT 0.000298 CCGTA 0.000216 CCGTC 0.000403 CCGTG 0.000707 CCGTT 0.000344 CCTAA 0.000617 CCTAC 0.000583 CCTAG 0.000381 CCTAT 0.000542 CCTCA 0.00139 CCTCC 0.00196 CCTCG 0.000549 CCTCT 0.00156 CCTGA 0.00119 CCTGC 0.002 CCTGG 0.00149 CCTGT 0.00132 CCTTA 0.000729 CCTTC 0.00156 CCTTG 0.0011 CCTTT 0.00163 CGAAA 0.000224 CGAAC 0.000193 CGAAG 0.000321 CGAAT 0.00014 CGACA 0.000209 CGACC 0.000222 CGACG 0.000174 CGACT 0.000162 CGAGA 0.000288 CGAGC 0.000534 CGAGG 0.000549 CGAGT 0.000225 CGATA 0.000119 CGATC 0.000163 CGATG 0.000301 CGATT 0.000169 CGCAA 0.000207 CGCAC 0.000494 CGCAG 0.00083 CGCAT 0.00026 CGCCA 0.000373 CGCCC 0.000884 CGCCG 0.000842 CGCCT 0.000477 CGCGA 0.000186 CGCGC 0.000681 CGCGG 0.000802 CGCGT 0.00026 CGCTA 0.000172 CGCTC 0.000769 CGCTG 0.00099 CGCTT 0.00041 CGGAA 0.000303 CGGAC 0.000245 CGGAG 0.000725 CGGAT 0.000205 CGGCA 0.000541 CGGCC 0.000902 CGGCG 0.000842 CGGCT 0.000606 CGGGA 0.000596 CGGGC 0.000853 CGGGG 0.00117 CGGGT 0.000354 CGGTA 0.000181 CGGTC 0.000253 CGGTG 0.00067 CGGTT 0.000272 CGTAA 0.000218 CGTAC 0.000194 CGTAG 0.000217 CGTAT 0.000203 CGTCA 0.000283 CGTCC 0.000436 CGTCG 0.000174 CGTCT 0.000287 CGTGA 0.000391 CGTGC 0.000692 CGTGG 0.000656 CGTGT 0.000512 CGTTA 0.000262 CGTTC 0.000382 CGTTG 0.000363 CGTTT 0.000462 CTAAA 0.000933 CTAAC 0.000517 CTAAG 0.000607 CTAAT 0.000625 CTACA 0.000876 CTACC 0.000503 CTACG 0.000217 CTACT 0.000661 CTAGA 0.000498 CTAGC 0.000396 CTAGG 0.000381 CTAGT 0.000359 CTATA 0.000487 CTATC 0.000449 CTATG 0.00064 CTATT 0.000774 CTCAA 0.000889 CTCAC 0.00122 CTCAG 0.00185 CTCAT 0.00101 CTCCA 0.00155 CTCCC 0.00189 CTCCG 0.000725 CTCCT 0.00188 CTCGA 0.000214 CTCGC 0.000462 CTCGG 0.000566 CTCGT 0.000355 CTCTA 0.000653 CTCTC 0.00148 CTCTG 0.00215 CTCTT 0.00149 CTGAA 0.0018 CTGAC 0.00102 CTGAG 0.00185 CTGAT 0.00109 CTGCA 0.00273 CTGCC 0.00209 CTGCG 0.00083 CTGCT 0.00289 CTGGA 0.00151 CTGGC 0.00124 CTGGG 0.00186 CTGGT 0.00108 CTGTA 0.00129 CTGTC 0.00124 CTGTG 0.00242 CTGTT 0.0017 CTTAA 0.000993 CTTAC 0.000682 CTTAG 0.000607 CTTAT 0.000702 CTTCA 0.00154 CTTCC 0.00174 CTTCG 0.000321 CTTCT 0.00181 CTTGA 0.000872 CTTGC 0.00107 CTTGG 0.00106 CTTGT 0.00111 CTTTA 0.00118 CTTTC 0.00162 CTTTG 0.00169 CTTTT 0.00216 GAAAA 0.00222 GAAAC 0.00115 GAAAG 0.00162 GAAAT 0.00146 GAACA 0.00121 GAACC 0.000635 GAACG 0.000382 GAACT 0.000895 GAAGA 0.00144 GAAGC 0.00128 GAAGG 0.00156 GAAGT 0.00112 GAATA 0.000748 GAATC 0.000591 GAATG 0.00101 GAATT 0.000923 GACAA 0.000855 GACAC 0.000812 GACAG 0.00124 GACAT 0.000694 GACCA 0.000637 GACCC 0.00063 GACCG 0.000253 GACCT 0.000679 GACGA 0.000184 GACGC 0.000291 GACGG 0.000403 GACGT 0.000303 GACTA 0.000343 GACTC 0.000526 GACTG 0.000938 GACTT 0.000778 GAGAA 0.00153 GAGAC 0.000745 GAGAG 0.00148 GAGAT 0.000964 GAGCA 0.00176 GAGCC 0.00124 GAGCG 0.000769 GAGCT 0.00163 GAGGA 0.00159 GAGGC 0.00119 GAGGG 0.00162 GAGGT 0.00106 GAGTA 0.000526 GAGTC 0.000526 GAGTG 0.000919 GAGTT 0.000823 GATAA 0.000678 GATAC 0.000469 GATAG 0.000449 GATAT 0.000549 GATCA 0.000642 GATCC 0.000567 GATCG 0.000163 GATCT 0.000724 GATGA 0.000915 GATGC 0.00101 GATGG 0.00116 GATGT 0.001 GATTA 0.00053 GATTC 0.000591 GATTG 0.000567 GATTT 0.00117 GCAAA 0.00154 GCAAC 0.000814 GCAAG 0.00107 GCAAT 0.000889 GCACA 0.00176 GCACC 0.00125 GCACG 0.000692 GCACT 0.00136 GCAGA 0.00193 GCAGC 0.00296 GCAGG 0.002 GCAGT 0.00164 GCATA 0.000602 GCATC 0.00101 GCATG 0.00103 GCATT 0.00117 GCCAA 0.000905 GCCAC 0.00105 GCCAG 0.00124 GCCAT 0.000942 GCCCA 0.00119 GCCCC 0.00164 GCCCG 0.000853 GCCCT 0.00131 GCCGA 0.000356 GCCGC 0.00117 GCCGG 0.000833 GCCGT 0.00053 GCCTA 0.000406 GCCTC 0.00119 GCCTG 0.00141 GCCTT 0.00116 GCGAA 0.000212 GCGAC 0.000225 GCGAG 0.000462 GCGAT 0.00024 GCGCA 0.000489 GCGCC 0.000741 GCGCG 0.000681 GCGCT 0.000775 GCGGA 0.000498 GCGGC 0.00117 GCGGG 0.00118 GCGGT 0.000516 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000291 GCGTG 0.000586 GCGTT 0.000399 GCTAA 0.000652 GCTAC 0.000576 GCTAG 0.000396 GCTAT 0.000616 GCTCA 0.00136 GCTCC 0.00178 GCTCG 0.000534 GCTCT 0.00173 GCTGA 0.00173 GCTGC 0.00296 GCTGG 0.00193 GCTGT 0.00219 GCTTA 0.000681 GCTTC 0.00128 GCTTG 0.00101 GCTTT 0.00185 GGAAA 0.00192 GGAAC 0.000896 GGAAG 0.00174 GGAAT 0.000894 GGACA 0.00106 GGACC 0.000605 GGACG 0.000436 GGACT 0.000697 GGAGA 0.00151 GGAGC 0.00178 GGAGG 0.00196 GGAGT 0.000808 GGATA 0.000528 GGATC 0.000567 GGATG 0.00127 GGATT 0.000774 GGCAA 0.000898 GGCAC 0.00125 GGCAG 0.00209 GGCAT 0.000803 GGCCA 0.000868 GGCCC 0.00101 GGCCG 0.000902 GGCCT 0.000829 GGCGA 0.000303 GGCGC 0.000741 GGCGG 0.00121 GGCGT 0.000325 GGCTA 0.000397 GGCTC 0.00124 GGCTG 0.00226 GGCTT 0.00105 GGGAA 0.00161 GGGAC 0.000974 GGGAG 0.00189 GGGAT 0.001 GGGCA 0.00149 GGGCC 0.00101 GGGCG 0.000884 GGGCT 0.0016 GGGGA 0.00166 GGGGC 0.00164 GGGGG 0.0019 GGGGT 0.00102 GGGTA 0.00047 GGGTC 0.00063 GGGTG 0.00122 GGGTT 0.000905 GGTAA 0.000604 GGTAC 0.000468 GGTAG 0.000503 GGTAT 0.00049 GGTCA 0.000683 GGTCC 0.000605 GGTCG 0.000222 GGTCT 0.000689 GGTGA 0.00104 GGTGC 0.00125 GGTGG 0.0013 GGTGT 0.000982 GGTTA 0.000524 GGTTC 0.000635 GGTTG 0.000864 GGTTT 0.00123 GTAAA 0.000973 GTAAC 0.000635 GTAAG 0.000682 GTAAT 0.000705 GTACA 0.000787 GTACC 0.000468 GTACG 0.000194 GTACT 0.00063 GTAGA 0.000574 GTAGC 0.000576 GTAGG 0.000583 GTAGT 0.000523 GTATA 0.000484 GTATC 0.000469 GTATG 0.000625 GTATT 0.000897 GTCAA 0.000526 GTCAC 0.000827 GTCAG 0.00102 GTCAT 0.000636 GTCCA 0.000648 GTCCC 0.000974 GTCCG 0.000245 GTCCT 0.000928 GTCGA 8.95e-05 GTCGC 0.000225 GTCGG 0.000267 GTCGT 0.000186 GTCTA 0.000331 GTCTC 0.000745 GTCTG 0.00108 GTCTT 0.000841 GTGAA 0.0011 GTGAC 0.000827 GTGAG 0.00122 GTGAT 0.000891 GTGCA 0.00145 GTGCC 0.00125 GTGCG 0.000494 GTGCT 0.00186 GTGGA 0.000988 GTGGC 0.00105 GTGGG 0.00148 GTGGT 0.00104 GTGTA 0.000722 GTGTC 0.000812 GTGTG 0.00153 GTGTT 0.00127 GTTAA 0.000798 GTTAC 0.000635 GTTAG 0.000517 GTTAT 0.000659 GTTCA 0.000882 GTTCC 0.000896 GTTCG 0.000193 GTTCT 0.00115 GTTGA 0.000619 GTTGC 0.000814 GTTGG 0.000965 GTTGT 0.000985 GTTTA 0.000872 GTTTC 0.00115 GTTTG 0.00132 GTTTT 0.00189 TAAAA 0.002 TAAAC 0.000872 TAAAG 0.00118 TAAAT 0.00137 TAACA 0.00102 TAACC 0.000524 TAACG 0.000262 TAACT 0.000798 TAAGA 0.000874 TAAGC 0.000681 TAAGG 0.000729 TAAGT 0.000702 TAATA 0.00087 TAATC 0.00053 TAATG 0.000906 TAATT 0.00111 TACAA 0.00103 TACAC 0.000722 TACAG 0.00129 TACAT 0.000906 TACCA 0.0007 TACCC 0.00047 TACCG 0.000181 TACCT 0.000713 TACGA 0.000163 TACGC 0.000171 TACGG 0.000216 TACGT 0.000282 TACTA 0.000458 TACTC 0.000526 TACTG 0.00105 TACTT 0.000922 TAGAA 0.000982 TAGAC 0.000331 TAGAG 0.000653 TAGAT 0.000562 TAGCA 0.000922 TAGCC 0.000397 TAGCG 0.000172 TAGCT 0.000748 TAGGA 0.000731 TAGGC 0.000406 TAGGG 0.000511 TAGGT 0.000474 TAGTA 0.000458 TAGTC 0.000343 TAGTG 0.00058 TAGTT 0.00065 TATAA 0.000807 TATAC 0.000484 TATAG 0.000487 TATAT 0.000983 TATCA 0.000701 TATCC 0.000528 TATCG 0.000119 TATCT 0.000797 TATGA 0.00069 TATGC 0.000602 TATGG 0.000645 TATGT 0.000791 TATTA 0.00087 TATTC 0.000748 TATTG 0.000738 TATTT 0.00196 TCAAA 0.00124 TCAAC 0.000619 TCAAG 0.000872 TCAAT 0.000647 TCACA 0.00141 TCACC 0.00104 TCACG 0.000391 TCACT 0.00119 TCAGA 0.00145 TCAGC 0.00173 TCAGG 0.00119 TCAGT 0.00138 TCATA 0.00069 TCATC 0.000915 TCATG 0.000854 TCATT 0.00123 TCCAA 0.00113 TCCAC 0.000988 TCCAG 0.00151 TCCAT 0.00112 TCCCA 0.00157 TCCCC 0.00166 TCCCG 0.000596 TCCCT 0.00165 TCCGA 0.000237 TCCGC 0.000498 TCCGG 0.000371 TCCGT 0.000373 TCCTA 0.000731 TCCTC 0.00159 TCCTG 0.00173 TCCTT 0.00166 TCGAA 0.000137 TCGAC 8.95e-05 TCGAG 0.000214 TCGAT 0.000135 TCGCA 0.000256 TCGCC 0.000303 TCGCG 0.000186 TCGCT 0.000394 TCGGA 0.000237 TCGGC 0.000356 TCGGG 0.000401 TCGGT 0.00028 TCGTA 0.000163 TCGTC 0.000184 TCGTG 0.000357 TCGTT 0.000302 TCTAA 0.000764 TCTAC 0.000574 TCTAG 0.000498 TCTAT 0.000692 TCTCA 0.00129 TCTCC 0.00151 TCTCG 0.000288 TCTCT 0.00164 TCTGA 0.00145 TCTGC 0.00193 TCTGG 0.00127 TCTGT 0.00184 TCTTA 0.000874 TCTTC 0.00144 TCTTG 0.0011 TCTTT 0.00193 TGAAA 0.00183 TGAAC 0.000882 TGAAG 0.00154 TGAAT 0.0011 TGACA 0.00114 TGACC 0.000683 TGACG 0.000283 TGACT 0.000899 TGAGA 0.00129 TGAGC 0.00136 TGAGG 0.00139 TGAGT 0.000921 TGATA 0.000701 TGATC 0.000642 TGATG 0.00119 TGATT 0.00102 TGCAA 0.00152 TGCAC 0.00145 TGCAG 0.00273 TGCAT 0.00144 TGCCA 0.00146 TGCCC 0.00149 TGCCG 0.000541 TGCCT 0.00155 TGCGA 0.000256 TGCGC 0.000489 TGCGG 0.000612 TGCGT 0.000434 TGCTA 0.000922 TGCTC 0.00176 TGCTG 0.00309 TGCTT 0.00198 TGGAA 0.00158 TGGAC 0.000648 TGGAG 0.00155 TGGAT 0.000978 TGGCA 0.00146 TGGCC 0.000868 TGGCG 0.000373 TGGCT 0.00143 TGGGA 0.00157 TGGGC 0.00119 TGGGG 0.00177 TGGGT 0.00106 TGGTA 0.0007 TGGTC 0.000637 TGGTG 0.0014 TGGTT 0.00114 TGTAA 0.00122 TGTAC 0.000787 TGTAG 0.000876 TGTAT 0.00107 TGTCA 0.00114 TGTCC 0.00106 TGTCG 0.000209 TGTCT 0.00119 TGTGA 0.00141 TGTGC 0.00176 TGTGG 0.00152 TGTGT 0.00177 TGTTA 0.00102 TGTTC 0.00121 TGTTG 0.00129 TGTTT 0.00223 TTAAA 0.00189 TTAAC 0.000798 TTAAG 0.000993 TTAAT 0.00123 TTACA 0.00122 TTACC 0.000604 TTACG 0.000218 TTACT 0.000957 TTAGA 0.000764 TTAGC 0.000652 TTAGG 0.000617 TTAGT 0.000649 TTATA 0.000807 TTATC 0.000678 TTATG 0.000785 TTATT 0.00158 TTCAA 0.00118 TTCAC 0.0011 TTCAG 0.0018 TTCAT 0.00127 TTCCA 0.00158 TTCCC 0.00161 TTCCG 0.000303 TTCCT 0.00195 TTCGA 0.000137 TTCGC 0.000212 TTCGG 0.00026 TTCGT 0.000268 TTCTA 0.000982 TTCTC 0.00153 TTCTG 0.00205 TTCTT 0.00201 TTGAA 0.00118 TTGAC 0.000526 TTGAG 0.000889 TTGAT 0.000783 TTGCA 0.00152 TTGCC 0.000898 TTGCG 0.000207 TTGCT 0.00169 TTGGA 0.00113 TTGGC 0.000905 TTGGG 0.00112 TTGGT 0.000986 TTGTA 0.00103 TTGTC 0.000855 TTGTG 0.00134 TTGTT 0.00167 TTTAA 0.00189 TTTAC 0.000973 TTTAG 0.000933 TTTAT 0.00163 TTTCA 0.00183 TTTCC 0.00192 TTTCG 0.000224 TTTCT 0.00248 TTTGA 0.00124 TTTGC 0.00154 TTTGG 0.00147 TTTGT 0.00197 TTTTA 0.002 TTTTC 0.00222 TTTTG 0.00195 TTTTT 0.00457 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [7] # (a,c,g,t)= (0.232, 0.268, 0.268, 0.232) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.252 C 0.248 G 0.248 T 0.252 # l= 1 # Values AA 0.0752 AC 0.0513 AG 0.0731 AT 0.0523 CA 0.0769 CC 0.069 CG 0.0289 CT 0.0732 GA 0.0573 GC 0.0704 GG 0.0691 GT 0.0513 TA 0.0425 TC 0.0573 TG 0.0769 TT 0.0753 # l= 2 # Values AAA 0.0276 AAC 0.0139 AAG 0.0187 AAT 0.015 ACA 0.0193 ACC 0.0124 ACG 0.00599 ACT 0.0136 AGA 0.0187 AGC 0.0218 AGG 0.019 AGT 0.0136 ATA 0.0112 ATC 0.011 ATG 0.0151 ATT 0.0151 CAA 0.0163 CAC 0.0184 CAG 0.0271 CAT 0.0151 CCA 0.0189 CCC 0.0216 CCG 0.00947 CCT 0.019 CGA 0.0042 CGC 0.00926 CGG 0.00947 CGT 0.00599 CTA 0.00847 CTC 0.0189 CTG 0.0271 CTT 0.0187 GAA 0.0177 GAC 0.00964 GAG 0.0189 GAT 0.011 GCA 0.0223 GCC 0.0171 GCG 0.00926 GCT 0.0218 GGA 0.018 GGC 0.0171 GGG 0.0216 GGT 0.0124 GTA 0.0093 GTC 0.00964 GTG 0.0184 GTT 0.0139 TAA 0.0136 TAC 0.0093 TAG 0.00847 TAT 0.0112 TCA 0.0164 TCC 0.018 TCG 0.0042 TCT 0.0187 TGA 0.0164 TGC 0.0223 TGG 0.0189 TGT 0.0193 TTA 0.0136 TTC 0.0178 TTG 0.0163 TTT 0.0276 # l= 3 # Values AAAA 0.0103 AAAC 0.00504 AAAG 0.00647 AAAT 0.00585 AACA 0.0055 AACC 0.00326 AACG 0.0015 AACT 0.00365 AAGA 0.00511 AAGC 0.00476 AAGG 0.00504 AAGT 0.00375 AATA 0.00404 AATC 0.00274 AATG 0.00444 AATT 0.00384 ACAA 0.00469 ACAC 0.00432 ACAG 0.00661 ACAT 0.0037 ACCA 0.00387 ACCC 0.00344 ACCG 0.00147 ACCT 0.00357 ACGA 0.00103 ACGC 0.00153 ACGG 0.0018 ACGT 0.00163 ACTA 0.00188 ACTC 0.00276 ACTG 0.00521 ACTT 0.00375 AGAA 0.00631 AGAC 0.00294 AGAG 0.00582 AGAT 0.0036 AGCA 0.00785 AGCC 0.00521 AGCG 0.00251 AGCT 0.00628 AGGA 0.00578 AGGC 0.00426 AGGG 0.00543 AGGT 0.00357 AGTA 0.00275 AGTC 0.00251 AGTG 0.00467 AGTT 0.00365 ATAA 0.00362 ATAC 0.00232 ATAG 0.00224 ATAT 0.00305 ATCA 0.00341 ATCC 0.00321 ATCG 0.000779 ATCT 0.0036 ATGA 0.00353 ATGC 0.00379 ATGG 0.00405 ATGT 0.0037 ATTA 0.00319 ATTC 0.00311 ATTG 0.0029 ATTT 0.00585 CAAA 0.00604 CAAC 0.00334 CAAG 0.00403 CAAT 0.0029 CACA 0.0065 CACC 0.00481 CACG 0.0024 CACT 0.00467 CAGA 0.00646 CAGC 0.00923 CAGG 0.00623 CAGT 0.00521 CATA 0.00258 CATC 0.00415 CATG 0.00391 CATT 0.00444 CCAA 0.00417 CCAC 0.00476 CCAG 0.00591 CCAT 0.00405 CCCA 0.006 CCCC 0.00693 CCCG 0.00327 CCCT 0.00543 CCGA 0.00137 CCGC 0.00364 CCGG 0.00266 CCGT 0.0018 CCTA 0.00207 CCTC 0.00571 CCTG 0.00623 CCTT 0.00504 CGAA 0.000908 CGAC 0.000815 CGAG 0.0017 CGAT 0.000779 CGCA 0.00192 CGCC 0.00276 CGCG 0.00207 CGCT 0.00251 CGGA 0.00159 CGGC 0.00313 CGGG 0.00327 CGGT 0.00147 CGTA 0.000829 CGTC 0.00126 CGTG 0.0024 CGTT 0.0015 CTAA 0.00253 CTAC 0.00216 CTAG 0.00154 CTAT 0.00224 CTCA 0.00498 CTCC 0.00638 CTCG 0.0017 CTCT 0.00582 CTGA 0.00569 CTGC 0.00891 CTGG 0.00592 CTGT 0.00661 CTTA 0.00281 CTTC 0.00535 CTTG 0.00403 CTTT 0.00647 GAAA 0.00621 GAAC 0.00308 GAAG 0.00535 GAAT 0.00311 GACA 0.00359 GACC 0.00228 GACG 0.00126 GACT 0.00251 GAGA 0.00473 GAGC 0.0057 GAGG 0.0057 GAGT 0.00276 GATA 0.00203 GATC 0.00208 GATG 0.00415 GATT 0.00274 GCAA 0.00426 GCAC 0.0053 GCAG 0.00891 GCAT 0.00379 GCCA 0.00428 GCCC 0.00542 GCCG 0.00313 GCCT 0.00426 GCGA 0.00121 GCGC 0.00288 GCGG 0.00364 GCGT 0.00153 GCTA 0.00215 GCTC 0.0057 GCTG 0.00923 GCTT 0.00476 GGAA 0.00544 GGAC 0.00293 GGAG 0.00638 GGAT 0.00321 GGCA 0.00527 GGCC 0.00385 GGCG 0.00276 GGCT 0.0052 GGGA 0.00584 GGGC 0.00542 GGGG 0.00693 GGGT 0.00344 GGTA 0.00201 GGTC 0.00228 GGTG 0.00482 GGTT 0.00326 GTAA 0.00282 GTAC 0.00201 GTAG 0.00216 GTAT 0.00232 GTCA 0.00296 GTCC 0.00293 GTCG 0.000815 GTCT 0.00294 GTGA 0.00402 GTGC 0.0053 GTGG 0.00476 GTGT 0.00432 GTTA 0.00246 GTTC 0.00308 GTTG 0.00334 GTTT 0.00504 TAAA 0.0051 TAAC 0.00246 TAAG 0.00281 TAAT 0.00319 TACA 0.00372 TACC 0.002 TACG 0.000828 TACT 0.00275 TAGA 0.00237 TAGC 0.00215 TAGG 0.00207 TAGT 0.00188 TATA 0.00257 TATC 0.00203 TATG 0.00258 TATT 0.00404 TCAA 0.0032 TCAC 0.00401 TCAG 0.00569 TCAT 0.00353 TCCA 0.00475 TCCC 0.00584 TCCG 0.00159 TCCT 0.00578 TCGA 0.00059 TCGC 0.00121 TCGG 0.00137 TCGT 0.00103 TCTA 0.00237 TCTC 0.00473 TCTG 0.00646 TCTT 0.00512 TGAA 0.00508 TGAC 0.00296 TGAG 0.00498 TGAT 0.00341 TGCA 0.00721 TGCC 0.00527 TGCG 0.00192 TGCT 0.00785 TGGA 0.00475 TGGC 0.00428 TGGG 0.006 TGGT 0.00387 TGTA 0.00372 TGTC 0.00359 TGTG 0.0065 TGTT 0.00551 TTAA 0.0046 TTAC 0.00282 TTAG 0.00253 TTAT 0.00362 TTCA 0.00508 TTCC 0.00544 TTCG 0.000908 TTCT 0.00632 TTGA 0.0032 TTGC 0.00426 TTGG 0.00417 TTGT 0.00469 TTTA 0.0051 TTTC 0.00621 TTTG 0.00605 TTTT 0.0103 # l= 4 # Values AAAAA 0.0044 AAAAC 0.00181 AAAAG 0.00207 AAAAT 0.00199 AAACA 0.00212 AAACC 0.00122 AAACG 0.000469 AAACT 0.00123 AAAGA 0.00185 AAAGC 0.00183 AAAGG 0.00162 AAAGT 0.00116 AAATA 0.00184 AAATC 0.00112 AAATG 0.0017 AAATT 0.0012 AACAA 0.00159 AACAC 0.00123 AACAG 0.00164 AACAT 0.00104 AACCA 0.00112 AACCC 0.000946 AACCG 0.000283 AACCT 0.00091 AACGA 0.000307 AACGC 0.000416 AACGG 0.00036 AACGT 0.000421 AACTA 0.000596 AACTC 0.000799 AACTG 0.00127 AACTT 0.000994 AAGAA 0.00191 AAGAC 0.000803 AAGAG 0.00146 AAGAT 0.000942 AAGCA 0.00194 AAGCC 0.00106 AAGCG 0.000428 AAGCT 0.00134 AAGGA 0.00165 AAGGC 0.00116 AAGGG 0.00133 AAGGT 0.000893 AAGTA 0.000846 AAGTC 0.000746 AAGTG 0.00116 AAGTT 0.000994 AATAA 0.00149 AATAC 0.000833 AATAG 0.000728 AATAT 0.000984 AATCA 0.000962 AATCC 0.000764 AATCG 0.000171 AATCT 0.000839 AATGA 0.00117 AATGC 0.00114 AATGG 0.00106 AATGT 0.00107 AATTA 0.00104 AATTC 0.000866 AATTG 0.000743 AATTT 0.0012 ACAAA 0.00189 ACAAC 0.000953 ACAAG 0.00107 ACAAT 0.000778 ACACA 0.00174 ACACC 0.00101 ACACG 0.000532 ACACT 0.00103 ACAGA 0.00179 ACAGC 0.00224 ACAGG 0.00133 ACAGT 0.00124 ACATA 0.000734 ACATC 0.000987 ACATG 0.000915 ACATT 0.00107 ACCAA 0.000967 ACCAC 0.00106 ACCAG 0.00108 ACCAT 0.000759 ACCCA 0.0011 ACCCC 0.00113 ACCCG 0.000387 ACCCT 0.000827 ACCGA 0.000295 ACCGC 0.000559 ACCGG 0.000325 ACCGT 0.000295 ACCTA 0.000449 ACCTC 0.00108 ACCTG 0.00115 ACCTT 0.000893 ACGAA 0.000272 ACGAC 0.000192 ACGAG 0.000369 ACGAT 0.000196 ACGCA 0.000456 ACGCC 0.000348 ACGCG 0.000281 ACGCT 0.000446 ACGGA 0.000398 ACGGC 0.000577 ACGGG 0.000531 ACGGT 0.000295 ACGTA 0.000274 ACGTC 0.000314 ACGTG 0.000622 ACGTT 0.000421 ACTAA 0.0006 ACTAC 0.000489 ACTAG 0.000329 ACTAT 0.000461 ACTCA 0.0009 ACTCC 0.000813 ACTCG 0.000232 ACTCT 0.00081 ACTGA 0.00132 ACTGC 0.00165 ACTGG 0.00099 ACTGT 0.00124 ACTTA 0.000646 ACTTC 0.00108 ACTTG 0.000867 ACTTT 0.00116 AGAAA 0.00237 AGAAC 0.00112 AGAAG 0.00177 AGAAT 0.00106 AGACA 0.00116 AGACC 0.000696 AGACG 0.000296 AGACT 0.000786 AGAGA 0.00161 AGAGC 0.0018 AGAGG 0.0016 AGAGT 0.00081 AGATA 0.000746 AGATC 0.000706 AGATG 0.00131 AGATT 0.000839 AGCAA 0.00166 AGCAC 0.00193 AGCAG 0.00298 AGCAT 0.00129 AGCCA 0.00147 AGCCC 0.00175 AGCCG 0.000655 AGCCT 0.00133 AGCGA 0.000414 AGCGC 0.000838 AGCGG 0.000807 AGCGT 0.000446 AGCTA 0.000705 AGCTC 0.00169 AGCTG 0.00254 AGCTT 0.00134 AGGAA 0.00192 AGGAC 0.00095 AGGAG 0.00195 AGGAT 0.000951 AGGCA 0.00157 AGGCC 0.000856 AGGCG 0.000503 AGGCT 0.00133 AGGGA 0.00172 AGGGC 0.0014 AGGGG 0.00149 AGGGT 0.000827 AGGTA 0.000682 AGGTC 0.000683 AGGTG 0.0013 AGGTT 0.00091 AGTAA 0.000884 AGTAC 0.00059 AGTAG 0.000618 AGTAT 0.000654 AGTCA 0.000861 AGTCC 0.000701 AGTCG 0.000167 AGTCT 0.000786 AGTGA 0.00116 AGTGC 0.00139 AGTGG 0.0011 AGTGT 0.00103 AGTTA 0.000737 AGTTC 0.000857 AGTTG 0.000831 AGTTT 0.00123 ATAAA 0.00154 ATAAC 0.00062 ATAAG 0.000661 ATAAT 0.0008 ATACA 0.000996 ATACC 0.000469 ATACG 0.000198 ATACT 0.000654 ATAGA 0.000653 ATAGC 0.000592 ATAGG 0.000532 ATAGT 0.000461 ATATA 0.000921 ATATC 0.000515 ATATG 0.000631 ATATT 0.000984 ATCAA 0.000734 ATCAC 0.000877 ATCAG 0.00106 ATCAT 0.000734 ATCCA 0.000964 ATCCC 0.00107 ATCCG 0.00022 ATCCT 0.000951 ATCGA 0.000137 ATCGC 0.000255 ATCGG 0.000191 ATCGT 0.000196 ATCTA 0.00052 ATCTC 0.000955 ATCTG 0.00118 ATCTT 0.000942 ATGAA 0.00119 ATGAC 0.000611 ATGAG 0.000992 ATGAT 0.000734 ATGCA 0.00141 ATGCC 0.00081 ATGCG 0.000273 ATGCT 0.00129 ATGGA 0.00112 ATGGC 0.000963 ATGGG 0.00121 ATGGT 0.000759 ATGTA 0.00084 ATGTC 0.000674 ATGTG 0.00115 ATGTT 0.00104 ATTAA 0.00115 ATTAC 0.000656 ATTAG 0.000584 ATTAT 0.0008 ATTCA 0.00103 ATTCC 0.000875 ATTCG 0.000142 ATTCT 0.00106 ATTGA 0.000609 ATTGC 0.000869 ATTGG 0.000645 ATTGT 0.000778 ATTTA 0.00128 ATTTC 0.00138 ATTTG 0.0012 ATTTT 0.00199 CAAAA 0.00187 CAAAC 0.0013 CAAAG 0.00168 CAAAT 0.0012 CAACA 0.00125 CAACC 0.000879 CAACG 0.000378 CAACT 0.000831 CAAGA 0.00105 CAAGC 0.001 CAAGG 0.00111 CAAGT 0.000867 CAATA 0.000696 CAATC 0.000554 CAATG 0.000909 CAATT 0.000743 CACAA 0.0013 CACAC 0.00156 CACAG 0.00248 CACAT 0.00115 CACCA 0.00144 CACCC 0.00134 CACCG 0.000736 CACCT 0.0013 CACGA 0.000371 CACGC 0.000631 CACGG 0.000779 CACGT 0.000622 CACTA 0.000549 CACTC 0.000932 CACTG 0.00203 CACTT 0.00116 CAGAA 0.00199 CAGAC 0.00108 CAGAG 0.00221 CAGAT 0.00118 CAGCA 0.0032 CAGCC 0.00242 CAGCG 0.00107 CAGCT 0.00254 CAGGA 0.00177 CAGGC 0.00146 CAGGG 0.00185 CAGGT 0.00115 CAGTA 0.000987 CAGTC 0.000922 CAGTG 0.00203 CAGTT 0.00127 CATAA 0.000735 CATAC 0.000593 CATAG 0.000621 CATAT 0.000631 CATCA 0.00117 CATCC 0.00134 CATCG 0.000321 CATCT 0.00131 CATGA 0.000822 CATGC 0.00104 CATGG 0.00113 CATGT 0.000915 CATTA 0.000852 CATTC 0.00098 CATTG 0.000909 CATTT 0.0017 CCAAA 0.00147 CCAAC 0.000987 CCAAG 0.00107 CCAAT 0.000645 CCACA 0.00156 CCACC 0.00139 CCACG 0.00072 CCACT 0.0011 CCAGA 0.00129 CCAGC 0.00206 CCAGG 0.00158 CCAGT 0.00099 CCATA 0.000636 CCATC 0.00122 CCATG 0.00113 CCATT 0.00106 CCCAA 0.00118 CCCAC 0.00161 CCCAG 0.002 CCCAT 0.00121 CCCCA 0.00198 CCCCC 0.00215 CCCCG 0.00131 CCCCT 0.00149 CCCGA 0.000441 CCCGC 0.00128 CCCGG 0.00102 CCCGT 0.000531 CCCTA 0.000521 CCCTC 0.00174 CCCTG 0.00185 CCCTT 0.00133 CCGAA 0.000276 CCGAC 0.000292 CCGAG 0.000613 CCGAT 0.000191 CCGCA 0.00067 CCGCC 0.00129 CCGCG 0.000868 CCGCT 0.000807 CCGGA 0.000404 CCGGC 0.000911 CCGGG 0.00102 CCGGT 0.000325 CCGTA 0.000223 CCGTC 0.00044 CCGTG 0.000779 CCGTT 0.00036 CCTAA 0.000596 CCTAC 0.000576 CCTAG 0.000367 CCTAT 0.000532 CCTCA 0.00141 CCTCC 0.0021 CCTCG 0.000591 CCTCT 0.0016 CCTGA 0.0012 CCTGC 0.00212 CCTGG 0.00158 CCTGT 0.00133 CCTTA 0.000705 CCTTC 0.00159 CCTTG 0.00111 CCTTT 0.00162 CGAAA 0.00023 CGAAC 0.000201 CGAAG 0.000336 CGAAT 0.000142 CGACA 0.000218 CGACC 0.00024 CGACG 0.00019 CGACT 0.000167 CGAGA 0.0003 CGAGC 0.000573 CGAGG 0.000591 CGAGT 0.000232 CGATA 0.000118 CGATC 0.000168 CGATG 0.000321 CGATT 0.000171 CGCAA 0.000214 CGCAC 0.000532 CGCAG 0.000902 CGCAT 0.000273 CGCCA 0.000398 CGCCC 0.000958 CGCCG 0.000904 CGCCT 0.000503 CGCGA 0.000197 CGCGC 0.000724 CGCGG 0.000868 CGCGT 0.000281 CGCTA 0.000174 CGCTC 0.000833 CGCTG 0.00107 CGCTT 0.000428 CGGAA 0.000315 CGGAC 0.000265 CGGAG 0.000794 CGGAT 0.00022 CGGCA 0.000586 CGGCC 0.000981 CGGCG 0.000904 CGGCT 0.000655 CGGGA 0.000649 CGGGC 0.000924 CGGGG 0.00131 CGGGT 0.000387 CGGTA 0.000185 CGGTC 0.00027 CGGTG 0.000736 CGGTT 0.000283 CGTAA 0.000214 CGTAC 0.000197 CGTAG 0.00022 CGTAT 0.000198 CGTCA 0.000293 CGTCC 0.000479 CGTCG 0.00019 CGTCT 0.000296 CGTGA 0.000402 CGTGC 0.000747 CGTGG 0.00072 CGTGT 0.000532 CGTTA 0.000261 CGTTC 0.000396 CGTTG 0.000378 CGTTT 0.000469 CTAAA 0.000877 CTAAC 0.00049 CTAAG 0.000575 CTAAT 0.000584 CTACA 0.000836 CTACC 0.000489 CTACG 0.00022 CTACT 0.000618 CTAGA 0.000467 CTAGC 0.000378 CTAGG 0.000367 CTAGT 0.000329 CTATA 0.000457 CTATC 0.00043 CTATG 0.000621 CTATT 0.000728 CTCAA 0.000859 CTCAC 0.00124 CTCAG 0.00189 CTCAT 0.000992 CTCCA 0.0016 CTCCC 0.00203 CTCCG 0.000794 CTCCT 0.00195 CTCGA 0.000222 CTCGC 0.000492 CTCGG 0.000613 CTCGT 0.000369 CTCTA 0.000627 CTCTC 0.00153 CTCTG 0.00221 CTCTT 0.00146 CTGAA 0.00172 CTGAC 0.00101 CTGAG 0.00189 CTGAT 0.00106 CTGCA 0.00282 CTGCC 0.00221 CTGCG 0.000902 CTGCT 0.00298 CTGGA 0.00153 CTGGC 0.0013 CTGGG 0.002 CTGGT 0.00108 CTGTA 0.00123 CTGTC 0.00126 CTGTG 0.00248 CTGTT 0.00164 CTTAA 0.000929 CTTAC 0.000646 CTTAG 0.000575 CTTAT 0.000661 CTTCA 0.00149 CTTCC 0.00176 CTTCG 0.000336 CTTCT 0.00177 CTTGA 0.000828 CTTGC 0.00106 CTTGG 0.00107 CTTGT 0.00107 CTTTA 0.00113 CTTTC 0.00159 CTTTG 0.00168 CTTTT 0.00207 GAAAA 0.00212 GAAAC 0.00111 GAAAG 0.00159 GAAAT 0.00138 GAACA 0.00117 GAACC 0.000649 GAACG 0.000396 GAACT 0.000857 GAAGA 0.0014 GAAGC 0.00129 GAAGG 0.00159 GAAGT 0.00108 GAATA 0.000699 GAATC 0.000571 GAATG 0.00098 GAATT 0.000866 GACAA 0.000828 GACAC 0.000832 GACAG 0.00126 GACAT 0.000674 GACCA 0.000638 GACCC 0.000688 GACCG 0.00027 GACCT 0.000683 GACGA 0.000191 GACGC 0.000312 GACGG 0.00044 GACGT 0.000314 GACTA 0.000319 GACTC 0.000528 GACTG 0.000922 GACTT 0.000746 GAGAA 0.0015 GAGAC 0.00075 GAGAG 0.00153 GAGAT 0.000955 GAGCA 0.00183 GAGCC 0.00134 GAGCG 0.000833 GAGCT 0.00169 GAGGA 0.00165 GAGGC 0.00124 GAGGG 0.00174 GAGGT 0.00108 GAGTA 0.000496 GAGTC 0.000528 GAGTG 0.000932 GAGTT 0.000799 GATAA 0.000642 GATAC 0.000445 GATAG 0.00043 GATAT 0.000515 GATCA 0.000622 GATCC 0.000586 GATCG 0.000168 GATCT 0.000706 GATGA 0.000896 GATGC 0.00105 GATGG 0.00122 GATGT 0.000987 GATTA 0.000493 GATTC 0.000571 GATTG 0.000554 GATTT 0.00112 GCAAA 0.00152 GCAAC 0.000808 GCAAG 0.00106 GCAAT 0.000869 GCACA 0.00182 GCACC 0.00134 GCACG 0.000747 GCACT 0.00139 GCAGA 0.00198 GCAGC 0.00316 GCAGG 0.00212 GCAGT 0.00165 GCATA 0.000567 GCATC 0.00105 GCATG 0.00104 GCATT 0.00114 GCCAA 0.000918 GCCAC 0.0011 GCCAG 0.0013 GCCAT 0.000963 GCCCA 0.00127 GCCCC 0.00183 GCCCG 0.000924 GCCCT 0.0014 GCCGA 0.000382 GCCGC 0.00126 GCCGG 0.000911 GCCGT 0.000577 GCCTA 0.000394 GCCTC 0.00124 GCCTG 0.00146 GCCTT 0.00116 GCGAA 0.000222 GCGAC 0.000238 GCGAG 0.000492 GCGAT 0.000255 GCGCA 0.000525 GCGCC 0.000796 GCGCG 0.000724 GCGCT 0.000838 GCGGA 0.000539 GCGGC 0.00126 GCGGG 0.00128 GCGGT 0.000559 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000312 GCGTG 0.000631 GCGTT 0.000416 GCTAA 0.000621 GCTAC 0.000555 GCTAG 0.000378 GCTAT 0.000592 GCTCA 0.00141 GCTCC 0.00191 GCTCG 0.000573 GCTCT 0.0018 GCTGA 0.00177 GCTGC 0.00316 GCTGG 0.00206 GCTGT 0.00224 GCTTA 0.000647 GCTTC 0.00129 GCTTG 0.001 GCTTT 0.00183 GGAAA 0.0019 GGAAC 0.00091 GGAAG 0.00176 GGAAT 0.000875 GGACA 0.0011 GGACC 0.000651 GGACG 0.000479 GGACT 0.000701 GGAGA 0.00156 GGAGC 0.00191 GGAGG 0.0021 GGAGT 0.000813 GGATA 0.000515 GGATC 0.000586 GGATG 0.00134 GGATT 0.000764 GGCAA 0.000899 GGCAC 0.00135 GGCAG 0.00221 GGCAT 0.00081 GGCCA 0.000916 GGCCC 0.0011 GGCCG 0.000981 GGCCT 0.000856 GGCGA 0.000326 GGCGC 0.000796 GGCGG 0.00129 GGCGT 0.000348 GGCTA 0.000388 GGCTC 0.00134 GGCTG 0.00242 GGCTT 0.00106 GGGAA 0.00167 GGGAC 0.00107 GGGAG 0.00203 GGGAT 0.00107 GGGCA 0.00161 GGGCC 0.0011 GGGCG 0.000958 GGGCT 0.00175 GGGGA 0.00182 GGGGC 0.00183 GGGGG 0.00215 GGGGT 0.00113 GGGTA 0.000472 GGGTC 0.000688 GGGTG 0.00134 GGGTT 0.000946 GGTAA 0.000579 GGTAC 0.000467 GGTAG 0.000489 GGTAT 0.000469 GGTCA 0.000692 GGTCC 0.000651 GGTCG 0.00024 GGTCT 0.000696 GGTGA 0.00107 GGTGC 0.00134 GGTGG 0.00139 GGTGT 0.00101 GGTTA 0.000507 GGTTC 0.000649 GGTTG 0.000879 GGTTT 0.00122 GTAAA 0.000912 GTAAC 0.000603 GTAAG 0.000646 GTAAT 0.000656 GTACA 0.000752 GTACC 0.000467 GTACG 0.000197 GTACT 0.00059 GTAGA 0.000543 GTAGC 0.000555 GTAGG 0.000576 GTAGT 0.000489 GTATA 0.000446 GTATC 0.000445 GTATG 0.000593 GTATT 0.000833 GTCAA 0.0005 GTCAC 0.000836 GTCAG 0.00101 GTCAT 0.000611 GTCCA 0.000648 GTCCC 0.00107 GTCCG 0.000265 GTCCT 0.00095 GTCGA 9.24e-05 GTCGC 0.000238 GTCGG 0.000292 GTCGT 0.000192 GTCTA 0.000309 GTCTC 0.00075 GTCTG 0.00108 GTCTT 0.000803 GTGAA 0.00106 GTGAC 0.000836 GTGAG 0.00124 GTGAT 0.000877 GTGCA 0.00149 GTGCC 0.00135 GTGCG 0.000532 GTGCT 0.00193 GTGGA 0.000996 GTGGC 0.0011 GTGGG 0.00161 GTGGT 0.00106 GTGTA 0.000687 GTGTC 0.000832 GTGTG 0.00156 GTGTT 0.00123 GTTAA 0.000751 GTTAC 0.000603 GTTAG 0.00049 GTTAT 0.00062 GTTCA 0.000849 GTTCC 0.00091 GTTCG 0.000201 GTTCT 0.00112 GTTGA 0.000591 GTTGC 0.000808 GTTGG 0.000987 GTTGT 0.000953 GTTTA 0.00082 GTTTC 0.00111 GTTTG 0.0013 GTTTT 0.00181 TAAAA 0.00187 TAAAC 0.00082 TAAAG 0.00113 TAAAT 0.00128 TAACA 0.000959 TAACC 0.000507 TAACG 0.000261 TAACT 0.000737 TAAGA 0.000813 TAAGC 0.000647 TAAGG 0.000705 TAAGT 0.000646 TAATA 0.000805 TAATC 0.000493 TAATG 0.000852 TAATT 0.00104 TACAA 0.000964 TACAC 0.000687 TACAG 0.00123 TACAT 0.00084 TACCA 0.000665 TACCC 0.000472 TACCG 0.000185 TACCT 0.000682 TACGA 0.00016 TACGC 0.000171 TACGG 0.000223 TACGT 0.000274 TACTA 0.000416 TACTC 0.000496 TACTG 0.000987 TACTT 0.000846 TAGAA 0.000915 TAGAC 0.000309 TAGAG 0.000627 TAGAT 0.00052 TAGCA 0.000878 TAGCC 0.000388 TAGCG 0.000174 TAGCT 0.000705 TAGGA 0.000706 TAGGC 0.000394 TAGGG 0.000521 TAGGT 0.000449 TAGTA 0.000416 TAGTC 0.000319 TAGTG 0.000549 TAGTT 0.000596 TATAA 0.000747 TATAC 0.000446 TATAG 0.000457 TATAT 0.000921 TATCA 0.000652 TATCC 0.000515 TATCG 0.000118 TATCT 0.000746 TATGA 0.000644 TATGC 0.000567 TATGG 0.000636 TATGT 0.000734 TATTA 0.000805 TATTC 0.000699 TATTG 0.000696 TATTT 0.00184 TCAAA 0.00117 TCAAC 0.000591 TCAAG 0.000828 TCAAT 0.000609 TCACA 0.00138 TCACC 0.00107 TCACG 0.000402 TCACT 0.00116 TCAGA 0.0014 TCAGC 0.00177 TCAGG 0.0012 TCAGT 0.00132 TCATA 0.000644 TCATC 0.000896 TCATG 0.000822 TCATT 0.00117 TCCAA 0.00111 TCCAC 0.000996 TCCAG 0.00153 TCCAT 0.00112 TCCCA 0.00165 TCCCC 0.00182 TCCCG 0.000649 TCCCT 0.00172 TCCGA 0.000253 TCCGC 0.000539 TCCGG 0.000404 TCCGT 0.000398 TCCTA 0.000706 TCCTC 0.00165 TCCTG 0.00177 TCCTT 0.00165 TCGAA 0.000138 TCGAC 9.24e-05 TCGAG 0.000222 TCGAT 0.000137 TCGCA 0.00027 TCGCC 0.000326 TCGCG 0.000197 TCGCT 0.000414 TCGGA 0.000253 TCGGC 0.000382 TCGGG 0.000441 TCGGT 0.000295 TCGTA 0.00016 TCGTC 0.000191 TCGTG 0.000371 TCGTT 0.000307 TCTAA 0.000709 TCTAC 0.000543 TCTAG 0.000467 TCTAT 0.000653 TCTCA 0.00126 TCTCC 0.00156 TCTCG 0.0003 TCTCT 0.00161 TCTGA 0.0014 TCTGC 0.00198 TCTGG 0.00129 TCTGT 0.00179 TCTTA 0.000813 TCTTC 0.0014 TCTTG 0.00105 TCTTT 0.00185 TGAAA 0.00172 TGAAC 0.000849 TGAAG 0.00149 TGAAT 0.00103 TGACA 0.00111 TGACC 0.000692 TGACG 0.000293 TGACT 0.000861 TGAGA 0.00126 TGAGC 0.00141 TGAGG 0.00141 TGAGT 0.0009 TGATA 0.000652 TGATC 0.000622 TGATG 0.00117 TGATT 0.000962 TGCAA 0.00149 TGCAC 0.00149 TGCAG 0.00282 TGCAT 0.00141 TGCCA 0.0015 TGCCC 0.00161 TGCCG 0.000586 TGCCT 0.00157 TGCGA 0.00027 TGCGC 0.000525 TGCGG 0.00067 TGCGT 0.000456 TGCTA 0.000878 TGCTC 0.00183 TGCTG 0.0032 TGCTT 0.00194 TGGAA 0.00154 TGGAC 0.000648 TGGAG 0.0016 TGGAT 0.000964 TGGCA 0.0015 TGGCC 0.000916 TGGCG 0.000398 TGGCT 0.00147 TGGGA 0.00165 TGGGC 0.00127 TGGGG 0.00198 TGGGT 0.0011 TGGTA 0.000665 TGGTC 0.000638 TGGTG 0.00144 TGGTT 0.00112 TGTAA 0.00114 TGTAC 0.000752 TGTAG 0.000836 TGTAT 0.000996 TGTCA 0.00111 TGTCC 0.0011 TGTCG 0.000218 TGTCT 0.00116 TGTGA 0.00138 TGTGC 0.00182 TGTGG 0.00156 TGTGT 0.00174 TGTTA 0.000959 TGTTC 0.00117 TGTTG 0.00125 TGTTT 0.00212 TTAAA 0.00177 TTAAC 0.000751 TTAAG 0.000929 TTAAT 0.00115 TTACA 0.00114 TTACC 0.000579 TTACG 0.000214 TTACT 0.000884 TTAGA 0.000709 TTAGC 0.000621 TTAGG 0.000596 TTAGT 0.0006 TTATA 0.000747 TTATC 0.000642 TTATG 0.000735 TTATT 0.00149 TTCAA 0.0011 TTCAC 0.00106 TTCAG 0.00172 TTCAT 0.00119 TTCCA 0.00154 TTCCC 0.00167 TTCCG 0.000315 TTCCT 0.00192 TTCGA 0.000138 TTCGC 0.000222 TTCGG 0.000276 TTCGT 0.000272 TTCTA 0.000915 TTCTC 0.0015 TTCTG 0.00199 TTCTT 0.00191 TTGAA 0.0011 TTGAC 0.0005 TTGAG 0.000859 TTGAT 0.000734 TTGCA 0.00149 TTGCC 0.000899 TTGCG 0.000214 TTGCT 0.00166 TTGGA 0.00111 TTGGC 0.000918 TTGGG 0.00118 TTGGT 0.000967 TTGTA 0.000964 TTGTC 0.000828 TTGTG 0.0013 TTGTT 0.00159 TTTAA 0.00177 TTTAC 0.000912 TTTAG 0.000877 TTTAT 0.00154 TTTCA 0.00172 TTTCC 0.0019 TTTCG 0.00023 TTTCT 0.00237 TTTGA 0.00117 TTTGC 0.00152 TTTGG 0.00147 TTTGT 0.00189 TTTTA 0.00187 TTTTC 0.00212 TTTTG 0.00187 TTTTT 0.0044 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [8] # (a,c,g,t)= (0.221, 0.279, 0.279, 0.221) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.247 C 0.253 G 0.253 T 0.247 # l= 1 # Values AA 0.0725 AC 0.0508 AG 0.073 AT 0.0505 CA 0.077 CC 0.0724 CG 0.0308 CT 0.073 GA 0.0571 GC 0.0729 GG 0.0724 GT 0.0508 TA 0.0403 TC 0.0571 TG 0.077 TT 0.0725 # l= 2 # Values AAA 0.0266 AAC 0.0135 AAG 0.0181 AAT 0.0143 ACA 0.0189 ACC 0.0126 ACG 0.00624 ACT 0.0131 AGA 0.0182 AGC 0.0223 AGG 0.0194 AGT 0.0131 ATA 0.0106 ATC 0.0108 ATG 0.0148 ATT 0.0143 CAA 0.0159 CAC 0.0188 CAG 0.0275 CAT 0.0148 CCA 0.0194 CCC 0.0234 CCG 0.0103 CCT 0.0194 CGA 0.0044 CGC 0.00989 CGG 0.0103 CGT 0.00624 CTA 0.00805 CTC 0.0193 CTG 0.0275 CTT 0.0181 GAA 0.0172 GAC 0.0097 GAG 0.0193 GAT 0.0108 GCA 0.0227 GCC 0.018 GCG 0.00989 GCT 0.0223 GGA 0.0184 GGC 0.018 GGG 0.0234 GGT 0.0126 GTA 0.00885 GTC 0.00971 GTG 0.0188 GTT 0.0135 TAA 0.0128 TAC 0.00885 TAG 0.00805 TAT 0.0106 TCA 0.016 TCC 0.0184 TCG 0.0044 TCT 0.0182 TGA 0.016 TGC 0.0227 TGG 0.0194 TGT 0.0189 TTA 0.0128 TTC 0.0172 TTG 0.0159 TTT 0.0266 # l= 3 # Values AAAA 0.00989 AAAC 0.00487 AAAG 0.00628 AAAT 0.00552 AACA 0.00527 AACC 0.00325 AACG 0.00153 AACT 0.00345 AAGA 0.00489 AAGC 0.00468 AAGG 0.00502 AAGT 0.00354 AATA 0.0038 AATC 0.00262 AATG 0.00426 AATT 0.0036 ACAA 0.00449 ACAC 0.0043 ACAG 0.00656 ACAT 0.00355 ACCA 0.00384 ACCC 0.00366 ACCG 0.00158 ACCT 0.00353 ACGA 0.00105 ACGC 0.00161 ACGG 0.00194 ACGT 0.00165 ACTA 0.00174 ACTC 0.00271 ACTG 0.00508 ACTT 0.00354 AGAA 0.00606 AGAC 0.00287 AGAG 0.00585 AGAT 0.00345 AGCA 0.00791 AGCC 0.00544 AGCG 0.00267 AGCT 0.00629 AGGA 0.00582 AGGC 0.00433 AGGG 0.00572 AGGT 0.00353 AGTA 0.00256 AGTC 0.00244 AGTG 0.00463 AGTT 0.00345 ATAA 0.00343 ATAC 0.00218 ATAG 0.00214 ATAT 0.00287 ATCA 0.00328 ATCC 0.00327 ATCG 0.000804 ATCT 0.00345 ATGA 0.00338 ATGC 0.00375 ATGG 0.00412 ATGT 0.00354 ATTA 0.003 ATTC 0.00297 ATTG 0.0028 ATTT 0.00552 CAAA 0.00587 CAAC 0.00329 CAAG 0.00393 CAAT 0.0028 CACA 0.00653 CACC 0.00506 CACG 0.00255 CACT 0.00463 CAGA 0.00639 CAGC 0.0096 CAGG 0.00643 CAGT 0.00509 CATA 0.00245 CATC 0.00419 CATG 0.00389 CATT 0.00426 CCAA 0.00418 CCAC 0.00496 CCAG 0.00611 CCAT 0.00412 CCCA 0.0064 CCCC 0.00768 CCCG 0.0036 CCCT 0.00572 CCGA 0.00147 CCGC 0.00392 CCGG 0.00293 CCGT 0.00194 CCTA 0.00202 CCTC 0.00593 CCTG 0.00644 CCTT 0.00502 CGAA 0.000937 CGAC 0.000861 CGAG 0.0018 CGAT 0.000804 CGCA 0.00205 CGCC 0.00295 CGCG 0.00222 CGCT 0.00267 CGGA 0.00171 CGGC 0.00337 CGGG 0.0036 CGGT 0.00158 CGTA 0.000822 CGTC 0.00134 CGTG 0.00255 CGTT 0.00153 CTAA 0.00238 CTAC 0.00208 CTAG 0.00145 CTAT 0.00214 CTCA 0.00499 CTCC 0.00669 CTCG 0.0018 CTCT 0.00585 CTGA 0.0056 CTGC 0.00924 CTGG 0.00611 CTGT 0.00656 CTTA 0.00265 CTTC 0.00527 CTTG 0.00393 CTTT 0.00628 GAAA 0.00598 GAAC 0.00302 GAAG 0.00527 GAAT 0.00297 GACA 0.00358 GACC 0.00235 GACG 0.00134 GACT 0.00244 GAGA 0.00471 GAGC 0.00597 GAGG 0.00593 GAGT 0.00271 GATA 0.00193 GATC 0.00206 GATG 0.00419 GATT 0.00262 GCAA 0.00419 GCAC 0.00553 GCAG 0.00924 GCAT 0.00375 GCCA 0.0044 GCCC 0.00586 GCCG 0.00337 GCCT 0.00433 GCGA 0.00127 GCGC 0.00308 GCGG 0.00392 GCGT 0.00161 GCTA 0.00205 GCTC 0.00597 GCTG 0.0096 GCTT 0.00468 GGAA 0.00542 GGAC 0.00307 GGAG 0.00669 GGAT 0.00327 GGCA 0.00548 GGCC 0.0041 GGCG 0.00295 GGCT 0.00544 GGGA 0.00619 GGGC 0.00587 GGGG 0.00769 GGGT 0.00366 GGTA 0.00194 GGTC 0.00235 GGTG 0.00506 GGTT 0.00325 GTAA 0.00265 GTAC 0.00194 GTAG 0.00208 GTAT 0.00218 GTCA 0.00291 GTCC 0.00307 GTCG 0.000861 GTCT 0.00287 GTGA 0.00399 GTGC 0.00553 GTGG 0.00496 GTGT 0.0043 GTTA 0.00233 GTTC 0.00302 GTTG 0.00329 GTTT 0.00487 TAAA 0.00481 TAAC 0.00233 TAAG 0.00265 TAAT 0.003 TACA 0.00352 TACC 0.00194 TACG 0.000822 TACT 0.00256 TAGA 0.00223 TAGC 0.00205 TAGG 0.00202 TAGT 0.00174 TATA 0.00242 TATC 0.00193 TATG 0.00245 TATT 0.0038 TCAA 0.00302 TCAC 0.00399 TCAG 0.0056 TCAT 0.00338 TCCA 0.00473 TCCC 0.00619 TCCG 0.00171 TCCT 0.00582 TCGA 0.000603 TCGC 0.00127 TCGG 0.00147 TCGT 0.00105 TCTA 0.00223 TCTC 0.00471 TCTG 0.00639 TCTT 0.00489 TGAA 0.00483 TGAC 0.00291 TGAG 0.00499 TGAT 0.00328 TGCA 0.00726 TGCC 0.00548 TGCG 0.00205 TGCT 0.00791 TGGA 0.00473 TGGC 0.0044 TGGG 0.0064 TGGT 0.00384 TGTA 0.00352 TGTC 0.00358 TGTG 0.00653 TGTT 0.00527 TTAA 0.00433 TTAC 0.00266 TTAG 0.00238 TTAT 0.00343 TTCA 0.00483 TTCC 0.00542 TTCG 0.000937 TTCT 0.00606 TTGA 0.00302 TTGC 0.00419 TTGG 0.00418 TTGT 0.00449 TTTA 0.00481 TTTC 0.00598 TTTG 0.00587 TTTT 0.00989 # l= 4 # Values AAAAA 0.00429 AAAAC 0.00174 AAAAG 0.002 AAAAT 0.00187 AAACA 0.00202 AAACC 0.00121 AAACG 0.000473 AAACT 0.00116 AAAGA 0.00178 AAAGC 0.0018 AAAGG 0.00161 AAAGT 0.0011 AAATA 0.00173 AAATC 0.00107 AAATG 0.00161 AAATT 0.00111 AACAA 0.00152 AACAC 0.0012 AACAG 0.00158 AACAT 0.000972 AACCA 0.0011 AACCC 0.000983 AACCG 0.000295 AACCT 0.000881 AACGA 0.00031 AACGC 0.000431 AACGG 0.000375 AACGT 0.000416 AACTA 0.000548 AACTC 0.000775 AACTG 0.0012 AACTT 0.000927 AAGAA 0.00182 AAGAC 0.000764 AAGAG 0.00142 AAGAT 0.000885 AAGCA 0.00189 AAGCC 0.00106 AAGCG 0.000443 AAGCT 0.00129 AAGGA 0.00163 AAGGC 0.00116 AAGGG 0.00137 AAGGT 0.000865 AAGTA 0.000779 AAGTC 0.000713 AAGTG 0.00112 AAGTT 0.000927 AATAA 0.00142 AATAC 0.000778 AATAG 0.000688 AATAT 0.000915 AATCA 0.000912 AATCC 0.000752 AATCG 0.000173 AATCT 0.000786 AATGA 0.00111 AATGC 0.0011 AATGG 0.00105 AATGT 0.001 AATTA 0.000973 AATTC 0.000813 AATTG 0.0007 AATTT 0.00111 ACAAA 0.00181 ACAAC 0.000923 ACAAG 0.00102 ACAAT 0.000734 ACACA 0.00172 ACACC 0.00103 ACACG 0.000552 ACACT 0.000994 ACAGA 0.00175 ACAGC 0.00229 ACAGG 0.00134 ACAGT 0.00119 ACATA 0.000686 ACATC 0.000973 ACATG 0.000883 ACATT 0.001 ACCAA 0.000946 ACCAC 0.00107 ACCAG 0.00108 ACCAT 0.000743 ACCCA 0.00114 ACCCC 0.00125 ACCCG 0.000421 ACCCT 0.000851 ACCGA 0.00031 ACCGC 0.000603 ACCGG 0.000356 ACCGT 0.000308 ACCTA 0.000426 ACCTC 0.0011 ACCTG 0.00115 ACCTT 0.000865 ACGAA 0.000274 ACGAC 0.000198 ACGAG 0.000381 ACGAT 0.000195 ACGCA 0.000477 ACGCC 0.00037 ACGCG 0.000303 ACGCT 0.000463 ACGGA 0.000422 ACGGC 0.000624 ACGGG 0.000581 ACGGT 0.000308 ACGTA 0.000265 ACGTC 0.000325 ACGTG 0.000641 ACGTT 0.000416 ACTAA 0.000556 ACTAC 0.000458 ACTAG 0.000303 ACTAT 0.000426 ACTCA 0.000879 ACTCC 0.000815 ACTCG 0.000238 ACTCT 0.000781 ACTGA 0.00126 ACTGC 0.00165 ACTGG 0.000977 ACTGT 0.00119 ACTTA 0.000597 ACTTC 0.00103 ACTTG 0.000819 ACTTT 0.0011 AGAAA 0.00227 AGAAC 0.00108 AGAAG 0.00171 AGAAT 0.000999 AGACA 0.00112 AGACC 0.000698 AGACG 0.000305 AGACT 0.000746 AGAGA 0.00158 AGAGC 0.00185 AGAGG 0.00163 AGAGT 0.000781 AGATA 0.000702 AGATC 0.000684 AGATG 0.00128 AGATT 0.000786 AGCAA 0.00162 AGCAC 0.00198 AGCAG 0.00305 AGCAT 0.00126 AGCCA 0.00149 AGCCC 0.0019 AGCCG 0.000706 AGCCT 0.00134 AGCGA 0.000431 AGCGC 0.000902 AGCGG 0.000874 AGCGT 0.000463 AGCTA 0.000664 AGCTC 0.00175 AGCTG 0.00259 AGCTT 0.00129 AGGAA 0.00189 AGGAC 0.000966 AGGAG 0.00201 AGGAT 0.000948 AGGCA 0.00158 AGGCC 0.000879 AGGCG 0.000528 AGGCT 0.00134 AGGGA 0.00179 AGGGC 0.00149 AGGGG 0.0016 AGGGT 0.000851 AGGTA 0.00065 AGGTC 0.000684 AGGTG 0.00132 AGGTT 0.000881 AGTAA 0.000821 AGTAC 0.000555 AGTAG 0.00058 AGTAT 0.000605 AGTCA 0.000822 AGTCC 0.000701 AGTCG 0.000172 AGTCT 0.000746 AGTGA 0.00113 AGTGC 0.00141 AGTGG 0.0011 AGTGT 0.000994 AGTTA 0.000682 AGTTC 0.00082 AGTTG 0.000792 AGTTT 0.00116 ATAAA 0.00146 ATAAC 0.000587 ATAAG 0.000625 ATAAT 0.000752 ATACA 0.000932 ATACC 0.000448 ATACG 0.000193 ATACT 0.000605 ATAGA 0.000618 ATAGC 0.000568 ATAGG 0.000524 ATAGT 0.000426 ATATA 0.000873 ATATC 0.000488 ATATG 0.000593 ATATT 0.000915 ATCAA 0.000691 ATCAC 0.000861 ATCAG 0.00103 ATCAT 0.000694 ATCCA 0.000945 ATCCC 0.00114 ATCCG 0.000234 ATCCT 0.000948 ATCGA 0.000139 ATCGC 0.00027 ATCGG 0.000201 ATCGT 0.000195 ATCTA 0.000484 ATCTC 0.000939 ATCTG 0.00115 ATCTT 0.000885 ATGAA 0.00113 ATGAC 0.000586 ATGAG 0.000974 ATGAT 0.000694 ATGCA 0.00138 ATGCC 0.000815 ATGCG 0.000285 ATGCT 0.00126 ATGGA 0.00111 ATGGC 0.000978 ATGGG 0.00128 ATGGT 0.000743 ATGTA 0.000785 ATGTC 0.000656 ATGTG 0.00113 ATGTT 0.000972 ATTAA 0.00108 ATTAC 0.000616 ATTAG 0.000548 ATTAT 0.000752 ATTCA 0.000973 ATTCC 0.000854 ATTCG 0.000142 ATTCT 0.000999 ATTGA 0.000577 ATTGC 0.00085 ATTGG 0.000639 ATTGT 0.000734 ATTTA 0.0012 ATTTC 0.00132 ATTTG 0.00114 ATTTT 0.00187 CAAAA 0.0018 CAAAC 0.00127 CAAAG 0.00166 CAAAT 0.00114 CAACA 0.00121 CAACC 0.000889 CAACG 0.000392 CAACT 0.000792 CAAGA 0.001 CAAGC 0.00099 CAAGG 0.00112 CAAGT 0.000819 CAATA 0.000659 CAATC 0.000541 CAATG 0.000899 CAATT 0.0007 CACAA 0.00127 CACAC 0.00159 CACAG 0.00254 CACAT 0.00113 CACCA 0.00148 CACCC 0.00146 CACCG 0.000806 CACCT 0.00132 CACGA 0.000383 CACGC 0.000676 CACGG 0.000855 CACGT 0.000641 CACTA 0.00052 CACTC 0.00094 CACTG 0.00205 CACTT 0.00112 CAGAA 0.00191 CAGAC 0.00107 CAGAG 0.00227 CAGAT 0.00115 CAGCA 0.00329 CAGCC 0.00257 CAGCG 0.00115 CAGCT 0.00259 CAGGA 0.00181 CAGGC 0.0015 CAGGG 0.00197 CAGGT 0.00115 CAGTA 0.00093 CAGTC 0.000904 CAGTG 0.00205 CAGTT 0.0012 CATAA 0.000692 CATAC 0.000563 CATAG 0.000604 CATAT 0.000593 CATCA 0.00115 CATCC 0.00141 CATCG 0.000341 CATCT 0.00128 CATGA 0.000793 CATGC 0.00104 CATGG 0.00117 CATGT 0.000883 CATTA 0.000803 CATTC 0.000948 CATTG 0.000899 CATTT 0.00161 CCAAA 0.00147 CCAAC 0.001 CCAAG 0.00108 CCAAT 0.000639 CCACA 0.00159 CCACC 0.00148 CCACG 0.000785 CCACT 0.0011 CCAGA 0.00129 CCAGC 0.00218 CCAGG 0.00166 CCAGT 0.000977 CCATA 0.000627 CCATC 0.00127 CCATG 0.00117 CCATT 0.00105 CCCAA 0.00123 CCCAC 0.00174 CCCAG 0.00214 CCCAT 0.00128 CCCCA 0.00219 CCCCC 0.00243 CCCCG 0.00147 CCCCT 0.0016 CCCGA 0.000483 CCCGC 0.00139 CCCGG 0.00114 CCCGT 0.000581 CCCTA 0.000531 CCCTC 0.00185 CCCTG 0.00197 CCCTT 0.00137 CCGAA 0.000291 CCGAC 0.000317 CCGAG 0.000662 CCGAT 0.000201 CCGCA 0.00073 CCGCC 0.00138 CCGCG 0.000938 CCGCT 0.000874 CCGGA 0.00044 CCGGC 0.000997 CCGGG 0.00114 CCGGT 0.000356 CCGTA 0.00023 CCGTC 0.000478 CCGTG 0.000855 CCGTT 0.000375 CCTAA 0.000573 CCTAC 0.000569 CCTAG 0.000353 CCTAT 0.000524 CCTCA 0.00143 CCTCC 0.00224 CCTCG 0.000633 CCTCT 0.00163 CCTGA 0.0012 CCTGC 0.00224 CCTGG 0.00166 CCTGT 0.00134 CCTTA 0.000681 CCTTC 0.00162 CCTTG 0.00112 CCTTT 0.00161 CGAAA 0.000237 CGAAC 0.000209 CGAAG 0.000348 CGAAT 0.000142 CGACA 0.000226 CGACC 0.000258 CGACG 0.000205 CGACT 0.000172 CGAGA 0.000312 CGAGC 0.000613 CGAGG 0.000633 CGAGT 0.000238 CGATA 0.000117 CGATC 0.000173 CGATG 0.000341 CGATT 0.000173 CGCAA 0.000221 CGCAC 0.000572 CGCAG 0.000975 CGCAT 0.000285 CGCCA 0.000422 CGCCC 0.00104 CGCCG 0.000966 CGCCT 0.000528 CGCGA 0.00021 CGCGC 0.000765 CGCGG 0.000938 CGCGT 0.000303 CGCTA 0.000175 CGCTC 0.000898 CGCTG 0.00115 CGCTT 0.000443 CGGAA 0.000327 CGGAC 0.000286 CGGAG 0.000865 CGGAT 0.000234 CGGCA 0.000635 CGGCC 0.00107 CGGCG 0.000966 CGGCT 0.000706 CGGGA 0.000706 CGGGC 0.001 CGGGG 0.00147 CGGGT 0.000421 CGGTA 0.00019 CGGTC 0.000287 CGGTG 0.000806 CGGTT 0.000295 CGTAA 0.000209 CGTAC 0.000198 CGTAG 0.000221 CGTAT 0.000193 CGTCA 0.000302 CGTCC 0.000525 CGTCG 0.000205 CGTCT 0.000305 CGTGA 0.000414 CGTGC 0.000801 CGTGG 0.000785 CGTGT 0.000552 CGTTA 0.000258 CGTTC 0.000408 CGTTG 0.000392 CGTTT 0.000473 CTAAA 0.000826 CTAAC 0.000462 CTAAG 0.000543 CTAAT 0.000548 CTACA 0.0008 CTACC 0.000476 CTACG 0.000221 CTACT 0.00058 CTAGA 0.000438 CTAGC 0.00036 CTAGG 0.000353 CTAGT 0.000303 CTATA 0.000433 CTATC 0.000412 CTATG 0.000604 CTATT 0.000688 CTCAA 0.000828 CTCAC 0.00126 CTCAG 0.00192 CTCAT 0.000974 CTCCA 0.00165 CTCCC 0.00217 CTCCG 0.000865 CTCCT 0.00201 CTCGA 0.00023 CTCGC 0.000522 CTCGG 0.000662 CTCGT 0.000381 CTCTA 0.000603 CTCTC 0.00156 CTCTG 0.00227 CTCTT 0.00142 CTGAA 0.00165 CTGAC 0.001 CTGAG 0.00192 CTGAT 0.00103 CTGCA 0.00289 CTGCC 0.00233 CTGCG 0.000975 CTGCT 0.00305 CTGGA 0.00153 CTGGC 0.00135 CTGGG 0.00214 CTGGT 0.00108 CTGTA 0.00118 CTGTC 0.00127 CTGTG 0.00254 CTGTT 0.00158 CTTAA 0.00087 CTTAC 0.000611 CTTAG 0.000543 CTTAT 0.000625 CTTCA 0.00143 CTTCC 0.00178 CTTCG 0.000348 CTTCT 0.00171 CTTGA 0.000784 CTTGC 0.00105 CTTGG 0.00108 CTTGT 0.00102 CTTTA 0.00108 CTTTC 0.00155 CTTTG 0.00166 CTTTT 0.002 GAAAA 0.00204 GAAAC 0.00108 GAAAG 0.00155 GAAAT 0.00132 GAACA 0.00113 GAACC 0.000661 GAACG 0.000408 GAACT 0.00082 GAAGA 0.00135 GAAGC 0.00128 GAAGG 0.00162 GAAGT 0.00103 GAATA 0.000656 GAATC 0.000551 GAATG 0.000948 GAATT 0.000813 GACAA 0.000801 GACAC 0.000851 GACAG 0.00127 GACAT 0.000656 GACCA 0.000635 GACCC 0.000748 GACCG 0.000287 GACCT 0.000684 GACGA 0.000198 GACGC 0.000335 GACGG 0.000478 GACGT 0.000325 GACTA 0.000296 GACTC 0.000527 GACTG 0.000904 GACTT 0.000713 GAGAA 0.00146 GAGAC 0.000751 GAGAG 0.00156 GAGAT 0.000939 GAGCA 0.00189 GAGCC 0.00143 GAGCG 0.000898 GAGCT 0.00175 GAGGA 0.0017 GAGGC 0.00129 GAGGG 0.00185 GAGGT 0.0011 GAGTA 0.00047 GAGTC 0.000527 GAGTG 0.00094 GAGTT 0.000775 GATAA 0.00061 GATAC 0.000422 GATAG 0.000412 GATAT 0.000488 GATCA 0.000601 GATCC 0.000602 GATCG 0.000173 GATCT 0.000684 GATGA 0.000876 GATGC 0.00107 GATGG 0.00127 GATGT 0.000973 GATTA 0.000463 GATTC 0.000551 GATTG 0.000541 GATTT 0.00107 GCAAA 0.00149 GCAAC 0.000798 GCAAG 0.00105 GCAAT 0.00085 GCACA 0.00187 GCACC 0.00144 GCACG 0.000801 GCACT 0.00141 GCAGA 0.00201 GCAGC 0.00335 GCAGG 0.00224 GCAGT 0.00165 GCATA 0.000535 GCATC 0.00107 GCATG 0.00104 GCATT 0.0011 GCCAA 0.000926 GCCAC 0.00115 GCCAG 0.00135 GCCAT 0.000978 GCCCA 0.00134 GCCCC 0.00203 GCCCG 0.001 GCCCT 0.00149 GCCGA 0.00041 GCCGC 0.00134 GCCGG 0.000997 GCCGT 0.000624 GCCTA 0.000381 GCCTC 0.00129 GCCTG 0.0015 GCCTT 0.00116 GCGAA 0.000232 GCGAC 0.000251 GCGAG 0.000522 GCGAT 0.00027 GCGCA 0.000562 GCGCC 0.000851 GCGCG 0.000765 GCGCT 0.000902 GCGGA 0.000582 GCGGC 0.00134 GCGGG 0.00139 GCGGT 0.000603 GCGTA 0.000171 GCGTC 0.000335 GCGTG 0.000676 GCGTT 0.000431 GCTAA 0.000589 GCTAC 0.000535 GCTAG 0.00036 GCTAT 0.000568 GCTCA 0.00146 GCTCC 0.00205 GCTCG 0.000613 GCTCT 0.00185 GCTGA 0.00179 GCTGC 0.00335 GCTGG 0.00218 GCTGT 0.00229 GCTTA 0.000612 GCTTC 0.00128 GCTTG 0.00099 GCTTT 0.0018 GGAAA 0.00187 GGAAC 0.00092 GGAAG 0.00178 GGAAT 0.000854 GGACA 0.00114 GGACC 0.000698 GGACG 0.000525 GGACT 0.000701 GGAGA 0.00159 GGAGC 0.00205 GGAGG 0.00224 GGAGT 0.000815 GGATA 0.000503 GGATC 0.000602 GGATG 0.00141 GGATT 0.000752 GGCAA 0.000895 GGCAC 0.00144 GGCAG 0.00233 GGCAT 0.000815 GGCCA 0.00096 GGCCC 0.00119 GGCCG 0.00107 GGCCT 0.000879 GGCGA 0.000351 GGCGC 0.000851 GGCGG 0.00138 GGCGT 0.00037 GGCTA 0.000378 GGCTC 0.00143 GGCTG 0.00257 GGCTT 0.00106 GGGAA 0.00171 GGGAC 0.00117 GGGAG 0.00217 GGGAT 0.00114 GGGCA 0.00174 GGGCC 0.00119 GGGCG 0.00104 GGGCT 0.0019 GGGGA 0.00198 GGGGC 0.00203 GGGGG 0.00243 GGGGT 0.00125 GGGTA 0.000474 GGGTC 0.000748 GGGTG 0.00146 GGGTT 0.000983 GGTAA 0.000555 GGTAC 0.000465 GGTAG 0.000476 GGTAT 0.000448 GGTCA 0.000699 GGTCC 0.000698 GGTCG 0.000258 GGTCT 0.000698 GGTGA 0.0011 GGTGC 0.00144 GGTGG 0.00148 GGTGT 0.00103 GGTTA 0.000492 GGTTC 0.000661 GGTTG 0.000889 GGTTT 0.00121 GTAAA 0.000857 GTAAC 0.000571 GTAAG 0.000611 GTAAT 0.000616 GTACA 0.000719 GTACC 0.000465 GTACG 0.000198 GTACT 0.000555 GTAGA 0.000515 GTAGC 0.000535 GTAGG 0.000569 GTAGT 0.000458 GTATA 0.000414 GTATC 0.000422 GTATG 0.000563 GTATT 0.000778 GTCAA 0.000475 GTCAC 0.000843 GTCAG 0.001 GTCAT 0.000586 GTCCA 0.000645 GTCCC 0.00117 GTCCG 0.000286 GTCCT 0.000966 GTCGA 9.48e-05 GTCGC 0.000251 GTCGG 0.000317 GTCGT 0.000198 GTCTA 0.000289 GTCTC 0.000751 GTCTG 0.00107 GTCTT 0.000764 GTGAA 0.00102 GTGAC 0.000843 GTGAG 0.00126 GTGAT 0.000861 GTGCA 0.00153 GTGCC 0.00144 GTGCG 0.000572 GTGCT 0.00198 GTGGA 0.000997 GTGGC 0.00115 GTGGG 0.00174 GTGGT 0.00107 GTGTA 0.000654 GTGTC 0.000851 GTGTG 0.00159 GTGTT 0.0012 GTTAA 0.00071 GTTAC 0.000571 GTTAG 0.000462 GTTAT 0.000587 GTTCA 0.000813 GTTCC 0.00092 GTTCG 0.000209 GTTCT 0.00108 GTTGA 0.000565 GTTGC 0.000798 GTTGG 0.001 GTTGT 0.000923 GTTTA 0.000774 GTTTC 0.00108 GTTTG 0.00127 GTTTT 0.00174 TAAAA 0.00176 TAAAC 0.000774 TAAAG 0.00108 TAAAT 0.0012 TAACA 0.000898 TAACC 0.000492 TAACG 0.000258 TAACT 0.000682 TAAGA 0.000759 TAAGC 0.000612 TAAGG 0.000681 TAAGT 0.000597 TAATA 0.000757 TAATC 0.000463 TAATG 0.000803 TAATT 0.000973 TACAA 0.000905 TACAC 0.000654 TACAG 0.00118 TACAT 0.000785 TACCA 0.000631 TACCC 0.000474 TACCG 0.00019 TACCT 0.00065 TACGA 0.000157 TACGC 0.000171 TACGG 0.00023 TACGT 0.000265 TACTA 0.000381 TACTC 0.00047 TACTG 0.00093 TACTT 0.000779 TAGAA 0.000857 TAGAC 0.000289 TAGAG 0.000603 TAGAT 0.000484 TAGCA 0.000835 TAGCC 0.000378 TAGCG 0.000175 TAGCT 0.000664 TAGGA 0.000681 TAGGC 0.000381 TAGGG 0.000531 TAGGT 0.000426 TAGTA 0.000381 TAGTC 0.000296 TAGTG 0.00052 TAGTT 0.000548 TATAA 0.0007 TATAC 0.000414 TATAG 0.000433 TATAT 0.000873 TATCA 0.00061 TATCC 0.000503 TATCG 0.000117 TATCT 0.000702 TATGA 0.000605 TATGC 0.000535 TATGG 0.000627 TATGT 0.000686 TATTA 0.000757 TATTC 0.000656 TATTG 0.000659 TATTT 0.00173 TCAAA 0.0011 TCAAC 0.000565 TCAAG 0.000784 TCAAT 0.000577 TCACA 0.00135 TCACC 0.0011 TCACG 0.000414 TCACT 0.00113 TCAGA 0.00135 TCAGC 0.00179 TCAGG 0.0012 TCAGT 0.00126 TCATA 0.000605 TCATC 0.000876 TCATG 0.000793 TCATT 0.00111 TCCAA 0.00108 TCCAC 0.000997 TCCAG 0.00153 TCCAT 0.00111 TCCCA 0.00172 TCCCC 0.00198 TCCCG 0.000706 TCCCT 0.00179 TCCGA 0.000269 TCCGC 0.000582 TCCGG 0.00044 TCCGT 0.000422 TCCTA 0.000681 TCCTC 0.0017 TCCTG 0.00181 TCCTT 0.00163 TCGAA 0.00014 TCGAC 9.48e-05 TCGAG 0.00023 TCGAT 0.000139 TCGCA 0.000283 TCGCC 0.000351 TCGCG 0.00021 TCGCT 0.000431 TCGGA 0.000269 TCGGC 0.00041 TCGGG 0.000483 TCGGT 0.00031 TCGTA 0.000157 TCGTC 0.000198 TCGTG 0.000383 TCGTT 0.00031 TCTAA 0.000662 TCTAC 0.000515 TCTAG 0.000438 TCTAT 0.000618 TCTCA 0.00122 TCTCC 0.00159 TCTCG 0.000312 TCTCT 0.00158 TCTGA 0.00135 TCTGC 0.00201 TCTGG 0.00129 TCTGT 0.00175 TCTTA 0.000759 TCTTC 0.00135 TCTTG 0.001 TCTTT 0.00178 TGAAA 0.00161 TGAAC 0.000813 TGAAG 0.00143 TGAAT 0.000973 TGACA 0.00108 TGACC 0.000699 TGACG 0.000302 TGACT 0.000822 TGAGA 0.00122 TGAGC 0.00146 TGAGG 0.00143 TGAGT 0.000879 TGATA 0.00061 TGATC 0.000601 TGATG 0.00115 TGATT 0.000912 TGCAA 0.00145 TGCAC 0.00153 TGCAG 0.00289 TGCAT 0.00138 TGCCA 0.00153 TGCCC 0.00174 TGCCG 0.000635 TGCCT 0.00158 TGCGA 0.000283 TGCGC 0.000562 TGCGG 0.00073 TGCGT 0.000477 TGCTA 0.000835 TGCTC 0.00189 TGCTG 0.00329 TGCTT 0.00189 TGGAA 0.00149 TGGAC 0.000645 TGGAG 0.00165 TGGAT 0.000945 TGGCA 0.00153 TGGCC 0.00096 TGGCG 0.000422 TGGCT 0.00149 TGGGA 0.00172 TGGGC 0.00134 TGGGG 0.00219 TGGGT 0.00114 TGGTA 0.000631 TGGTC 0.000635 TGGTG 0.00148 TGGTT 0.0011 TGTAA 0.00107 TGTAC 0.000719 TGTAG 0.0008 TGTAT 0.000932 TGTCA 0.00108 TGTCC 0.00114 TGTCG 0.000226 TGTCT 0.00112 TGTGA 0.00135 TGTGC 0.00187 TGTGG 0.00159 TGTGT 0.00172 TGTTA 0.000898 TGTTC 0.00113 TGTTG 0.00121 TGTTT 0.00202 TTAAA 0.00167 TTAAC 0.00071 TTAAG 0.00087 TTAAT 0.00108 TTACA 0.00107 TTACC 0.000555 TTACG 0.000209 TTACT 0.000821 TTAGA 0.000662 TTAGC 0.000589 TTAGG 0.000573 TTAGT 0.000556 TTATA 0.0007 TTATC 0.00061 TTATG 0.000692 TTATT 0.00142 TTCAA 0.00103 TTCAC 0.00102 TTCAG 0.00165 TTCAT 0.00113 TTCCA 0.00149 TTCCC 0.00171 TTCCG 0.000327 TTCCT 0.00189 TTCGA 0.00014 TTCGC 0.000232 TTCGG 0.000291 TTCGT 0.000274 TTCTA 0.000857 TTCTC 0.00146 TTCTG 0.00191 TTCTT 0.00182 TTGAA 0.00103 TTGAC 0.000475 TTGAG 0.000828 TTGAT 0.000691 TTGCA 0.00145 TTGCC 0.000895 TTGCG 0.000221 TTGCT 0.00162 TTGGA 0.00108 TTGGC 0.000926 TTGGG 0.00123 TTGGT 0.000946 TTGTA 0.000905 TTGTC 0.000801 TTGTG 0.00127 TTGTT 0.00152 TTTAA 0.00167 TTTAC 0.000857 TTTAG 0.000826 TTTAT 0.00146 TTTCA 0.00161 TTTCC 0.00187 TTTCG 0.000237 TTTCT 0.00227 TTTGA 0.0011 TTTGC 0.00149 TTTGG 0.00147 TTTGT 0.00181 TTTTA 0.00176 TTTTC 0.00204 TTTTG 0.0018 TTTTT 0.00429 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [9] # (a,c,g,t)= (0.211, 0.289, 0.289, 0.211) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.243 C 0.257 G 0.257 T 0.243 # l= 1 # Values AA 0.0706 AC 0.0505 AG 0.0728 AT 0.0493 CA 0.0769 CC 0.0749 CG 0.0322 CT 0.0728 GA 0.0568 GC 0.0746 GG 0.0749 GT 0.0505 TA 0.0389 TC 0.0568 TG 0.0769 TT 0.0706 # l= 2 # Values AAA 0.0258 AAC 0.0132 AAG 0.0177 AAT 0.0138 ACA 0.0186 ACC 0.0128 ACG 0.00641 ACT 0.0127 AGA 0.0179 AGC 0.0226 AGG 0.0196 AGT 0.0127 ATA 0.0102 ATC 0.0107 ATG 0.0146 ATT 0.0138 CAA 0.0156 CAC 0.019 CAG 0.0277 CAT 0.0146 CCA 0.0197 CCC 0.0248 CCG 0.0109 CCT 0.0196 CGA 0.00454 CGC 0.0104 CGG 0.0109 CGT 0.00641 CTA 0.00777 CTC 0.0196 CTG 0.0277 CTT 0.0177 GAA 0.0169 GAC 0.00974 GAG 0.0196 GAT 0.0107 GCA 0.023 GCC 0.0186 GCG 0.0104 GCT 0.0226 GGA 0.0187 GGC 0.0186 GGG 0.0248 GGT 0.0128 GTA 0.00855 GTC 0.00974 GTG 0.019 GTT 0.0132 TAA 0.0123 TAC 0.00855 TAG 0.00777 TAT 0.0102 TCA 0.0157 TCC 0.0187 TCG 0.00454 TCT 0.0179 TGA 0.0157 TGC 0.023 TGG 0.0197 TGT 0.0186 TTA 0.0123 TTC 0.0169 TTG 0.0156 TTT 0.0258 # l= 3 # Values AAAA 0.00963 AAAC 0.00474 AAAG 0.00614 AAAT 0.00533 AACA 0.0051 AACC 0.00324 AACG 0.00154 AACT 0.00332 AAGA 0.00472 AAGC 0.00461 AAGG 0.00498 AAGT 0.0034 AATA 0.00367 AATC 0.00255 AATG 0.00414 AATT 0.00346 ACAA 0.00436 ACAC 0.00427 ACAG 0.00652 ACAT 0.00345 ACCA 0.00381 ACCC 0.00382 ACCG 0.00166 ACCT 0.00349 ACGA 0.00105 ACGC 0.00167 ACGG 0.00204 ACGT 0.00165 ACTA 0.00167 ACTC 0.00267 ACTG 0.00499 ACTT 0.0034 AGAA 0.00587 AGAC 0.00282 AGAG 0.00583 AGAT 0.00335 AGCA 0.00792 AGCC 0.0056 AGCG 0.00279 AGCT 0.00628 AGGA 0.00582 AGGC 0.00435 AGGG 0.00592 AGGT 0.00349 AGTA 0.00245 AGTC 0.00238 AGTG 0.00459 AGTT 0.00332 ATAA 0.00331 ATAC 0.00209 ATAG 0.00207 ATAT 0.00277 ATCA 0.00319 ATCC 0.00331 ATCG 0.000821 ATCT 0.00335 ATGA 0.00328 ATGC 0.00372 ATGG 0.00416 ATGT 0.00345 ATTA 0.00289 ATTC 0.00287 ATTG 0.00273 ATTT 0.00533 CAAA 0.00574 CAAC 0.00324 CAAG 0.00384 CAAT 0.00273 CACA 0.00653 CACC 0.00523 CACG 0.00266 CACT 0.00459 CAGA 0.00633 CAGC 0.00985 CAGG 0.00656 CAGT 0.00499 CATA 0.00238 CATC 0.00422 CATG 0.00386 CATT 0.00414 CCAA 0.00417 CCAC 0.0051 CCAG 0.00623 CCAT 0.00416 CCCA 0.00669 CCCC 0.00829 CCCG 0.00386 CCCT 0.00592 CCGA 0.00155 CCGC 0.00415 CCGG 0.00316 CCGT 0.00204 CCTA 0.00198 CCTC 0.00607 CCTG 0.00656 CCTT 0.00498 CGAA 0.000955 CGAC 0.000894 CGAG 0.00187 CGAT 0.000821 CGCA 0.00215 CGCC 0.0031 CGCG 0.00233 CGCT 0.00279 CGGA 0.0018 CGGC 0.00358 CGGG 0.00386 CGGT 0.00166 CGTA 0.000817 CGTC 0.00139 CGTG 0.00266 CGTT 0.00154 CTAA 0.00229 CTAC 0.00202 CTAG 0.00139 CTAT 0.00207 CTCA 0.00497 CTCC 0.0069 CTCG 0.00187 CTCT 0.00583 CTGA 0.00553 CTGC 0.00946 CTGG 0.00623 CTGT 0.00652 CTTA 0.00254 CTTC 0.0052 CTTG 0.00384 CTTT 0.00614 GAAA 0.00582 GAAC 0.00298 GAAG 0.0052 GAAT 0.00287 GACA 0.00356 GACC 0.0024 GACG 0.00139 GACT 0.00238 GAGA 0.00467 GAGC 0.00615 GAGG 0.00606 GAGT 0.00267 GATA 0.00187 GATC 0.00204 GATG 0.00422 GATT 0.00255 GCAA 0.00412 GCAC 0.00568 GCAG 0.00946 GCAT 0.00372 GCCA 0.00448 GCCC 0.00621 GCCG 0.00358 GCCT 0.00435 GCGA 0.00132 GCGC 0.00323 GCGG 0.00415 GCGT 0.00167 GCTA 0.00198 GCTC 0.00615 GCTG 0.00985 GCTT 0.00461 GGAA 0.00538 GGAC 0.00316 GGAG 0.0069 GGAT 0.00331 GGCA 0.00563 GGCC 0.00428 GGCG 0.0031 GGCT 0.0056 GGGA 0.00644 GGGC 0.00621 GGGG 0.00829 GGGT 0.00382 GGTA 0.0019 GGTC 0.0024 GGTG 0.00524 GGTT 0.00324 GTAA 0.00255 GTAC 0.00189 GTAG 0.00202 GTAT 0.00209 GTCA 0.00286 GTCC 0.00316 GTCG 0.000894 GTCT 0.00282 GTGA 0.00396 GTGC 0.00568 GTGG 0.0051 GTGT 0.00427 GTTA 0.00224 GTTC 0.00298 GTTG 0.00324 GTTT 0.00474 TAAA 0.00465 TAAC 0.00224 TAAG 0.00254 TAAT 0.00289 TACA 0.00339 TACC 0.0019 TACG 0.000817 TACT 0.00245 TAGA 0.00214 TAGC 0.00198 TAGG 0.00198 TAGT 0.00167 TATA 0.00233 TATC 0.00187 TATG 0.00238 TATT 0.00367 TCAA 0.00291 TCAC 0.00396 TCAG 0.00553 TCAT 0.00328 TCCA 0.00468 TCCC 0.00644 TCCG 0.0018 TCCT 0.00582 TCGA 0.000611 TCGC 0.00132 TCGG 0.00155 TCGT 0.00105 TCTA 0.00214 TCTC 0.00467 TCTG 0.00633 TCTT 0.00472 TGAA 0.00466 TGAC 0.00286 TGAG 0.00497 TGAT 0.00319 TGCA 0.00727 TGCC 0.00563 TGCG 0.00215 TGCT 0.00792 TGGA 0.00468 TGGC 0.00448 TGGG 0.00669 TGGT 0.0038 TGTA 0.00339 TGTC 0.00356 TGTG 0.00653 TGTT 0.00511 TTAA 0.00417 TTAC 0.00255 TTAG 0.00229 TTAT 0.00331 TTCA 0.00466 TTCC 0.00538 TTCG 0.000956 TTCT 0.00587 TTGA 0.00291 TTGC 0.00412 TTGG 0.00417 TTGT 0.00436 TTTA 0.00465 TTTC 0.00582 TTTG 0.00574 TTTT 0.00963 # l= 4 # Values AAAAA 0.0042 AAAAC 0.00169 AAAAG 0.00194 AAAAT 0.0018 AAACA 0.00196 AAACC 0.0012 AAACG 0.000474 AAACT 0.00111 AAAGA 0.00172 AAAGC 0.00177 AAAGG 0.00159 AAAGT 0.00106 AAATA 0.00167 AAATC 0.00104 AAATG 0.00155 AAATT 0.00106 AACAA 0.00147 AACAC 0.00117 AACAG 0.00153 AACAT 0.000934 AACCA 0.00108 AACCC 0.001 AACCG 0.000301 AACCT 0.00086 AACGA 0.00031 AACGC 0.000439 AACGG 0.000385 AACGT 0.00041 AACTA 0.000522 AACTC 0.000755 AACTG 0.00115 AACTT 0.000887 AAGAA 0.00175 AAGAC 0.000734 AAGAG 0.00138 AAGAT 0.000849 AAGCA 0.00185 AAGCC 0.00106 AAGCG 0.000452 AAGCT 0.00125 AAGGA 0.0016 AAGGC 0.00115 AAGGG 0.00139 AAGGT 0.000842 AAGTA 0.00074 AAGTC 0.000688 AAGTG 0.00109 AAGTT 0.000887 AATAA 0.00138 AATAC 0.000745 AATAG 0.000664 AATAT 0.000879 AATCA 0.00088 AATCC 0.000741 AATCG 0.000173 AATCT 0.000755 AATGA 0.00107 AATGC 0.00108 AATGG 0.00103 AATGT 0.000964 AATTA 0.000939 AATTC 0.000781 AATTG 0.000674 AATTT 0.00106 ACAAA 0.00176 ACAAC 0.0009 ACAAG 0.00099 ACAAT 0.000709 ACACA 0.00169 ACACC 0.00105 ACACG 0.000564 ACACT 0.000968 ACAGA 0.00171 ACAGC 0.00231 ACAGG 0.00133 ACAGT 0.00116 ACATA 0.000659 ACATC 0.000962 ACATG 0.00086 ACATT 0.000964 ACCAA 0.000929 ACCAC 0.00107 ACCAG 0.00107 ACCAT 0.00073 ACCCA 0.00117 ACCCC 0.00134 ACCCG 0.000447 ACCCT 0.000869 ACCGA 0.00032 ACCGC 0.000639 ACCGG 0.00038 ACCGT 0.000319 ACCTA 0.000409 ACCTC 0.0011 ACCTG 0.00114 ACCTT 0.000842 ACGAA 0.000274 ACGAC 0.0002 ACGAG 0.000388 ACGAT 0.000193 ACGCA 0.000492 ACGCC 0.000386 ACGCG 0.000318 ACGCT 0.000472 ACGGA 0.000441 ACGGC 0.000663 ACGGG 0.000621 ACGGT 0.000319 ACGTA 0.000258 ACGTC 0.000331 ACGTG 0.000648 ACGTT 0.00041 ACTAA 0.000531 ACTAC 0.000441 ACTAG 0.000287 ACTAT 0.000408 ACTCA 0.000861 ACTCC 0.000813 ACTCG 0.000242 ACTCT 0.000758 ACTGA 0.00122 ACTGC 0.00165 ACTGG 0.000965 ACTGT 0.00116 ACTTA 0.000567 ACTTC 0.000994 ACTTG 0.000783 ACTTT 0.00106 AGAAA 0.00219 AGAAC 0.00105 AGAAG 0.00167 AGAAT 0.000957 AGACA 0.0011 AGACC 0.000698 AGACG 0.000309 AGACT 0.000716 AGAGA 0.00155 AGAGC 0.00188 AGAGG 0.00164 AGAGT 0.000758 AGATA 0.000675 AGATC 0.000665 AGATG 0.00126 AGATT 0.000755 AGCAA 0.00158 AGCAC 0.00202 AGCAG 0.00308 AGCAT 0.00124 AGCCA 0.0015 AGCCC 0.00201 AGCCG 0.000747 AGCCT 0.00134 AGCGA 0.000441 AGCGC 0.000951 AGCGG 0.000928 AGCGT 0.000472 AGCTA 0.000633 AGCTC 0.00178 AGCTG 0.00261 AGCTT 0.00125 AGGAA 0.00186 AGGAC 0.000973 AGGAG 0.00204 AGGAT 0.000944 AGGCA 0.00158 AGGCC 0.000888 AGGCG 0.000544 AGGCT 0.00134 AGGGA 0.00182 AGGGC 0.00155 AGGGG 0.00168 AGGGT 0.000869 AGGTA 0.000626 AGGTC 0.00068 AGGTG 0.00133 AGGTT 0.00086 AGTAA 0.000781 AGTAC 0.000533 AGTAG 0.000556 AGTAT 0.000577 AGTCA 0.000794 AGTCC 0.000697 AGTCG 0.000174 AGTCT 0.000716 AGTGA 0.0011 AGTGC 0.00142 AGTGG 0.0011 AGTGT 0.000968 AGTTA 0.000648 AGTTC 0.000793 AGTTG 0.000765 AGTTT 0.00111 ATAAA 0.00142 ATAAC 0.000565 ATAAG 0.000602 ATAAT 0.000726 ATACA 0.000891 ATACC 0.000434 ATACG 0.000189 ATACT 0.000577 ATAGA 0.000595 ATAGC 0.000553 ATAGG 0.000517 ATAGT 0.000408 ATATA 0.000843 ATATC 0.000472 ATATG 0.000572 ATATT 0.000879 ATCAA 0.000664 ATCAC 0.00085 ATCAG 0.00101 ATCAT 0.000669 ATCCA 0.000927 ATCCC 0.00119 ATCCG 0.000245 ATCCT 0.000944 ATCGA 0.00014 ATCGC 0.000281 ATCGG 0.000208 ATCGT 0.000193 ATCTA 0.000462 ATCTC 0.000925 ATCTG 0.00112 ATCTT 0.000849 ATGAA 0.00108 ATGAC 0.000569 ATGAG 0.00096 ATGAT 0.000669 ATGCA 0.00136 ATGCC 0.000816 ATGCG 0.000294 ATGCT 0.00124 ATGGA 0.00111 ATGGC 0.000987 ATGGG 0.00133 ATGGT 0.00073 ATGTA 0.000753 ATGTC 0.000646 ATGTG 0.00111 ATGTT 0.000934 ATTAA 0.00104 ATTAC 0.000592 ATTAG 0.000526 ATTAT 0.000726 ATTCA 0.000935 ATTCC 0.000838 ATTCG 0.000142 ATTCT 0.000957 ATTGA 0.000557 ATTGC 0.000835 ATTGG 0.000632 ATTGT 0.000709 ATTTA 0.00115 ATTTC 0.00128 ATTTG 0.0011 ATTTT 0.0018 CAAAA 0.00175 CAAAC 0.00125 CAAAG 0.00164 CAAAT 0.0011 CAACA 0.00118 CAACC 0.000893 CAACG 0.000401 CAACT 0.000765 CAAGA 0.000965 CAAGC 0.000977 CAAGG 0.00111 CAAGT 0.000783 CAATA 0.000637 CAATC 0.000532 CAATG 0.00089 CAATT 0.000674 CACAA 0.00124 CACAC 0.0016 CACAG 0.00257 CACAT 0.00111 CACCA 0.0015 CACCC 0.00155 CACCG 0.000862 CACCT 0.00133 CACGA 0.00039 CACGC 0.000707 CACGG 0.000916 CACGT 0.000648 CACTA 0.000502 CACTC 0.000942 CACTG 0.00206 CACTT 0.00109 CAGAA 0.00186 CAGAC 0.00106 CAGAG 0.00229 CAGAT 0.00112 CAGCA 0.00334 CAGCC 0.00267 CAGCG 0.00122 CAGCT 0.00261 CAGGA 0.00183 CAGGC 0.00152 CAGGG 0.00207 CAGGT 0.00114 CAGTA 0.000892 CAGTC 0.000887 CAGTG 0.00206 CAGTT 0.00115 CATAA 0.000668 CATAC 0.000544 CATAG 0.000592 CATAT 0.000572 CATCA 0.00114 CATCC 0.00146 CATCG 0.000357 CATCT 0.00126 CATGA 0.000772 CATGC 0.00104 CATGG 0.0012 CATGT 0.00086 CATTA 0.000772 CATTC 0.000926 CATTG 0.00089 CATTT 0.00155 CCAAA 0.00146 CCAAC 0.00101 CCAAG 0.00107 CCAAT 0.000632 CCACA 0.00161 CCACC 0.00155 CCACG 0.000836 CCACT 0.0011 CCAGA 0.00129 CCAGC 0.00226 CCAGG 0.00172 CCAGT 0.000965 CCATA 0.000621 CCATC 0.00131 CCATG 0.0012 CCATT 0.00103 CCCAA 0.00126 CCCAC 0.00185 CCCAG 0.00225 CCCAT 0.00133 CCCCA 0.00236 CCCCC 0.00265 CCCCG 0.0016 CCCCT 0.00168 CCCGA 0.000515 CCCGC 0.00148 CCCGG 0.00124 CCCGT 0.000621 CCCTA 0.000538 CCCTC 0.00193 CCCTG 0.00207 CCCTT 0.00139 CCGAA 0.000301 CCGAC 0.000338 CCGAG 0.000699 CCGAT 0.000208 CCGCA 0.000778 CCGCC 0.00145 CCGCG 0.000994 CCGCT 0.000928 CCGGA 0.000468 CCGGC 0.00107 CCGGG 0.00124 CCGGT 0.00038 CCGTA 0.000234 CCGTC 0.000508 CCGTG 0.000916 CCGTT 0.000385 CCTAA 0.000558 CCTAC 0.000562 CCTAG 0.000342 CCTAT 0.000517 CCTCA 0.00143 CCTCC 0.00233 CCTCG 0.000664 CCTCT 0.00164 CCTGA 0.00119 CCTGC 0.00231 CCTGG 0.00172 CCTGT 0.00133 CCTTA 0.000663 CCTTC 0.00162 CCTTG 0.00111 CCTTT 0.00159 CGAAA 0.000243 CGAAC 0.000214 CGAAG 0.000357 CGAAT 0.000142 CGACA 0.000233 CGACC 0.000272 CGACG 0.000216 CGACT 0.000174 CGAGA 0.000319 CGAGC 0.000641 CGAGG 0.000664 CGAGT 0.000242 CGATA 0.000116 CGATC 0.000175 CGATG 0.000357 CGATT 0.000173 CGCAA 0.000225 CGCAC 0.000601 CGCAG 0.00103 CGCAT 0.000294 CGCCA 0.00044 CGCCC 0.0011 CGCCG 0.00102 CGCCT 0.000544 CGCGA 0.000219 CGCGC 0.000796 CGCGG 0.000994 CGCGT 0.000318 CGCTA 0.000175 CGCTC 0.000946 CGCTG 0.00122 CGCTT 0.000452 CGGAA 0.000333 CGGAC 0.000304 CGGAG 0.00092 CGGAT 0.000245 CGGCA 0.000676 CGGCC 0.00114 CGGCG 0.00102 CGGCT 0.000747 CGGGA 0.000753 CGGGC 0.00106 CGGGG 0.0016 CGGGT 0.000447 CGGTA 0.000194 CGGTC 0.000301 CGGTG 0.000862 CGGTT 0.000301 CGTAA 0.000207 CGTAC 0.000199 CGTAG 0.000223 CGTAT 0.000189 CGTCA 0.000307 CGTCC 0.00056 CGTCG 0.000216 CGTCT 0.000309 CGTGA 0.000419 CGTGC 0.000842 CGTGG 0.000836 CGTGT 0.000564 CGTTA 0.000255 CGTTC 0.000415 CGTTG 0.000401 CGTTT 0.000474 CTAAA 0.000794 CTAAC 0.000445 CTAAG 0.000522 CTAAT 0.000526 CTACA 0.000776 CTACC 0.000465 CTACG 0.000223 CTACT 0.000556 CTAGA 0.000419 CTAGC 0.000346 CTAGG 0.000342 CTAGT 0.000287 CTATA 0.000416 CTATC 0.0004 CTATG 0.000592 CTATT 0.000664 CTCAA 0.000804 CTCAC 0.00127 CTCAG 0.00194 CTCAT 0.00096 CTCCA 0.00167 CTCCC 0.00227 CTCCG 0.00092 CTCCT 0.00204 CTCGA 0.000234 CTCGC 0.000544 CTCGG 0.000699 CTCGT 0.000388 CTCTA 0.000585 CTCTC 0.00157 CTCTG 0.00229 CTCTT 0.00138 CTGAA 0.00159 CTGAC 0.00099 CTGAG 0.00194 CTGAT 0.00101 CTGCA 0.00293 CTGCC 0.00241 CTGCG 0.00103 CTGCT 0.00308 CTGGA 0.00153 CTGGC 0.00138 CTGGG 0.00225 CTGGT 0.00107 CTGTA 0.00114 CTGTC 0.00127 CTGTG 0.00257 CTGTT 0.00153 CTTAA 0.000832 CTTAC 0.000589 CTTAG 0.000522 CTTAT 0.000602 CTTCA 0.00139 CTTCC 0.00178 CTTCG 0.000357 CTTCT 0.00167 CTTGA 0.00075 CTTGC 0.00103 CTTGG 0.00107 CTTGT 0.00099 CTTTA 0.00104 CTTTC 0.00151 CTTTG 0.00164 CTTTT 0.00194 GAAAA 0.00198 GAAAC 0.00106 GAAAG 0.00151 GAAAT 0.00128 GAACA 0.0011 GAACC 0.000666 GAACG 0.000415 GAACT 0.000793 GAAGA 0.00131 GAAGC 0.00127 GAAGG 0.00162 GAAGT 0.000994 GAATA 0.00063 GAATC 0.000535 GAATG 0.000926 GAATT 0.000781 GACAA 0.000782 GACAC 0.000861 GACAG 0.00127 GACAT 0.000646 GACCA 0.000627 GACCC 0.000796 GACCG 0.000301 GACCT 0.00068 GACGA 0.000201 GACGC 0.000352 GACGG 0.000508 GACGT 0.000331 GACTA 0.000281 GACTC 0.000524 GACTG 0.000887 GACTT 0.000688 GAGAA 0.00143 GAGAC 0.000749 GAGAG 0.00157 GAGAT 0.000925 GAGCA 0.00193 GAGCC 0.0015 GAGCG 0.000946 GAGCT 0.00178 GAGGA 0.00172 GAGGC 0.00131 GAGGG 0.00193 GAGGT 0.0011 GAGTA 0.000452 GAGTC 0.000524 GAGTG 0.000942 GAGTT 0.000755 GATAA 0.000588 GATAC 0.000406 GATAG 0.0004 GATAT 0.000472 GATCA 0.000584 GATCC 0.000611 GATCG 0.000175 GATCT 0.000665 GATGA 0.000861 GATGC 0.00109 GATGG 0.00131 GATGT 0.000962 GATTA 0.000445 GATTC 0.000535 GATTG 0.000532 GATTT 0.00104 GCAAA 0.00147 GCAAC 0.000786 GCAAG 0.00103 GCAAT 0.000835 GCACA 0.00191 GCACC 0.00152 GCACG 0.000842 GCACT 0.00142 GCAGA 0.00202 GCAGC 0.00347 GCAGG 0.00231 GCAGT 0.00165 GCATA 0.000514 GCATC 0.00109 GCATG 0.00104 GCATT 0.00108 GCCAA 0.000927 GCCAC 0.00119 GCCAG 0.00138 GCCAT 0.000987 GCCCA 0.0014 GCCCC 0.0022 GCCCG 0.00106 GCCCT 0.00155 GCCGA 0.000431 GCCGC 0.00141 GCCGG 0.00107 GCCGT 0.000663 GCCTA 0.000371 GCCTC 0.00131 GCCTG 0.00152 GCCTT 0.00115 GCGAA 0.000239 GCGAC 0.00026 GCGAG 0.000544 GCGAT 0.000281 GCGCA 0.000589 GCGCC 0.000895 GCGCG 0.000796 GCGCT 0.000951 GCGGA 0.000614 GCGGC 0.00141 GCGGG 0.00148 GCGGT 0.000639 GCGTA 0.00017 GCGTC 0.000352 GCGTG 0.000707 GCGTT 0.000439 GCTAA 0.000565 GCTAC 0.00052 GCTAG 0.000346 GCTAT 0.000553 GCTCA 0.00148 GCTCC 0.00214 GCTCG 0.000641 GCTCT 0.00188 GCTGA 0.0018 GCTGC 0.00347 GCTGG 0.00226 GCTGT 0.00231 GCTTA 0.00059 GCTTC 0.00127 GCTTG 0.000977 GCTTT 0.00177 GGAAA 0.00184 GGAAC 0.000924 GGAAG 0.00178 GGAAT 0.000838 GGACA 0.00117 GGACC 0.000734 GGACG 0.00056 GGACT 0.000697 GGAGA 0.00161 GGAGC 0.00214 GGAGG 0.00233 GGAGT 0.000813 GGATA 0.000492 GGATC 0.000611 GGATG 0.00146 GGATT 0.000741 GGCAA 0.000888 GGCAC 0.00152 GGCAG 0.00241 GGCAT 0.000816 GGCCA 0.000989 GGCCC 0.00127 GGCCG 0.00114 GGCCT 0.000888 GGCGA 0.000371 GGCGC 0.000895 GGCGG 0.00145 GGCGT 0.000386 GGCTA 0.000371 GGCTC 0.0015 GGCTG 0.00267 GGCTT 0.00106 GGGAA 0.00174 GGGAC 0.00125 GGGAG 0.00227 GGGAT 0.00119 GGGCA 0.00183 GGGCC 0.00127 GGGCG 0.0011 GGGCT 0.00201 GGGGA 0.0021 GGGGC 0.0022 GGGGG 0.00265 GGGGT 0.00134 GGGTA 0.000474 GGGTC 0.000796 GGGTG 0.00155 GGGTT 0.001 GGTAA 0.000539 GGTAC 0.000463 GGTAG 0.000465 GGTAT 0.000434 GGTCA 0.000701 GGTCC 0.000734 GGTCG 0.000272 GGTCT 0.000698 GGTGA 0.00112 GGTGC 0.00152 GGTGG 0.00155 GGTGT 0.00105 GGTTA 0.00048 GGTTC 0.000666 GGTTG 0.000893 GGTTT 0.0012 GTAAA 0.000824 GTAAC 0.00055 GTAAG 0.000589 GTAAT 0.000592 GTACA 0.000696 GTACC 0.000463 GTACG 0.000199 GTACT 0.000533 GTAGA 0.000496 GTAGC 0.00052 GTAGG 0.000562 GTAGT 0.000441 GTATA 0.000394 GTATC 0.000406 GTATG 0.000544 GTATT 0.000745 GTCAA 0.000458 GTCAC 0.000846 GTCAG 0.00099 GTCAT 0.000569 GTCCA 0.000638 GTCCC 0.00125 GTCCG 0.000304 GTCCT 0.000973 GTCGA 9.63e-05 GTCGC 0.00026 GTCGG 0.000338 GTCGT 0.0002 GTCTA 0.000275 GTCTC 0.000749 GTCTG 0.00106 GTCTT 0.000734 GTGAA 0.000995 GTGAC 0.000846 GTGAG 0.00127 GTGAT 0.00085 GTGCA 0.00155 GTGCC 0.00152 GTGCG 0.000601 GTGCT 0.00202 GTGGA 0.000993 GTGGC 0.00119 GTGGG 0.00185 GTGGT 0.00107 GTGTA 0.000631 GTGTC 0.000861 GTGTG 0.0016 GTGTT 0.00117 GTTAA 0.000683 GTTAC 0.00055 GTTAG 0.000445 GTTAT 0.000565 GTTCA 0.000788 GTTCC 0.000924 GTTCG 0.000214 GTTCT 0.00105 GTTGA 0.000548 GTTGC 0.000786 GTTGG 0.00101 GTTGT 0.0009 GTTTA 0.000747 GTTTC 0.00106 GTTTG 0.00125 GTTTT 0.00169 TAAAA 0.0017 TAAAC 0.000747 TAAAG 0.00104 TAAAT 0.00115 TAACA 0.000859 TAACC 0.00048 TAACG 0.000255 TAACT 0.000648 TAAGA 0.000725 TAAGC 0.00059 TAAGG 0.000663 TAAGT 0.000567 TAATA 0.000731 TAATC 0.000445 TAATG 0.000772 TAATT 0.000939 TACAA 0.000869 TACAC 0.000631 TACAG 0.00114 TACAT 0.000753 TACCA 0.000607 TACCC 0.000474 TACCG 0.000194 TACCT 0.000626 TACGA 0.000154 TACGC 0.00017 TACGG 0.000234 TACGT 0.000258 TACTA 0.000363 TACTC 0.000452 TACTG 0.000892 TACTT 0.00074 TAGAA 0.000821 TAGAC 0.000275 TAGAG 0.000585 TAGAT 0.000462 TAGCA 0.000804 TAGCC 0.000371 TAGCG 0.000175 TAGCT 0.000633 TAGGA 0.00066 TAGGC 0.000371 TAGGG 0.000538 TAGGT 0.000409 TAGTA 0.000363 TAGTC 0.000281 TAGTG 0.000502 TAGTT 0.000522 TATAA 0.000672 TATAC 0.000394 TATAG 0.000416 TATAT 0.000843 TATCA 0.000583 TATCC 0.000492 TATCG 0.000116 TATCT 0.000675 TATGA 0.000582 TATGC 0.000514 TATGG 0.000621 TATGT 0.000659 TATTA 0.000731 TATTC 0.00063 TATTG 0.000637 TATTT 0.00167 TCAAA 0.00106 TCAAC 0.000548 TCAAG 0.00075 TCAAT 0.000557 TCACA 0.00132 TCACC 0.00112 TCACG 0.000419 TCACT 0.0011 TCAGA 0.00131 TCAGC 0.0018 TCAGG 0.00119 TCAGT 0.00122 TCATA 0.000582 TCATC 0.000861 TCATG 0.000772 TCATT 0.00107 TCCAA 0.00105 TCCAC 0.000993 TCCAG 0.00153 TCCAT 0.00111 TCCCA 0.00176 TCCCC 0.0021 TCCCG 0.000753 TCCCT 0.00182 TCCGA 0.000279 TCCGC 0.000614 TCCGG 0.000468 TCCGT 0.000441 TCCTA 0.00066 TCCTC 0.00172 TCCTG 0.00183 TCCTT 0.0016 TCGAA 0.000141 TCGAC 9.63e-05 TCGAG 0.000234 TCGAT 0.00014 TCGCA 0.000293 TCGCC 0.000371 TCGCG 0.000219 TCGCT 0.000441 TCGGA 0.000279 TCGGC 0.000431 TCGGG 0.000515 TCGGT 0.00032 TCGTA 0.000154 TCGTC 0.000201 TCGTG 0.00039 TCGTT 0.00031 TCTAA 0.000633 TCTAC 0.000496 TCTAG 0.000419 TCTAT 0.000595 TCTCA 0.0012 TCTCC 0.00161 TCTCG 0.000319 TCTCT 0.00155 TCTGA 0.00131 TCTGC 0.00202 TCTGG 0.00129 TCTGT 0.00171 TCTTA 0.000725 TCTTC 0.00131 TCTTG 0.000965 TCTTT 0.00172 TGAAA 0.00155 TGAAC 0.000788 TGAAG 0.00139 TGAAT 0.000935 TGACA 0.00106 TGACC 0.000701 TGACG 0.000307 TGACT 0.000794 TGAGA 0.0012 TGAGC 0.00148 TGAGG 0.00143 TGAGT 0.000861 TGATA 0.000583 TGATC 0.000584 TGATG 0.00114 TGATT 0.00088 TGCAA 0.00143 TGCAC 0.00155 TGCAG 0.00293 TGCAT 0.00136 TGCCA 0.00155 TGCCC 0.00183 TGCCG 0.000676 TGCCT 0.00158 TGCGA 0.000293 TGCGC 0.000589 TGCGG 0.000778 TGCGT 0.000492 TGCTA 0.000804 TGCTC 0.00193 TGCTG 0.00334 TGCTT 0.00185 TGGAA 0.00145 TGGAC 0.000638 TGGAG 0.00167 TGGAT 0.000927 TGGCA 0.00155 TGGCC 0.000989 TGGCG 0.00044 TGGCT 0.0015 TGGGA 0.00176 TGGGC 0.0014 TGGGG 0.00236 TGGGT 0.00117 TGGTA 0.000607 TGGTC 0.000627 TGGTG 0.0015 TGGTT 0.00108 TGTAA 0.00103 TGTAC 0.000696 TGTAG 0.000776 TGTAT 0.000891 TGTCA 0.00106 TGTCC 0.00117 TGTCG 0.000233 TGTCT 0.0011 TGTGA 0.00132 TGTGC 0.00191 TGTGG 0.00161 TGTGT 0.00169 TGTTA 0.000859 TGTTC 0.0011 TGTTG 0.00118 TGTTT 0.00196 TTAAA 0.00161 TTAAC 0.000683 TTAAG 0.000832 TTAAT 0.00104 TTACA 0.00103 TTACC 0.000539 TTACG 0.000207 TTACT 0.000781 TTAGA 0.000633 TTAGC 0.000565 TTAGG 0.000558 TTAGT 0.000531 TTATA 0.000672 TTATC 0.000588 TTATG 0.000668 TTATT 0.00138 TTCAA 0.000985 TTCAC 0.000995 TTCAG 0.00159 TTCAT 0.00108 TTCCA 0.00145 TTCCC 0.00174 TTCCG 0.000333 TTCCT 0.00186 TTCGA 0.000141 TTCGC 0.000239 TTCGG 0.000301 TTCGT 0.000274 TTCTA 0.000821 TTCTC 0.00143 TTCTG 0.00186 TTCTT 0.00175 TTGAA 0.000985 TTGAC 0.000458 TTGAG 0.000804 TTGAT 0.000664 TTGCA 0.00143 TTGCC 0.000888 TTGCG 0.000225 TTGCT 0.00158 TTGGA 0.00105 TTGGC 0.000927 TTGGG 0.00126 TTGGT 0.000929 TTGTA 0.000869 TTGTC 0.000782 TTGTG 0.00124 TTGTT 0.00147 TTTAA 0.00161 TTTAC 0.000824 TTTAG 0.000794 TTTAT 0.00142 TTTCA 0.00155 TTTCC 0.00184 TTTCG 0.000243 TTTCT 0.00219 TTTGA 0.00106 TTTGC 0.00147 TTTGG 0.00146 TTTGT 0.00176 TTTTA 0.0017 TTTTC 0.00198 TTTTG 0.00175 TTTTT 0.0042 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418 [10] # (a,c,g,t)= (0.2, 0.3, 0.3, 0.2) # # Probabilities file for the intergenic region model # # k = 4 # The P_l's [P_ls] # l= 0 # Values A 0.241 C 0.259 G 0.259 T 0.241 # l= 1 # Values AA 0.0695 AC 0.0503 AG 0.0724 AT 0.0488 CA 0.0767 CC 0.0766 CG 0.0334 CT 0.0724 GA 0.0565 GC 0.0756 GG 0.0766 GT 0.0503 TA 0.0383 TC 0.0566 TG 0.0767 TT 0.0695 # l= 2 # Values AAA 0.0255 AAC 0.013 AAG 0.0174 AAT 0.0136 ACA 0.0184 ACC 0.0129 ACG 0.00654 ACT 0.0125 AGA 0.0176 AGC 0.0227 AGG 0.0196 AGT 0.0125 ATA 0.0101 ATC 0.0106 ATG 0.0145 ATT 0.0136 CAA 0.0153 CAC 0.0191 CAG 0.0277 CAT 0.0145 CCA 0.0198 CCC 0.0257 CCG 0.0114 CCT 0.0196 CGA 0.00463 CGC 0.0108 CGG 0.0114 CGT 0.00654 CTA 0.00762 CTC 0.0196 CTG 0.0277 CTT 0.0174 GAA 0.0166 GAC 0.00976 GAG 0.0196 GAT 0.0106 GCA 0.0231 GCC 0.0191 GCG 0.0108 GCT 0.0227 GGA 0.0189 GGC 0.0191 GGG 0.0258 GGT 0.0129 GTA 0.00841 GTC 0.00976 GTG 0.0191 GTT 0.013 TAA 0.0121 TAC 0.00841 TAG 0.00762 TAT 0.0101 TCA 0.0155 TCC 0.0189 TCG 0.00464 TCT 0.0176 TGA 0.0155 TGC 0.0231 TGG 0.0198 TGT 0.0184 TTA 0.0121 TTC 0.0166 TTG 0.0153 TTT 0.0255 # l= 3 # Values AAAA 0.00953 AAAC 0.00467 AAAG 0.00604 AAAT 0.00525 AACA 0.005 AACC 0.00322 AACG 0.00155 AACT 0.00325 AAGA 0.00461 AAGC 0.00453 AAGG 0.00493 AAGT 0.00333 AATA 0.00363 AATC 0.0025 AATG 0.00407 AATT 0.00341 ACAA 0.00428 ACAC 0.00425 ACAG 0.00647 ACAT 0.0034 ACCA 0.00376 ACCC 0.00393 ACCG 0.00172 ACCT 0.00345 ACGA 0.00106 ACGC 0.00171 ACGG 0.00213 ACGT 0.00164 ACTA 0.00164 ACTC 0.00264 ACTG 0.00493 ACTT 0.00333 AGAA 0.00574 AGAC 0.00277 AGAG 0.00578 AGAT 0.00328 AGCA 0.00787 AGCC 0.00569 AGCG 0.00288 AGCT 0.00623 AGGA 0.00578 AGGC 0.00434 AGGG 0.00603 AGGT 0.00345 AGTA 0.0024 AGTC 0.00234 AGTG 0.00454 AGTT 0.00325 ATAA 0.00328 ATAC 0.00205 ATAG 0.00204 ATAT 0.00274 ATCA 0.00314 ATCC 0.00332 ATCG 0.000832 ATCT 0.00328 ATGA 0.00322 ATGC 0.00369 ATGG 0.00418 ATGT 0.0034 ATTA 0.00285 ATTC 0.00281 ATTG 0.0027 ATTT 0.00525 CAAA 0.00566 CAAC 0.0032 CAAG 0.00375 CAAT 0.0027 CACA 0.00652 CACC 0.00534 CACG 0.00274 CACT 0.00454 CAGA 0.00626 CAGC 0.00996 CAGG 0.0066 CAGT 0.00493 CATA 0.00235 CATC 0.00423 CATG 0.00385 CATT 0.00407 CCAA 0.00413 CCAC 0.00519 CCAG 0.00627 CCAT 0.00418 CCCA 0.00687 CCCC 0.00876 CCCG 0.00409 CCCT 0.00603 CCGA 0.0016 CCGC 0.00434 CCGG 0.00335 CCGT 0.00213 CCTA 0.00195 CCTC 0.00613 CCTG 0.0066 CCTT 0.00493 CGAA 0.000968 CGAC 0.000921 CGAG 0.00191 CGAT 0.000833 CGCA 0.00223 CGCC 0.00323 CGCG 0.00243 CGCT 0.00288 CGGA 0.00187 CGGC 0.00375 CGGG 0.00409 CGGT 0.00172 CGTA 0.000814 CGTC 0.00144 CGTG 0.00274 CGTT 0.00155 CTAA 0.00224 CTAC 0.00199 CTAG 0.00136 CTAT 0.00204 CTCA 0.00493 CTCC 0.007 CTCG 0.00191 CTCT 0.00578 CTGA 0.00545 CTGC 0.00954 CTGG 0.00627 CTGT 0.00647 CTTA 0.00248 CTTC 0.00512 CTTG 0.00375 CTTT 0.00604 GAAA 0.00571 GAAC 0.00294 GAAG 0.00512 GAAT 0.00281 GACA 0.00355 GACC 0.00243 GACG 0.00144 GACT 0.00234 GAGA 0.00461 GAGC 0.00624 GAGG 0.00613 GAGT 0.00264 GATA 0.00184 GATC 0.00201 GATG 0.00423 GATT 0.0025 GCAA 0.00405 GCAC 0.00578 GCAG 0.00954 GCAT 0.00369 GCCA 0.00451 GCCC 0.00646 GCCG 0.00375 GCCT 0.00434 GCGA 0.00136 GCGC 0.00336 GCGG 0.00434 GCGT 0.00171 GCTA 0.00194 GCTC 0.00624 GCTG 0.00996 GCTT 0.00453 GGAA 0.00533 GGAC 0.00323 GGAG 0.007 GGAT 0.00332 GGCA 0.00572 GGCC 0.00443 GGCG 0.00323 GGCT 0.00569 GGGA 0.00659 GGGC 0.00646 GGGG 0.00876 GGGT 0.00393 GGTA 0.00187 GGTC 0.00243 GGTG 0.00534 GGTT 0.00322 GTAA 0.0025 GTAC 0.00187 GTAG 0.00199 GTAT 0.00205 GTCA 0.00283 GTCC 0.00323 GTCG 0.000921 GTCT 0.00278 GTGA 0.00393 GTGC 0.00578 GTGG 0.00519 GTGT 0.00425 GTTA 0.0022 GTTC 0.00294 GTTG 0.0032 GTTT 0.00467 TAAA 0.00458 TAAC 0.0022 TAAG 0.00248 TAAT 0.00285 TACA 0.00333 TACC 0.00187 TACG 0.000814 TACT 0.0024 TAGA 0.0021 TAGC 0.00194 TAGG 0.00195 TAGT 0.00164 TATA 0.0023 TATC 0.00184 TATG 0.00235 TATT 0.00363 TCAA 0.00285 TCAC 0.00393 TCAG 0.00546 TCAT 0.00322 TCCA 0.00463 TCCC 0.00659 TCCG 0.00187 TCCT 0.00578 TCGA 0.000615 TCGC 0.00136 TCGG 0.0016 TCGT 0.00106 TCTA 0.0021 TCTC 0.00461 TCTG 0.00626 TCTT 0.00461 TGAA 0.00456 TGAC 0.00283 TGAG 0.00493 TGAT 0.00314 TGCA 0.00725 TGCC 0.00572 TGCG 0.00223 TGCT 0.00787 TGGA 0.00463 TGGC 0.00451 TGGG 0.00687 TGGT 0.00376 TGTA 0.00333 TGTC 0.00355 TGTG 0.00652 TGTT 0.005 TTAA 0.0041 TTAC 0.0025 TTAG 0.00224 TTAT 0.00328 TTCA 0.00456 TTCC 0.00533 TTCG 0.000969 TTCT 0.00574 TTGA 0.00285 TTGC 0.00405 TTGG 0.00413 TTGT 0.00428 TTTA 0.00458 TTTC 0.00571 TTTG 0.00566 TTTT 0.00953 # l= 4 # Values AAAAA 0.00418 AAAAC 0.00166 AAAAG 0.00191 AAAAT 0.00178 AAACA 0.00192 AAACC 0.00119 AAACG 0.000473 AAACT 0.00109 AAAGA 0.00169 AAAGC 0.00174 AAAGG 0.00157 AAAGT 0.00104 AAATA 0.00165 AAATC 0.00102 AAATG 0.00152 AAATT 0.00105 AACAA 0.00144 AACAC 0.00115 AACAG 0.0015 AACAT 0.000916 AACCA 0.00105 AACCC 0.00101 AACCG 0.000305 AACCT 0.000842 AACGA 0.000308 AACGC 0.000444 AACGG 0.000392 AACGT 0.000404 AACTA 0.000512 AACTC 0.00074 AACTG 0.00113 AACTT 0.000867 AAGAA 0.00171 AAGAC 0.000716 AAGAG 0.00135 AAGAT 0.000828 AAGCA 0.0018 AAGCC 0.00105 AAGCG 0.000457 AAGCT 0.00122 AAGGA 0.00158 AAGGC 0.00114 AAGGG 0.00139 AAGGT 0.000825 AAGTA 0.000724 AAGTC 0.000671 AAGTG 0.00106 AAGTT 0.000867 AATAA 0.00137 AATAC 0.000731 AATAG 0.000652 AATAT 0.000872 AATCA 0.000863 AATCC 0.00073 AATCG 0.000172 AATCT 0.000738 AATGA 0.00104 AATGC 0.00106 AATGG 0.00102 AATGT 0.000946 AATTA 0.000929 AATTC 0.000764 AATTG 0.000664 AATTT 0.00105 ACAAA 0.00173 ACAAC 0.000885 ACAAG 0.000965 ACAAT 0.0007 ACACA 0.00167 ACACC 0.00105 ACACG 0.000572 ACACT 0.000951 ACAGA 0.00169 ACAGC 0.00232 ACAGG 0.00133 ACAGT 0.00114 ACATA 0.000652 ACATC 0.000955 ACATG 0.000848 ACATT 0.000946 ACCAA 0.000911 ACCAC 0.00107 ACCAG 0.00106 ACCAT 0.000722 ACCCA 0.00118 ACCCC 0.00141 ACCCG 0.000466 ACCCT 0.000877 ACCGA 0.000328 ACCGC 0.000667 ACCGG 0.000401 ACCGT 0.000325 ACCTA 0.0004 ACCTC 0.0011 ACCTG 0.00113 ACCTT 0.000825 ACGAA 0.000274 ACGAC 0.000202 ACGAG 0.000391 ACGAT 0.00019 ACGCA 0.000501 ACGCC 0.000399 ACGCG 0.000333 ACGCT 0.000479 ACGGA 0.000454 ACGGC 0.000694 ACGGG 0.000654 ACGGT 0.000325 ACGTA 0.000254 ACGTC 0.000334 ACGTG 0.000652 ACGTT 0.000404 ACTAA 0.000521 ACTAC 0.000434 ACTAG 0.00028 ACTAT 0.0004 ACTCA 0.000848 ACTCC 0.000806 ACTCG 0.000242 ACTCT 0.000744 ACTGA 0.00119 ACTGC 0.00164 ACTGG 0.000953 ACTGT 0.00114 ACTTA 0.000554 ACTTC 0.000972 ACTTG 0.00076 ACTTT 0.00104 AGAAA 0.00214 AGAAC 0.00103 AGAAG 0.00163 AGAAT 0.000934 AGACA 0.00108 AGACC 0.000692 AGACG 0.000311 AGACT 0.000697 AGAGA 0.00151 AGAGC 0.00189 AGAGG 0.00164 AGAGT 0.000744 AGATA 0.000662 AGATC 0.000648 AGATG 0.00124 AGATT 0.000738 AGCAA 0.00154 AGCAC 0.00203 AGCAG 0.00307 AGCAT 0.00122 AGCCA 0.00149 AGCCC 0.00208 AGCCG 0.000779 AGCCT 0.00133 AGCGA 0.000446 AGCGC 0.000988 AGCGG 0.000971 AGCGT 0.000479 AGCTA 0.000614 AGCTC 0.00179 AGCTG 0.00261 AGCTT 0.00122 AGGAA 0.00183 AGGAC 0.000973 AGGAG 0.00204 AGGAT 0.000938 AGGCA 0.00156 AGGCC 0.000896 AGGCG 0.000556 AGGCT 0.00133 AGGGA 0.00184 AGGGC 0.00159 AGGGG 0.00173 AGGGT 0.000877 AGGTA 0.000613 AGGTC 0.000672 AGGTG 0.00133 AGGTT 0.000842 AGTAA 0.000763 AGTAC 0.000524 AGTAG 0.000545 AGTAT 0.000567 AGTCA 0.000775 AGTCC 0.000692 AGTCG 0.000175 AGTCT 0.000697 AGTGA 0.00108 AGTGC 0.00142 AGTGG 0.0011 AGTGT 0.000951 AGTTA 0.000633 AGTTC 0.000776 AGTTG 0.000748 AGTTT 0.00109 ATAAA 0.00141 ATAAC 0.000557 ATAAG 0.000591 ATAAT 0.000722 ATACA 0.000875 ATACC 0.000426 ATACG 0.000187 ATACT 0.000567 ATAGA 0.000583 ATAGC 0.000543 ATAGG 0.000515 ATAGT 0.0004 ATATA 0.000837 ATATC 0.000465 ATATG 0.000567 ATATT 0.000872 ATCAA 0.000653 ATCAC 0.00084 ATCAG 0.00099 ATCAT 0.000656 ATCCA 0.000911 ATCCC 0.00122 ATCCG 0.000253 ATCCT 0.000938 ATCGA 0.00014 ATCGC 0.000289 ATCGG 0.000213 ATCGT 0.00019 ATCTA 0.000451 ATCTC 0.000909 ATCTG 0.0011 ATCTT 0.000828 ATGAA 0.00106 ATGAC 0.000559 ATGAG 0.000947 ATGAT 0.000656 ATGCA 0.00135 ATGCC 0.000816 ATGCG 0.0003 ATGCT 0.00122 ATGGA 0.0011 ATGGC 0.000989 ATGGG 0.00137 ATGGT 0.000722 ATGTA 0.000741 ATGTC 0.00064 ATGTG 0.0011 ATGTT 0.000916 ATTAA 0.00103 ATTAC 0.000583 ATTAG 0.000515 ATTAT 0.000722 ATTCA 0.000914 ATTCC 0.000824 ATTCG 0.000141 ATTCT 0.000934 ATTGA 0.000549 ATTGC 0.000824 ATTGG 0.000627 ATTGT 0.0007 ATTTA 0.00114 ATTTC 0.00125 ATTTG 0.00108 ATTTT 0.00178 CAAAA 0.00173 CAAAC 0.00124 CAAAG 0.00162 CAAAT 0.00108 CAACA 0.00116 CAACC 0.000891 CAACG 0.000404 CAACT 0.000748 CAAGA 0.000936 CAAGC 0.000959 CAAGG 0.0011 CAAGT 0.00076 CAATA 0.000628 CAATC 0.000523 CAATG 0.000884 CAATT 0.000664 CACAA 0.00122 CACAC 0.00161 CACAG 0.00258 CACAT 0.0011 CACCA 0.0015 CACCC 0.00161 CACCG 0.000906 CACCT 0.00133 CACGA 0.000394 CACGC 0.000729 CACGG 0.000965 CACGT 0.000652 CACTA 0.000492 CACTC 0.000937 CACTG 0.00205 CACTT 0.00106 CAGAA 0.00182 CAGAC 0.00105 CAGAG 0.00229 CAGAT 0.0011 CAGCA 0.00335 CAGCC 0.00273 CAGCG 0.00127 CAGCT 0.00261 CAGGA 0.00183 CAGGC 0.00152 CAGGG 0.00212 CAGGT 0.00113 CAGTA 0.000873 CAGTC 0.000875 CAGTG 0.00205 CAGTT 0.00113 CATAA 0.00066 CATAC 0.000536 CATAG 0.000584 CATAT 0.000567 CATCA 0.00113 CATCC 0.00149 CATCG 0.000368 CATCT 0.00124 CATGA 0.000757 CATGC 0.00103 CATGG 0.00121 CATGT 0.000848 CATTA 0.000756 CATTC 0.000907 CATTG 0.000884 CATTT 0.00152 CCAAA 0.00145 CCAAC 0.001 CCAAG 0.00105 CCAAT 0.000627 CCACA 0.00162 CCACC 0.00159 CCACG 0.000874 CCACT 0.0011 CCAGA 0.00128 CCAGC 0.0023 CCAGG 0.00175 CCAGT 0.000953 CCATA 0.000618 CCATC 0.00133 CCATG 0.00121 CCATT 0.00102 CCCAA 0.00127 CCCAC 0.00192 CCCAG 0.0023 CCCAT 0.00137 CCCCA 0.00249 CCCCC 0.00284 CCCCG 0.00171 CCCCT 0.00173 CCCGA 0.000541 CCCGC 0.00156 CCCGG 0.00133 CCCGT 0.000654 CCCTA 0.000543 CCCTC 0.00199 CCCTG 0.00212 CCCTT 0.00139 CCGAA 0.000309 CCGAC 0.000355 CCGAG 0.000726 CCGAT 0.000213 CCGCA 0.000815 CCGCC 0.00151 CCGCG 0.00104 CCGCT 0.000971 CCGGA 0.000488 CCGGC 0.00113 CCGGG 0.00133 CCGGT 0.000401 CCGTA 0.000238 CCGTC 0.000534 CCGTG 0.000965 CCGTT 0.000392 CCTAA 0.000545 CCTAC 0.000557 CCTAG 0.000334 CCTAT 0.000515 CCTCA 0.00142 CCTCC 0.00238 CCTCG 0.000688 CCTCT 0.00164 CCTGA 0.00118 CCTGC 0.00235 CCTGG 0.00175 CCTGT 0.00133 CCTTA 0.000649 CCTTC 0.00161 CCTTG 0.0011 CCTTT 0.00157 CGAAA 0.000247 CGAAC 0.000218 CGAAG 0.000362 CGAAT 0.000141 CGACA 0.000237 CGACC 0.000283 CGACG 0.000226 CGACT 0.000175 CGAGA 0.000321 CGAGC 0.000662 CGAGG 0.000688 CGAGT 0.000242 CGATA 0.000115 CGATC 0.000177 CGATG 0.000368 CGATT 0.000172 CGCAA 0.000229 CGCAC 0.000623 CGCAG 0.00108 CGCAT 0.0003 CGCCA 0.000455 CGCCC 0.00116 CGCCG 0.00106 CGCCT 0.000556 CGCGA 0.000227 CGCGC 0.000822 CGCGG 0.00104 CGCGT 0.000333 CGCTA 0.000177 CGCTC 0.000984 CGCTG 0.00127 CGCTT 0.000457 CGGAA 0.000336 CGGAC 0.000318 CGGAG 0.00096 CGGAT 0.000253 CGGCA 0.000709 CGGCC 0.00119 CGGCG 0.00106 CGGCT 0.000779 CGGGA 0.000792 CGGGC 0.00112 CGGGG 0.00171 CGGGT 0.000466 CGGTA 0.000197 CGGTC 0.000312 CGGTG 0.000906 CGGTT 0.000305 CGTAA 0.000204 CGTAC 0.0002 CGTAG 0.000223 CGTAT 0.000187 CGTCA 0.000311 CGTCC 0.00059 CGTCG 0.000226 CGTCT 0.000311 CGTGA 0.000422 CGTGC 0.00087 CGTGG 0.000874 CGTGT 0.000572 CGTTA 0.000252 CGTTC 0.000419 CGTTG 0.000404 CGTTT 0.000473 CTAAA 0.00078 CTAAC 0.000434 CTAAG 0.000507 CTAAT 0.000515 CTACA 0.000763 CTACC 0.000456 CTACG 0.000223 CTACT 0.000545 CTAGA 0.000409 CTAGC 0.000336 CTAGG 0.000334 CTAGT 0.00028 CTATA 0.000411 CTATC 0.000394 CTATG 0.000584 CTATT 0.000652 CTCAA 0.000787 CTCAC 0.00126 CTCAG 0.00193 CTCAT 0.000947 CTCCA 0.00167 CTCCC 0.00232 CTCCG 0.00096 CTCCT 0.00204 CTCGA 0.000236 CTCGC 0.00056 CTCGG 0.000726 CTCGT 0.000391 CTCTA 0.000573 CTCTC 0.00156 CTCTG 0.00229 CTCTT 0.00135 CTGAA 0.00155 CTGAC 0.000979 CTGAG 0.00193 CTGAT 0.00099 CTGCA 0.00294 CTGCC 0.00245 CTGCG 0.00108 CTGCT 0.00307 CTGGA 0.00152 CTGGC 0.00139 CTGGG 0.0023 CTGGT 0.00106 CTGTA 0.00111 CTGTC 0.00127 CTGTG 0.00258 CTGTT 0.0015 CTTAA 0.000813 CTTAC 0.000574 CTTAG 0.000507 CTTAT 0.000591 CTTCA 0.00136 CTTCC 0.00177 CTTCG 0.000362 CTTCT 0.00163 CTTGA 0.000729 CTTGC 0.00101 CTTGG 0.00105 CTTGT 0.000965 CTTTA 0.00103 CTTTC 0.00148 CTTTG 0.00162 CTTTT 0.00191 GAAAA 0.00194 GAAAC 0.00104 GAAAG 0.00148 GAAAT 0.00125 GAACA 0.00108 GAACC 0.000667 GAACG 0.000419 GAACT 0.000776 GAAGA 0.00128 GAAGC 0.00126 GAAGG 0.00161 GAAGT 0.000972 GAATA 0.000618 GAATC 0.000524 GAATG 0.000907 GAATT 0.000764 GACAA 0.000767 GACAC 0.000868 GACAG 0.00127 GACAT 0.00064 GACCA 0.000619 GACCC 0.000832 GACCG 0.000312 GACCT 0.000672 GACGA 0.000203 GACGC 0.000367 GACGG 0.000534 GACGT 0.000334 GACTA 0.000274 GACTC 0.00052 GACTG 0.000875 GACTT 0.000671 GAGAA 0.0014 GAGAC 0.000742 GAGAG 0.00156 GAGAT 0.000909 GAGCA 0.00193 GAGCC 0.00154 GAGCG 0.000984 GAGCT 0.00179 GAGGA 0.00173 GAGGC 0.00132 GAGGG 0.00199 GAGGT 0.0011 GAGTA 0.000443 GAGTC 0.00052 GAGTG 0.000937 GAGTT 0.00074 GATAA 0.000578 GATAC 0.000399 GATAG 0.000394 GATAT 0.000465 GATCA 0.000571 GATCC 0.000613 GATCG 0.000177 GATCT 0.000648 GATGA 0.00085 GATGC 0.0011 GATGG 0.00133 GATGT 0.000955 GATTA 0.000437 GATTC 0.000524 GATTG 0.000523 GATTT 0.00102 GCAAA 0.00144 GCAAC 0.000777 GCAAG 0.00101 GCAAT 0.000824 GCACA 0.00192 GCACC 0.00157 GCACG 0.00087 GCACT 0.00142 GCAGA 0.00201 GCAGC 0.00355 GCAGG 0.00235 GCAGT 0.00164 GCATA 0.000504 GCATC 0.0011 GCATG 0.00103 GCATT 0.00106 GCCAA 0.000919 GCCAC 0.00121 GCCAG 0.00139 GCCAT 0.000989 GCCCA 0.00142 GCCCC 0.00234 GCCCG 0.00112 GCCCT 0.00159 GCCGA 0.000448 GCCGC 0.00147 GCCGG 0.00113 GCCGT 0.000694 GCCTA 0.000363 GCCTC 0.00132 GCCTG 0.00152 GCCTT 0.00114 GCGAA 0.000243 GCGAC 0.000267 GCGAG 0.00056 GCGAT 0.000289 GCGCA 0.000612 GCGCC 0.000933 GCGCG 0.000822 GCGCT 0.000988 GCGGA 0.000638 GCGGC 0.00147 GCGGG 0.00156 GCGGT 0.000667 GCGTA 0.00017 GCGTC 0.000367 GCGTG 0.000729 GCGTT 0.000444 GCTAA 0.000551 GCTAC 0.00051 GCTAG 0.000336 GCTAT 0.000543 GCTCA 0.00149 GCTCC 0.0022 GCTCG 0.000662 GCTCT 0.00189 GCTGA 0.0018 GCTGC 0.00355 GCTGG 0.0023 GCTGT 0.00232 GCTTA 0.000574 GCTTC 0.00126 GCTTG 0.000959 GCTTT 0.00174 GGAAA 0.00181 GGAAC 0.000922 GGAAG 0.00177 GGAAT 0.000824 GGACA 0.00119 GGACC 0.000759 GGACG 0.00059 GGACT 0.000692 GGAGA 0.00161 GGAGC 0.0022 GGAGG 0.00238 GGAGT 0.000806 GGATA 0.000486 GGATC 0.000613 GGATG 0.00149 GGATT 0.00073 GGCAA 0.000876 GGCAC 0.00157 GGCAG 0.00245 GGCAT 0.000816 GGCCA 0.00101 GGCCC 0.00133 GGCCG 0.00119 GGCCT 0.000896 GGCGA 0.000386 GGCGC 0.000933 GGCGG 0.00151 GGCGT 0.000399 GGCTA 0.000365 GGCTC 0.00154 GGCTG 0.00273 GGCTT 0.00105 GGGAA 0.00174 GGGAC 0.00131 GGGAG 0.00232 GGGAT 0.00122 GGGCA 0.00189 GGGCC 0.00133 GGGCG 0.00116 GGGCT 0.00208 GGGGA 0.00219 GGGGC 0.00234 GGGGG 0.00284 GGGGT 0.00141 GGGTA 0.000471 GGGTC 0.000832 GGGTG 0.00161 GGGTT 0.00101 GGTAA 0.000529 GGTAC 0.000461 GGTAG 0.000456 GGTAT 0.000426 GGTCA 0.000699 GGTCC 0.000759 GGTCG 0.000283 GGTCT 0.000692 GGTGA 0.00113 GGTGC 0.00157 GGTGG 0.00159 GGTGT 0.00105 GGTTA 0.000473 GGTTC 0.000667 GGTTG 0.000891 GGTTT 0.00119 GTAAA 0.000808 GTAAC 0.000537 GTAAG 0.000574 GTAAT 0.000583 GTACA 0.000684 GTACC 0.000461 GTACG 0.0002 GTACT 0.000524 GTAGA 0.000485 GTAGC 0.00051 GTAGG 0.000557 GTAGT 0.000434 GTATA 0.000389 GTATC 0.000399 GTATG 0.000536 GTATT 0.000731 GTCAA 0.000447 GTCAC 0.000849 GTCAG 0.000979 GTCAT 0.000559 GTCCA 0.000631 GTCCC 0.00131 GTCCG 0.000318 GTCCT 0.000973 GTCGA 9.71e-05 GTCGC 0.000267 GTCGG 0.000355 GTCGT 0.000202 GTCTA 0.000269 GTCTC 0.000742 GTCTG 0.00105 GTCTT 0.000716 GTGAA 0.000976 GTGAC 0.000849 GTGAG 0.00126 GTGAT 0.00084 GTGCA 0.00155 GTGCC 0.00157 GTGCG 0.000623 GTGCT 0.00203 GTGGA 0.000985 GTGGC 0.00121 GTGGG 0.00192 GTGGT 0.00107 GTGTA 0.000618 GTGTC 0.000868 GTGTG 0.00161 GTGTT 0.00115 GTTAA 0.00067 GTTAC 0.000537 GTTAG 0.000434 GTTAT 0.000557 GTTCA 0.000771 GTTCC 0.000922 GTTCG 0.000218 GTTCT 0.00103 GTTGA 0.000538 GTTGC 0.000777 GTTGG 0.001 GTTGT 0.000885 GTTTA 0.000735 GTTTC 0.00104 GTTTG 0.00124 GTTTT 0.00166 TAAAA 0.00168 TAAAC 0.000735 TAAAG 0.00103 TAAAT 0.00114 TAACA 0.00084 TAACC 0.000473 TAACG 0.000252 TAACT 0.000633 TAAGA 0.000707 TAAGC 0.000574 TAAGG 0.000649 TAAGT 0.000554 TAATA 0.000726 TAATC 0.000437 TAATG 0.000756 TAATT 0.000929 TACAA 0.000853 TACAC 0.000618 TACAG 0.00111 TACAT 0.000741 TACCA 0.00059 TACCC 0.000471 TACCG 0.000197 TACCT 0.000613 TACGA 0.000153 TACGC 0.00017 TACGG 0.000238 TACGT 0.000254 TACTA 0.000358 TACTC 0.000443 TACTG 0.000873 TACTT 0.000724 TAGAA 0.000803 TAGAC 0.000269 TAGAG 0.000573 TAGAT 0.000451 TAGCA 0.000784 TAGCC 0.000365 TAGCG 0.000177 TAGCT 0.000614 TAGGA 0.000645 TAGGC 0.000363 TAGGG 0.000543 TAGGT 0.0004 TAGTA 0.000358 TAGTC 0.000274 TAGTG 0.000492 TAGTT 0.000512 TATAA 0.000666 TATAC 0.000389 TATAG 0.000411 TATAT 0.000837 TATCA 0.000572 TATCC 0.000486 TATCG 0.000115 TATCT 0.000662 TATGA 0.000573 TATGC 0.000504 TATGG 0.000618 TATGT 0.000652 TATTA 0.000726 TATTC 0.000618 TATTG 0.000628 TATTT 0.00165 TCAAA 0.00104 TCAAC 0.000538 TCAAG 0.000729 TCAAT 0.000549 TCACA 0.0013 TCACC 0.00113 TCACG 0.000422 TCACT 0.00108 TCAGA 0.00128 TCAGC 0.0018 TCAGG 0.00118 TCAGT 0.00119 TCATA 0.000573 TCATC 0.00085 TCATG 0.000757 TCATT 0.00104 TCCAA 0.00103 TCCAC 0.000985 TCCAG 0.00152 TCCAT 0.0011 TCCCA 0.00178 TCCCC 0.00219 TCCCG 0.000792 TCCCT 0.00184 TCCGA 0.000286 TCCGC 0.000638 TCCGG 0.000488 TCCGT 0.000454 TCCTA 0.000645 TCCTC 0.00173 TCCTG 0.00183 TCCTT 0.00158 TCGAA 0.000142 TCGAC 9.71e-05 TCGAG 0.000236 TCGAT 0.00014 TCGCA 0.0003 TCGCC 0.000386 TCGCG 0.000227 TCGCT 0.000446 TCGGA 0.000286 TCGGC 0.000448 TCGGG 0.000541 TCGGT 0.000328 TCGTA 0.000153 TCGTC 0.000203 TCGTG 0.000394 TCGTT 0.000308 TCTAA 0.000619 TCTAC 0.000485 TCTAG 0.000409 TCTAT 0.000583 TCTCA 0.00117 TCTCC 0.00161 TCTCG 0.000321 TCTCT 0.00151 TCTGA 0.00128 TCTGC 0.00201 TCTGG 0.00128 TCTGT 0.00169 TCTTA 0.000707 TCTTC 0.00128 TCTTG 0.000936 TCTTT 0.00169 TGAAA 0.00151 TGAAC 0.000771 TGAAG 0.00136 TGAAT 0.000914 TGACA 0.00105 TGACC 0.000699 TGACG 0.000311 TGACT 0.000775 TGAGA 0.00117 TGAGC 0.00149 TGAGG 0.00142 TGAGT 0.000848 TGATA 0.000572 TGATC 0.000571 TGATG 0.00113 TGATT 0.000863 TGCAA 0.0014 TGCAC 0.00155 TGCAG 0.00294 TGCAT 0.00135 TGCCA 0.00155 TGCCC 0.00189 TGCCG 0.000709 TGCCT 0.00156 TGCGA 0.0003 TGCGC 0.000612 TGCGG 0.000815 TGCGT 0.000501 TGCTA 0.000784 TGCTC 0.00193 TGCTG 0.00335 TGCTT 0.0018 TGGAA 0.00142 TGGAC 0.000631 TGGAG 0.00167 TGGAT 0.000911 TGGCA 0.00155 TGGCC 0.00101 TGGCG 0.000455 TGGCT 0.00149 TGGGA 0.00178 TGGGC 0.00142 TGGGG 0.00249 TGGGT 0.00118 TGGTA 0.00059 TGGTC 0.000619 TGGTG 0.0015 TGGTT 0.00105 TGTAA 0.001 TGTAC 0.000684 TGTAG 0.000763 TGTAT 0.000875 TGTCA 0.00105 TGTCC 0.00119 TGTCG 0.000237 TGTCT 0.00108 TGTGA 0.0013 TGTGC 0.00192 TGTGG 0.00162 TGTGT 0.00167 TGTTA 0.00084 TGTTC 0.00108 TGTTG 0.00116 TGTTT 0.00192 TTAAA 0.00159 TTAAC 0.00067 TTAAG 0.000813 TTAAT 0.00103 TTACA 0.001 TTACC 0.000529 TTACG 0.000204 TTACT 0.000763 TTAGA 0.000619 TTAGC 0.000551 TTAGG 0.000545 TTAGT 0.000521 TTATA 0.000666 TTATC 0.000578 TTATG 0.00066 TTATT 0.00137 TTCAA 0.000965 TTCAC 0.000976 TTCAG 0.00155 TTCAT 0.00106 TTCCA 0.00142 TTCCC 0.00174 TTCCG 0.000336 TTCCT 0.00183 TTCGA 0.000142 TTCGC 0.000243 TTCGG 0.000309 TTCGT 0.000274 TTCTA 0.000803 TTCTC 0.0014 TTCTG 0.00182 TTCTT 0.00171 TTGAA 0.000965 TTGAC 0.000447 TTGAG 0.000787 TTGAT 0.000653 TTGCA 0.0014 TTGCC 0.000876 TTGCG 0.000229 TTGCT 0.00154 TTGGA 0.00103 TTGGC 0.000919 TTGGG 0.00127 TTGGT 0.000911 TTGTA 0.000853 TTGTC 0.000767 TTGTG 0.00122 TTGTT 0.00144 TTTAA 0.00159 TTTAC 0.000808 TTTAG 0.00078 TTTAT 0.00141 TTTCA 0.00151 TTTCC 0.00181 TTTCG 0.000247 TTTCT 0.00214 TTTGA 0.00104 TTTGC 0.00144 TTTGG 0.00145 TTTGT 0.00173 TTTTA 0.00168 TTTTC 0.00194 TTTTG 0.00173 TTTTT 0.00418 [EMISSION] # Vector size (4^(k+1)) 1024 # Probabilities AAAAA 0.4179 AAAAC 0.1718 AAAAG 0.1925 AAAAT 0.2177 AAACA 0.4439 AAACC 0.207 AAACG 0.07339 AAACT 0.2757 AAAGA 0.3058 AAAGC 0.2604 AAAGG 0.2242 AAAGT 0.2096 AAATA 0.3223 AAATC 0.1759 AAATG 0.2754 AAATT 0.2264 AACAA 0.3 AACAC 0.2049 AACAG 0.2836 AACAT 0.2115 AACCA 0.3761 AACCC 0.2368 AACCG 0.07208 AACCT 0.3151 AACGA 0.2084 AACGC 0.2511 AACGG 0.2167 AACGT 0.3238 AACTA 0.1875 AACTC 0.1903 AACTG 0.331 AACTT 0.2912 AAGAA 0.3875 AAGAC 0.1581 AAGAG 0.2512 AAGAT 0.2032 AAGCA 0.4221 AAGCC 0.2016 AAGCG 0.07072 AAGCT 0.3055 AAGGA 0.3411 AAGGC 0.2264 AAGGG 0.2283 AAGGT 0.2042 AAGTA 0.2563 AAGTC 0.1834 AAGTG 0.2759 AAGTT 0.2844 AATAA 0.3554 AATAC 0.2082 AATAG 0.173 AATAT 0.2634 AATCA 0.3706 AATCC 0.2419 AATCG 0.04792 AATCT 0.3396 AATGA 0.2776 AATGC 0.2406 AATGG 0.2094 AATGT 0.2724 AATTA 0.27 AATTC 0.2138 AATTG 0.1865 AATTT 0.3297 ACAAA 0.4052 ACAAC 0.1929 ACAAG 0.2179 ACAAT 0.184 ACACA 0.4221 ACACC 0.203 ACACG 0.1002 ACACT 0.2747 ACAGA 0.2951 ACAGC 0.2901 ACAGG 0.1884 ACAGT 0.2264 ACATA 0.2258 ACATC 0.2271 ACATG 0.2316 ACATT 0.3155 ACCAA 0.2683 ACCAC 0.2508 ACCAG 0.2662 ACCAT 0.2146 ACCCA 0.3499 ACCCC 0.2712 ACCCG 0.09918 ACCCT 0.2797 ACCGA 0.2129 ACCGC 0.3589 ACCGG 0.2008 ACCGT 0.2274 ACCTA 0.1561 ACCTC 0.2642 ACCTG 0.304 ACCTT 0.2757 ACGAA 0.2828 ACGAC 0.1783 ACGAG 0.3241 ACGAT 0.2148 ACGCA 0.3065 ACGCC 0.2158 ACGCG 0.1664 ACGCT 0.3113 ACGGA 0.2325 ACGGC 0.3077 ACGGG 0.2673 ACGGT 0.1925 ACGTA 0.2044 ACGTC 0.1702 ACGTG 0.3404 ACGTT 0.2849 ACTAA 0.3198 ACTAC 0.2492 ACTAG 0.1785 ACTAT 0.2525 ACTCA 0.3418 ACTCC 0.2662 ACTCG 0.06747 ACTCT 0.3245 ACTGA 0.2779 ACTGC 0.2768 ACTGG 0.1782 ACTGT 0.267 ACTTA 0.1909 ACTTC 0.2679 ACTTG 0.2237 ACTTT 0.3174 AGAAA 0.3831 AGAAC 0.1695 AGAAG 0.2577 AGAAT 0.1898 AGACA 0.4104 AGACC 0.2043 AGACG 0.07948 AGACT 0.3059 AGAGA 0.3065 AGAGC 0.268 AGAGG 0.2538 AGAGT 0.1718 AGATA 0.2338 AGATC 0.1798 AGATG 0.3227 AGATT 0.2637 AGCAA 0.2435 AGCAC 0.2203 AGCAG 0.3431 AGCAT 0.1931 AGCCA 0.315 AGCCC 0.2767 AGCCG 0.1114 AGCCT 0.2969 AGCGA 0.1783 AGCGC 0.3179 AGCGG 0.304 AGCGT 0.1998 AGCTA 0.1496 AGCTC 0.2299 AGCTG 0.3672 AGCTT 0.2533 AGGAA 0.3699 AGGAC 0.1557 AGGAG 0.2968 AGGAT 0.1776 AGGCA 0.3803 AGGCC 0.1934 AGGCG 0.1045 AGGCT 0.3219 AGGGA 0.3391 AGGGC 0.2415 AGGGG 0.2475 AGGGT 0.1718 AGGTA 0.2281 AGGTC 0.1774 AGGTG 0.3179 AGGTT 0.2766 AGTAA 0.3273 AGTAC 0.2055 AGTAG 0.2151 AGTAT 0.2521 AGTCA 0.3646 AGTCC 0.2391 AGTCG 0.05112 AGTCT 0.3452 AGTGA 0.2724 AGTGC 0.2614 AGTGG 0.2154 AGTGT 0.2509 AGTTA 0.2203 AGTTC 0.2187 AGTTG 0.2139 AGTTT 0.3471 ATAAA 0.4174 ATAAC 0.1679 ATAAG 0.1781 ATAAT 0.2366 ATACA 0.4393 ATACC 0.1826 ATACG 0.07002 ATACT 0.3081 ATAGA 0.3018 ATAGC 0.251 ATAGG 0.2083 ATAGT 0.2388 ATATA 0.2969 ATATC 0.1593 ATATG 0.2055 ATATT 0.3382 ATCAA 0.2411 ATCAC 0.2305 ATCAG 0.2944 ATCAT 0.234 ATCCA 0.3465 ATCCC 0.2692 ATCCG 0.0549 ATCCT 0.3294 ATCGA 0.1946 ATCGC 0.2913 ATCGG 0.2179 ATCGT 0.2961 ATCTA 0.1709 ATCTC 0.2283 ATCTG 0.3094 ATCTT 0.2913 ATGAA 0.3655 ATGAC 0.1698 ATGAG 0.2441 ATGAT 0.2206 ATGCA 0.3925 ATGCC 0.1955 ATGCG 0.05539 ATGCT 0.3567 ATGGA 0.3055 ATGGC 0.2318 ATGGG 0.2399 ATGGT 0.2227 ATGTA 0.2554 ATGTC 0.1667 ATGTG 0.2733 ATGTT 0.3046 ATTAA 0.3551 ATTAC 0.2051 ATTAG 0.1782 ATTAT 0.2617 ATTCA 0.3506 ATTCC 0.2474 ATTCG 0.03452 ATTCT 0.3675 ATTGA 0.2301 ATTGC 0.2754 ATTGG 0.1941 ATTGT 0.3004 ATTTA 0.2265 ATTTC 0.2218 ATTTG 0.1954 ATTTT 0.3562 CAAAA 0.3313 CAAAC 0.1993 CAAAG 0.2469 CAAAT 0.2225 CAACA 0.4003 CAACC 0.227 CAACG 0.08626 CAACT 0.2864 CAAGA 0.2837 CAAGC 0.2296 CAAGG 0.2366 CAAGT 0.2501 CAATA 0.2616 CAATC 0.1755 CAATG 0.2741 CAATT 0.2888 CACAA 0.232 CACAC 0.2213 CACAG 0.3439 CACAT 0.2028 CACCA 0.3324 CACCC 0.2316 CACCG 0.1275 CACCT 0.3086 CACGA 0.1727 CACGC 0.2508 CACGG 0.2827 CACGT 0.2938 CACTA 0.1473 CACTC 0.1793 CACTG 0.393 CACTT 0.2804 CAGAA 0.3473 CAGAC 0.1624 CAGAG 0.2868 CAGAT 0.2035 CAGCA 0.3626 CAGCC 0.2361 CAGCG 0.1013 CAGCT 0.3 CAGGA 0.3013 CAGGC 0.2333 CAGGG 0.25 CAGGT 0.2154 CAGTA 0.2283 CAGTC 0.1712 CAGTG 0.3272 CAGTT 0.2733 CATAA 0.2997 CATAC 0.2241 CATAG 0.2112 CATAT 0.265 CATCA 0.3178 CATCC 0.2647 CATCG 0.0609 CATCT 0.3565 CATGA 0.2414 CATGC 0.2509 CATGG 0.2391 CATGT 0.2686 CATTA 0.2094 CATTC 0.2075 CATTG 0.1785 CATTT 0.4045 CCAAA 0.3626 CCAAC 0.219 CCAAG 0.2483 CCAAT 0.1701 CCACA 0.3563 CCACC 0.2598 CCACG 0.1185 CCACT 0.2654 CCAGA 0.247 CCAGC 0.3042 CCAGG 0.2393 CCAGT 0.2095 CCATA 0.1848 CCATC 0.2574 CCATG 0.2564 CCATT 0.3014 CCCAA 0.2162 CCCAC 0.2523 CCCAG 0.3215 CCCAT 0.21 CCCCA 0.2827 CCCCC 0.2877 CCCCG 0.1859 CCCCT 0.2437 CCCGA 0.1332 CCCGC 0.4149 CCCGG 0.2905 CCCGT 0.1614 CCCTA 0.1166 CCCTC 0.3005 CCCTG 0.3112 CCCTT 0.2717 CCGAA 0.219 CCGAC 0.2006 CCGAG 0.4317 CCGAT 0.1487 CCGCA 0.1701 CCGCC 0.3748 CCGCG 0.2383 CCGCT 0.2169 CCGGA 0.1579 CCGGC 0.3579 CCGGG 0.3578 CCGGT 0.1264 CCGTA 0.1522 CCGTC 0.2321 CCGTG 0.3892 CCGTT 0.2265 CCTAA 0.3005 CCTAC 0.2608 CCTAG 0.1834 CCTAT 0.2553 CCTCA 0.2803 CCTCC 0.3244 CCTCG 0.09178 CCTCT 0.3035 CCTGA 0.2218 CCTGC 0.303 CCTGG 0.2273 CCTGT 0.2479 CCTTA 0.1645 CCTTC 0.2912 CCTTG 0.209 CCTTT 0.3353 CGAAA 0.2669 CGAAC 0.2116 CGAAG 0.3495 CGAAT 0.172 CGACA 0.2917 CGACC 0.2707 CGACG 0.2049 CGACT 0.2327 CGAGA 0.1925 CGAGC 0.3199 CGAGG 0.3328 CGAGT 0.1549 CGATA 0.1848 CGATC 0.2137 CGATG 0.3591 CGATT 0.2424 CGCAA 0.1331 CGCAC 0.268 CGCAG 0.4411 CGCAT 0.1578 CGCCA 0.1478 CGCCC 0.3311 CGCCG 0.3269 CGCCT 0.1941 CGCGA 0.1003 CGCGC 0.3623 CGCGG 0.4072 CGCGT 0.1302 CGCTA 0.0916 CGCTC 0.313 CGCTG 0.4043 CGCTT 0.1912 CGGAA 0.2312 CGGAC 0.1668 CGGAG 0.4597 CGGAT 0.1424 CGGCA 0.1881 CGGCC 0.3049 CGGCG 0.3005 CGGCT 0.2064 CGGGA 0.2085 CGGGC 0.3045 CGGGG 0.3682 CGGGT 0.1188 CGGTA 0.1578 CGGTC 0.1877 CGGTG 0.4417 CGGTT 0.2129 CGTAA 0.2723 CGTAC 0.222 CGTAG 0.2466 CGTAT 0.2592 CGTCA 0.2645 CGTCC 0.3303 CGTCG 0.1354 CGTCT 0.2697 CGTGA 0.1967 CGTGC 0.2944 CGTGG 0.2607 CGTGT 0.2482 CGTTA 0.1954 CGTTC 0.2489 CGTTG 0.2283 CGTTT 0.3274 CTAAA 0.3539 CTAAC 0.1873 CTAAG 0.2185 CTAAT 0.2403 CTACA 0.3959 CTACC 0.2073 CTACG 0.08025 CTACT 0.3165 CTAGA 0.3138 CTAGC 0.2289 CTAGG 0.2149 CTAGT 0.2425 CTATA 0.2199 CTATC 0.1854 CTATG 0.2525 CTATT 0.3422 CTCAA 0.2061 CTCAC 0.2288 CTCAG 0.3449 CTCAT 0.2201 CTCCA 0.278 CTCCC 0.289 CTCCG 0.1055 CTCCT 0.3275 CTCGA 0.1444 CTCGC 0.2904 CTCGG 0.3312 CTCGT 0.2341 CTCTA 0.1356 CTCTC 0.2381 CTCTG 0.343 CTCTT 0.2833 CTGAA 0.3456 CTGAC 0.1707 CTGAG 0.2803 CTGAT 0.2034 CTGCA 0.3322 CTGCC 0.2325 CTGCG 0.08548 CTGCT 0.3498 CTGGA 0.2927 CTGGC 0.2131 CTGGG 0.282 CTGGT 0.2122 CTGTA 0.2234 CTGTC 0.1762 CTGTG 0.3193 CTGTT 0.2812 CTTAA 0.3405 CTTAC 0.2218 CTTAG 0.1974 CTTAT 0.2402 CTTCA 0.3103 CTTCC 0.29 CTTCG 0.04926 CTTCT 0.3505 CTTGA 0.236 CTTGC 0.247 CTTGG 0.2293 CTTGT 0.2876 CTTTA 0.191 CTTTC 0.2357 CTTTG 0.2338 CTTTT 0.3395 GAAAA 0.3566 GAAAC 0.1701 GAAAG 0.235 GAAAT 0.2383 GAACA 0.4089 GAACC 0.1759 GAACG 0.101 GAACT 0.3143 GAAGA 0.2872 GAAGC 0.2212 GAAGG 0.2576 GAAGT 0.234 GAATA 0.2463 GAATC 0.1693 GAATG 0.2867 GAATT 0.2978 GACAA 0.2592 GACAC 0.2032 GACAG 0.3255 GACAT 0.2121 GACCA 0.3198 GACCC 0.2386 GACCG 0.1057 GACCT 0.336 GACGA 0.1687 GACGC 0.239 GACGG 0.3165 GACGT 0.2758 GACTA 0.1562 GACTC 0.1804 GACTG 0.3481 GACTT 0.3153 GAGAA 0.3499 GAGAC 0.1547 GAGAG 0.2824 GAGAT 0.213 GAGCA 0.3422 GAGCC 0.2132 GAGCG 0.131 GAGCT 0.3137 GAGGA 0.3024 GAGGC 0.2177 GAGGG 0.2703 GAGGT 0.2096 GAGTA 0.2198 GAGTC 0.1752 GAGTG 0.2947 GAGTT 0.3103 GATAA 0.3169 GATAC 0.216 GATAG 0.201 GATAT 0.2661 GATCA 0.3328 GATCC 0.2365 GATCG 0.06644 GATCT 0.3642 GATGA 0.2506 GATGC 0.232 GATGG 0.2467 GATGT 0.2707 GATTA 0.2035 GATTC 0.1971 GATTG 0.1838 GATTT 0.4156 GCAAA 0.3608 GCAAC 0.1844 GCAAG 0.2391 GCAAT 0.2157 GCACA 0.3636 GCACC 0.2211 GCACG 0.1219 GCACT 0.2934 GCAGA 0.2446 GCAGC 0.3164 GCAGG 0.2173 GCAGT 0.2216 GCATA 0.188 GCATC 0.2292 GCATG 0.2548 GCATT 0.3281 GCCAA 0.233 GCCAC 0.2404 GCCAG 0.2869 GCCAT 0.2397 GCCCA 0.249 GCCCC 0.302 GCCCG 0.1763 GCCCT 0.2727 GCCGA 0.1239 GCCGC 0.4178 GCCGG 0.2795 GCCGT 0.1787 GCCTA 0.1194 GCCTC 0.2657 GCCTG 0.3189 GCCTT 0.296 GCGAA 0.1941 GCGAC 0.198 GCGAG 0.3985 GCGAT 0.2094 GCGCA 0.1822 GCGCC 0.277 GCGCG 0.2614 GCGCT 0.2795 GCGGA 0.1463 GCGGC 0.3591 GCGGG 0.3429 GCGGT 0.1516 GCGTA 0.1463 GCGTC 0.1911 GCGTG 0.3765 GCGTT 0.2861 GCTAA 0.2962 GCTAC 0.2497 GCTAG 0.1764 GCTAT 0.2777 GCTCA 0.2676 GCTCC 0.3032 GCTCG 0.09266 GCTCT 0.3366 GCTGA 0.2173 GCTGC 0.3106 GCTGG 0.2034 GCTGT 0.2688 GCTTA 0.1627 GCTTC 0.2487 GCTTG 0.2016 GCTTT 0.387 GGAAA 0.3663 GGAAC 0.1556 GGAAG 0.299 GGAAT 0.1792 GGACA 0.3891 GGACC 0.1959 GGACG 0.1306 GGACT 0.2844 GGAGA 0.2705 GGAGC 0.2694 GGAGG 0.3028 GGAGT 0.1573 GGATA 0.1974 GGATC 0.1722 GGATG 0.3534 GGATT 0.277 GGCAA 0.2061 GGCAC 0.2248 GGCAG 0.3887 GGCAT 0.1804 GGCCA 0.2491 GGCCC 0.2612 GGCCG 0.2351 GGCCT 0.2547 GGCGA 0.1147 GGCGC 0.2849 GGCGG 0.4751 GGCGT 0.1253 GGCTA 0.1043 GGCTC 0.2286 GGCTG 0.4227 GGCTT 0.2445 GGGAA 0.328 GGGAC 0.162 GGGAG 0.3281 GGGAT 0.1819 GGGCA 0.3043 GGGCC 0.2039 GGGCG 0.1833 GGGCT 0.3085 GGGGA 0.2849 GGGGC 0.2633 GGGGG 0.2878 GGGGT 0.164 GGGTA 0.1782 GGGTC 0.1808 GGGTG 0.3426 GGGTT 0.2984 GGTAA 0.3033 GGTAC 0.2073 GGTAG 0.2375 GGTAT 0.2519 GGTCA 0.3325 GGTCC 0.2417 GGTCG 0.08729 GGTCT 0.3384 GGTGA 0.2449 GGTGC 0.2507 GGTGG 0.2683 GGTGT 0.236 GGTTA 0.1811 GGTTC 0.1813 GGTTG 0.2512 GGTTT 0.3863 GTAAA 0.3323 GTAAC 0.2026 GTAAG 0.2187 GTAAT 0.2464 GTACA 0.3899 GTACC 0.1987 GTACG 0.07932 GTACT 0.3321 GTAGA 0.2678 GTAGC 0.245 GTAGG 0.2312 GTAGT 0.256 GTATA 0.2077 GTATC 0.1796 GTATG 0.2415 GTATT 0.3712 GTCAA 0.196 GTCAC 0.2511 GTCAG 0.3197 GTCAT 0.2332 GTCCA 0.2684 GTCCC 0.296 GTCCG 0.07934 GTCCT 0.3564 GTCGA 0.1285 GTCGC 0.2945 GTCGG 0.3142 GTCGT 0.2628 GTCTA 0.1328 GTCTC 0.2249 GTCTG 0.3348 GTCTT 0.3075 GTGAA 0.3025 GTGAC 0.1951 GTGAG 0.2707 GTGAT 0.2317 GTGCA 0.3076 GTGCC 0.2265 GTGCG 0.0875 GTGCT 0.3784 GTGGA 0.2448 GTGGC 0.2248 GTGGG 0.2786 GTGGT 0.2517 GTGTA 0.1957 GTGTC 0.1706 GTGTG 0.3186 GTGTT 0.3151 GTTAA 0.3093 GTTAC 0.2361 GTTAG 0.1945 GTTAT 0.2601 GTTCA 0.3066 GTTCC 0.2544 GTTCG 0.05029 GTTCT 0.3887 GTTGA 0.2056 GTTGC 0.2338 GTTGG 0.2481 GTTGT 0.3125 GTTTA 0.184 GTTTC 0.2102 GTTTG 0.2325 GTTTT 0.3733 TAAAA 0.3777 TAAAC 0.159 TAAAG 0.2034 TAAAT 0.2599 TAACA 0.4075 TAACC 0.1821 TAACG 0.08219 TAACT 0.3282 TAAGA 0.3048 TAAGC 0.2202 TAAGG 0.2214 TAAGT 0.2536 TAATA 0.2634 TAATC 0.1532 TAATG 0.2536 TAATT 0.3297 TACAA 0.2697 TACAC 0.1753 TACAG 0.3105 TACAT 0.2445 TACCA 0.3619 TACCC 0.1985 TACCG 0.07497 TACCT 0.3647 TACGA 0.2029 TACGC 0.2021 TACGG 0.2292 TACGT 0.3658 TACTA 0.1689 TACTC 0.1663 TACTG 0.341 TACTT 0.3238 TAGAA 0.3979 TAGAC 0.1336 TAGAG 0.2353 TAGAT 0.2333 TAGCA 0.42 TAGCC 0.1661 TAGCG 0.06542 TAGCT 0.3485 TAGGA 0.3518 TAGGC 0.1942 TAGGG 0.2083 TAGGT 0.2457 TAGTA 0.242 TAGTC 0.1644 TAGTG 0.2624 TAGTT 0.3313 TATAA 0.2973 TATAC 0.1783 TATAG 0.1702 TATAT 0.3541 TATCA 0.3457 TATCC 0.2211 TATCG 0.04687 TATCT 0.3863 TATGA 0.2657 TATGC 0.2194 TATGG 0.2044 TATGT 0.3104 TATTA 0.2092 TATTC 0.1715 TATTG 0.1639 TATTT 0.4553 TCAAA 0.379 TCAAC 0.1764 TCAAG 0.2485 TCAAT 0.1961 TCACA 0.3705 TCACC 0.2254 TCACG 0.08498 TCACT 0.3191 TCAGA 0.2714 TCAGC 0.2675 TCAGG 0.1923 TCAGT 0.2688 TCATA 0.2071 TCATC 0.2253 TCATG 0.2231 TCATT 0.3444 TCCAA 0.2533 TCCAC 0.2011 TCCAG 0.3029 TCCAT 0.2427 TCCCA 0.299 TCCCC 0.2758 TCCCG 0.1019 TCCCT 0.3233 TCCGA 0.1639 TCCGC 0.3322 TCCGG 0.2405 TCCGT 0.2634 TCCTA 0.1499 TCCTC 0.2557 TCCTG 0.2854 TCCTT 0.309 TCGAA 0.2546 TCGAC 0.1517 TCGAG 0.348 TCGAT 0.2456 TCGCA 0.2317 TCGCC 0.2516 TCGCG 0.1632 TCGCT 0.3535 TCGGA 0.1906 TCGGC 0.2812 TCGGG 0.2908 TCGGT 0.2375 TCGTA 0.1887 TCGTC 0.1733 TCGTG 0.3329 TCGTT 0.3051 TCTAA 0.3128 TCTAC 0.2209 TCTAG 0.1959 TCTAT 0.2704 TCTCA 0.2962 TCTCC 0.2875 TCTCG 0.05265 TCTCT 0.3636 TCTGA 0.2452 TCTGC 0.267 TCTGG 0.1837 TCTGT 0.3041 TCTTA 0.1799 TCTTC 0.2579 TCTTG 0.199 TCTTT 0.3631 TGAAA 0.3582 TGAAC 0.1581 TGAAG 0.2697 TGAAT 0.2141 TGACA 0.3948 TGACC 0.2019 TGACG 0.0784 TGACT 0.3249 TGAGA 0.2844 TGAGC 0.2426 TGAGG 0.2669 TGAGT 0.2061 TGATA 0.2205 TGATC 0.1732 TGATG 0.3031 TGATT 0.3032 TGCAA 0.2379 TGCAC 0.1902 TGCAG 0.3462 TGCAT 0.2257 TGCCA 0.3102 TGCCC 0.2596 TGCCG 0.09662 TGCCT 0.3336 TGCGA 0.1539 TGCGC 0.2729 TGCGG 0.3141 TGCGT 0.2592 TGCTA 0.1472 TGCTC 0.2047 TGCTG 0.3624 TGCTT 0.2857 TGGAA 0.3602 TGGAC 0.135 TGGAG 0.2899 TGGAT 0.215 TGGCA 0.3669 TGGCC 0.1963 TGGCG 0.08255 TGGCT 0.3543 TGGGA 0.3027 TGGGC 0.2128 TGGGG 0.2771 TGGGT 0.2075 TGGTA 0.212 TGGTC 0.1581 TGGTG 0.3207 TGGTT 0.3092 TGTAA 0.3134 TGTAC 0.1905 TGTAG 0.2124 TGTAT 0.2838 TGTCA 0.3415 TGTCC 0.2522 TGTCG 0.0494 TGTCT 0.357 TGTGA 0.2405 TGTGC 0.2464 TGTGG 0.2199 TGTGT 0.2932 TGTTA 0.1932 TGTTC 0.201 TGTTG 0.2112 TGTTT 0.3947 TTAAA 0.3911 TTAAC 0.1572 TTAAG 0.1989 TTAAT 0.2528 TTACA 0.4116 TTACC 0.1865 TTACG 0.06242 TTACT 0.3394 TTAGA 0.2998 TTAGC 0.2298 TTAGG 0.2106 TTAGT 0.2598 TTATA 0.221 TTATC 0.1682 TTATG 0.2061 TTATT 0.4046 TTCAA 0.2379 TTCAC 0.1929 TTCAG 0.3207 TTCAT 0.2485 TTCCA 0.3152 TTCCC 0.2637 TTCCG 0.04841 TTCCT 0.3726 TTCGA 0.1706 TTCGC 0.2284 TTCGG 0.2713 TTCGT 0.3297 TTCTA 0.1666 TTCTC 0.2143 TTCTG 0.3017 TTCTT 0.3174 TTGAA 0.3689 TTGAC 0.1506 TTGAG 0.241 TTGAT 0.2396 TTGCA 0.365 TTGCC 0.1971 TTGCG 0.04123 TTGCT 0.3967 TTGGA 0.2981 TTGGC 0.2107 TTGGG 0.2308 TTGGT 0.2603 TTGTA 0.229 TTGTC 0.1656 TTGTG 0.2542 TTGTT 0.3511 TTTAA 0.3545 TTTAC 0.1784 TTTAG 0.1693 TTTAT 0.2979 TTTCA 0.3107 TTTCC 0.2679 TTTCG 0.02838 TTTCT 0.393 TTTGA 0.2246 TTTGC 0.2325 TTTGG 0.209 TTTGT 0.3339 TTTTA 0.2012 TTTTC 0.2028 TTTTG 0.178 TTTTT 0.418